View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14291_low_1 (Length: 687)

Name: NF14291_low_1
Description: NF14291
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14291_low_1
NF14291_low_1
[»] chr3 (176 HSPs)
chr3 (18-676)||(51942998-51943657)
chr3 (62-675)||(1313082-1313695)
chr3 (62-675)||(53917635-53918250)
chr3 (61-675)||(53915467-53916083)
chr3 (62-663)||(25533107-25533716)
chr3 (58-663)||(746418-747031)
chr3 (61-663)||(457949-458558)
chr3 (62-663)||(455573-456181)
chr3 (62-663)||(4103879-4104483)
chr3 (60-663)||(10621513-10622129)
chr3 (61-679)||(42991952-42992560)
chr3 (321-670)||(4308257-4308609)
chr3 (317-676)||(45882864-45883227)
chr3 (317-675)||(43423434-43423795)
chr3 (62-446)||(27635830-27636212)
chr3 (317-663)||(18099153-18099502)
chr3 (317-663)||(10956010-10956359)
chr3 (317-669)||(1626660-1627015)
chr3 (355-670)||(30005804-30006122)
chr3 (317-676)||(48361641-48362002)
chr3 (317-675)||(43421386-43421747)
chr3 (317-669)||(3314609-3314965)
chr3 (317-664)||(11170329-11170679)
chr3 (317-663)||(10958306-10958655)
chr3 (317-670)||(18096876-18097233)
chr3 (317-669)||(28101979-28102334)
chr3 (355-679)||(42990267-42990594)
chr3 (317-675)||(880422-880784)
chr3 (355-663)||(38890003-38890314)
chr3 (321-669)||(43228220-43228571)
chr3 (62-472)||(41848804-41849232)
chr3 (317-663)||(3859453-3859801)
chr3 (321-670)||(24979636-24979989)
chr3 (321-663)||(51726990-51727334)
chr3 (321-654)||(43226015-43226350)
chr3 (321-669)||(27101158-27101513)
chr3 (317-670)||(18162589-18162944)
chr3 (317-663)||(26720473-26720821)
chr3 (317-663)||(10084372-10084725)
chr3 (276-605)||(6561694-6562028)
chr3 (317-663)||(5191578-5191925)
chr3 (317-655)||(5926755-5927096)
chr3 (317-670)||(12267951-12268298)
chr3 (317-663)||(22114288-22114637)
chr3 (355-670)||(9604583-9604900)
chr3 (317-669)||(53468430-53468787)
chr3 (317-669)||(47148872-47149232)
chr3 (317-670)||(36011752-36012108)
chr3 (317-669)||(32264015-32264375)
chr3 (317-663)||(6065779-6066129)
chr3 (317-661)||(54691559-54691905)
chr3 (317-663)||(6063429-6063780)
chr3 (321-663)||(50493928-50494273)
chr3 (317-663)||(5522610-5522947)
chr3 (317-663)||(28761410-28761760)
chr3 (317-675)||(51674737-51675087)
chr3 (355-663)||(25388869-25389179)
chr3 (396-663)||(1321483-1321753)
chr3 (317-651)||(10191305-10191645)
chr3 (317-668)||(39715395-39715744)
chr3 (67-344)||(42989957-42990234)
chr3 (355-663)||(38210333-38210644)
chr3 (317-675)||(15780785-15781165)
chr3 (355-610)||(29956649-29956907)
chr3 (323-670)||(32219026-32219366)
chr3 (317-640)||(889779-890103)
chr3 (321-646)||(35917944-35918277)
chr3 (405-668)||(6484372-6484639)
chr3 (317-544)||(28100143-28100373)
chr3 (382-663)||(28413014-28413299)
chr3 (414-663)||(7606571-7606822)
chr3 (317-648)||(53591120-53591442)
chr3 (509-676)||(27635628-27635795)
chr3 (317-554)||(35777346-35777587)
chr3 (443-669)||(25688137-25688367)
chr3 (317-668)||(23633385-23633732)
chr3 (317-675)||(31151272-31151631)
chr3 (317-552)||(28180949-28181185)
chr3 (413-675)||(4666535-4666800)
chr3 (480-663)||(5886290-5886472)
chr3 (480-663)||(5899763-5899945)
chr3 (440-670)||(6231849-6232081)
chr3 (399-668)||(17795269-17795538)
chr3 (399-668)||(19103709-19103978)
chr3 (456-663)||(11168165-11168375)
chr3 (317-642)||(53597166-53597491)
chr3 (317-460)||(11163075-11163218)
chr3 (317-537)||(28137415-28137627)
chr3 (516-663)||(47701654-47701801)
chr3 (399-642)||(13420189-13420432)
chr3 (473-669)||(3306845-3307040)
chr3 (322-651)||(36871295-36871624)
chr3 (399-651)||(561769-562024)
chr3 (316-566)||(23636951-23637200)
chr3 (399-651)||(25635391-25635644)
chr3 (317-601)||(54884082-54884367)
chr3 (317-446)||(47701798-47701927)
chr3 (316-445)||(6231373-6231502)
chr3 (573-670)||(41849243-41849340)
chr3 (317-435)||(3306724-3306842)
chr3 (582-663)||(35919098-35919179)
chr3 (503-651)||(24181494-24181644)
chr3 (392-651)||(1673975-1674227)
chr3 (61-136)||(6561612-6561687)
chr3 (321-529)||(4560401-4560593)
chr3 (594-663)||(53894040-53894109)
chr3 (484-649)||(1620457-1620624)
chr3 (532-651)||(25634030-25634150)
chr3 (478-624)||(11007545-11007683)
chr3 (72-145)||(53974124-53974197)
chr3 (317-493)||(24177204-24177380)
chr3 (72-228)||(11066255-11066429)
chr3 (72-145)||(11072644-11072717)
chr3 (317-392)||(1321366-1321441)
chr3 (94-217)||(54287487-54287627)
chr3 (147-212)||(53974011-53974077)
chr3 (614-679)||(42992611-42992676)
chr3 (594-648)||(1736334-1736388)
chr3 (142-212)||(11072731-11072801)
chr3 (594-648)||(18552912-18552966)
chr3 (586-640)||(28181185-28181238)
chr3 (594-648)||(30709819-30709873)
chr3 (317-377)||(6484310-6484370)
chr3 (583-654)||(10612772-10612844)
chr3 (583-654)||(47878165-47878237)
chr3 (596-648)||(47923937-47923989)
chr3 (594-648)||(1417519-1417573)
chr3 (594-648)||(3716031-3716085)
chr3 (594-648)||(8370515-8370569)
chr3 (594-648)||(27974981-27975035)
chr3 (594-648)||(27986475-27986529)
chr3 (599-648)||(21711227-21711276)
chr3 (583-654)||(10595028-10595100)
chr3 (583-654)||(10897121-10897193)
chr3 (371-473)||(13419864-13419960)
chr3 (540-654)||(15823641-15823756)
chr3 (62-102)||(27000083-27000123)
chr3 (604-648)||(29682483-29682527)
chr3 (604-648)||(40913417-40913461)
chr3 (604-648)||(44331669-44331713)
chr3 (583-654)||(48390296-48390368)
chr3 (321-388)||(1618916-1618986)
chr3 (399-500)||(25633930-25634031)
chr3 (594-645)||(48438221-48438272)
chr3 (626-668)||(8183112-8183154)
chr3 (594-648)||(16264354-16264408)
chr3 (594-648)||(25795785-25795839)
chr3 (594-648)||(26298992-26299046)
chr3 (473-654)||(29913949-29914128)
chr3 (604-654)||(30236249-30236299)
chr3 (594-648)||(32143325-32143379)
chr3 (594-648)||(33386695-33386749)
chr3 (594-648)||(37466295-37466349)
chr3 (454-528)||(11073007-11073084)
chr3 (583-624)||(11079633-11079674)
chr3 (595-648)||(24695194-24695247)
chr3 (321-370)||(53896475-53896524)
chr3 (635-675)||(880211-880251)
chr3 (596-648)||(3328387-3328439)
chr3 (317-353)||(4663844-4663880)
chr3 (23-59)||(5156118-5156154)
chr3 (604-648)||(9666466-9666510)
chr3 (583-650)||(10094073-10094141)
chr3 (583-650)||(10100090-10100158)
chr3 (583-650)||(10200953-10201021)
chr3 (604-648)||(16499153-16499197)
chr3 (604-648)||(23391909-23391953)
chr3 (627-675)||(28181242-28181290)
chr3 (604-648)||(29196386-29196430)
chr3 (608-648)||(32744436-32744476)
chr3 (604-648)||(39153361-39153405)
chr3 (604-648)||(40734622-40734666)
chr3 (604-644)||(40735507-40735547)
chr3 (604-648)||(47304375-47304419)
chr3 (604-648)||(51398938-51398982)
chr3 (583-650)||(54193342-54193410)
[»] chr1 (145 HSPs)
chr1 (62-676)||(17324610-17325227)
chr1 (60-675)||(47905954-47906576)
chr1 (62-676)||(28998227-28998844)
chr1 (62-676)||(29003943-29004560)
chr1 (61-663)||(31735508-31736116)
chr1 (62-669)||(2949213-2949815)
chr1 (62-663)||(39931762-39932368)
chr1 (62-663)||(15294821-15295439)
chr1 (62-660)||(24325347-24325954)
chr1 (62-669)||(27339112-27339730)
chr1 (61-669)||(27336921-27337533)
chr1 (89-612)||(21948226-21948756)
chr1 (61-663)||(9463231-9463841)
chr1 (62-663)||(9459404-9460013)
chr1 (290-676)||(6995674-6996064)
chr1 (184-663)||(2510312-2510801)
chr1 (317-675)||(12302480-12302846)
chr1 (317-668)||(50307527-50307883)
chr1 (317-663)||(51749984-51750333)
chr1 (317-670)||(15823491-15823847)
chr1 (317-669)||(18307054-18307409)
chr1 (317-675)||(38925456-38925814)
chr1 (317-675)||(11457450-11457811)
chr1 (317-670)||(28207048-28207402)
chr1 (317-669)||(41646865-41647220)
chr1 (317-663)||(10399815-10400164)
chr1 (317-658)||(13215026-13215375)
chr1 (317-661)||(6822960-6823306)
chr1 (321-670)||(39462468-39462820)
chr1 (174-663)||(46431693-46432207)
chr1 (317-668)||(9241067-9241422)
chr1 (321-669)||(14097950-14098302)
chr1 (317-663)||(28840623-28840973)
chr1 (317-675)||(18839532-18839894)
chr1 (317-675)||(17318838-17319193)
chr1 (317-663)||(13761782-13762130)
chr1 (317-646)||(47451593-47451919)
chr1 (317-669)||(25251255-25251611)
chr1 (321-661)||(2617465-2617808)
chr1 (317-675)||(16428598-16428960)
chr1 (317-663)||(20302404-20302752)
chr1 (317-670)||(50076652-50077008)
chr1 (317-661)||(3579606-3579954)
chr1 (317-669)||(50248551-50248908)
chr1 (317-663)||(28842438-28842788)
chr1 (317-663)||(51752310-51752657)
chr1 (347-675)||(31424990-31425325)
chr1 (317-670)||(50078800-50079157)
chr1 (317-670)||(6756472-6756829)
chr1 (317-668)||(17186109-17186464)
chr1 (317-668)||(31489860-31490211)
chr1 (276-595)||(48665074-48665404)
chr1 (355-669)||(25127855-25128173)
chr1 (317-663)||(16226112-16226461)
chr1 (317-663)||(20291402-20291750)
chr1 (317-663)||(47179654-47180006)
chr1 (342-663)||(4131362-4131692)
chr1 (317-659)||(31422851-31423210)
chr1 (62-260)||(48664852-48665050)
chr1 (317-654)||(17324010-17324349)
chr1 (317-663)||(47177303-47177655)
chr1 (317-663)||(40133880-40134239)
chr1 (62-254)||(4131690-4131882)
chr1 (70-252)||(45693834-45694016)
chr1 (317-659)||(14183581-14183922)
chr1 (61-245)||(6115534-6115719)
chr1 (296-651)||(42922157-42922514)
chr1 (363-675)||(16432396-16432702)
chr1 (473-675)||(16429061-16429264)
chr1 (317-568)||(6823829-6824091)
chr1 (439-669)||(25248532-25248766)
chr1 (317-654)||(49495206-49495535)
chr1 (317-637)||(8347284-8347605)
chr1 (61-250)||(6997213-6997395)
chr1 (317-651)||(18800570-18800905)
chr1 (317-668)||(15669374-15669727)
chr1 (512-668)||(23816029-23816185)
chr1 (473-675)||(6115077-6115280)
chr1 (62-177)||(46432521-46432636)
chr1 (100-260)||(6996067-6996221)
chr1 (316-668)||(8349033-8349386)
chr1 (482-651)||(23785953-23786121)
chr1 (69-215)||(16561138-16561284)
chr1 (439-663)||(16231630-16231856)
chr1 (473-663)||(51757635-51757824)
chr1 (196-556)||(26520207-26520580)
chr1 (322-651)||(13125455-13125787)
chr1 (574-663)||(13358778-13358867)
chr1 (142-228)||(11693580-11693666)
chr1 (317-411)||(25248756-25248850)
chr1 (72-228)||(13785662-13785835)
chr1 (317-649)||(30790401-30790730)
chr1 (541-651)||(15916562-15916674)
chr1 (72-191)||(32260746-32260882)
chr1 (317-412)||(16231546-16231641)
chr1 (372-651)||(27916500-27916780)
chr1 (145-228)||(14352759-14352842)
chr1 (454-668)||(26613221-26613440)
chr1 (473-651)||(30738625-30738808)
chr1 (451-651)||(16561545-16561751)
chr1 (204-263)||(6115479-6115538)
chr1 (489-663)||(28279385-28279563)
chr1 (99-228)||(10115509-10115653)
chr1 (129-182)||(13112046-13112099)
chr1 (622-663)||(13447260-13447301)
chr1 (454-626)||(155788-155963)
chr1 (72-139)||(11693686-11693753)
chr1 (558-651)||(13127685-13127780)
chr1 (594-648)||(9476265-9476319)
chr1 (322-475)||(13127811-13127959)
chr1 (473-654)||(21353342-21353521)
chr1 (598-648)||(47102884-47102934)
chr1 (596-648)||(13598402-13598454)
chr1 (537-607)||(43104329-43104400)
chr1 (594-648)||(16124555-16124609)
chr1 (594-648)||(19072932-19072986)
chr1 (594-648)||(19120822-19120876)
chr1 (317-387)||(26613503-26613576)
chr1 (594-648)||(26644936-26644990)
chr1 (594-648)||(47098863-47098917)
chr1 (594-648)||(47703975-47704029)
chr1 (317-354)||(43104104-43104141)
chr1 (604-648)||(834167-834211)
chr1 (348-388)||(6115344-6115384)
chr1 (583-650)||(9526582-9526650)
chr1 (604-648)||(13137976-13138020)
chr1 (604-648)||(28220226-28220270)
chr1 (604-648)||(28265554-28265598)
chr1 (584-648)||(37069774-37069838)
chr1 (604-648)||(50169210-50169254)
chr1 (594-645)||(3281715-3281766)
chr1 (62-101)||(6997388-6997427)
chr1 (109-140)||(16855265-16855296)
chr1 (594-645)||(29651818-29651869)
chr1 (594-648)||(21536608-21536662)
chr1 (606-648)||(45644354-45644396)
chr1 (583-654)||(2393277-2393348)
chr1 (583-654)||(2401215-2401287)
chr1 (604-648)||(3156989-3157033)
chr1 (583-654)||(4144677-4144749)
chr1 (604-648)||(4552637-4552681)
chr1 (604-648)||(10925350-10925394)
chr1 (604-648)||(13659336-13659380)
chr1 (604-648)||(28223421-28223465)
chr1 (604-648)||(31659362-31659406)
[»] chr7 (139 HSPs)
chr7 (62-669)||(21989853-21990460)
chr7 (62-676)||(37412097-37412716)
chr7 (62-663)||(20625734-20626342)
chr7 (62-663)||(20629625-20630233)
chr7 (62-663)||(20642044-20642652)
chr7 (61-663)||(7471965-7472575)
chr7 (62-663)||(38393683-38394290)
chr7 (61-663)||(7470007-7470622)
chr7 (61-663)||(20299154-20299764)
chr7 (62-662)||(3035415-3036027)
chr7 (131-669)||(13099453-13099996)
chr7 (61-663)||(28487248-28487857)
chr7 (62-663)||(18345237-18345845)
chr7 (62-668)||(42330977-42331593)
chr7 (62-661)||(28485261-28485867)
chr7 (61-663)||(31155896-31156501)
chr7 (61-663)||(1849664-1850285)
chr7 (62-663)||(7351637-7352246)
chr7 (62-589)||(11756925-11757460)
chr7 (61-663)||(7349262-7349868)
chr7 (70-670)||(24258166-24258779)
chr7 (166-663)||(20297163-20297666)
chr7 (317-669)||(44724534-44724889)
chr7 (276-669)||(443508-443906)
chr7 (142-663)||(43253502-43254035)
chr7 (317-675)||(20137082-20137443)
chr7 (317-675)||(4295907-4296270)
chr7 (317-675)||(27306205-27306563)
chr7 (321-663)||(48457608-48457957)
chr7 (317-663)||(44519-44868)
chr7 (341-675)||(21592116-21592453)
chr7 (317-668)||(11355213-11355567)
chr7 (317-663)||(35584-35933)
chr7 (317-675)||(31435019-31435381)
chr7 (317-669)||(9680769-9681130)
chr7 (317-663)||(40836728-40837076)
chr7 (61-411)||(7092414-7092769)
chr7 (317-661)||(1049283-1049629)
chr7 (61-411)||(7094662-7095016)
chr7 (317-668)||(24748549-24748904)
chr7 (317-675)||(21678021-21678380)
chr7 (317-669)||(39145965-39146321)
chr7 (317-675)||(21679982-21680346)
chr7 (327-663)||(3878540-3878881)
chr7 (317-661)||(25542486-25542830)
chr7 (317-675)||(42223111-42223474)
chr7 (355-661)||(1046912-1047220)
chr7 (317-661)||(9679009-9679361)
chr7 (361-663)||(40946327-40946632)
chr7 (61-345)||(38395985-38396269)
chr7 (62-364)||(1606171-1606472)
chr7 (62-262)||(47865328-47865528)
chr7 (61-332)||(21470614-21470884)
chr7 (432-663)||(7092198-7092431)
chr7 (317-668)||(25276096-25276439)
chr7 (317-654)||(27832631-27832968)
chr7 (317-583)||(22251611-22251876)
chr7 (432-663)||(7094445-7094678)
chr7 (62-384)||(3676997-3677301)
chr7 (318-638)||(24817362-24817682)
chr7 (317-608)||(22828672-22828967)
chr7 (317-549)||(26804528-26804762)
chr7 (61-210)||(443325-443474)
chr7 (317-651)||(7188498-7188833)
chr7 (317-473)||(18567568-18567724)
chr7 (317-612)||(20091583-20091875)
chr7 (440-663)||(38396713-38396938)
chr7 (391-669)||(24813477-24813755)
chr7 (513-668)||(22393876-22394032)
chr7 (482-651)||(2935392-2935560)
chr7 (317-651)||(24465503-24465829)
chr7 (482-663)||(22137202-22137381)
chr7 (482-663)||(40552229-40552408)
chr7 (482-663)||(22108191-22108370)
chr7 (67-228)||(40281824-40281987)
chr7 (482-663)||(40549951-40550130)
chr7 (482-651)||(1606504-1606671)
chr7 (482-651)||(9027191-9027358)
chr7 (499-654)||(26295587-26295743)
chr7 (317-651)||(6332181-6332514)
chr7 (317-506)||(22392428-22392608)
chr7 (72-228)||(10690684-10690845)
chr7 (596-663)||(11759364-11759431)
chr7 (372-668)||(11081522-11081819)
chr7 (72-125)||(20297108-20297161)
chr7 (362-423)||(38396316-38396377)
chr7 (489-583)||(6348912-6349006)
chr7 (614-675)||(26804765-26804826)
chr7 (473-651)||(16297018-16297200)
chr7 (142-228)||(12310442-12310528)
chr7 (79-145)||(12310542-12310608)
chr7 (70-116)||(43254023-43254069)
chr7 (594-648)||(46516349-46516403)
chr7 (583-663)||(6067183-6067264)
chr7 (628-669)||(22251564-22251605)
chr7 (495-636)||(6046629-6046772)
chr7 (594-648)||(9190047-9190101)
chr7 (594-648)||(20284093-20284147)
chr7 (594-648)||(29159807-29159861)
chr7 (297-374)||(30906327-30906405)
chr7 (604-648)||(14379861-14379905)
chr7 (583-654)||(25410246-25410318)
chr7 (583-654)||(34546874-34546946)
chr7 (322-447)||(6348778-6348903)
chr7 (594-648)||(2580394-2580448)
chr7 (594-648)||(21983288-21983342)
chr7 (595-648)||(4796707-4796760)
chr7 (583-654)||(2075231-2075303)
chr7 (583-654)||(7464513-7464585)
chr7 (604-648)||(14069833-14069877)
chr7 (604-648)||(27347941-27347985)
chr7 (604-648)||(41317434-41317478)
chr7 (594-645)||(55955-56005)
chr7 (109-140)||(6628853-6628884)
chr7 (142-189)||(12484976-12485023)
chr7 (142-189)||(12506407-12506454)
chr7 (109-140)||(12657667-12657698)
chr7 (594-648)||(2647735-2647789)
chr7 (594-648)||(9185204-9185258)
chr7 (109-139)||(12485044-12485074)
chr7 (109-139)||(12506475-12506505)
chr7 (473-654)||(25351360-25351539)
chr7 (594-648)||(28617264-28617318)
chr7 (594-648)||(33332489-33332543)
chr7 (594-648)||(35960820-35960874)
chr7 (583-624)||(44010775-44010816)
chr7 (583-654)||(2121015-2121087)
chr7 (583-650)||(3320049-3320117)
chr7 (583-650)||(3324797-3324865)
chr7 (604-648)||(8153466-8153510)
chr7 (604-648)||(12097867-12097911)
chr7 (604-648)||(18126768-18126812)
chr7 (583-650)||(25405508-25405576)
chr7 (604-648)||(30814560-30814604)
chr7 (604-648)||(31732969-31733013)
chr7 (604-648)||(41649011-41649055)
chr7 (604-648)||(43864368-43864412)
chr7 (591-654)||(44512520-44512583)
chr7 (604-648)||(48489555-48489599)
[»] chr5 (119 HSPs)
chr5 (67-675)||(18511185-18511797)
chr5 (62-663)||(25803707-25804318)
chr5 (67-675)||(18509291-18509902)
chr5 (62-669)||(26097421-26098031)
chr5 (61-663)||(27912218-27912830)
chr5 (61-663)||(18468697-18469303)
chr5 (61-663)||(27910134-27910744)
chr5 (70-662)||(18596334-18596939)
chr5 (62-663)||(15551925-15552539)
chr5 (142-663)||(18466453-18466978)
chr5 (82-663)||(10586549-10587126)
chr5 (61-520)||(26098379-26098842)
chr5 (317-670)||(2818313-2818670)
chr5 (195-669)||(40221340-40221823)
chr5 (317-669)||(21947972-21948326)
chr5 (321-656)||(10529091-10529429)
chr5 (317-669)||(25904048-25904403)
chr5 (317-663)||(25921458-25921807)
chr5 (317-657)||(17072828-17073172)
chr5 (321-669)||(39854433-39854783)
chr5 (317-663)||(2174864-2175212)
chr5 (317-663)||(4236574-4236922)
chr5 (319-669)||(10474302-10474655)
chr5 (317-668)||(24126801-24127155)
chr5 (317-663)||(38882050-38882399)
chr5 (317-669)||(1189586-1189948)
chr5 (318-675)||(16092172-16092537)
chr5 (317-663)||(16776102-16776451)
chr5 (317-670)||(31472590-31472947)
chr5 (355-663)||(6745052-6745362)
chr5 (317-675)||(6756439-6756798)
chr5 (317-675)||(12555896-12556257)
chr5 (323-663)||(17818477-17818817)
chr5 (317-654)||(37705774-37706114)
chr5 (317-663)||(31545025-31545374)
chr5 (355-663)||(34477038-34477350)
chr5 (321-663)||(6747253-6747598)
chr5 (317-670)||(36402306-36402662)
chr5 (317-663)||(31542680-31543028)
chr5 (355-663)||(34479403-34479715)
chr5 (355-663)||(21684437-21684747)
chr5 (317-668)||(695834-696177)
chr5 (317-651)||(31179368-31179705)
chr5 (394-675)||(658329-658610)
chr5 (317-663)||(39397978-39398326)
chr5 (62-344)||(3373348-3373630)
chr5 (324-675)||(2954368-2954722)
chr5 (323-668)||(21288715-21289060)
chr5 (317-675)||(31465962-31466312)
chr5 (317-583)||(34530731-34531000)
chr5 (439-663)||(41585729-41585956)
chr5 (450-668)||(20505823-20506042)
chr5 (278-651)||(6661181-6661555)
chr5 (62-245)||(21288529-21288713)
chr5 (434-669)||(2723964-2724193)
chr5 (317-531)||(20044955-20045172)
chr5 (317-527)||(20042995-20043208)
chr5 (451-663)||(39798126-39798341)
chr5 (439-663)||(4410090-4410316)
chr5 (317-658)||(36208525-36208865)
chr5 (69-214)||(17415748-17415893)
chr5 (482-655)||(10749814-10749986)
chr5 (317-663)||(9020167-9020514)
chr5 (482-655)||(10757291-10757462)
chr5 (482-663)||(15354560-15354739)
chr5 (482-663)||(23665158-23665337)
chr5 (482-663)||(23741844-23742023)
chr5 (482-663)||(23793250-23793429)
chr5 (482-663)||(15356836-15357015)
chr5 (317-454)||(20507659-20507796)
chr5 (483-663)||(3373122-3373301)
chr5 (482-663)||(38960117-38960296)
chr5 (359-668)||(20053834-20054136)
chr5 (62-166)||(6661929-6662033)
chr5 (558-669)||(26098267-26098379)
chr5 (276-411)||(41585946-41586082)
chr5 (142-359)||(15143262-15143475)
chr5 (478-651)||(15143574-15143750)
chr5 (61-141)||(40221281-40221361)
chr5 (321-412)||(4410006-4410101)
chr5 (372-637)||(17413176-17413441)
chr5 (585-668)||(20043206-20043289)
chr5 (62-116)||(15143220-15143274)
chr5 (72-145)||(5779144-5779217)
chr5 (499-584)||(42770940-42771025)
chr5 (61-116)||(18466410-18466465)
chr5 (317-537)||(42770719-42770934)
chr5 (540-651)||(15445263-15445375)
chr5 (478-662)||(4897837-4898023)
chr5 (564-652)||(23667513-23667601)
chr5 (583-654)||(42238376-42238448)
chr5 (594-648)||(9353371-9353425)
chr5 (594-648)||(28832263-28832317)
chr5 (594-648)||(36932389-36932443)
chr5 (317-366)||(2723912-2723961)
chr5 (599-648)||(14520234-14520283)
chr5 (599-648)||(17004004-17004053)
chr5 (564-611)||(2144599-2144647)
chr5 (604-648)||(19806487-19806531)
chr5 (583-654)||(22672950-22673022)
chr5 (583-654)||(25445612-25445684)
chr5 (142-215)||(32520241-32520316)
chr5 (604-648)||(32636948-32636992)
chr5 (109-143)||(2532750-2532784)
chr5 (594-648)||(10281755-10281809)
chr5 (594-648)||(11917011-11917065)
chr5 (594-648)||(15464536-15464590)
chr5 (594-648)||(19588750-19588804)
chr5 (598-648)||(24553549-24553599)
chr5 (583-624)||(10627482-10627523)
chr5 (604-645)||(13488327-13488368)
chr5 (583-651)||(17841246-17841315)
chr5 (603-648)||(31300644-31300689)
chr5 (604-648)||(533893-533937)
chr5 (583-650)||(1170926-1170994)
chr5 (317-364)||(2144878-2144926)
chr5 (591-654)||(28786528-28786592)
chr5 (583-650)||(35385450-35385518)
chr5 (604-648)||(42428430-42428474)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (62-670)||(11451-12061)
[»] chr2 (114 HSPs)
chr2 (62-675)||(42923482-42924094)
chr2 (62-663)||(23452222-23452829)
chr2 (62-663)||(42452449-42453050)
chr2 (61-663)||(35215571-35216185)
chr2 (62-663)||(35217948-35218565)
chr2 (317-663)||(19007561-19007910)
chr2 (317-669)||(22287315-22287670)
chr2 (317-669)||(6264127-6264479)
chr2 (317-663)||(19504331-19504679)
chr2 (317-669)||(40032032-40032392)
chr2 (316-663)||(19501996-19502346)
chr2 (317-669)||(21520672-21521029)
chr2 (317-675)||(28196558-28196917)
chr2 (321-663)||(45279969-45280315)
chr2 (317-663)||(13910030-13910378)
chr2 (317-663)||(27104720-27105067)
chr2 (317-669)||(6258796-6259149)
chr2 (317-663)||(42064436-42064785)
chr2 (317-675)||(43623553-43623902)
chr2 (317-670)||(11739537-11739894)
chr2 (317-675)||(17848366-17848722)
chr2 (317-669)||(17849038-17849393)
chr2 (317-669)||(14837194-14837544)
chr2 (317-663)||(24162208-24162546)
chr2 (324-663)||(34979562-34979906)
chr2 (319-669)||(3022086-3022448)
chr2 (317-625)||(45239000-45239315)
chr2 (317-652)||(31732772-31733099)
chr2 (317-669)||(44289046-44289402)
chr2 (317-651)||(11578104-11578438)
chr2 (317-678)||(18800283-18800636)
chr2 (317-570)||(15539553-15539809)
chr2 (446-675)||(5375319-5375550)
chr2 (317-668)||(22874063-22874406)
chr2 (61-346)||(27583631-27583908)
chr2 (506-669)||(22407433-22407596)
chr2 (406-668)||(28459170-28459435)
chr2 (317-469)||(22407591-22407743)
chr2 (317-651)||(20146604-20146941)
chr2 (482-663)||(36558849-36559029)
chr2 (482-663)||(36561126-36561306)
chr2 (72-228)||(28568584-28568740)
chr2 (317-473)||(22163125-22163281)
chr2 (317-651)||(17897242-17897576)
chr2 (482-663)||(45332166-45332346)
chr2 (559-675)||(22162995-22163111)
chr2 (529-669)||(22707730-22707872)
chr2 (354-549)||(38020160-38020348)
chr2 (62-191)||(27136368-27136505)
chr2 (519-645)||(7462950-7463077)
chr2 (321-451)||(5377629-5377763)
chr2 (296-651)||(37962938-37963283)
chr2 (528-669)||(23870951-23871092)
chr2 (69-157)||(34575608-34575696)
chr2 (72-228)||(15693583-15693755)
chr2 (452-651)||(40699429-40699634)
chr2 (317-668)||(35107221-35107571)
chr2 (317-410)||(38020064-38020157)
chr2 (72-220)||(41303457-41303623)
chr2 (72-137)||(28568346-28568411)
chr2 (478-597)||(20589775-20589896)
chr2 (406-578)||(27136195-27136368)
chr2 (142-213)||(39286971-39287042)
chr2 (317-377)||(12342684-12342744)
chr2 (143-228)||(7502638-7502723)
chr2 (167-263)||(34575528-34575617)
chr2 (485-651)||(13828338-13828507)
chr2 (624-669)||(15539508-15539553)
chr2 (439-535)||(38414194-38414291)
chr2 (76-140)||(39286892-39286952)
chr2 (142-221)||(41304806-41304884)
chr2 (594-648)||(14699046-14699100)
chr2 (346-411)||(38414281-38414340)
chr2 (604-648)||(17057369-17057413)
chr2 (604-648)||(17085352-17085396)
chr2 (583-654)||(38191128-38191200)
chr2 (75-126)||(7502582-7502633)
chr2 (604-647)||(17490149-17490192)
chr2 (317-364)||(40699231-40699278)
chr2 (594-648)||(8390189-8390243)
chr2 (594-648)||(13569332-13569386)
chr2 (594-648)||(20522224-20522278)
chr2 (72-145)||(41304898-41304964)
chr2 (601-654)||(1345587-1345640)
chr2 (601-654)||(2838076-2838129)
chr2 (564-661)||(10942497-10942597)
chr2 (564-661)||(10948366-10948466)
chr2 (604-648)||(723744-723788)
chr2 (583-654)||(27517633-27517705)
chr2 (604-648)||(33162450-33162494)
chr2 (604-648)||(34139770-34139814)
chr2 (604-648)||(36318009-36318053)
chr2 (604-648)||(39284960-39285004)
chr2 (583-650)||(39680160-39680228)
chr2 (583-650)||(39687098-39687166)
chr2 (605-648)||(11151591-11151634)
chr2 (594-648)||(2869732-2869786)
chr2 (594-648)||(8040064-8040118)
chr2 (594-648)||(10445483-10445537)
chr2 (317-359)||(20147040-20147082)
chr2 (594-648)||(28259216-28259270)
chr2 (593-654)||(30479120-30479182)
chr2 (594-648)||(31056048-31056102)
chr2 (594-648)||(34682373-34682427)
chr2 (372-528)||(43139356-43139509)
chr2 (583-624)||(12781246-12781287)
chr2 (583-650)||(2736320-2736388)
chr2 (604-648)||(11067429-11067473)
chr2 (604-648)||(14633825-14633869)
chr2 (583-650)||(17462551-17462619)
chr2 (473-528)||(17921777-17921833)
chr2 (604-648)||(36773686-36773730)
chr2 (604-648)||(38312364-38312408)
chr2 (583-650)||(45679838-45679906)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (62-670)||(78883-79495)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (61-654)||(51708-52307)
scaffold0005 (321-663)||(183626-183969)
scaffold0005 (54-133)||(50151-50230)
scaffold0005 (583-654)||(50235-50308)
scaffold0005 (142-184)||(170076-170118)
[»] chr4 (160 HSPs)
chr4 (61-654)||(14787423-14788022)
chr4 (62-644)||(56030189-56030770)
chr4 (62-663)||(24347959-24348566)
chr4 (62-670)||(17662223-17662826)
chr4 (62-663)||(44599823-44600428)
chr4 (61-651)||(22132389-22132988)
chr4 (62-651)||(22134615-22135219)
chr4 (61-454)||(5100742-5101133)
chr4 (317-670)||(38928155-38928512)
chr4 (317-661)||(48486318-48486665)
chr4 (321-670)||(40637077-40637429)
chr4 (317-670)||(24888795-24889151)
chr4 (317-670)||(22802712-22803068)
chr4 (317-663)||(5198419-5198768)
chr4 (321-663)||(14633323-14633666)
chr4 (317-675)||(33415461-33415821)
chr4 (317-675)||(40091388-40091749)
chr4 (317-670)||(22800840-22801196)
chr4 (317-669)||(24878988-24879344)
chr4 (317-669)||(24880450-24880806)
chr4 (317-663)||(47274726-47275073)
chr4 (317-668)||(19095881-19096236)
chr4 (317-663)||(11434954-11435302)
chr4 (317-663)||(37089357-37089708)
chr4 (169-668)||(19322547-19323048)
chr4 (321-663)||(8631404-8631753)
chr4 (317-669)||(12400786-12401141)
chr4 (317-663)||(22044376-22044724)
chr4 (317-663)||(22046671-22047019)
chr4 (317-675)||(36921466-36921829)
chr4 (317-663)||(9148250-9148600)
chr4 (317-669)||(12395824-12396179)
chr4 (317-669)||(36919563-36919921)
chr4 (317-675)||(16453308-16453670)
chr4 (317-675)||(36378291-36378653)
chr4 (317-668)||(619428-619781)
chr4 (321-663)||(6764842-6765192)
chr4 (317-663)||(51015245-51015593)
chr4 (321-661)||(47868404-47868747)
chr4 (317-663)||(7941318-7941671)
chr4 (78-668)||(30136331-30136903)
chr4 (317-663)||(18847152-18847500)
chr4 (317-663)||(38409198-38409552)
chr4 (321-663)||(2484858-2485203)
chr4 (190-663)||(53404998-53405481)
chr4 (276-663)||(18709149-18709547)
chr4 (317-663)||(11006222-11006575)
chr4 (317-663)||(9174131-9174480)
chr4 (317-663)||(31849584-31849933)
chr4 (317-663)||(37313050-37313400)
chr4 (318-661)||(9176461-9176807)
chr4 (355-663)||(11008553-11008862)
chr4 (317-663)||(16934128-16934477)
chr4 (391-663)||(26085962-26086236)
chr4 (317-663)||(16931774-16932123)
chr4 (355-663)||(22780358-22780669)
chr4 (355-663)||(22782723-22783034)
chr4 (320-651)||(41997494-41997828)
chr4 (317-628)||(13543953-13544272)
chr4 (317-589)||(5637524-5637803)
chr4 (276-644)||(47210756-47211122)
chr4 (317-589)||(3824629-3824907)
chr4 (394-675)||(36380425-36380710)
chr4 (317-651)||(18409344-18409680)
chr4 (431-654)||(16455354-16455581)
chr4 (317-651)||(18537470-18537805)
chr4 (401-669)||(27499128-27499396)
chr4 (317-668)||(8756231-8756584)
chr4 (317-543)||(3937314-3937542)
chr4 (317-651)||(18534828-18535163)
chr4 (473-669)||(13547312-13547508)
chr4 (492-663)||(4215483-4215654)
chr4 (62-212)||(47211158-47211308)
chr4 (62-642)||(10112626-10113198)
chr4 (512-663)||(5635461-5635612)
chr4 (321-570)||(52942537-52942777)
chr4 (512-663)||(11437560-11437710)
chr4 (473-669)||(2891449-2891646)
chr4 (317-533)||(6132872-6133090)
chr4 (398-651)||(38890221-38890476)
chr4 (317-473)||(38270164-38270320)
chr4 (62-228)||(9022060-9022225)
chr4 (317-638)||(15032557-15032870)
chr4 (317-473)||(24446762-24446913)
chr4 (516-663)||(5101130-5101276)
chr4 (62-263)||(38890517-38890701)
chr4 (317-435)||(2891315-2891434)
chr4 (563-669)||(47563009-47563115)
chr4 (317-651)||(28453686-28454020)
chr4 (70-216)||(9863507-9863650)
chr4 (453-651)||(12102221-12102425)
chr4 (67-163)||(19322413-19322510)
chr4 (540-655)||(49088794-49088911)
chr4 (312-651)||(9863702-9864049)
chr4 (478-651)||(16185831-16186006)
chr4 (551-675)||(24446627-24446738)
chr4 (54-133)||(14789500-14789579)
chr4 (533-670)||(25357859-25357998)
chr4 (72-228)||(38209098-38209259)
chr4 (317-607)||(40998990-40999281)
chr4 (583-654)||(14789422-14789495)
chr4 (142-228)||(54929094-54929180)
chr4 (583-675)||(6133105-6133197)
chr4 (453-611)||(31983564-31983727)
chr4 (473-637)||(3982186-3982354)
chr4 (142-221)||(10979676-10979755)
chr4 (78-140)||(5516771-5516833)
chr4 (454-668)||(47150873-47151092)
chr4 (609-679)||(52942457-52942527)
chr4 (614-668)||(3937254-3937308)
chr4 (583-663)||(5336765-5336846)
chr4 (76-145)||(29609914-29609983)
chr4 (317-388)||(16186099-16186171)
chr4 (594-648)||(10047383-10047437)
chr4 (594-648)||(39245998-39246052)
chr4 (594-647)||(6743454-6743507)
chr4 (564-651)||(26557833-26557922)
chr4 (145-202)||(29609840-29609897)
chr4 (583-654)||(4884990-4885062)
chr4 (583-654)||(8529383-8529455)
chr4 (596-648)||(54867188-54867239)
chr4 (72-143)||(54929198-54929267)
chr4 (628-663)||(3824595-3824630)
chr4 (594-648)||(5269230-5269284)
chr4 (142-184)||(14647172-14647214)
chr4 (317-387)||(16455286-16455356)
chr4 (317-388)||(12102089-12102162)
chr4 (583-651)||(31300540-31300608)
chr4 (594-647)||(36315268-36315321)
chr4 (594-647)||(36329477-36329530)
chr4 (583-654)||(4556054-4556126)
chr4 (604-648)||(12739550-12739594)
chr4 (583-654)||(18587082-18587154)
chr4 (604-648)||(26175636-26175680)
chr4 (604-648)||(36463389-36463433)
chr4 (583-654)||(36769595-36769667)
chr4 (500-540)||(38270118-38270158)
chr4 (604-648)||(48893638-48893682)
chr4 (604-648)||(52467354-52467398)
chr4 (317-364)||(25357636-25357683)
chr4 (594-648)||(5143263-5143317)
chr4 (594-648)||(5396710-5396764)
chr4 (594-648)||(31985673-31985726)
chr4 (594-648)||(38152478-38152532)
chr4 (564-651)||(3578668-3578756)
chr4 (583-624)||(15831257-15831298)
chr4 (604-648)||(5429803-5429847)
chr4 (147-191)||(5516703-5516747)
chr4 (604-648)||(5871944-5871988)
chr4 (604-648)||(9927458-9927502)
chr4 (583-650)||(11853664-11853732)
chr4 (604-648)||(12743925-12743969)
chr4 (604-648)||(12745314-12745358)
chr4 (583-654)||(15317074-15317145)
chr4 (583-654)||(16688934-16689006)
chr4 (604-648)||(27416965-27417009)
chr4 (317-361)||(36380373-36380417)
chr4 (604-648)||(46147391-46147435)
chr4 (604-648)||(47038411-47038455)
chr4 (317-364)||(52043716-52043764)
[»] chr8 (102 HSPs)
chr8 (67-669)||(41382424-41383018)
chr8 (61-669)||(41384492-41385100)
chr8 (62-663)||(15808962-15809568)
chr8 (62-663)||(28283206-28283813)
chr8 (62-663)||(3873750-3874360)
chr8 (62-656)||(608470-609077)
chr8 (62-663)||(43529871-43530465)
chr8 (276-663)||(32339264-32339659)
chr8 (317-675)||(1225167-1225529)
chr8 (317-675)||(30480476-30480837)
chr8 (317-675)||(15072711-15073073)
chr8 (317-675)||(14807752-14808123)
chr8 (317-675)||(14419163-14419525)
chr8 (317-661)||(27106884-27107231)
chr8 (317-663)||(27829298-27829646)
chr8 (317-662)||(15067982-15068330)
chr8 (317-670)||(28251545-28251901)
chr8 (317-663)||(4424019-4424368)
chr8 (317-663)||(27826987-27827335)
chr8 (317-659)||(27911016-27911359)
chr8 (317-659)||(27957435-27957778)
chr8 (317-655)||(13858477-13858818)
chr8 (317-663)||(18810709-18811057)
chr8 (355-663)||(22684638-22684952)
chr8 (317-668)||(25952522-25952876)
chr8 (317-668)||(36865538-36865892)
chr8 (317-663)||(44720844-44721193)
chr8 (276-651)||(24873178-24873563)
chr8 (317-668)||(5372156-5372511)
chr8 (317-669)||(33541389-33541722)
chr8 (355-663)||(43079642-43079952)
chr8 (355-663)||(43082012-43082323)
chr8 (317-663)||(18812894-18813231)
chr8 (317-668)||(15185694-15186044)
chr8 (317-548)||(14477277-14477511)
chr8 (317-651)||(21482323-21482649)
chr8 (406-675)||(15956051-15956320)
chr8 (62-220)||(32339094-32339252)
chr8 (344-642)||(21480542-21480832)
chr8 (317-651)||(31162214-31162551)
chr8 (317-509)||(5622877-5623072)
chr8 (317-473)||(26775202-26775358)
chr8 (61-179)||(3265635-3265753)
chr8 (347-654)||(3005624-3005931)
chr8 (317-473)||(35872561-35872712)
chr8 (213-411)||(181434-181632)
chr8 (347-531)||(37214317-37214514)
chr8 (317-427)||(12517248-12517360)
chr8 (317-416)||(3886153-3886252)
chr8 (454-651)||(31578273-31578476)
chr8 (519-651)||(2468126-2468259)
chr8 (451-651)||(31035252-31035459)
chr8 (439-612)||(181622-181798)
chr8 (551-675)||(35872426-35872537)
chr8 (593-661)||(37214251-37214319)
chr8 (582-675)||(14477519-14477613)
chr8 (317-473)||(31035068-31035223)
chr8 (372-580)||(31573794-31574000)
chr8 (72-143)||(13986304-13986374)
chr8 (317-388)||(2468361-2468432)
chr8 (142-228)||(11701364-11701447)
chr8 (72-143)||(30679186-30679256)
chr8 (594-648)||(19752433-19752487)
chr8 (474-651)||(6376149-6376328)
chr8 (604-648)||(12702634-12702678)
chr8 (632-675)||(181798-181841)
chr8 (145-216)||(13986214-13986285)
chr8 (594-648)||(4696635-4696689)
chr8 (594-648)||(9765858-9765912)
chr8 (604-654)||(10930193-10930243)
chr8 (473-641)||(17847685-17847848)
chr8 (594-648)||(26403269-26403323)
chr8 (553-649)||(16833789-16833886)
chr8 (583-650)||(4812486-4812554)
chr8 (558-609)||(14419734-14419786)
chr8 (604-648)||(15212910-15212954)
chr8 (583-654)||(17799418-17799490)
chr8 (583-654)||(23179555-23179627)
chr8 (604-648)||(27811402-27811446)
chr8 (583-650)||(28328023-28328091)
chr8 (604-648)||(33352274-33352318)
chr8 (604-648)||(40321204-40321248)
chr8 (604-647)||(4733830-4733873)
chr8 (317-352)||(6375990-6376025)
chr8 (540-612)||(3896048-3896122)
chr8 (594-648)||(5702522-5702576)
chr8 (594-648)||(7412345-7412399)
chr8 (594-648)||(23799616-23799670)
chr8 (594-648)||(31071268-31071322)
chr8 (114-143)||(27820149-27820178)
chr8 (604-645)||(40221869-40221910)
chr8 (604-648)||(4743214-4743258)
chr8 (604-648)||(5689395-5689439)
chr8 (604-648)||(6599096-6599140)
chr8 (604-648)||(6674549-6674593)
chr8 (72-116)||(11701435-11701479)
chr8 (583-650)||(16757266-16757334)
chr8 (583-650)||(25684758-25684826)
chr8 (583-650)||(28332746-28332814)
chr8 (583-650)||(28890881-28890949)
chr8 (583-650)||(28895618-28895686)
chr8 (604-648)||(43036547-43036591)
[»] chr6 (101 HSPs)
chr6 (62-663)||(2628871-2629479)
chr6 (62-663)||(19704552-19705165)
chr6 (62-663)||(30966923-30967530)
chr6 (62-661)||(30034590-30035196)
chr6 (62-663)||(12195500-12196104)
chr6 (62-663)||(26932546-26933158)
chr6 (317-670)||(11983007-11983363)
chr6 (317-669)||(9019906-9020261)
chr6 (321-663)||(28241306-28241651)
chr6 (317-668)||(13057174-13057529)
chr6 (317-675)||(3629838-3630198)
chr6 (317-659)||(3390359-3390705)
chr6 (321-663)||(1230234-1230579)
chr6 (317-668)||(15541120-15541474)
chr6 (317-663)||(14507161-14507509)
chr6 (323-663)||(14458752-14459093)
chr6 (317-668)||(13039734-13040089)
chr6 (317-669)||(3233704-3234064)
chr6 (317-668)||(25477254-25477616)
chr6 (67-581)||(17011784-17012287)
chr6 (70-445)||(17852275-17852650)
chr6 (318-661)||(3631926-3632271)
chr6 (355-663)||(4816216-4816527)
chr6 (317-656)||(15532674-15533015)
chr6 (317-661)||(30728811-30729162)
chr6 (317-669)||(32279977-32280332)
chr6 (317-653)||(20915351-20915692)
chr6 (317-605)||(15530166-15530456)
chr6 (355-663)||(26065004-26065310)
chr6 (355-663)||(26084973-26085279)
chr6 (317-675)||(24338421-24338782)
chr6 (62-263)||(5275727-5275928)
chr6 (62-339)||(18317751-18318028)
chr6 (317-669)||(12161537-12161888)
chr6 (62-651)||(22857949-22858536)
chr6 (317-583)||(22490619-22490889)
chr6 (317-538)||(19227518-19227742)
chr6 (317-651)||(3027848-3028184)
chr6 (317-668)||(14466313-14466658)
chr6 (436-651)||(5273213-5273431)
chr6 (457-675)||(1069691-1069913)
chr6 (482-663)||(26066109-26066289)
chr6 (348-651)||(15719665-15719961)
chr6 (482-663)||(26068380-26068560)
chr6 (317-464)||(32447502-32447650)
chr6 (482-663)||(29754694-29754874)
chr6 (482-663)||(33309006-33309185)
chr6 (317-461)||(1072067-1072211)
chr6 (67-228)||(20526551-20526708)
chr6 (318-651)||(16455421-16455757)
chr6 (482-663)||(33311275-33311454)
chr6 (453-668)||(12186051-12186271)
chr6 (403-668)||(15367101-15367365)
chr6 (317-436)||(8995459-8995578)
chr6 (323-464)||(13870609-13870749)
chr6 (512-651)||(15346525-15346664)
chr6 (566-669)||(10584227-10584331)
chr6 (317-651)||(19696421-19696759)
chr6 (452-651)||(26945258-26945463)
chr6 (84-228)||(30445243-30445404)
chr6 (317-428)||(10584106-10584212)
chr6 (317-473)||(15346371-15346515)
chr6 (72-145)||(30443022-30443097)
chr6 (564-668)||(12911426-12911531)
chr6 (529-668)||(25465571-25465710)
chr6 (454-670)||(25078536-25078755)
chr6 (564-668)||(12937174-12937278)
chr6 (583-654)||(17694846-17694918)
chr6 (142-228)||(30443111-30443195)
chr6 (583-661)||(30443537-30443616)
chr6 (512-640)||(30445701-30445832)
chr6 (594-648)||(5572280-5572334)
chr6 (540-651)||(28037722-28037838)
chr6 (583-654)||(22342795-22342867)
chr6 (583-654)||(25941785-25941857)
chr6 (594-648)||(5017508-5017562)
chr6 (594-648)||(5757517-5757571)
chr6 (594-648)||(10077204-10077258)
chr6 (594-648)||(31979517-31979571)
chr6 (317-388)||(12186330-12186403)
chr6 (593-642)||(24436009-24436058)
chr6 (604-648)||(603088-603132)
chr6 (583-654)||(3577484-3577555)
chr6 (583-654)||(12166140-12166212)
chr6 (604-648)||(33211185-33211229)
chr6 (583-650)||(35201325-35201393)
chr6 (76-119)||(12158532-12158575)
chr6 (575-651)||(11262699-11262777)
chr6 (594-648)||(21356040-21356094)
chr6 (594-648)||(31936591-31936645)
chr6 (583-667)||(13883590-13883674)
chr6 (391-447)||(17904566-17904619)
chr6 (583-651)||(25465896-25465965)
chr6 (96-140)||(3833176-3833220)
chr6 (388-447)||(4595046-4595102)
chr6 (583-654)||(13467461-13467532)
chr6 (583-650)||(13878842-13878910)
chr6 (604-648)||(16569146-16569190)
chr6 (583-650)||(16786034-16786102)
chr6 (583-650)||(17038350-17038418)
chr6 (583-654)||(33215943-33216015)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (62-612)||(1735-2293)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (321-663)||(41468-41813)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (317-663)||(3951-4298)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (317-663)||(69277-69629)
scaffold0025 (317-464)||(73210-73361)
scaffold0025 (428-473)||(73165-73210)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (317-669)||(79813-80168)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (355-654)||(14376-14678)
scaffold0131 (317-670)||(14973-15327)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (317-663)||(6153-6502)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (317-663)||(2834-3182)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (355-663)||(29163-29473)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (355-663)||(33-344)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (317-675)||(85185-85546)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (205-651)||(1638-2080)
scaffold0468 (67-177)||(2070-2180)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (430-663)||(1438-1673)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (296-651)||(15817-16174)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (317-538)||(35594-35817)
scaffold0011 (583-675)||(35817-35909)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (316-651)||(16646-16982)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (482-663)||(22239-22418)
scaffold0140 (482-663)||(24514-24693)
scaffold0140 (594-648)||(8458-8512)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (276-642)||(4727-5095)
scaffold0133 (68-210)||(4552-4694)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (61-156)||(1-96)
scaffold1674 (610-660)||(1439-1489)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (321-464)||(1013-1161)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (594-661)||(4666-4733)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (145-215)||(57836-57905)
scaffold0008 (540-624)||(57452-57537)
scaffold0008 (72-143)||(57926-57995)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (596-648)||(5687-5739)
scaffold0006 (594-648)||(2496-2550)
scaffold0006 (604-648)||(149097-149141)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (99-140)||(2232-2273)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (599-648)||(36876-36925)
scaffold0087 (594-648)||(44000-44054)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (583-654)||(16980-17052)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (604-648)||(20415-20459)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (72-122)||(10443-10493)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (583-650)||(3068-3136)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (583-650)||(16441-16509)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 504; Significance: 0; HSPs: 176)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 676
Target Start/End: Original strand, 51942998 - 51943657
Alignment:
Q  18 cgttgtactttagaggagcatggaatgagaagtttgatgtttcatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51942998 cgttgtactttagaggagcatggaatgagaagtttgatgtttcgtgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataa 51943097  T
Q  118 aagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51943098 aagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttga 51943197  T
Q  218 aagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata- 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  51943198 aagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcattgaaggagaaagaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgatttatac 51943295  T
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943296 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 51943395  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943396 agtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggct 51943495  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  51943496 ttaggtagaattaggcgggagac-ttttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccc 51943594  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 676  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51943595 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttctcttctt 51943657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 675
Target Start/End: Original strand, 1313082 - 1313695
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1313082 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 1313181  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1313182 acaataaatatatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 1313281  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1313282 agaaaaaaaaa---gtatctttagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagat 1313378  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313379 agagggggctgaaacaa-ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 1313477  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  1313478 accttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 1313577  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313578 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1313677  T
Q  658 tgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  1313678 tgttctctcttcttttct 1313695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 53918250 - 53917635
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  53918250 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 53918151  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53918150 acaataaatatatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 53918051  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  53918050 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagat 53917953  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917952 ggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 53917853  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  53917852 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 53917753  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917752 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 53917653  T
Q  658 tgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  53917652 tgttctctcttcttttct 53917635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 53916083 - 53915467
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53916083 atgttgtagtatgactcaaaatttgagggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 53915984  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53915983 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 53915884  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    |||            ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  53915883 gagaaaaaaaaac--gtatcttgagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaaga 53915786  T
Q  360 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53915785 tagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatt 53915686  T
Q  460 cacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 556  Q
     |||| | |||||||||    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53915685 taccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 53915586  T
Q  557 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 656  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53915585 tatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattctttt 53915486  T
Q  657 gtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  53915485 gtgttctctcttcttttct 53915467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 25533107 - 25533716
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25533107 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatgg 25533206  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25533207 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 25533306  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            |||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          
T  25533307 agaaaaaaac----gtatcttcagtgtgatatttgttctaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 25533402  T
Q  355 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 452  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25533403 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagg 25533502  T
Q  453 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25533503 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25533602  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25533603 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 25533702  T
Q  650 ttcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||    
T  25533703 ttcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 663
Target Start/End: Original strand, 746418 - 747031
Alignment:
Q  58 ttcatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746418 ttcatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 746517  T
Q  158 atggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  746518 atggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactg 746617  T
Q  258 aaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-- 354  Q
    ||||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |      
T  746618 aaggagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttg 746715  T
Q  355 ----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 450  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  746716 agagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgt 746815  T
Q  451 gggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgt 546  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  746816 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 746915  T
Q  547 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 646  Q
    ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  746916 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 747014  T
Q  647 aaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||  ||||||||||    
T  747015 aaatttctttgtgttct 747031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Original strand, 457949 - 458558
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  457949 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtg 458048  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  458049 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 458148  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||           | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    |    
T  458149 gagaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgaga 458247  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  458248 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 458347  T
Q  456 gattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  458348 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 458447  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  458448 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaata 458546  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
      ||||||||||    
T  458547 tctttgtgttct 458558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 455573 - 456181
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  455573 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtgg 455672  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  455673 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 455772  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||           | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    ||    
T  455773 agaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgcggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagag 455871  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  455872 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 455971  T
Q  457 attcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  455972 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 456071  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||      
T  456072 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatat 456170  T
Q  653 ttttgtgttct 663  Q
     ||||||||||    
T  456171 ctttgtgttct 456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4104483 - 4103879
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4104483 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatactttatgctgaaaatatatttatgg 4104384  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4104383 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 4104284  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||           | ||||   ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  4104283 agaaaaaaaaaacg-tatc---agtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 4104188  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4104187 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 4104088  T
Q  457 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4104087 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 4103988  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103987 tgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 4103889  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  4103888 tttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10622129 - 10621513
Alignment:
Q  60 catgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10622129 catgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttat 10622030  T
Q  160 ggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10622029 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 10621930  T
Q  260 ggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct---- 354  Q
    ||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |        
T  10621929 ggagaaaaaaaac---gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgag 10621833  T
Q  355 --------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 446  Q
            |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10621832 agagagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggt 10621733  T
Q  447 ttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 542  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621732 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 10621633  T
Q  543 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 642  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  10621632 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggt 10621534  T
Q  643 caacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  10621533 caacaaatttctttgtgttct 10621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 679
Target Start/End: Original strand, 42991952 - 42992560
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42991952 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaaggtttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 42992051  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42992052 gacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 42992151  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||            |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| |    |    
T  42992152 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtaatattaattccaaatttatgagttatacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaaga 42992249  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42992250 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 42992349  T
Q  456 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    ||||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||| | || ||||||||||               || |||||||||||||    
T  42992350 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactca 42992433  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42992434 ttgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattt 42992533  T
Q  653 ttttgtgttctatcttctcttcttctc 679  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  42992534 ttttgtgttctctctccttttcttctc 42992560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 321 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 4308609 - 4308257
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308609 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 4308510  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  4308509 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgg 4308410  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4308409 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagac 4308310  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4308309 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 4308257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 317 - 676
Target Start/End: Original strand, 45882864 - 45883227
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882864 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 45882963  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  45882964 attttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggact 45883063  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45883064 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 45883163  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45883164 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctt 45883227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 43423795 - 43423434
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423795 ttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43423696  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43423695 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 43423596  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||      
T  43423595 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctg 43423496  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43423495 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 43423434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 62 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27636212 - 27635830
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636212 tgttgtagtatgatttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaatattagtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27636113  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27636112 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 27636013  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata--ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27636012 agaaaaaaat----gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatattttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgaga 27635917  T
Q  360 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635916 tagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 18099502 - 18099153
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18099502 ttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 18099404  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  18099403 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 18099304  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18099303 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 18099204  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099203 tagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10956010
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccacc 10956060  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956059 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1627015 - 1626660
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627015 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 1626916  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  1626915 agtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggact 1626816  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1626815 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgccc 1626716  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1626715 agactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1626660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 355 - 670
Target Start/End: Original strand, 30005804 - 30006122
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005804 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 30005903  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30005904 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 30006003  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006004 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30006103  T
Q  652 cttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  30006104 cttttgtgttctctcttct 30006122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 48362002 - 48361641
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48362002 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 48361904  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  48361903 agtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggct 48361804  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  48361803 tttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctccccc 48361704  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 676  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48361703 agactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctt 48361641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421386
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctccccc 43421448  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43421447 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 43421386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 3314609 - 3314965
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3314609 ttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 3314708  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  3314709 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggct 3314808  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314809 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 3314908  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3314909 caaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Original strand, 11170329 - 11170679
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170329 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11170428  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  11170429 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggact 11170528  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11170529 ttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 11170628  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcta 664  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11170629 agactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcta 11170679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958306
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||   ||    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 10958356  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10958355 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 10958306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 18097233 - 18096876
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18097233 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 18097134  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  18097133 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 18097034  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18097033 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccc 18096934  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18096933 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctctcttct 18096876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 28102334 - 28101979
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||  | ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102334 ttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 28102235  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28102234 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 28102135  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  28102134 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctcccca 28102035  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28102034 aagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28101979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 355 - 679
Target Start/End: Original strand, 42990267 - 42990594
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42990267 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggt 42990366  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42990367 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 42990466  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990467 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42990566  T
Q  652 cttttgtgttctatcttctcttcttctc 679  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  42990567 cttttgtgttctctctccttttcttctc 42990594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 880784 - 880422
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  880784 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 880685  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  880684 agttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggc 880585  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  880584 tttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcccc 880485  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  880484 tagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 880422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 38890003 - 38890314
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  38890003 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 38890102  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38890103 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 38890202  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890203 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38890302  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||    
T  38890303 cttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 321 - 669
Target Start/End: Original strand, 43228220 - 43228571
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43228220 actataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtt 43228319  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  43228320 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 43228419  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  43228420 gtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 43228519  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43228520 taggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43228571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 62 - 472
Target Start/End: Original strand, 41848804 - 41849232
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848804 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 41848903  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  41848904 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaaag 41849003  T
Q  262 ag-------nnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacc 353  Q
    ||                   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||     
T  41849004 agaaaaaaaaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaact 41849103  T
Q  354 t----------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 443  Q
    |          | ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41849104 ttgagagagagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 41849203  T
Q  444 ggtttgagggttgattcacctcgggaaac 472  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41849204 ggtttgagggttgattcaccttgggaaac 41849232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 3859453 - 3859801
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859453 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3859552  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  3859553 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 3859652  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  3859653 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctccccc 3859751  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859752 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 321 - 670
Target Start/End: Original strand, 24979636 - 24979989
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979636 actataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 24979735  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa---cattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  24979736 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgg 24979835  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 616  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  24979836 gtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaa 24979935  T
Q  617 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24979936 ctaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 24979989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 51727334 - 51726990
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51727334 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtt 51727235  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||  |||||  || | ||||||    
T  51727234 tgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgg 51727136  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51727135 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 51727036  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51727035 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 321 - 654
Target Start/End: Original strand, 43226015 - 43226350
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43226015 actataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtt 43226113  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  43226114 tgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 43226213  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43226214 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagac 43226313  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226314 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43226350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 321 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 27101513 - 27101158
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacc----tagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||      |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101513 actataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27101414  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||    
T  27101413 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggact 27101314  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  27101313 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccccc 27101214  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101213 agaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27101158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 18162589 - 18162944
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatca-gagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162589 ttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18162686  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  18162687 gagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18162786  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162787 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 18162886  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18162887 ccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctcttct 18162944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 26720473 - 26720821
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26720473 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 26720572  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg--aaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 514  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||| |||||||| | ||||||||| ||||||  |||| |||    
T  26720573 agtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggttaactattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactt 26720672  T
Q  515 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 614  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  26720673 tgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctccccta 26720772  T
Q  615 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720773 gattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10084725 - 10084372
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10084725 ttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgt 10084626  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  10084625 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgg 10084526  T
Q  510 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10084525 gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10084426  T
Q  610 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10084425 cccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 276 - 605
Target Start/End: Original strand, 6561694 - 6562028
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaac 375  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6561694 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaac 6561793  T
Q  376 aatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac--- 472  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||       
T  6561794 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 6561893  T
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaac 571  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||     
T  6561894 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaag 6561993  T
Q  572 gttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 605  Q
    || |||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  6561994 gtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 5191578 - 5191925
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191578 ttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 5191677  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  5191678 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 5191777  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||     
T  5191778 ttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctctcccc- 5191875  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191876 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 317 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 5927096 - 5926755
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5927096 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatag 5926997  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  5926996 agtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 5926897  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||      
T  5926896 tttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgc 5926797  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926796 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5926755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 12268298 - 12267951
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12268298 ttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtata 12268199  T
Q  416 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12268198 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 12268099  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12268098 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 12268010  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12268009 ccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 12267951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22114637 - 22114288
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22114637 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatag 22114538  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||  |    
T  22114537 agtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggatt 22114438  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||     
T  22114437 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctccccc 22114338  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114337 aaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 355 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 9604900 - 9604583
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  9604900 agagatagagggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggt 9604802  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9604801 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9604702  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9604701 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaatt 9604602  T
Q  652 cttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  9604601 cttttgtgttctctcttct 9604583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 53468787 - 53468430
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53468787 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatag 53468689  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  53468688 agtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggact 53468589  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53468588 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccc 53468489  T
Q  613 tag--actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53468488 cagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 53468430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 47149232 - 47148872
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagag----atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149232 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 47149133  T
Q  412 tatagagtttgtctctttggaa-caaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattg 508  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| || || || |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47149132 tatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 47149033  T
Q  509 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47149032 ggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctct 47148933  T
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  47148932 cccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctcttc 47148872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 36011752 - 36012108
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  36011752 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatag 36011851  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||| | | ||||||||| |||||||||| | ||    
T  36011852 agtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgact 36011951  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |       
T  36011952 ttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttc 36012051  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012052 agactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttct 36012108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 32264375 - 32264015
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaa----cctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  32264375 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgt 32264276  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||    
T  32264275 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgg 32264176  T
Q  510 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32264175 aactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctc 32264076  T
Q  608 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32264075 tcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttctctcttc 32264015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 6066129 - 6065779
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggggg-ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066129 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6066030  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  6066029 gattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 6065930  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  6065929 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctccc 6065831  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6065830 ctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 54691905 - 54691559
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54691905 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatag 54691807  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  54691806 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggct 54691707  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54691706 ttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccct 54691607  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  54691606 agactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgtt 54691559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 6063780 - 6063429
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063780 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6063681  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6063680 agagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 6063581  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6063580 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 6063482  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6063481 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Original strand, 50493928 - 50494273
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493928 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 50494027  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 516  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  50494028 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttg 50494127  T
Q  517 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 616  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  50494128 ggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccaga 50494226  T
Q  617 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  50494227 ctaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 50494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 5522947 - 5522610
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  5522947 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt---- 5522852  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
           ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  5522851 -------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 5522759  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||      
T  5522758 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgc 5522660  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522659 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28761760 - 28761410
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28761760 ttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatat 28761661  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||    
T  28761660 agtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagact 28761562  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28761561 ttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccc 28761462  T
Q  613 tagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28761461 cagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttct 28761410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674737
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccc 51674799  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  51674798 ataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 51674737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 25388869 - 25389179
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25388869 agagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 25388968  T
Q  455 tgattcacctcgggaa-ac-attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| || || || |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  25388969 tgattcaccttggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaaccc 25389068  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389069 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 25389167  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
      ||||||||||    
T  25389168 tctttgtgttct 25389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 396 - 663
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321753
Alignment:
Q  396 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttgg 492  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  493 ttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaa 592  Q
    ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  593 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10191645 - 10191305
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10191645 ttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggttttt 10191546  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| ||||||||  ||||||  |||    
T  10191545 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctgg 10191446  T
Q  510 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10191445 a-ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10191347  T
Q  610 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191346 cctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 39715395 - 39715744
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39715395 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatag 39715493  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  39715494 agtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 39715593  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || || ||  ||||||||     
T  39715594 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctccccc 39715689  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39715690 atactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 39715744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Original strand, 42989957 - 42990234
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42989957 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttttgctgaaagtatatttatggacaat 42990056  T
Q  167 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  42990057 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 42990156  T
Q  267 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatca 344  Q
             ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990157 aaaaaaat-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 38210333 - 38210644
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38210333 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 38210432  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38210433 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 38210532  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38210533 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
       ||||||||||    
T  38210632 atctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 15780785 - 15781165
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780785 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 15780884  T
Q  417 agtt-----------tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaag 502  Q
    ||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  15780885 agtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaag 15780984  T
Q  503 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggag 597  Q
    ||  || | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    |||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||| ||    
T  15780985 aggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaag 15781084  T
Q  598 gg---ctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  15781085 ggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttct 15781165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 355 - 610
Target Start/End: Original strand, 29956649 - 29956907
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29956649 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggt 29956748  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29956749 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 29956848  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29956849 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 323 - 670
Target Start/End: Original strand, 32219026 - 32219366
Alignment:
Q  323 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 422  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  32219026 tataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttg 32219114  T
Q  423 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggt 519  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||     
T  32219115 tctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggc 32219214  T
Q  520 agaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa-cgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagact 618  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  32219215 agaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagact 32219314  T
Q  619 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32219315 atgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 32219366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 317 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 890103 - 889779
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  890103 ttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatag 890006  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  890005 agtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggc 889907  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  889906 tttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccg 889807  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgg 640  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  889806 cagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 321 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 35918277 - 35917944
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918277 actataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 35918178  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    ||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||| | ||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  35918177 tgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactggga 35918078  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35918077 atttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctctctccc 35917978  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 646  Q
      ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35917977 tcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 405 - 668
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484639
Alignment:
Q  405 gggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgaga 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  501 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 600  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  601 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 6484639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 317 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28100373 - 28100143
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28100373 ttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 28100274  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28100273 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggct 28100174  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttctt 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28100173 ttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 382 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413014
Alignment:
Q  382 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaag 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  479 attg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttact 577  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  |||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 28413101  T
Q  578 catcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct 28413014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 414 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606571
Alignment:
Q  414 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctattt-gtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 317 - 648
Target Start/End: Original strand, 53591120 - 53591442
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  53591120 ttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt---- 53591215  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaag---attgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
           |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |    
T  53591216 -------ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggatt 53591308  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  53591309 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctctcccc- 53591407  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53591408 agactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 509 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 27635795 - 27635628
Alignment:
Q  509 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635795 gggctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 27635696  T
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 676  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27635695 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctt 27635628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 554
Target Start/End: Original strand, 35777346 - 35777587
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35777346 ttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 35777445  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  35777446 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 35777545  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35777546 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 443 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688137
Alignment:
Q  443 gggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttt 539  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  540 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa-cgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 638  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  639 gggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttctctcttc 25688137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 23633385 - 23633732
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  23633385 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatag 23633483  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||    
T  23633484 tgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 23633578  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23633579 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctcccc 23633677  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23633678 -agactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 23633732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 31151272 - 31151631
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  31151272 ttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtat 31151370  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||     
T  31151371 agagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggga 31151467  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca-tcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31151468 ctttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcc 31151565  T
Q  611 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    || |||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  31151566 cccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctcttcttttct 31151631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 317 - 552
Target Start/End: Original strand, 28180949 - 28181185
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28180949 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 28181046  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa---cattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  28181047 agtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggact 28181146  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  28181147 ttggatagaattaggcgggagacgtattcttataactca 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 413 - 675
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666800
Alignment:
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 509  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  510 ggctttgggtagaattaggcgggaga--ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctct 606  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  607 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4666735 cccc---agactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 4666800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 480 - 663
Target Start/End: Original strand, 5886290 - 5886472
Alignment:
Q  480 ttgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca 579  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||| | |||||||||||    
T  5886290 ttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttgtcttt-gaaacgttactca 5886388  T
Q  580 tcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886389 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 480 - 663
Target Start/End: Original strand, 5899763 - 5899945
Alignment:
Q  480 ttgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca 579  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  5899763 ttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gcaacgttactca 5899861  T
Q  580 tcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899862 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 440 - 670
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232081
Alignment:
Q  440 ctagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaaga---ttgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |   |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  537 tttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 635  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtgaa-cggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  636 actgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 6232081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 399 - 668
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795538
Alignment:
Q  399 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 495  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||| |   ||| |||||||||| ||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  496 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 594  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 17795464  T
Q  595 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  17795465 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 17795538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 399 - 668
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103978
Alignment:
Q  399 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 495  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||| |   ||| |||||||||| ||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  496 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 594  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 19103904  T
Q  595 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  19103905 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 19103978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 456 - 663
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  456 gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  653 ttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||    
T  11168365 ttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 317 - 642
Target Start/End: Original strand, 53597166 - 53597491
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  53597166 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-ggggatgaaacaagggttta-taagtcaacaagaaaactaggggttgtatag 53597263  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |    
T  53597264 agttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaa--gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagatt 53597360  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||     
T  53597361 ttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctccca 53597460  T
Q  613 tagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 642  Q
     | ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  53597461 caaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 317 - 460
Target Start/End: Original strand, 11163075 - 11163218
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163075 ttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11163174  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163175 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 317 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28137627 - 28137415
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||               
T  28137627 ttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag----------- 28137539  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28137538 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggct 28137439  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagact 537  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  28137438 ttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 516 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701654
Alignment:
Q  516 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 615  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  616 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttct 47701654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 399 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420189
Alignment:
Q  399 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  496 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 594  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacg 13420237  T
Q  595 gagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggt 642  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13420236 gagagctgctctctcacc-agactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 473 - 669
Target Start/End: Original strand, 3306845 - 3307040
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||| |||||||||| ||||||||   |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  3306845 attaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 3306944  T
Q  573 ttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3306945 ttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctctcttc 3307040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 322 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871295
Alignment:
Q  322 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 421  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  422 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttggg 518  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| || |||||   |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttggg 36871430  T
Q  519 tagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 616  Q
    ||||||||||   | |||||| |||||| ||| | |||  ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  36871429 tagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaga 36871331  T
Q  617 ctaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36871330 ctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 399 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561769
Alignment:
Q  399 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||   ||| |||| ||||| ||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  496 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 594  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 561828  T
Q  595 gagggctgctctctccc-ctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  561827 aagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 316 - 566
Target Start/End: Original strand, 23636951 - 23637200
Alignment:
Q  316 attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  23636951 attttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtata 23637049  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||   ||| |||||||||| ||| | | | ||||| ||| || |    
T  23637050 gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggac 23637146  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  23637147 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 399 - 651
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635644
Alignment:
Q  399 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  496 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 594  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||     
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  595 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 317 - 601
Target Start/End: Original strand, 54884082 - 54884367
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||    
T  54884082 ttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--tag 54884179  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||   |||| |||||||||| ||||||||   |||||||||   ||    
T  54884180 agtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaact 54884279  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggct 601  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  54884280 ttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 317 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 47701927 - 47701798
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701927 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 47701828  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggt 446  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701827 agtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 316 - 445
Target Start/End: Original strand, 6231373 - 6231502
Alignment:
Q  316 attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231373 attttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6231472  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactaggg 445  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231473 gagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 573 - 670
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849340
Alignment:
Q  573 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 41849340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 317 - 435
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  417 agtttgtctctttggaaca 435  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 582 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919098
Alignment:
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 503 - 651
Target Start/End: Original strand, 24181494 - 24181644
Alignment:
Q  503 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggct 601  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||    
T  24181494 agattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgact 24181593  T
Q  602 gctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||| | | |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24181594 gctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 392 - 651
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674227
Alignment:
Q  392 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtctt 488  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||   ||| ||||||||||     
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  489 ttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagt 588  Q
    ||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| | |||| || |||||||||| |||||        |  |    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac--------tttt 1674163  T
Q  589 gaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  1674164 ggaacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Original strand, 6561612 - 6561687
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 136  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561612 atgttgtagtatgactcgaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 6561687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 321 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 4560593 - 4560401
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||| |||||||  || |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||           |||||||    
T  4560593 actataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaac-----------tagagtt 4560505  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  4560504 tgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgg 4560413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 53894109 - 53894040
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53894109 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 484 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 1620624 - 1620457
Alignment:
Q  484 gtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca 582  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   || | ||  |||||||||| | |||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  1620624 gtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaaccctttgatatctcttt-gtaaacttactcatca 1620526  T
Q  583 t-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||    
T  1620525 ttatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaaa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 532 - 651
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  532 gagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgg 630  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  631 accgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 478 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007545
Alignment:
Q  478 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttact 577  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  578 catca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 624  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11007592 catcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 53974197 - 53974124
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974197 tgactcaaaatttgatggatgaagaatgttgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaattatattttgtgct 53974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 493
Target Start/End: Original strand, 24177204 - 24177380
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||    
T  24177204 ttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag-atgtcaacaagaaaactagggtttgtata 24177302  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggt 493  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| |||||    
T  24177303 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 11066255 - 11066429
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaat-ataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatat 153  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||                 |||||||     
T  11066255 tgactcataatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaaagataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgctttcggaagattgttgttgaaaatac 11066354  T
Q  154 atttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  11066355 atttatggacaataaatatatttttttaccatatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaagagaatatt 11066429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 11072644 - 11072717
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11072644 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgcaaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11072717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Original strand, 1321366 - 1321441
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggca 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1321366 ttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54287627 - 54287487
Alignment:
Q  94 agaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatatatttatggacaataaatatattt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                 ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  54287627 agaagattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttcgtgcttccaaaagattgctgttgaaaatatatttatggataataaatacattt 54287528  T
Q  177 ttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttga 217  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  54287527 ttgtactgtatgaaggaatatttgatgcaaatatattttga 54287487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53974077 - 53974011
Alignment:
Q  147 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatg-aagaatgatttgatacaaatatat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  53974077 aaaatatatttatagacaataaatatatttttgtaccgtatgaaaggaagatttgatgcaaatatat 53974011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 614 - 679
Target Start/End: Original strand, 42992611 - 42992676
Alignment:
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttcttctc 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||    
T  42992611 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctctccttttcttctc 42992676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 1736334 - 1736388
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1736334 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 212
Target Start/End: Original strand, 11072731 - 11072801
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatat 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||||    
T  11072731 tgctgaaaatacatttatggacaacaaatagatttttgtaccgtattacggaagatttgatgcaaatatat 11072801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 18552912 - 18552966
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18552912 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Original strand, 28181185 - 28181238
Alignment:
Q  586 agtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgg 640  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28181185 agtgaaacggaaggctgctctctccc-tagactaggtcaatttggactgaactgg 28181238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 30709819 - 30709873
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30709819 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 377
Target Start/End: Original strand, 6484310 - 6484370
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaa 377  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6484310 ttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa 6484370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 10612844 - 10612772
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10612844 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10612772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 47878237 - 47878165
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  47878237 tatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 47923937 - 47923989
Alignment:
Q  596 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  47923937 agggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 1417519 - 1417573
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1417519 ggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 3716031 - 3716085
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3716031 ggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 8370515 - 8370569
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8370515 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 27974981 - 27975035
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27974981 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 27986475 - 27986529
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27986475 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21711276 - 21711227
Alignment:
Q  599 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21711276 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 10595100 - 10595028
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10595100 tatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 10897121 - 10897193
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10897121 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 473
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13419960
Alignment:
Q  371 gaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa 470  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaa 13419957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 540 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 15823756 - 15823641
Alignment:
Q  540 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 637  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| |  |||| |||| |||||| |||| || ||||||||||| || ||| || |||||| ||||||||||     
T  15823756 ttcttgtaaccctttgacatctcttt-gtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattggaccgaat 15823658  T
Q  638 tgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15823657 tgggtaaacaaattctt 15823641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 102
Target Start/End: Original strand, 27000083 - 27000123
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattg 102  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27000083 tgttgtagtatgactgaaaatttgatggatggagaatattg 27000123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 29682483 - 29682527
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29682483 tctctcccctagattagatcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390296
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattctt 48390296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1618986 - 1618916
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1618986 actataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 500
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634031
Alignment:
Q  399 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggtta 495  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |   || ||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||| ||||| |    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtca 25634026  T
Q  496 cgaga 500  Q
    |||||    
T  25634027 cgaga 25634031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 48438272 - 48438221
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  48438272 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 626 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8183154 - 8183112
Alignment:
Q  626 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8183154 tttgggccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 8183112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16264408 - 16264354
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16264408 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 25795839 - 25795785
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25795839 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 26299046 - 26298992
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  26299046 ggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 473 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 29914128 - 29913949
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 571  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||   || ||||  ||||||||||||| |   |||||||| ||||     
T  29914128 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaat---atctcttt-gtaaa 29914034  T
Q  572 gttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |  ||||||||| |||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  29914033 gaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 604 - 654
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236299
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttctt 30236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 32143379 - 32143325
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32143379 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 33386695 - 33386749
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  33386695 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 37466349 - 37466295
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  37466349 ggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 528
Target Start/End: Original strand, 11073007 - 11073084
Alignment:
Q  454 ttgattcacct-cgggaaaca-ttaagattgagtcttttggttacgagaagaga-ttggggctttgggtagaattagg 528  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  11073007 ttgattcaccttcgagaaacacttatgattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattagg 11073084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 624
Target Start/End: Original strand, 11079633 - 11079674
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 624  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11079633 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 24695194 - 24695247
Alignment:
Q  595 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  24695194 gagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 24695247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 53896524 - 53896475
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggct 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||    
T  53896524 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 635 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 880251 - 880211
Alignment:
Q  635 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  880251 aactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 880211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 3328387 - 3328439
Alignment:
Q  596 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  3328387 agggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaa 3328439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 353
Target Start/End: Original strand, 4663844 - 4663880
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacc 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4663844 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacc 4663880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 59
Target Start/End: Original strand, 5156118 - 5156154
Alignment:
Q  23 tactttagaggagcatggaatgagaagtttgatgttt 59  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5156118 tactttaaaggagcatggagtgagaagtttgatgttt 5156154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 9666510 - 9666466
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9666510 tctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 10094141 - 10094073
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10094141 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10094073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 10100158 - 10100090
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10100158 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10100090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 10201021 - 10200953
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10201021 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10200953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 16499153 - 16499197
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16499153 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23391953 - 23391909
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23391953 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 675
Target Start/End: Original strand, 28181242 - 28181290
Alignment:
Q  627 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  28181242 ttggaccgaactaggtcaacaaattctcctgtgttctctcttcttttct 28181290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29196430 - 29196386
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29196430 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 32744476 - 32744436
Alignment:
Q  608 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32744476 tcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153361
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734666
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 644
Target Start/End: Original strand, 40735507 - 40735547
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 644  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtca 40735547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 47304375 - 47304419
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47304375 tctctccccaagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaa 47304419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 54193342 - 54193410
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  54193342 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54193410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 145)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 17325227 - 17324610
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17325227 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgagttgaaaatatatttatgg 17325128  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17325127 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 17325028  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||           | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  17325027 agaaaaaaaaaacg-tatcttcagggtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagat 17324929  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324928 acagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattc 17324829  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17324828 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgat 17324729  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324728 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17324629  T
Q  658 tgttctatcttctcttctt 676  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  17324628 tgttctctcttctcttctt 17324610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 675
Target Start/End: Original strand, 47905954 - 47906576
Alignment:
Q  60 catgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 159  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47905954 catgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 47906053  T
Q  160 ggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47906054 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaa 47906153  T
Q  260 ggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct---- 354  Q
    ||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |        
T  47906154 ggagaaaaaaaaa---gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgag 47906250  T
Q  355 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 452  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47906251 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagg 47906350  T
Q  453 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
    |||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47906351 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 47906450  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906451 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 47906550  T
Q  650 ttcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  47906551 ttcttttgtgttctctcttcttttct 47906576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 28998844 - 28998227
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998844 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28998745  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28998744 acaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 28998645  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||           | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  28998644 agaaaaaaaaaccg-tatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagat 28998546  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28998545 agaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattc 28998446  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998445 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 28998346  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998345 atctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28998246  T
Q  658 tgttctatcttctcttctt 676  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  28998245 tgttctctcttttcttctt 28998227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 29004560 - 29003943
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004560 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 29004461  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29004460 acaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 29004361  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||           | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  29004360 agaaaaaaaaaccg-tatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagat 29004262  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29004261 agaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattc 29004162  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004161 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 29004062  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004061 atctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 29003962  T
Q  658 tgttctatcttctcttctt 676  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  29003961 tgttctctcttttcttctt 29003943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31736116 - 31735508
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736116 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggaaggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 31736017  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31736016 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 31735917  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctaga-- 357  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||      
T  31735916 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaat 31735819  T
Q  358 --gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
      ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31735818 gagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 31735719  T
Q  456 gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  31735718 gattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcca 31735619  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735618 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 31735519  T
Q  653 ttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||    
T  31735518 ttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 2949815 - 2949213
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949815 tgttatagtatgactcaaaatttcatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 2949716  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  2949715 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaatattctttcactgaag- 2949617  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||           | ||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||    
T  2949616 agaaaaaaaaaacg-tatcttg------gtattcgttccaaatttatgagttatacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagat 2949524  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2949523 agagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattc 2949424  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949423 accttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 2949324  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949323 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 2949225  T
Q  658 tgttctatcttc 669  Q
    |||||| |||||    
T  2949224 tgttctctcttc 2949213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 39931762 - 39932368
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931762 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 39931861  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  39931862 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaatattcttttattgaagg 39931961  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agag 358  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||  |||| |  ||||    
T  39931962 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagag 39932059  T
Q  359 atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39932060 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgat 39932159  T
Q  459 tcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 555  Q
    | |||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  39932160 taaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattg 39932259  T
Q  556 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc-tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39932260 atttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattctt 39932359  T
Q  655 ttgtgttct 663  Q
    |||||||||    
T  39932360 ttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 15295439 - 15294821
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295439 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 15295340  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15295339 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15295240  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||           | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |          
T  15295239 agaaaaaaaaaatg-tatcttcagtgtggtattcgttcctaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 15295141  T
Q  355 --------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 446  Q
            |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15295140 agagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggtt 15295041  T
Q  447 ttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttct 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  15295040 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattct 15294941  T
Q  544 tgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 643  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294940 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 15294841  T
Q  644 aacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15294840 aacaaattcttttgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 660
Target Start/End: Original strand, 24325347 - 24325954
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325347 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 24325446  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24325447 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 24325546  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |          
T  24325547 agaaaaaaaaat--gtatctttagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 24325644  T
Q  355 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 452  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24325645 agagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgg 24325743  T
Q  453 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24325744 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 24325843  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24325844 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaa 24325943  T
Q  650 ttcttttgtgt 660  Q
    |||||||||||    
T  24325944 ttcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 27339730 - 27339112
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat----tt 157  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  27339730 tgttgtagtatgactccaaatttgacggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatatattt 27339631  T
Q  158 atggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27339630 atggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactg 27339531  T
Q  258 aaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-- 354  Q
    |||||             ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |      
T  27339530 aaggaaaaaaaaaagaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttg 27339431  T
Q  355 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 452  Q
      ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27339430 agagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgg 27339331  T
Q  453 gttgattcacctcgggaaa---cattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
    |||||||||||| ||||||    |||| |||||||||| || |||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27339330 gttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaac 27339231  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27339230 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 27339132  T
Q  650 ttcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  27339131 ttcttttgtgttctctcttc 27339112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 27337533 - 27336921
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337533 atgttgtagtatgactccaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 27337434  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27337433 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaag 27337334  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    ||             ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |    |    
T  27337333 gaaaaaaaaaaac--gtatcttcgatgtggtatttgttccaaatttatgcgttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgaga 27337236  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27337235 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27337137  T
Q  456 gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27337136 gattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27337037  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337036 ttgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27336938  T
Q  653 ttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27336937 ttttgtgttctctcttc 27336921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 21948756 - 21948226
Alignment:
Q  89 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21948756 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg 21948657  T
Q  189 aagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgt 288  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||            |||||||||||||    
T  21948656 aagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcacagaaggaggaaaaaaaaaacgtatcttcagtgt 21948557  T
Q  289 agtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggttt 383  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21948556 ggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 21948457  T
Q  384 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagatt 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||| ||||    
T  21948456 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaacactattaggatt 21948357  T
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21948356 gagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 21948257  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21948256 atatagtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9463841 - 9463231
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463841 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 9463742  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9463741 gacaataaatatatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 9463642  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 354  Q
    |||            ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  9463641 gagaaaaaaaaac--gtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 9463544  T
Q  355 -agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 453  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||    
T  9463543 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtggg 9463444  T
Q  454 ttgattcacctcgggaaac---attaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9463443 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaac 9463344  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9463343 ccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9463245  T
Q  650 ttcttttgtgttct 663  Q
    ||  ||||||||||    
T  9463244 tttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9460013 - 9459404
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460013 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 9459914  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9459913 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 9459814  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          
T  9459813 agaaaaaaaaac--gtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 9459716  T
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  9459715 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggt 9459616  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  9459615 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacc 9459516  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9459515 cattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 9459417  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |  ||||||||||    
T  9459416 ttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 290 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 6996064 - 6995674
Alignment:
Q  290 gtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6996064 gtattcgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaa 6995965  T
Q  389 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagt 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  6995964 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagt 6995865  T
Q  486 cttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 585  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6995864 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatat 6995765  T
Q  586 agtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6995764 agtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctt 6995674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 184 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2510801 - 2510312
Alignment:
Q  184 gtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnng---gtatc 280  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||               ||||     
T  2510801 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagggaaagaaaaaaaacgtatt 2510702  T
Q  281 ttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaac 375  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  2510701 ttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaac 2510602  T
Q  376 aatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac--- 472  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||       
T  2510601 aagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacact 2510502  T
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||| |    
T  2510501 attaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaag 2510403  T
Q  573 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510402 ttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 12302846 - 12302480
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12302846 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg 12302747  T
Q  412 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattg 508  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12302746 tatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 12302647  T
Q  509 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302646 ggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 12302547  T
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12302546 cccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 12302480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50307883 - 50307527
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50307883 ttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatag 50307784  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50307783 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 50307684  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307683 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 50307584  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgttctatctt 668  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50307583 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctctctt 50307527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 51749984 - 51750333
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749984 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 51750083  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  51750084 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 51750183  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  51750184 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 51750283  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750284 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 15823491 - 15823847
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823491 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 15823590  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  15823591 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 15823690  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15823691 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccc 15823790  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15823791 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 15823847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307409
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccc 18307353  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18307354 -agactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18307409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 38925814 - 38925456
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925814 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 38925715  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  38925714 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 38925615  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  38925614 ttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctctcccc- 38925518  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38925517 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 38925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 11457811 - 11457450
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11457811 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 11457712  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||  |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  11457711 agtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggt 11457612  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  11457611 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctccccc 11457512  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11457511 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 11457450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28207402 - 28207048
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  28207402 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaa 28207303  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||   |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  28207302 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggct 28207203  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28207202 ttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctccccc 28207105  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28207104 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 28207048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 41646865 - 41647220
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41646865 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 41646964  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||    
T  41646965 agtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgact 41647064  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  41647065 ttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatc 41647164  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41647165 agactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 41647220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10400164 - 10399815
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10400164 tttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 10400065  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  10400064 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 10399965  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  10399964 ttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 10399865  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399864 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 658
Target Start/End: Original strand, 13215026 - 13215375
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215026 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 13215125  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  13215126 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 13215225  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215226 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 13215325  T
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 658  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215326 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Original strand, 6822960 - 6823306
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822960 ttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6823059  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  6823060 agtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggct 6823158  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  6823159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 6823258  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823259 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 321 - 670
Target Start/End: Original strand, 39462468 - 39462820
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39462468 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 39462567  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  39462568 tgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 39462667  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39462668 gtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagac 39462767  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39462768 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 39462820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 174 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46431693
Alignment:
Q  174 tttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnn 273  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||              
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaa 46432108  T
Q  274 nggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagag-------- 364  Q
     | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||| ||||            
T  46432107 cg-tatcttcactgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagag 46432009  T
Q  365 -------------ggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 451  Q
                 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  46432008 agagagagagatgggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 46431909  T
Q  452 ggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 548  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46431908 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 46431809  T
Q  549 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct--cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 646  Q
    | ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431808 cccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 46431710  T
Q  647 aaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||    
T  46431709 aaattcttttgtgttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 9241422 - 9241067
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggggg-ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241422 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 9241324  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241323 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggc 9241224  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9241223 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 9241124  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  9241123 ccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctctt 9241067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 321 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 14098302 - 14097950
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14098302 actataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtt 14098203  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  14098202 tgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgg 14098103  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 616  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  14098102 gtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaa 14098003  T
Q  617 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14098002 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 28840623 - 28840973
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28840623 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtat 28840722  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||     
T  28840723 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 28840822  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28840823 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 28840921  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840922 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 18839532 - 18839894
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839532 ttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18839631  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  18839632 agtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagact 18839731  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18839732 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccc 18839831  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  18839832 catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctcttcttttct 18839894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319193
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 516  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||   | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac---aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttg 17319034  T
Q  517 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 615  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17319035 ggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctag 17319133  T
Q  616 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17319134 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 17319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 13761782 - 13762130
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13761782 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatag 13761881  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  13761882 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgact 13761981  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  13761982 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctccccc 13762080  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13762081 agactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 646
Target Start/End: Original strand, 47451593 - 47451919
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451593 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 47451692  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 516  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |      ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47451693 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt---ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttg 47451789  T
Q  517 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 616  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | |    
T  47451790 ggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccata 47451889  T
Q  617 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451890 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251255
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccc 25251312  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25251311 aatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 25251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 321 - 661
Target Start/End: Original strand, 2617465 - 2617808
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617465 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 2617564  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  2617565 tgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 2617664  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  2617665 gtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagac 2617764  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  2617765 taggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 16428598 - 16428960
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428598 ttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 16428697  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  16428698 agtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 16428797  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428798 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccc 16428897  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16428898 caaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 16428960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 20302404 - 20302752
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302404 ttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 20302503  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||| | || ||    
T  20302504 agtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggact 20302603  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || ||||||||||     
T  20302604 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctccccc 20302702  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20302703 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 50077008 - 50076652
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  50077008 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 50076909  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
T  50076908 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaat 50076809  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  50076808 ttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 50076709  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50076708 -agactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 50076652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 3579954 - 3579606
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggggg--ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3579954 ttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtat 3579855  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  3579854 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattgggg 3579755  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  3579754 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctccc 3579656  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579655 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 50248908 - 50248551
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||    
T  50248908 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatag 50248809  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||| | | ||    
T  50248808 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagact 50248709  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||    
T  50248708 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctccc 50248609  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50248608 ctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 50248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 28842438 - 28842788
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842438 ttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28842537  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || |     
T  28842538 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgaga 28842637  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  28842638 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctccc 28842736  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28842737 ccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 51752310 - 51752657
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  51752310 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatag 51752409  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatta--agattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 514  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||  || | |||    
T  51752410 agtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattagattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 51752509  T
Q  515 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 614  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  51752510 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctccccca 51752608  T
Q  615 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752609 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 347 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31425325 - 31424990
Alignment:
Q  347 gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactaggg 445  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31425325 gtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactaggg 31425226  T
Q  446 tttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgag---tcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttt 539  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||   ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  31425225 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggctta 31425126  T
Q  540 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 638  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31425125 ttcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctcccc-atactaggtcaatttggaccgaact 31425027  T
Q  639 gggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31425026 gggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 31424990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 50079157 - 50078800
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  50079157 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatag 50079058  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||    
T  50079057 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggact 50078958  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  50078957 ttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccc 50078858  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50078857 cagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctcttct 50078800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 6756472 - 6756829
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756472 ttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6756571  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  6756572 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc--ttgattacgagaagagattgggac 6756669  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  6756670 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccc 6756769  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6756770 cccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctcttct 6756829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 17186464 - 17186109
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186464 ttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 17186365  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || | |||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||    
T  17186364 agtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaact 17186265  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  17186264 ttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccc 17186165  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17186164 cagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 17186109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 31489860 - 31490211
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31489860 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 31489959  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| | | ||||||||| |||||||||| | ||    
T  31489960 --tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagact 31490057  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  31490058 ttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-ccccc 31490156  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31490157 agactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 31490211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 276 - 595
Target Start/End: Original strand, 48665074 - 48665404
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggc----- 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||          
T  48665074 gtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggaggggg 48665173  T
Q  370 -tgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg 468  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  48665174 ttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag 48665273  T
Q  469 aaac---attaagattgagtcttttggtta-cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctt 564  Q
    ||||   |||| |||||||||| ||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  48665274 aaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 48665373  T
Q  565 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgg 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48665374 ttgtaacgttactcatcatatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 355 - 669
Target Start/End: Original strand, 25127855 - 25128173
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25127855 agagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggt 25127954  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| | |||||   |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25127955 tgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25128055 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T
Q  651 tcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25128155 tcttttgtgttctctcttc 25128173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 16226112 - 16226461
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16226112 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 16226211  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  16226212 agtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 16226311  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16226312 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 16226410  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16226411 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 16226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 20291402 - 20291750
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||  | ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291402 ttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 20291501  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| | || ||    
T  20291502 agtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggact 20291601  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||     
T  20291602 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctccccc 20291700  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20291701 acactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 20291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 47179654 - 47180006
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47179654 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 47179753  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattg 508  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47179754 atagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 47179853  T
Q  509 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  47179854 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 47179952  T
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47179953 cccc-agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47180006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 342 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131362
Alignment:
Q  342 tcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 439  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  440 ctagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 536  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||  | || ||||||||||||||||||| || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  537 tttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 631  Q
    || |||||||||| |||||| |    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4131394  T
Q  632 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4131393 ctgaactatgtcaacaaattcttttgtgttct 4131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 317 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 31423210 - 31422851
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31423210 ttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatag 31423111  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  31423110 agtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 31423011  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tata------------gtgaaacggaggg 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||            ||||||| |||||    
T  31423010 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagaggg 31422911  T
Q  600 ctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 659  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31422910 ctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 62 - 260
Target Start/End: Original strand, 48664852 - 48665050
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664852 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 48664951  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48664952 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 48665050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 317 - 654
Target Start/End: Original strand, 17324010 - 17324349
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||    
T  17324010 ttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatag 17324107  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||  || | |||||||||||  ||    
T  17324108 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaact 17324207  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17324208 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctcccc 17324307  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17324308 atgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 17324349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 47177303 - 47177655
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47177303 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 47177402  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagat-tgagtcttttggttacgagaagagattg 508  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47177403 atagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattg 47177502  T
Q  509 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  47177503 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 47177601  T
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47177602 cccc-agactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47177655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 40133880 - 40134239
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg---------gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 407  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||| |||||         |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||    
T  40133880 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggggctgaaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaagg 40133979  T
Q  408 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagag 504  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  40133980 tttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagag 40134079  T
Q  505 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgc 603  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40134080 attgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgc 40134179  T
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40134180 tctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttct 40134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 62 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4131882 - 4131690
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4131882 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 4131783  T
Q  162 ac-aataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttca 254  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4131782 acaaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatattctttca 4131690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45694016 - 45693834
Alignment:
Q  70 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45694016 tatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatggacaataaa 45693917  T
Q  170 tatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttcttt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  45693916 tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatattcttt 45693834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 317 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 14183922 - 14183581
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||    
T  14183922 ttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtatag 14183826  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||   |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |    
T  14183825 aggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaatt 14183729  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14183728 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 14183629  T
Q  613 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 659  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14183628 cagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtg 14183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6115719 - 6115534
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaa-tttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 159  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115719 atgttgtaggatgactcaaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 6115620  T
Q  160 ggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115619 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaat 6115534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 296 - 651
Target Start/End: Original strand, 42922157 - 42922514
Alignment:
Q  296 gttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaac 394  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||    
T  42922157 gttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaac 42922255  T
Q  395 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttg 491  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |   ||| |||||||||| |||    
T  42922256 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttg 42922352  T
Q  492 gttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtga 590  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  42922353 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtgg 42922452  T
Q  591 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42922453 aacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 363 - 675
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432702
Alignment:
Q  363 agggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 462  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  463 ctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacat 559  Q
    || |||||||||||    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||| |||||| ||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  560 ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16432585 ctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 16432684  T
Q  658 tgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  16432685 tgttctctcttcttttct 16432702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 473 - 675
Target Start/End: Original strand, 16429061 - 16429264
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  16429061 attaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagg 16429160  T
Q  573 ttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctc 671  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16429161 ttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 16429260  T
Q  672 ttct 675  Q
    ||||    
T  16429261 ttct 16429264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 317 - 568
Target Start/End: Original strand, 6823829 - 6824091
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg-gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823829 ttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6823928  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtctttt-------ggttacgagaagaga 505  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||       ||||||| |||||||    
T  6823929 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagaga 6824028  T
Q  506 ttggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6824029 ttggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 439 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248532
Alignment:
Q  439 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||| ||||| | ||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  536 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 634  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  635 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgttttatcttc 25248532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 317 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 49495535 - 49495206
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||          ||||||||||||| |||     
T  49495535 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcatat 49495444  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaaga---ttgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||||| |||||||| ||| |   |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  49495443 agtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggct 49495348  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  49495347 ttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctcccc 49495248  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
     |||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  49495247 aagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 317 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 8347605 - 8347284
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  8347605 ttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtata 8347508  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||| | |    
T  8347507 gagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagac 8347411  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  8347410 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttccc 8347311  T
Q  612 ctagactaggtca-atttggaccgaac 637  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||    
T  8347310 ctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 250
Target Start/End: Original strand, 6997213 - 6997395
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6997213 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatata-ttatg 6997311  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttct 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6997312 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacgatttgatgcaaa------ttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattct 6997395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 18800905 - 18800570
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  18800905 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtatag 18800807  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  ||||||||||||  | ||||||   ||| |||||||||| | ||| ||| | ||||||| |  ||    
T  18800806 agtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaact 18800710  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18800709 ttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccc 18800610  T
Q  613 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     | ||||||| |  |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18800609 caaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatt 18800570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15669727 - 15669374
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | | ||||||||||||||||| | | ||||| | | |||| || ||||| ||||||||||||    
T  15669727 ttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttggga-ggcagca-caaaagtagggtttgtat 15669630  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    | |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |     
T  15669629 aaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 15669533  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15669532 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 15669433  T
Q  611 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    || |||||||||||  ||| ||| |||||| || |||||||| | ||||||||| ||||    
T  15669432 ccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctctt 15669374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 512 - 668
Target Start/End: Original strand, 23816029 - 23816185
Alignment:
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||    
T  23816029 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctccc 23816128  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23816129 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 23816185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 473 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 6115280 - 6115077
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||      
T  6115280 attaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaaccaattgatatctcttttgtaaaa 6115181  T
Q  573 ttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctc 671  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  6115180 ttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctcttctt 6115081  T
Q  672 ttct 675  Q
    ||||    
T  6115080 ttct 6115077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 46432636 - 46432521
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432636 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 46432537  T
Q  162 acaataaatatatttt 177  Q
    ||||||||||||||||    
T  46432536 acaataaatatatttt 46432521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Original strand, 6996067 - 6996221
Alignment:
Q  100 ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgattt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6996067 ttgttgctaaaaatataaaagacttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaatacatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 6996166  T
Q  200 gatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    |||  |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6996167 gatgtaaa------ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaatattctttcactgaag 6996221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 316 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8349386 - 8349033
Alignment:
Q  316 attttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| || |||||||||    
T  8349386 attttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtat 8349288  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||     
T  8349287 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattagga 8349191  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||  ||||| || |||||||    
T  8349190 ctttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctcc 8349091  T
Q  611 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    || |||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  8349090 ccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 8349033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 482 - 651
Target Start/End: Original strand, 23785953 - 23786121
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23785953 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23786051  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23786052 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Original strand, 16561138 - 16561284
Alignment:
Q  69 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataa 168  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16561138 gtatgattcaaaatttgttggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttattgacaataa 16561237  T
Q  169 atatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatatttt 215  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  16561238 atatctttttgtaccgtatgaaggaatatttgaaacaaatatatttt 16561284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 439 - 663
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231856
Alignment:
Q  439 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggag 534  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  535 actttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 634  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  635 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaatatctttgtgttct 16231856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 473 - 663
Target Start/End: Original strand, 51757635 - 51757824
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||  ||||||| ||||||    
T  51757635 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctcttt-gtaacg 51757733  T
Q  573 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51757734 atactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26520580 - 26520207
Alignment:
Q  196 atttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnngg-----tatcttcagtgtag 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||            |     ||||||||||||      
T  26520580 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagaagaaaaaaacaaaagaaatgtatcttcagtgtga 26520481  T
Q  291 tattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagag-ggggctg-aaacaatggtttagaaa 388  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||    
T  26520480 tattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aa 26520382  T
Q  389 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagt 485  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||    
T  26520381 gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-agattga-ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagt 26520285  T
Q  486 cttttg------gttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattga 556  Q
    || |||      || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  26520284 ctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattga 26520207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 322 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125455
Alignment:
Q  322 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtt 420  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    || ||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    ||| ||||||| || ||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T
Q  518 gtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 615  Q
    |||||||||||   || ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||       
T  13125591 gtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctccccccctt 13125492  T
Q  616 actaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||    
T  13125491 actaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 574 - 663
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358867
Alignment:
Q  574 tactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11693666 - 11693580
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11693666 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 317 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13785835 - 13785662
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatata 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||    
T  13785835 tgactcaaaaattgatggatggagaatattgtcgctaaaaatatgaaagatttgtttcaaatatattttgtgtttctagaatattgttgctgaaaatata 13785736  T
Q  155 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785735 tttatagatagtaaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 317 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 30790730 - 30790401
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||  |||  |  ||||||||||||   ||    
T  30790730 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---ta 30790636  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| |||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | | |    
T  30790635 gagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagac 30790540  T
Q  513 tttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    |||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |    
T  30790539 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc 30790440  T
Q  611 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  30790439 cc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 541 - 651
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  541 tcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaa-tttggaccgaact 638  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  639 gggtcaacaaatt 651  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 191
Target Start/End: Original strand, 32260746 - 32260882
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatata 154  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||                 |||||||||||||    
T  32260746 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaaagaattgtttaaaatatattttgtgttttcagaagattgttgctgaaaatata 32260845  T
Q  155 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32260846 tttatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 32260882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 317 - 412
Target Start/End: Original strand, 16231546 - 16231641
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16231546 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 372 - 651
Target Start/End: Original strand, 27916500 - 27916780
Alignment:
Q  372 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 471  Q
    |||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   ||||||||||| || |||    
T  27916500 aaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaa 27916593  T
Q  472 ca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaac--tcattgacatctcttt 565  Q
    ||   |||  ||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||| ||||||||   || ||||  ||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  27916594 cactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctcttt 27916693  T
Q  566 tgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  27916694 -gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 14352759 - 14352842
Alignment:
Q  145 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14352759 tgaaaatatatttatgaatagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 454 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613221
Alignment:
Q  454 ttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||| |||||||| ||    |||||||||  ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
     | |||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  648 aattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||| || |||||||| ||||    
T  26613240 aatt-ttgtgtgttctctctt 26613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 473 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 30738808 - 30738625
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 571  Q
    |||| |||||||||| ||||| |   ||||||||||||  ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||     
T  30738808 attaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaa 30738709  T
Q  572 gttactcatca---tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  30738708 gttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 451 - 651
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  451 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgt 546  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||  |||  || |||||| | |||||||||||| ||||   || ||||| |||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  547 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 644  Q
    ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  645 acaaatt 651  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6115538 - 6115479
Alignment:
Q  204 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6115538 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 6115479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 663
Target Start/End: Original strand, 28279385 - 28279563
Alignment:
Q  489 ttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tata 586  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28279385 ttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattata 28279484  T
Q  587 gtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||| ||  ||| | || ||| | |||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  28279485 gtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttct 28279563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 10115509 - 10115653
Alignment:
Q  99 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-----------------tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |     
T  10115509 attgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgcttccataagattgttgttgaaaatatatttatggacaataa--atatttttatc 10115606  T
Q  182 ccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  10115607 ccgtatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaacggaatatt 10115653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13112099 - 13112046
Alignment:
Q  129 caaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtac 182  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13112099 caaatgtattttatgctgaaaatatattcatggacaataaatatatttttgtac 13112046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447260
Alignment:
Q  622 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13447260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 454 - 626
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  454 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||   | ||| |  ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 626  Q
       |||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc-aaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11693753 - 11693686
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11693753 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattattgctaaaattataaaaattttgttttaaatatattt 11693686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 558 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 13127780 - 13127685
Alignment:
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  13127780 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 9476319 - 9476265
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9476319 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127811
Alignment:
Q  322 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 421  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagaga-ggggttgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  422 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatt 475  Q
      || || | ||||||||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt--gggatagattcaccttgggaaacatt 13127811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 21353521 - 21353342
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 571  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||   || ||||  ||||||||||||| |   |||||||| ||||     
T  21353521 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaat---atctcttt-gtaaa 21353427  T
Q  572 gttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |  ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21353426 gaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 648
Target Start/End: Original strand, 47102884 - 47102934
Alignment:
Q  598 ggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47102884 ggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13598454 - 13598402
Alignment:
Q  596 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13598454 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 537 - 607
Target Start/End: Original strand, 43104329 - 43104400
Alignment:
Q  537 tttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||    
T  43104329 tttttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 16124555 - 16124609
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16124555 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19072986 - 19072932
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19072986 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19120876 - 19120822
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19120876 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26613576 - 26613503
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctg-aaacaatggtttagaa 387  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26613576 ttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaa 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 26644936 - 26644990
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26644936 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 47098863 - 47098917
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47098863 ggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 47703975 - 47704029
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47703975 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 354
Target Start/End: Original strand, 43104104 - 43104141
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43104104 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacct 43104141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115344
Alignment:
Q  348 taaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 9526582 - 9526650
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  9526582 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13138020 - 13137976
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13138020 tctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13137976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 584 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  584 atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 50169254 - 50169210
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50169254 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaa 50169210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3281766 - 3281715
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3281766 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6997427 - 6997388
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatt 101  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6997427 tgttgtagtatgactcaaaatatgatggatggagaatatt 6997388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16855296 - 16855265
Alignment:
Q  109 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855296 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 16855265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 29651869 - 29651818
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29651869 ggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 21536608 - 21536662
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  21536608 ggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 606 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  606 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 2393348 - 2393277
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||    
T  2393348 tatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 2393277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 2401287 - 2401215
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  2401287 tatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2401215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157033
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 4144749 - 4144677
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4144749 tatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4144677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 4552681 - 4552637
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4552681 tctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 10925350 - 10925394
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  10925350 tctctcccctagattaggtaaagttggatcgaactgggtcaacaa 10925394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13659380 - 13659336
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223421
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 31659362 - 31659406
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31659362 tctctccctcagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 139)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 669
Target Start/End: Original strand, 21989853 - 21990460
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  21989853 tgttgtagtatgacccaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattgtgt--tgaaaatatatttatgg 21989950  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21989951 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 21990050  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||           | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21990051 aggaaaaaaaaacg-tatcttctgtgtggtattcgttccaaatttatgagttataattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagat 21990149  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990150 agagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 21990248  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| | ||||||   |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21990249 accttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgat 21990348  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990349 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 21990448  T
Q  658 tgttctatcttc 669  Q
    |||||| |||||    
T  21990449 tgttctctcttc 21990460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 37412716 - 37412097
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412716 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 37412617  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37412616 acaataaatataattatgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttccactgaagg 37412517  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatatttt-actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37412516 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtgttattcgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagat 37412419  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgagggttgatt 459  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412418 atagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgatt 37412319  T
Q  460 cacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 556  Q
    ||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37412318 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 37412219  T
Q  557 catctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37412218 tatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattctt 37412119  T
Q  655 ttgtgttctatcttctcttctt 676  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  37412118 ttgtgttctcccttctcttctt 37412097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 20625734 - 20626342
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625734 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20625833  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20625834 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20625933  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |    ||    
T  20625934 agcaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20626032  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20626033 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20626132  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  20626133 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20626232  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626233 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20626332  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  20626333 tttgtgttct 20626342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 20629625 - 20630233
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629625 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20629724  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20629725 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20629824  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |    ||    
T  20629825 agcaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20629923  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20629924 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20630023  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  20630024 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20630123  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630124 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20630223  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  20630224 tttgtgttct 20630233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 20642044 - 20642652
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642044 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20642143  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20642144 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20642243  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |    ||    
T  20642244 agcaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20642342  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20642343 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20642442  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  20642443 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20642542  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642543 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20642642  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  20642643 tttgtgttct 20642652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7472575 - 7471965
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472575 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 7472476  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7472475 gacaataaatatattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 7472376  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    |    
T  7472375 gagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 7472276  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7472275 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7472176  T
Q  456 gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  7472175 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaaccca 7472076  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472075 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 7471976  T
Q  653 ttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||    
T  7471975 ttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 38393683 - 38394290
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38393683 tgttgtagtatgattctaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatttatttatgg 38393782  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38393783 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 38393882  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
     |            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  38393883 tgaaaaaataac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 38393980  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38393981 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 38394080  T
Q  457 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  38394081 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 38394180  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394181 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 38394280  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  38394281 tttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7470622 - 7470007
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470622 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaacatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 7470523  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7470522 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 7470423  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnng-----gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct 354  Q
    |||                 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  7470422 gagaaaagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactt 7470323  T
Q  355 ----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 450  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7470322 tgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgt 7470223  T
Q  451 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgta 547  Q
    |||||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7470222 gggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 7470123  T
Q  548 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470122 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 7470023  T
Q  648 aattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||    
T  7470022 aattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Original strand, 20299154 - 20299764
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299154 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 20299253  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20299254 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 20299353  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    |    
T  20299354 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccatatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 20299451  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaa-tggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgaggg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20299452 gagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgaggg 20299551  T
Q  454 ttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20299552 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 20299651  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299652 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20299751  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||    
T  20299752 tcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 662
Target Start/End: Original strand, 3035415 - 3036027
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035415 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3035514  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3035515 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 3035614  T
Q  262 agnnnnnnnnnnng-gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    ||             ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    |    
T  3035615 agaaagaaaaaaaacgtatcttcagtatggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 3035714  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3035715 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 3035814  T
Q  456 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacg---agaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3035815 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 3035914  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035915 ccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3036014  T
Q  650 ttcttttgtgttc 662  Q
    |||||||||||||    
T  3036015 ttcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 131 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 13099996 - 13099453
Alignment:
Q  131 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099996 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattat 13099897  T
Q  231 atttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaat 329  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13099896 atttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaat 13099798  T
Q  330 atagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099797 atagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt 13099698  T
Q  430 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaatta 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099697 ggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaatta 13099598  T
Q  527 ggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 624  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13099597 ggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 13099498  T
Q  625 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13099497 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 13099453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Original strand, 28487248 - 28487857
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487248 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgcttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 28487347  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28487348 gacaataaatataattttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 28487447  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||           | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||  ||||| |    |    
T  28487448 gagaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtatttgttctaaatttatgagttatacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgaga 28487546  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  456 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    |||||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  28487647 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28487746  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28487747 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 28487846  T
Q  653 ttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||    
T  28487847 ttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 18345237 - 18345845
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18345237 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttattg 18345336  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18345337 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 18345436  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagag-- 358  Q
    ||           | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| | |||      
T  18345437 agaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgaggg 18345535  T
Q  359 --atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
      |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  18345536 agatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttg 18345635  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18345636 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 18345735  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18345736 tgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattct 18345835  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  18345836 tttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 42331593 - 42330977
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331593 tgttgtagtatgacttaaaatttgatgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42331494  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42331493 acaataagtatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 42331394  T
Q  262 agnnnnnnnnnnng----gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctag 356  Q
    ||                ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |    
T  42331393 agaaagaaaaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttg 42331294  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42331293 agatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttg 42331194  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttac--gagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  42331193 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 42331094  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331093 attgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42330994  T
Q  652 cttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||||| ||||    
T  42330993 cttttgtgttctctctt 42330977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 661
Target Start/End: Original strand, 28485261 - 28485867
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485261 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28485360  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28485361 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagg 28485460  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  28485461 aggaaaaaaaacacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 28485560  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28485561 agatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttg 28485660  T
Q  457 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    ||||||||  ||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  28485661 attcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccat 28485760  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485761 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctctcctc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 28485859  T
Q  654 tttgtgtt 661  Q
    ||||||||    
T  28485860 tttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31156501 - 31155896
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31156501 atgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatg 31156402  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31156401 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 31156302  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    |||           |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  | |||| | ||||    
T  31156301 gagaaaaaaaaaacga-atcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgaga 31156203  T
Q  360 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 459  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  31156202 tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgatt 31156103  T
Q  460 cacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 555  Q
    ||||| |||||||   |||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31156102 caccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 31156003  T
Q  556 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 655  Q
    |  |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31156002 atttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 31155904  T
Q  656 tgtgttct 663  Q
    ||||||||    
T  31155903 tgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Original strand, 1849664 - 1850285
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849664 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 1849763  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1849764 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaag 1849863  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 354  Q
    |||           |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||| |         
T  1849864 gagaaaaaaaaaacga-atcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T
Q  355 -----------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 443  Q
               ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1849963 gagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 1850062  T
Q  444 ggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 540  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||   ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1850063 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttat 1850162  T
Q  541 tcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgg 640  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1850163 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgg 1850262  T
Q  641 gtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1850263 gtcaacaaattcttttgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7352246 - 7351637
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7352246 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 7352147  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  7352146 acaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatg 7352047  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| |          
T  7352046 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagag 7351949  T
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  7351948 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 7351849  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7351848 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 7351749  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7351748 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 7351650  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |  ||||||||||    
T  7351649 ttctttgtgttct 7351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 589
Target Start/End: Original strand, 11756925 - 11757460
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756925 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 11757024  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11757025 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 11757124  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  11757125 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 11757222  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaa-tggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgagggt 454  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11757223 agatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggt 11757322  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  11757323 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11757422  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 589  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757423 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7349868 - 7349262
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349868 atgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatg 7349769  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  7349768 gacaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaat 7349669  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 354  Q
    |||            |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  7349668 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 7349571  T
Q  355 -agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 453  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  7349570 gagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtggg 7349471  T
Q  454 ttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7349470 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7349371  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    |||||||||    
T  7349370 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaa 7349276  T
Q  650 ttcttttgtgttct 663  Q
    ||  ||||||||||    
T  7349275 tttctttgtgttct 7349262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 70 - 670
Target Start/End: Original strand, 24258166 - 24258779
Alignment:
Q  70 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258166 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 24258265  T
Q  170 tatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnn 269  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||          
T  24258266 tatatttttgtacagtatgaaggacgatt-gatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcactgaaggagaaaaaa 24258364  T
Q  270 nnnnng----gtatcttcagtgtag--tattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagataga 363  Q
         |    |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||   ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  24258365 ataaagaaatgtatcttcagtgtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagataga 24258464  T
Q  364 gggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 463  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24258465 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcacc 24258564  T
Q  464 tcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatc 560  Q
    | || ||||   |||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||    
T  24258565 ttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatc 24258664  T
Q  561 tcttttgtaacgttactcatca----tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac-aaattcttt 655  Q
    |||||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||    
T  24258665 tcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttt 24258764  T
Q  656 tgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||| ||||||    
T  24258765 tgtgttctctcttct 24258779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 166 - 663
Target Start/End: Original strand, 20297163 - 20297666
Alignment:
Q  166 taaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnn 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||      
T  20297163 taaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggagaa 20297262  T
Q  266 nnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagat 360  Q
              ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||| |    ||||||    
T  20297263 aaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttacgagttatacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagat 20297360  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20297361 agagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattc 20297460  T
Q  461 acctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||     
T  20297461 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgat 20297560  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20297561 ttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttg 20297660  T
Q  658 tgttct 663  Q
    ||||||    
T  20297661 tgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 44724534 - 44724889
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724534 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 44724633  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  44724634 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggact 44724733  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  44724734 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 44724833  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44724834 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 44724889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 276 - 669
Target Start/End: Original strand, 443508 - 443906
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa 374  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  443508 gtatcttcagtgtggaattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaa 443607  T
Q  375 caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac-- 472  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  443608 caatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 443707  T
Q  473 -attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 571  Q
     |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  443708 tattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataac 443807  T
Q  572 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  443808 gttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 443906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 142 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 43254035 - 43253502
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254035 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 43253936  T
Q  242 aaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnng-gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttg 339  Q
    |||| |||||||||||||||||             |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43253935 aaatattctttcactgaaggagaaaaaataagaaagtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttg 43253836  T
Q  340 aatcagagtaaacctagagatagaggg--------ggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 431  Q
     |||||  ||||| | |||| |||| |        ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253835 tatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 43253736  T
Q  432 aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||| |||||  |||||  || | |||||| ||||||||||    
T  43253735 aacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattagg 43253637  T
Q  529 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43253636 cgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaattt 43253537  T
Q  629 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43253536 agaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 43253502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 20137443 - 20137082
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20137443 ttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 20137344  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||    
T  20137343 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggact 20137244  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137243 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 20137144  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20137143 -agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 20137082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 4296270 - 4295907
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagacctt-gaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4296270 ttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 4296171  T
Q  416 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  4296170 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 4296071  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4296070 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctccc 4295971  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4295970 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 4295907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 27306563 - 27306205
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27306563 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatag 27306465  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  27306464 agtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 27306365  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27306364 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccct 27306265  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  27306264 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctcttcttttct 27306205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Original strand, 48457608 - 48457957
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457608 actataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 48457707  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  48457708 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 48457807  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  48457808 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 48457907  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457908 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 44519 - 44868
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44519 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 44618  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  44619 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggact 44718  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||     
T  44719 ttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctccccc 44818  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44819 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 341 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 21592453 - 21592116
Alignment:
Q  341 atcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 440  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592453 atcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 21592354  T
Q  441 tagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagact 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||   ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21592353 tagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagact 21592254  T
Q  538 ttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaac 637  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21592253 tattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaac 21592154  T
Q  638 tgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21592153 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 21592116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 11355213 - 11355567
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355213 ttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11355312  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||    
T  11355313 agtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagact 11355412  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  11355413 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccct 11355512  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11355513 agactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctctt 11355567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 35584 - 35933
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  35584 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtag 35683  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  35684 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 35783  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  35784 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccct 35883  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35884 agactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31435381 - 31435019
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435381 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31435282  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||    
T  31435281 agtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaact 31435182  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31435181 ttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 31435082  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31435081 caaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 31435019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 9680769 - 9681130
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9680769 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttg 9680868  T
Q  412 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 507  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9680869 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 9680968  T
Q  508 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9680969 gagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctc 9681068  T
Q  608 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9681069 tcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttc 9681130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 40837076 - 40836728
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837076 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 40836977  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  40836976 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 40836877  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  40836876 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 40836778  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836777 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 61 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7092769 - 7092414
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7092769 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatg 7092670  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7092669 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 7092570  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    |    
T  7092569 gaggaaaaaaaatt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 7092471  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaa-actagggtttg 411  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7092470 gagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 1049629 - 1049283
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049629 ttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 1049530  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   || | |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  1049529 agtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 1049430  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  1049429 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 1049331  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049330 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 61 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7095016 - 7094662
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7095016 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 7094917  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7094916 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 7094817  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |    |    
T  7094816 gaggaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 7094718  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094717 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 24748549 - 24748904
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24748549 ttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatag 24748648  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||    
T  24748649 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggact 24748748  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24748749 ttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctc 24748848  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24748849 cagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24748904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 21678021 - 21678380
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21678021 ttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatag 21678120  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  21678121 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggact 21678220  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21678221 ttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccct 21678320  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  21678321 agactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattc--ttgtgttctctcttcttttct 21678380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 39146321 - 39145965
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39146321 ttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatag 39146222  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||    
T  39146221 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaact 39146122  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  39146121 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccc 39146022  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39146021 taaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39145965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 21679982 - 21680346
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679982 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 21680081  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||    
T  21680082 agtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggact 21680181  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  21680182 ttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctccccc 21680281  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaa---ctgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  21680282 agactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctcttcttttct 21680346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 327 - 663
Target Start/End: Original strand, 3878540 - 3878881
Alignment:
Q  327 aatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 424  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878540 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 3878639  T
Q  425 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtag 521  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  3878640 tctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 3878739  T
Q  522 aattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactagg 621  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3878740 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatg 3878839  T
Q  622 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878840 ttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Original strand, 25542486 - 25542830
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25542486 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 25542584  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 514  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||    
T  25542585 agtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactt 25542684  T
Q  515 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 614  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  25542685 tgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctccccta 25542783  T
Q  615 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542784 gactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 42223111 - 42223474
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagg-gggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42223111 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 42223210  T
Q  416 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  42223211 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 42223310  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42223311 ctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccc 42223410  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  42223411 ccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttct 42223474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 355 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 1047220 - 1046912
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1047220 agagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 1047121  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1047120 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1047021  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047020 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1046922  T
Q  652 cttttgtgtt 661  Q
    ||||||||||    
T  1046921 cttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679361
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  412 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 507  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  508 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 9679307  T
Q  608 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    |  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9679308 tttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 361 - 663
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946632
Alignment:
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    || | || |||||   ||| |||||||||| || |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946527 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40946626  T
Q  658 tgttct 663  Q
    ||||||    
T  40946627 tgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 61 - 345
Target Start/End: Original strand, 38395985 - 38396269
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38395985 atgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 38396084  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38396085 tacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 38396184  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcag 345  Q
    |||            |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38396185 gagaaaaaaaaaac-gtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 38396269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 62 - 364
Target Start/End: Original strand, 1606171 - 1606472
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1606171 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 1606270  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1606271 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 1606370  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||    
T  1606371 agaaaaaaaaac--gaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 1606468  T
Q  361 agag 364  Q
    ||||    
T  1606469 agag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 62 - 262
Target Start/End: Original strand, 47865328 - 47865528
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865328 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 47865427  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47865428 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 47865527  T
Q  262 a 262  Q
    |    
T  47865528 a 47865528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 61 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21470884 - 21470614
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470884 atgttgtagtttgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 21470785  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21470784 gacaataaatatatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 21470685  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatata 332  Q
    |||            |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21470684 gagaaaaaaaaac--gtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 21470614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 432 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092198
Alignment:
Q  432 aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  529 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 628  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaattt 7092233  T
Q  629 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092232 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 25276096 - 25276439
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276096 ttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 25276195  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  25276196 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 25276295  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||           ||||||    
T  25276296 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg-----------ctcccc 25276384  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  25276385 -agactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctctt 25276439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 317 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 27832968 - 27832631
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg-gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||||||||    || ||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27832968 ttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtata 27832869  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  27832868 gagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 27832769  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27832768 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctccc 27832669  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    | |||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  27832668 ccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 317 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22251876 - 22251611
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22251876 ttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 22251777  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 516  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22251776 agtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga-----taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttg 22251682  T
Q  517 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatcat 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22251681 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 432 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094445
Alignment:
Q  432 aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  529 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 628  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  629 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 3676997 - 3677301
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  3676997 tgttgtagtatgactcaaaatttgatagatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaa----------- 3677085  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
            |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3677086 --------tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 3677177  T
Q  262 ag-nnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttat-attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    ||             |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  3677178 agagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatgtttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggaga 3677277  T
Q  360 tagagggggctgaaacaatggttta 384  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||    
T  3677278 taga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 318 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817362
Alignment:
Q  318 tttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| || || ||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 24817389  T
Q  613 tagactaggtca-atttggaccgaact 638  Q
     | |||||||||  |||||||||||||    
T  24817388 catactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 317 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22828967 - 22828672
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828967 ttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatag 22828868  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||  |  | ||||   |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||    
T  22828867 agtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagact 22828768  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22828767 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 317 - 549
Target Start/End: Original strand, 26804528 - 26804762
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804528 ttttactataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 26804623  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacac---tagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  || |    
T  26804624 agtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgag 26804723  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26804724 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 443325 - 443474
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443325 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 443424  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  443425 gacaataaatatatttttgtaccgtctgaagaacaatttgatgcaaatat 443474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Original strand, 7188498 - 7188833
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  7188498 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtatag 7188596  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
     ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||| | ||    
T  7188597 ggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagact 7188693  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  7188694 ttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccc 7188793  T
Q  613 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     || ||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188794 cagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Original strand, 18567568 - 18567724
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567568 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18567667  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18567668 agtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 18567724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 317 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 20091875 - 20091583
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20091875 ttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggtttgtata 20091778  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||| || || | |||||| | ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  20091777 gagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagac 20091681  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20091680 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctcccc 20091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 440 - 663
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  440 ctagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 536  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  537 tttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 636  Q
    || || ||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctcttt-gtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  637 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 391 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813477
Alignment:
Q  391 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtct 487  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  488 tttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tata 586  Q
     ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  587 gtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctcttc 24813477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 513 - 668
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394032
Alignment:
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 22394032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 482 - 651
Target Start/End: Original strand, 2935392 - 2935560
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2935392 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 2935490  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2935491 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465829
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |   ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| |    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctccc 24465789  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | ||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  24465790 ccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 22137202 - 22137381
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22137202 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 22137299  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22137300 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22137381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 40552229 - 40552408
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  40552229 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 40552326  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40552327 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40552408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 22108191 - 22108370
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22108191 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 22108288  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22108289 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22108370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40281987 - 40281824
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaata--ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggaca 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40281987 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaagaatttgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggaaa 40281888  T
Q  165 ataaatatatttttgtaccgtatg-aagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  40281887 ataaatatatttttgtaccgtatgaaagaat-atttgatacggatatatttttaaaaggaatatt 40281824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 40549951 - 40550130
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  40549951 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 40550048  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40550049 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40550130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 482 - 651
Target Start/End: Original strand, 1606504 - 1606671
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  1606504 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 1606601  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1606602 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 9027358 - 9027191
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  9027358 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 9027261  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9027260 aaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 499 - 654
Target Start/End: Original strand, 26295587 - 26295743
Alignment:
Q  499 gaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggag 597  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  26295587 gaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagat 26295686  T
Q  598 ggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  26295687 gactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Original strand, 6332181 - 6332514
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggca-acaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  || |||||| | |||||||||  ||    
T  6332181 ttttactataaatataaaacttgtatcagagtaa-ccttgagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacaga-ctagggttt--at 6332274  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||| || |||  ||||||||  | || |||||   |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |     
T  6332275 agagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgaga 6332371  T
Q  512 ctttgggtagaattaggc-gggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  6332372 ctttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctc 6332471  T
Q  610 ccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6332472 ccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 506
Target Start/End: Original strand, 22392428 - 22392608
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |        ||  ||||||||||||||||||    
T  22392428 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata--------aatcaaactagggtttgtatag 22392519  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagat 506  Q
    | |||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22392520 aatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 10690684 - 10690845
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat------ttatggacaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   || | ||      ||||| ||||    
T  10690684 tgactcaaaatttgatggagggagaagattgttgctaaaaatataaaag-tatgtttcaaatatattttgtgctttcaaaaaattgttgcttatgtacaa 10690782  T
Q  166 taaatatatttttgtaccgtatga-agaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  10690783 taaatatatttttgtaccatgtgacagaat-atttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 10690845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759431
Alignment:
Q  596 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 372 - 668
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081819
Alignment:
Q  372 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 471  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  472 ca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcatt--gacatctcttt 565  Q
    ||   ||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||  |||| ||| |||||||   || ||||  |||||||||| | ||  || |||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  566 tgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||| |||||||||| | | | || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttct 11081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 125
Target Start/End: Original strand, 20297108 - 20297161
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297108 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 20297161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 362 - 423
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  362 gagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 423  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 583
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  489 ttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 583  Q
    ||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 614 - 675
Target Start/End: Original strand, 26804765 - 26804826
Alignment:
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26804765 agactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 26804826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 473 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16297200 - 16297018
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgac-atctcttttgtaa 570  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||    || || |  |||||||||| | || |  |||||||||| ||    
T  16297200 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaacccttttaatatctcttttgcaa 16297101  T
Q  571 cgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  16297100 agttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12310528 - 12310442
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310528 tgctgaaattatacttaaggacagttaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12310608 - 12310542
Alignment:
Q  79 aaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 145  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12310608 aaatttaatggatgaagaagattgttgctactgatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 12310542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 43254069 - 43254023
Alignment:
Q  70 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254069 tatgtctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 43254023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 46516349 - 46516403
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46516349 ggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 6067264 - 6067183
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  6067264 tatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttct 6067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 628 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251564
Alignment:
Q  628 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 22251564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 495 - 636
Target Start/End: Original strand, 6046629 - 6046772
Alignment:
Q  495 acgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaa 592  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||   | |||||| |||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  6046629 acgagaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaa 6046727  T
Q  593 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaa 636  Q
     | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  6046728 tgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 9190047 - 9190101
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9190047 ggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20284147 - 20284093
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20284147 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29159861 - 29159807
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29159861 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30906405 - 30906327
Alignment:
Q  297 ttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa 374  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30906405 ttccaattttatgatggatacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaa 30906327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379861
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 25410246 - 25410318
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25410246 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546874
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 447
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  322 ctataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 419  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa-gtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  420 ttgtctctttggaacaaacactagggtt 447  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 2580448 - 2580394
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  2580448 ggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21983342 - 21983288
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21983342 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 4796707 - 4796760
Alignment:
Q  595 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4796707 gagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 2075231 - 2075303
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  2075231 tatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 7464585 - 7464513
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  7464585 tatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069833
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 56005 - 55955
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  56005 ggagggctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 140
Target Start/End: Original strand, 6628853 - 6628884
Alignment:
Q  109 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628853 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 6628884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12485023 - 12484976
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatga 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  12485023 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12484976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12506454 - 12506407
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatga 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  12506454 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12506407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12657698 - 12657667
Alignment:
Q  109 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657698 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 12657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 2647735 - 2647789
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  2647735 ggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 9185204 - 9185258
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9185204 ggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12485074 - 12485044
Alignment:
Q  109 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12485074 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12485044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12506505 - 12506475
Alignment:
Q  109 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506505 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12506475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 473 - 654
Target Start/End: Original strand, 25351360 - 25351539
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 571  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||   || ||||  ||||||||||||| |   |||||||| ||||     
T  25351360 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaat---atctcttt-gtaaa 25351454  T
Q  572 gttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |  ||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25351455 gaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 28617264 - 28617318
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28617264 ggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 33332489 - 33332543
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  33332489 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 35960874 - 35960820
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960874 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 44010816 - 44010775
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 624  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44010816 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 2121015 - 2121087
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2121015 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaattctt 2121087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 3320117 - 3320049
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3320117 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 3324865 - 3324797
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3324865 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3324797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153510
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 18126768 - 18126812
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  18126768 tctctcccccagactaggtcaagtttgaccgacctgggtcaacaa 18126812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 25405508 - 25405576
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  25405508 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25405576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814604
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732969
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41649011
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 43864368 - 43864412
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43864368 tctctctcccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 44512583 - 44512520
Alignment:
Q  591 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  44512583 aacggagagctgctctctccc-tagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 44512520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 48489555 - 48489599
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaa 48489599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 119)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 67 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 18511797 - 18511185
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511797 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 18511698  T
Q  167 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  18511697 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18511598  T
Q  267 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagataga 363  Q
             ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||    
T  18511597 aaaaaac--gtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagataga 18511500  T
Q  364 gggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 463  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511499 gggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 18511400  T
Q  464 tcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatc 560  Q
    | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||    
T  18511399 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatc 18511300  T
Q  561 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 660  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18511299 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 18511200  T
Q  661 tctatcttctcttct 675  Q
    ||| |||||| ||||    
T  18511199 tctctcttcttttct 18511185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 25803707 - 25804318
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803707 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 25803806  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25803807 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 25803906  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |          
T  25803907 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaatttgagaga 25804004  T
Q  355 ---agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 451  Q
       |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25804005 gagagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgag 25804104  T
Q  452 ggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 548  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25804105 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25804204  T
Q  549 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25804205 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataa 25804303  T
Q  649 attcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||    
T  25804304 attcttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 67 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 18509902 - 18509291
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509902 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 18509803  T
Q  167 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  18509802 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18509703  T
Q  267 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagataga 363  Q
             ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||    
T  18509702 aaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcatcccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagataga 18509605  T
Q  364 gggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 463  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509604 gggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 18509506  T
Q  464 tcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatc 560  Q
    | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  18509505 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatc 18509406  T
Q  561 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 660  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18509405 tattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 18509306  T
Q  661 tctatcttctcttct 675  Q
    ||| |||||| ||||    
T  18509305 tctctcttcttttct 18509291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 669
Target Start/End: Original strand, 26097421 - 26098031
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097421 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtactgaaaatatatttatgg 26097520  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaa--agggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26097521 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 26097620  T
Q  260 ggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagag 358  Q
    ||||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26097621 ggaggaaaaaaaaatg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgag 26097719  T
Q  359 atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 458  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26097720 atagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgat 26097819  T
Q  459 tcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 556  Q
    |||||| || || || |||| || ||||||| ||||||||| ||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26097820 tcaccttggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 26097919  T
Q  557 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 656  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26097920 tatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattctttt 26098018  T
Q  657 gtgttctatcttc 669  Q
    ||||||| |||||    
T  26098019 gtgttctctcttc 26098031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Original strand, 27912218 - 27912830
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912218 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 27912317  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27912318 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 27912417  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 354  Q
    |||            |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  27912418 gagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 27912517  T
Q  355 -agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 453  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  27912518 gagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgaggg 27912617  T
Q  454 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27912618 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 27912717  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912718 cattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27912817  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||    
T  27912818 tcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Original strand, 18468697 - 18469303
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468697 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 18468796  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18468797 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 18468896  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    |    
T  18468897 gagaaaataaaaa--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgaga 18468994  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18468995 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 18469094  T
Q  456 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18469095 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaaccca 18469194  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18469195 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctctccc--agactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattc 18469292  T
Q  653 ttttgtgttct 663  Q
    ||||| |||||    
T  18469293 ttttgcgttct 18469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Original strand, 27910134 - 27910744
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910134 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 27910233  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27910234 gacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 27910333  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 354  Q
    |||           | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  27910334 gagaaaaaaaaaaag-tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgaga 27910432  T
Q  355 -agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 453  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27910433 gagagatagcgggggctgaaacaa-ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaggg 27910531  T
Q  454 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27910532 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 27910631  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910632 cattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27910731  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||    
T  27910732 tcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 70 - 662
Target Start/End: Original strand, 18596334 - 18596939
Alignment:
Q  70 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18596334 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggacaataaa 18596433  T
Q  170 tata-----------tttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactga 258  Q
    ||||           |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  18596434 tataccataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaatattctatcactga 18596533  T
Q  259 aggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctaga 357  Q
    |||||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18596534 aggagaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgg 18596632  T
Q  358 gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18596633 gatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttga 18596730  T
Q  458 ttcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 554  Q
    ||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18596731 ttcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcatt 18596830  T
Q  555 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18596831 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattct 18596930  T
Q  654 tttgtgttc 662  Q
    |||||||||    
T  18596931 tttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 15551925 - 15552539
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15551925 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatgg 15552024  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15552025 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15552124  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||           | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          
T  15552125 agaaaaaaaaaacg-tatcttcagcgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 15552223  T
Q  355 ----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 450  Q
        ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  15552224 agagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgt 15552323  T
Q  451 gggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgt 546  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15552324 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 15552423  T
Q  547 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 646  Q
    ||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15552424 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 15552522  T
Q  647 aaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15552523 aaatttctttgtgttct 15552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 142 - 663
Target Start/End: Original strand, 18466453 - 18466978
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466453 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 18466552  T
Q  242 aaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttga 340  Q
    |||| |||||||||| ||||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18466553 aaatattctttcactaaaggagaaaaaaaa----gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgt 18466648  T
Q  341 atcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 436  Q
    |||||  ||||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18466649 atcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaa 18466748  T
Q  437 acactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga 533  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18466749 acactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga 18466848  T
Q  534 gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggacc 633  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18466849 gacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 18466948  T
Q  634 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466949 gaactgggtcaacaaattcttttgttttct 18466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 82 - 663
Target Start/End: Original strand, 10586549 - 10587126
Alignment:
Q  82 tttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586549 tttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 10586648  T
Q  182 ccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatct 281  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            ||||||    
T  10586649 tcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaac-gtatct 10586747  T
Q  282 tcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaaca 376  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||||||||| ||||||||||||    
T  10586748 tcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataga-ggggctgaaaca 10586846  T
Q  377 atggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac--- 472  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  10586847 agggtttagaatggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 10586935  T
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||| |||| ||||| ||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||||||||    
T  10586936 attaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacg 10587034  T
Q  573 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587035 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 61 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26098842 - 26098379
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098842 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 26098743  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  26098742 gacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaaaattctttcattgaag 26098643  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    |||            ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26098642 gagaaataaaaaaacgtatcttcaatgtggtattcgttccaattttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggaga 26098543  T
Q  360 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 459  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098542 tagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgatt 26098443  T
Q  460 cacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggta 520  Q
    ||||| |  ||||   |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  26098442 caccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattggggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 2818670 - 2818313
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2818670 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatag 2818571  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt-gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||| |    
T  2818570 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggac 2818471  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2818470 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccc 2818371  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2818370 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 2818313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 195 - 669
Target Start/End: Original strand, 40221340 - 40221823
Alignment:
Q  195 gatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnng------gtatcttcagtgt 288  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||                  |||||||||||||    
T  40221340 gatttgtttcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgcaggagaaggaaaaaacaaaaaacgtatcttcagtgt 40221439  T
Q  289 agtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaa 388  Q
      ||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  40221440 gatatccgttctaaatttatgagttac-ttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 40221538  T
Q  389 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagt 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||   |||| ||||||||    
T  40221539 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 40221638  T
Q  486 cttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-ta 584  Q
    || ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40221639 ctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 40221738  T
Q  585 tagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  40221739 tagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctcttc 40221823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 21947972 - 21948326
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21947972 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 21948070  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||| ||    
T  21948071 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 21948170  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21948171 ttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 21948270  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21948271 agactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21948326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 321 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 10529429 - 10529091
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10529429 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtt 10529330  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10529329 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgg 10529230  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  10529229 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagac 10529130  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529129 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 25904048 - 25904403
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904048 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatag 25904147  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25904148 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggct 25904247  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  25904248 ttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccc 25904347  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25904348 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 25904403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 25921807 - 25921458
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25921807 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 25921708  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  25921707 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 25921608  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  25921607 ctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctccccc 25921508  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921507 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 657
Target Start/End: Original strand, 17072828 - 17073172
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17072828 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 17072927  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  17072928 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggct 17073027  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    || | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17073028 ttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccc 17073127  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073128 cagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 321 - 669
Target Start/End: Original strand, 39854433 - 39854783
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854433 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 39854531  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||||||    
T  39854532 tgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgg 39854631  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  39854632 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 39854731  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39854732 tagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39854783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 2174864 - 2175212
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174864 ttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 2174963  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  2174964 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 2175063  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  2175064 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 2175162  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175163 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 4236574 - 4236922
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236574 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 4236673  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  4236674 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 4236773  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  4236774 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 4236873  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4236874 aaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 319 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474302
Alignment:
Q  319 ttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 418  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  419 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggcttt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  516 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 615  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  10474455 gagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccat 10474356  T
Q  616 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10474355 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 10474302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 24126801 - 24127155
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24126801 ttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 24126900  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  24126901 agtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggact 24127000  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24127001 ttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 24127100  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24127101 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24127155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 38882050 - 38882399
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg-gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882050 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38882149  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  38882150 gagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 38882249  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  38882250 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctc 38882348  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882349 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1189948 - 1189586
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1189948 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttg 1189849  T
Q  412 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  1189848 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattg 1189749  T
Q  509 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  1189748 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctc 1189649  T
Q  608 tcc-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189648 tcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1189586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 318 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 16092537 - 16092172
Alignment:
Q  318 tttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct---agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 413  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16092537 tttactagaaatatagactttgtatcagatgtaaacttgtgagagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 16092438  T
Q  414 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  16092437 tagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 16092338  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16092337 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctc 16092238  T
Q  610 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16092237 ctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 16092172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 16776102 - 16776451
Alignment:
Q  317 ttttactataaa-tatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776102 ttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 16776201  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  16776202 gagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 16776301  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  16776302 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccc 16776400  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776401 cagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 16776451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 31472947 - 31472590
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472947 ttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31472848  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  31472847 agtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggact 31472748  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    || |||||||||||||||||  | | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31472747 tttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccc 31472648  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31472647 catactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 31472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 6745052 - 6745362
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6745052 agagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggt 6745150  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6745151 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 6745250  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745251 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 6745350  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||    
T  6745351 cttttgtgttct 6745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 6756439 - 6756798
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6756439 ttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatag 6756538  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||    
T  6756539 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagact 6756638  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6756639 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccc 6756735  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  6756736 caaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctcttcttttct 6756798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 12556257 - 12555896
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12556257 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 12556158  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |    
T  12556157 agtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattggag-t 12556059  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  12556058 tttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccc 12555959  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12555958 catactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttctcttct 12555896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 323 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818477
Alignment:
Q  323 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 422  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  423 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggt 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  520 agaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagacta 619  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||| | ||||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaacta 17818521  T
Q  620 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818520 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17818477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 317 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 37706114 - 37705774
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37706114 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatag 37706015  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |    
T  37706014 actttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 37705915  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||     
T  37705914 ttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctccccc 37705815  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37705814 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 31545025 - 31545374
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545025 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31545124  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  31545125 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggac 31545224  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31545225 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 31545323  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31545324 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31545374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 34477350 - 34477038
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34477350 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 34477251  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 549  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  34477250 tgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 34477151  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477150 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34477052  T
Q  650 ttcttttgtgttct 663  Q
    |||| |||||||||    
T  34477051 ttctcttgtgttct 34477038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Original strand, 6747253 - 6747598
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaaccta--gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||   |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  6747253 actataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaa 6747352  T
Q  419 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggcttt 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6747353 tttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggacttt 6747451  T
Q  516 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 615  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||    
T  6747452 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcag 6747550  T
Q  616 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747551 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6747598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 36402662 - 36402306
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||    
T  36402662 ttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatag 36402563  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |   ||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||  ||    
T  36402562 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaact 36402463  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||     
T  36402462 ttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctccccc 36402363  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36402362 agactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 36402306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 31542680 - 31543028
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542680 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31542779  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  31542780 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 31542879  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31542880 tttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 31542977  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31542978 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 34479715 - 34479403
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34479715 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 34479616  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 549  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  34479615 tgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 34479516  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479515 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34479417  T
Q  650 ttcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||    
T  34479416 ttcttttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 21684747 - 21684437
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  21684747 agagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggt 21684648  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||| ||| |||| ||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21684647 tgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactc 21684548  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684547 attgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 21684449  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
    | ||||||||||    
T  21684448 cgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 695834 - 696177
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  695834 ttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-- 695931  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 514  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  695932 ---------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 696022  T
Q  515 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  696023 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccc 696122  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  696123 agacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 696177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 31179705 - 31179368
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179705 ttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31179606  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  31179605 agtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 31179506  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31179505 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 31179407  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31179406 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 394 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658329
Alignment:
Q  394 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtctttt 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| ||| |||||| ||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  491 ggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 590  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  591 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  658410 aacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 658329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 39398326 - 39397978
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||| || ||| | | | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398326 ttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 39398228  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||  |    
T  39398227 agtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaac 39398129  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  39398128 tttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctccca 39398029  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  39398028 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttct 39397978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 62 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3373630 - 3373348
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3373630 tgttgtagtatgactcagaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 3373531  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3373530 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 3373431  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatca 344  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3373430 agaaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 3373348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 324 - 675
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954722
Alignment:
Q  324 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 423  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  424 ctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggt 519  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  520 agaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagacta 619  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttt-gtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaacta 2954666  T
Q  620 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2954667 ggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 2954722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 323 - 668
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289060
Alignment:
Q  323 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 422  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  423 tctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 514  Q
    ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |  || || |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttgaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactt 21288914  T
Q  515 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 614  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21288915 tggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca--------tcttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccca 21289006  T
Q  615 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21289007 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctctt 21289060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31466312 - 31465962
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  31466312 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatag 31466213  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||    
T  31466212 agtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggact 31466113  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||          |||||||||||| ||||     
T  31466112 ttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcaccccc 31466024  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  31466023 agactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctcttcttttct 31465962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 317 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 34531000 - 34530731
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34531000 ttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatag 34530901  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||    
T  34530900 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggact 34530801  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 583  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34530800 ttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 439 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585729
Alignment:
Q  439 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  536 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 635  Q
    ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  636 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 41585729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 450 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505823
Alignment:
Q  450 agggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgt 546  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  547 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 646  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc--tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  647 aaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  20505844 aaattcttttgtgttctctctt 20505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 278 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 6661555 - 6661181
Alignment:
Q  278 atcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaa 377  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  6661555 atcttcagtgttatatccgtttcaaatttatgagttatatttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaa 6661456  T
Q  378 tggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---at 474  Q
     ||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||   |||||||||||||  |||||||   ||    
T  6661455 gggtttag-aagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcaccatgggaaacactat 6661360  T
Q  475 taagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 574  Q
    || |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  6661359 taggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 6661260  T
Q  575 actcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     ||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6661259 gctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 21288529 - 21288713
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288529 tgttgtagtataactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaataaaaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 21288628  T
Q  162 acaataaatatatttt-tgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 245  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288629 acaataaatatattttcggtaccgtatgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 434 - 669
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724193
Alignment:
Q  434 caaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcg 530  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  531 ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgg 630  Q
    || || || |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  631 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2724193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 317 - 531
Target Start/End: Original strand, 20044955 - 20045172
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20044955 ttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 20045054  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||    
T  20045055 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggact 20045154  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgg 531  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20045155 ttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 317 - 527
Target Start/End: Original strand, 20042995 - 20043208
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20042995 ttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 20043094  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  20043095 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 20043194  T
Q  514 ttgggtagaattag 527  Q
    |||| |||||||||    
T  20043195 ttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 451 - 663
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  451 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgta 547  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  548 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    || ||||||  |||||||| ||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  648 aattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 439 - 663
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  439 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 535  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  536 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 635  Q
    ||| ||||||||||  |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  636 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 317 - 658
Target Start/End: Original strand, 36208525 - 36208865
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||| || |    
T  36208525 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-taga 36208621  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatta---agattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||| || |||||  |    | | |||||||||   |  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  36208622 gagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagac 36208718  T
Q  513 tttgggtagaattaggcggg-agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  36208719 tttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttcc 36208818  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 658  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36208819 cc-atactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17415893 - 17415748
Alignment:
Q  69 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17415893 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaataa 17415794  T
Q  169 atatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattt 214  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  17415793 atatatttttgtactgtatgaaggaaaatttgatgcaaatatattt 17415748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 482 - 655
Target Start/End: Original strand, 10749814 - 10749986
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10749814 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 10749912  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 655  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749913 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020514
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| ||| ||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    ||||||   ||||| | ||||||||||||||||  ||  ||||||||||| || |||||   |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |    
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggag 9020360  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  9020361 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcc 9020460  T
Q  611 cctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     | | | ||||||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  9020461 tccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttct 9020514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 655
Target Start/End: Original strand, 10757291 - 10757462
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  10757291 gagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttcttt-gtaacgttactcatc 10757388  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 655  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10757389 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 15354739 - 15354560
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  15354739 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatt 15354642  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15354641 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15354560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 23665158 - 23665337
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23665158 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23665255  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23665256 aaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23665337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741844
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23741926  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23741925 aaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 23793429 - 23793250
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23793429 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23793332  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23793331 aaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23793250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 15357015 - 15356836
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  15357015 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatt 15356918  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15356917 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15356836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 317 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20507796 - 20507659
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  20507796 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatag 20507697  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20507696 agtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 483 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 3373301 - 3373122
Alignment:
Q  483 agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca 582  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||    
T  3373301 agtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatca 3373203  T
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3373202 tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 3373122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 38960296 - 38960117
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  38960296 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 38960199  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38960198 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 38960117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 359 - 668
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054136
Alignment:
Q  359 atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 458  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  459 tcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 555  Q
    |||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||  ||||     ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttggaga-----ttgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  556 acatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattct 20054121  T
Q  654 tttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||| ||||    
T  20054122 tttgtgttctctctt 20054136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6662033 - 6661929
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6662033 tgttgtagtatgacttaaaacttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 6661934  T
Q  162 acaat 166  Q
    |||||    
T  6661933 acaat 6661929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 558 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 26098379 - 26098267
Alignment:
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26098379 atctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctttt 26098280  T
Q  657 gtgttctatcttc 669  Q
     |||||| |||||    
T  26098279 atgttctctcttc 26098267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 41586082 - 41585946
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa 374  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41586082 gtatcttcagtctggtattcgttccaaatctatgagttatacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaa 41585983  T
Q  375 caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    ||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41585982 caagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 359
Target Start/End: Original strand, 15143262 - 15143475
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  15143262 tgctaaaaatatatttatggacaataaatacatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgc 15143354  T
Q  242 aaatgttctttcactgaag--gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttg 339  Q
    |||| ||||||||||||||  | |            |||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15143355 aaatattctttcactgaagaaggggaaaaaagaaacgtatcttcagcgtgatatccgttacaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttg 15143454  T
Q  340 aatcaga-gtaaacctagaga 359  Q
     |||||| |||||||| ||||    
T  15143455 tatcagatgtaaaccttgaga 15143475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 478 - 651
Target Start/End: Original strand, 15143574 - 15143750
Alignment:
Q  478 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 576  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    
T  15143574 gattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 15143673  T
Q  577 tcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||    
T  15143674 tcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaacaaatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 141
Target Start/End: Original strand, 40221281 - 40221361
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221281 atgttgtagtatgactcaaaatttaattgatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 40221361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 4410006 - 4410101
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410006 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 372 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413176
Alignment:
Q  372 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 471  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaa-ggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  472 ca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga-ctttttcttgtaactcattgacatctcttttg 567  Q
    ||   ||| |||||||||| ||||| | | |||||||||| | |||| ||||||||||||   || | ||| |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 17413248  T
Q  568 taacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 637  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||||    
T  17413247 taaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 585 - 668
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043289
Alignment:
Q  585 tagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 20043289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 116
Target Start/End: Original strand, 15143220 - 15143274
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15143220 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 15143274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5779217 - 5779144
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 145  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5779217 tgacttaaaatttgatagatgaagaagattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 5779144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 499 - 584
Target Start/End: Original strand, 42770940 - 42771025
Alignment:
Q  499 gaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcata 584  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42770940 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Original strand, 18466410 - 18466465
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466410 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 18466465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 537
Target Start/End: Original strand, 42770719 - 42770934
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  42770719 ttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaattagg-tttatata 42770814  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 514  Q
    || |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| |||||||  ||||||| |||| || ||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||    
T  42770815 gaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaactattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 42770911  T
Q  515 tgggtagaattaggcgggagact 537  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  42770912 tgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 540 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 15445375 - 15445263
Alignment:
Q  540 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 637  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  15445375 ttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttccc-agactaggtcagtattggactgaac 15445277  T
Q  638 tgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||| ||||||||    
T  15445276 tgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 478 - 662
Target Start/End: Original strand, 4897837 - 4898023
Alignment:
Q  478 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggc-gggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 576  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||    
T  4897837 gattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattgtaaagttac 4897936  T
Q  577 tcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 662  Q
    |||||| ||||| | ||| | |||||||| ||||||| | ||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4897937 tcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt-ttttgtgttc 4898023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 564 - 652
Target Start/End: Original strand, 23667513 - 23667601
Alignment:
Q  564 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23667513 tttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238448
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 9353371 - 9353425
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9353371 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28832317 - 28832263
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28832317 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 36932389 - 36932443
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36932389 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 366
Target Start/End: Original strand, 2723912 - 2723961
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggg 366  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2723912 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14520283 - 14520234
Alignment:
Q  599 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14520283 gctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 648
Target Start/End: Original strand, 17004004 - 17004053
Alignment:
Q  599 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17004004 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 2144647 - 2144599
Alignment:
Q  564 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2144647 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 22672950 - 22673022
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22672950 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 25445612 - 25445684
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25445612 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 215
Target Start/End: Original strand, 32520241 - 32520316
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaa--tatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatatttt 215  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  32520241 tgctgaaaatatatttatgtagagtaaaaatatatttttgtaccgtacgaagaaaaatttgatgcaaacatatttt 32520316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2532784 - 2532750
Alignment:
Q  109 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2532784 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatcttgtg 2532750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 10281809 - 10281755
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10281809 ggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 11917011 - 11917065
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11917011 ggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15464590 - 15464536
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15464590 ggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19588804 - 19588750
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19588804 ggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 648
Target Start/End: Original strand, 24553549 - 24553599
Alignment:
Q  598 ggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  24553549 ggctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 24553599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 624
Target Start/End: Original strand, 10627482 - 10627523
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 624  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10627482 tatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtca 10627523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 645
Target Start/End: Original strand, 13488327 - 13488368
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13488327 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 13488368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 17841315 - 17841246
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  17841315 tatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17841246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 648
Target Start/End: Original strand, 31300644 - 31300689
Alignment:
Q  603 ctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31300644 ctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533937
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 1170926 - 1170994
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  1170926 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 1170994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2144926 - 2144878
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagag 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  2144926 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 2144878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 654
Target Start/End: Original strand, 28786528 - 28786592
Alignment:
Q  591 aacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  28786528 aacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 28786592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 35385518 - 35385450
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  35385518 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 35385450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428430
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 12061 - 11451
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12061 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 11962  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11961 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 11862  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11861 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagat 11764  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11763 agagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattt 11664  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
     ||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||     
T  11663 tccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgat 11564  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11563 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttg 11464  T
Q  658 tgttctatcttct 670  Q
    |||||| ||||||    
T  11463 tgttctctcttct 11451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 114)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 42924094 - 42923482
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42924094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42923995  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42923994 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42923895  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agag 358  Q
    ||            ||||||||||    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  42923894 agaacaaataa---gtatcttcag----gtgttcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagag 42923802  T
Q  359 atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 458  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923801 atagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 42923702  T
Q  459 tcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 555  Q
    |||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  42923701 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattg 42923602  T
Q  556 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 655  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923601 atatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 42923502  T
Q  656 tgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  42923501 tgtgttctctcttcttttct 42923482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 23452829 - 23452222
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23452829 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaataaatttatgg 23452730  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23452729 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 23452630  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||            ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  23452629 agaaaaaaaaaa--gtaccttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 23452532  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23452531 agacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 23452432  T
Q  457 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  23452431 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccat 23452332  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452331 tgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 23452232  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  23452231 tttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 42452449 - 42453050
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452449 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42452548  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42452549 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42452648  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||           | ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||    
T  42452649 agaaaaaaaaaatg-tatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagat 42452747  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42452748 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggttgattc 42452845  T
Q  461 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  42452846 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 42452945  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452946 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 42453044  T
Q  658 tgttct 663  Q
    ||||||    
T  42453045 tgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 35216185 - 35215571
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216185 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 35216086  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35216085 gacaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaag 35215986  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 354  Q
    |||            | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  35215985 gagaaaaaaaaat--gaatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 35215888  T
Q  355 -----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 449  Q
         ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35215887 gagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttg 35215788  T
Q  450 agggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttg 545  Q
     |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35215787 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttg 35215688  T
Q  546 taactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35215687 taactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 35215589  T
Q  646 caaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||   ||||||||||    
T  35215588 caaatatctttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 35218565 - 35217948
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218565 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 35218466  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35218465 acaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 35218366  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |          
T  35218365 agaaaaaaaaac--gaatcttcagtgtggtatttgctccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgagag 35218268  T
Q  355 --------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 446  Q
            ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35218267 agagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggt 35218168  T
Q  447 ttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 542  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  35218167 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattc 35218068  T
Q  543 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 642  Q
    ||||||| | ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35218067 ttgtaacccgttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 35217969  T
Q  643 caacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||   ||||||||||    
T  35217968 caacaaatatctttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 19007561 - 19007910
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19007561 ttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatag 19007660  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  19007661 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggct 19007760  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  19007761 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctccccc 19007860  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19007861 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 19007910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22287670 - 22287315
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287670 ttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22287571  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||   ||    
T  22287570 agtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacact 22287471  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22287470 tcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccct 22287371  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22287370 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22287315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264127
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatag 6264384  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6264184  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6264183 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6264127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19504679 - 19504331
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504679 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 19504580  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  19504579 agtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggctgggact 19504481  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||     
T  19504480 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctccccc 19504381  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504380 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 40032392 - 40032032
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032392 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 40032293  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||| || || ||    
T  40032292 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggact 40032193  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40032192 ttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctct 40032093  T
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40032092 ccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 40032032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 316 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19502346 - 19501996
Alignment:
Q  316 attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19502346 attttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 19502247  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | |    
T  19502246 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 19502147  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  19502146 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccc 19502047  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502046 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 21521029 - 21520672
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21521029 ttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtat 21520930  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||||  | ||     
T  21520929 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctagga 21520830  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21520829 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccc 21520730  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21520729 ccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21520672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 28196558 - 28196917
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196558 ttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 28196657  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  28196658 agtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggct 28196757  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  28196758 ttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctccccc 28196857  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28196858 agactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 28196917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 45280315 - 45279969
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 419  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280315 actataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 45280216  T
Q  420 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  45280215 ttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 45280116  T
Q  517 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 616  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  45280115 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 45280016  T
Q  617 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280015 ctaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 13910378 - 13910030
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910378 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 13910279  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  ||    
T  13910278 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaact 13910179  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||     
T  13910178 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctccccc 13910080  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910079 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 27104720 - 27105067
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104720 ttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27104819  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  27104820 agtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 27104918  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  27104919 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 27105017  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105018 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 6259149 - 6258796
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6259149 ttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatag 6259050  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  6259049 agtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggggct 6258952  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258951 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6258852  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6258851 -atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6258796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 42064436 - 42064785
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064436 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 42064535  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  42064536 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 42064635  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  42064636 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 42064734  T
Q  614 agactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064735 agactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 43623902 - 43623553
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623902 ttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43623803  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||            |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  43623802 agtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 43623715  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  43623714 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 43623615  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43623614 aaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 43623553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 11739894 - 11739537
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  11739894 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatgg 11739795  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| |||||||   |||||||||||| ||    
T  11739794 agtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggact 11739695  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  11739694 ttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 11739595  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11739594 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 11739537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 17848366 - 17848722
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17848366 ttttactataaatataggctttgtatcag--taatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 17848463  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  17848464 agtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 17848563  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17848564 tttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccc 17848659  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17848660 catactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 17848722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 17849038 - 17849393
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  17849038 ttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatag 17849137  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||    
T  17849138 agtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagact 17849237  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17849238 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctccca 17849336  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17849337 catactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17849393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 14837194 - 14837544
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  14837194 ttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacat 14837293  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||      |||||||||| | ||    
T  14837294 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagact 14837387  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14837388 ttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccc 14837487  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14837488 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 24162546 - 24162208
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162546 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 24162447  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |          |||| ||    
T  24162446 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggact 24162357  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||     
T  24162356 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctccccc 24162258  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24162257 ggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 324 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979562
Alignment:
Q  324 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 423  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  424 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggta 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  521 gaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct-ctcccctagact 618  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||| | |||| | |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  619 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 34979562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 319 - 669
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022448
Alignment:
Q  319 ttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 418  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  419 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggcttt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| || |||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  516 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca----------tatagtgaaacggagggctgctc 605  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||| ||| |||||||||||          |||| |||||| || ||||||||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctc 3022384  T
Q  606 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3022385 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3022448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 317 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 45239315 - 45239000
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45239315 ttttactataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 45239216  T
Q  412 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 507  Q
    |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45239215 tatagacttt--ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 45239118  T
Q  508 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239117 ggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 45239018  T
Q  608 tcccctagactaggtcaa 625  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  45239017 tcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 317 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31733099 - 31732772
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31733099 ttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 31733000  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||| |||||            ||||| ||    
T  31732999 agtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggact 31732912  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31732911 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccc 31732812  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31732811 cagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 44289402 - 44289046
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| || |||||| || ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44289402 ttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 44289303  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  44289302 agtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggact 44289203  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    | ||||||||||| | || | |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||    
T  44289202 tagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccc 44289103  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44289102 caaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 44289046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 11578438 - 11578104
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  11578438 ttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtatag 11578340  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    | ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  11578339 aatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggact 11578244  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  11578243 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccc 11578144  T
Q  613 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     ||||||| |||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  11578143 cagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 317 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 18800636 - 18800283
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||          || |||||||||||||||    
T  18800636 ttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtatag 18800545  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  18800544 aggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggct 18800449  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18800448 ttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctctcccc 18800349  T
Q  613 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttcttct 678  Q
     |||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18800348 -agaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttcttct 18800283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 317 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539553
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 446 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375319
Alignment:
Q  446 tttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 542  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  543 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 642  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  643 caacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 5375319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 22874063 - 22874406
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| ||||||||| || | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  22874063 ttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatag 22874154  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| || || ||| |||||||||| ||||    
T  22874155 agtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggct 22874250  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    || |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  22874251 ttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccct 22874350  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  22874351 catactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 22874406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27583908 - 27583631
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27583908 atgttgtagtatgactcaaattttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatg 27583809  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583808 aacaataaatatatttttataccatatgaaggaatatttgatgcaaatatattttgaaaaggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaag 27583716  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcaga 346  Q
    |||            |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  27583715 gagaaaaaagaaat-gtatcttcagcgtgatatccgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagatcttgtatcaga 27583631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 506 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407433
Alignment:
Q  506 ttggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 605  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  606 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22407433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459170
Alignment:
Q  406 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaag 502  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  503 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggct 601  Q
    || |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  602 gctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  28459235 tctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctctt 28459170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 317 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22407743 - 22407591
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407743 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22407644  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggga 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22407643 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146604
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||| |     |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||| |||||||| ||    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |     
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgaga 20146746  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20146745 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 20146646  T
Q  611 cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |  |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20146645 ctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 36559029 - 36558849
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  36559029 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 36558931  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36558930 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36558849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 36561306 - 36561126
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  36561306 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 36561208  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36561207 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36561126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28568740 - 28568584
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaata 171  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28568740 tgactcaaaatttgatagatgaagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttcaaatatattttgttttgaaaatatatttatggacaataaata 28568641  T
Q  172 tatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28568640 tatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 28568584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22163281 - 22163125
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22163281 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatag 22163182  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22163181 agtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaaca 22163125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 17897576 - 17897242
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctga-aacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  17897576 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgtat 17897479  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||| |     
T  17897478 agagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgaga 17897383  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  17897382 ttttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctctcc 17897283  T
Q  611 cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    || ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  17897282 cc-agactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 45332346 - 45332166
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||| |||| | ||||||||    
T  45332346 gagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctcttt-gtaaaggtactcatc 45332248  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45332247 atatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 45332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 559 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22162995
Alignment:
Q  559 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 22163012  T
Q  659 gttctatcttctcttct 675  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  22163011 gttctctcttcttttct 22162995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 529 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707730
Alignment:
Q  529 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct--agactaggtcaat 626  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  627 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22707730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 38020160 - 38020348
Alignment:
Q  354 tagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38020160 tagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgaggg 38020259  T
Q  454 ttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagatt-ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||  || ||||   |||| |||||||||| |||||           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38020260 ttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt-----------attgggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 38020348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27136505 - 27136368
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaat--------at 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||    
T  27136505 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattggtgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatataaatat 27136406  T
Q  154 atttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27136405 atttatggaaaataaatatatttttgtaccgtatgaag 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 519 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  519 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagact 618  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  619 aggtcaa-tttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 321 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5377763 - 5377629
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| |    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5377763 actataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatag 5377664  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5377663 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 37963283 - 37962938
Alignment:
Q  296 gttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaac 394  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||            
T  37963283 gttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga-------- 37963192  T
Q  395 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatta---agattgagtcttttg 491  Q
    ||  |||||||||||||| || |||||| |||||   ||||||||| | ||||   | |||||||| |||  | ||||||||   ||||||||||| |||    
T  37963191 aatcaaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttg 37963096  T
Q  492 gttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtga 590  Q
    || ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||    | |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  37963095 gtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattga---tttttttgtaaagttattcatcattatagtga 37962999  T
Q  591 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||| | || ||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37962998 aacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 528 - 669
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871092
Alignment:
Q  528 gcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 627  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  628 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctcttc 23871092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34575696 - 34575608
Alignment:
Q  69 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575696 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttctaaatatattttgtgctgaaaatatattt 34575608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693755
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatata 154  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||    
T  15693583 tgacttaaaatttgatggatgaataatattgttgctaaaaatataaa-gatttgtttcaaatatattttgtgcttccaaaaacttgttgctgaaaatata 15693681  T
Q  155 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  15693682 tttatgggcaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 452 - 651
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  452 ggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgta 547  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||| || |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  548 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  646 caaatt 651  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 35107221 - 35107571
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatg-gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||| |  || |||| | | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  35107221 ttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtata 35107318  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||||| | |||||||||    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  35107319 gagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgac 35107412  T
Q  513 tttgggtagaattaggcg--ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
    |||||||||||||||     | |||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||     
T  35107413 tttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaac-ctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctt 35107511  T
Q  610 ccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     || ||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  35107512 tcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctctt 35107571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 410
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 410  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41303623 - 41303457
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaa-tataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatat 153  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||    
T  41303623 tgactcagaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgcttccataagattgttgctgaaaatat 41303524  T
Q  154 atttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaag 220  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||| ||||    
T  41303523 atttatggacagtaaatataattttgtaccgtgtgaaggaagaattgattcaaatatatttttaaag 41303457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 137
Target Start/End: Original strand, 28568346 - 28568411
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568346 tgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 28568411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 478 - 597
Target Start/End: Original strand, 20589775 - 20589896
Alignment:
Q  478 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 576  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||    
T  20589775 gattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctcttttgtgaagttac 20589874  T
Q  577 tcatca-tatagtgaaacggag 597  Q
    |||||| ||||||| |||||||    
T  20589875 tcatcattatagtgtaacggag 20589896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 406 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  406 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaag 502  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| || || |||||   ||| |||||| ||| ||||| |||  |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  503 agattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactc 578  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Original strand, 39286971 - 39287042
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatatt 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  39286971 tgcttaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccatatgaatgaagatttgatgcaaatatatt 39287042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12342744 - 12342684
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaa 377  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12342744 ttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa 12342684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 228
Target Start/End: Original strand, 7502638 - 7502723
Alignment:
Q  143 gctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatga-agaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  7502638 gctgaaaatatatttatgaacaataaaaatatttttgtattgtatgacagaa-gatttgatgcaaatatatttttaaaggaaatatt 7502723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34575617 - 34575528
Alignment:
Q  167 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggag 263  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34575617 aaatatatttttgtaccatataaaggaaaatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 34575528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 13828507 - 13828338
Alignment:
Q  485 tcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 583  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||| |   || ||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  13828507 tcttttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataat 13828408  T
Q  584 -atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt-tggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     |||||| ||| |   ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  13828407 tatagtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatt 13828338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 624 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539508
Alignment:
Q  624 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 15539508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  439 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 535  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg-gaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Original strand, 39286892 - 39286952
Alignment:
Q  76 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 140  Q
    |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39286892 tcaaaatttgatggatg----agattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatttt 39286952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41304884 - 41304806
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagg 221  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  41304884 tgctgacaatatatttatggatagtaaatatatttttgta-catatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 41304806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 14699046 - 14699100
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14699046 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38414340 - 38414281
Alignment:
Q  346 agtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414340 agtaaaccttgagatagagggggctgaaac------ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 38191128 - 38191200
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  38191128 tatagtggaacgaagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 38191200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 7502582 - 7502633
Alignment:
Q  75 ctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgt 126  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7502582 ctcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctcaaagtataaaagatttgt 7502633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 604 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 17490192 - 17490149
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17490192 tctctcccctagagtaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 364
Target Start/End: Original strand, 40699231 - 40699278
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagag 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  40699231 ttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 8390189 - 8390243
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8390189 ggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13569386 - 13569332
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13569386 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20522278 - 20522224
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20522278 ggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41304964 - 41304898
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41304964 tgactcaaaatttgatggatgaagaagatt-----taaaaatataaaagatttg--tcaaatatattttgtgct 41304898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 654
Target Start/End: Original strand, 1345587 - 1345640
Alignment:
Q  601 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1345587 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 1345640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 654
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838129
Alignment:
Q  601 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 2838129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 10942597 - 10942497
Alignment:
Q  564 tttgtaacgttactcatca--tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 660  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||| |||| || |||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10942597 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgt 10942498  T
Q  661 t 661  Q
    |    
T  10942497 t 10942497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 10948466 - 10948366
Alignment:
Q  564 tttgtaacgttactcatca--tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 660  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||| |||| || |||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10948466 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgt 10948367  T
Q  661 t 661  Q
    |    
T  10948366 t 10948366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 27517705 - 27517633
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  27517705 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattctt 27517633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 33162494 - 33162450
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33162494 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 33162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36318053 - 36318009
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36318053 tctctcccttagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36318009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 39680160 - 39680228
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  39680160 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39680228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 39687098 - 39687166
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  39687098 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  605 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 2869732 - 2869786
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  2869732 ggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 2869786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8040118 - 8040064
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8040118 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 10445483 - 10445537
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  10445483 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 28259216 - 28259270
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28259216 ggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 593 - 654
Target Start/End: Original strand, 30479120 - 30479182
Alignment:
Q  593 cggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  30479120 cggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 30479182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31056102 - 31056048
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  31056102 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 34682373 - 34682427
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34682373 ggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 528
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139509
Alignment:
Q  372 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 471  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||| || ||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  472 cattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg 528  Q
    |||||    |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattagg 43139509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 12781287 - 12781246
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 624  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12781287 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 12781246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 2736320 - 2736388
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  2736320 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14633869 - 14633825
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14633869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 14633825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 17462551 - 17462619
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  17462551 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17462619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 528
Target Start/End: Original strand, 17921777 - 17921833
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg-ctttgggtagaattagg 528  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17921777 attaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773730
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312408
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679906
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 45679906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 670
Target Start/End: Original strand, 78883 - 79495
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  78883 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtctcaaatatattttctgctaaaaatatatttatgg 78982  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  78983 ataataaatatatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 79082  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  79083 aggaaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagat 79182  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  79183 agagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattc 79282  T
Q  461 acctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  79283 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 79382  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 657  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  79383 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttg 79482  T
Q  658 tgttctatcttct 670  Q
    |||||| ||||||    
T  79483 tgttctctcttct 79495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 654
Target Start/End: Original strand, 51708 - 52307
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51708 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatg 51807  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51808 gacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 51907  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--aga 357  Q
    |||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |  |||    
T  51908 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga 52005  T
Q  358 gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52006 gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattga 52105  T
Q  458 ttcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 554  Q
    ||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52106 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcatt 52205  T
Q  555 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52206 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc 52305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 183969 - 183626
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  183969 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 183871  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  183870 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgg 183772  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  183771 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagac 183672  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183671 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Original strand, 50151 - 50230
Alignment:
Q  54 atgtttcatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 133  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50151 atgttacatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 50230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50308
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctc--ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Original strand, 170076 - 170118
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccg 184  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  170076 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgtaccg 170118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 160)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14788022 - 14787423
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14788022 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatg 14787923  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14787922 gacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 14787823  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--aga 357  Q
    |||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |  |||    
T  14787822 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga 14787725  T
Q  358 gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14787724 gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattga 14787625  T
Q  458 ttcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 554  Q
    ||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14787624 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcatt 14787525  T
Q  555 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc--tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14787524 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc 14787425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 644
Target Start/End: Original strand, 56030189 - 56030770
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030189 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 56030288  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  56030289 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaatattctttcactgaagg 56030388  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatatttt-actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  56030389 agaaaaaaaaaa--gtatcttcggtgtggtattctttccaaatttatgagttatatttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagat 56030486  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030487 agaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 56030586  T
Q  461 acctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 557  Q
    |||| |||||||   |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030587 accttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 56030686  T
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 644  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030687 atttcttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 24347959 - 24348566
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24347959 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-gaaaatatatttatgg 24348057  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24348058 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 24348157  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||           | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    ||    
T  24348158 agaaaaaaaaaaag-tatcttcaatgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagag 24348256  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24348257 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttg 24348356  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  24348357 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccat 24348456  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348457 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24348556  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  24348557 tttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 17662826 - 17662223
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662826 tgttgtagtatgactacaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 17662727  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17662726 acaataaatatatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 17662627  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    ||    
T  17662626 agaaaaaaaaaa--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 17662529  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17662528 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttg 17662440  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17662439 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 17662340  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662339 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 17662240  T
Q  654 tttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17662239 tttgtgttctctcttct 17662223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 44600428 - 44599823
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44600428 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 44600329  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44600328 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 44600229  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||| | |||||    
T  44600228 aggaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagat 44600129  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44600128 agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 44600029  T
Q  461 acctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 556  Q
    |||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44600028 accttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 44599929  T
Q  557 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 656  Q
      |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  44599928 tttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatcttt 44599830  T
Q  657 gtgttct 663  Q
    |||||||    
T  44599829 gtgttct 44599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22132988 - 22132389
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132988 atgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 22132889  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22132888 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 22132789  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||    
T  22132788 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 22132691  T
Q  360 tagag---------ggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 450  Q
     ||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  22132690 gagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgt 22132592  T
Q  451 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgta 547  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22132591 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 22132492  T
Q  548 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    || ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132491 acccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 22132393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 62 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22135219 - 22134615
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135219 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 22135120  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22135119 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaatattctttcactgaagg 22135020  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| | ||||     
T  22135019 agaaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagag 22134921  T
Q  361 agag---------------ggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 445  Q
    ||||               ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22134920 agagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-ttcaaacaaacactaggg 22134822  T
Q  446 tttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 542  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22134821 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattc 22134722  T
Q  543 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 642  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134721 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggt 22134624  T
Q  643 caacaaatt 651  Q
    |||||||||    
T  22134623 caacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 61 - 454
Target Start/End: Original strand, 5100742 - 5101133
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100742 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 5100841  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5100842 gacaacaaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 5100941  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    |||            ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5100942 gagaaaaaaaac---gtatcttcaatctggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgaga 5101038  T
Q  360 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101039 tagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 38928512 - 38928155
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928512 ttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 38928413  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  38928412 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggc 38928313  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38928312 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccc 38928213  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38928212 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 38928155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Original strand, 48486318 - 48486665
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486318 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 48486417  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  48486418 agtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 48486517  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  48486518 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccc 48486617  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48486618 agactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 48486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 321 - 670
Target Start/End: Original strand, 40637077 - 40637429
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637077 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 40637176  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  40637177 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 40637276  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40637277 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 40637376  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40637377 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 40637429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 24888795 - 24889151
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24888795 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatag 24888894  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||    
T  24888895 agtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggact 24888994  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24888995 ttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 24889094  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24889095 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttct 24889151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 22803068 - 22802712
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803068 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22802969  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  22802968 agtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 22802869  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||     
T  22802868 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctccccc 22802769  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802768 agactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 22802712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 5198419 - 5198768
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5198419 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatag 5198518  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5198519 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggct 5198618  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  5198619 ttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 5198718  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198719 agactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Original strand, 14633323 - 14633666
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14633323 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 14633421  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14633422 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgg 14633520  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14633521 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagac 14633620  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633621 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415461
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctc 33415523  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33415522 aggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttcttttct 33415461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 40091749 - 40091388
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  40091749 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttag 40091650  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  40091649 agtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 40091550  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40091549 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc 40091450  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40091449 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 40091388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 22801196 - 22800840
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22801196 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 22801097  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||  || | ||    
T  22801096 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagact 22800997  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22800996 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccc 22800897  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22800896 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 22800840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 24878988 - 24879344
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24878988 ttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 24879087  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  24879088 agtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 24879187  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879188 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24879287  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24879288 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24879344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 24880450 - 24880806
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880450 ttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 24880549  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  24880550 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 24880649  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880650 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24880749  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24880750 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24880806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 47274726 - 47275073
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47274726 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata- 47274824  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||   |||| ||    
T  47274825 agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggact 47274924  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47274925 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc- 47275023  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47275024 agactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 19095881 - 19096236
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19095881 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 19095980  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  19095981 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagc 19096080  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19096081 tttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccc 19096180  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19096181 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 19096236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 11434954 - 11435302
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434954 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11435053  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||  |||||||  ||||||  | || ||    
T  11435054 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggact 11435153  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11435154 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccct 11435252  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435253 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 37089708 - 37089357
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct---agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37089708 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 37089609  T
Q  414 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||    
T  37089608 tagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctggg 37089509  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37089508 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 37089410  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089409 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 169 - 668
Target Start/End: Original strand, 19322547 - 19323048
Alignment:
Q  169 atatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnn 268  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         
T  19322547 atatatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa 19322646  T
Q  269 nnnnnng-gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg 367  Q
            ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19322647 aaagaaatgtatcttcaatgtgatattcattccaaatttatgagttatattcatctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggg 19322746  T
Q  368 gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgg 467  Q
    | |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  19322747 gatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgg 19322842  T
Q  468 gaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctt 564  Q
    ||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  19322843 gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 19322942  T
Q  565 ttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 662  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19322943 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttc 19323042  T
Q  663 tatctt 668  Q
    | ||||    
T  19323043 tctctt 19323048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 8631753 - 8631404
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631753 actataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 8631654  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  8631653 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 8631554  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  8631553 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 8631454  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631453 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 12401141 - 12400786
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401141 ttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 12401042  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  12401041 agtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgact 12400942  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12400941 ttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccccc 12400842  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12400841 agactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12400786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22044724 - 22044376
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044724 ttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22044625  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  22044624 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 22044525  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||      
T  22044524 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctc 22044426  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044425 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22047019 - 22046671
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047019 ttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22046920  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  22046919 agtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 22046820  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||      
T  22046819 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctc 22046721  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046720 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 36921829 - 36921466
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921829 ttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36921731  T
Q  415 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  36921730 atagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 36921631  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36921630 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 36921531  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36921530 cccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 36921466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 9148250 - 9148600
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9148250 ttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtat 9148349  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||     
T  9148350 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 9148449  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9148450 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 9148548  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148549 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 12396179 - 12395824
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396179 ttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 12396080  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  12396079 agtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgact 12395980  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12395979 ttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccccc 12395880  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12395879 agactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12395824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 36919921 - 36919563
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctaga--gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36919921 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggat 36919822  T
Q  415 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  36919821 aaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 36919722  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  36919721 acttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcc 36919622  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36919621 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 36919563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 16453308 - 16453670
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  16453308 ttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaa 16453407  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16453408 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggact 16453507  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16453508 ttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccc 16453607  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16453608 cagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctcttcttttct 16453670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 36378291 - 36378653
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378291 ttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 36378390  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   |||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||    
T  36378391 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggact 36378490  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36378491 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 36378590  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  36378591 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctcttcttttct 36378653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 619781 - 619428
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  619781 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatag 619682  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| |||||| | | ||||||| | |||||||||||| ||    
T  619681 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtct 619582  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  619581 ttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccct 619482  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  619481 a-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Original strand, 6764842 - 6765192
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764842 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 6764941  T
Q  421 tgtctcttt-----ggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||| |    
T  6764942 tgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggac 6765041  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  6765042 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 6765141  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765142 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 51015245 - 51015593
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015245 ttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 51015344  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  51015345 tgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 51015444  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||      
T  51015445 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctc 51015543  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015544 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 321 - 661
Target Start/End: Original strand, 47868404 - 47868747
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868404 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 47868503  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||    
T  47868504 tgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgg 47868603  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  47868604 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccatac 47868703  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47868704 taggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 7941318 - 7941671
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941318 ttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 7941417  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaa--cactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 509  Q
    ||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||||  |||    
T  7941418 agagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgg 7941517  T
Q  510 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  7941518 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 7941617  T
Q  610 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941618 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 78 - 668
Target Start/End: Original strand, 30136331 - 30136903
Alignment:
Q  78 aaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136331 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 30136430  T
Q  178 tgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggt 277  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||            ||    
T  30136431 tgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaatattctttcattgaaggagaaaaaaaaaac-gt 30136529  T
Q  278 atcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaaca 376  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||| | |||| | ||||| || ||||||||       ||||||    
T  30136530 atcttcagtgtgatattcgttctaaatttattagttatatttctctataaatatatacctagtatcaaatgtaaatcttgagataga-------gaaaca 30136622  T
Q  377 atggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---a 473  Q
    | ||||| |  |||||||           ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||   |    
T  30136623 aaggttt-gggaggcaac-----------ggtttgtatagagttt-actcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacacta 30136707  T
Q  474 ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgt 573  Q
     || ||||| |||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  30136708 ctatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagt 30136807  T
Q  574 tactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  30136808 taatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctt 30136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 18847152 - 18847500
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847152 ttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18847251  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  18847252 agtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 18847351  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  18847352 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 18847450  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847451 -agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 38409198 - 38409552
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga------tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38409198 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 38409297  T
Q  411 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  38409298 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 38409397  T
Q  508 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38409398 gggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 38409496  T
Q  608 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38409497 tcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2485203 - 2484858
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagataga-gggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 419  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485203 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 2485104  T
Q  420 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 516  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  2485103 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 2485004  T
Q  517 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 616  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  2485003 ggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 2484905  T
Q  617 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2484904 ctaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 190 - 663
Target Start/End: Original strand, 53404998 - 53405481
Alignment:
Q  190 agaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgta 289  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||            |||| ||||||||     
T  53404998 agaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaaaaaaaaaaacgtattttcagtgtg 53405097  T
Q  290 gtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggttta 384  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  53405098 gtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataga-ggggctgaaacaagggttta 53405196  T
Q  385 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||    
T  53405197 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt 53405295  T
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga------ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 575  Q
    |||||| |||||||||  |||||  || | |||| |||||||||| ||||||||      ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||    
T  53405296 gagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgata 53405395  T
Q  576 ctcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53405396 ctcatcatatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttct 53405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 18709547 - 18709149
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--------agagatagaggg 366  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |        ||||||||||||    
T  18709547 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagaggg 18709448  T
Q  367 ggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcg 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  18709447 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttg 18709348  T
Q  467 ggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 563  Q
    ||||||   |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||     
T  18709347 ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 18709249  T
Q  564 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709248 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 18709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 11006575 - 11006222
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaa----acctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||     |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006575 ttttactataaatatagaccttgtatcagactattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 11006476  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattg 508  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  11006475 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctg 11006376  T
Q  509 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11006375 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11006277  T
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11006276 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9174480 - 9174131
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9174480 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 9174381  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  9174380 agtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagac 9174281  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||    
T  9174280 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccc 9174182  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9174181 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9174131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31849933 - 31849584
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849933 ttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31849834  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacact-agggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||  || | |    
T  31849833 agtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagac 31849734  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31849733 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 31849635  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849634 cagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313050
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||  |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccc 37313101  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37313100 cagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttct 37313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 318 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 9176807 - 9176461
Alignment:
Q  318 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 417  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9176807 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaa 9176708  T
Q  418 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  9176707 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 9176608  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  9176607 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 9176509  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9176508 agactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 11008862 - 11008553
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11008862 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 11008763  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  11008762 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 11008663  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  ||   ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11008662 cattgatttc---tttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 11008566  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||    
T  11008565 tcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 16934477 - 16934128
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16934477 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 16934378  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  16934377 agtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagac 16934278  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16934277 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 16934179  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934178 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 391 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085962
Alignment:
Q  391 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtct 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  488 tttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatag 587  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  588 tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    || | |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 16932123 - 16931774
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16932123 ttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 16932024  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  16932023 agtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagac 16931924  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16931923 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 16931825  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16931824 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22780669 - 22780358
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22780669 agagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 22780570  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22780569 tgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22780470  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22780469 cattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
       ||||||||||    
T  22780370 atctttgtgttct 22780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22783034 - 22782723
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22783034 agagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 22782935  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22782934 tgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22782835  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22782834 cattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
       ||||||||||    
T  22782735 atctttgtgttct 22782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 320 - 651
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997828
Alignment:
Q  320 tactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 419  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  420 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 516  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| || |||||| ||| |||||| |  ||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  517 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctag 615  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctcccc-ag 41997792  T
Q  616 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41997793 actaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 317 - 628
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  412 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 507  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  508 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 13544251  T
Q  608 tcccctagactaggtcaattt 628  Q
    |  || |||||||||||||||    
T  13544252 tttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 317 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 5637803 - 5637524
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637803 ttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 5637704  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  5637703 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 5637604  T
Q  510 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 589  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637603 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 276 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 47211122 - 47210756
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga------tagaggggg 368  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||      |||||||||    
T  47211122 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagaggggg 47211023  T
Q  369 ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |            | |||    
T  47211022 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttggg 47210935  T
Q  469 aaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttt 565  Q
    |||||   ||| |||||||||| || |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  47210934 aaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 47210835  T
Q  566 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 644  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47210834 tgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 317 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3824907 - 3824629
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||     ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3824907 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 3824810  T
Q  412 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  3824809 tatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctg 3824710  T
Q  509 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 589  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824709 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 394 - 675
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380710
Alignment:
Q  394 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtctttt 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  491 ggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtg 589  Q
    ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  590 aaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 36380710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 18409680 - 18409344
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409680 ttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18409582  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc-tcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||| || ||||   |||||||||| | ||    
T  18409581 agtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagact 18409482  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||     
T  18409481 tttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccct 18409383  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18409382 cagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 431 - 654
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455581
Alignment:
Q  431 gaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattag 527  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  528 gcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 626  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  627 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 16455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 18537805 - 18537470
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  18537805 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtata 18537708  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  18537707 gagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac 18537611  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18537610 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 18537511  T
Q  612 ctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | | | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18537510 ccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 401 - 669
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499396
Alignment:
Q  401 actagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||   |||| |||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  498 agaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgga 596  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    | | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaac---ctaatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  597 gggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27499325 gggctgctctttcccc-agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27499396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8756584 - 8756231
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||    
T  8756584 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgtata 8756486  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtct-tttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |     
T  8756485 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgaga 8756389  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  8756388 ctttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcc 8756289  T
Q  611 cctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     | ||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  8756288 tccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 8756231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 317 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3937542 - 3937314
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3937542 ttttactataaatatagactttta-tcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatag 3937444  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||   ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  3937443 agtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggct 3937344  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttct 543  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3937343 ttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 18535163 - 18534828
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  18535163 ttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtata 18535066  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |    
T  18535065 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagac 18534969  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  18534968 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctccccc 18534869  T
Q  612 ctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | ||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  18534868 ccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 473 - 669
Target Start/End: Original strand, 13547312 - 13547508
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  13547312 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaag 13547411  T
Q  573 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  13547412 ttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttc 13547508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 492 - 663
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215654
Alignment:
Q  492 gttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 591  Q
    |||||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  592 acggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4215654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47211308 - 47211158
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47211308 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctcaaaatatatttatgg 47211209  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatat 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47211208 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 642
Target Start/End: Original strand, 10112626 - 10113198
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10112626 tgttgtagtatgacttaaaatttgttgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaag----gtttcaaatatattttgtgctgaaactatatttatgg 10112721  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||| |||||       |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  10112722 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgtaaatata-tttgaaagagaata-------tttgatgcaaatattatttcactaaagg 10112813  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata--ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagag 358  Q
    ||            |||||||||| ||   || |||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||    
T  10112814 agaaaaaaaaaat-gtatcttcagcgtgaaatccgttccaaatttatgagttatatttttttttataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgag 10112912  T
Q  359 atagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 457  Q
    | |||||| | || |||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||||    
T  10112913 agagagggagttgaaaacaagggtttag-aagccaacacaaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattga 10113006  T
Q  458 ttcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttac-gagaagagattggggctttgggtagaattag-gcgggagactttttcttgtaa-ctc 551  Q
    |||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||    | |||||  ||||||||| ||     
T  10113007 ttcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctt 10113106  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 642  Q
     |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  10113107 tttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 512 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 5635612 - 5635461
Alignment:
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5635612 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 5635513  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635512 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 321 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 52942777 - 52942537
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaat--cagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942777 actataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 52942679  T
Q  419 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggcttt 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||             || |||    
T  52942678 tttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-------------gggttt 52942592  T
Q  516 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52942591 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 512 - 663
Target Start/End: Original strand, 11437560 - 11437710
Alignment:
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11437560 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 11437658  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437659 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 473 - 669
Target Start/End: Original strand, 2891449 - 2891646
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  2891449 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgatatctcttttgtaagg 2891548  T
Q  573 ttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2891549 ttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2891646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 317 - 533
Target Start/End: Original strand, 6132872 - 6133090
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6132872 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatag 6132970  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  6132971 agtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 6133070  T
Q  514 ttgggtagaattaggcggga 533  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6133071 ttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 398 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  398 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  | ||||||||   ||| |||||||||| ||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  495 acgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaac 593  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38270320 - 38270164
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38270320 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 38270221  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38270220 agtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaaca 38270164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 9022060 - 9022225
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9022060 tgttgtagtatgattcaaaattttatggatgagaaatattgttgttgaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttat-g 9022158  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9022159 acaataaatatatttttctaccgtatgaagaaagatttgatgcaaatatattttaaaagggaatatt 9022225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 317 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 15032870 - 15032557
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  15032870 ttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatag 15032772  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||| ||||||| ||||||          ||||| ||||||||  |  |||||||   ||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||| || ||    
T  15032771 agtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggact 15032684  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| || ||||||||||||||    
T  15032683 tttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccc 15032584  T
Q  613 tagactaggtcaat-ttggaccgaact 638  Q
     | ||||||||| | ||||||||||||    
T  15032583 caaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24446913 - 24446762
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  24446913 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatag 24446819  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24446818 agtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 24446762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 516 - 663
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101276
Alignment:
Q  516 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 615  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcccc-ag 5101228  T
Q  616 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5101276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38890701 - 38890517
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||    
T  38890701 tgttgtagcatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatt------------------tatgg 38890620  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaaggg-aatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  38890619 acaataaatatatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaag 38890520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 317 - 435
Target Start/End: Original strand, 2891315 - 2891434
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttg-aatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891315 ttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 2891414  T
Q  416 gagtttgtctctttggaaca 435  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2891415 gagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 563 - 669
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563115
Alignment:
Q  563 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 662  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 47563108  T
Q  663 tatcttc 669  Q
    | |||||    
T  47563109 tctcttc 47563115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454020
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| |||| | | ||| |||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||       
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtaga-gagtctgaaaacaagggtttag-aagccaacactaaaactagggtttg--c 28453781  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||| ||||| | || |||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||     
T  28453782 agagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    | |||||||||||||||  | |||||  |||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcc 28453978  T
Q  611 cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    || ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28453979 cccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Original strand, 9863507 - 9863650
Alignment:
Q  70 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 169  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9863507 tatgactcaaaatttgttggatgaaatatattgttactaaaaatataaatgatttgtttcaaacatattttgtgctaaaaatatatttatgaacaataaa 9863606  T
Q  170 tatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttg 216  Q
    |||||||||||   | |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  9863607 tatatttttgt---gcatgaaggaagatttgatgcaaatatattttg 9863650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 453 - 651
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  453 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaa 548  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||||| | | ||| |||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  549 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 646  Q
    | || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  647 aaatt 651  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Original strand, 19322413 - 19322510
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgtt-gctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19322413 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattttttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttatactgaaaatatatttatggac 19322510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 540 - 655
Target Start/End: Original strand, 49088794 - 49088911
Alignment:
Q  540 ttcttgtaactcattgacatct-cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct-agactaggtcaatttggaccgaac 637  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  49088794 ttcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccgaac 49088893  T
Q  638 tgggtcaacaaattcttt 655  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49088894 tgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 312 - 651
Target Start/End: Original strand, 9863702 - 9864049
Alignment:
Q  312 ttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatag-agggggctg--aaacaatggtttagaaaggcaacaac-aaaactaggg 407  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| || | ||||  |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  9863702 ttatatttctctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttag-aagccaaaaacaaaaactaggg 9863800  T
Q  408 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagag 504  Q
    ||||  |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||   || ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9863801 tttg--tagagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggtt--gggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagag 9863895  T
Q  505 attggggctttgggtagaatt-aggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca----tatagtgaaacggaggg 599  Q
    |||| | |||||||||||||| ||   | |||||  ||||||||||   |||| ||||| ||||||| |||||||||||    ||||||| ||||||| |    
T  9863896 attgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagag 9863994  T
Q  600 ctgctctct--cccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  9863995 ctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 478 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16186006 - 16185831
Alignment:
Q  478 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 576  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||   | |||||| |||||| ||| | |||| || || ||||||| |||||    
T  16186006 gattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-tttgtaaagttac 16185908  T
Q  577 tcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16185907 tcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 551 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 24446738 - 24446627
Alignment:
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||    
T  24446738 cattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccgaactgggtcaacaaat 24446652  T
Q  651 tcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  24446651 tcttttgtgttctctcttcttttct 24446627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14789579 - 14789500
Alignment:
Q  54 atgtttcatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 133  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789579 atgttacatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 14789500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 25357859 - 25357998
Alignment:
Q  533 agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttgg 630  Q
    |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25357859 agacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattgg 25357958  T
Q  631 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  25357959 acctaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctcttct 25357998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38209259 - 38209098
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct--gaaaatatatttatggaca--ata 167  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | || ||  || | || |  |||    
T  38209259 tgactcaaaatttgatggatgaaaaatattgttgttaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgcttcaagaagattgttgttgaaaatata 38209160  T
Q  168 aatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatat-tttgaaagggaatatt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38209159 aatatatttttgtactgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatatttgaaaaggaatatt 38209098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40998990
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||| |  |||||| ||| ||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtata 40999184  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||| || |||  ||||||||||| || ||||||||    |||||||||| ||||| ||| |||||||| | | |    
T  40999183 gagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagac 40999087  T
Q  513 tttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctc 607  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  40999086 tttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789422
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctc--ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54929180 - 54929094
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929180 tgctgaaaatatatttatggacaaaaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 583 - 675
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133197
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 6133197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 453 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  453 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaa 548  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||   | |||||| || ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  549 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    | | |||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 473 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 3982354 - 3982186
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg-ctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 570  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |   || ||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  3982354 attaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaa 3982255  T
Q  571 cgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 637  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||    
T  3982254 agttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 221
Target Start/End: Original strand, 10979676 - 10979755
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  10979676 tgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtgctgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 10979755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5516833 - 5516771
Alignment:
Q  78 aaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5516833 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaatgaattgtttcaaatatatttt 5516771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150873
Alignment:
Q  454 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
     | |||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||  | || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||     
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaact 47150893  T
Q  648 aattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  47150892 aatt-tcttgtgttctctctt 47150873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 609 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942457
Alignment:
Q  609 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttcttctc 679  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttcctctc 52942457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 614 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3937308 - 3937254
Alignment:
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3937308 agactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctctt 3937254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 5336846 - 5336765
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  5336846 tatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttct 5336765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29609983 - 29609914
Alignment:
Q  76 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29609983 tcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaagtattcttgatttttttcaaatatattttgtgct 29609914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16186171 - 16186099
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggct-gaaacaatggtttagaaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  16186171 ttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 10047437 - 10047383
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10047437 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 39246052 - 39245998
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39246052 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 647
Target Start/End: Original strand, 6743454 - 6743507
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6743454 ggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 651
Target Start/End: Original strand, 26557833 - 26557922
Alignment:
Q  564 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557833 tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29609897 - 29609840
Alignment:
Q  145 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgat 202  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29609897 tgaaaatatatttatgaagagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgat 29609840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 4884990 - 4885062
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4884990 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 8529383 - 8529455
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  8529383 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  596 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54867239 agggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 54929267 - 54929198
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 143  Q
    ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  54929267 tgacttaaaatttgatggaa--ataatattgttgctaaaaatataaaagatttgatttaaatgtattttgtg 54929198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 628 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824595
Alignment:
Q  628 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 5269230 - 5269284
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5269230 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14647214 - 14647172
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccg 184  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14647214 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgtaccg 14647172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 387
Target Start/End: Original strand, 16455286 - 16455356
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaa 387  Q
    |||| |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16455286 ttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 388
Target Start/End: Original strand, 12102089 - 12102162
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagataga-gggggctg-aaacaatggtttagaaa 388  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  12102089 ttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaa 12102162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 31300540 - 31300608
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  31300540 tatagtggaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 647
Target Start/End: Original strand, 36315268 - 36315321
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36315268 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 647
Target Start/End: Original strand, 36329477 - 36329530
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36329477 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 4556126 - 4556054
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4556126 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattctt 4556054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 18587082 - 18587154
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18587082 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 36769595 - 36769667
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||    
T  36769595 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 36769667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 500 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270118
Alignment:
Q  500 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 540  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactttt 38270118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467354
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 364
Target Start/End: Original strand, 25357636 - 25357683
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagag 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  25357636 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagag 25357683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 5143317 - 5143263
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5143317 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 5396710 - 5396764
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5396710 ggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 31985673 - 31985726
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31985673 ggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 38152478 - 38152532
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38152478 ggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 3578756 - 3578668
Alignment:
Q  564 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||    
T  3578756 tttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 624
Target Start/End: Original strand, 15831257 - 15831298
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 624  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15831257 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429847
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5516747 - 5516703
Alignment:
Q  147 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 191  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||    
T  5516747 aaaatatatttatagataataaatatatttttttatcgtatgaag 5516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 5871944 - 5871988
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5871944 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaa 5871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 9927502 - 9927458
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 9927458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 11853664 - 11853732
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  11853664 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 11853732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743925
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745314
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 15317074 - 15317145
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  15317074 tatagtggaacagagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 15317145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 16689006 - 16688934
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  16689006 tatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 27417009 - 27416965
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27417009 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 27416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 361
Target Start/End: Original strand, 36380373 - 36380417
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagata 361  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  36380373 ttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 46147435 - 46147391
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 47038455 - 47038411
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52043764 - 52043716
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagag 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  52043764 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 52043716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 102)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 67 - 669
Target Start/End: Original strand, 41382424 - 41383018
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41382424 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatggacaat 41382523  T
Q  167 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||       
T  41382524 aaatatatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaatgagaaa 41382623  T
Q  267 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagg 365  Q
            | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41382624 aaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatg 41382722  T
Q  366 gggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctc 465  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41382723 gggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct- 41382821  T
Q  466 gggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttt 565  Q
           |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382822 -------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttt 41382914  T
Q  566 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctat 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  41382915 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 41383014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 669
Target Start/End: Original strand, 41384492 - 41385100
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41384492 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatg 41384591  T
Q  161 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  41384592 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt-atgcaaatattctttcattgaag 41384690  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 359  Q
    ||             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||    
T  41384691 gaaaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgaga 41384788  T
Q  360 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 459  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41384789 tagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgatt 41384887  T
Q  460 cacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 556  Q
    ||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41384888 caccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattga 41384987  T
Q  557 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384988 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 41385087  T
Q  657 gtgttctatcttc 669  Q
     |||||| |||||    
T  41385088 ctgttctctcttc 41385100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 15808962 - 15809568
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15808962 tgttttagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 15809061  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15809062 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15809161  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  15809162 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 15809259  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15809260 agataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttg 15809358  T
Q  457 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15809359 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 15809458  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809459 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 15809558  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  15809559 tttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28283813 - 28283206
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283813 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28283714  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28283713 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 28283614  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          
T  28283613 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 28283516  T
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283515 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggt 28283416  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||| | |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |    
T  28283415 tgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaaccc 28283316  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283315 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 28283218  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||    
T  28283217 cttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 3873750 - 3874360
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873750 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3873849  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaat-gatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3873850 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 3873949  T
Q  261 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 355  Q
    |||             ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |    |    
T  3873950 gagaaaaaaaaaaacatatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgaga 3874049  T
Q  356 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3874050 gagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 3874149  T
Q  456 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 552  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3874150 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3874249  T
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874250 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 3874349  T
Q  653 ttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||    
T  3874350 ttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Original strand, 608470 - 609077
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608470 tgttgtagtatcactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 608569  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  608570 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaatattctttcactgaagg 608669  T
Q  262 agnnnnnnnnnnng--gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 354  Q
    ||              |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||| |         
T  608670 agaaaaaaaaaagaacgtatcttcggtgtgatatttgttccaaatttatgagttatatttcactgtaaatatagaccttatatcatagcaaactttgaga 608769  T
Q  355 ---agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 451  Q
       ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608770 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 608869  T
Q  452 ggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 548  Q
    |||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  608870 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 608969  T
Q  549 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  608970 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 609069  T
Q  649 attctttt 656  Q
    ||||||||    
T  609070 attctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 43529871 - 43530465
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529871 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 43529970  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  43529971 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaatattctttcactgaagg 43530070  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||            ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    ||    
T  43530071 agaaaaaaaaaa--gtatcttcagtgtggtatttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 43530168  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||             || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43530169 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac-------------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttg 43530255  T
Q  457 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||||||||| | ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  43530256 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccat 43530355  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530356 tgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 43530455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 276 - 663
Target Start/End: Original strand, 32339264 - 32339659
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggct 370  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||||||||||||||||    
T  32339264 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggct 32339363  T
Q  371 gaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa 470  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  32339364 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaa 32339463  T
Q  471 ac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 567  Q
    ||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32339464 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 32339563  T
Q  568 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32339564 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 1225167 - 1225529
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  1225167 ttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 1225266  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1225267 agtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 1225366  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  1225367 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccct 1225466  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1225467 catactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 1225529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 30480837 - 30480476
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30480837 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatag 30480738  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  30480737 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggct 30480638  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  30480637 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccccc 30480538  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30480537 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 30480476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 15072711 - 15073073
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15072711 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatag 15072810  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagaga-ttggggc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  15072811 agtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggac 15072910  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15072911 tttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctcccc 15073010  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15073011 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttct 15073073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 14807752 - 14808123
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807752 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 14807851  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  14807852 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 14807951  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg----------c 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |    
T  14807952 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 14808051  T
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14808052 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 14808123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 14419525 - 14419163
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14419525 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatag 14419426  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  14419425 agtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 14419326  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14419325 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccc 14419226  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14419225 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 14419163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 27107231 - 27106884
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107231 ttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27107132  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  27107131 agtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgact 27107032  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  27107031 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctcc 27106932  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27106931 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 27829298 - 27829646
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829298 ttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27829397  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |     
T  27829398 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacc 27829497  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  27829498 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 27829596  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829597 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 662
Target Start/End: Original strand, 15067982 - 15068330
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15067982 ttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatag 15068081  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||    
T  15068082 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagact 15068181  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  15068182 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctccccc 15068281  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 662  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068282 agactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28251901 - 28251545
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251901 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 28251802  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  28251801 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 28251702  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  28251701 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 28251602  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28251601 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 28251545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 4424019 - 4424368
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424019 ttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 4424118  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  4424119 agtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 4424218  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  4424219 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 4424318  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424319 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 27826987 - 27827335
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826987 ttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27827086  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||  |||| |     
T  27827087 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggacc 27827186  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  27827187 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 27827285  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827286 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 659
Target Start/End: Original strand, 27911016 - 27911359
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911016 ttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27911114  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  27911115 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 27911214  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27911215 ttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccc- 27911313  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 659  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27911314 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27911359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 659
Target Start/End: Original strand, 27957435 - 27957778
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957435 ttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27957533  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  27957534 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 27957633  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27957634 ttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccc- 27957732  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 659  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27957733 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27957778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 317 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 13858818 - 13858477
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13858818 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 13858719  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  13858718 agtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggct 13858619  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13858618 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccc 13858520  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 655  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13858519 cagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattcttt 13858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 18810709 - 18811057
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810709 ttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18810808  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||| ||    
T  18810809 agtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggact 18810908  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  18810909 ttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 18811007  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811008 agattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22684952 - 22684638
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22684952 agagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggt 22684853  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22684852 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22684753  T
Q  552 ---attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
       |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684752 aatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22684653  T
Q  649 attcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||    
T  22684652 attcttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 25952522 - 25952876
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||     
T  25952522 ttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatat 25952620  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | |     
T  25952621 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagaca 25952720  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25952721 ttgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 25952820  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25952821 cagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 25952876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865892
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||    ||| |||||||||||  |    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttc---acgggaagagattggaac 36865734  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttctgtctt 36865892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 44720844 - 44721193
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44720844 ttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatag 44720943  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac----attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  44720944 agtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 44721043  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||     
T  44721044 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccg 44721142  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44721143 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 44721193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 276 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 24873563 - 24873178
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------agagatagaggggg 368  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |      ||||||||||||||    
T  24873563 gtatcttcagtgttgtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagaggggg 24873464  T
Q  369 ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24873463 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttgg 24873364  T
Q  469 aaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctt 564  Q
    ||||   |||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||| |    
T  24873363 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-t 24873265  T
Q  565 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  24873264 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5372511 - 5372156
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5372511 ttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatag 5372413  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||    
T  5372412 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggact 5372313  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-ccc 611  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  5372312 ttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctcccc 5372213  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  5372212 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttctttctt 5372156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 33541722 - 33541389
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541722 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 33541623  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||    
T  33541622 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggact 33541523  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || ||||||||||||                      |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  33541522 tttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctccccc 33541445  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  33541444 agactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttctctcttc 33541389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 43079642 - 43079952
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43079642 agagatag-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 43079740  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43079741 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 43079840  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43079841 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 43079939  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |  ||||||||||    
T  43079940 ttctttgtgttct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 43082012 - 43082323
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43082012 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 43082111  T
Q  455 tgattcacctcgggaaacattaa---gattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||| ||    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  43082112 tgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacc 43082211  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43082212 cattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 43082310  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |  ||||||||||    
T  43082311 ttctttgtgttct 43082323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 18812894 - 18813231
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||               
T  18812894 ttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag----------- 18812982  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||| |||| ||||||  || | ||    
T  18812983 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgact 18813082  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  18813083 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 18813181  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18813182 atattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15186044 - 15185694
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||     
T  15186044 ttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataa 15185945  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttt--tggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||   |||  ||||||||| |  |||||||| |||||||||        
T  15185944 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagatt---- 15185849  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
       |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15185848 ---tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcc 15185752  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15185751 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctt 15185694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 317 - 548
Target Start/End: Original strand, 14477277 - 14477511
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14477277 ttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 14477376  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  14477377 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 14477476  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14477477 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 14477511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Original strand, 21482323 - 21482649
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||     
T  21482323 ttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtataa 21482414  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  21482415 agtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggct 21482510  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21482511 ttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccc 21482610  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21482611 caaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 406 - 675
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956320
Alignment:
Q  406 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaag 502  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||||||||| ||| ||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  503 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggct 601  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  602 gctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttcttttct 15956320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 220
Target Start/End: Original strand, 32339094 - 32339252
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 32339193  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaag 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32339194 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 344 - 642
Target Start/End: Original strand, 21480542 - 21480832
Alignment:
Q  344 agagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 443  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21480542 agagtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactag 21480632  T
Q  444 ggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 540  Q
    | ||   |||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  21480633 gttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttat 21480729  T
Q  541 tcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactg 639  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21480730 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactg 21480829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Original strand, 31162214 - 31162551
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaa-caacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||||    
T  31162214 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtgtttgtat 31162310  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    | |||||| ||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||     
T  31162311 aaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattggga 31162407  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-- 608  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      
T  31162408 ctttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcc 31162507  T
Q  609 cccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  31162508 cccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 317 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5623072 - 5622877
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5623072 ttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 5622973  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatta---agattgagtcttttggttacgagaagagattgg 509  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  5622972 agtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Original strand, 26775202 - 26775358
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  26775202 ttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatat 26775301  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  26775302 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaaca 26775358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3265753 - 3265635
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3265753 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 3265654  T
Q  161 gacaataaatatatttttg 179  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  3265653 gacaataaatatatgtttg 3265635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 347 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 3005931 - 3005624
Alignment:
Q  347 gtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 445  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||    
T  3005931 gtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaataggg 3005835  T
Q  446 tttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 542  Q
    || ||   ||||||||| | || |||||   |||  ||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3005834 ttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 3005738  T
Q  543 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgg 640  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||    
T  3005737 ttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgg 3005638  T
Q  641 gtcaacaaattctt 654  Q
    || |||||||||||    
T  3005637 gtaaacaaattctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35872712 - 35872561
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  35872712 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatag 35872618  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35872617 agtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 35872561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 411
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181632
Alignment:
Q  213 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaagaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagt 181532  T
Q  313 tata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  181533 tatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 347 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 37214514 - 37214317
Alignment:
Q  347 gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctct 427  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||    
T  37214514 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctct 37214415  T
Q  428 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattag 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  37214414 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaattag 37214321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 317 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12517360 - 12517248
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517360 ttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 12517261  T
Q  415 agagtttgtctct 427  Q
    |||||||||||||    
T  12517260 agagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 317 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3886252 - 3886153
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886252 ttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 454 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  454 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
       |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  648 aatt 651  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 519 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  519 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || |||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 451 - 651
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  451 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgt 546  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||   || ||||| |||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  547 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagac--taggtcaat-ttggaccgaactgggt 642  Q
    ||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  643 caacaaatt 651  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 439 - 612
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181798
Alignment:
Q  439 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca----ttaagattgagtcttttggttacgag--aagagattggggctttgggtagaattaggcggg 532  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    ||| |||| ||||| || |||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  533 agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatgactgctctctcccc 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 551 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 35872537 - 35872426
Alignment:
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||    
T  35872537 cattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccgaactgggtcaacaaat 35872451  T
Q  651 tcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  35872450 tcttttgtgttctctcttcttttct 35872426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 593 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214251
Alignment:
Q  593 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 37214251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 582 - 675
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477613
Alignment:
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactg-ggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctttcttcttttct 14477613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035223
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagaga--tagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||  ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgt 31035165  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  31035166 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaaca 31035223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 31574000 - 31573794
Alignment:
Q  372 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 471  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||| ||||||    
T  31574000 aaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31573907  T
Q  472 ca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 567  Q
    ||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||   | |||||  ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  31573906 cactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttg 31573807  T
Q  568 taacgttactcat 580  Q
    ||| |||||||||    
T  31573806 taaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13986374 - 13986304
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 143  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13986374 tgactcaaaattttatggatgaagaagattgttgctaaaaatat-aaagatttgttttaaatatattttgtg 13986304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2468432 - 2468361
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  2468432 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaa 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11701447 - 11701364
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  11701447 tgctgaaaatatatttatggtcagtaaatatatttttgtaccgtatg--gaa-gaattgatgtaaatatatttttaaagggaatatt 11701364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30679256 - 30679186
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30679256 tgactcaaaatttgatggatgaagaatat-gttggtaaaaataaaaaagatttgttttagatatattttgtg 30679186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 19752433 - 19752487
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19752433 ggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 651
Target Start/End: Original strand, 6376149 - 6376328
Alignment:
Q  474 ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 572  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||  |||||||||||   || ||||  ||||||| ||   |||| |||||||| |||| |    
T  6376149 ttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctcttt-gtaaag 6376247  T
Q  573 ttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||    
T  6376248 ttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702634
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 632 - 675
Target Start/End: Original strand, 181798 - 181841
Alignment:
Q  632 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  181798 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 181841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13986285 - 13986214
Alignment:
Q  145 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttg 216  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  13986285 tgaaaatatatttatggatagttaataaatttttgtaccgcatgaaagaagatttgatgcaaatatattttg 13986214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 4696635 - 4696689
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  4696635 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 9765858 - 9765912
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9765858 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930193
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 641
Target Start/End: Original strand, 17847685 - 17847848
Alignment:
Q  473 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 571  Q
    |||| |||||| ||| ||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||   || ||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||     
T  17847685 attaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac-ctttgatatctcttttgtaa- 17847782  T
Q  572 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactggg 641  Q
       | ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  17847783 ---aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactggg 17847848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 26403269 - 26403323
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26403269 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 649
Target Start/End: Original strand, 16833789 - 16833886
Alignment:
Q  553 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||| ||| |  |||||||||| ||||||    
T  16833789 ttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttggacgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 4812554 - 4812486
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  4812554 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 609
Target Start/End: Original strand, 14419734 - 14419786
Alignment:
Q  558 atctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14419734 atctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 17799490 - 17799418
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17799490 tatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 23179627 - 23179555
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  23179627 tatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 28328023 - 28328091
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28328023 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 647
Target Start/End: Original strand, 4733830 - 4733873
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4733830 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 352
Target Start/End: Original strand, 6375990 - 6376025
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaac 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6375990 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaac 6376025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 540 - 612
Target Start/End: Original strand, 3896048 - 3896122
Alignment:
Q  540 ttcttgtaactcat-tgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||  |||||| |||||||||||||||    
T  3896048 ttcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctcccc 3896122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 5702522 - 5702576
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5702522 ggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 7412399 - 7412345
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7412399 ggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 23799616 - 23799670
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23799616 ggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 31071268 - 31071322
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31071268 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27820178 - 27820149
Alignment:
Q  114 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820178 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 27820149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 645
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 4743258 - 4743214
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4743258 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 5689395 - 5689439
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5689395 tctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 5689439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599140
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674593
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11701479 - 11701435
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  11701479 tgactcaaaatttgatggacgaagaagattgttgctgaaaatata 11701435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 16757334 - 16757266
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16757334 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 25684758 - 25684826
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  25684758 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 28332746 - 28332814
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28332746 tatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28332814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890949
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28890949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 28895618 - 28895686
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28895618 tatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28895686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 43036547 - 43036591
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 101)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2629479 - 2628871
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629479 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 2629380  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2629379 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 2629280  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||           | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| | ||||     
T  2629279 aggaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtagtatttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagag 2629181  T
Q  361 agag-----ggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 455  Q
    ||||     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2629180 agagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggtt 2629081  T
Q  456 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttt-ttcttgtaactc 551  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |    
T  2629080 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-ggagaatttattcttgtaaccc 2628982  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2628981 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 2628883  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||    
T  2628882 cttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19705165 - 19704552
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705165 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgg 19705066  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19705065 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 19704966  T
Q  262 agnnnnnnnnnnng-gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||             ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |          
T  19704965 agaaaaaaaagaaacgtatcttaagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 19704866  T
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  19704865 agagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggt 19704766  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  19704765 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 19704666  T
Q  551 cattgacatctct-tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 649  Q
    ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704665 cattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 19704566  T
Q  650 ttcttttgtgttct 663  Q
    || |||||||||||    
T  19704565 ttattttgtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Original strand, 30966923 - 30967530
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966923 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 30967022  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30967023 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 30967122  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||           |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |    ||    
T  30967123 agaaaaaaaaaacga-atcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgagag 30967220  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30967221 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 30967320  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  30967321 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccat 30967420  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967421 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 30967520  T
Q  654 tttgtgttct 663  Q
    ||||||||||    
T  30967521 tttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 30035196 - 30034590
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30035196 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatag 30035097  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30035096 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaagg 30034997  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 356  Q
    ||           | |||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  30034996 agaaaataaaaacg-tatcttcaatgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagag 30034898  T
Q  357 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 456  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30034897 agatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 30034798  T
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||  ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  30034797 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 30034698  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034697 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 30034598  T
Q  654 tttgtgtt 661  Q
    ||||||||    
T  30034597 tttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 12196104 - 12195500
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12196104 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 12196005  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12196004 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 12195905  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 360  Q
    ||           |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||    
T  12195904 agaaaaaaaaaacga-atcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 12195806  T
Q  361 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195805 agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattc 12195706  T
Q  461 acctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 556  Q
    |||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12195705 accttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattga 12195606  T
Q  557 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 656  Q
      |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12195605 tttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttcttt 12195507  T
Q  657 gtgttct 663  Q
    |||||||    
T  12195506 gtgttct 12195500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 62 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 26933158 - 26932546
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  26933158 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatattattatgg 26933059  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26933058 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 26932959  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| |          
T  26932958 agaaaaaaaaac--gaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgggttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 26932861  T
Q  355 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 452  Q
      |||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  26932860 agagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgg 26932761  T
Q  453 gttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 548  Q
    |||||||||||| | |||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26932760 gttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26932661  T
Q  549 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    | ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26932660 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T
Q  649 a-ttcttttgtgttct 663  Q
    | ||||||||||||||    
T  26932561 atttcttttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 11983363 - 11983007
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983363 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11983264  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  11983263 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 11983164  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  11983163 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 11983064  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11983063 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 11983007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 9019906 - 9020261
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019906 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 9020005  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||   |||||||||||| ||    
T  9020006 agtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggact 9020105  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  9020106 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccccc 9020205  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9020206 aaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 9020261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28241651 - 28241306
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241651 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 28241552  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||| |    
T  28241551 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcg 28241452  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28241451 gtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagac 28241352  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241351 taggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 13057174 - 13057529
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13057174 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatag 13057273  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  13057274 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggact 13057373  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13057374 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccc 13057473  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13057474 caaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13057529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 3630198 - 3629838
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630198 ttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3630099  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3630098 agtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggct 3629999  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3629998 ttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctctcccc- 3629900  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3629899 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 3629838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 317 - 659
Target Start/End: Original strand, 3390359 - 3390705
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390359 ttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3390458  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  3390459 agtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggct 3390558  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3390559 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccc 3390658  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 659  Q
     | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3390659 catactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtg 3390705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1230579 - 1230234
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230579 actataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 1230480  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| |||||||   ||||||  |||| ||||||    
T  1230479 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgg 1230380  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1230379 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 1230280  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230279 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15541474 - 15541120
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15541474 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatag 15541375  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  15541374 agtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggact 15541275  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |     
T  15541274 ttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcctcc 15541175  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15541174 agactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 15541120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 14507509 - 14507161
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507509 ttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 14507410  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  14507409 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 14507310  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  14507309 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccc 14507211  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507210 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 323 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458752
Alignment:
Q  323 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  423 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggt 519  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  520 agaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagacta 619  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 14458796  T
Q  620 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458795 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 13039734 - 13040089
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13039734 ttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatag 13039833  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  13039834 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagact 13039933  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13039934 ttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 13040033  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13040034 tagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13040089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 3234064 - 3233704
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  3234064 ttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatat 3233966  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  3233965 agtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 3233866  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233865 tttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccc 3233766  T
Q  613 tagactaggtcaatttggacc-----gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     | ||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3233765 cacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3233704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 25477254 - 25477616
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25477254 ttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatag 25477353  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  25477354 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggct 25477453  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa-------cgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25477454 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctc 25477553  T
Q  606 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25477554 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctctctt 25477616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 67 - 581
Target Start/End: Original strand, 17011784 - 17012287
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17011784 tagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattattgctaaaaatataaaag-tttgttttaaatat--tttgtgtagaaaatatatttatggacaat 17011880  T
Q  167 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |        
T  17011881 aaatatatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaaaa---- 17011976  T
Q  267 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggg 366  Q
             |||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  17011977 ---aaaaacgtatcttcagagtgatgttcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggg 17012073  T
Q  367 ggctgaa-acaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctc 465  Q
    | ||||| | || ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  17012074 gtctgaataaaagggtttag-aagtaaacaac-aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg-ttga-ggttgattcacctt 17012168  T
Q  466 gggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 562  Q
      |||||   |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17012169 ctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 17012268  T
Q  563 ttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17012269 ttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 70 - 445
Target Start/End: Original strand, 17852275 - 17852650
Alignment:
Q  70 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgt--tgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaata 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17852275 tatgactcaaaatttgatg-atggagaatattgtgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat--tttatgctgaaaatatatttatggacaata 17852371  T
Q  168 aatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggag-nnn 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||        
T  17852372 aatatatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattatttcactgaaagagaaga 17852471  T
Q  267 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagg 365  Q
             |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17852472 aaaaaaaaagtatcttc-gtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagg 17852570  T
Q  366 gggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 445  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852571 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 318 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631926
Alignment:
Q  318 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 417  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  418 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 514  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  515 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||      
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgtccc-- 3631974  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631973 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4816527 - 4816216
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4816527 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 4816428  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4816427 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 4816328  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816327 attgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 4816228  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
    ||||||||||||    
T  4816227 cttttgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 317 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15533015 - 15532674
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15533015 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataa 15532916  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||    
T  15532915 agtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggact 15532816  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15532815 tttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctat-ccct 15532717  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 656  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15532716 agactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 30729162 - 30728811
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30729162 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatag 30729063  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  30729062 agtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggct 30728963  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30728962 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctctctc 30728863  T
Q  610 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30728862 ccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 32279977 - 32280332
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32279977 ttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatag 32280075  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  32280076 agtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 32280175  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32280176 tcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccc 32280275  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  32280276 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctcttc 32280332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 317 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 20915692 - 20915351
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaa--cctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20915692 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtat 20915593  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20915592 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattggg 20915493  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  20915492 acttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 20915394  T
Q  611 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 653  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915393 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 15530456 - 15530166
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530456 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 15530357  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15530356 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 15530257  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 605  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15530256 ttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 26065004 - 26065310
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26065004 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggt 26065100  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26065101 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26065200  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065201 attgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26065298  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||    
T  26065299 attttgtgttct 26065310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 26084973 - 26085279
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26084973 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggt 26085069  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26085070 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26085169  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085170 attgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26085267  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||    
T  26085268 attttgtgttct 26085279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 24338782 - 24338421
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24338782 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataa 24338683  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacacta-gggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  | |    
T  24338682 agtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagac 24338583  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24338582 tttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctccc 24338485  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| | |||||| ||||    
T  24338484 ccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctcttcttttct 24338421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 62 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5275928 - 5275727
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275928 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 5275829  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5275828 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 5275729  T
Q  262 ag 263  Q
    ||    
T  5275728 ag 5275727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 62 - 339
Target Start/End: Original strand, 18317751 - 18318028
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317751 tgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18317850  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18317851 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 18317950  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttg 339  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18317951 agaaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatactttcactataaatatagaccttg 18318028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 12161888 - 12161537
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12161888 ttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatag 12161790  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  12161789 agtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagact 12161692  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    || |||| ||||| | |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  12161691 ttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccct 12161593  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12161592 aaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctcttc 12161537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22858536 - 22857949
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22858536 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttaataaaaatataaaagatttgttttaaatatactttgtgctgaaaatatatttatgg 22858437  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22858436 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaa--------ttttgatgcaaatattctttcattgaagg 22858345  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-----ag 356  Q
    ||            |||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| | ||  |     ||    
T  22858344 agaaaaaaagaaacgtatcttcaacgtgatatacgttccaaatttatgagttatatttctctataaatataaaccttgtatcaga-tgaatttgtgagag 22858246  T
Q  357 agatagagggggc--tgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    |||||||| |  |    |||||| ||||||| |||  ||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||| | |    
T  22858245 agatagagagaaccagaaaacaagggtttag-aagctaacacaaaaactagggtttg--tagaattt-tctcttggtaacaaacactaggg-ttga-gat 22858152  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||| |||||   | |||||  ||||||||||     
T  22858151 tgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacc 22858052  T
Q  551 c-attgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    |  |||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  22858051 cttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaaca 22857953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 317 - 583
Target Start/End: Original strand, 22490619 - 22490889
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggttta-gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490619 ttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 22490718  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    || ||||| | |||||   |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |    
T  22490719 tagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac 22490818  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 583  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22490819 tttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 317 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19227742 - 19227518
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227742 ttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 19227643  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  19227642 agtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19227543  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactt 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19227542 ttgggtagaattaggcgggagactt 19227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 3028184 - 3027848
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| | |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3028184 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggtttgtata 3028087  T
Q  416 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  3028086 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagac 3027990  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cc 610  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  3027989 tttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccc 3027890  T
Q  611 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    || |||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3027889 cccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 317 - 668
Target Start/End: Original strand, 14466313 - 14466658
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||               
T  14466313 ttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag----------- 14466401  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||      
T  14466402 agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggag 14466501  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | ||||    
T  14466502 tttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttccc 14466601  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  14466602 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctctt 14466658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 436 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  436 aacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgg 531  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  532 gagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 631  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  632 ccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 457 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069691
Alignment:
Q  457 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 553  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  554 tgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 652  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  653 ttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    |||| |||||| |||||| ||||    
T  1069713 ttttatgttctctcttcttttct 1069691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 26066289 - 26066109
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  26066289 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttacttatc 26066191  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26066190 aaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26066109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 348 - 651
Target Start/End: Original strand, 15719665 - 15719961
Alignment:
Q  348 taaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  15719665 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt 15719755  T
Q  448 tgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttctt 544  Q
       | |||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15719756 ---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  545 gtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 642  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggt 15719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 26068560 - 26068380
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  26068560 gagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttgctcatc 26068462  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26068461 aaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26068380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 317 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 32447650 - 32447502
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447650 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 32447551  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 464  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447550 agtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 29754874 - 29754694
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  29754874 gagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 29754776  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29754775 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 29754694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 33309006 - 33309185
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  33309006 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 33309103  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33309104 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33309185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 317 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 1072211 - 1072067
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1072211 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 1072112  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072111 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Original strand, 20526551 - 20526708
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |    
T  20526551 tagtatgactcaaaatttgatgggtgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaatatatttatg-----t 20526645  T
Q  167 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatata-ttttgaaagggaatatt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  20526646 acatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttgaaagagaatatt 20526708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 318 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16455757 - 16455421
Alignment:
Q  318 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga--tagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| ||||  ||||| |  |||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||     
T  16455757 tttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtac 16455660  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||| | |||  |||||||||||     
T  16455659 agagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattggga 16455563  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16455562 ctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 16455463  T
Q  611 cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    || | ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  16455462 cccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 33311275 - 33311454
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  33311275 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 33311372  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33311373 aaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33311454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 453 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186051
Alignment:
Q  453 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaa 548  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||| | ||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  549 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  648 aattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctctt 12186051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 403 - 668
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367365
Alignment:
Q  403 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgag 499  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| || ||  || |    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  500 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg 599  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaagg 15367296  T
Q  600 ctgctctctc-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  15367297 ctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 15367365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 317 - 436
Target Start/End: Original strand, 8995459 - 8995578
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995459 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 8995558  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaa 436  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8995559 agtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 323 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870609
Alignment:
Q  323 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 422  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  423 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 464  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacct 13870609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 512 - 651
Target Start/End: Original strand, 15346525 - 15346664
Alignment:
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 611  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15346525 ctttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctccc 15346624  T
Q  612 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15346625 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 566 - 669
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584331
Alignment:
Q  566 tgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcta 664  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctc 10584326  T
Q  665 tcttc 669  Q
    |||||    
T  10584327 tcttc 10584331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 317 - 651
Target Start/End: Original strand, 19696421 - 19696759
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggg--ggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||| |||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  19696421 ttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgta 19696518  T
Q  414 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 510  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  |   ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| || || ||   ||||||||| |    
T  19696519 tagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgag 19696615  T
Q  511 gctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 608  Q
     |||||| ||||||||||   || ||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  19696616 actttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctct 19696715  T
Q  609 cccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  19696716 ctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 452 - 651
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  452 ggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggg-agactttttcttgta 547  Q
    |||||| |||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||| || |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  548 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 645  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||| || ||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  646 caaatt 651  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 30445243 - 30445404
Alignment:
Q  84 tgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatatatttatggacaat 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||| |||||    
T  30445243 tgatggatgaagaatattgttgctagaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgcttccagaatattgttgctgaaaatatatttatgaacaat 30445342  T
Q  167 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445343 aaatatatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 428
Target Start/End: Original strand, 10584106 - 10584212
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10584106 ttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatag 10584200  T
Q  417 agtttgtctctt 428  Q
    ||||||||||||    
T  10584201 agtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Original strand, 15346371 - 15346515
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||        |   |||||||||||||||||     
T  15346371 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga--------attcaaactagggtttgtataa 15346462  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    | |||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  15346463 aatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaaca 15346515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 30443022 - 30443097
Alignment:
Q  72 tgactcaaaattt--gatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 145  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30443022 tgactcaaaatttatgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataagagatttgtttcaaatatattttttgct 30443097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 564 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12911531 - 12911426
Alignment:
Q  564 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  12911531 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt-ttgtgtgtt 12911433  T
Q  662 ctatctt 668  Q
    |||||||    
T  12911432 ctatctt 12911426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 529 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465571
Alignment:
Q  529 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat- 626  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || | |||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  627 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 668  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 25465571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078536
Alignment:
Q  454 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaac 549  Q
    ||||||||||| || |||||   |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |  |||  |||||||||||   || ||||| ||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  550 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 647  Q
     | |||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttccc-agtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 25078558  T
Q  648 aattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |||| || |||||||| ||||||    
T  25078557 aatt-ttgtgtgttctctcttct 25078536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12937278 - 12937174
Alignment:
Q  564 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  12937278 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc-agactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt-ttgtgtgtt 12937181  T
Q  662 ctatctt 668  Q
    |||||||    
T  12937180 ctatctt 12937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 17694918 - 17694846
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17694918 tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Original strand, 30443111 - 30443195
Alignment:
Q  142 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||    
T  30443111 tgctgaaaatatatttatggacaa--aatatatgtttgtaccgtataaaggaagatttgatgcaaatgtatttttaaaagaaatatt 30443195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 661
Target Start/End: Original strand, 30443537 - 30443616
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  30443537 tatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgtt 30443616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 512 - 640
Target Start/End: Original strand, 30445701 - 30445832
Alignment:
Q  512 ctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
    |||||||||||||||||   || ||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  30445701 ctttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctc 30445800  T
Q  610 ccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgg 640  Q
    | | | ||||||||| | |||||| |||||||    
T  30445801 caccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 5572280 - 5572334
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  5572280 ggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 28037838 - 28037722
Alignment:
Q  540 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaa---acggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccg 634  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |   ||| | ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  28037838 ttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccg 28037739  T
Q  635 aactgggtcaacaaatt 651  Q
    | |||||| ||||||||    
T  28037738 agctgggtaaacaaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 22342867 - 22342795
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22342867 tatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22342795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941857
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 5017508 - 5017562
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5017508 ggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaa 5017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 5757517 - 5757571
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5757517 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 10077204 - 10077258
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10077204 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31979571 - 31979517
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31979571 ggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12186403 - 12186330
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  12186403 ttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 642
Target Start/End: Original strand, 24436009 - 24436058
Alignment:
Q  593 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  24436009 cggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603088
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 3577555 - 3577484
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  3577555 tatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 3577484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 12166212 - 12166140
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12166212 tatagtgaagcagagagctgctatctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 12166140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 35201393 - 35201325
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  35201393 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 119
Target Start/End: Original strand, 12158532 - 12158575
Alignment:
Q  76 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaa 119  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12158532 tcaaaatttgatgaatgaagaagattgttgctaaaaatataaaa 12158575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 575 - 651
Target Start/End: Original strand, 11262699 - 11262777
Alignment:
Q  575 actcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  11262699 actcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatt 11262777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21356094 - 21356040
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21356094 ggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31936645 - 31936591
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31936645 ggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 667
Target Start/End: Original strand, 13883590 - 13883674
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatct 667  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  13883590 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-tatcttgtgttctatct 13883674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17904619 - 17904566
Alignment:
Q  391 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 447  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17904619 caacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tctctttgcaacaaacactaaggtt 17904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 25465965 - 25465896
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  25465965 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 3833176 - 3833220
Alignment:
Q  96 aatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  3833176 aatattattgctaaaaacataaaatatttgttttaaatatatttt 3833220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 447
Target Start/End: Original strand, 4595046 - 4595102
Alignment:
Q  388 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  4595046 aggcaacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 13467532 - 13467461
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  13467532 tatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaattctt 13467461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 13878842 - 13878910
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  13878842 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13878910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 16569146 - 16569190
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16569146 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 16569190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 16786034 - 16786102
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16786034 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 17038350 - 17038418
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  17038350 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17038418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Original strand, 33215943 - 33216015
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  33215943 tatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 33216015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 62 - 612
Target Start/End: Original strand, 1735 - 2293
Alignment:
Q  62 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1735 tgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 1834  T
Q  162 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1835 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 1934  T
Q  262 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 354  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| |          
T  1935 agaaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttataagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 2033  T
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2034 aaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggt 2132  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  2133 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 2232  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2233 attaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 321 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 41813 - 41468
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41813 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 41714  T
Q  421 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||| |    
T  41713 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcg 41614  T
Q  518 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 617  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41613 gtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagac 41514  T
Q  618 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41513 taggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 3951 - 4298
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3951 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata- 4049  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||   |||| ||    
T  4050 agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggact 4149  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4150 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc- 4248  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4249 agactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 69629 - 69277
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69629 ttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 69530  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  69529 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 69430  T
Q  510 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 609  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  69429 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctc 69331  T
Q  610 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69330 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 317 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 73361 - 73210
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || |||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  73361 ttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgt 73262  T
Q  413 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73261 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 73210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 428 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73165
Alignment:
Q  428 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 473  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 73165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 317 - 669
Target Start/End: Original strand, 79813 - 80168
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  79813 ttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatag 79912  T
Q  417 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  79913 agtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggc 80012  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80013 tttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 80111  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 669  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  80112 cagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctcttc 80168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 355 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14678 - 14376
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14678 agagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggt 14579  T
Q  455 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14578 tgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 14479  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14478 attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14379  T
Q  652 ctt 654  Q
    |||    
T  14378 ctt 14376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 14973 - 15327
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14973 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataa 15072  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||    
T  15073 agtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagact 15172  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||     
T  15173 ttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctccccc 15272  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 670  Q
    |  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  15273 atgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattc--ttgtgttctctcttct 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 6153 - 6502
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6153 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatag 6252  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggc 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  6253 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggac 6352  T
Q  513 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6353 tttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccc 6451  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
     |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  6452 cagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttct 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 317 - 663
Target Start/End: Original strand, 2834 - 3182
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2834 ttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 2933  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||  | || ||    
T  2934 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggact 3033  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||     
T  3034 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccg 3132  T
Q  614 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3133 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 29163 - 29473
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  29163 agagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggt 29262  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 551  Q
    |||||| ||| |||| ||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29263 tgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactc 29362  T
Q  552 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29363 attgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 29461  T
Q  652 cttttgtgttct 663  Q
    | ||||||||||    
T  29462 cgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Original strand, 33 - 344
Alignment:
Q  355 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggt 132  T
Q  455 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 550  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  133 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacc 232  T
Q  551 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  233 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 331  T
Q  651 tcttttgtgttct 663  Q
    |  ||||||||||    
T  332 ttctttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 317 - 675
Target Start/End: Original strand, 85185 - 85546
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| | ||  ||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  85185 ttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 85283  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  85284 agtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgact 85383  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 612  Q
    ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  85384 ttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 85483  T
Q  613 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
     |||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  85484 cagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 85546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 205 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 1638
Alignment:
Q  205 aaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnngg----tatcttcagtgtagtattcgttcc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |     ||||||||| ||  ||| | ||||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaaggaaacctatcttcagcgtgatatccattcc 1981  T
Q  301 aaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaa 399  Q
    ||||||| || ||| ||||  || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||    
T  1980 aaatttacgagttacattt--ctctaaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaa 1884  T
Q  400 aactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttac 496  Q
    ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||||| ||    
T  1883 aactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcac 1795  T
Q  497 gagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgg 595  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  1794 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgt 1695  T
Q  596 agggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1694 agggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2180 - 2070
Alignment:
Q  67 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 2081  T
Q  167 aaatatatttt 177  Q
    |||||||||||    
T  2080 aaatatatttt 2070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 430 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1438
Alignment:
Q  430 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaatta 526  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  527 ggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 626  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  627 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 296 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16174 - 15817
Alignment:
Q  296 gttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaac 394  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||    
T  16174 gttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaac 16076  T
Q  395 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttg 491  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |   ||| |||||||||| |||    
T  16075 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttg 15979  T
Q  492 gttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtga 590  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  15978 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtgg 15879  T
Q  591 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15878 aacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 317 - 538
Target Start/End: Original strand, 35594 - 35817
Alignment:
Q  317 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594 ttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 35692  T
Q  417 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  35693 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggact 35792  T
Q  514 ttgggtagaattaggcgggagactt 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35793 ttgggtagaattaggcgggagactt 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 583 - 675
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35909
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 675  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttct 35909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 316 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16982 - 16646
Alignment:
Q  316 attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16982 attttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtat 16885  T
Q  415 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 511  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||  |||||||   ||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||| |     
T  16884 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgaga 16788  T
Q  512 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 610  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||  |||| |  |||||||    
T  16787 ctttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcc 16688  T
Q  611 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 651  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16687 cccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 22239 - 22418
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22239 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 22336  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22337 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 482 - 663
Target Start/End: Original strand, 24514 - 24693
Alignment:
Q  482 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 581  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  24514 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 24611  T
Q  582 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 663  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24612 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 24693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 8458 - 8512
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8458 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 276 - 642
Target Start/End: Original strand, 4727 - 5095
Alignment:
Q  276 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaac 375  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  4727 gtatcttcagtgtgatattcgtttcaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaa 4826  T
Q  376 aatgg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac-- 472  Q
    || || ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||| | |||| | ||||||||  | |||||||      
T  4827 aaaggatttag-aagtaagcaac-aaactagggtttatatagcgttt-tctctcagcaacaaacactagag-ttga-gtttgattcatgttgggaaacac 4921  T
Q  473 -attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaa 570  Q
     |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4922 tattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaa 5021  T
Q  571 cgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 642  Q
     | ||||||||| ||||||| |||  ||  ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  5022 agatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4694
Alignment:
Q  68 agtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaata 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 agtataactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatatttcgtgctgaaaatatatttatggacaata 4651  T
Q  168 aatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatat 210  Q
     |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||    
T  4652 tatatatttttgtactgtatgaaggacaatttgatgcaaatat 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 1
Alignment:
Q  61 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 610 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 1489 - 1439
Alignment:
Q  610 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1489 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 321 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1013
Alignment:
Q  321 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1161 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 1062  T
Q  421 tgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 464  Q
    ||||||     |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||    
T  1061 tgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccacct 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 594 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4666
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 57905 - 57836
Alignment:
Q  145 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatatttt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  57905 tgaaaatatatgtatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaa-aatttgatgcaaatatatttt 57836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 57537 - 57452
Alignment:
Q  540 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 624  Q
    |||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||| | |||| || ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  57537 ttcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 57995 - 57926
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  57995 tgactcaaaatttgatggatgatgaat--tgtttctaaaagtataaaagatttgttttatatattttttgtg 57926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 5739 - 5687
Alignment:
Q  596 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5739 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 2550 - 2496
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  2550 ggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 149141 - 149097
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2273 - 2232
Alignment:
Q  99 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 140  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273 attgttgcagaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 2232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 648
Target Start/End: Original strand, 36876 - 36925
Alignment:
Q  599 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36876 gctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 44000 - 44054
Alignment:
Q  594 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  44000 ggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 17052 - 16980
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 654  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17052 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  604 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 648  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 10443 - 10493
Alignment:
Q  72 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagat 122  Q
    ||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  10443 tgactcaaaatttgatggataaaaaagattgttgttaaaaatataaaagat 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3068
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 650
Target Start/End: Original strand, 16441 - 16509
Alignment:
Q  583 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 650  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16441 tatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University