View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14306_low_1 (Length: 947)

Name: NF14306_low_1
Description: NF14306
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14306_low_1
NF14306_low_1
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (1-947)||(4616837-4617783)
chr6 (1-764)||(4601787-4602550)
chr6 (5-762)||(4563711-4564468)
chr6 (5-762)||(4592231-4592988)
chr6 (122-764)||(4514613-4515255)
chr6 (20-759)||(4266559-4267295)
chr6 (148-764)||(4480691-4481307)
chr6 (143-762)||(4613231-4613850)
chr6 (134-764)||(4505855-4506485)
chr6 (148-762)||(4560506-4561118)
chr6 (20-762)||(4585636-4586375)
chr6 (133-762)||(4574308-4574937)
chr6 (20-741)||(4259547-4260265)
chr6 (133-764)||(4625949-4626580)
chr6 (88-759)||(4622145-4622811)
chr6 (20-764)||(4516319-4517060)
chr6 (133-764)||(3171739-3172370)
chr6 (133-764)||(4461121-4461752)
chr6 (79-759)||(4256076-4256741)
chr6 (133-756)||(4503900-4504523)
chr6 (133-756)||(4469809-4470432)
chr6 (19-758)||(4598175-4598911)
chr6 (133-756)||(4489858-4490481)
chr6 (143-762)||(4557125-4557744)
chr6 (143-762)||(4570972-4571591)
chr6 (149-762)||(4579432-4580045)
chr6 (20-596)||(4457760-4458334)
chr6 (20-482)||(4299214-4299673)
chr6 (266-743)||(4568072-4568552)
chr6 (371-764)||(4492953-4493346)
chr6 (555-764)||(4299671-4299874)
chr6 (656-765)||(4392052-4392161)
chr6 (697-762)||(4606958-4607023)
chr6 (783-855)||(4601643-4601715)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (1-764)||(1281112-1281875)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (5-764)||(1674224-1674984)
chr8 (5-762)||(20863221-20863975)
chr8 (148-762)||(16685785-16686399)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (276-764)||(27999745-28000233)
chr5 (20-759)||(24103002-24103738)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (88-759)||(3179-3848)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (20-759)||(4082-4815)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (133-765)||(3086417-3087049)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (5-224)||(1-221)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (410-600)||(3465-3654)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 879; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 879; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 4617783 - 4616837
Alignment:
Q  1 attcttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4617783 attcttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccacaattccttctatttatccgattggccctttaccttcattat 4617684  T
Q  101 taaaacaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4617683 taaaacaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagccggg 4617584  T
Q  201 atcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4617583 atcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaatcatttttg 4617484  T
Q  301 tggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4617483 tggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttctcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctaatagcaagttggtgtc 4617384  T
Q  401 cacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgtt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4617383 cacaagacaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaattcaaccactgaaagtatatgcgctggagtgccaatgtt 4617284  T
Q  501 gtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4617283 gtgttggccattttttgccgaccagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggag 4617184  T
Q  601 ttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4617183 ttggcaaagctgatcaatgaagtgatagccggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagac 4617084  T
Q  701 caggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaattaaggcacgaggtcgtatcaaaatttttaggctattac 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4617083 caggtggttgttcatacatgaacttgaacaaagttattaaggatgtgttgcttaaacaaaattaagccaggaggtcgtatcgaaatttttaggccattac 4616984  T
Q  801 tatgctttgatgtactgtatttttaactatgtattgtttcaatatttaatttgggtttattggtggattattggtaagtgtaccaaatcgtcaatcaaag 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4616983 tatgctttgatgtactgtatttttaactatgtattgtttcaatatttaatttgggtttattggtggattattggtaagtgtaccaaatcgtcaatcaaag 4616884  T
Q  901 taataaatttctaagttcatattcagagtttatcttagattgcaatt 947  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4616883 taataaatttctaagttcatattcagagtttatcttagattgcaatt 4616837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4602550 - 4601787
Alignment:
Q  1 attcttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |  || ||  | |||||| | ||| | || || || || | ||||||||    
T  4602550 attcttttgaatacttacaatgaacttgagagtgatgtaatgaatgcactatattctatgttcccttctttatatactatcggacctttgcattcattat 4602451  T
Q  101 taaaacaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccgg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4602450 taaatcaaactccacaaattcatcaattggactgtttaggttccaacctctggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaaggagccggg 4602351  T
Q  201 atcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttg 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4602350 atccgttgtttatgtgaattttggcagcattacagttatgacaccccatcaattattagaattcgcttggggtttggccaattgccataaaccatttttg 4602251  T
Q  301 tggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtc 400  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4602250 tggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttgtcatctgagtttacaaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagttggtgtc 4602151  T
Q  401 cacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgtt 500  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4602150 cacaagagaaagtgttgaaccacccttcgatcggcggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccgatgtt 4602051  T
Q  501 gtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggag 600  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4602050 gtgttggcctttttttgccgatcagccaacaaactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacaaatgtgaagagagaggag 4601951  T
Q  601 ttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagac 700  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  4601950 ttggcgaagctgatcaatgaagtgatagccggagataaaggcaagaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagatggcaaaggagagcactagac 4601851  T
Q  701 caggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4601850 taggtggttgttcatacaagaacctggacaaagttattaaggaggtgttgcttaaacaaaatta 4601787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4564468 - 4563711
Alignment:
Q  5 ttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  4564468 ttttgaatactttccatgaactttagagtgatgtaataaatgctctctcctctatgtttccttctctttaccccattggccctttaccttcattattaaa 4564369  T
Q  105 acaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatca 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  4564368 ccaaactccacaaattcatcaattggattctttaggttccaacctttggaaagaagatactaagtgtcttgaatggcttgaatccaaggagccgggatcc 4564269  T
Q  205 gttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtgga 304  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4564268 gttgtttatgtgaattttggaagcattacagttatgacaccaaaacaactgttggaatttgcttgggggttggccaattgcaataaaccctttttgtgga 4564169  T
Q  305 tcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccaca 404  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  4564168 tcattaggcctgaccttgtcattggtggctcagtcgttttgtcatctgagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcttaattgcaagttggtgtccaca 4564069  T
Q  405 agtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgt 504  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4564068 ggagaaagtattgaaccacccttcaattggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttgtgt 4563969  T
Q  505 tggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttgg 604  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  4563968 tggccattctttggtgatcagccaacaaactgtagacttatttacaatgaatgggagattgggatggaaatcgatacgaatgtaaagagagaagaggtgg 4563869  T
Q  605 caaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccagg 704  Q
      || ||  |||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||| | ||    
T  4563868 agaaacttgtcaatgaattgatgtcaggagagaaaggaaagaagatgcggcaaaaggcaattgagttgaagaagaaagtggaggaaaacacgagagctgg 4563769  T
Q  705 tggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  4563768 aggttgttcatacatgaacttggacaaagtgatcaaggaggttttgcttaaacaaaat 4563711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4592988 - 4592231
Alignment:
Q  5 ttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  4592988 ttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctctatgtttccttctctttaccccattggccctttaccttcattattaaa 4592889  T
Q  105 acaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatca 204  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||  | || ||     
T  4592888 ccaaactccacaaatccatcaattggattcttttggttccaacatatggaaagaagatactgagtgtcttaaatggcttgaatcgaaggaatcgggttcc 4592789  T
Q  205 gttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtgga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||| || |  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4592788 gttgtttatgtgaatttcggcagccttacagttatgaatgaagagaaaatgttagagtttgcttggggtttggccaattgcaataaaccttttttgtgga 4592689  T
Q  305 tcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccaca 404  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||| | || || || |||||||| ||    
T  4592688 tcattaggcctgatcttgtcattggtggcacaattgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcgtaatcgcgagctggtgtcctca 4592589  T
Q  405 agtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgt 504  Q
    ||   |||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4592588 agagcaagtattaaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagtatatgtgctggaattccaatgttgtgt 4592489  T
Q  505 tggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttgg 604  Q
    |||||||| |||   |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4592488 tggccattctttagtgatcagccaacaaactgtagacttatttacaatgaatgggagattgggatggaaattgatacgaatgtaaagagagaggaggtgg 4592389  T
Q  605 caaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccagg 704  Q
      || || ||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4592388 agaaacttatcaatgaattgatggtgggagagaaaggaaagaagatgaggaaaaaggcaatcgagttgaagaagaaggcagaggagaacacgagacctgg 4592289  T
Q  705 tggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||    
T  4592288 aggttgttcatatatgaacttggacaaattgatcaaggaggtgttgcttaaataaaat 4592231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 122 - 764
Target Start/End: Original strand, 4514613 - 4515255
Alignment:
Q  122 atcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaattt 221  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  4514613 atcacttggaatctttaggttccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaatcaggatctgttgtttatgttaattt 4514712  T
Q  222 cggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatctt 321  Q
     || ||||| ||  ||||| | || ||| ||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4514713 tggtagcatcacgattatgtctccggagaaattgttagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaaaacctttttatggatcattaggcctgatctt 4514812  T
Q  322 gtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaacc 421  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  4514813 gtcattggtggctcagtggttttgtcgtctgagtttgtgaatgaaattgcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagttttgaacc 4514912  T
Q  422 acccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccga 521  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||    
T  4514913 acccttcaattggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgagagcatatgcgctggagtgccaatgctttgttggcaattctttggtga 4515012  T
Q  522 tcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaa 621  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||    
T  4515013 tcaaccaacaaactgtagatttatttgcaatgaatgggagattgggatcgaaatcgatatgaatgtgaagagagaggaggttgaaaagcttgtcaatgaa 4515112  T
Q  622 gtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatga 721  Q
     |||| |  ||||| |||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  || || | ||||||| |||    
T  4515113 ttgatggtgggagagaaaggaaataaaatgaggaaaaaggttatggagttgaaaaagaaggcagacgaggacactagacttggcgggtcttcatacttga 4515212  T
Q  722 acttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4515213 acttggacaaagtgatcaaggaggtgttgcttaaacaaaatta 4515255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 759
Target Start/End: Original strand, 4266559 - 4267295
Alignment:
Q  20 atgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  | |||||||| ||  | |||||||| ||  |||| || ||||| |||| ||||||||     
T  4266559 atgaacttgagagtgatgttatgaatgctctctactctatgttcccttctatatacaccattggcccatttgcttcttttttaaatcaaagtccacaaa- 4266657  T
Q  120 tcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaat 219  Q
      |||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| |||    
T  4266658 --atcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgagtggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaat 4266755  T
Q  220 ttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatc 319  Q
    || || ||||| ||||||||| |||  ||| |  |  | || ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  4266756 tttggtagcatcacagttatgtcacgagagaagctcttagagtttgcttggggtttggccaacagcaagaacccttttttgtggataattaggcctgatc 4266855  T
Q  320 ttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaa 419  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||   || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4266856 ttgtcattgggggctcagttgttttgtcatctgatttttttaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagataaagtgttgaa 4266955  T
Q  420 ccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgcc 519  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  4266956 ccacccttcgattggtggattcttgactcattgcggatggaattcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggccattctttggt 4267055  T
Q  520 gatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatg 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||| ||  | |  ||| |  ||||||    
T  4267056 gatcagccaacaaactgtagatttatttgctatgaatgggagattggactcgaaatcaatacaaatgtgaagagagatgacgtcgagaagttagtcaatg 4267155  T
Q  620 aagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacat 719  Q
    || |||| |  ||||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  4267156 aattgatggtgggagagaaaggaaatatgatgaagcaaaatgtcttggagttgaagaggaaggcagaagagaacacaagacctggtggtttttcatacat 4267255  T
Q  720 gaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaa 759  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4267256 gaacttggacaaagttattaaggaggtcatgcttaaacaa 4267295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 148 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4481307 - 4480691
Alignment:
Q  148 ctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccg 247  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |  |    
T  4481307 ctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcacaattatgtctcaag 4481208  T
Q  248 agcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatc 347  Q
    || || |  | || |||||||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  4481207 agaaactcttagagtttgcttggggttttgccaatagcaaaaaaaactttttgtggattattaggtctaatcttgtcattggtggctcagtggtgttgtc 4481108  T
Q  348 atctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgact 447  Q
    |||||||| |   || |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4481107 atctgagtatttgaaagaaatttcaaatagaggcctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaatcggcggattcttgact 4481008  T
Q  448 cattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttattt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||| ||||||    
T  4481007 cattgcggatggaactcaaccactgaaagtgtatgtgctggagtgccaatgttgtgttggccattctttgccgatcagccacctaaccgtagaattattt 4480908  T
Q  548 gtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaa 647  Q
    | |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  | | | ||||||||| || | |  ||||| |||||||||||    
T  4480907 gcaatgaatgggagattggactcgaaatcgataccaatgtgaagagagaagatgtggagaggttaatcaatgaattgttggtgggagagaaaggaaagaa 4480808  T
Q  648 aatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtg 747  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  4480807 gatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagatggcagaggaggacacaagacctggtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtc 4480708  T
Q  748 ttgcttaaacaaaatta 764  Q
    |||||||||||||||||    
T  4480707 ttgcttaaacaaaatta 4480691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 143 - 762
Target Start/End: Original strand, 4613231 - 4613850
Alignment:
Q  143 ccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgac 242  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  4613231 ccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgattggcttgaatccaaggaaccgaagtccgttgtttatgtgaattttgggagcatgaccgttatgac 4613330  T
Q  243 acccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgatt 342  Q
      | ||  || || | || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  4613331 tgcagaaaaactattagagtttgcttggggtttggcgaatagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcagttgtt 4613430  T
Q  343 ttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattct 442  Q
    || ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||| ||||   |||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  4613431 ttgtcatcagagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgagctggtgtcctcaagagcaagtattaaaccacccttcaattggcggattct 4613530  T
Q  443 tgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatt 542  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||     
T  4613531 tgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggccatttttcgcggatcagccagcaaactgcagata 4613630  T
Q  543 tatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaagga 642  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||| |||| |  ||||| ||||||    
T  4613631 tatatgcaatgaatgggaaattgggatggaaattgacaccaatgtgaagagagatgaggtagagaagctggtcaatgaattgatggtgggagagaaagga 4613730  T
Q  643 aagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaagg 742  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  4613731 aagaaaatgaggcaaaaggcaattgagttgaagaagaaggcagaggaggacacgagaccaggaggttgttcatatatgaacttggacaaagtgatcaatg 4613830  T
Q  743 aagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
    | ||| |||| |||||||||    
T  4613831 aggtgctgctgaaacaaaat 4613850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 134 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4506485 - 4505855
Alignment:
Q  134 ctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattac 233  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||| || || || |  || ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  4506485 ctttagattcaaatctttggaaagaggatactaaatgtctcgaatggctggaatcaaaagaaccggcttctgttgtttatgtgaattttggaagcatcac 4506386  T
Q  234 agttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggc 333  Q
    | ||||| | || ||| ||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4506385 aattatgtctccggagaaatttttagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtaattggtggc 4506286  T
Q  334 tcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcg 433  Q
    |||||| |||| || || |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||| |    
T  4506285 tcagtggttttgtcttcagagtttgcaaatgaaatttcagatagaagccttatagcaagctggtgttcacaagagaaagtgttaaatcacccttcaattg 4506186  T
Q  434 gaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacaga 533  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||| |||||| |    
T  4506185 gtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgctgtgttggccgttctttggtgatcaaccaacaaa 4506086  T
Q  534 ctgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgga 633  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||  |  | |  |||||| || ||||| | || | ||||    
T  4506085 ctgtagatttatttgcaatgaattggagattggaatcgaaattgatactaatgtgaatagagaaaatgtagagaagctggtcgatgaaattatggttgga 4505986  T
Q  634 gataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaag 733  Q
    || |||||||| || |||| | |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4505985 gagaaaggaaacaagatgaggaaaaaggtcatggagttgaaaaagagggcaaaggaggatacaagacctggtggttgttcattcatgaacttggacaaag 4505886  T
Q  734 ttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4505885 ttattaaggaggtgttgcttaaacaaaatta 4505855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 148 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4561118 - 4560506
Alignment:
Q  148 ctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccg 247  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| | | |  |    
T  4561118 ctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttaagtctcaag 4561019  T
Q  248 agcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatc 347  Q
    || ||    | || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  4561018 ag-aagccttagagtttgcttggggtttggccaacagcaagaaaccatttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctc 4560920  T
Q  348 atctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgact 447  Q
    |||||| |||  ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  4560919 atctgatttttgaaa-gaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacccatcagtcggtggattcttgact 4560821  T
Q  448 cattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttattt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||    
T  4560820 cattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttgtgttggccattttttgcagatcagccagcaaactgaagatatattt 4560721  T
Q  548 gtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaa 647  Q
    | ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||  || ||| |||||||| ||||  |  ||||||||||||||||    
T  4560720 gcaatgaatggaagattggaaacgaaattgatacaaatgtaaagagggaggacgtggagaaactggtcaatgaattgatgtcctgagataaaggaaagaa 4560621  T
Q  648 aatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtg 747  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  4560620 gatgaggcaaaaggccatggagctgaagaaaaaggcggaggtgtacacgagacctggaggttgttcatacatgaacttggagaaagtgattaaggaggtg 4560521  T
Q  748 ttgcttaaacaaaat 762  Q
    |||||||||||||||    
T  4560520 ttgcttaaacaaaat 4560506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4586375 - 4585636
Alignment:
Q  20 atgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaat 119  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||| ||||||||     
T  4586375 atgaacttgagaaggatgtaataaatgttctctccactaagttcccttctatttatgccattggccctttatcatcatttttaaatcaaagtccacaaa- 4586277  T
Q  120 tcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaat 219  Q
      | || || |  ||||||  | | || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  4586276 --accacttagcatctttaagtacaaatctttggaaagaggataccaagtgtcttgattggcttgaatcaaaggaaccgaggtccgttgtttatgtgaat 4586179  T
Q  220 ttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatc 319  Q
    || || ||||  |||||||||||  | ||  || || | || ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||| || |||||||    
T  4586178 tttgggagcacaacagttatgactacagaaaaactattagagtttgcttggggtttggccaatagcaagcaacattttttatggatcattagacctgatc 4586079  T
Q  320 ttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaa 419  Q
    ||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||| || ||||   |||| |||||    
T  4586078 ttgtcattggtggttccttggttttgtcatctgagtttaagaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgggttggtgcccgcaagagcaagtattgaa 4585979  T
Q  420 ccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgcc 519  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  4585978 ccacccttcaattggtggattcttgactcactgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggccattcattgct 4585879  T
Q  520 gatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatg 619  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||    
T  4585878 gatcagccaacaaactgtagaattatttgcaatgaatgggagattgggatggaagttgacaccaatgtgaagagagaggaggtggagaagttggtcaatg 4585779  T
Q  620 aagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacat 719  Q
    || |||| |  ||||| || |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4585778 aattgatggtgggagagaatggaaagaagatgaggcaaaaggcaatcgagttgaagaagaaggcggaggaggacacgagacctggaggttgttcatacat 4585679  T
Q  720 gaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
     |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  4585678 aaacttggaaaaagtgattaaggaggttttgcttaaataaaat 4585636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 133 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4574937 - 4574308
Alignment:
Q  133 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 232  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||| || || ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4574937 tctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggattgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatca 4574838  T
Q  233 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 332  Q
    | |||||| | |  ||| |  |  | || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4574837 ctgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtgg 4574738  T
Q  333 ctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatc 432  Q
    ||| ||| |||| |||||||| |||   || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||    
T  4574737 ctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtc 4574638  T
Q  433 ggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacag 532  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  4574637 ggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccatttttttcggatcagccagcaa 4574538  T
Q  533 actgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgg 632  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||  || ||| |||||||| ||||  | ||    
T  4574537 actgcagatatatttgcaatgaatgggagattggaaaggaaatcgatactaatgtaaagagggaggaggtggagaaactggtcaatgaattgatgtccgg 4574438  T
Q  633 agataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 732  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| | |||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||    
T  4574437 agataaaggaaagaagatgaggcaaaaagccattgagctgaagaagaaggtggaggtggacacgagacctggaggttgttcatacacaaacttggagaaa 4574338  T
Q  733 gttattaaggaagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4574337 gtgattaaggaggtgttgcttaaacaaaat 4574308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 741
Target Start/End: Original strand, 4259547 - 4260265
Alignment:
Q  20 atgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||  || ||  | |||||| | ||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  4259547 atgaacttgagagtgatgtaatgaatgtgctctattctatgttcccttctttatatgctattggacctttaccttcattattaaatcaaactccacataa 4259646  T
Q  120 tcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaat 219  Q
    ||| |   |||  || |||| |||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||  ||||| || |  || |||||||| ||||||    
T  4259647 tcacc---tggcatcgttaggttccaatctttggaaagaagataccaaatgtcttgaatggcttgaatttaaggaacctgagtctgttgtttacgtgaat 4259743  T
Q  220 ttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatc 319  Q
    || |||||||||||||||||||| || || |||||  | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  4259744 tttggcagcattacagttatgactccagatcaatttttagagtttgcttggggattggccaatagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgacc 4259843  T
Q  320 ttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaa 419  Q
    |  | |||||||||||  | ||||| ||||||||||||   | ||||||| | ||||||||||| || || || |||||||| ||||   ||||  ||||    
T  4259844 tcattattggtggctcctttattttgtcatctgagtttgagagtgaaatttcggatagaggcctaatcgcgagctggtgtccgcaagagcaagtactgaa 4259943  T
Q  420 ccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgcc 519  Q
    |||| ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4259944 ccactcttcagttggtggattcttaactcattgcggatggaactcaaccattgaaagcatttgtgccgaagttccaatgttgtgttggccattttttgct 4260043  T
Q  520 gatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatg 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  4260044 gatcagccaacaaactgtagatttatttgtaacgaatgggagattggaattgaaattaatactaatgtgaaaagagatgaggtggcgaagctgatcaatg 4260143  T
Q  620 aagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacat 719  Q
    || | ||  | |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||  ||    
T  4260144 aaattatgtcaggagaagaaggaaagaagatgaggcaaaaggtcatggagttgaagaggaaggcagaggagaacaccagtccatctggttattcattgat 4260243  T
Q  720 gaacttggacaaagttattaag 741  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4260244 gaacttggacaaagttattaag 4260265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 133 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4626580 - 4625949
Alignment:
Q  133 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 232  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| |||||| ||    || |||||||||||||| || |||||| |||    
T  4626580 tctttaggttccaatctttggaaagaagacaccaattgtcttgaatggcttgaattcaaggaaccaaagtctgttgtttatgtgaactttggcagcgtta 4626481  T
Q  233 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 332  Q
     ||||||||| ||  || || |  | || |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4626480 tagttatgactccacagaaactgttagagtttgcttggggtttggctgatagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtgattggtgg 4626381  T
Q  333 ctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatc 432  Q
    |||| | ||||  ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||     
T  4626380 ctcatttatttcgtcatccgagtttgagaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcaagctggtgtccgcaagagaaagtactgaaccatccttcaatt 4626281  T
Q  433 ggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacag 532  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||     
T  4626280 ggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccattgaaagcatatgcgctggagttccaatgctgtgttggccaaattttgctgatcagccaacaa 4626181  T
Q  533 actgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgg 632  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| | | |  || |||||||||| | |||| || ||    
T  4626180 attgtagatatatttgcaatgaatgggagattggaatggaaatcgatgctaatgtgaagagggagggggtagagaaactgatcaatgcattgatggcagg 4626081  T
Q  633 agataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 732  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  4626080 agataacggaaagaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacattagtcccggtggttgttcatacatgaatatggataaa 4625981  T
Q  733 gttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
     | ||||| || || |||||||||||| ||||    
T  4625980 ctgattaatgatgtcttgcttaaacaatatta 4625949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 88 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 4622811 - 4622145
Alignment:
Q  88 ttaccttcattattaaaacaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaat 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||| ||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  4622811 ttaccttcattattaaatcaaactccacata---atcacttggcatctctaggttccaatctttggaaagaagatatcaagtgtcttgagtggcttgaat 4622715  T
Q  188 ccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaa 287  Q
    ||||||| || |  ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |  || ||| || | || |||||||||||||||||  || ||||    
T  4622714 ccaaggaacctgactc--ttgtttacgtgaattttggcagcattacagtgatgactcgagatcaactattagagtttgcttggggtttggctgatagcaa 4622617  T
Q  288 gaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcata 387  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||| ||     
T  4622616 gaaaccctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcatgggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcaggtagaggcctaatc 4622517  T
Q  388 gcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctg 487  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||  | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  4622516 gcaggttggtgtccacaagaggaagtacttaaccaccctgcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccaccgaaagcatatgtgctg 4622417  T
Q  488 gagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgt 587  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| || |||  |||||||||||| || |||||| |||| |||||    
T  4622416 gagtttcaatgctgtgttggccatttttcgctgatcagccaacaaactgtagatatatctgcaattcatgggagattggaatcgaaatcaatactaatgt 4622317  T
Q  588 gaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagag 687  Q
    ||| ||||||||| || | || |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4622316 gaaaagagaggaggtgtcgaatctgatcaatgaattgatgtcgggagataaaggaaagaagatgagacaaaaggccatggagttgaaggagaaggcagat 4622217  T
Q  688 gagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaa 759  Q
    ||||  || || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4622216 gagacgaccagccctggtggttgttcatacaacaacttggacaaagttattaaggaggtcatgcttaaacaa 4622145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4517060 - 4516319
Alignment:
Q  20 atgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaat 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || || |||| ||| ||||     
T  4517060 atgaacttgagaatgatgtaataaatgctctatctattaagatcccttctatttatgccattggccctttaacttcatttttgaatcaaagtccgcaaa- 4516962  T
Q  120 tcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaat 219  Q
      || | ||||  ||| ||| ||| || ||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||| ||||| |  || || || ||||||||||||    
T  4516961 --ataacttggcttctataggttctaatctttggaaagaagatatgaaatgtcttgaatggcttgaatctaaggaacaaggttctgtagtttatgtgaat 4516864  T
Q  220 ttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatc 319  Q
    || || ||||| || || ||||| || || ||| |  | || || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  4516863 tttggaagcatcacggtcatgactccagatcaactgttagagttcgcttggggtttggccaacagcaagaaaccttttttgtggattattaggcctgacc 4516764  T
Q  320 ttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaa 419  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||   ||||||| | | ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  4516763 ttgtcattggtggctcggttattttgtcatccgattttgtgaatgaaacttcggatagaggcgtaatagcaagctggtgtccgcaagagaaagtgttgaa 4516664  T
Q  420 ccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgcc 519  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  4516663 ccatccttcagttggaggattcttgactcattgtggatggaactccacaatggaaagcatctgtgccggagtaccaatgttgtgttggcctttttttgct 4516564  T
Q  520 gatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatg 619  Q
    || ||||||||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  4516563 gagcagccaacaaattgcagatatatttgcaatgaatgggagattggagcagaaattgataccaatgtgaagagagaggaggtggagaagctgatcaatg 4516464  T
Q  620 aagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacat 719  Q
    || | || |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  4516463 aattaatggtgggagataaaggaaagaagatgaggcaaaaggccatggaattgaagaagaaggcagaggaggacacaagaccaggtggttgttcatatgt 4516364  T
Q  720 gaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  4516363 gaacttggaaaaagtgattaaggaggtgctgctcaaacaaaatta 4516319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 133 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 3172370 - 3171739
Alignment:
Q  133 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 232  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| | || ||  |   ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  3172370 tctttagattctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaaacaaaagaatcaaaatctgttgtttatgtaaattttggcagcatca 3172271  T
Q  233 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 332  Q
     ||||||| | |  ||| ||||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3172270 tagttatgtctcaagagaaattattagagtttgcttggggtttagccaacagcaagaaaccctttttgtggattattaggcctgatcttgtcattggtgg 3172171  T
Q  333 ctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatc 432  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||     
T  3172170 ctcggttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccgcaagagaaagtgttgaaccatccttcaatt 3172071  T
Q  433 ggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacag 532  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |      
T  3172070 ggcggattcttgactcactgcggatggaactcaaccacggaaagtgtatgtgctggaatgccaatgttgtgtaggccattttttgctgatcaaccaccta 3171971  T
Q  533 actgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgg 632  Q
    || ||||| |||||||  | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | |  || |||||||| ||| |||| |  ||    
T  3171970 acagtagaattatttgccaagaatggaagattgggatggaaattgataccaatgtaaagagaggggaggtagagaaactgatcaacgaattgatggtggg 3171871  T
Q  633 agataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 732  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3171870 agagaaaggaaagaagatgaggcaaagggccatggagttgaagaagaaggcagaggaggatacaagatttggtggttgttcatacatgaacttggataaa 3171771  T
Q  733 gttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    || |||||||| || |||||||||||| ||||    
T  3171770 gtgattaaggaggtcttgcttaaacaatatta 3171739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 133 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4461752 - 4461121
Alignment:
Q  133 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 232  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  4461752 tctttaaattccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtctatgtaaattttggcagcatca 4461653  T
Q  233 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 332  Q
    |||||||||| || || ||| |  | || |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4461652 cagttatgactcctgatcaactgttagagtttgcttggggtttggctgatagcaagaaaccctttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggcgg 4461553  T
Q  333 ctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatc 432  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||  ||||||||||||||||     
T  4461552 ctcgtttattttgtcatctgagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccacccttcaatt 4461453  T
Q  433 ggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacag 532  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||     
T  4461452 ggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccgatgttgtgttggccattctttggtgatcagccagcaa 4461353  T
Q  533 actgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgg 632  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||| || ||| |||  ||| || |||| ||| |||| | |||    
T  4461352 actgtagatttatttgcaacaaatgggagattggacttgaaatcgataaagatgtgaagagggatgaggtggagaagttggtcaacgaattgatggttgg 4461253  T
Q  633 agataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 732  Q
    ||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||||||||  |||||| | || ||||| || |||  |||||||| |||||||||||||    
T  4461252 agagattggaaagaagatgaggcaaaaggtcatggaattcaagaagaaggtggaggaggataccagacctggaggtgtttcatacaagaacttggacaaa 4461153  T
Q  733 gttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  4461152 gtcattaaggatgtcttgcttaaacaaaatta 4461121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 79 - 759
Target Start/End: Original strand, 4256076 - 4256741
Alignment:
Q  79 attggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgatt 178  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    ||||  || |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  4256076 attggacctttaccttcattattaaatcaaactccacatagtcac---ttggcatcgttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaat 4256172  T
Q  179 ggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggc 278  Q
    |||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| |  | || ||||||||||| |||||    
T  4256173 ggcttgaatccaaggaacctgagtctgttgtttacgtgaattttggcagcattacagttatgactccagatcaactgttagagtttgcttggggattggc 4256272  T
Q  279 caattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagataga 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||             | ||||||    
T  4256273 caatagcaagaaaccatttttgtgtatcattaggcctgacctcgtcattggtggctcctttattttgtcatctgagttt-------------cggataga 4256359  T
Q  379 ggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagca 478  Q
    || || || |  ||||||||||| ||||   ||||  |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4256360 ggactaatcgagagttggtgtccgcaagagcaagtactgaaccactcttcagttggtggattcttgactcattgaggatggaactcaaccattgaaagca 4256459  T
Q  479 tatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcag-ccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcg 577  Q
    | || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||     
T  4256460 tttgtgccggagttccaatgttgtgttggccattttttgctgatcagaccaacaaactgtagatttatttgtagcgaatgggagattggaattgaaatca 4256559  T
Q  578 atacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaa 677  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  4256560 atactaatgtgaagagagatgaggtggagaatctgatcaatgaattgatgtcgggagaaaaaggaaagaagatgaggcaaaaggtcatggaattgaagaa 4256659  T
Q  678 gaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaa 759  Q
    |||| ||||| ||||||| || |||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4256660 gaagacagagaagaacaccagcccagctggtcattcattgatgaacttggacaaagttattaaggaggtcatgcttaaacaa 4256741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 133 - 756
Target Start/End: Original strand, 4503900 - 4504523
Alignment:
Q  133 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 232  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4503900 tctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgattggcttgaattaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcatta 4503999  T
Q  233 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 332  Q
    |||||||| |    ||  ||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  4504000 cagttatgtcttaagataaattgttagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaaaccttttttgtggattattaggcctgatcttgttattggtgg 4504099  T
Q  333 ctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatc 432  Q
    ||||| | | || |||||||| |||   ||||||| | |  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4504100 ctcagaggtgttgtcatctgattttgtgaatgaaacttctaatagaggacttgtagcaagttggtgtccacaagataaagtgttgaaccacccttcaatc 4504199  T
Q  433 ggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacag 532  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        
T  4504200 ggaggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagtgtttgtgctggagtgccaatgttgtgttggccatttttttctgatcagccactta 4504299  T
Q  533 actgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgg 632  Q
    |  | |   |||||||  | |||||||||||||| ||| | || ||| | |||||  ||||||| ||| | |  || || || |||||| |||| |  ||    
T  4504300 atagcaacattatttgcgaagaatgggagattgggatgaagattgatgccaatgtacagagagaagaggtagagaaacttattaatgaattgatggtggg 4504399  T
Q  633 agataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 732  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4504400 agagaaaggaaagaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggaggacacaagacttggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 4504499  T
Q  733 gttattaaggaagtgttgcttaaa 756  Q
    || |||||||| || |||||||||    
T  4504500 gtgattaaggacgtcttgcttaaa 4504523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 133 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 4470432 - 4469809
Alignment:
Q  133 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 232  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  4470432 tctttaaatttcaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgagtggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtctatgtaaatttcggcagcgtca 4470333  T
Q  233 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 332  Q
    |||||||| | || ||| || |  | || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  4470332 cagttatgtctccagagaaactgttagagtttgcttggggtttggcaaatagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcattggcgg 4470233  T
Q  333 ctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatc 432  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| || |  |  |||||||| ||||   ||||  |||||||||||||||||    
T  4470232 ctcggtagttttctcatcagagattgtaaatggaatttcagatagaggcctaatcgtgaactggtgtcctcaagagcaagtactgaaccacccttcaatc 4470133  T
Q  433 ggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacag 532  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||     
T  4470132 ggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattctttggtgatcagctagcaa 4470033  T
Q  533 actgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgg 632  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||   ||||||||||||| ||| |||  |||||  |||||||| |||| | |||    
T  4470032 attgtagatttatttgcaatgaatgggagattggacttgaaatcgataaagatgtgaagagagatgaggtggagaagctagtcaatgaattgatggttgg 4469933  T
Q  633 agataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 732  Q
    ||| || |||||||| |||| | |||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| | || ||||| || |||  |||||||| |||||||||||||    
T  4469932 agagaatggaaagaagatgagggaaaagatcatggagttcaagaagaaggtggaggaggataccagacctggaggtgtttcatacaagaacttggacaaa 4469833  T
Q  733 gttattaaggaagtgttgcttaaa 756  Q
    || |||||||| || |||||||||    
T  4469832 gtcattaaggatgtcttgcttaaa 4469809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 4598911 - 4598175
Alignment:
Q  19 aatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaa 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||   ||  | |||| ||||||| | |||||||| ||| |||| || ||||| |||| || |||||    
T  4598911 aatgaacttgagaatgatgtattgaatgttctctccagtatgttcccttgtatttatgccattggccctttatcttcgtttttaaatcaaagtcaacaaa 4598812  T
Q  119 ttcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaa 218  Q
      |||   ||||  ||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||  | || ||||||||||||||    
T  4598811 agcat---ttggcatctttaggtaccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgactggcttgaatccaatgaaccaaggtctgttgtttatgtgaa 4598715  T
Q  219 tttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgat 318  Q
    ||| || ||||| || || |||||  | ||  | ||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4598714 ttttgggagcataacggtgatgactgcagaaaagttgttagactttgcttggggtttggccaatagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgat 4598615  T
Q  319 cttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttga 418  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||| |  | ||||| |||||||  ||||   |||| || |    
T  4598614 cttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcttagttgcaagctggtgtctgcaagagcaagtattaa 4598515  T
Q  419 accacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgc 518  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  4598514 accatccttcaattggtggattcttaactcattgcggatggaactcaaccactgaaagtatatgtgccggagtgccaatgttgtgttgtccctttttcgc 4598415  T
Q  519 cgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaat 618  Q
     ||||||| | |  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || || |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||     
T  4598414 ggatcagcaagccaactgcagatatatttgcaatgaatgggagattggaatcaaaattgaaactaatgtgaagagagaggaggtggagaagctggtcaac 4598315  T
Q  619 gaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcataca 718  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||| |||||| |||||| | || ||||  || |||||||||||||    
T  4598314 gaattgatgtcgggagataaaggaaagaaaatgaggcaaaagacaattgatttgaagatgaaggcggaggaggaaacgagacttggaggttgttcataca 4598215  T
Q  719 tgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaaca 758  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4598214 tgaacttagagaaagtgattaaggaggtgtttcttaaaca 4598175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 133 - 756
Target Start/End: Original strand, 4489858 - 4490481
Alignment:
Q  133 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 232  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4489858 tctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcatca 4489957  T
Q  233 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 332  Q
    | |||||| | |  ||| |  || | || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4489958 ctgttatgtctcgagagaagctattagagtttgcatggggtttggccaacagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgttattggtgg 4490057  T
Q  333 ctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatc 432  Q
    ||||  | | || |||||||| |||   || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||     
T  4490058 ctcacaggtgttgtcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaggtattgaatcacccttcaatt 4490157  T
Q  433 ggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacag 532  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||        
T  4490158 ggtggattcttgactcattgtggatggaactcaatcatggagagtatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgctgatcaaccactta 4490257  T
Q  533 actgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgg 632  Q
     | ||||| |||||||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||| | |  || |||||||||||| |||| |  ||    
T  4490258 gcagtagaattatttgcgaagaatgggagattgggatgaaaattgataccaatgtaaagagagaagaggtagagaaactgatcaatgaattgatggtggg 4490357  T
Q  633 agataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 732  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4490358 agagaaaggaaagaagatgaggcaaaaggcgacggagttgaagaagaaggcagcggaggacacgagactcggtggtagttcatacatgaacttggacaaa 4490457  T
Q  733 gttattaaggaagtgttgcttaaa 756  Q
    || |||||||| ||  ||||||||    
T  4490458 gtgattaaggatgtcatgcttaaa 4490481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 143 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4557744 - 4557125
Alignment:
Q  143 ccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgac 242  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  4557744 ccaatctttggaaagaagataacaagtgtcttggttggcttgaatccaaggaaccgaggtccgttgtttatgtgaattttgggagcatgacagttatgac 4557645  T
Q  243 acccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgatt 342  Q
      | ||  || |  | || ||||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  4557644 ggcagaaaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaatagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcatcggtggctcagttgtt 4557545  T
Q  343 ttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattct 442  Q
    || ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||   |||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  4557544 ttgtcatcggagtttgtcaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgggctggtgcccgcaagagcaagtattaaaccatccttcaattggtggattct 4557445  T
Q  443 tgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatt 542  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||     
T  4557444 tgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatatctgctggagttccaatgttgtgttggccattttttgctgatcagccagcaaactgcagata 4557345  T
Q  543 tatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaagga 642  Q
    |||||| |||  |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| | |  ||  || |||||||| |||| |  || || ||||||    
T  4557344 tatttgcaatacatgggagattggcatggaaattgacaccaatgtgaagagagatgaggtagagaatttggtcaatgaattgatggagggggagaaagga 4557245  T
Q  643 aagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaagg 742  Q
    ||||| |||  | |||||   || ||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4557244 aagaagatgtggaaaaagataattgagatgaagacgaaggcggaggaggacacgagacctggtggttgttcatacatgaatttggaaaaagtgattaagg 4557145  T
Q  743 aagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
    | || |||||||||||||||    
T  4557144 aggttttgcttaaacaaaat 4557125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 143 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4571591 - 4570972
Alignment:
Q  143 ccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgac 242  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  4571591 ccaatctttggaaagaagataacaagtgtcttgattggcttgaatcaaaggaaccgaggtccgttgtttatgtgaattttgggagcaggacagttatgac 4571492  T
Q  243 acccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgatt 342  Q
      | ||  || |  | || ||||| |||||||| || ||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  4571491 ttcagaaaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaatagcaagcaactctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcattggtggctcagttgtt 4571392  T
Q  343 ttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattct 442  Q
    || ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||  | ||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  4571391 ttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaattgctggttggtgctcgcaagagaaagtattgaaccatccttcaattggtggtttct 4571292  T
Q  443 tgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatt 542  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||     
T  4571291 tgactcactgtggatggaactcaacgaccgaaagcatatctactggagttccaatgttgtgttagccattttttgctgatcagccagcaaactgtagata 4571192  T
Q  543 tatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaagga 642  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||  ||  || |||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  4571191 tatctgcaatacatgggagattggaatcgaaatcgatactaatgtgaagagaaatgaggtggagaatttggtcaatgaattgatggtgggagataaagga 4571092  T
Q  643 aagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaagg 742  Q
    ||||| |||| | ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4571091 aagaagatgaggaaaaatataatggagatgaagaagaaggcggaggaggacacgagacctggtggttgttcatacatgaacttggaaaaagtgattaagg 4570992  T
Q  743 aagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
    | || ||||||||| |||||    
T  4570991 aggttttgcttaaataaaat 4570972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 149 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4580045 - 4579432
Alignment:
Q  149 tttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccga 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||  | ||    
T  4580045 tttggaaagaagataccaagtgtctttattggcttgaatccaaggaacctaggtctgttgtttatgtgaattttgggagcttgacagttatgactgcaga 4579946  T
Q  249 gcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatca 348  Q
      || |  | || ||||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||   |||| |||    
T  4579945 aaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaatagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcatcggcggctcagctgttttgtca 4579846  T
Q  349 tctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactc 448  Q
    || ||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4579845 tcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaataacgagctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactc 4579746  T
Q  449 attgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttg 548  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |  ||| |||| | | ||    
T  4579745 attgcggatggaactcaatcactgaaagcatatctgctggagttccaatgttgtgttggccatttttcgctgatcacccagtaagctgcagatatttatg 4579646  T
Q  549 taatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaa 648  Q
     |||  |||| | ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||| |||| |  ||||| |||| ||||||     
T  4579645 caatacatggaaaattggaattgaaatcgacactaatgtgaagagagaggaggtggagaagctggttaatgaattgatggtgggagagaaagcaaagaag 4579546  T
Q  649 atgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgt 748  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4579545 atgaggcaaaaggcaattgagttgaagaagaaggtggaggaggacacgagacctggaggctgttcatacatgaacttggagaaagtgattaaggaggtgt 4579446  T
Q  749 tgcttaaacaaaat 762  Q
    | || |||||||||    
T  4579445 tactcaaacaaaat 4579432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 4458334 - 4457760
Alignment:
Q  20 atgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||  | |||||||| ||  | |||||||| ||  |||| ||  |||| |||| ||||||||     
T  4458334 atgaacttgagagtgatgttatgaatactctctactctatgttcccttctatatacaccattggcccatttgcttcttttataaatcaaagtccacaaa- 4458236  T
Q  120 tcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaat 219  Q
      |||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||| || || ||    || ||| ||||||| |||    
T  4458235 --atcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaatatactaaatgtcttgagtggcttgaatcaaaagaaccaaagtctgttatttatgtaaat 4458138  T
Q  220 ttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaa-ccatttttgtggatcataaggcctgat 318  Q
    || || ||||| ||||||||| | |  ||| |  |  | ||||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||| |  |||||||||    
T  4458137 tttggaagcatcacagttatgtctcaagagaagctcttagaatttgcttgggttttggccaacagcaagaaaaccttttttgtggataactaggcctgat 4458038  T
Q  319 cttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttga 418  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || |||   ||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4458037 cttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggattttgtgaatgaaacttctgatagaggcttaatagcaagttggtgtccacaagataaagtgttga 4457938  T
Q  419 accacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||     
T  4457937 accacccttcaatcggaggattcttgactcattgtggatgaaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgctgcgttggccattctttgg 4457838  T
Q  519 cgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagaga 596  Q
     ||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4457837 tgataagccaacaagttgtagatttatttgcaatgaatgagagattgggatggaaatcgatacaaatgtgaagagaga 4457760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 482
Target Start/End: Original strand, 4299214 - 4299673
Alignment:
Q  20 atgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||  | |||||| | ||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  4299214 atgaacttgagagtgatgtaatgaatgctctctattctatgttcccttctttatatactattggacctttaccttcattattaaatcaaactccacata- 4299312  T
Q  120 tcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaat 219  Q
      |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4299313 --atcacttggaatctttaggttccaatctttggaaagaagataccaaatgtcttgaatggcttgaatccaaggagccgggatcggttgtttatgtgaat 4299410  T
Q  220 ttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatc 319  Q
    || |||||| ||||||||||||| || |||||| |  | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  4299411 tttggcagcgttacagttatgactccagagcaactgttagagattgcttggggtttggccaattgcaggaaaccatttttgtggatcattaggccagacc 4299510  T
Q  320 ttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaa 419  Q
    |||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||||   ||||||||| || |||||||||| |  ||||| | |||||||||||   ||||  ||||    
T  4299511 ttgtcattggcggcttgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcaaatagaggcctaaccgcaagctagtgtccacaagaacaagtactgaa 4299610  T
Q  420 ccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatg 482  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4299611 ccacccttcaattggtggattcttgactcactgtggatggaactcaaccattgaaagcatatg 4299673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 266 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 4568552 - 4568072
Alignment:
Q  266 cttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatga 365  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   ||||     
T  4568552 cttgaggttttgccaacagcaagaaaccttttttgtggatcattaggccttagcttgtcattggtggctcagttattttgtcatccgagtttgtgaatgg 4568453  T
Q  366 aattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactca 465  Q
    || | | ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  4568452 aacttcggatagaggccaaatagcaagctggtgtccgcaagagcaagtgttgaaccacccttcagttggacgattcttgactcattgtggatggaactcc 4568353  T
Q  466 accactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattg 565  Q
    ||    |||||||| || ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | |||||| |    
T  4568352 acattggaaagcatttgtgccagagtaccaatgttatgttggccttttttttctgagcagccaacatactgcagatatatttgtaataagttggagatcg 4568253  T
Q  566 gtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccat 665  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| | || |  ||| | |||||||| || |||| |||||||||| |    
T  4568252 gaatcgaaattgatacaaatgtgaagagagaggaggtggagaagctgatgaatgaattaatggtgggacagaaaggaaaaaagatgaggcaaaaggccgt 4568153  T
Q  666 ggagtt---gaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaagga 743  Q
    ||||||   |||||||||||||||| || |||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4568152 ggagttgaagaagaagaaggcagagaaggacacaagacctggtgattcttcatacatgaacttggacaaagtgattaagga 4568072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 371 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4493346 - 4492953
Alignment:
Q  371 cagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccac 470  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4493346 cagatagaggcctaattgctagttggtgtccacaagagaaactgctgaaccaccattcgattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaactac 4493247  T
Q  471 tgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatg 570  Q
      ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |     
T  4493246 caaaaacatatgtgccggagtgccaatgttgtgttggcctttctttagtgatcagccaacaaactgtagattgatttgcaatgaattggagattggagta 4493147  T
Q  571 gaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagt 670  Q
    |||||||||| |||||| || |||||  |  |||  || ||| |||||||  | || | |||||| |||||||| || |||| |  ||| |||| |||||    
T  4493146 gaaatcgataggaatgttaatagagaaaatgtggagaatctggtcaatgagattatggttggagagaaaggaaacaagatgaggagaaaagccacggagt 4493047  T
Q  671 tgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  4493046 tgaaaaagaaggcagaggaggacacagtacctggtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgatcaaggatgtcttgcttaaacaaaatta 4492953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 555 - 764
Target Start/End: Original strand, 4299671 - 4299874
Alignment:
Q  555 atgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaag 654  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||| | || ||||      
T  4299671 atgggagattggaatcgaaatcgatacaaatgtgaggagagaggaggtggaaaagctgatcaatgaattgatggtgggagagaaaggagataagatgaga 4299770  T
Q  655 caaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgctta 754  Q
    |||||||| | ||||||||||      ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  4299771 caaaaggcaagggagttgaag------gcagaggagaacactaatccaggtggttgttcgtacatgaacttggacaaagttattaaggaggttctgctta 4299864  T
Q  755 aacaaaatta 764  Q
    ||||| ||||    
T  4299865 aacaatatta 4299874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 656 - 765
Target Start/End: Original strand, 4392052 - 4392161
Alignment:
Q  656 aaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaa 755  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  4392052 aaaaggcgatcgagttgaagaagaaggcaaaggaggacacatgacctggtggttcttcattcatgaacttggacaaactgattaaggaggtcttgcttaa 4392151  T
Q  756 acaaaattaa 765  Q
    ||| ||||||    
T  4392152 acataattaa 4392161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 697 - 762
Target Start/End: Original strand, 4606958 - 4607023
Alignment:
Q  697 agaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||    
T  4606958 agaccaggtggtttttcatacatgaacttggaaaaagtgattaagaaggttttgcttaaacaaaat 4607023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 783 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 4601715 - 4601643
Alignment:
Q  783 aaatttttaggctattactatgctttgatgtactgtatttttaactatgtattgtttcaatatttaatttggg 855  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||    
T  4601715 aaattattaagctattactatgctttgatgcaatgtattttttactatgtactattccaatattgaatttggg 4601643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 528; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 1281875 - 1281112
Alignment:
Q  1 attcttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1281875 attcttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctctataattccttctgtttacccgattggccctttaccttcattat 1281776  T
Q  101 taaaacaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccgg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||  |    
T  1281775 taaaccaaactccacaaattcatcaattggattctttagattccaacctttggaaagaagatatcgagtgtcttcaatggcttgaatcgaaggaaccgag 1281676  T
Q  201 atcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttg 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  1281675 atctgttgtttatgtgaatttcggaagcattacagttatgactccagagcaacttcaggaatttgcttggggtctggctaatagcaagaaaccatttttg 1281576  T
Q  301 tggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtc 400  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1281575 tggatcactaggcctgatcttgtcattggcggctcagtgattttgtcatctgactttgcgaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagttggtgtc 1281476  T
Q  401 cacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgtt 500  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1281475 cacaagagaaagtgttgaaccacccttcaatcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgtt 1281376  T
Q  501 gtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggag 600  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1281375 gtgttggccattttttgctgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatggaagattggtatggaaatcgatacaaatgtgaagagagaggag 1281276  T
Q  601 ttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagac 700  Q
     |||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  1281275 gtggctaagttgatcaatgaattgatagccggggatgaaggaaagaatatgagagaaaaggccatggaattgaagaaggcggcggaggagaacactagac 1281176  T
Q  701 caggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1281175 cgggtggttgttcatacatgaacttcgacaaagtgattaaggaaatgttgcttaaacaaaatta 1281112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 1674984 - 1674224
Alignment:
Q  5 ttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctc-tcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |  |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1674984 ttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaccgctctcctcctctttgtttccttctctttaccccattggccctttaccttcattattaa 1674885  T
Q  104 aacaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatc 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  1674884 accaaactccacaaattcatcaattagaatctttaggttccaacctttggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaacgaaccgggatc 1674785  T
Q  204 agttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtgg 303  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || || ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1674784 ggttgtttatgtgaatttcggtagcattattgttatgactccagatcaactattggagtttgcttggggtttggccgattgcaagaaaccttttttgtgg 1674685  T
Q  304 atcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccac 403  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1674684 atcactaggcctgatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcatctgagtttatgaaagaaatttcagatagaggcctaatatcaaattggtgtccac 1674585  T
Q  404 aagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtg 503  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674584 aagagaaagtgttgaaccacccttcaatcggcggattcttgacacactgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtg 1674485  T
Q  504 ttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttg 603  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  1674484 ttggccattttttgctgatcagccaacaaactgtagatttatttgtaatgaatggaagattggtatggaaattgatacgaatgtgaagagagagggtttg 1674385  T
Q  604 gcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccag 703  Q
    |  ||||| ||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674384 gagaagcttatcaatgaattgatggtgggagagaatggaaaaaagatgaggcaaaaggccatggaattgaagaagaaggcagaggagaacactagaccag 1674285  T
Q  704 gtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674284 gtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 1674224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 762
Target Start/End: Original strand, 20863221 - 20863975
Alignment:
Q  5 ttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaa 104  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||  || ||  | |||||| | ||  | |||||||| ||   ||| || |||||    
T  20863221 ttttcaatactttcaatgagcttgagagtgatgttatgaatgttctctattctatgttcccttctctatacaccattggcccttttgtttcttttttaaa 20863320  T
Q  105 acaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatca 204  Q
     |||| |||||| |   |||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||| || || || |||||     
T  20863321 tcaaagtccacaga---atcacttggcgtctttagattcaagtctttggaaagaagacactgaatgtcttgcatggcttgaatcgaaagaaccgggatct 20863417  T
Q  205 gttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtgga 304  Q
     |||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| ||| |    ||  ||||  | || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20863418 attgtatatgtaaattttggcagtaccacagtcatgtctgtagaaaaattgttagagtttgcatggggtttggccaacagcaagaaaccctttttgtgga 20863517  T
Q  305 tcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccaca 404  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20863518 tcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtgattttttcatctgcgtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgagttggtgtccaca 20863617  T
Q  405 agtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgt 504  Q
    ||  || ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20863618 agagaaggtgttgaaccatccttcaattggtggatttctaactcattgtggatggaactcaaccattgagagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgc 20863717  T
Q  505 tggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttgg 604  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||||| ||  ||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||| |||    
T  20863718 tggccattttttgctgatcagccgacaaactgcagatacatttgcaacaaatgggagattgggatcgaaattgacaccaatgtcaagagagaggaggtgg 20863817  T
Q  605 caaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccagg 704  Q
      | |||| | |||||| |||| |  ||||| ||||||| ||  |||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |     
T  20863818 agatgctggtaaatgaattgatggtgggagagaaaggaaggaggatgaggcaaaagacaaatgagttgaagaagaaggcagaggaggacacaagaccgga 20863917  T
Q  705 tggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaat 762  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20863918 aggtggttcatatatgaacttggacaaagtgattaaggaggtgttgcttaaacaaaat 20863975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 148 - 762
Target Start/End: Original strand, 16685785 - 16686399
Alignment:
Q  148 ctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccg 247  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  | |    
T  16685785 ctttggaaataagataccaagtgtcttgattggcttgaatccaaggaaccgagttccgttgtttatgtgaattttgggagcatgacagttatgactgcag 16685884  T
Q  248 agcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatc 347  Q
    |  || || | || ||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||   |||||||| ||| |||||||||||||| | || || ||| |||| ||    
T  16685885 aaaaactattagagtttgcttggggtttgaccaatagcaagcaacattttcaatggatcattaggtctgatcttgtcatttgcggttccgtggttttgtc 16685984  T
Q  348 atctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgact 447  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| || || || ||||| || ||||   |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  16685985 atctgagtttaagaatgaaatctcagatagaagcctaatcgcgagctggtgcccgcaagagcaagtattaaaccatccttcaatcggtggattcttaact 16686084  T
Q  448 cattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttattt 547  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||| |||||    
T  16686085 cattgtggatggaactcaaccactgaaagtatatatgctggagttccaatgttgtgttggccattttttgctgatcagccagcaaaatgcagatatattt 16686184  T
Q  548 gtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaa 647  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| |||  ||  || |||||||| |||| |  ||||| |||||||||||    
T  16686185 gcaatgaatgggagattggcatggaaattgacaccaatgtgaagagagatgaggtggagaaattggtcaatgaattgatggtgggagagaaaggaaagaa 16686284  T
Q  648 aatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtg 747  Q
     |||| | |||||   || ||  || | | |||||  || ||  || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||     
T  16686285 gatgaggaaaaagataattgaactgcaaatgaaggtggacgaagacccgagacctggtggttgttcatacatgaacttggaaaaagtgattatggaggtt 16686384  T
Q  748 ttgcttaaacaaaat 762  Q
    |||||||||||||||    
T  16686385 ttgcttaaacaaaat 16686399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 276 - 764
Target Start/End: Original strand, 27999745 - 28000233
Alignment:
Q  276 ggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagat 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||| |||||    
T  27999745 ggccaattgcaagaaaccttttttgtggatcactaggcctaatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcatctgagtttaggaaagaaatttcagat 27999844  T
Q  376 agaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaa 475  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27999845 agaggcctaatatcaaattggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaatcagcgggttcttgactcactgcggatggaactcaaccaccgaaa 27999944  T
Q  476 gcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaat 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27999945 gcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggtcattttttgctgatcagccaacaaactgtagatttatttgtaatgaatggaagattggtatggaaat 28000044  T
Q  576 cgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaag 675  Q
     |||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28000045 tgatatgaatgtgaagatagaggatttggagaagcttatcaatgaattgatggtgggagagaatggaaaaaagatgaggcaaaaggccatggagttgaag 28000144  T
Q  676 aagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaaaatta 764  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28000145 aaaaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaagtgttgtttaaacaaaatta 28000233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 24103738 - 24103002
Alignment:
Q  20 atgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  | |||||||| ||  | |||||||| ||  |||| || ||||| |||| ||||||||     
T  24103738 atgaacttgagagtgatgttatgaatgctctctactctatgttcccttctatatacaccattggcccatttgcttcttttttaaatcaaagtccacaaa- 24103640  T
Q  120 tcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaat 219  Q
      |||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || ||  |||||||||||||||| |||    
T  24103639 --atcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgagtggcttgaatcaaaagaaccaagatcagttgtttatgtaaat 24103542  T
Q  220 ttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatc 319  Q
    || || ||||| ||||||||| |||  ||| |  |  | || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  24103541 tttggtagcatcacagttatgtcacgagagaagctcttagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaacccttttttgtggataattaggcctgatc 24103442  T
Q  320 ttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaa 419  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||   || ||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  24103441 ttgtcattgggggctcagttgttttgtcatctgatttttttaaagaagtttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagataaagtgttaaa 24103342  T
Q  420 ccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgcc 519  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  24103341 ccacccttcgattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggccattctttggt 24103242  T
Q  520 gatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatg 619  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |  ||| |  ||||||    
T  24103241 gatcaaccaacaaactgtagatttatttgctatgaatgggagattggactcgaaatcgatacaaatgtgaagagagatgacgtcgagaagttagtcaatg 24103142  T
Q  620 aagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacat 719  Q
    || |||| |  ||||| || |||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  24103141 aattgatggtgggagagaacggaaagacgatgaagcaaaaggtcttggagttcaagaagaaggcagaagagaacacaagatctggtggtttttcatacat 24103042  T
Q  720 gaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaa 759  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  24103041 gaacttggacaaagttattaaggaggtcatgcttaaacaa 24103002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 88 - 759
Target Start/End: Original strand, 3179 - 3848
Alignment:
Q  88 ttaccttcattattaaaacaaactccacaaattcatcaattggactcttt-agattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaa 186  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |   |||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  3179 ttaccttcattattaagtcaaactccacata---atcacttggaatcttttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaatggctcgaa 3275  T
Q  187 tccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgca 286  Q
    |||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |  | ||||||||||||||||||||| || |||    
T  3276 tccaaggaacctgagtctgttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgactccaaatcaactgttagaatttgcttggggtttggccgatagca 3375  T
Q  287 agaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcat 386  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| || |||   ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3376 agaaaccgtttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcgtttattttgtcatcagaatttgagaatgaaatttcagatagaggcctaat 3475  T
Q  387 agcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgct 486  Q
      |||| |||||||||||||   ||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3476 cacaagctggtgtccacaagagcaagtactgatccacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccactgaaagcatatgcgct 3575  T
Q  487 ggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatg 586  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||| | |||    
T  3576 ggagtaccaatgctttgttggccattctttggtgatcagccaacaaactgtagatttatttgcaacgaatgggagattggacttgaaatcgatatggatg 3675  T
Q  587 tgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcaga 686  Q
    |||||||||| ||| |||  |||||  |||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3676 tgaagagagatgaggtggagaagctagtcaatgaattgacggtgggagagaaaggaaagaagatgaggcaaaaggccgtggagttaaagaagaaggcaga 3775  T
Q  687 ggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaa 759  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3776 ggagaacactagaccaggtggtcgttcatacatgaacctggacaaagttattaaggaggttttgcttaaacaa 3848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 759
Target Start/End: Original strand, 4082 - 4815
Alignment:
Q  20 atgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaaaacaaactccacaaat 119  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||  || ||  | |||||| | ||| | ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  4082 atgaacttgagagcggtgtattgaatgctctctattctatgttcccttctttatataccattggacctttaacttcattattaaatcaaactccacataa 4181  T
Q  120 tcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaat 219  Q
    |||  |||      |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| || |  || |||||||||||||||    
T  4182 tcactaat------ctttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgagtggcttgcatccaaggaacctgagtcggttgtttatgtgaat 4275  T
Q  220 ttcggcagcattacagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatc 319  Q
    || || ||||||||||||||||| || || ||| |  | || |||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |    
T  4276 tttggaagcattacagttatgactccagatcaactgttagagtttgcttgggttttgaccaattgtaagaaatcctttttgtggatcattaggcctgacc 4375  T
Q  320 ttgtcattggtggctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaa 419  Q
    |||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||   ||||  ||||    
T  4376 ttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcagatagaggcctaattgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaa 4475  T
Q  420 ccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgcc 519  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4476 ccacccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgtaggagtgccaatgttgtgttggccatttttcgcc 4575  T
Q  520 gatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatg 619  Q
    |||||||||||| ||| | | | ||| |   ||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |  | ||  |||||||||    
T  4576 gatcagccaacaaactatcggtatatctcccatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgaagagagagaaggtaacgaatatgatcaatg 4675  T
Q  620 aagtgatagctggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacat 719  Q
    || ||||  | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||    
T  4676 aattgatgtcgggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacaccagttctggtggctgttcatacat 4775  T
Q  720 gaacttggacaaagttattaaggaagtgttgcttaaacaa 759  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  4776 gaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 4815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 133 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 3087049 - 3086417
Alignment:
Q  133 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 232  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||  |  |  || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3087049 tctttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaatggcttgaatcaaagggacttgagtctgttgtttatgtgagttttggcagcatta 3086950  T
Q  233 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaaccatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 332  Q
    |||||||||| |  |||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  3086949 cagttatgactcaagagcaactattagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaaaccatttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcgg 3086850  T
Q  333 ctcagtgattttatcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctcatagcaagttggtgtccacaagtcaaagtgttgaaccacccttcaatc 432  Q
    |||  | ||| | ||||||||||||   || |||||| |||||||||| || || ||||| |||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||     
T  3086849 ctcctttattatgtcatctgagtttgagaaagaaatttcagatagaggtctaatcgcaagctggtgtccgcaagagcaagtattgaatcacccttcaatt 3086750  T
Q  433 ggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgatcagccaacag 532  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |     
T  3086749 ggtggattcttgactcattgtggatggaactcaacggttgaaagcgtacttgctggagtgccaatgttgtgttggccattttatggagatcaaccaataa 3086650  T
Q  533 actgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagctgg 632  Q
    ||||||||| ||| || |||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||| |  ||    
T  3086649 actgtagatatatctgcaatatatgggagattggaattgaaatcgatactaatgtgaagagagaggaggtcgagaagctgatcaatgaattgatggtggg 3086550  T
Q  633 agataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 732  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |   ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3086549 agataaaggaaagaagatgaggcaaaatgtcgcagagttaaagaagaaagcagaagagaacaccagtatcggtggttgttcatacatgaacttggacaaa 3086450  T
Q  733 gttattaaggaagtgttgcttaaacaaaattaa 765  Q
    ||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  3086449 gttattaaggaggtcttgcttaaaaaatattaa 3086417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 221 - 1
Alignment:
Q  5 ttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctc-tcctccataattccttctatttatccgattggccccttaccttcattattaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |  |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  221 ttttgaatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaccgctctcctcctctttgtttccttctctttaccccattggccctttaccttcattattaa 122  T
Q  104 aacaaactccacaaattcatcaattggactctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagcccggatc 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  121 accaaactccacaaattcatcaattagaatctttaggttccaacctttggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaacgaaccgggatc 22  T
Q  204 agttgtttatgtgaatttcgg 224  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  21 ggttgtttatgtgaatttcgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 410 - 600
Target Start/End: Original strand, 3465 - 3654
Alignment:
Q  410 aagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggcc 509  Q
    |||||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||| || |||||||    
T  3465 aagtgttgaaccaccctt-agttggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccattgaaagcatttgttctggagttccaatgctgcgttggcc 3563  T
Q  510 attttttgccgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaatgtgaagagagaggag 600  Q
    ||||||  |||| ||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  3564 atttttccccgaacactcaacaaactgtagatgcatttggaatgaatgggagattggaagtgaaatagattccaatgtgaagagagaggag 3654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University