View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14296_low_9 (Length: 357)

Name: NF14296_low_9
Description: NF14296
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14296_low_9
NF14296_low_9
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (22-295)||(2711538-2711811)
chr8 (22-295)||(2988928-2989201)
chr8 (132-340)||(3002021-3002229)
chr8 (20-291)||(3142422-3142696)
chr8 (26-295)||(9851352-9851624)
chr8 (52-187)||(2916491-2916626)
chr8 (22-100)||(3001944-3002022)
chr8 (26-201)||(2911477-2911652)
chr8 (20-117)||(2980014-2980111)
chr8 (22-193)||(13790874-13791045)
chr8 (128-193)||(3282852-3282917)
chr8 (314-342)||(2711491-2711519)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (22-295)||(18355325-18355598)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (25-295)||(10755912-10756182)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (35-295)||(50223-50486)
scaffold0065 (26-295)||(45045-45317)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (31-295)||(3919404-3919671)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (25-179)||(8572638-8572792)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (25-179)||(28698598-28698752)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2711811 - 2711538
Alignment:
Q  22 atggatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaact 121  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2711811 atggatgaattggaaatactcaagaacacagttgaatccatcaaagctgtcctccttgatgctgaagacaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaact 2711712  T
Q  122 gggttagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||    
T  2711711 gggttagaaggctcaaagatgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgagtttcttattgaagatatgatacataaaagggataaagctcataacaa 2711612  T
Q  222 caaagtgacacaggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattg 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2711611 caaagtgactcaggtatttcattccttatccataagcagagctgcttttcgccgtaaaatggctcatgagattg 2711538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 2988928 - 2989201
Alignment:
Q  22 atggatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaact 121  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||  ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||    
T  2988928 atggatgaattagaaagacttaaaaacacaattgaagtcatcagagctgtactccttgatgctgaggagaaacaagagaaaagtcctgctgtacaagtct 2989027  T
Q  122 gggttagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaa 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  2989028 gggtaagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgcagatgatttgatagatgagtttcttattgaagatatgatacacaaacgggataaagctcataagaa 2989127  T
Q  222 caaagtgacacaggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattg 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2989128 caaagtgacacaggtaattcattccttcttaccaagcagaactgcttttcgccgtaaaatggctcatgagattg 2989201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 340
Target Start/End: Original strand, 3002021 - 3002229
Alignment:
Q  132 gctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaacaaagtgaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3002021 gctcaaagacgtgcttcttcctgctgttgatttgatagatgagtttcttattgaagatatgatacacaaaagggataaagctgataagaacaaagtgaca 3002120  T
Q  232 caggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattgnnnnnnnnnnnnnnngttttaatgatgttgtgaaag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||               |||||||||||||||||||||    
T  3002121 caggtatttcattccttctctctaagcagagctgctttttgccataaaatggctcttgagattgaaaaaatacaaaaaagttttaatgatgttgtgaaag 3002220  T
Q  332 atatgtctg 340  Q
    |||||||||    
T  3002221 atatgtctg 3002229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3142696 - 3142422
Alignment:
Q  20 tgatggatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaa 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3142696 tgatggatgaactggaaaggcttaaaaacacagttgaatccatcaaagctgtgctccttgatgctgaagacaaacaagagaaaagtcatgctgtacaaat 3142597  T
Q  120 ctgggttagaaggctcaaa---gacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgat 216  Q
    |||| | ||||| ||||||   || || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||| |||| ||| ||| | ||| |||||  |    
T  3142596 ctggataagaagactcaaagatgatgtacttcatcctgctgatgacttgctagatgaatttgctatcgaagacatgagacaaaaacgggatgaagctcgt 3142497  T
Q  217 aagaacaaagtgacacaggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgag 291  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||  |  |||  ||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  3142496 aagaacaaagtaacacaggtgcttcattctttatctccgaatagaattgcttttagccgtaaaatggcttatgag 3142422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9851624 - 9851352
Alignment:
Q  26 atgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagag---caaagtcatgctgtacaaaactg 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || | || |||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||||| | ||| ||    
T  9851624 atgaattggaaaagcttaagaacacggttgaatctattagagttgtgctccttgatgctgaagagaaacaagaagcacaaaatcatgctgttcgaaattg 9851525  T
Q  123 ggttagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaac 222  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||  ||| || || ||||||||    
T  9851524 ggtaagaaggctcaaagatgtgcttcatcctgcagatgatttgctagatgaatttgttattgaagatatgaggaacaaaatggatgaaactcataagaac 9851425  T
Q  223 aaagtgacacaggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattg 295  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| |||| || || |  | ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  9851424 aaagtaacaaaggtacttcattccttatctccaaacaaaatttcttttcgccgtaaaatggcatatgagattg 9851352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2916626 - 2916491
Alignment:
Q  52 gttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaactgggttagaaggctcaaagacgtgcttcttc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||    
T  2916626 gttgaatccatcaaagctgtgctccttgatgctgaggagaaacaagaacaaaaccatgctgtacaaaactggattagaagactcaatgatgtgcttcatc 2916527  T
Q  152 ctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaag 187  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  2916526 ctgctgatgacttgctagatgaatttgttattgaag 2916491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 100
Target Start/End: Original strand, 3001944 - 3002022
Alignment:
Q  22 atggatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3001944 atggatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctccttgatgctgaagacaaacaagagc 3002022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2911652 - 2911477
Alignment:
Q  26 atgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaactgggt 125  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |  ||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |    
T  2911652 atgagttggaaaggcttaagaatacagttgagtctatcagaaatgtactccttgatgctgaggacaaacaagaacaaaaccatgctgtaaaaaactggat 2911553  T
Q  126 tagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaa 201  Q
    |||||| |||||||| |||||   |  ||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  2911552 tagaagactcaaagatgtgctgaattttgctgacaacttgctagatgaatttgttattgaagatttgagacacaaa 2911477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Original strand, 2980014 - 2980111
Alignment:
Q  20 tgatggatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaa 117  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||  ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2980014 tgatggatgaattagaaagacttaaaaacacaattgaagtcatcagagctgtactccttgatgctgaggagaaacaagagaaaagtcatgctgtacaa 2980111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 13790874 - 13791045
Alignment:
Q  22 atggatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaact 121  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| | | | || |||||||||| | ||  | || ||||| || |||| |  || |||||| || |    
T  13790874 atggatgagttggaaagacttaagaactctgttgaatgcgtaagagttgtgctccttgacgcccaggataaacaggaacaaaattttgttgtacagaatt 13790973  T
Q  122 gggttagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatga 193  Q
    || | |||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13790974 ggataagaaggctcacagatgtgcttcatcttgcagatgacttgctagatgaatttattattgaaggtatga 13791045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3282917 - 3282852
Alignment:
Q  128 gaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatga 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  3282917 gaaggctcaaagatgtgcttcatcttgcagatgacttgctagatgaattcattattgaaggtatga 3282852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2711519 - 2711491
Alignment:
Q  314 ttaatgatgttgtgaaagatatgtctgtg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2711519 ttaatgatgttgtgaaagatatgtctgtg 2711491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 18355325 - 18355598
Alignment:
Q  22 atggatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaact 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18355325 atggatgaactggaaaggcttaagaagacagttgaatccatcaaagctgtgctccttgatgctgaagacaaacaagagcaaagtcatgctgtacaactct 18355424  T
Q  122 gggttagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaa 221  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18355425 gggttagaaggctcaacgacctgcttcttcctgcagatgatttgatagatgaattttttattgaagatatgatacacaaaagggataaagctcataagaa 18355524  T
Q  222 caaagtgacacaggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattg 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18355525 caaagtgaaacaggtatttcattccttctcaccaagcagaactgcttttcgccgtaaaatggctcatgagattg 18355598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10756182 - 10755912
Alignment:
Q  25 gatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaactggg 124  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  10756182 gatgaattagaaagccttacgaagacagttgaatccatcagagctgtgctccttgatgctgagaacaaacaagagaaaagtctttgtgtacaaaactggg 10756083  T
Q  125 ttagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaacaa 224  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  10756082 ttacaaggctcaaagatgtgcttgttgctgcagatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacgcaaaagggatgaagctcataagaacaa 10755983  T
Q  225 agtgacacaggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattg 295  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||| | | |||||||||||  |||||||    
T  10755982 agtaacaaaggtacttcattctttctctttaagcaaagctgttttttgtcgtaaaatggctctagagattg 10755912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Original strand, 50223 - 50486
Alignment:
Q  35 aaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaactgggttagaaggct 134  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||    
T  50223 aaaggcttaagaatactgttgaatccgtctgagctgtgctcctcgatgctgaagagaaacaagagcaaagtaatgctgtacaaatctggataagaagact 50322  T
Q  135 caaagacg---tgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaacaaagtgaca 231  Q
    |||||| |   | |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  |||||| ||| ||| |    
T  50323 caaagatgatgtacttcatcctgctgatgacttgctagataaatttcttattgaagatttgagacacaaacgagatgaagctcgtaagaaaaaactgaga 50422  T
Q  232 caggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattg 295  Q
    |||||| ||||||| || |||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50423 caggtacttcattctttatctccaaacagaattgcttttcgccttaaaatggctcatgagattg 50486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 295
Target Start/End: Original strand, 45045 - 45317
Alignment:
Q  26 atgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaactgggt 125  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  45045 atgagttggaaaggcttaagaatactgttgaatccgtcagagctgtgctccttgatgctgaggagaaacaacaacaaagtcatggtgtgcaaaactggat 45144  T
Q  126 tagaaggctcaaa---gacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaac 222  Q
     ||||| ||||||   || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||   ||||||    
T  45145 aagaagactcaaagatgatgtgcttcatcctgctgatgatttgctagatgaattttctattgaagacatgagacacaaacgggatgaagctcgcaagaac 45244  T
Q  223 aaagtgacacaggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattg 295  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  45245 aaagtgacacaggtacttcatcgcttatctccaaatagaattgcttttagccgtaaaatggctcatgagattg 45317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3919671 - 3919404
Alignment:
Q  31 ttggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaactgggttagaa 130  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  3919671 ttggaaaggcttaagagtacagttcaatccatcagagctgtgctccttgatgccgaggagaaacaacaacaaaatcatggtgtgcaaaactggataagaa 3919572  T
Q  131 ggctcaaagacg---tgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttcttattgaagatatgatacacaaaagagataaagctgataagaacaaagt 227  Q
    |||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  3919571 ggctcaaagatgatgtgcttcatcctgctgatgacttgctcgatgaatttgttattcacgatatgagacacaaaattgaggaagctgataagaacaaagt 3919472  T
Q  228 gacacaggtatttcattccttctctctaagcagagctgcttttcgccataaaatggctcatgagattg 295  Q
     ||| ||||| |||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3919471 aacaaaggtacttcattccttatctccaaacagatttgcttttcgccgtaaaatggctcatgagattg 3919404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 8572638 - 8572792
Alignment:
Q  25 gatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaactggg 124  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  8572638 gatgaattagaaagtcttacgaagacagttgaatccatcagagctgcgctccttgatgctgagaacaaacaagagaaaagtctttgtgtacaaaactggg 8572737  T
Q  125 ttagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttct 179  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8572738 ttacaaggctcaaagatgtgcttgttgctgcagatgatttgatagatgaatttct 8572792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 28698598 - 28698752
Alignment:
Q  25 gatgaattggaaaggcttaagaacacagttgaatccatcaaagctgtgctcctttatgctgaagagaaacaagagcaaagtcatgctgtacaaaactggg 124  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  28698598 gatgaattagaaagtcttacgaagacagttgaatccatcagagctgcgctccttgatgctgagaacaaacaagagaaaagtctttgtgtacaaaactggg 28698697  T
Q  125 ttagaaggctcaaagacgtgcttcttcctgctgatgatttgatagatgaatttct 179  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28698698 ttacaaggctcaaagatgtgcttgttgctgcagatgatttgatagatgaatttct 28698752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University