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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
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| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF14299_high_8 (Length: 287)
Name: NF14299_high_8
Description: NF14299
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14299_high_8 |
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Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
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Target Start/End: Complemental strand, 11676876 - 11676649
Alignment:
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Q |
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atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattatattgttggggcctgcttgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
11676777 |
T |
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| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttaagatatttggttaaattattatttaactg-ttttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctaataaatgttttaagaaa |
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T |
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tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
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|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
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tttttatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 21147967 - 21148193
Alignment:
| Q |
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Q |
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|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21147967 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataatttccgctgcaatgt |
21148065 |
T |
|
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ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21148066 |
ttaagatatttggttaaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaa |
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T |
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| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21148165 |
tttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
21148193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 24641633 - 24641859
Alignment:
| Q |
16 |
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Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgctatttgttatattgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
24641732 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24641733 |
ttaagatatttagttaaattattatttaactg--tttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaa |
24641830 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24641831 |
tttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
24641859 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 24873128 - 24873340
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24873128 |
ttgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttctgctgcaatgattaagatatttggtt |
24873226 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||| |
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|
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24873227 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttatattttgggaa |
24873325 |
T |
|
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231 |
aacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
24873326 |
aacggggtgttacaa |
24873340 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 15670498 - 15670724
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaact-aactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatg |
114 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr2; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 15697023 - 15697233
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T |
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| Q |
131 |
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230 |
Q |
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Q |
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| T |
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T |
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Target: chr2; HSP #7
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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24881210 |
T |
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244 |
Q |
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| T |
24881211 |
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T |
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Target: chr2; HSP #8
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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244 |
Q |
| |
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| T |
25584842 |
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25584814 |
T |
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Target: chr2; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 20450329 - 20450554
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115 |
Q |
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20450427 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
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20450525 |
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244 |
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| |
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| T |
20450526 |
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20450554 |
T |
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Target: chr2; HSP #10
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130 |
Q |
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24502442 |
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| Q |
131 |
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230 |
Q |
| |
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| T |
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24502345 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr2; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 31 - 244
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129 |
Q |
| |
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30658010 |
T |
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
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30658109 |
T |
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| Q |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
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Q |
| |
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|
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23898875 |
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23898779 |
T |
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| Q |
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244 |
Q |
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| T |
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23898690 |
T |
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Target: chr2; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 22688881 - 22689066
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154 |
Q |
| |
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| T |
22688881 |
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T |
|
| Q |
155 |
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243 |
Q |
| |
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|
| T |
22688978 |
attatgttttatgtgatatcccgttgtttgtgaagtttactctgataaatgatttaagaaatttttatattgggaaaacgaggtgttac |
22689066 |
T |
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Target: chr2; HSP #14
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| |
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13971110 |
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13971207 |
T |
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244 |
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| |
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| T |
13971208 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
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Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |
|
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| T |
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38688451 |
T |
|
| Q |
152 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
38688452 |
tggattatgttaaatgtgatttctcgtttgtttatgctgtttactctgataaatg-tttatgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
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134 |
Q |
| |
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| T |
45058153 |
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45058250 |
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|
| Q |
135 |
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234 |
Q |
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| T |
45058251 |
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45058349 |
T |
|
| Q |
235 |
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244 |
Q |
| |
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|||||||||| |
|
|
| T |
45058350 |
gggtgttaca |
45058359 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
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| Q |
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
24714078 |
tttgagggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt- |
24713981 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24713980 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
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161 |
Q |
| |
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29023783 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgt |
29023880 |
T |
|
| Q |
162 |
tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29023881 |
t-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
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tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
| |
|
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tactttgatggggcctgcgtgccaaagcgttttatggattatgaaataa-ttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactg-ttt |
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T |
|
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152 |
tggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
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|
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27195138 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27368637 - 27368453
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| |
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27368637 |
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T |
|
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atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
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| T |
27368538 |
acgtt-tatgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
27368453 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27845050 - 27844855
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
27845050 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaagcgttttatggattatgaaataa-ttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactg-ttt |
27844953 |
T |
|
| Q |
152 |
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249 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27844952 |
tggattatgttaaatgtaatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataaatg-tttatgaaattttaattttgggaaaacggggtgttacacaaac |
27844855 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41666374 - 41666195
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
41666374 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgaaataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttt-g |
41666276 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggg |
236 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41666275 |
attatgtta-atgtgatatcccgtttgtttatgctgcttactctgataattg-tttaaggaatttttatattgggaaaacggg |
41666195 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 245
Target Start/End: Original strand, 44375450 - 44375632
Alignment:
| Q |
63 |
ggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgtt |
162 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44375450 |
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44375548 |
T |
|
| Q |
163 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44375549 |
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44375632 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27375308 - 27375123
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27375308 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttatatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggatt |
27375210 |
T |
|
| Q |
158 |
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245 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27375209 |
acgtt-tatgtgacatgccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
27375123 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 245
Target Start/End: Original strand, 44381971 - 44382158
Alignment:
| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
44381971 |
tgatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgacataaattccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactg-ttttggat |
44382068 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaa-gaaattttt-atattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44382069 |
tacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaatgaaatttttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
44382158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 23115452 - 23115644
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
23115452 |
tactttgatagggcctgcgtgccaaggcgttttatggatgatgaaataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactg-ttt |
23115550 |
T |
|
| Q |
152 |
tggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | |||| ||||||||||| || | |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23115551 |
tggattaagttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaaag-tttatgaaatttttatgttggaaaaacgggttgttacaa |
23115644 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 245
Target Start/End: Original strand, 44391031 - 44391212
Alignment:
| Q |
63 |
ggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgtt |
162 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
44391031 |
ggcctgtgttccaaaacgttttatg-attatgacataaattccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactg-ttttggattacgtt |
44391128 |
T |
|
| Q |
163 |
atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaa-gaaattttt-atattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44391129 |
-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaatgaaatttttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
44391212 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29232916 - 29232708
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
29232916 |
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29232819 |
T |
|
| Q |
135 |
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229 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
29232818 |
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29232723 |
T |
|
| Q |
230 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
29232722 |
aaacggggtgttaca |
29232708 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29346215 - 29346007
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
29346215 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagtta-ttggttaaat |
29346118 |
T |
|
| Q |
135 |
tattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataa-----atgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
29346117 |
tattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgttttaagaaattttgatattggaa |
29346022 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
29346021 |
aaacggggtgttaca |
29346007 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 22461874 - 22462066
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
22461874 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttcgaaataattttccgctgcattgtttaag-tatttggttaaatttttatttaactgatattg |
22461972 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttt--tatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22461973 |
atttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaatttttatatattgggaaaacggggtgttacaa |
22462066 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 23867158 - 23867345
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23867158 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttgactg---ttggattat |
23867253 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23867254 |
gttatatgtgatattccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttacaa |
23867345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 60225 - 60038
Alignment:
| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
60225 |
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60126 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60125 |
tatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgctaaatg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
60038 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 30971753 - 30971947
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagat-atttg------gttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
30971753 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagttaatttgttgaaagttaaattgttatttaactg |
30971852 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatg--ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30971853 |
attttggattatgttttgtatgtgatatcccg---tttatgctgaatactctgataaatgatt--agaaatttttatattggaaaaacggggtgttacaa |
30971947 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 19929186 - 19929378
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
19929186 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaattcgttgaaagttaaattgttatttaactga |
19929285 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19929286 |
ttttggattaaatttgtatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
19929378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33484950 - 33484760
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |
|
|
| T |
33484950 |
ttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattgttatttaactgtt---g |
33484855 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt-----ttaagaaattttta-tattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33484854 |
gattacgttatatgtgatatcccgttgttt--gatgtttactctgataaatgttatgttttaagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
33484760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24734838 - 24734620
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| Q |
26 |
tgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt |
125 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
24734838 |
tgatgttgaattaactcatttgaaat-attttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggttttcaaattaatttccgctgcaacgtttgaaatatt |
24734740 |
T |
|
| Q |
126 |
tg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaattttt |
220 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24734739 |
tgttaaagttaaattgttatttaactgttttgcgattatgttgaatgtgatatcccgttattt--gatgtttactctgataaatgttt--agaaattttt |
24734644 |
T |
|
| Q |
221 |
atattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24734643 |
atattgggaaaacggggtgttaca |
24734620 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24266414 - 24266223
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |
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| T |
24266414 |
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24266319 |
T |
|
| Q |
154 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
24266318 |
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24266223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24261331 - 24261184
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24261331 |
ttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatgaattaagattatgattttccgctgcaatggttaagata-ttggttaaattgttatttaactg---ttg |
24261236 |
T |
|
| Q |
154 |
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207 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24261235 |
gattacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
24261184 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Original strand, 26878300 - 26878464
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaa |
133 |
Q |
| |
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| T |
26878300 |
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26878395 |
T |
|
| Q |
134 |
ttattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26878396 |
ttattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctgataaatgtt |
26878464 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 41605463 - 41605673
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
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| T |
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41605560 |
T |
|
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
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| T |
41605561 |
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41605656 |
T |
|
| Q |
229 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41605657 |
aaaacggggtgttacaa |
41605673 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 250
Target Start/End: Original strand, 25191693 - 25191886
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25191693 |
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25191788 |
T |
|
| Q |
159 |
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250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25191789 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttacaataaca |
25191886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 22321744 - 22321886
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22321744 |
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22321839 |
T |
|
| Q |
159 |
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207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22321840 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
22321886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 22327897 - 22328039
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
22327897 |
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22327992 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22327993 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
22328039 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1842451 - 1842241
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
1842451 |
taactcttttgagat-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
1842354 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgttttt-ggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
1842353 |
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1842258 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1842257 |
gaaaacggggtgttaca |
1842241 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23186494 - 23186301
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttgg-------ttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23186494 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaatgatttatggatttcgaaataattttccgctgcaacgtttaagatattttgctgaaagttaaattgttatttaacta |
23186395 |
T |
|
| Q |
148 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23186394 |
atttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgtt---agaaatttttatagtgggaaaacggggtgttacaa |
23186301 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23597757 - 23597564
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttgg-------ttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
23597757 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaatgatttatggatttcgaaataattttccgctgcaacgtttaagatattttgctgaaagttaaattgttatttaacta |
23597658 |
T |
|
| Q |
148 |
-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
23597657 |
atttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgtt---agaaatttttatagtgggaaaacggggtgttacaa |
23597564 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24174194 - 24174002
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24174194 |
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24174095 |
T |
|
| Q |
149 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24174094 |
ttttggactatgtttcgaatgtgatatcccgttatt---gatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
24174002 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Original strand, 24914798 - 24914912
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24914798 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
24914893 |
T |
|
| Q |
227 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24914894 |
ggaaaacggggtgttacaa |
24914912 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 25962255 - 25962447
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt--tg---gttaaattattatttgactgtt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
25962255 |
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25962354 |
T |
|
| Q |
150 |
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244 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25962355 |
tttttagattatgtttgaatgtgatatcccgttc---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
25962447 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 245
Target Start/End: Original strand, 24656065 - 24656243
Alignment:
| Q |
69 |
cgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgtttttggattatg-t |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| | |
|
|
| T |
24656065 |
cgtgccaaaacgatttatggattttgaattaatttccgctgcaatgtttgagatatttgttgaaagttaaattgttatttaactatttttagattatgtt |
24656164 |
T |
|
| Q |
162 |
tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24656165 |
tgaatgtgatatcccg---ttcatgacgtttactctgataattg--ttaagaaatttttattttgggaaaacggagtgttacaa |
24656243 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33491164 - 33491048
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |
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| T |
33491164 |
ttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattgttatttaactg---ttg |
33491069 |
T |
|
| Q |
154 |
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174 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
33491068 |
gattacgatatatgtgatatc |
33491048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 18856143 - 18856334
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
18856143 |
tttgatggagcctacgtgccaaaaacgttttatggattatgaaataatttatgctgcattgtt-aagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaactg |
18856241 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18856242 |
attttggattatgttataatgtgatatcccgttat---tgctgtttactctgataaatattt--agaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
18856334 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 24945222 - 24945434
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
24945222 |
taactcttttgagac-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatgttttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
24945319 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
24945320 |
taaattattatttaactttttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgttaaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
24945415 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaaaa |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24945416 |
aaaacggggtgttacaaaa |
24945434 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12828346 - 12828233
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
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|
| T |
12828346 |
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12828251 |
T |
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227 |
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244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12828250 |
gaaaaacggggtgttaca |
12828233 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23170317 - 23170204
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23170317 |
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23170222 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23170221 |
ggaaaacggggtgttaca |
23170204 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23581574 |
gttaaattgttatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
23581479 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23581478 |
ggaaaacggggtgttaca |
23581461 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 41611456 - 41611569
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41611456 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacatttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
41611551 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41611552 |
ggaaaacggggtgttaca |
41611569 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24869286 - 24869093
Alignment:
| Q |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
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24869286 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattttcgaattaactccgctgcaatgtttaagatattttcttgaaagttaaattgttatttaactg |
24869187 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24869186 |
ttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttaatt--gattattactctgataattgtttt--gaaaattttatattgggaaaacggggtgttaca |
24869093 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
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Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10865453 - 10865339
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| Q |
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10865453 |
ggttaaattattatttgactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
10865358 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10865357 |
gggaaaacggggtgttaca |
10865339 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 244
Target Start/End: Original strand, 22382584 - 22382707
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| Q |
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215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22382584 |
ttggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctgataaatgttatgttttttttaagaaa |
22382678 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22382679 |
ttttgatattgggaaaacggggtgttaca |
22382707 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Original strand, 23659794 - 23659939
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
23659794 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
23659890 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23659891 |
tctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
23659939 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27598507 - 27598394
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
27598507 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctttgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaattttgtatattg |
27598412 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27598411 |
ggaaaacggggtgttaca |
27598394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37317643 - 37317452
Alignment:
| Q |
55 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
37317643 |
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37317544 |
T |
|
| Q |
150 |
tttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaa-tgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37317543 |
tttggactatgtttgtatgtgatatcccgttt---atgttgaatactctgataaaatgttt--agaaatttttatattggaaaaacggggtgttaca |
37317452 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14888073 - 14887972
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| Q |
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199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
14888073 |
tttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgct--tgttgcttactctga |
14887980 |
T |
|
| Q |
200 |
taaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
14887979 |
taaatgtt |
14887972 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 19646085 - 19646294
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
19646085 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactaatttatggattacgaactaaattccgctgcaacgtttgaaatatttgttgaagtta |
19646183 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgat-aaatgttttaagaaatttttatatt-agg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19646184 |
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19646278 |
T |
|
| Q |
229 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
19646279 |
aaaacggggtgttaca |
19646294 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40427859 - 40427666
Alignment:
| Q |
55 |
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146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
40427859 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatatttgaattaact-ctgctgcaatgtttgagatattttattgaaagttaaattgttatttaact |
40427761 |
T |
|
| Q |
147 |
gtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40427760 |
gttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttaatt--gatgattactctgataattgtttt--gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
40427666 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
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Query Start/End: Original strand, 127 - 245
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| Q |
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
10872818 |
ggttaaataattatttgactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
10872723 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10872722 |
gggaaaacggggtgttacaa |
10872703 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17003062 - 17002853
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| Q |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || || |
|
|
| T |
17003062 |
aactcttttgagat-actt--attgggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaagg |
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T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
17002965 |
ttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgg |
17002871 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17002870 |
gaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9339581 - 9339436
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| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
9339581 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
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T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9339485 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 101 - 245
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| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
9488215 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
9488120 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9488119 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
9488070 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16996429 - 16996221
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| Q |
38 |
aactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatattt------gg |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || || |
|
|
| T |
16996429 |
aactcttttgagat-actt--attgggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaagg |
16996333 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
16996332 |
ttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgg |
16996238 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996237 |
gaaaacggggtgttaca |
16996221 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22675095 - 22674981
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127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
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|
| T |
22675095 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
22675000 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22674999 |
gggaaaacggggtgttaca |
22674981 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9607476 - 9607332
Alignment:
| Q |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
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|
| T |
9607476 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
9607381 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9607380 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
9607332 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 19123835 - 19124022
Alignment:
| Q |
62 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19123835 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
19123933 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19123934 |
ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
19124022 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Original strand, 23027935 - 23028048
Alignment:
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
23027935 |
gttaaattgttatttaactatttttagattatgtgaaatgtgatatcccattttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
23028030 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23028031 |
gaaaacggggtgttacaa |
23028048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 23843288 - 23843401
Alignment:
| Q |
127 |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23843288 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatccag----ttatggtttttactctgataattg-tttaagaaatttgaatatt |
23843382 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23843383 |
gggaaaacggggtgttaca |
23843401 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27616656 - 27616472
Alignment:
| Q |
62 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27616656 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
27616558 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27616557 |
attacgtttctatgtgatatccg----tttatggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
27616472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
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Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Original strand, 13307337 - 13307545
Alignment:
| Q |
38 |
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128 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13307337 |
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13307433 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
13307434 |
ttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgcatattgg |
13307528 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13307529 |
gaaaacggggtgttaca |
13307545 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13578101 - 13577960
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
13578101 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
13578006 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13578005 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgtt |
13577960 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 19490636 - 19490824
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| Q |
62 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19490636 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
19490734 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19490735 |
ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattggaaaaacggggtgttacaa |
19490824 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24672796 - 24672720
Alignment:
| Q |
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atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgtgatatcccgtttt--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
24672720 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
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Alignment:
| Q |
62 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25934368 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
25934270 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25934269 |
ggattacgtttctatgtgataacccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
25934181 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 207
Target Start/End: Original strand, 28432739 - 28432829
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| Q |
111 |
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207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggataacgttatatgtgatatcccgttgat--tgatgattactctgataaatgtt |
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T |
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Target: chr2; HSP #84
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| Q |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||| || | |
|
|
| T |
24679457 |
gttaaattgttatttaactatttttgaat-atgcgaaatgtgatatcctgtttt--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttatgttgg |
24679362 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24679361 |
gaaaacggggtgttacaa |
24679344 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
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| Q |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||| | ||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
40623052 |
gttaaattgttatttaactattttag-attatgtgaaatgtgatatcccgttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
40623146 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40623147 |
gaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
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| Q |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16985112 |
gggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
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| Q |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38448043 |
gggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||||| |||| | | |||||||||||| || ||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
20949907 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccg---tttacggtttttactctgataattg-cttatgaaatttgtatatt |
20950002 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20950003 |
gggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #89
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
27211895 |
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T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27211800 |
gggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #90
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #91
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #92
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #93
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Q |
| |
|
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|
|
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45678970 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccgtttt |
45679023 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Original strand, 25347102 - 25347141
Alignment:
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25347102 |
ttttatgaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
25347141 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 244
Target Start/End: Original strand, 20634760 - 20634798
Alignment:
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20634760 |
ttttatgaaatttttatgttaggaaaacggggtgttaca |
20634798 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 246
Target Start/End: Original strand, 21328483 - 21328521
Alignment:
| Q |
208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21328483 |
ttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaaa |
21328521 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16921611 - 16921559
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16921611 |
ttactctgataattgttt-aagaaatttgcatattgggaaaacggggtgttaca |
16921559 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 245
Target Start/End: Original strand, 22741515 - 22741552
Alignment:
| Q |
208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22741515 |
ttaagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
22741552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 244
Target Start/End: Original strand, 23760176 - 23760212
Alignment:
| Q |
208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23760176 |
ttaagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
23760212 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0436 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:
Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13294 - 13068
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13294 |
atgctatttgttatattgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatga |
13195 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13194 |
ttaagatatttggttaaattattatttaactg--tttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaa |
13097 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13096 |
tttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
13068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 177)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10325279 - 10325054
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10325279 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaagacgttttatggattatgttataatttccgctgcaatgt |
10325180 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10325179 |
ttaagatatttggttaaattattatttaactg-ttttggatcatgttatatgtgatatcccg-tgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
10325082 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10325081 |
tttttatatt-gggaaacggggtgttaca |
10325054 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12890763 - 12890552
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12890763 |
ttgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgattaagatatttggtt |
12890665 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
12890664 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
12890566 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
12890565 |
aacggggtgttaca |
12890552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 16864716 - 16864927
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16864716 |
ttgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attataatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
16864814 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16864815 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
16864913 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
16864914 |
aacagggtgttaca |
16864927 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 17253805 - 17254017
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17253805 |
ttgaactaactcttttgagactactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
17253903 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
17253904 |
aaattattatttaactatttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgcttgtgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
17254002 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
17254003 |
aacggggtgttacaa |
17254017 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13320334 - 13320120
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13320334 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgt-ttatgatataatttccgctacaatggttaagatatttggtt |
13320236 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
13320235 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttttatgtgatatcccgttgcttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
13320137 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttacaaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13320136 |
aacgaggtgttacaaaa |
13320120 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Original strand, 28369161 - 28369354
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
28369161 |
tttgatggggcctgcgtgccgaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
28369259 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
28369260 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacggagtgttacagaaac |
28369354 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Original strand, 28376979 - 28377172
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
28376979 |
tttgatggggcctgcgtgccgaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
28377077 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
28377078 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacggagtgttacagaaac |
28377172 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Original strand, 28384801 - 28384994
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
28384801 |
tttgatggggcctgcgtgccgaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
28384899 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
28384900 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacggagtgttacagaaac |
28384994 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7985094 - 7984905
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
7985094 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaatgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
7984996 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7984995 |
attatgtcatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgagaaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacagggtgttacaa |
7984905 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 13316900 - 13317087
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
13316900 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatatgatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttt-gg |
13316997 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13316998 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
13317087 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 55148421 - 55148197
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55148421 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatggggcctgcgtgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
55148323 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
55148322 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
55148226 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55148225 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
55148197 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24187220 - 24186995
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16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24187220 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatggggcctgcgtgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
24187122 |
T |
|
| Q |
116 |
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tttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
24186995 |
T |
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Target: chr3; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 838642 - 838453
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154 |
Q |
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T |
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245 |
Q |
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| T |
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838453 |
T |
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Target: chr3; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 24892741 - 24892556
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57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
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| T |
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T |
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244 |
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| T |
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24892556 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 15350988 - 15351181
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152 |
Q |
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| T |
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15351085 |
T |
|
| Q |
153 |
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248 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr3; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 3344096 - 3344285
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154 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
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245 |
Q |
| |
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| T |
3344195 |
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3344285 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Original strand, 5421031 - 5421219
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| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
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| T |
5421031 |
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5421129 |
T |
|
| Q |
156 |
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245 |
Q |
| |
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|
| T |
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5421219 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 411489 - 411679
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| Q |
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152 |
Q |
| |
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| T |
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411586 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
411587 |
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411679 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 15344344 - 15344534
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| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
15344344 |
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15344441 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
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|
| T |
15344442 |
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15344534 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5200562 - 5200374
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| Q |
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157 |
Q |
| |
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| T |
5200562 |
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5200465 |
T |
|
| Q |
158 |
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249 |
Q |
| |
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| T |
5200464 |
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5200374 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 55 - 244
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| Q |
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152 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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8722085 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 9073782 - 9073972
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| Q |
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152 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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9073880 |
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|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
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|
| T |
9073881 |
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9073972 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
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Target Start/End: Original strand, 15367675 - 15367861
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154 |
Q |
| |
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15367675 |
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15367771 |
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244 |
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| |
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|
|
| T |
15367772 |
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15367861 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 1146291 - 1146481
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| Q |
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152 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1146291 |
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1146388 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
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|
| T |
1146389 |
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1146481 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
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152 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5147537 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt- |
5147634 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5147635 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
5147727 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
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| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16332606 |
atgctatttgtgatattgaactaaatcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataatttccgctgcaatgt |
16332508 |
T |
|
| Q |
116 |
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172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16332507 |
ttaagatatttggttaaattattatttaact-attttggattatgttatatgtgata |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
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|
| T |
5427438 |
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5427536 |
T |
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| Q |
156 |
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245 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |
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|
| T |
5427537 |
ttacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaattttcatattggaaaaacagggtgttacaa |
5427626 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaaga-tatttggttaaatt |
135 |
Q |
| |
|
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| T |
21282456 |
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21282554 |
T |
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| Q |
136 |
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235 |
Q |
| |
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|
| T |
21282555 |
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21282653 |
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236 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
21282654 |
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21282662 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
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31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg--- |
127 |
Q |
| |
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| T |
15825055 |
ttgaattaactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattacgaactaatttccgctgcaacgtttgaaatatttgtta |
15824957 |
T |
|
| Q |
128 |
--gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
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|
| T |
15824956 |
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15824858 |
T |
|
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226 |
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244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15824857 |
ggaaaaacggggtgttaca |
15824839 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12481754 - 12481548
Alignment:
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37 |
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135 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |
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| T |
12481754 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgaccatttggttagatc |
12481656 |
T |
|
| Q |
136 |
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235 |
Q |
| |
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| T |
12481655 |
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12481557 |
T |
|
| Q |
236 |
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244 |
Q |
| |
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||||||||| |
|
|
| T |
12481556 |
ggtgttaca |
12481548 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15360080 - 15359892
Alignment:
| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
15360080 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---tt |
15359985 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15359984 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtttttaagaattttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
15359892 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 15405238 - 15405424
Alignment:
| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |
|
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| T |
15405238 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---tt |
15405333 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15405334 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
15405424 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19802814 - 19802626
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
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19802716 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19802715 |
atcatgttatatgtgatattccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattggaaaaacggggtgttaca |
19802626 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 16624804 - 16624980
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16624804 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-----------attttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttgactgtttt-gg |
16624890 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16624891 |
attatgtcttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
16624980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 15398620 - 15398807
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15398620 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---tt |
15398715 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15398716 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtttttaagaatgtttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
15398807 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 245
Target Start/End: Original strand, 15942593 - 15942781
Alignment:
| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaag-atatttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
15942593 |
tgatggggcctacgtgccaaaacgttttatggattatgaaatattttccgctgcaacgattaagtttatttggttaaattgttatttaacagttattgga |
15942692 |
T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15942693 |
tcatgttaaatgtgatatcccgttgtgtatattgtttactctgat-aatgttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
15942781 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21390741 - 21390561
Alignment:
| Q |
61 |
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158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
21390741 |
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21390646 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21390645 |
cgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtttttaaaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
21390561 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 10154516 - 10154724
Alignment:
| Q |
37 |
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134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
10154516 |
taactcttttgagat-actttgttagggcctgcgtgccaaaaccttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagttatt-ggttaaat |
10154613 |
T |
|
| Q |
135 |
tattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgt-----tttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
10154614 |
tattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgaagcttactctgataaatgttatgttttaagaaattttgatattggga |
10154709 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
10154710 |
aaacggggtgttaca |
10154724 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17684148 - 17683961
Alignment:
| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | || |
|
|
| T |
17684148 |
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17684050 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17684049 |
ggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatgttt--aaaaatttttatattgggaaaacggggtgtta |
17683961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15336815 - 15336634
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| Q |
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ggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
15336815 |
ggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
15336720 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15336719 |
cgttatatgtgatatcccattgttt-tgatgcttactttgataaatgtttttaagaattttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
15336634 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 5150706 - 5150918
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| Q |
32 |
tgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt-tg-- |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
5150706 |
tgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttat-gactatgatataatattccgctgctatg-ttaagatattatgtg |
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T |
|
| Q |
128 |
---gttaaattattatttgactgtttttggattatgt-tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttata |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5150804 |
aaagttaaattattatttaactaattttggattatgtctctatgtgatatcccg---tttatggt-tttactctgataaatgttt--agaaatttttata |
5150897 |
T |
|
| Q |
224 |
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244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5150898 |
ttgggaaaacggggtgttaca |
5150918 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5220792 - 5220584
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
5220792 |
taactctttggagat-actttgttggggcctgcgtgccaaaacattttatgaactatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagtta-ttggttaaat |
5220695 |
T |
|
| Q |
135 |
tattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataa-----atgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
5220694 |
tattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccgttgtgt-tgatgcttactctgataaatgttatgttttaagaaattttgatattggga |
5220599 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
5220598 |
aaacggggtgttaca |
5220584 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4709692 - 4709505
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttcc-gctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | || |
|
|
| T |
4709692 |
ttgatgaggcctgcgtgccaaaacactttatg-attatgatatgattttctgctgcaatgtttaagataattggttaaattattatttaacagttct-gg |
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T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4709594 |
actatgttttatgcgatacctcgttgattatgatgcttactctgataaatggcttaagaaattttgatattgggaaaacagggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 62 - 245
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gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
16752804 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattacgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttgactg---ttggcttac |
16752899 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtatttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
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Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16710136 - 16709943
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
16710136 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattacgaactaaattccgctgcaatgattaagatgttttgttaaatcattatttaaccg--tttgg |
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T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16710038 |
attatgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
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Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 16759329 - 16759515
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
16759329 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattacgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttgactg---ttggcttac |
16759424 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16759425 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtatttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
16759515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
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| Q |
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ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
31098240 |
ttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttcgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttattatgttgaattgttatttaactgattt-gt |
31098338 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31098339 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttatttatgttgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
31098427 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 1599165 - 1599352
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagat-atttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
1599165 |
ttgatggggcctacgtgccaaaa-gatttatggattatgaaataattttccgctgcaacgtttaagtttatttggttaaattgttatttaattgttattg |
1599263 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1599264 |
gattatgttaaatgtgatatcccgtttgttaagttgtttactttgat-aatg-tttaagaaattttcatattgggaaaactgggtgttaca |
1599352 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 9186868 - 9187062
Alignment:
| Q |
55 |
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147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
9186868 |
tttgatggggcctgcgtgacaaaacgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagttaattcgttgaaagttaaattcttatttaactg |
9186967 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9186968 |
attttggattatgttttgtatgtgatatcccgttt---atgctgaatactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
9187062 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 15850517 - 15850730
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttgg------- |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
15850517 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctgcgtgccaaaacgatttatggatttcgaaataattttccgctgcaacgtttaagatattttgctgaaag |
15850615 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactg-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15850616 |
ttaaattgttatttaactgatttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaatttttatattg |
15850710 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15850711 |
ggaaaacggggtgttacaaa |
15850730 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 12842409 - 12842616
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
12842409 |
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12842504 |
T |
|
| Q |
135 |
tattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
12842505 |
tattatttaactg---ttggattacgatatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgg |
12842599 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12842600 |
gaaaacggggtgttaca |
12842616 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 14125230 - 14125440
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
14125230 |
taactgttttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaacgatttattgatttcgaattaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgaagtta |
14125328 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgtt--atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14125329 |
aattgttatttaactgattttggattatgtttcgaatgtgatatctcgttatt--tgatgtttactctgataattgtttt--gaaatttttatattggga |
14125424 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
14125425 |
aaacggggtgttacaa |
14125440 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17241393 - 17241202
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | || |
|
|
| T |
17241393 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttcgaaataattttccactacattgtttaa-atatttggttaaattgttatttaactgatatta |
17241295 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttt--tatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17241294 |
atttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactttgataaatg-tttaagaaatttttatatattgggaaaacggggtgttaca |
17241202 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6596616 - 6596429
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa--tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| |
|
|
| T |
6596616 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgtttatgacttttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggctta |
6596521 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6596520 |
cgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtatttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4290457 - 4290363
Alignment:
| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4290457 |
ttttggtttatgttttatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa-ttttatattgggaaaacggggtgttaca |
4290363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 10847038 - 10847224
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||| |
|
|
| T |
10847038 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatgtttatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggaattac |
10847134 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10847135 |
gttatatgtgatatcccgttgtt--tggtgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
10847224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10903573 - 10903432
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| Q |
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ggcctgcgtgccaaaac-gttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || || || ||||||||| |
|
|
| T |
10903573 |
ggcctgcgtgccaaaaccgatttatggattacgaactaaattccgctgcaatgttaaggatattatgttaaatcattatttaaccgtctt-ggattatgt |
10903475 |
T |
|
| Q |
162 |
tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10903474 |
tatatgtgatatcccgttgtttatgatgc-tactctgataaatg |
10903432 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10910245 - 10910104
Alignment:
| Q |
63 |
ggcctgcgtgccaaaac-gttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || || || ||||||||| |
|
|
| T |
10910245 |
ggcctgcgtgccaaaaccgatttatggattacgaactaaattccgctgcaatgttaaggatattatgttaaatcattatttaaccgtctt-ggattatgt |
10910147 |
T |
|
| Q |
162 |
tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10910146 |
tatatgtgatatcccgttgtttatgatgc-tactctgataaatg |
10910104 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
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Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7574414 - 7574224
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| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgtttta-tggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
7574414 |
ttgatggggcctacgtgccaaaacgatttaatggatttcgaaataatattccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgatatttaactg-atttg |
7574316 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatg-ttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7574315 |
gattatgtttaaatgtgatatcccgtttatttatgttgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatgttggaaaaatagggtgttacaa |
7574224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 57 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10009637 - 10009441
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| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaac-gttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || || || ||| |
|
|
| T |
10009637 |
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T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg---------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10009538 |
ttatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgc-tactctgataaatgctatgtttttttaaagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 10237114 - 10237322
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37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
10237114 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattacgaactaatttccgctgcaacatttgaaatatttgttaaagtta |
10237212 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgt--tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10237213 |
aattgttatttaactaattttgtattatgtcttgtatgtgatatcccgttt---atgctgaatactctgataaatgttt--agaaatttttatattggga |
10237307 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10002990 - 10002843
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57 |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || || || ||| |
|
|
| T |
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|
| Q |
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ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg |
205 |
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| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10002891 |
ttatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgc-tactctgataaatg |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 15592129 - 15592338
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatt-tccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
15592129 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaaccgatttatgatttctgaactaatactccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
15592226 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15592227 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
15592322 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
15592323 |
aaaacggggtgttaca |
15592338 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 417362 - 417176
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
417362 |
gggcctgcgtgccaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
417263 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
417262 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
417176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Original strand, 23413941 - 23414071
Alignment:
| Q |
114 |
gtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaag |
212 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23413941 |
gtttaagttatttggttaaattgttatttaactgattt-ggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgtggtttactctgataaatg-tttaaa |
23414038 |
T |
|
| Q |
213 |
aaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23414039 |
aaaaatttatattgggaaaacggggtgttacaa |
23414071 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37614741 - 37614599
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
37614741 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggatta |
37614646 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37614645 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
37614599 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Original strand, 21028353 - 21028447
Alignment:
| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21028353 |
ttttggtttatgttttacgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa-ttttatattgggaaaacggggtgttaca |
21028447 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Original strand, 26789514 - 26789702
Alignment:
| Q |
60 |
tggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---ttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26789514 |
tggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagttaaattattatttaactgttttt |
26789612 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26789613 |
ggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
26789702 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 245
Target Start/End: Original strand, 30778040 - 30778134
Alignment:
| Q |
150 |
tttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30778040 |
tttggtttatgttttatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa-ttttatattggaaaaacggggtgttacaa |
30778134 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11848646 - 11848502
Alignment:
| Q |
103 |
tccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttact |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11848646 |
tccgctgcaatgtttaagatattttgttgaaagttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg---tttatgatgtttact |
11848550 |
T |
|
| Q |
196 |
ctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11848549 |
ctgataattg--ttaagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
11848502 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 15585471 - 15585681
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatt-tccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
15585471 |
taactcttttgagat-actttgttggggcttgcgtgccaaaccgatttatgatttctgaactaatactccgctgctatgtt-aagatattatatggaagt |
15585568 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15585569 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
15585664 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15585665 |
aaaacggggtgttacaa |
15585681 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20716527 - 20716445
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatat |
98 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20716527 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattatattgatggggcttgcgtgccaaaacgttttatggattataatat |
20716445 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20718574 - 20718492
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatat |
98 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20718574 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattatattgatggggcttgcgtgccaaaacgttttatggattataatat |
20718492 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20722452 - 20722370
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatat |
98 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20722452 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattatattgatggggcttgcgtgccaaaacgttttatggattataatat |
20722370 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Original strand, 26795129 - 26795316
Alignment:
| Q |
60 |
tggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---ttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26795129 |
tggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagttaaattattatttaactgttttt |
26795227 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26795228 |
ggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
26795316 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 2028357 - 2028499
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
2028357 |
gggcctgcgtgccaaaacgttacatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggatta |
2028452 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2028453 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
2028499 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 5107640 - 5107782
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
5107640 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattctccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggatta |
5107735 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5107736 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
5107782 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 11595860 - 11596053
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
11595860 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttactgattttcgaattaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgaagttaaattgttatttaactga |
11595959 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11595960 |
ttttggattatgtttcgaatgtgatatcccgttattc--gatgtttactctgataattgttt--agaaatttttatattggaaaaacggggtgttaca |
11596053 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12817155 - 12817013
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| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
12817155 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
12817060 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12817059 |
cgttatatgtgatatcccattgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
12817013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 16490400 - 16490612
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
16490400 |
taacgcttttgagat-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
16490497 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
16490498 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttttatgtgatatcccgtttatggttttt-ttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
16490595 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16490596 |
aaaacggggtgttacaa |
16490612 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 3403668 - 3403861
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-------gttaaattattatttgact |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
3403668 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattttcgaaattaactccgctgcaatgtttaagatattttcttgaaagttaaattgttatttaact |
3403767 |
T |
|
| Q |
147 |
gtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3403768 |
gttttgcgattatgtttgaatgtgatgtcccgttt---atgatgtttactctgataattgtttt--gaaatttttatcttgggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11910347 - 11910230
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
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| T |
11910347 |
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11910252 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaaaa |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11910251 |
gggaaaacggggtgttacaaaa |
11910230 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
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Target Start/End: Complemental strand, 13623415 - 13623302
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226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13623415 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
13623320 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13623319 |
ggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
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Target Start/End: Original strand, 15992817 - 15993032
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31 |
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127 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||||||| |
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| T |
15992817 |
ttgaattaactcgtttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattacgaactaatttccgctgcaacgtttgaaatatttgtta |
15992915 |
T |
|
| Q |
128 |
--gttaaattattatttgactgtttttggattatg--ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttata |
223 |
Q |
| |
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| T |
15992916 |
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15993011 |
T |
|
| Q |
224 |
ttaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15993012 |
ttgggaaaatcgggtgttaca |
15993032 |
T |
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Target: chr3; HSP #85
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Target Start/End: Original strand, 20058198 - 20058343
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| Q |
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195 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
20058198 |
ttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggcttttact |
20058294 |
T |
|
| Q |
196 |
ctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20058295 |
ctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
20058343 |
T |
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Target: chr3; HSP #86
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Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Original strand, 20064836 - 20064981
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| Q |
102 |
ttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttact |
195 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
20064836 |
ttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggcttttact |
20064932 |
T |
|
| Q |
196 |
ctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20064933 |
ctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
20064981 |
T |
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Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Original strand, 31423310 - 31423451
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| Q |
62 |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
31423310 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
31423405 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgt |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31423406 |
cgttatatgtgatatcctgttgtt--tgatgtttactctgataaatgt |
31423451 |
T |
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Target: chr3; HSP #88
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Target Start/End: Original strand, 1983535 - 1983728
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| Q |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
1983535 |
tttgatggggcctacttgccaaaacgattttatggatttcgaattaatttccgctgtaatgtttgagatatttgtttaaagttaaattgttatttaactg |
1983634 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
1983635 |
tttttagattatgtttgaatgtgatatcccgttc---atggtgtttactctgataattgtt--aagaaatatttatattgggaaatcggggtgttacaa |
1983728 |
T |
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Target: chr3; HSP #89
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Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3689977 - 3689784
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| Q |
55 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3689977 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatgatttttgaatttaatattccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgt |
3689878 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3689877 |
ttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
3689784 |
T |
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Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12066491 - 12066351
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| Q |
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159 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12066491 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattac |
12066397 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12066396 |
gttatatgtgatatcccgttgct--tgttgcttactctgataaatgtt |
12066351 |
T |
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Target: chr3; HSP #91
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Target Start/End: Original strand, 23420041 - 23420166
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
23420041 |
tttgatggggcctacgtgccaaagtgatttatggatttcgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactg-atttg |
23420139 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23420140 |
gattatgttaaatgtgatatcccgttt |
23420166 |
T |
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Target: chr3; HSP #92
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| Q |
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gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatattt------ggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
26196305 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttattg |
26196404 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26196405 |
gattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggttcttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
26196492 |
T |
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Target: chr3; HSP #93
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Target Start/End: Original strand, 1333904 - 1334019
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1333904 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
1333999 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1334000 |
gggaaaacggggtgttacaa |
1334019 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12882735 - 12882621
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12882735 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atgttt-ttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatatt |
12882641 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12882640 |
gggaaaacggggtgttacaa |
12882621 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 207
Target Start/End: Original strand, 16809565 - 16809720
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| Q |
55 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16809565 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgatttatggtttatgaaataatttccgctgcaacgtttaagttaatttgttaaagttaaattgttatttaactg- |
16809663 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16809664 |
atttgaattatgtttaaatgtgatatcccg---tttatgctgtttactctgataaatgtt |
16809720 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
23705500 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcttgccaaactgatttatgatttctgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
23705597 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
23705598 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgga |
23705693 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
23705694 |
aaaacggggtgttaca |
23705709 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #97
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Query Start/End: Original strand, 37 - 244
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
23723956 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcttgccaaactgatttatgatttctgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
23724053 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
23724054 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgga |
23724149 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
23724150 |
aaaacggggtgttaca |
23724165 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 23742412 - 23742621
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
23742412 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcttgccaaactgatttatgatttctgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
23742509 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
23742510 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgga |
23742605 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
23742606 |
aaaacggggtgttaca |
23742621 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42325337 - 42325143
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55 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
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|
| T |
42325337 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttactgattttcgaattaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgaagttaaattgttatttaactga |
42325238 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtt--atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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| T |
42325237 |
ttttggattatgtttcaaatgtgatatcccgttatt--cgatgtttactctgataattgttt--aaaaaattttatattgggaaaatggggtgttacaa |
42325143 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6598078 - 6597895
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||| |
|
|
| T |
6598078 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgtttatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattatt---taactgtt---ggcttac |
6597986 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataa-----atgt-tttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6597985 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaaggctatgtatttaatgaaattttgatatt-ggaaaacggggtgttacaa |
6597895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 14673946 - 14674135
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatattt------ggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14673946 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
14674044 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14674045 |
ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
14674135 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12756217 - 12756104
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12756217 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
12756122 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12756121 |
gaaaaacggggtgttaca |
12756104 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 15727873 - 15727986
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15727873 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgctt-aagaaatttgtatattg |
15727968 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15727969 |
ggaaaacggggtgttaca |
15727986 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 41093215 - 41093328
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41093215 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---aaggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
41093310 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41093311 |
ggaaaacggggtgttaca |
41093328 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11180759 - 11180697
Alignment:
| Q |
174 |
cccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggg |
236 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
11180759 |
cccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaatacggg |
11180697 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 19291563 - 19291664
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctga |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19291563 |
tttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctga |
19291656 |
T |
|
| Q |
200 |
taaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
19291657 |
taaatgtt |
19291664 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48429403 - 48429288
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48429403 |
ggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
48429308 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48429307 |
gggaaaacggggtgttacaa |
48429288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 53381195 - 53381310
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | | |||||||||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
53381195 |
ggttaaattatgatttaactgtttttggattatgtttctatgtgatatcccg---tttacggtttttactctgataattg-tttaagaaatttgtatatt |
53381290 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53381291 |
gggaaaacggggtgttacaa |
53381310 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6604758 - 6604575
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||| |
|
|
| T |
6604758 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgtttatgacttttcgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattatt---taactgtt---ggcttac |
6604666 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataa-----atgt-tttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6604665 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaaggctatgtatttaatgaaattttgatatt-ggaaaacggggtgttacaa |
6604575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 16865130 - 16865242
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16865130 |
gttaatttgttatttaactaattttggattatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattg |
16865224 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16865225 |
ggaaaacggggtgttaca |
16865242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48422625 - 48422511
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48422625 |
ggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
48422530 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48422529 |
gggaaaacggggtgttaca |
48422511 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 53387847 - 53387961
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | | |||||||||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
53387847 |
ggttaaattatgatttaactgtttttggattatgtttctatgtgatatcccg---tttacggtttttactctgataattg-tttaagaaatttgtatatt |
53387942 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53387943 |
gggaaaacggggtgttaca |
53387961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15067024 - 15066911
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
15067024 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttttgtggtgtttactctgatttatg--ttaagaaatttttatgttgg |
15066929 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15066928 |
gaaaacggggtgttacaa |
15066911 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20716448 - 20716376
Alignment:
| Q |
170 |
atatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20716448 |
atatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
20716376 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20718495 - 20718423
Alignment:
| Q |
170 |
atatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20718495 |
atatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
20718423 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9181342 - 9181228
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtttt-aagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9181342 |
gttaaattattatttaactgttt--ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgtttttaagaaatttgtatatt |
9181248 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9181247 |
gggaaaacggggtgttacaa |
9181228 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Original strand, 14129475 - 14129661
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |
|
|
| T |
14129475 |
taactgttttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatagatttcgaattaatttccgctgcaaagtttgagaaatttgttgaagttc |
14129573 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgtt--atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaattttta |
221 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14129574 |
aattgttatttaactgattttggattatgtttcgaatgtgatatcccgttatt--tgatgtttactctgataattgtttt--gaaattttta |
14129661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #118
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Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 15712135 - 15712345
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
15712135 |
taactcttttgagat-accttgttggggcctgcgtgccaaactgatttatgatttctgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
15712232 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15712233 |
taaattattatttaactatttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgctt-aagaaatttgtatattggg |
15712328 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15712329 |
aaaacagggtgttacaa |
15712345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16696203 - 16696009
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataa-tttccgctgcaatgtttaaga-tatttg-----gttaaattattatttgact |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
16696203 |
tttgatggggcctgcatgccaaactgatttatggatttttgaaataactttccgctgcaacgtttaagtctttttgctaaagttaaatcgttatttaact |
16696104 |
T |
|
| Q |
147 |
gtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16696103 |
gattttgaattatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
16696009 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 250
Target Start/End: Original strand, 18384721 - 18384838
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
18384721 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaaggtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
18384815 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaaaaaca |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18384816 |
gaaaacggggtgttacataaaca |
18384838 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23957608 - 23957422
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23957608 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgactttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
23957510 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23957509 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattggaaaaacggggtgttacaa |
23957422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 321901 - 321789
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
321901 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaaggtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
321807 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
321806 |
gaaaacggggtgttacaa |
321789 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16639760 - 16639615
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
16639760 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
16639665 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16639664 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
16639615 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Original strand, 26197261 - 26197337
Alignment:
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26197261 |
atgtgatatcccgttattt--gatgattactctgataaatgttt-aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
26197337 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26888735 - 26888621
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
26888735 |
ggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
26888640 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26888639 |
gggaaaacggggtgttaca |
26888621 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43166662 - 43166517
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
43166662 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
43166567 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43166566 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
43166517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15482082 - 15481893
Alignment:
| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15482082 |
tgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggatttcgaaacaattttccgctgcaatgtttaagttattttgttgaaagttaaattgttatttaactga |
15481983 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || | ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15481982 |
ttttggaatatatttgaatgtgatatctcgttt---atgctgtttactctgatatatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgtta |
15481893 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16633150 - 16633006
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
16633150 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
16633055 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16633054 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
16633006 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 41202530 - 41202742
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
41202530 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaactgatttatgatttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
41202627 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatg----ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41202628 |
taaattattatttaactgttttttttttattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgcatatt |
41202723 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41202724 |
gggaaaacggggtgttaca |
41202742 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43160425 - 43160281
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
43160425 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
43160330 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43160329 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
43160281 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13250071 - 13249885
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13250071 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactatttttgg |
13249973 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13249972 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgctt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
13249885 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
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Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13256717 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactatttttgg |
13256619 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13256618 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgctt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #133
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Target Start/End: Original strand, 14879301 - 14879413
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| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
14879301 |
gttaaattattatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttg |
14879394 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14879395 |
ggaaaacggggtgttacaa |
14879413 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #134
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| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
7805357 |
aaattgttatttaactgttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttattt--gatgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattggaa |
7805452 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |
|
|
| T |
7805453 |
aaacagggtgttaca |
7805467 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #135
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| Q |
62 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
19180345 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactatttttgg |
19180247 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19180246 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactttgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
19180160 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #136
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9185343 |
atgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
9185268 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #137
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
11558107 |
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11558206 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11558207 |
ttttgtgattatgtttgaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgataattgttt--agaaatttttatgttgggaaaacgggatgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #138
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Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 11567376 - 11567569
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| Q |
55 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
11567376 |
tttgatggggcctacgtggcaaaacgatttatggatttttgaattaactccgctgcaatgtttgagatattttcttgaaagttaaattgttatttaattg |
11567475 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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|
| T |
11567476 |
ttttgtgattatgtttgaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgataattgttt--agaaatttttatgttgggaaaacgggatgttacaa |
11567569 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #139
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Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18382848 - 18382737
Alignment:
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
18382848 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaaggtgatatcccgattgt---gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
18382754 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18382753 |
gaaaacggggtgttaca |
18382737 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #140
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| Q |
62 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
50964198 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
50964100 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50964099 |
ggattacgtttctatgtgatatcccattt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
50964011 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #141
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Target Start/End: Original strand, 12038565 - 12038643
Alignment:
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12038565 |
atgtgatatcccgttattt--gatgattactctgatgaatgttt-aagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttacaaa |
12038643 |
T |
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Target: chr3; HSP #142
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||| |||||| |||||| | || | |
|
|
| T |
15051164 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttttgtggtgtttactctgatttatg--ttaagatatttttctgttgg |
15051069 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15051068 |
gaaaacggggtgttaca |
15051052 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #143
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16909215 |
gttaaatcgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcctgttttga--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
16909120 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16909119 |
gaaaacggggtgttaca |
16909103 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51694778 - 51694725
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51694778 |
ttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattggaaaaacggggtgttacaa |
51694725 |
T |
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Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
6607750 |
ggttaaattatcatttaactatttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtt-ttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
6607656 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6607655 |
gggaaaacggggtgttaca |
6607637 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtt---tttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttata |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
22644134 |
gttaaattattatttaactgttgtttttggattacgtttccatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtata |
22644229 |
T |
|
| Q |
224 |
ttaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22644230 |
ttggaaaaacggggtgttaca |
22644250 |
T |
|
Back To:
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Target: chr3; HSP #147
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Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16368733 - 16368620
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
16368733 |
gttaaattgttatttaactgtttttacattatgtgaaatgtgatatcc--tgttttgtgatgtttactctgatttatg--ttaagaaaattttatgttgg |
16368638 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16368637 |
gaaaacgtggtgttacaa |
16368620 |
T |
|
Back To:
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Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
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| Q |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1920249 |
ttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
1920300 |
T |
|
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Query Start/End: Original strand, 127 - 245
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11479587 |
ggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
11479681 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11479682 |
gaaaaaacggggtgttacaa |
11479701 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #150
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Target Start/End: Original strand, 14872759 - 14872871
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
14872759 |
gttaaattattatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttg |
14872852 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14872853 |
ggaaaaaagggtgttacaa |
14872871 |
T |
|
Back To:
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Target: chr3; HSP #151
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| Q |
208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19726784 |
ttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
19726821 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #152
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| Q |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38813676 |
ttactctgataattgttt-aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
38813624 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #153
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Query Start/End: Original strand, 212 - 244
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
328009 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
328041 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #154
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| Q |
208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11302917 |
ttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
11302953 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #155
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12172067 |
atgtgatatcccgttt---atgatgtttactctaataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgtta |
12171995 |
T |
|
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Target: chr3; HSP #156
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| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
15878840 |
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T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15878934 |
gaaaacggggtgttaca |
15878950 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #157
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| Q |
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tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21606882 |
tctgataaatgttt-atgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaa |
21606832 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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131 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
29696409 |
taactcatttgagattt-tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattacgaattatattccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagtta |
29696507 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatg--ttatatgtgatatcccgttt |
180 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29696508 |
aattgttatttaactaattttggactatgttttgtatgtgatatcccgttt |
29696558 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50242058 |
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50242019 |
T |
|
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| Q |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15458661 |
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15458714 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15463187 |
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15463149 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| | | |||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
16701019 |
gttaaattgttatttaactgtgtttagattatgtgaaatgtgatatcc--tgttttgtgatgtttactctgat--ttttgttaagaaacttttatgttgg |
16701114 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16701115 |
gaaaacagggtgttaca |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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192 |
tactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36526845 |
tactctgataattgttt--agaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
36526794 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3832965 - 3832913
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3832965 |
ttactctgataattgttt-aagaaaattttatgttgggaaaacggggtgttaca |
3832913 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 4290575 - 4290535
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaa |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4290575 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaaa |
4290535 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #166
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Query Start/End: Original strand, 207 - 244
Target Start/End: Original strand, 10835771 - 10835808
Alignment:
| Q |
207 |
tttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10835771 |
tttaagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
10835808 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 21028235 - 21028275
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaa |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21028235 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaaa |
21028275 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 244
Target Start/End: Original strand, 23420183 - 23420216
Alignment:
| Q |
211 |
agaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23420183 |
agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
23420216 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 30777921 - 30777961
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaa |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30777921 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaaa |
30777961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31414552 - 31414515
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31414552 |
gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaaaac |
31414515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 3266024 - 3266081
Alignment:
| Q |
185 |
tgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3266024 |
tgatgattactctgataattcttt--agaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
3266081 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14571866 - 14571811
Alignment:
| Q |
186 |
gatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14571866 |
gatgtttactctgatatatgttt---gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
14571811 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 245
Target Start/End: Original strand, 14577691 - 14577742
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14577691 |
ttactctgatatatgttt---gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
14577742 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17045944 - 17045908
Alignment:
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17045944 |
ttttatgaaatttttatattgggaaaacggggtgtta |
17045908 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17048104 - 17048068
Alignment:
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17048104 |
ttttatgaaatttttatattgggaaaacggggtgtta |
17048068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Original strand, 30176374 - 30176406
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30176374 |
gaaatttttatgttaggaaaacggggtgttaca |
30176406 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Original strand, 31225896 - 31225928
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31225896 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
31225928 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Original strand, 26935925 - 26936140
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26935925 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actacgatataatttccgctacaatgtttaagatatttggtt |
26936023 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
26936024 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
26936122 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttacaaaaa |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26936123 |
aacggggtgttacaaaaa |
26936140 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3215622 - 3215411
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3215622 |
ttgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgattaagatatttggtt |
3215524 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
3215523 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaagttgtatattgggaa |
3215425 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
3215424 |
aacggggtgttaca |
3215411 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20526891 - 20526666
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20526891 |
atgctatt-gtgatattgaactaactcttttgagaatgttttgatgtggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataatttccgctgcaacgt |
20526794 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20526793 |
ttaagttatttggttaaattattatttaactgtttt-ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
20526695 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20526694 |
tttttatattgggaaaacggggtgttaca |
20526666 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 20706301 - 20706526
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20706301 |
atgctattcgttatattgaactaactcttttgagattatttttatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattaggatataatttccgctgcaatgt |
20706400 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
20706401 |
ttaagatatttggttaaattattatttaactg---ttagattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaaaaaa |
20706497 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20706498 |
tttgtatattgggaaaacagggtgttaca |
20706526 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27135495 - 27135284
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27135495 |
ttgaactaactcttttgaaaatattttgacggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataatttccgctgcaatgtttaagatattgggtt |
27135397 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
27135396 |
aaattattatttaactatttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattggaaa |
27135298 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
27135297 |
aacggggtgttaca |
27135284 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 23846510 - 23846696
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
23846510 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgaaataatttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt-gg |
23846606 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23846607 |
attatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
23846696 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19904895 - 19904704
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
19904895 |
tactttgaaggggcctgcgtgccaaagcgttttacggattatgaaataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactg-ttt |
19904797 |
T |
|
| Q |
152 |
tggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19904796 |
tggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttatgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
19904704 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 20024668 - 20024857
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20024668 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt- |
20024765 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20024766 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
20024857 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18064666 - 18064482
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
18064666 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttgaatcattatttaactgtttt-ggatt |
18064569 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18064568 |
atgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
18064482 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 246
Target Start/End: Original strand, 30325677 - 30325870
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
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T |
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246 |
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30325870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 17829265 - 17829458
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttt |
150 |
Q |
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17829364 |
T |
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| Q |
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245 |
Q |
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| T |
17829365 |
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17829458 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Original strand, 24446186 - 24446379
Alignment:
| Q |
52 |
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150 |
Q |
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24446285 |
T |
|
| Q |
151 |
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244 |
Q |
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| T |
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24446379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 30309436 - 30309628
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
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| T |
30309436 |
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30309534 |
T |
|
| Q |
152 |
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245 |
Q |
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| T |
30309535 |
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30309628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 22113710 - 22113899
Alignment:
| Q |
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154 |
Q |
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| T |
22113710 |
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22113808 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
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| T |
22113809 |
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22113899 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 22166362 - 22166550
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
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| T |
22166362 |
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22166460 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
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| T |
22166461 |
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22166550 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 17056068 - 17056256
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
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| T |
17056068 |
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17056166 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
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| T |
17056167 |
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17056256 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20880096 - 20879920
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
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| T |
20880096 |
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20880010 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
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| T |
20880009 |
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20879920 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 22135213 - 22135401
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
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| T |
22135213 |
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22135311 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
22135312 |
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22135401 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23833667 - 23833475
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
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| T |
23833667 |
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23833568 |
T |
|
| Q |
149 |
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245 |
Q |
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| T |
23833567 |
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23833475 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 17508147 - 17508334
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
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| T |
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17508242 |
T |
|
| Q |
160 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17508243 |
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17508334 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 17670328 - 17670515
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| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
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|
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| T |
17670328 |
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17670423 |
T |
|
| Q |
160 |
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245 |
Q |
| |
|
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| T |
17670424 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttacaa |
17670515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12473464 - 12473276
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
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| T |
12473464 |
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12473366 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
12473365 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataattg-tttaagaaatttttatattgggaaaacggagtgttaca |
12473276 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 17676980 - 17677166
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
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| T |
17676980 |
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17677075 |
T |
|
| Q |
160 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17677076 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
17677166 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32604626 - 32604438
Alignment:
| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
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| T |
32604626 |
atggggcctacgtgccaaaaacgatttatggtttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttagttaaattgttatttaactattattggat |
32604527 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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| T |
32604526 |
tatgttaaatgtgatatctcgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
32604438 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 5535194 - 5535380
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| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5535194 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggattac |
5535289 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
5535290 |
gttgtatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
5535380 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15537871 - 15537676
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| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgac |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| || |
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| T |
15537871 |
tactttgatggggcctacgtgccaaaa-gatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaac |
15537773 |
T |
|
| Q |
146 |
tgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
15537772 |
tgattttggactaagtttgtatgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
15537677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 12277712 - 12277919
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaat |
134 |
Q |
| |
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| T |
12277712 |
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227 |
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12277902 |
T |
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244 |
Q |
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|
|
| T |
12277903 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 15440008 - 15439814
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Q |
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T |
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| Q |
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244 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15531312 - 15531118
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| Q |
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Q |
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15531214 |
T |
|
| Q |
146 |
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244 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22581670 - 22581475
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| Q |
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145 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
146 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22044299 - 22044111
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152 |
Q |
| |
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| T |
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22044200 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
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22044111 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 16232160 - 16232352
Alignment:
| Q |
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148 |
Q |
| |
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| T |
16232160 |
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16232259 |
T |
|
| Q |
149 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
16232260 |
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T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 23847700 - 23847892
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148 |
Q |
| |
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| T |
23847700 |
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23847799 |
T |
|
| Q |
149 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29122458 - 29122249
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129 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29122458 |
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29122361 |
T |
|
| Q |
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228 |
Q |
| |
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| T |
29122360 |
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T |
|
| Q |
229 |
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244 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 29532120 - 29532262
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158 |
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| |
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29532120 |
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T |
|
| Q |
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207 |
Q |
| |
|
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|
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cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
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T |
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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
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Target Start/End: Original strand, 16884003 - 16884116
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226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
227 |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16884099 |
ggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 22125268 - 22125478
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Q |
| |
|
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22125365 |
T |
|
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
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|
| T |
22125366 |
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22125461 |
T |
|
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229 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22125462 |
aaaacggggtgttacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24657147 - 24656962
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| Q |
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159 |
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| |
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| T |
24657147 |
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T |
|
| Q |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 29438657 - 29438770
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226 |
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| |
|
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29438657 |
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29438752 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
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| |
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|
|
| T |
29438753 |
ggaaaacggggtgttaca |
29438770 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
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129 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22116458 |
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22116555 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
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| T |
22116556 |
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T |
|
| Q |
229 |
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245 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22116652 |
aaaacggggtgttacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
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| |
|
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|
|
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|
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
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gggaaaacggggtgttacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 127 - 245
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
22579011 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
22578916 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22578915 |
gggaaaacggggtgttacaa |
22578896 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 55 - 244
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28454107 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatgatttttgaatttaatattccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgt |
28454008 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28454007 |
ttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
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Target Start/End: Original strand, 22986881 - 22987022
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Q |
| |
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|
| T |
22986881 |
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22986975 |
T |
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207 |
Q |
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| T |
22986976 |
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22987022 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 21671551 - 21671762
Alignment:
| Q |
37 |
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129 |
Q |
| |
|
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| T |
21671551 |
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21671649 |
T |
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227 |
Q |
| |
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| T |
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21671744 |
T |
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228 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21671745 |
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21671762 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 21916363 - 21916464
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| Q |
101 |
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199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21916363 |
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21916456 |
T |
|
| Q |
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207 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21916457 |
taaatgtt |
21916464 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
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Target Start/End: Original strand, 23082160 - 23082372
Alignment:
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31 |
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127 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||||| |
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| T |
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23082258 |
T |
|
| Q |
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223 |
Q |
| |
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| T |
23082259 |
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23082353 |
T |
|
| Q |
224 |
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242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23082354 |
ttgggaaaacggggtgtta |
23082372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 30644116 - 30644228
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| Q |
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227 |
Q |
| |
|
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|
| T |
30644116 |
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30644211 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30644212 |
gaaaacggggtgttaca |
30644228 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 24264738 - 24264924
Alignment:
| Q |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24264738 |
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24264836 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24264837 |
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24264924 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 20020718 - 20020832
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20020718 |
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20020813 |
T |
|
| Q |
226 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20020814 |
gggaaaacggggtgttaca |
20020832 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 376640 - 376530
Alignment:
| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
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|
| T |
376640 |
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376547 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
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|
|
| T |
376546 |
gaaaacggggtgttaca |
376530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18860979 - 18860866
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| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18860979 |
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18860884 |
T |
|
| Q |
228 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18860883 |
gaaaacggggtgttacaa |
18860866 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19116897 - 19116688
Alignment:
| Q |
38 |
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128 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19116897 |
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19116801 |
T |
|
| Q |
129 |
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227 |
Q |
| |
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| T |
19116800 |
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19116706 |
T |
|
| Q |
228 |
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245 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19116705 |
gaaaacggggtgttacaa |
19116688 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19497716 - 19497601
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
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|
| T |
19497716 |
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19497621 |
T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19497620 |
gggaaaacggggtgttacaa |
19497601 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22083142 - 22082997
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| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatattt------ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgctta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
22083142 |
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22083047 |
T |
|
| Q |
194 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22083046 |
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22082997 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19110606 - 19110398
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38 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || || |
|
|
| T |
19110606 |
aactcttttgagat-actt--attgggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaagg |
19110510 |
T |
|
| Q |
129 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |
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|
| T |
19110509 |
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19110415 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19110414 |
gaaaacggggtgttaca |
19110398 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
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|
| T |
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T |
|
| Q |
226 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19495572 |
gggaaaacggggtgttaca |
19495554 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22047224 - 22047110
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
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|
| T |
22047224 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
22047129 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22047128 |
gggaaaacggggtgttaca |
22047110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 149
Target Start/End: Original strand, 22124139 - 22124234
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
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22124139 |
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22124234 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
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225 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
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|
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T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41436426 |
gggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
11605201 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtga-atgtgatatcccgttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
11605107 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11605106 |
gaaaacgggatgttacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
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226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18854237 |
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18854142 |
T |
|
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ggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
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||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18854141 |
ggagaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
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| Q |
55 |
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147 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
20857162 |
tttgatggggactacgtgccaaaacgatttatggattttcgaattaactccgctgcaatgtttaagatattatcttgaaagttaaattgttatttaactg |
20857261 |
T |
|
| Q |
148 |
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246 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20857262 |
ttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccattt---atgatgtttactctgatagttgttt--agaaatttttatattggaaaaacgaggtgttacaaa |
20857356 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
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Target Start/End: Complemental strand, 22028646 - 22028535
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| ||| || | |
|
|
| T |
22028646 |
gttaaattgttatttaactgattttggattatgttgaatgtgatatccc---atttatgctgtttactgtgataaatgttt--agaaatttatattttgg |
22028552 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22028551 |
gaaaacggggtgttaca |
22028535 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
20466826 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttttgtgatgtttactctgatttatg--ttaagaaatttttatgttgg |
20466921 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20466922 |
aaaatcggggtgttaca |
20466938 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
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Target Start/End: Original strand, 39095645 - 39095838
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55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggat-tatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-------gttaaattattatttgact |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
39095645 |
tttgatggagcctacgtgccaaaacgatttatggatatttgaattaact-ccgctgcaatgtttgagatattttattgaaagttaaattgttatttaact |
39095743 |
T |
|
| Q |
147 |
gtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39095744 |
gttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttaatt--gatgattactctgataattgtttt--gaaatttttatattgggaaaacgggatgttaca |
39095838 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
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Target Start/End: Complemental strand, 19898339 - 19898264
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19898339 |
atgtgatatcccgtttt--atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttcggaaaacggggtgttaca |
19898264 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 32598092 - 32597981
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| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || ||| |
|
|
| T |
32598092 |
atggggcctacgtgccaaaaacgatttatggtttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttagttaaattgttatttaactattattagat |
32597993 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgt |
168 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |
|
|
| T |
32597992 |
tatgttaaatgt |
32597981 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19982335 - 19982259
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19982335 |
atgtgatatcccgtttt--atgatgtttactttgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
19982259 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
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Target Start/End: Complemental strand, 21285244 - 21285193
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21285244 |
ttactctgataaatgtttt--gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
21285193 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
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Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Original strand, 27286343 - 27286417
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27286343 |
atgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
27286417 |
T |
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Target: chr8; HSP #72
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Target Start/End: Original strand, 8355591 - 8355706
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
8355591 |
ggttaaattattatttaattatttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgtttaagaaaatttgtatatt |
8355687 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8355688 |
gggaaaacggggtgttaca |
8355706 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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Target Start/End: Original strand, 19260323 - 19260434
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| Q |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
19260323 |
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19260417 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19260418 |
gaaaacgaggtgttaca |
19260434 |
T |
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Target: chr8; HSP #74
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| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||| | ||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16182766 |
gttaaattgttatttaactattttag-attatgtgaaatgtgatatcccgttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
16182672 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16182671 |
gaaaacgaggtgttaca |
16182655 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24755041 - 24754930
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||| | ||||||| | ||||||||| |||| || | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
24755041 |
gttaaattgttatttaactattttag-attatgtgaaatgtgatattccgtcttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatattgg |
24754947 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24754946 |
gaaaacggggtgttaca |
24754930 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 245
Target Start/End: Original strand, 22011544 - 22011577
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22011544 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
22011577 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 208 - 244
Target Start/End: Original strand, 16411141 - 16411177
Alignment:
| Q |
208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16411141 |
ttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
16411177 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Original strand, 17354282 - 17354393
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
17354282 |
gttaaattgttatttaactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttgg |
17354375 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17354376 |
gaaaacgaggtgttacaa |
17354393 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31970576 - 31970500
Alignment:
| Q |
166 |
tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31970576 |
tgtgatatcccgttat--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttacaa |
31970500 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23405699 - 23405646
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23405699 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttacaa |
23405646 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 19802662 - 19802714
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19802662 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
19802714 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 245
Target Start/End: Original strand, 22124252 - 22124296
Alignment:
| Q |
203 |
atgttttaagaaattttta--tattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22124252 |
atgttttaagaaatttttaaatattgggaaaacggggtgttacaa |
22124296 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 26953616 - 26953668
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
26953616 |
ttactctgataattgttt-aagaaatttttatattggaaaaacggagtgttaca |
26953668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28092236 - 28092184
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28092236 |
ttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
28092184 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 17152708 - 17152748
Alignment:
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17152708 |
ttttatgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaa |
17152748 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 44386619 - 44386663
Alignment:
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaaca |
250 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44386619 |
ttttatgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacagaaaca |
44386663 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8304577 - 8304351
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8304577 |
atgctatttgtgatattgaactaaatcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataatttccgctgcaatat |
8304479 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8304478 |
ttaagatatttggttaaattattatttaactgtttt-ggtttatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaa |
8304380 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8304379 |
tttgtatattgggaaaacagggtgttaca |
8304351 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23762615 - 23762427
Alignment:
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
23762615 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgtttt-gg |
23762517 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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|
| T |
23762516 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
23762427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21436092 - 21435868
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21436092 |
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21435994 |
T |
|
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
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| T |
21435993 |
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21435897 |
T |
|
| Q |
216 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21435896 |
tttttatgttgggaaaacgaggtgttaca |
21435868 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 20525925 - 20526110
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| |
|
|
| T |
20525925 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaattg-ttttgg |
20526023 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20526024 |
attatgttatatgtgatacctcgttgtttatggt-tttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtattaca |
20526110 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19104141 - 19103958
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| Q |
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161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |
|
|
| T |
19104141 |
gggcctgcgtgccaaaacgttatatgaattatgatataatttccgccgaaatgttgaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttggattacgt |
19104043 |
T |
|
| Q |
162 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
19104042 |
tatatgtgatatcccgttgtttgtgatacttactctgataaatgttttaagaaaattttatattgaggaaaacggggtgttacaa |
19103958 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19110790 - 19110607
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgt |
161 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19110790 |
gggcctacgtgccaaaacgttatatggattatgatataatttccgctgaaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttggattacgt |
19110692 |
T |
|
| Q |
162 |
tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt-aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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| T |
19110691 |
tatatgtgatatctcgttatttgtgatacttactctgataaatgttttaagaaaattttatattggggaaaacggggtgttacaa |
19110607 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15743868 - 15743679
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| Q |
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152 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15743868 |
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15743771 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15743770 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
15743679 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 21807941 - 21808130
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| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21807941 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgatattccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt- |
21808038 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21808039 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
21808130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33384405 - 33384221
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33384405 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggatt |
33384307 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33384306 |
acgtt-tatgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
33384221 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 33386963 - 33387151
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33386963 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttt-atgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt- |
33387059 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33387060 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaag-aatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
33387151 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 33393608 - 33393795
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| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33393608 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttt-atgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt- |
33393704 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33393705 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaag-aatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
33393795 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 43064047 - 43064232
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| Q |
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157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43064047 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccactgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggatt |
43064145 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43064146 |
acgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgtcttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
43064232 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21834731 - 21834543
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| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21834731 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgatattccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt- |
21834634 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttac |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21834633 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacgggttgttac |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 18627066 - 18627271
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taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatta |
136 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
18627066 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgacttttggttaaatta |
18627164 |
T |
|
| Q |
137 |
ttatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggg |
236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | |
|
|
| T |
18627165 |
ttatttaactgtttt-ggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaaaaaatttgtatattgggaaaacgag |
18627263 |
T |
|
| Q |
237 |
gtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
18627264 |
gtgttaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
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157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
44755440 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgttaaagatatttggttaaatcattatttaactgtttt-ggatt |
44755343 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44755342 |
acgtt-tatctgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 58 - 244
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157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
49333908 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcaatagttaactgtttt-ggatt |
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T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
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157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
27899430 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgatgtgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttt-ggatt |
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T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27899528 |
aagtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattggaaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Original strand, 17040945 - 17041133
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |
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|
| T |
17040945 |
atggggcctacgtgccaaaaacgatttatggtttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactattattggat |
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T |
|
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tatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
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| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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|
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tatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
Target Start/End: Original strand, 17046483 - 17046670
Alignment:
| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |
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|
| T |
17046483 |
atggggcctacgtgccaaaaacgatttatggtttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactattattggat |
17046582 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17046583 |
tatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
17046670 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Original strand, 13287289 - 13287472
Alignment:
| Q |
66 |
ctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13287289 |
ctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttgactgtt---ggattatgtta |
13287384 |
T |
|
| Q |
164 |
tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13287385 |
tatgtgatatcccgttgctt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
13287472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12646290 - 12646099
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
12646290 |
tttgatggggcctacgagccaaaacgatttatggatttcgaaataattttccgctgcattgtttaag-tatttggttaaattgttatttaactgatattg |
12646192 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttt--tatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12646191 |
atttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaatttttatatattgggaaaacggggtgttaca |
12646099 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 207
Target Start/End: Original strand, 41479309 - 41479457
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
41479309 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattgttatttaactg---tt |
41479404 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41479405 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
41479457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 21238092 - 21238284
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| |
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| T |
21238092 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaattcgttgaaagttaaattgttatttaactga |
21238191 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21238192 |
ttttggattaagtttgtatgtaatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
21238284 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 18394668 - 18394878
Alignment:
| Q |
37 |
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129 |
Q |
| |
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|||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
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| T |
18394668 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttcgaattaatttccgctgcaatgcttaagatattttgttgaaagt |
18394766 |
T |
|
| Q |
130 |
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227 |
Q |
| |
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| T |
18394767 |
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18394861 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18394862 |
gaaaacggggtgttaca |
18394878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 18600842 - 18601052
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18600842 |
taactcttttgagat-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
18600939 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
18600940 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
18601035 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18601036 |
aaaacggggtgttacaa |
18601052 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20934683 - 20934542
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
20934683 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattgttatttaactg---ttggattac |
20934588 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20934587 |
gttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
20934542 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21177794 - 21177602
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
21177794 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggttttcgaattaatttccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagttaaatttttatttaactgtt |
21177695 |
T |
|
| Q |
150 |
tttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21177694 |
ttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttattt--gatgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
21177602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20137505 - 20137315
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
20137505 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattatga-ataatttccgctgcattgtttaagtaattcgttgaaagttaaattgttatttgattga |
20137407 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20137406 |
ttttggagtaagtttgtatgtgatattccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
20137315 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 24783771 - 24783981
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || || ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
24783771 |
taactcttttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaacgatttattgttttcgaattaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgcaagtt |
24783869 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactg-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
24783870 |
aaattgttatttaactgatttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattggg |
24783964 |
T |
|
| Q |
229 |
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245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24783965 |
aaaacagggtgttacaa |
24783981 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27367039 - 27366945
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| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27367039 |
ttttggtttatgttttatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa-ttttatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21312563 - 21312344
Alignment:
| Q |
26 |
tgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt |
125 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||| |||| | ||||| |
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|
| T |
21312563 |
tgatattgaattaactcatttgaaat-attttgatggggcctgcgtgccaaaatgatttatggttttcgaattaatttccgctgcaacgtttgaaatatt |
21312465 |
T |
|
| Q |
126 |
tg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttt |
219 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
21312464 |
tgttaaagttaaattgttatttaactgttttgcgattacgtttgaatgtgatatcccgttatt--tgatgtttactctgataaatgttt--agaaatttt |
21312369 |
T |
|
| Q |
220 |
tatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21312368 |
tatattgggaagacggggtgttaca |
21312344 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21305313 - 21305104
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
21305313 |
taactcttttgagat-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
21305216 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
21305215 |
taaattattatttaactgttttcggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
21305120 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
21305119 |
aaaacggggtgttaca |
21305104 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 50888606 - 50888724
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128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
50888606 |
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50888701 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
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|
| T |
50888702 |
ggaaaacggggtgttacaaaaac |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 45490453 - 45490645
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149 |
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| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| | |
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|
| T |
45490453 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttactgatttcgaattaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgaagttaaattgttatttaactgat |
45490552 |
T |
|
| Q |
150 |
tttggattatgtt--atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45490553 |
tttggattatgtttcgaatgtgatatcctgttatt--cgatgtttactctgataattgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 16081099 - 16081293
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || | |
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|
| T |
16081099 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttattgattttcaaatttaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgaagttaaattgttatttaaccg |
16081198 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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| T |
16081199 |
attttggattatgtttcgaatgtgatatcccgttgttt--gatgtttactctgataaattttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
16081293 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Original strand, 18095137 - 18095248
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18095137 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatatta |
18095232 |
T |
|
| Q |
227 |
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242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
18095233 |
ggaaaacggggtgtta |
18095248 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 33050709 - 33050918
Alignment:
| Q |
37 |
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128 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | |
|
|
| T |
33050709 |
taactgttttgagat-attttgatggggcttacgtgccaaaacgatttatgaatttcgaattaatttccgctgcagtgcttaagatatttttgttgaaag |
33050807 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactg-tttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33050808 |
ttaaattgttatttaactgatttttggattatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattg |
33050902 |
T |
|
| Q |
227 |
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242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
33050903 |
ggaaaacggggtgtta |
33050918 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24238288 - 24238098
Alignment:
| Q |
60 |
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152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24238288 |
tggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagttaaattattatttaactgttttt |
24238190 |
T |
|
| Q |
153 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24238189 |
ggattacgtttttatgtgatatccc---ttttatggtttttactctgataaatgtttttaagaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaaa |
24238098 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 46158166 - 46158280
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46158166 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatatt |
46158261 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46158262 |
gggaaaacggggtgttaca |
46158280 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 16346523 - 16346716
Alignment:
| Q |
55 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16346523 |
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16346622 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16346623 |
ttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
16346716 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 16353172 - 16353365
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tataat-ttccgctgcaatgtttaagatattt----ggttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16353172 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatgatttttgaatttaatattccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgt |
16353271 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16353272 |
ttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
16353365 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28620886 - 28620667
Alignment:
| Q |
26 |
tgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt |
125 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
28620886 |
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28620788 |
T |
|
| Q |
126 |
tg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttt |
219 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28620787 |
tgttaaagttaaattgttatttaaccgttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttattt--gatgtttactctgataaatgttt--agaaatttt |
28620692 |
T |
|
| Q |
220 |
tatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28620691 |
tatattgggaaaacggggtgttaca |
28620667 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Original strand, 44845711 - 44845825
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44845711 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt----atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
44845805 |
T |
|
| Q |
227 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44845806 |
ggaaaacggggtgttacaaa |
44845825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21843563 - 21843452
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21843563 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
21843468 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
21843467 |
ggaaaacggggtgtta |
21843452 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 147
Target Start/End: Original strand, 36819995 - 36820088
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
36819995 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattttgaaataattttccgctgcaatgtttaagttattttgttaaattgttatttaactg |
36820088 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12328788 - 12328674
Alignment:
| Q |
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
12328788 |
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12328693 |
T |
|
| Q |
226 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12328692 |
gggaaaacggggtgttaca |
12328674 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21827989 - 21827876
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21827989 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atgggttttactctgataaatgttt-aagaaatttatatattg |
21827894 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21827893 |
ggaaaacggggtgttaca |
21827876 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
Target Start/End: Original strand, 36820103 - 36820287
Alignment:
| Q |
59 |
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157 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
36820103 |
atggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttcgaaataattttccgctgcaatgtttaagttattttgttaaattgttatttaactg-atttagatt |
36820201 |
T |
|
| Q |
158 |
atg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaa---atttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36820202 |
atgtttgaatgtgatatcccg---tttatgttgtttgctctgataaatgttt--agaatttttttttatattgagaaaacggggtgttaca |
36820287 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Original strand, 50455533 - 50455720
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
50455533 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
50455631 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50455632 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaaa |
50455720 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Original strand, 19302115 - 19302290
Alignment:
| Q |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
19302115 |
taactcttttgagat-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
19302212 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggatta--tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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taaattattatttaactgtttttggattacgttttttatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
19302290 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47658493 - 47658379
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47658493 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccg---tttatggcttttactctgataaatg-tttaagaaattcgtatatt |
47658398 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47658397 |
gggaaaacggggtgttaca |
47658379 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 248
Target Start/End: Original strand, 18182942 - 18183058
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
18182942 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttttgtgatgattactctaatttatg--ttaagaaatttttatgttgg |
18183037 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaaaaa |
248 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18183038 |
gaaaacagggtgttacaaaaa |
18183058 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 20216721 - 20216822
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101 |
tttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctga |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
20216721 |
tttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacattatatgtgatatcccgttgctt--gatgcttactctga |
20216814 |
T |
|
| Q |
200 |
taaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
20216815 |
taaatgtt |
20216822 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
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Target Start/End: Original strand, 22835878 - 22835989
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
22835878 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtga-atgtgatatcccgttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
22835972 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22835973 |
gaaaacggggtgttaca |
22835989 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 41349678 - 41349793
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| Q |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
41349678 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
41349773 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41349774 |
gggaaaacggggtgttacaa |
41349793 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
41357115 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
41357210 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41357211 |
gggaaaacggggtgttaca |
41357229 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 43077738 - 43077593
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| Q |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
43077738 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
43077643 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43077642 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
43077593 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
6151182 |
gttaaattgttgtttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttttgtgatgtttactctgatttatg--ttaagaaatttttatgttgg |
6151087 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6151086 |
gaaaacggagtgttaca |
6151070 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
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| Q |
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23507768 |
ggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
23507674 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23507673 |
gggaaaacggggtgttacaaa |
23507653 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
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| Q |
38 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || || |
|
|
| T |
51329405 |
aactcttttgagat-actt--attgggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaagg |
51329501 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
51329502 |
ttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggttttcactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgg |
51329596 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51329597 |
gaaaacggggtgttacaa |
51329614 |
T |
|
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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
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| Q |
38 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || || |
|
|
| T |
51336039 |
aactcttttgagat-actt--attgggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaagg |
51336135 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
51336136 |
ttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggttttcactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgg |
51336230 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51336231 |
gaaaacggggtgttaca |
51336247 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
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| Q |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
8762371 |
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8762470 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8762471 |
ttttgcgattatatttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttattctgataattgtttaaa---atttttatattgggaaaacggggtgttaca |
8762562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15269996 - 15269852
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | |||| |
|
|
| T |
15269996 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcctgttt---atggtttttac |
15269901 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15269900 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
15269852 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
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| Q |
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tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23594727 |
tttatgttgattactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
23594788 |
T |
|
Back To:
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Target: chr1; HSP #65
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
21021914 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatccc---atttgagatgtttactctgat--atttgttaagaaatttttatgttgg |
21021820 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21021819 |
gcaaacggggtgttaca |
21021803 |
T |
|
Back To:
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Target: chr1; HSP #66
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| Q |
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atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14296476 |
atgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgtttaaa--aattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
14296550 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
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| Q |
181 |
tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21788945 |
tttatgttgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
21789006 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27240635 |
atgtgatatcccgttat--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
27240711 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
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| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| || ||||||| | || ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
20086036 |
gttaaattattatttaaccatttatg-attatgtgaaatatgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttgg |
20086129 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20086130 |
gaaaacggggtgttaca |
20086146 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 211 - 245
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| Q |
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agaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49999358 |
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49999324 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
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| Q |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20848010 |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21302421 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
21302473 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
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| Q |
192 |
tactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21704284 |
tactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
21704234 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
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Query Start/End: Original strand, 191 - 244
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22922782 |
ttactctgataaatgttttt-gaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
22922834 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
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Query Start/End: Original strand, 212 - 244
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22444898 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
22444930 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22450132 |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
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gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0216 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:
Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 9515 - 9732
Alignment:
| Q |
25 |
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124 |
Q |
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T |
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224 |
Q |
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9712 |
T |
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225 |
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244 |
Q |
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| |||||||||||||||||| |
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| T |
9713 |
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9732 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0109
Description:
Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42619 - 42407
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
42619 |
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42520 |
T |
|
| Q |
131 |
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230 |
Q |
| |
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|
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| T |
42519 |
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42422 |
T |
|
| Q |
231 |
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245 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |
|
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| T |
42421 |
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42407 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6383 - 6190
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttt |
150 |
Q |
| |
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| T |
6383 |
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6284 |
T |
|
| Q |
151 |
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245 |
Q |
| |
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| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6283 |
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6190 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 242
Target Start/End: Original strand, 11991 - 12177
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
11991 |
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12088 |
T |
|
| Q |
154 |
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242 |
Q |
| |
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||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12089 |
gattaagtttaatgtgatatcccgtttgtttatgttatttactctgataactg-tttaaggaatttttatattgggaaaacggggtgtta |
12177 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 39508 - 39696
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |
|
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| T |
39508 |
tttgacggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgacataattttccgctgcaatg-ttaagttatttggttaaattgttatttaactagtttt- |
39605 |
T |
|
| Q |
154 |
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244 |
Q |
| |
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||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39606 |
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39696 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25900 - 25787
Alignment:
| Q |
128 |
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226 |
Q |
| |
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||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |
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| T |
25900 |
gttaaatcattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgatatatgttt-aagaaatttgtatattg |
25805 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25804 |
ggaaaacggggtgttaca |
25787 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 122)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22758287 - 22758061
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22758287 |
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22758188 |
T |
|
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
22758187 |
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22758090 |
T |
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| Q |
216 |
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244 |
Q |
| |
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|| |||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
22758089 |
ttggtatattgggaaaacggggtgttaca |
22758061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 246
Target Start/End: Original strand, 23278165 - 23278378
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23278165 |
ttgaactaactcctttgagactattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
23278263 |
T |
|
| Q |
131 |
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230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | || |
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|
| T |
23278264 |
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23278362 |
T |
|
| Q |
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246 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |
|
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| T |
23278363 |
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23278378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4167318 - 4167130
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
4167318 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttt-gg |
4167221 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4167220 |
attatgttttatgtgatatcccgttgtttaagatgcttactctgatatatgatttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
4167130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4207998 - 4207810
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
4207998 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttt-gg |
4207901 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4207900 |
attatgttttatgtgatatcccgttgtttaagatgcttactctgatatatgatttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
4207810 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22331516 - 22331292
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22331516 |
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22331419 |
T |
|
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
22331418 |
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22331319 |
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|
| Q |
216 |
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244 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||| |
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| T |
22331318 |
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22331292 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 25597372 - 25597559
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
25597372 |
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25597469 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
25597470 |
atcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaaaacgtggtgttaca |
25597559 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Original strand, 34299286 - 34299510
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34299286 |
atgctatttgtgatattgaactaactctt--gagattatattgatggggcctgcgtgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
34299383 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
34299384 |
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34299480 |
T |
|
| Q |
216 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34299481 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
34299510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21414562 - 21414393
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
21414562 |
tttgatggggcctgcgtgccagaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatctggttaaattattatttaactg-ttttgg |
21414464 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21414463 |
attatgttatatgtgatatctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
21414393 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19807914 - 19807724
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggatt-atgatataatttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
19807914 |
tttgatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatggatttatgatataatttccgctgcaaatgtttaagttatttggttaaattatcatttaactgttt-- |
19807817 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19807816 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
19807724 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34832015 - 34831802
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| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
34832015 |
ttgaactaactcttttgagattatattgatggggcctgcatgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgtttaagatattgggtt |
34831917 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| | || |||||||||||| |||||| |||| |
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|
| T |
34831916 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcatgttgtttatgaagcttacattgattattgatttaagaaatttgtatattgggaa |
34831818 |
T |
|
| Q |
231 |
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246 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |
|
|
| T |
34831817 |
aacggggtgttacaaa |
34831802 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21701698 - 21701513
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59 |
atggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
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21701513 |
T |
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Target: chr6; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 1545809 - 1545993
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156 |
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244 |
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1545993 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 32566013 - 32566198
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157 |
Q |
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32566111 |
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245 |
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32566198 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #14
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154 |
Q |
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| T |
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16370974 |
T |
|
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244 |
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| T |
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16370887 |
T |
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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25116833 - 25116646
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| Q |
55 |
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154 |
Q |
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| T |
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25116736 |
T |
|
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245 |
Q |
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| T |
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25116646 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 22334263 - 22334455
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151 |
Q |
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| T |
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22334361 |
T |
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| Q |
152 |
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244 |
Q |
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| T |
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22334455 |
T |
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Target: chr6; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25110230 - 25110044
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| Q |
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
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155 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
25110132 |
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25110044 |
T |
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Target: chr6; HSP #18
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Target Start/End: Original strand, 5835215 - 5835423
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31 |
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130 |
Q |
| |
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| T |
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228 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
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245 |
Q |
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| T |
5835407 |
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5835423 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 24291785 - 24291975
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152 |
Q |
| |
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| T |
24291785 |
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24291882 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
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24291975 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
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Target Start/End: Original strand, 24315814 - 24316003
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152 |
Q |
| |
|
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| T |
24315814 |
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24315911 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
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|
| T |
24315912 |
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24316003 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Original strand, 16552791 - 16552975
Alignment:
| Q |
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157 |
Q |
| |
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|
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| T |
16552791 |
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16552889 |
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|
| Q |
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244 |
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| |
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| T |
16552890 |
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16552975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Original strand, 16629347 - 16629531
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| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16629347 |
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16629445 |
T |
|
| Q |
158 |
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244 |
Q |
| |
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| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
16629446 |
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16629531 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 17038093 - 17038309
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| Q |
26 |
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125 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17038093 |
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17038191 |
T |
|
| Q |
126 |
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223 |
Q |
| |
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| T |
17038192 |
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17038288 |
T |
|
| Q |
224 |
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244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17038289 |
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17038309 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16576155 - 16575977
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| Q |
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cctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttat |
164 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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16576058 |
T |
|
| Q |
165 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16576057 |
atgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 16619225 - 16619403
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cctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttat |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
16619225 |
cctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-t |
16619322 |
T |
|
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16619323 |
atgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 31317826 - 31318016
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
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|
| T |
31317826 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt- |
31317923 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31317924 |
ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgattcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20176317 - 20176110
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31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20176317 |
ttgaactaactctttcgagata--tttgatgaggcctgcgtgccaaa-cgttat---gattatgatataatttctgctgcaatgtttaagatatttggtt |
20176224 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgtt-ttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt-agg |
228 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
20176223 |
aaattattatttaactg--tttggattatgttatatgtgatatcccgttgttttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaattttcttattgggg |
20176126 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
20176125 |
aaaacggggtgttaca |
20176110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 22159674 - 22159881
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| Q |
31 |
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130 |
Q |
| |
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22159674 |
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22159767 |
T |
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131 |
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228 |
Q |
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| T |
22159768 |
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22159865 |
T |
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244 |
Q |
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|
| T |
22159866 |
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22159881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 34370683 - 34370868
Alignment:
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154 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34370683 |
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34370781 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34370782 |
attatgttatatgtgatacctcgttgtttatggt-tttactctgataaatgttt--aacaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
34370868 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 20804240 - 20804428
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
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|
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| T |
20804240 |
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20804338 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
20804339 |
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20804428 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 17017704 - 17017910
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37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaaga-tatttggttaaatt |
135 |
Q |
| |
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|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
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| T |
17017704 |
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17017802 |
T |
|
| Q |
136 |
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235 |
Q |
| |
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| T |
17017803 |
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17017901 |
T |
|
| Q |
236 |
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244 |
Q |
| |
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||||||||| |
|
|
| T |
17017902 |
ggtgttaca |
17017910 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 20650547 - 20650741
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| Q |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20650547 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgactatgatataatttccgctgcaatgtttaagatattggttaaaattattatttaactgt |
20650646 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
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| T |
20650647 |
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20650741 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 9484999 - 9485189
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacg-ttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
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| T |
9484999 |
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9485097 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9485098 |
ggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
9485189 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 25136318 - 25136507
Alignment:
| Q |
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| |||| |
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| T |
25136318 |
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25136416 |
T |
|
| Q |
154 |
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244 |
Q |
| |
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||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25136417 |
gattaagtttaatgtgatatcccgtttgtttatgctccttactctgataactg-tttaaggaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
25136507 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12495730 - 12495539
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacg-ttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| | || |
|
|
| T |
12495730 |
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12495632 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12495631 |
ggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactcttataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
12495539 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19662218 - 19662031
Alignment:
| Q |
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155 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||| |
|
|
| T |
19662218 |
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19662120 |
T |
|
| Q |
156 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19662119 |
ttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacgggatgttaca |
19662031 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
Target Start/End: Original strand, 1588429 - 1588616
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| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | | |
|
|
| T |
1588429 |
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1588528 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1588529 |
tatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
1588616 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 2686003 - 2686192
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| Q |
55 |
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153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
2686003 |
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2686100 |
T |
|
| Q |
154 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2686101 |
gattatgttaaatgtgatatctcgtttgtttatgtggtttactctaataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
2686192 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8796519 - 8796335
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
8796519 |
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8796421 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8796420 |
attacgttatatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
8796335 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 18194889 - 18195099
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atataa--tttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaa |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18194889 |
taactcttttgagat-actctgttggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgatttttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttaa |
18194986 |
T |
|
| Q |
133 |
attattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataa-----atgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
18194987 |
attattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgtttactctgataaatgttatgtttaaagaaattttgatattgg |
18195082 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18195083 |
gaaaacggggtgttaca |
18195099 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16740625 - 16740438
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16740625 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacaatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaactga |
16740526 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16740525 |
ttttggattatgttgaatgtgatatcccg---tttatgctgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgtt |
16740438 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12706144 - 12705953
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
12706144 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggtttatgaaataattttcgctgcattgtttaagtaatttgttgaaagttgaatcattatttaactga |
12706045 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12706044 |
ttttggattatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
12705953 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 207
Target Start/End: Original strand, 25804913 - 25805064
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
25804913 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactg-ttttag |
25805011 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25805012 |
attaagtttaatatgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgtt |
25805064 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16262860 - 16262715
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16262860 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttgactgtt---ggattatgttatatgtgatataccgttgttt-tgatgcttactctgat |
16262766 |
T |
|
| Q |
201 |
aaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16262765 |
aaatgctatgtatttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
16262715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 23657790 - 23657983
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
23657790 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttattgattttagaattaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgaagttaaattgttatttaactga |
23657889 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23657890 |
ttttggattatgttttgaatgtgatatcccg---tttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaatggggtgttacaa |
23657983 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35119503 - 35119311
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
35119503 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattatgaaataattttccgctgcattgtttaagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaactg |
35119404 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35119403 |
atcttggattatgttataatgtgatatcccgttatt---gttgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
35119311 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30596598 - 30596388
Alignment:
| Q |
38 |
aactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttt--tatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30596598 |
aactcttttgagat-actctgttggggcctgcgtgccaaaacatttcatatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaa |
30596501 |
T |
|
| Q |
134 |
ttattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30596500 |
ttattatttaactg---ttggactacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattg |
30596406 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30596405 |
ggaaaacggggtgttaca |
30596388 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Original strand, 9485190 - 9485373
Alignment:
| Q |
64 |
gcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
9485190 |
gcctacgtgccaaaatgatttatggattataaaataatttccgctgcattgtttaagtaattcgttgaaagttaaattgttatttaactgattttggatt |
9485289 |
T |
|
| Q |
158 |
atgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9485290 |
aagtttgtatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
9485373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Original strand, 5617508 - 5617695
Alignment:
| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataatttc-cgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
5617508 |
atggggcctacgtgccaaaaaccatttatggtttatgaaacaatttttcgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggat |
5617607 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5617608 |
tacattaaatgtgatatcccgttgtttaagttgtttactctgataattg-tttaagaaattttcatattgaaaaaatggggtgttacaa |
5617695 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23435880 - 23435692
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatattt------ggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23435880 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttttg |
23435781 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23435780 |
gattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
23435692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30693734 - 30693525
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
30693734 |
taactcttttgagat-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
30693637 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
30693636 |
taaattattatttaactgttttgggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
30693541 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
30693540 |
aaaacggggtgttaca |
30693525 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21585008 - 21584815
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
21585008 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttactgattttcgaattaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgaagttaaattgttatttaactga |
21584909 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21584908 |
ttttggattatgtttcgaatgtgatatcccgttattc--gatgtttactctgataattgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
21584815 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3486016 - 3485809
Alignment:
| Q |
38 |
aactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatt-tccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
3486016 |
aactcttttgagat-actt-gttggggcctgcgtgccaaactgatttatgatttctgaactaatactccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggtta |
3485919 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
3485918 |
aattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaa |
3485823 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
3485822 |
aacggggtgttaca |
3485809 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 3709182 - 3709397
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg--- |
127 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
3709182 |
ttgaattaactcatttgagat-atttcgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattacgaactaattttcgctgcaacgtttgaaatatttgtta |
3709280 |
T |
|
| Q |
128 |
--gttaaattattatttgactgtttttggattatg--ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttata |
223 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3709281 |
aagttaaattgttatttaactaattttggattatgtcttgtatgtgatatcccgtttatgctga--aatactctgataaatgttt--agaaatttttata |
3709376 |
T |
|
| Q |
224 |
ttaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3709377 |
ttgggaaaacggggtgttaca |
3709397 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 207
Target Start/End: Original strand, 4234206 - 4234368
Alignment:
| Q |
38 |
aactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataatttcc-gctgcaatgtttaagatatttggttaaatt |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4234206 |
aactcttttgagat-acttt--ttgggcctgcgtgccaaaacgttt-atgaattatgtttatgattttctgctgcaatatttaagatatt-ggttaaatt |
4234300 |
T |
|
| Q |
136 |
attatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4234301 |
attatttaactgtt---ggattacgtcatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
4234368 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 28259208 - 28259348
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa---tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
28259208 |
gggcctgagtgccaaaacgttttatgaattat-atttacgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
28259302 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28259303 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatg-ttactctgataaatgtt |
28259348 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 28265832 - 28265972
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa---tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
28265832 |
gggcctgagtgccaaaacgttttatgaattat-atttacgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
28265926 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28265927 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatg-ttactctgataaatgtt |
28265972 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28286708 - 28286568
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa---tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
28286708 |
gggcctgagtgccaaaacgttttatgaattat-atttacgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggatta |
28286614 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28286613 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatg-ttactctgataaatgtt |
28286568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 28337957 - 28338097
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa---tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
28337957 |
gggcctgagtgccaaaacgttttatgaattat-atttacgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
28338051 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28338052 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatg-ttactctgataaatgtt |
28338097 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 28344581 - 28344721
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa---tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
28344581 |
gggcctgagtgccaaaacgttttatgaattat-atttacgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
28344675 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28344676 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatg-ttactctgataaatgtt |
28344721 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23013012 - 23012899
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23013012 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
23012917 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23012916 |
ggaaaacggggtgttaca |
23012899 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8228147 - 8228031
Alignment:
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127 |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8228147 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
8228052 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8228051 |
gggaaaacggggtgttacaaa |
8228031 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20059928 - 20059815
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| Q |
128 |
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226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20059928 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt----atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
20059834 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20059833 |
ggaaaacggggtgttacaa |
20059815 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 26129837 - 26129628
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||| || || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
26129837 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaattgatttatgacttctgaactaatattccgctgctatatt-aagatattatgtggaagt |
26129740 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
26129739 |
taaattattatttaactgcttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
26129644 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
26129643 |
aaaacggggtgttaca |
26129628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
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Target Start/End: Complemental strand, 18930338 - 18930224
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| Q |
127 |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18930338 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
18930243 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18930242 |
gggaaaacggggtgttaca |
18930224 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 27328883 - 27328997
Alignment:
| Q |
127 |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27328883 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
27328978 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27328979 |
gggaaaacggggtgttaca |
27328997 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 27389623 - 27389737
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| Q |
127 |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27389623 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
27389718 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27389719 |
gggaaaacggggtgttaca |
27389737 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 19791472 - 19791683
Alignment:
| Q |
37 |
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128 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| | |
|
|
| T |
19791472 |
taactgttttgagat-attttgatggggcctatgtgccaaaacgatttatgaatttcgaattaatttccgctgcagtgcttaagatttttttgttgaaag |
19791570 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactg-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19791571 |
ttaaattgttatttaactgatttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattg |
19791665 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19791666 |
ggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19297818 - 19297622
Alignment:
| Q |
52 |
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143 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
19297818 |
tactttgatggggtctacgtgccaaagtgatttatggatttcgaaacaatttttccgctgcattgtttaagtaatttgttgaaggttaaattgttattta |
19297719 |
T |
|
| Q |
144 |
actgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19297718 |
actgattttggattatgttataatgtgatatcacg---tttatgctgtttactttgataaatgttt--agaaatttttatattgagaaaacggggtgtta |
19297624 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 27563471 - 27563572
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| Q |
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199 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27563471 |
tttccgctgcgaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctga |
27563564 |
T |
|
| Q |
200 |
taaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
27563565 |
taaatgtt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6980012 - 6979827
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| Q |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
6980012 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttgagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggatta |
6979918 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6979917 |
cgttatatgtgataacccgttgctt--gatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
6979827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 23382266 - 23382381
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| Q |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23382266 |
ggttaaattattatttaactgtatttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
23382361 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23382362 |
gggaaaacggggtgttacaa |
23382381 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 27431110 - 27431225
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| Q |
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
27431110 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
27431205 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27431206 |
gggaaaacggggtgttacaa |
27431225 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34451903 - 34451788
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| Q |
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226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34451903 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttttatgtgatatcccgtttatggttttt-ttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
34451806 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34451805 |
ggaaaacggggtgttaca |
34451788 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16194340 - 16194133
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| Q |
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taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || | ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
16194340 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgtcaaaatgatttatggttttccaattaatttccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagtta |
16194242 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
16194241 |
aattgttatttaactgattttggtttatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattgggaa |
16194147 |
T |
|
| Q |
231 |
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244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |
|
|
| T |
16194146 |
aacgtggtgttaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #76
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
25469183 |
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T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25469087 |
gggaaaacggggtgttaca |
25469069 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 52 - 244
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146 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
25767826 |
tactttgatagggcctacgtgccaaaatgatttatggttttcgagttaatttccgctacaacgtttggaatatttgttaaagttaaattgttatttaact |
25767925 |
T |
|
| Q |
147 |
gtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25767926 |
gttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttattt--gatgtttactctgatgaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacgaggtgttaca |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #78
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ttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttact |
195 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
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ttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccg---tttatggattttact |
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T |
|
| Q |
196 |
ctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ctgataattg-tttacgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaaaa |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28365938 |
gggaaaacggggtgttacaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
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Target Start/End: Original strand, 15895211 - 15895322
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Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
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|
| T |
15895211 |
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15895305 |
T |
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244 |
Q |
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|
|
| T |
15895306 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #81
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227 |
Q |
| |
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18906288 |
T |
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228 |
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244 |
Q |
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|
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18906271 |
T |
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Target: chr6; HSP #82
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Q |
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T |
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| Q |
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244 |
Q |
| |
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20908782 |
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20908876 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #83
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146 |
Q |
| |
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| T |
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20923229 |
T |
|
| Q |
147 |
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244 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr6; HSP #84
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224 |
Q |
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30639066 |
T |
|
| Q |
225 |
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244 |
Q |
| |
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30639067 |
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T |
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Target: chr6; HSP #85
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Query Start/End: Original strand, 127 - 245
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225 |
Q |
| |
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| T |
20801037 |
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20800942 |
T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr6; HSP #86
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Q |
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|
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|
| T |
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T |
|
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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gggaaaacggggtgttacaa |
27184870 |
T |
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Target: chr6; HSP #87
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Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27206821 - 27206706
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225 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27206821 |
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T |
|
| Q |
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245 |
Q |
| |
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| T |
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gggaaaacggggtgttacaa |
27206706 |
T |
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Target: chr6; HSP #88
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Target Start/End: Original strand, 27242407 - 27242522
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||| ||||||| |||||| |
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|
| T |
27242407 |
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27242502 |
T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
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|
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| T |
27242503 |
gggaaaacggggtgttacaa |
27242522 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
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Target Start/End: Original strand, 27264255 - 27264370
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225 |
Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #90
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Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
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Q |
| |
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|
|
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gg--aacggggtgttaca |
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T |
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Target: chr6; HSP #91
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226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
18731616 |
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18731711 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18731712 |
ggaaaatggggtgttaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #92
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227 |
Q |
| |
|
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|
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T |
|
| Q |
228 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21740903 |
gaaaacggggtgttacaa |
21740920 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
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|
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|
|
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T |
|
| Q |
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245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | | ||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Target: chr6; HSP #94
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
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T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #95
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193 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |
|
|
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19498911 |
T |
|
| Q |
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ctctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19498910 |
ctctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #96
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| |
|
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|
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T |
|
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226 |
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Q |
| |
|
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| T |
20077262 |
gggaaaacggggtattaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #97
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
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taactcatttgagat-attttgattgggcctacgtgccaaaacgatttttatggatttccgaattaaattccgctgcaatgtttaagatattttgttgaa |
22430804 |
T |
|
| Q |
131 |
----aaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |
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22430805 |
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22430898 |
T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22430899 |
gggaaaacggggtgtgacaa |
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T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #98
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224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |
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|
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T |
|
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225 |
taggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |
|
|
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31178154 |
tgggaaaacggggtgttaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #99
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
8414840 |
ggttaaattattattttactttttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
8414935 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
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8414936 |
gggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #100
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225 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
14054306 |
ggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
14054401 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14054402 |
ggggaaacggggtgttaca |
14054420 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #101
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| Q |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
29588488 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
29588583 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29588584 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaatggggtgttacaa |
29588633 |
T |
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Target: chr6; HSP #102
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| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
29594629 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
29594724 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29594725 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaatggggtgttaca |
29594773 |
T |
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Target: chr6; HSP #103
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204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
2870861 |
aatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggatttacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatattat |
2870954 |
T |
|
| Q |
205 |
gtttt--aagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2870955 |
gtttttaaagaagttttgctattgggaaaacggggtgttacaa |
2870997 |
T |
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Target: chr6; HSP #104
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| Q |
111 |
aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgga-ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg---- |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
2877476 |
aatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggatttacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgttgactctgataaatgttat |
2877569 |
T |
|
| Q |
206 |
---ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2877570 |
gtttttaaagaagttttgatattgggaaaacggggtgttaca |
2877611 |
T |
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Target: chr6; HSP #105
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| Q |
128 |
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225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21806033 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtttatgatttttttttactctgataaatg-tttaagaaatttgtatatt |
21805935 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
21805934 |
ggaaaaatcgggtgttaca |
21805916 |
T |
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Target: chr6; HSP #106
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Query Start/End: Original strand, 55 - 244
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| Q |
55 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
27568331 |
tttgatggggcctacgtgtcaaaacgatttatggatttttgaattaactctgctgcaatgtttaagatattttcttgaaacttaaattgttatttaactg |
27568430 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttatatg-tgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | | ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27568431 |
ttttgcgattatgtttgaaggtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgataattgttt--agaaaattttatattgggaaaacggggtgttaca |
27568523 |
T |
|
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Target: chr6; HSP #107
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Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 22603968 - 22604020
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22603968 |
ttactctgataattgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
22604020 |
T |
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Target: chr6; HSP #108
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14097911 |
gttaaattattatttaactgattatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt--agaaatttttacattg |
14097817 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14097816 |
gaaaaacggggtgttaca |
14097799 |
T |
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Target: chr6; HSP #109
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| Q |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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gaaaacagggtgttacaa |
16524303 |
T |
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Target: chr6; HSP #110
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| Q |
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ttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
19872388 |
ttaaattgttatttaactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgata--tttcttaagaaatttttatgttggg |
19872295 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19872294 |
aaaacggggtgttacaa |
19872278 |
T |
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Target: chr6; HSP #111
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| Q |
207 |
tttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttatgaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
324 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17757193 - 17757141
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17757193 |
ttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
17757141 |
T |
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Target: chr6; HSP #113
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aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
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Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||| || ||||| | | |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || |
|
|
| T |
18692725 |
aaattgttatttaactgtttttagaatatgtgaaaggtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttggaaa |
18692819 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
18692820 |
aacggggtgttacaa |
18692834 |
T |
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Target: chr6; HSP #114
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
19862247 |
gttaaattgttatttaactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttgg |
19862154 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19862153 |
gaaaatggggtgttacaa |
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T |
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Target: chr6; HSP #115
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| ||| ||| ||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
22431518 |
gttaaattgtcatttaactatttatggtttatgtgaaatgtgatatcccgttt---atgatatttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgg |
22431424 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
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gaaaatggagtgttacaa |
22431406 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #116
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25643130 |
gaaaacgggttgttacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaaaacggggtgttaca |
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T |
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tttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
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|
|
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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Target: chr6; HSP #121
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gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
|||||||| | |||| ||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
22438065 |
gttaaattgtcatttaactatttatggtttatgggaaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgg |
22437971 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
22437970 |
gaaaatggggttttacaa |
22437953 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0090
Description:
Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 39508 - 39735
Alignment:
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115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39508 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattatattgttggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
39607 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39608 |
ttaagatatttggttaaattattatttaactg-ctttggattatgttatatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaa |
39706 |
T |
|
| Q |
216 |
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244 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39707 |
tttgtatattgggaaaacgggatgttaca |
39735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 30984 - 31099
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30984 |
ggttaaattattatttaacagtttttggattatgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgatt-aagaaatttgtatatt |
31079 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31080 |
gggaaaacggggtgttacaa |
31099 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 245
Target Start/End: Original strand, 29972 - 30048
Alignment:
| Q |
166 |
tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29972 |
tgtgatatcccgttatatat--tgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttacaa |
30048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 119)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 22326652 - 22326878
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22326652 |
atgctatt-gtgatattgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgtttttatgactatgatataatttccgctgcaatga |
22326750 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22326751 |
ttaagatatttggttaaattattatttaactg-ttttggattatgttatatgtgatatcccattttttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaa |
22326849 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
22326850 |
tttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
22326878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22352286 - 22352073
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352286 |
ttgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgattaagatatttggtt |
22352188 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |
|
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| T |
22352187 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaataaatttgtatattgcgaa |
22352089 |
T |
|
| Q |
231 |
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246 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352088 |
aacggggtgttacaaa |
22352073 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21632107 - 21631933
Alignment:
| Q |
71 |
tgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtga |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21632107 |
tgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttttggattatgttatatgtga |
21632008 |
T |
|
| Q |
171 |
tatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21632007 |
tatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatatttatattgggaaaacggggtgttacaa |
21631933 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 15442674 - 15442862
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
15442674 |
tttgatggggcctgcgtgacgaaacgttttatggattatgatataatttccactgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgtttt-gg |
15442772 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15442773 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacgaggtgttaca |
15442862 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22342856 - 22342645
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22342856 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcttgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatatagtttccgctgcaatgattaagatatatggtt |
22342758 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
22342757 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgattatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgagaa |
22342659 |
T |
|
| Q |
231 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
22342658 |
aacggggtgttaca |
22342645 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 14360539 - 14360729
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggatt-atgatataatttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
14360539 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggatttatgatataatttccgctgcaaatgtttaagttatttggttaaattatcatttaactgttt-- |
14360636 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14360637 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctaataaatgttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
14360729 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24553974 - 24553749
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24553974 |
atgctttttgtgatattgaactaactcttttgagatcatattgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatattataatttccgctgcaatgt |
24553875 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24553874 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggaatatgttaaatatgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
24553778 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24553777 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
24553749 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25526146 - 25525922
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25526146 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatggggcctgcgtgccaaagcgttttatggattataatataattttcgctgcaatgt |
25526048 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
25526047 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--acaaa |
25525951 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25525950 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
25525922 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 21295926 - 21296151
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21295926 |
atgctatttgtgatattgaactaagtgttt-gagattatattgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
21296024 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21296025 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-atttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaa |
21296122 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21296123 |
tttttatgttggaaaaacggggtgttaca |
21296151 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 23337967 - 23338193
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
23337967 |
atgctatttgtgatatttaactaactcttttgagattatattaatgtggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataaattccgcttcaatgt |
23338066 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23338067 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttacgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
23338163 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatatt-aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23338164 |
tttttatgttggggaaaacggggtgttaca |
23338193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20775221 - 20775036
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57 |
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156 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
20775221 |
tgatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgacataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttt-ggat |
20775124 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20775123 |
tacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaattttgataatgggaaaacggggtgttacaa |
20775036 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26171882 - 26171692
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |
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|
| T |
26171882 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatggattatgaaataatttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattgg |
26171783 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
26171782 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataattg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
26171692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Original strand, 17731093 - 17731285
Alignment:
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
17731093 |
tactatgatggggcctacgtgccaaaacgttttatggattatgaaataatttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttat |
17731192 |
T |
|
| Q |
152 |
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17731285 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 25809028 - 25809214
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
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T |
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244 |
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25809125 |
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25809214 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29315796 - 29315607
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
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| Q |
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249 |
Q |
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29315607 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 250
Target Start/End: Original strand, 21668577 - 21668766
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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250 |
Q |
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21668766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 21885876 - 21886065
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
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| T |
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21885975 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
21885976 |
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21886065 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23249319 - 23249130
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
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| T |
23249319 |
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23249222 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
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| T |
23249221 |
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23249130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19767725 - 19767519
Alignment:
| Q |
37 |
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134 |
Q |
| |
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234 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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244 |
Q |
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| T |
19767528 |
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19767519 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24019667 - 24019462
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatta |
136 |
Q |
| |
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| T |
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| Q |
137 |
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236 |
Q |
| |
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24019568 |
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24019470 |
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| Q |
237 |
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244 |
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| T |
24019469 |
gtgttaca |
24019462 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19774321 - 19774115
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaat |
134 |
Q |
| |
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| T |
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| Q |
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233 |
Q |
| |
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| T |
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19774127 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
19774126 |
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19774115 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37543394 - 37543218
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37543394 |
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37543308 |
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|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
37543307 |
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37543218 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 26666815 - 26667005
Alignment:
| Q |
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153 |
Q |
| |
|
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|
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| Q |
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245 |
Q |
| |
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|
| T |
26666914 |
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26667005 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 26938412 - 26938602
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26938412 |
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26938510 |
T |
|
| Q |
154 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26938511 |
gattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
26938602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacg--ttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
| |
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| T |
21343474 |
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21343572 |
T |
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| Q |
152 |
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245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21343573 |
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21343666 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 24533732 - 24533920
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24533732 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttcgaaataattttccgctgcattgtttaag-tatttggttaaattgttatttaactaattt-g |
24533829 |
T |
|
| Q |
154 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24533830 |
gattatgttaaatgtgatatcccatttgtttatgtggtttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
24533920 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 245
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| Q |
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ggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
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| T |
25230107 |
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25230206 |
T |
|
| Q |
159 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25230207 |
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25230293 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
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ggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| || |||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| |
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| T |
25294263 |
ggggcctacgtgccaaaaacgatttatgctttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactattattggatta |
25294362 |
T |
|
| Q |
159 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25294363 |
tgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
25294449 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
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156 |
Q |
| |
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| T |
4035626 |
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4035527 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
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| T |
4035526 |
tatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaattttcatattgaaaaaacggggtgttaca |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
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| Q |
38 |
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135 |
Q |
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Q |
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T |
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| T |
20231791 |
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20231781 |
T |
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Target: chr5; HSP #31
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T |
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| Q |
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245 |
Q |
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T |
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Target: chr5; HSP #32
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152 |
Q |
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T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
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T |
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Target: chr5; HSP #33
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Q |
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26743527 |
T |
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| Q |
146 |
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244 |
Q |
| |
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T |
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Q |
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| T |
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27688177 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr5; HSP #35
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152 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| |
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| Q |
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207 |
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| |
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| T |
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37287683 |
T |
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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 207
Target Start/End: Original strand, 37294237 - 37294386
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| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
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| T |
37294237 |
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37294332 |
T |
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| Q |
153 |
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207 |
Q |
| |
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| T |
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37294386 |
T |
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Target: chr5; HSP #38
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129 |
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Q |
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|
|
| T |
14995967 |
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T |
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Target: chr5; HSP #39
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Target Start/End: Original strand, 22328897 - 22329107
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129 |
Q |
| |
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|
| T |
22328897 |
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22328994 |
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130 |
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228 |
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245 |
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|
|
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22329091 |
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22329107 |
T |
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Target: chr5; HSP #40
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129 |
Q |
| |
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| T |
17283439 |
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17283342 |
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| Q |
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228 |
Q |
| |
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|
| T |
17283341 |
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17283246 |
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244 |
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| |
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|
|
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17283245 |
aaaacggggtgttaca |
17283230 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 22342328 - 22342537
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
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| T |
22342328 |
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22342425 |
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| Q |
130 |
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228 |
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| T |
22342426 |
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22342521 |
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244 |
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| |
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| T |
22342522 |
aaaacggggtgttaca |
22342537 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
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132 |
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225 |
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23609108 |
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249 |
Q |
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23609107 |
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23609084 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 37 - 249
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132 |
Q |
| |
|
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| T |
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23840599 |
T |
|
| Q |
133 |
attattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
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|||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| |
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| T |
23840598 |
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23840504 |
T |
|
| Q |
226 |
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249 |
Q |
| |
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|
| T |
23840503 |
gggaaaacggggtgttacaaaaac |
23840480 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26679993 - 26679783
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130 |
Q |
| |
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| Q |
131 |
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227 |
Q |
| |
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| T |
26679894 |
taaattgttatttaactgatttttggattatgtttgaatgtgatatcctgttt---atgatgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgg |
26679800 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26679799 |
gaaaacggggtgttaca |
26679783 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26951600 - 26951390
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37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt------ |
130 |
Q |
| |
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| T |
26951600 |
taactcatttgagat-attttgctggggcctacgtgccaaaacaatttatgaattttgaattaatttccgctgcaatgcttaagatattttgttgaaatt |
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T |
|
| Q |
131 |
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227 |
Q |
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26951407 |
T |
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228 |
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244 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26951406 |
gaaaacggggtgttaca |
26951390 |
T |
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Target: chr5; HSP #46
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155 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33725210 |
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33725112 |
T |
|
| Q |
156 |
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205 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33725111 |
ttatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgc-tactctgataaatg |
33725063 |
T |
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Target: chr5; HSP #47
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55 |
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147 |
Q |
| |
|
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22121424 |
T |
|
| Q |
148 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
22121425 |
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22121519 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 24473004 - 24473146
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62 |
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158 |
Q |
| |
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|
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| T |
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24473099 |
T |
|
| Q |
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207 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
24473146 |
T |
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Target: chr5; HSP #49
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Target Start/End: Complemental strand, 25405699 - 25405585
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226 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25405699 |
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25405604 |
T |
|
| Q |
227 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25405603 |
ggaaaacggggtgttacaa |
25405585 |
T |
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Target: chr5; HSP #50
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Target Start/End: Original strand, 27671186 - 27671328
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| Q |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
27671186 |
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27671281 |
T |
|
| Q |
159 |
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207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27671282 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
27671328 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 41098980 - 41099122
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| Q |
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gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
41098980 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
41099075 |
T |
|
| Q |
159 |
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207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41099076 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
41099122 |
T |
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Target: chr5; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41775185 - 41774997
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| Q |
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152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41775185 |
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41775087 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41775086 |
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41774997 |
T |
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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 143
Target Start/End: Original strand, 22259251 - 22259336
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| Q |
57 |
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143 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22259251 |
tgatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgacataaattccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttg |
22259336 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 22411350 - 22411560
Alignment:
| Q |
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taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatt-tccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22411350 |
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22411447 |
T |
|
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
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| T |
22411448 |
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22411543 |
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|
| Q |
229 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22411544 |
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22411560 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 37 - 240
Target Start/End: Original strand, 15002416 - 15002621
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
15002416 |
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15002513 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15002514 |
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15002609 |
T |
|
| Q |
229 |
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240 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
15002610 |
aaaacggggtgt |
15002621 |
T |
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Target: chr5; HSP #56
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Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 124038 - 124232
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| Q |
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146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
124038 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggatttcgaattaattttccgctgcaatgtttaagatatttggttgaaagttaaattgttatttaact |
124137 |
T |
|
| Q |
147 |
gtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
124138 |
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124232 |
T |
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Target: chr5; HSP #57
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | | || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
12029287 |
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12029386 |
T |
|
| Q |
149 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12029387 |
ttttggattatgtttcgaatgtgatatcccgttattt--ggtgtttactctgataattgttt--agaaaattttatattgggaaaacggggtgttaca |
12029480 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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22264204 |
T |
|
| Q |
159 |
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207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22264203 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
27664547 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgcagcaaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
27664642 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27664643 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22587371 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
22587276 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22587275 |
ggaaaacggggtgttaca |
22587258 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41768611 - 41768423
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| Q |
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152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
41768611 |
tggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagttaaattattatttaactgttttt |
41768513 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41768512 |
ggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctaataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
17919877 |
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T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17919977 |
attttggattaggtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
17920069 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27614697 - 27614511
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62 |
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Q |
| |
|
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|
| T |
27614697 |
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27614603 |
T |
|
| Q |
159 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27614602 |
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27614511 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18783386 - 18783273
Alignment:
| Q |
128 |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18783386 |
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18783292 |
T |
|
| Q |
227 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18783291 |
ggaaaacggggtgttacaa |
18783273 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19991255 - 19991046
Alignment:
| Q |
37 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
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| T |
19991255 |
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19991158 |
T |
|
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
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| T |
19991157 |
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19991062 |
T |
|
| Q |
229 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
19991061 |
aaaacggggtgttaca |
19991046 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27522770 - 27522562
Alignment:
| Q |
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130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| || || |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
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27522674 |
T |
|
| Q |
131 |
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229 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |
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|
| T |
27522673 |
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27522578 |
T |
|
| Q |
230 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
27522577 |
aaacggggtgttacaa |
27522562 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27608091 - 27607906
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
27608091 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttgagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggatta |
27607997 |
T |
|
| Q |
159 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27607996 |
cgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
27607906 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 29472093 - 29472305
Alignment:
| Q |
37 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
29472093 |
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29472190 |
T |
|
| Q |
130 |
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226 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
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| T |
29472191 |
taaattattatttaactgtttttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
29472286 |
T |
|
| Q |
227 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29472287 |
ggaaaacggggtgttacaa |
29472305 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27516133 - 27515926
Alignment:
| Q |
38 |
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130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| || || |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
27516133 |
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27516037 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |
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|
| T |
27516036 |
aaattatcatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattggga |
27515941 |
T |
|
| Q |
230 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
27515940 |
aaacggggtgttaca |
27515926 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22132272 - 22132159
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22132272 |
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T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22132176 |
ggaaaacggggtgttaca |
22132159 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 17707724 - 17707825
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| Q |
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tttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctga |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17707724 |
tttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctga |
17707817 |
T |
|
| Q |
200 |
taaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
17707818 |
taaatgtt |
17707825 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42804760 - 42804646
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| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42804760 |
gttaaattgttatttaactgattttggattatcttataatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattg |
42804666 |
T |
|
| Q |
227 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42804665 |
ggaaaatggggtgttacaaa |
42804646 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 21905327 - 21905441
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
21905327 |
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21905422 |
T |
|
| Q |
227 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21905423 |
ggaaaacggggtgttacaa |
21905441 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22138964 - 22138850
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| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22138964 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaacgttt-aagaaatttgtatattg |
22138869 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22138868 |
ggaaaacgaggtgttacaa |
22138850 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 41295265 - 41295378
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41295265 |
gttaaattgttatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatattccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
41295360 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41295361 |
ggaaaacggggtgttaca |
41295378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21828135 - 21828049
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| Q |
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attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21828135 |
attatgttgaatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaaa |
21828049 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23571424 - 23571312
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| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
23571424 |
gttaaattgttatttaactgtttttcgattatgtgaaatgtgatatctcgttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
23571329 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23571328 |
gaaaacggggtgttaca |
23571312 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | || |
|
|
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aatttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggttttt |
34570698 |
T |
|
| Q |
193 |
actctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34570697 |
actctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
34570646 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||| || ||||| |
|
|
| T |
18773543 |
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18773449 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18773448 |
ggaaaacggggtgttacaa |
18773430 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34564138 - 34563992
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| Q |
99 |
aatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgctt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
34564138 |
aatttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggttttt |
34564043 |
T |
|
| Q |
193 |
actctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34564042 |
actctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
34563992 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16360802 - 16360657
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| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
16360802 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
16360707 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16360706 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
16360657 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24221284 - 24221091
Alignment:
| Q |
55 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24221284 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattttcgaattaactccgctgcaatgtttaagatattctcttgaaagttaaattgttatttaactg |
24221185 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24221184 |
ttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttaat--tgattattactctgataattgtctt--gaaaattttatattgggaaaacggggtgttaca |
24221091 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14078416 - 14078327
Alignment:
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14078416 |
gattatgtgaaatgtgatatcccgtttt--atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacgggatgttacaaaa |
14078327 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16354143 - 16353999
Alignment:
| Q |
101 |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
16354143 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
16354048 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16354047 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
16353999 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 22063572 - 22063759
Alignment:
| Q |
62 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22063572 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
22063670 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22063671 |
ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
22063759 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Original strand, 23536368 - 23536443
Alignment:
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23536368 |
atgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
23536443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25106082 - 25105938
Alignment:
| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
25106082 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
25105987 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25105986 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
25105938 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25165175 - 25165031
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| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
25165175 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
25165080 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25165079 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
25165031 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 34295300 - 34295487
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatattt------ggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34295300 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
34295398 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34295399 |
ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
34295487 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 29478688 - 29478901
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
29478688 |
taactcttttgagat-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatggttaatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
29478785 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgttttt--ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29478786 |
taaattattatttaactgtttttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
29478881 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaac-ggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29478882 |
gaaaaacgggggtgttacaa |
29478901 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33408521 - 33408468
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33408521 |
ttactctgataattgttt-aagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
33408468 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
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Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40713048 |
ggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
40712954 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40712953 |
gggaaaacggggtgttacaa |
40712934 |
T |
|
Back To:
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Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6540414 - 6540202
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| Q |
37 |
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128 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||||| | |
|
|
| T |
6540414 |
taactgttttgagat-attttgatggggcctaagtgccaaaacgatttatgaatttcgaattactttccgctgcagtgcttaagatatttttgttgaaag |
6540316 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactg-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6540315 |
ttaaattgttatttaaatgatttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataactgttt--agaaattttcatattg |
6540221 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6540220 |
tgaaaacggagtgttacaa |
6540202 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #94
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23511432 |
gttaaatgattatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctaataattgtt--aagaaatttttatgtta |
23511339 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23511338 |
ggaaaacggggtgttaca |
23511321 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40706406 |
ggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
40706312 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40706311 |
gggaaaacggggtgttaca |
40706293 |
T |
|
Back To:
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Target: chr5; HSP #96
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22756029 |
atgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #97
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| Q |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22259337 |
gataaatgttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #98
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36313773 |
atgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
36313699 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaacaac |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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20766218 |
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128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||| | ||||| | | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
22031599 |
gttaaattgttatttaactattttag-attatatgaaatgtgatatcccgttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
22031505 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22031504 |
gaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #101
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16673444 |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #102
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22109349 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21998399 |
tgtgatatcccgttat--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
21998474 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #104
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Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23462130 - 23462055
Alignment:
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23462130 |
atgtgatatcccgttattt--gatgattactctgatttatgttt---gaaatttttatattgggaaaacagggtgttacaa |
23462055 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #105
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Alignment:
| Q |
164 |
tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23583651 |
tatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
23583574 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #106
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128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||| | ||||| | | ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
18770776 |
gttaaattgttatttaactattttag-attatatgaaatgtgatatccagttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
18770870 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18770871 |
gaaaacggggtgttaca |
18770887 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #107
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20804836 |
atgtgatatcccgttaatt--gatgattactctgatttatgtt--aagaaatttttatattgggaaaacgaggtgttacaa |
20804760 |
T |
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Target: chr5; HSP #108
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22141990 |
ttactctgataaatgttat--gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
22141939 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #109
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Query Start/End: Original strand, 207 - 245
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| Q |
207 |
tttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36448156 |
tttatgaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
36448118 |
T |
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Target: chr5; HSP #110
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Target Start/End: Complemental strand, 17004962 - 17004929
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17004962 |
gaaatttttatgttaggaaaacggggtgttacaa |
17004929 |
T |
|
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Target: chr5; HSP #111
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Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18417336 - 18417284
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18417336 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
18417284 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21886485 - 21886452
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21886485 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
21886452 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Original strand, 1859863 - 1859895
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1859863 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
1859895 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 247
Target Start/End: Original strand, 10776609 - 10776662
Alignment:
| Q |
192 |
tactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaa |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10776609 |
tactctgataattgttgt--gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaaa |
10776662 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 21330431 - 21330480
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21330431 |
ttactctgataaatgtttt--gaaatttttatgttgagaaaacggggtgtta |
21330480 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Original strand, 23391392 - 23391454
Alignment:
| Q |
180 |
ttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23391392 |
ttttatgatg-ttgctctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
23391454 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23439216 - 23439184
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23439216 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
23439184 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23450583 - 23450551
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23450583 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
23450551 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 246
Target Start/End: Original strand, 41096544 - 41096580
Alignment:
| Q |
210 |
aagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41096544 |
aagaaatttttattttgggaaaacggggtgttacaaa |
41096580 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 126)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 30235729 - 30235941
Alignment:
| Q |
31 |
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130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30235729 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggtctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
30235827 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
30235828 |
aaattattatttaactgttttggatttatgttatatgtgatatcccgttgcttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
30235927 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |
|
|
| T |
30235928 |
aacgaggtgttaca |
30235941 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 21340390 - 21340579
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
21340390 |
tttgctggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
21340488 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21340489 |
attatgttatatgtgatatcccgtttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
21340579 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 41386408 - 41386633
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41386408 |
atgctatttgtgatattgaactaaaccttttgagattatattgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
41386507 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41386508 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
41386604 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41386605 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
41386633 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23837876 - 23837651
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23837876 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattatgttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattataatataattttcgctgcaatgt |
23837777 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23837776 |
ttaagat-tttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatattaaatgtgatatcccgttgtttataatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
23837681 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23837680 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
23837651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 12409851 - 12410075
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12409851 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatggggcctgcgtgccaaagcgttctatggattataatataatttccgctgcaatgt |
12409949 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12409950 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
12410046 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12410047 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
12410075 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14684613 - 14684388
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14684613 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatgtggcctgcgtgacaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
14684515 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14684514 |
ttaagttgtttggttaaattgttatttaactg-ttttagattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
14684418 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14684417 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
14684388 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35613354 - 35613165
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
35613354 |
tttgctggggcctgcgtgccaaaacattttatgaattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattattaaactg-ttttgg |
35613256 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35613255 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtctatgatatttactctgataaatgtatt-agaaatttttatattaggaaaacggagtgttacaaa |
35613165 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23080953 - 23080764
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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23080764 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Original strand, 15322860 - 15323047
Alignment:
| Q |
57 |
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156 |
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15323047 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35170042 - 35169851
Alignment:
| Q |
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154 |
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35169851 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12521480 - 12521295
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
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12521295 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27709113 - 27708922
Alignment:
| Q |
53 |
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150 |
Q |
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27708922 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4771476 - 4771287
Alignment:
| Q |
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152 |
Q |
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4771287 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13282187 - 13281998
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| Q |
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
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| T |
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| T |
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13281998 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20806810 - 20806620
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
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| T |
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20806710 |
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20806620 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Original strand, 12350345 - 12350528
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
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| T |
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12350528 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 26244348 - 26244536
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
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| T |
26244348 |
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26244446 |
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| Q |
155 |
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244 |
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| |
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| T |
26244447 |
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26244536 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 242
Target Start/End: Original strand, 19942894 - 19943081
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
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| T |
19942894 |
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19942991 |
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| T |
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19943081 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 13020924 - 13021133
Alignment:
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31 |
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130 |
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13021133 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Original strand, 12300699 - 12300886
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| Q |
57 |
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155 |
Q |
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| T |
12300699 |
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| T |
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12300886 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 55794801 - 55794611
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| Q |
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
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| T |
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244 |
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| T |
55794702 |
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55794611 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 85 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14654496 - 14654337
Alignment:
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atggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgtttttta |
184 |
Q |
| |
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| T |
14654496 |
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14654398 |
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|
| Q |
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247 |
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| |
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| T |
14654397 |
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14654337 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Original strand, 14709328 - 14709512
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| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
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| T |
14709328 |
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14709426 |
T |
|
| Q |
158 |
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244 |
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| |
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| T |
14709427 |
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14709512 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 1952446 - 1952634
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154 |
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| T |
1952446 |
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1952544 |
T |
|
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155 |
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245 |
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| |
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| T |
1952545 |
attatgttgaatgtgatatcccgtttatgcatgttgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
1952634 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 28570111 - 28570298
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Q |
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| T |
28570111 |
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28570209 |
T |
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155 |
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| T |
28570210 |
attatgttaaatgtgatatccggtttatttatgctgtttactctgataattg-tttaagaaattttcatatt-ggaaaaatgggtgttaca |
28570298 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 14269174 - 14269382
Alignment:
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37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaat |
134 |
Q |
| |
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| T |
14269174 |
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14269271 |
T |
|
| Q |
135 |
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229 |
Q |
| |
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|||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |
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| T |
14269272 |
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14269367 |
T |
|
| Q |
230 |
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244 |
Q |
| |
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|
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| T |
14269368 |
aaacggggtgttaca |
14269382 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23138693 - 23138503
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacg-ttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
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| T |
23138693 |
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23138595 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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| T |
23138594 |
ggattatgttaaatgtgatatctcgtttgtttatgttgtttactctaataaatg-tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
23138503 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 9272923 - 9273110
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
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| T |
9272923 |
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9273021 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
9273022 |
atcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgatatatg-tttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
9273110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 18603417 - 18603611
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtt |
149 |
Q |
| |
|
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| T |
18603417 |
tactttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggatttttgaaataattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgtt |
18603516 |
T |
|
| Q |
150 |
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245 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
18603517 |
attggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttaagttgtttactctgat-aatagtttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
18603611 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Original strand, 18617823 - 18618016
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtt |
149 |
Q |
| |
|
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| T |
18617823 |
tactttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggatttttgaaataattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgtt |
18617922 |
T |
|
| Q |
150 |
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244 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18617923 |
attggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttaagttgtttactctgat-aatagtttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
18618016 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 19781047 - 19781233
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19781047 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttgactgtt---ggattat |
19781142 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19781143 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
19781233 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18236312 - 18236122
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
18236312 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatggatttcgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactg-atttg |
18236214 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18236213 |
gactatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtctactctgataattg-tttaagaaaaatttatattgggaaaacggggtgttacaa |
18236122 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Original strand, 18229536 - 18229730
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgac |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
18229536 |
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18229635 |
T |
|
| Q |
146 |
tgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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|
| T |
18229636 |
tgatttcggataatggtataatgtgatatcccg---tttatgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
18229730 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 42998123 - 42998331
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacg-ttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaat |
134 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
42998123 |
taactcatttgagatatgtttgatggggcctacgtgccaaaacgattttatggtttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaat |
42998222 |
T |
|
| Q |
135 |
tattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaac |
233 |
Q |
| |
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|||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
42998223 |
cgttatttaactgattt-ggattatgttaaaagtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaacgttt-aagaaattttcatattgggaaaac |
42998320 |
T |
|
| Q |
234 |
ggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
42998321 |
ggggtgttaca |
42998331 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13514765 - 13514577
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| | || ||||| |
|
|
| T |
13514765 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattatgaaataatttttgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaattg-atttgg |
13514667 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||| ||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13514666 |
attacgttgaatgtgatatcccatttatgcatgttgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
13514577 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 16244085 - 16244278
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaaga------tatttggttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16244085 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattatgacataatttccgctgcattgtttaagtaatctgtatttagttaaattgttatttaactga |
16244184 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16244185 |
ttttggattaagtttgtatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacagggtgttacaa |
16244278 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 18223061 - 18223256
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaag---atatttg---gttaaattattatttgac |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
18223061 |
tactttgatggggcctacgtgccaaaacgtttaatggattatgaaataatttccgctgcattatttaagtaaatttttgaaagttaaattgttatttaac |
18223160 |
T |
|
| Q |
146 |
tgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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|
| T |
18223161 |
tgatttcggataatgttataatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattggaaaaacggggtgttaca |
18223255 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 17153170 - 17153363
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatgg-ggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
17153170 |
tttgatggtggcctacgtgccaaaacaatttatggattatgaaataatttccgcagcattgtttaagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaactg |
17153269 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17153270 |
attttggattatgttataatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
17153363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19781498 - 19781329
Alignment:
| Q |
76 |
aaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatc |
174 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |
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| T |
19781498 |
aaacgatttatgaattatgaaacaattttccgctgcaacatttaagtcatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatc |
19781399 |
T |
|
| Q |
175 |
ccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19781398 |
ccgtttgtttatgttgtttactctgataattg-tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
19781329 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45937571 - 45937381
Alignment:
| Q |
53 |
actttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | | |
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| T |
45937571 |
actttgatggggcctacgcgccaaaagatttt-tggattatgaaataattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactactgt |
45937473 |
T |
|
| Q |
152 |
tggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
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|
| T |
45937472 |
tggattatggtaaatgtgatatcccgttgtttaagttgtttactctgat-aatagtttaagaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
45937381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22528066 - 22527934
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113 |
tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaa |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |
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| T |
22528066 |
tgtttaag-tatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataattgttttaa |
22527968 |
T |
|
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |
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|
| T |
22527967 |
gaaatttttatattgggaaagcagggtgttacaa |
22527934 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2014199 - 2014008
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55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2014199 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaattcgttgaaagttaaattgttatttaactga |
2014100 |
T |
|
| Q |
149 |
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244 |
Q |
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2014099 |
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2014008 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 3108254 - 3108447
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
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| T |
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3108349 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3108350 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgttatgttttaagaatttttttaatattgggaaaacggggtgttacaa |
3108447 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 244
Target Start/End: Original strand, 42998740 - 42998924
Alignment:
| Q |
61 |
ggggcctgcgtgccaaaacg-ttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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42998838 |
T |
|
| Q |
159 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
42998839 |
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42998924 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20114841 - 20114693
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20114841 |
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20114746 |
T |
|
| Q |
153 |
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207 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20114745 |
ggattatgatatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
20114693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 2536371 - 2536564
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2536371 |
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2536467 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2536468 |
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2536564 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 14306147 - 14306357
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
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| T |
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14306244 |
T |
|
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
|
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| T |
14306245 |
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14306340 |
T |
|
| Q |
229 |
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245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14306341 |
aaaacggggtgttacaa |
14306357 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Original strand, 16957474 - 16957568
Alignment:
| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16957474 |
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16957568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 19758308 - 19758477
Alignment:
| Q |
76 |
aaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatc |
174 |
Q |
| |
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| T |
19758308 |
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19758407 |
T |
|
| Q |
175 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || | ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
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|
| T |
19758408 |
ccgtttgtttatgttgttcactctcataattg-cttaagaaatttttatattgggaaagcggggtgttaca |
19758477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12481009 - 12480822
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12481009 |
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12480910 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12480909 |
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12480822 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12829672 - 12829463
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
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| T |
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12829575 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || |
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|
| T |
12829574 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctaataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
12829479 |
T |
|
| Q |
229 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
12829478 |
aaaacggggtgttaca |
12829463 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12474379 - 12474193
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12474379 |
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12474280 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12474279 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
12474193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23953495 - 23953353
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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23953400 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23953399 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
23953353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23960157 - 23960015
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
23960157 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggatta |
23960062 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23960061 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
23960015 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 14299550 - 14299760
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
14299550 |
taactcttttgagat-actttattggggcctacgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgttgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
14299647 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
14299648 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
14299743 |
T |
|
| Q |
229 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14299744 |
aaaacggggtgttacaa |
14299760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 205
Target Start/End: Original strand, 17963105 - 17963245
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
17963105 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagactttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
17963200 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17963201 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatg |
17963245 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 36885489 - 36885629
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
36885489 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggattac |
36885583 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36885584 |
gttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctgataaatgtt |
36885629 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15143440 - 15143348
Alignment:
| Q |
151 |
ttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15143440 |
ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
15143348 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9529849 - 9529663
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| Q |
60 |
tggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||| |
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|
| T |
9529849 |
tggggccttcgtgccaaaaacgttctatggattatgaaataatttccactgcattgtt-aagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaactgatttt |
9529751 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9529750 |
ggattatgttataatgtgatatcccgttat---tgctgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
9529663 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12528788 - 12528602
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| Q |
62 |
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154 |
Q |
| |
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| T |
12528788 |
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12528689 |
T |
|
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244 |
Q |
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| T |
12528688 |
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12528602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
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Target Start/End: Complemental strand, 13444436 - 13444323
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226 |
Q |
| |
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| T |
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13444341 |
T |
|
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13444340 |
ggaaaacggggtgttaca |
13444323 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 53432630 - 53432517
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| Q |
128 |
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226 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53432630 |
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53432535 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53432534 |
ggaaaacggggtgttaca |
53432517 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3412219 - 3412023
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| Q |
52 |
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144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||| | |
|
|
| T |
3412219 |
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3412121 |
T |
|
| Q |
145 |
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243 |
Q |
| |
|
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|
| T |
3412120 |
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3412024 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15147736 - 15147622
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15147736 |
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15147642 |
T |
|
| Q |
227 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15147641 |
ggaaaacggggtgttacaaa |
15147622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 26285643 - 26285853
Alignment:
| Q |
37 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
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|
| T |
26285643 |
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26285740 |
T |
|
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |
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|
| T |
26285741 |
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26285836 |
T |
|
| Q |
229 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26285837 |
aaaacggggtgttacaa |
26285853 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 11251263 - 11251472
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |
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|
| T |
11251263 |
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11251361 |
T |
|
| Q |
132 |
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229 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |
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| T |
11251362 |
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11251457 |
T |
|
| Q |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
11251458 |
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11251472 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 17090824 - 17090939
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| Q |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17090824 |
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17090919 |
T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17090920 |
gggaaaacggggtgttacaa |
17090939 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8384095 - 8383981
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8384095 |
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8384000 |
T |
|
| Q |
226 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gggaaaacggggtgttaca |
8383981 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 11918012 - 11918125
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11918012 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atgttt-ttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatatt |
11918106 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11918107 |
gggaaaacggggtgttaca |
11918125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Original strand, 15354029 - 15354227
Alignment:
| Q |
55 |
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147 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15354029 |
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15354128 |
T |
|
| Q |
148 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15354129 |
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15354223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 17105718 - 17105832
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| Q |
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17105718 |
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17105813 |
T |
|
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226 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17105814 |
gggaaaacggggtgttaca |
17105832 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 18025175 - 18025364
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| Q |
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152 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18025175 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
18025273 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18025274 |
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18025364 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
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| Q |
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22193897 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt----atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
22193803 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22193802 |
ggaaaacggggtgttaca |
22193785 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35668927 - 35668718
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38 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || || |
|
|
| T |
35668927 |
aactcttttgagat-actt--attgggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaagg |
35668831 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
35668830 |
ttaaatcattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgg |
35668735 |
T |
|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35668734 |
gaaaacggggtgttaca |
35668718 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 246
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| Q |
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199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctga |
15361350 |
T |
|
| Q |
200 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15361349 |
taaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttacaaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 101 - 207
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199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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15384371 |
T |
|
| Q |
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207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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taaatgtt |
15384379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 16232637 - 16232738
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tttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctga |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16232637 |
tttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctga |
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T |
|
| Q |
200 |
taaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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taaatgtt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
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Query Start/End: Original strand, 37 - 245
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37 |
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131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| | ||| ||| |||| |
|
|
| T |
21333287 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactgttttatggattacaaactaaattccgctgcaacgtttgaaataattgttgaagtta |
21333189 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaa-tgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
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T |
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245 |
Q |
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|
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| T |
21333093 |
aaatggggtgttacaa |
21333078 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
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Target Start/End: Original strand, 36134610 - 36134829
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125 |
Q |
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36134708 |
T |
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219 |
Q |
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| T |
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36134804 |
T |
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244 |
Q |
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| T |
36134805 |
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T |
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Target: chr4; HSP #80
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225 |
Q |
| |
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8049393 |
T |
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245 |
Q |
| |
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| T |
8049394 |
gggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #81
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148 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |
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| T |
16352504 |
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16352603 |
T |
|
| Q |
149 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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16352696 |
T |
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Target: chr4; HSP #82
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225 |
Q |
| |
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T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
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gggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #83
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226 |
Q |
| |
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51494738 |
T |
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| Q |
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244 |
Q |
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| T |
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51494756 |
T |
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Target: chr4; HSP #84
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226 |
Q |
| |
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| T |
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6874304 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||| |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #85
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225 |
Q |
| |
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| T |
8055912 |
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8056006 |
T |
|
| Q |
226 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
8056007 |
gggaaaacggggtgttaca |
8056025 |
T |
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Target: chr4; HSP #86
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Q |
| |
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| T |
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10612678 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
10612679 |
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10612765 |
T |
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Target: chr4; HSP #87
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158 |
Q |
| |
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| T |
16206908 |
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16207003 |
T |
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| Q |
159 |
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207 |
Q |
| |
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| T |
16207004 |
cattatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
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T |
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Target: chr4; HSP #88
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| Q |
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230 |
Q |
| |
|
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| T |
39122029 |
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39121935 |
T |
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| Q |
231 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
39121934 |
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T |
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Target: chr4; HSP #89
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128 |
Q |
| |
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18294908 |
T |
|
| Q |
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227 |
Q |
| |
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| T |
18294907 |
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18294813 |
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|
| Q |
228 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
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| T |
18294812 |
gaaaacggggtgttaca |
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Target: chr4; HSP #90
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Q |
| |
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||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| |
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| T |
23645229 |
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T |
|
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176 |
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244 |
Q |
| |
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|
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T |
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Q |
| |
|
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| T |
387162 |
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T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
387258 |
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T |
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Target: chr4; HSP #92
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Q |
| |
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| T |
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|
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244 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
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tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
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T |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17807615 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
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| T |
29041707 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
29041802 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29041803 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
29041851 |
T |
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Target: chr4; HSP #95
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Q |
| |
|
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|
| T |
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tttccgctgctatgttaaagatattttgtgaaggttaaattattacttaactgtctttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtt-tta |
48761326 |
T |
|
| Q |
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ctctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48761325 |
ctctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #96
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226 |
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| |
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|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |
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gttaaatttttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttg |
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T |
|
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ggaaaacggggtgttacaaaaac |
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Q |
| |
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Target Start/End: Complemental strand, 16396504 - 16396390
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128 |
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225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16396504 |
gttaaattattatttaactgtttttttgattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgatt-aagaaatttgtatatt |
16396409 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16396408 |
gggaaaacggggtgttaca |
16396390 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #98
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8390750 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
8390655 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaa |
231 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
8390654 |
gggaaa |
8390649 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #99
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| Q |
16 |
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91 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14676333 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatgtgacctgcgtgccaaagcgttttatggatt |
14676259 |
T |
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Target: chr4; HSP #100
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| Q |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
15255906 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatctcgttt---atggtttttac |
15255811 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15255810 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
15255762 |
T |
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
20616949 |
gttaaattgttatttaactatttttagattatgtgaaatgtgatatcccg---tttgtgatgtttactctgatttatg--ttaacaaatttttatgttgg |
20617043 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20617044 |
gaaaacggggtgttaca |
20617060 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #102
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| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
33198900 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgattt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
33198805 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33198804 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
33198756 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #103
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12338797 |
atgtgatatccc---ttttatgttgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
12338871 |
T |
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Target: chr4; HSP #104
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23842736 |
atgtgatatcccgtttt--atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacagggtgttacaa |
23842660 |
T |
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Target: chr4; HSP #105
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
13568839 |
gttaaattgttatttgactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccg---tttatgatgtttactctgat--atttgttaagaaatttttatgttgg |
13568746 |
T |
|
| Q |
228 |
g-aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13568745 |
gaaaaacggggtgttacaa |
13568727 |
T |
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Target: chr4; HSP #106
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| Q |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40453076 |
ttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Target: chr4; HSP #107
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| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatattt-----ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
17162652 |
tttccgctgctatgttaaagatatttatgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
17162557 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattagg-aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17162556 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattggggaaaacggggtgttaca |
17162507 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #108
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| Q |
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tttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40477344 |
tttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactttgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
40477250 |
T |
|
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||| | ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
12569358 |
gttaaattgttatttaactattttag-attatgtgaaatgtgatatcccgtttt--atgatgtttattctgataattgtt--aagaaatttttatgttga |
12569264 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
12569263 |
aaaaacggggtgttaca |
12569247 |
T |
|
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Target: chr4; HSP #110
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| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19242309 |
atgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgttt--agaaattttcgtattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
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gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgctg |
15092976 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15092975 |
ggaaaatggggtgttaca |
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T |
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Target: chr4; HSP #112
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || | | |||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
15122628 |
gttaaattgttatttaactatttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttttgtgatgtttactct--tatttttgttaagaaattttttatgttg |
15122723 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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Q |
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||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3095642 |
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T |
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| Q |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7902019 |
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T |
|
| Q |
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ggaaaacggggtgt |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
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Q |
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|
|
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Q |
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|
|
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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Q |
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|
|
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| |
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|
|
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Target Start/End: Complemental strand, 14157037 - 14157000
Alignment:
| Q |
208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14157037 |
ttaagaaatttttacattgggaaaacggggtgttacaa |
14157000 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15366924 - 15366872
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15366924 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttcggaaaacggggtgttaca |
15366872 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 16957356 - 16957396
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaa |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16957356 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaaa |
16957396 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #125
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Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12485611 - 12485575
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaa |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12485611 |
gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaaaa |
12485575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 245
Target Start/End: Original strand, 19619123 - 19619155
Alignment:
| Q |
213 |
aaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19619123 |
aaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
19619155 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0259 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:
Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9613 - 9387
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9613 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattatattgatggggcctgggtgccaaaacgttttatggatcatgatataatttccgctgcgatgt |
9514 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9513 |
ttaagttattttgttaaattattatttaactg-tttgggattatg-tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaggaaa |
9416 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9415 |
tttttatattgggaaaacggggtgttaca |
9387 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 110)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7540060 - 7539849
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7540060 |
ttgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgcatgccaaaacatcttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
7539961 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
7539960 |
aaattattatttaactg--tttggattatgttatatgtgatattccgttgtttatgatgtttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
7539863 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
7539862 |
aacggggtgttaca |
7539849 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 6017906 - 6018131
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6017906 |
atgctatt-gtgatattgaactaactcttttgagattattttgatggggcctgtgtaccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatga |
6018003 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6018004 |
ttaagatatttggttaaattattatttaactatttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaa |
6018102 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6018103 |
tttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
6018131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11261771 - 11261546
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11261771 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttgagattatattgatggggcctgcgtgccaaaacgtattatggattataatataatttccgctgcaatgt |
11261672 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11261671 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatattccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
11261575 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11261574 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
11261546 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18530681 - 18530455
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18530681 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttttaagattattttgatgggacctgcgtgccaaaacgtcttatg-attatgatataattttcgctgcaatgt |
18530583 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18530582 |
ttacgataattggttaaattattatttaactgtttt-ggattctgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaa |
18530484 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18530483 |
tttgtatattgggaaaacagggtgttaca |
18530455 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13143288 - 13143071
Alignment:
| Q |
25 |
gtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatat |
124 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13143288 |
gtgatattgaactaactcctttgagattattctgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttctgctgcaatgattaagatat |
13143190 |
T |
|
| Q |
125 |
ttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatat |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13143189 |
ttggttaaattattatttaactgtttt-ggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctaataaatgatttaagaaatttgtatat |
13143091 |
T |
|
| Q |
225 |
taggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13143090 |
tggaaaaacggggtgttaca |
13143071 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9409333 - 9409146
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
9409333 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttt-gg |
9409236 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9409235 |
attatgttttatgtgatatcccgttgtctaagatgcttactctgataaatgatttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
9409146 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26419442 - 26419217
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26419442 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatggggcctctgtgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
26419344 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26419343 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
26419247 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26419246 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
26419217 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12691938 - 12691713
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12691938 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatgaggcctgcgtgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
12691840 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
12691839 |
ttaagttatttggttaaattgttaattaactg-ttttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctaataattgttt--agaaa |
12691743 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12691742 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
12691713 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 25045272 - 25045496
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25045272 |
atgctatttgtgatattgaactaactattt-gagattatattgatggagcctgcgtgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
25045370 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25045371 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggactatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
25045467 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25045468 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
25045496 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 44408973 - 44409200
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44408973 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatggggcctgtgtgccaaagcgttttatggattatgaaataatttccgctgcaatgt |
44409071 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaa |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
44409072 |
ttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggatttttgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataaatgtttt-agaa |
44409170 |
T |
|
| Q |
215 |
atttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44409171 |
atttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
44409200 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 4319306 - 4319493
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
4319306 |
tttgatggggtctgtgtgccaaaacgttttatggattatgacataatttccactgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
4319404 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4319405 |
attatgttatatgtgatatcctgttgtttatgatgcttactctgataaatgttataag-aatttttatattgtgaaaatggggtgttaca |
4319493 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 245
Target Start/End: Original strand, 23520734 - 23520920
Alignment:
| Q |
57 |
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156 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
23520734 |
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245 |
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23520920 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8916848 - 8916657
Alignment:
| Q |
52 |
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151 |
Q |
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| T |
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T |
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244 |
Q |
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8916657 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15770482 - 15770298
Alignment:
| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
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T |
|
| Q |
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244 |
Q |
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| T |
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15770298 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 18586045 - 18586229
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
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| T |
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T |
|
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245 |
Q |
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| T |
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18586229 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Original strand, 18554304 - 18554487
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
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| T |
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18554401 |
T |
|
| Q |
158 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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18554487 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10874869 - 10874663
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatta |
136 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
137 |
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236 |
Q |
| |
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| T |
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| Q |
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245 |
Q |
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| T |
10874671 |
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10874663 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8705330 - 8705146
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
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| T |
8705330 |
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8705233 |
T |
|
| Q |
158 |
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245 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
8705232 |
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8705146 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10868789 - 10868580
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatta |
136 |
Q |
| |
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| T |
10868789 |
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10868691 |
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|
| Q |
137 |
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236 |
Q |
| |
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| T |
10868690 |
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248 |
Q |
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| T |
10868591 |
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10868580 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19729233 - 19729044
Alignment:
| Q |
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152 |
Q |
| |
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| T |
19729233 |
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19729136 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
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| T |
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19729044 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35151055 - 35150866
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| Q |
55 |
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153 |
Q |
| |
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| T |
35151055 |
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35150956 |
T |
|
| Q |
154 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
35150955 |
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35150866 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8712001 - 8711817
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
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| T |
8712001 |
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8711904 |
T |
|
| Q |
158 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
8711903 |
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8711817 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16274940 - 16274752
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
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| T |
16274940 |
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16274842 |
T |
|
| Q |
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244 |
Q |
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| T |
16274841 |
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16274752 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 246
Target Start/End: Original strand, 10492195 - 10492382
Alignment:
| Q |
59 |
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157 |
Q |
| |
|
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| T |
10492195 |
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10492293 |
T |
|
| Q |
158 |
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246 |
Q |
| |
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|
| T |
10492294 |
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10492382 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 48814207 - 48814394
Alignment:
| Q |
56 |
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154 |
Q |
| |
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| T |
48814207 |
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48814305 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
| T |
48814306 |
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48814394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13461178 - 13460986
Alignment:
| Q |
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
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| T |
13461178 |
tttgatggggcctacgtgccaaattgttttatggatttcgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-atttg |
13461080 |
T |
|
| Q |
154 |
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247 |
Q |
| |
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| T |
13461079 |
gattatgttaaatgtgatatcctgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgtaacaaaa |
13460986 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 248
Target Start/End: Original strand, 40524121 - 40524302
Alignment:
| Q |
64 |
gcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta |
163 |
Q |
| |
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| T |
40524121 |
gcctgcgtgccaaaacgttttacg-attatgat----tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttgactgtt---ggattatgtta |
40524211 |
T |
|
| Q |
164 |
tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaa |
248 |
Q |
| |
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| T |
40524212 |
tatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttacaaaaa |
40524302 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 14141095 - 14141282
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56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
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| T |
14141095 |
ttgatggggcctacgtgccaaaacgatttgtggatttcgaaacaactttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactgattt-gg |
14141193 |
T |
|
| Q |
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attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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| T |
14141194 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttatttatgttgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
14141282 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
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59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
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| T |
15727732 |
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15727633 |
T |
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157 |
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244 |
Q |
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| T |
15727632 |
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15727545 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 16408050 - 16408234
Alignment:
| Q |
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159 |
Q |
| |
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|
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| T |
16408050 |
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16408145 |
T |
|
| Q |
160 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
16408146 |
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16408234 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13683813 - 13683621
Alignment:
| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
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|
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| T |
13683813 |
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13683718 |
T |
|
| Q |
153 |
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245 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
13683717 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt--gatgtttactctgataaatgttatgttttaagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttacaa |
13683621 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13690444 - 13690252
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
13690444 |
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13690349 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt-----ttaagaaattttta-tattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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| T |
13690348 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt--gatgtttactctgataaatgttatgttttaagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttacaa |
13690252 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9592766 - 9592578
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
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| T |
9592766 |
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9592668 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
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|||| ||| |||||||||||| ||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
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| T |
9592667 |
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9592578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Original strand, 16725322 - 16725510
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
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| T |
16725322 |
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16725419 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
16725420 |
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16725510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Original strand, 17702336 - 17702524
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17702336 |
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17702433 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17702434 |
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17702524 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11979470 - 11979278
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagata-tttg-----gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||| |||||| |||| |
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|
| T |
11979470 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggtttatgaaataatttccgctgcaacgattaagttaatttgttaaagttaaattgttatttaactga |
11979371 |
T |
|
| Q |
149 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11979370 |
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11979278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6800632 - 6800440
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
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| T |
6800632 |
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6800534 |
T |
|
| Q |
154 |
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245 |
Q |
| |
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|
| T |
6800533 |
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6800440 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14207647 - 14207462
Alignment:
| Q |
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156 |
Q |
| |
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|
| T |
14207647 |
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14207548 |
T |
|
| Q |
157 |
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242 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14207547 |
tatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaat-atttaagaaattttaatattgggaaaacggggtgtta |
14207462 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14216337 - 14216152
Alignment:
| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| | | |
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|
| T |
14216337 |
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14216238 |
T |
|
| Q |
157 |
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242 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14216237 |
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14216152 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11365548 - 11365400
Alignment:
| Q |
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152 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11365548 |
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11365453 |
T |
|
| Q |
153 |
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207 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11365452 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Original strand, 16727398 - 16727540
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| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctga |
199 |
Q |
| |
|
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| T |
16727398 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatcgttatttaactgattt-ggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
16727496 |
T |
|
| Q |
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244 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16727497 |
taaatg-tttaagaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
16727540 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Original strand, 17704470 - 17704612
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctga |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
17704470 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatcgttatttaactgattt-ggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
17704568 |
T |
|
| Q |
200 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
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|
| T |
17704569 |
taaatg-tttaagaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
17704612 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17246733 - 17246547
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17246733 |
gggcctgcgtgctaaaacgtttcatgaattatggttatgattttccgccgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattac |
17246638 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17246637 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggagtgttaca |
17246547 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 15156906 - 15157116
Alignment:
| Q |
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taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
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| T |
15156906 |
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15157003 |
T |
|
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
|
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| T |
15157004 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
15157099 |
T |
|
| Q |
229 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
15157100 |
aaaacggggtgttacaa |
15157116 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 15163557 - 15163767
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37 |
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129 |
Q |
| |
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| T |
15163557 |
taactcttttgagat-actttattggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagt |
15163654 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
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| T |
15163655 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
15163750 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15163751 |
aaaacggggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 11548947 - 11549160
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31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt----t |
126 |
Q |
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| T |
11548947 |
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11549045 |
T |
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225 |
Q |
| |
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11549140 |
T |
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226 |
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245 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11549141 |
gggaaaacggggtgttacaa |
11549160 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14952919 - 14952784
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| Q |
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206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14952919 |
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14952821 |
T |
|
| Q |
207 |
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242 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14952820 |
tttaagaaattttttatgttgggagaacggggtgtta |
14952784 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14958855 - 14958720
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| Q |
111 |
aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgtttt |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| |
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| T |
14958855 |
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14958757 |
T |
|
| Q |
210 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14958756 |
aagaaattttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
14958720 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 244
Target Start/End: Original strand, 20480 - 20561
Alignment:
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atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20480 |
atatgtgatatcccattgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
20561 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 11239844 - 11239959
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| Q |
127 |
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
11239844 |
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11239939 |
T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239940 |
gggaaaacggggtgttacaa |
11239959 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 14152664 - 14152884
Alignment:
| Q |
26 |
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125 |
Q |
| |
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| T |
14152664 |
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14152762 |
T |
|
| Q |
126 |
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218 |
Q |
| |
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| T |
14152763 |
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14152858 |
T |
|
| Q |
219 |
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244 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
14152859 |
ttatattgggaaaacggggtgttaca |
14152884 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15380512 - 15380377
Alignment:
| Q |
108 |
tgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgt |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15380512 |
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15380414 |
T |
|
| Q |
207 |
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242 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15380413 |
tttaagaaattttttatgttgggagaacggggtgtta |
15380377 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 18165431 - 18165573
Alignment:
| Q |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
18165431 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
18165526 |
T |
|
| Q |
159 |
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207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18165527 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
18165573 |
T |
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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 14183293 - 14183513
Alignment:
| Q |
26 |
tgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt |
125 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
14183293 |
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14183391 |
T |
|
| Q |
126 |
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219 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
14183392 |
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14183487 |
T |
|
| Q |
220 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14183488 |
tatattgggaaaacggggtgttacaa |
14183513 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 11725765 - 11725957
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11725765 |
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11725860 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11725861 |
ggattacgatatatgtgatatcccgttgat--tgatgtttactctgataaatgttatgctttaagaaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
11725957 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 14170984 - 14171203
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| Q |
26 |
tgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt |
125 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
14170984 |
tgatattgaattaactcatttgaaat-attttgatggggcctatgtgccaaaatgatttatggttttcgaattaatttccgctgcaacgtttgaaatatt |
14171082 |
T |
|
| Q |
126 |
tg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttt |
219 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14171083 |
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14171178 |
T |
|
| Q |
220 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14171179 |
tatattgggaaaacggggtgttaca |
14171203 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 11233157 - 11233272
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| Q |
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11233157 |
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11233252 |
T |
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226 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11233253 |
gggaaaacgggatgttacaa |
11233272 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1346739 - 1346625
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| Q |
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1346739 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgttactatgtgatatcccattt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatatt |
1346644 |
T |
|
| Q |
226 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1346643 |
gggaaaacggggtgttaca |
1346625 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 11555543 - 11555755
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt----t |
126 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
11555543 |
ttgaattaactcatttgagat-attttggtggggcctacgtgccaaaatgatttatggattacgaactaatttccgctgcaacgtttgaaatattgttaa |
11555641 |
T |
|
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
11555642 |
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11555736 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11555737 |
gggaaaacggggtgttaca |
11555755 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 16458042 - 16458235
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-------gttaaattattatttgact |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
16458042 |
tttgatggggccttcgtgccaaaacgatttatggatttcgaaacaattttccgctgcattgtttaagttaatttattgaaagttaaattgttatttaact |
16458141 |
T |
|
| Q |
147 |
gtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16458142 |
gattttggactatgttataatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgctt--agaaatttttatattgggaaaacagggtgttaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14336697 - 14336582
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14336697 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
14336602 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14336601 |
gggaaaacggggtgttacaa |
14336582 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 23255 - 23367
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128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23255 |
gttaaattgttatttaactgattttggattatgttataatgtgatatcccg---tttatgctgtttactctaataaatgttt--agaaattttcatattg |
23349 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23350 |
ggaaaacggggtgttaca |
23367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6336430 - 6336288
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| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
6336430 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggatta |
6336335 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6336334 |
cgttatatgtgatatcccattgttta--ataattactctgataaatgtt |
6336288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14330114 - 14330000
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
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Q |
| |
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| T |
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14330019 |
T |
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226 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
14330018 |
gggaaaacggggtgttaca |
14330000 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17053429 - 17053287
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158 |
Q |
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| T |
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17053334 |
T |
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| Q |
159 |
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207 |
Q |
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| T |
17053333 |
cgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
17053287 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18556391 - 18556198
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| Q |
55 |
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147 |
Q |
| |
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| T |
18556391 |
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18556294 |
T |
|
| Q |
148 |
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246 |
Q |
| |
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| T |
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tttttggattatgttataatgtgatatcccgttat---tgctgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgagaaaacagggtgttacaaa |
18556199 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 20570317 - 20570510
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| Q |
55 |
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148 |
Q |
| |
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| T |
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20570416 |
T |
|
| Q |
149 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
20570417 |
ttttggactatgtttcgaatgtgatatcccgttatt--tgatgtttactctgacaattgttt--agaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
20570510 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
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Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 9511765 - 9511906
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| Q |
62 |
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158 |
Q |
| |
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| T |
9511765 |
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9511859 |
T |
|
| Q |
159 |
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207 |
Q |
| |
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| T |
9511860 |
cgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgcttactctgataaatgtt |
9511906 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32766952 - 32766839
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| Q |
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226 |
Q |
| |
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| T |
32766952 |
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32766857 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
32766856 |
ggaaaacggggtgttaca |
32766839 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 12704189 - 12704290
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| Q |
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199 |
Q |
| |
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| T |
12704189 |
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12704282 |
T |
|
| Q |
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207 |
Q |
| |
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| T |
12704283 |
taaatgtt |
12704290 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18182058 - 18181942
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgttttt-ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatat |
224 |
Q |
| |
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| T |
18182058 |
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18181963 |
T |
|
| Q |
225 |
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245 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||| |
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| T |
18181962 |
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18181942 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 23439395 - 23439513
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
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| T |
23439395 |
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23439490 |
T |
|
| Q |
227 |
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249 |
Q |
| |
|
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| T |
23439491 |
ggaaaacggggtgttacagaaac |
23439513 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 49050730 - 49050545
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| Q |
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154 |
Q |
| |
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| T |
49050730 |
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49050632 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
49050631 |
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49050545 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15021489 - 15021281
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129 |
Q |
| |
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| T |
15021489 |
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15021393 |
T |
|
| Q |
130 |
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228 |
Q |
| |
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| T |
15021392 |
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15021297 |
T |
|
| Q |
229 |
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244 |
Q |
| |
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|
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| T |
15021296 |
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15021281 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42203392 - 42203200
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatattt-------ggttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
42203392 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttttgaattaattccgctgcaatgtttaagatattttcttgaaagttaagttgttatttaactg |
42203293 |
T |
|
| Q |
148 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
42203292 |
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42203200 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 61387 - 61500
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225 |
Q |
| |
|
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|
| T |
61387 |
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61481 |
T |
|
| Q |
226 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
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| T |
61482 |
gggaaaacggggtgttaca |
61500 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18175386 - 18175271
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgttttt-ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatat |
224 |
Q |
| |
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| T |
18175386 |
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18175291 |
T |
|
| Q |
225 |
taggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18175290 |
tgggaaaacggggtgttaca |
18175271 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
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| Q |
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taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20703724 |
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20703821 |
T |
|
| Q |
130 |
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224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
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| T |
20703822 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatg-tttaagaaatttgtatat |
20703913 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Original strand, 20871768 - 20871957
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| Q |
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taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20871768 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaactgatttatgatttctgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
20871865 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatat |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
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|
| T |
20871866 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatg-tttaagaaatttgtatat |
20871957 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
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Query Start/End: Original strand, 38 - 245
Target Start/End: Original strand, 44787201 - 44787410
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| Q |
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128 |
Q |
| |
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|
| T |
44787201 |
aactcttttgagat-actt--attgggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaagg |
44787297 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |
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| T |
44787298 |
ttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgg |
44787392 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44787393 |
gaaaacggggtgttacaa |
44787410 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
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Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5733705 - 5733492
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37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
5733705 |
taactcttttgagat-actttgttggggtctgcgtgccaaactgatttatgatttctgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
5733608 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgttt----ttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatat |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
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|
| T |
5733607 |
taaattattatttaactgtttgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatat |
5733512 |
T |
|
| Q |
225 |
taggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5733511 |
tgggaaaacggggtgttaca |
5733492 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15580086 - 15579892
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacg-ttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgact |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| | | |
|
|
| T |
15580086 |
tttgatggggcctacgtggcaaaacgattttatggatttcgattgaatttccgctgcattgtttacgatattttgttgaaagttaaattgttatttaatt |
15579987 |
T |
|
| Q |
147 |
g-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15579986 |
gatttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgctt--agaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
15579892 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
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Target Start/End: Original strand, 44793842 - 44794050
Alignment:
| Q |
38 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || || |
|
|
| T |
44793842 |
aactcttttgagat-actt--attgggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaagg |
44793938 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
44793939 |
ttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgg |
44794033 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44794034 |
gaaaacggggtgttaca |
44794050 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20980 - 20836
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| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
20980 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
20885 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20884 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
20836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 9446880 - 9447073
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-------gttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
9446880 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgacttatggatttttgaattaactccgctgcaatgtttaagatattttcttgaaagttaaattgttatttaactg |
9446979 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9446980 |
tttaccgattatgtttgaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgataattgtttt--gaaatttttatgttggtaaaacggggtgttacaa |
9447073 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
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| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11857834 |
gattatgtgaaatgtgatatcccgtttt--atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgtta |
11857750 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 13148575 - 13148402
Alignment:
| Q |
55 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
13148575 |
tttgatggggcctacgtgtcaaaatgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaattcgttgaaagttaaattgttatttaactga |
13148476 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || |||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13148475 |
ttttgtattaagtttgtatgtgatatcccg---tttatgctgttttctctaataaatgttt--agaaattttcatatta |
13148402 |
T |
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Target: chr7; HSP #88
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Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 11857148 - 11857225
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| Q |
125 |
ttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11857148 |
ttggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
11857225 |
T |
|
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Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 16494598 - 16494523
Alignment:
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16494598 |
atgtgatatcccgttt---atgttgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
16494523 |
T |
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Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
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Target Start/End: Original strand, 15164505 - 15164558
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15164505 |
ttactctgataaatgttt-aagaaatttttatcttgggaaaacggggtgttacaa |
15164558 |
T |
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Target: chr7; HSP #91
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
9702600 |
gttaaattgttatttgactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccg---tttatgatgtttactctgat--atttgttaagaaatttttatgttgg |
9702507 |
T |
|
| Q |
228 |
g-aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9702506 |
gaaaaacggggtgttacaa |
9702488 |
T |
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Target: chr7; HSP #92
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaacaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12317437 |
ttactctgataaatattt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaacaacaa |
12317379 |
T |
|
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Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
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Target Start/End: Original strand, 14656241 - 14656320
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| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttt |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14656241 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt |
14656320 |
T |
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Target: chr7; HSP #94
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| Q |
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227 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
14125798 |
gttaaagtgttatttaactgtttttagattatgtgaaaggtgatatcccgtttgt---gatgtttaccctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
14125704 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14125703 |
gaaaacggggtgttaca |
14125687 |
T |
|
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Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
14429194 |
gttaaagtgttatttaactgtttttagattatgtgaaaggtgatatcccgtttgt---gatgtttaccctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
14429100 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14429099 |
gaaaacggggtgttaca |
14429083 |
T |
|
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Target: chr7; HSP #96
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15144925 |
ttactctgataaatgttt-aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgtta |
15144975 |
T |
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Target: chr7; HSP #97
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| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
8202882 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
8202977 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaac |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
8202978 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaac |
8203015 |
T |
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Target: chr7; HSP #98
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| Q |
166 |
tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16403276 |
tgtgatatcccgttat--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttacaa |
16403352 |
T |
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| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1860791 |
ttttatgaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
1860829 |
T |
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| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13920380 |
ttttatgaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
13920418 |
T |
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39720470 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaaa |
39720436 |
T |
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| Q |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47830998 |
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47830947 |
T |
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2759371 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
2759338 |
T |
|
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11773123 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
11773156 |
T |
|
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaacaac |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38226677 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaatggggtgttacataaacaac |
38226617 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40442704 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaa |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Original strand, 16552092 - 16552124
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16552092 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
16552124 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16613570 - 16613538
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16613570 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
16613538 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 32217328 - 32217439
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| || ||||||| | |||| |||||| |||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
32217328 |
gttaaattgttatttgactatttatg-attatgtgaaatgtaatatcctgttt---atgatgtttactctgat--atttgttaagaaatttttatgttgg |
32217421 |
T |
|
| Q |
228 |
g-aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32217422 |
gaaaaacggggtgttaca |
32217439 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8727 - 8539
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
8727 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccactgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
8629 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8628 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaatggggtgttaca |
8539 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 81915 - 82102
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| || |||| | ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
81915 |
ttgatggggcctacgtgccaaa-cgatttacgaattatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatttttatttaactg-atttgg |
82012 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatg-cttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
82013 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttatctatgttgttttactctgataaaggttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
82102 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 244
Target Start/End: Original strand, 119592 - 119774
Alignment:
| Q |
63 |
ggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatg |
160 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
119592 |
ggcctacgtgccaaaaacgatttatggtttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatttttatttaactg-atttggattatg |
119690 |
T |
|
| Q |
161 |
ttatatgtgatatcccgttt-tttatgatg-cttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
119691 |
ttaaatgtgatatcccgtttatctatgttgttttactctgataaaggttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
119774 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Original strand, 3476 - 3551
Alignment:
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3476 |
atgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
3551 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 85655 - 85769
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttg-gattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
85655 |
gttaaattattatttaactattttttagattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatatt |
85750 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
85751 |
gggaaaacggggtgttaca |
85769 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 153891 - 153682
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
153891 |
ttgaactaactcttttgagattattttgatggtgcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgattaagatatttggtt |
153793 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
153792 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
153694 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
153693 |
aacggggtgtta |
153682 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 40454 - 40565
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
40454 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaatggtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
40548 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40549 |
gaaaacggggtgttaca |
40565 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 74174 - 74285
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
74174 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaatggtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
74268 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
74269 |
gaaaacggggtgttaca |
74285 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0098 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:
Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9375 - 9163
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9375 |
ttgaactaactcctttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatg-attatgatataattttccgctgcaatgtttaagatatttggt |
9277 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
9276 |
taaatcattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgcttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattggga |
9178 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |
|
|
| T |
9177 |
aaacggagtgttaca |
9163 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0089 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:
Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 20322 - 20534
Alignment:
| Q |
31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20322 |
ttgaactaactcttttgagattatcttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgcttcaaagtttaagttatttggtt |
20421 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20422 |
aaattatcatttaactg-ttttggattatgctatatgtgatatcccg-ttgttatgatgcttactctgatatatgttttaagaaatttttatattgggaa |
20519 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
20520 |
aacggggtgttacaa |
20534 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 9)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4977 - 4788
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
4977 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattttcgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
4879 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4878 |
attattttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacagggtgttacaa |
4788 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40661 - 40548
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40661 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
40566 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40565 |
ggaaaacggggtgttaca |
40548 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46202 - 46090
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46202 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgatatatgttt--agaaatttttacattt |
46108 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46107 |
ggaaaacggggtgttaca |
46090 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 59899 - 59757
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
59899 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggattt |
59804 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
59803 |
cgttatatgtgatatcccgttgct--tgatgtttgctctgataaatgtt |
59757 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 9255 - 9332
Alignment:
| Q |
168 |
tgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9255 |
tgatatcccgtttgtttatgatgtttactctgataactgttt-aaggaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
9332 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 19489 - 19601
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| || |||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
19489 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttctgtgatgtttactctgataattg--ttaagacatttttatgttgg |
19584 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19585 |
gaaaacggggtgttaca |
19601 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46508 - 46394
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
46508 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
46413 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46412 |
gggaaaacggggtgttaca |
46394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 56226 - 56338
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128 |
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || | ||||| |||||||||| | | ||||||||||| || || | |
|
|
| T |
56226 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttctgtgatgtttactctgat--ttttgctaagaaattttaatgttgg |
56321 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56322 |
gaaaacggggtgttaca |
56338 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33247 - 33134
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||| | | |||| || ||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
33247 |
gttaaattgttatttacctgtttttagcttatgtgaaatgtgatatcccgttctgt--gatgtttgctctgatttttgtt--aagaaatttttatgttgg |
33152 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33151 |
gaaaacggggtgttacaa |
33134 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0862 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0862
Description:
Target: scaffold0862; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
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| Q |
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130 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4729 |
ttgaactaactcctttgagattattttgatggggcctgcgtgccaaaatgttttatg-attatgatataatttccgctacaatgtttaagatatttggtt |
4631 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatg-atgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
4630 |
aaattattatttaactg-ttttggattttgttatatgtgatatcccgttgtttatgaatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattggga |
4532 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
4531 |
aaacggggtgttaca |
4517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
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Target Start/End: Complemental strand, 241500 - 241276
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| Q |
16 |
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115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
241500 |
atgctatt-gtgatattgaactaactcttttgagattatattgatggggcctgcgtgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
241402 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
241401 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactttgataaatgttt--agaaa |
241305 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
241304 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
241276 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9116 - 8925
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| Q |
55 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
9116 |
tttgatgggtcctacgtgccaaaacgatttatggattaagaaataatttccgctgcaatgtttaagatatttgttgaaagttaaattgttatttaactga |
9017 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9016 |
ttttcgattatgttataatgtgatatcccgtttgt---gctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
8925 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15872 - 15680
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15872 |
tttgatggggcctacgtgtcaaaacgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagatatttgttgaaagttaaattgttatttaactga |
15773 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15772 |
ttttggattatgttataatgtgatatcccg---tttgtgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattggaaaaatggggtgttacaa |
15680 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22636 - 22444
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
22636 |
tttgatggggcctacgtgtcaaaacgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagatatttgttgaaagttaaattgttatttaactga |
22537 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22536 |
ttttggattatgttataatgtgatatcccg---tttgtgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattggaaaaatggggtgttacaa |
22444 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0358 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0358
Description:
Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14382 - 14194
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| || |
|
|
| T |
14382 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttaattaactgtttt-gg |
14284 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14283 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttgtgatgcttactctgataaatgtcttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
14194 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Original strand, 3338 - 3532
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| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaac-gttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| || || || ||| |
|
|
| T |
3338 |
tgatgaggcctgcgtgccaaaaccgatttatggattacgaactaaattccgctgcaatgttaagaatattatgttaaatcattatttaaccgtctt-gga |
3436 |
T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg--------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3437 |
ttatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgc-tactctgataaatgctatgttttttaaagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttaca |
3532 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10266 - 10206
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| Q |
180 |
ttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtt |
241 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10266 |
ttttatgttgtttactctgataaatgttttt-gaaatttttatgttgggaaaacggggtgtt |
10206 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0358; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3979 - 3904
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| Q |
166 |
tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3979 |
tgtgatatcccgttat--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttatgttgggaaaacagggtgttaca |
3904 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0096 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:
Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15947
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31 |
ttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15737 |
ttgaactaactcttt-gagattattttggtggggccttcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttacgctgcaatgattaagatatttggtt |
15834 |
T |
|
| Q |
131 |
aaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaa |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15835 |
aaattattatttaactgtttt-ggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaa |
15933 |
T |
|
| Q |
231 |
aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
15934 |
aacggggtgttaca |
15947 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
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Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34185 - 33996
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| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || |
|
|
| T |
34185 |
tttgatggggcttgcgtgccgaaactttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaatttttatttaactgtttt-gg |
34087 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34086 |
attatgttatatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaaccgggtgttacaa |
33996 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0656 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:
Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 746 - 557
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| Q |
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
746 |
tttgatggggcttgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggtttaattattatttaactg-ttttgg |
648 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
647 |
attatgttatatgtgatatctcgttgtttgtgatgcttactctgataaatgtctgaagaaatttttatattgggaaaacagggtgttacaa |
557 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0048 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:
Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 9576 - 9754
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| Q |
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cctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttat |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9576 |
cctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttcactgcttt-ggattatgttat |
9673 |
T |
|
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9674 |
atgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgatttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
9754 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0242 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:
Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
19141 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacattttatggattataatataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttgga |
19043 |
T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19042 |
ttatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
18956 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0242; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25288 - 25103
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56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||| |
|
|
| T |
25288 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacattttatggattataatataatttccgctgcaatgtttaatttatttggttaaattgttattt-atttgttttgga |
25190 |
T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25189 |
ttatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
25103 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 57 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 56441 - 56256
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
56441 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgt-ttatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt-ggat |
56345 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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|
| T |
56344 |
tatgttttatgtgatatcctgttgtttgtgatgtttactctgataaatgatttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
56256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40934 - 40749
Alignment:
| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
40934 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgtct-atgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt-ggat |
40838 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40837 |
tatgttttatgtgatatcctgttgtttgtgatgtttactctgataaatgatttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
40749 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22442 - 22232
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
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|||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
22442 |
taactcatttgagat-attttgatggagcctacgtgccaaactgatttatggattacgaactaaattccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagtta |
22344 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaa-tgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
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| T |
22343 |
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22249 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22248 |
aaaacggggtgttacaa |
22232 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6389 - 6179
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
6389 |
taactcatttgagat-attttgatggagcctacgtgccaaactgatttatggattacgaactaaattccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagtta |
6291 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaa-tgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6290 |
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6196 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6195 |
aaaacagggtgttacaa |
6179 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12914 - 12704
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggt-----ta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||||||| | || |
|
|
| T |
12914 |
taactcatttgagat-attttgatggagcctacgtgccaaactgatttatggattacgaactaaattccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaattta |
12816 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaa-tgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12815 |
aattgttatttaactaattttggactatgttttgtatgtgatatcccgttt---atgctgaatactctgataaaatgttt--agaaatttttatattggg |
12721 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12720 |
aaaacggggtgttacaa |
12704 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 66857 - 66768
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62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat--ataatttccgctgc-aatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
66857 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagata-ttggttagattattatttaactgtt |
66768 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 133343 - 133306
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| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
133343 |
gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaaaac |
133306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Original strand, 28134 - 28359
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| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28134 |
atgctacttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatgagacctgcatgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
28232 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28233 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaaatg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgttt--agaaa |
28329 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28330 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
28359 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0586 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:
Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4304 - 4078
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4304 |
atgctatttgtgatattgaactaactcatt-gagattatattgatgaggcctgtgtgccaaagcgttttatggattataatataatttc-gctgcaatgt |
4207 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaa |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
4206 |
ttaagatatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataaatg-tttatgaa |
4109 |
T |
|
| Q |
215 |
atttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4108 |
atttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
4078 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:
Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 126872 - 127061
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
126872 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaattaaattccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgtttttg- |
126970 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126971 |
atcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
127061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 106638 - 106826
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
106638 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaattaaattccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgtttt-gg |
106736 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
106737 |
atcatgttatatgtaatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
106826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9581 - 9468
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
9581 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgggatatcccgttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
9486 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9485 |
gaaaacggggtgttacaa |
9468 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0217 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:
Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 214 - 420
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatta |
136 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
214 |
taactcatttgagatatttttgatggggcctacgtgccaaactgaattatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgacttttggttaaatta |
313 |
T |
|
| Q |
137 |
ttatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggg |
236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
314 |
ttatttaactgtttt-ggatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattgggaaaacggg |
412 |
T |
|
| Q |
237 |
gtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
413 |
gtgttaca |
420 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0553 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:
Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8167 - 7983
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8167 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggatt |
8069 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8068 |
acgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgtcttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
7983 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0065 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:
Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29154 - 28970
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29154 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggatt |
29056 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29055 |
acgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgtcttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
28970 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0379 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0379
Description:
Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 12405 - 12629
Alignment:
| Q |
16 |
atgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12405 |
atgctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgataagacctaagtgccaaagcgttttatggattataatataatttccgctgcaatgt |
12503 |
T |
|
| Q |
116 |
ttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaa |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
12504 |
ttaagttatttggttaaattgttatttaactg-ttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactatgataaaagttt--agaaa |
12600 |
T |
|
| Q |
216 |
tttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12601 |
tttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
12629 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 143 - 333
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || | |
|
|
| T |
143 |
ttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattgttatttaactatt---g |
238 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt-----ttaagaaattttta-tattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
239 |
gattacgttatatgtgatatcccgttgttt--gatgtttactctgataaatgttatgttttaagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
333 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0379; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11721 - 11511
Alignment:
| Q |
38 |
aactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttt--tatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaa |
133 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
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| T |
11721 |
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11624 |
T |
|
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134 |
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226 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
11623 |
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11529 |
T |
|
| Q |
227 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11528 |
ggaaaacggggtgttaca |
11511 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0146 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:
Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 843 - 657
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| Q |
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atggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataat-ttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
843 |
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746 |
T |
|
| Q |
157 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
745 |
tatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
657 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:
Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1642 - 1467
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| Q |
70 |
gtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtg |
169 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1642 |
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1543 |
T |
|
| Q |
170 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1542 |
atatcccatttgtttatgttgtttactctaataaatg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
1467 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0572 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:
Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9237 - 9032
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatta |
136 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
9237 |
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9139 |
T |
|
| Q |
137 |
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236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |
|
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| T |
9138 |
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9040 |
T |
|
| Q |
237 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
9039 |
gtgttaca |
9032 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:
Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15037 - 14848
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| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
15037 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgacataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttt-g |
14939 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
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|||| | | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14938 |
attaagcttaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataactg-tttaaggaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
14848 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7917 - 7729
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
7917 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgacataatttccgctgcaatg-ttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttt-g |
7820 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
|
|||| | | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7819 |
attaagcttaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataactg-tttaaggaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
7729 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31700 - 31626
Alignment:
| Q |
165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31700 |
atgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttggaaaaacggggtgttaca |
31626 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0303 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:
Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15671 - 15482
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
15671 |
ttgatggggtctacgtgccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgtttt-gga |
15573 |
T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15572 |
tcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
15482 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0232 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:
Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1338 - 1151
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| | |
|
|
| T |
1338 |
tttgatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatggatgatgaaataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaattggtttt-g |
1240 |
T |
|
| Q |
155 |
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244 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1239 |
attatgtta-atgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataattg-tttaaggaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
1151 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47605 - 47422
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
47605 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgatataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttt-ggatt |
47508 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47507 |
acgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactcttataaatgtttaaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
47422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43675 - 43635
Alignment:
| Q |
205 |
gttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43675 |
gttttatgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
43635 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0278 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:
Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 3338 - 3521
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3338 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt-ggattat |
3435 |
T |
|
| Q |
160 |
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245 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3436 |
gttttatgagatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
3521 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23948 - 23888
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| Q |
184 |
atgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23948 |
atgatgcttactctgataaatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacagggtgttaca |
23888 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7600 - 7394
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| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatta |
136 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
7600 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgacttttggttaaatta |
7502 |
T |
|
| Q |
137 |
ttatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggg |
236 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
7501 |
ttatttaactgttttag-attacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatgttgggaaaacggg |
7403 |
T |
|
| Q |
237 |
gtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
7402 |
gtgttacaa |
7394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0126 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:
Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 246
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5034
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| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
4849 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttt-ggatt |
4946 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4947 |
acgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgtataaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacaaa |
5034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0683 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:
Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 7936
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
8125 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatggattatgaaataattttctctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactg-gtttgg |
8027 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8026 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgatatttg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
7936 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0423 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:
Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5419 - 5231
Alignment:
| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatta |
158 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
5419 |
atggggcctaagtgccaaaacgttttatgaattatgaaataatttccgctgcaaagtgtaagttatttggttaaattgttatttaactg-gtttggatta |
5321 |
T |
|
| Q |
159 |
tgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaa |
248 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5320 |
tgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataattg-tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaaaaa |
5231 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0248 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0248
Description:
Target: scaffold0248; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25900 - 25717
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| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
25900 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcactatttaactgtttt-ggatt |
25803 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25802 |
acgtt-tatatgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
25717 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0233 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0233
Description:
Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Original strand, 15209 - 15372
Alignment:
| Q |
14 |
aaatgctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaat |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15209 |
aaatgctatt-gtgatattgaactaactcttttgaaaatg-tttgatagggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatcatataatttccgctgcaat |
15306 |
T |
|
| Q |
114 |
gtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15307 |
gtttaagttatttggttaaattattatttaactg-ttttggattacgttatatgtgatatcccgttt |
15372 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0233; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 244
Target Start/End: Original strand, 20670 - 20739
Alignment:
| Q |
175 |
ccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20670 |
ccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaaattttatattgggaaaacggggtgttaca |
20739 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Original strand, 267435 - 267618
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
267435 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcactatttaactgtttt-ggatt |
267532 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
267533 |
acgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaataaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
267618 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 304072 - 304267
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttt |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
304072 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaaagatttatggattatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactatta |
304171 |
T |
|
| Q |
151 |
ttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatg-ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
304172 |
ttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttg-ttactctgataattgtttttaagaaatttttatattgggaaagcggggtgttacaa |
304267 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 306469 - 306260
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
306469 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaactgatttatgatttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
306372 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
306371 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
306276 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
306275 |
aaaacggggtgttaca |
306260 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 281436 - 281547
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
281436 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtga-atgtgatatcccgttttgt--gatgtttactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
281530 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
281531 |
gaaaacggggtgttaca |
281547 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 8334 - 8540
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagat-atttggttaaatt |
135 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |
|
|
| T |
8334 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgaccatttggttagatc |
8432 |
T |
|
| Q |
136 |
attatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacgg |
235 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8433 |
attatttaactgtttt-ggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattgggaaaacgg |
8531 |
T |
|
| Q |
236 |
ggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
8532 |
ggtgttaca |
8540 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Original strand, 98 - 285
Alignment:
| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagat-atttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
98 |
tgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgaccatttggttagatcattatttaactgtttt-gga |
196 |
T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197 |
ttacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
285 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0371 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:
Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14752 - 14564
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
14752 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgaaataaattccgctgcaaagtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttt-g |
14654 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgtt--ttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14653 |
attatgtta-atgtgatatcccgtttgttttatgctgtttactctgataattg-tttaagaaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
14564 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0133 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:
Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21528 - 21322
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaaga-tatttggttaaatt |
135 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21528 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgttccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgactatttggttaaatc |
21430 |
T |
|
| Q |
136 |
attatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacgg |
235 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21429 |
attatttaactgtttt-ggattacgttttatgtgatatcccattgtttacgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattgggaaaacgg |
21331 |
T |
|
| Q |
236 |
ggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
21330 |
ggtgttaca |
21322 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0585 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:
Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8749 - 8568
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8749 |
gggcctacgtgccaaaacgttttatggattatgaaataatttccactgcaaagtttaagttatttggttaaattgttatttaactg-gtttggattatgt |
8651 |
T |
|
| Q |
162 |
tatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8650 |
taaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataattg-tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
8568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1293 - 1105
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
1293 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgaaataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttt-g |
1195 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1194 |
attatatta-atgtgatatcccgtttgtgtatgctgtttaccctgataattg-tttaaggaatttttatattgggaaaatggggtgttacaa |
1105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Original strand, 138459 - 138627
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttt |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
138459 |
tactttgatggcgcctacgtgccaaaaagatttatggcttatgaaataattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgtta |
138558 |
T |
|
| Q |
151 |
ttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaattttt |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| | || || ||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
138559 |
ttggattacgttaaatgtaataccccgttgtttaagttgtttcctctgat-aatagtttaagaaattttt |
138627 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Original strand, 79276 - 79333
Alignment:
| Q |
185 |
tgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79276 |
tgatgattactctgataattgtat---gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
79333 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 244
Target Start/End: Original strand, 34732 - 34768
Alignment:
| Q |
208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34732 |
ttaagcaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
34768 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 100492 - 100303
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
100492 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattatgaagtaatttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactg-atctgg |
100394 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
100393 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttatttatgctgtttactctgataaatgtttt-agaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
100303 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 139133 - 138942
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgtttt--atggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | || |
|
|
| T |
139133 |
tttgatggggccttcgtgccaaaacgattttgatggttcatgagataatttccgctgcattgtttaag-tatttggttaaattgttatttaactgatatt |
139035 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
139034 |
ggattatgttaaatgtcatatcccatttgtttatgttgtttactctggtaaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
138942 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 56253 - 56138
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
56253 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
56158 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56157 |
gggaaaacggggtgttacaa |
56138 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 414770 - 414963
Alignment:
| Q |
55 |
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146 |
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244 |
Q |
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414869 |
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414963 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0043 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:
Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 77858 - 78046
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| Q |
55 |
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154 |
Q |
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| T |
77858 |
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77956 |
T |
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244 |
Q |
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| T |
77957 |
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78046 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17515 - 17405
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
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| T |
17515 |
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17422 |
T |
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228 |
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244 |
Q |
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|
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| T |
17421 |
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17405 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 61672 - 61485
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| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
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| T |
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T |
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157 |
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244 |
Q |
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| T |
61572 |
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61485 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29874 - 29687
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
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| T |
29874 |
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29779 |
T |
|
| Q |
160 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
29778 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttacaa |
29687 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Original strand, 73635 - 73822
Alignment:
| Q |
60 |
tggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---ttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
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| T |
73635 |
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73733 |
T |
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| Q |
153 |
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244 |
Q |
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| T |
73734 |
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73822 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12307 - 12114
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgact |
146 |
Q |
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| T |
12307 |
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12208 |
T |
|
| Q |
147 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
12207 |
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12114 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7432 - 7219
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
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| T |
7432 |
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7335 |
T |
|
| Q |
130 |
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225 |
Q |
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| T |
7334 |
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7239 |
T |
|
| Q |
226 |
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245 |
Q |
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|
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| T |
7238 |
gggaaaacggggtgttacaa |
7219 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18609 - 18415
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgact |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
18609 |
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18510 |
T |
|
| Q |
147 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18509 |
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18415 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1207 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1207
Description:
Target: scaffold1207; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 357 - 542
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
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|
|
| T |
357 |
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455 |
T |
|
| Q |
155 |
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245 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
456 |
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542 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33643 - 33453
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacg--ttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
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|
| T |
33643 |
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33545 |
T |
|
| Q |
153 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33544 |
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33453 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 245
Target Start/End: Original strand, 45305 - 45357
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45305 |
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45357 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0546 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:
Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 6924 - 7117
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| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttt |
150 |
Q |
| |
|
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|
| T |
6924 |
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7023 |
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|
| Q |
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245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
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| T |
7024 |
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7117 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1316 - 1130
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
1316 |
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1219 |
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| Q |
154 |
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242 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1218 |
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1130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1618 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1618
Description:
Target: scaffold1618; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 86 - 277
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacg--ttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
| |
|
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| T |
86 |
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184 |
T |
|
| Q |
152 |
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244 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
185 |
tggattatgttaaatgtgatatcccatttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
277 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0063 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:
Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 73350 - 73157
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttt |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
73350 |
tactttgatggggcctacgtgccaaaaagatttatggattatgaaataattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgtta |
73251 |
T |
|
| Q |
151 |
ttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| ||| || |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
73250 |
ttggattacgttaaatgtgataccccattgtttaagttgtttactctgat-aatagtttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
73157 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 244
Target Start/End: Original strand, 39404 - 39442
Alignment:
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39404 |
ttttatgaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
39442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0600 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:
Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1565 - 1375
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa--tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||| |
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|
| T |
1565 |
ttgatggggcctacgtgccaaa-cgatttatgaattatgaaacaaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatattg |
1467 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
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| T |
1466 |
gattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-tttaagaaatttttatattgggaaaacagggtgttacaa |
1375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
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Target Start/End: Original strand, 69 - 312
Alignment:
| Q |
18 |
gctattagtgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgttt |
117 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
69 |
gctatttgtgatattgaactaactcttt-gagattatattgatggggcctgcgtgccaaagcgttttatggattataaaataatttccgatgcaatgttt |
167 |
T |
|
| Q |
118 |
aagatatttggttaaattattatttg-----actgt----------ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataa |
202 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
168 |
aagttatttggttaaattgttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgtgatatcctgttgtttatgatgtttactctgataa |
267 |
T |
|
| Q |
203 |
atgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
268 |
atggtt--agaaatttttatgttgggaaaacgaggtgttacagaaac |
312 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
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Target Start/End: Original strand, 46665 - 46854
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| Q |
52 |
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150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
46665 |
tactttgatggggcctacgtgccaaaa-gatttatggattatgaaataattttccgctgtaacgtttaaattatttggttaaattgttatttaactgtta |
46763 |
T |
|
| Q |
151 |
ttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46764 |
ttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttaagttgtttactctgat-aatagtttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgtta |
46854 |
T |
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Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 246
Target Start/End: Original strand, 168838 - 168915
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| Q |
166 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
168838 |
tgtgatatcccgttat--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaattattatgttgggaaaactgggtgttacaaa |
168915 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0265 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0265
Description:
Target: scaffold0265; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 24819 - 24679
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102 |
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201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24819 |
ttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtttt-ggattatgttttatgagatatcccgttgtttatgatgcttactctgata |
24722 |
T |
|
| Q |
202 |
aatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24721 |
aatgtttttaagaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
24679 |
T |
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Target: scaffold0265; HSP #2
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191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4856 |
ttactctgataaatgttt-aagaaatttatatattgggaaaacggggtgttaca |
4908 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0186 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:
Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
33492 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattatgaactaaattccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactg-ttttgg |
33394 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33393 |
attacgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattcgtatattgggaaaacggggtgttaca |
33297 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
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Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38055 - 37869
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62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38055 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttgactgtt---ggattat |
37960 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37959 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
37869 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0473 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:
Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 1351 - 1538
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| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1351 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttgactgtt---ggattat |
1446 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1447 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaaagaaattttaatattgggaaaatggggtgttacaa |
1538 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:
Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24702 - 24562
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
24702 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactg-ttttggatt |
24605 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgata |
201 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24604 |
atgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
24562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:
Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9691 - 9551
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| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
9691 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactg-ttttggatt |
9594 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgata |
201 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9593 |
atgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
9551 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 56113 - 55973
Alignment:
| Q |
58 |
gatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggatt |
157 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
56113 |
gatgaggcctgcgtgccaaaacgttttatg-actatgacataatttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactg-ttttggatt |
56016 |
T |
|
| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgata |
201 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
56015 |
atgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
55973 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 1885 - 1998
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1885 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggttttaactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
1980 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1981 |
ggaaaacggggtgttaca |
1998 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0223 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:
Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
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Target Start/End: Complemental strand, 28801 - 28615
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| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28801 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttgactg---ttggattat |
28706 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28705 |
gttatatgtgatatccc-tttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
28615 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0042 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:
Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 63283 - 63095
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| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||| || |||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||| |
|
|
| T |
63283 |
ttgatggggcctacgagccaaa-cgatttatgaattatgaaacaattttccactgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatattgg |
63185 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
63184 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg-attaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
63095 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 98042 - 98143
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaa-tgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctga |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
98042 |
tttccgctgcaaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctga |
98135 |
T |
|
| Q |
200 |
taaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
98136 |
taaatgtt |
98143 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 69578 - 69393
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
69578 |
gggcctgcgtgccaaaac-ttttatgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagttatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
69480 |
T |
|
| Q |
155 |
attatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69479 |
attacgtttctatgtgatatcccg---tttatggttaaaactctgataaatg-tttatgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
69393 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:
Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 8664 - 8872
Alignment:
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37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatt |
135 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
8664 |
taactcatttgagatatgtttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggtttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttaatttgttaaatc |
8763 |
T |
|
| Q |
136 |
attatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacg |
234 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
8764 |
gttatttaactgatttggatttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatgtttt-agaaattttcatattgggaaaacg |
8862 |
T |
|
| Q |
235 |
gggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
8863 |
gggtgttaca |
8872 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Original strand, 6674 - 6883
Alignment:
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37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatt |
135 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
6674 |
taactcatttgagatatgtttgatagggcctacgtgccaaaacgatttatggtttatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttaatttgttaaatc |
6773 |
T |
|
| Q |
136 |
attatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacg |
234 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
6774 |
gttatttaactgatttggatttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatgtttt-agaaattttcatattgggaaaacg |
6872 |
T |
|
| Q |
235 |
gggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
6873 |
gggtgttacaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27107 - 27048
Alignment:
| Q |
185 |
tgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27107 |
tgatgattactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttacaa |
27048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0285 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:
Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6266 - 6079
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
6266 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaactga |
6167 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgtt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6166 |
ttttggattatgttgaatgtgatatcccg---tttatgctgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgtt |
6079 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0193 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:
Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8837 - 8648
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
8837 |
ttgatggggcctacgtgccaaa-cgatttatgaattatgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattgg |
8739 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt-aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8738 |
attatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactatgttaattg-tttaagaaatttttatattggggaaaacggggtgttaca |
8648 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41102 - 41008
Alignment:
| Q |
150 |
tttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41102 |
tttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaattttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
41008 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35347 - 35254
Alignment:
| Q |
148 |
tttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35347 |
tttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
35254 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0174 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:
Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 68 - 260
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
68 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattgttatttaactg---tt |
163 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgt-----tttaagaaattttt--atattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164 |
ggattaagatatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgttatgctttaagaaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
260 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 19318 - 19404
Alignment:
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19318 |
gattatgtgaaatgtgatatcccgttttgt--gatgtttactctgatg--tttattaagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
19404 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0142 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:
Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36118 - 35937
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
36118 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaactga |
36019 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacg |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
36018 |
ttttggattatgttataatgtgatatcccg---tttatgctgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattggaaaaacg |
35937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0500 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:
Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 169 - 357
Alignment:
| Q |
56 |
ttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || | || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
169 |
ttgatggggcctacgtgccaaaacaatttatggattttcgaaacaattttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactg-atttg |
267 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
268 |
gattatgttaaatgtgatatcccatttatttatgttgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattggaaaaacggggtgttaca |
357 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0260 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:
Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22617 - 22468
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
22617 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---tt |
22522 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22521 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgtttactctgataaatgtt |
22468 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0252 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0252
Description:
Target: scaffold0252; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24679 - 24469
Alignment:
| Q |
38 |
aactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttt--tatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24679 |
aactcttttgagat-actctgttggggcctgcgtgccaaaacgtttcatatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaa |
24582 |
T |
|
| Q |
134 |
ttattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24581 |
ttattatttaactg---ttggattattttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattg |
24487 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24486 |
ggaaaacggggtgttaca |
24469 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0249 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:
Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Original strand, 146 - 241
Alignment:
| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
146 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattggaaaaacggagtgttaca |
241 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 103
Target Start/End: Original strand, 100 - 140
Alignment:
| Q |
63 |
ggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt |
103 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
100 |
ggcctacgtgccaaaacgttttatggattatgatattattt |
140 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 245
Target Start/End: Original strand, 304791 - 304878
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| Q |
158 |
atgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
304791 |
atgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
304878 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0228 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:
Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 19317 - 19502
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttg |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
19317 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttcgaaataattttccgctgcaatgtttaagttattttgttaaattgttatttaactg-atttg |
19415 |
T |
|
| Q |
154 |
gattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19416 |
gattatgtttgaatgtgatatcc---tgtttatgttgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattggaaaaacggggtgttaca |
19502 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 101484 - 101668
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
101484 |
gggcctgcgtgccaaaacgtttcatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggattac |
101579 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101580 |
tttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgttatgtttttaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
101668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 64124 - 64010
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
64124 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
64029 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
64028 |
gggaaaacggggtgttaca |
64010 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 121566 - 121380
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
121566 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcattgtttatgata-ttggttaaattattatttgactg---ttggattat |
121471 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
121470 |
gttatatgtgatattcc-tttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
121380 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29676 - 29484
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
29676 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattgttatttaactg---tt |
29581 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgata-----aatgttttaagaaatttt-tatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29580 |
ggtttacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgatatatgttatgttttaagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttacaa |
29484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Original strand, 25636 - 25820
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatt |
135 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
25636 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctgcgtgccaaaatgatttatggatttcgaaataattttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatt |
25734 |
T |
|
| Q |
136 |
attatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttata |
223 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25735 |
gttatttaactg-atttggattatgttaaatgtgatgtcccgtttatttatgttgtttactctgataattgttt--agaaatttttata |
25820 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 225844 - 225769
Alignment:
| Q |
166 |
tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
225844 |
tgtgatatcccgttat--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
225769 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Original strand, 32439 - 32471
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32439 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
32471 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 250
Target Start/End: Original strand, 423242 - 423439
Alignment:
| Q |
55 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
423242 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattttcgaattaatttccgctgcaatgtttgagatattgttgaaagttaaattgttatttaactgt |
423341 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
423342 |
ttttagattatgtttgaatgtgatatcccgttc---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaata |
423436 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 168308 - 168221
Alignment:
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttac |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
168308 |
ttatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgattgaagaaatttgtatattgggaaaatggggtgttac |
168221 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 6795 - 6980
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6795 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
6893 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6894 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgtta-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
6980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 172978 - 172865
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
172978 |
gttaaattgttatttaactgattttggattatgtttgaatgtgatatcccgtttatgct--tgtttactctgataaatattt--agaaatttttatattg |
172883 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
172882 |
ggaaaacggggtgttaca |
172865 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 178681 - 178568
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
178681 |
gttaaattgttatttaactgattttggattatgtttgaatgtgatatcccgtttatgct--tgtttactctgataaatattt--agaaatttttatattg |
178586 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
178585 |
ggaaaacggggtgttaca |
178568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1148 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1148
Description:
Target: scaffold1148; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2550 - 2366
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatg-atat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
2550 |
gggcctgcgtgccaaaatgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttatgata-ttggttaaattattatttaa---ttgttggattac |
2455 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataa-----atgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2454 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgttttaagaaattttgatgttgtgaaaacggggtgttaca |
2366 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 6)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 59975 - 59784
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
59975 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggattatga-ataatttccgctgcattgtttaagtaattcgttgaaagttaaattgttatttaactga |
59877 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
59876 |
ttttggattaagtttgtatgtgatatcccgtttt--atgctgtttactcttataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
59784 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 192099 - 191889
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt------ |
130 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
192099 |
taactgttttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatgaatttcgaattaatttccgttgcaatgcttaagatattttgttgaaagt |
192001 |
T |
|
| Q |
131 |
-aaattattatttgactg-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
192000 |
taaattgttatttaactgatttttggattatgtttgaatgttatatcccgttt---atgatgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgg |
191906 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |
|
|
| T |
191905 |
gaaatcggggtgttaca |
191889 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 21574 - 21767
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-------gttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
21574 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggataattgaattaactccgctgcaatgtttgagatattttattgaaagttaaattgttatttaactg |
21673 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21674 |
ttttgcaattaagtttgaatgtgatatcccgttaatt--gatgattactctgataattgtttt--gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
21767 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 138418 - 138231
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
138418 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactatttttgg |
138320 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138319 |
attacgtttccatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaaa |
138231 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 15922 - 16115
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| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-------gttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15922 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggataattgaattaactcc-ctgcaatgtttgagatattttattgaaagttaaattgttatttaactg |
16020 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16021 |
ttttgcaattatgtttgaatgtgatatcccgttaatt--gatgattactctgataattgtttt--gaaatttttatattggaaaaacggggtgttacaa |
16115 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 20444 - 20637
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55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-------gttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
20444 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggataattgaattaactcc-ctgcaatgtttgagatattttattgaaagttaaattgttatttaactg |
20542 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20543 |
ttttgcaattatgtttgaatgtgatatcccgttaatt--gatgattactctgataattgtttt--gaaatttttatattggaaaaacggggtgttacaa |
20637 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:
Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 14328 - 14514
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| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
14328 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagata-taggttaaattattatttaactg---ttggattat |
14423 |
T |
|
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg------ttttaa-gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14424 |
gttatatgtgatataccattgatt-tgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
14514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:
Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 169422 - 169226
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgac |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||| | |
|
|
| T |
169422 |
tactttgatggggcctacgtgccaaaaagatttatgaattatgaaataatttccgctgcattgtttaagtaaattgttgaaagttaaattgttatttaat |
169323 |
T |
|
| Q |
146 |
tgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || ||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
169322 |
tgattttggactaagtttgtacgtgatatcccgttt---atgctgtttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
169227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0040 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:
Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 246
Target Start/End: Original strand, 6620 - 6813
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataatttcc-gctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
6620 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttcagctgcaatgttaaagatatt-ggttaaattgttatttaactgtt--- |
6715 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt-----ttaagaaattttta-tattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6716 |
ggattacgttatatgtgatatcacattgttta--atgtttactctgataaatgttatgttttaagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttacaaa |
6813 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0439 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:
Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Original strand, 11018 - 11213
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
11018 |
tttgatggggcctacgtgccgaaatgatttatggatttcgaattaatttccgctgtaatgtttaagatattttgttgaaagttaaattgttatttaactg |
11117 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11118 |
attttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaaa |
11212 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0577 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:
Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8486 - 8290
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgac |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
8486 |
tactttgatggggcctacgtgccaaggagatttatggattatgaaataatttccgctgcattttttaattaatttgttgaaagttaaattgttatttaac |
8387 |
T |
|
| Q |
146 |
tgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8386 |
tgattttggattaagtttgtatgtgatatcccgtttatt--gctg-ttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
8292 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 20698 - 20890
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatattt-------ggttaaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
20698 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggattatgaaataatttccgctgctatgtttaagttattttgttgaaggttaaattgttatttaattg |
20797 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20798 |
-aattggattatgttttgaatgtgatatcccg---tttatgttgtttactctgataattgttt--agaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
20890 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8977 - 8863
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactg-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8977 |
gttaaattgttatttaactgatttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatatt |
8883 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8882 |
gggaaaacggggtgttacaa |
8863 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 207
Target Start/End: Original strand, 2 - 47
Alignment:
| Q |
160 |
gttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2 |
gttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
47 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0177 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:
Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 13877 - 14097
Alignment:
| Q |
26 |
tgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt |
125 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
13877 |
tgatattgaattaactcatttgaaat-attttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggttttcgaattaatttccgctgcaacgtttgaaatatt |
13975 |
T |
|
| Q |
126 |
tg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttt |
219 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13976 |
tgttaaagttaaatttttatttaactgttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttatt--tgatgtttactctgataaatgttt--agaaatttt |
14071 |
T |
|
| Q |
220 |
tatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14072 |
tatattgggaaaacagggtgttacaa |
14097 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0810 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:
Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 157 - 351
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
157 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggatttcgaattaatttccgctgcaatggttaagatattttgttgaaagttaaattgttatttaactg |
256 |
T |
|
| Q |
148 |
-tttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
257 |
atttttggattatgtttcgaatgtgatatcccattt---atgatgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
351 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0293 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:
Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10337 - 10146
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
10337 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggttttcgaattaatttccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagttaaattgttatttaactgtt |
10238 |
T |
|
| Q |
150 |
tttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10237 |
ttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttatt--tgatgtttactctgataaatgttt--agaaatttttatattggaaaaacggggtgttaca |
10146 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0225 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:
Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2321
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---t |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
2112 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaattgatttatgacttctgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattgtgtggaagt |
2209 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
2210 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattggg |
2305 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
2306 |
aaaacggggtgttaca |
2321 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0229 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:
Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 12499 - 12685
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12499 |
gggcctgcgtgccaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
12598 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12599 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
12685 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:
Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33774 - 33638
Alignment:
| Q |
65 |
cctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgtt |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
33774 |
cctgcgtgccaagacgttttatg-attatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggcttacgtt |
33680 |
T |
|
| Q |
163 |
atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33679 |
atatgtgatatcccgttgctt-tgatgcttactctgataaatg |
33638 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1424 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:
Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1833 - 1704
Alignment:
| Q |
114 |
gtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaag |
212 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
1833 |
gtttaagttatttggttaaattgttatttaactggttt-ggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactccgataattg-tttaag |
1736 |
T |
|
| Q |
213 |
aaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1735 |
aaattttcatattggaaaaacggggtgttaca |
1704 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0231 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:
Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Original strand, 642 - 736
Alignment:
| Q |
149 |
ttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
642 |
ttttggtttatgttttatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgtttaaagaaa-ttttatattgggaaaacggggtgttaca |
736 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 524 - 564
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaa |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
524 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaaa |
564 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 4922 - 5115
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
4922 |
tttgatggagcctacgtgccaaaatgatttatggatttcgaattaatttccgctgcaatgcttaagatattttgttgaaagttaaattgttatttaactg |
5021 |
T |
|
| Q |
148 |
-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5022 |
atttttggaatatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
5115 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0073 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:
Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42242 - 42055
Alignment:
| Q |
60 |
tggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---ttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42242 |
tggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagttaaattattatttaactgttttt |
42144 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42143 |
ggattacgtttttatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
42055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0144 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:
Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20127 - 19980
Alignment:
| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaac-gttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || || || ||| |
|
|
| T |
20127 |
tgatgaggcctgcgtgccaaaactgatttatgggttacgaactaaattccgctgcaatgtttaagatattatgttaaatcattatttaaccgtctt-gga |
20029 |
T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
20028 |
ttatgatatatgtgatatcccgttggttatgatgc-tactctgacaaatg |
19980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Original strand, 33075 - 33222
Alignment:
| Q |
57 |
tgatggggcctgcgtgccaaaac-gttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttgga |
155 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | | ||||| |
|
|
| T |
33075 |
tgatgaggcctgcgtgccaaaactgatttatgggttacgaactaaattccgctgcaatgtttaagatattatgttaaatcattatttaaccg-tcttgga |
33173 |
T |
|
| Q |
156 |
ttatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
33174 |
ttatgatatatgtgatatcccgttggttatgatgc-tactctgacaaatg |
33222 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 52972 - 52781
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtt |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
52972 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggttttcgaattaatttccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagttaaattgttatttaactgtt |
52873 |
T |
|
| Q |
150 |
tttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52872 |
ttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttatt--tgatctttactctgataaatgttt--agaaatttttatatagggaaaacggggtgttaca |
52781 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 187490 - 187282
Alignment:
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37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||| ||| |||| |
|
|
| T |
187490 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactgttttatggattatgaactaaattccgctgcaacgtttgaaataattgttgaagtta |
187392 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgat-aaatgttttaagaaatttttatattagga |
229 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
187391 |
aattgttatttaactgattttggattatgtttgtatgtgatatcccg---tttatgctgaatactctgataaaatgttt--agaaatttttatattggaa |
187297 |
T |
|
| Q |
230 |
aaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |
|
|
| T |
187296 |
aaatggggtgttaca |
187282 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 77600 - 77390
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
77600 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattacgaactaaattccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagtta |
77502 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggatta--tgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgat-aaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| |||| || || | || |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
77501 |
aattgttatttaactaattttagactactttttgtatgtgatatcccg---tttatgttgaatactctgataaaatgttt--agaaatttttatattgag |
77407 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77406 |
aaaacggggtgttacaa |
77390 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 386667 - 386555
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
386667 |
gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcctgtttt--atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttg |
386573 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
386572 |
ggaaaacggtgtgttaca |
386555 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 331503 - 331463
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| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
331503 |
ttttatgaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaaa |
331463 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 69176 - 69092
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| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69176 |
gattatgtgaaatgtgatatcccgttgt----gatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
69092 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1933 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold1933
Description:
Target: scaffold1933; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 120
Target Start/End: Original strand, 178 - 246
Alignment:
| Q |
52 |
tactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaag |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
178 |
tactttgatggggcctacgtgccaaaacgttttatggattatgaaataatttccgctgcattgtttaag |
246 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1933; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 305 - 356
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
305 |
ttactctgataaatgttt--agaaatttttatattgggaaaacagggtgttaca |
356 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0637 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0637
Description:
Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7955 - 7762
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattat-gatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
7955 |
tttgatggggcctaagtgccaaaacgatttattgattttcgaattaatttccgctgcaaagtttgagatatttgttgaagttaaattgttatttaactga |
7856 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtt--atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7855 |
ttttggattatgtttcaaatgtgatatcccgttatt--tggtgtttactctgataattgttt--agaaaattttatattgggaaaacggggtattaca |
7762 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0637; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 244
Target Start/End: Original strand, 2 - 39
Alignment:
| Q |
207 |
tttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2 |
tttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
39 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0403 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:
Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1024 - 830
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
1024 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatcgatttcgaattaatttccgctgcaatgtttgaattatttgttgaaagttaaattgttatttaactgt |
925 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttg--gattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
924 |
ttttttagattatgtttgaatgtgatatcccgttc---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0088 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:
Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 27739 - 27925
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27739 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
27838 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27839 |
attacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatgttgggaaaacggggtgttaca |
27925 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Original strand, 205769 - 205978
Alignment:
| Q |
38 |
aactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttggtt------ |
130 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
205769 |
aactcgtttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggatttcaaattaattttccgctgcaatgtttaagatattttgttgaaagt |
205867 |
T |
|
| Q |
131 |
-aaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
205868 |
taaattgttatttaactgattttggattatgtttgaatgtgatatctcgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattggg |
205962 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
205963 |
aaaacggggtgttaca |
205978 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 17796 - 17911
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
17796 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaattttgatatt |
17891 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17892 |
gggaaaacggggtgttacaa |
17911 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 126018 - 125968
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| Q |
192 |
tactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126018 |
tactctgataaatgttat--gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
125968 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0235 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:
Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
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Target Start/End: Complemental strand, 16031 - 15908
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16031 |
gttaaattgttatttaact-tatttgaattatgttaaatgtgatatcctgtttatttatgatgtttactctaataaatgttt--agaaatttttatattg |
15935 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaaaaacaact |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
15934 |
ggaaaacggggtgttacacatacaact |
15908 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0181 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0181
Description:
Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
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Target Start/End: Original strand, 27856 - 28049
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
27856 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggatttttgaattaactccgctgcaatgtttaagatattttgttgaaagttaaattgttatttaactg |
27955 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27956 |
attttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--ataaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
28049 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0181; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 33751 - 33943
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt-------aaattattatttgactg |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | || |
|
|
| T |
33751 |
tttgatggggcctacgtgccaaaatgatttatggatttttgaattaactccgctgcaatgtttaagatattttgttgaaagttaaattgttatttaaatg |
33850 |
T |
|
| Q |
148 |
tttttggattatgt-tatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33851 |
attttggattatgtatgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
33943 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
172660 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
172755 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
172756 |
ggaaaacggggtgttaca |
172773 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
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| Q |
199 |
ataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6574 |
ataaatgttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
6529 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 166 - 244
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| Q |
166 |
tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
121079 |
tgtgatatcccgttat--atgttgtttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
121004 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
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| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
162 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
257 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
258 |
ggaaaacggggtgttaca |
275 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 245
Target Start/End: Original strand, 228764 - 228900
Alignment:
| Q |
108 |
tgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatg |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
228764 |
tgcaatgtttaagttattttcttaaattgttatttaactgattt-ggattatgtttgaatgtgatatcccgtttatttatgttgtttactctcataaatg |
228862 |
T |
|
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
228863 |
ttt--agaaattttcatattgggaaaacggggtgttacaa |
228900 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 73280 - 73163
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
73280 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatctcgtttatggttttttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattg |
73182 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
73181 |
ggaaaacggggtgttacaa |
73163 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0410 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:
Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1595 - 1384
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttggtt------ |
130 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1595 |
taactgttttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatgattttcgaattaatttccgctgcaaagcttaagatattttgttgaaagt |
1497 |
T |
|
| Q |
131 |
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227 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
1496 |
taaattgttatttaactgatttttggattatgtttgaatttgatatcccgttt---atgatgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgg |
1402 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1401 |
gaaatcggggtgttacaa |
1384 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0468 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:
Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13508 - 13328
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13508 |
gggcctgcgtgccaagacgttttatgaattacgat----tttccgctgctatgttaaagataattgtgagggttaaattatcatttaactgtttttggat |
13413 |
T |
|
| Q |
157 |
tatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13412 |
tacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
13328 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 244
Target Start/End: Original strand, 23672 - 23859
Alignment:
| Q |
59 |
atggggcctgcgtgccaaaac-gttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg------gttaaattattatttgactgtttt |
151 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
23672 |
atggggcctacgtgccaaaaatgttttatggattacgaaataatttccgctgcattgtt-aagtaatttgttgaaagttaaattgttatttaactgattt |
23770 |
T |
|
| Q |
152 |
tggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23771 |
tggattatgttataatgtgatatcccgttat---tgctgtttactccgataaatgttt--agaaattctcatattgggaaaacggggtgttaca |
23859 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0431 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0431
Description:
Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11829 - 11619
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
11829 |
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11731 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaa-tgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11730 |
aattgttatttaactaattttggactatgttttgtatgtgatatcccgttt---atgctgaatactctgataaaatgttt--agaaatttttatattggg |
11636 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11635 |
aaaacggggtgttacaa |
11619 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0431; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6505 - 6296
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gtta |
131 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
6505 |
taactcatttgagat-attttgatggggcctacgtgccaaactgatttatggattacgaactaaattccgctgcaacgtttgaaatatttgttaaagtta |
6407 |
T |
|
| Q |
132 |
aattattatttgactgtttttggattatgttat--atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaa-tgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6406 |
aattgttatttaactaattttggactatgttttgtatgtgatatcccgttt---atgctgaatactctgataaaatgttt--agaaatttttatattggg |
6312 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
6311 |
aaaacggggtgttaca |
6296 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0405 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:
Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 10429 - 10541
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10429 |
gttaaattattatttaactgattttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgctgtttactctcataaatgttt--agaaatttttatattg |
10523 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10524 |
ggaaaacggggtgttaca |
10541 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0155 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:
Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 10565 - 10760
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg--------gttaaattattatttgac |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10565 |
tttgatggggcctacgtgccaacaggatttatggatttcgaattaattttccgctgcaacgtttaagttatttatattgaaagttaaattattatttaac |
10664 |
T |
|
| Q |
146 |
tgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10665 |
tgtttttggattacgtttctatgtgatatcccattt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
10760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0551 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:
Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Original strand, 8763 - 8950
Alignment:
| Q |
60 |
tggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tgg---ttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8763 |
tggggcctgcgtgccaaactgatttatggtttatgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtggaagttaaattattatttaactgttttt |
8861 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8862 |
ggattacgtttttatgtgatatcacgttt---atggtttttactctgataaaagttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
8950 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0316 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:
Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20388 - 20195
Alignment:
| Q |
55 |
tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatga-tataat-ttccgctgcaatgtttaagatattt----ggttaaattattatttgactgt |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
20388 |
tttgatggggcctacgtgccaaactgatttatgatttttgaatttaatattccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaacttt |
20289 |
T |
|
| Q |
149 |
ttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20288 |
ttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
20195 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0863 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0863
Description:
Target: scaffold0863; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4894 - 4780
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4894 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atgttt-ttactttgataaatgttt-aagaaatttgtatatt |
4800 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4799 |
gggaaaacggggtgttacaa |
4780 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0167 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:
Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11208 - 10999
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt-tg-----gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
11208 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaactgatttatgatttccgaattaatattccgctgctatgtt-aagatattatgcgaaagt |
11111 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || |
|
|
| T |
11110 |
taaattgttatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aggaaatttgtatattggg |
11015 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
11014 |
aaaacggggtgttaca |
10999 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0318 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:
Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 252 - 364
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||| |||||| |
|
|
| T |
252 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt----atggtttttactctgataaatgtttaaa-aaatttgtatattg |
346 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
347 |
ggaaaacggggtgttaca |
364 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:
Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 38469 - 38583
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38469 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgttaatatgtgatatccc---atttatggtttttactctgataattg-tttaagaaatttgtatatt |
38564 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38565 |
gggaaaatggggtgttaca |
38583 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49975 - 49885
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| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49975 |
gattatgtta-atgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataattgttt-aaggaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
49885 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1756 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1756
Description:
Target: scaffold1756; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1227 - 1114
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1227 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactcttataattgttt-aagaaatttgtatattg |
1132 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1131 |
ggaaaacggggtgttaca |
1114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1276 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:
Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1607 - 1497
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
1607 |
gttaaattattatttgactatttacg-attatgtttaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgg |
1514 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1513 |
gaaaacggggtgttaca |
1497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2785 - 2565
Alignment:
| Q |
26 |
tgatcttgaactaactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatt |
125 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||| |||| | || || |
|
|
| T |
2785 |
tgatattgaattaactcatttgaaat-attttgatggggcctacgtgccaaaataatttatggttttcgaattaatttccgcttcaacgtttgaaatttt |
2687 |
T |
|
| Q |
126 |
tg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttt |
219 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
2686 |
tgttaaagttaaattgttatttaactgttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttattt--gatgtttactctgataaatgttt--agaaatatt |
2591 |
T |
|
| Q |
220 |
tatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2590 |
tatatcgggaaaacggggtgttacaa |
2565 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0435 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0435
Description:
Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Original strand, 20 - 164
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
20 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
115 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
116 |
tctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
164 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0284 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:
Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18127 - 18014
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18127 |
gttaaattgttatttaactgattttggattaagtttgtatgtgatatcccgttt---atgctctttactctgataaatgttt-aagaaatttttatattg |
18032 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18031 |
gaaaaacggggtgttaca |
18014 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1468 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1468
Description:
Target: scaffold1468; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1764 - 1706
Alignment:
| Q |
186 |
gatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1764 |
gatgcttactctgataaatgttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
1706 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0333 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:
Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1896 - 1686
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataat-ttccgctgcaatgtttaagatatt---tg---gt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
1896 |
taactcttttgagat-actttgttggggcctgcgtgccaaactgatttatgatctctgaactaatattccgctgctatgtt-aagatattatgtgaaagt |
1799 |
T |
|
| Q |
130 |
taaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattagg |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| || |||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
1798 |
taaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccg---tttatggtttttactcttatatttg-tttaagaaatttgtatattggg |
1703 |
T |
|
| Q |
229 |
aaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1702 |
aaaacggggtgttacaa |
1686 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0672 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:
Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Original strand, 4123 - 4238
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4123 |
ggttaaattattatttaactgtatatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgatt-aagaaatttgtatatt |
4218 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4219 |
gggaaaacggggtgttacaa |
4238 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0466 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:
Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13605 - 13490
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatg-ttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
13605 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccg---tttatggttgatactctgataattg-tttatgaaatttgtatatt |
13510 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13509 |
gggaaaacggggtgttacaa |
13490 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0426 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:
Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15436 - 15321
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
15436 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
15341 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15340 |
gggaaaacggggtgttacaa |
15321 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0347 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:
Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18601 - 18486
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttgga-ttatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18601 |
gttaaattattatttaactgtttttggaattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
18506 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18505 |
gggaaaacggggtgttacaa |
18486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8084 - 8047
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8084 |
gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaaaac |
8047 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0205 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:
Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 250
Target Start/End: Original strand, 60 - 253
Alignment:
| Q |
62 |
gggcctgcgtgccaaaa-cgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatattt------ggttaaattattatttgactgttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
60 |
gggcctgcgtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt- |
158 |
T |
|
| Q |
153 |
ggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
159 |
ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacacaaaca |
253 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold2108 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2108
Description:
Target: scaffold2108; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1070 - 958
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1070 |
gttaaattgttatttagctgattttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattg |
976 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
975 |
ggaaaacggggtgttaca |
958 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1695 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1695
Description:
Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Original strand, 82 - 227
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
82 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
177 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
178 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0850 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0850
Description:
Target: scaffold0850; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Original strand, 3483 - 3628
Alignment:
| Q |
101 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
3483 |
tttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttac |
3578 |
T |
|
| Q |
195 |
tctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3579 |
tctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaa |
3628 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0592 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0592
Description:
Target: scaffold0592; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 1998 - 2112
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1998 |
ggttaaattattatttaactatttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctaataattgttt-aagaaatttgtatatt |
2093 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2094 |
gggaaaacggggtgttaca |
2112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0441 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0441
Description:
Target: scaffold0441; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 244
Target Start/End: Original strand, 1 - 106
Alignment:
| Q |
137 |
ttatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttt-tttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacgg |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1 |
ttatttaactggttttg-attatgtta-atgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataattgttt-aaggaatttttatattgggaaaacga |
97 |
T |
|
| Q |
236 |
ggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
98 |
ggtgttaca |
106 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0352 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:
Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 203 - 316
Alignment:
| Q |
127 |
ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
203 |
ggttaaatcattatttaactgtttt-ggattatgtttctatgtgatatcccgttt---aaggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatatt |
297 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
298 |
gggaaaacggggtgttaca |
316 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0305 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:
Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4321 - 4110
Alignment:
| Q |
37 |
taactcttttgagattactttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatatttgg-------- |
128 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
4321 |
taactgttttgagat-attttgatggg-cctacgtgccaaaacgatttatgaatttcgaattaatttccgctgcagtgcttaagatatttttgttgaaac |
4224 |
T |
|
| Q |
129 |
ttaaattattatttgactg-tttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4223 |
ttaaattgttatttaactgatttttggattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgtttattctgataattgttt--agaaattttcatattg |
4129 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4128 |
ggaaaacggggtgttacaa |
4110 |
T |
|
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Name: scaffold0149
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Target: scaffold0149; HSP #1
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
3030 |
gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgtttt--atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttg |
2936 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
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ggaaaacggggtgttacaa |
2917 |
T |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
7461 |
gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgtttt--atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttg |
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T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ggaaaacggggtgttacaa |
7348 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
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Target: scaffold0141; HSP #1
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
37319 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
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T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
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37223 |
gggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Target: scaffold0049 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
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Target: scaffold0049; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 77493 - 77607
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
77493 |
ggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatatt |
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T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77589 |
gggaaaacggggtgttaca |
77607 |
T |
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Target: scaffold0064 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
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Target: scaffold0064; HSP #1
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227 |
Q |
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|
|
| T |
65466 |
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65561 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
65562 |
gaaaacggggtgttacaa |
65579 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0311 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0311; HSP #1
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
7946 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttttgtgatgtttactctgatgtatg--ttaataaatttttatgttgg |
8041 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8042 |
gaaaacgaggtgttaca |
8058 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0158; HSP #1
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
2186 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtga-atgtgatatcccgttttgt--gatgattactctgatttatgtt--aagaaatttttatgttgg |
2092 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
2091 |
aaaaacggggtgttaca |
2075 |
T |
|
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Target: scaffold0138 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
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Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
28730 |
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T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaaaacggggtgttaca |
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T |
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Target: scaffold0138; HSP #2
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
40726 |
gttaaattgtcatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttctatgatgtttactctgat--ttttgttaagaaatttttatgttgg |
40631 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40630 |
gaaaacggggtgttaca |
40614 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0070 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
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Target: scaffold0070; HSP #1
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227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| | |
|
|
| T |
2473 |
ttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgg |
2568 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
2569 |
aaaaacggggtgttaca |
2585 |
T |
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Target: scaffold0070; HSP #2
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146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||| |||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
9321 |
tttgatggggcctgcgtgccaaactgatttatggatttttgaaataactttctgctgcaacgtttaagtctttttgctaaagttaaatcgttatttaact |
9222 |
T |
|
| Q |
147 |
gtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9221 |
gattttgaattatgtttaaatgtgatatctcgttt---atgctgtttactctgataaatgttt--agaaattttcatattgggaaaacatggtgttacaa |
9127 |
T |
|
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Target: scaffold0061 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0061; HSP #1
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
60215 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactatttttgg |
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T |
|
| Q |
155 |
attatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attacgtttccatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaaa |
60402 |
T |
|
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Target: scaffold0406; HSP #1
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225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
115 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccg---tttatggttaatactctgataaaag-attatgaaatttgtatatt |
210 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
211 |
gggaaaacggggtgttacaa |
230 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0036; HSP #1
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
68525 |
gttaaattgttatttaactgattttggattatgtttgaatgtgatatcccgttc---atggtgtttactctgataattgttt--agaaattttcatattg |
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T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
68430 |
ggaaaacggggtgttacagaaac |
68408 |
T |
|
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212 |
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244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67259 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
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226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
49980 |
gttaaattattatttaactaattttggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactttgataaatgttt--agaaatttttacattg |
49886 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49885 |
ggaaaacggggtgttacaa |
49867 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0924 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0924; HSP #1
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1756 |
gggcctgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactatttttgg |
1854 |
T |
|
| Q |
155 |
attatgttat-atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1855 |
attacgtttccatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-atgaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
1941 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0393 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0393; HSP #1
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| || | |
|
|
| T |
801 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaaggtgatatcccg---tttgtgatgtttactctgatttatg--ttaaggaatttttatgttgg |
707 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
706 |
gaaaacggggtgttacaa |
689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1868 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold1868; HSP #1
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
1204 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaaggtgatatcccg---tttgtgatgtttactctgatttatg--ttaagaaatttttatgctgg |
1110 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1109 |
gaaaacggggtgttaca |
1093 |
T |
|
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
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|
|
| T |
4 |
ttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacaaa |
58 |
T |
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128 |
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227 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
1465 |
gttaaatcgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg--ttttgagatgtttactctgatttatg--ttaagaaatttttatgttgg |
1370 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1369 |
gaaaacgggatgttacaa |
1352 |
T |
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Target: scaffold0100; HSP #1
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244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16112 |
tatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
16188 |
T |
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gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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24807 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
24839 |
T |
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Target: scaffold0993; HSP #1
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ggttaaattattatttgactgtttttggattatgtta-tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatt |
225 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1621 |
ggttaattcattatttaactgtttt-ggattacgtttctatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatatt |
1527 |
T |
|
| Q |
226 |
aggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1526 |
gggaaaacggggtgttacaa |
1507 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
4862 |
tttccgctgcaatgtttaagatattttgttgaaagttaaattgttatttaactgattttggtttatgcttgaatgtgatatcccgttt---acgatgttt |
4766 |
T |
|
| Q |
193 |
actctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaa-cggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4765 |
actctgataattgttt--agaaattttcatattgggaaaaacggggtgttaca |
4715 |
T |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
1007 |
gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgctg |
1100 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1101 |
ggaaaacggggtgttacaa |
1119 |
T |
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128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgtt-atatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
5630 |
gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgctg |
5723 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5724 |
ggaaaacggggtgttacaa |
5742 |
T |
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Target: scaffold0020; HSP #1
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191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14614 |
ttactctgataattgttt-aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
14666 |
T |
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Target: scaffold0015; HSP #1
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165 |
atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
195764 |
atgtgatatcccgttaatt--gatgattactctgataattgtttt--gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
195839 |
T |
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Target: scaffold1813; HSP #1
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| Q |
192 |
tactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1336 |
tactctgataaatgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
1285 |
T |
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224 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
20 |
gttaaattgttatttaactaattttggactatgttttgtatgtgatatcccgttt---atgctgaatactctgataaaatgttt--agaaattttgatat |
114 |
T |
|
| Q |
225 |
taggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
115 |
tgggaaaacggggtgttacaaa |
136 |
T |
|
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Target: scaffold0676 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
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Target: scaffold0676; HSP #1
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttat |
222 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3763 |
gttaaattgttatttaactgtttttagattatgtgaaatgtgatatcccg---tttgtgatgtttactctgatatttg-tttaagaaatttttat |
3673 |
T |
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Target: scaffold0375; HSP #1
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
232 |
gttaaattgttatttaactatttttagattatgtgaaatatgatatcccg--ttttatgatgtttactctgatttatg--ttaataaatttttatgttgg |
327 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgtta |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |
|
|
| T |
328 |
gaaaatggggtgtta |
342 |
T |
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Target: scaffold0297; HSP #1
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
11368 |
gttaaattgttatttaactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttgg |
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T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaaaacggggtgttacaa |
11479 |
T |
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Target: scaffold0081; HSP #1
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atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13910 |
atgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacagggtgttacaaa |
13834 |
T |
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atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22935 |
atgtgatatcccgttt---atgatgtttactttgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
22860 |
T |
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atgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38359 |
atgtgatatcccgttt---atgatgtttactttgataattgtt--aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
38284 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold1908; HSP #1
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
8 |
gttaaattgttatttaactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttgg |
101 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
102 |
gaaaacggggtgttaca |
118 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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tttgatggggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgatataatttccgctgcaatgtttaagatattt |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1185 |
tttgatggggcctacgtgccaaaacgatttatggatttcga-attaactccgctgcaatgtttaagatattt |
1115 |
T |
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Target: scaffold0508; HSP #1
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tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15 |
tatgtgatatcccgttt---atggtttttactctgataattgttt-aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
91 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0417; HSP #1
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130 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
139 |
tgatggggcctacgtgccaaattgatttatggatttcgaattaattttccgctgcaatgtttaagatatttggtt |
213 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10926 |
ttactctgataaatgtttt--gaaatttttgtgttgggaaaacggggtgttaca |
10977 |
T |
|
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128 |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
47549 |
gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgttg |
47642 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
47643 |
ggaaaacgagatgttacaaa |
47662 |
T |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12752 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
12700 |
T |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26263 |
ttactctgataaatgttt-aagaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
26211 |
T |
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26145 |
ttactctgataattgttt-aagaaatttttatattgggaaaacgggatgttaca |
26197 |
T |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| || |
|
|
| T |
29563 |
gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactttgataattgtt--aagaattttttatgttg |
29656 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29657 |
ggaaaacggggtgttacaa |
29675 |
T |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
5385 |
gttaaattgttatttgactatttacg-attatgtttaaatgtgatatcccgttt---ataatgtttactctgataattgtt--aagaaatttttatgctg |
5292 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5291 |
ggaaaacggggtgttaca |
5274 |
T |
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tatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8688 |
tatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttatgttgggaaaatggggtgttacaa |
8764 |
T |
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192 |
tactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11085 |
tactctgataaat-ttttatgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
11034 |
T |
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Target: scaffold0420; HSP #1
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tactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaa |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14605 |
tactctgataattgttat--gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaaaa |
14658 |
T |
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Target: scaffold0324; HSP #1
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227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
19995 |
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19902 |
T |
|
| Q |
228 |
gaa-aacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19901 |
gaagaacggggtgttaca |
19884 |
T |
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Target: scaffold0261; HSP #1
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | || | |
|
|
| T |
605 |
gttaaattgttatttaactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccgtttgt---gatgtttactctgatatttgtt--aagaaatttttttgttgg |
512 |
T |
|
| Q |
228 |
gaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
511 |
gaaaacggggtgttacaa |
494 |
T |
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Target: scaffold1212; HSP #1
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ggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgtt |
207 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2395 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgtt--tgatgtttactctgataaatgtt |
2343 |
T |
|
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Target: scaffold0550; HSP #1
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gttaaattattatttgactgtttttggattatgttata-tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatatta |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| || || |
|
|
| T |
6792 |
gttaaattgttatttaactgttttgcgattatgtttgaatgtgatatcccgttt---atgatgcttactctgat-tatttgttaagaaattttcatgttg |
6697 |
T |
|
| Q |
227 |
ggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
6696 |
ggagaacgggatgttaca |
6679 |
T |
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Target: scaffold0075; HSP #1
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54470 |
ttactctgataaatgttat--gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaa |
54522 |
T |
|
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Target: scaffold0034; HSP #1
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191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31629 |
ttactctgataaatgtttt--gaaatttttaagttgggaaaacggggtgttacaa |
31577 |
T |
|
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208 |
ttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17162 |
ttaaggaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
17199 |
T |
|
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaac |
249 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3114 |
ttactctgataaatgttt-atgaaaattttaagttcggaaaacggggtgttacaaaaac |
3057 |
T |
|
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Target: scaffold0674; HSP #1
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206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2780 |
ttttatgaaatttttatgttaggaaaacggggtgttaca |
2742 |
T |
|
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Target: scaffold0557; HSP #1
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gggcctgcgtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattt-ccgctgcaatgtttaagatatttg-----gttaaattattatttgactgtttttgg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||| | ||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
280 |
gggcctgcttgccaaatcgttttacgaattttgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttgg |
379 |
T |
|
| Q |
155 |
attatg-ttatatgtgatatcccgttt |
180 |
Q |
| |
|
|||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
380 |
attacgtttctatctgatatcccgttt |
406 |
T |
|
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31752 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagtttggaaaacggggtgttacaa |
31699 |
T |
|
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3530 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttacaa |
3477 |
T |
|
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ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1377 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttcggaaaacggggtgttaca |
1325 |
T |
|
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208 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2600 |
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2563 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
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T |
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gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
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| |
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|
|
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T |
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Query Start/End: Original strand, 212 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1069 - 1036
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1069 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
1036 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0282 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
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Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 11842 - 11894
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11842 |
ttactttgataaatgttt-atgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
11894 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0221 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:
Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1146 - 1096
Alignment:
| Q |
192 |
tactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1146 |
tactctgataattgtttt--gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
1096 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0161 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:
Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3316
Alignment:
| Q |
191 |
ttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3264 |
ttactctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
3316 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 245
Target Start/End: Original strand, 9138 - 9171
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9138 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
9171 |
T |
|
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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 245
Target Start/End: Original strand, 44809 - 44841
Alignment:
| Q |
213 |
aaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44809 |
aaatttttatattgggaaaacggggtgttacaa |
44841 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:
Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 9838 - 9923
Alignment:
| Q |
154 |
gattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9838 |
gattatgtgaaatgtgatatcccgttt---atgatgtttactctgatatttgat--aagaaattcttatgttgggaaaacggggtgttaca |
9923 |
T |
|
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Target: scaffold0964 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0964
Description:
Target: scaffold0964; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3490 - 3416
Alignment:
| Q |
166 |
tgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3490 |
tgtgatatcccgtttgtgatgat--ttactctgataaatgtatt--gaaatttttaagttgggaaaacggagtgttaca |
3416 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0956 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:
Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3644 - 3612
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3644 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
3612 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0634 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:
Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Original strand, 5539 - 5598
Alignment:
| Q |
185 |
tgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaa |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5539 |
tgatgattactctgataaatg-tttatgaaatttttaagttggaaaaacggggtgttacaa |
5598 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0452 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:
Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Original strand, 2167 - 2199
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2167 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
2199 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0434 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:
Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Original strand, 264 - 296
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
264 |
gaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
296 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:
Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 244
Target Start/End: Original strand, 1515 - 1626
Alignment:
| Q |
128 |
gttaaattattatttgactgtttttggattatgttatatgtgatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattag |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || | |||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
1515 |
gttaaattgttatttgactatttatg-attatgtgaaatgtgatatcccg---tttatgacgtttactctgat--atttattaagaaattgttatgttgg |
1608 |
T |
|
| Q |
228 |
g-aaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1609 |
gaaaaacggggtgttaca |
1626 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:
Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 34866 - 34902
Alignment:
| Q |
212 |
gaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaaaa |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34866 |
gaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaaaa |
34902 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0047 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:
Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 77165 - 77125
Alignment:
| Q |
206 |
ttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttacaaa |
246 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77165 |
ttttatgaaatttttatgttgggaaaacggggtgttacaaa |
77125 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1076 - 1014
Alignment:
| Q |
180 |
ttttatgatgcttactctgataaatgttttaagaaatttttatattaggaaaacggggtgttaca |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1076 |
ttttatgatg-ttgctctgataaatgttt-atgaaatttttaagttgggaaaacggggtgttaca |
1014 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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