View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14278_low_17 (Length: 238)

Name: NF14278_low_17
Description: NF14278
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14278_low_17
NF14278_low_17
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-229)||(22907247-22907476)
chr8 (1-133)||(5238184-5238317)
chr8 (1-133)||(24661281-24661414)
chr8 (1-133)||(43685643-43685776)
chr8 (2-230)||(16193750-16193980)
chr8 (2-229)||(43373502-43373731)
chr8 (2-225)||(6774280-6774505)
chr8 (2-225)||(24548986-24549211)
chr8 (2-229)||(16405009-16405235)
chr8 (2-218)||(17345581-17345798)
chr8 (2-218)||(24928825-24929043)
chr8 (2-100)||(21844594-21844692)
chr8 (2-100)||(21851987-21852085)
chr8 (2-100)||(30120854-30120952)
chr8 (2-100)||(16674414-16674512)
chr8 (118-212)||(23837214-23837308)
chr8 (43-229)||(222754-222943)
chr8 (43-229)||(736377-736566)
chr8 (43-229)||(860272-860461)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (1-229)||(26680201-26680430)
chr4 (2-229)||(15675123-15675352)
chr4 (1-133)||(10488659-10488792)
chr4 (1-133)||(16327959-16328092)
chr4 (2-229)||(31115629-31115858)
chr4 (2-229)||(13246430-13246659)
chr4 (2-229)||(54118278-54118507)
chr4 (2-165)||(10104284-10104449)
chr4 (2-100)||(122020-122118)
chr4 (2-229)||(10644219-10644449)
chr4 (4-100)||(13048257-13048353)
chr4 (131-229)||(111395-111493)
chr4 (2-229)||(47357654-47357884)
chr4 (118-212)||(41166083-41166177)
chr4 (184-229)||(10104449-10104494)
chr4 (8-165)||(40885594-40885753)
chr4 (118-205)||(15044851-15044938)
chr4 (118-230)||(52265645-52265758)
chr4 (118-182)||(13809647-13809711)
chr4 (2-30)||(33240901-33240929)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-229)||(37099-37328)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (1-229)||(7293017-7293246)
chr7 (1-133)||(11516324-11516457)
chr7 (1-133)||(15441597-15441730)
chr7 (1-133)||(30262162-30262295)
chr7 (2-229)||(47481065-47481294)
chr7 (2-224)||(11580773-11580997)
chr7 (4-229)||(18253871-18254098)
chr7 (3-229)||(16478985-16479213)
chr7 (2-229)||(36052667-36052893)
chr7 (2-229)||(13037048-13037277)
chr7 (2-227)||(16211768-16211995)
chr7 (2-229)||(13321014-13321245)
chr7 (2-229)||(3059966-3060195)
chr7 (2-100)||(13572808-13572906)
chr7 (1-100)||(25292371-25292470)
chr7 (2-100)||(10989541-10989639)
chr7 (2-92)||(13911046-13911136)
chr7 (2-99)||(2437590-2437687)
chr7 (8-96)||(296006-296094)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (1-229)||(16744148-16744377)
chr3 (1-229)||(17912515-17912744)
chr3 (2-229)||(15859058-15859287)
chr3 (1-133)||(2449271-2449404)
chr3 (2-230)||(51158052-51158282)
chr3 (2-218)||(13838905-13839123)
chr3 (4-229)||(15936663-15936890)
chr3 (2-229)||(14842595-14842824)
chr3 (4-226)||(15938505-15938729)
chr3 (6-229)||(2049810-2050035)
chr3 (2-229)||(12030181-12030410)
chr3 (12-225)||(15614838-15615053)
chr3 (2-229)||(16821139-16821369)
chr3 (120-229)||(47984650-47984759)
chr3 (120-229)||(48003224-48003333)
chr3 (1-100)||(13975755-13975853)
chr3 (1-100)||(45860937-45861035)
chr3 (2-100)||(55316351-55316449)
chr3 (120-229)||(47993937-47994046)
chr3 (120-229)||(48012510-48012619)
chr3 (1-100)||(13954923-13955021)
chr3 (2-100)||(41270207-41270305)
chr3 (112-229)||(12264932-12265049)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (2-229)||(19206-19435)
scaffold0195 (2-229)||(21290-21519)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (1-133)||(20623066-20623199)
chr5 (1-133)||(21233561-21233694)
chr5 (2-229)||(18531101-18531330)
chr5 (1-130)||(37052844-37052974)
chr5 (1-133)||(16536294-16536427)
chr5 (2-229)||(22053867-22054096)
chr5 (2-229)||(23506965-23507194)
chr5 (1-133)||(25900439-25900571)
chr5 (2-229)||(27182581-27182810)
chr5 (2-218)||(34939289-34939506)
chr5 (2-100)||(29188306-29188404)
chr5 (2-98)||(27009975-27010071)
chr5 (2-229)||(4200007-4200237)
chr5 (2-229)||(18778014-18778244)
chr5 (2-229)||(22366503-22366733)
chr5 (2-229)||(25426628-25426858)
chr5 (2-100)||(43443417-43443515)
chr5 (2-229)||(12374-12604)
chr5 (2-100)||(19500031-19500129)
chr5 (2-229)||(21073617-21073847)
chr5 (118-229)||(23493917-23494029)
chr5 (118-182)||(7728466-7728530)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (1-133)||(19689434-19689567)
chr2 (2-229)||(19794738-19794967)
chr2 (1-133)||(23820168-23820301)
chr2 (2-229)||(36982475-36982704)
chr2 (1-133)||(14906473-14906606)
chr2 (2-229)||(24341423-24341652)
chr2 (1-133)||(20015108-20015241)
chr2 (2-229)||(43642991-43643220)
chr2 (1-229)||(25265423-25265653)
chr2 (2-224)||(462743-462967)
chr2 (2-229)||(8891242-8891471)
chr2 (18-229)||(7507894-7508107)
chr2 (2-229)||(20627347-20627576)
chr2 (1-100)||(17396686-17396784)
chr2 (2-229)||(19886683-19886913)
chr2 (152-212)||(9636761-9636821)
chr2 (152-196)||(24884718-24884762)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (1-133)||(51452589-51452722)
chr1 (2-229)||(20445679-20445908)
chr1 (2-229)||(20531444-20531673)
chr1 (2-229)||(20893660-20893889)
chr1 (2-229)||(20931345-20931574)
chr1 (2-229)||(41394222-41394451)
chr1 (2-225)||(2116258-2116484)
chr1 (2-229)||(20913037-20913259)
chr1 (2-229)||(37844484-37844714)
chr1 (18-229)||(22227809-22228022)
chr1 (18-229)||(22232506-22232719)
chr1 (2-100)||(45051554-45051652)
chr1 (2-100)||(18601140-18601238)
chr1 (2-100)||(5072410-5072508)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-133)||(22637-22770)
scaffold0141 (1-133)||(26892-27025)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-133)||(1615-1748)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (2-229)||(8849-9078)
scaffold0025 (2-229)||(148721-148950)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (2-229)||(36947-37176)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (2-225)||(14626152-14626377)
chr6 (2-218)||(23153458-23153676)
chr6 (2-229)||(35009473-35009702)
chr6 (2-218)||(1657782-1657999)
chr6 (2-218)||(15862484-15862700)
chr6 (2-225)||(1650127-1650352)
chr6 (8-229)||(25175563-25175787)
chr6 (126-229)||(27740838-27740941)
chr6 (2-229)||(27654005-27654235)
chr6 (119-212)||(18381821-18381914)
chr6 (2-51)||(27751605-27751654)
chr6 (142-229)||(22361926-22362014)
chr6 (118-182)||(25367374-25367438)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (4-229)||(48187-48414)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-229)||(1124-1354)
scaffold0266 (2-227)||(3616-3843)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (4-229)||(107747-107974)
scaffold0026 (37-100)||(64585-64648)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (2-229)||(12115-12342)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-229)||(13506-13736)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (2-218)||(171916-172134)
scaffold0001 (2-218)||(177619-177837)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (2-229)||(990-1218)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (2-229)||(48598-48827)
scaffold0023 (2-100)||(36225-36323)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (2-229)||(123198-123427)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (2-229)||(41648-41877)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (2-225)||(9371-9596)
scaffold0215 (2-225)||(16269-16494)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (4-223)||(272031-272252)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (2-229)||(8878-9107)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (2-229)||(6098-6326)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (6-229)||(5099-5324)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (2-225)||(2966-3192)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (2-229)||(34494-34724)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (2-229)||(128203-128431)
scaffold0008 (2-92)||(31697-31787)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (2-225)||(41733-41958)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (4-218)||(247478-247694)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-229)||(26448-26678)
scaffold0162 (2-229)||(8214-8440)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (2-229)||(568-797)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-100)||(5660-5759)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (18-229)||(5254-5466)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (2-100)||(13347-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-100)||(167-265)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (131-229)||(9382-9480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (18-229)||(3722-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (3-229)||(42997-43226)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-100)||(51216-51314)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (2-100)||(14083-14181)
scaffold0139 (2-97)||(21138-21233)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (2-100)||(89488-89586)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (18-229)||(54416-54630)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (2-100)||(1326-1424)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (140-229)||(48514-48603)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (118-205)||(197390-197477)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (152-229)||(104793-104871)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (151-212)||(2471-2532)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (141-205)||(2548-2612)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (175-227)||(3210-3262)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22907247 - 22907476
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22907247 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22907346  T
Q  101 aaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22907347 aaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgc 22907446  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907447 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5238317 - 5238184
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  5238317 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238217 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 24661281 - 24661414
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  24661281 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661381 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43685776 - 43685643
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  43685776 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685676 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 16193750 - 16193980
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  16193750 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 16193849  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  16193850 caattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 16193949  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatgt 230  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16193950 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 43373502 - 43373731
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  43373502 tgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 43373601  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| |||||||||| || |     
T  43373602 caattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgc 43373701  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43373702 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 6774280 - 6774505
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  6774280 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 6774379  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  |     
T  6774380 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgc 6774479  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  6774480 ttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24549211 - 24548986
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  24549211 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 24549112  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  24549111 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 24549012  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24549011 ttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 16405009 - 16405235
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||     
T  16405009 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgct 16405108  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||  |     
T  16405109 caattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgc 16405205  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  16405206 ttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17345798 - 17345581
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  17345798 tgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgct 17345699  T
Q  101 aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  |     
T  17345698 caattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgc 17345600  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17345599 ttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 24928825 - 24929043
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  24928825 tgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 24928924  T
Q  101 aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| |     
T  24928925 caattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 24929024  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  24929025 ttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 21844594 - 21844692
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21844594 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21844692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 21851987 - 21852085
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21851987 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 30120952 - 30120854
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  30120952 tgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 30120854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 16674414 - 16674512
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16674414 tgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837214
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 212  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 23837214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  43 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 139  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  140 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  43 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 139  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  140 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  43 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 139  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  140 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26680430 - 26680201
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26680430 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26680331  T
Q  101 aaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26680330 aaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgc 26680231  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680230 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 15675123 - 15675352
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  15675123 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 15675222  T
Q  102 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  15675223 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 15675322  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15675323 ttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10488792 - 10488659
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  10488792 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488692 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 16327959 - 16328092
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16327959 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328059 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31115858 - 31115629
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| |||||||| |||     
T  31115858 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgct 31115759  T
Q  102 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  31115758 caattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 31115659  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31115658 ttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13246659 - 13246430
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  13246659 tgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13246560  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  13246559 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 13246460  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13246459 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 54118278 - 54118507
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||     
T  54118278 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgct 54118377  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  54118378 caattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 54118477  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  54118478 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 10104284 - 10104449
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  10104284 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 10104383  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 165  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10104384 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 122118 - 122020
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  122118 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10644449 - 10644219
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||     
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 10644350  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  10644349 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 10644250  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10644249 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 13048257 - 13048353
Alignment:
Q  4 atgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  13048257 atgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  131 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47357884 - 47357654
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  47357884 tgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 47357785  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  47357784 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 47357685  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47357684 attgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 212  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 10104449 - 10104494
Alignment:
Q  184 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10104449 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 40885594 - 40885753
Alignment:
Q  8 tatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa-tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||  |||||||| ||||| |||  |||     
T  40885594 tatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattatgctcaatt 40885692  T
Q  106 gatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 165  Q
    | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885693 ggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044851
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 205  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265758
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 216  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  217 tggattgatgatgt 230  Q
    ||  ||||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatgt 52265758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809711
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 182  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgt 13809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 33240929 - 33240901
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 30  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240929 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37099 - 37328
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  37099 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37198  T
Q  101 aaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  37199 aaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgc 37298  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37299 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7293246 - 7293017
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7293246 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 7293147  T
Q  101 aaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  7293146 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgc 7293047  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293046 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11516457 - 11516324
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  11516457 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516357 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15441597 - 15441730
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  15441597 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441697 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 30262162 - 30262295
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  30262162 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262262 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 47481065 - 47481294
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      
T  47481065 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgtt 47481164  T
Q  100 caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||| | ||||||||||||| |    
T  47481165 caattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattg 47481263  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47481264 cttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 11580773 - 11580997
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  11580773 tgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 11580872  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  11580873 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 11580972  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattga 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  11580973 ttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 18253871 - 18254098
Alignment:
Q  4 atgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  18253871 atgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctca 18253970  T
Q  103 atggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgttt 201  Q
    || | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |  |    
T  18253971 attggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcct 18254070  T
Q  202 gggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||    
T  18254071 gagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479213
Alignment:
Q  3 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16479084  T
Q  102 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 200  Q
    ||| | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |    
T  16479085 aattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgct 16479184  T
Q  201 tgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16479185 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36052893 - 36052667
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  36052893 tgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 36052794  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||| || |     
T  36052793 caattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgc 36052697  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36052696 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 13037048 - 13037277
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  13037048 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13037147  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  13037148 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 13037247  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13037248 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16211995 - 16211768
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  16211995 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 16211896  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||| |||| |     
T  16211895 caattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgattcattgc 16211796  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatga 227  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  16211795 ttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13321245 - 13321014
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  13321245 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtg 13321147  T
Q  100 ca-aatggatgaatttgac-atgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 196  Q
    |  ||| | |||||||  | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||    
T  13321146 ctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcat 13321047  T
Q  197 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
       |||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  13321046 gacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3060195 - 3059966
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| |||     
T  3060195 tgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgct 3060096  T
Q  101 -aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
     |||||| ||||||| |  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  3060095 caaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 3059997  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  3059996 cttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13572906 - 13572808
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13572906 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 25292371 - 25292470
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292371 ttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10989639 - 10989541
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  10989639 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 10989541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Original strand, 13911046 - 13911136
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 92  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 13911136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2437687 - 2437590
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  2437687 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 96
Target Start/End: Original strand, 296006 - 296094
Alignment:
Q  8 tatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaatt 96  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  296006 tatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16744148 - 16744377
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16744148 ttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16744247  T
Q  101 aaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  16744248 aaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgc 16744347  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16744348 ttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17912515 - 17912744
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17912515 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 17912614  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  |     
T  17912615 aaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgc 17912714  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17912715 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 15859058 - 15859287
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  15859058 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 15859157  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  15859158 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 15859257  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15859258 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 2449271 - 2449404
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  2449271 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449371 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 51158052 - 51158282
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  51158052 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 51158151  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  51158152 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 51158251  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatgt 230  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  51158252 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13839123 - 13838905
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  13839123 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13839024  T
Q  102 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  13839023 caattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgt 13838924  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  13838923 ttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 15936663 - 15936890
Alignment:
Q  4 atgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  15936663 atgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctca 15936762  T
Q  103 atggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgttt 201  Q
    || | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |  |    
T  15936763 attggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcct 15936862  T
Q  202 gggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||    
T  15936863 gagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 14842595 - 14842824
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  14842595 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgct 14842694  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || |     
T  14842695 caattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattga 14842794  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14842795 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 15938505 - 15938729
Alignment:
Q  4 atgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aa 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  15938505 atgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctca 15938604  T
Q  103 atggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgttt 201  Q
    || | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |  |    
T  15938605 attggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcct 15938704  T
Q  202 gggtatacatattcatggattgatg 226  Q
    | |||| ||||||||||||||||||    
T  15938705 gagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2050035 - 2049810
Alignment:
Q  6 gatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| | |||| || || ||||||||||||  |||    
T  2050035 gatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaat 2049936  T
Q  105 ggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgg 203  Q
     | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  2049935 tggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgg 2049836  T
Q  204 gtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2049835 gtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 12030181 - 12030410
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||     
T  12030181 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgct 12030280  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||||||| |     
T  12030281 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatgaatcattgc 12030380  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12030381 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614838
Alignment:
Q  12 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||  ||| | |||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  111 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 209  Q
    ||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 15614854  T
Q  210 atattcatggattgat 225  Q
    ||||||||| ||||||    
T  15614853 atattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821139
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984650
Alignment:
Q  120 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 219  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  220 attgatgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  47984659 attgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003224
Alignment:
Q  120 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 219  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  220 attgatgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  48003233 attgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 13975755 - 13975853
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13975755 ttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 45861035 - 45860937
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  45861035 ttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 55316449 - 55316351
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  55316449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 55316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993937
Alignment:
Q  120 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 219  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  220 attgatgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  47993946 attgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012510
Alignment:
Q  120 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 219  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  220 attgatgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  48012519 attgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 13954923 - 13955021
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  13954923 ttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgc 13955021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41270305 - 41270207
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  41270305 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 41270207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265049
Alignment:
Q  112 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 211  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  212 attcatggattgatgatg 229  Q
    | | ||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19435 - 19206
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  19435 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 19336  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  19335 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 19236  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19235 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21519 - 21290
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  21519 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 21420  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  21419 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 21320  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21319 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20623199 - 20623066
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  20623199 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623099 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 21233561 - 21233694
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21233561 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233661 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 18531101 - 18531330
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||      
T  18531101 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgtt 18531200  T
Q  100 caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  18531201 caattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattg 18531299  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18531300 ctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37052974 - 37052844
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37052974 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37052875  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttga 130  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052874 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16536427 - 16536294
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16536427 ttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536327 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 22053867 - 22054096
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  22053867 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 22053966  T
Q  102 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  22053967 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 22054066  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22054067 ttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23507194 - 23506965
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  23507194 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 23507095  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||| || |     
T  23507094 caattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgc 23506995  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23506994 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 25900439 - 25900571
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  25900439 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900539 aaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 27182581 - 27182810
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  27182581 tgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 27182680  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  27182681 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 27182780  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27182781 ttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34939506 - 34939289
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  34939506 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgct 34939407  T
Q  101 aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  |     
T  34939406 caattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgc 34939308  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  34939307 ttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 29188306 - 29188404
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  29188306 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27010071 - 27009975
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27010071 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 4200007 - 4200237
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 18778014 - 18778244
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 22366503 - 22366733
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  22366503 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 22366602  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  22366603 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 22366702  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22366703 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25426858 - 25426628
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  25426858 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 25426759  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  25426758 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 25426659  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25426658 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 43443417 - 43443515
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 43443515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12604 - 12374
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || ||| |||||||||| |||||||     
T  12604 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 12505  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  12504 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 12405  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12404 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19500129 - 19500031
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  19500129 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 19500031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 21073617 - 21073847
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  21073617 tgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 21073716  T
Q  101 aaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||  | ||||||  |   | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  21073717 aaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 21073816  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21073817 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493917
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 216  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  217 tggattgatgatg 229  Q
    ||  |||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatg 23493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 182  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 19689434 - 19689567
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19689434 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689534 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 19794738 - 19794967
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  19794738 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 19794837  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||| ||||||||||||||| |     
T  19794838 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgc 19794937  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794938 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23820301 - 23820168
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  23820301 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820201 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 36982475 - 36982704
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  36982475 tgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 36982574  T
Q  102 -aatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  36982575 caattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgt 36982674  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36982675 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 14906473 - 14906606
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  14906473 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906573 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 24341423 - 24341652
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  24341423 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 24341522  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||||||||||||| |     
T  24341523 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgc 24341622  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24341623 ttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20015241 - 20015108
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  20015241 ttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015141 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 43642991 - 43643220
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||     
T  43642991 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgct 43643090  T
Q  101 aaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||  |     
T  43643091 caattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgc 43643190  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43643191 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 25265423 - 25265653
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  25265423 ttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgc 25265522  T
Q  101 -aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
      ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||| |    
T  25265523 tcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatgg 25265622  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25265623 cttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 462967 - 462743
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-- 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      
T  462967 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgtt 462868  T
Q  100 caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    ||| ||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||| ||  |||||||||||| |    
T  462867 caattgg-tgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattg 462769  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattga 224  Q
     |||||||| |||||||||| |||||    
T  462768 cttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8891471 - 8891242
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  8891471 tgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 8891372  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  8891371 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 8891272  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  8891271 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  18 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 115  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttg 7507992  T
Q  116 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 213  Q
     | | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  7507993 gctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  214 tcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 20627347 - 20627576
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||     
T  20627347 tgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgct 20627446  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| |||||||| || | | || |||| | |||||| ||||||||||||| |     
T  20627447 caattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgc 20627546  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  20627547 ttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 17396686 - 17396784
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17396686 ttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 19886683 - 19886913
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || ||| |||||||||| |||||||     
T  19886683 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 19886782  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  19886783 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 19886882  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19886883 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  152 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 212  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  152 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 51452722 - 51452589
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  51452722 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452622 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20445908 - 20445679
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||     
T  20445908 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgct 20445809  T
Q  102 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  20445808 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 20445709  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20445708 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20531673 - 20531444
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||     
T  20531673 tgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgct 20531574  T
Q  102 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  20531573 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 20531474  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20531473 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 20893660 - 20893889
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  20893660 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 20893759  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20893760 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgt 20893859  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  20893860 ttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20931574 - 20931345
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  20931574 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgct 20931475  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||| ||       
T  20931474 aaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatttc 20931375  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  20931374 ttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41394451 - 41394222
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  41394451 tgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 41394352  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  |     
T  41394351 caattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactga 41394252  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394251 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116258
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 2116385  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattga-gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||   | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2116384 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattg 2116285  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2116284 cttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20913259 - 20913037
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  20913259 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgct 20913160  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||||| || |     
T  20913159 caattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatgaataattgc 20913067  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20913066 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 37844484 - 37844714
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta-tgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||  || ||||||||||||    
T  37844484 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgc 37844583  T
Q  101 -aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
      |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||| |||| |    
T  37844584 tcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcattg 37844683  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  37844684 cttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227809
Alignment:
Q  18 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttg 115  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  116 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 215  Q
      | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  216 atggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||    
T  22227822 atggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232506
Alignment:
Q  18 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttg 115  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  116 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 215  Q
      | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  216 atggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||    
T  22232519 atggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 45051652 - 45051554
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45051652 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 18601140 - 18601238
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  18601140 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 5072410 - 5072508
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  5072410 tgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 5072508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22770 - 22637
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22770 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22670 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27025 - 26892
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  27025 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26925 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 1615 - 1748
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  1615 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 133  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1715 aaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9078 - 8849
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  9078 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 8979  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  8978 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 8879  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8878 ttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 148950 - 148721
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  148950 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 148851  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  148850 caattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgc 148751  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  148750 ttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 36947 - 37176
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  36947 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 37046  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  37047 aaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 37146  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37147 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 14626152 - 14626377
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgtg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||    
T  14626152 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtg 14626251  T
Q  100 caaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    ||| ||| |||||| ||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14626252 caattgg-tgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattg 14626350  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||    
T  14626351 cttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23153676 - 23153458
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  23153676 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 23153577  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||||| |||||||||||||       
T  23153576 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattac 23153477  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23153476 ttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 35009473 - 35009702
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  35009473 tgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgct 35009572  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  35009573 caattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 35009672  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35009673 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 1657782 - 1657999
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  1657782 tgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgct 1657881  T
Q  101 aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  |     
T  1657882 caattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgc 1657980  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  1657981 ttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15862700 - 15862484
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  15862700 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgct 15862601  T
Q  101 aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  |     
T  15862600 caattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgc 15862503  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15862502 ttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 1650127 - 1650352
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||     
T  1650127 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgct 1650226  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  |     
T  1650227 caattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgc 1650326  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1650327 ttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175563
Alignment:
Q  8 tatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatgg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  107 atgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttggg 204  Q
     |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||    
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25175588  T
Q  205 tatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  25175587 tatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740838
Alignment:
Q  126 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  226 gatg 229  Q
    ||||    
T  27740841 gatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 27654005 - 27654235
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  27654005 tgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 27654104  T
Q  101 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  27654105 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 27654204  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27654205 cttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381914
Alignment:
Q  119 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 212  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 18381914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 27751654 - 27751605
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 51  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751654 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 229
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362014
Alignment:
Q  142 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 229  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 22362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 182  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48414 - 48187
Alignment:
Q  4 atgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  48414 atgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctca 48315  T
Q  103 atggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgttt 201  Q
    || | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |  |    
T  48314 attggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcct 48215  T
Q  202 gggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48214 gggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1354 - 1124
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1354 ttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 1255  T
Q  101 -aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
      ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||||| || |    
T  1254 tcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatgaataattg 1155  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  1154 cttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 3616 - 3843
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      
T  3616 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 3715  T
Q  100 caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    ||| |||   | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| |||| || |     
T  3716 caattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgaggaataattgc 3815  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatga 227  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3816 ttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 107974 - 107747
Alignment:
Q  4 atgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || | |||||| ||||| | ||||||||||  |    
T  107974 atgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctca 107875  T
Q  103 atggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgttt 201  Q
    || | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || | ||    
T  107874 attggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgctt 107775  T
Q  202 gggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||    
T  107774 gggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Original strand, 64585 - 64648
Alignment:
Q  37 tgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  64585 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 64648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12342 - 12115
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  12342 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 12243  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||||| || |     
T  12242 aaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatgaataattgc 12145  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12144 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13736 - 13506
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  13736 ttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgc 13637  T
Q  101 -aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
      ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||      
T  13636 tcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatga 13537  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13536 cttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 172134 - 171916
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  172134 tgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 172035  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  172034 aaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 171935  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  171934 ttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 177837 - 177619
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  177837 tgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 177738  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  177737 aaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 177638  T
Q  200 ttgggtatacatattcatg 218  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  177637 ttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 990 - 1218
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||     
T  990 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 1089  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| || |     
T  1090 caattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgc 1188  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1189 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48827 - 48598
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  48827 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 48728  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  48727 cagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 48628  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48627 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36225
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 123198 - 123427
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  123198 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 123297  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||| || |     
T  123298 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatggc 123397  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  123398 ttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41877 - 41648
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||      
T  41877 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgtt 41778  T
Q  100 caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
    ||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| |    
T  41777 caattgg-tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattg 41679  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41678 cttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9596
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16494
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 272252 - 272031
Alignment:
Q  4 atgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  272252 atgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaa 272153  T
Q  103 atggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgttt 201  Q
    || | |||||||  | | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||    
T  272152 attggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 272053  T
Q  202 gggtatacatattcatggattg 223  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  272052 gggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9107 - 8878
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||  ||||| ||||||||||||     
T  9107 tgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgct 9008  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |     
T  9007 caattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgc 8908  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8907 ttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 6098 - 6326
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||     
T  6098 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgct 6197  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   |||| |  ||||||||| || |     
T  6198 gaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaataattgc 6296  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6297 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 5099 - 5324
Alignment:
Q  6 gatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||    
T  5099 gatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaat 5198  T
Q  105 ggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgg 203  Q
     | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  5199 tggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgg 5298  T
Q  204 gtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  5299 gtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3192 - 2966
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  3192 tgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 3093  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  |    
T  3092 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactg 2993  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
     ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  2992 cttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 34494 - 34724
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || | |||| ||||  |||||| |||||||||| |     
T  34494 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttct 34593  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||       
T  34594 caataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcacta 34693  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34694 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 128203 - 128431
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| ||||||||||||     
T  128203 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgct 128302  T
Q  101 -aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     || |||   | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |     
T  128303 caattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattga 128401  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  128402 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31787
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 92  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 31787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41958 - 41733
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |||||| || || ||||||||||||     
T  41958 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgct 41859  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||||||| ||||||||||| |     
T  41858 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattgg 41759  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgat 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  41758 ttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 247478 - 247694
Alignment:
Q  4 atgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--ca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  247478 atgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctca 247577  T
Q  102 aatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgttt 201  Q
    | |||   | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||    
T  247578 attggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 247677  T
Q  202 gggtatacatattcatg 218  Q
    |||||| ||||||||||    
T  247678 gggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26448 - 26678
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |    
T  26448 ttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttc 26547  T
Q  101 -aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 198  Q
      ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  26548 tcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattg 26647  T
Q  199 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
     |||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  26648 cttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 8214 - 8440
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  8214 tgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 8313  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||| |     
T  8314 caattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggc 8410  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8411 ttgggtatgcatatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 568 - 797
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | ||||||  |||| |||||||||| |     
T  568 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtact 667  T
Q  101 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
     ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  668 caattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 767  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  768 ttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 5759 - 5660
Alignment:
Q  1 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5759 ttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  18 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-ttt 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttt 5352  T
Q  115 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 214  Q
    |    ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | ||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  215 catggattgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13445
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 167
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  265 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  131 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  18 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgt-agaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-ttt 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | ||| | |||| |||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  115 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 214  Q
    |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  215 catggattgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42997
Alignment:
Q  3 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 101  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  102 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 199  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |     
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  200 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 51216 - 51314
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51216 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14181
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Original strand, 21138 - 21233
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattg 97  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21138 tgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattg 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 89488 - 89586
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| ||||||||||||    
T  89488 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54416
Alignment:
Q  18 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  115 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 213  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  214 tcatggattgatgatg 229  Q
    | ||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 1326 - 1424
Alignment:
Q  2 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  1326 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48514
Alignment:
Q  140 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197477
Alignment:
Q  118 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 205  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 197477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 229
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104871
Alignment:
Q  152 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  151 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2548
Alignment:
Q  141 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 205  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2612 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3210
Alignment:
Q  175 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 227  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University