View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF14326_low_5 (Length: 265)
Name: NF14326_low_5
Description: NF14326
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14326_low_5 |
 | |
|
| [»] scaffold0427 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0330 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0011 (3 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0060 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0444 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0172 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0166 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1515 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0264 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0154 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0074 (3 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0459 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0366 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0262 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0239 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0789 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0130 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0983 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0734 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0380 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0308 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1335 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0768 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0140 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0654 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0533 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0236 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0027 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0007 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0015 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0005 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0475 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0268 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0187 (2 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 204)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 24589511 - 24589678
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24589511 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
24589610 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24589611 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
24589678 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 46160352 - 46160512
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46160352 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
46160451 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46160452 |
c--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
46160512 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8712146 - 8711979
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8712146 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcctta |
8712047 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8712046 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
8711979 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 3550001 - 3550168
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
3550001 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttccttttgtatcctta |
3550100 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3550101 |
ac--tatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
3550168 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 39282545 - 39282712
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39282545 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
39282644 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39282645 |
ac--tatttattactgtttcttttttcaaatctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
39282712 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44343912 - 44343745
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44343912 |
ccaaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
44343813 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44343812 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
44343745 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Original strand, 16705304 - 16705474
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16705304 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttactattatatcc |
16705403 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16705404 |
ttaa--atatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttttccatatcatttattaaggataat |
16705474 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3552828 - 3552661
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |
|
|
| T |
3552828 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttcttttttatcctta |
3552729 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3552728 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaaggataat |
3552661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47393648 - 47393490
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47393648 |
aaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaac |
47393549 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47393548 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaa |
47393490 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 25984388 - 25984555
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25984388 |
ccaaattgtttgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
25984487 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25984488 |
ac--tatttattactcattcttttttcaattctttcatttatctttctcatataatttattaaggataat |
25984555 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26333552 - 26333385
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26333552 |
ccaaattgtatgtcacttaaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
26333453 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26333452 |
ac--tatttattgctctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
26333385 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42334524 - 42334366
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42334524 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatattcgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaac |
42334425 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42334424 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaa |
42334366 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 4227759 - 4227926
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4227759 |
ccaatttgtatgtcacttttgaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcattttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
4227858 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4227859 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttaatttatcttttccatatcatttattaaggataat |
4227926 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 14202945 - 14203112
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14202945 |
ccaaattgcatgttactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
14203044 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14203045 |
ac--tatttattactctttctttttccaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
14203112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29361512 - 29361345
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29361512 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
29361413 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29361412 |
a--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
29361345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4750468 - 4750307
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4750468 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataacctta |
4750369 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4750368 |
ac--tatttattactctttcttctttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaag |
4750307 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22172697 - 22172532
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22172697 |
ccaaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttagaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
22172598 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22172597 |
ac--tatttatta--ctttcttttttcaattctttcatttttctttcacatatcatttattaaggataat |
22172532 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 32557942 - 32558077
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32557942 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattc |
32558039 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32558040 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
32558077 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49251833 - 49251672
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49251833 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaaatgtatctcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattgtatcctta |
49251734 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
49251733 |
ac--tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccatgtcatttattaag |
49251672 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 29672316 - 29672482
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29672316 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
29672415 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29672416 |
a--ttatttattact-gttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
29672482 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31925351 - 31925168
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31925351 |
taatactccctccgtttcaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttacttt |
31925252 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
31925251 |
tcctattatatccttaac--tatttattactctcccttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
31925168 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 16010929 - 16011087
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16010929 |
ccaaattgtatgtcactttagaacaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
16011028 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16011029 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
16011087 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 50942632 - 50942801
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaa--aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
50942632 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcct |
50942731 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
50942732 |
taac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttttctcattttatttattaaggataat |
50942801 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 26834841 - 26835008
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26834841 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
26834940 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
26834941 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
26835008 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26541290 - 26541132
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26541290 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
26541191 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
26541190 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
26541132 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32049597 - 32049435
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32049597 |
ccaaattgtatgtc----tagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatg-tatttttccttttatatcctta |
32049503 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32049502 |
ac--tattcattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
32049435 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 23624852 - 23625023
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat---ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23624852 |
ccaaattgtatgtcactttaaaaaaaaaaaaaattgttccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
23624951 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactc-tttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23624952 |
ttaac--tatttattactctttttttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
23625023 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Original strand, 42379204 - 42379361
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42379204 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattattgttacttttcctattatatcctta |
42379303 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42379304 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttat |
42379361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47038578 - 47038413
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
47038578 |
aaattatacgtcactttagaaaaaatatttatcctaaattgtatgtcattttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcgtaac |
47038479 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47038478 |
--tatttattactatttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
47038413 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49419629 - 49419472
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49419629 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
49419530 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
49419529 |
ac--tatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttat |
49419472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45467340 - 45467157
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
45467340 |
taatactccctctgtcccaaattatatgtcatttttaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgttactttacaatatcaatgaaacattaatgctatttt |
45467241 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45467240 |
tcctattatatccttaa--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcacatatcatttattaaggataat |
45467157 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 119 - 251
Target Start/End: Original strand, 35096662 - 35096792
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35096662 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattgtatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttca |
35096759 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35096760 |
tttatctttcccatataatttattaaggataat |
35096792 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 4226252 - 4226401
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4226252 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattataacctta |
4226351 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4226352 |
ac--tatttattactctctcttctttcaaatcttttatttatctttctcata |
4226401 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 38665070 - 38665235
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
38665070 |
aaattgtatgtcattttataaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcttattatatccttaac |
38665169 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38665170 |
--tatttattactctttcttctttcaattattttacttatttttcccatatcatttattaaggataat |
38665235 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Original strand, 38816862 - 38817019
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38816862 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcggtttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaa |
38816961 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
38816962 |
c--tatttattactctctcttctttcaatttctttatttatctttctcatatcatttatt |
38817019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 41529122 - 41529283
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41529122 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttcgaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatcctta |
41529221 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
41529222 |
ac--tatttattactttttcttttttcaattctttcatttatatttcctatatcattcattaag |
41529283 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49980533 - 49980377
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49980533 |
aaattgtatgtcactttagaaaatatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaa- |
49980435 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49980434 |
-ttatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
49980377 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 184
Target Start/End: Original strand, 24583842 - 24583944
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24583842 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
24583941 |
T |
|
| Q |
182 |
act |
184 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
24583942 |
act |
24583944 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 34347284 - 34347451
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34347284 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattatttttcctattatatcctta |
34347383 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
34347384 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcttatatcatttattgaggataat |
34347451 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 42643121 - 42643288
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42643121 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
42643220 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
42643221 |
ac--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcctatatcatttattgaggataat |
42643288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51984028 - 51983869
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51984028 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
51983929 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatt-tatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
51983928 |
ac--tatttattattctctcttctttcaattccttcattgtatctttctcatatcatttatt |
51983869 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16011630 - 16011472
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16011630 |
ccaaattgtacgtcactttggaaaaaatatttgtcccaaattgtacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
16011531 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
16011530 |
ac--tatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttccgatatcatttatt |
16011472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31045611 - 31045453
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31045611 |
ccaaattttatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
31045512 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
31045511 |
ac--tatttattactctcttttcttttaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
31045453 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34967599 - 34967441
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
34967599 |
ccaaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttctattatatcttta |
34967500 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
34967499 |
ac--tatttattactctctcttttttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttatt |
34967441 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13985538 - 13985376
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13985538 |
ccaaattgtacgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgttgatttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
13985439 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13985438 |
act-tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttattaag |
13985376 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 18127347 - 18127515
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18127347 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
18127446 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcattt-atctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18127447 |
ac--tatttattactctctcttcttttaattccttcatttaatctttctcatatcatttattaaggataat |
18127515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1037731 - 1037569
Alignment:
| Q |
80 |
ttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1037731 |
ttccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcct |
1037632 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttatta--ctctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1037631 |
taac--tatttattactctctctcttctttcaatttctttatttatctttcccatatcatttatt |
1037569 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1044637 - 1044475
Alignment:
| Q |
80 |
ttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1044637 |
ttccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcct |
1044538 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttatta--ctctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1044537 |
taac--tatttattactctctctcttctttcaatttctttatttatctttcccatatcatttatt |
1044475 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5653756 - 5653598
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
5653756 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcttta |
5653657 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
5653656 |
ac--tatttattactctcttttcttttaattttttcatttatctttctcatatcatttatt |
5653598 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 30679286 - 30679444
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30679286 |
ccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgttgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatcctta |
30679385 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30679386 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttatt |
30679444 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 32145366 - 32145524
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
32145366 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatattacttttcctattatatcctca |
32145465 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
32145466 |
ac--tatttattactttctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttatt |
32145524 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 50324840 - 50324998
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
50324840 |
ccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttagttttcatattatatcctta |
50324939 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
50324940 |
ac--tatttattactacctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
50324998 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8462565 - 8462388
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8462565 |
taatactccttccgttccaaattgtacgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttt |
8462466 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8462465 |
ttctattatatccttaac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttattattctcatatcatttattaag |
8462388 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 13352464 - 13352613
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13352464 |
ccaaattgtatgtccctttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcccattatatcctta |
13352563 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13352564 |
ac--tatttattactctatcttctttcaattctttaatttatctttctcata |
13352613 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 42709689 - 42709849
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
42709689 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaat-aaacattaatgttattttttcgattatatcctta |
42709787 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42709788 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttattaag |
42709849 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6920998 - 6920833
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6920998 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattatttttcctattatatcctta |
6920899 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
6920898 |
ac--tatttattactc--tctcctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
6920833 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 31787083 - 31787243
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31787083 |
caaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaa |
31787182 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31787183 |
--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
31787243 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 251
Target Start/End: Original strand, 31809470 - 31809650
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
|||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31809470 |
tactctctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatgtgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
31809569 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31809570 |
tattatatccttaa--gtattaattactccttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
31809650 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 38238879 - 38239044
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38238879 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattaattttcctattatatcctta |
38238978 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
38238979 |
ac--tatttattactc--tctcctttcaattccttcatttatctttcacatatcatttattgaggataat |
38239044 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 52833614 - 52833770
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52833614 |
aaattgtatgtcattttagaaaatatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
52833713 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
52833714 |
--tatttattgctccctcttctttcaattcattcatttatctttctcatatcatttatt |
52833770 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 13387538 - 13387697
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13387538 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
13387637 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13387638 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
13387697 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32162479 - 32162313
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32162479 |
ccaaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatatcgctttacaataccaatgaaaaattaat-ttacttttcctattatatcctta |
32162381 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
32162380 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
32162313 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43555096 - 43554929
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43555096 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttagagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccaattata |
43554997 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43554996 |
accttaac--tatttattattatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
43554929 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Original strand, 2458495 - 2458668
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2458495 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttgtaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattata |
2458594 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2458595 |
tccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
2458668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Original strand, 9066335 - 9066492
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9066335 |
caaattgtatgttgctttagaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttag |
9066434 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9066435 |
c--tatttattactctctcttatttcaattcctttatttatttttcccatatcatttatt |
9066492 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 11353572 - 11353734
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11353572 |
gttccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaattgtgtc--aaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatatca |
11353669 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11353670 |
ttaac--tatttattactttttcttctttcaattttttcatttatctttctcatatcatttattaag |
11353734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16630101 - 16629964
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16630101 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctctct |
16630004 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16630003 |
tctttcaatttcttcatttatctttcccatatcatttatt |
16629964 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Original strand, 39655351 - 39655529
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttaga--aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39655351 |
atactctctccgtcccaaattgtatgtcgctttagaggaaaaat-tttgtcccaaattatatgtcgttttacaatgtcaatgcaacattaatgttacttt |
39655449 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39655450 |
tcctattataaccttaactatatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
39655529 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 12966915 - 12967072
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12966915 |
aaattgtatgtggctttaggaaaaaaat--gtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaac |
12967012 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12967013 |
--tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
12967072 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 29095262 - 29095418
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29095262 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgttgctttacgataccaatgaaaaattaatgtttcttttcctattatatccttaa- |
29095360 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29095361 |
-ttatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatataatttatt |
29095418 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40403983 - 40403807
Alignment:
| Q |
64 |
agtaatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttact |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
40403983 |
agtaatactccttccgtcccaaaatatatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatt |
40403884 |
T |
|
| Q |
164 |
tttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40403883 |
tttcctattgtatctttaac--tatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatataatttatt |
40403807 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12959565 - 12959406
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12959565 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatacaacattaatgttacttttcctattataacctta |
12959466 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12959465 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttatta |
12959406 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 28011080 - 28011239
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28011080 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataacctta |
28011179 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28011180 |
ac--tacttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttatta |
28011239 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33488170 - 33488011
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33488170 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
33488071 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
33488070 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttatta |
33488011 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 2994148 - 2994306
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2994148 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatattattcttaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
2994247 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
2994248 |
ac--tatttattactcactcttctttcaatttattcatttatcttttccatatcatttatt |
2994306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 19010790 - 19010949
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19010790 |
ccaaattgtatatcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgatttacaatactaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
19010889 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19010890 |
ac--tatttattgctc--tcttctttcaattccttcatttatctttcacatatcatttattaag |
19010949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 51560759 - 51560917
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51560759 |
ccaaattgtatgctactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatattattttttctattatatcctta |
51560858 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
51560859 |
ac--tatttattgctctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttatt |
51560917 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15575131 - 15574971
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
15575131 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaaaatt-gtctcaaattgtatgccactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatcatatcttca |
15575033 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15575032 |
ac--tatttattactctttcttctttaaattatttcatttatcttttccatatcatttattaag |
15574971 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15824368 - 15824223
Alignment:
| Q |
98 |
tttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactc |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15824368 |
tttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactc |
15824271 |
T |
|
| Q |
198 |
tttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
15824270 |
tctcttctttcaagtcttttatttatctttctcatattatttattaag |
15824223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Original strand, 27952639 - 27952780
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
27952639 |
gaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaac--tatttattactctctc |
27952736 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27952737 |
ttctttcaattctttaatttatctttctcataccatttattaag |
27952780 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42219853 - 42219688
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42219853 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac |
42219754 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42219753 |
--tattaattactccctattctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattaaggataat |
42219688 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Original strand, 48355772 - 48355925
Alignment:
| Q |
90 |
tatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatt |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
48355772 |
tatgtcactttagaaaacatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccgatgaaacattaatgttacttttcatattataacattaac--tatt |
48355869 |
T |
|
| Q |
190 |
tattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48355870 |
tattcctctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaag |
48355925 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 242
Target Start/End: Original strand, 42728216 - 42728388
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42728216 |
atactccatccgtcccaaattgtatgttactttataaaaaatgtttgtctcaagttgtatgtagctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
42728315 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
42728316 |
ctattatatccttaac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatatcttccatatcatttatt |
42728388 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Original strand, 52666818 - 52666986
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52666818 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttagaggaaaatttttgtcccaaattatatgtcgttttacaatgccaatgcaacattaatgttacttttcctattat |
52666917 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52666918 |
aaccttaac--tatttattactctctcttctttcaattttttcatttatctttcccatattatttattaag |
52666986 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23825269 - 23825111
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23825269 |
ccaaattgtacgtcgctttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatcctta |
23825171 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23825170 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
23825111 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16051917 - 16051755
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
16051917 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaacgttacttttcctcttataacctt |
16051818 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16051817 |
aac--tatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
16051755 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 17180684 - 17180846
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17180684 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
17180783 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17180784 |
aac--tatttattactctctcttctttcaattctttcgtttatctttcccatattatttattaag |
17180846 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31583356 - 31583198
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31583356 |
caaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaa |
31583257 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31583256 |
c--tattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
31583198 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38680156 - 38679985
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga----aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38680156 |
ccaaattgtatgtcattttagagagaaaaaaaaattgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatt |
38680057 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||||| || ||||| |
|
|
| T |
38680056 |
cttaac--tatttattactctttcttttttcaattcctttatttatctttctcatatcgtttattgaggataat |
38679985 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 21362481 - 21362626
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |
|
|
| T |
21362481 |
aaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaac--tatttattactctatttt |
21362578 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21362579 |
ctttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaaggataat |
21362626 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Original strand, 23827375 - 23827492
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
23827375 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctctcttctttcaagtc |
23827472 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23827473 |
ttttatttatctttcccata |
23827492 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 39501692 - 39501857
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaa-aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
39501692 |
gttccaaattgtatgtcattttagaaaaaaatatttgtcttaaattgtatgttgttttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatc |
39501791 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39501792 |
attaac--tatttattactctcttttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattaag |
39501857 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26061930 - 26061770
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
26061930 |
ccaaattgtatgtcactttaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcatattataacctta |
26061831 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26061830 |
ac--tatttattactatatcttttttcaattctttcatttatattttccatattatttattaa |
26061770 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 40100498 - 40100663
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
40100498 |
ccaaattatatgtcactttaagaaaaaaaattatcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatcctta |
40100597 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40100598 |
a--gtatttattactc--tcttctttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
40100663 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 2733854 - 2734021
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2733854 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttatgataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcatta |
2733953 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2733954 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
2734021 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6540732 - 6540565
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6540732 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
6540633 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6540632 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattgtttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
6540565 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23549472 - 23549313
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23549472 |
ccaaattgtatgtcgctatggaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
23549373 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23549372 |
--tctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
23549313 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 30469529 - 30469693
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30469529 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgatacttttcctattataaccttaa |
30469628 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30469629 |
c--tatttattactc--tcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
30469693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31500794 - 31500636
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31500794 |
ccaaattatatgtcgttttagaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
31500696 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31500695 |
actg--ttaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
31500636 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46436554 - 46436383
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46436554 |
gttccaaattgtacgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcc |
46436455 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaatt-ctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
46436454 |
ttaac--tattgattactctctcttctttcaattattttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
46436383 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51417635 - 51417476
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51417635 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttatcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
51417536 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| | || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
51417535 |
ac--tattaattactctcttttctttcaattattttatttatcttttccataccatttatta |
51417476 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Original strand, 52703380 - 52703549
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52703380 |
gttccaaattgtatgtcacttt-gaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcc |
52703478 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctt-tcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| |||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52703479 |
ttcac--tatttatt-gtcttctctactctcaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
52703549 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7318844 - 7318678
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7318844 |
caaattgtatgtcgcttcggaaaaaaaatttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaa |
7318745 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| || | |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7318744 |
c--tactaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttattaaggataat |
7318678 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35369662 - 35369493
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35369662 |
ccaaatcgtatgtcgttttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
35369563 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc--tttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35369562 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttttccataccatttattaaggataat |
35369493 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35379783 - 35379623
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttt--agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35379783 |
ccaaattgtatgtcgctttgaagaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcct |
35379685 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35379684 |
taa--ttattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
35379623 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Original strand, 28121270 - 28121426
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28121270 |
aaattgtatgtcgttttggaaaaaa-atttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaac |
28121368 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28121369 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
28121426 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 1395692 - 1395859
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1395692 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgttttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
1395791 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1395792 |
ac--tattaattactacctcttctttcaattatttcatttatcttttccatactatttattaaggataat |
1395859 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 40132240 - 40132407
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40132240 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtcacaaattatttgtcgctttacgatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcttta |
40132339 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
40132340 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattttttaatttatctttctcataccatatattaaggataat |
40132407 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51905865 - 51905698
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
51905865 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcacaaatgataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcatta |
51905766 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51905765 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataat |
51905698 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8768724 - 8768558
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaata-tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
8768724 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattat |
8768625 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8768624 |
atcctta--tctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
8768558 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40052417 - 40052248
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||| | || || |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40052417 |
ccaaattgtatgttactttaggagaaaaaaaattatctcaaattatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattatatctt |
40052318 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40052317 |
taac--tatttattactcttttttctttcaattattttatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
40052248 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 8878775 - 8878936
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
8878775 |
ccaaattgtatgtcgttttaggaaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttactttttctattataacctta |
8878874 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8878875 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
8878936 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41621062 - 41620889
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||| | || | | |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41621062 |
aatactctttccgtcctaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattattctaaataatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttt |
41620963 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
41620962 |
cctattatatccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatt |
41620889 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48363637 - 48363472
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
48363637 |
aaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgttccaaattatatgccgctttacaatactaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccgtaac |
48363538 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48363537 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
48363472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 8330154 - 8330314
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8330154 |
caaattatatgtcgctttagggaaaaaaattgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaa |
8330253 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
8330254 |
--ttatttattactctctattctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
8330314 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15170334 - 15170190
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaata-tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15170334 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaatttgtcccaaattatatttcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatcctt |
15170235 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15170234 |
aac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttt |
15170190 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 16436068 - 16436236
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
16436068 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaaaaaaattgtcacaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatattacttttcttattatatcttt |
16436167 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16436168 |
aact--atttattactctctattctttcaattccttcatctatcttttccatatcatttattaaggataat |
16436236 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52001276 - 52001116
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
52001276 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaa |
52001177 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
52001176 |
c--tatttattactatctcttctttcaattatttcatttatctttcacatgttatttattaag |
52001116 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 52688148 - 52688318
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa---aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52688148 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcatattatatcc |
52688247 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52688248 |
ttaac--tattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
52688318 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5467161 - 5467014
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5467161 |
aaattgtatgtcgttttggaaaaaatatttgtcctaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcccattatatccttaac |
5467062 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
5467061 |
--tatttattactctctattctttcaattctttaatttatcattctcata |
5467014 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24322765 - 24322626
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | | |
|
|
| T |
24322765 |
aaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaaccttaatgttatttttcctattataaccttagc--tatttattactctcttta |
24322668 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24322667 |
ctttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaag |
24322626 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Original strand, 28646163 - 28646310
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
28646163 |
caaattgcatgtcgctttagaaaaaatatttgtcttaaattatatgttgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttag |
28646262 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28646263 |
c--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccat |
28646310 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45269242 - 45269074
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45269242 |
gttccaaactgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcttaaatt--atgtcgttttataatctcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcc |
45269145 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45269144 |
ttaact--attaattactctctcttatttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
45269074 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13896633 - 13896471
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13896633 |
ccaaattttatgtcgccttaggaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccattgcaacattaatgttatttttcctattataacctt |
13896534 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
13896533 |
aac--tagttattactctttcttctttcaattctttcatttatttttctcatattatttattaag |
13896471 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 42787868 - 42788030
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42787868 |
ccaaattgtatgtcgctttaggggaaaaaatttgtcataaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
42787967 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
42787968 |
agc--tatttattactctctcttcttttaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
42788030 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 48747246 - 48747408
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatattt-gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48747246 |
ccaaattgtatgtctctttagggaaatttttttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataacctt |
48747345 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48747346 |
agc--tattttttactctctcttctttcaattctttcgtttatctttcccatattatttattaag |
48747408 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 49872511 - 49872673
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| | | |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
49872511 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaatagtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatggtacttttcctattataacctt |
49872610 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
49872611 |
aa--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
49872673 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 290540 - 290391
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
290540 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgccgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
290441 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
290440 |
ac--tattaattactatctcttctttcaattattccatttatcttttccata |
290391 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36633312 - 36633176
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36633312 |
aaaaaatatttgtctcaaattatatgttgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcatattatatccttaacc--atttattactctctct |
36633216 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36633215 |
tctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
36633176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 39674030 - 39674191
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39674030 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcgcaaattatacgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
39674129 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39674130 |
a--ttatctattaccctctcttctttcaattctttaatttatctttcccatattatttattaag |
39674191 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10656838 - 10656681
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10656838 |
ccaaattgtttgtcgctttggaaaaaaa--tggtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
10656741 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10656740 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
10656681 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 244
Target Start/End: Original strand, 8307824 - 8307959
Alignment:
| Q |
107 |
aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
8307824 |
aatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatattatttttcttattataaccttaa--ttatttattactctctcttctt |
8307921 |
T |
|
| Q |
207 |
tcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
8307922 |
tcaattctttcatttatctttcccttattatttattaa |
8307959 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17179533 - 17179374
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17179533 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgttactttacaataccaatgaagaattaatgttatttttcctattatatccttaac |
17179434 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||| || || || |||||||||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
17179433 |
--tatttactactttctcttcttctaagtcattcatttatctttcatatatcatttactaag |
17179374 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26551744 - 26551579
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcacttt--agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26551744 |
gttccaaattgtatgtcactttgaagaaaaaaaatt-gtctcaaattgtatatcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatat |
26551646 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||| | | ||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26551645 |
ccttcac--tatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
26551579 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 44789281 - 44789448
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
44789281 |
ccaaattgtatgtcattttaaaaaaataaattgttccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctatcatatcatta |
44789380 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44789381 |
a--gtatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
44789448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41457939 - 41457805
Alignment:
| Q |
115 |
tcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattct |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
41457939 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaac--tattaattactccatcttctttcaattat |
41457842 |
T |
|
| Q |
215 |
ttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41457841 |
ttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
41457805 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32871479 - 32871374
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacat |
237 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
32871479 |
aataccaattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaact--atttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttcctgtatcat |
32871382 |
T |
|
| Q |
238 |
ttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
32871381 |
ttattaag |
32871374 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 3163188 - 3163347
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
3163188 |
ccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataacctt |
3163287 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3163288 |
aa--ttaattattactc---cctctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
3163347 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39673767 - 39673599
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39673767 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatcctt |
39673668 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39673667 |
aac--tattaattactccctcttcttttaattatttcatttattttttccataccatttattaaggataat |
39673599 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 3788060 - 3788227
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| ||||||| | || ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3788060 |
ccaaattgtatttcgctttggaaaaaaaaattatcccaaattatatgtcattttacaatacaaatgcaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
3788159 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| | || ||||||| | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3788160 |
ac--tcttaattactccctattctttcaattatttcatttttcttttccatatcatttattaaggataat |
3788227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7572574 - 7572412
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
7572574 |
ccaaattgtatgtcgctttagagaaaaaaatttgtcgcaaattatttgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcatattgtatcctt |
7572475 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
7572474 |
aac--tatttattactctcccttcttttaattttttcatttatctttcttatataatttattaag |
7572412 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 196
Target Start/End: Original strand, 10085727 - 10085836
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10085727 |
aaattgtacgtcactctggaaaaaa-atttgtcccaaattgtatgtcgctttacactaccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttaac |
10085825 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattact |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
10085826 |
--tatttattact |
10085836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46273013 - 46272855
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46273013 |
ccaaattttatgtcactttagaaaaaatatttgtcataaattatatatcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttttattatatcctta |
46272914 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
46272913 |
act--atttattgtcatctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcttttatt |
46272855 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16128811 - 16128651
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
16128811 |
ccaaattgtatgttgctttaggaaaaaaatt-gtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataacttta |
16128713 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
16128712 |
ac--tatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttctcatgttatttattaag |
16128651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46569187 - 46569045
Alignment:
| Q |
87 |
ttgtatgtcactttagaaa---aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46569187 |
ttgtatgtcactttagaaagaaaaaaaattgtaccaaattatatgtcgttttataatac-aattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaat |
46569089 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46569088 |
t--atttattactctttcttctttcaatactttcatttatctttcc |
46569045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Original strand, 45430041 - 45430179
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45430041 |
aaaaaaatttgtcc-aaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattgtatccttagtt--atttattactctctctt |
45430137 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
45430138 |
ctttcaattctttcatttatctttcctatattatttattaag |
45430179 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 49367523 - 49367409
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
49367523 |
taatactccctccgttctaaattgtatgtcactttgaaaaaaaaaattgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattcatgttacttt |
49367424 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
49367423 |
tcctattatatcctt |
49367409 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9265030 - 9264904
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttt |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
9265030 |
aaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttattttttcaattataaccttaac--tatttattattatctcttc |
9264933 |
T |
|
| Q |
205 |
tttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9264932 |
tttcaattctttcatttatctttctcata |
9264904 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 83172 - 83073
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
83172 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac |
83074 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5432400 - 5432332
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5432400 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaattaaacattaatgttacttttcctattatatctttaa |
5432332 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31023857 - 31023697
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
31023857 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacattttctattataccctta |
31023759 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31023758 |
ac--tatttattattctctcttctttcatttctttaatctatctttttcatatcatttattaag |
31023697 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31681781 - 31681658
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
31681781 |
aaaaaaaaattgttccaaattgtatgccgctttacaataccaaagaaacattaatgttatttttactattatatccttaac--tatttattactttctct |
31681684 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
31681683 |
tctttcaagtcattcatttatctttc |
31681658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 245
Target Start/End: Original strand, 39739449 - 39739548
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39739449 |
aatgaaatattaatgctactttttctattatatccttaatt--atttattactctctcttttttcaattctttaatttatcttttccataccatttatta |
39739546 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 50309971 - 50309807
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
50309971 |
ccaaattgtatgtcgcttt-gaaaaaaaatt-gtcctaaattatatgtcgttttatcataccaatgaaatattaatgttatttttc-tattatatcctta |
50309875 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
50309874 |
act--attaattactcctcattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
50309807 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 50776171 - 50776335
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatattt-gtcccaaattgtatgtcacttt-agaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| || | ||||| |||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50776171 |
gttctaaattgtatgtcgctttagaagaaaaattttgttctaaattatatgtcgcttttacaatacccatgcaacattaatgttacttttcctattataa |
50776270 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50776271 |
ccttaa--tcatttattactc--tattctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
50776335 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 27999634 - 27999783
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
27999634 |
ccaaattatatgtcgctttaaggaaaaaagttgtcttaaattatatgtcactttacaatactaatgtaacgttaatgttacttttcctattataacttta |
27999733 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27999734 |
a--ttatttattactccctcttctttcaattcttttatttatctttcccata |
27999783 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 52177796 - 52177957
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | |||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
52177796 |
ccaaattgtatgtcattttgaagaaaaaaattgtctcaaattgtatgtctctttacaataccaatgaatcattaatattacttttcctattatatcattc |
52177895 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | ||||| || ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
52177896 |
ac--tatttatttcattttctacttccaagtcatttatttatctttctcatatcatttattaag |
52177957 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28359861 - 28359754
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28359861 |
ctttacaataccaataaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaatc--atttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttccca |
28359765 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |
|
|
| T |
28359764 |
tatcatttatt |
28359754 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8012689 - 8012616
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaaca |
152 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8012689 |
tctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaa---tatgtcactttacaataccaatgaaaca |
8012616 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26448292 - 26448133
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc-ctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26448292 |
aattatatgtgattttggaaaatatatttgtcccaatttatatgtctttttaaaaaaccaatgaaaaattaatgttatttttttctattatatcattaac |
26448193 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26448192 |
t--atttattactccatcttctttcaattctttaatttatctttcacatttcatttattaag |
26448133 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2619591 - 2619453
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttt |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| |||||| || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2619591 |
aaaaaatttgtcttaaattatatgtcgattaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaact--atttattactccctcttc |
2619494 |
T |
|
| Q |
205 |
tttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
2619493 |
tttcaattctttaatttatctttctcatattatttattaag |
2619453 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 17772935 - 17773081
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||||| || |||| || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
17772935 |
aaaaaaaattagtcacaaattataagtcatttcacaatacaaataaaacattaatgttatttttcttattatacccttaact--atttattactctctca |
17773032 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17773033 |
tttttcaattttttaatttatctttttcaaatcatttattaagtataat |
17773081 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 46398611 - 46398773
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
46398611 |
ccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtctcaaattatatgttgctttacaatacccatgcaacattaatgttgctttttcaattataacctt |
46398710 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46398711 |
aa--ttaattattactccctcttcttttagttctttcatttatctttcccatattatttattaag |
46398773 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 244
Target Start/End: Original strand, 4953591 - 4953694
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacat |
237 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
4953591 |
aataccaatcaaacattaatgttgttttttctattatatccttaactat---tattactctttcttctttcaattatttcattcatctttctcatatcat |
4953687 |
T |
|
| Q |
238 |
ttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
4953688 |
ttattaa |
4953694 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 245
Target Start/End: Original strand, 10426569 - 10426686
Alignment:
| Q |
126 |
atgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
225 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
10426569 |
atgtcgctttacaatagcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaac--tatttattactccatcttctttcaattacttcatttatat |
10426666 |
T |
|
| Q |
226 |
ttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10426667 |
ttcccatattatttattaag |
10426686 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Original strand, 39640311 - 39640440
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
39640311 |
ttgtcctaaattatacgtcgcttaacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaa--ttattaattactatctcttctttcaat |
39640408 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39640409 |
tatttcatttatcttttccataccatttatta |
39640440 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 6596862 - 6597020
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||| | || | | ||||| | |||| ||||| |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6596862 |
aaattgtatgtcgcttcagaaaaaaaaattatactaaattatgtgtcgctttacgatactaaagaaacattaatgttaatttttctattatattcttaac |
6596961 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6596962 |
---atttattactatctcttctttcgcttctttaatttatctttcccataccatttattaag |
6597020 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10977893 - 10977785
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10977893 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatacccttaac--tatttattattctctcttctttcgattttttaatttatctttcacat |
10977796 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| | ||||||| |
|
|
| T |
10977795 |
agcgtttatta |
10977785 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19316624 - 19316500
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| |||| ||| | ||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19316624 |
aaattgtatgtcattttacaatatcaataaaataataaagttattttttctattatatccttcatt--atttattactctttcttctttcaattctttca |
19316527 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19316526 |
ttcatcttttccatattatttattaag |
19316500 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14795189 - 14795039
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| | |||| | || ||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
14795189 |
ccaaattgtatgtcattttaggagaaaaaaaattatcctaaattatatgtcgctttacgataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtcat |
14795090 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | || ||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14795089 |
taac--tatttattactctcttttcttttaattccttcgtttatctttcccat |
14795039 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28979803 - 28979692
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacat |
237 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
28979803 |
aatatcaataaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactg--tttattgctctctcttctttcaattctattatttatctttctcatactat |
28979706 |
T |
|
| Q |
238 |
ttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |
|
|
| T |
28979705 |
ttatcaaggataat |
28979692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 20793371 - 20793517
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
20793371 |
aaaaaaaaattgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttattttttttattatatccttaa--ttattaattactctatct |
20793468 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20793469 |
tctttcaattatttcatttatttttttcataccatttattaaggataat |
20793517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Original strand, 39782464 - 39782587
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
39782464 |
aaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattgacgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactctctcttacttcaattctttta |
39782561 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
39782562 |
tttatatttctcatattatttattaa |
39782587 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5432301 - 5432237
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5432301 |
tatttattactcttt-tcttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaagtataat |
5432237 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 11030084 - 11030210
Alignment:
| Q |
115 |
tcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattct |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
11030084 |
tcccaaattataagtcgttttacaatacgtatgaaaaattaatgttacttttcttattatacccttgact--atttattattctctcttctttcaatttt |
11030181 |
T |
|
| Q |
215 |
ttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
11030182 |
ttaatttatctttcacataccatttatta |
11030210 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38606225 - 38606152
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38606225 |
aaaaaaaaattgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
38606152 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Original strand, 46762159 - 46762241
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattact |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46762159 |
ttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcttattataaccttaac--tatttattact |
46762241 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41617637 - 41617544
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41617637 |
tttacaataccagtgaaacattaatgttactttttctattatacttttaac--tatttattactattttttctttcaattctttaatttatctttc |
41617544 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9411047 - 9410988
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9411047 |
tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaag |
9410988 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 181
Target Start/End: Original strand, 25792206 - 25792268
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25792206 |
aaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
25792268 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20711103 - 20710991
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact-gtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||| ||| ||| |
|
|
| T |
20711103 |
tttacaataccaatgaaacattaatattactttt-ctattatactctcaactagtatttattattctctcgtctttcaattatttaatttattttttcca |
20711005 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |
|
|
| T |
20711004 |
taccatttattaag |
20710991 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34186478 - 34186368
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
34186478 |
ctttacaatatcaatgaaacattaatattactttttctattataaccttaa--ttatgtattactctatctttttttaattttttaatttatatttctca |
34186381 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |
|
|
| T |
34186380 |
tactatttattaa |
34186368 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52551816 - 52551710
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
52551816 |
tttacaatatcaatgattcattaatattatttttcttattacatccttaact--atttaatactctctcttctttcaattctttcatttatctttttcat |
52551719 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttat |
241 |
Q |
| |
|
| ||||||| |
|
|
| T |
52551718 |
atcatttat |
52551710 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26060717 - 26060618
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | | |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
26060717 |
tttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattacacctttaact--atttattactatctcttctttcaattctttaatttatatttcccat |
26060620 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6519761 - 6519683
Alignment:
| Q |
164 |
tttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6519761 |
tttcctattatatcatgaact--atttattactcttccttctttcaattctttaatttatttttctcatatcatttattaa |
6519683 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Original strand, 6049742 - 6049870
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
6049742 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaagaattaatattatttttc-tattattttcttaact--atttattactctctcttcttttaatta |
6049838 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
6049839 |
tttaatttatctttcatatatcatctattaag |
6049870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35691754 - 35691675
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
35691754 |
aaaaaatatttatcctaaattataagtcattttacaataccaataaaacattaattttactttttatattatacccttaa |
35691675 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14795248 - 14795207
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14795248 |
tatttattactctatcttttttcaattctttaatttatcttt |
14795207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35150222 - 35150116
Alignment:
| Q |
143 |
caatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| || |||||||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
35150222 |
caatgaaactttaatgttattttttctattatacctttaattgc--ttattactttctcttctttcaattatttaatttatctttctcatataatttatt |
35150125 |
T |
|
| Q |
243 |
aagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
35150124 |
aaggataat |
35150116 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 182
Target Start/End: Original strand, 39387502 - 39387579
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || |||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39387502 |
aaaaaatttgtcccaatttatatgacgctttgcaataccaataaaatattaatgttactttttctattatattcttaa |
39387579 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 3875720 - 3875817
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
3875720 |
attaatattacttttccaattatactattaact--atttattactttatcttctttcaattcttttatttatctttctcatatcattaatgaaggataat |
3875817 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25163224 - 25163146
Alignment:
| Q |
145 |
atgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25163224 |
atgaaacattaatgttacatttcctattatactcttgac--tatttatta--ctttcttctttcaattctttagtttatcttt |
25163146 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 221
Target Start/End: Original strand, 1938664 - 1938728
Alignment:
| Q |
155 |
aatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcattt |
221 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
1938664 |
aatgttacttttcctattatacccttaactg--tttattattctttcttctctcaattttttaattt |
1938728 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 40332544 - 40332603
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
40332544 |
tatttattactctatcttttttcaattcttttatttatttttttcataccatttaataag |
40332603 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 184
Target Start/End: Original strand, 46529980 - 46530031
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46529980 |
tttataataccaataaaacattaacgttatttttcctattatatcattaact |
46530031 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 47562556 - 47562615
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47562556 |
tatttactactattacttctttcaattctttaatttatctttctcatatcatttattaag |
47562615 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14149400 - 14149305
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtata |
249 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| |||||| || |||||| |||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
14149400 |
attaatgtcactattcttattatctctttaact--atttattaatatctcttctttcaattctttaatttatctttcacatataatttattaattata |
14149305 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19958387 - 19958349
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19958387 |
aatgaaacattaatattactttttctattatatccttaa |
19958349 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27288918 - 27288836
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatga-aacattaatgttac |
162 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
27288918 |
ccaaattatatgtcgctttagagaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaattataacattaattttac |
27288836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30455424 - 30455337
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
30455424 |
aataccaatgaaatattaatgataattttcttattatatcattaac--tatatattactttctcttcattcaattatttaatttatcttt |
30455337 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4321139 - 4321081
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactct |
198 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4321139 |
aatatcaataaaacattaatgttatttttcttattatatcattaac--tatttattactct |
4321081 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8012613 - 8012556
Alignment:
| Q |
188 |
tttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8012613 |
tttattactctctcttctttcaagtcttttatttatttttcccatattatttattaag |
8012556 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Original strand, 16966706 - 16966758
Alignment:
| Q |
125 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16966706 |
tatgtcgctttacaataacaatgaaacattaatattatttttcatattatatc |
16966758 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 244
Target Start/End: Original strand, 17633660 - 17633760
Alignment:
| Q |
139 |
ataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatt |
238 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
17633660 |
atacgaatgaaacattaatgttatattt---attatacccttaact--atttatttctgtcttttttttcaattctttaatttatctttttcatactatt |
17633754 |
T |
|
| Q |
239 |
tattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
17633755 |
tattaa |
17633760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 157)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 29816217 - 29816384
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29816217 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
29816316 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29816317 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
29816384 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 34163135 - 34163296
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34163135 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
34163234 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34163235 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattttttcatttatctttcctatatcatttattaag |
34163296 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 7414628 - 7414795
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7414628 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaattatacttttcctattatattctta |
7414727 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7414728 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
7414795 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34607064 - 34606897
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34607064 |
ccaaattgtatgccactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
34606965 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34606964 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcttttattaaggataat |
34606897 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14153764 - 14153598
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14153764 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatattcttaa |
14153665 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14153664 |
c--tatttattactctttattttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
14153598 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 4456406 - 4456573
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4456406 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
4456505 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4456506 |
a--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
4456573 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34382090 - 34381923
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34382090 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatcctta |
34381991 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34381990 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatgtttctcatatcatttattaaggataat |
34381923 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39410684 - 39410519
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39410684 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatctgttccaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaac |
39410585 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39410584 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccgtatcatttattaaggataat |
39410519 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Original strand, 20495434 - 20495617
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20495434 |
taatactccctccgttccaaattatatgttattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttt |
20495533 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20495534 |
tcctattatatccttaac--tatttattactttttcttttttcaattctttcatttatcttttccatatcatttattaaggataat |
20495617 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25784787 - 25784632
Alignment:
| Q |
94 |
tcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttatt |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25784787 |
tcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac--tatttatt |
25784690 |
T |
|
| Q |
194 |
actctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
25784689 |
actctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttatgaaggataat |
25784632 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 12503860 - 12504018
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12503860 |
ccaaattgtatgtca-tttagaaaaaatatttgtcccaa-ttgtatgtcacttttgaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
12503957 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12503958 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaa |
12504018 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36347475 - 36347317
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36347475 |
ccaaattgtatgccactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtacgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
36347376 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
36347375 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
36347317 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 35080282 - 35080446
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35080282 |
aaattgtatgtcacttta-aaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcattttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaac |
35080380 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35080381 |
--tatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
35080446 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40915681 - 40915515
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
40915681 |
ccaaattgtatgtca-tttggaaaaaatatttgtcttaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttactttttctattatatcctta |
40915583 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40915582 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
40915515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39896054 - 39895901
Alignment:
| Q |
96 |
actttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattac |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39896054 |
actttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattactgttattttttctattatatccttaac--tatttattac |
39895957 |
T |
|
| Q |
196 |
tctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39895956 |
tctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
39895901 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 12360800 - 12360958
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12360800 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatcctta |
12360899 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12360900 |
ac--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatatcatttatt |
12360958 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18473259 - 18473088
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18473259 |
tctgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatttcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctactata |
18473160 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18473159 |
tccttaac--tatt--ttactttttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
18473088 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27293583 - 27293409
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27293583 |
taatactccctctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttt |
27293484 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
27293483 |
tcctattatatccttaac--aatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
27293409 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5378234 - 5378076
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5378234 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
5378135 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
5378134 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatattatttatt |
5378076 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4047870 - 4047713
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4047870 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaactaatgttacttttcctattatatccttaa |
4047771 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
4047770 |
c--tatttattactctatcttctttcaatttcttcatttatctttccaatatcatttatt |
4047713 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 227
Target Start/End: Original strand, 37337032 - 37337181
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37337032 |
tctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
37337131 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37337132 |
accttaac--tatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatcttt |
37337181 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 9201144 - 9201300
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9201144 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
9201243 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9201244 |
--tatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
9201300 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 35869942 - 35870101
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatacc-aatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35869942 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatgctt |
35870041 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
35870042 |
aac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
35870101 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27808023 - 27807844
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27808023 |
atactctctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttc |
27807924 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
27807923 |
ctattatatccttaac--tatttattactc--tcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
27807844 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29619486 - 29619328
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29619486 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatcctta |
29619387 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
29619386 |
ac--tatttattactttctcttttttcaattccttcatttatctttcccttatcatttatt |
29619328 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8042625 - 8042465
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8042625 |
gttccaaattgtatgtcacttttgaaaaaatatttgtcc-aaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcc |
8042527 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
8042526 |
ttaac--tatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
8042465 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13978509 - 13978344
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13978509 |
taatactccatccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttt |
13978410 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13978409 |
tcctattataactttaac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttctcata |
13978344 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18094749 - 18094588
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18094749 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttatcccaaattgtacgacactttacaatatcaataaaacattaatgttatttttcctattatatcttta |
18094650 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18094649 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
18094588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36302533 - 36302369
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36302533 |
tctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattata |
36302434 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36302433 |
tccttaac--tatttattactctcttttctttcaattccttcatttatttttcccatataatttatt |
36302369 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7363366 - 7363199
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7363366 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctatacaataccaatgaaaatttaatgttatttttcctattatatcttta |
7363267 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
7363266 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
7363199 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 35189190 - 35189346
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35189190 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
35189289 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
35189290 |
ac--tatttattactc--tcttctttcaattcattcatttatcttttccatatcatttatt |
35189346 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 8542773 - 8542931
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8542773 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
8542872 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8542873 |
ac--tatttattggtctctcttcttttaattccttcatttatatttcccatatcatttatt |
8542931 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 11130164 - 11130322
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11130164 |
ccaaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
11130263 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
11130264 |
ac--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttatt |
11130322 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20656530 - 20656369
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20656530 |
gttccaaattgtacgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcc |
20656431 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
20656430 |
ttaac--tatttattacactctcttctttcaattcctttatttatctttccaatatcatttatt |
20656369 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 42940777 - 42940937
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaa--aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42940777 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcct |
42940876 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
42940877 |
taa--taatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
42940937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 242
Target Start/End: Original strand, 9461365 - 9461529
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9461365 |
tctgtcccaaattgtatttcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattata |
9461464 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
9461465 |
tccttaac--tatttattgctctctcttttttcaattccttcatttatctttctcatattatttatt |
9461529 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27366505 - 27366341
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27366505 |
gttccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatatcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacc |
27366406 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27366405 |
ttaa--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
27366341 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21772918 - 21772749
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaa--tatttgtcccaaattgtat--gtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21772918 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaaaatatttgtcttaaattgtatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctt |
21772819 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21772818 |
taac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcttatatcatttattaaggataat |
21772749 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39990468 - 39990310
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39990468 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaa |
39990369 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39990368 |
ct---attattattcttttttctttcaattctttcatttatcttt-tcatatcatttattaag |
39990310 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 10370560 - 10370728
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10370560 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatattaataaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
10370659 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt-cccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
10370660 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttccccatatcatttattgaggataat |
10370728 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10602107 - 10601937
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10602107 |
tctgtcccaaattgtatgttattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
10602008 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactc---tttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10602007 |
tccttaac--tatttattactctttttttttttttcaattcctttatttatcttttccatatcatttattaag |
10601937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39729830 - 39729662
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaa-aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39729830 |
ccaaattgtatgtcgctttagagagaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
39729731 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39729730 |
aac--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
39729662 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 2914436 - 2914603
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2914436 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
2914535 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2914536 |
ac--tattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
2914603 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 11247932 - 11248091
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11247932 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
11248031 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11248032 |
ac--tattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
11248091 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24781233 - 24781074
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24781233 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
24781134 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24781133 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
24781074 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Original strand, 28377648 - 28377815
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |
|
|
| T |
28377648 |
gttccaaattatatgttactttagaaaa-atatttgtcccaaattgtatgtcactttacgataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatattc |
28377746 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28377747 |
ttaa--ttatttatta--cttttttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
28377815 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 32706744 - 32706911
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32706744 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttagaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
32706843 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32706844 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatgccatttattaaggataat |
32706911 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34381608 - 34381478
Alignment:
| Q |
113 |
tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaatt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34381608 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctctaac--tatttattactctttctcatttcaatt |
34381511 |
T |
|
| Q |
213 |
ctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34381510 |
ttttcatttatcttttccataacatttattaag |
34381478 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43403501 - 43403346
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43403501 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgcattacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaa |
43403402 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
43403401 |
c--tatttattactc--tcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
43403346 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Original strand, 9641026 - 9641199
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9641026 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
9641125 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9641126 |
tctttaac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
9641199 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 10164689 - 10164850
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10164689 |
ccaaattgtatgtcactttagaaagaaaaattgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcccta |
10164788 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
10164789 |
ac--tatttattactctttctcctttcaattttttcatttatcttttctatgacatttattaag |
10164850 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 13987559 - 13987720
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13987559 |
ccaaattgtatgccgctttaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
13987658 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13987659 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
13987720 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 29665329 - 29665494
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29665329 |
aaattgtatgtcgttttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac |
29665428 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29665429 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
29665494 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 43359667 - 43359832
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43359667 |
aaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgttccaacttatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
43359766 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| |
|
|
| T |
43359767 |
--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatattatttattgaggataat |
43359832 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 251
Target Start/End: Original strand, 4744705 - 4744884
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
|||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4744705 |
tactctctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgatacttttcc |
4744803 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4744804 |
tattatatctttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcctataccatttattaaggataat |
4744884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27187479 - 27187323
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27187479 |
aaattgtatgtcactttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaac |
27187380 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
27187379 |
--tatttattgatctctcttctttcaaatccttcatttatctttctcatatcatttatt |
27187323 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 440113 - 439954
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
440113 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcttta |
440014 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
440013 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatatcatttatta |
439954 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3099308 - 3099149
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3099308 |
gttccaaattatatgtcattttaaaaaaaatatttagcctaaattgtatgtcactttacgataccaattaaacattaatgttactttttctattatatcc |
3099209 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
3099208 |
ttaac--tatttattactcattcttctttcaattctttcatttatttttctcatatcattta |
3099149 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6517646 - 6517511
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6517646 |
gtcccaaattgtatgtcatttgacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctttcttctttcaattc |
6517549 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6517548 |
ttttatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
6517511 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 7458589 - 7458756
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7458589 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcttta |
7458688 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| || | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7458689 |
ac--tattaattaccctattttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataat |
7458756 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 9248941 - 9249100
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9248941 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcttaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
9249040 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9249041 |
ac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
9249100 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 19712495 - 19712662
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19712495 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
19712594 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19712595 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
19712662 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21195304 - 21195138
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21195304 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaat-tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttc |
21195206 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21195205 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataat |
21195138 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29000943 - 29000824
Alignment:
| Q |
123 |
tgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcattta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29000943 |
tgtatgtcactttagaataccaatggaacattaatgttactttttctattatatctttaact--atttattactctttcttttttcaattctttcattta |
29000846 |
T |
|
| Q |
223 |
tctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
29000845 |
tctttctcatatcatttattaa |
29000824 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 40555082 - 40555249
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
40555082 |
ccaaattgtatgtcgtttttggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcctta |
40555181 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40555182 |
ac--tattaattactctctcttttttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
40555249 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 25538052 - 25538214
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25538052 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgttctaaattatatgtcgttttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataacctt |
25538151 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25538152 |
aact--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
25538214 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 35288127 - 35288289
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttta-gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35288127 |
ccaaattgtatgtcgttttaagagaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
35288226 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35288227 |
aac--tatttattactctatcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaag |
35288289 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 39527446 - 39527611
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39527446 |
aaattatatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac |
39527545 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39527546 |
--tattaattactctcccttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
39527611 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Original strand, 8225621 - 8225748
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8225621 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaataattaatgttacttttcctattatatcctta |
8225720 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
8225721 |
ac--aatttattactctctcttctttcaat |
8225748 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18026168 - 18026009
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18026168 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatatttatgttacttttcctattctatcctta |
18026069 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
18026068 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttacataccatttatta |
18026009 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 22510413 - 22510580
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22510413 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcatattatatcctta |
22510512 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22510513 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
22510580 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 32292466 - 32292625
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
32292466 |
ccaaattgtatatcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatattctta |
32292565 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32292566 |
ac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
32292625 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38394395 - 38394228
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38394395 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
38394296 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38394295 |
ac--tattaattactctcccttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
38394228 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 39932824 - 39932990
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39932824 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttg |
39932922 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39932923 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttctcataccatttattaaggataat |
39932990 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 243
Target Start/End: Original strand, 8035749 - 8035915
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaata-tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8035749 |
tctgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattat |
8035848 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8035849 |
atccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
8035915 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22801922 - 22801788
Alignment:
| Q |
115 |
tcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattct |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22801922 |
tcccaaattatatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatctttaac--tatttattactttttcttctttcaattct |
22801825 |
T |
|
| Q |
215 |
ttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22801824 |
ttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
22801788 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 9246038 - 9246199
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
9246038 |
ccaaattgtatgtcgctttggagaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcttattatatcatta |
9246137 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9246138 |
ac--tatttattactatctcttcttttaattttttcatttatctttctcatatcatttattaag |
9246199 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36302940 - 36302796
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttt |
204 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
36302940 |
aaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactctatcttc |
36302843 |
T |
|
| Q |
205 |
tttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36302842 |
tttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
36302796 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 3633934 - 3634096
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgt--cccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |
|
|
| T |
3633934 |
ccaaattgtatgtcactttagagaaaatttttttatcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaacattaacgttatttttccaattatatctt |
3634033 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3634034 |
taac--tatttattactattttttctttcaactctttcatttatcttttccatatcatttattaa |
3634096 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 9591369 - 9591528
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9591369 |
aaattctatgtcgctttaggaaaaaaatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaac |
9591468 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9591469 |
--tatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
9591528 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 5070792 - 5070950
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5070792 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
5070891 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
5070892 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttatt |
5070950 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 18048608 - 18048754
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
18048608 |
aaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac--tattaattactctctct |
18048705 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
18048706 |
tctttcaattatttcatttatcttttccataccatttcttaaggataat |
18048754 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34900248 - 34900102
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
34900248 |
aaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac--tattaattactctctct |
34900151 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34900150 |
tctttcaattatttcatttatcttttccataccttttattaaggataat |
34900102 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19282710 - 19282545
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19282710 |
ccaaattgtatgtcgctttagcaaaaaaatttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgcaatattaatgttatttttcctattataacctta |
19282611 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19282610 |
ac--tatttattactc--tcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
19282545 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 4431525 - 4431692
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4431525 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaattttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcttattatatcctta |
4431624 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4431625 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
4431692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15268541 - 15268375
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15268541 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaa-atttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttgttttttctattatatcctta |
15268443 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15268442 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttaatttattttttccataccatttattaaggataat |
15268375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5847071 - 5846908
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5847071 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgttttataatactaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac |
5846972 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5846971 |
--tattaattactc--tcttctttcaattattttatttatcttttccataccatttattaaggataat |
5846908 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 8050402 - 8050568
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
8050402 |
aaattgtatgtcgctttaggggaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttga |
8050501 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8050502 |
ct--atttattactctatcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
8050568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40365563 - 40365401
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40365563 |
gttccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcatattatatcc |
40365464 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40365463 |
ttaa--ttattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
40365401 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33923 - 33762
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
33923 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaactttgtcccaaattatatgtcgctttgcaataccaatgaaacaataatgttttttttcctactatatcatta |
33824 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33823 |
a--atattcattactctatcttcttttaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
33762 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 182
Target Start/End: Original strand, 6334948 - 6335064
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6334948 |
taatactccctctgttccaaattgtatgccactttacaaaaaaaaattgtcccaaattatatgttactttacaataccaatgaaacattaatattacttt |
6335047 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6335048 |
tcctattatatccttaa |
6335064 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 21486643 - 21486804
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||| | |||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
21486643 |
ccaaattgtatctcgttttggaaaaaaaaattgtttcaagttatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttactttttctgttatatcctta |
21486742 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21486743 |
act--atttattactctctcttctttcaattctttaatttatcttttccataacatttattaag |
21486804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27535088 - 27534923
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27535088 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcttaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcctattata |
27534989 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27534988 |
tcattaac--tattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
27534923 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33629998 - 33629828
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaata---ccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33629998 |
ccaaattgtatgtcgttctggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataataccaataaaatattaatgttacttttcctattatatcc |
33629899 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33629898 |
ttaac--tattaattactctctattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
33629828 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40275452 - 40275288
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40275452 |
gttccaaattgtatgtcactttgaaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatcc |
40275353 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| | | ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40275352 |
ttcac--tatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
40275288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 32833577 - 32833736
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||| | || ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32833577 |
ccaaattgtatgtcgttttggagaaaaaaattatcctaaattatatgtcgctttacaatcccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
32833676 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32833677 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
32833736 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23320519 - 23320401
Alignment:
| Q |
125 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23320519 |
tatgtcactttaaaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaatt--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatc |
23320422 |
T |
|
| Q |
225 |
tttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23320421 |
tttcccatattatttattaag |
23320401 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Original strand, 6923021 - 6923166
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaatt---gtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6923021 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaaaaaaaattgtcttatattatagtatgtcactttacaatactaatgaaacattaatgttatttttcctattatat |
6923120 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc |
224 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6923121 |
ccttaac--tatttattactcttttttctttcaattctttcatttatc |
6923166 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Original strand, 11312959 - 11313114
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11312959 |
ccaaattgtatgacactttagaaaaaa-atttatcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaagattaatgtttcttttcctattatatcctta |
11313057 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
11313058 |
ac--tatttattacactctcttctttcagtttcttcatttatctttctcatatcattta |
11313114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35584982 - 35584818
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaaca-----ttaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35584982 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaataaaatatttatgttacttttcctattatat |
35584883 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
35584882 |
ctttaact--attaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
35584818 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4890223 - 4890113
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaata-tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4890223 |
taatactccatccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaaaaatttgttctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactt |
4890124 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
4890123 |
ttcctattata |
4890113 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 8883211 - 8883367
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8883211 |
ccaaattgtatctcactttagaaaaaatattcatcccaaattatatgtcgctttacaataccgatgaaaaattaatattatttttcctattatattatta |
8883310 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
8883311 |
ac--tatttattgctc--tcttctttcaattccttcatttatctttccaatatcatttatt |
8883367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9577709 - 9577575
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
9577709 |
gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac--tattaattactccctattctttcaatta |
9577612 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9577611 |
tttcatttatcttttccat-acatttattaaggataat |
9577575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 15856314 - 15856472
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaa--aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15856314 |
aaattgtacgttactttagaaaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgttttacaatatcaataaaaaattaatgttacttttcctattatatcttta |
15856413 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
15856414 |
ac--tatttattactctctattctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
15856472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 245
Target Start/End: Original strand, 36487299 - 36487457
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36487299 |
aattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaagcattaatgttattttttctattatatccttaa-- |
36487396 |
T |
|
| Q |
185 |
gtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||| || ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
36487397 |
ttatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttactaag |
36487457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37881670 - 37881540
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
37881670 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta--gttatttattattc--tcttctttcaa |
37881575 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37881574 |
ttctttcatttatctttcccatattatttattaag |
37881540 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Original strand, 40040939 - 40041072
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
40040939 |
atttgttctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaact--atttattactctctcttatttca |
40041036 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40041037 |
attctttcatttatttttcccatattatttattaag |
40041072 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13662458 - 13662321
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13662458 |
aaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttattttttctattataactttaac--tatttattactc--tctt |
13662363 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13662362 |
atttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
13662321 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 26256313 - 26256473
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatt-tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| | | || |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26256313 |
aaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaaaatctctcaaattatatgtcgctttacaatattaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaa |
26256412 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26256413 |
ct--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaag |
26256473 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41349000 - 41348850
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41349000 |
aaattgtatgtcgctttggagaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaagattaatgttatttttcctattatatccttaac |
41348901 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41348900 |
--tatttattac---------tttctcttctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
41348850 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2606653 - 2606531
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2606653 |
caaattatatctcgctttacaatacaaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaac--tatttattactctctcttctttcaattctttc |
2606556 |
T |
|
| Q |
218 |
atttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
2606555 |
gtttatctttcccgtatcatttatt |
2606531 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2620307 - 2620150
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2620307 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcacaaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaacgttacttttcctattatatgcttaac |
2620209 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2620208 |
--tattaattacttcctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaa |
2620150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31196322 - 31196161
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31196322 |
ccaaattgtatgtcactttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaatcattaatgttacttttcctattatatccttc |
31196223 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctt-tcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| ||| || ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31196222 |
ac--tatttatt-gtcttctctacttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaag |
31196161 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35809496 - 35809334
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
35809496 |
ccaaattgtatgttgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacctatgcaatattaatgttatttttccaattataacctt |
35809397 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
35809396 |
aa--ttatttattactccctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
35809334 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Original strand, 37410708 - 37410813
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
37410708 |
aatgaaacattaattttacttttcttattatatccttaact--atttattactttttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttatta |
37410805 |
T |
|
| Q |
244 |
agtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
37410806 |
aggataat |
37410813 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 39630529 - 39630693
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39630529 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcctaaattatatgtcgttttacgatactaatgaaatattgatgttacttttcctattatatccttaac |
39630627 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| || |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39630628 |
--tattaattactctctcttcttataattatttaatttatcttttccataccatttattaaggataat |
39630693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 233
Target Start/End: Original strand, 937834 - 937953
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
937834 |
tttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaacctta--gttatttattactctatc-tttttcaa |
937930 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
937931 |
ttctttcatttatctttcccata |
937953 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 238
Target Start/End: Original strand, 1313239 - 1313371
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1313239 |
aaaaaaatttgtcccaaattgtaagtcactttacaataccaatgaaacatcaatattatttttcctattatacacttaac--tatttattactctctctt |
1313336 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
1313337 |
ctttcaattctctaatttatgttttcaataacatt |
1313371 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14640266 - 14640110
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14640266 |
ccaaattgtatgtggcttt-gaaaaaaaaattgtcctaaattatatgttgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
14640168 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14640167 |
ac--tattaattactc--tcttctttcaattatttcacttatcttttccataccatttatta |
14640110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 251
Target Start/End: Original strand, 18652260 - 18652384
Alignment:
| Q |
125 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc |
224 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18652260 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatctccttgac--tattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatc |
18652357 |
T |
|
| Q |
225 |
tttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18652358 |
tttctcataccatttattaaggataat |
18652384 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10934989 - 10934862
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
10934989 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaac--tattaattactccctcttctttcaatta |
10934892 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10934891 |
tttcatttattttttccatatcatttatta |
10934862 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 14341768 - 14341890
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14341768 |
aaattgtatatcattttaggaaaaa-atttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacactaatgttatttttcctattatatccttaac |
14341866 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14341867 |
--tatttattactctttcttctttca |
14341890 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Original strand, 28024575 - 28024720
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |
|
|
| T |
28024575 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttctattataacttta |
28024674 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28024675 |
a--ttatttattactctatcttctttcaattctttcatttatttttcc |
28024720 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24520644 - 24520473
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttt--agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24520644 |
ccaaattgtacgtcgctttgaagaaaaaaaatt-gtcctaaattatatgtcgctttataataccaattaaatattaatgttatttttcctattatatcct |
24520546 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttca---attctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24520545 |
taac--tattaattactctcccttctttcaattattttttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
24520473 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32238100 - 32238035
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatg |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32238100 |
ccaaattgtacgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatg |
32238035 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 154
Target Start/End: Original strand, 1108201 - 1108273
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacatt |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1108201 |
ccaaattgcatgccactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacatt |
1108273 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Original strand, 23991754 - 23991863
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| ||||||| |
|
|
| T |
23991754 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattaatttctcttctttcaat |
23991851 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
23991852 |
cctttcatttat |
23991863 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Original strand, 37410447 - 37410552
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
37410447 |
aatgaaacattaattttacttttcttattatatccttagct--atttattaccttttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttatta |
37410544 |
T |
|
| Q |
244 |
agtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
37410545 |
aggataat |
37410552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21582785 - 21582619
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||| | || ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
21582785 |
ccaaattatatgtcgctttggaaaaaaaaatt-tcccaaattatatattgttttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcatta |
21582687 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| | ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21582686 |
att--attaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaagcataat |
21582619 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Original strand, 26630451 - 26630546
Alignment:
| Q |
148 |
aaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
26630451 |
aaacattaatgttacttttcctattataaccttaatt--atttattactctctcttctttcaattcttttatttatctttcctatattatttattaag |
26630546 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 12659020 - 12659179
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| || ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
12659020 |
ccaaattatatgtcgcttcaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctaatataacctta |
12659119 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12659120 |
a--atatttattactc--tctcccctcaattcttttatttatctttcccatgtaatttattaag |
12659179 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Original strand, 2881861 - 2881994
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
2881861 |
atttatcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatattatttttcctattataacattaact--atttattactatctcttctttca |
2881958 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2881959 |
attctttcatttatattttccatattatttattaag |
2881994 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2123889 - 2123773
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2123889 |
tttacaataccgatgaaacattaatattatttttcttattatatcattaact--atttattattctctcttctttcatttctttaatttatctttctcat |
2123792 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2123791 |
accatttattaaggataat |
2123773 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15251393 - 15251251
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
15251393 |
ccaaattataagtcacttcgggaaaaagatttgtcccaaattataagttgctttacaataccaatgaaacattgatgttatttttccttttata-ccata |
15251295 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15251294 |
ac--tatttattactctcttttctttcaattctttaatttatcttt |
15251251 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Original strand, 15251413 - 15251510
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15251413 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctactataccataaactg--tttattactctctcttctttcaattcttt-atttatctttctcat |
15251509 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Original strand, 16626265 - 16626402
Alignment:
| Q |
90 |
tatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatga--aacattaatgttacttttcctattatatccttaactgta |
187 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16626265 |
tatgtcattttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttataataccaataaatattattaatgttactttttctattatatccttaac--ta |
16626362 |
T |
|
| Q |
188 |
tttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||| | | ||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
16626363 |
tttattattttctctcatttcaagtcattcatttatcttt |
16626402 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22635813 - 22635645
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
22635813 |
tctgtcccaaattgtaggtcgctttagtggaaaaaatttgtcacaaattgtatgttgctttacgatataaatgcaactttaatgtcactttttctattat |
22635714 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
22635713 |
aacattaact--atttattactctctcttatttcaattcttttatttatttttctcatattatttattaag |
22635645 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13090114 - 13089975
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |
|
|
| T |
13090114 |
aaaaaaatttgtcctaaattctacgtcgctttacaataccaatgaagcattaatattatttttcttattatatccttaac--tatttactactttctctt |
13090017 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
13090016 |
cttccaagtcattcatttatttttcctatatcatttactaag |
13089975 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2993259 - 2993163
Alignment:
| Q |
147 |
gaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
2993259 |
gaaacattaatgttatttttcctattatatcattaac--tatttattactctatcttcttcgaattctttcatttttttttctcatatcttttattaag |
2993163 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 5288882 - 5288994
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttt |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
5288882 |
aaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttttctattataattttaa--ttatttattactatctcttc |
5288979 |
T |
|
| Q |
205 |
tttcaattctttcat |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
5288980 |
tttcaattctttcat |
5288994 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 13032973 - 13033052
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13032973 |
attaatgttattctttctattataaccttaact--atttattaatctttcttctttcaattctttcatttatctttcacata |
13033052 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 13102946 - 13103025
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13102946 |
attaatgttattctttctattataaccttaact--atttattaatctttcttctttcaattctttcatttatctttcacata |
13103025 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30077373 - 30077254
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
30077373 |
ttgtctcaaattatatgttgctttataatactaatacaatattaatgttgtttttcctattataaccctaact--atttattactctctcttctttcaat |
30077276 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
30077275 |
tctttcatttatttttctcata |
30077254 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37148227 - 37148128
Alignment:
| Q |
143 |
caatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
37148227 |
caataaaacattaatgttatttttctttttatatccttaact--atttattactctctcttctttcacttctttaatttatttttctcatactatttatt |
37148130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 251
Target Start/End: Original strand, 1122501 - 1122562
Alignment:
| Q |
190 |
tattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1122501 |
tattactctttcttttttcaattatttcatttgtctttcccatataatttattaaggataat |
1122562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4060843 - 4060766
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4060843 |
ccaaattgtatgtcactttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatgt |
4060766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28119088 - 28119013
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
28119088 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattaca-ccttaactg--tttattactctctattctttcaat |
28119013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 245
Target Start/End: Original strand, 31747854 - 31747945
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31747854 |
attaatgttacttttcctgttatatccttaa--ttatttattactctctattctttcgattctttaatttatattttccatactatttattaag |
31747945 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 590377 - 590308
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
590377 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttagaatcccaatacaactttaatgttacttttcctattataacctta |
590308 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9375306 - 9375240
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9375306 |
caaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaatattaatgttaattttgctattatatccttaact |
9375240 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13510649 - 13510506
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacatt-aatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| ||| || |||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
13510649 |
ccaaattataagtcattttggagaaaaaatttgtcccaaattataagtcacactacaataccgatgaagcattaaatgctacttttcctactataccctc |
13510550 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
13510549 |
aac--tatttactactc--tcttctttcaattctttaatttatatttc |
13510506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Original strand, 16745349 - 16745405
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16745349 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttac-tttcctattatat |
16745405 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 24806816 - 24806909
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |||| || || |||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24806816 |
ctttacaatatcaatgaaaaattaatgttaatttttctatgatgtctttaact--atttattattcttcctccttttaattctttcatttatcttt |
24806909 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4890092 - 4890049
Alignment:
| Q |
208 |
caattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4890092 |
caattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
4890049 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 177
Target Start/End: Original strand, 37706378 - 37706436
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37706378 |
aaattataagtcgctttataataccaatgaaactataattttacttttcctattatatc |
37706436 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 39410659 - 39410629
Alignment:
| Q |
74 |
tatctgttccaaattgtatgtcactttagaa |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39410659 |
tatctgttccaaattgtatgtcactttagaa |
39410629 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10832760 - 10832715
Alignment:
| Q |
188 |
tttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10832760 |
tttattactctctcttctttcaattttttcatttatcttttccata |
10832715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 208)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11249012 - 11248849
Alignment:
| Q |
86 |
attgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactg |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11249012 |
attgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac-- |
11248915 |
T |
|
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11248914 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
11248849 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 55984382 - 55984222
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55984382 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
55984283 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
55984282 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaa |
55984222 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29832811 - 29832644
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29832811 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatgtcctta |
29832712 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29832711 |
ac--tatttattactatttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaagaataat |
29832644 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 5388173 - 5388338
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5388173 |
aaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
5388272 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5388273 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
5388338 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 55968554 - 55968714
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55968554 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
55968653 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
55968654 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaa |
55968714 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42507804 - 42507637
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42507804 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatatcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcctta |
42507705 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42507704 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
42507637 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42629850 - 42629683
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
42629850 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcttta |
42629751 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42629750 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaaggataat |
42629683 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 48380586 - 48380753
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48380586 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
48380685 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48380686 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttattttttccatatcatttattaaggataat |
48380753 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 43587678 - 43587845
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43587678 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatacaaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
43587777 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43587778 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattcttttatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
43587845 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4294197 - 4294036
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4294197 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
4294098 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4294097 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
4294036 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25771246 - 25771079
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25771246 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacatcaatgttacttttcctattatatcctta |
25771147 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25771146 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttttttcatattatttattaaggataat |
25771079 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 42168290 - 42168457
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
42168290 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaacgttatttttcctattatatcttta |
42168389 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42168390 |
ac--tatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
42168457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52920852 - 52920685
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52920852 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
52920753 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52920752 |
ac--tatttattattgtttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
52920685 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10555364 - 10555203
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10555364 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcttta |
10555265 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10555264 |
ac--tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
10555203 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33600055 - 33599891
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33600055 |
gttccaaattgtatgttattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatca |
33599956 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33599955 |
ttaac--tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
33599891 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7258177 - 7258010
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7258177 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcctta |
7258078 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7258077 |
gc--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaaggataat |
7258010 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34491951 - 34491784
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34491951 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatattctta |
34491852 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34491851 |
ac--tatttattactctttcgtttttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaaggataat |
34491784 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23511376 - 23511196
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23511376 |
tactctctccgtcccaaattatatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtttctttataataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
23511277 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
23511276 |
tattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttttccataacatctattaaggataat |
23511196 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 37669926 - 37670090
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37669926 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcc |
37670025 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37670026 |
ttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
37670090 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 22019103 - 22019261
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22019103 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatcctta |
22019202 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22019203 |
ac--tatttattactctctcttttttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
22019261 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29290378 - 29290212
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29290378 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaatattaatgttacttttcctattatattcttaa |
29290279 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29290278 |
--ttatttattactctttattttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
29290212 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Original strand, 20180381 - 20180538
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20180381 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaa |
20180480 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20180481 |
c--tatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttatt |
20180538 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47869312 - 47869151
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47869312 |
gttccaaattgtatgtcaatttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcc |
47869213 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
47869212 |
ttaac--tatttattactctctcttttttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
47869151 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25367515 - 25367351
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25367515 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataacc |
25367416 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
25367415 |
ttaac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcctatattatttattaag |
25367351 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51234980 - 51234813
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51234980 |
ccaaattatatatcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtacgtcattttagaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatattctta |
51234881 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51234880 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
51234813 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51817212 - 51817045
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
51817212 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcatta |
51817113 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
51817112 |
ac--tatttattactcttttttttttcaattcttttatttatctttcccagatcatttataaaggataat |
51817045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30088866 - 30088708
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30088866 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
30088767 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30088766 |
ac--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatatcatttatt |
30088708 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 45250083 - 45250241
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45250083 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
45250182 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45250183 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttatt |
45250241 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 34447645 - 34447812
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34447645 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgcttcacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
34447744 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
34447745 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
34447812 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31648602 - 31648444
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31648602 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgagaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
31648503 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31648502 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttatt |
31648444 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33245040 - 33244870
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33245040 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcc |
33244941 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
33244940 |
ttaac--tatttattactctcttttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgaggataat |
33244870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 56038684 - 56038526
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56038684 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
56038585 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
56038584 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
56038526 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 23222484 - 23222645
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23222484 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctgttatatcctta |
23222583 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
23222584 |
ac--tatctattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcgtatcatttattaag |
23222645 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 13880464 - 13880631
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13880464 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
13880563 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |
|
|
| T |
13880564 |
ac--tatttattactctcttttctttcaattccttcatttatctttcccatatcaattattgaggataat |
13880631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29495031 - 29494873
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29495031 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
29494932 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29494931 |
ac--tatttattactctctcttctttcaataccttcatttatctttcccatatcatttatt |
29494873 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32860887 - 32860753
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32860887 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatattttta |
32860788 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32860787 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattctttca |
32860753 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49236027 - 49235869
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49236027 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattctatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
49235928 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
49235927 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttctcatatcatttatt |
49235869 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 13494116 - 13494277
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13494116 |
ccaaattgtatgtcactttagataaaaaaattgttccaaattgtatgtctctttataataccattgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
13494215 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13494216 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
13494277 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42179717 - 42179568
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42179717 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattgatgttacttttcctattataacctta |
42179618 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42179617 |
ac--tattcattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccata |
42179568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33924995 - 33924819
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33924995 |
aatactccatctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaataatttgtcccagattatatgtcactttacaattccaataaaacattaatgttactttt |
33924896 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33924895 |
cctattatatctttaa--ttatttattactctttcttctttcaattcttttatttatttttcccatatcatttattaag |
33924819 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 232
Target Start/End: Original strand, 31486864 - 31487015
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31486864 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaagtatttgtcccaagttgtatgtcactttacaataccaatgagttattaatgttatttttcctattatatcc |
31486963 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31486964 |
ttaa--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccat |
31487015 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 23137698 - 23137856
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23137698 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatctgtcccaaattgtaggtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
23137797 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
23137798 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttccaatatcatttatt |
23137856 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 2401233 - 2401398
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaat----atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2401233 |
ccaaattgtatgtcactttagaaagaaagaaaaattgtcccaaattgtatgtcaatctacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
2401332 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2401333 |
cttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
2401398 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 18052727 - 18052883
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18052727 |
aaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgatttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaac |
18052826 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18052827 |
--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
18052883 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50690684 - 50690528
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50690684 |
aattgtatgtcactttataaaaaaatatgtgttctaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac |
50690585 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttca-tttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
50690584 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcattttatcattcccataacatttat |
50690528 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 6920616 - 6920765
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6920616 |
ccaaattgtatgtcactttataaaaaatatttatcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataacctta |
6920715 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6920716 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccata |
6920765 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27383702 - 27383541
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27383702 |
ccaaattgtatgtaactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattataacctta |
27383603 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27383602 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccatattatttattaag |
27383541 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35877111 - 35876950
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35877111 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaataatttgtcccaaattgtatgtcactttccaatactaatgaaacattaatgttattttttctattatatcctta |
35877012 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35877011 |
ac--tatttattactctttcttgtttcaattcttttatttaattttctcatatcatttattaag |
35876950 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17609249 - 17609079
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa---aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17609249 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaaaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatcc |
17609150 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17609149 |
ttaac--tatttattactctttcttctttcaattatttcatttatctttcacatatcatttattaaggataat |
17609079 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 3506024 - 3506183
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3506024 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttttcctaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaa |
3506123 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3506124 |
--ttattttttactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaa |
3506183 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10125749 - 10125582
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10125749 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
10125650 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10125649 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
10125582 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 22842918 - 22843077
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22842918 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
22843017 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22843018 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
22843077 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 56235162 - 56235329
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56235162 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
56235261 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
56235262 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
56235329 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 21634582 - 21634739
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21634582 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttttcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atgttacttttcctattatatcctta |
21634680 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21634681 |
a--tcatttattactctatcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttatt |
21634739 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 251
Target Start/End: Original strand, 34246777 - 34246935
Alignment:
| Q |
91 |
atgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtattt |
190 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34246777 |
atgtcactttagaaaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctataatatccttaac--tattt |
34246874 |
T |
|
| Q |
191 |
attactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34246875 |
attactctttcttttttcaattatttcatttatcttttccatatcatttattaaggataat |
34246935 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 251
Target Start/End: Original strand, 37912445 - 37912627
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37912445 |
atactccatccgtcccaaattgtatgtcgctttagagaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttt |
37912544 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37912545 |
cctattataaccttaac--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggataat |
37912627 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38794076 - 38793927
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38794076 |
ccaaattgtacgtcactttagaaaaaatatttgtc-----------gtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttcctattatatcctta |
38793988 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38793987 |
act--atttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaa |
38793927 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 41858726 - 41858884
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41858726 |
ccaaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttttctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
41858825 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41858826 |
ac--tatttattactctctcttcttttaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
41858884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1788862 - 1788701
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1788862 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccgataaaacattaatgttacttttcctattatatcgtta |
1788763 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1788762 |
a--ttatctattactctctcttctttcaattctttcatttatctatctcatatcatttattaag |
1788701 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Original strand, 36937212 - 36937369
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36937212 |
caaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgtcccaaattatatgtctctttacaataccaataaaaaattaatattactttttctattatatccttaa |
36937311 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
36937312 |
c--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcacatatcatttatt |
36937369 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 6628887 - 6629050
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6628887 |
aattgtatgtcactttagaaaa-atatttgtttcaaattatatgtcactttagaatatcaattaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac- |
6628984 |
T |
|
| Q |
185 |
gtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
6628985 |
-tatttattactctttcctttttcaattctttcatttatctttctcatataatttaataaggataat |
6629050 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26483253 - 26483097
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26483253 |
aaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttaccttttctattatatacttaac |
26483154 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
26483153 |
--tatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
26483097 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 13800344 - 13800510
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13800344 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaatt-tatgtcgctttacgataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
13800442 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13800443 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
13800510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 26882768 - 26882903
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
26882768 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttccaattatatccttaa--gtatttattactctttattccttcaattc |
26882865 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26882866 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
26882903 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37175438 - 37175279
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37175438 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
37175339 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37175338 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
37175279 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 39417812 - 39417979
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39417812 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
39417911 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39417912 |
a--gtattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatatttctcataccatttattaaggataat |
39417979 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41458961 - 41458805
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41458961 |
ccaaattgtatgacactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
41458862 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
41458861 |
ac--tatttattactc--tcttctttcaattcattcatttatctttctcatatcatttatt |
41458805 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 2409754 - 2409916
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaa-aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2409754 |
ccaaattgtacgtcgctttagagagaaaaatttgtcccaaattatatgtctctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
2409853 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2409854 |
aac--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
2409916 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 243
Target Start/End: Original strand, 22320535 - 22320701
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaata-tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22320535 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattat |
22320634 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22320635 |
atccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
22320701 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29832335 - 29832173
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
29832335 |
ccaaattgtatgtcgctttagagaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttactttttctattataacctt |
29832236 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29832235 |
aa--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
29832173 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38615328 - 38615158
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
38615328 |
gttccaaattgtatgtcgctttaggaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatacaaatgtaacattaatgttacttttcctattataacc |
38615229 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38615228 |
ttaac--tatttattaatctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaaggataat |
38615158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 251
Target Start/End: Original strand, 55925659 - 55925841
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
55925659 |
aatactcgctctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttt |
55925758 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
55925759 |
cctattatatccttaac--tattaattactccttattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
55925841 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 46674873 - 46675034
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46674873 |
ccaaattgtatatcaatttagaaaaaatatttgtctcaaattttatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatcctta |
46674972 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattcttt-catttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
46674973 |
ac--tatctattactctttcttctttcaattttttccatttatatttctcatatcatttattaa |
46675034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20540519 - 20540363
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20540519 |
aaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgttttataatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
20540420 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
20540419 |
--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttatt |
20540363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 27851180 - 27851347
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27851180 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttatcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
27851279 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27851280 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
27851347 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 39915785 - 39915944
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39915785 |
aaattgtatgtcgctttggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttccaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac |
39915884 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
39915885 |
--tatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
39915944 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 56513723 - 56513556
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56513723 |
ccaaattgtatgtccctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
56513624 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
56513623 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcgtttatcttttccataccatttattaaggataat |
56513556 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 19877766 - 19877915
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19877766 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaaagttacttttctcattatatcctta |
19877865 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19877866 |
ac--tatttattactctctattctttcaattatttaatttatctttcccata |
19877915 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 30418720 - 30418884
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30418720 |
ccaaattgtatgtcgctttaaaaaaaaaa---gtcccaaattatatgtcgctttagaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
30418816 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30418817 |
ac--tattaattagtctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
30418884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 251
Target Start/End: Original strand, 43050164 - 43050345
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43050164 |
atactctctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttt |
43050263 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43050264 |
ctattatatccttaac--tattaattactccctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
43050345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 242
Target Start/End: Original strand, 46390733 - 46390877
Alignment:
| Q |
95 |
cactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttatta |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
46390733 |
cactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atgttactttttctattatatccttaac--catttatta |
46390829 |
T |
|
| Q |
195 |
ctctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
46390830 |
ctctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
46390877 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3086322 - 3086162
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3086322 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaatatttatcccaaattatatgttgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcccattatatccttaa |
3086223 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
3086222 |
c--tatttattactctctcttatttcaattctttaatttatctttctcatataatttattaag |
3086162 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 23237011 - 23237174
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23237011 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataacct |
23237110 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
23237111 |
ta--gttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcctatattatttattaag |
23237174 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 288357 - 288516
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
288357 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattatatcatta |
288456 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
288457 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
288516 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 16605200 - 16605367
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16605200 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgtcccacattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
16605299 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16605300 |
ac--tattaattactcttttttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
16605367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 22100928 - 22101095
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22100928 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaatgttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
22101027 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22101028 |
ac--tattaattactatctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
22101095 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 23138049 - 23138215
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23138049 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatcctta |
23138147 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23138148 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
23138215 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 23621651 - 23621797
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23621651 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atgttacttttcctattatatcctta |
23621749 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23621750 |
a--tcatttattactctcttttctttcaattccttcatttctctttccca |
23621797 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 34002184 - 34002343
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34002184 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcctattatatcctta |
34002283 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34002284 |
ac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
34002343 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 16032300 - 16032462
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16032300 |
gttctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcc |
16032399 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
16032400 |
ctaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatgccatttatta |
16032462 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 245
Target Start/End: Original strand, 33501338 - 33501495
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33501338 |
aattgtatgtcattttagaaaaa-tatgcgtcccaaattggatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattataaccttaac- |
33501435 |
T |
|
| Q |
185 |
gtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33501436 |
-tatttattactctctcttatttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaag |
33501495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 245
Target Start/End: Original strand, 51779533 - 51779707
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
|||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
51779533 |
tactctctccgtcccaaattgtatgtcactttataaaaaatatttgtcctaaattatatatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttactttttc |
51779632 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
51779633 |
tattatatccttaac--tatttattattctctcttcttttaattccttcatttaattttctcatatcatttattaag |
51779707 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 7770466 - 7770625
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7770466 |
ccaaattgtatgtcaatttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcactttacaata-caaggaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
7770564 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| | | | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7770565 |
actatttactgttctctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
7770625 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 23662539 - 23662699
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
23662539 |
ccaaattgtatgttgttttaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaatattaatgttacttttcctaatatatcatta |
23662638 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23662639 |
a--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttat-ttttccatatcatttattaag |
23662699 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36878713 - 36878548
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
36878713 |
gttccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcctaaattgtacgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttactttttctattataac |
36878614 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36878613 |
cttaac--tatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
36878548 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 37390509 - 37390669
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37390509 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatt-gttttaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatgaaacattaatgttattttttctattatatcctta |
37390607 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37390608 |
act--atttattactctttcttctttcaattctttcttttatctttcccatatcatttattaag |
37390669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47477245 - 47477080
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
47477245 |
gttctaaattatatgtcgctttagagaaaaaaatttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataac |
47477146 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47477145 |
cttaac--tatttattactctctcttatttcaattcttttatttatttttcccatattatttattaag |
47477080 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 28002527 - 28002686
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28002527 |
ccaaattgtatgttgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
28002626 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
28002627 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatactatttatta |
28002686 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41988231 - 41988064
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41988231 |
ccaaaatgtatgtcactttaaaaaaaatatttgttctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
41988132 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | |||| |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
41988131 |
ac--tatttattaccttctcttctttcaaatccttcatttatcttttccatatcatttattgaggataat |
41988064 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 52183868 - 52184035
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52183868 |
ccaaattgtatgtcgcttcggaaaaaaattttgtcctaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
52183967 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52183968 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
52184035 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 52808863 - 52808998
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
52808863 |
gtcccaaattgtacgtcactttacaataccaatgcaacattaacgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactctctcttctttcaatta |
52808960 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52808961 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
52808998 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38852904 - 38852746
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaata-tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38852904 |
aaattgtatgtcgttttagaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcttattatatccttaa |
38852805 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38852804 |
c--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
38852746 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 56299699 - 56299865
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
56299699 |
caaattatatgtcattttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaa |
56299798 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
56299799 |
c--tatttattaatctctcttctttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
56299865 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20788408 - 20788243
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcacttta-gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20788408 |
gttccaaattatatgtcgctttatgagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataac |
20788309 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20788308 |
cttaa--ttatttattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccatattatttattaag |
20788243 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47170951 - 47170794
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47170951 |
aaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac |
47170852 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| | |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47170851 |
--taataattattctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
47170794 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26740464 - 26740324
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
26740464 |
aaaaaatatttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaac--tatttattgttctctct |
26740367 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26740366 |
tctttcaattcctttatttatctttcccatatcatttattaag |
26740324 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 32402693 - 32402853
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
32402693 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaa |
32402792 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32402793 |
c--tatttattactatctcttctttcaattatttcatttatctttcccatgttatttattaag |
32402853 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42133828 - 42133665
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42133828 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaatatttatctcagattatatgtcgctttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcccattatatcctta |
42133729 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttatta--ctctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42133728 |
a--ttatttattactctctctcttctttcaattctttaatttatcttttccatacaatttattaag |
42133665 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25063878 - 25063735
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25063878 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
25063779 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25063778 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
25063735 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41414339 - 41414168
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41414339 |
gttccaaattatatgtcactttggaaaaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatc |
41414240 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41414239 |
cttaa--ttattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattaaggataat |
41414168 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 50098184 - 50098343
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50098184 |
caaattgtacgtcgctttagaaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
50098283 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50098284 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
50098343 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 53690238 - 53690410
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
53690238 |
aatactctctccgtcccaaattatatgtcgctttggaaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttt |
53690335 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
53690336 |
cctattatatctttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
53690410 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 245
Target Start/End: Original strand, 17678575 - 17678701
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaa-cattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17678575 |
caaattgtatgtcactttacaatactaatgaaaacattaatgttatttttcatattatatccttaact--atttattactctttcttttttcaatttttt |
17678672 |
T |
|
| Q |
217 |
catttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17678673 |
catttatcattctcatatcatttattaag |
17678701 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Original strand, 34016780 - 34016856
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatg |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34016780 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatg |
34016856 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 43566010 - 43566168
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
43566010 |
aaattgtatgtcattttaggaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaa |
43566109 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
43566110 |
c--tatttattactc--tcttatttcaattctttcatttatttttcacatattatttattaag |
43566168 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Original strand, 44570793 - 44570949
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44570793 |
atactctctctgtcccaaattgtatgccgttttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
44570891 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44570892 |
ctattatatccttaac--tattaattactatctcttctttcaattatttcatttatcttt |
44570949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49651133 - 49650956
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
49651133 |
taatactccatccgtcccaaattatatgtcactttaggaaaaaaaattgtctcaaattatttgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttt |
49651034 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
49651033 |
tcctattataaccttaac--tatttattcttatctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
49650956 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Original strand, 14965350 - 14965506
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14965350 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttgcaatactaatgaagcattaatgttatttttcctattatatcctta |
14965449 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| | |||| || ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14965450 |
ac--tatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttcccatatcattta |
14965506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48510904 - 48510737
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
48510904 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacattaccaatgcaacattaatgttacttttccaattgtaacctta |
48510805 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48510804 |
ac--tatttatttttatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
48510737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 184
Target Start/End: Original strand, 50533778 - 50533884
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaa-aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
50533778 |
gttctaaattgtatgtcactttagaaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatc |
50533877 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaact |
184 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
50533878 |
cttaact |
50533884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 26799356 - 26799518
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
26799356 |
ccaaattgtatgccgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcattttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataacctt |
26799455 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
26799456 |
aa--ttatttattactccctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
26799518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Original strand, 37787892 - 37788047
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37787892 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaa- |
37787990 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37787991 |
-ttattaattactc--tcttctttcaattatttcatttatcctttccataccatttatta |
37788047 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51487816 - 51487666
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
51487816 |
ccaaattgtatgtcgctttagagaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcactttacaatatcaatgcaacattaatgttactttttctattataacctt |
51487717 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
51487716 |
aac--tatttattattatctcttctttcaattctttcatttatatttctcata |
51487666 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 51624858 - 51625010
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcacttta---gaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
51624858 |
ccaaattatatgccactttagaaaaaatatttgtttcaaattgtatgtcactttatactaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataact |
51624957 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51624958 |
ttaac--tatttattactctcttttctttcaggtcttttatttatcttttccata |
51625010 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53334126 - 53333964
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
53334126 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattgatgttactttttctattataacctt |
53334027 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
53334026 |
aac--tatttattactatctcttctttcaattctttcatttatatttctcatattatttattaag |
53333964 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 388057 - 388217
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
388057 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatt-gtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattagtgttacttttcctattatatccttc |
388155 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
388156 |
ac--tatttattgcattctctacttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
388217 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 34735932 - 34736093
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34735932 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttaaaatatcaatgcaacattaatgatatttttcctattataacctta |
34736031 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34736032 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaag |
34736093 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 245
Target Start/End: Original strand, 35836101 - 35836226
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttc |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
35836101 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaac--tatttattattctctcttctttcaaatctttt |
35836198 |
T |
|
| Q |
218 |
atttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
35836199 |
atttatctttccaatattatttattaag |
35836226 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41608861 - 41608732
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
41608861 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataactttaac--tatttattactctctcttatttcaattc |
41608764 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
41608763 |
tttcatttatttttctcatattatttattaag |
41608732 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 32882127 - 32882283
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32882127 |
tctgtcccaaattgtatgttgttttagggaaaaatatttgttccaaattatatatcgctttataataccaatgcaacattaatgttatttttcctattat |
32882226 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32882227 |
aaccttaac--tatttattactctatcttctttcaattcttttatttatctttctcata |
32882283 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36871498 - 36871350
Alignment:
| Q |
101 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
36871498 |
agaaaaaatatttgtttcaaattatacgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaac--tatttattactctct |
36871401 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
36871400 |
cttctttcagttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
36871350 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41947838 - 41947671
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatg-ttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41947838 |
gttccaaattgtatgtcattttagaagaaaaaaatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaataattaatgtttacttttcctattata |
41947739 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| | | ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41947738 |
tccttcac--tatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
41947671 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19807094 - 19806935
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19807094 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaattgtatcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaa |
19806995 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
19806994 |
c--tatttattactctatcttctttcaattattttatttatctttctcatattatttattaa |
19806935 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 43609272 - 43609433
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga----aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43609272 |
ccaaattgtatatcactttagagaagaaaaaaaattgtctcaaactgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
43609371 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43609372 |
tttaac--tatatgttactctttc----ttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
43609433 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 54270782 - 54270949
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
54270782 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcctaaattatatttcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcctta |
54270881 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |
|
|
| T |
54270882 |
ac--tattaattactttctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccttatattaaggataat |
54270949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8178232 - 8178075
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8178232 |
ccaaattgtatgtcgttttaggaaaaaaatt-gtcccacattatatgttgctttacaataccaataaaacattaatgtaatttttcatattatatccttt |
8178134 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8178133 |
act--atttattactctctcttatttcaattctttcatttatctttcccatataatttatt |
8178075 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26707391 - 26707273
Alignment:
| Q |
125 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc |
224 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26707391 |
tatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgctacttttcctattataaccttagct--atttattactctctcttatttcaattctttcatttatc |
26707294 |
T |
|
| Q |
225 |
tttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26707293 |
tttcccatattatttattaag |
26707273 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29753195 - 29753065
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29753195 |
tttgtcccaaattagatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaa--ttattaattactctttcttctttcaa |
29753098 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
29753097 |
ttatttcatttatcttttccatacaatttatta |
29753065 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Original strand, 30049505 - 30049647
Alignment:
| Q |
107 |
aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
30049505 |
aatatttgtcccaaattatatgttgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac--tattaattactctctcttctt |
30049602 |
T |
|
| Q |
207 |
tcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30049603 |
tcaattatttcatttatcttttccatgctatttattaaggataat |
30049647 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 30609241 - 30609402
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||| |||| | || ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30609241 |
ccaaattgtatgtcgctttggaagaaaaaaaattatcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctgttatatcct |
30609340 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30609341 |
taac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
30609402 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37731023 - 37730861
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37731023 |
ccaaattgtatgtcgctttaacgaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacagtaccaatgcaactttaatgttatttttcctattataacctt |
37730924 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
37730923 |
aac--tatttattagtctctcttcttccaattctttcatttatctttcctatattatttattaag |
37730861 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9542601 - 9542472
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
9542601 |
gtcccaaattatatgtcactttgcaataccaatgaaacattaacgttaattttcctattatgtccctaac--tatttgttactctctcttctttcaattc |
9542504 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9542503 |
tttcatttaacttttccatatcatttattaag |
9542472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13252413 - 13252300
Alignment:
| Q |
94 |
tcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttatt |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13252413 |
tcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttatt |
13252316 |
T |
|
| Q |
194 |
actctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
13252315 |
actatctcttctttca |
13252300 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 251
Target Start/End: Original strand, 34018750 - 34018851
Alignment:
| Q |
148 |
aaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagta |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
34018750 |
aaacattaatgttaatttttgtattatatccttaact--atttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaagga |
34018847 |
T |
|
| Q |
248 |
taat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
34018848 |
taat |
34018851 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44622485 - 44622319
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44622485 |
ccaaattatatatcgctttggaacaaaaatttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcttta |
44622386 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcattta-tctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44622385 |
ac--tattaattactc--tcttttttcaattatttcatttatttttttccataccatttattaagaataat |
44622319 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22496746 - 22496568
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcacttt--agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttact |
163 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22496746 |
taatactccatccgtcccaaattgtatgtcactttgaagaaaaaaaatt-gtcccaaattgtatgtgtctttacaataccaatgaatcattaatgttact |
22496648 |
T |
|
| Q |
164 |
tttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||| | | ||| || ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22496647 |
tttcctattatatcctt--cgctatttattgcattctctacttccaagtcatttatttatctttcccatatcatttattaag |
22496568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 596367 - 596260
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
596367 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaac--tatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttctcat |
596270 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
596269 |
atcatttatt |
596260 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 6284026 - 6284161
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
6284026 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcatattatgtccttaac--tatttattattatctcttctttcaattc |
6284123 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6284124 |
tttaatttatcttttccatatcatttattaaggataat |
6284161 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1607055 - 1606916
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
1607055 |
aaattgtatgtcgctttagaaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattgtaaccttaac |
1606958 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1606957 |
--gatttattactctcttttttttcaattatttcatttatcttt |
1606916 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 175
Target Start/End: Original strand, 29832448 - 29832541
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29832448 |
ccaaattgtatgtcatttaaaaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
29832541 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30035566 - 30035421
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
30035566 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaattgtctcaaattatatgttactttacaataccaatgcaacattaatattaatttctctattataacctta |
30035467 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30035466 |
ac--tatttattactatctcttctttcaattctttcatttatttttcc |
30035421 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Original strand, 44197281 - 44197422
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || |
|
|
| T |
44197281 |
gaaaaaaaaattgtcctaaattatacgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcttattataaccttaact--atttattactatctc |
44197378 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44197379 |
ttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
44197422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52397957 - 52397793
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52397957 |
aaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatt-gtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcttattatatcattaac |
52397859 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52397858 |
--tattaattactttctcttctttcaattatttcatttatcattttcataccatttattaaggataat |
52397793 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Original strand, 26855398 - 26855493
Alignment:
| Q |
148 |
aaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26855398 |
aaacattaatgttacttttcctgttatatccttaact--atttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcccatacaatttattaag |
26855493 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32397539 - 32397377
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
32397539 |
ccaaattatatgtcgctttagaaaaaaaaaattgtcacgaattatatgtcgttttacaatacctatgtaacattaatgttattttttctattataacctt |
32397440 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32397439 |
aact--atttattactctatcttctttcaattcttttatttatttttcccatattatttattaag |
32397377 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 54315060 - 54315227
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcacttt---agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54315060 |
gttccaaattatatgtcactttggaagaaaaaaaaattgtctcaaattgtatgtcgcattacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattata |
54315159 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| || | ||| || ||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
54315160 |
tccttcac--tatttattgctttctctacttccaagtcattcatttatttttctcatattatttattaag |
54315227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8591901 - 8591797
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacat |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
8591901 |
aataccaatgaaatatcaatgttacctttcctattatatccttagct--atttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcat |
8591804 |
T |
|
| Q |
238 |
ttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
8591803 |
ttattaa |
8591797 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36507592 - 36507433
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36507592 |
ccaaattatatgtcatttt-gaaaaaaaaattgtcccaaattgtattttgctttacaataccaatgaaacattaattttatttttcctattatatattta |
36507494 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | ||| || ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36507493 |
ac--tatttattactttatctcattccaagtcattcatttatcttttccatatcatttattaa |
36507433 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30649857 - 30649687
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
30649857 |
gttccaaattgtatgttgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattttatcc |
30649759 |
T |
|
| Q |
179 |
-ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| | || ||| ||| | || |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30649758 |
tttaac--tcttaattgctccctattctttcaattattttatttatcttttccataccatttattaaggataat |
30649687 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18872479 - 18872354
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18872479 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtttcaaattatatgtcgttttataataccaataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac |
18872380 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
18872379 |
--tatttattactttatcttctttcaat |
18872354 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13394531 - 13394443
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
13394531 |
attaatgttacttttcctattatatccttaact--atttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
13394443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13397670 - 13397582
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
13397670 |
attaatgttacttttcctattatatccttaact--atttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
13397582 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32385562 - 32385467
Alignment:
| Q |
147 |
gaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32385562 |
gaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac--tatttatta-tctctcttctttcaattctttaatttatctttctcataccatttattaag |
32385467 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16833842 - 16833711
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||| |||| || |
|
|
| T |
16833842 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattacataattaac--tattaattactctctcttctttctat |
16833745 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16833744 |
tcattcatttatttttctcatatcatttattaag |
16833711 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Original strand, 22128784 - 22128894
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22128784 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatcttttctattatatcattaac--tatttattactctattttcttttaattctttcatttatctttccggt |
22128881 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |
|
|
| T |
22128882 |
atcatttattaag |
22128894 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 23153711 - 23153817
Alignment:
| Q |
125 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23153711 |
tatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctgttatgtcattaac--tatttattactctctcgtctttcaattctttaatttatc |
23153808 |
T |
|
| Q |
225 |
tttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
23153809 |
tttctcata |
23153817 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26478231 - 26478058
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || | ||||||||| || |||||| ||||| | || || |||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26478231 |
aatactccatccgtcctaaattgtatatcgctttaggaaaaaaaattctctcaaattatatgtcgctttatattatcaatgaaacattaat---actttt |
26478135 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26478134 |
ccgattatatccttaact--atttattgctctcttttttttcaattattttatttatttttccaatatcatttattaag |
26478058 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 23138300 - 23138397
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23138300 |
attaatgttacttttcatattatatccttaact--attaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
23138397 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49226610 - 49226508
Alignment:
| Q |
139 |
ataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatt |
238 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
49226610 |
ataccaatgcaatattaatgttacttttcctattataaccttagc--tatttattactc--tcttctttcaattctttcatttatttttcccatattatt |
49226515 |
T |
|
| Q |
239 |
tattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
49226514 |
tattaag |
49226508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15986582 - 15986474
Alignment:
| Q |
141 |
accaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15986582 |
accaatgcaacattaatgttactttttcaattgtaaccttaact--atttattattattttttctttcaattctttcatttatctttcccatattattta |
15986485 |
T |
|
| Q |
241 |
ttaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
15986484 |
ttaaggataat |
15986474 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Original strand, 14604248 - 14604379
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
14604248 |
caaattatatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataactttaac--tagttattattctcgcttctttccattcttta |
14604345 |
T |
|
| Q |
218 |
atttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14604346 |
atttatcattctcataccatttattaaggataat |
14604379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29462739 - 29462618
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
29462739 |
aaattataagtctctttacaataccaatgaaac-ttaatgttacttttcctat-atacccttaact--atttattactttaacttttttcaattttttaa |
29462644 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
29462643 |
tttatctttcctatatcatttattaa |
29462618 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39603439 - 39603356
Alignment:
| Q |
160 |
tacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39603439 |
tacttttcctattatacccttaact--atttattactttttcttctttcaattttttaatttatctttcccataccatttattaag |
39603356 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6154198 - 6154085
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | | |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
6154198 |
ctttacaatatcaatgaaacattaatgttaattttcctattataccattaactatttacgttactctttcttctttcaattttttaatttatttttcgca |
6154099 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |
|
|
| T |
6154098 |
taccatttattaag |
6154085 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13398053 - 13397980
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaa |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13398053 |
caaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaa |
13397980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27956021 - 27955937
Alignment:
| Q |
159 |
ttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27956021 |
ttacttttcctattataaccttaatt--atttattactctattttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
27955937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 29832833 - 29832892
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29832833 |
tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaag |
29832892 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29977132 - 29977001
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29977132 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacat---tgatacttttcctattataacctta-----attatttaccctttcttctttcaat |
29977041 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29977040 |
tctttcatttaattttctcatatcatttattaaggataat |
29977001 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9583786 - 9583664
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
9583786 |
aaattatatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaact--atttagtactct--cttctttcaattttttta |
9583691 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9583690 |
tttatctttcccatatcatttattaag |
9583664 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9589481 - 9589359
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
9589481 |
aaattatatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaact--atttagtactct--cttctttcaattttttta |
9589386 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9589385 |
tttatctttcccatatcatttattaag |
9589359 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11116547 - 11116466
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11116547 |
aatgaaacattaatgttacttgtcttattatacccttaac--tatttattactatctcttctttcaattctttgatttatcttt |
11116466 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 46481652 - 46481548
Alignment:
| Q |
117 |
ccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46481652 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttatttttcttattgtaaccttaacg--atttattactctctcttttttcaattattt |
46481555 |
T |
|
| Q |
217 |
catttat |
223 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
46481554 |
catttat |
46481548 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 251
Target Start/End: Original strand, 6893243 - 6893301
Alignment:
| Q |
193 |
tactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6893243 |
tactctttcttctttcaattatttcatttatctttccaatatcatttattaagtataat |
6893301 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 13967728 - 13967810
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat-ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13967728 |
tttacaataccaatgaaacatcaatgttacttttcttattacataccttaa--gtatttattactctttattctttcaattcttt |
13967810 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 184
Target Start/End: Original strand, 6892571 - 6892673
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
6892571 |
gttccaaattgtacgtcactttagaagaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacaaaaccaatgaaacattcat-----ttttcctattatat |
6892665 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
6892666 |
ccttaact |
6892673 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Original strand, 10754447 - 10754588
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||| |||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| || | |||||||| | |
|
|
| T |
10754447 |
gaaaaaaaattcgtctcaaattataagtcggtttaaaataccaatgaagaattaatgttactttttctattatacctttaac--taatcattactctcta |
10754544 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
10754545 |
ttctttcaattctttaatttatctttcgcatggtatttattaag |
10754588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Original strand, 10968216 - 10968357
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||| |||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| || | |||||||| | |
|
|
| T |
10968216 |
gaaaaaaaattcgtctcaaattataagtcggtttaaaataccaatgaagaattaatgttactttttctattatacctttaac--taatcattactctcta |
10968313 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
10968314 |
ttctttcaattctttaatttatctttcgcatggtatttattaag |
10968357 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19721332 - 19721259
Alignment:
| Q |
170 |
attatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19721332 |
attatatccttaact--atttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcttataccatttattaag |
19721259 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 49228169 - 49228105
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaat |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
49228169 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaatatttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaat |
49228105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 55710894 - 55710846
Alignment:
| Q |
19 |
acaatgtgttagctggccttcctaagttgtcgactacttcagtatagta |
67 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55710894 |
acaatgtgttagctggccttcctaagttgtcgactactcaagtatagta |
55710846 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 20978103 - 20978162
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20978103 |
tatttattactctatcttatttcaattctttcatttatctttttcatatcatttattaag |
20978162 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 37041149 - 37041086
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37041149 |
tttgtcccagattatatgtcgctttacaataccactgaagcattaatgttacttttcctattat |
37041086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 49248144 - 49248069
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatg |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | || ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
49248144 |
caaattgtatgtccctttagaaaaaatatttgtcctaaattatatatcgttgtacaataccaatgaaatattaatg |
49248069 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10699423 - 10699312
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc-ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
10699423 |
tttaaaataccaatgaagaattaatgttatttttttctattataccattaatt--atttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcgca |
10699326 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
10699325 |
tagtatttattaag |
10699312 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10913193 - 10913082
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc-ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
10913193 |
tttaaaataccaatgaagaattaatgttatttttttctattataccattaatt--atttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcgca |
10913096 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
10913095 |
tagtatttattaag |
10913082 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Original strand, 9033593 - 9033699
Alignment:
| Q |
143 |
caatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
9033593 |
caatggaacattaatgttactttttctattatagtcataaat--atttattactttccctttttacaattctttcatttatctttttcatataatttatt |
9033690 |
T |
|
| Q |
243 |
aagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
9033691 |
aaggataat |
9033699 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 18316844 - 18316884
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18316844 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatacccttaact |
18316884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23949806 - 23949640
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat---- |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| | || || |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
23949806 |
ccaaattgtatgtcactttagagaaaaaagattatctcaaattatatgtcgctttacaatataaatgcaacattaatgttattttttctattatatataa |
23949707 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||| | || ||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
23949706 |
ccttaac--tatttatcactctcttttcttttaattatttcttttatctttctaatattatttattaag |
23949640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 184
Target Start/End: Original strand, 3761807 - 3761853
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3761807 |
aataccaatgaaacattaatgttattttttctattatgtccttaact |
3761853 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 244
Target Start/End: Original strand, 34498208 - 34498245
Alignment:
| Q |
207 |
tcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34498208 |
tcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaa |
34498245 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3727192 - 3727097
Alignment:
| Q |
128 |
gtcactttagaataccaatgaaacattaatgtta-cttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc |
224 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
3727192 |
gtcattttacaataccaattaaacattaatgttatttttttctattatatctttacc--tatttattactcttccttatttaaattttttaatttatc |
3727097 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Original strand, 24323238 - 24323316
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24323238 |
aaattatatgtcgttttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcctattat-tctttaac--tatttattactcttt |
24323316 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32295403 - 32295341
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
32295403 |
ttgtcccaaattatacgtcgccttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattat |
32295341 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 229
Target Start/End: Original strand, 50174402 - 50174518
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaa-tgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttc |
208 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
50174402 |
atttatcccaaattataattcgctttacaataccaatgaagtattaaatgttacttttcctactataccctcaac--tatttatta--ctgtcttctttc |
50174497 |
T |
|
| Q |
209 |
aattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
50174498 |
aattatttaatttatctttcc |
50174518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Original strand, 13529616 - 13529714
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13529616 |
tctgtcccaaattatatgtcattttaaaaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtggctttacaatactaatgaaaacttattgttactttttgtattata |
13529713 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 242
Target Start/End: Original strand, 50534179 - 50534236
Alignment:
| Q |
185 |
gtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
50534179 |
gtatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatattatttatt |
50534236 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 55852220 - 55852171
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtt |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
55852220 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaaaattaatgtt |
55852171 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 25200202 - 25200275
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcat |
219 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
25200202 |
aatgaatcattaatgttattttttatattatatcattaac--tagttattactctctcttctttcaattatttcat |
25200275 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 186)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 14527762 - 14527929
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14527762 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
14527861 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14527862 |
ac--tatttattactctttattttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
14527929 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 13375324 - 13375491
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13375324 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatcttacttttcctattatatcctta |
13375423 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13375424 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
13375491 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14943532 - 14943365
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14943532 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
14943433 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14943432 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
14943365 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 19002918 - 19003085
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19002918 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcacattagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
19003017 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19003018 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaaggataat |
19003085 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26850091 - 26849930
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26850091 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
26849992 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26849991 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
26849930 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9047520 - 9047340
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9047520 |
tactctctccgtcccaaattgtatgtcaatttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
9047421 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9047420 |
tattatatctttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
9047340 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 36068117 - 36068284
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36068117 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
36068216 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36068217 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
36068284 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 40833481 - 40833648
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
40833481 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcctta |
40833580 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40833581 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttatcatatcatttattaaggataat |
40833648 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24000409 - 24000226
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24000409 |
taatactccatccgtctcaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtttcttt |
24000310 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24000309 |
tcctattatatccttaac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
24000226 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 42056049 - 42056216
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42056049 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttattccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttcctattatatcctta |
42056148 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42056149 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
42056216 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 251
Target Start/End: Original strand, 6579700 - 6579881
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6579700 |
tactccatccgttccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaataaaacattaatgttatttttcc |
6579799 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttc-ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6579800 |
tattatatccttaactg--tttattactctttctttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
6579881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Original strand, 16062525 - 16062708
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16062525 |
taatactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaagtatttgtctcaaattgtatgtcactgtagaataccaatgaaacattaatgttatttt |
16062624 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16062625 |
tcctattatatccttaac--tatttattactttttcttttttcaattctttcatttatctttcccgtataatttattaaggataat |
16062708 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 22060992 - 22061159
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22060992 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
22061091 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22061092 |
a--ttatttattattctttcttctttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
22061159 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Original strand, 25898997 - 25899179
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25898997 |
taatactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
25899096 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25899097 |
ttctattatatcattaac--tatttattaccatttcttttttcaattc-ttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
25899179 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 39407789 - 39407956
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39407789 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccactgaaacattaatgttatttttcctattatattctta |
39407888 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39407889 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcgtttatctttctcatatcatttattaaggataat |
39407956 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8341749 - 8341582
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
8341749 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatattactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcttta |
8341650 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8341649 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
8341582 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40171806 - 40171639
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40171806 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatattctta |
40171707 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40171706 |
ac--tatttattactttttcttctttcaattctttcatttattttttccatattatttattaaggataat |
40171639 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19275208 - 19275044
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19275208 |
aaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
19275109 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
19275108 |
--tatttattactctttcatctttcaattctttcatttatctttcccatatca-ttattaaggataat |
19275044 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39927759 - 39927598
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39927759 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaagatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataacctta |
39927660 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39927659 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccataatatttattaag |
39927598 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4646661 - 4646494
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4646661 |
ccaaattgtatgtgactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatatcactttataataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
4646562 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4646561 |
ac--catttattactctttcttctttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaaggataat |
4646494 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13849529 - 13849366
Alignment:
| Q |
86 |
attgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactg |
185 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13849529 |
attgtatgccactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaatagcaatgaaacattagtgttatttttcctattatatccttaac-- |
13849432 |
T |
|
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13849431 |
tatttattactatttcttttttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaaggataat |
13849366 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 28330757 - 28330924
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28330757 |
ccaaattgtatatcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcatta |
28330856 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28330857 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattcattcatttatctttcctatatcatttattaaggataat |
28330924 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 1204925 - 1205092
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1204925 |
ccaaattgtatgtcatttttaaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatcctta |
1205024 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
1205025 |
ac--tatttattactctttcatttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttaataaggataat |
1205092 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28181759 - 28181598
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28181759 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttgctattatatcc |
28181660 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28181659 |
ttaac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
28181598 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 36443526 - 36443687
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36443526 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatcctta |
36443625 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36443626 |
a--ttatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
36443687 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 325400 - 325233
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
325400 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
325301 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
325300 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
325233 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 10877317 - 10877475
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10877317 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
10877416 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10877417 |
ac--tatttattactctctcttcttttaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
10877475 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 23498050 - 23498207
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23498050 |
ccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttata-taccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
23498148 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23498149 |
act--atttattactctttcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
23498207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1221307 - 1221158
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1221307 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataacctta |
1221208 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1221207 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccata |
1221158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5669274 - 5669114
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5669274 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaa |
5669175 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5669174 |
c--tatttattactatctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattaag |
5669114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 27244931 - 27245066
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27244931 |
gtcccaaattgtatgtcacttttgaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattc |
27245028 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27245029 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
27245066 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28786992 - 28786825
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28786992 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaataaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
28786893 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
28786892 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
28786825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 12192419 - 12192587
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12192419 |
ccaaattgtatgttattttaaaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
12192518 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc-tttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12192519 |
a--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcttttttcatatcatttattaagaataat |
12192587 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19240884 - 19240722
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19240884 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatctt |
19240785 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19240784 |
aac--tatttattactctctcttctttcaaatcttttatttatatttcccatattatttattaag |
19240722 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 30780069 - 30780227
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30780069 |
ccaaattgtatgtcactttacaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
30780168 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30780169 |
ac--tatttattactttctcttctttcaattccttcatttttctttcccatatcatttatt |
30780227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31909846 - 31909677
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31909846 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgatatttttcctattatatcct |
31909747 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31909746 |
taact--atttattactctttcttctttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
31909677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39235251 - 39235093
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39235251 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcggattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcttta |
39235152 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
39235151 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattccttaatttatctttcctatatcatttatt |
39235093 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 41095938 - 41096096
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41095938 |
ccaaattgtatgtcacttaggaaaaaatatttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
41096037 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
41096038 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttttcatatcatttatt |
41096096 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28206674 - 28206509
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28206674 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
28206575 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
28206574 |
--tatttattactctcccttctttcaatttcttcatttatcttttccatatcatttattgaggataat |
28206509 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 34036112 - 34036269
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaa-aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34036112 |
aaattgtatgtcactttaaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaa |
34036211 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
34036212 |
c--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatcttttccatatcatttatt |
34036269 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 19576061 - 19576217
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19576061 |
aaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaac |
19576160 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19576161 |
--tatttattactctatcttctttcaattccttcatttatttttcccatgtcatttatt |
19576217 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7491722 - 7491555
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7491722 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatgtgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
7491623 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
7491622 |
ac--catttattactatctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
7491555 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 12467674 - 12467809
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12467674 |
gtcccaaattgtatgtcactctagaataccaatgaaacattaatgctattttttctattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattc |
12467771 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12467772 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
12467809 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 35669699 - 35669858
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35669699 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
35669798 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
35669799 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
35669858 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 5421446 - 5421608
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata-tcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
5421446 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatttctt |
5421545 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5421546 |
aac--tatttattactctctctcctttcaattccttcctttatctttcccatatcatttattaag |
5421608 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 27183068 - 27183227
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27183068 |
ccaaattatatgtcattttagaaaaaatatttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
27183167 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27183168 |
ac--tatttattactc--tcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaag |
27183227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 27832610 - 27832769
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27832610 |
ccaaattatatgtcattttagaaaaaatatttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
27832709 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27832710 |
ac--tatttattactc--tcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaag |
27832769 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 41186797 - 41186961
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41186797 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaa- |
41186895 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
41186896 |
-ttatttattactctctcttctttcaa-tccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataat |
41186961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29843945 - 29843769
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
29843945 |
aatactccatccgtcctaaattgtatgtcactttaggaaaaaaaattgtctcaaattgcatgtcactatacaataccaatgaaatattaatgttattttt |
29843846 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29843845 |
cctattatatccttaa--ttatttattactctttcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaag |
29843769 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 6596481 - 6596640
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6596481 |
aaattgtatgttactttacaaaaataatttgtctcaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatccttaac |
6596580 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6596581 |
--tatttattactttttcttctttcaattatttcatttatttttcccatatcatttattaag |
6596640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14309173 - 14309014
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14309173 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
14309074 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14309073 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
14309014 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27341858 - 27341695
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaa---aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27341858 |
ccaaattgtatgtcactttagaaagaaaaaaaattgtctcaaattgtatgtcacttttcaataccaatgaaacattaatgttt-ttttcctattatatca |
27341760 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27341759 |
ttaact--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
27341695 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41285871 - 41285705
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41285871 |
caaattgtatgtcgctttagaaaaaaagtttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaa |
41285772 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41285771 |
c--tattaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttattaaggataat |
41285705 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2048267 - 2048099
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
2048267 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcatt |
2048168 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2048167 |
aac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
2048099 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6027118 - 6026961
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6027118 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
6027021 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6027020 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
6026961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22154281 - 22154122
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22154281 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
22154182 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22154181 |
ac--tattaattactcactcttctttcaattatttcatttattttttccataccatttatta |
22154122 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 37985537 - 37985703
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37985537 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
37985635 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37985636 |
ac--tattaattactttttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
37985703 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1667028 - 1666866
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1667028 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgccgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
1666929 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1666928 |
agc--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
1666866 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3873680 - 3873518
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3873680 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
3873581 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3873580 |
tgc--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
3873518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 9527462 - 9527631
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttt--agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9527462 |
ccaaattgtatgtcgctttgaagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatctt |
9527561 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9527562 |
taac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
9527631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19166450 - 19166292
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19166450 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgccctaaattatataccgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcatta |
19166351 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19166350 |
ac--tatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
19166292 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 34213140 - 34213289
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34213140 |
ccaaattgtatgtca-tttagaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataacctt |
34213238 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34213239 |
aac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccata |
34213289 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1420933 - 1420776
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |
|
|
| T |
1420933 |
caaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatatcgctttacaatactaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatctttga |
1420834 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1420833 |
c--tatttattactctctcttctttcaattccttaatttatctttcccatatcatttatt |
1420776 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3628653 - 3628493
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3628653 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtta-tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataacctta |
3628555 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
3628554 |
a--ttatttattagtctctcttctttcaagtcttttatttatctttcctatattatttattaag |
3628493 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 40171904 - 40172029
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
40171904 |
ccaaattgtatgtcagattagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgacacattaatgttactttttctattatatcttta |
40172003 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40172004 |
a--ttatttattactctttcttttttca |
40172029 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5748728 - 5748565
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
5748728 |
ccaaattgtatgttactttagaagaaaaaaaattgttccaaattgtatgttactttacgataccaatgaaacattaacgttatttttcctattatattct |
5748629 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
5748628 |
taac--tatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttctcgtatcatttattaag |
5748565 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 38150533 - 38150689
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
38150533 |
aaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcttaaattatatctcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaac |
38150632 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
38150633 |
--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcacatatcatttatt |
38150689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 518477 - 518637
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
518477 |
ccaaattgtatgtcgccttaggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataacctt |
518576 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
518577 |
agc--tatttattactc--tcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
518637 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8444266 - 8444099
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8444266 |
ccaaattgtatgttgctttggaaaataaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttactttttctattatatcctta |
8444167 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8444166 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
8444099 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 11216605 - 11216764
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11216605 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
11216704 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11216705 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
11216764 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14780970 - 14780812
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14780970 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtccctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
14780872 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14780871 |
ac--tattaattactctttcttctttcaattatttcatttattttttccataccatttatta |
14780812 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31072684 - 31072525
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31072684 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaattttttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
31072585 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
31072584 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
31072525 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 38959748 - 38959907
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38959748 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
38959847 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
38959848 |
ac--tattaattactctctctcctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttatta |
38959907 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41787132 - 41786993
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41787132 |
aaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactctctctt |
41787035 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
41787034 |
ctttcaattctttcatttatctttcctatattatttattaag |
41786993 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22050734 - 22050577
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22050734 |
aaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaac |
22050635 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22050634 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
22050577 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5005290 - 5005131
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
5005290 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataacctta |
5005192 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5005191 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaa |
5005131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 36845833 - 36845998
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36845833 |
ccaaattgtatgtcgctttgggaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
36845930 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36845931 |
ac--tattaattactctttcttctttcaattatttcatttatattttccatacaatttattaaggataat |
36845998 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40425230 - 40425062
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40425230 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgcaactttaatattatttttcctattataacctt |
40425131 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40425130 |
aac--tatttattactctctcttatttcaattctttcatttatttttttcatactatttattaaggataat |
40425062 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 16198405 - 16198564
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16198405 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttgtttttcctattatatcctta |
16198504 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16198505 |
ac--tattatttactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
16198564 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27863069 - 27862910
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27863069 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttt |
27862970 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27862969 |
a--ttattaattactctcttttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
27862910 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 29411823 - 29411986
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaac-----attaatgtta |
161 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29411823 |
aatactccatccgttccaaattgtatgtcactttggaaaaattttttgtcccaaattatatgtcattttacaataccaatgaaatgaaatattaatgtta |
29411922 |
T |
|
| Q |
162 |
cttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29411923 |
cttttcctattatatccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
29411986 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43521661 - 43521495
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43521661 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttc |
43521563 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43521562 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataat |
43521495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 23494454 - 23494616
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| || |||| |
|
|
| T |
23494454 |
ccaaattgtatgtcactttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcactttacaatactaatgcaacattaatgttactttttcaattgtaacctt |
23494553 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23494554 |
aac--tatttattattatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
23494616 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 29026981 - 29027143
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
29026981 |
ccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataacctt |
29027080 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29027081 |
aa--ttaattattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
29027143 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 34504355 - 34504513
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34504355 |
caaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaa |
34504454 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34504455 |
--ttattaattactctattttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
34504513 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 43446548 - 43446713
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43446548 |
caaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaa |
43446646 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43446647 |
c--tattaattattctctcttatttcaattatatcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
43446713 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44710103 - 44709941
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
44710103 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaaaaaaaatgtcccaaattatatgtccctttataataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcctc |
44710004 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44710003 |
aac--tatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaag |
44709941 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 6713895 - 6714060
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
6713895 |
gttccaaattgtatgtcgctttagtagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataac |
6713994 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6713995 |
cttaa--ttaattattactctatcttctttcaattctttcatttatatttcccatattatttattaag |
6714060 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8247404 - 8247239
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8247404 |
aaattgtatattattttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatatcgctttacaataccaataaaaaattaatgttactttttctattatatcattaac |
8247305 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
8247304 |
--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
8247239 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32674635 - 32674506
Alignment:
| Q |
107 |
aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttt |
206 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
32674635 |
aatatttatcccaaattgtatatcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctctcttctt |
32674538 |
T |
|
| Q |
207 |
tcaattctttcatttatctttcccataacatt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
32674537 |
tcaattctttcatttatctttctcatatcatt |
32674506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21134646 - 21134514
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
21134646 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattattctctcttctttcaa |
21134549 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21134548 |
ttctttcatttatatttcccatattatttattaag |
21134514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32068485 - 32068317
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatattt-gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32068485 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaattttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctt |
32068386 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32068385 |
aa--ttattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatatcatttattaaggataat |
32068317 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1684406 - 1684242
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaa---aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
1684406 |
aaattgtacgtcactttaggaagaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcttt |
1684307 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattc--tttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1684306 |
aa--ttatttattactctttcttctttcaattcaattttatttatctttctcatatcatttattaag |
1684242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 8495291 - 8495450
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8495291 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgttctaaattatatgtcactttacaataccaataaaatatttatgttatttttcctattatatcctta |
8495390 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8495391 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
8495450 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22375286 - 22375127
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22375286 |
caaattgaatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaa |
22375187 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22375186 |
c--tattaattacttcatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaa |
22375127 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 242
Target Start/End: Original strand, 14885055 - 14885189
Alignment:
| Q |
106 |
aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctttt |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
14885055 |
aaatatttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaac--tatttattactctctcttct |
14885152 |
T |
|
| Q |
206 |
ttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14885153 |
ttcaattatttcatttatctttcccatataatttatt |
14885189 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2443552 - 2443387
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatattt-gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
2443552 |
gttccaaattgtatgtcgctttagggaaatttttttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaac |
2443453 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
2443452 |
ctta--gttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
2443387 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10198087 - 10197926
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| |||| ||||||| | |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10198087 |
ccaaattataagtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattataagtcgttttacaataccaatgaaacatcaatgttactttttctattatacccttg |
10197988 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10197987 |
act--atttattactttatcttctttcaattctttaatttatctttcccataacatttattaag |
10197926 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 15848638 - 15848799
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15848638 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttc |
15848737 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15848738 |
ac--tatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
15848799 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 38993499 - 38993665
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaata-tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38993499 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctt |
38993598 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38993599 |
aac--tattaattactc--tcttctttcaattatttcatttatattttccataccatttattaaggataat |
38993665 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30549835 - 30549671
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30549835 |
aattgtatgtcgttttggaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac- |
30549737 |
T |
|
| Q |
185 |
gtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30549736 |
-tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
30549671 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Original strand, 3870805 - 3870936
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttc |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
3870805 |
caaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctttgc--tatttattactctcttttctttcaattctttc |
3870902 |
T |
|
| Q |
218 |
atttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3870903 |
atttatctttcccatattatttattaaggataat |
3870936 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 4826306 - 4826465
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4826306 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttctaaattatacgtcgctttataatatcaataaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac |
4826405 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||||| | ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4826406 |
--tatttattattctctcttgtttcaattcatttatttaaccttctcatatcatttattaag |
4826465 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 12363633 - 12363800
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12363633 |
ccaaattgcatgtcactttggaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatacccttc |
12363732 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| || ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12363733 |
ac--tatttattgccttatctacttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
12363800 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 17399774 - 17399932
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17399774 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcttaaattatatgtagctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
17399872 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17399873 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
17399932 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 21288864 - 21289031
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21288864 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacggtaccaatgaaatattaatgttatttttcatattatatcctta |
21288963 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21288964 |
a--gtattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
21289031 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29432951 - 29432792
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29432951 |
ccaaattatatgtcgctttggaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
29432852 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| | |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29432851 |
ac--tattaattactatctcttcttttaattatttcatttatcttttccatatcatttatta |
29432792 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37111270 - 37111103
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||||| | ||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37111270 |
ccaaattgtatgtcgctttgggaaaaaaaattgtctcaaattacatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
37111171 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37111170 |
ac--tattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
37111103 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39958421 - 39958262
Alignment:
| Q |
90 |
tatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatt |
189 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39958421 |
tatgtcgctttggaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatccttaac--tatt |
39958324 |
T |
|
| Q |
190 |
tattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| |||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39958323 |
aattactttatcttctttcaattatatcatttattttttccatatcatttattaaggataat |
39958262 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40483663 - 40483505
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40483663 |
ccaaattgtacgtcgctttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
40483565 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
40483564 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
40483505 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 36173966 - 36174127
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
36173966 |
gttccaaattgtatgtcgctttggaaaaagaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatatt-tatcc |
36174064 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
36174065 |
ttaac--tattaattactctaccttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
36174127 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3376717 - 3376533
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| | | |||| |||||||||| || |
|
|
| T |
3376717 |
taatactctctccgtcccaaattgtacgtcactttagaaaaaaatatttgtcataaattgtatgtcgttttacaatatcgacgaaaaattaatgttattt |
3376618 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |
|
|
| T |
3376617 |
tttctattatatccttaac--aatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatattatttattgaggataat |
3376533 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 40649066 - 40649225
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40649066 |
caaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttca |
40649164 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||| | | ||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40649165 |
c--tatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
40649225 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18450198 - 18450100
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18450198 |
ccaaattgtatgtcactttgaaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatattacttttcctattatatcctt |
18450100 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Original strand, 29360780 - 29360922
Alignment:
| Q |
101 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
29360780 |
agaaaaaaaatttgtcccaaattaccggtcgctttacaataccaatgaaacattaattttactttttctattatatctttaac--tatttattactctct |
29360877 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29360878 |
attctttcaattttttcttttatctttcccatatcatttattaag |
29360922 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 37988215 - 37988361
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | |
|
|
| T |
37988215 |
aaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaac--tattaattactctcttt |
37988312 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37988313 |
tctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattaggtataat |
37988361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 242
Target Start/End: Original strand, 38448157 - 38448283
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
38448157 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatgttgtatccttaac--tatttattaccctctcttctttcaattc |
38448254 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38448255 |
cttcatttatctttcccatatcatttatt |
38448283 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 44421588 - 44421750
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
44421588 |
ccaaattgtatgttgctttaggagaaaaaatttgtcccgaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataacctt |
44421687 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
44421688 |
aa--ttaattattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
44421750 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19505900 - 19505740
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19505900 |
ccaaattgtatgtcgcttt-gaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaacgaagcattaatgttatttttcctattatatcctta |
19505802 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| | |||| || ||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
19505801 |
ac--tattttctactttctcttcttccaaatcattcatttatctttcctatatcatttactaag |
19505740 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Original strand, 28248499 - 28248629
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
28248499 |
tttgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaactttaatgttactttttctattatatccttaac--tatttattactc--tcttctttcaa |
28248594 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28248595 |
ttctttaatttatcttttccataccatttattaag |
28248629 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Original strand, 29513381 - 29513541
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
29513381 |
aaattgtatatcgctttagggaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttctattataacctta |
29513480 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
29513481 |
att--atttattaccctttcttctttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaa |
29513541 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30564218 - 30564086
Alignment:
| Q |
117 |
ccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| | | |
|
|
| T |
30564218 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaa--gtattaattactccctcttctttcaattatat |
30564121 |
T |
|
| Q |
217 |
catttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30564120 |
catttatcgtttccataccatttattaaggataat |
30564086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 8059826 - 8059984
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
8059826 |
caaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatt-gtcctaaattatatgtcgctttacaatacagatgcaacaacaatgttacttttcttattataaccttaa |
8059924 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8059925 |
tt--atttattactctctcttttttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaa |
8059984 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36598848 - 36598689
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36598848 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
36598749 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
36598748 |
ac--tattaaatactctctcttctttcaattatttcatttatattttccatactatttatta |
36598689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 200
Target Start/End: Original strand, 6312229 - 6312346
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6312229 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaaaaaattgtctcaaattgtatgtcactttacaataccgatgaaacattaatgttatttttgttattatatcctt |
6312328 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6312329 |
aac--tatttattactcttt |
6312346 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Original strand, 9110656 - 9110802
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaa---aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
9110656 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaagaaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatattc |
9110755 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9110756 |
ttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
9110802 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20925966 - 20925806
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | ||||| | || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20925966 |
ccaaattgtacgtcactttgggaaaaaaaattatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaacgttatttttcctattatattctta |
20925867 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | ||| || ||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20925866 |
ac--tatttattactttctctcattccaaatcattcatttatttttcccatgtcatttattaa |
20925806 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Original strand, 45423268 - 45423408
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
45423268 |
gaaaaaaaaattgtctcaaattatatgtctctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcttgttatctcctcaatt--atttattaatctttt |
45423365 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
45423366 |
ttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaa |
45423408 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11154509 - 11154347
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
11154509 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttaacttaaattatatgtcactttacaataccaatacaacattaatgttactttttctgttataatctt |
11154410 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11154409 |
aatt--atttattaccctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
11154347 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Original strand, 44195607 - 44195737
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcacttt-agaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaatt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
44195607 |
gtcccaaattatatgtcgcttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--catttattactatctcttctttcaatt |
44195704 |
T |
|
| Q |
213 |
ctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44195705 |
ctttcatttatatttcccatattatttattaag |
44195737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44653699 - 44653614
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44653699 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatattgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
44653614 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12208407 - 12208246
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt-cctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12208407 |
aaattgtacgtcgctttaggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaatgccaatgcaacgttaatgatattttttcctattataacctta |
12208308 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12208307 |
att--atttattactctctcttctttcaattcttttatttatctttctcatatcatttattaag |
12208246 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 14834054 - 14834173
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc--tttcc |
229 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
14834054 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttttc |
14834151 |
T |
|
| Q |
230 |
cataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14834152 |
cataccatttattaaggataat |
14834173 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33677397 - 33677244
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33677397 |
ccaaattgtatgtcgctttgcaaaaaaa--ttggcctaaattatatgtcgctttacaatactgatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
33677300 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
33677299 |
a--ttatttattactc--tcttctttcaatgctttaatttatctttctcataccatttat |
33677244 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 1780304 - 1780404
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1780304 |
aaattgtatgtccctttatgaaaaaaatttgtcccaaatcatatgtcgctttaaaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac |
1780403 |
T |
|
| Q |
184 |
t |
184 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
1780404 |
t |
1780404 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Original strand, 9053523 - 9053698
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
9053523 |
taatactctctccgtcccaaattgtatgtcgcttt-gaaaaaaaatattatcttaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttattt |
9053621 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9053622 |
tttctattttatccttaac--tattaattactctctcttctttcaattaatttatttatcttttccataccatttatta |
9053698 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35155759 - 35155637
Alignment:
| Q |
120 |
aattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcat |
219 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | | |||| |||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35155759 |
aattatatgtcactttacaataccaatgacgcataattgttacttttccaattatatcccttattag-tttactactctatcttttttcaattctttaat |
35155661 |
T |
|
| Q |
220 |
ttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35155660 |
ttatctttcccataacatttatta |
35155637 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40346525 - 40346408
Alignment:
| Q |
64 |
agtaatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttact |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
40346525 |
agtaatactccctctattctaaattgtatgtcattttagaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatattact |
40346427 |
T |
|
| Q |
164 |
tttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40346426 |
ttttctattatatacttaa |
40346408 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 241
Target Start/End: Original strand, 39293410 - 39293516
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | | | | ||||||||||||||| |||||||| || ||| |
|
|
| T |
39293410 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaac--tatttatcattatatattttttcaattctttaatttatctctctcat |
39293507 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttat |
241 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
39293508 |
aacatttat |
39293516 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Original strand, 25556919 - 25557024
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
25556919 |
aatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaatt--atttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttatta |
25557016 |
T |
|
| Q |
244 |
agtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
25557017 |
aggataat |
25557024 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 30803451 - 30803575
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
30803451 |
ccaaattgtatttcgttttaggaaaaaaatt-gtcacaaattgttagtcactttacaataccaatgaaacattaatattactttttctattatatcttta |
30803549 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
30803550 |
ac--tatttattactcgttcttctttca |
30803575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 43681121 - 43681238
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc-ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43681121 |
tttacaataccaatataacattagtgttatttttttctattataaccttaact--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttccca |
43681218 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43681219 |
tgttatttattaaggataat |
43681238 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 241
Target Start/End: Original strand, 4553354 - 4553490
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
4553354 |
aaaaaaaaattgtcacaaattatatgtcattttacaataccattgaaacaataatgttgcttttcttattatatccttaa--ttatttattattctctct |
4553451 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
4553452 |
tctttcaattctttaatatatttttcacataccatttat |
4553490 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5443908 - 5443769
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| | | || |
|
|
| T |
5443908 |
aaaaatatttgttttaaattatatgtcgttttacaatatcaatgtaatattaatgttattttttctattatatctttaact--atttattactatctatt |
5443811 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5443810 |
ctttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaag |
5443769 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Original strand, 15269563 - 15269674
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta-tatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15269563 |
tttacaataccaaaaaaacattaatgttacttttcatattactatccttagct--atttattactctatcttctttcaattctttcatttctctttctca |
15269660 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||| |
|
|
| T |
15269661 |
taccattttttaag |
15269674 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 182
Target Start/End: Original strand, 30903563 - 30903677
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30903563 |
atactctctctgttccaaattatatgtcgttttgagaaaaatatttgtctcaaattatatatcactttataatatcaacgaagcattaatgttacttttc |
30903662 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |
|
|
| T |
30903663 |
ttattatatctttaa |
30903677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43257479 - 43257380
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43257479 |
aatgaaatattaatgttacttttcttattatatcattaatt--atttattactttttcttctttcaattcttttatttatttttcccatataatttatta |
43257382 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Original strand, 44987728 - 44987826
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtca-ctttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
44987728 |
caaattgtatgtaaactttggaaaaaaaaattgtctcaaattgtatgtcacattacaataccaatgaatcattaatgttactttttttattatatcctt |
44987826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Original strand, 27525032 - 27525130
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacat |
237 |
Q |
| |
|
|||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
27525032 |
aatatcaatcaagcattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctttcttcttttaattctttaaattatcctttccatatcat |
27525129 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42801115 - 42801012
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacat |
237 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||| |
|
|
| T |
42801115 |
aatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattataacttta---ctatttattactctatcttatttcaatcctttcatttatctatcatatatcat |
42801019 |
T |
|
| Q |
238 |
ttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
42801018 |
ttattaa |
42801012 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12123117 - 12122978
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||| || ||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12123117 |
gaaaaaaaaattgtcctaaattatacgtcgttttataatatcaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaac--tatttattactctcca |
12123020 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
12123019 |
ttctttcaatt-tttaatttatctttcacataccatttattaa |
12122978 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4898397 - 4898311
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4898397 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaagtatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4898311 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4945791 - 4945705
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4945791 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaagtatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4945705 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9936780 - 9936685
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9936780 |
aatgaaatattaatgttacttttcagattatatccttaac--tatttattactttctctttttctaagtcattcatttatctttcccatatcatttat |
9936685 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 13196408 - 13196532
Alignment:
| Q |
115 |
tcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattct |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
13196408 |
tcccaaattatatatcattttacaataccaatgaaacattaatattattttttctattatatgcttaa--ttatttattactctt--ttatttcaattct |
13196503 |
T |
|
| Q |
215 |
ttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
13196504 |
ataatttatctttttcataccatttatta |
13196532 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Original strand, 42695616 - 42695747
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| |||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
42695616 |
ttgtccaaaattataaatcattttacaataacattgaaacattaatgttattttttatattatatcattaact--atttattactcaatccattttcaat |
42695713 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42695714 |
tatttaatttatctttctcataacatttattaag |
42695747 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 229
Target Start/End: Original strand, 21884345 - 21884427
Alignment:
| Q |
145 |
atgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
21884345 |
atgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaac--tatttattagtctctcttctttcaattctttcttttatttttcc |
21884427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36174595 - 36174528
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36174595 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaacatt-atgttatttttcctattatatccttaa |
36174528 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 40171843 - 40171895
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40171843 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatatcactt |
40171895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2893961 - 2893869
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2893961 |
ctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaac--tatttactactc--tcttctttcaa-tccttcatttatctttcc |
2893869 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15041156 - 15041068
Alignment:
| Q |
155 |
aatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15041156 |
aatgatacttttcatattatatcattaact--atttattactctctcttctttcaattctttgatttatctttctgataccatttattaag |
15041068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 7669656 - 7669734
Alignment:
| Q |
98 |
tttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7669656 |
tttagaaaaaatatttgtcataaattatatgtcgttttacaatatcgatgaaacattaatgctacttttcctattatat |
7669734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Original strand, 44019766 - 44019837
Alignment:
| Q |
113 |
tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44019766 |
tgtccaaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatctttaact |
44019837 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 180
Target Start/End: Original strand, 22060704 - 22060758
Alignment:
| Q |
126 |
atgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22060704 |
atgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcttattatatcctt |
22060758 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4898162 - 4898088
Alignment:
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
4898162 |
tattataaccttaact--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatcctttacatattatttattaag |
4898088 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4945556 - 4945482
Alignment:
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
4945556 |
tattataaccttaact--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatcctttacatattatttattaag |
4945482 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Original strand, 14723837 - 14723886
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttact |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14723837 |
gtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaatattaatgttact |
14723886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35020354 - 35020305
Alignment:
| Q |
131 |
actttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35020354 |
actttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatcctt |
35020305 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45383560 - 45383466
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttac-ttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | || || | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45383560 |
ctttacaataccaatgaagcattaatgttacttttttctattatatccttaa--ttatttattgccctctcatatttcaattctttaatttatcttt |
45383466 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 7669762 - 7669821
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7669762 |
tatttattactttttcttctttcaattctttcattcttatttcccatatcatttattaag |
7669821 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 8001601 - 8001689
Alignment:
| Q |
154 |
taatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| || | ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8001601 |
taatgttatttttcttattatgtccttaattgt--ttctcactctatattttttcaatttttttatttatctttcccatatcatttattaa |
8001689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13995456 - 13995380
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcattta |
222 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13995456 |
aatgaagcattaatgttatttttcctattatattattaac--tatttattactcgctcatctttcaattctttcattta |
13995380 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 165
Target Start/End: Original strand, 27862702 - 27862791
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcacttt---agaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27862702 |
gttccaaactgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaacaataccaatgcaacattaatgttacttt |
27862791 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 38445836 - 38445875
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38445836 |
caaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaat |
38445875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 212
Target Start/End: Original strand, 12598269 - 12598367
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
12598269 |
tttgtcacaaattatatatcactttacaataccaataaaatattaatgttatttttc-tatcatatatttaactgt--ttattactctctcttctttcaa |
12598365 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 228
Target Start/End: Original strand, 12465626 - 12465705
Alignment:
| Q |
146 |
tgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12465626 |
tgaaacattaatatttttttttttattatatctttaa---tatttattactctctcgtttttcaattctttaatttatctttc |
12465705 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 181
Target Start/End: Original strand, 8983447 - 8983514
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8983447 |
gtcccaaattatatgttgctttacaataccaacaaaaaattaatgttatttttcatattatatcctta |
8983514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 28464197 - 28464290
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28464197 |
aaattataagtcgctttacaatatcaatgaagtattaatgttatttttcatattattttcttaact--atttattactct--cttttttcaattcttt |
28464290 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36602185 - 36602135
Alignment:
| Q |
195 |
ctctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36602185 |
ctcttccttttttcaattctttaatttatctttttcatatcatttattaag |
36602135 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 251
Target Start/End: Original strand, 4079804 - 4079869
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| || || | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4079804 |
tatttattactctctcttctttcaattcatttatctgtcttttccatatcatttattaagaataat |
4079869 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Original strand, 11825480 - 11825547
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatt |
172 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11825480 |
aaaaaaatttgtcccaaatt-taagtcgctttacaatttcaatgaagcattaatgttacttttcttatt |
11825547 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13197105 - 13196976
Alignment:
| Q |
113 |
tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaatt |
212 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
13197105 |
tgtctcaaattatatatcgctttacaataccaattaaacattaatgatattttttttattatattattaa--ttatttattactctctcttcttttaatt |
13197008 |
T |
|
| Q |
213 |
ctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||| || ||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
13197007 |
ttttaatatatctttttcgtaccatttattaa |
13196976 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33713692 - 33713581
Alignment:
| Q |
70 |
actctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
169 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
33713692 |
actctctccgtttcaaattatatgtcgctttggaaaaaaa---tgtctcaaattatatgtcgttttacaataccagtgaagaattaatgttactttttct |
33713596 |
T |
|
| Q |
170 |
attatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| |
|
|
| T |
33713595 |
attaaatcgttaact |
33713581 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36888084 - 36888024
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactct-ttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
36888084 |
tatttattactttatttttttttcaattctttaatttatctatcccttaccatttattaag |
36888024 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 232
Target Start/End: Original strand, 38766216 - 38766306
Alignment:
| Q |
139 |
ataccaatgaaacattaa-tgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
38766216 |
ataccaatgaagcatcaaatgttacttttcctattatacccctaac--tatttattgatc--tcttctttcaattctttaatttatttttcccat |
38766306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 43257527 - 43257499
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaa |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43257527 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaa |
43257499 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0427 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:
Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 5246 - 5411
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5246 |
aaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
5345 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5346 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
5411 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 190)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 251
Target Start/End: Original strand, 22578197 - 22578385
Alignment:
| Q |
61 |
tatagtaatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtt |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22578197 |
tatagtaatactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtt |
22578296 |
T |
|
| Q |
161 |
acttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22578297 |
acttttcctattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccaatataatttattaaggataat |
22578385 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 18673383 - 18673548
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18673383 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaac |
18673482 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18673483 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
18673548 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38896727 - 38896560
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38896727 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
38896628 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38896627 |
ac--tatttattactctttattttttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaaggataat |
38896560 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 19715240 - 19715407
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19715240 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
19715339 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19715340 |
a--ttatttattactatttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
19715407 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 35631040 - 35631207
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35631040 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcatta |
35631139 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35631140 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
35631207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20091244 - 20091089
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20091244 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
20091145 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattt |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20091144 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattttttcatttatctttcccatatcattt |
20091089 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Original strand, 30851971 - 30852154
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
30851971 |
taatactctatctgtcctaaattgtatgtcactttaaaaaaattatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttt |
30852070 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30852071 |
tcctattatatccttaac--tatttattactctttaatctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
30852154 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 36652447 - 36652614
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36652447 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatttatgttacttttcctattatatcctta |
36652546 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36652547 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattcttttacttatctttcccatatcatttattaaggataat |
36652614 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21583005 - 21582825
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21583005 |
aatactctctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttagtttt |
21582906 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21582905 |
cctattatatccttaac--tattta-tactctttcgtttttcaattctttcatttatctttcccat-acatttattaaggataat |
21582825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 42927130 - 42927295
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42927130 |
aaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac |
42927229 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42927230 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatttcatttattaaggataat |
42927295 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 1042385 - 1042550
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1042385 |
aaattatatgtcactttagaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctgttatatccttaac |
1042484 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1042485 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccaatatcatttattaaggataat |
1042550 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 13429081 - 13429242
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13429081 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatcctta |
13429180 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13429181 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatatattaag |
13429242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 34908692 - 34908861
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaa-aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34908692 |
ccaaattgtatgtcactttaaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctt |
34908791 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttc-ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34908792 |
aac--tatttattactctttctttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
34908861 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41541261 - 41541088
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
41541261 |
tactccatccgtcccaaattgaatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacataaatgttaaatttca |
41541162 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41541161 |
tattatatcattaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaa |
41541088 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39169061 - 39168900
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39169061 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattc |
39168962 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
39168961 |
ttaac--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatataatttatt |
39168900 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42192495 - 42192326
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42192495 |
ccaaattgtatatcactttagaaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
42192396 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactcttt-cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42192395 |
aac--tatttattactctttatttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
42192326 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 12000493 - 12000632
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
12000493 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatcatta |
12000592 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12000593 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
12000632 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7427438 - 7427280
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7427438 |
ccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
7427339 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7427338 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
7427280 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 27667502 - 27667648
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27667502 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac--tatttaatactctttct |
27667599 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27667600 |
tttttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaaggataat |
27667648 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42946688 - 42946530
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42946688 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
42946589 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
42946588 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
42946530 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32629878 - 32629694
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32629878 |
taatactctctccgtcccaaattgtatgttactttaaaaaaaatatttgttctaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttatttt |
32629779 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttc-ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32629778 |
ttctattatatccttaac--tatttattactctttctttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
32629694 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14433417 - 14433250
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14433417 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
14433318 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
14433317 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
14433250 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31873688 - 31873521
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31873688 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
31873589 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
31873588 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
31873521 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 5830955 - 5831113
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
5830955 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattttatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccata |
5831054 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5831055 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
5831113 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9268071 - 9267913
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9268071 |
ccaaactgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
9267972 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9267971 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
9267913 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16872629 - 16872467
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16872629 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctt |
16872530 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16872529 |
aa--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcacatatcatttattaag |
16872467 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 251
Target Start/End: Original strand, 24616515 - 24616694
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24616515 |
atactccatccgtcccaaattgtatgccattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttc |
24616614 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24616615 |
ctattgtatccttaac--tatttatta--ctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
24616694 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13779854 - 13779682
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13779854 |
atactccatccgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttc |
13779755 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13779754 |
c---tatatcattaac--tattttttactctttcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaag |
13779682 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18203287 - 18203126
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18203287 |
ccaaattgtatgtcactttacaaaaataatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
18203188 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18203187 |
a--ttatttattactttttcttatttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaag |
18203126 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28074530 - 28074381
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28074530 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataacctta |
28074431 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28074430 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccata |
28074381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37965103 - 37964938
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37965103 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaaaaattgttccaaattgtatatcactttacaatactaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaac |
37965004 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37965003 |
--tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
37964938 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 6796111 - 6796274
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
6796111 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatctt |
6796210 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6796211 |
taac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatatttcccatatcatttattaag |
6796274 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 6878525 - 6878692
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6878525 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaacatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatcctta |
6878624 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
6878625 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgattataat |
6878692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 23606196 - 23606354
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23606196 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatcctta |
23606295 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
23606296 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttatt |
23606354 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 29938303 - 29938461
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29938303 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
29938402 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
29938403 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatattatttatt |
29938461 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30087996 - 30087838
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30087996 |
ccaaattgtacgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
30087897 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
30087896 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatatcatttatt |
30087838 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35544261 - 35544103
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35544261 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatttcctta |
35544162 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
35544161 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttatt |
35544103 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25838741 - 25838580
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25838741 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataacctta |
25838642 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25838641 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccatattatttattaag |
25838580 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37954744 - 37954579
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37954744 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacactacaaatgaaatattaatgttaccttttctattatatccttaa- |
37954646 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37954645 |
-ttatttattattctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
37954579 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 30526172 - 30526328
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30526172 |
aaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
30526271 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
30526272 |
--aatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
30526328 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 24333023 - 24333182
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
24333023 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgacccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattttaaccttaac |
24333122 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24333123 |
--tatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaag |
24333182 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 37505000 - 37505135
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37505000 |
gtcccaaattgtatgtcactttataatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattc |
37505097 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37505098 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
37505135 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37665001 - 37664842
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37665001 |
aaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcataaattgtatatcactttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
37664902 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37664901 |
--tatttattactctttcttctttcaattttttcatttatctttctcatatcatttattaag |
37664842 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39645977 - 39645810
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39645977 |
ccaaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatcctta |
39645878 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
39645877 |
ac--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
39645810 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 11714451 - 11714609
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11714451 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttc |
11714550 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11714551 |
ac--tatttattactttatcttatttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
11714609 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 39284209 - 39284367
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39284209 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcatta |
39284308 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
39284309 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatataatttatt |
39284367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 600319 - 600158
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
600319 |
ccaaattgtacgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatcctta |
600220 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
600219 |
ac--tatttattactccatcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattaag |
600158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 29949110 - 29949259
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29949110 |
ccaaattgtatatcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
29949209 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29949210 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccata |
29949259 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2099232 - 2099084
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2099232 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
2099133 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2099132 |
ac--tatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttcccat |
2099084 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 4135701 - 4135861
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
4135701 |
caaattgtatgtcactttagaaaaataatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccagtgaaacattaatgttattttttctattatatcattaa |
4135800 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4135801 |
--ttatttattactctttcttttttcaattcttttatttatttttcccatatcatttattaag |
4135861 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42373275 - 42373110
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42373275 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatcctta |
42373176 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
42373175 |
ac--tatttattactc--tcttatttcaattcattcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
42373110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22453587 - 22453425
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22453587 |
gttccaaattgtatgtcactttaaaaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgagaaattaatgttacttttcctattatatc |
22453488 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
22453487 |
cttaac--tatttattactctctcttatttcaattccttcatttatcttttccatatcatttatt |
22453425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 23897695 - 23897860
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23897695 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac |
23897794 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23897795 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataat |
23897860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 28848969 - 28849136
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28848969 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
28849068 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28849069 |
ac--tattaattaccatctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataat |
28849136 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34141685 - 34141519
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34141685 |
ccaaattgtatgttactttagacaaaa-atttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttgtttttcctattatatcctta |
34141587 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34141586 |
ac--tatttattactctttattctttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
34141519 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 5371554 - 5371720
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
5371554 |
caaattgtatgtcatttttgaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattataactttaa |
5371653 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5371654 |
c--tatttattactctctattctttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaaggataat |
5371720 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32395305 - 32395147
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32395305 |
ccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
32395206 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
32395205 |
a--ttatttattactctattttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
32395147 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Original strand, 1953279 - 1953452
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1953279 |
tctgtcccaaattgtatatcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattata |
1953378 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1953379 |
tccttaac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
1953452 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8378358 - 8378197
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8378358 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaaaattgtctcaaattatacgccgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattctt |
8378259 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8378258 |
aact--atttattactctttcttttttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattaa |
8378197 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Original strand, 24450524 - 24450697
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
24450524 |
tctgttctaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgttttaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttcgattata |
24450623 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24450624 |
tccttaa--gtatttattactctttcttccttcaattctttcatttatttttctcgaatcatttattaaggataat |
24450697 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 29342719 - 29342880
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29342719 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
29342818 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29342819 |
ac--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatttttcccatgttatttattaag |
29342880 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31231141 - 31231000
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31231141 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcgtattatatccttaac |
31231042 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31231041 |
--tatttattactctcttttctttcaattccttcatttatcttt |
31231000 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 251
Target Start/End: Original strand, 5665667 - 5665851
Alignment:
| Q |
65 |
gtaatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5665667 |
gtaatactctctccgtcccaaattatatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccgatgaaatattaatgttactt |
5665766 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5665767 |
ttactattatatccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
5665851 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24422578 - 24422413
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24422578 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatcctta |
24422479 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
24422478 |
ac--tatttattactc--tctcctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
24422413 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 26746843 - 26747002
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26746843 |
aaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatattattttttctattatatccttaac |
26746942 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26746943 |
--tatttattactttttttttttccaattccttcatttatttttcccatatcatttattaag |
26747002 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38367675 - 38367540
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
38367675 |
gtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaac--tatttattactttttcttttttcaattc |
38367578 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
38367577 |
tttcatttatctttcctatatcattttttaaggataat |
38367540 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 9724596 - 9724758
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9724596 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
9724695 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9724696 |
aa--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
9724758 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 40483737 - 40483883
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40483737 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtctgctactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatc |
40483836 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40483837 |
ttaac--tatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatcttt |
40483883 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12113623 - 12113456
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12113623 |
taatactccttccgttctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaatatcagtgaaaaattaatgttacttt |
12113524 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12113523 |
tcctattatatcc-------tatttattactctt--ttttttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
12113456 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30597315 - 30597155
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30597315 |
aaattgtatgtcattttagaaaaaaatatttatcctaaattgtatgtcgctttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcatattatatccttaa |
30597216 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30597215 |
c--tatttattactctgtcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaag |
30597155 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 1366759 - 1366926
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1366759 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
1366858 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1366859 |
ac--tattaattattccttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
1366926 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16862017 - 16861850
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16862017 |
ccaaattgtatgttgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatattcttg |
16861918 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16861917 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataat |
16861850 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 28868735 - 28868901
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28868735 |
ccaaattgtatgtg-ctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
28868833 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28868834 |
ac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatctatcttttccataccatttattaaggataat |
28868901 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37163802 - 37163643
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37163802 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
37163703 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37163702 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
37163643 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40325591 - 40325432
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40325591 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
40325492 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40325491 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccatatcatttatta |
40325432 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44023673 - 44023515
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44023673 |
caaattgtacgtcgctttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaa |
44023574 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44023573 |
c--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
44023515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 9470820 - 9470981
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9470820 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
9470919 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
9470920 |
a--ttatttattaccctctcttctttcaattctttcatttatctttcctatattatttattaag |
9470981 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Original strand, 26513704 - 26513860
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26513704 |
aaattgtatgtcgcttt-gaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaac |
26513802 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26513803 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
26513860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 38044929 - 38045094
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38044929 |
aaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac |
38045028 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38045029 |
--tattaattactctattttctttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
38045094 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 42981204 - 42981364
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga--aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
42981204 |
ccaaattgtatctcactttagagaaaaaatatttgttctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcat |
42981303 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
42981304 |
taac--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttatt |
42981364 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 899629 - 899474
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
899629 |
aaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacagtaccaatgaaaaattaatgttatttttcttattatatcattaac |
899530 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
899529 |
--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccttatcatttat |
899474 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 4174548 - 4174715
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4174548 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttttcctattatatcctta |
4174647 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4174648 |
ac--tattaattactctctcttctttcaaatatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
4174715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26805093 - 26804926
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26805093 |
ccaaattgtatgtcgttttagggaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
26804994 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26804993 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
26804926 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 31692747 - 31692905
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31692747 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
31692845 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31692846 |
--tctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
31692905 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 33012076 - 33012235
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33012076 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatttggccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
33012175 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33012176 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
33012235 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38194735 - 38194568
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38194735 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtaacttttcctattatatcctta |
38194636 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38194635 |
ac--tattaattactcttttttctttcaattattttatttatcctttccataccatttattaaggataat |
38194568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 43564599 - 43564765
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43564599 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaataaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
43564697 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43564698 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaagaataat |
43564765 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4631207 - 4631049
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
4631207 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcttattatatcatta |
4631108 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
4631107 |
ac--tatttattactctatcttctttcttttcatttatttatctttctcatatcatttatt |
4631049 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11589062 - 11588924
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11589062 |
ccaaactgtatgtcattttaggaaaaaaaattgtcacaaattatatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatcatta |
11588963 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcattta |
222 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11588962 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattctttcattta |
11588924 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31602983 - 31602821
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31602983 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
31602884 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31602883 |
aac--tatttattactatctcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaag |
31602821 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6010381 - 6010221
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6010381 |
ccaaattgtatgtcatttt-gaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgttttagaataccaataaatcattaatgttacttttcctattatatcctta |
6010283 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | ||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6010282 |
ac--tatttattactttctctccttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
6010221 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 242
Target Start/End: Original strand, 24612850 - 24613015
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttac-ttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
24612850 |
tctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttcatattat |
24612949 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
24612950 |
atcattaac--tatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttcttatatcatttatt |
24613015 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 29867270 - 29867431
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29867270 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgttgcttttaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
29867369 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29867370 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
29867431 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12988251 - 12988089
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12988251 |
ccaaattgtatgtcgttttagggaaaaaat-tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacct |
12988153 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12988152 |
tagc--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
12988089 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14810126 - 14809979
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
14810126 |
gaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatcaatgttacttttcctattatatccttagc--tatttattactctctc |
14810029 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14810028 |
ttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
14809979 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 15225853 - 15226019
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
15225853 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattaaatcatta |
15225951 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15225952 |
ac--tattaattactctctcttgtttcaattatttcatttatattttccataccatttattaaggataat |
15226019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 34356527 - 34356694
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34356527 |
ccaaattgtatgtcgccttagggaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatacaacattaatgttacttttcctattataacctta |
34356626 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34356627 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttctcttttccatattatttattaaggataat |
34356694 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 596955 - 597112
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
596955 |
ccaaattgtatgtcagtttataaaaaatatttgtcccaaaatatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atgttacttttcctattatatcctta |
597053 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
597054 |
a--tcatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcaattatt |
597112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5449587 - 5449409
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| || |
|
|
| T |
5449587 |
taatactccctccgttccaaattgtatgtcgctttagggaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaattttaatgttattt |
5449488 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5449487 |
ttcctattataatcttaac--tatttattactctctcttcttccaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
5449409 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17524844 - 17524682
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17524844 |
gttccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacgataccaatgaaatattaatgttacttttcatattatatcc |
17524745 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
17524744 |
ttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
17524682 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26394089 - 26393927
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26394089 |
ccaaattgtatgtcgctttaggggaaaatttttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
26393990 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
26393989 |
aac--tatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcacatgttatttattaag |
26393927 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 39628854 - 39629016
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
39628854 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacttt |
39628953 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39628954 |
a--gttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
39629016 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 39638404 - 39638566
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
39638404 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacttt |
39638503 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39638504 |
a--gttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
39638566 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4395533 - 4395373
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
4395533 |
ccaaattgtatgtcgctttagtgaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattatat-cata |
4395435 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4395434 |
ac--tatatattactctctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
4395373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41256467 - 41256302
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41256467 |
aaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac |
41256368 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41256367 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttattaaggataat |
41256302 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17949706 - 17949538
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17949706 |
ccaaattgtatgtcgctttagcgaaaaaaagttgtctcaaattatatgtcgctttacggtaccaatgaaatattaatgttacttttcctattataacctt |
17949607 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17949606 |
aact--atttattactccttcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
17949538 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 16421873 - 16422034
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16421873 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttc |
16421972 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctt-tcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| ||| || ||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16421973 |
ac--tatttatt-gtcttctctacttccaagtcgttcatttatttttcccatatcatttattaag |
16422034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 245
Target Start/End: Original strand, 44052880 - 44053046
Alignment:
| Q |
78 |
tgttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44052880 |
tgttccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaacattaatgttactttttctattataa |
44052979 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44052980 |
ccttagtt--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
44053046 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44263376 - 44263214
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
44263376 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgcaactttaatgttatttttcgtattataacctt |
44263277 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44263276 |
cac--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
44263214 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1513564 - 1513443
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
1513564 |
atttgtcccaaattatatgccgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaac--tatttattactctatcttctttca |
1513467 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1513466 |
attctttcatttatctttcccata |
1513443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7884555 - 7884398
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7884555 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaac |
7884456 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | | || ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7884455 |
--tattaattactttcttttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
7884398 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Original strand, 9267650 - 9267798
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9267650 |
aattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaaattgtcataaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaa |
9267749 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9267750 |
--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccata |
9267798 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Original strand, 21545296 - 21545429
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
21545296 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactatctcttctttca |
21545393 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21545394 |
attatttcatttatctttcccatgttatttattaag |
21545429 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 27421234 - 27421395
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
27421234 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaagctgtcccaaattatatgccgctttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcttattatatcttta |
27421333 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27421334 |
ac--tatttattactctatcttatttcaattatttaatttatctttttcataccatttattaag |
27421395 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Original strand, 17911008 - 17911131
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17911008 |
aaattgtatgtcactt-acaataccaatgaaacattaatgttaatttttctattatattcttaatt--atttattactctttcttctttcaattctttca |
17911104 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17911105 |
tttatctttctcatatcatttattaag |
17911131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 18526346 - 18526512
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18526346 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcatta |
18526445 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
18526446 |
ac--tattaattactctatcttctttcaattatatcatttatcttttccatacca-ttattaaggataat |
18526512 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43537076 - 43536917
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43537076 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgttccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttccgattatatcctta |
43536977 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
43536976 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
43536917 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 45439526 - 45439695
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45439526 |
ccaaattgtatgtcgcttcggaaaaaa-atttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgtaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
45439624 |
T |
|
| Q |
182 |
act-gtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| || || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
45439625 |
actattaatttttactctctcttctttcaattatttcatttatctttctcatatcattcattaaggataat |
45439695 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 167314 - 167461
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatg--aaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
167314 |
ccaaattgtatgacacttta-aaaaaatat--gtcttaaattgtatgtcactttacaataccaatataaaacattaatgttatttttcctattatatcct |
167410 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
167411 |
taac--tatttattactctttcttctttcaattc-ttcatttatctttctcata |
167461 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3598910 - 3598749
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
3598910 |
caaattgtatgtcgttttagggaaaaatatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatattatttttcttattataacctta |
3598811 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3598810 |
ac--tatttattactctatcttctttcaattctttcatttattttttccatattatttattaag |
3598749 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Original strand, 38450969 - 38451126
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38450969 |
aaattgtatgtcgctttagaaaaaaagattgtcttaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaa- |
38451067 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
38451068 |
-ttattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatatatta |
38451126 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 40488153 - 40488311
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40488153 |
ccaaattgtatgtcactttagggaaaaaata---gacccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacct |
40488249 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40488250 |
taac--gatttattactc--tcttctttcaattctttcatttatctttctcataatatttattaag |
40488311 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42827754 - 42827594
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42827754 |
ccaaattgtatgtcgctttagagaattttttttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgctacgtttcctattataacctt |
42827655 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42827654 |
agc--tatttattactc--tcttatttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
42827594 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2120529 - 2120367
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2120529 |
ccaaattgtatgtcgctttagaggaaaaaatttgtcccaaattatacgttgttttacaatgtcaatgcaacattaatgttacttttcctattataatctt |
2120430 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
2120429 |
aactgt--ttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcacatattatttattaag |
2120367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 11181255 - 11181416
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11181255 |
ccaaattgtatgtcgttttaggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacgatatcaatgcaactttaatgttacttttcctattataacctt |
11181354 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
11181355 |
aac--tatttattactctctcttatttcaattatttcatttatttttctcatattatttattaa |
11181416 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Original strand, 6247649 - 6247789
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
6247649 |
aaaaaaaaattgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtccttaac--tatttattacttttttt |
6247746 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6247747 |
tctttcaattccttcatttatctttcccatataatttattaag |
6247789 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9792335 - 9792192
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9792335 |
ccaaattgtatgttaccttagaaaaaa-atttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatattactttttctattatatcctta |
9792237 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
9792236 |
a--atatttattactctatcttctttcaactccttcatttatctttc |
9792192 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 251
Target Start/End: Original strand, 45186944 - 45187092
Alignment:
| Q |
101 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| | ||||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
45186944 |
agaaaaaaaaattgttctaaattatatgtcgctttacagtaccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaac--tattaattactccct |
45187041 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45187042 |
cttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
45187092 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 4924418 - 4924579
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga--aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | || |
|
|
| T |
4924418 |
caaattgtatgtcgctttagatgaaaaat-tttgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttccaattataacttt |
4924516 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
4924517 |
aac--tatttattattatctcttctttcaattttttcatttatctttctcatattatttattaag |
4924579 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Original strand, 16998903 - 16998997
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16998903 |
gttccaaattgtacgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcactttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatatta |
16998997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Original strand, 28719725 - 28719856
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
28719725 |
ttgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgatt--atttattactctctcttctttcaat |
28719822 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28719823 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaag |
28719856 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 4393922 - 4394068
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |
|
|
| T |
4393922 |
aaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcttattatatccttaac--tattaattcctctctct |
4394019 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4394020 |
tctttcgattatttcatttatctttctcatactatttattaaggataat |
4394068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14584844 - 14584714
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
14584844 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac--tattaattactctcttttctttcaattatttca |
14584747 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14584746 |
tttatcttttccatacaatttattaaggataat |
14584714 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 245
Target Start/End: Original strand, 36514169 - 36514283
Alignment:
| Q |
129 |
tcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
36514169 |
tcactttacaattacaatgaaacattaatttttcttttcttattatatccttaact--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatatttc |
36514266 |
T |
|
| Q |
229 |
ccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36514267 |
tcatatcatttattaag |
36514283 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27919694 - 27919533
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27919694 |
ccaaattgtatgtcactttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcatt- |
27919596 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||| | | ||| || ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27919595 |
-cattatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttcacatatcatttattaag |
27919533 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 29440877 - 29441038
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29440877 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaagcattaatattatttttcctattatatcctta |
29440976 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| | |||| || ||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
29440977 |
ac--cattttctactttctcttcttccaagtcattcatttatctttcctatatcatttactaag |
29441038 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 8737987 - 8738146
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
8737987 |
ccaaattatatgtca-tttcgaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttgcttttcctattatatctttt |
8738085 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| |||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8738086 |
ac--tatttattgccttctctactttcaagtcatttatttatcttttccatatcatttattaa |
8738146 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 161
Target Start/End: Original strand, 23597274 - 23597353
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtta |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23597274 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgtta |
23597353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37954439 - 37954271
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| || ||||| | ||||| |||||| || ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37954439 |
ccaaattgtatgccgctttggagaaaaaaaattgtctcaaattatacgtcgctttacaataccgatgaaatattaatgttatttttcctattatattctt |
37954340 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37954339 |
aac--tattaattactctcgcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
37954271 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 3457058 - 3457199
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
3457058 |
aaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac-------attactctctct |
3457150 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3457151 |
tctttcaattatttcatttattttttccatactatttattaagaataat |
3457199 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 28712378 - 28712497
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
28712378 |
ttgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgatt--atttattactctctcttctttcaat |
28712475 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28712476 |
tctttcatttatctttcccata |
28712497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 28727367 - 28727486
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
28727367 |
ttgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgatt--atttattactctctcttctttcaat |
28727464 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28727465 |
tctttcatttatctttcccata |
28727486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40734967 - 40734802
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| |||| | | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40734967 |
ccaaattgtacgtcgctttagggaaaaaaatggtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataacctta |
40734868 |
T |
|
| Q |
182 |
ac--tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| | |||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40734867 |
actatttattgtttttttttttttttttcaattcattcatttatctttcccatattatttattaag |
40734802 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 548225 - 548131
Alignment:
| Q |
149 |
aacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
548225 |
aacattaatgttacttttcctattataaccttaact--atttattactctatcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaag |
548131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37391004 - 37390840
Alignment:
| Q |
87 |
ttgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat----ccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37391004 |
ttgtatgtcattttaaaaaaaatatttggcatagattatatgtc--tttacaataccaatgaaacattaacgttactttttctattatatatatccttaa |
37390907 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
37390906 |
ct--atttattactcttttttctttcaattatttcatttatctttctcatatcatttatgaaggataat |
37390840 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42159257 - 42159119
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| | ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42159257 |
aaaaaatatttatctcaaagtacatgtcgctttacaatatcaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaatt--atttattagtctttct |
42159160 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
42159159 |
tctttcaattttttcatttatctttcccatataatttatta |
42159119 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2031658 - 2031497
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
2031658 |
caaattgtatgtcgctttagaataaaatttttgttccaaattatatgtcgctttacaatatccatgcaatattaatgttacttttcctattataacatta |
2031559 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2031558 |
a--tcatttattattctctcttctttcaattttttcatttatcttttccatattatttattaag |
2031497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16736651 - 16736534
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
16736651 |
ctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac--tattaattactctatcttctttcaattatatcatttattttttcca |
16736554 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16736553 |
taccatttattaaggataat |
16736534 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Original strand, 34865622 - 34865798
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34865622 |
taatactctctccgtcctaaattgtatgtcacttt-gaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtagctttacaatatcaatgaatcattaatgttatttt |
34865720 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||| ||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
34865721 |
ttctattatatctttaac--tatttattactctctctcattccaagtcattcatttattttttcaatgtcatttattaag |
34865798 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 181
Target Start/End: Original strand, 17833907 - 17834021
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17833907 |
atactctctccgtcccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttt |
17834006 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17834007 |
cctattataacctta |
17834021 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32642664 - 32642506
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
32642664 |
aattgtatgtcgctttagagaaaaaaatttgtcccaaattatatatcattttccaataccaataaaacatttatgttacttttcc-attatatcctttac |
32642566 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32642565 |
--tatttattaaaatatgttttttcaattctttcatttatcttatccatactatttattaag |
32642506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10709369 - 10709207
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||| |
|
|
| T |
10709369 |
ccaaattgtatgtcgctctaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactcatgcaacattaatattacttttccaattacaacctt |
10709270 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10709269 |
aa--ttaattattactccctcttctttcaattctttcatttatcttccccatattatttattaag |
10709207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Original strand, 24523984 - 24524098
Alignment:
| Q |
117 |
ccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24523984 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactttatcttctttcaattcttt |
24524081 |
T |
|
| Q |
217 |
catttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24524082 |
tatttatcttttccata |
24524098 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Original strand, 6806707 - 6806846
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6806707 |
aaaaaaaaattgtcacaaattatatgtcgttatacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatattcttaact---tttattactctatct |
6806803 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
6806804 |
tctttcaattctttcatttatcattctaatataatttattaag |
6806846 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 543819 - 543680
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt-cctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||| | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
543819 |
aaaaaatttgtaccaaattatatgtcgctttacaatacccatgtaacattaatgttactttttccaattataacattaatt--atttattactccctctt |
543722 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
543721 |
ctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
543680 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38503188 - 38503088
Alignment:
| Q |
139 |
ataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
38503188 |
ataccaatgaaacattaatgttacttcttctattatatccataa-tg-atttattactctatcttctttcaattttttcatttatctttctcatatcatt |
38503091 |
T |
|
| Q |
239 |
tat |
241 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
38503090 |
tat |
38503088 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 245
Target Start/End: Original strand, 44053129 - 44053228
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44053129 |
aatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagtt--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttatta |
44053226 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Original strand, 14762379 - 14762515
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgt--tacttttcctattatatccttaactgtat-ttattactctttcttttttc |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | | | |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
14762379 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatatttatcctattatatccttaattatttattattacttcatcttatttc |
14762478 |
T |
|
| Q |
209 |
aattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14762479 |
aattctttaatttatctttctcataccatttattaag |
14762515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13779991 - 13779924
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcacttt |
135 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13779991 |
atactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtaacttt |
13779924 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33987525 - 33987385
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcacttt-agaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | | |
|
|
| T |
33987525 |
aaaaaaaatttgttctaaattatatgtcatttttataataccaataaaacattaatgttatttttgatattatatccttaac--tatttattattttctg |
33987428 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33987427 |
ttttttcaattttttaatttatcttttccatatcatttattaa |
33987385 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22553247 - 22553148
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
22553247 |
aatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaact--atttattactctcccttctttcaattctttcatttatcttactcatattatttatta |
22553150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15286598 - 15286485
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
15286598 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataactttaac--tatttattactcaatcttctttcaat |
15286501 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
15286500 |
tttttcctttatcttt |
15286485 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15466967 - 15466854
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
15466967 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataactttaac--tatttattactcaatcttctttcaat |
15466870 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
15466869 |
tttttcctttatcttt |
15466854 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23681916 - 23681819
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23681916 |
attaatgttatttttcctattatatccttaact--attaattactcaatattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
23681819 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 35455468 - 35455582
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
35455468 |
tttacaatactaatgaaacattaatgttattttttctattatatctttaac--tatttattactc--tcttcttttaattctttaatttatctttcatat |
35455563 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35455564 |
accatttattaaggataat |
35455582 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 3310852 - 3310964
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| | |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
3310852 |
aaattatatgtcattttacattaccaatgcaatattaatgttactttttctattataaccttagtt--atttattagtctctcttcttttaattctttca |
3310949 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
3310950 |
tttatctttcccata |
3310964 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 23550708 - 23550808
Alignment:
| Q |
126 |
atgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
225 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23550708 |
atgtctctttacaatactaatgaaacattaatgttactttttttattatatcattaac--tatttattattttctcttctttcaattctttaatttatct |
23550805 |
T |
|
| Q |
226 |
ttc |
228 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
23550806 |
ttc |
23550808 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Original strand, 36821853 - 36821972
Alignment:
| Q |
113 |
tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttt--tttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
36821853 |
tgtcccaaattatatgtcgttttacaataccactaaaaaattaatgttacatttcctattatatcctcaac--tatttattacttttttttttctttcaa |
36821950 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
36821951 |
ttctttaatttatcttttccat |
36821972 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43414087 - 43413990
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43414087 |
caaattgtacgtcgctttaggaaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcc |
43413990 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5062334 - 5062231
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacat |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
5062334 |
aatactaatgaaacattaatgttatttatcctattatatcctta--catatttattactc--tcttctttcaattcttttatttatttttcctatatcat |
5062239 |
T |
|
| Q |
238 |
ttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
5062238 |
ttattaag |
5062231 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Original strand, 17505142 - 17505231
Alignment:
| Q |
131 |
actttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcattta |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17505142 |
actttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcctattatatcattaac--tatttattactctctattctttcaattctttgattta |
17505231 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6900104 - 6900013
Alignment:
| Q |
125 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcat |
219 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6900104 |
tatgtcattttacaataccaacgaaacattaatgttaattttcctataatatcc-taac--tatttatcattttttcttctttcaattctttcat |
6900013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 44012274 - 44012390
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| | | | || ||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44012274 |
tttacaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcactaac--tatttattattatcttttcgttcaattctttaatttatctttctcat |
44012371 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
44012372 |
accatttattgaggataat |
44012390 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3562511 - 3562385
Alignment:
| Q |
115 |
tcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattct |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
3562511 |
tcccaaattataagtcgttttacaataccgatgaaccattaatgttattttttctattatacccttaactg--tttattactc--tcttctttcaattct |
3562416 |
T |
|
| Q |
215 |
ttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||| | || | || ||||||||||| |
|
|
| T |
3562415 |
tcaatttatttctctcgtaccatttattaag |
3562385 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5733364 - 5733271
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5733364 |
tttacaataccaacgaaatattaatgttattttttctattatatctttaact--attcattactctcgattcttttaattctttcatttatctttc |
5733271 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 251
Target Start/End: Original strand, 15595495 - 15595603
Alignment:
| Q |
141 |
accaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| | | || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |
|
|
| T |
15595495 |
accaatgcaactttaatattactttccctattataatcttaact--atttataactttcttttctttcaattctttcatttatttttctcatattattta |
15595592 |
T |
|
| Q |
241 |
ttaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
15595593 |
ttaaggataat |
15595603 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30157626 - 30157518
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | |||||| |||| ||||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30157626 |
aaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatattaatttttctattgtaactttaact--attttttactatctattttttcaattctttca |
30157529 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
30157528 |
tttatctttcc |
30157518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 4407992 - 4408066
Alignment:
| Q |
97 |
ctttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctat |
171 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4407992 |
ctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgttgcgttacaataccaatacaacattaatgttactttttctat |
4408066 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 11018490 - 11018577
Alignment:
| Q |
140 |
taccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11018490 |
taccaatgcaacattaatgttaatttttctattataatcttaatt--atttcttattatcccttttttcaattctttcatttatctttcc |
11018577 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 233
Target Start/End: Original strand, 11530050 - 11530133
Alignment:
| Q |
148 |
aaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
11530050 |
aaacattaatattactttttctattatatctttaatt--atttattaccctctcttgtttcaattctttaatttatatttctcata |
11530133 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Original strand, 31154984 - 31155084
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
31154984 |
aaattgtatgttactttataataccaataaaatattgatgttattttttctattatatctttaa--ttatttatta--ttttcttcttttaattctttca |
31155079 |
T |
|
| Q |
219 |
tttat |
223 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
31155080 |
tttat |
31155084 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 251
Target Start/End: Original strand, 12000631 - 12000672
Alignment:
| Q |
210 |
attctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12000631 |
attctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
12000672 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 251
Target Start/End: Original strand, 16999294 - 16999371
Alignment:
| Q |
172 |
tatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
16999294 |
tatatccttaact--atttattactctctattctttcaattccttcatttatcttttctatatcatttattgaggataat |
16999371 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 184
Target Start/End: Original strand, 3360234 - 3360308
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3360234 |
atttgtacaaaattatatgtccttttacaatattaatgaaacattaatattacttttgttattatatccttaact |
3360308 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Original strand, 18185426 - 18185549
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||| |||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||| | |||| ||| | |||||| | |
|
|
| T |
18185426 |
aaattataggtcgctttacaataacaataaagtattaatgttacttttcttattataactttaatt--atttattactttatcttcttttagttctttaa |
18185523 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
18185524 |
tttatttttctcataccatttattaa |
18185549 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24530135 - 24530089
Alignment:
| Q |
115 |
tcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtta |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24530135 |
tcccaaattatatgtcattttacaataacaatgaaacattaatgtta |
24530089 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42351509 - 42351446
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactct |
198 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
42351509 |
tttataatatcaataaaatattaatgttactttttctattatatccttaa--gtatttgttactct |
42351446 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Original strand, 16863999 - 16864109
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
16863999 |
tttacaattccaacgaagcattaatgttatttttttgattatattcttaact--acttattactctatctactttcaattctttaatttatctttcatat |
16864096 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| |
|
|
| T |
16864097 |
accattaattaag |
16864109 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Original strand, 36648591 - 36648660
Alignment:
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
36648591 |
tattatatcattaact--atttattactgtctcttctttcaattttttaatttatctttccaatatcattta |
36648660 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42821055 - 42820974
Alignment:
| Q |
151 |
cattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataa |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42821055 |
cattaatgttactttttcaattacacacttaa--atatttattactcattcttctttcaattatttaatttatcttttccataa |
42820974 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26029 - 25862
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26029 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
25930 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25929 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
25862 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 98875 - 99042
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
98875 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
98974 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
98975 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattcttttatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
99042 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 123)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 6835725 - 6835892
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6835725 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
6835824 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6835825 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
6835892 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 3787105 - 3787272
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3787105 |
ccaaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatcctta |
3787204 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3787205 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
3787272 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 17360614 - 17360779
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17360614 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcatattatatccttaac |
17360713 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17360714 |
--tatctattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
17360779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 1352484 - 1352651
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1352484 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
1352583 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1352584 |
a--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
1352651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 26409060 - 26409227
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26409060 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacattaccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
26409159 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26409160 |
a--ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
26409227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8493666 - 8493499
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8493666 |
ccaaattgtatgttactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
8493567 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8493566 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcattcatctttcccatatgatttattaaggataat |
8493499 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30739420 - 30739253
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30739420 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgatacattaatattatttttcctattatattctta |
30739321 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30739320 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
30739253 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9660494 - 9660333
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9660494 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattatatcctta |
9660395 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9660394 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
9660333 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14311033 - 14310868
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14311033 |
aaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaac |
14310934 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14310933 |
--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
14310868 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2603664 - 2603497
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2603664 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtaactttttctattatatcctta |
2603565 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2603564 |
ac--tatttattattcttttttttttcaattcttacatttatcttttccatatcatttattaaggataat |
2603497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15989857 - 15989690
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15989857 |
ccaaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
15989758 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15989757 |
ac--tatttattaatctttcttatttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
15989690 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10364740 - 10364595
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaa--tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10364740 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatcct |
10364641 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10364640 |
taac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
10364595 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8415287 - 8415111
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8415287 |
aatactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccatattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttt |
8415188 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8415187 |
cctattatatccttaac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattaag |
8415111 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 11172898 - 11173065
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11172898 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
11172997 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
11172998 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
11173065 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 9961328 - 9961495
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9961328 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
9961427 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9961428 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatatcatttattaaggataat |
9961495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 31492895 - 31493054
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31492895 |
aaattgtatgtcattttaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaa- |
31492993 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31492994 |
-ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
31493054 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 31498284 - 31498443
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31498284 |
aaattgtatgtcattttaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaa- |
31498382 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31498383 |
-ttatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
31498443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 11615365 - 11615527
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11615365 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
11615464 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatt-tatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11615465 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcattgtatctttcccatatcatttattaag |
11615527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31949425 - 31949251
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31949425 |
taatactctctccgtcccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttt |
31949326 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
31949325 |
tcctattatatccttaac--tatttattactctctcttatttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
31949251 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 3888575 - 3888736
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3888575 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatttatcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
3888674 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
3888675 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcgtttatctttcacatataatttattaag |
3888736 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Original strand, 4130852 - 4131026
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4130852 |
atactctctctgtcccaaattgtatgtcgcttt-gaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
4130950 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4130951 |
ctaatatatccttaac--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatatcatttattaag |
4131026 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 31003917 - 31004084
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
31003917 |
ccaaattgtatatcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcattttacaatagcaatgaaacattaatgttactttttcgattatatcatta |
31004016 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31004017 |
a--gtatttattactctttcttccttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
31004084 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 242
Target Start/End: Original strand, 6612372 - 6612546
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6612372 |
aatactccctctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttt |
6612471 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatt-tatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6612472 |
cttattatatccttaac--tatttattactctctcttctttcaattccttcattgtatctttcccatatcatttatt |
6612546 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 1228410 - 1228575
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1228410 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtttcaaattgtatgtcactttacaatatcaataaaacattaatgttatttttccgattatatccttaa- |
1228508 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1228509 |
-gtatttattactctttcttccttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
1228575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 32142388 - 32142545
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32142388 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
32142487 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
32142488 |
ac--tatttattactctatc-tttttcatttccttcatttatctttcccatatcatttatt |
32142545 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 14499121 - 14499282
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14499121 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccattgaaacattaacgttatttttcctattatatcctta |
14499220 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14499221 |
a--atatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaag |
14499282 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12499737 - 12499581
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12499737 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
12499638 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
12499637 |
--tatttaatactctctcttttttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
12499581 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12507066 - 12506910
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12507066 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
12506967 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
12506966 |
--tatttatttctttttcttttttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
12506910 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 12509164 - 12509320
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12509164 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac |
12509263 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
12509264 |
--tatttaatactctctcttttttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
12509320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32393733 - 32393565
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32393733 |
ccaaattgtatgtcactttaaaaaaaaatatctgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctt |
32393634 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
32393633 |
aac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
32393565 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Original strand, 1778823 - 1778993
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1778823 |
tactccatccgtcccaaattgtatgtcactctagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgtta-ttttcc |
1778921 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1778922 |
tattatatccttaac--tatttattactctcccttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttatt |
1778993 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13631331 - 13631173
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13631331 |
ccaaattgtatgacactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
13631232 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
13631231 |
ac--tatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
13631173 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Original strand, 14304356 - 14304526
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14304356 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatcc |
14304455 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
14304456 |
ttaa--ttatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
14304526 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 17941621 - 17941781
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17941621 |
ccaaattgtatatcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaat-aaaaattaatgttacttttcctattatattctta |
17941719 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
17941720 |
ac--tatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttgttaag |
17941781 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16524786 - 16524619
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16524786 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
16524687 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16524686 |
ac--tattaattactctctattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
16524619 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 8201473 - 8201631
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8201473 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatcctta |
8201572 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
8201573 |
ac--aatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
8201631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 12058582 - 12058741
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12058582 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
12058681 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12058682 |
a--ttatttatt--tctctcttctttcaattctttcatttatctatctcatatcatttattaag |
12058741 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2010337 - 2010176
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2010337 |
ccaaattgtatgtcgctttggagaaaaattttgtcccaaattatatgttgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
2010238 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2010237 |
ac--tatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
2010176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Original strand, 19098533 - 19098690
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19098533 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaa |
19098632 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
19098633 |
c--tatttattgctctctcttcattcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
19098690 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 9461586 - 9461754
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaa-aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9461586 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataacaatgaaaaattaatattacttttcctattatatcctt |
9461685 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
9461686 |
aac--tatttattactctctcttctttcaatttatttatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
9461754 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 24178240 - 24178399
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24178240 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
24178339 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24178340 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
24178399 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 34283356 - 34283523
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34283356 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
34283455 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34283456 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
34283523 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1114582 - 1114432
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1114582 |
ccaaattgtacgtgactttagaaaaaatatttgtcccaaattatacgtcgctttacaattccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
1114483 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataa |
234 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
1114482 |
ac--tatttattactctctcttttttcaattccttcatttatttttctcataa |
1114432 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1228268 - 1228103
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1228268 |
aaattgtatgtcactttagaagaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatctttaac |
1228169 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| |
|
|
| T |
1228168 |
--tatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctttctcatattatttattgaggataat |
1228103 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 3337393 - 3337552
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaa-aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3337393 |
ccaaattttacgtcactttagaaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
3337492 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3337493 |
aac--tatttattactctttc---------ttctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
3337552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21140023 - 21139863
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21140023 |
gttccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatttttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcc |
21139924 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21139923 |
ttaac--tattaattactc--tcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
21139863 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25526905 - 25526763
Alignment:
| Q |
98 |
tttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactc |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25526905 |
tttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaac--tatttattactc |
25526808 |
T |
|
| Q |
198 |
tttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
25526807 |
tctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
25526763 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10629585 - 10629418
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10629585 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatcctta |
10629486 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10629485 |
ac--tattaattactttatcttctttcaattatttcatttatctttttcatactatttattaaggataat |
10629418 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 15497854 - 15498013
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaa-ttgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15497854 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccgg |
15497953 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
15497954 |
aac--tatttattgctctctcttcattcaatttcttcatttatcttttccatatcatttatt |
15498013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 20605582 - 20605749
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20605582 |
ccaaattgtatttcgttttaggaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
20605681 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20605682 |
ac--tatttattaatctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaaggataat |
20605749 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14600705 - 14600535
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14600705 |
gttccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcctaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcc |
14600606 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14600605 |
ttaac--tattaattactttctcttctttcaattatttcatttattttttccatatcatttattaaggataat |
14600535 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31022652 - 31022495
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31022652 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac |
31022554 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31022553 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaa |
31022495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Original strand, 7358463 - 7358640
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7358463 |
taatactctttccgtcccaaattatatatcactttagaaaaaaaaattgtttcaaattatatgtcactttacaatatcaatcaaacattaatgttacttt |
7358562 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7358563 |
ttttattatattcttaa--ttatttattactttttcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaag |
7358640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 32609805 - 32609966
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32609805 |
ccaaattgtatgtcgctttaggggaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
32609904 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32609905 |
ac--tatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaag |
32609966 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9038503 - 9038373
Alignment:
| Q |
94 |
tcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttatt |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9038503 |
tcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaatt-atgttacttttcctattatatccttaac--catttatt |
9038407 |
T |
|
| Q |
194 |
actctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9038406 |
actctctcttctttcaattccttcatttatcttt |
9038373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30511037 - 30510862
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30511037 |
atactctctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaattttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttc |
30510938 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||| | | ||| || ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30510937 |
ctattatatccttcac--tatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttcccatttcatttattaag |
30510862 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 690526 - 690386
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
690526 |
aaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgttactttataataccaatgaaacattaatgttactttt-ctattataaccttaac |
690428 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
690427 |
--tatttattactctcttttctttcaagttttttatttatcttt |
690386 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7245973 - 7245795
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
7245973 |
tactctctctgtctcaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttctttcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatcttatttttcc |
7245874 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
7245873 |
tattatatctttaac--tatttattgctc--tcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
7245795 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 29343988 - 29344136
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttta-gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29343988 |
ccaaattgtatgtcgttttaaggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
29344087 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29344088 |
aa--ttatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttccca |
29344136 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 29901207 - 29901375
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
29901207 |
ccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattattgttactttttcaattataacctt |
29901306 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29901307 |
aatt--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
29901375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 33254346 - 33254514
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaa-aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33254346 |
ccaaattgtatgtcattttaaaaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacatttcatattatatcctt |
33254445 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |
|
|
| T |
33254446 |
aac--tatttattgctctctcttctttcaattcatttatttatctttcccatattatttattgaggataat |
33254514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 3819616 - 3819782
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3819616 |
ccaaattgtaagtcgctttggaaaaaaaatt-gttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
3819714 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3819715 |
ac--tattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttccatactatttattaaggataat |
3819782 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6792020 - 6791881
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
6792020 |
aaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactatatctt |
6791923 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6791922 |
ctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaag |
6791881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Original strand, 24430184 - 24430323
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
24430184 |
aaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacatttcctattataaccttaac--tatttattactatctctt |
24430281 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24430282 |
ctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaag |
24430323 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 29017040 - 29017207
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29017040 |
ccaaattatatgtcgctttgtaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctactatatcctta |
29017139 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29017140 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttattaaggataat |
29017207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 6850018 - 6850183
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6850018 |
gttccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttacaatactaatgcagcattaatgttacttttcctattataa |
6850117 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
6850118 |
ccttaac--tatttattactctctcttctttcaattatttcatttatctttctcatattatttattaa |
6850183 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16466428 - 16466263
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16466428 |
aaattgtatgccgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac |
16466329 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
16466328 |
--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatcaaggataat |
16466263 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4148340 - 4148192
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttta-gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4148340 |
ccaaattatatgtcactttaagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaatacgaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
4148241 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4148240 |
aac--tatttattactc--tcttctttcaattcttttatttatcttttccata |
4148192 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 242
Target Start/End: Original strand, 21858574 - 21858697
Alignment:
| Q |
117 |
ccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| || |
|
|
| T |
21858574 |
ccaaaatgtacgtccctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctctattctttcaattcctt |
21858671 |
T |
|
| Q |
217 |
catttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21858672 |
catttatctttcccatatcatttatt |
21858697 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24053213 - 24053055
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24053213 |
ccaaattgtatgtcgcttt-gaaaaaaaaattatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
24053115 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| | | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24053114 |
ac--tattaattattatctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
24053055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35040103 - 35039936
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35040103 |
ccaaattgtatgtcactttgaaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacatttcctattatatccttc |
35040004 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| || ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35040003 |
ac--tatttattgcattctctacttccaagtcattcatttatctttcacatatcatttattaaggataat |
35039936 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6335181 - 6335054
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
6335181 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactc--tcttatttcaattc |
6335086 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6335085 |
tttcatttatttttcccatattatttattaag |
6335054 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 29818195 - 29818357
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaa-aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| || || | |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
29818195 |
ccaaattgtatgtcgctttagagaacaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttagaatatcaatgcaacattaatcttactttttctattataacctt |
29818294 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29818295 |
aa--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttcccatgttatttattaag |
29818357 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 245
Target Start/End: Original strand, 31503923 - 31504021
Alignment:
| Q |
145 |
atgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31503923 |
atgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaatt--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaa |
31504020 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 240
Target Start/End: Original strand, 32588691 - 32588845
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32588691 |
aaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaagctttaatgttattttttctattatatccttaac |
32588790 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
|||||| |||| | |||| || ||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
32588791 |
--tatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttcctatatcattta |
32588845 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6334946 - 6334829
Alignment:
| Q |
124 |
gtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6334946 |
gtatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttat |
6334849 |
T |
|
| Q |
224 |
ctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6334848 |
cttttccataccatttatta |
6334829 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Original strand, 8550174 - 8550343
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcacttt-agaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
173 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8550174 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgcttttataatacccatgcaatattaatgttacttttccaatta |
8550273 |
T |
|
| Q |
174 |
tatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8550274 |
taaccttaatt--atttattactccttcttctttcaattctttcatttttctttcccatattatttattaag |
8550343 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 30238822 - 30238983
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30238822 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgttccaaattatatgtcgttttaaaatactaatgcaacattaatgttatttttcctattataacctta |
30238921 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30238922 |
a--ttatttattactctctcttttttcaattttttcatttatcttttccatattatttattaag |
30238983 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 6833760 - 6833920
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6833760 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaa |
6833859 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6833860 |
c--tatttattattatctcttctttcaattatttcatttatcttttccatgttatttattaag |
6833920 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Original strand, 10133724 - 10133847
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10133724 |
aaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacaatcatgttactttttctattacatccttaac--tatttattactctttc-tttttcaattctttca |
10133820 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10133821 |
tttatctttcttatatcatttattaag |
10133847 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 11000386 - 11000542
Alignment:
| Q |
87 |
ttgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgt |
186 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| | |
|
|
| T |
11000386 |
ttgtatgttgctttagagaaaaaaattgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgcaacaataatgttactttttctattataaccttaa--tt |
11000483 |
T |
|
| Q |
187 |
atttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11000484 |
atttattactctttattctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaag |
11000542 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27080581 - 27080441
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
27080581 |
aaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcactttgcaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcactaac--tattcattactctctct |
27080484 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27080483 |
tcttttaattctttcatttatctttcacatatcatttattaag |
27080441 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 251
Target Start/End: Original strand, 200118 - 200220
Alignment:
| Q |
147 |
gaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
200118 |
gaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact--atttattattctttcttttttcaattctttcattcatctttctcatatcaattattaagg |
200215 |
T |
|
| Q |
247 |
ataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
200216 |
ataat |
200220 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 30240220 - 30240386
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
30240220 |
caaattatatgtcattttggaaaaaaaaattgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatttccttca |
30240319 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30240320 |
c--tatttattaccttctctactctcaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
30240386 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 5489588 - 5489756
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgta------tgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5489588 |
ccaaattgtatgtcgctttagaagaaaatatttgtctcaaattataattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattat |
5489687 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
5489688 |
aaccttaac--tatttattactttatcttctttcaattatttcatttatctttctcatattatttattaag |
5489756 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11213653 - 11213504
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |
|
|
| T |
11213653 |
caaattgtatgtcgctttatagaaaaatatttatttcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataacttta |
11213554 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11213553 |
--gttatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccata |
11213504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 251
Target Start/End: Original strand, 16970461 - 16970597
Alignment:
| Q |
113 |
tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaatt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |
|
|
| T |
16970461 |
tgtcccaaatgatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctgttataaccttaa--atatttattactctctcttctttcagtt |
16970558 |
T |
|
| Q |
213 |
ctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16970559 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggataat |
16970597 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Original strand, 11130157 - 11130288
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
11130157 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttgcttattataaccttaac--tatttattactttatcttctttcaat |
11130254 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
11130255 |
tctttcatttatctttctcatattatttattaag |
11130288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 78387 - 78282
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacat |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
78387 |
aataccaatgcaacattaatgtcacttttccgattataaccttaact--atttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattat |
78290 |
T |
|
| Q |
238 |
ttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
78289 |
ttattaag |
78282 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 245
Target Start/End: Original strand, 4657877 - 4657976
Alignment:
| Q |
143 |
caatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
4657877 |
caataaaacattaacgttacttt-cctattatatccttaact--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatcttttctatatcatttatt |
4657973 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4981408 - 4981244
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaa---aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
4981408 |
ccaaattgtaagtcattttagaaagaaaaaaaattgtcgcaaattatatgtcgctttacaatactaataaaatattaatgttactttttctattatgtct |
4981309 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
4981308 |
ttaac--tatttattactctcttttctttcaattcattcatttatctttctcatataatttattaag |
4981244 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28075253 - 28075127
Alignment:
| Q |
117 |
ccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28075253 |
ccaaattatatgtcgctttacaatacctatgcaacattaatattacttttcctattataaccttaa--atatttattactctctcttctttcaattcttt |
28075156 |
T |
|
| Q |
217 |
catttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28075155 |
tattgatcttttccatattatttattaag |
28075127 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17275476 - 17275352
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
17275476 |
aaattatatgtcgctttacaatatcagtgcaacattaatgttatttttcctattataactttaact--atttattactctctcttcttttaattctttca |
17275379 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17275378 |
tttatgtttcccatataatttattaag |
17275352 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 16465823 - 16465968
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
16465823 |
tctgttctaaattgtatctcgctttagagaaaaattttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaatattaatgttattttttctattata |
16465922 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgta-tttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16465923 |
acctta---gtaatttattactctatcttctttcaattctttcatttat |
16465968 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 18105640 - 18105797
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| ||| | || ||| ||||| ||||| | ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
18105640 |
aaattgtatgttattttaaaaaaaatatttatcctaaagtatacgtcgctttacaatacta-tgaaatattaatgatattttttctattatatccttcac |
18105738 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18105739 |
t--atttattactcttt-ttttttcaattccatcatttatctttcccatattatttattaag |
18105797 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5609491 - 5609393
Alignment:
| Q |
145 |
atgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5609491 |
atgaaatattaatgttagttttcctattatatcattaact--atttattactctcacttttttcaaatctttcatttatttttcccatataatttattaa |
5609394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9225681 - 9225531
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttt-agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9225681 |
ccaaattgtatgtcgttttgaaaaaaaaaaattgtcccaaattgtgtgtcgctttacaataccaatgaagcattaatgttatttttcatattatatcctt |
9225582 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||| | |||| || ||| || || ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9225581 |
aac--tatttactactttctcttcttccaagtcattaatttatctttctcata |
9225531 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 182
Target Start/End: Original strand, 17441698 - 17441769
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17441698 |
tttgtctcaaattatatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatattcttaa |
17441769 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21072216 - 21072076
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21072216 |
aaaaaaaaattgtcctaaatcatatgtcattttgcaataccaatgaagaattaatattactttttctattatatccgtagct--atttattactctctct |
21072119 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21072118 |
tctttcaaatctttaatttatctttctcataccatttattaag |
21072076 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12278980 - 12278905
Alignment:
| Q |
120 |
aattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactc |
197 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12278980 |
aattgtatctcactttacaataccaatgaaacattaattttacttttcctattatatctttaac--tatttattactc |
12278905 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 182
Target Start/End: Original strand, 29455367 - 29455464
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29455367 |
aaattgtatgtcgttttaggaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcagcattaatgttacttttcctattataaccttaa |
29455464 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Original strand, 31503671 - 31503737
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31503671 |
aaattgtatgtcattttaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaa |
31503737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 251
Target Start/End: Original strand, 33841315 - 33841415
Alignment:
| Q |
147 |
gaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
33841315 |
gaaacattaatattactttttctattatattcttaact--atttattacttttt--tttttcaattctttaatttatctttctcgtaccatttattaagg |
33841410 |
T |
|
| Q |
247 |
ataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
33841411 |
ataat |
33841415 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21047532 - 21047356
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| || ||||| |||| ||||||| | |||||| || | ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
21047532 |
aatactccctctgtcccaatttatatgtggctttggaaaaaaaaattgtcctaagtcatatgtcattttgcaataccaatgaagaattaatattattttt |
21047433 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21047432 |
tctattatatccgtagct--atttattactctcacttctttcaaatctttaatttatctttctcataccatttattaag |
21047356 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7885303 - 7885208
Alignment:
| Q |
148 |
aaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
7885303 |
aaacattaatgttactttttctattatatcattagct--atttattactctctcttctttcaattatttaatttatctttcttatactatttattaag |
7885208 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7897016 - 7896914
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
7897016 |
aaaaaaatttgttccaaattatatgtg-ctttgcaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactatctctt |
7896920 |
T |
|
| Q |
204 |
ttttca |
209 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
7896919 |
ctttca |
7896914 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 247
Target Start/End: Original strand, 11173321 - 11173408
Alignment:
| Q |
158 |
gttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagta |
247 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11173321 |
gttactttttctattataaccttaact--atttattactctatcttatttcaattcttacatttatttttctcatattatttattaagta |
11173408 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Original strand, 290394 - 290511
Alignment:
| Q |
125 |
tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatc |
224 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
290394 |
tatgtcgctttacaataccaatgaa-cattaattttattttttatattatatctttaact--atttattactctctcttctttcaactctttaatttttc |
290490 |
T |
|
| Q |
225 |
tttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
290491 |
tttttcataccatttattaag |
290511 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31872799 - 31872689
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
31872799 |
ctttaaaatatcaatgaagcattaatgctatttttcttattatattcttaact--atttataactcactcttctttcaatttttttatttatctttctca |
31872702 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
31872701 |
taccatttattaa |
31872689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Original strand, 31858246 - 31858378
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
31858246 |
tttgtcccaaattatatatcgtattaaaatatcaatgaaatattaatgttattttttttattatatccttaac--tatttattactacctcttcattcaa |
31858343 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
31858344 |
ttatttaatttatctttctcatatcatctattaag |
31858378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 7595903 - 7596032
Alignment:
| Q |
113 |
tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaatt |
212 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| | || | |||||||| | | |||| |||||||| |
|
|
| T |
7595903 |
tgtcctaaattatatgtcactttacaatatcaataaaacatcaatgttttttttc-tattatatcttgaatt--atttattattatatcttctttcaatt |
7595999 |
T |
|
| Q |
213 |
ctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
7596000 |
ctttaatttatctttccgacaccatttattaag |
7596032 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 251
Target Start/End: Original strand, 10027881 - 10027946
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10027881 |
tatttattactctctcttctttcgattctttcatttatcttttccatattatttattaagaataat |
10027946 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Original strand, 24718320 - 24718392
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24718320 |
ttgtcctaaattatatgtcattttacaatatcaataaaacattattgttacttttcttattatacccttaact |
24718392 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 244
Target Start/End: Original strand, 32614602 - 32614758
Alignment:
| Q |
85 |
aattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||| |||| |||||| |||||| | ||||| || |||| | ||| | |||||||| |
|
|
| T |
32614602 |
aattatatgtcactttagaaaaaaaatta-tctcaaattataagtcattttacaataccgatgaaatactaatgatattttttttcttacacccttaact |
32614700 |
T |
|
| Q |
185 |
gtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
32614701 |
tt--ttattaatctctcttctttcaattctttaatttatctttctcttatcatttattaa |
32614758 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 244
Target Start/End: Original strand, 35030409 - 35030518
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| || ||| |
|
|
| T |
35030409 |
tttacaattccaatgaaatatcaatgttacttttcctattataccattaa--ttatttattactctctttactttcaattctttaatttatctctcacat |
35030506 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| |
|
|
| T |
35030507 |
accatgtattaa |
35030518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 78598 - 78525
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacat |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
78598 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacat |
78525 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13587102 - 13586971
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||||| | | | |||||| |
|
|
| T |
13587102 |
tttgtcccaaattataaatcactttacaaaaccagtgaaatagtaatgttgatttttctattataacctaaact--atttattactttctatcctttcaa |
13587005 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13587004 |
atctttaatttatctttctcataatatttattaa |
13586971 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19687924 - 19687832
Alignment:
| Q |
153 |
ttaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19687924 |
ttaacgttacttttcctattagatccttaac--tatttaatactc-ttctttt---aattttttcatttatttttcccatataatttattaaggataat |
19687832 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34219127 - 34219018
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34219127 |
tttacaataccaatgaatcattaatattatttcttctattatatccttaac--tatttattactttatctcctttcatgtgattcatttatcttt-ccat |
34219031 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |
|
|
| T |
34219030 |
atcatttattaag |
34219018 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 251
Target Start/End: Original strand, 14386591 - 14386643
Alignment:
| Q |
199 |
ttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14386591 |
ttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
14386643 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 17441921 - 17441980
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17441921 |
tatttattactatctcttctttcaattatttcttttatcattcccatatcatttattaag |
17441980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 290737 - 290795
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
290737 |
caaattatatgtttctttacaatatcaatgaagcattaatgttacttttcatattatat |
290795 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12278581 - 12278536
Alignment:
| Q |
198 |
tttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
12278581 |
tttcttctttcaattctttcgtttatctttctcatatcatttatta |
12278536 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 196)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 68 - 251
Target Start/End: Original strand, 8104229 - 8104410
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8104229 |
atactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
8104328 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8104329 |
ctattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
8104410 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 24978842 - 24979009
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24978842 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
24978941 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24978942 |
ac--tatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaagaataat |
24979009 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 28226984 - 28227151
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28226984 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttaggataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcttta |
28227083 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28227084 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcacatatcatttattaaggataat |
28227151 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 30744866 - 30745032
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30744866 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaa |
30744965 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30744966 |
c--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
30745032 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28686437 - 28686264
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28686437 |
tctgtcccaaattgtatgttactttagaaaaaacatttgtcccaaattgtacgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattata |
28686338 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28686337 |
tccttaac--tatttattactctttcttttttaaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
28686264 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 251
Target Start/End: Original strand, 31786791 - 31786975
Alignment:
| Q |
65 |
gtaatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31786791 |
gtaatactccatccgtcccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactt |
31786890 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31786891 |
ttcctattatatcgttaac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcctatattatttattaaggataat |
31786975 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 42490054 - 42490198
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42490054 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcttattatatcctta |
42490153 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42490154 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
42490198 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32100350 - 32100183
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32100350 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtacgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
32100251 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32100250 |
ac--tatttattactctttcgtttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
32100183 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42939844 - 42939677
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42939844 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgaagcattaatgttacttttcctattatatcctta |
42939745 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42939744 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
42939677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 43175747 - 43175914
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43175747 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtccaaaattatatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcttattatatcctta |
43175846 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43175847 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
43175914 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46195896 - 46195729
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46195896 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcctaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
46195797 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
46195796 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccaatataatttattaaggataat |
46195729 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 54080379 - 54080220
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54080379 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatatcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
54080280 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
54080279 |
ac--tatttattattctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttatta |
54080220 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5137740 - 5137573
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5137740 |
ccaaattgtatatcactttagaaaaataatttgttccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
5137641 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5137640 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
5137573 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21216935 - 21216768
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
21216935 |
ccaaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttaatattatatcatta |
21216836 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21216835 |
ac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttaactttcccatatcatttattaaggataat |
21216768 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 40643329 - 40643489
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40643329 |
ccaaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
40643428 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
40643429 |
ac--tatttattactctttattttttcaattttttcatttatctttccgatatcatttattaa |
40643489 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 47241177 - 47241342
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47241177 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgccactttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaac |
47241276 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47241277 |
--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
47241342 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 23782078 - 23782245
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23782078 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatatcactttacattaccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
23782177 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23782178 |
a--ttatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
23782245 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29227439 - 29227272
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29227439 |
ccaaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacataaatgttactttttctattatatcctta |
29227340 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29227339 |
a--ttatttattactctttcttatttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
29227272 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38783710 - 38783552
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38783710 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
38783611 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38783610 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
38783552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48584153 - 48583992
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48584153 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
48584054 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48584053 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattaag |
48583992 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48910606 - 48910439
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48910606 |
aaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaac |
48910507 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttc--ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
48910506 |
--tatttattactctttcttttttttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
48910439 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4047347 - 4047189
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4047347 |
ccaaattgtatgtcgctttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
4047248 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4047247 |
ac--tatttattactctttcttatttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
4047189 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33840069 - 33839909
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33840069 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
33839970 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactc--tttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
33839969 |
ac--tatttattactcttttttttttttcaattccttcatttatctttcctatatcatttatt |
33839909 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 38999460 - 38999624
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
38999460 |
aaattgtatgtcacttta-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaa- |
38999557 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38999558 |
-ttatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
38999624 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Original strand, 1540659 - 1540830
Alignment:
| Q |
78 |
tgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
1540659 |
tgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatctcaaattgtatgtcactttagaatattaatgaaatattagtgttatcttttctattatatc |
1540758 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1540759 |
cttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaaggataat |
1540830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 24089341 - 24089508
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24089341 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtccgaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
24089440 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
24089441 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
24089508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27848922 - 27848787
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27848922 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaattc |
27848825 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27848824 |
tttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
27848787 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 34663443 - 34663610
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34663443 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
34663542 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
34663543 |
ac--tatttattactctcttttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattgagaataat |
34663610 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52060540 - 52060373
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52060540 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatcctta |
52060441 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
52060440 |
ac--tatttattactccctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
52060373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23609502 - 23609344
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23609502 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcttta |
23609403 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
23609402 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatatcatttatt |
23609344 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 47054009 - 47054167
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47054009 |
ccaaattgtatgtcacattagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
47054108 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
47054109 |
ac--tatttattactttatcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
47054167 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52679858 - 52679689
Alignment:
| Q |
81 |
tccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
52679858 |
tccaaattgtatgtcacttcaaaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctt |
52679759 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52679758 |
taa--ttatttattactcttttttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
52679689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3671649 - 3671493
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
3671649 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcacgttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccaattatatcatta |
3671550 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
3671549 |
--tgtatttattactctttattccttcaattctttcatttatatttcctatatcattta |
3671493 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 68 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38483615 - 38483443
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
38483615 |
atactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
38483516 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
38483515 |
ctattatatccttaac--tatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttatt |
38483443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Original strand, 38096029 - 38096200
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
38096029 |
tactccatccgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcctaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacattttc |
38096128 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
38096129 |
tattatatccttaac--tatttattactctctcttatttcaattctttcatttatctttctcatatcatttatt |
38096200 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2929937 - 2929791
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2929937 |
aaaaaatatttatcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaac--tatttattactctttct |
2929840 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2929839 |
tttttcaattctttcatttatctttctcatataatttattaaggataat |
2929791 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25904177 - 25904019
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
25904177 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcttgttatatcctta |
25904078 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
25904077 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
25904019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 29343215 - 29343373
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
29343215 |
ccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcttta |
29343314 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
29343315 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
29343373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Original strand, 30190320 - 30190494
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30190320 |
taatactccatccgtctcaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttt |
30190419 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30190420 |
tcctattatatctttaac--tatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
30190494 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 41751114 - 41751272
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41751114 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatcctta |
41751213 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41751214 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattcctttatttatctttcccatatcatttatt |
41751272 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45824154 - 45823997
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45824154 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atgttacttttcctattatatcctta |
45824056 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45824055 |
ac--catttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
45823997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4392598 - 4392442
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4392598 |
aaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgatttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaac |
4392499 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4392498 |
--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
4392442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 48333723 - 48333888
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48333723 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
48333822 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
48333823 |
ac--tatttattactc--tattctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
48333888 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 44048111 - 44048270
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatg-aaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44048111 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaaaaattaatgttatttttcctattatatcctt |
44048210 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
44048211 |
aac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
44048270 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52040518 - 52040351
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52040518 |
ccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaacgatacttttcctattatatcctta |
52040419 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
52040418 |
ac--tatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
52040351 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2510294 - 2510136
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2510294 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattctta |
2510195 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
2510194 |
ac--tatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
2510136 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3645974 - 3645816
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3645974 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
3645875 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
3645874 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccatcatttatctttctcatatcatttatt |
3645816 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 8108448 - 8108606
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
8108448 |
ccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatgttacctttcctattatatcccta |
8108547 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
8108548 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
8108606 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 51865702 - 51865860
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51865702 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatacaaaattataagtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
51865801 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
51865802 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
51865860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 52915036 - 52915194
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52915036 |
ccaaattgtatgtcactttggaataaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
52915135 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
52915136 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
52915194 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19961094 - 19960933
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19961094 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcacaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
19960995 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
19960994 |
ac--tatttattactctctcttcttttaattccttcatttatctttctcatatcatttactaag |
19960933 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49384521 - 49384361
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49384521 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtc-gtttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattatatcctta |
49384423 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
49384422 |
ac--tatttattactctctctgctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaag |
49384361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 240745 - 240581
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||| || |
|
|
| T |
240745 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaacattaatatcattttttctattataacc |
240646 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
240645 |
ttaac--tatttattactctcttttctttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaag |
240581 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 29652006 - 29652173
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc------ctattata |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
29652006 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcttattactattata |
29652105 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29652106 |
tccttaac--tatttattattctttcttttttcaattctttcatttatctttcacatatcatttattaag |
29652173 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 242
Target Start/End: Original strand, 31725621 - 31725793
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31725621 |
atactctctccgttctaaattgtatgtcactttagaaaatatatttgttccaaattatatttcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
31725720 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31725721 |
ctattatatccttaac--tatttattattctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
31725793 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Original strand, 19602182 - 19602345
Alignment:
| Q |
80 |
ttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19602182 |
ttccaaattgtatgtcactatagaaaaaatatttgtcctaaattgtatatcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattataacct |
19602281 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19602282 |
taac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttattttttccatattatttattaag |
19602345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40710781 - 40710614
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40710781 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaacattaattttacttttcctattataacctta |
40710682 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40710681 |
ac--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaaggataat |
40710614 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47109331 - 47109164
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47109331 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
47109232 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47109231 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttctcataccatttattaaggataat |
47109164 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 15019791 - 15019949
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15019791 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcgtaaattatatgtcgctttacaataccaacgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
15019890 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
15019891 |
ac--tatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttatt |
15019949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 43599583 - 43599740
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43599583 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atattacttttcctattatatcctta |
43599681 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
43599682 |
ac--catttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcacatatcatttatt |
43599740 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51166516 - 51166390
Alignment:
| Q |
117 |
ccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattcttt |
216 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51166516 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaact--atttattactctttcttttttcaattcttt |
51166419 |
T |
|
| Q |
217 |
catttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
51166418 |
catttatctttcccatatcatttattaag |
51166390 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13759907 - 13759746
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
13759907 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaatatttatcccaaattatatgtcactttacgataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacttta |
13759808 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
13759807 |
ac--tatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttctcatgttatttattaag |
13759746 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 45218730 - 45218885
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45218730 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
45218829 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
45218830 |
ac--tatttattactc--tcttctttcaattccttcatttatcttt-ccatatcatttatt |
45218885 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29517485 - 29517315
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29517485 |
gttcgaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcc |
29517386 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29517385 |
ttaa--ttattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataat |
29517315 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35084606 - 35084448
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35084606 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatcctta |
35084507 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
35084506 |
ac--tatttattactttatcttctttcaattccttcatttatctttctcatataatttatt |
35084448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 36669161 - 36669319
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36669161 |
ccaaattgtatgtcatgttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgttgctttacaatatcaatgaaaaattaatattacttttcctattatatcctta |
36669260 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
36669261 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
36669319 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40164298 - 40164201
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40164298 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta |
40164201 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 50622770 - 50622612
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50622770 |
ccaaattgtatgtcactttagacaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacgataccaatgaaaaaataatgttacttttcctattatatcctta |
50622671 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
50622670 |
ac--tatttattactctctcttctttcaatttctttatttatctttcccatatcatttatt |
50622612 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 54677628 - 54677786
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54677628 |
caaattgtaagtcactttataaaataattttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaa |
54677727 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54677728 |
c--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttatta |
54677786 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Original strand, 12569300 - 12569472
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaata--tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12569300 |
gttccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatat |
12569399 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12569400 |
ccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
12569472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Original strand, 13545764 - 13545936
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaata--tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13545764 |
gttccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatat |
13545863 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13545864 |
ccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
13545936 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 43109607 - 43109772
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43109607 |
aaattgtatatcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactcttcctattatatccttaac |
43109706 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43109707 |
--tattaattactctttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
43109772 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 101 - 242
Target Start/End: Original strand, 30358750 - 30358887
Alignment:
| Q |
101 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
30358750 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattactc--t |
30358845 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
30358846 |
cttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
30358887 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 53655233 - 53655077
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
53655233 |
aaattatatgtcattttagaaaaaatatttgtttcaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaac |
53655134 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
53655133 |
--tatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
53655077 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27039144 - 27039001
Alignment:
| Q |
88 |
tgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgta |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |
|
|
| T |
27039144 |
tgtatgtcactttagaaaaaatatttatttcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaac--ta |
27039047 |
T |
|
| Q |
188 |
tttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27039046 |
tttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttctcata |
27039001 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34817173 - 34817006
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34817173 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttgtcctattatatcctta |
34817074 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34817073 |
a--ttattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
34817006 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 10659214 - 10659374
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||| |||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10659214 |
ccaaattgtatgccgctttaaaaaaaaaatt-gtctcaaattatacgtcgcttaacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
10659312 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10659313 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaag |
10659374 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52804969 - 52804792
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |
|
|
| T |
52804969 |
taatactctttccgtctcaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatcgatgttatttt |
52804870 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52804869 |
tcctattatatccttaac--tatttattattttctcttctttcaattccttcatttatttttcccatataatttattaag |
52804792 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16661537 - 16661377
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
16661537 |
aaattgtatatcattttagaaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatttattttactttttctattatatctttaa |
16661438 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16661437 |
c--tatttattaccttttcttcttttaattctttcatttatttttcccatatcatttattaag |
16661377 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 242
Target Start/End: Original strand, 17378210 - 17378342
Alignment:
| Q |
108 |
atatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctttttt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
17378210 |
atatttgtcgcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaac--tatttattactctctcttcttt |
17378307 |
T |
|
| Q |
208 |
caattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17378308 |
caattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
17378342 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41637152 - 41636989
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41637152 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtcctta |
41637053 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttt--tttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41637052 |
ac--tatttattacttttttttttctttcaattccttcatttatctttcccatataatttattaag |
41636989 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 8724292 - 8724451
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8724292 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatcctta |
8724391 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8724392 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
8724451 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 9076179 - 9076338
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9076179 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatcctta |
9076278 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9076279 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
9076338 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15999087 - 15998925
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15999087 |
ccaaattgtacctcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atgctacttttcctattatatcctta |
15998989 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagta |
247 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15998988 |
a--tcatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgagta |
15998925 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 22926049 - 22926216
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22926049 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
22926148 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22926149 |
a--ttattaattattccttcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
22926216 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 29674872 - 29675031
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29674872 |
ccaaattgtatgtcgttttaaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
29674971 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29674972 |
--tctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
29675031 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 43185357 - 43185524
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43185357 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
43185456 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43185457 |
ac--tattaattactcccaattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
43185524 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47498173 - 47498006
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47498173 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
47498074 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47498073 |
a--ttattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
47498006 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49610215 - 49610056
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49610215 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccagattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
49610116 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
49610115 |
ac--tattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
49610056 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52870706 - 52870539
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52870706 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
52870607 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| | || ||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52870606 |
a--ttcttaattactccctattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
52870539 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54747976 - 54747820
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
54747976 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttctattatatcctta |
54747877 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| || |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
54747876 |
attg--tttatt--gctatcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
54747820 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33193229 - 33193074
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
33193229 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacctttcatattatatctttaa |
33193130 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
33193129 |
c--tatttattactc--tcttctttcaattccttcatttatatttctcatatcatttatt |
33193074 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33610360 - 33610198
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33610360 |
ccaaattgtatgtcgctttaggagaaaagatttgtcccaaattataggtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
33610261 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33610260 |
aac--tatttattactccatcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaag |
33610198 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45347247 - 45347101
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
45347247 |
aaaaaatatttatcccaaattatacgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttagttttcctattatctccttaact--atttattactctatct |
45347150 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45347149 |
tttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
45347101 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 32078031 - 32078192
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttt-agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32078031 |
ccaaattgtatgtcgttttgaaaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctt |
32078130 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
32078131 |
cac--tatttattactctatcttatttcaattctttaatttatctttctcatacaatttattaa |
32078192 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 32758482 - 32758641
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32758482 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatt-gttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcatta |
32758580 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
32758581 |
ac--tatttattactctttattctttcaattcatttatttatctttctaatatcatttattaa |
32758641 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Original strand, 23781915 - 23782061
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23781915 |
gttccaaattatatgtcactttagaaaa-atatttgtcccagattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaattttatttttcctattatatct |
23782013 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
23782014 |
ttaac--tatttattactctatcttctttcaattcctttatttatctttc |
23782061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27942281 - 27942154
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27942281 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcatattatatccttaac |
27942182 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
27942181 |
--tatttattactctctcttctttcaattc |
27942154 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 39259271 - 39259418
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39259271 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataacctta |
39259370 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39259371 |
gc--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttccca |
39259418 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 242
Target Start/End: Original strand, 41979872 - 41980045
Alignment:
| Q |
65 |
gtaatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |
|
|
| T |
41979872 |
gtaatactccctccgtcccaaattgtacgtcactttagaaaaaa-atttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttattt |
41979969 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41979970 |
ttcctatcatatccttaacc--atttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttatt |
41980045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1672967 - 1672805
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1672967 |
ccaaattatatgtcgctttagggaaaaatatttgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
1672868 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1672867 |
agc--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
1672805 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9508754 - 9508612
Alignment:
| Q |
101 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
9508754 |
agaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaatattaatgttactttttctattatattcttaact--atttattactctct |
9508657 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9508656 |
cttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
9508612 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9516729 - 9516587
Alignment:
| Q |
101 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
9516729 |
agaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaatattaatgttactttttctattatattcttaact--atttattactctct |
9516632 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9516631 |
cttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
9516587 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51380293 - 51380130
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
51380293 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaata----tgaaatattaatgttactttttctattatatccttg |
51380198 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51380197 |
act--attaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataat |
51380130 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 335960 - 335811
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
335960 |
ccaaattgtatgtcgctttatgaaaaatatttgtcataaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
335861 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
335860 |
gc--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccata |
335811 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 21272641 - 21272802
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
21272641 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataacttta |
21272740 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
21272741 |
ac--tatttattactctcttttatttcaattctttcatttatttttcctatattatttattaag |
21272802 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Original strand, 38550871 - 38551048
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||| || || | |||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
38550871 |
taatactctctccgtccaaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttataataccaatgcaatattaatgttatttt |
38550970 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38550971 |
tcctattataaccttaactg--tttattactctctcttctttcaattttttcatttatttttcccatataatttattaag |
38551048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 51571766 - 51571926
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51571766 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatggtacttttcctattataaccttaa |
51571865 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51571866 |
c--tatttattactatctcttctttcaattatttcatttatctttcccatgttatttattaag |
51571926 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 41265524 - 41265691
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41265524 |
ccaaattgtatgtccctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgttgttttacaataccaataaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
41265623 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41265624 |
ac--tattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataat |
41265691 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 242
Target Start/End: Original strand, 43408303 - 43408438
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttt |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43408303 |
aaaatatttgtcccaaattatatgttgctttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaac--tatttattactctatcttc |
43408400 |
T |
|
| Q |
205 |
tttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43408401 |
tttcaattatttcatttatctttcccatattatttatt |
43408438 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46741217 - 46741053
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46741217 |
tctgtcccaaattatatgtcgctttggaaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattata |
46741120 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46741119 |
tccttaac--tattaattaccctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaa |
46741053 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48962837 - 48962670
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48962837 |
ccaaattgtatgtcgtttaggaaaaaaaatttgtcataaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttc |
48962738 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48962737 |
ac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataat |
48962670 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54103985 - 54103874
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
54103985 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattactctctcttctttcaagtc |
54103888 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
54103887 |
ttttatttatcttt |
54103874 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 43600880 - 43601042
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
43600880 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttatattataacctt |
43600979 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43600980 |
agc--tatttattactctctattcttttaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
43601042 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Original strand, 49818288 - 49818458
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
49818288 |
gttctaaattatatgtcgttttagagaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataacc |
49818387 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
49818388 |
ttaa--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttctctttaccatattatttattaaggataat |
49818458 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 52262267 - 52262397
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | |
|
|
| T |
52262267 |
ttgtcccaaattatacgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatacccttaac--tatttattactctctcttctttcatt |
52262364 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
52262365 |
tctttaatttatctttctcatatcatttattaa |
52262397 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54241090 - 54240936
Alignment:
| Q |
86 |
attgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactg |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54241090 |
attgtatgtcactttagaaaaaatatttgtccgaaattgtatgtcgttttacaataccgatgaaaaataaatgttacttttcctattatatccttaa--t |
54240993 |
T |
|
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||| || || | || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
54240992 |
tatttatcaccctctattctttcaattacttcatttatctttctcatatcatttatt |
54240936 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29756786 - 29756629
Alignment:
| Q |
86 |
attgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactg |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29756786 |
attgtatgtcgctttagggaaaaaaaatgtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac-- |
29756689 |
T |
|
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
29756688 |
tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcgtattatttattaag |
29756629 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 5925313 - 5925477
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5925313 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaatttgtcc-aaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataacctta |
5925411 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5925412 |
ac--tatttattactc--tcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggataat |
5925477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8096874 - 8096715
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8096874 |
ccaaattatatgtcactttagaataaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacaatagcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
8096775 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8096774 |
aac--tatttattactctttc---------ttctttcatttatctttcacatatcatttattaaggataat |
8096715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 39290549 - 39290688
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39290549 |
ccaaattgtatctcgctttggaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttctcattatatcctta |
39290648 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
39290649 |
ac--tatttattactctatcttctttcaattccttaatttat |
39290688 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 196
Target Start/End: Original strand, 3835265 - 3835375
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3835265 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaac |
3835364 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattact |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
3835365 |
--tatttattact |
3835375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 227
Target Start/End: Original strand, 4756351 - 4756465
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4756351 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttaagataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaac--tatttattactctttcttttttcaa |
4756448 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4756449 |
ttctttaatttatcttt |
4756465 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 38808121 - 38808267
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
38808121 |
aaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac--tattaatcactctctct |
38808218 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38808219 |
tctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
38808267 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42662727 - 42662566
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42662727 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttc |
42662628 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctt-tcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| ||| || ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42662627 |
ac--tatttatt-gtcttctctacttccaagtcattcatttatctttcacatatcatttattaag |
42662566 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 390800 - 390636
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaata-ccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
390800 |
gttccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgttccaaattgtatgtcgctttacaatacccaatgaatcattaatgttactttttctattatatc |
390701 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctt-tcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||| || |||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
390700 |
cttcac--tatttatt-gtcttctctactttcaagtcattcatttatctttcacatatcatttattaa |
390636 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 49780496 - 49780328
Alignment:
| Q |
81 |
tccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
49780496 |
tccaaattgtatcttgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgccgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttaattttcctattatattctt |
49780397 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
49780396 |
aac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttctataccatttattaaggataat |
49780328 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 50106321 - 50106157
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
50106321 |
ccaaattgtatgtcgttttaaaaaaaaaatt-gtcctaaattatacgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattttatcctta |
50106223 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
50106222 |
ac--tatttatcactc--tcttctttcaattctttaatttatctttcccataccatttattaaggataat |
50106157 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31289352 - 31289185
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| | | || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31289352 |
ccaaattatatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcctaaattatttatcgttttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
31289253 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31289252 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatatcatttattaagaataat |
31289185 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Original strand, 37056612 - 37056788
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
37056612 |
taatactccatccgtcccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaattgtccaaaattgtatgtcgctttacaataccaatacaactttaatgttattt |
37056711 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37056712 |
ttcctattataaccttaac--tatttattagtc--tcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
37056788 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 44976316 - 44976481
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44976316 |
ccaaattgtatgtcgcttt-gaaaaaaaatt-gtttcaaattatatgttattttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
44976413 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44976414 |
ac--tattaattacattctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
44976481 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 251
Target Start/End: Original strand, 47142198 - 47142381
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
47142198 |
aatactccctctgttctaaattgtatgtcgttttagagaaaaaaaattgtcttaaattatatttcattttacaataccaatgcaacattaacgttacttt |
47142297 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47142298 |
ttctattataaccttaact--atttattactctattttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaggataat |
47142381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 49102444 - 49102613
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49102444 |
ccaaattgtatgtcgttttggaagaaaaaaaattgtcccaaattatatatcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatcct |
49102543 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
49102544 |
taac--tattaattactctatcttttttcaattatttcatttatctttttcataccatttattaaggataat |
49102613 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 53722169 - 53722330
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
53722169 |
caaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaattgttccaaattatatatcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
53722268 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
53722269 |
ac--tatttattactatatcttctttcaattatttcatttatctttcccatgttatttattaag |
53722330 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20394273 - 20394162
Alignment:
| Q |
69 |
tactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
168 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20394273 |
tactccatccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgttccaaattgtacgtcgctttacaataccgatgaatcattaatgttacttttcc |
20394174 |
T |
|
| Q |
169 |
tattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
20394173 |
tattatatcctt |
20394162 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 23307789 - 23307949
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |
|
|
| T |
23307789 |
ccaaattgtatgtcgctttaggggaaaaaattgtcccaaattatatgttgttttacaatactaatgtaacattaatgttactttttctattataacttta |
23307888 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23307889 |
ac--tatttattgctctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaa |
23307949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23513182 - 23512999
Alignment:
| Q |
61 |
tatagtaatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatattt-gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgt |
159 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||| |||||| |||||| |||| || ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23513182 |
tatagtattactccctccgttccaaattgtatgtcgctttaggagaaaaattttgtctcaaattatatgtcgttttataacacccatgcaacattaatgt |
23513083 |
T |
|
| Q |
160 |
tacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||| | |||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23513082 |
tgctttttcaattataaccttaatt--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
23512999 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 180
Target Start/End: Original strand, 31170398 - 31170495
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31170398 |
ccaaattgtatatcactttggaaaaaaaatt-gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcctt |
31170495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29361598 - 29361436
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttta-gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
29361598 |
ccaaattgtatatcgctttaaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgcaactttaatgttatttttcttattataacctt |
29361499 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29361498 |
aac--tatttattactctcttttatttcaattctttaatttatttttcccatattatttattaag |
29361436 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31171656 - 31171491
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31171656 |
aaattgtatgttgttttggaaaaaatatttgttttaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatcattaac |
31171557 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31171556 |
--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccatactatttattaaggataat |
31171491 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 245
Target Start/End: Original strand, 32048031 - 32048167
Alignment:
| Q |
106 |
aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctttt |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
32048031 |
aaatatttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaac--tatttattactc-ctcttct |
32048127 |
T |
|
| Q |
206 |
ttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
32048128 |
ttcgattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
32048167 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33593221 - 33593060
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
33593221 |
ccaaattatatgtcgctttagggaaaaaaatttgtctcaaaatttatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacttt |
33593122 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
33593121 |
aa--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttctcatattatttattaa |
33593060 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33600352 - 33600191
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
33600352 |
ccaaattatatgtcgctttagggaaaaaaatttgtctcaaaatttatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacttt |
33600253 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
33600252 |
aa--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttctcatattatttattaa |
33600191 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39144674 - 39144526
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||||| ||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39144674 |
ccaaattgtatgtcgctttgggaaaaaaatt-gttttaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcatta |
39144576 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39144575 |
ac--tatttattactctctcttatttcaattctttaatttatctttctcata |
39144526 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4822949 - 4822788
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4822949 |
ccaaattgtatgttgctttagggaaaaatatttgttctaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacat-aatgttacttttcctattataacctt |
4822851 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4822850 |
agtt--atttattactttcttttctttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaag |
4822788 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9783294 - 9783150
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9783294 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctt-----------------attaatgttacttttcctaatatatcc |
9783212 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
9783211 |
ttaac--tatttattattctctcttctttcaattccttcctttatcttttccatatcatttatt |
9783150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 245
Target Start/End: Original strand, 41935918 - 41936082
Alignment:
| Q |
81 |
tccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat--ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41935918 |
tccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttaattttcctattatatcc |
41936017 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| | | ||| | |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41936018 |
ttcac--tatttattgccttctctactctcaagtcattcatttatcttttccatataatttattaag |
41936082 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 11363062 - 11363219
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatt-tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||| | || | ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11363062 |
caaattgtatgtcgctttagggaaatttttgtatcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
11363161 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
11363162 |
gc--tatttattac----tcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
11363219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43190756 - 43190597
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
43190756 |
caaattgtatgtcgtttt-gaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattatatcattaa |
43190658 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| | |||| || ||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
43190657 |
c--tatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttccgatatcatttactaag |
43190597 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8333710 - 8333543
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
8333710 |
caaattgtatgtcgctttagcgaaaaaaaattgtcaaaaattatatgttgttttacaatactaatgcaacattaatattactttttctattataacctta |
8333611 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8333610 |
act--atttattactctctcttcttttaattctttcatttatttttcccatattatttattaaggataat |
8333543 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32852205 - 32852076
Alignment:
| Q |
113 |
tgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactc--tttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
32852205 |
tgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccaattatgcccttaac--tatttattactctattttttttttcaa |
32852108 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
32852107 |
ttatttaatttatctttctcataccatttatt |
32852076 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 44035154 - 44035316
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
44035154 |
ccaaattgtacgtcgctttaggagaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatattacttttccaattataacttt |
44035253 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| | | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
44035254 |
aatt--aattattactccatcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
44035316 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47916053 - 47915923
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
47916053 |
aaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaac--tatttattactctcttttctttcaattatttaa |
47915956 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47915955 |
tttatctttctcatacaatttattaaggataat |
47915923 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 184
Target Start/End: Original strand, 9794487 - 9794587
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9794487 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcctta |
9794584 |
T |
|
| Q |
182 |
act |
184 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
9794585 |
act |
9794587 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Original strand, 46336741 - 46336864
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
46336741 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttatttttcttattataacc--------atttattactctctcttcttccaattc |
46336832 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46336833 |
tttcatttatctttcccatattatttattaag |
46336864 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 251
Target Start/End: Original strand, 14780979 - 14781073
Alignment:
| Q |
155 |
aatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14780979 |
aatgttacttttcctattatatctttaact--attaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
14781073 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48574871 - 48574753
Alignment:
| Q |
122 |
ttgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcattt |
221 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48574871 |
ttgtacgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatattattttttctattatatctttaact--atttattactctctcttctttcaattccttcattt |
48574774 |
T |
|
| Q |
222 |
atctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48574773 |
atctttcccatattatttatt |
48574753 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26367444 - 26367284
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
26367444 |
caaattgtatgttactttagagaaaaaaaattgtccaaaattatatgttgttttacaatactaataaaatattaatgttactttttctattatatc-tta |
26367346 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26367345 |
attgt--ttattactttatcttctttgaattccttcatttatctttcccatataatttattaag |
26367284 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7674175 - 7674080
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7674175 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaaattgtcctaaattgtatttcgttttacaatatcaatgaatcattaatgttgcttttcctattatatc |
7674080 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Original strand, 27834344 - 27834474
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttc |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
27834344 |
caaattgtatgtcg-tttacaatattaataaaacattaatgttatttttcctatcatatccttaatt--atttattactctctcttcttttaattctttc |
27834440 |
T |
|
| Q |
218 |
atttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
27834441 |
atttatctatcacatatcatttagtaaggataat |
27834474 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Original strand, 23656314 - 23656404
Alignment:
| Q |
152 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
23656314 |
attaatgttacttttcctattataaccataatt--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaa |
23656404 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35958090 - 35957961
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
35958090 |
tttgtcccaaattataagtagctttaaaatacc---gaagcattaatgctacttttcctattatacccttaact--atttattactttctcttttttcaa |
35957996 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35957995 |
ttttttattttatctttctcatatcatttattaag |
35957961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49893165 - 49893071
Alignment:
| Q |
149 |
aacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49893165 |
aacattaatgttactttttctattataaccttagct--atttattactctctattctttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
49893071 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18019717 - 18019593
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
18019717 |
caaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcc-aaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaaaattaattttacttttcctattacaacctta |
18019619 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
18019618 |
ac--catttattactctctattttttca |
18019593 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37331457 - 37331296
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| | ||| |
|
|
| T |
37331457 |
caaattgtatgtcgctttaggggaaaaaatgtgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttattttttcaattataacatta |
37331358 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37331357 |
act--atttattatgatctcttctttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaag |
37331296 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21817592 - 21817468
Alignment:
| Q |
101 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
21817592 |
agaaaaaaaaattgtttcaaattatatgtcgttttaccataccaatgaaacattaatgttatttttcccgttatattcttaac--tatttattactctct |
21817495 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21817494 |
cttccttcaattctttcttttatcttt |
21817468 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 233
Target Start/End: Original strand, 49384121 - 49384249
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
49384121 |
aaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatacaatattaatgttatttttcctattataactttaac--tttttattactttatct |
49384218 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
49384219 |
tctttcaattctttcatttatttttctcata |
49384249 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3429109 - 3428953
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
3429109 |
caaattatatgtcgctttggaaaaaat---tgtctcaaattatttgtcgttttacaataccaatgaagtattaatgttatttttcttattatatcctaat |
3429013 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3429012 |
---tatttattactctctcttctttcaattctttaatttatcattttcataccatttattaag |
3428953 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 245
Target Start/End: Original strand, 23005704 - 23005867
Alignment:
| Q |
78 |
tgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||| || |||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
23005704 |
tgtttcaaattatatgtcgatttagaaaaaaa--ttatctcaaattatatgtcattttacaatactaatgaagcattgatattacttttccaattacatc |
23005801 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
23005802 |
tttaact--attttttactctctcttctttcaattctttcatttatttttctcgtataatttattaag |
23005867 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Original strand, 49615375 - 49615477
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
49615375 |
aatgaaacattaatgttac-tttcctattatatccttaac--tatttattactc--tatttttttaactctttcttttatctttctcgtatcatttatta |
49615469 |
T |
|
| Q |
244 |
agtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
49615470 |
aggataat |
49615477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 29040469 - 29040601
Alignment:
| Q |
116 |
cccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctt |
215 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
29040469 |
cccaaattatacgtcgctttacaatagcaatgaagcattaacgttacttttt-tattatgtctttaact--atttattaccatctcttttttcaattttt |
29040565 |
T |
|
| Q |
216 |
tcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29040566 |
ttatttatctttcacatatcatttattaaggataat |
29040601 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3442861 - 3442727
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaaca---ttaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttc |
208 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
3442861 |
ttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaaatattaatgttatttttcctattatatcatcaact--atctattactctatcttatttc |
3442764 |
T |
|
| Q |
209 |
aattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
3442763 |
aattcattcatttatctttctaacaccatttattaag |
3442727 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 244
Target Start/End: Original strand, 19562758 - 19562899
Alignment:
| Q |
104 |
aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta---tatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
19562758 |
aaaaaaatttgtcccaaattatacgtctctttaaaatatcaataaagcattaatgtcaattttcctattacaccatccttaac--tatttattacttact |
19562855 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19562856 |
cttcttttaactctttaatttatctttcccataccatttattaa |
19562899 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30767856 - 30767798
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
30767856 |
tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaa |
30767798 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48897267 - 48897148
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
48897267 |
aaattatatgtcactttataatattaatgaaa----aatgttaatttgctcattatatccttaact--atttattactctt-catctttcaattctttca |
48897175 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48897174 |
tttatctttctcatatcatttattaag |
48897148 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40164205 - 40164144
Alignment:
| Q |
190 |
tattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40164205 |
tattactttttctttattcaattctttcatttatcttttccatatcatttattaaggataat |
40164144 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43191000 - 43190863
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaata-tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||| |||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||| | | |
|
|
| T |
43191000 |
gaaaaaataatttgtctcaaattatatatcattttacaatatcagtgaaacattaacgttattttttctattatatcattaac--tacttattactttat |
43190903 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacattta |
240 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
43190902 |
cttcttttcattctttaatttatctttctcataccattta |
43190863 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9151415 - 9151308
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
9151415 |
aaattatatgtcattttacaatatcaatgcaacatcaatgatacttttactattataatcttagtt--atttattactctctcttctttcaattctttaa |
9151318 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
9151317 |
tttatctttc |
9151308 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32151392 - 32151313
Alignment:
| Q |
163 |
ttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
32151392 |
ttttcctattatttcattaact--atttattactctttcttctttcaattctttaatttattttttccataccatttgttaa |
32151313 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Original strand, 47895181 - 47895256
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattact |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47895181 |
aaattgtatgtcgttttacaatatcaatgaataattaatgttactttttctattatatccttaac--tatttattact |
47895256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Original strand, 19538457 - 19538562
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc--cttaactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
19538457 |
ttgtcacaaattatatgtccatttacaataccaatgaaacattaatgtcactctttctattacaccatcttaac--tatttattactctttcttctttta |
19538554 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
19538555 |
attctttc |
19538562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 251
Target Start/End: Original strand, 42938041 - 42938143
Alignment:
| Q |
147 |
gaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | |||||||| || ||| |||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42938041 |
gaaacattaatgttattttttccattatatcattgact--atttgttactctctcatctttcaattctttcatttacttttcacatatcatttattaagg |
42938138 |
T |
|
| Q |
247 |
ataat |
251 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
42938139 |
ataat |
42938143 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 51167380 - 51167339
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaatt |
123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51167380 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaatt |
51167339 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4493402 - 4493362
Alignment:
| Q |
144 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4493402 |
aatgaaacattaatgttacttttcctattatacccttaact |
4493362 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6466500 - 6466444
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
6466500 |
tatttattgctctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatatcatttatt |
6466444 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40501041 - 40500964
Alignment:
| Q |
154 |
taatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40501041 |
taatgttattttttctattataaccttaact--atttattactatatcttctttcaattttttcatttatctttctcata |
40500964 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 45674342 - 45674307
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcc |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45674342 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcc |
45674307 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 19547157 - 19547287
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc--cttaactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
19547157 |
ttgtcccaaattatatgtatatttacaatatcaatgaagcactaattacactttttctattatatcatcttaact--atttattactct--cttctttta |
19547252 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
19547253 |
attctttaatttatctttcccgtaccatttattaa |
19547287 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 251
Target Start/End: Original strand, 9795273 - 9795333
Alignment:
| Q |
191 |
attactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9795273 |
attactctctattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
9795333 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45207769 - 45207612
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaa----aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45207769 |
caaattgtatgtcactttggaagaaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgttgctttacaatactaatga------attgttacttttcatattatatcc |
45207676 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| | ||| || || || ||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45207675 |
ttcac--tatttattaccttctctacttctaagtcattcatttatttttcccatattatttattaa |
45207612 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7554642 - 7554552
Alignment:
| Q |
159 |
ttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | | || ||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7554642 |
ttactttttctattatactcttaact--atttattactttctgttcttttaattctttaatttatttttctcataccatttattaaggataat |
7554552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25134751 - 25134678
Alignment:
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25134751 |
tattatatctttaact--atttattactctctcttcttttaattctttattttatctttctcat-acatttattaag |
25134678 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Original strand, 1384416 - 1384472
Alignment:
| Q |
116 |
cccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatt |
172 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||| | |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1384416 |
cccaaagtatatgtcacttgacaataacaattaagcattaatgttacttttcctatt |
1384472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30744071 - 30743978
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| | || |||| ||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
30744071 |
aatatcaatgaaatattaattttacttttcttattatactcttagct--atttattactctatattctttcgattctttaatttatttttctcata |
30743978 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33272877 - 33272814
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33272877 |
aaaaaatatt-gtctcaaattataagtcactttatattaccaataaaacattaatgttatttttc |
33272814 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 244
Target Start/End: Original strand, 34344483 - 34344527
Alignment:
| Q |
200 |
tcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
34344483 |
tcttttttcaattctttaatttatctttctcatactatttattaa |
34344527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 178)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 46774122 - 46774289
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46774122 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
46774221 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
46774222 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
46774289 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 68 - 251
Target Start/End: Original strand, 25428178 - 25428360
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25428178 |
atactccatcggtcccaaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttc |
25428277 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttc-ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25428278 |
ctattatatccttaac--tatttattactctttctttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
25428360 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 18234898 - 18235065
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18234898 |
ccaaattgtatgtcactttagcaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttaattttcctattatatcctta |
18234997 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18234998 |
ac--tatttattactgtttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
18235065 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24685696 - 24685529
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24685696 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcttta |
24685597 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24685596 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttccaatatcatttattaaggataat |
24685529 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1643774 - 1643613
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1643774 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcctta |
1643675 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1643674 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattttttcatttatctttctcatatcatttattaag |
1643613 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 242
Target Start/End: Original strand, 44186889 - 44187053
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44186889 |
tctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattata |
44186988 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44186989 |
tccttaac--tatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcccatgtcatttatt |
44187053 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 22624327 - 22624494
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22624327 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatatcctta |
22624426 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
22624427 |
ac--tatttattactcttttctttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttaataaggataat |
22624494 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40768745 - 40768587
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40768745 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
40768646 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40768645 |
ac--tatttattactctctcttatttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
40768587 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 39199059 - 39199226
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39199059 |
ccaaattgtatgtcatttttaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
39199158 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39199159 |
ac--tatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttcttatatcatttattaaggataat |
39199226 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Original strand, 38589422 - 38589596
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38589422 |
taatactccatctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgttgctttacaatactaatgaaaaattaatgttacttt |
38589521 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
38589522 |
tcctattatatccttaac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttatt |
38589596 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 25756354 - 25756518
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaa---aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25756354 |
ccaaattgtatgtcactttaggaagaaaaaaaattgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaacgttacttttcctattatatcc |
25756453 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25756454 |
ttaac--tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaag |
25756518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 44480999 - 44481157
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44480999 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatcctta |
44481098 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
44481099 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
44481157 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46373271 - 46373113
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46373271 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatcctta |
46373172 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
46373171 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttatt |
46373113 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35144370 - 35144197
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35144370 |
aatactctctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttt |
35144271 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35144270 |
cctattatatccttaac--tatttattactctctcttctttaaattccttcatttatttttcccatatcatttatt |
35144197 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35421883 - 35421734
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35421883 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
35421784 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35421783 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccata |
35421734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33938486 - 33938322
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33938486 |
gttccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatcc |
33938387 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33938386 |
ttaac--tatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttctcatatcatttattaag |
33938322 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 38074511 - 38074675
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38074511 |
gttccaaattgtatgtcactttagagaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
38074610 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38074611 |
ctaac--tatttattattctttctcctttcaattatttcatttatcttttccataacatttattaag |
38074675 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 8611826 - 8611993
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8611826 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
8611925 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
8611926 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattcctttatttatctttctcatatcatttattgaggataat |
8611993 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12118872 - 12118721
Alignment:
| Q |
98 |
tttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactc |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12118872 |
tttagaaaaaatatttgtcccaaactgtatgtcattttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac--tatttattactc |
12118775 |
T |
|
| Q |
198 |
tttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12118774 |
tttcttttttcaaatctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
12118721 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 23059083 - 23059250
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23059083 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
23059182 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
23059183 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataat |
23059250 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 5528397 - 5528555
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5528397 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtctttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
5528496 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
5528497 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttatt |
5528555 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23726644 - 23726486
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23726644 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattactttttctattatatcctta |
23726545 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23726544 |
ac--tatttattactctctcttatttcaattccttaatttatctttcccatatcatttatt |
23726486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4513628 - 4513471
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4513628 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaatactaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
4513529 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4513528 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttat |
4513471 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 22918186 - 22918335
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22918186 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataacctta |
22918285 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22918286 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttctcata |
22918335 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 251
Target Start/End: Original strand, 37798060 - 37798228
Alignment:
| Q |
81 |
tccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37798060 |
tccaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctt |
37798159 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
37798160 |
aac--tatttattactctcttttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataat |
37798228 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 2648913 - 2649080
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2648913 |
ccaaattgtatgtcgtttttaaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaatgccaaagaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
2649012 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2649013 |
ac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcatatatcatttattaaggataat |
2649080 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44894842 - 44894684
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44894842 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcacaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcatta |
44894743 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44894742 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttatt |
44894684 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 42121914 - 42122075
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42121914 |
ccaaattgtatgtccctttacaaaaataatttgtctcaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatcctta |
42122013 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42122014 |
ac--tatttattactttttcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaag |
42122075 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43468541 - 43468384
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43468541 |
caaattgtatgtcgcttcagaaaaaatatttgtccaaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaa |
43468442 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43468441 |
--ttatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
43468384 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45823227 - 45823070
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45823227 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatcctta |
45823128 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatt-tatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45823127 |
ac--tatttattactc--tcttctttcaattctttcattgtatctttcccatatcatttatt |
45823070 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34275724 - 34275565
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34275724 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatcctt |
34275625 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34275624 |
aac--tatttattactctctcttttttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
34275565 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29986038 - 29985880
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29986038 |
ccaaattgtatgccactttgaaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
29985939 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29985938 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
29985880 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47834419 - 47834262
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47834419 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaa |
47834320 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
47834319 |
c--tatttattactttctcttatttcaattccttcatttttctttcccatatcatttatt |
47834262 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27119131 - 27118955
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27119131 |
aatactccctctgtcccaaattgtatgtcgttttatgaaaaaaaattgtctcgaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttt |
27119032 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27119031 |
cctattatatccttaa--gtatttattactctttcttctttcaattctttcgtttatatttcacatatcatttattaag |
27118955 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32827887 - 32827727
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32827887 |
aaattgtatgtcacttgagagaaaaaaaagtgtcacaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
32827788 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32827787 |
c--tatttattactctttcttcttttaattctttcatttatatttcccatgacatttattaag |
32827727 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28472334 - 28472176
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28472334 |
aaattgtatgtcacttgaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaatac-aatgaaacattaatgttacttttcctattacatccttaac |
28472236 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28472235 |
t--atttattactctttcttcttttaattctttcatttatatttcccatgacatttattaag |
28472176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42688794 - 42688636
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42688794 |
ccaaattgtatgtcactttggaataaatatttatcctaaattgtatctcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatcctta |
42688695 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
42688694 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttatt |
42688636 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47578947 - 47578790
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47578947 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaa-tatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
47578849 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
47578848 |
ac--tatttattactctattttctttcatttccttcatttatctttctcatatcatttatt |
47578790 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39403983 - 39403807
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39403983 |
aatactccctctgtcccaaattgtatgtcattttgaaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttattttt |
39403884 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
39403883 |
cctattataaccttaac--tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttctcatattatttattaag |
39403807 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17611588 - 17611406
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
17611588 |
taatactctctctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttt |
17611490 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17611489 |
tcctattatatccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
17611406 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 21177224 - 21177391
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21177224 |
ccaaattttatgtcgctttggaaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
21177323 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21177324 |
ac--tattaattactctatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
21177391 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28234377 - 28234242
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28234377 |
gtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaa--ttatttattactctttcttttttcaattc |
28234280 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
28234279 |
tttcatttatctttctcatatcatttagtaaggataat |
28234242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 28703556 - 28703715
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28703556 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
28703655 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28703656 |
ac--tattaattactatctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
28703715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 31466061 - 31466228
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31466061 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
31466160 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31466161 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
31466228 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 32467820 - 32467987
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32467820 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttg |
32467919 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32467920 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcccatactatttattaaggataat |
32467987 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 45780918 - 45780791
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45780918 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
45780819 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
45780818 |
ac--tatttattactctctcttctttcaat |
45780791 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 3225448 - 3225606
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3225448 |
ccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttattccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
3225547 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
3225548 |
ac--tatatattactcttttttctttcaattccttcatttatctttctcatgtcatttatt |
3225606 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 30264439 - 30264601
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30264439 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
30264538 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
30264539 |
agc--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
30264601 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5680470 - 5680321
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5680470 |
ccaaattatatgtcactttaaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataacctta |
5680371 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5680370 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagttttttatttatcttttccata |
5680321 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5705522 - 5705373
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5705522 |
ccaaattatatgtcactttaaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataacctta |
5705423 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5705422 |
ac--tatttattactctctcttctttcaagttttttatttatcttttccata |
5705373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28537029 - 28536880
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28537029 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
28536930 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28536929 |
ac--tatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcata |
28536880 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24924440 - 24924296
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24924440 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaatttgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttctattatatcctta |
24924341 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttc |
228 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24924340 |
ac--tatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttc |
24924296 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29155760 - 29155604
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
29155760 |
aaattgtatgtcgctttaaaaaaaatatgtgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattgtatccttagc |
29155661 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
29155660 |
--tatttattagtctctcttatttcaattccttcatttatctttctcatatcatttatt |
29155604 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 6882853 - 6883012
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgtta-cttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6882853 |
ccaaattgtatatcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgtcattttttcctattatatcctt |
6882952 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
6882953 |
aac--tatttattattctctcttctttcaattcattcatttatctttctcatatcatttatt |
6883012 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 30803297 - 30803456
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30803297 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatattacttttcctattatatcctta |
30803396 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30803397 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
30803456 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 37115745 - 37115903
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaa--aatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37115745 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatcctta |
37115844 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
37115845 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcacatataatttatt |
37115903 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6696891 - 6696722
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6696891 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaaaaaaaattgtcccaaattatatttcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttttattatatcct |
6696792 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6696791 |
taatt--atttattactctttcttctttcaattatttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
6696722 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 36916681 - 36916846
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
36916681 |
aaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattataaatcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatattatattcttaac |
36916780 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
36916781 |
--tatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataat |
36916846 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 3264365 - 3264523
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
3264365 |
caaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaagttatatgt-------gaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatc-ttaa |
3264456 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3264457 |
ct--atttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcaaatcatttattaaggataat |
3264523 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 18975945 - 18976101
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18975945 |
tctgtcccaaattgtatgtcgctttagagaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattat |
18976044 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18976045 |
aaccttaac--tatttattactctctcttcgttcaattctttcatttatctttctcata |
18976101 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 232
Target Start/End: Original strand, 31502821 - 31502969
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31502821 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta |
31502920 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31502921 |
gc--tatttattactctcttttctttcaattctttaatttatctttcccat |
31502969 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32827389 - 32827205
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattg-tatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactt |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
32827389 |
taatactctctccgtctcaaattgtatgtcgctttgggaaaaaaatttgtcccaaatttatatgtctctttacaataccaatgaaatattaatgttattt |
32827290 |
T |
|
| Q |
165 |
ttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32827289 |
ttcctattatatccttaac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
32827205 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 242
Target Start/End: Original strand, 35497655 - 35497827
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35497655 |
atactccatccgtcccaaattgtatgttattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttt |
35497754 |
T |
|
| Q |
168 |
ctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
35497755 |
ctattatatctttaac--catttattactctctcttctatcaattccttcatttatcttttctatatcatttatt |
35497827 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 7979006 - 7979173
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7979006 |
ccaaattgtatgttactttggaaaaaagatttgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
7979105 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7979106 |
ac--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttctataccatttattaaggataat |
7979173 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 13439330 - 13439469
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13439330 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatcctta |
13439429 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13439430 |
a--ttatttattactatctcttctttcaattccttcatttat |
13439469 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38510178 - 38510020
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38510178 |
ccaaattgtatgtcattttagaaaaaatacttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaataaaagattaatgttacttttcctattatattctta |
38510079 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
38510078 |
ac--aatttattacactctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttatt |
38510020 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43884393 - 43884227
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43884393 |
caaattgtatgtcgctttggaaaaaaattttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaa |
43884294 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43884293 |
c--tattaattactctatcttctttcaattatatcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
43884227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25651253 - 25651153
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25651253 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttgcaataccaatgaaacattaattttacttttcctattatatctttaac |
25651154 |
T |
|
| Q |
184 |
t |
184 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
25651153 |
t |
25651153 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27116679 - 27116522
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27116679 |
aaattatatgtcgctttagaaaaaaaatttgtcccaaattatatatcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaac |
27116580 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
27116579 |
--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttttcataccatttatta |
27116522 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29410354 - 29410193
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
29410354 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcattttacaataccaatgcaacattaatgttatttttccaattataacctta |
29410255 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29410254 |
ac--tatttattattatctcttctttcaattctttcatttatcttacccatattatttattaag |
29410193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 17832925 - 17833093
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttt-agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17832925 |
ccaaactgtatgtcgctttgaaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatcctt |
17833024 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17833025 |
aac--tattaattagtctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
17833093 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 242
Target Start/End: Original strand, 35541975 - 35542131
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35541975 |
aaattgtatgtcactttataaaaaatatttgtcataaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaataaatgttacttttcctattatatccttaa- |
35542073 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
35542074 |
-ttatttattactctctcttctttcaattacttcatttattttttccatatcatttatt |
35542131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3458601 - 3458442
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3458601 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
3458502 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3458501 |
ac--tattaattattctctattctttcaattatttcatttatcttttctataccatttatta |
3458442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10453176 - 10453021
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10453176 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaatt-atgttactttttctattatatcctta |
10453078 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10453077 |
ac--catttgttactc--tcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
10453021 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11910700 - 11910544
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11910700 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgccgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
11910601 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
11910600 |
ac--tatttattgttc--tcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatatatt |
11910544 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 33616391 - 33616550
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33616391 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatcctta |
33616490 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33616491 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
33616550 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47604749 - 47604590
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47604749 |
ccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaattttttctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
47604650 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47604649 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
47604590 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22326795 - 22326633
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
22326795 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaacctt |
22326696 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22326695 |
a--gttatttattactctctcttttttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
22326633 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27059807 - 27059658
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27059807 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcatta |
27059708 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27059707 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccata |
27059658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32466430 - 32466258
Alignment:
| Q |
77 |
ctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaac-attaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32466430 |
ctgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaatattaatgttacttttcctattata |
32466332 |
T |
|
| Q |
176 |
tccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32466331 |
ttcttgact--attaattactctctcttctttcaattatttcatttatctttctcataccatttattaaggataat |
32466258 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 584659 - 584483
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcacttta-gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||| | ||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
584659 |
atactctctccgtcccaaattgtatggcgctttaaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcactttacaatactaatgcaacattaatattactttt |
584560 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
584559 |
tctattataaccttaatt--atttattactctctcttttttcaattttttcatttatctttcccatattatttattaag |
584483 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 22369516 - 22369678
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag--aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
22369516 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaat-tttctcccaaattatatgtcgctttacaataccaatggaacattaatgttacttttcctattgtaacct |
22369614 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22369615 |
tagtt--atttattactctctcttttttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaag |
22369678 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42584602 - 42584434
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| |||||| ||| | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42584602 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgcttaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataacctt |
42584503 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42584502 |
aact--atttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcccatattatttattaaggataat |
42584434 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 12263663 - 12263830
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12263663 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgctttacaagaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
12263762 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12263763 |
ac--tattaattactccccattctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
12263830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26913876 - 26913691
Alignment:
| Q |
66 |
taatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttaga----ataccaatgaaacattaatgtta |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
26913876 |
taatactctctccgtcccaaattatacgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttgcaatatataccaataaaatattaatgtta |
26913777 |
T |
|
| Q |
162 |
cttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26913776 |
tttttcctattatatctttaac--tatttattactc--tcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaagaataat |
26913691 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 29669285 - 29669444
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29669285 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtccaaaattatatgtcgctttacaataacaatgaaatattaatgttactttttctattatatcctta |
29669384 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29669385 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattattttatttatcttttccataccatttatta |
29669444 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36669796 - 36669657
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36669796 |
ccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatcctta |
36669697 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36669696 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttat |
36669657 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 39430094 - 39430261
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39430094 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaatttttttgtcccaaattatatgtcgcttgacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
39430193 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39430194 |
ac--tattaattactccatattctttcaattatttcatttatctttttcgtaccatttattaaggataat |
39430261 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 40704402 - 40704568
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40704402 |
ccaaattgtatatcgctttggaaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatg-aatattaatgttatttttcctattatatcctta |
40704500 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40704501 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattattacatttatcttttccataccatttattaaggataat |
40704568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 24161648 - 24161814
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24161648 |
caaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttatccaaaattatatgtcattttacgataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaa |
24161747 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24161748 |
--ttattaattattctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
24161814 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25547978 - 25547821
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25547978 |
ccaaattttatgtcattttagaaaaaatatttgtcc-aaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatattacttttcatattatatcctta |
25547880 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| | ||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
25547879 |
ac--tatttattactctctcttctatcagttccttcgtttatcttttccatatcatttatt |
25547821 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26838212 - 26838074
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
26838212 |
tttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttagc--tatttattactatcacttctttcaa |
26838115 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26838114 |
ttctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
26838074 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9417871 - 9417710
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9417871 |
ccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttc |
9417772 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9417771 |
ac--tatttattgccttctctactctcaaatcattcatttatctttctcatatcatttattaag |
9417710 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 9818097 - 9818262
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-----aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9818097 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaagaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatat |
9818196 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
9818197 |
ccttaa--gtatttattactctatcttctttcacttccttcatttatctttctcatatcatttattaa |
9818262 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 10720022 - 10720187
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-----aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10720022 |
ccaaattgtatgtcactttagaagaagaaaaaaaattgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatat |
10720121 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
10720122 |
ccttaa--gtatttattactctatcttctttcacttccttcatttatctttctcatatcatttattaa |
10720187 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19785810 - 19785680
Alignment:
| Q |
123 |
tgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt----ttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19785810 |
tgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaac--tatttattactttttttttttcttttcaattctttca |
19785713 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19785712 |
attatctttcccatatcatttattaaggataat |
19785680 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 28586948 - 28587108
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
28586948 |
ccaaattatatgtcgctttaggaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccta-tataacttta |
28587046 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
28587047 |
ac--tatttattattctcttttctttcaattctttcatttatctttctcatgttatttattaag |
28587108 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 37277696 - 37277864
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaa--aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37277696 |
caaattgtatgtcgctttggaagaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcttt |
37277795 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37277796 |
aac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
37277864 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 10316561 - 10316708
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttta-gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10316561 |
ccaaattgtatgtcgctttaaggaaaaaaacttgtcccaaattatatttcgttttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataacctt |
10316660 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccc |
230 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10316661 |
aac--tatttattactctctcttctttcaattttttcatttatctttccc |
10316708 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 23709573 - 23709731
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23709573 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatta-tctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctta |
23709671 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23709672 |
ac--tattaattactctctcatctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
23709731 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 43576770 - 43576909
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
43576770 |
gaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaac--tattaattactctcta |
43576867 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43576868 |
ttctttcaattattttatttatcttttccataccatttatta |
43576909 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 45041988 - 45042154
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
45041988 |
ccaaattgtatgtcatttt-gaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttagaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcattc |
45042086 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| || ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45042087 |
ac--tatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaaggataat |
45042154 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 48339460 - 48339626
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48339460 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgttttacaataccgatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctta |
48339558 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48339559 |
ac--tattaattactatcgcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
48339626 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40537049 - 40536886
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40537049 |
ccaaattatatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttagttttcctattatatcctta |
40536950 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| |||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40536949 |
a--gtattaattactctctcttcttttaattat----tttatcttttccataccatttattaaggataat |
40536886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 41877712 - 41877874
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
41877712 |
ccaaattatatgtcgctttagggaaaaaaatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccaattataacctt |
41877811 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41877812 |
aac--tatttattattatctcttctttcaattctttcatttatcttttccatattatttattaag |
41877874 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4503894 - 4503737
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4503894 |
aaattgtatgtcgctttaaaaaaaaa--ttgtactaaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac |
4503797 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4503796 |
--tattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaag |
4503737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32328089 - 32327949
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
32328089 |
aaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatatttttcctattataaccttaa--ttatttattaccctttct |
32327992 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32327991 |
tctttcaattctttcatttatttttctcatatcatttattaag |
32327949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40353900 - 40353735
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttt--agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40353900 |
ccaaattgtatgttactttgaagaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcct |
40353802 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40353801 |
taac--tattaattactc---cttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
40353735 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42912483 - 42912318
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag----aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatc |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
42912483 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttatttttcctattataac |
42912384 |
T |
|
| Q |
178 |
cttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
42912383 |
cttaac--tatttattactctctcttatttcaattcttccatttatttttctcatattatttattaag |
42912318 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 243
Target Start/End: Original strand, 42940934 - 42941061
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
42940934 |
gtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaa--ttattaattactctctcttctttcaatta |
42941031 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42941032 |
tttcatttatcttttccataccatttatta |
42941061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 242
Target Start/End: Original strand, 29409359 - 29409497
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
29409359 |
gaaaaaatatttgttccaaattatacgtcgctttacaatacaaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaac--tatttattgctctctc |
29409456 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
29409457 |
ttctttcaattccttcatttatctttctcatataatttatt |
29409497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5114097 - 5113980
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
5114097 |
gtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac--tatttattattccctcttctttcaattc |
5114000 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
5113999 |
tttcattcatctttcgcata |
5113980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9603927 - 9603766
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| | || |||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
9603927 |
ccaaattgtttgtcgctttagggacaaaatttatctcaaattgtatgttaatttacgatatcaatgaaacattaattttactttttttattatatcttta |
9603828 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
9603827 |
act--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
9603766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9831498 - 9831337
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| | || |||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
9831498 |
ccaaattgtttgtcgctttagggacaaaatttatctcaaattgtatgttaatttacgatatcaatgaaacattaattttactttttttattatatcttta |
9831399 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
9831398 |
act--atttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
9831337 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42808493 - 42808352
Alignment:
| Q |
102 |
gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttc |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
42808493 |
gaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaa--ttattaattacttcctc |
42808396 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42808395 |
ttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaag |
42808352 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32267798 - 32267636
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttag---aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| | |||| | ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
32267798 |
aaattgtacgtcactttagtgaagaaaaaaattgtctcaaattatacgtcattttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataacctt |
32267699 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
32267698 |
aatt--atttattactctatcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
32267636 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2850038 - 2849874
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
2850038 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatgtgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataatcttaa |
2849939 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2849938 |
--ttatttattactc--tcttctttcaattcttttatttatctttcctatattatttattaaggataat |
2849874 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Original strand, 2887296 - 2887427
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaat |
211 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
2887296 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattgatgttacttttcctattataaccttaatt--atttattactctctcttctttcaat |
2887393 |
T |
|
| Q |
212 |
tctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
2887394 |
tctttcatttatctttcccgtattatttattaag |
2887427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10657251 - 10657101
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatattt-gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10657251 |
ccaaattgtatgtcgctttagcgaaatttttttgtcttaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
10657152 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10657151 |
aac--tatttattactccctcttctttcaattatttcatttatttttcccata |
10657101 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16875932 - 16875770
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16875932 |
ccaaattgtatgctgctttaggaaaaaaaatttgtcataaattatatgtcgctttacaataccagtgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
16875833 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16875832 |
aac--tatttattactatctcttatttcaattatttcatttatttttcccatgttatttattaag |
16875770 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24302860 - 24302698
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| | |||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24302860 |
ccaaattgtatctcgctttaggagaaaaaatttatcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacgttaatgttacttttccaattataacctt |
24302761 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24302760 |
aa--ttaattattactcactcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
24302698 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24729778 - 24729628
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24729778 |
aatactccctctgtcccaaattgtatgtcactttagtaaaaaaaaattgtcccaacttatatgttgttttacaataccagtgaaatattaatgttacttt |
24729679 |
T |
|
| Q |
166 |
tcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
24729678 |
tcctattatatctttaac--tatttattactctctcttctttcaattccttca |
24729628 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 37411085 - 37411249
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||| | | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37411085 |
caaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatggtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaa |
37411184 |
T |
|
| Q |
183 |
c--tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| | |||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37411185 |
ctatttattgtttttttttttttttttcaattcattcatttatctttcccatattatttattaag |
37411249 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47988473 - 47988311
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
47988473 |
ccaaattgtaggtcgctttaggagaaaaaatttgtcctaaattatatgtcactttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataacttt |
47988374 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
47988373 |
aa--ttaattattactccctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
47988311 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19866545 - 19866384
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19866545 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttatttttcctattatatccttc |
19866446 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| || ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19866445 |
ac--tatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaag |
19866384 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39983498 - 39983369
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
39983498 |
gtcccaaattatatgtcgctttaaaatactaatacaacattaatgttacttttcctattataaccttaa--ttatttattactctatcttctttcaattc |
39983401 |
T |
|
| Q |
214 |
tttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
39983400 |
tttcatttatatttctcatattatttattaag |
39983369 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22707032 - 22706871
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcacttt---agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22707032 |
aaattgtatgtcactttgaaagaaaaaaaatt-gtgccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttatttttcctattatatcctt |
22706934 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | ||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22706933 |
cac--tatttattgccttctctacttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
22706871 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41887837 - 41887680
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
41887837 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaaggcaatattaatgttacttttcctattataactttaa- |
41887739 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41887738 |
-ttatttattactc--tcttctttcaattctttcatttatatttcccatattatttattaag |
41887680 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 173
Target Start/End: Original strand, 4089256 - 4089360
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
167 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4089256 |
atactccatctgtcccaaattgtatgtcgctttagaaaaaaaatt-gtcccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
4089354 |
T |
|
| Q |
168 |
ctatta |
173 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
4089355 |
ctatta |
4089360 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 3945142 - 3945305
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaa--aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
3945142 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaagaaaaaaaatgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttattttttctattataacct |
3945241 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
3945242 |
taac--tatttattactatcttttctttcaattctttcatttatctttctcatgttatttattaag |
3945305 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 8670376 - 8670528
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat |
174 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||| |||||| || ||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8670376 |
tctgtcccaaattatatgtcactttattaaaaaaaaattgtctcaaattatacgtcgctttacaatacaaataaaatattaatgttacttttcctattat |
8670475 |
T |
|
| Q |
175 |
atccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8670476 |
attcttaac--tatttattactatctcttctttcaattccttcatttatttttcc |
8670528 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43073976 - 43073874
Alignment:
| Q |
105 |
aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttt |
204 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| |
|
|
| T |
43073976 |
aaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaac--tatttattaccctctcttc |
43073879 |
T |
|
| Q |
205 |
tttca |
209 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
43073878 |
tttca |
43073874 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 244
Target Start/End: Original strand, 12848236 - 12848376
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactc-tttc |
201 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12848236 |
aaaaaaaatttgtttcaaattatatgtcaatttacaatatcaataaaacattaatattatttttcctattatatctctaac--tatttattactcttttt |
12848333 |
T |
|
| Q |
202 |
ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
12848334 |
ttttttcaattctttaatttatctttctcataccatttgttaa |
12848376 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21849919 - 21849753
Alignment:
| Q |
81 |
tccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctat---tatat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
21849919 |
tccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactatttctattagtataa |
21849820 |
T |
|
| Q |
177 |
ccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
21849819 |
ccttaac--tatttattactatctcttctatcaatactttcatttatctttctcatattatttattaag |
21849753 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 244
Target Start/End: Original strand, 39003956 - 39004066
Alignment:
| Q |
133 |
tttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
39003956 |
tttacaataccaatgaaacttaaataatacttttcctattatacccttaactat-tttattactttctcttatttcaattctttaatttatctttcccat |
39004054 |
T |
|
| Q |
233 |
aacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
39004055 |
accatttattaa |
39004066 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 46578613 - 46578776
Alignment:
| Q |
68 |
atactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| || |||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46578613 |
atactccatccgtcccaaattgtatgttgctttaggagaaaaaatttgtcccaa-ttatatgtcgcattacaatactcatgcaacattaatgttactttt |
46578711 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46578712 |
tcaattataaccttaatt--aattattactccttcttctttcaattctttcatttatctttcccata |
46578776 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10439438 - 10439311
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
10439438 |
atttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttactttttctattatatccttaacc--atttgttactct--cttctttca |
10439344 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10439343 |
attccttcatttatctttcccatatcatttatt |
10439311 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 169
Target Start/End: Original strand, 9140600 - 9140693
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
169 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9140600 |
tctgtcccaaattgtatgtcactttatgaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcattttacaataccaataaaatattaatgttacttttcct |
9140693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 40020315 - 40020475
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
40020315 |
caaattgtatgtcgctttaggagaaaaaatttgtcccaaattatatctcgttttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataacctta |
40020414 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40020415 |
a--ttaattattactccctcttcttttaa-tccttcatttatctttcccatattatttattaag |
40020475 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 19293057 - 19293220
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttc--ctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19293057 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaattttttttgtcccagattgtatgtcgcttcacaatatcaatgaaacattaatgttatttttctattattatatcct |
19293156 |
T |
|
| Q |
180 |
taactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| | |||| || ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
19293157 |
taac--tatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttactaag |
19293220 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 44452263 - 44452351
Alignment:
| Q |
155 |
aatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44452263 |
aatgttacttttcctattataaccttagtt--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
44452351 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 245
Target Start/End: Original strand, 46342738 - 46342908
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaa---aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatt |
172 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
46342738 |
tctgtcccaaattacaagtcactttagaaagaaaaaaaattgtcacaaattataagtcgctttacaataccattgaaacagtaatgttactttttctatt |
46342837 |
T |
|
| Q |
173 |
atatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||| || |||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46342838 |
ataaccttgac--tatttattgttctattttctttcaattctttaatttatcttttccacaacatttattaag |
46342908 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 203
Target Start/End: Original strand, 41820903 - 41820994
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctt |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41820903 |
atttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaac--tatttattactctatctt |
41820994 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46944677 - 46944596
Alignment:
| Q |
163 |
ttttcctattatatccttaactgtatttattactctttctttttt-caattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46944677 |
ttttcctattatatctttaact--atttattactcattctttttttcaattctttcatttatatttcccatatcatttattaag |
46944596 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26941429 - 26941289
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| || ||| ||||| | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
26941429 |
aaaaaaaaattgtccaaaattatacgtcgctttacactatcaataaaacattaattttacttttcctattatatctttaac--tatttattactttatct |
26941332 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
26941331 |
tctttcaattatttaatttatcttttacttatcatttattaag |
26941289 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Original strand, 42520123 - 42520215
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaatt |
212 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
42520123 |
caaattataagtcgctttacaatatcattgaaacattaatgttacttttcctataatacccttaac--tatttattactctttcttctttcaatt |
42520215 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24166835 - 24166732
Alignment:
| Q |
128 |
gtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24166835 |
gtcactttacaataccaatgcaacattaatgttacttttctcattctaatcttaac--tatttattattctctcttctttcaattctttcatttgtcttt |
24166738 |
T |
|
| Q |
228 |
cccata |
233 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
24166737 |
ctcata |
24166732 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42149861 - 42149712
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42149861 |
ccaaattgtaagtcgctttagagaaaaaaaattgtctcaaattatatgtcgctttacaatagcaatgcaacattaatgctacttttcctat--------- |
42149771 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42149770 |
------atttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
42149712 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Original strand, 12804394 - 12804495
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
12804394 |
ccaaattgtatgttgctttaggagaaaaaatttgtcctaaattatatgtcactttacaatactcatgcaacattaatgttacttttccaattataacctt |
12804493 |
T |
|
| Q |
181 |
aa |
182 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
12804494 |
aa |
12804495 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 39938609 - 39938735
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatattt-gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
39938609 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaattgttttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttactttttctattataacctt |
39938708 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
39938709 |
a--gttatttattactctctcttctttca |
39938735 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Original strand, 42259158 - 42259299
Alignment:
| Q |
101 |
agaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactcttt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
42259158 |
agaaaaaaaaattgccccaaattacatgtcgttttataatatcaatgaaatattaat-ttatttttcttattatatctttaact--atttattacttctt |
42259254 |
T |
|
| Q |
201 |
cttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
42259255 |
cttctttcaattctttcttttatctttctcgtatcatttattaag |
42259299 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 42521416 - 42521489
Alignment:
| Q |
154 |
taatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
42521416 |
taatgttacttttcctataatacccttaact--atttattactctttcttctttcaattctttaatttatttttcc |
42521489 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48841272 - 48841140
Alignment:
| Q |
112 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtat-ttattactctttcttttttcaa |
210 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | | ||||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
48841272 |
ttgtcctaaattatctttcattttacaatatcaatgaagcattaatgttaattttcttattatatccttaattatttagtattactctatattatttcaa |
48841173 |
T |
|
| Q |
211 |
ttctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
48841172 |
ttctttaatttatctttcacataccatttatta |
48841140 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31582215 - 31582087
Alignment:
| Q |
115 |
tcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattct |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| | | ||| | ||| || |
|
|
| T |
31582215 |
tcccaaattgtatgtcgttttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcttattatatccttcac--tatttattgccttctctactcccaaatca |
31582118 |
T |
|
| Q |
215 |
ttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31582117 |
ttcatttatctttctcatatcatttattaag |
31582087 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 6202915 - 6203002
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6202915 |
aataccaatgaaatatgaatgttacttttcttattatatctttaac--tatttattactttattttctttcaattctttcgtttatcttt |
6203002 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43015595 - 43015546
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtca |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43015595 |
ccaaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtca |
43015546 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 165
Target Start/End: Original strand, 7399650 - 7399734
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7399650 |
ccaaattatatgtcactttagaagaaaaaaaatgtctcaagttgtatgtcactttacaatatcgatgaaacattaatgttacttt |
7399734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 27045097 - 27045233
Alignment:
| Q |
114 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
27045097 |
gtcccaaattgtatatcgctttatactatcgatgaaacattaattttacttttaatattatatccttagc--tatttattactctattttttttttattc |
27045194 |
T |
|
| Q |
214 |
-tttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| | || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27045195 |
atttattttatctttctcgtatcatttattaaggataat |
27045233 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27131549 - 27131425
Alignment:
| Q |
119 |
aaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttca |
218 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| || | |||||| ||| | |
|
|
| T |
27131549 |
aaattataagtcactttgcaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatacagttaac--tatttattattcttctttctctcaattttttta |
27131452 |
T |
|
| Q |
219 |
tttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
27131451 |
tttatctttctcatactatttattaag |
27131425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30440636 - 30440525
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||| |||| || ||||| | |||||| |||||||| ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
30440636 |
atttgtcacaaattatatgttgctttacaatactaatgcaatattaatgttattttttcttttataccattaact--atttattattctctcttctttca |
30440539 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
30440538 |
attctttcatttat |
30440525 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 241
Target Start/End: Original strand, 32777853 - 32777976
Alignment:
| Q |
116 |
cccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctt |
215 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32777853 |
cccaaattataagtcgctttacaactccaatgaagcactaatgctatttttcttattatatccttaac--taattaatactctctctactttcaattctt |
32777950 |
T |
|
| Q |
216 |
tcatttatctttcccataacatttat |
241 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32777951 |
taatttatccttcccataccatttat |
32777976 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10200548 - 10200479
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10200548 |
atttgttctaaattatatgttgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcct |
10200479 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 244
Target Start/End: Original strand, 21443132 - 21443205
Alignment:
| Q |
169 |
tattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
21443132 |
tattatatccttaact--atttattactttatcttatttcaattctttaatttatctttctcgtatcatttattaa |
21443205 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 165
Target Start/End: Original strand, 7399750 - 7399793
Alignment:
| Q |
122 |
ttgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttt |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7399750 |
ttgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttt |
7399793 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 46944727 - 46944680
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtc |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46944727 |
caaattgtatgttactttaaaaaaaatatttgtcccaaattatatgtc |
46944680 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8566033 - 8565871
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcacttta---gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
8566033 |
ccaaattgtatgtcgatttacgggaaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcataattaatgttattttttctattataatt |
8565934 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8565933 |
ttagccgt--ttattactct--cttctttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
8565871 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 223
Target Start/End: Original strand, 39199317 - 39199354
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39199317 |
tatttattactctttcttctttcaattctttcatttat |
39199354 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39961066 - 39960981
Alignment:
| Q |
163 |
ttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39961066 |
tttttctattataaccttaact--atttattactctctcttcttttaattcttt-atttatctttctcatattatttattaagaataat |
39960981 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25651121 - 25651065
Alignment:
| Q |
189 |
ttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25651121 |
ttattattttttcttcttttaattctttcatttatttttcccatatcatttattaag |
25651065 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39694867 - 39694810
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
39694867 |
tatttattactct--cttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
39694810 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 10543901 - 10543960
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10543901 |
tatttattactctttcttctttcatttttttaatttatcattctcataccatttattaag |
10543960 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 245
Target Start/End: Original strand, 18517184 - 18517284
Alignment:
| Q |
143 |
caatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| || |||| | |||||| |
|
|
| T |
18517184 |
caatgaagtattaatgttaatttttctattatatcattaatt--atttattactttatcttctttgaattctttcatttatcgttttcatatcgtttatt |
18517281 |
T |
|
| Q |
243 |
aag |
245 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
18517282 |
aag |
18517284 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21747009 - 21746894
Alignment:
| Q |
126 |
atgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatct |
225 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
21747009 |
atgtcagtttacaataccaatgaatcattaatgctacttttcttattatacttttaac--tatttattac-cttttttatttcaatttgataatttatct |
21746913 |
T |
|
| Q |
226 |
ttcccataacatttattaa |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
21746912 |
ttcctataccattaattaa |
21746894 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 6186520 - 6186607
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6186520 |
aataccaatgaagtatgagtgttacttttcttattatatctttaac--tatttattacattattttctttcaattttttcatttatcttt |
6186607 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 6193036 - 6193123
Alignment:
| Q |
138 |
aataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6193036 |
aataccaatgaagtatgagtgttacttttcttattatatctttaac--tatttattacattattttctttcaattttttcatttatcttt |
6193123 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Original strand, 9658592 - 9658690
Alignment:
| Q |
76 |
tctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9658592 |
tctgtcccaaattatatgtcattttaaaaaaaaa--ttgtcccaaattatatgtggctttacaatactaatgaaaacttattgttactttttgtattata |
9658689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 44526404 - 44526494
Alignment:
| Q |
153 |
ttaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
44526404 |
ttaatattactttttctattatatacttaatt--atttattactttcttttttttcaattatttaatttatcttttcaatatcatttaataag |
44526494 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 27330337 - 27330394
Alignment:
| Q |
186 |
tatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
27330337 |
tatttattattctttcttttttcaattctt--aattatctttctcatatcatgtattaag |
27330394 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0330 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:
Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13960 - 13803
Alignment:
| Q |
90 |
tatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatt |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13960 |
tatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacgttaatgttacttttcctattatatccttaac--tatt |
13863 |
T |
|
| Q |
190 |
tattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13862 |
--ttactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataat |
13803 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 63357 - 63515
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
63357 |
ccaaaatgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcctta |
63456 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
63457 |
ac--tatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatt |
63515 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 1256 - 1422
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1256 |
caaattgtatgtcgctttcgaaaaaaaaattgtcccaagttatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaa |
1355 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1356 |
c--tattgattactctctcttctttcaaatatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
1422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13959 - 13777
Alignment:
| Q |
67 |
aatactctatctgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| |||||| |||||| |||| | |||| | |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
13959 |
aatactctctccgtttcaaattatatgtcgctttgaagaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaataataatgttactttt |
13860 |
T |
|
| Q |
167 |
cctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13859 |
cctattatatccttaac--tattaattactccccattctttcaattatttcatttatcttttccatactatttattaaggataat |
13777 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21694 - 21534
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21694 |
caaattgtacgtcactttagaaaaaatatttatcctaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaa |
21595 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21594 |
c--tattttttactctttcttctttcaattctttcatttattttccccatatcatttattaag |
21534 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28108 - 27974
Alignment:
| Q |
110 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaac---attaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttt |
206 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
28108 |
atttgtctcaaattatatgtcgctttataatatcaatgaaacattattaatgttactttttcttttatacttttaac--tatttagttctctt--ttttt |
28013 |
T |
|
| Q |
207 |
tcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
28012 |
tcaattctttaatttattttttccctatgatttattaag |
27974 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 184
Target Start/End: Original strand, 524301 - 524406
Alignment:
| Q |
79 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
524301 |
gttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacaataatgttacttttcctattatatcc |
524400 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaact |
184 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
524401 |
ttaact |
524406 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0444 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 7608 - 7775
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7608 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
7707 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7708 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
7775 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0172 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:
Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18461 - 18294
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18461 |
ccaaattatatgtcactttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcctta |
18362 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
18361 |
ac--tatttattaccctcttttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgaggataat |
18294 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0166 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:
Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23616 - 23457
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23616 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
23517 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23516 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
23457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1515 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1515
Description:
Target: scaffold1515; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Original strand, 1458 - 1616
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1458 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttaattttcctattatattctta |
1557 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatt |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1558 |
ac--tatttattactttgtcttctttcaattccttcatttatctttcccatattatttatt |
1616 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:
Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18948 - 18786
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18948 |
ccaaattgtatgtcactttagggaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtctctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataacctt |
18849 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18848 |
aac--tatttattactttctcttatttcaattctttcatttatttttcccatattatttattaag |
18786 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:
Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4249 - 4087
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
4249 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaattgtttcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatattctt |
4150 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4149 |
aac--tatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttgtcatatcatttattaag |
4087 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 6579 - 6740
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || | ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6579 |
ccaaattgtatgtcgttttagagaatttttttattccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaacattaatgctacttttcctattataacctta |
6678 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6679 |
gc--tatttattactctctcttatttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
6740 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 8450 - 8616
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8450 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaa-atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaattttatttttcctattatatcctta |
8548 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8549 |
ac--tattaattattctctcttctttcaattatttcatttatctttcccataccatttattaaggataat |
8616 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:
Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 17471 - 17638
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17471 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaatttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttccctattatatcctta |
17570 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17571 |
ac--tattaattactccatcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
17638 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Original strand, 45594 - 45717
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
45594 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgtgttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacatta |
45693 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttctttttt |
207 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
45694 |
ac--tatttattactttttttttttt |
45717 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 245
Target Start/End: Original strand, 45815 - 45873
Alignment:
| Q |
187 |
atttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
45815 |
atttattactctctcttctttcaattatttcatttatctttcacatattatttattaag |
45873 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0459 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:
Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11765 - 11605
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11765 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctt |
11666 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11665 |
aac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
11605 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:
Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13072 - 12912
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13072 |
ccaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatcctt |
12973 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12972 |
aac--tattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
12912 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 322 - 155
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
322 |
ccaaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttacagtaccaatgcaacattaatgttacttttccaattgtaacctta |
223 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
222 |
ac--tatttattattatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataat |
155 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0262 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:
Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 3771 - 3938
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| | |||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3771 |
ccaaattgtatgtcgctttgaaaaaaaaaattgttctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcctta |
3870 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3871 |
ac--tattaattactctctcttctttcaattatatcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
3938 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:
Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1505 - 1343
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1505 |
ccaaattgtatgtcgctttagaggaaaaaaattgtcccaacttatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctt |
1406 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
1405 |
aac--tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
1343 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15998 - 15838
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15998 |
aaattgtatgtcgctttaggggaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaa |
15899 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
15898 |
--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaag |
15838 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 151652 - 151814
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaa-aaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
151652 |
ccaaattgtatgtcgctttaggagaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattataacctt |
151751 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
151752 |
aa--gcatttattactccatcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaag |
151814 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0789 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:
Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 3324 - 3485
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3324 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatacttttcctattataacctta |
3423 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
3424 |
a--ttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttactaag |
3485 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:
Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23138 - 22979
Alignment:
| Q |
90 |
tatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatt |
189 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
23138 |
tatgtcgctttggaaaaaaaatttgttccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac--tact |
23041 |
T |
|
| Q |
190 |
tattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23040 |
aattattctctcttgtttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
22979 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0983 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:
Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1339 - 1177
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1339 |
ccaaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgcttcacaatatcaatgcaacattaatattacttttcctattataacctt |
1240 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1239 |
aac--tatttattactatctcttctttcaattctttcatttatatttcccatattatttattaag |
1177 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0734 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0734
Description:
Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 6280 - 6441
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
6280 |
caaattgtatgtcgttttagggaaaaatatttgtctcaatttatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacttta |
6379 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6380 |
gc--tatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaag |
6441 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0380 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:
Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16269 - 16110
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaac |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16269 |
aaattgtatgtcgttttaggaaaaaaaattgtcttaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctta-- |
16172 |
T |
|
| Q |
184 |
tgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16171 |
tctatttattactctcttttctttcaattctttcatttatctttcccatgttatttattaag |
16110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0308 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:
Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Original strand, 20681 - 20830
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttag-aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
20681 |
caaattgtatgtcgctttaggaaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaatattaatgctactttttctattataacctta |
20780 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20781 |
ac--tatttattaccctctcttctttcaattctttcagttatctttcccata |
20830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1335 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1335
Description:
Target: scaffold1335; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1276
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcacttta-gaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1436 |
aaattgtacgtcgctttaaggaaaaatatttgacctaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaactttaatgttatttttcctattataaccttaa |
1337 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
1336 |
c--tatttattactctctcttcttccaattctttcatttatctttcctatattatttattaag |
1276 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0768 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0768
Description:
Target: scaffold0768; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6168 - 6008
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6168 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaa |
6069 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6068 |
c--tatttattattatctcttctttcaattatttcatttatcttttccatgttatttattaag |
6008 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:
Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18391 - 18230
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatg-ttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18391 |
ccaaattgtatgtga--ttagaaaaataatttgtctcaaattgtatgtcactttataataccaatgaaatattaatgtttattttttctattatatcctt |
18294 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttc-ttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18293 |
aa--ttatttatttctctttcttttttttaattcttttatttatttttcctatatcatttattaag |
18230 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0654 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:
Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3097 - 2945
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaaca---ttaatgttacttttcctattatatcc |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || | |||||| ||||||| | |||||| || |
|
|
| T |
3097 |
caaattgtatgtcgctttagcgaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaataatattaatgctactttttccattataacc |
2998 |
T |
|
| Q |
179 |
ttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccata |
233 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2997 |
ttaact--atttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccata |
2945 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 13324 - 13480
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13324 |
ccaaattgtatgtcgcttt-gaaaaaaaaattgtttcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattata--ctta |
13420 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13421 |
ac--tattaattactctctcttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttatta |
13480 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0533 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:
Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Original strand, 7241 - 7379
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
7241 |
aaaaaaaaattgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaac--tattaattactctctct |
7338 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttatta |
243 |
Q |
| |
|
| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7339 |
tctttctattatttcatttatcttttccataccatttatta |
7379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 188856 - 188718
Alignment:
| Q |
84 |
aaattgtatgtcactttaga-aaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
188856 |
aaattgtatgtcgctttagggaaaaaaaattgtcccaaattatatgtcgatttacaataccaatgcaacattaatattatttttcctattataaccttaa |
188757 |
T |
|
| Q |
183 |
ctgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
188756 |
c--tatttattactgtctcttctttcaattctttcatttat |
188718 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0236 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:
Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 20284 - 20451
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatat-ttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctt |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||| | || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20284 |
ccaaattgtatgccgctttggaaaaaaaaaattatcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttactttttctattatatcctt |
20383 |
T |
|
| Q |
181 |
aactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
| |||| | |||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20384 |
a---ctattaactactctcttttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataat |
20451 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0027 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:
Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11233 - 11101
Alignment:
| Q |
111 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctt-tcttttttca |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || |
|
|
| T |
11233 |
tttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcac--tatttatt-gtcttctctacttcca |
11137 |
T |
|
| Q |
210 |
attctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11136 |
agtcattcatttatctttcccatatcatttattaag |
11101 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0007 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 245
Target Start/End: Original strand, 2937 - 3096
Alignment:
| Q |
82 |
ccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcctta |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2937 |
ccaaattgtacgtcgcttcagggaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccattgcaacaat--tgttacttttcctattataacctta |
3034 |
T |
|
| Q |
182 |
actgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3035 |
act--atttattactctctctcctttcaattctttcgtttatttttcccatattatttattaag |
3096 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0015 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:
Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Original strand, 20491 - 20630
Alignment:
| Q |
103 |
aaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttct |
202 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
20491 |
aaaaaaaaattgtcctaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaattattaatgttaccttttctattatatcttta---ctatttattactttctct |
20587 |
T |
|
| Q |
203 |
tttttcaattctttcatttatctttcccataacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20588 |
tcttccaattcattcatttatctttctcatatcatttattaag |
20630 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 213130 - 212999
Alignment:
| Q |
118 |
caaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttc |
217 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
213130 |
caaattatatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataactttaac--tagttattattctcgcttctttccattcttta |
213033 |
T |
|
| Q |
218 |
atttatctttcccataacatttattaagtataat |
251 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
213032 |
atttatcattctcataccatttattaaggataat |
212999 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0475 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:
Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 5173 - 5249
Alignment:
| Q |
143 |
caatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttat |
223 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5173 |
caataaaacattaacgttacttt-cctattatatccttaac--tatttattactctttc-ttcttcaattctttcatttat |
5249 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0268 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:
Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Original strand, 20346 - 20443
Alignment:
| Q |
83 |
caaattgtatgtcactttagaaa-aaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcct |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20346 |
caaattgtatgtcgttttagagagaaaaatttgttctaaattatatgttactttacaatatcaatgaaacataaatgttatttttcctattatatcct |
20443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:
Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10511 - 10398
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | | | ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||| || |
|
|
| T |
10511 |
ctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaatttatcattctca |
10412 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |
|
|
| T |
10411 |
taccatttattaag |
10398 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20839 - 20726
Alignment:
| Q |
132 |
ctttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactgtatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccca |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | | | ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||| || |
|
|
| T |
20839 |
ctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaatttatcattctca |
20740 |
T |
|
| Q |
232 |
taacatttattaag |
245 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |
|
|
| T |
20739 |
taccatttattaag |
20726 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University