View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14307_high_20 (Length: 492)

Name: NF14307_high_20
Description: NF14307
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14307_high_20
NF14307_high_20
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (11-473)||(10593161-10593622)
chr5 (11-473)||(25078023-25078485)
chr5 (11-473)||(25135992-25136454)
chr5 (11-473)||(40379995-40380455)
chr5 (11-473)||(40382206-40382666)
chr5 (11-473)||(16544312-16544775)
chr5 (11-473)||(16546534-16546997)
chr5 (18-470)||(29720274-29720721)
chr5 (22-473)||(22536102-22536541)
chr5 (18-470)||(29722434-29722881)
chr5 (18-471)||(29750969-29751418)
chr5 (20-467)||(9789042-9789480)
chr5 (20-467)||(18441462-18441904)
chr5 (20-397)||(16409387-16409764)
chr5 (20-398)||(26177795-26178172)
chr5 (20-330)||(26170686-26170983)
chr5 (25-296)||(25412672-25412947)
chr5 (18-377)||(30182492-30182852)
chr5 (18-280)||(13342964-13343232)
chr5 (18-296)||(36074024-36074309)
chr5 (38-377)||(13239674-13240016)
chr5 (127-296)||(37439161-37439328)
chr5 (108-273)||(213465-213630)
chr5 (108-377)||(32636824-32637088)
chr5 (108-273)||(40147261-40147425)
chr5 (108-288)||(28278316-28278494)
chr5 (108-280)||(42428427-42428598)
chr5 (108-267)||(13488203-13488361)
chr5 (126-299)||(8565926-8566095)
chr5 (108-296)||(13695672-13695859)
chr5 (108-273)||(5058047-5058209)
chr5 (25-267)||(30682932-30683178)
chr5 (20-296)||(31182878-31183157)
chr5 (38-296)||(16452003-16452266)
chr5 (108-273)||(27637616-27637781)
chr5 (108-280)||(42426232-42426403)
chr5 (25-296)||(33831590-33831866)
chr5 (108-293)||(533769-533952)
chr5 (108-265)||(28750667-28750823)
chr5 (111-238)||(39468587-39468714)
chr5 (127-255)||(16640961-16641086)
chr5 (111-267)||(538028-538183)
chr5 (162-265)||(9049354-9049455)
chr5 (208-280)||(19806463-19806534)
chr5 (193-273)||(27015609-27015687)
chr5 (211-252)||(4160702-4160743)
chr5 (114-267)||(316769-316922)
chr5 (112-256)||(38747009-38747153)
chr5 (162-258)||(42309953-42310048)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (11-473)||(25421208-25421670)
chr6 (11-473)||(6027151-6027610)
chr6 (4-472)||(16653008-16653471)
chr6 (11-472)||(16554772-16555228)
chr6 (11-472)||(16631328-16631784)
chr6 (11-472)||(16578327-16578783)
chr6 (11-472)||(16616597-16617053)
chr6 (11-473)||(33341907-33342370)
chr6 (11-473)||(34166983-34167444)
chr6 (11-473)||(34164761-34165222)
chr6 (88-473)||(13153893-13154279)
chr6 (20-472)||(27647775-27648210)
chr6 (20-377)||(412014-412369)
chr6 (20-368)||(3072670-3073016)
chr6 (18-379)||(6097349-6097699)
chr6 (18-296)||(2171512-2171796)
chr6 (17-296)||(31404656-31404940)
chr6 (17-296)||(5406181-5406464)
chr6 (17-296)||(5410506-5410789)
chr6 (18-296)||(16452310-16452594)
chr6 (18-296)||(30834517-30834801)
chr6 (17-296)||(5413376-5413658)
chr6 (364-473)||(6136107-6136216)
chr6 (108-285)||(3808699-3808877)
chr6 (108-377)||(33160254-33160521)
chr6 (108-273)||(21588931-21589095)
chr6 (108-273)||(21593664-21593828)
chr6 (111-273)||(17758026-17758188)
chr6 (108-273)||(2972943-2973107)
chr6 (389-473)||(13159051-13159135)
chr6 (108-273)||(17762990-17763155)
chr6 (193-296)||(5409051-5409151)
chr6 (25-296)||(16568953-16569208)
chr6 (108-294)||(9183015-9183199)
chr6 (111-280)||(26954283-26954450)
chr6 (108-265)||(28137420-28137576)
chr6 (110-258)||(26830141-26830289)
chr6 (108-273)||(22424829-22424995)
chr6 (128-273)||(5043648-5043792)
chr6 (162-267)||(26800642-26800746)
chr6 (108-280)||(33211182-33211353)
chr6 (108-253)||(3038926-3039071)
chr6 (162-284)||(603081-603201)
chr6 (108-226)||(4045423-4045542)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (11-473)||(25637331-25637794)
chr3 (11-473)||(3617352-3617814)
chr3 (22-473)||(4598327-4598777)
chr3 (18-472)||(45282893-45283345)
chr3 (22-473)||(4600548-4600998)
chr3 (22-473)||(10211309-10211759)
chr3 (11-473)||(10056122-10056583)
chr3 (11-473)||(10058344-10058805)
chr3 (11-473)||(10060566-10061027)
chr3 (11-473)||(10062788-10063249)
chr3 (11-473)||(10065010-10065471)
chr3 (22-473)||(10209089-10209539)
chr3 (18-449)||(54635035-54635462)
chr3 (20-472)||(6716412-6716859)
chr3 (20-379)||(801003-801355)
chr3 (71-467)||(7779821-7780208)
chr3 (11-210)||(10067232-10067431)
chr3 (237-473)||(10067435-10067670)
chr3 (18-397)||(23200020-23200402)
chr3 (18-368)||(23197850-23198203)
chr3 (20-142)||(6718596-6718718)
chr3 (12-296)||(45095062-45095350)
chr3 (20-296)||(9636106-9636390)
chr3 (20-296)||(5258125-5258407)
chr3 (17-296)||(5260304-5260589)
chr3 (111-377)||(19683792-19684054)
chr3 (17-296)||(37408361-37408645)
chr3 (108-280)||(7762265-7762437)
chr3 (20-280)||(9581188-9581454)
chr3 (119-296)||(7764476-7764651)
chr3 (108-295)||(34491212-34491397)
chr3 (108-288)||(49199457-49199638)
chr3 (108-296)||(29196368-29196555)
chr3 (112-288)||(30236129-30236304)
chr3 (108-267)||(4569952-4570111)
chr3 (108-288)||(43401789-43401970)
chr3 (20-295)||(40735288-40735568)
chr3 (111-256)||(39153381-39153526)
chr3 (108-284)||(43403736-43403913)
chr3 (111-267)||(22835012-22835167)
chr3 (108-280)||(40734498-40734669)
chr3 (108-273)||(41819526-41819691)
chr3 (108-280)||(44331545-44331716)
chr3 (108-280)||(44700476-44700646)
chr3 (126-295)||(51398833-51398999)
chr3 (20-256)||(760752-760995)
chr3 (108-267)||(6095609-6095767)
chr3 (193-296)||(16499115-16499215)
chr3 (127-288)||(46173377-46173536)
chr3 (110-296)||(31314447-31314631)
chr3 (108-265)||(46860474-46860631)
chr3 (108-273)||(54593704-54593868)
chr3 (193-288)||(40913379-40913472)
chr3 (108-295)||(5236440-5236624)
chr3 (128-256)||(29810889-29811016)
chr3 (108-267)||(53921513-53921671)
chr3 (25-280)||(29682269-29682530)
chr3 (20-296)||(32744418-32744689)
chr3 (127-280)||(29813083-29813234)
chr3 (168-273)||(55301975-55302079)
chr3 (126-296)||(9666448-9666616)
chr3 (110-267)||(32891105-32891262)
chr3 (209-267)||(27305720-27305777)
chr3 (196-288)||(47304340-47304430)
chr3 (113-296)||(4055745-4055926)
chr3 (108-180)||(5433971-5434046)
chr3 (193-296)||(23391891-23391991)
chr3 (108-237)||(51352150-51352278)
chr3 (108-243)||(36018852-36018987)
chr3 (208-256)||(2075095-2075143)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (11-473)||(12647190-12647650)
chr2 (88-473)||(13655833-13656220)
chr2 (18-445)||(6266601-6267023)
chr2 (20-397)||(32289477-32289853)
chr2 (20-397)||(4484211-4484594)
chr2 (20-397)||(30833250-30833633)
chr2 (18-296)||(45099658-45099941)
chr2 (18-377)||(4503037-4503397)
chr2 (17-296)||(5723237-5723520)
chr2 (18-296)||(36205646-36205928)
chr2 (20-377)||(36987979-36988338)
chr2 (40-296)||(2334399-2334661)
chr2 (127-296)||(6594987-6595154)
chr2 (126-296)||(34139752-34139920)
chr2 (108-273)||(45726929-45727093)
chr2 (108-385)||(29867869-29868142)
chr2 (126-296)||(723726-723893)
chr2 (126-296)||(14633807-14633975)
chr2 (20-256)||(42362257-42362500)
chr2 (127-273)||(35446888-35447032)
chr2 (108-296)||(36773562-36773748)
chr2 (108-280)||(38312240-38312411)
chr2 (108-267)||(1631742-1631900)
chr2 (126-296)||(33162432-33162599)
chr2 (113-267)||(33648176-33648331)
chr2 (108-296)||(11151573-11151759)
chr2 (108-296)||(36317991-36318177)
chr2 (193-295)||(17057352-17057451)
chr2 (193-295)||(17085335-17085434)
chr2 (108-288)||(24398055-24398238)
chr2 (126-296)||(11067324-11067491)
chr2 (108-266)||(26353184-26353341)
chr2 (108-242)||(13121769-13121901)
chr2 (162-267)||(17490158-17490261)
chr2 (208-280)||(17450678-17450748)
chr2 (111-267)||(11690504-11690659)
chr2 (108-226)||(7815323-7815441)
chr2 (208-280)||(39284936-39285007)
chr2 (213-271)||(28672036-28672094)
chr2 (108-267)||(42288121-42288278)
chr2 (193-256)||(7451204-7451266)
chr2 (208-253)||(42412118-42412162)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (22-473)||(32060126-32060579)
chr7 (11-473)||(6594362-6594822)
chr7 (11-473)||(18388564-18389024)
chr7 (11-473)||(18392000-18392460)
chr7 (11-473)||(6592144-6592604)
chr7 (18-472)||(20343807-20344255)
chr7 (185-473)||(1560469-1560757)
chr7 (18-343)||(24789751-24790074)
chr7 (20-445)||(43503991-43504411)
chr7 (20-397)||(39731281-39731656)
chr7 (11-178)||(1562103-1562268)
chr7 (18-296)||(35853818-35854102)
chr7 (18-296)||(25766940-25767219)
chr7 (19-296)||(29990959-29991240)
chr7 (18-296)||(48408705-48408992)
chr7 (38-377)||(25615785-25616119)
chr7 (108-280)||(34310712-34310884)
chr7 (108-280)||(23555039-23555212)
chr7 (18-296)||(4178678-4178960)
chr7 (20-296)||(19502083-19502365)
chr7 (108-295)||(22269973-22270158)
chr7 (108-296)||(41317416-41317602)
chr7 (108-294)||(14069817-14070001)
chr7 (108-294)||(14379845-14380029)
chr7 (126-288)||(2390301-2390461)
chr7 (108-377)||(27347817-27348081)
chr7 (108-273)||(8359319-8359485)
chr7 (108-267)||(29608737-29608895)
chr7 (108-267)||(30024742-30024900)
chr7 (127-296)||(41648993-41649158)
chr7 (162-273)||(32358058-32358167)
chr7 (108-256)||(48491579-48491727)
chr7 (108-296)||(4253510-4253697)
chr7 (108-272)||(6431971-6432134)
chr7 (108-296)||(36146390-36146576)
chr7 (108-295)||(18126644-18126829)
chr7 (108-273)||(3258995-3259159)
chr7 (108-273)||(48599338-48599502)
chr7 (108-256)||(2360992-2361140)
chr7 (108-256)||(8153342-8153490)
chr7 (38-267)||(47673954-47674189)
chr7 (108-267)||(43864244-43864402)
chr7 (108-295)||(48489431-48489616)
chr7 (108-273)||(4508710-4508874)
chr7 (126-280)||(31732966-31733118)
chr7 (127-256)||(23565081-23565210)
chr7 (108-267)||(4586161-4586319)
chr7 (108-295)||(26417316-26417501)
chr7 (20-296)||(38671204-38671485)
chr7 (108-267)||(47676146-47676304)
chr7 (339-445)||(24790230-24790333)
chr7 (111-256)||(496003-496148)
chr7 (133-267)||(2759207-2759339)
chr7 (212-296)||(12097849-12097931)
chr7 (129-258)||(1113679-1113807)
chr7 (162-288)||(6359941-6360065)
chr7 (193-256)||(24525522-24525584)
chr7 (111-267)||(31105403-31105558)
chr7 (193-267)||(31518988-31519061)
chr7 (108-271)||(23343975-23344135)
chr7 (18-110)||(24514934-24515025)
chr7 (108-179)||(24525992-24526065)
chr7 (162-273)||(4510552-4510661)
chr7 (162-273)||(4512394-4512503)
chr7 (208-267)||(18396418-18396477)
chr7 (208-267)||(30814536-30814594)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (11-473)||(44203536-44203996)
chr1 (11-472)||(9036320-9036775)
chr1 (18-471)||(21053868-21054314)
chr1 (18-445)||(40282287-40282711)
chr1 (18-471)||(9987112-9987558)
chr1 (18-445)||(20622072-20622496)
chr1 (20-397)||(51765300-51765684)
chr1 (18-296)||(20762575-20762859)
chr1 (111-377)||(8550688-8550952)
chr1 (107-280)||(13316348-13316521)
chr1 (108-296)||(3189330-3189517)
chr1 (108-296)||(3198147-3198334)
chr1 (108-296)||(3206986-3207173)
chr1 (108-273)||(37168297-37168462)
chr1 (108-273)||(29136247-29136412)
chr1 (108-288)||(42297963-42298143)
chr1 (108-273)||(7482234-7482399)
chr1 (108-273)||(13547093-13547257)
chr1 (108-295)||(37503540-37503722)
chr1 (108-295)||(49918350-49918535)
chr1 (108-294)||(28220210-28220394)
chr1 (126-273)||(31925711-31925856)
chr1 (111-296)||(834149-834332)
chr1 (20-295)||(3156771-3157050)
chr1 (108-273)||(13549004-13549168)
chr1 (108-273)||(47255343-47255508)
chr1 (108-296)||(4552619-4552805)
chr1 (127-296)||(28265536-28265702)
chr1 (108-267)||(11348698-11348856)
chr1 (108-267)||(44455160-44455318)
chr1 (126-272)||(34603595-34603740)
chr1 (108-280)||(37033068-37033241)
chr1 (193-296)||(13659318-13659418)
chr1 (108-296)||(50167157-50167343)
chr1 (108-273)||(47115171-47115337)
chr1 (108-294)||(28223405-28223589)
chr1 (108-256)||(23555286-23555433)
chr1 (108-280)||(45644351-45644523)
chr1 (108-296)||(50169192-50169378)
chr1 (108-265)||(19754494-19754651)
chr1 (193-273)||(28242391-28242469)
chr1 (162-273)||(193666-193775)
chr1 (108-253)||(1833522-1833667)
chr1 (111-296)||(3847103-3847286)
chr1 (108-280)||(31659238-31659409)
chr1 (108-296)||(41360914-41361101)
chr1 (193-296)||(46065004-46065104)
chr1 (108-280)||(19752685-19752857)
chr1 (108-295)||(37559850-37560037)
chr1 (126-271)||(15820326-15820469)
chr1 (113-252)||(22079322-22079461)
chr1 (127-267)||(196917-197056)
chr1 (193-296)||(36683766-36683866)
chr1 (193-296)||(40122178-40122280)
chr1 (193-273)||(37876770-37876848)
chr1 (126-184)||(32736952-32737009)
chr1 (129-256)||(927996-928123)
chr1 (162-250)||(6808507-6808595)
chr1 (208-265)||(8871074-8871130)
chr1 (113-208)||(12318589-12318685)
chr1 (162-237)||(16455676-16455750)
chr1 (127-269)||(37282699-37282841)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (11-473)||(2408-2868)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (11-473)||(6177-6639)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (11-473)||(7124804-7125266)
chr4 (11-473)||(8395508-8395968)
chr4 (11-473)||(7122585-7123047)
chr4 (11-473)||(8393299-8393759)
chr4 (11-473)||(5138193-5138655)
chr4 (11-473)||(5135967-5136430)
chr4 (20-398)||(31495188-31495573)
chr4 (18-296)||(13992274-13992551)
chr4 (19-273)||(29999809-30000069)
chr4 (38-296)||(56178618-56178882)
chr4 (108-296)||(52095344-52095530)
chr4 (122-377)||(5369986-5370237)
chr4 (112-288)||(2209717-2209894)
chr4 (108-296)||(48143042-48143230)
chr4 (108-273)||(41964415-41964580)
chr4 (108-267)||(9927468-9927626)
chr4 (108-296)||(47038393-47038577)
chr4 (108-273)||(12073392-12073557)
chr4 (162-273)||(50673851-50673960)
chr4 (108-272)||(8665408-8665571)
chr4 (108-288)||(26364236-26364415)
chr4 (128-288)||(12119559-12119719)
chr4 (108-295)||(12739533-12739718)
chr4 (127-295)||(12743908-12744073)
chr4 (127-295)||(12745297-12745462)
chr4 (108-265)||(46703500-46703658)
chr4 (108-271)||(37229727-37229890)
chr4 (108-288)||(54883020-54883199)
chr4 (108-295)||(26175619-26175804)
chr4 (108-295)||(34570397-34570582)
chr4 (108-267)||(40632445-40632603)
chr4 (108-267)||(41639426-41639584)
chr4 (126-265)||(6655975-6656112)
chr4 (110-296)||(46147373-46147557)
chr4 (115-253)||(5207865-5208003)
chr4 (126-267)||(379399-379539)
chr4 (108-280)||(36463386-36463557)
chr4 (25-267)||(37740536-37740783)
chr4 (108-296)||(45687164-45687351)
chr4 (162-296)||(48893620-48893751)
chr4 (162-288)||(50262689-50262814)
chr4 (108-267)||(36994524-36994682)
chr4 (108-273)||(8648139-8648303)
chr4 (127-296)||(6542161-6542328)
chr4 (108-256)||(54199926-54200074)
chr4 (108-267)||(27416975-27417133)
chr4 (162-267)||(35662496-35662599)
chr4 (162-256)||(4588014-4588107)
chr4 (108-280)||(5429679-5429850)
chr4 (127-236)||(12744087-12744195)
chr4 (108-238)||(12747794-12747924)
chr4 (108-293)||(5871820-5872003)
chr4 (126-236)||(12745476-12745585)
chr4 (126-296)||(52467336-52467503)
chr4 (134-267)||(26699451-26699585)
chr4 (162-296)||(31474206-31474337)
chr4 (183-256)||(13009464-13009535)
chr4 (108-296)||(52082645-52082825)
chr4 (193-295)||(29254580-29254679)
chr4 (162-252)||(33989899-33989989)
chr4 (193-238)||(3913534-3913578)
chr4 (108-226)||(24969112-24969230)
chr4 (198-250)||(33089970-33090021)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (11-458)||(3545-3990)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (22-473)||(15290438-15290888)
chr8 (22-473)||(15470807-15471257)
chr8 (22-473)||(42575129-42575578)
chr8 (20-472)||(3439416-3439861)
chr8 (22-472)||(25689869-25690313)
chr8 (20-377)||(2627647-2628002)
chr8 (17-296)||(34254312-34254594)
chr8 (19-296)||(44303758-44304042)
chr8 (18-296)||(17982556-17982840)
chr8 (17-296)||(34256488-34256770)
chr8 (18-296)||(31218160-31218444)
chr8 (108-377)||(42498193-42498459)
chr8 (18-296)||(19945340-19945625)
chr8 (127-296)||(1746200-1746366)
chr8 (108-295)||(15212786-15212971)
chr8 (108-273)||(42434995-42435159)
chr8 (108-295)||(43036423-43036608)
chr8 (108-273)||(4283524-4283688)
chr8 (108-280)||(33352150-33352321)
chr8 (110-280)||(40321082-40321251)
chr8 (108-273)||(18655400-18655564)
chr8 (162-296)||(1345353-1345484)
chr8 (108-296)||(3303652-3303838)
chr8 (181-296)||(4743196-4743308)
chr8 (108-280)||(27811278-27811449)
chr8 (126-372)||(12702542-12702783)
chr8 (111-250)||(40328782-40328922)
chr8 (108-267)||(40221745-40221903)
chr8 (114-256)||(30143346-30143488)
chr8 (108-256)||(18141821-18141968)
chr8 (162-280)||(5689326-5689442)
chr8 (193-288)||(10930188-10930281)
chr8 (108-296)||(19491680-19491867)
chr8 (108-267)||(30291606-30291766)
chr8 (108-295)||(4731658-4731843)
chr8 (162-267)||(41366625-41366727)
chr8 (108-226)||(9765745-9765863)
chr8 (111-280)||(6598975-6599143)
chr8 (111-280)||(6674428-6674596)
chr8 (108-267)||(1292474-1292631)
chr8 (111-238)||(44353796-44353923)
chr8 (108-267)||(8965701-8965859)
chr8 (126-273)||(11384004-11384149)
chr8 (162-296)||(10015136-10015265)
chr8 (193-267)||(4733792-4733864)
chr8 (126-265)||(4162516-4162652)
chr8 (193-265)||(8153844-8153914)
chr8 (162-267)||(18106091-18106191)
chr8 (334-371)||(32902096-32902133)
chr8 (208-252)||(7597715-7597759)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (244-458)||(1-214)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (20-397)||(11042-11425)
scaffold0491 (106-397)||(8616-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (18-377)||(434436-434798)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (108-296)||(11557-11745)
scaffold0286 (18-58)||(22247-22286)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (18-280)||(820-1087)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (108-280)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (127-273)||(18007-18151)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (193-296)||(149079-149179)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (108-273)||(7327-7491)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (108-377)||(20319-20583)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (164-267)||(10546-10647)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (208-271)||(27447-27510)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 10593161 - 10593622
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593161 caaagggggaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 10593260  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593261 gtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 10593360  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10593361 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttttctacttccctctc 10593460  T
Q  311 cttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgtt 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10593461 cttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtt 10593559  T
Q  411 cggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593560 tggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 10593622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 25078023 - 25078485
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078023 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25078122  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgt-aagaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25078123 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 25078222  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  25078223 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 25078322  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  25078323 tccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 25078420  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25078421 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttctttgtattggtgtggttcgatcc 25078485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 25135992 - 25136454
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135992 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25136091  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgt-aagaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25136092 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 25136191  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  25136192 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 25136291  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  25136292 tccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 25136389  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25136390 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttctttgtattggtgtggttcgatcc 25136454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 40379995 - 40380455
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40379995 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 40380092  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40380093 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 40380192  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  40380193 gatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 40380292  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  40380293 --cttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 40380390  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380391 tttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 40380455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 40382206 - 40382666
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40382206 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 40382303  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40382304 gtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 40382403  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  40382404 gatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 40382503  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  40382504 --cttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 40382601  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382602 tttggtggttaccactctccgccgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 40382666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 16544312 - 16544775
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16544312 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 16544409  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16544410 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatt 16544509  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16544510 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 16544609  T
Q  308 ctcctt-gtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactct 405  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||    
T  16544610 ctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagct 16544707  T
Q  406 ttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544708 ttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 16544775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 16546534 - 16546997
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16546534 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 16546631  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16546632 gtgagattaggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatt 16546731  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16546732 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 16546831  T
Q  308 ctcctt-gtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactct 405  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||    
T  16546832 ctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgt--ttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagct 16546929  T
Q  406 ttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546930 ttgtttggtggttatcactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 16546997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 18 - 470
Target Start/End: Original strand, 29720274 - 29720721
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29720274 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagat 29720373  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29720374 tgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtg 29720472  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  29720473 gattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tt 29720570  T
Q  317 tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtgg 416  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || | || ||||||| |||||    
T  29720571 tatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtac-acacactttgtttggtgg 29720668  T
Q  417 ttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcga 470  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29720669 ttaccactctcctttgctccacacaaca-tatttcttgtattggtgtggttcga 29720721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22536541 - 22536102
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536541 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgca--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 22536444  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22536443 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattg 22536345  T
Q  222 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatct 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  22536344 gggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--tttatct 22536247  T
Q  322 tgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg-ttcggtggttac 420  Q
    |||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||   |||| ||||| || |||||||||    
T  22536246 tgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggt-gttttttgttgattgttgcttgc---atacactttgctttggtggttac 22536152  T
Q  421 cgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22536151 cgctctccgtcgctccacacatc---attctttgtattggtgtggttcgatcc 22536102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 470
Target Start/End: Original strand, 29722434 - 29722881
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29722434 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagat 29722533  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29722534 tgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtg 29722632  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  29722633 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tt 29722730  T
Q  317 tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtgg 416  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || | || ||||||| |||||    
T  29722731 tatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtac-acacactttgtttggtgg 29722828  T
Q  417 ttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcga 470  Q
    ||||| |||| | | |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29722829 ttaccactctactttgctccacacacca-tatttcttgtattggtgtggttcga 29722881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 18 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 29751418 - 29750969
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29751418 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagat 29751319  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29751318 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtg 29751220  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt-atttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  29751219 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcct--t 29751122  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtg 415  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| | || | ||||| ||||    
T  29751121 ttatcttgtgattg-tgtactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacacattgtttggtg 29751024  T
Q  416 gttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 471  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  29751023 gttaccactctcctttgctccacacatca-tatttcttgtattggtgtggttcgat 29750969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 9789480 - 9789042
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  9789480 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 9789382  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    || ||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9789381 ggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtg 9789284  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||    
T  9789283 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcc--gt 9789186  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtg 415  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||   || ||||||| ||||    
T  9789185 ttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgatttttgcttgcac---acactttgtt-ggtg 9789091  T
Q  416 gttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggtt 467  Q
    |||||  || ||| | ||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  9789090 gttactactttcctttgctccacacatc---atactttgtattggtgtggtt 9789042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 18441904 - 18441462
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  18441904 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 18441806  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18441805 ggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtg 18441708  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||    
T  18441707 gattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcc--gt 18441610  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtg----tttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttc 411  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||    |||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||   || |||||||     
T  18441609 ttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgcac---acactttgtt- 18441515  T
Q  412 ggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggtt 467  Q
    |||||||||  || ||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  18441514 ggtggttactactttcctttgctccacacatc-tta--ctttgtattggtgtggtt 18441462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Original strand, 16409387 - 16409764
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16409387 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 16409485  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16409486 ggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtg 16409583  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  16409584 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--t 16409681  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    |||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  16409682 ttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 16409764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 398
Target Start/End: Original strand, 26177795 - 26178172
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  26177795 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 26177893  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26177894 ggaaaaggg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtg 26177990  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  26177991 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--t 26178088  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcaca 398  Q
    |||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||||||||||    
T  26178089 ttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttatcattgattattgcttgcaca 26178172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Original strand, 26170686 - 26170983
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  26170686 aactctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 26170784  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtgg 217  Q
    || |||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26170785 ggaaaaggg-tagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaagaactcatt-gatagtgg 26170871  T
Q  218 attggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtt 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||    
T  26170872 attggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tt 26170969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 25412672 - 25412947
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  25412672 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 25412769  T
Q  117 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatag 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  25412770 ttgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag 25412866  T
Q  215 tggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  25412867 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 25412947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Original strand, 30182492 - 30182852
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  30182492 gcaactttagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 30182589  T
Q  111 -gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||| | |||||||||    
T  30182590 ggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttgg-aagaactca 30182687  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccc 306  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  |    
T  30182688 tt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--c 30182783  T
Q  307 tctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30182784 tctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 30182852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Original strand, 13342964 - 13343232
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  13342964 gcaactttagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 13343061  T
Q  111 -gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||||||    
T  13343062 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg--aagaactc 13343158  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13343159 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatct 13343232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36074309 - 36074024
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  36074309 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 36074212  T
Q  111 -gtgagattgggaaag----gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
     ||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||    
T  36074211 ggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaac 36074115  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  36074114 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36074024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 377
Target Start/End: Original strand, 13239674 - 13240016
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg-gg 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||| |||   ||    
T  13239674 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg 13239772  T
Q  129 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 226  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13239773 tagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagag 13239869  T
Q  227 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtga 326  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||   ||||  |||||||  |||||||| ||     
T  13239870 atcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaat-ttttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttttgc 13239964  T
Q  327 ttgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    |||| | |||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  13239965 ttgtggttttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 13240016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439328
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 37439257  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37439258 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 37439328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213630
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 213562  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  213563 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 213630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32637088
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 32636921  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 304  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||   |||||    
T  32636922 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttc 32637018  T
Q  305 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    |||| |    ||||||||||| ||||   |||| ||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  32637019 cctccc----tttatcttgtgcttgtgattttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 32637088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147425
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 40147358  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40147359 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 40147425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278494
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 28278413  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  28278414 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat-tcttggtgt 28278494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428427
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42428501  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  42428500 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 13488203 - 13488361
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  13488203 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13488300  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13488301 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaact 13488361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8566095 - 8565926
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8566095 gggtagaacttagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctct-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 8565999  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttct 299  Q
    |||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||    
T  8565998 gagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa--tcttggtgtgtttgttttct 8565926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695672
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactc 13695760  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | || |||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  13695759 a-ttaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa-cttggaccaaactaggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 13695672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 5058047 - 5058209
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||   |||| |||||  |||||| ||||||||| ||  || ||||| |||| |||||||||    
T  5058047 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttct--gtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt-gtaagaact 5058142  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5058143 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 5058209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30683178 - 30682932
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  30683178 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaga 30683081  T
Q  117 ttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaa--ctcatttga 211  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||  |||||| ||    
T  30683080 ttgggaaaaagggtagaaattagggttcttt----gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcatt-ga 30682987  T
Q  212 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30682986 tagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 30682932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Original strand, 31182878 - 31183157
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| |   || || |||||||||||||||||           
T  31182878 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 31182975  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcattt 209  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| | ||||  ||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31182976 gtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgtatccc-tttgtaagaactca-tt 31183072  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | || ||| ||||||| |||||||    
T  31183073 gatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacattct-ttggtgtgtttgttt 31183157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 296
Target Start/End: Original strand, 16452003 - 16452266
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaag-ggg 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |       |||||||| |||  |||    
T  16452003 tctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatggg 16452101  T
Q  129 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 226  Q
    ||||||||| | ||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16452102 tagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattc-atagtggattggagag 16452198  T
Q  227 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
       ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||||||    
T  16452199 ataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 16452266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637616
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 27637684  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  27637683 tcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 27637616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42426403 - 42426232
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  42426403 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42426306  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  42426305 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaag-ttggactgaactaggtcaacaatct 42426232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 33831590 - 33831866
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 115  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||||        |||||    
T  33831590 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgag 33831687  T
Q  116 attgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgat 212  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  33831688 attggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gat 33831784  T
Q  213 agtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  33831785 agtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct-ttggtgtttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 293
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533952
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 533866  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttg 293  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||    
T  533867 catt-gatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtctttg 533952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28750823 - 28750667
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||  ||| ||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||    
T  28750823 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaact 28750726  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28750725 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaa 28750667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39468714 - 39468587
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||    
T  39468714 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 39468617  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcc 238  Q
    | ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  39468616 t-gatagtggattagagagatcaatctctcc 39468587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16641086 - 16640961
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||| |||||  ||||| ||||||  |||| || ||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||    
T  16641086 ggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctcttt-gtaagaact----tgatagtggattggag 16640992  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagt 255  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16640991 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 267
Target Start/End: Original strand, 538028 - 538183
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| | || | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||    
T  538028 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 538125  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    | |||||| ||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  538126 t-gatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaact 538183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9049455 - 9049354
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  9049455 aagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtgaag-ttgga 9049359  T
Q  261 ccgaa 265  Q
    |||||    
T  9049358 ccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806534
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 273
Target Start/End: Original strand, 27015609 - 27015687
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27015609 tttgtaagaactcatt-gatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtga 27015687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 252
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160743
Alignment:
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtca 252  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 4160743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 267
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316922
Alignment:
Q  114 agattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactcatttga 211  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||||||||| ||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcatt-ga 316866  T
Q  212 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    || ||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||    
T  316867 taatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaact 316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 256
Target Start/End: Original strand, 38747009 - 38747153
Alignment:
Q  112 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| | || ||||||||    
T  38747009 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaa-aactcatt 38747106  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
     ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  38747107 -gatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaagtt 38747153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42310048 - 42309953
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||  |||||||||| ||| ||||| | |||||||    
T  42310048 aagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaacttatt-gatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtagattaagtttg 42309953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 25421208 - 25421670
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421208 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25421307  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgt-aagaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25421308 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 25421407  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |    
T  25421408 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--c 25421505  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  25421506 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 25421605  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421606 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 25421670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 6027151 - 6027610
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6027151 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 6027248  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6027249 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 6027348  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  6027349 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 6027448  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  6027449 --cat-tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacaccttg 6027545  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027546 ttaggtggttacccctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 6027610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 472
Target Start/End: Original strand, 16653008 - 16653471
Alignment:
Q  4 ggagaagcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgag 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653008 ggagaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgag 16653107  T
Q  104 tgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16653108 tgtcttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaac 16653207  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16653208 tcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttct 16653307  T
Q  303 tccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||    
T  16653308 tccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---ac 16653403  T
Q  403 tctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  16653404 actttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--ttagtattggtgtggttcgatc 16653471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Original strand, 16554772 - 16555228
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554772 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16554871  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554872 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 16554971  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554972 atagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctct 16555071  T
Q  310 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgt 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   || ||||||    
T  16555072 ccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---acactttgt 16555167  T
Q  410 tcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  16555168 ttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--ttagtattggtgtggttcgatc 16555228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Original strand, 16631328 - 16631784
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631328 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16631427  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631428 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 16631527  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631528 atagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctct 16631627  T
Q  310 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgt 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   || ||||||    
T  16631628 ccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---acactttgt 16631723  T
Q  410 tcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  16631724 ttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--ttagtattggtgtggttcgatc 16631784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16578783 - 16578327
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578783 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16578684  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578683 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 16578584  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578583 atagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctct 16578484  T
Q  310 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgt 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   || ||||||    
T  16578483 ccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---acactttgt 16578388  T
Q  410 tcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  16578387 ttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--ttagtattggtgtggttcgatc 16578327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Original strand, 16616597 - 16617053
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616597 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16616696  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616697 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 16616796  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616797 atagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctct 16616896  T
Q  310 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgt 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   || ||||||    
T  16616897 ccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---acactttgt 16616992  T
Q  410 tcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  16616993 ttggtggttaccactctccttggctccacacatcattat--ttagtattggtgtggttcgatc 16617053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 33342370 - 33341907
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33342370 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 33342273  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  33342272 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactccttttgtaaagaactcatt 33342173  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  33342172 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 33342073  T
Q  308 ctcctt-gtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactct 405  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  33342072 ctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgt--ttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataagct 33341975  T
Q  406 ttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341974 ttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 33341907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 34166983 - 34167444
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34166983 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 34167080  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  34167081 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaacttatt 34167180  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  34167181 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 34167280  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactcttt 407  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||    
T  34167281 ctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgctcaatatttttt 34167378  T
Q  408 gttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167379 gtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 34167444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 34164761 - 34165222
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34164761 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 34164858  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34164859 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 34164958  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  34164959 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 34165058  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctt 406  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  34165059 ctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagctt 34165155  T
Q  407 tgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165156 ggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 34165222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 88 - 473
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13154279
Alignment:
Q  88 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153893 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 13153992  T
Q  187 atcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttgg 285  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13153993 attccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg 13154092  T
Q  286 tgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgt 384  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  13154093 tgtttattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgt 13154190  T
Q  385 ttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154191 ttcttgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 13154279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 472
Target Start/End: Original strand, 27647775 - 27648210
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647775 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 27647872  T
Q  120 ggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27647873 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 27647971  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27647972 tggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttat 27648069  T
Q  320 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtta 419  Q
    ||||       ||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  27648070 cttg-------tgtattgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgttcggtggtta 27648161  T
Q  420 ccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    || |||||| | |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  27648162 ccactctcctttgctccacacatcatt----cttgtattggtgtggttcgatc 27648210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 412014 - 412369
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  412014 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattg 412112  T
Q  120 ggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--cctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  412113 ggaaaaaggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca-ttgatagtg 412210  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  412211 gattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctcct--t 412308  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  412309 ttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgtt 412369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3073016 - 3072670
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3073016 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 3072918  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 215  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3072917 gggaaaatggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagt 3072820  T
Q  216 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  3072819 gaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--t 3072722  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatcta 368  Q
    |||||||||| ||| || ||| || ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3072721 ttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatcta 3072670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6097699 - 6097349
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||| |||||||||    
T  6097699 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttggtgaga 6097600  T
Q  117 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||| |||  ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||    
T  6097599 ttggaaaaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaagaactcatt-gatagt 6097512  T
Q  216 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttg 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6097511 ggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttg 6097412  T
Q  315 tttatcttgtgattgttgctttgtg-tttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 379  Q
      ||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6097411 --tatcttgtgattg-tgtattgtgtttttccacttgttacctagattagatcaaggtgctgtttt 6097349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2171796 - 2171512
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  2171796 gcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 2171698  T
Q  111 -gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  2171697 ggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatctcttt-gtaagaactcat 2171600  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2171599 t-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttt 2171512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31404940 - 31404656
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 110  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||         
T  31404940 ggcaactttagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 31404842  T
Q  111 --gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  31404841 cagtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 31404744  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  31404743 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 31404656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5406464 - 5406181
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||         
T  5406464 ggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 5406367  T
Q  111 --gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  5406366 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 5406269  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5406268 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5406181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5410789 - 5410506
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||         
T  5410789 ggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 5410692  T
Q  111 --gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  5410691 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 5410594  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5410593 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5410506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16452594 - 16452310
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  16452594 gcaactttagagtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 16452497  T
Q  111 -gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcttg-tatcccttttgtaagaactc 205  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||| |||| | ||||||||    
T  16452496 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttgg-aagaactc 16452399  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  16452398 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 16452310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30834801 - 30834517
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |   || || |||||||||||||||||          
T  30834801 gcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 30834704  T
Q  111 -gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  30834703 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactc 30834606  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  30834605 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatct-ttggtgtgtttgttt 30834517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5413658 - 5413376
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | |||||| |||   || || |||||||||||||||||         
T  5413658 ggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 5413561  T
Q  111 --gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  5413560 tggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 5413463  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5413462 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5413376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 364 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6136216 - 6136107
Alignment:
Q  364 atctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgt 463  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6136216 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccgttgctccacacatcattattctttgtattggtat 6136117  T
Q  464 ggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||    
T  6136116 ggttcgatcc 6136107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808699
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 3808780  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttgg 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3808779 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctcttgg 3808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33160521 - 33160254
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||    
T  33160521 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaac 33160424  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttctt 303  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||    
T  33160423 tcatt-gatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt 33160326  T
Q  304 ccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
      |||||||| |||||||| || |||| | |||||| ||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  33160325 --ctctcctt-tttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 33160254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589095
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21589028  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21589029 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21589095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593828
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21593761  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21593762 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21593828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 273
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758188
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 17758123  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17758124 t-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtga 17758188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972943
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 2973010  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2973009 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtga 2972943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 389 - 473
Target Start/End: Original strand, 13159051 - 13159135
Alignment:
Q  389 tgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13159051 tgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 13159135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763155
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttggaagaact 17763087  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17763088 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtga 17763155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5409151 - 5409051
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  5409151 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatct-ttggtgtgttt 5409055  T
Q  293 gttt 296  Q
    ||||    
T  5409054 gttt 5409051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569208
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgta-aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 122  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  123 aag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 220  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||            ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacct------------ttgtaagaactcatt-gatagtggatt 16569134  T
Q  221 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  16569135 ggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 16569208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9183199 - 9183015
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  9183199 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9183102  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgt 294  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||    
T  9183101 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 9183015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954283
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||| |    
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctc-tttgtaagaactca-t 26954354  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  26954353 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137420
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||||||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 28137479  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28137478 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 28137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830141
Alignment:
Q  110 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctcttt-gtaagaactca 26830192  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 258  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26830191 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttg 26830141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424829
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc---tcttgtatcccttttgtaagaa 202  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||||| |||| |||||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaa 22424898  T
Q  203 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| |||||    
T  22424897 ctcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtga 22424829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 273
Target Start/End: Original strand, 5043648 - 5043792
Alignment:
Q  128 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggaga 225  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5043648 gtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtagattggaga 5043744  T
Q  226 gtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||    
T  5043745 gatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 5043792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 267
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800746
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac--ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 259  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctc-tttgtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgg 26800738  T
Q  260 accgaact 267  Q
    ||||||||    
T  26800739 accgaact 26800746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33211353 - 33211182
Alignment:
Q  108 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| | |  ||||||| | ||||||||||||    
T  33211353 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattatgg-ttgttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctc-tttgtaagaact 33211256  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  33211255 cattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038926
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 3038974  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 253  Q
    | ||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3038973 c-tttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 603201 - 603081
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  603201 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttgga 603105  T
Q  261 ccgaactaggtgaccaatctcttg 284  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||    
T  603104 ccgaactgggtcaacaatctcttg 603081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| | ||||||||||||||||| | | || |||| ||||   || |||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactc 4045522  T
Q  206 atttgatagtggattggagag 226  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  4045523 a-ttgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 25637331 - 25637794
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25637331 caaaggggtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 25637428  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25637429 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 25637528  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctctt-ggtgtatttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  25637529 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctc 25637628  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgtt-gctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactcttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25637629 tccttgtttatcttgtgattgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcctgcttgcacaatacacttt 25637728  T
Q  408 gttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637729 gttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 25637794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 3617352 - 3617814
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617352 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 3617451  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgt-aagaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3617452 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 3617551  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  3617552 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 3617651  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  3617652 tccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 3617749  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3617750 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttatttgtattggtgtggttcgatcc 3617814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4598777 - 4598327
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598777 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 4598680  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4598679 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 4598580  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598579 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgttta 4598480  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  4598479 tcttgtgattgttgctttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggtt 4598382  T
Q  419 accgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598381 accactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 4598327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 472
Target Start/End: Original strand, 45282893 - 45283345
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282893 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 45282992  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccc---ttttgtaagaactcatttgatag 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  45282993 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatag 45283092  T
Q  215 tggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45283093 tggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctctccttg 45283192  T
Q  315 tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggt 414  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||||| |||    
T  45283193 tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcactagtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaa-acactttgtttggt 45283290  T
Q  415 ggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  45283291 ggttaccgctctccgtcgctccacacatc---attctttgtattggtgtggttcgatc 45283345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4600998 - 4600548
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600998 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 4600901  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4600900 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 4600801  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600800 tggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgttta 4600701  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtt 418  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  4600700 tcttgtgattgttgatttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttctggcttgctcaataagctttgtttggtggtt 4600603  T
Q  419 accgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600602 accactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 4600548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Original strand, 10211309 - 10211759
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211309 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 10211406  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10211407 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 10211506  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10211507 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctctccttgttta 10211606  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||    
T  10211607 tcttgtgattgttgctttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgattggtggtt 10211704  T
Q  419 accgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10211705 accactctccgtcgctccacacatcattattctctgtattggtgtggttcgatcc 10211759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 10056122 - 10056583
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10056122 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 10056219  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10056220 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 10056319  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  10056320 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 10056419  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctt 406  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  10056420 ctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagctt 10056516  T
Q  407 tgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056517 ggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 10056583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 10058344 - 10058805
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10058344 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 10058441  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10058442 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 10058541  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  10058542 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 10058641  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctt 406  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  10058642 ctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagctt 10058738  T
Q  407 tgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058739 ggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 10058805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 10060566 - 10061027
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10060566 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 10060663  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10060664 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 10060763  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  10060764 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 10060863  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctt 406  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  10060864 ctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagctt 10060960  T
Q  407 tgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060961 ggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 10061027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 10062788 - 10063249
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10062788 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 10062885  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10062886 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 10062985  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  10062986 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 10063085  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctt 406  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  10063086 ctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagctt 10063182  T
Q  407 tgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10063183 ggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 10063249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 10065010 - 10065471
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10065010 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 10065107  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10065108 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 10065207  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  10065208 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 10065307  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctt 406  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  10065308 ctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagctt 10065404  T
Q  407 tgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065405 ggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 10065471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Original strand, 10209089 - 10209539
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209089 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 10209186  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10209187 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagtccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 10209286  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10209287 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctctccttgttta 10209386  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||    
T  10209387 tcttgtgattgttgctttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgattggtggtt 10209484  T
Q  419 accgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10209485 accactctccgtcactccacacatcattattctctgtattggtgtggttcgatcc 10209539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 18 - 449
Target Start/End: Original strand, 54635035 - 54635462
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635035 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 54635134  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtgg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54635135 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtgg 54635233  T
Q  218 attggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtt 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  54635234 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tt 54635331  T
Q  317 tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtgg 416  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | || ||||||| |||||    
T  54635332 tatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtgg 54635429  T
Q  417 ttaccgctctccgtcgctccacacatcattatt 449  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  54635430 ttaccactctcctttgctccacacatcattatt 54635462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 472
Target Start/End: Original strand, 6716412 - 6716859
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716412 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 6716511  T
Q  120 ggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6716512 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 6716610  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  6716611 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--ttta 6716708  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt-attgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggt 417  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  6716709 tcttgtgattgtatttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttggttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtggt 6716807  T
Q  418 taccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||    
T  6716808 taccgctttccgttgctccacacatc---actctttgcattggtgtggttcgatc 6716859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 801003 - 801355
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  801003 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 801101  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  801102 gggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagt 801199  T
Q  216 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  801200 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--t 801297  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 379  Q
    ||||||||||  | |||   ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  801298 ttatcttgtg--tattg---tgtttttc-cacttgtttcctagattagatctaggtgctgtttt 801355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 71 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779821
Alignment:
Q  71 tgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaat 169  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  170 ttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactag 269  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  7780109 ttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgg 7780011  T
Q  270 gtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtg-tttcacacttggttcctagattagatcta 368  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  7780010 gtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatcta 7779914  T
Q  369 ggtggtg-ttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggtt 467  Q
    |||| || |||| ||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  7779913 ggtgctgtttttgttgattattgcttgcac---acactttgtt-ggtggttaccactctcctttgctccacacatc-tta--cttcgtattggtgtggtt 7779821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 210
Target Start/End: Original strand, 10067232 - 10067431
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10067232 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 10067329  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgt-aagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10067330 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 10067429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 237 - 473
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067670
Alignment:
Q  237 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgct 10067534  T
Q  335 ttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgct 434  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10067535 ttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttg-ttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgct 10067631  T
Q  435 ccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067632 ccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 10067670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23200402 - 23200020
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  23200402 gcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttg 23200304  T
Q  111 gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  23200303 gtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcat 23200206  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccct 307  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23200205 t-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcttcttccct 23200108  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcaca-cttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    |||||  |||||||| || ||| || |||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||| | | || ||| || ||||||||||    
T  23200107 ctcct--tttatcttatgcttg-tggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtgttttattgttgattattgcttgcac 23200020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23198203 - 23197850
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  23198203 gcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttg 23198105  T
Q  111 gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  23198104 gtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcat 23198007  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccct 307  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  23198006 t-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttctct 23197909  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcaca-cttggttcctagattagatcta 368  Q
    |||||  ||||||||||| ||| || |||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||    
T  23197908 ctcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatcta 23197850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Original strand, 6718596 - 6718718
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718596 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 6718695  T
Q  120 ggaaaggggtagaaattagggtt 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  6718696 ggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 45095062 - 45095350
Alignment:
Q  12 aaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||    
T  45095062 aaagaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 45095159  T
Q  111 -------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaga 201  Q
           ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  45095160 ttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaaga 45095257  T
Q  202 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  45095258 actcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggcgtatttgttt 45095350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9636390 - 9636106
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt------ 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||          
T  9636390 aactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattgg 9636292  T
Q  113 -gagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
     ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  9636291 tgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcat 9636194  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9636193 t-gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 9636106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5258407 - 5258125
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------g 111  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |    
T  5258407 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 5258310  T
Q  112 tgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||    
T  5258309 tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcat 5258212  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5258211 t-gatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5258125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5260589 - 5260304
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt--- 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||       
T  5260589 ggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcat 5260492  T
Q  113 ----gagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
        ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||    
T  5260491 tggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaact 5260394  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5260393 catt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5260304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683792
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19683957  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccct 307  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  ||    
T  19683956 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ct 19683861  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    |||||  |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19683860 ctcct--tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcacttttattcctagattagatctaggtgctgtt 19683792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Original strand, 37408361 - 37408645
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 110  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||    || || ||| |||||||||||||         
T  37408361 ggcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcat 37408458  T
Q  111 --gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
      ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  37408459 tggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactc 37408556  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37408557 att-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 37408645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 7762265 - 7762437
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  7762265 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaact 7762362  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7762363 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 7762437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Original strand, 9581188 - 9581454
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  9581188 aactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 9581285  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||    
T  9581286 gtgggattcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt 9581383  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9581384 -gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9581454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Original strand, 7764476 - 7764651
Alignment:
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  7764476 gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtg 7764572  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  7764573 gattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 7764651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491397
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 34491309  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  34491310 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 34491397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199457
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 49199541  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49199540 tcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 49199457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196368
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29196457  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29196456 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 29196368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 288
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236304
Alignment:
Q  112 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 30236226  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  30236227 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgt 30236304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570111
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 4570049  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4570050 catt-gatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaact 4570111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401789
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||   | || |||| |||| ||||||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaac 43401873  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43401872 tcatt-gatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 43401789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Original strand, 40735288 - 40735568
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaa-gagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||           
T  40735288 aactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 40735385  T
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||    
T  40735386 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctcttt-gtaagaactcat 40735483  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  40735484 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaatct-ttggtgtatttgtt 40735568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39153526 - 39153381
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||    
T  39153526 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttta-taagaactcat 39153429  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39153428 t-gatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaagtt 39153381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43403913 - 43403736
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  ||||| ||||||||||||   | || |||| |||| ||||||||    
T  43403913 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggctt-gttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctcttt-gtaagaac 43403816  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttg 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43403815 tcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 43403736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835012
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 22835070  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  22835069 t-gatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaact 22835012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 40734498 - 40734669
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  40734498 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt-gtaagaact 40734595  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  40734596 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819526
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 41819594  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  41819593 tcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtga 41819526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaagaact 44331642  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  44331643 tatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700476
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 44700549  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  44700548 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 295
Target Start/End: Original strand, 51398833 - 51398999
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51398833 gggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 51398929  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  51398930 gagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 51398999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 760752 - 760995
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||| |  || || |||||||||||||||||           
T  760752 aactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 760849  T
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  760850 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 760947  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  760948 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095609
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | || ||||| |  ||| |||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6095670  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6095669 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 6095609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Original strand, 16499115 - 16499215
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  16499115 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtattt 16499211  T
Q  293 gttt 296  Q
    ||||    
T  16499212 gttt 16499215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 288
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173536
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46173377 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggag 46173473  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  46173474 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactagatcaacaatttcttggtgt 46173536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314631
Alignment:
Q  110 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||     
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactc- 31314543  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  || | |||||| ||||||| |||||||    
T  31314544 tttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 31314631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860631
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataact 46860571  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  46860572 catt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 46860631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593868
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54593801  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  54593802 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtga 54593868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Original strand, 40913379 - 40913472
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40913379 tttgtaagaactcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctcttggtgt 40913472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5236624 - 5236440
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||    
T  5236624 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 5236527  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    || |||||| |||||| |||||  |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  5236526 ca-ttgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 5236440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Original strand, 29810889 - 29811016
Alignment:
Q  128 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggaga 225  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29810889 gtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggaga 29810985  T
Q  226 gtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29810986 gatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921513
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| || |||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaagaact 53921574  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||    
T  53921573 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaact 53921513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 29682269 - 29682530
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 115  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  29682269 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgag 29682366  T
Q  116 attgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgat 212  Q
    |||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  29682367 attgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gat 29682463  T
Q  213 agtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  29682464 agtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32744689 - 32744418
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   || || ||||||||||| | ||| |||||||    
T  32744689 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtattttg-tgagatt 32744593  T
Q  119 gggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 215  Q
    |  |||  |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  32744592 gaaaaaatgggtagaaattag--tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaactc-tttgatagt 32744497  T
Q  216 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||||| ||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  32744496 ggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 32744418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 280
Target Start/End: Original strand, 29813083 - 29813234
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29813083 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaactcattt-atagtggattggag 29813179  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||  |||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||| ||| | ||||||    
T  29813180 agatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301975
Alignment:
Q  168 atttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 266  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaac 55301982  T
Q  267 taggtga 273  Q
    | |||||    
T  55301981 ttggtga 55301975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9666616 - 9666448
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatccct-tttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9666616 gggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-tcatttatacctctttgtaagaattc-tttgatagtggattgga 9666519  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  9666518 gagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 9666448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 267
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891262
Alignment:
Q  110 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||     
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcg 32891203  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    || |||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  32891204 tt-gatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaact 32891262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305720
Alignment:
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaact 27305720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 288
Target Start/End: Original strand, 47304340 - 47304430
Alignment:
Q  196 gtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||| | |||||||    
T  47304340 gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatttattggtgt 47304430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055745
Alignment:
Q  113 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacctc--ttgtatcccttttgtaag-aactcatt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| |    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactca-t 4055831  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga-gtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||||||||| ||||  |  ||||||| ||||| ||||||||   |||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4055830 tgatagtggattgaagagatc--tctctcccccagatgtaggtcattgttgggccgaactgggtaaccaa-atcttggtgtatttgttt 4055745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433971
Alignment:
Q  108 ttggtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 180  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23391991 - 23391891
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||    
T  23391991 tttgcaagaactc-tttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgttt 23391895  T
Q  293 gttt 296  Q
    ||||    
T  23391894 gttt 23391891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352150
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||||||  ||||||  | ||||||| ||||||    
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccatttgtatttc-tttgtaataactca 51352180  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctc 237  Q
     |||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  51352179 -ttgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 243
Target Start/End: Original strand, 36018852 - 36018987
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    ||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| ||||||||||||||   | ||||||| |||| ||||||||    
T  36018852 ttggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaac 36018949  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 243  Q
    |||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  36018950 tcatt--atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2075143 - 2075095
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  2075143 ttgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaagtt 2075095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12647650 - 12647190
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12647650 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 12647553  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12647552 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 12647453  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  12647452 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 12647353  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  12647352 tccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 12647255  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647254 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 12647190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13656220 - 13655833
Alignment:
Q  88 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgta 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656220 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgta 13656121  T
Q  188 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13656120 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 13656021  T
Q  287 gtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtt 385  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13656020 gtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 13655921  T
Q  386 tcttgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655920 tcttgcttgcacaatatactctgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 13655833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 18 - 445
Target Start/End: Original strand, 6266601 - 6267023
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6266601 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagat 6266700  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6266701 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtg 6266799  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt-atttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||    
T  6266800 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcc--gt 6266897  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtg 415  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |||   || ||||||| ||||    
T  6266898 ttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgttttgttgatttttgcttacac---acactttgtttggtg 6266993  T
Q  416 gttaccgctctccgtcgctccacacatcat 445  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  6266994 gttaccactctcctttgctccacacatcat 6267023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Original strand, 32289477 - 32289853
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  32289477 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 32289575  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  32289576 ggaaaaggg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagta 32289672  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
     ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||  |    
T  32289673 aattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttttcctcttccctctcct--t 32289770  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    |||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  32289771 ttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 32289853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4484594 - 4484211
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || |  |||||||||||||||||      ||    
T  4484594 aactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggt 4484496  T
Q  113 gagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    || |||||||  || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4484495 gaaattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcatt 4484397  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctc 308  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4484396 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcttcttccctc 4484299  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttg-ctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    ||||  ||||||||||| |||| |  ||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  4484298 tcct--tttatcttgtgcttgtggtttttgcttttcac-tttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 4484211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Original strand, 30833250 - 30833633
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gt 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||| | |||||| |||   || |  |||||||||||||||||      ||    
T  30833250 aactctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggt 30833348  T
Q  113 gagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30833349 gagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcatt 30833447  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctc 308  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30833448 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctc 30833545  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    ||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  30833546 tcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 30833633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Original strand, 45099658 - 45099941
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  45099658 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 45099755  T
Q  111 -gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||    
T  45099756 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactc 45099852  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45099853 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 45099941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4503397 - 4503037
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt---- 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||||||| |        
T  4503397 gcaactttagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 4503300  T
Q  113 ---gagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
       ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||    
T  4503299 ggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactc 4503203  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttcc 305  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||      
T  4503202 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt-- 4503107  T
Q  306 ctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4503106 ctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgtt 4503037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5723520 - 5723237
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 110  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||         
T  5723520 ggcaactttagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 5723423  T
Q  111 --gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactca 206  Q
      ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  5723422 tggtgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctcttt-gtaagaactca 5723325  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5723324 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5723237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36205928 - 36205646
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  36205928 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 36205831  T
Q  111 -gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||    
T  36205830 ggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactca 36205734  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  36205733 tt-gacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36205646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36988338 - 36987979
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------g 111  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |    
T  36988338 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 36988241  T
Q  112 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    || |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  36988240 tgggattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt 36988143  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctc 308  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  |||    
T  36988142 -gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctc 36988047  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    ||||  |||||||| || |||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36988046 tcct--tttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 36987979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2334661 - 2334399
Alignment:
Q  40 tttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggta 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||    
T  2334661 tttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggta 2334563  T
Q  131 gaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagta 228  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  2334562 gaaataagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagat 2334466  T
Q  229 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||    
T  2334465 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct-ttggtgtgtttgttt 2334399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6595154 - 6594987
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  6595154 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattggag 6595058  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  6595057 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 6594987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34139920 - 34139752
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctct-tgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34139920 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcatt-gatagtggattgga 34139823  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  34139822 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 34139752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727093
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 45727026  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45727027 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 45727093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 385
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868142
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29867966  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 304  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||| ||| ||| |||||||   ||||     
T  29867967 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct-ttgatgtgtttgtttctctctt- 29868062  T
Q  305 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtt 385  Q
     ||||||  |||||||||||| |||| | |||| ||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29868063 -ctctcc--gtttatcttgtgcttgtggttttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgttattattgtt 29868142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 723893 - 723726
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  723893 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 723797  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  723796 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 723726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14633975 - 14633807
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14633975 gggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactcata-gatagtggattgga 14633878  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  || | |||||| ||||||| |||||||    
T  14633877 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 14633807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 42362257 - 42362500
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  42362257 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 42362354  T
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  42362355 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 42362452  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    | |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362453 t-gatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35447032 - 35446888
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35447032 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 35446936  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35446935 agatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 35446888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773748
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 36773659  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36773660 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36773748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 38312240 - 38312411
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||| ||    
T  38312240 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagatct 38312337  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  38312338 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38312411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631742
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 1631803  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1631802 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 1631742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 33162599 - 33162432
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33162599 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctct-gtaagaactcatt-gatagtggattaga 33162503  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  33162502 gagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 33162432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 267
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648331
Alignment:
Q  113 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||   ||||||||||| |    
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcatt-g 33648274  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  33648275 atagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaact 33648331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151573
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 11151662  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  11151661 c-ttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 11151573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36317991
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36318080  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36318079 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36317991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17057451 - 17057352
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||    
T  17057451 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgttt 17057355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17085434 - 17085335
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||    
T  17085434 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgttt 17085338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398238
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaa--aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||   ||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaac 24398154  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||| | ||| ||||  ||||||||    
T  24398155 tcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaattacttggtgt 24398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Original strand, 11067324 - 11067491
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||| ||| || | | |||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  11067324 gggtagaaattagtgtt-gtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattt-ataatggattgaa 11067420  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  11067421 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 11067491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 266
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353341
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatct-ttttgtaagtactc 26353282  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 266  Q
    ||| |||||||||||||||||  || |||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  26353283 att-gatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaac 26353341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 242
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121901
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||    
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacct-ttgtatctc-tttgtagaaactca 13121866  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctcca 242  Q
     |||||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  13121867 -ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17490261 - 17490158
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  17490261 aagctaatttcttgtaactcttttgtaactcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttgga 17490165  T
Q  261 ccgaact 267  Q
    |||||||    
T  17490164 ccgaact 17490158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 17450678 - 17450748
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17450678 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 267
Target Start/End: Original strand, 11690504 - 11690659
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| || |    
T  11690504 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaaatcgt 11690601  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    | |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | || |||||| ||||||||||||    
T  11690602 t-gatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaact 11690659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7815441 - 7815323
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |    | |||||  |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  7815441 ttggtgagattgagaaaaaggttgaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgtaagaactc 7815343  T
Q  206 atttgatagtggattggagag 226  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  7815342 attt-atagtggattggagag 7815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39285007
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 271
Target Start/End: Original strand, 28672036 - 28672094
Alignment:
Q  213 agtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggt 271  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  28672036 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattaggt 28672094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42288278 - 42288121
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||  |||| |||||| ||    
T  42288278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttcttt-gtaagagct 42288181  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42288180 catt-gataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaag-ttggaccgaact 42288121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 7451204 - 7451266
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  7451204 tttgtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaagtt 7451266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 253
Target Start/End: Original strand, 42412118 - 42412162
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 253  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  42412118 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 32060579 - 32060126
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060579 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 32060480  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccc--ttttgt-aagaactcatttgatagtgga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32060479 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtgga 32060380  T
Q  219 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||    
T  32060379 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgttt 32060282  T
Q  318 atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32060281 atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggt 32060182  T
Q  418 taccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32060181 taccactctccgtcgctccacacatcattattctttatattggtgtggttcgatcc 32060126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6594822 - 6594362
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6594822 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 6594725  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6594724 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 6594625  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  6594624 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 6594525  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  6594524 --cttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 6594427  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594426 tttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 6594362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18389024 - 18388564
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18389024 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 18388927  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18388926 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 18388827  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18388826 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 18388727  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  18388726 tctttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 18388629  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388628 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 18388564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18392460 - 18392000
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18392460 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 18392363  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18392362 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 18392263  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18392262 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 18392163  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  18392162 tccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 18392065  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392064 ttcggtggttaccactctctgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 18392000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6592604 - 6592144
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6592604 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 6592507  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6592506 gtgagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 6592407  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  6592406 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 6592307  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  6592306 --cttgtttttcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 6592209  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592208 tttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 6592144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 472
Target Start/End: Original strand, 20343807 - 20344255
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343807 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 20343906  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtgg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343907 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtgg 20344006  T
Q  218 attggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  20344007 attggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tt 20344103  T
Q  317 tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgt---ttcttgcttgcacaatactctttgttcgg 413  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||   || ||||||||||   || ||||||| ||    
T  20344104 tatcttgtgattg-tgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtgctggttttttgtcgattgttgcttgcac---acactttgtttgg 20344199  T
Q  414 tggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  20344200 tggttaccactctcctttgctccacacatc---attctttgcattggtgtggttcgatc 20344255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 185 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560469
Alignment:
Q  185 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttg 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttg 1560658  T
Q  285 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgt 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1560657 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 1560558  T
Q  385 ttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560557 ttcttgcttgcacaatatactctgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 1560469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 343
Target Start/End: Original strand, 24789751 - 24790074
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24789751 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtaagat 24789850  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24789851 tgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttgtaaaaactc-tttgatagtg 24789949  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttg-ttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |    
T  24789950 gattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtttttcttcttccctctcct--t 24790047  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 343  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24790048 ttatcttgtgattg-tgcattgtgtttc 24790074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 43504411 - 43503991
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43504411 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcgagtgtcttggtgagatt 43504313  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43504312 gggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagt 43504215  T
Q  216 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  43504214 gaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--t 43504117  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggt 414  Q
    |||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||   |||| ||| || |||||||||| | || ||||||| |||    
T  43504116 ttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctagctg--tttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtt-ggt 43504022  T
Q  415 ggttaccgctctccgtcgctccacacatcat 445  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  43504021 ggttaccactctcctttgctccacacatcat 43503991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Original strand, 39731281 - 39731656
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  39731281 aactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 39731379  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39731380 ggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtg 39731477  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtt 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||    
T  39731478 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tt 39731574  T
Q  317 tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    ||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  39731575 tatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 39731656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1562268 - 1562103
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1562268 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 1562171  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 178  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562170 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Original strand, 35853818 - 35854102
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  35853818 gcaactttagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 35853915  T
Q  111 -gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  35853916 ggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 35854013  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35854014 tt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 35854102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25767219 - 25766940
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt----g 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||||||| |    |    
T  25767219 gcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctctttggg---aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 25767124  T
Q  114 agattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtatcccttttgtaagaactcattt 209  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||     
T  25767123 agattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aagaactcatt- 25767027  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25767026 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 25766940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Original strand, 29990959 - 29991240
Alignment:
Q  19 caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||           
T  29990959 caactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 29991056  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  29991057 gtgagattgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttc-taataactcatt 29991154  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  29991155 -gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 29991240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Original strand, 48408705 - 48408992
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  48408705 gcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 48408803  T
Q  111 -gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtatcccttttgtaagaactc 205  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| || |||||    
T  48408804 ggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactc 48408902  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  48408903 att-gatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgtgtttgttt 48408992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 377
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616119
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaag-gggtagaaa 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  135 ttagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaat 232  Q
    ||||| |||||||   |||  |||||  |||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatca-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaat 25615977  T
Q  233 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt---tcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||   |||||||| |||      ||||||||||| |||    
T  25615978 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttcttctctc------tttatcttgtgcttg 25616070  T
Q  330 ttgctttgtgtttcacactt-ggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    | | |||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25616071 tggttttgtgcttttcacttcgattcctagattagatctaggtgttgtt 25616119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaagaact 34310787  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34310786 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 23555039 - 23555212
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||    
T  23555039 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctcttt-gtaagaac 23555136  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23555137 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 23555212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Original strand, 4178678 - 4178960
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  4178678 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 4178775  T
Q  111 -gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||    
T  4178776 ggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactca 4178872  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  4178873 tt-gatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 4178960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Original strand, 19502083 - 19502365
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------g 111  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||       |    
T  19502083 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtgg 19502180  T
Q  112 tgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    |||||||| ||||   || ||||||||| |||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19502181 tgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt-gttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19502278  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  19502279 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 19502365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270158
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 22270070  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22270071 gatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaac-atctcttggtgtgtttgtt 22270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317416
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaagaact 41317505  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  41317504 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 41317416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069817
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14069904  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgt 294  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||    
T  14069903 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 14069817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379845
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14379932  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgt 294  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||    
T  14379931 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 14379845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 288
Target Start/End: Original strand, 2390301 - 2390461
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  2390301 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataactcatat-atagtggattgga 2390397  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2390398 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgt 2390461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27348081
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 27347914  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 304  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    |||||    
T  27347915 catt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc 27348011  T
Q  305 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
     ||| |    |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27348012 tctcac----tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 27348081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359319
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 8359388  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  8359387 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 8359319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608895
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 29608834  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29608835 catt-gatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 29608895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30024900 - 30024742
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  30024900 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30024803  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30024802 c-tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 30024742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41649158 - 41648993
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggaga 225  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41649158 ggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggaga 41649062  T
Q  226 gtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  41649061 gatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 41648993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358058
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 32358071  T
Q  261 ccgaactaggtga 273  Q
    ||||||| |||||    
T  32358070 ccgaactgggtga 32358058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 256
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491727
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| | |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gaaagaact 48491676  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48491677 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253510
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||| || |||| |||| | ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactc 4253598  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||| |||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  4253597 a-ttgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 4253510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 272
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432134
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6432068  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtg 272  Q
    | || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6432069 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146390
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  | |||| |||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||||| | ||||||||||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttc-tgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 36146479  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36146478 ca-ttgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36146390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126829
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18126741  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||| |||||||||||||||    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  18126742 catt-gatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 18126829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259159
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| |  ||||||| |||| |||| |||     
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaaaaacc 3259092  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  3259093 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtga 3259159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599338
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| | |||| ||    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg-aagagct 48599405  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||    
T  48599404 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtga 48599338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360992
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 2361043  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2361042 catt-gatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 2360992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 256
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153490
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 8153439  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8153440 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 8153490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673954
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gg 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||  ||    
T  47674189 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgg 47674091  T
Q  128 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggaga 225  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47674090 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggaga 47673994  T
Q  226 gtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |  |||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||    
T  47673993 gatcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaact 47673954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 43864244 - 43864402
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  43864244 ttggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 43864341  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43864342 aatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaact 43864402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 48489431 - 48489616
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |  |||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| | || ||||    
T  48489431 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gcaataact 48489528  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  48489529 cattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgtt 48489616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508710
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4508777  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| || ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  4508776 catt-gagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 4508710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31733118 - 31732966
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31733118 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatactggattgga 31733022  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  31733021 gagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565081
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 23565113  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||  |||||||||  | |||||||||||||||    
T  23565112 agatcaatctctctcctagagtaggtcaagtt 23565081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586319
Alignment:
Q  108 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||| |||||| ||  || |||| | ||||||||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctc-tttgtaagaact 4586258  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||||    
T  4586259 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaact 4586319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 26417316 - 26417501
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  26417316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26417413  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||| ||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  26417414 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgtt 26417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38671485 - 38671204
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  38671485 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 38671388  T
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  38671387 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcacttt-gtaagaactcat 38671290  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||| ||||   ||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  38671289 t-gatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 38671204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47676304 - 47676146
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  47676304 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47676207  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    || | ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  47676206 caat-gatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaact 47676146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 445
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790333
Alignment:
Q  339 gtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccac 438  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||    | ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattacttgcac---gcactttgtttggtggttaccactttccgttgctccac 24790326  T
Q  439 acatcat 445  Q
    |||||||    
T  24790327 acatcat 24790333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 496148 - 496003
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||  |||||||||||    
T  496148 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggta-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttta-taagaactcat 496051  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||    
T  496050 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaagtt 496003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759207
Alignment:
Q  133 aattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtaca 230  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |  || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  2759339 aattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggagatatca 2759243  T
Q  231 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2759242 atctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 2759207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12097931 - 12097849
Alignment:
Q  212 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  12097931 tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 12097849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 258
Target Start/End: Original strand, 1113679 - 1113807
Alignment:
Q  129 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 226  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1113679 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtagattggagag 1113775  T
Q  227 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 258  Q
      |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  1113776 atcaatctctcccccatattaggtcaagtttg 1113807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359941
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||| | ||||||||| |||||    
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttgga 6359969  T
Q  261 ccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
     |||||| ||| | |||| |||||||||    
T  6359968 tcgaactgggtcaacaatttcttggtgt 6359941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24525584 - 24525522
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24525584 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagtt 24525522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31105558 - 31105403
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||    
T  31105558 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactcat 31105461  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    | ||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31105460 t-gatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaact 31105403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 267
Target Start/End: Original strand, 31518988 - 31519061
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31518988 tttgtaagaactcatt-gacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 31519061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 271
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344135
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||  | ||||| |||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttagtatatc-tttgtgagaactc 23344073  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggt 271  Q
    | |||||| | |||||||||    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23344074 a-ttgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagtaggtcaag-ttggaccgaacaaggt 23344135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24515025 - 24514934
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||    
T  24515025 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 24514934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 179  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4510661 - 4510552
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  4510661 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaactcatt-gatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttgga 4510565  T
Q  261 ccgaactaggtga 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  4510564 ccgtactgggtga 4510552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4512503 - 4512394
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  4512503 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaactcatt-gatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttgga 4512407  T
Q  261 ccgaactaggtga 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  4512406 ccgtactgggtga 4512394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 18396418 - 18396477
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  18396418 ttgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaact 18396477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 30814536 - 30814594
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  30814536 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaact 30814594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 44203536 - 44203996
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44203536 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 44203633  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44203634 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 44203733  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  44203734 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 44203833  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  44203834 tccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 44203931  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203932 tttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 44203996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Original strand, 9036320 - 9036775
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036320 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 9036419  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9036420 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttg 9036518  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctc 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036519 atagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctc 9036618  T
Q  311 cttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgtt 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  9036619 cttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaa-acactttgtt 9036716  T
Q  411 cggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||    
T  9036717 tggtggttaccactctccttagctccacacatc---atcctttgcattggtgtggttcgatc 9036775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 471
Target Start/End: Original strand, 21053868 - 21054314
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21053868 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcattgagtgtcttggtgagat 21053967  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21053968 tgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtg 21054066  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtt 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21054067 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct--tt 21054164  T
Q  317 tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtgg 416  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||   || ||| ||| |||||    
T  21054165 tatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---acacttagtttggtgg 21054260  T
Q  417 ttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 471  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21054261 ttaccactctcctttgctccacacatca-tatttcttgtattggtgtggttcgat 21054314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 445
Target Start/End: Original strand, 40282287 - 40282711
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40282287 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagat 40282386  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40282387 tgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtg 40282485  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  40282486 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tt 40282583  T
Q  317 tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg-ttcggtg 415  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | || ||||| || ||||    
T  40282584 tatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgttttggtg 40282681  T
Q  416 gttaccgctctccgtcgctccacacatcat 445  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  40282682 gttaccactctcctttgctccacacatcat 40282711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 471
Target Start/End: Original strand, 9987112 - 9987558
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9987112 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagat 9987211  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9987212 tgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgcaagaactca-ttgatagtg 9987309  T
Q  217 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt-atttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  9987310 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcct--t 9987407  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtg 415  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||   || ||||| | ||||    
T  9987408 ttatcttgtgattg-tgtatagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---acactttgattggtg 9987503  T
Q  416 gttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 471  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  9987504 gttaccactctcctttgctccacacatca-tatttttcgtattggtgtggttcgat 9987558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 20622496 - 20622072
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20622496 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcattgactgtcttggtgagat 20622397  T
Q  118 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatccc--ttttgtaagaactcatttgatag 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  20622396 tgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttgtaagaactc-tttgatag 20622299  T
Q  215 tggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  20622298 tggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct-- 20622201  T
Q  315 tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggt 414  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | || ||||||| |||    
T  20622200 tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggt 20622103  T
Q  415 ggttaccgctctccgtcgctccacacatcat 445  Q
    ||||||  || ||| | ||||||||||||||    
T  20622102 ggttactactttcctttgctccacacatcat 20622072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Original strand, 51765300 - 51765684
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||   || |  |||||||||||||||||      ||     
T  51765300 aactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtt 51765398  T
Q  114 agattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
     ||||||||  || |||||||||||||||||    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  51765399 tgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcatt 51765498  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctc 308  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  51765499 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctc 51765596  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    ||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  51765597 tcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 51765684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Original strand, 20762575 - 20762859
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||| |||||          
T  20762575 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcatt 20762672  T
Q  111 -gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
     ||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  20762673 ggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttc-gtaagaactc 20762770  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20762771 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct-ttggtgtgtttgttt 20762859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550688
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcat 8550855  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttct-tcttccc 306  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| |     
T  8550854 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttttctctctt-ct 8550758  T
Q  307 tctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    ||||  | ||||||||||| ||||   |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8550757 tctc--tctttatcttgtgcttgtgattttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 8550688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316348
Alignment:
Q  107 cttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 13316424  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13316423 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 13316348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 3189330 - 3189517
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  3189330 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3189427  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  3189428 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3189517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 3198147 - 3198334
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  3198147 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3198244  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  3198245 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3198334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 3206986 - 3207173
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  3206986 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3207083  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  3207084 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3207173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168462
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 37168394  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37168395 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 37168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136412
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||  || ||||  |||| |||||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 29136344  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29136345 catt-gatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 29136412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297963
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 42298046  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42298045 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 42297963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482234
Alignment:
Q  108 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 7482302  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7482301 tcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 7482234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547093
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||| ||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13547160  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13547159 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13547093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503540
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacct--tgtatctcttt-gtaagaactc 37503627  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  37503626 att-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 37503540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918535
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 49918447  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  49918448 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 49918535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28220394 - 28220210
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  28220394 ttggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28220297  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgt 294  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||    
T  28220296 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 28220210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31925856 - 31925711
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31925856 gggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 31925760  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31925759 gagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 31925711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834149
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 834235  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  834234 t-gatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 834149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Original strand, 3156771 - 3157050
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------g 111  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||   || || |||||||||||||||||       |    
T  3156771 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 3156868  T
Q  112 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||    
T  3156869 tgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 3156966  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  3156967 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 3157050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549004
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || | ||||||| |||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13549071  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13549070 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13549004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255343
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47255411  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  47255410 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47255343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552619
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaagaact 4552708  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  4552707 catt-gataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 4552619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28265702 - 28265536
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28265702 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc-tttgatagtggattggag 28265606  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  28265605 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 28265536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348856
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| ||||  ||||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc-taagaact 11348795  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11348796 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 11348856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 44455160 - 44455318
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||    
T  44455160 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttgtaagaact 44455257  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44455258 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaact 44455318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 34603595 - 34603740
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | || |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  34603595 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctc-tttgtaagaactca-ttgatggtggattga 34603691  T
Q  223 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtg 272  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34603692 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033068
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |  | ||| ||| |||| ||||||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaac 37033144  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  37033143 tcatt-gatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13659418 - 13659318
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  13659418 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtattt 13659322  T
Q  293 gttt 296  Q
    ||||    
T  13659321 gttt 13659318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167157
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 50167246  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  50167245 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 50167157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115337
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||| |||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaac 47115268  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
     |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  47115269 ccatt-gatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47115337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28223589 - 28223405
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | || |  |||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  28223589 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28223492  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgt 294  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||    
T  28223491 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 28223405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||| |||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaagaact 23555336  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23555335 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 45644425  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  45644424 catt-gatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169192
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||| |||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagtact 50169281  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| | | | |||||| ||||||| |||||||    
T  50169280 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 50169192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754651
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19754591  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  19754592 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaa 19754651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 273
Target Start/End: Original strand, 28242391 - 28242469
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  28242391 tttgtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 28242469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 273
Target Start/End: Original strand, 193666 - 193775
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  193666 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataactcatt-gatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttgga 193762  T
Q  261 ccgaactaggtga 273  Q
    ||||||| |||||    
T  193763 ccgaactgggtga 193775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Original strand, 1833522 - 1833667
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||  | ||||||| |||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  1833522 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1833619  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 253  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1833620 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3847286 - 3847103
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||||||| || ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  3847286 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 3847189  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||||||||  | |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  3847188 t-gatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3847103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 31659238 - 31659409
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  31659238 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggct-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31659335  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  31659336 tatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31659409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 41360914 - 41361101
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  41360914 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 41361011  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | || |||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  41361012 cgtt-gatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtcatatt-ggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 41361101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Original strand, 46065004 - 46065104
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||| |||    
T  46065004 tttgtaagaactcattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgttt 46065100  T
Q  293 gttt 296  Q
    ||||    
T  46065101 gttt 46065104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 19752685 - 19752857
Alignment:
Q  108 ttggtgagattggg--aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||    
T  19752685 ttggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19752782  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  19752783 tcatt-gatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37560037 - 37559850
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc--aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||   ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||    
T  37560037 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaac 37559940  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctcc-agagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    ||  ||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  37559939 tc-gttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 37559850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 271
Target Start/End: Original strand, 15820326 - 15820469
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |    
T  15820326 gggtaaaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttt-taagaactcatt-gatagtgcattgaa 15820422  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggt 271  Q
    |||   |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15820423 gagataaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggatcgaactaggt 15820469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 252
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  113 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||| |    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcatt-g 22079419  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtca 252  Q
    ||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  22079420 atattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 197056 - 196917
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  197056 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 196960  T
Q  225 agtacaatctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    ||    |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  196959 agatttatctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 196917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683866
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || | || ||||||||||| |||    
T  36683766 tttgtaagaactcatt-gatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagttag-accgaactgagtaaaca-tctcttggtgtgttt 36683862  T
Q  293 gttt 296  Q
    ||||    
T  36683863 gttt 36683866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40122280 - 40122178
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgata--gtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat 290  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |    
T  40122280 tttgtaagaactc-tttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgt 40122184  T
Q  291 ttgttt 296  Q
    ||||||    
T  40122183 ttgttt 40122178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37876848 - 37876770
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||    
T  37876848 tttgtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtga 37876770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 184
Target Start/End: Original strand, 32736952 - 32737009
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  32736952 gggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctctt 32737009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 927996
Alignment:
Q  129 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctc-tttgtaaaaactca-ttaatagtggattagagag 928026  T
Q  227 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
      ||| |||| | |||  ||||||||||||    
T  928025 accaacctcttccccaaggtaggtcaagtt 927996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 250
Target Start/End: Original strand, 6808507 - 6808595
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggt 250  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||    
T  6808507 aagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8871130 - 8871074
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  8871130 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaag-ttggaccgaa 8871074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318589
Alignment:
Q  113 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||  ||| | ||||||||||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcatt 12318589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Original strand, 16455676 - 16455750
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 237  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  16455676 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctgt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37282841 - 37282699
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||| | |||||| | ||| ||| ||||   ||||||||||| | |||||||||||||    
T  37282841 ggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattag-tagtggattggag 37282743  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactag 269  Q
    ||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37282742 agataaatctctcctttggagtaggtcaa-tttggactgaactag 37282699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2868 - 2408
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2868 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 2771  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2770 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 2671  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  2670 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttttgtgtttattgttttcttcttccctc 2571  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  2570 tccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 2473  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2472 tttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 2408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 6177 - 6639
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6177 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 6274  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6275 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatcccttttgtaaagaactcattt 6374  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  6375 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgttattgttttcttcttccctct 6474  T
Q  310 ccttgttt-atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||    
T  6475 ccttgttttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 6574  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575 tttggtggttaccactctccgtcgctccacatatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 6639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 7124804 - 7125266
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124804 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 7124903  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgt-aagaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7124904 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 7125003  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |    
T  7125004 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttcc--c 7125101  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  7125102 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 7125201  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7125202 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttatattggtgtggttcgatcc 7125266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 8395508 - 8395968
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8395508 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 8395605  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395606 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 8395705  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  8395706 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 8395805  T
Q  310 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgt 409  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  8395806 ccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgcacaataaactttgt 8395904  T
Q  410 tcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395905 ttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 8395968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 7122585 - 7123047
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122585 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 7122684  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgt-aagaactcattt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7122685 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 7122784  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||  |    
T  7122785 gatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttctttgtgtttattgttttcttcttcc--c 7122882  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  7122883 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 7122982  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122983 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 7123047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 8393299 - 8393759
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8393299 caaaggggaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 8393396  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393397 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 8393496  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  8393497 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 8393596  T
Q  310 ccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgt 409  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  8393597 ccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttcgt 8393695  T
Q  410 tcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393696 ttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 8393759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 5138193 - 5138655
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5138193 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 5138290  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5138291 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 5138390  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  5138391 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct 5138490  T
Q  308 ctccttgtttatcttgtgatt--gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactct 405  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||  ||    
T  5138491 ctccttgtttatcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttgtctcttgcttgctcaataagct 5138587  T
Q  406 ttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138588 ttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 5138655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 5135967 - 5136430
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5135967 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgta--gagagaatcattgagtgtctt 5136064  T
Q  110 ggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5136065 ggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcat 5136164  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  5136165 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccc 5136264  T
Q  307 tctccttgtttatcttgtgatt--gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactc 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||  |    
T  5136265 tctccttgtttatcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttgtctcttgcttgctcaataagc 5136361  T
Q  405 tttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136362 tttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 5136430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31495573 - 31495188
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31495573 aactctagggtttatagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 31495475  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31495474 gggaaaagggtagaaattaggatt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagt 31495377  T
Q  216 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcctt-- 313  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  31495376 tgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcctttt 31495277  T
Q  314 ----gtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcaca 398  Q
         ||||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||    
T  31495276 atccttttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgcaca 31495188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13992551 - 13992274
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 116  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||    
T  13992551 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgaga 13992453  T
Q  117 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 212  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  13992452 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt--gtaagaactcatt-gat 13992357  T
Q  213 agtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  13992356 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 13992274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30000069 - 29999809
Alignment:
Q  19 caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   || || |||| ||||||||||||           
T  30000069 caactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattg 29999972  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  29999971 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcatt 29999873  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29999872 -gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 29999809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 56178882 - 56178618
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-ggg 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||    
T  56178882 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggg 56178784  T
Q  129 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 226  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56178783 tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagag 56178687  T
Q  227 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  56178686 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 56178618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 52095530 - 52095344
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||| |    
T  52095530 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52095433  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  52095432 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaat-ttttggtgtgtttgttt 52095344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5370237 - 5369986
Alignment:
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtgga 218  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5370237 aaagaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtgga 5370141  T
Q  219 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
     | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| |||||||   ||||  |||||||  ||||    
T  5370140 ctagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct-ttgatgtgtttgtttatctctt--ctctcct--ttta 5370046  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    |||| || |||| | |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5370045 tcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 5369986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 288
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209894
Alignment:
Q  112 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcat 2209814  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2209815 t-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 2209894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 48143042 - 48143230
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||||||    
T  48143042 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttca-taagaac 48143139  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  48143140 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 48143230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaac 41964512  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41964513 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9927626 - 9927468
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  9927626 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9927529  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9927528 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 9927468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038393
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |  |||||||  ||| ||||| |||||    
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatctgttt-gtaaggactca 47038480  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  47038479 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 47038393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073557
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 12073489  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12073490 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtga 12073557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50673960 - 50673851
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50673960 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 50673864  T
Q  261 ccgaactaggtga 273  Q
    |||||||||||||    
T  50673863 ccgaactaggtga 50673851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 272
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665571
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8665505  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtg 272  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8665506 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactaggtg 8665571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364415
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 26364333  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| | |||| |||||||||    
T  26364334 catta-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttcttggtgt 26364415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 288
Target Start/End: Original strand, 12119559 - 12119719
Alignment:
Q  128 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggaga 225  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12119559 gtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattt-atagtggattggaga 12119657  T
Q  226 gtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    |  |||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12119658 gatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtgt 12119719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739533
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||  ||| ||| |||||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12739621  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12739620 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12739533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743908
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12743977  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12743976 agatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12743908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745297
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12745366  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12745365 agatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12745297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703658
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 46703597  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  46703598 tcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 46703658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229727
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccct-tttgtaagaactc 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| ||||| ||||||||  || |||  || |||||||||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactc 37229791  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggt 271  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37229790 attt-atagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactaggt 37229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883199
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54883117  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  54883118 catt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 54883199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175619
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26175707  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  26175706 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 26175619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34570582 - 34570397
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctc-ttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||    
T  34570582 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt-gtaagaact 34570485  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  34570484 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 34570397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632603
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 40632542  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  40632543 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaact 40632603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639584
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||  ||| |||||||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 41639523  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41639524 catc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 41639584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656112
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 6656071  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6656072 gagatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 6656112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147373
Alignment:
Q  110 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||     
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactc- 46147461  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  46147460 tttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 46147373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207865
Alignment:
Q  115 gattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccct-tttgtaagaactcatttgat 212  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgtaagaactca-ttgat 5207906  T
Q  213 agtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 253  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  5207905 agtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa 5207865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Original strand, 379399 - 379539
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  379399 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaagaactaatt-gatagtggattgga 379495  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  379496 gagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaact 379539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36463460  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  36463459 c-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 37740536 - 37740783
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||| |||||||||||       ||||||    
T  37740536 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgaga 37740633  T
Q  117 ttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgata 213  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  37740634 tttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gata 37740730  T
Q  214 gtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  37740731 gtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaact 37740783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687164
Alignment:
Q  108 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||| |  |||||| |  ||||||||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtat-ctatttgtaagaact 45687253  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    || |||||||||||||||||||  | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  45687252 ca-ttgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 45687164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48893751 - 48893620
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  48893751 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgga 48893655  T
Q  261 ccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  48893654 ccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 48893620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 50262814 - 50262689
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||||   |||||    
T  50262814 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttgga 50262717  T
Q  261 ccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50262716 ccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 50262689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994682
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaact 36994621  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  36994622 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaact 36994682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648303
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8648236  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  8648237 catt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 8648303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6542328 - 6542161
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  6542328 ggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattggag 6542231  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||||||    
T  6542230 agatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 6542161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54199926
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54199977  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||| ||||||| ||| |||||  || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54199976 catt-gatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagtt 54199926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416975
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 27417036  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27417035 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 27416975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 267
Target Start/End: Original strand, 35662496 - 35662599
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35662496 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttgga 35662592  T
Q  261 ccgaact 267  Q
    |||||||    
T  35662593 ccgaact 35662599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Original strand, 4588014 - 4588107
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  4588014 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaagtt 4588107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 5429679 - 5429850
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||  ||| |||||||||    
T  5429679 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 5429776  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  5429777 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12744099  T
Q  225 agtacaatctct 236  Q
    ||  ||||||||    
T  12744098 agatcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12747924 - 12747794
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||| |||||    
T  12747924 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtatgaact 12747827  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcc 238  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12747826 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 293
Target Start/End: Original strand, 5871820 - 5872003
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgt-atcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||| ||||||||||||||  || | ||| |||| | |||||||    
T  5871820 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcacttt-gcaagaact 5871917  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttg 293  Q
    | |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||    
T  5871918 c-tttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg 5872003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12745585 - 12745476
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12745585 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 12745489  T
Q  224 gagtacaatctct 236  Q
    |||  ||||||||    
T  12745488 gagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 52467503 - 52467336
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  52467503 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaataactt-tttgatagtggattgga 52467407  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  52467406 gagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 52467336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26699585 - 26699451
Alignment:
Q  134 attagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaa 231  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  26699585 attagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattt-ataatggattggagagatcaa 26699487  T
Q  232 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||||   |||||||||||||   ||||||||||||    
T  26699486 tctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaact 26699451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Original strand, 31474206 - 31474337
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  31474206 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttgga 31474302  T
Q  261 ccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||| ||| | | || ||||||||| |||||||    
T  31474303 ccgaactgggtaaac-atatcttggtgtgtttgttt 31474337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13009535 - 13009464
Alignment:
Q  183 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||    
T  13009535 ttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagtt 13009464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 52082825 - 52082645
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||| |    
T  52082825 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52082728  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | ||||||||||||       |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  52082727 c-tttgatagtgga-------gatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 52082645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 29254580 - 29254679
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||    
T  29254580 tttgtaagaactcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgttt 29254676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 252
Target Start/End: Original strand, 33989899 - 33989989
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtca 252  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||   || ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  33989899 aagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgtta-atagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 238
Target Start/End: Original strand, 3913534 - 3913578
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3913534 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 3913578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 24969112 - 24969230
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  24969112 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 24969209  T
Q  205 catttgatagtggattggagag 226  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  24969210 aatt-gatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Original strand, 33089970 - 33090021
Alignment:
Q  198 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggt 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33089970 aagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 3990 - 3545
Alignment:
Q  11 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3990 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 3893  T
Q  111 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcattt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3892 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 3793  T
Q  210 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  3792 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 3693  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttg 408  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  3692 tccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttg 3595  T
Q  409 ttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtatt 458  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3594 ttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtatt 3545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Original strand, 15290438 - 15290888
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290438 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 15290535  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15290536 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 15290635  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  15290636 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgt--a 15290733  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  15290734 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttaggtggtt 15290833  T
Q  419 accgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290834 accactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 15290888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Original strand, 15470807 - 15471257
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470807 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 15470904  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15470905 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 15471004  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  15471005 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgt--a 15471102  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  15471103 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttaggtggtt 15471202  T
Q  419 accgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471203 accactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 15471257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 22 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42575578 - 42575129
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575578 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 42575481  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42575480 aaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 42575381  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  42575380 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgt--a 42575283  T
Q  319 tcttgtgattg-ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggt 417  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  42575282 tcttgtgtttggttgctttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggt 42575185  T
Q  418 taccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatcc 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42575184 taccactctccgtcgctccacacatcattatagtttgtattggtgtggttcgatcc 42575129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 472
Target Start/End: Original strand, 3439416 - 3439861
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3439416 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattg 3439515  T
Q  120 ggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3439516 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 3439614  T
Q  220 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgttta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3439615 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--ttta 3439712  T
Q  319 tcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtt 418  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||    
T  3439713 tcttgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattgttgcttgcac---acactttgtttggtggtt 3439808  T
Q  419 accgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  3439809 accgctctccgtcgctccacacatcatt-tttttagtattggtgtggttcgatc 3439861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 22 - 472
Target Start/End: Original strand, 25689869 - 25690313
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689869 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 25689968  T
Q  122 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattg 221  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25689969 aaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattg 25690067  T
Q  222 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctc-ttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttat 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||    
T  25690068 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctcccct--tttat 25690165  T
Q  320 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggtta 419  Q
    ||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||    
T  25690166 cttgtgagtg-tgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattcttgcttgcac-acacactttgtttggtggtta 25690263  T
Q  420 ccgctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatc 472  Q
    || |||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  25690264 ccactctcctttgctccacacatc---attctttgtattggtgtggttcgatc 25690313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 2627647 - 2628002
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2627647 aactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagatt 2627745  T
Q  119 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||   | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  2627746 gggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactcatt-gatagt 2627843  T
Q  216 ggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgt 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  2627844 ggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--t 2627941  T
Q  316 ttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    |||||||||| ||| || ||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2627942 ttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 2628002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34254594 - 34254312
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  34254594 ggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 34254497  T
Q  111 -gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  34254496 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaacttat 34254399  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  34254398 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 34254312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Original strand, 44303758 - 44304042
Alignment:
Q  19 caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------- 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||           
T  44303758 caactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 44303855  T
Q  111 gtgagattgggaaag---gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  44303856 gtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttt-taagaactc 44303953  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  44303954 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 44304042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Original strand, 17982556 - 17982840
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  17982556 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 17982653  T
Q  111 -gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  17982654 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactc 17982751  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  17982752 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 17982840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34256770 - 34256488
Alignment:
Q  17 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    | || |||||||||||||||||          
T  34256770 ggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 34256673  T
Q  111 -gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  34256672 ggtgagattggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcat 34256575  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  34256574 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 34256488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Original strand, 31218160 - 31218444
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  31218160 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 31218257  T
Q  111 -gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
     ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  31218258 ggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactc 31218355  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  31218356 att-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 31218444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Original strand, 42498193 - 42498459
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaac 203  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||    
T  42498193 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaac 42498290  T
Q  204 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttctt 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  42498291 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttccctctt 42498388  T
Q  304 ccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
      |||||||  |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42498389 --ctctcct--tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 42498459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19945625 - 19945340
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  19945625 gcaactttagggtttagagt-ctttgattagagt-tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 19945528  T
Q  111 -gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtatcccttttgtaagaact 204  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||||||    
T  19945527 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttgg-aagaact 19945430  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  19945429 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 19945340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1746366 - 1746200
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1746366 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggag 1746271  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  1746270 agttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc-gttggtgtgtttgttt 1746200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15212971
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 15212883  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  15212884 catt-gataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 15212971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434995
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42435062  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42435061 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 42434995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 43036423 - 43036608
Alignment:
Q  108 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||  |  ||||||| | ||||||||||||    
T  43036423 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaact 43036520  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  43036521 ca-ttgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 43036608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283688
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4283621  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4283622 catt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 4283688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352321
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 33352247  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  33352248 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 280
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  110 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||| |||| |||| |||||     
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaaaactc- 40321178  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  40321179 tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655564
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18655497  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18655498 catt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 18655564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1345484 - 1345353
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctct-tgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  1345484 aagctaatttcttgtaacccatatgtatctcttt-gaaagaactcatt-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttaga 1345388  T
Q  261 ccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  1345387 ccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 1345353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303652
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 3303741  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  3303740 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4743308 - 4743196
Alignment:
Q  181 tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  4743308 tcttgtaacccatttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4743211  T
Q  281 cttggtgtatttgttt 296  Q
     ||||||| |||||||    
T  4743210 -ttggtgtgtttgttt 4743196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811449
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||     
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaacc 27811375  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  27811376 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12702783 - 12702542
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12702783 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctcttt-gtaagaactcatt-gatattggattgga 12702687  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttg 323  Q
    |||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||| | |||||||   ||||| ||| |    |||||||||    
T  12702686 gagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtatgtttgtttctctcttctctccc----tttatcttg 12702593  T
Q  324 tgattgttgctttgtgtttcacacttgg--ttcctagattagatctaggtg 372  Q
    || |||| | |||||||||  ||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  12702592 tgcttgtggttttgtgtttttcactttgattttctagattagatctaggtg 12702542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||||||   | ||||||| |||| |||||||||||    
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactca 40328879  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggt 250  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40328880 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221903
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 40221842  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40221843 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 40221903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 256
Target Start/End: Original strand, 30143346 - 30143488
Alignment:
Q  114 agattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttg 210  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |    
T  30143346 agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-g 30143442  T
Q  211 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30143443 atagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagtt 30143488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 256
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141968
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 18141917  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 256  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18141918 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagtt 18141968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 280
Target Start/End: Original strand, 5689326 - 5689442
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  5689326 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttgga 5689422  T
Q  261 ccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    ||||||| ||| | ||||||    
T  5689423 ccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10930281 - 10930188
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgt 288  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  10930281 tttgtaagaacacatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 10930188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19491867 - 19491680
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  19491867 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 19491770  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    | || |||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  19491769 cgtt-gatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtcatatt-ggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 19491680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291766
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||| |    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaatt 30291704  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||    
T  30291705 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaag-ttggaccgaact 30291766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 4731658 - 4731843
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  4731658 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4731755  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| | ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  4731756 catt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 4731843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41366727 - 41366625
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  41366727 aagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttgga 41366632  T
Q  261 ccgaact 267  Q
    |||||||    
T  41366631 ccgaact 41366625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765863
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 9765842  T
Q  205 catttgatagtggattggagag 226  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  9765843 ca-ttgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Original strand, 6598975 - 6599143
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||    
T  6598975 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6599072  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    | ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  6599073 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Original strand, 6674428 - 6674596
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||    
T  6674428 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6674525  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    | ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  6674526 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292474
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 1292534  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    || ||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1292533 ca-ttgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 1292474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353923
Alignment:
Q  111 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcat 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||     
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctc-tttgtaagaactca- 44353892  T
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcc 238  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  44353893 ttgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965701
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||  ||| | ||| ||||||||| ||| ||| || |||| | |||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctc-tttgtaagaactc 8965761  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    | ||||||||| || ||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  8965760 a-ttgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaact 8965701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 273
Target Start/End: Original strand, 11384004 - 11384149
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||    
T  11384004 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaacccatt-gatactggattgga 11384100  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||   | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11384101 gacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 11384149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Original strand, 10015136 - 10015265
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  10015136 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttt--aggaactcatt-gatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttgga 10015230  T
Q  261 ccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    ||||||| ||| | | || |||||||||||||||||    
T  10015231 ccgaactgggtaatc-atttcttggtgtatttgttt 10015265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 267
Target Start/End: Original strand, 4733792 - 4733864
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4733792 tttgtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 4733864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 4162516 - 4162652
Alignment:
Q  126 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 223  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4162516 gggtagaagttagg-tttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatag-ggattgga 4162611  T
Q  224 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    ||   |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  4162612 gatatcaatctctccccaagagtaggtcaag-ttggaccgaa 4162652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Original strand, 8153844 - 8153914
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 265  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  8153844 tttgtaagaactcatt-gatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttggaccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18106191 - 18106091
Alignment:
Q  162 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 260  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  18106191 aagctaatttcttgtaactcatttgtatc--ttttgtaagaactca-ttgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaag-ttgga 18106098  T
Q  261 ccgaact 267  Q
    |||||||    
T  18106097 ccgaact 18106091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32902133 - 32902096
Alignment:
Q  334 tttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggt 371  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32902133 tttgtgtttttcacttggttcctagattagatctaggt 32902096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 252
Target Start/End: Original strand, 7597715 - 7597759
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtca 252  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  7597715 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtca 7597759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 244 - 458
Target Start/End: Original strand, 1 - 214
Alignment:
Q  244 agtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgttt 98  T
Q  343 cacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgcacaatactctttgttcggtggttaccgctctccgtcgctccacacat 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  99 cacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacat 198  T
Q  443 cattattctttgtatt 458  Q
    ||||||||||||||||    
T  199 cattattctttgtatt 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11425 - 11042
Alignment:
Q  20 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gt 112  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || |  |||||||||||||||||      ||    
T  11425 aactctagggtttatggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggt 11327  T
Q  113 gagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatt 208  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11326 gagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgtt 11228  T
Q  209 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctc 308  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11227 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctc 11130  T
Q  309 tccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    ||||  ||||||||||| ||| || |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  11129 tcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgtttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 11042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8907 - 8616
Alignment:
Q  106 tcttggtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaga 201  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  8907 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaaga 8809  T
Q  202 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttc 301  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  8808 actcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctc 8711  T
Q  302 ttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttattgtttcttgcttgcac 397  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  8710 ttccctcttct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 8616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Original strand, 434436 - 434798
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||   || || |||||||||||||||||          
T  434436 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 434533  T
Q  111 -gtgagattggg--aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactc 205  Q
     |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  434534 ggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactc 434631  T
Q  206 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttcc 305  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||   |||||     
T  434632 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatat-ttggtgtgtttgtttctctcttct 434729  T
Q  306 ctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
    ||| |||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  434730 ctc-cct--tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 434798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11745
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 11654  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11655 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttt 11745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 58
Target Start/End: Original strand, 22247 - 22286
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctt 58  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22247 gcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt 22286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Original strand, 820 - 1087
Alignment:
Q  18 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------ 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||          
T  820 gcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttg 917  T
Q  111 gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactca 206  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||   || ||||||    
T  918 gtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aacaactca 1014  T
Q  207 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1015 tt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114774
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt-gtaagaact 114699  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 280  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||    
T  114700 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct 114774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18007
Alignment:
Q  127 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 224  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18151 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-aactcatt-gatagtggattggag 18056  T
Q  225 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18055 agatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtga 18007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 149179 - 149079
Alignment:
Q  193 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtattt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  149179 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtattt 149083  T
Q  293 gttt 296  Q
    ||||    
T  149082 gttt 149079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7491
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 7424  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 273  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  7425 catt-gatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20319
Alignment:
Q  108 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 204  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 20486  T
Q  205 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 304  Q
    | ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||| | ||||||| ||||||    |||||    
T  20485 c-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat-ttttggtgtgtttgttcctctcttc 20389  T
Q  305 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 377  Q
     ||| |    |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20388 tctccc----tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 20319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 267
Target Start/End: Original strand, 10546 - 10647
Alignment:
Q  164 gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 262  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10546 gctaatttattgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggacc 10642  T
Q  263 gaact 267  Q
    |||||    
T  10643 gaact 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27510 - 27447
Alignment:
Q  208 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggt 271  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||   |||||||||| |||||    
T  27510 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaattaggt 27447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University