View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14323_high_58 (Length: 222)

Name: NF14323_high_58
Description: NF14323
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14323_high_58
NF14323_high_58
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (76-207)||(30326813-30326944)
chr1 (76-207)||(238374-238505)
chr1 (78-207)||(8222312-8222441)
chr1 (76-207)||(32216239-32216370)
chr1 (76-206)||(30254608-30254738)
chr1 (76-207)||(15383117-15383248)
chr1 (76-207)||(25160816-25160947)
chr1 (76-207)||(51129043-51129174)
chr1 (76-207)||(2959932-2960063)
chr1 (76-207)||(27227346-27227477)
chr1 (76-207)||(37451469-37451600)
chr1 (76-207)||(10922911-10923042)
chr1 (80-207)||(19899634-19899761)
chr1 (76-207)||(27267061-27267192)
chr1 (76-207)||(18422835-18422966)
chr1 (76-206)||(28564644-28564772)
chr1 (80-207)||(46931593-46931720)
chr1 (80-206)||(23999532-23999658)
chr1 (76-207)||(16415830-16415961)
chr1 (76-207)||(32267218-32267349)
chr1 (76-207)||(47682355-47682486)
chr1 (78-207)||(38759717-38759846)
chr1 (78-170)||(37618764-37618856)
chr1 (76-199)||(1359796-1359919)
chr1 (76-207)||(7078924-7079055)
chr1 (76-171)||(14758252-14758347)
chr1 (76-207)||(15168280-15168411)
chr1 (76-207)||(27532842-27532973)
chr1 (84-207)||(27763180-27763303)
chr1 (76-207)||(38823398-38823529)
chr1 (76-195)||(40885009-40885128)
chr1 (76-207)||(47279373-47279504)
chr1 (77-207)||(4330465-4330595)
chr1 (76-201)||(28769843-28769968)
chr1 (78-202)||(27563768-27563892)
chr1 (76-207)||(9902915-9903046)
chr1 (76-207)||(15752213-15752344)
chr1 (76-207)||(22170895-22171026)
chr1 (76-207)||(34012243-34012369)
chr1 (78-199)||(48353735-48353855)
chr1 (76-207)||(10181868-10182000)
chr1 (87-207)||(33725472-33725592)
chr1 (76-194)||(11742229-11742347)
chr1 (76-207)||(42721223-42721351)
chr1 (76-207)||(3535116-3535238)
chr1 (76-194)||(3309350-3309468)
chr1 (77-207)||(1547463-1547585)
chr1 (76-207)||(41926347-41926471)
chr1 (76-207)||(39393568-39393699)
chr1 (76-194)||(31621410-31621533)
chr1 (78-162)||(21289829-21289913)
chr1 (76-156)||(31962851-31962931)
chr1 (129-207)||(48620821-48620890)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (76-207)||(5830080-5830211)
chr5 (76-207)||(699338-699469)
chr5 (76-207)||(36860612-36860743)
chr5 (76-207)||(40133573-40133704)
chr5 (76-207)||(36866950-36867081)
chr5 (76-207)||(22255370-22255501)
chr5 (76-207)||(35504553-35504684)
chr5 (76-194)||(24886288-24886406)
chr5 (78-207)||(22980981-22981110)
chr5 (76-207)||(12910543-12910674)
chr5 (76-207)||(21088622-21088753)
chr5 (76-207)||(31786502-31786633)
chr5 (78-207)||(7208722-7208851)
chr5 (76-207)||(31705468-31705599)
chr5 (84-207)||(33908421-33908544)
chr5 (76-207)||(38528093-38528224)
chr5 (78-207)||(17157889-17158018)
chr5 (76-207)||(35826342-35826471)
chr5 (76-207)||(13956218-13956349)
chr5 (76-207)||(22973938-22974069)
chr5 (88-207)||(23116090-23116209)
chr5 (76-194)||(1429018-1429136)
chr5 (76-207)||(27318345-27318474)
chr5 (76-195)||(2888301-2888420)
chr5 (76-206)||(19120048-19120178)
chr5 (76-205)||(15992396-15992525)
chr5 (76-204)||(8437156-8437284)
chr5 (76-207)||(5837743-5837874)
chr5 (76-207)||(35511338-35511464)
chr5 (76-207)||(27330492-27330623)
chr5 (78-207)||(35934084-35934213)
chr5 (76-207)||(8741741-8741873)
chr5 (76-184)||(14409197-14409305)
chr5 (76-207)||(25500782-25500913)
chr5 (76-207)||(30969180-30969311)
chr5 (76-174)||(9200445-9200543)
chr5 (76-174)||(25669797-25669895)
chr5 (102-207)||(23954672-23954776)
chr5 (77-174)||(42342942-42343039)
chr5 (76-172)||(25889593-25889689)
chr5 (76-207)||(7693418-7693540)
chr5 (76-174)||(22019844-22019942)
chr5 (82-207)||(6824343-6824466)
chr5 (123-207)||(14919431-14919515)
chr5 (78-174)||(32563361-32563457)
chr5 (76-167)||(43308516-43308607)
chr5 (76-146)||(39573060-39573130)
chr5 (76-191)||(8466931-8467045)
chr5 (76-206)||(15724677-15724807)
chr5 (137-207)||(26268262-26268332)
chr5 (76-135)||(28416407-28416466)
chr5 (156-202)||(5112250-5112296)
chr5 (150-213)||(11898135-11898199)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (76-207)||(46297628-46297759)
chr3 (76-207)||(34133114-34133245)
chr3 (76-207)||(42505941-42506072)
chr3 (78-207)||(53229020-53229149)
chr3 (76-195)||(26941126-26941245)
chr3 (76-207)||(40552125-40552256)
chr3 (76-207)||(22622584-22622715)
chr3 (76-207)||(54828567-54828698)
chr3 (76-194)||(11357247-11357365)
chr3 (78-199)||(48355128-48355249)
chr3 (76-207)||(7327348-7327479)
chr3 (76-207)||(24707981-24708112)
chr3 (76-207)||(39282831-39282962)
chr3 (80-207)||(52040792-52040919)
chr3 (80-206)||(21009672-21009798)
chr3 (78-207)||(22451147-22451276)
chr3 (77-207)||(37157886-37158017)
chr3 (76-207)||(46994527-46994658)
chr3 (80-206)||(54505987-54506113)
chr3 (81-204)||(2008114-2008237)
chr3 (84-207)||(3655076-3655199)
chr3 (76-207)||(4015639-4015769)
chr3 (76-207)||(33378651-33378782)
chr3 (80-206)||(47481702-47481828)
chr3 (78-207)||(33698332-33698461)
chr3 (76-174)||(51212637-51212735)
chr3 (76-201)||(1089879-1090003)
chr3 (76-205)||(3362436-3362565)
chr3 (76-201)||(4761514-4761639)
chr3 (79-207)||(32373649-32373777)
chr3 (76-207)||(24488828-24488959)
chr3 (76-207)||(44891676-44891807)
chr3 (76-207)||(45174685-45174816)
chr3 (102-200)||(20373136-20373234)
chr3 (76-207)||(25579918-25580049)
chr3 (77-203)||(37203250-37203377)
chr3 (76-194)||(40936165-40936283)
chr3 (90-200)||(11357030-11357140)
chr3 (77-174)||(29099558-29099655)
chr3 (78-182)||(43975760-43975867)
chr3 (78-170)||(50475027-50475119)
chr3 (76-167)||(14586546-14586636)
chr3 (76-207)||(29163997-29164119)
chr3 (80-207)||(43348436-43348563)
chr3 (76-198)||(22445931-22446053)
chr3 (76-174)||(53811600-53811694)
chr3 (76-194)||(27480224-27480350)
chr3 (76-207)||(36012317-36012449)
chr3 (96-207)||(11467003-11467114)
chr3 (76-174)||(44186383-44186481)
chr3 (90-207)||(38591877-38591994)
chr3 (76-207)||(11835499-11835624)
chr3 (76-207)||(21193785-21193917)
chr3 (137-207)||(35844506-35844575)
chr3 (156-206)||(53176234-53176284)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (76-207)||(27283907-27284038)
chr7 (79-207)||(9355696-9355824)
chr7 (76-207)||(37110037-37110168)
chr7 (76-206)||(31578931-31579061)
chr7 (76-207)||(32820920-32821051)
chr7 (80-207)||(43686203-43686330)
chr7 (76-207)||(4583082-4583213)
chr7 (76-207)||(17842451-17842582)
chr7 (76-207)||(18797490-18797621)
chr7 (76-207)||(30055690-30055821)
chr7 (76-207)||(37703365-37703496)
chr7 (78-207)||(41764947-41765076)
chr7 (76-207)||(10481768-10481899)
chr7 (78-207)||(32432615-32432744)
chr7 (76-207)||(5657348-5657479)
chr7 (76-207)||(23111355-23111486)
chr7 (76-194)||(31520608-31520726)
chr7 (78-207)||(15612628-15612757)
chr7 (99-207)||(38258708-38258816)
chr7 (76-207)||(15672626-15672760)
chr7 (80-207)||(24211904-24212031)
chr7 (80-207)||(35353271-35353398)
chr7 (76-199)||(37347192-37347315)
chr7 (76-194)||(29173699-29173816)
chr7 (81-207)||(44598829-44598955)
chr7 (76-207)||(11071369-11071497)
chr7 (78-174)||(44411409-44411505)
chr7 (76-195)||(46480996-46481115)
chr7 (76-207)||(48928164-48928295)
chr7 (76-207)||(7334957-7335087)
chr7 (76-207)||(10359081-10359212)
chr7 (93-207)||(21991799-21991913)
chr7 (76-207)||(6546682-6546813)
chr7 (76-207)||(8861448-8861579)
chr7 (76-207)||(12165915-12166037)
chr7 (76-194)||(12390516-12390632)
chr7 (76-207)||(25691411-25691542)
chr7 (76-194)||(32593073-32593191)
chr7 (78-194)||(26980482-26980598)
chr7 (76-207)||(26587959-26588082)
chr7 (80-194)||(38053637-38053751)
chr7 (76-205)||(43925266-43925389)
chr7 (76-165)||(37704387-37704476)
chr7 (79-207)||(33688132-33688260)
chr7 (76-207)||(22687402-22687525)
chr7 (140-207)||(37704320-37704387)
chr7 (76-154)||(34362045-34362123)
chr7 (122-207)||(48928477-48928562)
chr7 (142-207)||(27421313-27421378)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (76-207)||(8075-8206)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (76-207)||(1149504-1149635)
chr8 (76-207)||(4132558-4132689)
chr8 (76-207)||(36694838-36694969)
chr8 (76-206)||(27082710-27082840)
chr8 (76-207)||(40862606-40862737)
chr8 (76-207)||(1205114-1205245)
chr8 (76-207)||(7890829-7890960)
chr8 (80-207)||(8803693-8803820)
chr8 (80-207)||(9864335-9864462)
chr8 (76-207)||(11727211-11727342)
chr8 (76-207)||(16223050-16223181)
chr8 (76-207)||(16446747-16446878)
chr8 (76-195)||(33906411-33906530)
chr8 (76-207)||(37970391-37970522)
chr8 (76-207)||(43643467-43643598)
chr8 (76-207)||(6098385-6098521)
chr8 (76-207)||(12876296-12876428)
chr8 (76-200)||(1149792-1149912)
chr8 (76-207)||(5299818-5299949)
chr8 (76-207)||(23854303-23854434)
chr8 (80-207)||(30654459-30654586)
chr8 (76-207)||(39098991-39099122)
chr8 (76-201)||(1953860-1953985)
chr8 (76-207)||(34895154-34895280)
chr8 (76-207)||(38644165-38644296)
chr8 (77-174)||(10555077-10555174)
chr8 (80-207)||(13307810-13307936)
chr8 (76-201)||(44869690-44869815)
chr8 (78-198)||(31933760-31933880)
chr8 (76-167)||(466059-466150)
chr8 (76-207)||(35459583-35459714)
chr8 (76-146)||(24823266-24823336)
chr8 (78-168)||(35859160-35859250)
chr8 (124-207)||(43025889-43025972)
chr8 (122-207)||(41910907-41910991)
chr8 (76-164)||(12587812-12587900)
chr8 (78-207)||(18259270-18259395)
chr8 (76-167)||(34951929-34952020)
chr8 (76-164)||(34463704-34463789)
chr8 (122-194)||(7998478-7998550)
chr8 (76-135)||(33198061-33198120)
chr8 (157-207)||(12585303-12585353)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (76-207)||(6864223-6864354)
chr4 (76-207)||(35020927-35021058)
chr4 (76-207)||(17173478-17173609)
chr4 (76-207)||(37663633-37663764)
chr4 (76-207)||(55477783-55477914)
chr4 (78-207)||(3042807-3042936)
chr4 (76-207)||(17167901-17168032)
chr4 (76-207)||(28002878-28003009)
chr4 (77-207)||(1815489-1815619)
chr4 (76-207)||(19089345-19089476)
chr4 (76-207)||(25184301-25184432)
chr4 (76-207)||(33816408-33816539)
chr4 (76-205)||(34947987-34948118)
chr4 (76-207)||(19440540-19440671)
chr4 (80-207)||(32912476-32912603)
chr4 (76-207)||(33341586-33341717)
chr4 (80-207)||(34361388-34361515)
chr4 (80-206)||(42199918-42200045)
chr4 (76-207)||(47253928-47254059)
chr4 (78-207)||(879442-879571)
chr4 (76-207)||(50697429-50697561)
chr4 (76-199)||(36493581-36493704)
chr4 (76-207)||(55240997-55241128)
chr4 (76-207)||(7703697-7703828)
chr4 (76-207)||(50764908-50765039)
chr4 (76-201)||(37287922-37288047)
chr4 (76-204)||(49376158-49376286)
chr4 (76-195)||(32579646-32579765)
chr4 (80-207)||(38012042-38012169)
chr4 (76-207)||(17272152-17272283)
chr4 (76-207)||(37775855-37775977)
chr4 (76-207)||(46888050-46888180)
chr4 (78-196)||(5047860-5047978)
chr4 (76-198)||(7152096-7152218)
chr4 (76-204)||(29584092-29584220)
chr4 (76-163)||(4205216-4205303)
chr4 (76-207)||(30002533-30002655)
chr4 (122-204)||(35025534-35025616)
chr4 (78-207)||(23761259-23761388)
chr4 (76-201)||(25700948-25701073)
chr4 (76-198)||(46884006-46884123)
chr4 (76-207)||(4598179-4598301)
chr4 (122-205)||(4934140-4934223)
chr4 (76-159)||(9139465-9139548)
chr4 (76-207)||(27396804-27396935)
chr4 (80-167)||(39400236-39400323)
chr4 (80-197)||(26896285-26896402)
chr4 (76-133)||(35025458-35025515)
chr4 (76-160)||(32592319-32592403)
chr4 (91-154)||(56050171-56050234)
chr4 (76-116)||(23431834-23431874)
chr4 (123-207)||(54499177-54499260)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (76-207)||(4167110-4167241)
chr2 (76-207)||(2325262-2325393)
chr2 (76-207)||(3177127-3177258)
chr2 (76-207)||(41961028-41961159)
chr2 (76-207)||(19289207-19289338)
chr2 (80-206)||(11366269-11366395)
chr2 (76-207)||(35959084-35959211)
chr2 (85-201)||(44913858-44913974)
chr2 (76-207)||(26357765-26357896)
chr2 (76-207)||(41465689-41465820)
chr2 (76-201)||(37905904-37906029)
chr2 (76-203)||(4763823-4763950)
chr2 (76-207)||(31570618-31570749)
chr2 (80-207)||(33550875-33551001)
chr2 (76-207)||(43648129-43648260)
chr2 (76-207)||(44286137-44286268)
chr2 (79-194)||(7006825-7006940)
chr2 (81-206)||(4263965-4264091)
chr2 (101-207)||(17071646-17071752)
chr2 (90-207)||(45327908-45328025)
chr2 (79-198)||(4478562-4478681)
chr2 (101-207)||(17054005-17054111)
chr2 (79-198)||(18494168-18494287)
chr2 (76-207)||(31862040-31862171)
chr2 (76-207)||(33709116-33709247)
chr2 (76-200)||(19500799-19500923)
chr2 (76-207)||(27349832-27349954)
chr2 (76-207)||(39167253-39167378)
chr2 (76-173)||(33660261-33660358)
chr2 (90-207)||(36642176-36642293)
chr2 (76-182)||(19314057-19314166)
chr2 (79-174)||(43770735-43770830)
chr2 (76-174)||(5881750-5881848)
chr2 (102-207)||(29242048-29242153)
chr2 (76-207)||(13711647-13711778)
chr2 (122-207)||(18258217-18258302)
chr2 (137-207)||(19424573-19424643)
chr2 (122-207)||(41463780-41463865)
chr2 (142-203)||(33902258-33902319)
chr2 (79-153)||(41051187-41051260)
chr2 (76-113)||(19424526-19424563)
chr2 (78-107)||(18257424-18257453)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (76-207)||(408295-408426)
scaffold0002 (76-207)||(322-447)
scaffold0002 (79-166)||(93969-94056)
scaffold0002 (158-207)||(94331-94380)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (76-207)||(3879804-3879935)
chr6 (80-207)||(1946022-1946149)
chr6 (76-207)||(7234900-7235031)
chr6 (76-207)||(6091047-6091179)
chr6 (80-206)||(5627580-5627706)
chr6 (76-207)||(20768270-20768401)
chr6 (76-207)||(21016983-21017108)
chr6 (76-206)||(8513417-8513547)
chr6 (76-201)||(29182358-29182483)
chr6 (76-207)||(4318687-4318818)
chr6 (76-194)||(33619026-33619149)
chr6 (76-206)||(6089092-6089222)
chr6 (76-174)||(33892877-33892975)
chr6 (109-207)||(30353256-30353354)
chr6 (80-142)||(7054642-7054704)
chr6 (137-207)||(7055141-7055211)
chr6 (126-207)||(15491803-15491884)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (80-206)||(145886-146012)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (78-207)||(267472-267602)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (76-207)||(12097-12228)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (76-206)||(44146-44275)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (76-206)||(154512-154641)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (76-174)||(100948-101034)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 30326813 - 30326944
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30326813 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat 30326912  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326913 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 30326944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 238374 - 238505
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  238374 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgat 238473  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  238474 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 238505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8222441 - 8222312
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8222441 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 8222342  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8222341 ttttaagtgttacactttgtggggtgttac 8222312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32216370 - 32216239
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  32216370 agtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgat 32216271  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216270 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 32216239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30254738 - 30254608
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30254738 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgac 30254639  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  30254638 agtcttaagtgttacactttatagggtgtta 30254608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15383248 - 15383117
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15383248 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgat 15383149  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383148 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 15383117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25160947 - 25160816
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  25160947 agtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 25160848  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25160847 agttttaagtgttatactttgtggggtgttac 25160816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 51129174 - 51129043
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  51129174 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 51129075  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  51129074 agttttaattgttacactttgtggggtgttac 51129043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2960063 - 2959932
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2960063 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgat 2959964  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2959963 agtcttaagtgttacaatttgtgggatgttac 2959932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 27227346 - 27227477
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27227346 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgat 27227445  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27227446 agtcttaagtgttgcactttgtggggtgttac 27227477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37451600 - 37451469
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37451600 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 37451501  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  37451500 agtcttaagtgttacactttttgaggtgttac 37451469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10923042 - 10922911
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10923042 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgac 10922943  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10922942 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 10922911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 19899634 - 19899761
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||     
T  19899634 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtc 19899733  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19899734 ttaagtgttacactttgtagggtgttac 19899761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 27267061 - 27267192
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27267061 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 27267160  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27267161 agtcttaagtgttgcactttgtggggtgttac 27267192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18422966 - 18422835
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||     
T  18422966 agtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgat 18422867  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422866 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 18422835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 28564644 - 28564772
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  28564644 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 28564743  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  28564744 a--gttaagtgttacactttacggggtgtta 28564772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46931720 - 46931593
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  46931720 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 46931621  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  46931620 ttaagtgttacactttgtagggtgttac 46931593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23999658 - 23999532
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  23999658 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 23999559  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23999558 ttaagtgttacactttgtagggtgtta 23999532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16415961 - 16415830
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16415961 agtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 16415862  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||| ||||    
T  16415861 agtcttaagtattacaatatgtggggtattac 16415830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32267349 - 32267218
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  32267349 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 32267250  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  32267249 agtcttgagtgttacactttgtggagtgttac 32267218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 47682355 - 47682486
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  47682355 agtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgat 47682454  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47682455 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 47682486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759717
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggggtgttac 38759717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Original strand, 37618764 - 37618856
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37618764 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 37618856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Original strand, 1359796 - 1359919
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1359796 agtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgat 1359895  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgg 199  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  1359896 aatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 7078924 - 7079055
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  7078924 agtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgat 7079023  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7079024 agtcttaagtcttatactttgtggggtgttac 7079055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14758347 - 14758252
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758347 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg 14758252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15168411 - 15168280
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15168411 agtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgat 15168312  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  15168311 agccttaagtgttacactttctgaggtgttac 15168280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 27532842 - 27532973
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||     
T  27532842 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgat 27532941  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  27532942 agtcttgagtgttacactttgtgaggtgttac 27532973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 27763180 - 27763303
Alignment:
Q  84 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  27763180 atctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaa 27763279  T
Q  184 gtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  27763280 gtattacactttgtagggtgttac 27763303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38823529 - 38823398
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  38823529 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgat 38823430  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38823429 agtcttaagtgttacactttgttgggtgttac 38823398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40885128 - 40885009
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  40885128 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgat 40885029  T
Q  176 agtgttaagtgttacacttt 195  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  40885028 agtcttaagtgttacacttt 40885009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47279504 - 47279373
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  47279504 agtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgat 47279405  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  47279404 agtcttaagtgttacactttatgggatgttac 47279373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4330595 - 4330465
Alignment:
Q  77 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgaca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  4330595 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgata 4330496  T
Q  177 gtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4330495 gtcttaagtgttacattttgtggggtgttac 4330465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28769968 - 28769843
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  28769968 agtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgat 28769869  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28769868 agtcttaagcgttacactttgtgggg 28769843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Original strand, 27563768 - 27563892
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||    
T  27563768 taattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatag 27563867  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggt 202  Q
    | ||||||||| | |||||||||||    
T  27563868 tcttaagtgttcctctttgtggggt 27563892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 9902915 - 9903046
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  9902915 agtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgat 9903014  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9903015 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttac 9903046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15752344 - 15752213
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  15752344 agtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgat 15752245  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15752244 actcttaagtgttacactttatggggtgttac 15752213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22171026 - 22170895
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  22171026 agtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 22170927  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22170926 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 22170895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 34012243 - 34012369
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  34012243 agtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 34012342  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||     |||||||| |||||||||||||||    
T  34012343 agt-----gtgttacattttgtggggtgttac 34012369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 48353855 - 48353735
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||    
T  48353855 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 48353756  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtgg 199  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  48353755 tctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 10181868 - 10182000
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacata-tattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||| ||| ||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  10181868 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtga 10181967  T
Q  175 cagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10181968 tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 10182000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725592
Alignment:
Q  87 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtg 186  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  187 ttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  33725572 ttacactttctggggtgttac 33725592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 11742229 - 11742347
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||     
T  11742229 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgat 11742328  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||| ||||||||||    
T  11742329 agtcttaattgttacactt 11742347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42721351 - 42721223
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  42721351 agtaattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgat 42721255  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42721254 aatcttaagtgttatactttgtggggtattac 42721223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3535238 - 3535116
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||        
T  3535238 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---- 3535143  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
         |||||||||||||||||||||||||||    
T  3535142 -----taagtgttacactttgtggggtgttac 3535116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3309468 - 3309350
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||     
T  3309468 agtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgat 3309369  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  3309368 agtcttaagtgttacactt 3309350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1547585 - 1547463
Alignment:
Q  77 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgaca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||        |||| ||||| |||||| |||||| |    
T  1547585 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgata 1547494  T
Q  177 gtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||    
T  1547493 gttttgagtgttacactttgtggggtgttac 1547463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41926471 - 41926347
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |     
T  41926471 agtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaa- 41926374  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
         ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41926373 -----taagtgttacactttgtggagtgttac 41926347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39393699 - 39393568
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||| || |||     
T  39393699 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgat 39393600  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  39393599 agtcttaagtgttacactttgtaggatgttac 39393568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 31621410 - 31621533
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattat 170  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31621410 agtagttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattat 31621509  T
Q  171 gtgacagtgttaagtgttacactt 194  Q
    | || ||| |||||||| ||||||    
T  31621510 gcgatagtcttaagtgtcacactt 31621533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21289913 - 21289829
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgat 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21289913 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagttgat 21289829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31962931 - 31962851
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacata 156  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31962931 agtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaacata 31962851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48620890 - 48620821
Alignment:
Q  129 tcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  48620890 tcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttac 48620821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5830211 - 5830080
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  5830211 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 5830112  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830111 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 5830080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 699469 - 699338
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  699469 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat 699370  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  699369 agtcttaagtattacactttgtggagtgttac 699338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36860743 - 36860612
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  36860743 agtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgat 36860644  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36860643 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 36860612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40133704 - 40133573
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  40133704 agtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgat 40133605  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133604 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 40133573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36867081 - 36866950
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  36867081 agtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgat 36866982  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36866981 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 36866950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22255501 - 22255370
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22255501 agtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaat 22255402  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22255401 agttttaagtgttacactttgtgtggtgttac 22255370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35504684 - 35504553
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||     
T  35504684 agtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgat 35504585  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504584 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 35504553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24886406 - 24886288
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24886406 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 24886307  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  24886306 agtcttaagtgttacactt 24886288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22981110 - 22980981
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  22981110 taattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatag 22981011  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22981010 tcttaagtgttacattttgtgaggtgttac 22980981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12910674 - 12910543
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||     
T  12910674 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgat 12910575  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12910574 agtcttaggtgttacactttgtggggtgttac 12910543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 21088622 - 21088753
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  21088622 agtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgat 21088721  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21088722 aatcttaagtgttacactttgtgggatgttac 21088753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 31786502 - 31786633
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  31786502 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgat 31786601  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31786602 agttttaagtgttacactttgtagggtgttac 31786633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 7208722 - 7208851
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  7208722 taattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatag 7208821  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7208822 tcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 7208851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 31705468 - 31705599
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  31705468 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 31705567  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     || |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  31705568 ggtcttaagtgttacattttgtgagatgttac 31705599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33908544 - 33908421
Alignment:
Q  84 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||    
T  33908544 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaa 33908445  T
Q  184 gtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  33908444 gtgttacactttctggggtgttac 33908421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 38528093 - 38528224
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||     
T  38528093 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgat 38528192  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528193 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 38528224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 17157889 - 17158018
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |    
T  17157889 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatgg 17157988  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157989 tcttaagtgttacactttgtggggtgttac 17158018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 35826342 - 35826471
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||     
T  35826342 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgat 35826439  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35826440 aatcttaagggttacactttgtggagtgttac 35826471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 13956218 - 13956349
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||     
T  13956218 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatatgat 13956317  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13956318 agtcttaagtgttacgctttgtagggtgttac 13956349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 22973938 - 22974069
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |     
T  22973938 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaat 22974037  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22974038 agtcttaagtgttacattttgtgaggtgttac 22974069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Original strand, 23116090 - 23116209
Alignment:
Q  88 agtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23116090 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 23116189  T
Q  188 tacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23116190 tacactttgtggggtgttac 23116209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 1429018 - 1429136
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||     
T  1429018 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgat 1429117  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  1429118 agtcttaagtgttacactt 1429136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 27318345 - 27318474
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27318345 agtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaactta--tgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 27318442  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318443 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 27318474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Original strand, 2888301 - 2888420
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  2888301 agtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgat 2888400  T
Q  176 agtgttaagtgttacacttt 195  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  2888401 agtcttaagtgttacacttt 2888420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19120178 - 19120048
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||     
T  19120178 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgat 19120079  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19120078 agtcttaagtgttacactttgtggggtgtta 19120048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 205
Target Start/End: Original strand, 15992396 - 15992525
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||     
T  15992396 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgat 15992495  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtt 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15992496 agtcttaagtgtgacactttgtggggtgtt 15992525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8437284 - 8437156
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  8437284 agtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgat 8437185  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgt 204  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||    
T  8437184 aatcttaagtgttacacattgtggggtgt 8437156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5837874 - 5837743
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||     
T  5837874 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgat 5837775  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5837774 agtcttaagtgttacactttgtggggtattac 5837743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 35511338 - 35511464
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  35511338 agtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 35511437  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||     |||||||| |||||||||||||||    
T  35511438 agt-----gtgttacattttgtggggtgttac 35511464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27330623 - 27330492
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||     
T  27330623 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgat 27330524  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  27330523 agtcttaagtgtgacacttcatggggtgttac 27330492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35934213 - 35934084
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||    
T  35934213 taattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatag 35934114  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35934113 tcttaagtgttacactttgtagggtgttac 35934084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 8741741 - 8741873
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgat-attatgtga 174  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||    
T  8741741 agtatttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtga 8741840  T
Q  175 cagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  8741841 tagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 8741873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 184
Target Start/End: Original strand, 14409197 - 14409305
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  14409197 agtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgat 14409296  T
Q  176 agtgttaag 184  Q
    ||| |||||    
T  14409297 agtcttaag 14409305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 25500782 - 25500913
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||| |||||| ||||||     
T  25500782 agtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgat 25500881  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25500882 gatcttaagtgttacactttgtggggtgttac 25500913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 30969180 - 30969311
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  30969180 agtaactcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgat 30969279  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30969280 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 30969311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9200543 - 9200445
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  9200543 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 9200445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25669895 - 25669797
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25669895 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 25669797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 207
Target Start/End: Original strand, 23954672 - 23954776
Alignment:
Q  102 catcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  23954672 catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagg 23954770  T
Q  202 tgttac 207  Q
    ||||||    
T  23954771 tgttac 23954776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42343039 - 42342942
Alignment:
Q  77 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42343039 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 42342942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25889689 - 25889593
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25889689 agtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 25889593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7693540 - 7693418
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||      
T  7693540 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtg-- 7693443  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
           |||||||||||||||||||||||||    
T  7693442 -------agtgttacactttgtggggtgttac 7693418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22019942 - 22019844
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22019942 agtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga 22019844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Original strand, 6824343 - 6824466
Alignment:
Q  82 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgtt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| ||    
T  6824343 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtctt 6824440  T
Q  182 aagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6824441 aagtgttacactttgtggggtgttac 6824466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 14919431 - 14919515
Alignment:
Q  123 attttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14919431 attttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttac 14919515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32563457 - 32563361
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  32563457 taatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 32563361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 167
Target Start/End: Original strand, 43308516 - 43308607
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  43308516 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat 43308607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39573130 - 39573060
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaaca 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  39573130 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca 39573060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8467045 - 8466931
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||   | |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||     
T  8467045 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgat 8466947  T
Q  176 agtgttaagtgttaca 191  Q
    ||| ||||||||||||    
T  8466946 agtcttaagtgttaca 8466931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15724807 - 15724677
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  || |||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||     
T  15724807 agtaattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgat 15724708  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||| |||| || ||||||||| || ||||||    
T  15724707 agtcttaattgatacactttggggcgtgtta 15724677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268262
Alignment:
Q  137 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttac 26268262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 135
Target Start/End: Original strand, 28416407 - 28416466
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttgg 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  28416407 agtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgg 28416466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 202
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112296
Alignment:
Q  156 agttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggt 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt 5112296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11898199 - 11898135
Alignment:
Q  150 aaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtgggg-tgttactgatga 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11898199 aaacagagttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgtggggatgttaccgatga 11898135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 46297628 - 46297759
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  46297628 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 46297727  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297728 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 46297759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34133245 - 34133114
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  34133245 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgat 34133146  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133145 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 34133114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 42505941 - 42506072
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  42505941 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgat 42506040  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506041 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 42506072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 53229020 - 53229149
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  53229020 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatag 53229119  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53229120 tcttaagtgttacactttgtggggagttac 53229149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Original strand, 26941126 - 26941245
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  26941126 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgat 26941225  T
Q  176 agtgttaagtgttacacttt 195  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  26941226 agttttaagtgttacacttt 26941245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 40552125 - 40552256
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40552125 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgac 40552224  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | |  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40552225 aatcctaagtgttacacgttgtgggatgttac 40552256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 22622584 - 22622715
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  22622584 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgat 22622683  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22622684 agtcttaagtgttacgctttgtggggtgttac 22622715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 54828567 - 54828698
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  54828567 agtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagttgatgatattatttgat 54828666  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54828667 agttttaagtgttacactttgtgggatgttac 54828698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 11357247 - 11357365
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11357247 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 11357346  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  11357347 agtcttaagtgttacactt 11357365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 48355249 - 48355128
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  48355249 taattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 48355150  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtgg 199  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  48355149 tcttaagtgttacactttgtgg 48355128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 7327348 - 7327479
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||     
T  7327348 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgat 7327447  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327448 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 7327479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 24707981 - 24708112
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  24707981 agtaatttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgat 24708080  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708081 tgttttaagtgttacactttgtggggtgttac 24708112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39282962 - 39282831
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  39282962 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgat 39282863  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39282862 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 39282831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 52040792 - 52040919
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  52040792 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc 52040891  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  52040892 ttaagtgttacactatgtggggtattac 52040919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 21009672 - 21009798
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||     
T  21009672 attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtc 21009771  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21009772 ttaagtgttacactttgtagagtgtta 21009798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22451276 - 22451147
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  22451276 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatag 22451177  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  22451176 tgttaaatgttacacttactggggtgttac 22451147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37158017 - 37157886
Alignment:
Q  77 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||     
T  37158017 gtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgat 37157918  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37157917 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 37157886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 46994527 - 46994658
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  46994527 agtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgat 46994626  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46994627 agtcttaagtgttacattttgtggggcgttac 46994658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 54506113 - 54505987
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||     
T  54506113 attcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtc 54506014  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  54506013 ttaagtgttacactttgtagagtgtta 54505987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2008237 - 2008114
Alignment:
Q  81 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |    
T  2008237 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtct 2008138  T
Q  181 taagtgttacactttgtggggtgt 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  2008137 taagtgttacactttgtggagtgt 2008114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 3655076 - 3655199
Alignment:
Q  84 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  3655076 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaa 3655175  T
Q  184 gtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
T  3655176 gtgttacattttgtggtgtgttac 3655199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4015769 - 4015639
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  4015769 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgat 4015671  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4015670 agtcttaagtgtgacactttgtggggtgttac 4015639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 33378651 - 33378782
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  33378651 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgat 33378750  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  33378751 agtcttaagtattacacttcttggggtgttac 33378782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47481828 - 47481702
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||     
T  47481828 attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtc 47481729  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  47481728 ttaagtgttacactttgtagggtgtta 47481702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33698461 - 33698332
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| || ||    
T  33698461 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatag 33698362  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698361 tcttaagtgttacactttgtggggtgttac 33698332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 51212637 - 51212735
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51212637 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 51212735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1090003 - 1089879
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||     
T  1090003 agtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgat 1089905  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1089904 agtcttaagtgttacactttgtgggg 1089879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3362565 - 3362436
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |  ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  3362565 agtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgat 3362466  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtt 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3362465 agtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 3362436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Original strand, 4761514 - 4761639
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |  || |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4761514 agtaattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgat 4761613  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  4761614 agtcttaagtgttatactttgtgggg 4761639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32373777 - 32373649
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||    
T  32373777 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagt 32373678  T
Q  179 gttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32373677 cttaagtgtcacactttgtgggatgttac 32373649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 24488828 - 24488959
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | |||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  24488828 agtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgat 24488927  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24488928 agtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttac 24488959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44891807 - 44891676
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||     
T  44891807 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgat 44891708  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44891707 agtcttaagtgttacactttgtggagtgttac 44891676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45174816 - 45174685
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | |     
T  45174816 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatattat 45174717  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  45174716 agtcttaagtgttacactttgtagagtgttac 45174685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 200
Target Start/End: Original strand, 20373136 - 20373234
Alignment:
Q  102 catcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggg 200  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  20373136 catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatggg 20373234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25580049 - 25579918
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |  ||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |     
T  25580049 agtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaat 25579950  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579949 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 25579918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37203377 - 37203250
Alignment:
Q  77 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaaca-tagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  || ||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||     
T  37203377 gtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgat 37203278  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37203277 agtcttaagtgttacactttgtggggtg 37203250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40936283 - 40936165
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||     
T  40936283 agtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgat 40936184  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  40936183 agtcttaagtgttacactt 40936165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 11357030 - 11357140
Alignment:
Q  90 taatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  11357030 taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgtta 11357129  T
Q  190 cactttgtggg 200  Q
    |||||||||||    
T  11357130 cactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29099655 - 29099558
Alignment:
Q  77 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29099655 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 29099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 182
Target Start/End: Original strand, 43975760 - 43975867
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgca---aacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||    
T  43975760 taattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcga 43975859  T
Q  175 cagtgtta 182  Q
     |||||||    
T  43975860 tagtgtta 43975867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50475119 - 50475027
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  50475119 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattat 50475027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 167
Target Start/End: Original strand, 14586546 - 14586636
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14586546 agtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccg-tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatat 14586636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29164119 - 29163997
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||      
T  29164119 agtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg-- 29164022  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
           |||||||||||||||||||||||||    
T  29164021 -------agtgttacactttgtggggtgttac 29163997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348436
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |||     
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttac 43348436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Original strand, 22445931 - 22446053
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  22445931 agtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgat 22446030  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtg 198  Q
    ||| || ||||||| || |||||    
T  22446031 agtcttgagtgttatacattgtg 22446053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 53811600 - 53811694
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  53811600 agtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgtga 53811694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 27480224 - 27480350
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttg----caacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaac----atagttgatgatat 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||     ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  27480224 agtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatat 27480323  T
Q  168 tatgtgacagtgttaagtgttacactt 194  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||    
T  27480324 tatgcgatagtcttaagtgttacactt 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36012449 - 36012317
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtga 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    || |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||| || |||    
T  36012449 agtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttga 36012350  T
Q  175 cagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36012349 tagtcttaagtgttacattttgtgggatgttac 36012317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11467114 - 11467003
Alignment:
Q  96 ttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacacttt 195  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11467114 ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 11467015  T
Q  196 gtggggtgttac 207  Q
    ||||||| ||||    
T  11467014 gtggggtattac 11467003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 44186383 - 44186481
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  44186383 agtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtga 44186481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38591994 - 38591877
Alignment:
Q  90 taatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||  |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  38591994 taatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtca 38591895  T
Q  190 cactttgtggggtgttac 207  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  38591894 cgttttgtggggtattac 38591877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 11835499 - 11835624
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||      |||||||| | |||||||||||| ||||||     
T  11835499 agtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat------catgcaaatagagttgatgatatcatgtgat 11835592  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  11835593 agtcttaattgttacactttgtaggttgttac 11835624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21193917 - 21193785
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||     
T  21193917 agtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgat 21193818  T
Q  176 agt-gttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||  ||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  21193817 agtctttaagtgttatcctttatggagtgttac 21193785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35844575 - 35844506
Alignment:
Q  137 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35844575 atctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttac 35844506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176234
Alignment:
Q  156 agttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgtta 53176234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27284038 - 27283907
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27284038 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgat 27283939  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283938 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 27283907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 9355696 - 9355824
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9355696 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 9355795  T
Q  179 gttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9355796 tttaagtgttacactttgtggggtgttac 9355824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37110168 - 37110037
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  37110168 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggt 37110069  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110068 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 37110037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 31578931 - 31579061
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  31578931 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgat 31579030  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  31579031 agtcttaagtgttacactttatagggtgtta 31579061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 32820920 - 32821051
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  32820920 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgat 32821019  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32821020 agtcttaagtgttacactttatggggtgttac 32821051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686203
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 43686203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4583213 - 4583082
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4583213 agtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgat 4583114  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583113 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 4583082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 17842451 - 17842582
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  17842451 agtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggt 17842550  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17842551 agtcttaagtgttacactttgtgggatgttac 17842582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18797621 - 18797490
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18797621 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 18797522  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18797521 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 18797490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30055821 - 30055690
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  30055821 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgat 30055722  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30055721 agtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 30055690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 37703365 - 37703496
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37703365 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat 37703464  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37703465 agtcttaagtggtacactttgtgggatgttac 37703496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 41764947 - 41765076
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41764947 taattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 41765046  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41765047 tcttaagtgttacactttctggggtgttac 41765076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10481899 - 10481768
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  10481899 agtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgat 10481800  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481799 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 10481768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32432744 - 32432615
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  32432744 taattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatag 32432645  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32432644 tcttaagtgttacattttgtggggtgttac 32432615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 5657348 - 5657479
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||     
T  5657348 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgat 5657447  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5657448 agtcttaagtattacactttgtgggctgttac 5657479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23111486 - 23111355
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23111486 agtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 23111387  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111386 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 23111355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 31520608 - 31520726
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  31520608 agtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgat 31520707  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  31520708 agtcttaagtgttacactt 31520726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 15612628 - 15612757
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||    
T  15612628 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 15612727  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612728 tcttaagtgttacactttgtggggtgttac 15612757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258708
Alignment:
Q  99 caacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtg 198  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  199 gggtgttac 207  Q
    |||||||||    
T  38258716 gggtgttac 38258708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 15672626 - 15672760
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca--ta-tattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  15672626 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgt 15672725  T
Q  173 gacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15672726 gatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttac 15672760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24212031 - 24211904
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  24212031 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 24211932  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  24211931 ttaggtgttacactttgtaggatgttac 24211904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35353398 - 35353271
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  35353398 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtc 35353299  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35353298 ttaagtgttacattttctggggtgttac 35353271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37347315 - 37347192
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  37347315 agtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggt 37347216  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgg 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  37347215 agtcttaagtgttacactttgtgg 37347192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29173816 - 29173699
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  29173816 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 29173718  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  29173717 agtcttaagtgtaacactt 29173699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44598955 - 44598829
Alignment:
Q  81 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |    
T  44598955 ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtct 44598856  T
Q  181 taagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  44598855 taggtgttacactttgtggggtgttac 44598829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11071497 - 11071369
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  11071497 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgat 11071401  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11071400 aatcttaagtgttacactttgtggggtattac 11071369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 174
Target Start/End: Original strand, 44411409 - 44411505
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44411409 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 44411505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Original strand, 46480996 - 46481115
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  46480996 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgat 46481095  T
Q  176 agtgttaagtgttacacttt 195  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  46481096 agtcttaagtgttacacttt 46481115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 48928164 - 48928295
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  48928164 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgat 48928263  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  48928264 agtcttaagcattacactttctgaggtgttac 48928295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7335087 - 7334957
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||     
T  7335087 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgat 7334989  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7334988 aatcttaagtgttacactctgtggggtgttac 7334957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 10359081 - 10359212
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||     
T  10359081 agtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgat 10359180  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359181 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 10359212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21991913 - 21991799
Alignment:
Q  93 tgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacac 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  21991913 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacac 21991814  T
Q  193 tttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||    
T  21991813 tttgtggggtgttac 21991799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6546813 - 6546682
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||     
T  6546813 agtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgat 6546714  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6546713 aatattaagtgttatactttgtggggtgttac 6546682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8861579 - 8861448
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||     
T  8861579 agtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgat 8861480  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  8861479 ggtcttgagtgttacactttgcggggtgttac 8861448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12166037 - 12165915
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  12166037 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg-- 12165940  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
           |||||||||||||||||||||||||    
T  12165939 -------agtgttacactttgtggggtgttac 12165915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 12390516 - 12390632
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||      
T  12390516 agtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtg-- 12390613  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  12390614 agtcttaagtgttacactt 12390632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 25691411 - 25691542
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  25691411 agtaattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgat 25691510  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25691511 agtcttaagtgtgacactttgtggggtgttac 25691542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 32593073 - 32593191
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  32593073 agtaatttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgat 32593172  T
Q  176 agtgttaagtgttacactt 194  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  32593173 agtcttaagtgttacactt 32593191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26980598 - 26980482
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||    
T  26980598 taattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatag 26980499  T
Q  178 tgttaagtgttacactt 194  Q
    | |||||||||||||||    
T  26980498 tcttaagtgttacactt 26980482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 26587959 - 26588082
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||     
T  26587959 agtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgat 26588050  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26588051 agtcttgagtgttacactttgtggggtgttac 26588082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053637
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  180 ttaagtgttacactt 194  Q
    |||||||||||||||    
T  38053651 ttaagtgttacactt 38053637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43925389 - 43925266
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  43925389 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgta------ttattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 43925296  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtt 205  Q
     || |||||| ||| || ||||| ||||||    
T  43925295 tgtattaagtattaaacgttgtgaggtgtt 43925266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37704476 - 37704387
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 165  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704476 agtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 33688132 - 33688260
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||| |||    
T  33688132 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagt 33688231  T
Q  179 gttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     || | ||||||||||| ||| |||||||    
T  33688232 cttgaatgttacactttatggagtgttac 33688260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22687525 - 22687402
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||        |||| ||||| |||||| ||| ||     
T  22687525 agtaattcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcctt--------aacagagttgttgatatcatgagat 22687434  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22687433 agtcttgagtgttacactttgtggggtgttac 22687402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704320
Alignment:
Q  140 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 37704320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 154
Target Start/End: Original strand, 34362045 - 34362123
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaaca 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  34362045 agtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 48928477 - 48928562
Alignment:
Q  122 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  48928477 tattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttac 48928562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421378
Alignment:
Q  142 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttac 27421378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8206 - 8075
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  8206 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgat 8107  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8106 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 1149504 - 1149635
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  1149504 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgat 1149603  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149604 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 1149635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 4132558 - 4132689
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4132558 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat 4132657  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4132658 agtcttatgtgttacactttgtggggtgttac 4132689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 36694838 - 36694969
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  36694838 agtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 36694937  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36694938 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 36694969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 27082710 - 27082840
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27082710 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgat 27082809  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27082810 agtcttaagtgttacactttgcggggtgtta 27082840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40862737 - 40862606
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  40862737 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgat 40862638  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40862637 agtcttaagtgttacactttgtggagtgttac 40862606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1205245 - 1205114
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  1205245 agtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgat 1205146  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205145 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 1205114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 7890829 - 7890960
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  7890829 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgat 7890928  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7890929 aatcttaagtgttacacgttgtggggtgttac 7890960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 8803693 - 8803820
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  8803693 attcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagta 8803792  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  8803793 ttaagtgttacactttttagggtgttac 8803820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9864462 - 9864335
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  9864462 attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtc 9864363  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864362 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 9864335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11727342 - 11727211
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||     
T  11727342 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgat 11727243  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11727242 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttac 11727211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16223181 - 16223050
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16223181 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 16223082  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16223081 actcttaagtgttacactttttggggtgttac 16223050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 16446747 - 16446878
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  16446747 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 16446846  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16446847 agtcttaagtgttacgctttgtggggtgttac 16446878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33906530 - 33906411
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33906530 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgat 33906431  T
Q  176 agtgttaagtgttacacttt 195  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  33906430 agtcttaagtgttacacttt 33906411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 37970391 - 37970522
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37970391 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 37970490  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970491 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 37970522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 43643467 - 43643598
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  43643467 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgat 43643566  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43643567 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 43643598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 6098385 - 6098521
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca-----tatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6098385 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 6098484  T
Q  171 gtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098485 gtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 6098521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12876428 - 12876296
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  12876428 agtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 12876329  T
Q  176 agt-gttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12876328 agtctttaagtgttacactttgtggggtgttac 12876296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 200
Target Start/End: Original strand, 1149792 - 1149912
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  1149792 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt--- 1149888  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggg 200  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  1149889 -gtcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 5299818 - 5299949
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||     
T  5299818 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgat 5299917  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299918 aatcttaagtgttacactttgtggggtgttac 5299949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 23854303 - 23854434
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  23854303 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgat 23854402  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  23854403 tgtcttaagtgttacactttatgcggtgttac 23854434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 30654459 - 30654586
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||     
T  30654459 attcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtc 30654558  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30654559 ttaagtgttacactttgtagggtgttac 30654586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 39098991 - 39099122
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||     
T  39098991 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgat 39099090  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  39099091 agtcttaagtgtgatactttgtgggatgttac 39099122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Original strand, 1953860 - 1953985
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  1953860 agtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgat 1953959  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1953960 agtcttaagtgttacactttgtgggg 1953985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34895280 - 34895154
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  34895280 agtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 34895181  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||     |||||||| |||||||||||||||    
T  34895180 agt-----gtgttacattttgtggggtgttac 34895154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38644296 - 38644165
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||     
T  38644296 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgat 38644197  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  38644196 agtcttgagtgttacactttatggagtgttac 38644165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 174
Target Start/End: Original strand, 10555077 - 10555174
Alignment:
Q  77 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10555077 gtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 10555174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307810
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||     
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 13307810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44869815 - 44869690
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||     
T  44869815 agtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgat 44869716  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44869715 agtcttaagtgttacactttgtgggg 44869690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 198
Target Start/End: Original strand, 31933760 - 31933880
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |     
T  31933760 taattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataa 31933859  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtg 198  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  31933860 ttttaagtgttacactttgtg 31933880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 466150 - 466059
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  466150 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 466059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 35459583 - 35459714
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |     
T  35459583 agtaattcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaat 35459682  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||| | | |||||| ||||||    
T  35459683 agtcttaagtgttataatctgtgggatgttac 35459714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 146
Target Start/End: Original strand, 24823266 - 24823336
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaaca 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  24823266 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35859250 - 35859160
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859250 taattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025889
Alignment:
Q  124 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttac 43025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 41910907 - 41910991
Alignment:
Q  122 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910907 tattttatcgttgca-tctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttac 41910991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12587900 - 12587812
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587900 agtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18259395 - 18259270
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||   | ||| ||||||  ||||||      
T  18259395 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtgac-- 18259298  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18259297 --ttaggtgttacactttgtgggatgttac 18259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 167
Target Start/End: Original strand, 34951929 - 34952020
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 167  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34951929 agtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34463789 - 34463704
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatga 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34463789 agtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7998550 - 7998478
Alignment:
Q  122 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7998550 tattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33198120 - 33198061
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttgg 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  33198120 agtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgg 33198061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12585353 - 12585303
Alignment:
Q  157 gttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  12585353 gttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttac 12585303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6864354 - 6864223
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6864354 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 6864255  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6864254 agtcttaagtattacactttgtggggtgttac 6864223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 35020927 - 35021058
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  35020927 agtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 35021026  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35021027 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 35021058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17173609 - 17173478
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17173609 agtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 17173510  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173509 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 17173478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 37663633 - 37663764
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  37663633 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgat 37663732  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663733 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 37663764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 55477783 - 55477914
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  55477783 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 55477882  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  55477883 agtcttcagtgttacacgttgtggggtgttac 55477914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3042936 - 3042807
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  3042936 taattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 3042837  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042836 tcttaagtgttacactttgtggggtgttac 3042807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17168032 - 17167901
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  17168032 agtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgat 17167933  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17167932 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 17167901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 28002878 - 28003009
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28002878 agtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat 28002977  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28002978 agttttaagtgttacactttctggggtgttac 28003009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1815619 - 1815489
Alignment:
Q  77 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgaca 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  1815619 gtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgata 1815520  T
Q  177 gtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815519 gtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 1815489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 19089345 - 19089476
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  19089345 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgat 19089444  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19089445 agtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 19089476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25184432 - 25184301
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  25184432 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgat 25184333  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25184332 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 25184301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 33816408 - 33816539
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33816408 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgat 33816507  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33816508 agtcttaagtgttacactttgtggggtattac 33816539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 205
Target Start/End: Original strand, 34947987 - 34948118
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  34947987 agtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgat 34948086  T
Q  176 agtgttaagt--gttacactttgtggggtgtt 205  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34948087 agtcttaagtacgttacactttgtggggtgtt 34948118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 19440540 - 19440671
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  19440540 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttat 19440639  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |   ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19440640 aaacttaagggttacacgttgtggggtgttac 19440671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 32912476 - 32912603
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  32912476 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 32912575  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32912576 ttaagtgttacactttgtagggtgttac 32912603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33341717 - 33341586
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  33341717 agtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgat 33341618  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33341617 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 33341586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 34361388 - 34361515
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||      
T  34361388 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagct 34361487  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34361488 ttaagtgttacactttgtagggtgttac 34361515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42200045 - 42199918
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacata-tattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||    
T  42200045 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagt 42199946  T
Q  179 gttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42199945 cttaagtgttacactttgtagggtgtta 42199918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47254059 - 47253928
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  47254059 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgat 47253960  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47253959 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 47253928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 879442 - 879571
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  879442 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 879541  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  879542 tcttaaatgttacactttgtgaggtgttac 879571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50697561 - 50697429
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaaca-tgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50697561 agtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtga 50697462  T
Q  175 cagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  50697461 tagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttac 50697429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Original strand, 36493581 - 36493704
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  36493581 agtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggt 36493680  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgg 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  36493681 agtcttaagtgttacactttgtgg 36493704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 55240997 - 55241128
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||     
T  55240997 agtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgat 55241096  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55241097 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttac 55241128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7703828 - 7703697
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  7703828 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgat 7703729  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7703728 agtcttaagtgtgacactttgtggagtgttac 7703697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50765039 - 50764908
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  50765039 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgat 50764940  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||    
T  50764939 aatattgagtgtttcactttgtggggtgttac 50764908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37288047 - 37287922
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||      
T  37288047 agtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgct 37287948  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||    
T  37287947 agtcttaagtgttacattttgtgggg 37287922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49376286 - 49376158
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  49376286 agtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgat 49376187  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgt 204  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||    
T  49376186 aatcttaagtgttacacattgtggggtgt 49376158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32579765 - 32579646
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  32579765 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagat 32579666  T
Q  176 agtgttaagtgttacacttt 195  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  32579665 agtcttaagagttacacttt 32579646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38012042
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttac 38012042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17272283 - 17272152
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| ||     
T  17272283 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgat 17272184  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  17272183 agtcttaagtgtgacacttcatggggtgttac 17272152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37775977 - 37775855
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||      
T  37775977 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg-- 37775880  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
           |||||||||||||||||||||||||    
T  37775879 -------agtgttacactttgtggggtgttac 37775855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 46888050 - 46888180
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||     
T  46888050 agtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgat 46888149  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  46888150 agt-ctaagtgttacgttttgtggggtgttac 46888180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 196
Target Start/End: Original strand, 5047860 - 5047978
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  5047860 taatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatag 5047959  T
Q  178 tgttaagtgttacactttg 196  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  5047960 tcttaagtgttacattttg 5047978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Original strand, 7152096 - 7152218
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  7152096 agtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgat 7152195  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtg 198  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  7152196 agtattaagtgttatactttgtg 7152218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 29584092 - 29584220
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||     
T  29584092 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgat 29584191  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgt 204  Q
    ||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  29584192 agtcttaagtgtgacacttcatggggtgt 29584220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4205303 - 4205216
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatg 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205303 agtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 30002533 - 30002655
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||      
T  30002533 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg-- 30002630  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
           |||||||||||||||||||||||||    
T  30002631 -------agtgttacactttgtggggtgttac 30002655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Original strand, 35025534 - 35025616
Alignment:
Q  122 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgt 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35025534 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgt 35025616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23761388 - 23761259
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| || ||    
T  23761388 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatag 23761289  T
Q  178 tgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | |||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  23761288 tcttaaatgtgacactttatgaggtgttac 23761259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Original strand, 25700948 - 25701073
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||  ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  25700948 agtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgat 25701047  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  25701048 aatcttaagtgttacactttgtgggg 25701073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Original strand, 46884006 - 46884123
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||     
T  46884006 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttacatac--tattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgat 46884101  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtg 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  46884102 agt-ttaagtgttacattttgtg 46884123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4598301 - 4598179
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||      
T  4598301 agtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtg-- 4598204  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
           |||||||||||||||||||||||||    
T  4598203 -------agtgttacactttgtggggtgttac 4598179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 4934140 - 4934223
Alignment:
Q  122 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgtt 205  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4934140 tattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgtt 4934223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9139548 - 9139465
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagtt 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9139548 agtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 9139465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27396935 - 27396804
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||     
T  27396935 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgat 27396836  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
     || |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  27396835 ggtcttaagtgtgacactttatgggatgttac 27396804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39400323 - 39400236
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400323 attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26896402 - 26896285
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatctt-ggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagt 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| || |||    
T  26896402 attcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagt 26896304  T
Q  179 gttaagtgttacactttgt 197  Q
     ||||||||||||||||||    
T  26896303 cttaagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Original strand, 35025458 - 35025515
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgtt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35025458 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32592403 - 32592319
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttg 160  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  32592403 agtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttg 32592319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  91 aatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaaca 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23431874 - 23431834
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23431874 agtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttaca 23431834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 54499177 - 54499260
Alignment:
Q  123 attttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||  | |||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  54499177 attttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttac 54499260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4167241 - 4167110
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4167241 agtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgat 4167142  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167141 agttttaagtgttacactttgtggggtgttac 4167110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 2325262 - 2325393
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  2325262 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgat 2325361  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325362 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 2325393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3177258 - 3177127
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3177258 agtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat 3177159  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177158 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 3177127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41961159 - 41961028
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||     
T  41961159 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgat 41961060  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961059 aatcttaagtgttacactttgtggggtgttac 41961028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 19289207 - 19289338
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  19289207 agtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgat 19289306  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19289307 agtcttaagtgttacactttgtgggatgttac 19289338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 11366269 - 11366395
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  11366269 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 11366368  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11366369 ttaagtgttacactttgtagggtgtta 11366395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35959211 - 35959084
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35959211 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac----atgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgat 35959116  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35959115 agtcttaactgttacactttgtggggtgttac 35959084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44913974 - 44913858
Alignment:
Q  85 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaag 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44913974 tctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 44913875  T
Q  185 tgttacactttgtgggg 201  Q
    |||||||||||||||||    
T  44913874 tgttacactttgtgggg 44913858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26357896 - 26357765
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||     
T  26357896 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgat 26357797  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26357796 agttttaagtgttacaatttgtgggatgttac 26357765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41465820 - 41465689
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  41465820 agtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgat 41465721  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  41465720 agtcttaagtgttacactttctgaggtgttac 41465689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37906029 - 37905904
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  37906029 agtaattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgat 37905930  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37905929 agttttaagtgttacactttgtgggg 37905904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4763950 - 4763823
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  4763950 agtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgat 4763851  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4763850 agtcttaagtgttacactttgtggggtg 4763823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 31570618 - 31570749
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31570618 agtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgac 31570717  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31570718 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttac 31570749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 33550875 - 33551001
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||     
T  33550875 attcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtc 33550973  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550974 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 33551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 43648129 - 43648260
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  43648129 agtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgat 43648228  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43648229 agtcttaagtgttatactttgtgtggtgttac 43648260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44286268 - 44286137
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||     
T  44286268 agtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgat 44286169  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44286168 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 44286137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 194
Target Start/End: Original strand, 7006825 - 7006940
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |    
T  7006825 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatatt 7006924  T
Q  179 gttaagtgttacactt 194  Q
     |||||||||||||||    
T  7006925 cttaagtgttacactt 7006940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 206
Target Start/End: Original strand, 4263965 - 4264091
Alignment:
Q  81 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg-tgacagtg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||     
T  4263965 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtc 4264064  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4264065 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 4264091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071752
Alignment:
Q  101 acatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggg 200  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  201 gtgttac 207  Q
    |||||||    
T  17071746 gtgttac 17071752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327908
Alignment:
Q  90 taatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgtta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  190 cactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||| || ||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttac 45327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4478681 - 4478562
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||     
T  4478681 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttggtgatatcatgtgataga 4478582  T
Q  179 gttaagtgttacactttgtg 198  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4478581 cttaagtgttacactttgtg 4478562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054111
Alignment:
Q  101 acatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggg 200  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  201 gtgttac 207  Q
    |||||||    
T  17054105 gtgttac 17054111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 18494168 - 18494287
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagt 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| |||    
T  18494168 aattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagt 18494267  T
Q  179 gttaagtgttacactttgtg 198  Q
     |||||||| || |||||||    
T  18494268 cttaagtgtgactctttgtg 18494287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31862171 - 31862040
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  31862171 agtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgat 31862072  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31862071 aattttaagtgttacactttgtggggtgttac 31862040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 33709116 - 33709247
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||     
T  33709116 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgat 33709215  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33709216 agtcttaagtgtgacactttgtagggtgttac 33709247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 200
Target Start/End: Original strand, 19500799 - 19500923
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||     
T  19500799 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgat 19500898  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggg 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||    
T  19500899 agtcttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 27349832 - 27349954
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||      
T  27349832 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtg-- 27349929  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
           |||||||||||||||||||||||||    
T  27349930 -------agtgttacactttgtggggtgttac 27349954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 39167253 - 39167378
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  39167253 agtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgat 39167352  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||      |||||||||||||||| ||||||    
T  39167353 agt------tgttacactttgtgggatgttac 39167378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Original strand, 33660261 - 33660358
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtg 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33660261 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg 33660358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642176
Alignment:
Q  90 taatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgtta 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  190 cactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||| |||||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttac 36642176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19314166 - 19314057
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta---catatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| || |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19314166 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgt 19314067  T
Q  173 gacagtgtta 182  Q
    || |||||||    
T  19314066 gatagtgtta 19314057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Original strand, 43770735 - 43770830
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  43770735 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 43770830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5881848 - 5881750
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  5881848 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga 5881750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 207
Target Start/End: Original strand, 29242048 - 29242153
Alignment:
Q  102 catcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29242048 catcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtgggg 29242147  T
Q  202 tgttac 207  Q
    ||||||    
T  29242148 tgttac 29242153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13711778 - 13711647
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |     
T  13711778 agtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcat 13711679  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  13711678 agtcttaactattatactttatggggtgttac 13711647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 18258217 - 18258302
Alignment:
Q  122 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18258217 tattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttac 18258302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 19424573 - 19424643
Alignment:
Q  137 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19424573 atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttac 19424643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 41463780 - 41463865
Alignment:
Q  122 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  41463780 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttac 41463865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902258
Alignment:
Q  142 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtg 203  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtg 33902258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 41051187 - 41051260
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaac 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  41051187 aattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttatccttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 113
Target Start/End: Original strand, 19424526 - 19424563
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19424526 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactt 19424563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 107
Target Start/End: Original strand, 18257424 - 18257453
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatctt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257424 taattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 408295 - 408426
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  408295 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgat 408394  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  408395 agtcttaagtgttccactttgtgaggtgttac 408426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 447 - 322
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  447 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgtac------tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 354  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  353 agtcttaagtgttacactttatggggtgttac 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 166
Target Start/End: Original strand, 93969 - 94056
Alignment:
Q  79 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgata 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  93969 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94380
Alignment:
Q  158 ttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 94380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 3879804 - 3879935
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3879804 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 3879903  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879904 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 3879935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1946149 - 1946022
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  1946149 attcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 1946050  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1946049 ttaagtgttacactttgtagggtgttac 1946022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 7234900 - 7235031
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7234900 agtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgat 7234999  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7235000 agtcttaagcgttacactttctggggtgttac 7235031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 6091047 - 6091179
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6091047 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 6091146  T
Q  176 agt-gttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6091147 agtctttaagtgttacactttgttgggtgttac 6091179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5627706 - 5627580
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  5627706 attcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 5627607  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5627606 ttaagtattacactttgtagggtgtta 5627580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20768401 - 20768270
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  20768401 agtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgat 20768302  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
      | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20768301 gatcttaagtgttacactttatgggatgttac 20768270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 21016983 - 21017108
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||      |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21016983 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacgtac------tattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 21017076  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017077 agtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 21017108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8513547 - 8513417
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  8513547 agtaattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgat 8513448  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8513447 agtcttaagtgttacactttgtagggtgtta 8513417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29182483 - 29182358
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||     
T  29182483 agtaattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgat 29182384  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtgggg 201  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||    
T  29182383 agtcttaagtgttacactttatgggg 29182358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 4318687 - 4318818
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  4318687 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgat 4318786  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  4318787 agtcttaagtgttacactttatagggtgttac 4318818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33619149 - 33619026
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattat 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33619149 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattat 33619050  T
Q  171 gtgacagtgttaagtgttacactt 194  Q
    | || | | |||||||| ||||||    
T  33619049 gcgatactcttaagtgtcacactt 33619026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6089222 - 6089092
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  6089222 agtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgat 6089123  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||| |||||||||| || |||| | ||||||    
T  6089122 agtcttaagtgttataccttgtagagtgtta 6089092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 33892877 - 33892975
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  33892877 agtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga 33892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353354
Alignment:
Q  109 gacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttac 30353354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Original strand, 7054642 - 7054704
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatcttt 142  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  7054642 attcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055211
Alignment:
Q  137 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttac 7055211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491803
Alignment:
Q  126 ttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttac 15491803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 145886 - 146012
Alignment:
Q  80 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacagtg 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  145886 attcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 145985  T
Q  180 ttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  145986 ttaagtgttacactttgtagggtgtta 146012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 267602 - 267472
Alignment:
Q  78 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgacag 177  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  267602 taattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 267503  T
Q  178 t-gttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  267502 tctttaagtgttacactttgtgggatgttac 267472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12228 - 12097
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||     
T  12228 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgat 12129  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgttac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12128 agtcttaagtgtgacactttgtggggtgttac 12097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44275 - 44146
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  44275 agtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 44176  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44175 ag-cttaagtgttacactttgtggggtgtta 44146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 154512 - 154641
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgac 175  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  154512 agtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 154611  T
Q  176 agtgttaagtgttacactttgtggggtgtta 206  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  154612 ag-cttaagtgttacactttgtggggtgtta 154641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 101034 - 100948
Alignment:
Q  76 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 174  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  101034 agtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacat------------cgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University