View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14349_high_20 (Length: 506)

Name: NF14349_high_20
Description: NF14349
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14349_high_20
NF14349_high_20
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (25-489)||(45367855-45368320)
chr2 (25-489)||(11992338-11992801)
chr2 (25-489)||(41763272-41763744)
chr2 (21-487)||(3865661-3866128)
chr2 (21-489)||(8180367-8180836)
chr2 (21-489)||(4807179-4807651)
chr2 (80-489)||(2610115-2610523)
chr2 (24-439)||(3243882-3244293)
chr2 (102-489)||(451931-452311)
chr2 (25-354)||(41197458-41197792)
chr2 (24-489)||(30743210-30743675)
chr2 (91-485)||(24583904-24584297)
chr2 (25-259)||(38429700-38429936)
chr2 (27-290)||(23997402-23997664)
chr2 (231-489)||(38453058-38453314)
chr2 (21-269)||(36183257-36183507)
chr2 (80-434)||(13148953-13149308)
chr2 (25-374)||(6237983-6238334)
chr2 (25-279)||(12734502-12734751)
chr2 (21-150)||(38452911-38453046)
chr2 (25-145)||(18424607-18424727)
chr2 (25-191)||(16097216-16097388)
chr2 (306-437)||(37281746-37281878)
chr2 (281-434)||(17581112-17581262)
chr2 (21-87)||(2610578-2610644)
chr2 (25-87)||(25834671-25834733)
chr2 (41-189)||(19337096-19337245)
chr2 (21-81)||(43238319-43238379)
chr2 (25-150)||(4598792-4598921)
chr2 (402-488)||(12475031-12475115)
chr2 (281-421)||(14769943-14770090)
chr2 (35-186)||(23714501-23714651)
chr2 (35-186)||(24102173-24102323)
chr2 (281-427)||(33594757-33594904)
chr2 (44-155)||(38434871-38434984)
chr2 (44-153)||(42092441-42092550)
chr2 (281-418)||(12904624-12904762)
chr2 (25-87)||(43752177-43752239)
chr2 (25-154)||(9578933-9579062)
chr2 (21-70)||(24583858-24583907)
chr2 (21-154)||(9556595-9556729)
chr2 (40-87)||(227312-227359)
chr2 (80-179)||(7825254-7825353)
chr2 (21-87)||(11412711-11412777)
chr2 (25-109)||(18958872-18958959)
chr2 (22-82)||(12141539-12141599)
chr2 (102-174)||(45077649-45077721)
chr2 (374-428)||(876778-876833)
chr2 (22-77)||(12882267-12882322)
chr2 (372-489)||(13592930-13593043)
chr2 (21-175)||(18188683-18188836)
chr2 (328-428)||(7135220-7135321)
chr2 (25-153)||(9647839-9647965)
chr2 (299-437)||(28317383-28317517)
chr2 (21-125)||(40759049-40759156)
chr2 (40-152)||(44411639-44411749)
chr2 (21-85)||(38860165-38860229)
chr2 (41-109)||(41545372-41545443)
chr2 (21-56)||(451874-451909)
chr2 (49-123)||(7615251-7615325)
chr2 (60-195)||(17581349-17581485)
chr2 (25-90)||(6218954-6219019)
chr2 (281-425)||(6465370-6465515)
chr2 (281-389)||(7292673-7292782)
chr2 (54-123)||(11017268-11017337)
chr2 (162-254)||(32443436-32443527)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (25-489)||(25190966-25191429)
chr3 (21-489)||(51447936-51448404)
chr3 (21-418)||(28245093-28245493)
chr3 (80-484)||(38849686-38850089)
chr3 (113-489)||(47542032-47542406)
chr3 (21-322)||(52138553-52138856)
chr3 (25-475)||(27917173-27917622)
chr3 (26-304)||(5168599-5168883)
chr3 (25-308)||(53519353-53519644)
chr3 (25-427)||(26489964-26490367)
chr3 (22-240)||(54278855-54279075)
chr3 (21-215)||(33272248-33272450)
chr3 (209-485)||(29817096-29817370)
chr3 (21-254)||(43694991-43695226)
chr3 (25-155)||(21993-22124)
chr3 (92-430)||(30345175-30345506)
chr3 (25-166)||(47233826-47233969)
chr3 (21-153)||(54128300-54128434)
chr3 (21-344)||(3186500-3186824)
chr3 (356-489)||(52138415-52138547)
chr3 (256-398)||(54425369-54425511)
chr3 (323-489)||(19757655-19757820)
chr3 (21-212)||(49503780-49503978)
chr3 (27-195)||(45728025-45728197)
chr3 (323-489)||(19736753-19736914)
chr3 (295-437)||(48221421-48221564)
chr3 (21-141)||(48734361-48734481)
chr3 (365-489)||(9258470-9258589)
chr3 (21-153)||(19736918-19737053)
chr3 (27-143)||(36820193-36820309)
chr3 (35-192)||(344951-345110)
chr3 (21-148)||(19757826-19757956)
chr3 (25-87)||(35033136-35033198)
chr3 (25-87)||(38060421-38060483)
chr3 (91-217)||(48953694-48953819)
chr3 (29-178)||(50249278-50249432)
chr3 (304-427)||(30724311-30724435)
chr3 (81-180)||(45236751-45236850)
chr3 (21-84)||(50960859-50960922)
chr3 (21-180)||(2340940-2341101)
chr3 (21-87)||(38850110-38850176)
chr3 (56-134)||(33307087-33307165)
chr3 (24-87)||(3987037-3987100)
chr3 (55-142)||(37227863-37227950)
chr3 (102-216)||(43308425-43308539)
chr3 (21-137)||(31337752-31337868)
chr3 (21-70)||(48953648-48953697)
chr3 (21-90)||(54365203-54365271)
chr3 (22-87)||(45289318-45289385)
chr3 (69-144)||(38054613-38054688)
chr3 (21-111)||(38430807-38430904)
chr3 (80-150)||(19676377-19676447)
chr3 (41-182)||(23534816-23534958)
chr3 (21-128)||(39600907-39601016)
chr3 (359-428)||(46145799-46145869)
chr3 (40-191)||(52679091-52679246)
chr3 (302-424)||(44395080-44395200)
chr3 (80-153)||(46568038-46568111)
chr3 (33-111)||(54425210-54425289)
chr3 (44-99)||(31454475-31454531)
chr3 (24-76)||(41842740-41842792)
chr3 (18-82)||(44134053-44134117)
chr3 (318-424)||(32490249-32490356)
chr3 (379-428)||(1470683-1470733)
chr3 (295-424)||(15750888-15751018)
chr3 (21-87)||(30294350-30294416)
chr3 (172-314)||(40674492-40674634)
chr3 (25-82)||(42510244-42510301)
chr3 (102-186)||(29919193-29919277)
chr3 (102-186)||(29968346-29968430)
chr3 (16-72)||(37534427-37534483)
chr3 (21-61)||(39235154-39235194)
chr3 (106-154)||(46431984-46432032)
chr3 (80-152)||(49841534-49841606)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (25-489)||(38606593-38607056)
chr7 (27-489)||(36651581-36652042)
chr7 (21-489)||(33350032-33350501)
chr7 (35-489)||(32630194-32630636)
chr7 (21-489)||(31004811-31005279)
chr7 (21-489)||(46356082-46356546)
chr7 (21-483)||(11593552-11594016)
chr7 (25-362)||(43281389-43281726)
chr7 (21-489)||(39906596-39907074)
chr7 (21-489)||(49028854-49029332)
chr7 (21-388)||(35906427-35906796)
chr7 (21-363)||(33072666-33073008)
chr7 (21-325)||(34869170-34869476)
chr7 (80-489)||(36869576-36869984)
chr7 (201-489)||(37616503-37616790)
chr7 (21-335)||(7272780-7273095)
chr7 (21-291)||(12841501-12841773)
chr7 (232-489)||(48918975-48919231)
chr7 (21-263)||(13859234-13859476)
chr7 (33-312)||(23404181-23404462)
chr7 (21-207)||(37617812-37618001)
chr7 (25-184)||(45836710-45836871)
chr7 (21-145)||(44855398-44855524)
chr7 (21-338)||(7189452-7189777)
chr7 (312-485)||(24177714-24177886)
chr7 (21-186)||(36514433-36514598)
chr7 (25-152)||(35559223-35559353)
chr7 (24-329)||(25579306-25579612)
chr7 (21-243)||(47848506-47848730)
chr7 (21-144)||(36136695-36136820)
chr7 (21-110)||(6374833-6374924)
chr7 (21-86)||(2885948-2886013)
chr7 (282-428)||(24550178-24550320)
chr7 (25-110)||(29650349-29650436)
chr7 (21-166)||(43491217-43491364)
chr7 (28-99)||(46014413-46014486)
chr7 (26-140)||(8492464-8492580)
chr7 (21-181)||(43282299-43282464)
chr7 (21-153)||(5335844-5335976)
chr7 (21-181)||(42187365-42187526)
chr7 (294-427)||(21517826-21517959)
chr7 (21-154)||(19262659-19262792)
chr7 (21-74)||(22349623-22349676)
chr7 (25-78)||(36869474-36869527)
chr7 (24-76)||(31682831-31682883)
chr7 (345-428)||(43793592-43793676)
chr7 (26-150)||(48736130-48736256)
chr7 (62-145)||(24598409-24598498)
chr7 (80-150)||(25731640-25731709)
chr7 (21-87)||(27021918-27021984)
chr7 (80-144)||(27021993-27022057)
chr7 (80-155)||(39811877-39811952)
chr7 (21-218)||(28628159-28628355)
chr7 (26-88)||(45558351-45558413)
chr7 (21-153)||(30200189-30200319)
chr7 (74-155)||(40008698-40008779)
chr7 (21-86)||(40169640-40169705)
chr7 (80-144)||(1523747-1523811)
chr7 (21-153)||(14593683-14593821)
chr7 (281-421)||(18637233-18637371)
chr7 (281-421)||(18650668-18650806)
chr7 (294-385)||(23087603-23087694)
chr7 (123-193)||(21517656-21517726)
chr7 (22-67)||(15682184-15682229)
chr7 (299-421)||(18608199-18608319)
chr7 (26-111)||(27893779-27893864)
chr7 (21-82)||(38920789-38920850)
chr7 (342-413)||(5843105-5843177)
chr7 (160-216)||(15681216-15681272)
chr7 (342-421)||(18626559-18626639)
chr7 (24-153)||(36101994-36102125)
chr7 (114-153)||(16013206-16013245)
chr7 (21-145)||(28020894-28021020)
chr7 (269-340)||(33139006-33139077)
chr7 (21-88)||(47796362-47796429)
chr7 (26-76)||(26742127-26742177)
chr7 (55-145)||(40139179-40139268)
chr7 (116-164)||(28542206-28542254)
chr7 (83-143)||(29653844-29653904)
[»] chr4 (99 HSPs)
chr4 (27-489)||(27450411-27450868)
chr4 (21-489)||(435816-436285)
chr4 (21-489)||(31960040-31960509)
chr4 (21-489)||(23906521-23906996)
chr4 (21-476)||(33226809-33227265)
chr4 (21-489)||(48174319-48174788)
chr4 (18-489)||(1777240-1777710)
chr4 (21-489)||(56374877-56375346)
chr4 (21-489)||(53707381-53707850)
chr4 (21-489)||(48622769-48623222)
chr4 (21-420)||(50286625-50287018)
chr4 (21-350)||(43433643-43433980)
chr4 (21-476)||(47265428-47265886)
chr4 (28-473)||(16002532-16002976)
chr4 (21-365)||(46583050-46583396)
chr4 (119-489)||(39708044-39708414)
chr4 (41-419)||(1211638-1212017)
chr4 (18-249)||(4440682-4440912)
chr4 (21-362)||(41009575-41009922)
chr4 (21-265)||(52569741-52569987)
chr4 (33-207)||(12494618-12494794)
chr4 (21-206)||(33191074-33191261)
chr4 (26-207)||(39100766-39100947)
chr4 (21-228)||(31458875-31459086)
chr4 (55-338)||(35690042-35690326)
chr4 (21-180)||(28236080-28236239)
chr4 (40-225)||(45205092-45205280)
chr4 (25-219)||(1793316-1793512)
chr4 (21-153)||(37773677-37773810)
chr4 (47-192)||(27983083-27983230)
chr4 (25-144)||(37797783-37797904)
chr4 (27-428)||(10775654-10776055)
chr4 (21-141)||(51421666-51421786)
chr4 (281-437)||(17666526-17666680)
chr4 (21-387)||(55578722-55579088)
chr4 (289-425)||(54787741-54787878)
chr4 (21-427)||(7092446-7092847)
chr4 (21-150)||(20591526-20591657)
chr4 (298-421)||(1629084-1629208)
chr4 (21-166)||(20601872-20602019)
chr4 (222-386)||(54914618-54914781)
chr4 (26-87)||(26037736-26037797)
chr4 (21-125)||(51252687-51252791)
chr4 (26-153)||(56224987-56225117)
chr4 (114-243)||(11389552-11389681)
chr4 (204-428)||(39754782-39755007)
chr4 (21-153)||(33709841-33709980)
chr4 (281-435)||(17667817-17667969)
chr4 (342-428)||(30807244-30807331)
chr4 (25-153)||(49987350-49987480)
chr4 (21-153)||(54470129-54470263)
chr4 (83-155)||(20105761-20105833)
chr4 (21-85)||(20192025-20192089)
chr4 (27-155)||(50662309-50662437)
chr4 (290-402)||(52280695-52280807)
chr4 (22-150)||(17900405-17900535)
chr4 (21-143)||(25257807-25257929)
chr4 (21-87)||(35555873-35555939)
chr4 (21-96)||(39708412-39708489)
chr4 (332-425)||(42037510-42037604)
chr4 (56-153)||(43070029-43070124)
chr4 (289-354)||(45185477-45185542)
chr4 (21-136)||(10208977-10209090)
chr4 (295-426)||(20917630-20917762)
chr4 (268-399)||(3273098-3273229)
chr4 (55-195)||(34233291-34233435)
chr4 (21-145)||(38570973-38571098)
chr4 (25-145)||(44047578-44047700)
chr4 (87-153)||(18966475-18966541)
chr4 (55-153)||(31403276-31403380)
chr4 (102-195)||(40933205-40933298)
chr4 (44-152)||(45423542-45423648)
chr4 (147-215)||(26037836-26037904)
chr4 (22-70)||(26356626-26356674)
chr4 (21-145)||(41192764-41192892)
chr4 (340-489)||(41427426-41427574)
chr4 (379-437)||(55768963-55769022)
chr4 (379-437)||(55833219-55833278)
chr4 (80-154)||(25967554-25967628)
chr4 (360-437)||(30853053-30853131)
chr4 (107-181)||(30853310-30853384)
chr4 (86-151)||(2588905-2588970)
chr4 (71-180)||(44667520-44667629)
chr4 (71-180)||(44686845-44686954)
chr4 (26-118)||(290026-290118)
chr4 (44-153)||(44360006-44360120)
chr4 (79-179)||(45185303-45185403)
chr4 (281-399)||(8917815-8917938)
chr4 (24-87)||(36557259-36557321)
chr4 (21-144)||(50471459-50471582)
chr4 (22-225)||(934663-934867)
chr4 (55-121)||(28467238-28467304)
chr4 (21-87)||(28497480-28497545)
chr4 (21-67)||(42285926-42285972)
chr4 (107-145)||(51841505-51841543)
chr4 (22-87)||(30621431-30621496)
chr4 (25-58)||(32479057-32479090)
chr4 (113-202)||(49739114-49739203)
chr4 (102-154)||(45094471-45094523)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (25-489)||(32082975-32083440)
chr1 (21-489)||(8671507-8671974)
chr1 (21-489)||(1210332-1210801)
chr1 (21-488)||(51601646-51602112)
chr1 (21-489)||(51440991-51441459)
chr1 (25-489)||(49347623-49348089)
chr1 (21-489)||(43240605-43241076)
chr1 (25-394)||(30202360-30202731)
chr1 (25-320)||(8391525-8391824)
chr1 (21-343)||(22089826-22090152)
chr1 (21-346)||(9592463-9592790)
chr1 (23-485)||(37463101-37463553)
chr1 (25-275)||(696069-696321)
chr1 (25-281)||(15085728-15085986)
chr1 (21-420)||(19936175-19936570)
chr1 (40-476)||(34827349-34827784)
chr1 (21-213)||(34792575-34792768)
chr1 (230-435)||(27445537-27445743)
chr1 (25-188)||(4001685-4001848)
chr1 (21-195)||(32231180-32231356)
chr1 (283-437)||(32066761-32066913)
chr1 (60-365)||(46226549-46226853)
chr1 (40-196)||(18469327-18469483)
chr1 (79-422)||(51234267-51234611)
chr1 (21-316)||(9599620-9599917)
chr1 (21-153)||(9509240-9509374)
chr1 (286-427)||(7921574-7921716)
chr1 (21-229)||(38807897-38808106)
chr1 (281-428)||(28528227-28528375)
chr1 (294-437)||(35828894-35829038)
chr1 (21-240)||(39140349-39140576)
chr1 (303-428)||(6640772-6640898)
chr1 (291-424)||(52739965-52740098)
chr1 (21-144)||(27848031-27848155)
chr1 (27-132)||(52561843-52561950)
chr1 (21-237)||(1661264-1661486)
chr1 (294-437)||(12807587-12807732)
chr1 (21-243)||(40419471-40419695)
chr1 (21-137)||(14226055-14226171)
chr1 (293-490)||(52421016-52421210)
chr1 (25-87)||(4029112-4029174)
chr1 (25-145)||(43423647-43423771)
chr1 (21-150)||(18793214-18793345)
chr1 (24-200)||(26016312-26016490)
chr1 (80-153)||(4379927-4380000)
chr1 (251-388)||(21275588-21275725)
chr1 (375-427)||(40419328-40419381)
chr1 (368-436)||(46226887-46226956)
chr1 (25-87)||(2544589-2544651)
chr1 (303-428)||(3877495-3877621)
chr1 (343-430)||(16142399-16142487)
chr1 (21-77)||(48431632-48431688)
chr1 (297-400)||(11331568-11331666)
chr1 (297-400)||(11489589-11489687)
chr1 (372-434)||(52641033-52641093)
chr1 (89-155)||(22167643-22167709)
chr1 (80-150)||(52442791-52442861)
chr1 (81-150)||(16142172-16142241)
chr1 (25-111)||(36624096-36624184)
chr1 (288-365)||(52640920-52640997)
chr1 (21-145)||(17815405-17815528)
chr1 (191-303)||(52831830-52831942)
chr1 (82-145)||(4590813-4590876)
chr1 (376-434)||(16273415-16273471)
chr1 (68-144)||(41611103-41611181)
chr1 (21-83)||(37263325-37263387)
chr1 (21-87)||(40416361-40416427)
chr1 (80-150)||(40920824-40920894)
chr1 (21-155)||(52831968-52832101)
chr1 (93-150)||(16822319-16822376)
chr1 (15-137)||(39894722-39894844)
chr1 (26-90)||(13827948-13828012)
chr1 (104-144)||(17275137-17275177)
chr1 (27-87)||(36340035-36340095)
chr1 (115-195)||(52633494-52633573)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (26-489)||(9706363-9706827)
chr6 (25-489)||(5258378-5258845)
chr6 (25-489)||(5631404-5631874)
chr6 (25-489)||(10100089-10100552)
chr6 (26-489)||(20427867-20428331)
chr6 (25-329)||(607905-608209)
chr6 (25-323)||(14030558-14030859)
chr6 (67-489)||(33495794-33496194)
chr6 (89-417)||(2689313-2689642)
chr6 (25-254)||(28085197-28085428)
chr6 (55-352)||(6056032-6056329)
chr6 (31-240)||(30031091-30031302)
chr6 (25-207)||(35043671-35043855)
chr6 (26-409)||(26291444-26291832)
chr6 (25-153)||(32755841-32755973)
chr6 (21-155)||(9593932-9594074)
chr6 (281-489)||(27790743-27790950)
chr6 (160-331)||(30679218-30679389)
chr6 (25-129)||(21352067-21352171)
chr6 (21-100)||(12890559-12890640)
chr6 (61-338)||(2065018-2065302)
chr6 (44-154)||(5080776-5080888)
chr6 (40-216)||(28027071-28027248)
chr6 (22-145)||(9568590-9568717)
chr6 (367-437)||(3632653-3632724)
chr6 (406-495)||(30670469-30670556)
chr6 (24-150)||(33083983-33084111)
chr6 (21-201)||(21870299-21870473)
chr6 (21-66)||(30679417-30679462)
chr6 (80-153)||(33998291-33998364)
chr6 (21-128)||(8364523-8364628)
chr6 (40-132)||(5095816-5095910)
chr6 (18-145)||(6641632-6641761)
chr6 (79-153)||(7150604-7150678)
chr6 (21-145)||(7513617-7513738)
chr6 (299-396)||(6641916-6642013)
chr6 (35-179)||(12134141-12134287)
chr6 (25-75)||(33496963-33497014)
chr6 (122-200)||(2079208-2079286)
chr6 (21-71)||(2689646-2689696)
chr6 (115-177)||(7513305-7513367)
chr6 (25-69)||(24665818-24665862)
chr6 (27-83)||(31818526-31818582)
[»] chr8 (77 HSPs)
chr8 (25-489)||(42854234-42854708)
chr8 (21-489)||(36565467-36565936)
chr8 (67-489)||(12492116-12492537)
chr8 (80-489)||(15215558-15215965)
chr8 (21-489)||(36544739-36545205)
chr8 (26-427)||(18124825-18125224)
chr8 (24-489)||(8879669-8880129)
chr8 (25-329)||(39946603-39946909)
chr8 (216-485)||(4032917-4033185)
chr8 (25-264)||(18752106-18752344)
chr8 (21-283)||(36395175-36395443)
chr8 (21-350)||(37077490-37077809)
chr8 (63-362)||(25299950-25300251)
chr8 (21-304)||(2796326-2796613)
chr8 (63-362)||(25288613-25288916)
chr8 (21-174)||(40813223-40813380)
chr8 (21-155)||(45419159-45419293)
chr8 (267-437)||(13984672-13984842)
chr8 (80-437)||(29735454-29735802)
chr8 (21-422)||(30113423-30113827)
chr8 (220-362)||(25439249-25439391)
chr8 (21-435)||(6510654-6511059)
chr8 (281-434)||(28300596-28300747)
chr8 (21-216)||(13171875-13172072)
chr8 (289-425)||(19293776-19293913)
chr8 (299-437)||(41444809-41444949)
chr8 (25-100)||(8932679-8932754)
chr8 (273-387)||(35601686-35601799)
chr8 (281-437)||(33830721-33830875)
chr8 (281-428)||(38667205-38667351)
chr8 (21-109)||(11523949-11524040)
chr8 (281-489)||(25985129-25985334)
chr8 (290-476)||(18849624-18849797)
chr8 (268-430)||(13589084-13589247)
chr8 (25-152)||(42493536-42493663)
chr8 (21-75)||(12491364-12491418)
chr8 (35-186)||(13986383-13986536)
chr8 (44-134)||(25985462-25985552)
chr8 (21-106)||(12796926-12797011)
chr8 (25-143)||(32043522-32043642)
chr8 (25-141)||(44681269-44681387)
chr8 (21-186)||(45512721-45512889)
chr8 (56-152)||(29520583-29520681)
chr8 (130-216)||(9905223-9905309)
chr8 (21-152)||(10080133-10080264)
chr8 (345-422)||(45332039-45332117)
chr8 (21-150)||(30748384-30748513)
chr8 (21-201)||(36143243-36143421)
chr8 (55-128)||(21121105-21121180)
chr8 (22-126)||(33666726-33666829)
chr8 (251-314)||(10824546-10824609)
chr8 (54-214)||(39760683-39760845)
chr8 (294-372)||(6986525-6986603)
chr8 (21-124)||(7046285-7046390)
chr8 (26-144)||(2518623-2518742)
chr8 (21-123)||(9695583-9695687)
chr8 (56-153)||(16351312-16351411)
chr8 (63-145)||(25439397-25439477)
chr8 (26-155)||(16252855-16252984)
chr8 (290-387)||(35601501-35601598)
chr8 (87-156)||(37256011-37256080)
chr8 (379-427)||(43732230-43732279)
chr8 (283-324)||(43732355-43732396)
chr8 (49-137)||(16705700-16705788)
chr8 (21-85)||(29700268-29700332)
chr8 (21-87)||(2776455-2776522)
chr8 (44-123)||(5908594-5908675)
chr8 (35-77)||(25985839-25985881)
chr8 (84-154)||(30783331-30783401)
chr8 (79-145)||(36069573-36069639)
chr8 (294-347)||(13172147-13172200)
chr8 (21-179)||(16917080-16917240)
chr8 (161-202)||(17491994-17492035)
chr8 (400-428)||(3285135-3285163)
chr8 (21-85)||(34196064-34196128)
chr8 (25-77)||(41444556-41444608)
chr8 (260-363)||(44681543-44681644)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (21-489)||(1274852-1275320)
chr5 (25-489)||(3301436-3301896)
chr5 (21-489)||(12492610-12493082)
chr5 (21-489)||(28977085-28977552)
chr5 (21-489)||(2075700-2076169)
chr5 (21-489)||(10638884-10639360)
chr5 (21-489)||(24178111-24178566)
chr5 (21-489)||(1287805-1288284)
chr5 (70-489)||(20318578-20318989)
chr5 (195-489)||(3394298-3394593)
chr5 (25-292)||(16347608-16347877)
chr5 (21-329)||(34272768-34273083)
chr5 (269-476)||(16347879-16348084)
chr5 (26-347)||(27622-27944)
chr5 (93-430)||(36200426-36200764)
chr5 (21-145)||(4496312-4496440)
chr5 (294-485)||(27302451-27302638)
chr5 (25-110)||(38684932-38685019)
chr5 (297-428)||(43558318-43558450)
chr5 (27-158)||(32516475-32516606)
chr5 (25-144)||(15168721-15168844)
chr5 (25-144)||(26884918-26885040)
chr5 (21-128)||(31636146-31636253)
chr5 (340-437)||(17341748-17341846)
chr5 (25-127)||(14665658-14665766)
chr5 (34-428)||(3096828-3097216)
chr5 (21-153)||(11002649-11002781)
chr5 (298-376)||(43423578-43423656)
chr5 (21-99)||(33667194-33667272)
chr5 (21-126)||(418211-418318)
chr5 (281-388)||(20077305-20077413)
chr5 (26-74)||(20456776-20456824)
chr5 (44-144)||(219702-219804)
chr5 (80-195)||(5305496-5305611)
chr5 (24-87)||(14667753-14667816)
chr5 (22-153)||(36215422-36215553)
chr5 (25-87)||(14749297-14749359)
chr5 (84-216)||(7678340-7678471)
chr5 (402-488)||(27518-27602)
chr5 (18-145)||(34194721-34194848)
chr5 (281-421)||(38578992-38579130)
chr5 (107-181)||(27998317-27998391)
chr5 (21-151)||(10082965-10083096)
chr5 (80-145)||(17340724-17340789)
chr5 (21-77)||(18351134-18351190)
chr5 (80-152)||(21952274-21952346)
chr5 (374-488)||(23979820-23979930)
chr5 (81-153)||(28186956-28187028)
chr5 (80-152)||(34039960-34040032)
chr5 (346-428)||(6368478-6368561)
chr5 (107-186)||(16454600-16454679)
chr5 (342-428)||(21915532-21915619)
chr5 (21-76)||(28676596-28676651)
chr5 (367-437)||(37124207-37124278)
chr5 (82-144)||(9235000-9235062)
chr5 (289-351)||(28676253-28676314)
chr5 (115-188)||(21093663-21093736)
chr5 (367-427)||(25937719-25937780)
chr5 (21-85)||(2712936-2713000)
chr5 (27-144)||(31906592-31906711)
chr5 (26-150)||(33006587-33006711)
chr5 (25-137)||(6888931-6889045)
chr5 (21-87)||(15489718-15489784)
chr5 (85-155)||(27553760-27553830)
chr5 (24-74)||(43475243-43475293)
chr5 (25-137)||(4026565-4026678)
chr5 (118-179)||(5848401-5848462)
chr5 (114-151)||(43558135-43558172)
chr5 (43-87)||(79503-79547)
chr5 (44-128)||(1174549-1174633)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (21-489)||(31055-31524)
scaffold0018 (21-155)||(44094-44233)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (25-439)||(82356-82773)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (21-489)||(11822-12293)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (117-475)||(2594-2951)
scaffold0570 (25-118)||(1178-1271)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (33-207)||(25683-25859)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (21-208)||(4497-4687)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (25-388)||(86839-87204)
scaffold0045 (384-489)||(88514-88618)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (356-432)||(5834-5911)
scaffold0171 (21-96)||(7422-7497)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (249-362)||(41-156)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (298-428)||(9303-9434)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 45367855 - 45368320
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc-cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45367855 ccaaaccatctaaggttattttctaccaacttttctactataggtgctaccccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 45367954  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggt 223  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45367955 accattcatccagcgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaatcgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggt 45368054  T
Q  224 ctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 323  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368055 ctgactgttgtccgataaaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 45368154  T
Q  324 tacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45368155 tacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaatttgggtatgatatgatctccaactttc 45368254  T
Q  424 acctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368255 acctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 45368320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 11992338 - 11992801
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  11992338 ccaaaccatctaagcttattttctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctctaatggtgtcattcctaatcttatcatgtctagtatta 11992437  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11992438 ccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcccatcactccgtaccatacaacattgccggtc 11992537  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 324  Q
     ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11992538 agactgctgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaat 11992637  T
Q  325 acgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttc 423  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11992638 acgatgatttacatctgcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttc 11992737  T
Q  424 acctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11992738 acctctaaggtagacc--cacttctctttttactgaagttacattccatatacttcgtcttgcttc 11992801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 41763272 - 41763744
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc-cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41763272 ccaaaccacctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgttaccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcttgtctagtctt 41763371  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggt 223  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  41763372 accactcatccatcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgccggt 41763471  T
Q  224 ctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctcca--------tttcaaccaccc 315  Q
    |||| || | | ||||| ||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||    
T  41763472 ctgattgttcttcgatagaactttccttttagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaagttttcaaccaccc 41763571  T
Q  316 agcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatct 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  41763572 agcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaatcgtgcaacttggggtatgatataatct 41763671  T
Q  415 ccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41763672 ccaactttcacctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 41763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3866128 - 3865661
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3866128 atgcacaaaccatctaagcctattttctaccaacttttttactataggtgctacccccactctctctccaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 3866029  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  3866028 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacg 3865929  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3865928 tcggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtagtactttcttatcacacaaaacatctgaggctcttctccatttcaaccacccagc 3865829  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctcca 417  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  3865828 ttgaatacgatagcttacatttgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagttattgaaaccgtgtaacttgggatacaatatgatctcca 3865729  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgct 487  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3865728 actttcacctccaaggtaga--cgtacttctccttccgctgaagttacatttcatatactccgtcttgct 3865661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 8180836 - 8180367
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8180836 atgcccaaaccatctaagcttattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 8180737  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  8180736 gtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacg 8180637  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
      |||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8180636 ctggtctgactgatgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaactcttgaggctcttctccatttcaaccacccagc 8180537  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8180536 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttataagaaggacccaaaatatttaaaccgtgtaacttggagtatgatatgatctcca 8180437  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8180436 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccactgaaattacattccatatactctgtcttgcttc 8180367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 4807651 - 4807179
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct------aatggtgtcattcttaatcctatcttg 114  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||| |||||||||| ||    
T  4807651 atgccgaaactatctaagcctattt-ctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctctaatgatgtcattcataatcctatcatg 4807553  T
Q  115 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaac 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||  | ||||||    
T  4807552 tctattcttaccattcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgctcaacactctgtgtcatacaac 4807453  T
Q  215 attgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 314  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807452 aacgtcggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 4807353  T
Q  315 cagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatc 413  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4807352 catcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatc 4807253  T
Q  414 tccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4807252 tccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 4807179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 80 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 2610523 - 2610115
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||    
T  2610523 ctctctctaatggtgtcattcctaatcctgtcctgtctagtcttaccactcatccaacgcagcatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgtt 2610424  T
Q  180 ggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca 279  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | | ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  2610423 gactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccagtctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgca 2610324  T
Q  280 caaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaaga 379  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||    
T  2610323 taaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggtttacatctgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaaga 2610224  T
Q  380 tatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccc 478  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||| ||||||| |    
T  2610223 tatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacatttcatatactc 2610126  T
Q  479 cgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||    
T  2610125 cgtcttgcttc 2610115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 439
Target Start/End: Original strand, 3243882 - 3244293
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  3243882 cccaaaccatctaagcctattttccatcaacttttttactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcataatcctatcatgtgtagtctt 3243981  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggt 223  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| | |||||  | ||||    
T  3243982 actactcatccaacgcaacatccttatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaactgtccaacactccgtaccattcaacaacgccggt 3244081  T
Q  224 ctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 323  Q
    | ||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3244082 cggactgctgtccgatagaactttcctttcaacataagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcatctccatttctaccacccagcttgaa 3244181  T
Q  324 tacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttc 423  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  3244182 tacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg----gatatgatcttcaactttc 3244277  T
Q  424 acctccaaggtagacc 439  Q
    ||||||||||||||||    
T  3244278 acctccaaggtagacc 3244293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 102 - 489
Target Start/End: Original strand, 451931 - 452311
Alignment:
Q  102 taatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  451931 taatcctatcatgtctagtcttaccactcatctaacgcaacatactcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactc 452030  T
Q  202 cgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctc 301  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  452031 cgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctc 452130  T
Q  302 catttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  452131 catttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg 452230  T
Q  401 gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  452231 gtatgatatgatctcca------acctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 452311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 354
Target Start/End: Original strand, 41197458 - 41197792
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41197458 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtgctaccctcactctatctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtct 41197557  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  ||    
T  41197558 taccactcatctagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacattgctgg 41197657  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    |||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41197658 tctgactgttgttcgatagaactttcctttcagcttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccaacttga 41197757  T
Q  323 atac---gataatttacatctgcttctatttctcc 354  Q
    ||||   ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  41197758 atacgatgatgattcacatatgcttctatttctcc 41197792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 30743675 - 30743210
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||    
T  30743675 cccaaaccatctaattctaatttctaccaatttttctaccataagtgctacccc-actctcttcctaacggtgacattcccaatcctatcccgtctagtc 30743577  T
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcg 221  Q
    ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||   | |||||||| | ||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||| |||||||| ||||    
T  30743576 ttagcactcatcatgcgcaacatcctcatctccacaacacttacttgattctcgtgttggcttttaatcgcctaactctccgtaccatacaacatcgtcg 30743477  T
Q  222 gtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttg 321  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  30743476 gtctgaccgctatccggtaaaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacatgaggctcttctcaatttcaatcactcagcttg 30743377  T
Q  322 aatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaact 420  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30743376 aatacgatgatttatatctacttctatttatccgtcattttgtactattgacctaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatggtatgatctccaact 30743277  T
Q  421 ttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  30743276 ttcacctccaaggtagacc--aatttctccttttgctgaagttacattccatatactctgtctttcttc 30743210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 485
Target Start/End: Original strand, 24583904 - 24584297
Alignment:
Q  91 ggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaacc 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | || |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  24583904 ggtgtcattcttaatcatatcatgtttagtcttaccactcatcccgcacaacatcttcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaacc 24584003  T
Q  191 gcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctg 290  Q
    ||||| || |  ||||| |||||||| |||||||||  | || ||  | | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  24584004 gcccaacattttgtaccatacaacatcgtcggtctggatactatctaacagaacttttctttcaacttaagtggtattttcttttcgcacaaaacacacg 24584103  T
Q  291 agactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccg 390  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24584104 aggctattctccatttccaccacccagcttgaatatgatggcttaaatctgcctatatttctccatcattttgtactatggacccaagatatttaaaccg 24584203  T
Q  391 tgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttg 485  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24584204 tgtaacttgcggtctgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga--cataattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttg 24584297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38429936 - 38429700
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38429936 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctgcccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtct 38429837  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  38429836 taccactcatccaacgcaacatcctcatctccgctacacttactctactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccgg 38429737  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 259  Q
    | ||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||    
T  38429736 tttgactgctgtctgatagaactttccttttagctta 38429700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23997664 - 23997402
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  23997664 aaaccatctaaggctattttctaccaaattttcta---taggtgctacacccactctatctctaatggtgtcattcctaatccgatcatgtctagtctta 23997568  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23997567 ccactcatccagcgcaacatcttcatctccgttacacttacttggctctcgtgttgactcttaactgcccaacacttcgtaccatacaacattgtcggtc 23997468  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctg 290  Q
    | |||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23997467 ttactgttgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtattttctcatcgcacaaaacacctg 23997402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 231 - 489
Target Start/End: Original strand, 38453058 - 38453314
Alignment:
Q  231 ctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgata 330  Q
    |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38453058 ctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatg 38453157  T
Q  331 atttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctcc 429  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38453158 gcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtatgaaggacccaagatatttaaatcgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcc 38453257  T
Q  430 aaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||    ||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38453258 aaggtagac---tacttctccttccgctgatgttacattccatatactccgtcttgcttc 38453314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36183507 - 36183257
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36183507 atgccgaaaccaactaagattattttctaccaacttttctactataggtgctacccctactctctctctaattgtgtcattcctaatcctatcatgtcta 36183408  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  36183407 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 36183308  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttt 269  Q
     ||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||    
T  36183307 ccggtcggactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtagttttt 36183257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13149308 - 13148953
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| |||| |||| ||| | | |||||||    
T  13149308 ctctctcaaatggtgtcattcctaatcttatcccttttagtcttaccacttgtccaacacaacaccctcatctctgttacacttgcttgattttcgtgtt 13149209  T
Q  180 ggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca 279  Q
    || |||||||| ||   ||||| ||||| |||||||| ||  | |||  || ||||| ||| ||  || |||| | ||| ||||||  |||||||||  |    
T  13149208 ggttcttaaccacctgacactctgtaccgtacaacatcgttagcctggttgttgtccaatataattttccttttaacttgagtggtactttcttatcata 13149109  T
Q  280 caaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaaga 379  Q
      ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||    
T  13149108 tgaaacacctgaagctcttcttcatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttgtatctacttctatttctccgtcattttgtactatggacctgaga 13149009  T
Q  380 tatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149008 tatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 13148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 6237983 - 6238334
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactat--aggtgctacccccactctctctaat-ggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||  | |  ||||||||   ||||||||||  || |||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  6237983 ccaaaccatctaagcatgttttctaccaacttatcttttttttaggtgctatgtccactctctcccattggtgtcattcctaattctatcatgtctagtc 6238082  T
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcg 221  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||  | || |  | ||| || | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||     
T  6238083 ttaccgctcatccagcgcaacatcctcacattcgctgcaattatttgattctcgtgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacatcgtca 6238182  T
Q  222 gtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttg 321  Q
    |||| |||| ||||||||| ||  ||  ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6238183 gtctaactgttgtccgatagaattttcttttcaacttaagtggtatttt-ttatcacacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccatccaacttg 6238281  T
Q  322 aatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacc 374  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  6238282 aatacgatgatttacatatgtttttatttctccgacattttgtactatggacc 6238334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12734751 - 12734502
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  12734751 ccaaaccatctaagcctattttctaccaatttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcatttctaatcctatcccgtctagtctta 12734652  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||     |||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||     
T  12734651 ccactcatccagcacaacatcctcatctccacta----cacttgattctcatgttggctctaaaccgcccaacactctgtaccatacaacatcgatggtt 12734556  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca 279  Q
    |||||| ||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  12734555 tgactgttgt-cgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttgtcgca 12734502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Original strand, 38452911 - 38453046
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca------ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  38452911 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatagatgctacccccactctctctctctctaatggtgtcattcctaatcctatgatg 38453010  T
Q  115 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38453011 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcat 38453046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Original strand, 18424607 - 18424727
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  18424607 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatagatgctacacccactctctctaatggtatcattcttaatcatatcatatctagtctta 18424706  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  18424707 ccactcatccgacgtaacatc 18424727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 16097216 - 16097388
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc------tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||  ||||| ||||   ||||    
T  16097216 ccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtgctacccccactctaactctctctaacggtgtcatttctaatcatatcccatcta 16097315  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccg 191  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  16097316 gtcttaccactcatccagtgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaaccg 16097388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 306 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37281878 - 37281746
Alignment:
Q  306 tcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtat 404  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  37281878 tcaaccacccaacttgaataggatgatttacatctacttctatttctccttcattttatactatggagctaagatatttaaaatgtgtaacttggggtat 37281779  T
Q  405 gatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37281778 gacatgatctcaaactttcacctccaaggtaga 37281746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17581262 - 17581112
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||  ||| ||||||||     
T  17581262 aaaacacctgagactcttctccatttgaaccatccaacttgaatatgaggatttacatctgcttttatttctttgtcattttgtacaatgaacccaaga- 17581164  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 434  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  17581163 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctctaactttcacttctaaggt 17581112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2610644 - 2610578
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2610644 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttccactataggtgctacccccactctctct 2610578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25834733 - 25834671
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834733 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 25834671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Original strand, 19337096 - 19337245
Alignment:
Q  41 tattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct-agtcttaccactcatccaacgc 139  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||     
T  19337096 tattttccaccatctttactactataggtgctaccccaactctctctaatgttctcatttataatcctatcctgcctaagtcttaccacacatccaacgt 19337195  T
Q  140 aacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaac 189  Q
    |||||| ||||||||  ||  |||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  19337196 aacatcctcatctccactacgcttattttattctcgtgttgattcttaac 19337245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Original strand, 43238319 - 43238379
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccact 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43238319 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccact 43238379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 4598792 - 4598921
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct----ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||  |||||| | ||| |||||  |||||||    
T  4598792 ccaaaccaccaaagtctagtttctaccatctttactactataggtgctaccccaactctctctctctaatgtcgtcattttgaattctatcccgtctagt 4598891  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4598892 cttaccacacatccaacgcaacatcatcat 4598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 402 - 488
Target Start/End: Original strand, 12475031 - 12475115
Alignment:
Q  402 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgctt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12475031 tatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgctt 12475115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14770090 - 14769943
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccc-agcttgaatacgata-----atttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacc 374  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     |||||||| |||||  |||||||  |  ||||||| ||||| ||    
T  14770090 aaaacaccttacactcttctccatttcaaccaccccagcttgaatatgatataatgatttacatatgcttgaatttctctgttgttttgtactatggccc 14769991  T
Q  375 caagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 421  Q
     |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  14769990 taagatatttaaaccgtgtaacttatgctatgatatgatctccaactt 14769943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Original strand, 23714501 - 23714651
Alignment:
Q  35 taagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatcc 134  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23714501 taagtctagtttccaccatcttttctactatatgtgctaccca-actctatctaatgtcgtcatttttaatcctattttgtctagtcttaccacacatcc 23714599  T
Q  135 aacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctctt 186  Q
    ||| ||||||  | ||||| | ||| |||| |||| | ||||||||| ||||    
T  23714600 aacacaacattctaatctctgctatgcttaatttattttcgtgttggttctt 23714651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Original strand, 24102173 - 24102323
Alignment:
Q  35 taagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatcc 134  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24102173 taagtctagtttccaccatcttttctactatatgtgctaccca-actctatctaatgtcgtcatttttaatcctattttgtctagtcttaccacacatcc 24102271  T
Q  135 aacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctctt 186  Q
    ||| ||||||  | ||||| | ||| |||| |||| | ||||||||| ||||    
T  24102272 aacacaacattctaatctctgctatgcttaatttattttcgtgttggttctt 24102323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Original strand, 33594757 - 33594904
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||  ||| |||||    
T  33594757 aaaacacctaagacactcctccatctcaaccacccagtttgaatttgatgttttacatctccttctatttctccgacgttttgtactatatacctaagat 33594856  T
Q  381 atttaaaccgtgtaact-tgggtatgatatgatctccaactttcacct 427  Q
    |||||||| |||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33594857 atttaaactgtgtaaatgctggtatgatatgaactccaactttcacct 33594904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38434984 - 38434871
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaa 141  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  38434984 tttccaccatcttttctactataggtgctaccccaattctctctctaatgttgtcatttctaatcttctctcgtctagttttaccacgcatccaatgcaa 38434885  T
Q  142 catcatcatctccg 155  Q
    |||| |||||||||    
T  38434884 catcctcatctccg 38434871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42092550 - 42092441
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaaca 143  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||   |||||||  ||||| ||||  |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  42092550 tttctaccatcttttctagtataggcgctaccccaactctctctaacattgtcatttctaatcatatcccgtctagtcttactacacatccaatgcaaca 42092451  T
Q  144 tcatcatctc 153  Q
    ||||||||||    
T  42092450 tcatcatctc 42092441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 12904762 - 12904624
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||| || | | |||||||| |||||||| ||| ||| | | ||    
T  12904762 aaaacacctgagacactcgtttatttcaaccacctaacttgaattctatggtttacatctcctccaacttctccattattttgtactatagacaccatat 12904663  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaa 418  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12904662 atttaaaccgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaa 12904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 43752177 - 43752239
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43752177 ccaaatcacctaagcctattttctaccaccttttctactataggtgctaccccaactctctct 43752239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Original strand, 9578933 - 9579062
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||  | || |||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||   ||||||| ||||| ||||| | |||| |||||    
T  9578933 ccaaaccacctaagtctattttacatcatctttactactatatgtgtcaccccaactctctctaacattgtcatttttaattctatcatatctattctta 9579032  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  9579033 ccacacatccaacgcaacatctttatctcc 9579062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 70
Target Start/End: Original strand, 24583858 - 24583907
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtg 70  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24583858 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtg 24583907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 9556595 - 9556729
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccact--ctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||| |||||||  ||||| ||||  |||||    
T  9556595 atgcctaaaccacctaagcctattttccaccat-ttttctactataagtgttaccccaactttctctctaatgttgtcatttctaatcatatcccgtcta 9556693  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  9556694 atcttaccacacatccaacacaacatcctcaactcc 9556729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 227359 - 227312
Alignment:
Q  40 ctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  227359 ctattttctacaaacttttctaccataggtgctacccccactctctct 227312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7825353 - 7825254
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||  ||||||||| |||| ||||    
T  7825353 ctctctctaatagtgtcatttctaatcatatccagtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctaatctctgctacgcttactttattctcatgtt 7825254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11412777 - 11412711
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11412777 atgcccaaacaacctaagcctattttccaccatattttctactataggtgctaccccaactctctct 11412711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18958959 - 18958872
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccact---ctctctaatggtgtcattcttaatccta 109  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | | |||| ||||||||    
T  18958959 ccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactgaactctctaatgtttttattcctaatccta 18958872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12141599 - 12141539
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc 82  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12141599 tgcccaaaccacctaagcctcttttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactc 12141539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45077721 - 45077649
Alignment:
Q  102 taatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctc 174  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||| ||||    
T  45077721 taattctatctagtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatctcagctatgcttattttattctc 45077649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 876833 - 876778
Alignment:
Q  374 ccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  876833 ccaacatatttaaactgtgtaacttgtggtaggatatgatctccaactttcacctc 876778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 77
Target Start/End: Original strand, 12882267 - 12882322
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc 77  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  12882267 tgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctagtataggtgctgcccc 12882322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 489
Target Start/End: Original strand, 13592930 - 13593043
Alignment:
Q  372 acccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattcca 471  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |   |||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  13592930 acccaagatatctaaactgtgtaacttc--tatgatatgatcttcaactttcacctctaagtttgaac--tacttcgtcttttgttgaagttacattaca 13593025  T
Q  472 tataccccgtcttgcttc 489  Q
     |||||  ||||||||||    
T  13593026 cataccatgtcttgcttc 13593043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18188836 - 18188683
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| | |  ||| |||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||  | ||| ||||  ||||||     
T  18188836 atgcccaaaccacctaagtcgagcttccaccatcttttctagaagaggtgctaccccaactctctccaatgttgtcatttctgatcatatcccgtctagc 18188737  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcg 175  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||| |||||    
T  18188736 ctta-cacacatccaacacaacatcctcatctttgttacacttaatttattctcg 18188683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 428
Target Start/End: Original strand, 7135220 - 7135321
Alignment:
Q  328 ataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 426  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  ||  ||||||| | |||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  7135220 ataatttacttctacttctatttctttattgttttgtactgtggacccaagactttttaactgtgtaacttgtggtatgatatgatatctaaatttcacc 7135319  T
Q  427 tc 428  Q
    ||    
T  7135320 tc 7135321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Original strand, 9647839 - 9647965
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||| ||||  ||| |||| |||| | |||||||||||||| || |||| ||||| |  |||| || ||||  ||||| ||||   ||||||||||    
T  9647839 ccaaaccacctaaagctagtttccaccatcatttctactataggtactgccccaactctat--aatgttgacatttctaatcttatcacatctagtctta 9647936  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9647937 ccacacatccaacgcaacatcctcatctc 9647965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28317517 - 28317383
Alignment:
Q  299 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 398  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || | ||  | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  || |||| |||| ||||  ||||| |||    
T  28317517 ctccgtttcaaccactcagcttggattcaatggtatacatctacttctttttatccatcattttgtactacagatccaaaatatataaattgtgtacctt 28317418  T
Q  399 gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28317417 g----tgatatgatctccaactttcacctctaagctaga 28317383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 40759156 - 40759049
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccac---tctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    |||| ||||||| ||||  ||| |||| ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  40759156 atgcacaaaccacctaactctagtttccaccattttttctactataagtgctaacccaacctctctctctaatgttgtcatttctaatcttatcttgtct 40759057  T
Q  118 agtcttac 125  Q
    ||||||||    
T  40759056 agtcttac 40759049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44411749 - 44411639
Alignment:
Q  40 ctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgc 139  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  | |  |||||||||| |||||||  ||||| |||||  ||||||||||| || |||| |||||    
T  44411749 ctattttccaccatctttcctactataggtgctacttcaa--ctctctaatgttgtcatttgtaatcatatctcatctagtcttacaacacatcaaacgc 44411652  T
Q  140 aacatcatcatct 152  Q
    || || |||||||    
T  44411651 aatattatcatct 44411639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 38860229 - 38860165
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct 85  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38860229 atgcctaaaccacctaagcctattttccacaatcttttctactatgggtgctgcccccactctct 38860165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 41545443 - 41545372
Alignment:
Q  41 tattttctaccaacttttct-actataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatccta 109  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41545443 tattttctaccaactttttttattataggtgttaccctcgctctctccctaatggtgtcattcttaatccta 41545372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 56
Target Start/End: Original strand, 451874 - 451909
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaactt 56  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  451874 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaactt 451909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7615325 - 7615251
Alignment:
Q  49 accaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||  || |||||||  ||||||||||    
T  7615325 accatcttttctactataggtgttaccccaagtctctctaatgtggtcatttctagtcctatcccgtctagtctt 7615251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17581485 - 17581349
Alignment:
Q  60 tactataggtgctacccccactctctcta--atggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgtt 157  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||  ||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||  ||      
T  17581485 tactataggtgctaccttaactatctctacaatgttgtcatttttaatcttatcatatctagtcttaccacacatccaacaaaacatccccatcctcg-c 17581387  T
Q  158 atacttactttactctcgtgttggctcttaaccgccca 195  Q
    | |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||    
T  17581386 acacttactttattttcgtgttggttcttaacctccca 17581349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 6219019 - 6218954
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaat 90  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  6219019 ccaaaccacctaagcctattatccactatcttttctactataagtgctaccccaactctatctaat 6218954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6465515 - 6465370
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  ||| |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||    |||| ||    
T  6465515 aaaacagctaagactcttctccatctcagccacctgacttgaatttgatgatttgcatatgcttcaatttctcagtcattttgtagtataatgccaaaat 6465416  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcac 425  Q
    ||| |||  |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  6465415 attaaaattgtgtaacttgtgttttaatatgatctccaactttcac 6465370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7292782 - 7292673
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga-cccaaga 379  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||| ||  |||  ||||||||| |||||||| | || ||| |||||| ||| || ||| |||    
T  7292782 aaaacacctgagtcactccttcatttcaaccacccaacttggatttgatggtttacatctccttctattcccccgtcagtttgtactatagaccccgaga 7292683  T
Q  380 tatttaaacc 389  Q
    ||||||||||    
T  7292682 tatttaaacc 7292673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11017337 - 11017268
Alignment:
Q  54 cttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  | |||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  11017337 cttttctactataggtgctacctcaactctctttaatattttcattcctaatcttatctcatctagtctt 11017268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32443527 - 32443436
Alignment:
Q  162 ttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttca 254  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||||| ||  |||||||||    
T  32443527 ttacttgattctcgtgttgattcttaaccacccaacactctgtaccatacaacattgt-ggtttgactgctatacgatagaatttttctttca 32443436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 25191429 - 25190966
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25191429 ccaaaccatctaagtctattttcttccaatttttctactataggtgctacccccattctctctaatgatgtcattcttaatcatatcatgtctagtctta 25191330  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  25191329 ccactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgactcttaacagcccaacactctgtaccatacaacatttccggtc 25191230  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 324  Q
    |||||  ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191229 tgactattgttcgatagaaccttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 25191130  T
Q  325 acgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttc 423  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25191129 acgatgatttacatttgcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggctatgatatgatctccaactttc 25191030  T
Q  424 acctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25191029 acctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 25190966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 51447936 - 51448404
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc-cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51447936 atgcccaaactatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtctag 51448035  T
Q  120 tcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| || | |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||    
T  51448036 tcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttagttgattctcatgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccatacaacaacgt 51448135  T
Q  220 cggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 319  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51448136 cggtcggactgctgtccgatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagct 51448235  T
Q  320 tgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaa 418  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51448236 tgaatacgatagcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaa 51448335  T
Q  419 ctttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  51448336 ctttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacatttcatatactccgtcttgcttc 51448404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28245493 - 28245093
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||  | |||    
T  28245493 atgcccaaaccatctaagtctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatgatgtcattcctaatcctatccaggcta 28245394  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||| | |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  28245393 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctttgctacacttacttaattctcatgttgacttttaaccgcccaacactccgtaccgtacaacaacg 28245294  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28245293 ccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaactgagactcttctccatttcaaccacccagc 28245194  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28245193 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccatcattttgtacgaaggatccaagatatttaagccgtgtaacttggggtattatatgatctcca 28245094  T
Q  418 a 418  Q
    |    
T  28245093 a 28245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 80 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 38850089 - 38849686
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||||||||    
T  38850089 ctctctctcatgatgtcattcctaatcatatcatgtctagtcttactactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgtt 38849990  T
Q  180 ggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca 279  Q
    | |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  38849989 gactcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacatcgtcggtgtgactgttgtccgataaaaaatttctttcaacttaagtggtactttgttatcgca 38849890  T
Q  280 caaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaaga 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  38849889 caaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactgtggacccaaga 38849790  T
Q  380 tatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccc 478  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  38849789 tatttaaaccgtgtaaattgaggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttttgatgtagttacattccatatactc 38849692  T
Q  479 cgtctt 484  Q
    ||||||    
T  38849691 cgtctt 38849686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 113 - 489
Target Start/End: Original strand, 47542032 - 47542406
Alignment:
Q  113 tgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| | |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  47542032 tgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacactttctt-attctcatgttgactcttaactgcccaacactccgtaccataca 47542130  T
Q  213 acattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca 312  Q
    |||  | ||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47542131 acaacgccggtcagaccgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaacca 47542230  T
Q  313 cccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatga 411  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47542231 cccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgaaatga 47542330  T
Q  412 tctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  47542331 tctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacattccatacactccgtcttgcttc 47542406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 52138856 - 52138553
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52138856 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 52138757  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |    
T  52138756 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatcttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaacg 52138657  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138656 ccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcgcacaagacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 52138557  T
Q  319 ttga 322  Q
    ||||    
T  52138556 ttga 52138553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27917622 - 27917173
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||| ||||    
T  27917622 ccaaaccatctaagcctatttcctaccatcttttctactataggtgctaccccaactttctctaatggggtcattcctaatcaaatctcgtctaggctta 27917523  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||  ||||||| | |||||| |||| ||||||| || || ||||  ||||| |||||||| | ||||     
T  27917522 ccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacgcttacttgattctcgttttggttcttaactgcacatcactttgtaccatacaacatcgccggtg 27917423  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 324  Q
    |||||| ||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||  ||| ||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||    
T  27917422 tgactgatgttcgatagaatttttcattcaacttaagtggtacttttttatcacataaaacacatgaggctcttctctatttcagctacccaacttgaat 27917323  T
Q  325 acgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttc 423  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27917322 acgatgatttatatatgcttatatttctccgtcattttgtactatggactcaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatctccaactttc 27917223  T
Q  424 acctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatata 475  Q
    |||| ||||||||| |   | ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  27917222 accttcaaggtagaac--tagttctccttttactgaagttacaatccatata 27917173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5168883 - 5168599
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct------aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5168883 caaaccatctaagcgtattttctaccaacttttctaccataggtgctacccccactctctctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtctag 5168784  T
Q  120 tcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgt 219  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  5168783 tcttacctatcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcatgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgc 5168684  T
Q  220 cggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccat 304  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5168683 cggtctgactgttgtccgatagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccat 5168599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53519644 - 53519353
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactata------ggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53519644 ccaaaacatctaagcctattttctaccaacttttctactatatatataggtgctacccccactctctgtctaatggtgtcattcttaatcctatcctgtc 53519545  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||    
T  53519544 tagtattaccactcatccaacgcaacatcctcatttccgctacactaactttactctcgtgttggctcttaaccgcttaacactccgtacaacacaacat 53519445  T
Q  217 tgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 308  Q
    || || |||||||||||||||||| |   || |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53519444 tgccgatctgactgctgtccgatagatttttcctttaagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttca 53519353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26490367 - 26489964
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||  |||| ||||||    
T  26490367 ccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacctcaactctgtctaatgacgtcattgctaatcatatcccgtcttgtctta 26490268  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacctt--acaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| || | | |||| |  ||||||| | |||    
T  26490267 ccactcatccaacgcaacatcctcatctccgctacacttacttgattctcttgttggttcttaaccgcccaaca-tacttaccatacacaacatcgccgg 26490169  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    |||||||| ||||||||| ||  || |||| |  ||||| ||| |||||| ||  || |||||  || || || |||| ||| |||||||| || ||| |    
T  26490168 tctgactgttgtccgatataattttcctttaaatttaagcggtattttctcattacataaaac-tctaaggctattcttcatctcaaccactcaacttca 26490070  T
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactt 421  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26490069 atatgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttatatcatggaaccaagatatttaaatcatgtaacttggagtatgatatgatctcccactt 26489970  T
Q  422 tcacct 427  Q
    ||||||    
T  26489969 tcacct 26489964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 54279075 - 54278855
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  54279075 tgcccaaaccgtctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccctactctctctctaatggtgtcattcctaattctatcttgtctag 54278976  T
Q  120 tcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgt 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| | | |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |     
T  54278975 tcttaccacttatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacctgattcttatgttgactcttaactgcccaacactccgtaccatacaacaacgc 54278876  T
Q  220 cggtctgactgctgtccgata 240  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  54278875 tggtctgactgctgtccgata 54278855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 33272248 - 33272450
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactata----ggtgctacccccactct----ctctaatggtgtcattcttaatcctatct 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33272248 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatatataggtgctacccccactctctctctctaatggtgtcattcttaatcctatca 33272347  T
Q  113 tgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  33272348 tgtctagtcttaccactcatccaatgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaactgcccaacactccgtaccataca 33272447  T
Q  213 aca 215  Q
    |||    
T  33272448 aca 33272450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 209 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29817370 - 29817096
Alignment:
Q  209 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 308  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||  ||||||||| |||||| | |  ||||||||| || ||||||    ||||| ||||| ||||||    
T  29817370 tacaacattatcggtctaactgttgtccggtagaaattttctttcaacttaagcgttactttcttatcacataaaacataacagactattctctatttca 29817271  T
Q  309 accacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgat 407  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  29817270 accacccaacttgaatacgatgatttacatctgccgttatttatccgtcattttgtactatgg-tcaaagatatttgaaccgtgtaacttatggtatgat 29817172  T
Q  408 atgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29817171 atgatctccaactttcacctccaagatagaac--aacttcaccttttgatgaagttacattccatatactctgtcttg 29817096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 43694991 - 43695226
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccc-actctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtc--- 116  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||| |||||||||| ||||       
T  43694991 atgcccaaaccatctaagcaaattttctaccaacttttctactataggtgctaccccccactctctctc----tgtcattcctaatcctatcatgtcatg 43695086  T
Q  117 --tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaac 214  Q
      | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||   ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  43695087 tctggtcttaccattcatccaacgcaacatcctcatctctgttacacttacttgattctcgtgttaattctcaaccacccaacactccgtaccatacaac 43695186  T
Q  215 attgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttca 254  Q
    || | |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43695187 atcgccggtctaactgctgtccgatagaacttttctttca 43695226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22124 - 21993
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22124 ccaaaccatctaagcctattt-ctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgacattcctaatcctatcatgtctagtct 22026  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22025 taccactcatccagcgcaacatcctcatctccg 21993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 30345506 - 30345175
Alignment:
Q  92 gtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccg 191  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||    || |||||| |||||||||    
T  30345506 gtgtcattcataattctatcatgtccaatcttaccgctcatccaacacaacatcctcatctccgctatacttaattt----tcatgttggttcttaaccg 30345411  T
Q  192 cccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctga 291  Q
    |||| ||||||||||  || ||||| |||  ||||| |   ||| | || ||  || ||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  30345410 cccatcactccgtacaatataacatcgtcaatctgattttcgtctggtagaattttcctttcaatttaagcggtactttcttatcgcataaaacacctga 30345311  T
Q  292 gactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || || || ||||||||  || ||||||| |||| |||    ||||||||||| |    
T  30345310 gactcttctccatttcaaccacccaacttgaatactatgatttatatatgtttttatttctctttctttttgtactatgaacc----atatttaaacctt 30345215  T
Q  392 gtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctcca 430  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  30345214 gtagcttggggtatgatatgagcttccactttcacctcca 30345175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 166
Target Start/End: Original strand, 47233826 - 47233969
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  47233826 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccattctctctctaatggtgtcatttctaatcttatcatgtctagtct 47233925  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttact 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||    
T  47233926 taccactcatccaacgcaatatcctcatcttcgctacacttact 47233969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54128434 - 54128300
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  54128434 atgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctaccccaacactctctctaatggtgtcattcataatcctatcgcgtcta 54128335  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54128334 gttttaccactcatcaaacgcaacatcctcatctc 54128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3186824 - 3186500
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||  | | |    
T  3186824 atgcccaaatcatcta-gcctattttctaccaactttcccactataggtgctaccaccactctttccataatggtgtcattcctaatcttatcccgccaa 3186726  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||  |||||| || || | |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||   || | |||||||| |    
T  3186725 gtcttaccgctcatccaacataagattctcatctacgctacatttacttgattctcgtgttgactcttaatcgcccaacactatatatcatacaacatcg 3186626  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
    | |||  ||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||| |  ||||||||| |  ||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||| |    
T  3186625 ttggtgggactgttgtccgatataactttcctttcaacttaagtgatactttcttatcacctaaaacacatgaaaatattcttcatttcaaccacccaac 3186526  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgctt 344  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  3186525 ttgaatacgatgttttacatctgctt 3186500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 356 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 52138547 - 52138415
Alignment:
Q  356 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctcctttt 454  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||      
T  52138547 tcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttcc 52138450  T
Q  455 gttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52138449 gctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 52138415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 398
Target Start/End: Original strand, 54425369 - 54425511
Alignment:
Q  256 cttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctcca 355  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  54425369 cttaagtggtactttcttatcacacaaaacacatgagactctttttcatttcaaccgcctagcttaaatacgatgatttacatatgcttctatttctccg 54425468  T
Q  356 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 398  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54425469 tcattttttactatggatccaagatatttaaaccgtgtaactt 54425511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19757820 - 19757655
Alignment:
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19757820 atacgatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 19757721  T
Q  422 tcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||  |   ||||  ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19757720 tcacctccaaggtaggac--tactttgccttttgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttc 19757655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 49503780 - 49503978
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacc--cccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  49503780 atgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacctgaactctctctctaatggtgtcattcccaatcctatctcgtcta 49503879  T
Q  119 gtcttaccactc-----atccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttaca 212  Q
    ||||||||||||     ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| | | || |||||  ||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  49503880 gtcttaccactcatccaatccaacgcaacatccttatctccgctacacttacttgattttcatgttgattcttaaccgtccaacactccataccataca 49503978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45728197 - 45728025
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct---aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||||| | |||| |||||    
T  45728197 aaaccatctgatcctactttctaccaacttttctactatatgtgctacccccactctctctctaaatgatgtcatttctaatcctatttcgtctcgtctt 45728098  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt-ggctcttaaccgccca 195  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  45728097 accactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgggctcttaaccgccca 45728025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 323 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19736914 - 19736753
Alignment:
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactt 421  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19736914 atacgatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatgga----agatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 19736819  T
Q  422 tcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||  | || ||   ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19736818 tcacctccaaggtaggactactct--gccttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttc 19736753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 48221564 - 48221421
Alignment:
Q  295 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 394  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||    
T  48221564 tcttcttcatttcaaccatccagtttgaattcgatgatttacatatgcttctacttctctgtcattttgtactatgaatccaagatatttaaaatgtgta 48221465  T
Q  395 acttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  48221464 acttgtggtatgatatgatcttcaactttcacctctaagataga 48221421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 48734361 - 48734481
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||  | |||||    
T  48734361 atgcccaaaccacctaagcctattttctaccatctgttctactatacgcgctaccccaacactctctaatggtgtcattcataatcttatcccgcctagt 48734460  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaa 141  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  48734461 tttaccactcatccaacgcaa 48734481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 365 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 9258589 - 9258470
Alignment:
Q  365 attatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagtt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||| |||    ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  9258589 attatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatatctaatgttcacctctaag----acctac--ttctccttttgttgaagtt 9258496  T
Q  464 acattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9258495 acattccatatactccgtcttgcttc 9258470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19737053 - 19736918
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca---ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| | ||| |  ||||| ||||  ||||    
T  19737053 atgctcaaaccacctaaacctattttctaccatcttttctactataggtgctgcccccaactctctctctaatgatttcacttctaatcgtatcccgtct 19736954  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19736953 agtcttaccactcatccaacacaacatcatcatctc 19736918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Original strand, 36820193 - 36820309
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttacc 126  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  36820193 aaaccacctaagcctagtttccaccatctttgctaatataggtgctaccccaactctctctaatgtcgtcatttctaatcctatctcgtctagtcttacc 36820292  T
Q  127 actcatccaacgcaaca 143  Q
    || ||||||||||||||    
T  36820293 acacatccaacgcaaca 36820309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Original strand, 344951 - 345110
Alignment:
Q  35 taagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcat 132  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||   |||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  344951 taagcctattttctaacatcttttctactataagtgctaccccaactctctctctaatgtcatcatttctaatcctatctcgtctagtcttaccacaaat 345050  T
Q  133 ccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgc 192  Q
    |||||  |||||| | || |||| ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  345051 ccaacataacatcctaatttccgctatgcttactttattcttgtgttggttcttaaccgc 345110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19757956 - 19757826
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca---ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| | ||| |  ||||| ||||| || |    
T  19757956 atgctcaaaccacctaaacctattttctaccatcttttctactataggtgctgcccccaactctctctctaatgatttcacttctaatcgtatctcgtgt 19757857  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatc 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19757856 agtcttaccactcatccaacacaacatcatc 19757826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 35033198 - 35033136
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033198 ccaaaccatataagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 35033136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38060483 - 38060421
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38060483 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtgctacccccactctctct 38060421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 217
Target Start/End: Original strand, 48953694 - 48953819
Alignment:
Q  91 ggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaacc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||   ||| ||||||| |||||| |    
T  48953694 ggtgtcattcttaatcctatctcatccaatcttaccgctcatccaacgcaacatcctcatctccg-cacacttacttgtttcttgtgttggatcttaaac 48953792  T
Q  191 gcccagcactccgtaccttacaacatt 217  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  48953793 gcccaacactccgtaacatacaacatt 48953819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50249432 - 50249278
Alignment:
Q  29 accatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatc---ctatcttgtctagtctt 123  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||| | |||||  |||||   |||||| |||||||| |    
T  50249432 accacctaagtctagtttccaccatcttttctactatacgcgctaccccaactctctctctaatgttatcatttctaatcatcctatctcgtctagtcct 50249333  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgt 178  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  50249332 accacacatccaacgaaacatcatcatctccgctatgcttattttattctcgtgt 50249278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 427
Target Start/End: Original strand, 30724311 - 30724435
Alignment:
Q  304 tttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggt 402  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||   ||    
T  30724311 tttctaccacccaacttgaattcgataatttacatatcattctatttctcacttattttgtaatatgtatccaagatatctaaactgtgtaacttatagt 30724410  T
Q  403 atgatatgatctccaactttcacct 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  30724411 atgatatgatctccaacgttcacct 30724435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45236850 - 45236751
Alignment:
Q  81 tctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttg 180  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||    
T  45236850 tctctctaatggtgtcatttctaatcatatccagtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctaatctcggctaggcttactttattctcgtgttg 45236751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Original strand, 50960859 - 50960922
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctc 84  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50960859 atgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctaccccaactctc 50960922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 2340940 - 2341101
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||| |||||||  |||||  |||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||  ||| |||||||||| | |||||  |||| ||||| ||||||    
T  2340940 atgctcaaaccacgtaagatgattttccaccatcttttctacgaatggtgctaccccaacaccctctctaatgttttcatttctaattctatcatgtcta 2341039  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttg 180  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| ||||    
T  2341040 gtcttaccacacatccaatgcaacatcctcatctccactatccttattttattctcgcgttg 2341101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38850176 - 38850110
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||    
T  38850176 atgcccaaaccatctaagtctattttctaccaacttttctactatatgtgctactctctctctctct 38850110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33307165 - 33307087
Alignment:
Q  56 tttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatcc 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  33307165 tttctactataggtgctaccccaactctctctaatgttgtcgtttctaatcttatcatgtttagtcttaccacacatcc 33307087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 3987100 - 3987037
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3987100 cccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgataccccaactctctct 3987037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37227950 - 37227863
Alignment:
Q  55 ttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaac 142  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  37227950 ttttctacgatagctgctactccaactctctctaatgtggtcatttctaatcctatattgtctagtcttaccacacaaccaacacaac 37227863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43308539 - 43308425
Alignment:
Q  102 taatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||| | || |||| ||||   ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  43308539 taatcctatcatgtctagtcttaccacaaattcaacgcaacaccttcgtctcggttacgattattttattctcgtgttggttctttaccgcccaacactc 43308440  T
Q  202 cgtaccttacaacat 216  Q
    | | || ||||||||    
T  43308439 catcccatacaacat 43308425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 31337752 - 31337868
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccc-ccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    |||| |||||||  |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||||    
T  31337752 atgctcaaaccacttaagcctagtttcaaccatcttttctactataggtgctacccaactttctctctaatgctgtcatt-ttaatcctatcccatctag 31337850  T
Q  120 tcttaccactcatccaac 137  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  31337851 tcttatcacacatccaac 31337868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 70
Target Start/End: Original strand, 48953648 - 48953697
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtg 70  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48953648 atgcccaaatcatctaagtttattttctaccaacttttctactataggtg 48953697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 54365203 - 54365271
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaat 90  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54365203 atgcccaaaccacctaag-ctattttccgccatattttctactataggtgctaccccaactctctctaat 54365271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 45289318 - 45289385
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctact--ataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  45289318 tgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactgaataggtgctaccccaactctctct 45289385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 144
Target Start/End: Original strand, 38054613 - 38054688
Alignment:
Q  69 tgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38054613 tgctacctcaactctctctaatgttatcatttctaatcctatcccgtctagtcttaccacccattcaacgcaacat 38054688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 38430904 - 38430807
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct-------ctctaatggtgtcattcttaatcctatc 111  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||       ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38430904 atgcccaatcaacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacctcaacgctctaaacgctctaatggtgtcattcctaatcctatc 38430807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Original strand, 19676377 - 19676447
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  19676377 ctctctctaatggtgtcactcctaatcttatcccatctagtcttaccgctcatccaatgcaacatcctcat 19676447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 182
Target Start/End: Original strand, 23534816 - 23534958
Alignment:
Q  41 tattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca-ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgc 139  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||| |||||  |||||| ||| ||  |||| |||||    
T  23534816 tattatctaccatcttttttactataaatgctacccccaactctctctaatattgtcatttctaatcttatctgatctagttttatcaaacatctaacgc 23534915  T
Q  140 aacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggc 182  Q
    |||||| || |||||| ||  |||| |||| |||| |||||||    
T  23534916 aacatcctcttctccgctacgcttattttattctcatgttggc 23534958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 39600907 - 39601016
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||| |||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||  ||||| ||||   ||||    
T  39600907 atgccaaaaccacctaagcttgttttccaccatcttttctactataggtactaccccaactctctctctaatgttgtcatttctaatcttatcccatcta 39601006  T
Q  119 gtcttaccac 128  Q
    ||||||||||    
T  39601007 gtcttaccac 39601016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 46145869 - 46145799
Alignment:
Q  359 ttttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  46145869 ttttgtactatggactcaaaatatttaaaccgtataacttgtggtatgacataatctccaactttaacctc 46145799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 191
Target Start/End: Original strand, 52679091 - 52679246
Alignment:
Q  40 ctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct----aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatcca 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||    |||||||||||| |||||  |||||  | |||| ||||| || |||||    
T  52679091 ctattttcttccaacttttctgctatagatgctatttccactctctctttctaatggtgtcatttttaatattatctcatatagttttaccgctgatcca 52679190  T
Q  136 acgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccg 191  Q
    | ||||||||  |||||| ||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||    
T  52679191 atgcaacatccccatctctgttatgcctatttgattcttgtgttgactcttaaccg 52679246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 44395200 - 44395080
Alignment:
Q  302 catttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-g 400  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||   ||||||||||  |  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  44395200 catttcaaccacttaacttgaattcgatggtttacatct---tctatttctctgttgtttagtactatggacccgagatatttaaatcgtgtaacttgcg 44395104  T
Q  401 gtatgatatgatctccaactttca 424  Q
     | || ||||||||||||||||||    
T  44395103 ttgtggtatgatctccaactttca 44395080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 46568111 - 46568038
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  46568111 ctctctctaatgttgtcatttctaattcaatctggtctagtcttaacacacatccaacacaacatcctcatctc 46568038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 111
Target Start/End: Original strand, 54425210 - 54425289
Alignment:
Q  33 tctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatc 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54425210 tctaagtctattttctacaaacttttctattatagatgata-cctcactctcttcctaatggtgtcattcataatcctatc 54425289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 99
Target Start/End: Original strand, 31454475 - 31454531
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgct-acccccactctctctaatggtgtcatt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  31454475 tttctaccatcttttctactataggtgctaaccaacactctctctaatgttgtcatt 31454531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Original strand, 41842740 - 41842792
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccc 76  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41842740 cccaaaccacctaagactggtttccaccatcttttctactataggtgctaccc 41842792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 44134053 - 44134117
Alignment:
Q  18 tagatgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc 82  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  44134053 tagatgtccaaaccacctaagtctattttccaccatcttttctactagaggcgctaccccaactc 44134117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Original strand, 32490249 - 32490356
Alignment:
Q  318 cttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctcc 416  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||  |||||||| | | || | || || ||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  32490249 cttgaattcgatagtttatatctagttctattttttcgtcgtcttataatatagacccaagaaatttaaattgtgtaacttgtggtatgatatgatcttc 32490348  T
Q  417 aactttca 424  Q
    ||||||||    
T  32490349 aactttca 32490356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 428
Target Start/End: Original strand, 1470683 - 1470733
Alignment:
Q  379 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1470683 atatttaaaccatgcaacttttggtatgatatgatctccaactttcacctc 1470733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15751018 - 15750888
Alignment:
Q  295 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 394  Q
    |||||| ||||||||||||| | | ||| || |||  ||||||| |||||| || ||||| || ||||| |||||| |||||| || |||||| | ||||    
T  15751018 tcttcttcatttcaaccacctaacatgagtatgatgttttacatatgcttcgatgtctccttcgttttgcattatgaacccaaaatgtttaaatcatgta 15750919  T
Q  395 acttg-ggtatgatatgatctccaactttca 424  Q
    | ||| | | | |||||||||||||||||||    
T  15750918 atttgagatgtcatatgatctccaactttca 15750888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 30294350 - 30294416
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | | ||||||||    
T  30294350 atgctcaaaccatctaaacctattttctaccaacttttttagtatatgtgctactctctctctctct 30294416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 40674492 - 40674634
Alignment:
Q  172 ctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttc 271  Q
    |||||||||  ||||| | | ||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| ||| | | ||||| ||  || |||||| |||||||| |  ||||    
T  40674492 ctcgtgttgattcttatcagtccaacactccgtactatacaacattgttgatctgcctgatattcgatagaattttcctttcaacttaagtgatactttc 40674591  T
Q  272 ttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 314  Q
    ||||| || |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  40674592 ttatcacataaaacatctcagactcttccccacttcaaccacc 40674634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 82
Target Start/End: Original strand, 42510244 - 42510301
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc 82  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42510244 ccaaaccacctaagcctattttccactatcttttctactataggtgctatcccaactc 42510301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29919277 - 29919193
Alignment:
Q  102 taatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctctt 186  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||  || ||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  29919277 taatcatatctcgtctaatcgtaccacacatccaacacaacatcgtcatctccactacactgattttattctcgtgttggttctt 29919193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29968430 - 29968346
Alignment:
Q  102 taatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctctt 186  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||  || ||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  29968430 taatcatatctcgtctaatcgtaccacacatccaacacaacatcgtcatctccactacactgattttattctcgtgttggttctt 29968346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Original strand, 37534427 - 37534483
Alignment:
Q  16 cgtagatgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgct 72  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  37534427 cgtacatgcccaaaccaggtaagcctattttccaccatcttttctactatcggtgct 37534483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 39235194 - 39235154
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttcta 61  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39235194 atgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttcta 39235154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 154
Target Start/End: Original strand, 46431984 - 46432032
Alignment:
Q  106 cctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  46431984 cctatcctgtctagtcttaccacacatccaatgcaacatccccatctcc 46432032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 49841606 - 49841534
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatct 152  Q
    ||||| |||||| |||||||  ||||| || || |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  49841606 ctctcactaatgttgtcatttctaatcttacctcgtctagtcttactacacatccaacacaacatcctcatct 49841534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 38607056 - 38606593
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct-aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  38607056 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacctttctactataggtgctacccccactctctcttaatgttgtcattcctaatcctatcatgtctagtctt 38606957  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggt 223  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38606956 accactcatccagcgcaacattatcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggt 38606857  T
Q  224 ctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 323  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38606856 ctgactgttgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaa 38606757  T
Q  324 tacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaacttt 422  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38606756 tacgatggtttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatctccaacttt 38606657  T
Q  423 cacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38606656 cacct-caaggtagacc--cacttctccttttgcaaaaattacattccatatactccgtcttgcttc 38606593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 36652042 - 36651581
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttacc 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36652042 aaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatggatgccacccctaccctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtctagtcttacc 36651943  T
Q  127 actcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctg 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| |    
T  36651942 actcatccaacgcaacatcctcatctctgttacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcgg 36651843  T
Q  227 actgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatac 326  Q
    | |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36651842 attgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatac 36651743  T
Q  327 gataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcac 425  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36651742 gatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgcgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcac 36651643  T
Q  426 ctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36651642 ctccaaggtagacc--tacttcttcttccgctgaagttccattccatatactccgtcttgcttc 36651581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 33350032 - 33350501
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33350032 atgcccaaaccatctaagcctattttctagcaacttttctactataggtgcaacccccactctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcatgtcta 33350131  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  33350132 gtcttaccactcatccaaggcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 33350231  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33350232 ccggtcggactgctgtccgatagaactttcctgtcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagc 33350331  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33350332 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagaccctagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 33350431  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| |||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33350432 actttcacctccaaggtagacc--tacttcttcttccgctgaagttacattccatatacttcgtcttgcttc 33350501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 35 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 32630636 - 32630194
Alignment:
Q  35 taagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcat 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32630636 taagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctccaatggtatcatcct-aatcctatcatgtctagtcttaccactcat 32630538  T
Q  133 ccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgct 232  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  32630537 ccagctcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgtcggtctgattgat 32630438  T
Q  233 gtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataat 332  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  32630437 gtccgatagaactttcctttcagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacactcgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatga- 32630339  T
Q  333 ttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaa 431  Q
               | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32630338 -----------tgtaattctccatcattttgtaatatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaa 32630250  T
Q  432 ggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32630249 ggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 32630194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 31005279 - 31004811
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  31005279 atgcccaaaccatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgttattcctaatcctatcctgtcta 31005180  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |    
T  31005179 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccatacaacaacg 31005080  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31005079 ccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccaac 31004980  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31004979 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggagccaagatatttaaa-cgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 31004881  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  31004880 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagtaacattccatatactctgtcttgcttc 31004811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 46356082 - 46356546
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  46356082 atgcccaaaccatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccattctctctctgatggtgtcattcctaatcctatcctgtcta 46356181  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | || ||||  ||    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  46356182 gtcttaccactcattcaacgcaacatcc-catctctgctacacttgatt----ctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaatg 46356276  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     |||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  46356277 ccggtctgactactgtccgatagaactttcctttcaacttaagtagtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccaac 46356376  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46356377 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 46356476  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46356477 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 46356546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 11594016 - 11593552
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  11594016 atgcccaaaccatctaaccgtattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctcaaatggtgtcattcctaatcttatcctgtcta 11593917  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  11593916 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacg 11593817  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     |||||  |||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11593816 ccggtcgaactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagc 11593717  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  11593716 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccatcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtctaacttggggtatgatatgatcttca 11593617  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttt-tgttgaagttacattccatataccccgtct 483  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11593616 actttcacctccaaggtagacc--tacttctcctttccgctgaagttacatttcatatactccgtct 11593552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43281726 - 43281389
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43281726 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcctaatcctatattgtctagtctta 43281627  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||     
T  43281626 ccactcatccagcgcaacatcctcatccccgctacacttactttactcttgcgttggctcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgccggtt 43281527  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 324  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281526 tgactgctgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacgcctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaat 43281427  T
Q  325 acgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43281426 acgatgatttacatctgcttctatttctccgtcatttt 43281389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 39906596 - 39907074
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39906596 atgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtcta 39906695  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc-----gttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||      | || |||||||| | |||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  39906696 gtcttaccactcatccaacgcagcatcctcatctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaatcgcctaacactccgtaccatacaa 39906795  T
Q  214 cattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccattt----caa 309  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    |||    
T  39906796 caacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatctgaggctcttctccatttcaaccaa 39906895  T
Q  310 ccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgata 408  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39906896 ccacccagcttgaatacgatggcttgcatctacttctatttctccgtcattttgtacgaatgacccaagatatttaaaccgtgtaacatgggatatgata 39906995  T
Q  409 tgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39906996 tgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 39907074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 49029332 - 49028854
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49029332 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 49029233  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||       
T  49029232 gtcttaccactcatccaacgtaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaaca 49029133  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccattt------------ 306  Q
     ||||  ||||||||||||||| ||| || |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                
T  49029132 ccggttggactgctgtccgatagaactttcctttc-----aagtggtattttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaaccaca 49029038  T
Q  307 --caaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggta 403  Q
      |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49029037 accaaccacccagcttgaatacgatggcatacatctgcttctatttctccatcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggta 49028938  T
Q  404 tgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49028937 tgatctgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttcccctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 49028854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 388
Target Start/End: Original strand, 35906427 - 35906796
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35906427 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtcta 35906526  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||  |    
T  35906527 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtatcatacaacaacg 35906626  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  35906627 ccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaagatcttctccatttcaaccacccagc 35906726  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 388  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  35906727 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 35906796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33073008 - 33072666
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33073008 atgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcctaatcctatcttgtctagt 33072909  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | |    
T  33072908 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctctgctacacttatttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacaacgcc 33072809  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33072808 ggtctaactgttgtccgatagaactttccttttaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccatccaactt 33072709  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttg 363  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  33072708 gaatacgatggcttacatctgcttctaattatccgtcattttg 33072666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34869476 - 34869170
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34869476 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 34869377  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  34869376 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctactacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 34869277  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  34869276 ccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacgcctgaggctcttctccaattcaaccacccagc 34869177  T
Q  319 ttgaata 325  Q
    |||||||    
T  34869176 ttgaata 34869170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 489
Target Start/End: Original strand, 36869576 - 36869984
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||| | || ||||||    
T  36869576 ctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtccagtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacacttacttgattcacgtgtt 36869675  T
Q  180 ggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca 279  Q
    | ||||||  ||| || || |||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  36869676 gactcttagtcgctcaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgca 36869775  T
Q  280 caaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaaga 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||    
T  36869776 caaaacccctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttttatttcttcgtcattttgtactatggatccaaga 36869875  T
Q  380 tatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccc 478  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||      
T  36869876 tatttaaaccgcgtaatttggggtatgatatgctctccaactttcacctccagggtaga--catactttcccttttcctgaagttacattccatatacta 36869973  T
Q  479 cgtcttgcttc 489  Q
     ||||||||||    
T  36869974 tgtcttgcttc 36869984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 201 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 37616790 - 37616503
Alignment:
Q  201 ccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttct 300  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37616790 ccgtaccatacaacaatgtcggtctgactgctggccgatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttct 37616691  T
Q  301 ccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-g 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  37616690 ccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaatcgtgtaacttgg 37616591  T
Q  400 ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37616590 ggtatgatatgatctccacctttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 37616503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7273095 - 7272780
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||  || ||    
T  7273095 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgatactcccgttctctccctaaaggtgtcattcctaatcctatcccgtgta 7272996  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  7272995 gtcttaccgctcatccagcacaacatcctcatctccggtacacttacttgattctcgtgttggctctcaaccgcccaacactctgtatcatacaacattg 7272896  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  7272895 tcggtttgactgctgaccgatacaactttcctctcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaatacctgaggct-ttctcaatctcaaccacccagc 7272797  T
Q  319 ttgaatacgataattta 335  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7272796 ttgaatacgatgattta 7272780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Original strand, 12841501 - 12841773
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  12841501 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccactctctctctaatggggtcattcctaatcctatcatgtcta 12841600  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |    
T  12841601 gttttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacaacg 12841700  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctga 291  Q
     ||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12841701 ccggtcagactgctgtacgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctga 12841773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 232 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 48919231 - 48918975
Alignment:
Q  232 tgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataa 331  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48919231 tgtccgatataaccttcctttcaacttaaggggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatga 48919132  T
Q  332 tttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctcca 430  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  48919131 ttcacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggatccaaaatatttaaaccgtgtaacttggggtgtaatatgatctcctacttttaccttca 48919032  T
Q  431 aggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    | |||||||   |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48919031 atgtagacc--tacttctccatttgctgaagtcacattccatatactccgtcttgcttc 48918975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 13859234 - 13859476
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13859234 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 13859333  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||  |||||| ||    
T  13859334 gtcttaccactcgtccaacgcaacatcctcatctc--tgctacttacttgattctcgtgttaactcttaaccgcccaacattccgtaccaaacaacactg 13859431  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtg 263  Q
     |||||| |||||||| | ||| ||| || |||||| ||||||||    
T  13859432 ccggtctaactgctgttcaatagaactttcctttcaacttaagtg 13859476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23404462 - 23404181
Alignment:
Q  33 tctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactc 130  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  23404462 tctaagcctattttctcccaacttttctactataagtgttacccccactctctccctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtatagtcttaccgctc 23404363  T
Q  131 atccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactg 230  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||  || |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  23404362 atccagcgcaacatcctcatttccaatacacttacttgattctcgtgctggcttttaaccgcccaaaacttcgtaccatacaatatcgtcggtctgactg 23404263  T
Q  231 ctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca 312  Q
     ||||||||| ||  || |||||| ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23404262 ttgtccgatagaattttcctttcaacttaagtggtcctttcttatctcagaaaacacctgaggctcttctccattttaacca 23404181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37618001 - 37617812
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactatttt-ctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37618001 atgcccaaaccatctaagcctatttttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcttgtct 37617902  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| | |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37617901 agtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttgcttgattctcatgttgactcttaaccgcccaagactccgtacc 37617812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Original strand, 45836710 - 45836871
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  45836710 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcttgtctactct 45836809  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctc 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  45836810 taccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctgcacttacttgactctcgtgttggctc 45836871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Original strand, 44855398 - 44855524
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44855398 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtactatccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 44855497  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||    
T  44855498 gtcttaccactcatccagcacaacatc 44855524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 7189452 - 7189777
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct----------aatggtgtcattcttaatcctat 110  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||          ||||||||||||| || ||||||    
T  7189452 atgcccaaaccacctaagcttattttctaccatcttttctactataggtgcgaccccaactctctctttctctctctaatggtgtcattcata-tcctat 7189550  T
Q  111 cttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacctta 210  Q
    || ||||| |||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||| | | | ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  7189551 ctcgtctaatcttaccggtcattcaacacaacatcctcatctccactatgcttacttgatttttgtgttggttcttaaccacccaacactctgtaccata 7189650  T
Q  211 caacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaac 310  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  ||||||  | |||||||  ||||||  |  |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7189651 caacatcgtcggtctgactactgtct-ataaaatttctctttcaatttaagtaatactttcttatcaaataaaacacctgagacttttctccatttcaac 7189749  T
Q  311 cacccagcttgaatacgataatttacat 338  Q
    ||| || | | ||||| || ||||||||    
T  7189750 cactcaacataaatacaatgatttacat 7189777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 312 - 485
Target Start/End: Original strand, 24177714 - 24177886
Alignment:
Q  312 acccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatg 410  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24177714 acccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactattgacccgtgatatttaaaccgtgtaaattggggtatgatatg 24177813  T
Q  411 atctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttg 485  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24177814 atctccaaccttcatctacaagctagacc--tacttcttcttttgctgaagttacattccatatactccatcttg 24177886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 36514433 - 36514598
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||| |||||  || ||||    
T  36514433 atgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctaatgttgtcctttctaattctatcccgtttagt 36514532  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctctt 186  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  36514533 cttaccacacatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttaatttattttcgtgttggttctt 36514598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Original strand, 35559223 - 35559353
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactat-aggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   |||  ||    
T  35559223 ccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataaggtgctacccccactctctctcaaatggtgtcattcctaatcctatcaaatctgatc 35559322  T
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacatcatcatct 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35559323 ttaccactcatccaacgcaacatcctcatct 35559353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Original strand, 25579306 - 25579612
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctac-ccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||     ||| |    
T  25579306 cccaaaccacctaagcctattttccaccattttttctgctatgggtgctactccccactctctctaatgtggtcatttctaatcctatct-----agtat 25579400  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||| | |||    
T  25579401 taccacacatccaacgcaacatcctcatctcctctacgcttattttattctcgtgttggttcttaaccgcccaacattccgttccatacaacatcgccgg 25579500  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtg---gttttttcttatcgcacaaaacacctgag--actcttctccatttcaaccacccag 317  Q
    ||| || ||||||||||| ||  || | |||| ||| || |    ||||||| |||| || |||| ||| |||   ||||||||||||| |||||||||     
T  25579501 tcttacagctgtccgatagaattttcccttcaacttgagcgtactttttttcgtatcacataaaatacccgaggctctcttctccattttaaccacccaa 25579600  T
Q  318 cttgaatacgat 329  Q
    ||||||||||||    
T  25579601 cttgaatacgat 25579612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47848730 - 47848506
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| | ||| |  | ||||||||  |||||    
T  47848730 atgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataggcgctaccccaactctctctctaatgttatcacttctgatcctatcccgtcta 47848631  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  || ||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| | || | || ||| |    
T  47848630 gtcttaccacacatccaacacaacatcctcatctcccctagacttattttattctcgtgttggttcttaaccacccaacactccattccattcatcatag 47848531  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaa 243  Q
    |||||||  | | ||||||||||||    
T  47848530 tcggtcttgcagttgtccgataaaa 47848506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36136820 - 36136695
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||    
T  36136820 atgcccaaacaacctaagactattttctaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctctaatggtgtcattcctaaacctatcccttcta 36136721  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  36136720 gtcttaccacccatccaacacaacat 36136695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 6374924 - 6374833
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctat 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6374924 atgctcaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctat 6374833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Original strand, 2885948 - 2886013
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2885948 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc 2886013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 428
Target Start/End: Original strand, 24550178 - 24550320
Alignment:
Q  282 aaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagata 381  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||| |||||||  ||||||    
T  24550178 aaacacgtgagaccctcctccatttcaaccacccaacttgaattcaacaatttacatctccttctattaatccgtcgttttgtaatatggactaaagata 24550277  T
Q  382 tttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    |||||| |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24550278 tttaaatcgtgtaact----tatgatatgatcttcaactttcacctc 24550320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 29650436 - 29650349
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  29650436 ccaaaccatctaagcctattttctaccaatttttctactataggtgctgcccccactctctctcgaatggtgtcattcctaatcctat 29650349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43491364 - 43491217
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||   ||||    
T  43491364 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaatttttatactataggtgttacccctactctctccccaatggtgtcattcctaatcatatcccatcta 43491265  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttact 166  Q
     ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||| | || |||||||    
T  43491264 atcttaccgctcatccagcacaacatcctcatctcggctacacttact 43491217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 99
Target Start/End: Original strand, 46014413 - 46014486
Alignment:
Q  28 aaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcatt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46014413 aaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgcaacccccactctctctctaatggtgtcatt 46014486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Original strand, 8492464 - 8492580
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  8492464 caaaccaccttagcctattttctaccatcatttttactataggtgttaccccaaatctctccctaatggtgtcattcgtaatcctatcccgtctagtctt 8492563  T
Q  124 accactcatccaacgca 140  Q
     ||||||||||||||||    
T  8492564 gccactcatccaacgca 8492580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43282464 - 43282299
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct-----aatggtgtcattcttaatcctatcttgt 115  Q
    ||||||||  || ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||| |||||||  ||||| |||| |||    
T  43282464 atgcccaattcacctaagcctagtttccaccgacttttctactataggtgctaccccaactctctctctctaaatgttgtcatttctaatcatatcatgt 43282365  T
Q  116 ctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttgg 181  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| | |||| |||| ||| |||||||    
T  43282364 ctagacttaccacacatctaacgcaacatcctcatatccgttgtgcttaatttattcttgtgttgg 43282299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5335976 - 5335844
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||   ||  ||||||||    
T  5335976 atgcccaaaccacctaagtctagtttcgaccatctttcctactatagatgctaccccaactctctctaatgttatcatttctaattgcattctgtctagt 5335877  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  5335876 cttaccacacattcaacgcaacatcctcatctc 5335844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 42187526 - 42187365
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctc--tctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||  ||||  ||||  |||||    
T  42187526 atgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctattataggtgctaccccgactctctttctaatgctgccatttctaat-atatcccgtcta 42187428  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttgg 181  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||| || ||| |||||||    
T  42187427 gtcttactacacatccaacacaacatcctcatctccgctacgcttactctattcttgtgttgg 42187365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 427
Target Start/End: Original strand, 21517826 - 21517959
Alignment:
Q  294 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 393  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |  ||||||| | ||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  21517826 ctcttctcgatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatatgttattatttcttcgtca-tttgtactatgaatccaagatatttaaactgtgt 21517924  T
Q  394 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacct 427  Q
    || ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  21517925 aaattgaggtatcatgtggtctccaactttcacct 21517959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 19262659 - 19262792
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||| ||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||  ||||| ||||||||    
T  19262659 atgctcaaaccacctaagccaagtttctaccatcttttctacaataggtgctaccccaactctctctaatattgtcatttctaactctatcatgtctagt 19262758  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
     |||||||  |||  ||| |||||| ||||||||    
T  19262759 attaccacatatcacacgtaacatcctcatctcc 19262792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22349676 - 22349623
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctac 74  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349676 atgccaaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctac 22349623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 36869474 - 36869527
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccc 78  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869474 ccaaaccatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccc 36869527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Original strand, 31682831 - 31682883
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccc 76  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31682831 cccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatatgtgctaccc 31682883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Original strand, 43793592 - 43793676
Alignment:
Q  345 ctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43793592 ctatttcttcgtcattttgtactatagacccaagatatttaaaatgtgtaactagtggtatgatatgatctctaactttcacctc 43793676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Original strand, 48736130 - 48736256
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||  ||||  |||||  |||||||||    
T  48736130 caaaccacctaagtctagtttctcccatcttttctactgtaggtgctaccccaactctctctataatgtcgtcatttctaattttatctcatctagtctt 48736229  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  48736230 accacacattcaacgcaacatcctcat 48736256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 24598409 - 24598498
Alignment:
Q  62 ctataggtgctacccccactctctct------aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  24598409 ctataggtgatacccccactctctctttctataatggtgtcattcctaatcctatcatgtctaaacttaccactcatccaacacaacatc 24598498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Original strand, 25731640 - 25731709
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25731640 ctctctctaaaggtgtcattcttaatcctttctcgtctagtcttaccattcatccaa-acaacatcatcat 25731709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 27021918 - 27021984
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27021918 atgcccaaaccacctaagcctagttttcaccaacttttctactataggtgctaccccaactctctct 27021984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Original strand, 27021993 - 27022057
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  27021993 ctctctctaatgttgtcatttttaatcctatcctgtctagtcttatcacacatccaatgcaacat 27022057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39811952 - 39811877
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  39811952 ctctctctaatgttgtcatttctaatcctatcacgtctagtcttaccacacatccaaagcaacatcctcatatccg 39811877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 28628159 - 28628355
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc--tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||| ||| |||  |||||| |||  || |     
T  28628159 atgcccaaaccacctaagccaattttccaccatcatttctactctaggtgctactccaactccctctctaatgttgtaatttctaatcccatcccgtatg 28628258  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   || | ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||  || || ||||||||||    
T  28628259 gtcttaccatacatccaaggcaacataatc---tctgctacgcttactttattctcgtgttggttctcaaccgcccaacactttgttccatacaacattg 28628355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 45558413 - 45558351
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta 88  Q
    ||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45558413 caaaccacctaagtcgagtttctaccaacttttctactataggtggtaccccaactctctcta 45558351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 30200189 - 30200319
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||| |||||||  ||||| ||||   |||| |    
T  30200189 atgccaaaatcacctaagcctagtttccaccatcttttctactataggtgttaccctaa--ctctctaatgttgtcatttctaatcatatcccatctaat 30200286  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30200287 cttaccacacatccaacacaacatcctcatctc 30200319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Original strand, 40008698 - 40008779
Alignment:
Q  74 cccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  |||| || | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  40008698 ccccaactctctctaatgttgtcatttctaattcttttttgtctagttttaccacacatcctacgcaacatcttcatctccg 40008779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 40169705 - 40169640
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc 86  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  40169705 atgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataagtgctaccccaattctctc 40169640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1523811 - 1523747
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  1523811 ctctctctaatggtgtcattaataatcctatcacgtctagtcttgtcactcatgcaacgcaacat 1523747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14593821 - 14593683
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc------cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttg 114  Q
    ||||||||| || ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||      | |||||||||||| |||||||  |||| |  |   |    
T  14593821 atgcccaaatcacctaagtctagtttctaccattttttctactataggtgtcaccccagctcactctctctctaatgttgtcatttctaattcggttccg 14593722  T
Q  115 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14593721 tctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatctc 14593683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18637371 - 18637233
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  |||||    
T  18637371 aaaacacatgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagat 18637275  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18637274 atttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18637233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18650806 - 18650668
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  |||||    
T  18650806 aaaacacatgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagat 18650710  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18650709 atttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 385
Target Start/End: Original strand, 23087603 - 23087694
Alignment:
Q  294 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatattta 385  Q
    ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| || ||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  23087603 ctcttttccatttcaaccatctaacttgaatacaatgatttacatacacttttatttctccttcattttgtactatgaacccaagagattta 23087694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 21517656 - 21517726
Alignment:
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcc 193  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21517656 taccacacatctaatgcaacatcatcatatccattatgcttattttattctcgtgttggttcttaaccgcc 21517726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15682229 - 15682184
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactatag 67  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15682229 tgcctaaaccatctaagcctatttcctaccaacttttctactatag 15682184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 421
Target Start/End: Original strand, 18608199 - 18608319
Alignment:
Q  299 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 398  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  ||||||||||||  |||||||||    
T  18608199 ctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaaaatgtgtaactt 18608295  T
Q  399 g-ggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  18608296 gtgatatgatatgatctccaactt 18608319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Original strand, 27893779 - 27893864
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatc 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||    
T  27893779 caaaccacctaagcctattttccaccatctattctactataggtgttacctcaactctctctaatattgtcgtttctaatcctatc 27893864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 38920850 - 38920789
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc 82  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38920850 atgcccaaaccacttaagcctagtttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactc 38920789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5843177 - 5843105
Alignment:
Q  342 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatc 413  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5843177 cttcgatttcttcatcgttttgtattataaacctaaaatatttaaatcgtgtaacttgtggtatgatatgatc 5843105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15681272 - 15681216
Alignment:
Q  160 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  15681272 acttacttgagtctcgtgttggctcttaaccgcccaacactctataccatacaacat 15681216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18626639 - 18626559
Alignment:
Q  342 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||  ||  ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18626639 cttctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18626559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 36101994 - 36102125
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||| |||||||  |||||  |||   |||||||    
T  36101994 cccaaaccacctaagcctattttccaacatcttttctattataggtgctaccttcactcttcctcaaatgttgtcatttctaatctcatcccatctagtc 36102093  T
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||  |||||||    
T  36102094 ttaccacacatcgaactcaacattttcatctc 36102125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16013245 - 16013206
Alignment:
Q  114 gtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16013245 gtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatctc 16013206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28021020 - 28020894
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc--tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||| | |||||   |||| |||| |||| |    
T  28021020 atgcccaaaccacctaagccaagtttccaccatcttttctacgataagtgctaccccaactctttctctaatgttatcatttcgaatcatatcatgtcca 28020921  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  28020920 gtcttatcacacatctaatgcaacatc 28020894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33139077 - 33139006
Alignment:
Q  269 ttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 340  Q
    |||||| ||||||| |||| | |  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  33139077 ttcttagcgcacaatacacattaagctcttctccatttcaatcacccaacatgaatacgatgatttacatct 33139006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Original strand, 47796362 - 47796429
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta 88  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||| || ||| || ||||||||||    
T  47796362 atgcccaaaccacctacgcctattttcaaccaccttttctactatagttggtactccaactctctcta 47796429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 26742127 - 26742177
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccc 76  Q
    ||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26742127 caaaccacctaatcctattttccaccatcttttctactataggtgctaccc 26742177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Original strand, 40139179 - 40139268
Alignment:
Q  55 ttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  40139179 ttttctactataggtgaaacccg-actctctctaatgttgtcttttctaatcttatcccgtctagtcttaccacacatcccacacaacatc 40139268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 164
Target Start/End: Original strand, 28542206 - 28542254
Alignment:
Q  116 ctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatactta 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  28542206 ctagtcttaccacacatccaacgcaacaccctcatctccgctacactta 28542254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 143
Target Start/End: Original strand, 29653844 - 29653904
Alignment:
Q  83 tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaaca 143  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29653844 tctctaatgatgtcatttctaattctatcccgtctagtgttaccacacatccaacgcaaca 29653904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 99)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 27 - 489
Target Start/End: Original strand, 27450411 - 27450868
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttacc 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||    
T  27450411 aaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattatt----ctatcatgtctagtcttacc 27450506  T
Q  127 actcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctg 226  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27450507 actcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaactgcccaacactccgtaccatacaacattgtcggtctg 27450606  T
Q  227 actgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatac 326  Q
    |||| |||| |||| ||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450607 actgttgtctgatagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatac 27450706  T
Q  327 gataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcac 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27450707 gatgatttacatctgcttctatttctccatcattttgcactatggacccaagatatgtaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcac 27450806  T
Q  426 ctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27450807 ctccaaggtatacc--cacttctccttttgctgaagttacattccaaatactccgtcttgcttc 27450868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 436285 - 435816
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  436285 atgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcatgtcta 436186  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  436185 gtcttacgactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 436086  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  436085 ccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccactcagc 435986  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  435985 ttgaatacgatgacttacatctgcttctatttctccgtcattttatacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 435886  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  435885 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcgtgcttc 435816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 31960040 - 31960509
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31960040 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtcta 31960139  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  31960140 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 31960239  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31960240 ccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatatgaggctcttctccatttcaaccacccagc 31960339  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31960340 ttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaaattggggtatgatatgatctcca 31960439  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31960440 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttc 31960509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 23906521 - 23906996
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--------ctctaatggtgtcattcttaatcctatct 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23906521 atgctcaaaccatctaagcctattttctacaaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctctctaatggtgtcattcctaatcctatct 23906620  T
Q  113 tgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttaca 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  23906621 tgtctagtcttgccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccataca 23906720  T
Q  213 acattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca 312  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23906721 acaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaacca 23906820  T
Q  313 cccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatga 411  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23906821 cccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatga 23906920  T
Q  412 tctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23906921 tctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 23906996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33227265 - 33226809
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33227265 atgcccaaacaatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcatgtcta 33227166  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||| | | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  33227165 gtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttacatgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 33227066  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227065 ccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgtacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 33226966  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33226965 ttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 33226866  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatac 476  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  33226865 actttcacctccaaggtagacc--tacttgtccttccgctgaagttacattccatatac 33226809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 48174319 - 48174788
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  48174319 atgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgttacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcatatcatgtcta 48174418  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| | | || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  48174419 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctttgctatacttacttgattttcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacg 48174518  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  48174519 ccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacctagc 48174618  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48174619 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcactttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 48174718  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48174719 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 48174788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 489
Target Start/End: Original strand, 1777240 - 1777710
Alignment:
Q  18 tagatgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1777240 tagatgtccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttttactataggtgctatttccactctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtct 1777339  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| | | || ||||| |||||||||   || ||||||||| | |||||||      
T  1777340 agtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctttgctatacttacttgattttcatgttgactcttaacctttcaacactccgtatcatacaacaac 1777439  T
Q  218 gtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1777440 gtcggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccag 1777539  T
Q  318 cttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcc 416  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1777540 cttgaatacgatgacttacatttgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaacgtgtaacttggggtatgatatgatttcc 1777639  T
Q  417 aactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1777640 aactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtattgcttc 1777710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 56375346 - 56374877
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  56375346 atgcccaaaccatctaagcctgttttctaccaacttttctattataggtgctacccctactctctctctaatggtgtcattcctaatcttatcttgtcta 56375247  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||  || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |    
T  56375246 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttgtttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaataacg 56375147  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
      |||||||||||||||||||| | | || ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  56375146 ctggtctgactgctgtccgatagatctttcctttcaaattaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctcaatttcaaccacccagc 56375047  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  56375046 ttgaatacgatggcttatatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgctctcca 56374947  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56374946 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 56374877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 53707850 - 53707381
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  53707850 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccactctctttctaatggtgtcattcctagtcctatcatgtcta 53707751  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||| ||  |    
T  53707750 gtcttactactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctctaccatacatcaacg 53707651  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||| || ||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53707650 ccggtcggaatgctggccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatctgagtctcttctccatttcaaccacccagc 53707551  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  53707550 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttagaccgtgtaacttggggtatgatatgatcttca 53707451  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  53707450 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccactgaagttacattcgatatactccgtcttgcttc 53707381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 48622769 - 48623222
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48622769 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatgggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagt 48622868  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||| |||||              ||| ||||| |  | |    
T  48622869 cttaccactcatccaaagcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcctaacc--------------accatacaataacgcc 48622954  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  48622955 ggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggcttttctccatttcaaccacccagctt 48623054  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaac 419  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  48623055 gaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaatcgtgtaatttggggtatgatatgctctccaac 48623154  T
Q  420 tttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48623155 tttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 48623222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 50287018 - 50286625
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50287018 atgcccaaaccatccaagtctattttctaccaacttttctactataggt-------cccctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagt 50286926  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||    
T  50286925 cttaccactcatccaacgcaacttcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtatcatacaacaacgtc 50286826  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    | |||||| | ||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50286825 gatctgacggttgtccgatagaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacatgtgactcttcttcatttcaaccacccagctt 50286726  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaac 419  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50286725 gaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacacaatatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaac 50286626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43433980 - 43433643
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--------aatggtgtcattcttaatcctatct 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||||    
T  43433980 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctctctaatggtgtcattcctaatcctatct 43433881  T
Q  113 tgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttaca 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43433880 tgtctagtcttgccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccataca 43433781  T
Q  213 acattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca 312  Q
    |||  | |||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  43433780 acaacgccggtctgattgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtgacactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaatca 43433681  T
Q  313 cccagcttgaatacgataatttacatctgcttctattt 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43433680 cccagcttgaatacgatggtttacatctgcttctattt 43433643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 476
Target Start/End: Original strand, 47265428 - 47265886
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta--atggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  47265428 atgcccaaatcatctaaacctattttctactaccttttctactataggtgttacccccactctctctataatggtgtcattcataatcttatcatgtcta 47265527  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || || ||||| | |||||||||| |||||||||| |||  |||  ||||| |||||||| |    
T  47265528 gtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctttgctacacctacttgattctcgtgttgactcttaaccgtccaatactttgtaccatacaacatcg 47265627  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttt---ttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccc 315  Q
      |||||||||| |||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||||  |   ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  47265628 ctggtctgactgttgtcagatagaactttcatttcaacttaagtggtactactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttcttcatttcaatcaccc 47265727  T
Q  316 agcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatct 414  Q
    |||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  47265728 agcttgaa-acgatggcttacatttgcttctatttctccgtcattttatactatggatccaagatatttaaactatgtaacttggggtatgatatgacct 47265826  T
Q  415 ccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatac 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47265827 ccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttacatttcatatac 47265886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16002976 - 16002532
Alignment:
Q  28 aaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta--atggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttac 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | || ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16002976 aaccatctaagactattttctatcaacttttataccataggtgccatcctcactcactctataatggtgtcattcctaatcctatttcgtctagtcttac 16002877  T
Q  126 cactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtct 225  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |  || |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | | ||||||| |  |||||    
T  16002876 cactcatccagcacaacatcatcgtcttcactacacttacttgattctcgtgttgactcttaacctcccaacacttcgttcat-acaacatcgctggtct 16002778  T
Q  226 gactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaata 325  Q
     |||| |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16002777 aactgatgtctgataaaacttttctttgaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacctgaggctcttctcaatttcaaccactcagcttaaata 16002678  T
Q  326 cgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttca 424  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |    
T  16002677 cgatgatttacatctgcttctatgtctccgtcattttgtactatggaaccaagat-tttaaaccgtgtaatttggggtatgatatgatttccaactttta 16002579  T
Q  425 cctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccata 473  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16002578 cctccaaggtaga--ctaacttctccttttgctaaagttatattccata 16002532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Original strand, 46583050 - 46583396
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  46583050 atgcccaacccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctatccccactctctctcgaatggtgtcattcctaatcctatgctgtcta 46583149  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||||  || || |||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  46583150 gtcttaccacttctctaatgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacagcg 46583249  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     || |||||||||||||| ||| ||| || ||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46583250 ccgatctgactgctgtccaatagaactttcctttcaaattaagtgatactttcttatcgcacaaaatacctgaggctcttctccatttcaaccacccagc 46583349  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgta 365  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46583350 ttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgta 46583396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 119 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 39708414 - 39708044
Alignment:
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |  || |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39708414 gtcttactgctcatccaacgcaacatcctcatctgcactacacttacttgattctcgtgttgcctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattg 39708315  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaa-cacctgagactcttctccatttcaaccacccag 317  Q
    ||| || ||||| || |||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| || |||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  39708314 tcgatcggactgttgcccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacaaaaaaccacctaaggctcttatccatttcaaccatccag 39708215  T
Q  318 cttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctcc 416  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  39708214 cttgaatacgaggatttacacctgcttctatttctccgtcattttgtactatcgacccaagatatttaaaccgcataacttgaggtataatatgatctcc 39708115  T
Q  417 aactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    || ||||||||||||| ||||||   | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39708114 aaatttcacctccaagatagacc--taattctccttttgctgaagttatattccatatactccgtcttgcttc 39708044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 419
Target Start/End: Original strand, 1211638 - 1212017
Alignment:
Q  41 tattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgca 140  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||    
T  1211638 tatttcctaccaacttgtttactataggtgctgctcccactctctcgaatggtgtcattcctaatcatatcatgtctagttttaccactcatccagtgca 1211737  T
Q  141 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 240  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  1211738 acatcctcatatccgctacacttacttgattctcgtgttggctcttaaccgtccaacactctgtaccacacaacatcaccggtctgactgttgtccgata 1211837  T
Q  241 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 340  Q
     ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||    
T  1211838 gaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcatacaaaacatttgaggctcttctccatttcaactacctaacttgaatacgatgatttacacct 1211937  T
Q  341 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac-ttgggtatgatatgatctccaac 419  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1211938 gcttctatttctctgttattttgtactatggacacaagatatttaaactatgtaacgtaaggtatgatatgatctccaac 1212017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4440912 - 4440682
Alignment:
Q  18 tagatgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4440912 tagatgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctgcccccactctctctaatggtgccattcctaatcctatcatgtct 4440813  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacatt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||      
T  4440812 agtcttaccactcatcgaacgcaacatcctaatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccg-ccaacaccccgtatcatacaacaac 4440714  T
Q  218 gtcggtctgactgctgtccgataaaacctttc 249  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4440713 gttggtctgactgctgtccgatagaacttttc 4440682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 362
Target Start/End: Original strand, 41009575 - 41009922
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttct-accaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||  |||||||| | |||||    
T  41009575 atgcacaaaccatctaagtctatttttttaccaacttttctactataggtgctacccccattatctccctaatgatgtcatttctaatcctaccatgtct 41009674  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacatt 217  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||     
T  41009675 agtcttaccgatcatccaacgcaacatcctcatttccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaatcgcccaacactccgtactatacaacatc 41009774  T
Q  218 gtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgag---actcttctccatttcaaccacc 314  Q
    |  ||||||| || ||||| ||| ||| ||| |  || |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||   | ||||||||||||||||||||    
T  41009775 gctggtctgattgttgtccaatagaacttttttcccaacttaagtggtattttcttatcatacaaatcacctcagattaatcttctccatttcaaccacc 41009874  T
Q  315 cagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 362  Q
     | |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41009875 taacttgaatacgaagatttacatttgcttctatttctccgtcatttt 41009922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 52569741 - 52569987
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52569741 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtcta 52569840  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||       
T  52569841 gtcttacccctcatccaacacaacatcctgatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgaacaacactccgtaccatacaacaaca 52569940  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggt 265  Q
     ||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||    
T  52569941 ccggtctgactgttgtccaatagaactttcctttcaacttaagtggt 52569987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12494794 - 12494618
Alignment:
Q  33 tctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactc 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12494794 tctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactc 12494695  T
Q  131 atccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12494694 atccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtacc 12494618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 33191074 - 33191261
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  33191074 atgcccaaacaatctaagtctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctatcta 33191173  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtac 206  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  33191174 atcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaatcgcccaacactccgtac 33191261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 207
Target Start/End: Original strand, 39100766 - 39100947
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  39100766 caaaccatctaagcctattttctatcaacttttcttctataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatttctagtcttac 39100865  T
Q  126 cactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc 207  Q
    |||||||    ||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  39100866 cactcatttggcgcaacatcctcatctccgctacacttacatgactctcgtgttggctcttaactgtccaacactctgtacc 39100947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31459086 - 31458875
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccac----tctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  31459086 atgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgctacctcgactctgtctctctaatggtatcattcctaatcctatcatgtc 31458987  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | || |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  31458986 tagtcttaccactcaaccaacgcaacatcctcatctgtgctacacttactttattttcgtgttggttcttaactgcccaacactccgtaccataaaacat 31458887  T
Q  217 tgtcggtctgac 228  Q
     | |||||||||    
T  31458886 cgccggtctgac 31458875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35690326 - 35690042
Alignment:
Q  55 ttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatct 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35690326 ttttctactataggtgctaccccaactctctctttaaaggtgtcattcctaatcctatctcgtctagtcttactactcatccaacgcaacatcctcatct 35690227  T
Q  153 ccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttcttt 252  Q
    | | || |||||||| | |||| |||||| |||||||| | || || ||| || | |||||||| |||||||| |||| |||| |||| ||  || || |    
T  35690226 cggctacacttacttgattctcatgttggttcttaaccacacaacattccatatcatacaacatcgtcggtctaactgttgtctgatagaattttcctct 35690127  T
Q  253 cagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacat 338  Q
    || |||||  ||   ||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35690126 caacttaaacggcactttcttatcacataaaacacccg-cactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatgatttacat 35690042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28236239 - 28236080
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |    
T  28236239 atgcccaaaccatctaagcctattttccaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatatctaat 28236140  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttg 180  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | || |||||||| | |||| |||||    
T  28236139 cttaccattcatccaatgcagcatcataatctctgctacacttacttgattctcatgttg 28236080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Original strand, 45205092 - 45205280
Alignment:
Q  40 ctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca-ctctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaa 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45205092 ctattttctaccatcttttctactataggcactacccccaactctctcgttaatggtgtcattcctaatcctatcccgtctagtcttaccactcatccaa 45205191  T
Q  137 cgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtct 225  Q
    | ||||||| ||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  45205192 cacaacatcctcatctccgctacgcttacttgattctcgtgttggttcttaactgcccaacactccgtaccatacaacatcgccggtct 45205280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1793512 - 1793316
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||||    
T  1793512 ccaaaccatctaagcttattttctaccaacttttttactataggtgctacccccgctctctccctaatggtgtcattcctaatcttatcccgttaagtct 1793413  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgt 219  Q
    ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||    
T  1793412 taccgttcatccaacacaacatcctcatctccgctacacttacttgattctagtgttggctcttaaccgccaaacactctgtatcatacaacattgt 1793316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 37773677 - 37773810
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc-cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  37773677 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccgacttttctactataggtgctaccccttactctctctaatggtatcattcataattctatcatgtctag 37773776  T
Q  120 tcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  37773777 tcttaccactcatccagcgcaacattctcatctc 37773810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27983230 - 27983083
Alignment:
Q  47 ctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||| ||    
T  27983230 ctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtatagtcttaccactcatctagcacaatat 27983131  T
Q  145 catcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgc 192  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27983130 cctcatctccgctacacttactttactctcatgttgactcttaaccgc 27983083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37797904 - 37797783
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  37797904 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacctccactctctctctaatggtgtcatttctaatcttatcatgtctagtct 37797805  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacat 144  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  37797804 tatcactcatccaacgcaacat 37797783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 428
Target Start/End: Original strand, 10775654 - 10776055
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| ||| |     
T  10775654 aaaccacctatgtctagtttctaccatcttttctactataggtgttaccccaacactctctctaatgttgtcatttctaattctttcctgtctggtcctg 10775753  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| |||| | | |  || | |||| |||||||| |||||  | || ||||||||  | ||||    
T  10775754 ccacgcatccaacacaacatcatcatctctgctacgcttaatttatttttgcattagttctttaccgcccaacactctttcccatacaacatcattggtc 10775853  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 324  Q
    | || | ||||| ||||||  || | |||| ||| || |||  ||||  ||| || ||||||  | || | || ||||||||||||||||||  ||||||    
T  10775854 ttaccgttgtccaataaaattttcccttcaacttgaggggtgctttcgcatcacataaaacaagtaaggcactcctccatttcaaccacccattttgaat 10775953  T
Q  325 acgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttc 423  Q
     | ||  |||||||||   |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10775954 tctatggtttacatct---taaacttctccatcattttgtattatagacccaagatatttaaaccatgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttc 10776050  T
Q  424 acctc 428  Q
     ||||    
T  10776051 ccctc 10776055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 51421786 - 51421666
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51421786 atgcccaaaccacctaagcctattttctatcatctaatctactatatgtgctaccccaacactctctaatggtgtcattcataatcctatctcgtctagt 51421687  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaa 141  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  51421686 cttactactcatccaacgcaa 51421666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 437
Target Start/End: Original strand, 17666526 - 17666680
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||| | || |||||||||    
T  17666526 aaaacacatgatgctcttctccatttcaacaatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttcttcgacattttgtactttgaacccaagat 17666625  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  17666626 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctctaacgttcacctctaagataga 17666680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 55579088 - 55578722
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta----atggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  || ||||||||||    || ||||||||| ||||| ||||| ||     
T  55579088 atgcccgaaccacctaagcatattttctaccattttttc-actataggtgttattccaactctctctataaaatagtgtcattcataatcttatctcgtt 55578990  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    |  |||||||||| || |||| ||||||| |||| |  | || ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  55578989 tcctcttaccacttattcaacacaacatcctcatatatgctacacttaattgattctcgtgttggttcttaaccgcccaacacttcataccatacaacat 55578890  T
Q  217 tgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 316  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||  || ||| || |||||| |      | ||||| || |||||| ||||   |||||||||||| ||||||| |    
T  55578889 tgttggtctgactgttgtccgatagaattttccttccaacttaagcg---acatgttatcacataaaacatctgaagatcttctccattttaaccaccta 55578793  T
Q  317 gcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaa 387  Q
     ||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||||||||||||||    
T  55578792 acttaaatacgatgatttatgtatgcttctatttctcagtcattttatactatagatccaagatatttaaa 55578722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 425
Target Start/End: Original strand, 54787741 - 54787878
Alignment:
Q  289 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  54787741 tgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaagatatttaaac 54787840  T
Q  389 cgtgtaa-cttgggtatgatatgatctccaactttcac 425  Q
    ||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  54787841 cgtgtaatctggggtttgatacgttcttcaactttcac 54787878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 427
Target Start/End: Original strand, 7092446 - 7092847
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  || |||||  |||||||  ||||||||| |||| ||||   ||||    
T  7092446 atgcccaaaccacttaaacctattttctatcatattttctactataggtgctattccaactctgtctctaatcatgtcattct-aatcatatcccttcta 7092544  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||   ||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| |    
T  7092545 gacttaccactcatccagcacaacatcctcatctctgctacacttacttgcttctcgtgttggttcttaactgcctaaaactccgtaccatacaacatcg 7092644  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     || ||| |||||||||  ||| ||  || ||||||       ||||  |||||||| | | |||||   |||| |  |  ||||||||||||||||| |    
T  7092645 ccgatctaactgctgtctaatagaattttcctttca-------tggtactttcttattgtataaaacttatgaggcattcttccatttcaaccacccaac 7092737  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||  || || ||||||||| ||||||| | | | ||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||    
T  7092738 ttgaataatatgatgtacatctgcatctatttattcgttattttatactatagacccacaatatttaaaccgtgtaatttaagatatgatatgatcttca 7092837  T
Q  418 actttcacct 427  Q
    ||||||||||    
T  7092838 actttcacct 7092847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Original strand, 20591526 - 20591657
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||   |||||    
T  20591526 atgcccaaaccatctaatcttattttctaccaacttttctactataagtgctacccccactctctccctaatggtgtcattctcaatctaattccgtcta 20591625  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||||| ||||    
T  20591626 gtcttactattcatccagcacaacatcctcat 20591657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1629208 - 1629084
Alignment:
Q  298 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaact 397  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||  |||||||    
T  1629208 tctccatttcaaccactcaagttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccatcgttttatactatgaattcaagatatttaaactatgtaact 1629109  T
Q  398 tg-ggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    || || | ||||||||||| |||||    
T  1629108 tgtggcacgatatgatctcaaactt 1629084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Original strand, 20601872 - 20602019
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |     
T  20601872 atgcacaaaccatctaatcctattttctaccaacttttctactataagtgttatctccactctctccctagtggtgtcattctcaattctatcatgtatt 20601971  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttact 166  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||    
T  20601972 gtcttagcgctcatccagcgcaacatcctcatatccgctacacttact 20602019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 386
Target Start/End: Original strand, 54914618 - 54914781
Alignment:
Q  222 gtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttg 321  Q
    |||||||| ||| |||||| ||  || |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||  || || |||||||||||||||||     |||    
T  54914618 gtctgactcctgaccgatagaattttcctttcaacttaagtggtattttcttatcacataaaacaccaaag-cttttctccatttcaaccacatgatttg 54914716  T
Q  322 aatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaa 386  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  54914717 aatacaaggatttacatctgtttctatttctccatcattttataccatggacccaagatatttaa 54914781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Original strand, 26037736 - 26037797
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26037736 caaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctct 26037797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Original strand, 51252687 - 51252791
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  51252687 atgcccataccacctaagcctagtttccaccatcttttctactagaggtgctaccccaactctctctaatgtagtcatttctaatcctatctcgtctagt 51252786  T
Q  121 cttac 125  Q
    |||||    
T  51252787 cttac 51252791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 56225117 - 56224987
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct---agtct 122  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||    ||||    
T  56225117 caaaccacctaagcctattttctaccatcttttatactataggtattatcccaactttctcttatggtgtcattcctaatcatatcatgtcttagtgtct 56225018  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  56225017 taccactcatccaccacaacatcatcatctc 56224987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11389681 - 11389552
Alignment:
Q  114 gtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaa 213  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| | | || |||||    
T  11389681 gtctagttttaccacacatccaatccaacatcctcatctctgctacgcttactttattctcgagttggttcttaaccgcccaacactactttccatacaa 11389582  T
Q  214 cattgtcggtctgactgctgtccgataaaa 243  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  11389581 cattgtcggtcttacaactgtccgataaaa 11389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 428
Target Start/End: Original strand, 39754782 - 39755007
Alignment:
Q  204 taccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctcca 303  Q
    |||| |||||||| |||||||  || | |||| |||||||   ||| |||| |||||||||| |||||  ||| || ||||||| |||| | ||  | ||    
T  39754782 taccgtacaacatcgtcggtcataccgttgtctgataaaataattccttcaacttaagtggtattttcgcatcacataaaacacttgaggcactggttca 39754881  T
Q  304 tttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggt 402  Q
    ||||||||||  | |||| || | || |||||||||| |||||||||||   || ||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| ||||| |||    
T  39754882 tttcaaccactaaacttggattcaatgatttacatctccttctatttctttgtcgttttgtactatagacccatgatatttaaagtgtgtgacttgtggt 39754981  T
Q  403 atgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  39754982 atgatatgatcttcaactttcacctc 39755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33709980 - 33709841
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatctt----- 113  Q
    ||||| |||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| || ||||  |||||||||| |         
T  33709980 atgcctaaaccacctaaacctagtttccaccatcttttctactataggtgttaccccaactctctctctaatgttgccatttctaatcctatcctatcat 33709881  T
Q  114 gtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33709880 gtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcatcatctc 33709841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 435
Target Start/End: Original strand, 17667817 - 17667969
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||   |||||||||| |||| |||||| ||    
T  17667817 aaaacacctgaagtttttctctatttataccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcgtttatttctaagtcattttgtactatgaacccaatat 17667916  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggta 435  Q
    ||||||||  | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17667917 atttaaactatataactt--gtatgatatgatatccaactttcacctctaaggta 17667969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30807331 - 30807244
Alignment:
Q  342 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30807331 cttctatttctcagtcattttgtactatagactccaaacatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctc 30807244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 49987480 - 49987350
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  49987480 ccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataggtgtgacccagactctctatctaatgttgtcatttctaatcctatcatgtctagtct 49987381  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||| |  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  49987380 tactaaacattcaacacaacatcctcatctc 49987350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54470263 - 54470129
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||   |||| ||||   ||||    
T  54470263 atgcccaaaccacttaagtctagtttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctctaatgttgttatttcaaatcatatcccatcta 54470164  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  54470163 gtcttaccacacatccaatgcaacatcctcatctc 54470129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 155
Target Start/End: Original strand, 20105761 - 20105833
Alignment:
Q  83 tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20105761 tctctaatgttgtcatttctaatcatatctcgtctagtcttaccacacatccatcgcaacatcatcatctccg 20105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20192089 - 20192025
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct 85  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20192089 atgcccaaactatctaagcttattttctatcaacttttctactataagtgctacccccactctct 20192025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50662437 - 50662309
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttacc 126  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||  | ||||||||||    
T  50662437 aaaccacctaagcctactttccaccatcttttctactataggtgttgcccaaactctctctaatgctgtcatttccaatcctatctcatatagtcttacc 50662338  T
Q  127 actcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    || ||||| || ||||||| || ||||||    
T  50662337 acacatcctacacaacatcctcgtctccg 50662309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 402
Target Start/End: Original strand, 52280695 - 52280807
Alignment:
Q  290 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaacc 389  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| | |||||||| | | ||||||| ||||||||| |    
T  52280695 gagacccttctccatttcaaccacacaacgtgaatacgattatttacacttgcttcagtttctcctttattttgtactttagacccaaaatatttaaatc 52280794  T
Q  390 gtgtaacttgggt 402  Q
    ||||||| |||||    
T  52280795 gtgtaacctgggt 52280807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17900535 - 17900405
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc--tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    |||||||||||  | || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||  ||||  ||||   |||||    
T  17900535 tgcccaaaccacatgagtctagtttctaccgtcttttctactataggtgctaccccaactccgtctctaatgtcgtcatttctaattttatcccatctag 17900436  T
Q  120 tcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17900435 tcttaccacacatccaacgcaacatcctcat 17900405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 25257807 - 25257929
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||| ||||||| ||||| |||  |||||||| ||||| || | |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  25257807 atgctcaaaccacctaagtctagcttctaccatcttttatattgtaggtgttacctcaactctctctaatgttgtcatttctaattctatcatgtctagt 25257906  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaaca 143  Q
    ||||| || |||||||| |||||    
T  25257907 cttactacacatccaacacaaca 25257929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 35555873 - 35555939
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35555873 atgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgctacccgaactctctct 35555939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 39708489 - 39708412
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtc 96  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  39708489 atgctcaaaccatctaagcctattttctaccaacttttatactacaggagctaccctcactctctccctaatggtgtc 39708412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42037604 - 42037510
Alignment:
Q  332 tttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcac 425  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||    
T  42037604 tttacatctccttatatttctcagtcattttgtactatagattcaagatatttaaaccgtgtaacttgtgggatgatatgatcttcaaatttcac 42037510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 153
Target Start/End: Original strand, 43070029 - 43070124
Alignment:
Q  56 tttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  43070029 tttctactataggcgctacctcaa--ctctctaatgttgtcatttctaatcctatcctgtctaatcttaccacacatccaacccaacatgatcatctc 43070124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 354
Target Start/End: Original strand, 45185477 - 45185542
Alignment:
Q  289 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctcc 354  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45185477 tgaggctcttctccctttcaaccactaagcttgaatacaatgatttacatctgcttctatttctcc 45185542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10209090 - 10208977
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||  |||| |||||   ||||||    
T  10209090 atgcccaaaccaactaagtttagtttctgccatcttttctactataggttctaccccaa--ctctctaatgttgtcatttctaattctatcccatctagt 10208993  T
Q  121 cttaccactcatccaa 136  Q
    |||||||| |||||||    
T  10208992 cttaccacacatccaa 10208977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 20917762 - 20917630
Alignment:
Q  295 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 394  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||| |||| | |||||| || |||||||||||| |  |||| || |||||| |   ||||||||||| |||||    
T  20917762 tcttctccattttaaccatctagattgaattcgatgacttacatatgtttctatttctccgttgttttatactatggagctcggatatttaaactgtgta 20917663  T
Q  395 actt-gggtatgatatgatctccaactttcacc 426  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20917662 acttatggtatgatatgatcttcaactttcacc 20917630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3273229 - 3273098
Alignment:
Q  268 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 367  Q
    |||| |||| || ||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||| || |||||||||||||   || ||||||| |    
T  3273229 tttcgtatcacataaaacaaatgaggctcatctccatttcaaccatccaacttgaattcgatggtttatatttgcttctatttctttgtcgttttgtact 3273130  T
Q  368 atggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg 399  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  3273129 atggacctaagatgtttaaattgtgtaacttg 3273098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 34233291 - 34233435
Alignment:
Q  55 ttttctactataggtgctacccccactctct----ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||    |||||| |||| ||  ||||||||||   |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  34233291 ttttctactataggtgctatcccaactctctatctctaatgttgtcgtttctaatcctatcacatctagtcttatcacacatccaacacaacatcatcat 34233390  T
Q  151 ctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgccca 195  Q
    ||||  || |||||  ||| || |||||||| |||| || |||||    
T  34233391 ctccactacacttatcttattcccgtgttggttcttcactgccca 34233435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Original strand, 38570973 - 38571098
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  38570973 atgcccaaaccacctaagcctagtttccactatcttttgtactataggtgcttccccagctctctctcaaatgttgtcatttccaatcctatcttgtcta 38571072  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||  |||||| |||||||| |||||||    
T  38571073 gt-gtaccacacatccaacacaacatc 38571098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Original strand, 44047578 - 44047700
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||  |||| |||||  | ||| ||     
T  44047578 ccaaaccacctaagcctagattctaccaccttttctactataggtgctaccccaactctctctctaatgttgtcatttctaattctatcccgcctaatcc 44047677  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||    
T  44047678 taccacgcattcaatgcaacatc 44047700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18966541 - 18966475
Alignment:
Q  87 taatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18966541 taatgttgtcatttataatcctattttgtctaatcttaccacacatccaacgcaacatcttcatctc 18966475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Original strand, 31403276 - 31403380
Alignment:
Q  55 ttttctactataggtgctacccccactct------ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| |||||||  ||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  31403276 ttttctactataggtgctaccccaactctatctgtctctaatgttgtcatttctaatcctatcccgtctaatctcaccacacattcaactcaacatcatc 31403375  T
Q  149 atctc 153  Q
    |||||    
T  31403376 atctc 31403380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 40933205 - 40933298
Alignment:
Q  102 taatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgccca 195  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  40933205 taattctatcatgtattgtcttaccacacattcaacgcaacatcctcatctacgctacacttattttactctcgtgttggttcttttccgccca 40933298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45423648 - 45423542
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaaca 143  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| |  |||| |||||||  |||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  45423648 tttctaccatcttttctattataggtgctacctcaactctat--aatgttgtcatttctaattctatcccgtctagtcttaccacacaaccaacacaaca 45423551  T
Q  144 tcatcatct 152  Q
    || ||||||    
T  45423550 tcctcatct 45423542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Original strand, 26037836 - 26037904
Alignment:
Q  147 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaaca 215  Q
    ||||||||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  26037836 tcatctccgctccacttacttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtatcatacaaca 26037904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26356674 - 26356626
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtg 70  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26356674 tgcccaaaccacctaagtctattttctaccatcttttctactataggtg 26356626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41192892 - 41192764
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct----aatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    |||| |||| || ||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || | |||||||  ||||  |||| ||||    
T  41192892 atgcacaaatcacctaagtctagtttccaccatcttttctactgtaggtgctaccccaactctctctctctaacgctgtcatttataattgtatcctgtc 41192793  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||    
T  41192792 taatcataccacacatccaacgcaacatc 41192764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 41427574 - 41427426
Alignment:
Q  340 tgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac 438  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||     
T  41427574 tgcttatatttctccgtcattctgtactatgagcacaagatatttaagtcgtgtaacttggggtatgatatgatcttcaattttcacttttaaggtagaa 41427475  T
Q  439 ccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |   |||||   ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  41427474 c--tacttcgttttttgctgaaattacatttcatataccatgtcttgcttc 41427426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 437
Target Start/End: Original strand, 55768963 - 55769022
Alignment:
Q  379 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55768963 atatttaaaccgtgttacttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtaga 55769022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 437
Target Start/End: Original strand, 55833219 - 55833278
Alignment:
Q  379 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55833219 atatttaaaccgtgttacttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtaga 55833278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Original strand, 25967554 - 25967628
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||    
T  25967554 ctctctctaatgtagtcatttctaatcctaccatgtctagtcttaccacacatccatcgcaacatcctcacctcc 25967628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30853131 - 30853053
Alignment:
Q  360 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  30853131 tttgtactatggacccaagatatttaaactgtgtagcttgtggtatgacatgttctccaaatttcaactctaagctaga 30853053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30853384 - 30853310
Alignment:
Q  107 ctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttgg 181  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |   |||| |||| |||||||||||    
T  30853384 ctatcttgtctagtcttaccatacatccaacacaacatcttcatctccgctgcgcttattttattctcgtgttgg 30853310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2588970 - 2588905
Alignment:
Q  86 ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatc 151  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2588970 ctaatgttgtcatttctaatcctatcccttctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatc 2588905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Original strand, 44667520 - 44667629
Alignment:
Q  71 ctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttac 170  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| |  |||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  ||||||||   || |||| ||||     
T  44667520 ctaccccaactctctctaatattgtcacttctaatactatcttgtctagtattaccgcatatccaacgcaacattctcatctcctcaatgcttattttaa 44667619  T
Q  171 tctcgtgttg 180  Q
    ||||||||||    
T  44667620 tctcgtgttg 44667629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Original strand, 44686845 - 44686954
Alignment:
Q  71 ctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttac 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||  ||||||||   || |||| ||||     
T  44686845 ctaccccaactctctctaatgttgtcacttctaatactatcttgtctagtattaccgcatatccaacacaacattctcatctcctcaatgcttattttaa 44686944  T
Q  171 tctcgtgttg 180  Q
    ||||||||||    
T  44686945 tctcgtgttg 44686954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 290026 - 290118
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||| || ||| | |||||||| |||| ||||||| |||||  ||||| |||||    
T  290026 caaaccatctaagtctaatttctatcatcttttcttctataggagcaacctcaactctctccaatgttgtcatttttaattttatctcgtcta 290118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44360120 - 44360006
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctc------tctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaac 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||      ||||||  |||||||  |||| |||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  44360120 tttctaccatcttttctactataggtgataccccaactctctctccatctaatattgtcatttctaattctatctcgcctagtcctaccacacatccaac 44360021  T
Q  138 gcaacatcatcatctc 153  Q
     |||||| ||||||||    
T  44360020 acaacat-atcatctc 44360006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 179
Target Start/End: Original strand, 45185303 - 45185403
Alignment:
Q  79 actctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||  | ||| ||| || |||||||||| ||||||||    
T  45185303 actctctctaatgttgtcatttctaattctatctcatctagtcttactacacatccaacacaatattcttatcaccgctacacttactttattctcgtgt 45185402  T
Q  179 t 179  Q
    |    
T  45185403 t 45185403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 399
Target Start/End: Original strand, 8917815 - 8917938
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat-----tatggaccc 375  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||  | ||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||      ||| ||||    
T  8917815 aaaacacttgaggctcttctcaatttcaattatccaacttgaaaacgatgatttatgtctgcttttatttctctgtcattttgtataattaaatgaaccc 8917914  T
Q  376 aagatatttaaaccgtgtaacttg 399  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  8917915 aatatatttaaactgtgtaacttg 8917938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Original strand, 36557259 - 36557321
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  36557259 cccaaacca-ctaagtctagtttctaccatcttttctactatgggtgctgccccaactctctct 36557321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 50471582 - 50471459
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    ||||||||||||  |||  ||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||   |||||||||   ||| |||    
T  50471582 atgcccaaaccacttaaacctagtttccaccatcttttctactattagtgctaccccgagtctctctaatgttgtcatctctaatcctattacgtcaagt 50471483  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||    
T  50471482 cttagcaaacatccaacacaacat 50471459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 934663 - 934867
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccac--tctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||| |  ||||||| |||||| ||  ||||||||||  | |||||  |||| ||||| |  ||||    
T  934663 tgcccaaaccacctaagatgagtttctaccatcttttc-atgataggtgataccccaaccctctctctaatattatcatttctaattctatcatacctag 934761  T
Q  120 tcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgt 219  Q
    || |||||| || ||||||||||| | ||||| ||  || ||||| ||||||||| |||| | |||| || ||| | ||| |||| || ||||||||||     
T  934762 tcataccacacagccaacgcaacaacctcatccccactacacttattttactctcatgttagttctttactgcctaacaccccgtcccatacaacattgc 934861  T
Q  220 cggtct 225  Q
    ||||||    
T  934862 cggtct 934867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28467304 - 28467238
Alignment:
Q  55 ttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||    
T  28467304 ttttctactataggtgctacctcatctctctttaatggtttcatttgtaatcctatcatgtttagtc 28467238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28497545 - 28497480
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28497545 atgcccaaaccacctaagcct-ttttccacaatcttttctactaaaggtgctaccccaactctctct 28497480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 42285926 - 42285972
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactatag 67  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42285926 atgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactatag 42285972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 145
Target Start/End: Original strand, 51841505 - 51841543
Alignment:
Q  107 ctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51841505 ctatcttgtctagtcttaccacacatccaacacaacatc 51841543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 30621431 - 30621496
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||| || ||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  30621431 tgcccaaatcacctaaacctattttccaccatcttttctactataagtgctaccccaactccctct 30621496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 32479090 - 32479057
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaactttt 58  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32479090 ccaaaccatctaagcctattttctaccaactttt 32479057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 202
Target Start/End: Original strand, 49739114 - 49739203
Alignment:
Q  113 tgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactcc 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| |||  ||  |||| ||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||    
T  49739114 tgtctagtcttaccacacatctaacgcaacatccccatttccactacgcttattttactctcttgttggttctttatcgcccaacactcc 49739203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Original strand, 45094471 - 45094523
Alignment:
Q  102 taatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  45094471 taatactatcttgtctagtattactacacatccaacacaacatcctcatctcc 45094523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 32082975 - 32083440
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  32082975 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctaccctgtctagtct 32083074  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32083075 taccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacatactttactctcgtgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgtcgg 32083174  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    |||||||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32083175 tctgactgttgtctgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcatagaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttga 32083274  T
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32083275 atacgatgatttacatttgcctctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaattgtgcaacttggggtatgatatgatctccaactt 32083374  T
Q  422 tcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32083375 tcacctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 32083440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 8671974 - 8671507
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8671974 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagt 8671875  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||||||  | |    
T  8671874 cttaccactcatccaacgcaacatccttatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacatttcgtaccatacaacaacgcc 8671775  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8671774 ggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagtctcttctccattttaaccacccagctt 8671675  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaac 419  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8671674 gaatacgatgacttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctccaac 8671575  T
Q  420 tttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8671574 tttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 8671507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1210801 - 1210332
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1210801 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtcta 1210702  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  1210701 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 1210602  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     |||||  |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  1210601 ccggtcgaactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctcaggctcttcttcatttcaaccacccagc 1210502  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1210501 ttgaatacgatggcttacatctgcttttatttctccatcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 1210402  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1210401 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 1210332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 51602112 - 51601646
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  51602112 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctctaatggtgtcattcctaatcatatcatgtctagt 51602013  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||   || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  | |    
T  51602012 cttaccactcatctaacgcaacatcctcatatctactacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacaacgcc 51601913  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51601912 ggtcggactactgtccgatagaactttcatttcaacttaaggggtactttcttatcgaacaaaacacctgagactcttctctatttccaccacccagctt 51601813  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaac 419  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51601812 gaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaac 51601713  T
Q  420 tttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgctt 488  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51601712 tttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgctt 51601646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 51440991 - 51441459
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51440991 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgttacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 51441090  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | || ||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  51441091 gtcttaccactcgtccaatgcaacatcctcatctctgctacactcacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 51441190  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51441191 tcggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgca-aaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagc 51441289  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    ||||||| |||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51441290 ttgaatatgatggcttagatctgcttctatttctccgtcattttgtatgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 51441389  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||| |||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51441390 actttcaccttcaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 51441459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 49347623 - 49348089
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49347623 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatagatgctacccctactctctctccaatggtgtcattcctaatcctatcctgtctagtct 49347722  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||  || ||    
T  49347723 taccactcatccaacgcaacatcctcatctttgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaaggttgg 49347822  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    || ||||||||||||||| |   || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347823 tcggactgctgtccgatagatttttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttga 49347922  T
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaacc-gtgtaactt-gggtatgatatgatctccaact 420  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49347923 atacgatggcttacacctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccagtgtaacttggggtatgatatgatctccaact 49348022  T
Q  421 ttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49348023 ttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattcgatatactccgtcttgcttc 49348089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 43240605 - 43241076
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct----ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  43240605 atgctcaaactatctaagcctattttctatcaatttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatggcgtcattcataatcctatcatgtc 43240704  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||     
T  43240705 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaacctcccaacactccgtatcatacaacaa 43240804  T
Q  217 tgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 316  Q
     | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43240805 cgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccca 43240904  T
Q  317 gcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctc 415  Q
    ||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43240905 gcttgaatatgatggcttacatctgcttccatttctccgtcattttgtacgaaggatccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctc 43241004  T
Q  416 caactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43241005 caactttcacctccaaggtagatc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 43241076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 394
Target Start/End: Original strand, 30202360 - 30202731
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30202360 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacctttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtct 30202459  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||  | |||    
T  30202460 taccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccacacaacaacgccgg 30202559  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    || ||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30202560 tcggactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccggcttga 30202659  T
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 394  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  30202660 atacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgta 30202731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8391824 - 8391525
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8391824 ccaaacaatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcttgtgtagtct 8391725  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc--ttacaacattgtc 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||   ||| |||||| |    
T  8391724 taccactcatccaacacaacatcttcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatatacgacattgcc 8391625  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8391624 ggtctgactgctgtccgataaaacattcctttaagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagctt 8391525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22090152 - 22089826
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct----aatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22090152 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatggtgtcattcataatcctatcctgtc 22090053  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  22090052 tagtcttaccactcatccaacacagcatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccacacaacaa 22089953  T
Q  217 tgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 316  Q
     | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089952 cgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtattttcttattgcacaaaacatctgagactcttctccatttcaaccaccca 22089853  T
Q  317 gcttgaatacgataatttacatctgct 343  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  22089852 gcttgaatacgatgacttacatctgct 22089826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9592790 - 9592463
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9592790 atgcccaacccatctaagcctattttctacaaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 9592691  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  9592690 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgattcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 9592591  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
    || ||||||||  ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9592590 tcagtctgactattgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccacccaac 9592491  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttct 346  Q
    |||||||||||   |||| |||||||||    
T  9592490 ttgaatacgatggcttacctctgcttct 9592463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 485
Target Start/End: Original strand, 37463101 - 37463553
Alignment:
Q  23 gcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  37463101 gcccaaaccacctaagcctattttctactgtcttttctactataggtgctaccccaactctctctaatggtgtcattcctaatcctaacctgtctagtct 37463200  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||  | |||  |||| | ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||   |    
T  37463201 taccactcatccaatgaaacatcctcatctcc--tctac--acttgattcttgtgttggttcttaaccacccaacactctgtaccatacaacattgctag 37463296  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    |||||||| |||| |||| ||  || |||||| |||||   ||  |||||||||  ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37463297 tctgactgttgtctgatagaattttcctttcaacttaatcagtgctttcttatc--acctaacacctaaggctcttctccatatcaaccacctagcttaa 37463394  T
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactt 421  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37463395 atacaatgatatacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggactcaagatatttaaactgtgtaactcggagtatgatatgatctccaactt 37463494  T
Q  422 tcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttg 485  Q
    ||||||||||||||||     ||| |  |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37463495 tcacctccaaggtaga-----actccggcttttgctgaagttacattccatatactctgtcttg 37463553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 696321 - 696069
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  696321 ccaagccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtctagtct 696222  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  696221 taccactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccacccaacactccgtaccatacaacattgccgg 696122  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 275  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  696121 tctgactgctgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttat 696069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15085986 - 15085728
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  15085986 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctatctagtct 15085887  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  15085886 taccactcgtccagcgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccgg 15085787  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcaca 281  Q
    | ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15085786 tttgactgctgtctgatagaactttcctttcagcttaagtggtgctttcttatcgcaca 15085728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 19936570 - 19936175
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||      |||||||||| || |||||||   ||||||    
T  19936570 atgcccaaaccacataaacctattttctaccatcttttttgctataggtgctaccctaactctc------ggtgtcattcctattcctatcccatctagt 19936477  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||| || | |||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||| || |||||||      
T  19936476 cttaccactcatccaacacaacattctcatctccgctatgcttatttgattctcatgttggttcttaaccgcccaacactctataccctataacattgct 19936377  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  || ||||||  ||||| |||  ||||||||| || ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  19936376 ggtctaactgctgtccgatataattttcctttcattttaagcggtactttcttatcacataaaacacttgaggttcttatccatttcaaccacccagctt 19936277  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatca-ttttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaa 418  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19936276 gaatacgatgatttacatatgcttctatttctccttcatttttgtattatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaa 19936177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 476
Target Start/End: Original strand, 34827349 - 34827784
Alignment:
Q  40 ctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgc 139  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||| |||||||  |     ||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  34827349 ctattttctaccatctttacttctatatgcgctaccccaactctctacataatagtcatttctaatcttatatcgtctagtcttaccactcatccaacac 34827448  T
Q  140 aacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgat 239  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| ||   | ||||||||| |||||||||  || ||||| ||||| |||||||| || | |||||||| ||||| ||    
T  34827449 aacatcctcatctcagttacacttatttgtttttcgtgttggttcttaaccgaacaacactctgtaccatacaacatcgttgatctgactgttgtccaat 34827548  T
Q  240 aaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatc 339  Q
    | ||  || ||||||  |||||  ||  ||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||     
T  34827549 ataattttcctttcaatttaagcagtactttcttatcacataaaacacatgaggctcttctccatttcaaccattcaacttgaatacaatgatttacata 34827648  T
Q  340 tgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac 438  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   | |      
T  34827649 tgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccttgtaacttagggtatgatatgatctcccactttcacctccatcatggga 34827748  T
Q  439 ccacacttctccttttgttgaagttacattccatatac 476  Q
    |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34827749 c--cacttcttcttttgatgaagttacattccatatac 34827784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 34792575 - 34792768
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  34792575 atgcccaaaccatctaagcctactttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtttcattcctaatcctatcatgtcta 34792674  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaa 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34792675 gtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctctgctacactt-cttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaa 34792768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27445743 - 27445537
Alignment:
Q  230 gctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 329  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| || |||||||  |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27445743 gctgcccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcacataaaacactcggaactcttctccatttcaaccaaccaacttgaatacgat 27445644  T
Q  330 aatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27445643 gatttacatctgcttctatttctccatcattttgtactatggacccaacataattaaaccgtgtaacttggggtatgataagatctccaactttcacctg 27445544  T
Q  429 caaggta 435  Q
    |||||||    
T  27445543 caaggta 27445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 4001685 - 4001848
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4001685 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctattttgtctagtct 4001784  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaa 188  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4001785 taccactcatctagcgcaacatcctcatcttcg--ctacttactttactctcgtgttgactcttaa 4001848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 32231180 - 32231356
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32231180 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaatttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 32231279  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgccca 195  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||||||   || |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  32231280 atcttaccactcatctagcgcaacatcctcatctctactacacttacttgattctcgtgttgacccttaaccgccca 32231356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 283 - 437
Target Start/End: Original strand, 32066761 - 32066913
Alignment:
Q  283 aacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatat 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  32066761 aacacctgaggctcttctccattttaaccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaatat 32066860  T
Q  383 ttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32066861 ttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctccaattttcacctctaaggtaga 32066913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 365
Target Start/End: Original strand, 46226549 - 46226853
Alignment:
Q  60 tactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttat 159  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||  |||  ||||| ||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  46226549 tactataagtgctaccataactctctctaacagtggtattctcaattctattacgtctagtctcaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgctaa 46226648  T
Q  160 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 259  Q
    |||||||| | ||||||||||| | ||||  || || || | |||||| |||||||| |||  | |||| | |||| |||| ||  ||||||||| ||||    
T  46226649 acttacttgattctcgtgttggttgttaattgctcaacatttcgtaccatacaacatcgtcactatgacagttgtctgatagaatttttctttcaactta 46226748  T
Q  260 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 359  Q
    ||   |  ||||||| | || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  46226749 agcactactttcttagcacataaaacacttgatgctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacaat-atttacatctgcttttgtttctccatcat 46226847  T
Q  360 tttgta 365  Q
    ||||||    
T  46226848 tttgta 46226853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 196
Target Start/End: Original strand, 18469327 - 18469483
Alignment:
Q  40 ctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgc 139  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18469327 ctattttctatcatcttctctactataggtgttaccccaactctctctaattgtgtcattcctaatcatatcatgtctagtcttaccactcatacaacgc 18469426  T
Q  140 aacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccag 196  Q
    | |||| ||||||||| ||   |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18469427 agcatcgtcatctccgctacgtttacttgattctcgtgttggttcttaaccgcccag 18469483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 51234611 - 51234267
Alignment:
Q  79 actctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct-agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtg 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| | |||  | || |||| |  ||||    
T  51234611 actctctctaatgttgtaatttctaatcctatcatgttttagtcttaccacacgtccaacacaacatcctcatctaccttacgcctattttatttgcgtg 51234512  T
Q  178 ttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcg 277  Q
    |||| |||| || ||||| || |  || || ||||| |||| |||| | || |||| | ||| |||  || | |||| ||| || |||  |||| ||||     
T  51234511 ttggttctttactgcccaacattttgttccgtacaaaattgccggttttacagctgactgatcaaattttcccttcaacttgagcggtgctttcgtatca 51234412  T
Q  278 cacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaa 377  Q
    || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  51234411 cataaaagacctgaggctattctccatttcaaccacccaacttgaatttgatgatttacatctgcttcaatttctccatcattttgcactatggactcaa 51234312  T
Q  378 gatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaacttt 422  Q
    |||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51234311 gatatttaaactatgaaacttgtttatgatatgatctccaacttt 51234267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Original strand, 9599620 - 9599917
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||    
T  9599620 atgcccgaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactataggtgttactccaactctctctctaatgatgtcattcctaatcatatcccgtcta 9599719  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||  ||||||| | | | ||||||| ||| |||||| || ||||  ||| | ||| |||| |    
T  9599720 gtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacgcttacttgattattgtgttggttctcaaccgcacaacactttgtatcataccacatcg 9599819  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 316  Q
      ||||||||||| ||| |||| ||  ||  ||||| || ||| |||  ||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  9599820 ctggtctgactgcggtctgatagaattttcatttcaactgaagcggtactttcttatcacataaaacacttgaggctcttatccatttaaaccaccca 9599917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9509374 - 9509240
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  9509374 atgcccaaactacctaagcctattttttaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctctaatggtgtcatttctaatcatatcctgtcta 9509275  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9509274 gtcttatcactcatccaacacaacatcctcatctc 9509240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 286 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 7921716 - 7921574
Alignment:
Q  286 acctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatattta 385  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  7921716 acctgagaccctcatccatttcaacaacccaacttgaattcgatggtttacatctccttctatttctcaatcgttttgtactatggatccaagatatata 7921617  T
Q  386 aaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacct 427  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7921616 aatcgtgtaacttgtggtaagatatgatctccaactttcacct 7921574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 38807897 - 38808106
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca------ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttg 114  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||  |||| |||||  |    
T  38807897 atgcctaaaccatctaagtctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccattctctctctctctaatggtgtcatttctaattctatcccg 38807996  T
Q  115 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaac 214  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  |  ||||||| | ||||||    |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  38807997 tctggtcttaccact-atccaacacaacatcctcatatccgccacgcttacttaattctcgt----gctcttaacctcccaacactctgtaccgtacaac 38808091  T
Q  215 attgtcggtctgact 229  Q
    || | ||||| ||||    
T  38808092 atcgccggtcggact 38808106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28528375 - 28528227
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| | || ||||  |||||| || |||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  28528375 aaaacacctgaggcactcctcaatttcaaccacccagctcggattcgatggtttacacctccttctatttctccattgttttgtaacatagacccaagat 28528276  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28528275 atttaaactgtgtaacttgtggtatgctatgatctccaactttcacctc 28528227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 35828894 - 35829038
Alignment:
Q  294 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 393  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||| | | ||    
T  35828894 ctcttttccatttcaaccacacagatcgaattcgatgatttacatatgcttctatttctccgtcgctttgtactatggacccaagatgtttaagcagcgt 35828993  T
Q  394 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35828994 aacttgtggtatgatatgatctctagctttcacctccaaggtaga 35829038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39140576 - 39140349
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  ||||    
T  39140576 atgcccaaaccacctaagccaattttttgccatcttttctactataggtgctacgccaactctctctgtaatggtttcattcctaatcctatctcatcta 39140477  T
Q  119 gtc-------ttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttac 211  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||  ||||||| | | || || ||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  39140476 gtcttaccagttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctactacgcttacttgattttcatgatggttcttaactgcccaacact-cgtaccatac 39140378  T
Q  212 aacattgtcggtctgactgctgtccgata 240  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||    
T  39140377 aacatcaccggtctgactgctgtccgata 39140349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 303 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6640898 - 6640772
Alignment:
Q  303 atttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-gg 401  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6640898 atttcaaccacccaacttggatccaatggtttacacctccttctatttctccataattttgtactatagactcaagatatttaaaccgtgtaacttgtgg 6640799  T
Q  402 tatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||    
T  6640798 tgtaatatgatctctaactttcacctc 6640772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 424
Target Start/End: Original strand, 52739965 - 52740098
Alignment:
Q  291 agactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccg 390  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||| ||||| ||||||    
T  52739965 agactcttctccatttcaaccatccaacttgagtaagatgacttacatctacttctatttctccgtcactttgtactataggtccaaaatattcaaaccg 52740064  T
Q  391 tgtaacttgggtatgatatgatctccaactttca 424  Q
    || |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  52740065 tgcaacttaagcatgatatgatctccaactttca 52740098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 27848031 - 27848155
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |  | |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||    
T  27848031 atgcccaaaccacctaagcttattttctaccatcttttctaccacaggtgctaccacaactctctctctaatggtgttattcct-atcctatcccgtcta 27848129  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27848130 gtcttaccactcatccaacacaacat 27848155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Original strand, 52561843 - 52561950
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||| ||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  52561843 aaaccacctaagcctattttctatcatcatttctactaaaggtgctaccccaactctctctctaatggtgtcattcctaatcatatcccgtctagtctta 52561942  T
Q  125 ccactcat 132  Q
    ||||||||    
T  52561943 ccactcat 52561950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1661486 - 1661264
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattc----ttaatcctatcttg 114  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||     ||||||||||       
T  1661486 atgctcaaaccatctgagcctattttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctcaaatattgtcattcatttctaatcctatcaca 1661387  T
Q  115 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaac 214  Q
    |||||||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||| | || |||||||| | |||  | || |||||     
T  1661386 tctagtcttatcagacattcaacacaacatcttcatctctgctatgcttattttattctcgtgttggtttttcaccgcccaacgctctatcccatacaat 1661287  T
Q  215 attgtcggtctgactgctgtccg 237  Q
    || || ||||| |||||||||||    
T  1661286 atcgttggtcttactgctgtccg 1661264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 12807587 - 12807732
Alignment:
Q  294 ctcttctccatttcaa-ccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 392  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||||||||| |||||||||||| | || |||| || |||||| ||||||||||||||  |||    
T  12807587 ctcttctccatttcaaaccacctagaataaattcgatgatttacatcagcttctatttcttcgtcgttttatactatggatccaagatatttaaattgtg 12807686  T
Q  393 taacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12807687 taacttgtagtatgatacgatcctcaactttcacctctaaggtaga 12807732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40419695 - 40419471
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || |||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||  ||||    
T  40419695 atgcccaaaccacttaagtctagttactaccatctattctactataagttctaccccaactctctctctaatgttgtcatttctaattctatctcatcta 40419596  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    || ||||||  ||| ||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||   ||||||||| |||| ||| |||| ||||| || || |||||||| |    
T  40419595 gttttaccatacattcaacgcaccatcctcatctctgctacacttactttatgttcgtgttggttctttaccacccaacactctgttccgtacaacatcg 40419496  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaa 243  Q
    ||| ||| || | ||||| ||||||    
T  40419495 tcgatcttaccgatgtcctataaaa 40419471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 14226055 - 14226171
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||  | |||||||| |||| || ||||  |||||||||| |||||||     
T  14226055 atgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctatgataggtgctactgcaactctctccaatgttgccatttctaatcctatcatgtctagc 14226154  T
Q  121 cttaccactcatccaac 137  Q
    |||||||| ||||||||    
T  14226155 cttaccacacatccaac 14226171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 52421210 - 52421016
Alignment:
Q  293 actcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||   || ||||||| ||  |||||||| |||||||| | ||    
T  52421210 actcttctctatttcaaccacccaacttgaattcgatgattaacatatgcttttatttctatgtc-ttttgtactaaagacccaagctatttaaa-cttg 52421113  T
Q  393 taacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttca 490  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||   | ||||| ||||||| |||| || |||| |||||| |  |||||||||||    
T  52421112 taacttgtggcatgatatgatctctaactttcacctataaggtaga--gatacttcaccttttgctgaaattccatttcatatatcatgtcttgcttca 52421016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4029174 - 4029112
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4029174 ccaaaccttctaagcctattttctaccaacttgtctactctaggtgctacccccactctctct 4029112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43423771 - 43423647
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  43423771 ccaaaccacctaagcctagtttccaccatcttttctactataggtgttaccccaactctctctctaatgtggtcatttctaatcctatcctgtctagtct 43423672  T
Q  123 t--accactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |   |||| ||||||||||||||||    
T  43423671 tcccccacacatccaacgcaacatc 43423647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Original strand, 18793214 - 18793345
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| || ||||||  ||||  |||||| ||| | ||||| ||||||    
T  18793214 atgccaaaatcaactaagtctagtttctaccatcttttctacaataagtcctaccccaaccctctctttaatgtcgtcatttttagttctatcctgtcta 18793313  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18793314 gtctttccacacatccaacgcaacatcatcat 18793345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26016490 - 26016312
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||  ||||   | |||  ||||  |||| |||||||||    
T  26016490 cccaaaccacctaaatctagtttctaccatcttttctcatataggtgttaccccaactctctctctaatgccattatttataattatatcctgtctagtc 26016391  T
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcact 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||   || |||||| |||| |||||||| ||||    
T  26016390 ttaccacacatccaacgcaacatcctcatctctgctacgcttactttatgttcttgttggttctttaccgcccaacact 26016312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4380000 - 4379927
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  4380000 ctctctctaatgttgtcatttctaatcatatcttttctagtcttaccacacatccaacacaacatcctcatctc 4379927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21275725 - 21275588
Alignment:
Q  251 ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctattt 350  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  | ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || | || |||||||||  ||| ||| |    
T  21275725 ttcagcttaagtggtactttcttatcaaataaagcacatgagactcttctttatttcaaccactcagcttggattcaatgatttacatcaacttttatat 21275626  T
Q  351 ctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 388  Q
    |||  || ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  21275625 ctctgtcgttttgcactatcgacccaagatatttaaac 21275588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 40419381 - 40419328
Alignment:
Q  375 caagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacct 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419381 caagatatttaaactgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 40419328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 436
Target Start/End: Original strand, 46226887 - 46226956
Alignment:
Q  368 atggacccaagatatttaaaccgtgtaact-tgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtag 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46226887 atggacccaagatatttaaaccgtgtaactcaaggtatggtatgatctccaacttgcacctccaaagtag 46226956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2544651 - 2544589
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2544651 ccaaaccacctaagtctgttttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctct 2544589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3877621 - 3877495
Alignment:
Q  303 atttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-gg 401  Q
    ||||||| ||||||  ||||||  ||| | ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |     
T  3877621 atttcaagcacccatattgaatttgatgaattatatttgcttctatttctccatcgttttatattatggacccatgatatttaaattgtgtaatttgtga 3877522  T
Q  402 tatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  3877521 aatgatataatctccaatttttacctc 3877495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Original strand, 16142399 - 16142487
Alignment:
Q  343 ttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctcca 430  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||    
T  16142399 ttctttttcttcgtcattttgtattatgaacccaagatatttaaaatgtgtcacttgggatatgatatgccctcccaccttcacctcca 16142487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 48431632 - 48431688
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc 77  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48431632 atgcccaaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataggggctacccc 48431688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 400
Target Start/End: Original strand, 11331568 - 11331666
Alignment:
Q  297 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 396  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  11331568 ttctccatttaaaccatccaacttaaaagcggtaatttacatctgcttctatttctctgtcatt-----ttatggaccaaatatatttaaatcgtgtaac 11331662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 400
Target Start/End: Original strand, 11489589 - 11489687
Alignment:
Q  297 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 396  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  11489589 ttctccatttaaaccatccaacttaaaagcggtaatttacatctgcttctatttctctgtcatt-----ttatggaccaaatatatttaaatcgtgtaac 11489683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Original strand, 52641033 - 52641093
Alignment:
Q  372 acccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 434  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52641033 acccaatatatttaaattgtgtaacttg--tatgatatgatctccaactttcacctctaaggt 52641093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Original strand, 22167643 - 22167709
Alignment:
Q  89 atggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22167643 atggtgtcattcttaatcatatctcgtcttgttttaaccctcatccaacgcaacatccttatctccg 22167709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Original strand, 52442791 - 52442861
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    ||||||| |||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  52442791 ctctctccaatgttctcatttctaatcttatcttgtctagtcttaccacacatccaacacaacatcctcat 52442861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Original strand, 16142172 - 16142241
Alignment:
Q  81 tctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  16142172 tctctctaatggtggcattcctgatcctatcccgtctagtcttaccacacatccaacataacatcttcat 16142241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Original strand, 36624096 - 36624184
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatc 111  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||  | || |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36624096 ccaaaccacctaagcctattttctacaatcttttctactgcaagtactaccccaactctctctctaatggtgtcattcctaattctatc 36624184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 365
Target Start/End: Original strand, 52640920 - 52640997
Alignment:
Q  288 ctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgta 365  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  52640920 ctgaggctcttcttcatttcaacaattcaacttgaatacgataatttacatatgcttttatctctctgtcattttgta 52640997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17815528 - 17815405
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||| | |||| || ||||| |  |||||||||||  |||||||  |||| |||||  |||||||    
T  17815528 atgcccaaaccaactaagcctagtttccaccatcttttccattataagtcctacctcatctctctctaatattgtcatttctaatgctatcccgtctagt 17815429  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    | |||||| |||||||| |||||||    
T  17815428 c-taccacacatccaacacaacatc 17815405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52831942 - 52831830
Alignment:
Q  191 gcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctg 290  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  |||||||||  |||| ||    |||||||||||| ||||||| ||    
T  52831942 gcccaacacttcgtatcatacaacattgtcggtctaactgtcgtccgatacaatttttctttcaatttaaatgacactttcttatcgcataaaacacatg 52831843  T
Q  291 agactcttctcca 303  Q
    || ||||||||||    
T  52831842 aggctcttctcca 52831830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 4590813 - 4590876
Alignment:
Q  82 ctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  4590813 ctctctaatattgtcatttctaatcctatcttgtctagtctcaccgcacattcaacgcaacatc 4590876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 434
Target Start/End: Original strand, 16273415 - 16273471
Alignment:
Q  376 aagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 434  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16273415 aagatatttaaattgtgtaacttg--tatgatatgatctccaactttcatctctaaggt 16273471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41611181 - 41611103
Alignment:
Q  68 gtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  41611181 gtgctaccccaacactctctctaatagcgtcattcctaatcatatcccgtccattcttactactcatccaacgcaacat 41611103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 37263387 - 37263325
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct 83  Q
    ||||||||||||   ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37263387 atgcccaaaccactgaagtctagtttctactatcttttctactataggtgctaccccaactct 37263325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 40416427 - 40416361
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||| |||||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40416427 atgcctaaaccacctaagcctcgtttccaccatcttttctactataggtgctactccaactctctct 40416361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Original strand, 40920824 - 40920894
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    |||||||||||  ||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  40920824 ctctctctaatattgtaatttctaatcctatctcgtctaatcttaccacacatccaatgcaacatcttcat 40920894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52832101 - 52831968
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||   |||||| || || |||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||| |||| || | ||||||||||  |  | |    
T  52832101 atgcccaaaccacctaaatttattttgtatcatcttttctactgtagctactaccccaactctctttaatgatgtctttttgaatcctatctcattaaat 52832002  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||    
T  52832001 cttaccactcattcaacac-acatcctcatctccg 52831968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 150
Target Start/End: Original strand, 16822319 - 16822376
Alignment:
Q  93 tgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  16822319 tgtcatttctaatcctatcttatctagtattaccacacatccaacacaacatcctcat 16822376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39894844 - 39894722
Alignment:
Q  15 ccgtagatgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta--atggtgtcattcttaatcctatct 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||   ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  39894844 ccgtacatgcccaaaccacctagatctatttt-tcccatcttttctactataggggctaccca-attctctctatgatagtgttattcttaatcctatct 39894747  T
Q  113 tgtctagtcttaccactcatccaac 137  Q
      |||| |||| ||||| |||||||    
T  39894746 catctaatcttgccacttatccaac 39894722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 13827948 - 13828012
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaat 90  Q
    ||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13827948 caaaccacctaaccctagtttccaccatcttttctactataggtgctgccccaaatctctctaat 13828012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17275177 - 17275137
Alignment:
Q  104 atcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17275177 atcctatcatgtgtagtcttaccacacatccaacgcaacat 17275137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 36340035 - 36340095
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  36340035 aaaccacctaaacctattttccaccatcttttctaatataggtgctacaccaactctctct 36340095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Original strand, 52633494 - 52633573
Alignment:
Q  115 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgccca 195  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||   | |||||||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  52633494 tctagtcttaccgcacattcaacgcaacatcctcatctcc-acacacttactttattctcgtgtcggttcttaactgccca 52633573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 9706827 - 9706363
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9706827 caaaccatctaagcctattttctaccaacttttctacaataggtgctacctccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtctt 9706728  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggt 223  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  9706727 accactcatccagtgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccacctaacacttcgtaccatacaacattgccggt 9706628  T
Q  224 ctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 323  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706627 ctgactgctgttcgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgatgctcttctccatttcaaccacccagcttgaa 9706528  T
Q  324 tacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaacttt 422  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9706527 tacgatgatttacacctgcttctatttctccatcattttgtaccatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaacttt 9706428  T
Q  423 cacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    || |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9706427 catctccaaggtatacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccatcttgcttc 9706363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 5258378 - 5258845
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct----aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5258378 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaacggtgtcattcataatcctatcttgtctagt 5258477  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  5258478 cttaccactcatccaacgcaacattctcacctccgctacacttactttgctctcgtgttggctcttcgccgcccaacactccgtaccatacaacattgcc 5258577  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5258578 ggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttctcatcgcaaaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagctt 5258677  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaac 419  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5258678 gaatacgatgatgtacatcagcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaac 5258777  T
Q  420 tttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  5258778 tttcacttccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttc 5258845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5631874 - 5631404
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct------aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  5631874 ccaaaccatctaagcatattttctaccaacttttctactataggtgttacccccactctctctctctctaatggtgtcattcctaatcatatccggtcta 5631775  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  5631774 gtcttaccactcatccaacacaacatcctcatcttcgctacacttactttactctcgcgttggctcttaaccgcccaacactccataccatacaacattg 5631675  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631674 tcggtctgactgttgtccgatagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccacccagc 5631575  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc-aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcc 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  5631574 ttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaaaaatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctct 5631475  T
Q  417 aactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  5631474 aactttcacctgcaaggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttc 5631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 10100089 - 10100552
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  10100089 ccaaaccatctaagcttattttctaccaacttttctactatatgtgcgacccccactctctctaatggtgtcatttctaatcatatattgtctagtctta 10100188  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10100189 ccactcatctaacgcaacatcctcatctccgctacacttacttgactctcgtcttggctcttaacctcccaacactccgtaccatacaacatcgtcggtc 10100288  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 324  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10100289 tgactactgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatctcacaaaacacatgaggctcttctccattccaaccacccagcttgaat 10100388  T
Q  325 acgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttc 423  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10100389 acgatgatttatatcagcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttc 10100488  T
Q  424 acctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10100489 acctccaaggtagacc--tacttctcattttgctaaagttacattccatatactccgtcttgcttc 10100552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 26 - 489
Target Start/End: Original strand, 20427867 - 20428331
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |    
T  20427867 caaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtcttgtcct 20427966  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggt 223  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| |  ||    
T  20427967 accactcatccagcgcaacatcctcatctccgctacacttatttgactctcgtgttggctcttaaccacccaacactctgtactatacaacatttttagt 20428066  T
Q  224 ctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 323  Q
     |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20428067 ttgactgctgtccaatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgga 20428166  T
Q  324 tacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaacttt 422  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20428167 tacgatgatttacatctgcttctatttttccgtcgttttgtactgtggacccaatatatttaaaccgcgtaacttgtggtatgatatgatctccaacttt 20428266  T
Q  423 cacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||| |||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20428267 cacctcctaggtagacc--taattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 20428331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 608209 - 607905
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  608209 ccaaaccatctaagcctattttctatcaacttttctactataggtgataccctcactctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctatctagtctta 608110  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  608109 ccactcatccaacggaacatcctcatctccgctacacttactttattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtacaatacaacattgccggtc 608010  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 324  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608009 tgactgctgtccgatagaacttttctttcagtttaagtggtcatgtcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaat 607910  T
Q  325 acgat 329  Q
    |||||    
T  607909 acgat 607905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14030859 - 14030558
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccact--ctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14030859 ccaaaccatttaagcctattatctaccaacttttctactataggtgctacccccactatctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtctagtct 14030760  T
Q  123 ta-ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcg 221  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||       
T  14030759 taaccactcatccatcgcaacatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgacttttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgcta 14030660  T
Q  222 gtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttg 321  Q
    || |||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14030659 gtttgactgttgtccgatagaactttcatttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactattctccatttcaaccacccagtttg 14030560  T
Q  322 aa 323  Q
    ||    
T  14030559 aa 14030558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 67 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 33496194 - 33495794
Alignment:
Q  67 ggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatactta 164  Q
    ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||  ||||| |||| | | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33496194 ggtgctacccctactatctctgtaatggtgtcatttctaatcttatcctatttaatcttaccattcatccaatgcaacatcatcatctccgttacactta 33496095  T
Q  165 ctttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtgg 264  Q
    ||| | |||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||  ||||             |||||||||    
T  33496094 cttgattctcatgttggtttttaaccgtccaacactctgtaccatacaacattgcaggtctgactgttgtcctttaaa-------------cttaagtgg 33496008  T
Q  265 ttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgt 364  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  33496007 tactttcttatcacacaaaacatctgagactcttctccatttcaaccatccagcttgaatatgatgagttacatatgcttctatttctccgttattttgt 33495908  T
Q  365 attatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagtta 464  Q
    | ||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  33495907 actatggacccaagat---------gtgtaactagggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttttgatgaagtta 33495819  T
Q  465 cattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  33495818 cattccatatactctgtcttgcttc 33495794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2689642 - 2689313
Alignment:
Q  89 atggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaa 188  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||  || | |||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  2689642 atggtgtcattcctaatcctatcctatttagtcttactgctcatccatcacaacatcctcatctccactacatttacttaattctcgcgttggctgttaa 2689543  T
Q  189 ccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||     
T  2689542 ccgcccaacactccgtaccatacaacatcgacggtctgactgctgtccgattgaactttcctttcaacttaagtagtgctttcttatcacacaaaataca 2689443  T
Q  289 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 388  Q
    |||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  2689442 tgaggcacttctccatttcaatcatccagcttgactacgatgatttacatctgattctatttctccgtcgttttgtactatagacccaaaatatttaaac 2689343  T
Q  389 cgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2689342 cgtgtaacttagggtatgatatgatctcca 2689313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28085428 - 28085197
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28085428 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcgtaatcctatcatgtctagtct 28085329  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||    |||    
T  28085328 taccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttagccgcccaacactccgtaccatacagcaacaccgg 28085229  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttca 254  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  28085228 tctgactgctgtccgatagaactttcctttca 28085197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 352
Target Start/End: Original strand, 6056032 - 6056329
Alignment:
Q  55 ttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||     
T  6056032 ttttctactataggtgttaccccaactctctctaatggtgtcattcttaatcacatcctttctagtcttaccactcatccaacgcaacatccgcatttct 6056131  T
Q  155 gttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttca 254  Q
      ||  ||||||| | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||   | ||||||    
T  6056132 actacgcttacttgattttcgtgttggttcttaaccacccaacactccgtatcatataacattgtcggtctgaccgttgtccgatagaattatcctttca 6056231  T
Q  255 gcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttct 352  Q
     ||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6056232 acttaaatgatattttcttatcgcataaaacacttgaagctcttctacatttcaaccacccaacttgcctacgatattttacatatgcttctatttct 6056329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30031302 - 30031091
Alignment:
Q  31 catctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc--tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccac 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  30031302 catctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactccctctctaatggtgacatttctaatcctatcccgtctagtcttaccac 30031203  T
Q  129 tcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgac 228  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| || ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||    
T  30031202 tcatccaacacaacaacctcatctccgctacactaacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcattggtctgac 30031103  T
Q  229 tgctgtccgata 240  Q
    ||||||||||||    
T  30031102 tgctgtccgata 30031091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 35043671 - 35043855
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctc--tctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  35043671 ccaaacaatctaagcctattttcaaccaacttttctactttaggtactaccctcactctccctctaatggtgtcattcataatcctatcatgtctaatct 35043770  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc 207  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35043771 taccaatcatccagcgcaacatcttcatctccgctacacttacttgactctcatgttggctcttaaccgtccaacactccgtacc 35043855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26291832 - 26291444
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtg-ctacccccactctct----ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||  |||||||    ||||| || |||||| |||| |||||  ||||||     
T  26291832 caaaccacctaagtctattttctaccatattttctattataggtgtctaccctaactctctatctctaatagtatcattcctaatactatcaagtctaga 26291733  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| | | ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  26291732 cttaccacacattcaacacaacatcatcatctcaattacacttactttattctcatgttggttttcaac-gcctaacactccgtaccatacaacattgtt 26291634  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
     || |||  | ||| ||||| ||  || ||| || |||||   ||  ||||||||| || |||| || ||||  | |||| ||||||||||| ||| |||    
T  26291633 agtatgatagttgttcgatataattttacttccaacttaacatgtgctttcttatcacataaaatacatgaggttattctacatttcaaccatccaactt 26291534  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatat 409  Q
    ||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26291533 gaatacgttgatttgcgtatgcttctatttctccatcattttctactatggactcaagatatttaaacggtgtaacttagggtatgatat 26291444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32755973 - 32755841
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct----ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  32755973 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatggtgtcattcctaatattatcatgtctagt 32755874  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32755873 cttaccactcatccaacacaacatcctcatctc 32755841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 9593932 - 9594074
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc--------tctctaatggtgtcattcttaatcctatct 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||        |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9593932 atgcccaaaccacctaagcctattttctaccatcttttctactaatggtgctaccccaactccctctctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcc 9594031  T
Q  113 tgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9594032 cgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctccg 9594074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 27790950 - 27790743
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||| | || ||| ||||| |  ||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||    
T  27790950 aaaacacttgaggctcttctctatttcaaccactcaactttattatgatgatttagacttgcttctatttatgcgtcattttgtactatggatccaagat 27790851  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatacccc 479  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||  ||||| |||| || |||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27790850 atttaaaccatgtaatttggagtattttatgacctcccaccttcacctccatggtagaac--tacttatccttttgttgaagttacactccatataccct 27790753  T
Q  480 gtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||    
T  27790752 gtcttgcttc 27790743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30679389 - 30679218
Alignment:
Q  160 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 259  Q
    |||||||| | ||||||||||  ||||||| | ||| || |  | ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| || |||||| ||||    
T  30679389 acttacttgattctcgtgttgattcttaactgtccaacattatgcaccatacaacatcgtcggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaactta 30679290  T
Q  260 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataa 331  Q
     |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30679289 tgtggtactttcttatcgctcaaaacacctgagcctcttctctatttcaaccacccaacttgaatacgataa 30679218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 21352067 - 21352171
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  21352067 ccaaatcatctaagcctattttctaccaatttttctactataggtgctacctccactctctctaacgatgttattcctaatcctatcatatctagtctta 21352166  T
Q  125 ccact 129  Q
    |||||    
T  21352167 ccact 21352171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12890640 - 12890559
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattc 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12890640 atgcccaaaccatgtaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctccctaatggtgtcattc 12890559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 338
Target Start/End: Original strand, 2065018 - 2065302
Alignment:
Q  61 actataggtgctacccccactctctct------aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||| ||||||||  | | |||| ||||||||    
T  2065018 actataggtgcttcccccactctctctttttctaatggtgtcattactaatcctatcatatgtagtcttaccgctcatccagggtagcatcctcatctcc 2065117  T
Q  155 gttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttca 254  Q
    | || || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| | | || | || | ||||||||| ||  || ||||||    
T  2065118 gctacacgtacttgattctcgtgttggctcttaaccgtccaacattccgtaccatacaacatcgccagttttacggttgtccgatagaagtttcctttca 2065217  T
Q  255 gcttaagtggttttttcttatcgcacaaaaca-cctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacat 338  Q
     ||||||  ||  |||||||||  | |||||| ||  || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  2065218 acttaagatgtactttcttatcaaataaaacacccaaagtctcttttccatttcaacaacacatcttgaatacgatgatttacat 2065302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5080888 - 5080776
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc--tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  5080888 tttctaccaacttttctactataggtgatacccccactcgttctctaatggtgtcattcctaatcttattatgtctaatcttaccagttatccagcgcaa 5080789  T
Q  142 catcatcatctcc 154  Q
    |||| ||||||||    
T  5080788 catcctcatctcc 5080776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Original strand, 28027071 - 28027248
Alignment:
Q  40 ctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca-ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacg 138  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| ||||| |  ||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||     
T  28027071 ctattttctaccacattttctactataggtgctaccccattctctatctaacgacgtcattcctaatcctatgccatctagtcttaccactcatccaaca 28027170  T
Q  139 caacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
     |||||| || |||| | ||| ||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  28027171 taacatcctcgtctctgctatgcttacttgattctcatgttggttcttaacctcccaacactccataccatacaacat 28027248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9568717 - 9568590
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct----ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||| |||||||| | || ||    |||||||| |||||||  |||| ||||| |||||    
T  9568717 tgcccaaaccatctaagtccattttccatcatcttttctactataagtgctacctcaacactggcgctctaatgttgtcatttataattctatcatgtct 9568618  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9568617 agtcttaccacacatccaacgcaacatc 9568590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3632724 - 3632653
Alignment:
Q  367 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3632724 tatggatccaagatatttaaatcgtgtaatttagggtatgatatgatctccaactttcacctcaaaggtaga 3632653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 30670556 - 30670469
Alignment:
Q  406 atatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttcatctca 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  30670556 atatgatctccaactttcacctccaaggtatacc--tacttctccttttgctaaagatacattctatatactccgtcttgcttcttctca 30670469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33084111 - 33083983
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||   ||||||  |||| |||||   |||||||    
T  33084111 cccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctaccataggtgctaccccaactctctctctaatatcgtcatttctaattctatcccatctagtc 33084012  T
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  33084011 ttaccacacatccaacgcagcatcctcat 33083983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 21870299 - 21870473
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||  |||| ||||| ||||||||    
T  21870299 atgcccaaaccacctaagccgagtttctaccatcttttctactacaggtgctaccccaactctct--aatattgacatttctaattctatcatgtctagt 21870396  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactc 201  Q
    | |||||    ||||| |||||||  | ||||||  || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  21870397 catacca----tccaatgcaacattctaatctcctctaaactaattttactctcgtgttggttctgaaccgaccaacactc 21870473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 30679462 - 30679417
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactata 66  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30679462 atgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactata 30679417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 33998291 - 33998364
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33998291 ctctctctaatgtagtcatttctaatcctatcacatctagtcttaccacacatccaacgcaacatcttcatctc 33998364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8364628 - 8364523
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |  || ||||||  |||||||  ||||||||||   ||||||    
T  8364628 atgcccaaaccacctaagcctattttcaaccaccttttctactatagttgctactccaa--ctgtctaatattgtcatttctaatcctatcccatctagt 8364531  T
Q  121 cttaccac 128  Q
    ||||||||    
T  8364530 cttaccac 8364523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5095910 - 5095816
Alignment:
Q  40 ctattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcat 132  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||    
T  5095910 ctattttctaccatctattctactataggtgatatcccaacactccctctaatgtagtcattcctaatcctatcccttccagtcttaccactcat 5095816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 6641632 - 6641761
Alignment:
Q  18 tagatgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactc--tctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgt 115  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||  |||||||   |||| ||||   |    
T  6641632 tagatgcccaaacaacccaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgataccccaactctatctctaatattgtcatttccaatcttatcccat 6641731  T
Q  116 ctagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  6641732 ctagtcttacaaaacatcgaacgcaacatc 6641761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 7150604 - 7150678
Alignment:
Q  79 actctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||||||||| | || |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||    
T  7150604 actctctctaatgttttcgttccaaatcctatctcgtctagtcttaccacacatccaaagcaacattagcatctc 7150678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Original strand, 7513617 - 7513738
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||   |||||  ||||  ||||  |||||||    
T  7513617 atgcccaaaccacctaagtctaggttctaccatcttttctattataggtgctccccgaactctctctaatg---tcatttctaattatatcgcgtctagt 7513713  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||    
T  7513714 cttaccacacactcaaggcaacatc 7513738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 396
Target Start/End: Original strand, 6641916 - 6642013
Alignment:
Q  299 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 396  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||  |||||| |||||||    
T  6641916 ctccatttcaaccacccaactttaattcaatggtttacatctccttctatttctctctcattttgtactatagccctaagatgcttaaactgtgtaac 6642013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 179
Target Start/End: Original strand, 12134141 - 12134287
Alignment:
Q  35 taagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcat 132  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| | |  |||||||||||  |||||||  |||| |||| |  ||| ||||| |||| |||    
T  12134141 taagcctattttccaccatcttttctactataggtcgtacctcaattctctctctaatattgtcatttctaattctatatcatcttgtcttgccacacat 12134240  T
Q  133 ccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    ||||| ||||||  ||||||| | ||| |||| |||| |||||||||    
T  12134241 ccaacacaacattctcatctctgctatgcttagtttattctcgtgtt 12134287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 33497014 - 33496963
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactatttt-ctaccaacttttctactataggtgctacc 75  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33497014 ccaaaccatctaagcctatttttctactaacttttctaccataggtgctacc 33496963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2079286 - 2079208
Alignment:
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcact 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| | |||| |||| ||| ||||    
T  2079286 ttaccacacatccaacacaacatcatcatctccgctacgcttattttattctcgtgttagttcttcaccgtccatcact 2079208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 2689696 - 2689646
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgc 71  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2689696 atgctcaaatcatctaagcctattttctacaaacttttcaactataggtgc 2689646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 7513305 - 7513367
Alignment:
Q  115 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtg 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||  ||| |||  ||||||||||||    
T  7513305 tctagtcttaccacacatccaacgcaacatcttcgtctccactattcttgttttactctcgtg 7513367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24665862 - 24665818
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggt 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24665862 ccaaaccacctaagcctattttctaccatattttctactataggt 24665818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31818582 - 31818526
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct 83  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31818582 aaaccacctaagtctattttccaccattttttgtactataggtgctaccccgactct 31818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 42854234 - 42854708
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta--atggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  42854234 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttctctgctataggtgttacccccactctctctctgatggtgtcattcctaatcctattctgtctagtct 42854333  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42854334 taccacttatccagcgcaacatcgtcatctccgctacactaactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgtcgg 42854433  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854434 tctgactgctgtccgatagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttga 42854533  T
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  42854534 atacgatgatttacatctgcttctatttctcaaacattttgtacgatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccacctt 42854633  T
Q  422 tcacctccaaggtagacccac----actt---ctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||||     |||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42854634 tcacctccaaggtagacccacttctccttttgctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 42854708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 36565467 - 36565936
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36565467 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtcta 36565566  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||| | |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  36565567 gtcttaccactcatccaacgcatcatcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 36565666  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36565667 ccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagc 36565766  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36565767 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 36565866  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  36565867 actttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgttgaagttacatttcatatactctatcttgcttc 36565936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 67 - 489
Target Start/End: Original strand, 12492116 - 12492537
Alignment:
Q  67 ggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttact 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||     
T  12492116 ggtgctacccccattctctctaatggtgtcattcataatcctatcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatatctgctacacttaca 12492215  T
Q  167 ttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtt 266  Q
    | | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  | ||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||     
T  12492216 tgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatgcaacaacgccggtcggacggctgtccgatagaactttcctttcatcttaagtggta 12492315  T
Q  267 ttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat 366  Q
     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  12492316 ctttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccaacctgaatacgatagcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtac 12492415  T
Q  367 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttac 465  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||  | |||||||||    
T  12492416 gaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttatccttccgctgaagttac 12492513  T
Q  466 attccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  12492514 attccatatactccgtcttgcttc 12492537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 489
Target Start/End: Original strand, 15215558 - 15215965
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15215558 ctctctctaatggtgtcatttctaatcctatcctgtatagtcttaccactcatccagcacaacatcctcatctccgcttcacttactttactctcgtgtt 15215657  T
Q  180 ggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |  ||||||| ||||    
T  15215658 ggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattttcggtctgactactgttcgatagaactttcctttcagcttaagtgatactttcttaccgca 15215757  T
Q  280 caaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgc-ttctatttctccatcattttgtattatggacccaag 378  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| |||||||||||     
T  15215758 caagacactggaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatgatttacatctgctttctatttct--gtcactttgtactatggacccaat 15215855  T
Q  379 atatttaaaccgtgtaac-ttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatacc 477  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||     
T  15215856 atatttaaaccgtgtaactttgggtatgatatgatctccaactttcacctccatggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacatttcatgtact 15215953  T
Q  478 ccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||    
T  15215954 ccgtcttgcttc 15215965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 36545205 - 36544739
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct----aatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36545205 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgttacccccactctctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtc 36545106  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||     
T  36545105 tagtcttaccactcatccaacacaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactcggtaccatacaacaa 36545006  T
Q  217 tgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 316  Q
     |  |||     |||| ||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36545005 cgctggt-----tgctatccgatagaactttcttttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttatccatttcaaccaccca 36544911  T
Q  317 gcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctc 415  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36544910 acttgaatacgatgacttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagccccatgatatttaaaccttgtaacttggggtatgatatgatctc 36544811  T
Q  416 caactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36544810 caactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttc 36544739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18125224 - 18124825
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttac 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  18125224 caaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcatttctaatcctatcatgtctcgtcttgt 18125125  T
Q  126 cactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtct 225  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18125124 cactcatccagcgcaacatgctcatctccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgttggtct 18125025  T
Q  226 gactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaata 325  Q
    ||||| ||||||||| ||| || |||||| | ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  18125024 gactgttgtccgatagaactttcctttcaac-taagtggtactttcttatcacataaaacacctgaggtttttctccatttcaaccattcagcttgaatt 18124926  T
Q  326 cgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttca 424  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||| |||||| |    
T  18124925 cgatgagttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga--caaaatatttaaaccatataacttaggatatggtatgatctcaaactttta 18124828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 489
Target Start/End: Original strand, 8879669 - 8880129
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  8879669 cccaaatcatctaagtctattttctaccaacttttctactataggtgcttcccccattctctctctaattgtgtcattcctaatcctatctagtccagtc 8879768  T
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcg 221  Q
    |||||||| ||| |  |||||||  ||||||||| || |||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||| ||| |       |||||||| || |    
T  8879769 ttaccacttatcaagtgcaacattctcatctccgctacacttacttgattcttgtgctggctcttcaccgcccaacacaca------tacaacatagtag 8879862  T
Q  222 gtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttg 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||| | ||    
T  8879863 gtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggttcttctctatttcaaccatccaacatg 8879962  T
Q  322 aatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaact 420  Q
    ||||||||  | | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  8879963 aatacgatgctattcatctggttctatttctccttcattttgtactatgagcccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgattttcaact 8880062  T
Q  421 ttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||| || ||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  8880063 ttcaccttcacggtcgacc--tacttctccttttgctgaagttacatttcatgtactccgtcttgcttc 8880129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39946909 - 39946603
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta--atggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39946909 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctttctataatggtgtcattcataatcctatcatgtctagtct 39946810  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||    
T  39946809 taccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacattccgtaccatacaacatcgccgg 39946710  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
     ||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39946709 cctgactgctgtccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccatccagcttga 39946610  T
Q  323 atacgat 329  Q
    |||||||    
T  39946609 atacgat 39946603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 216 - 485
Target Start/End: Original strand, 4032917 - 4033185
Alignment:
Q  216 ttgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccc 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4032917 ttgtcggtctgactgttgtccgataaaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccc 4033016  T
Q  316 agcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatct 414  Q
    | |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4033017 aacttgaatatgatgatttacatatgcttttatttctccatcattgtgtactatgaacccaagatacttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatct 4033116  T
Q  415 ccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttg 485  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4033117 ccaactttcatctccaaggtagacc--ttctactccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttg 4033185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Original strand, 18752106 - 18752344
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  18752106 ccaaaccatctaag-ctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcatccctaatcctattatgtctagtctta 18752204  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
     ||||||| || ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18752205 acactcattcagcgcaacattctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgtccagcactccgtaccatacaacattgccggtc 18752304  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtgg 264  Q
    |||||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  18752305 tgactgttgtccgatagaactttcctttgagcttaagtgg 18752344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 36395175 - 36395443
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaa-gactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36395175 atgcccaaaccatctaaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcctgtct 36395274  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgtt---atacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36395275 agtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacaacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaac 36395374  T
Q  215 attgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaa 283  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36395375 aacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaa 36395443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37077809 - 37077490
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||            || ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37077809 atgcccaaaccatctaagtctattttctaccaacttttctac------------cctcactctcttccgaatggtgtcattcctaatcctatctcgtcta 37077722  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  37077721 gttttaccactcatccagcgcaacatcctcatctccgccacacttacttgattctcgtgttggctcttaactgcccaacactccgtaccatacagcatcg 37077622  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||||||||| |||| || | ||| |  |||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  37077621 acggtctgactgttgtctgacataacttccctttcaacttaagtggtacttacttatcacacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacttagc 37077522  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctattt 350  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37077521 ttgaatacgatgatttacatcggcttctattt 37077490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25300251 - 25299950
Alignment:
Q  63 tataggtgctacccccac--tctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttata 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| || | || |    
T  25300251 tataggtgctacccccacactctctctaatggtgtccttcctaatcctatctcatctagtcttaccactaatccagctcaacatcctcatatctgctaca 25300152  T
Q  161 cttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaa 260  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||  |||| |||  |||| ||| || |||||| |||||    
T  25300151 cttatttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaa 25300052  T
Q  261 gtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatt 360  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25300051 ttggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccatcatt 25299952  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  25299951 tt 25299950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2796613 - 2796326
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2796613 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggcgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtcta 2796514  T
Q  119 --gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||| || ||||     
T  2796513 tagtcttaccactcatccagcgcaacatcctcatctttgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccacccaagactcggtaccatataacaa 2796414  T
Q  217 tgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccat 304  Q
     |||||||| |||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  2796413 cgtcggtctaactgttgtccaatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacagaacaccgaaggctcttctccat 2796326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25288916 - 25288613
Alignment:
Q  63 tataggtgctacccccac--tctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttata 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| || | || |    
T  25288916 tataggtgctacccccacactctctctaatggtgtccttcctaatcctatctcatctagtcttaccactaatccagctcaacatcctcatatctgctaca 25288817  T
Q  161 cttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaa 260  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||  |||| |||  |||| ||| || |||||| |||||    
T  25288816 cttatttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaa 25288717  T
Q  261 gtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca--cccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatca 358  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||    
T  25288716 ttggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccgtca 25288617  T
Q  359 tttt 362  Q
    ||||    
T  25288616 tttt 25288613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40813380 - 40813223
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct----aatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40813380 atgcccaaaccatctaaacctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctaatggtgtcattcttaatcctattatgtc 40813281  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctc 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | || |||||||||| ||||    
T  40813280 tagtcttaccactcatccaacacaacatcctaatctctgctacacttactttattctc 40813223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45419293 - 45419159
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||    
T  45419293 atgcccaaaccacctaagtctattttataccatcttttctactataggtgctaccccaattctctctaatggtgtcattcctaatcttatcccttctagt 45419194  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45419193 cttaccactaatccaacgcaacatcttcatctccg 45419159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 267 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13984842 - 13984672
Alignment:
Q  267 ttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat 366  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||     
T  13984842 ttttcttatcacataaaacacttgaggctcttcttcatttcaaccatccaacttaaatacgatgatttacatctgcttttatttctttgtcatttt-tac 13984744  T
Q  367 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  13984743 tatggacccaagatatttaaaccgtgtatcttggggtatgatatgatcttcttctttcaccttcaaggtaga 13984672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29735802 - 29735454
Alignment:
Q  80 ctctctctaa-tggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgt 178  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||  |||| || | ||||||||    
T  29735802 ctctctctaaatggtgttattcttaattctttctcgtctagtcttaccattcatccaacacaacatcctcatctccactacgcttatttcattctcgtgt 29735703  T
Q  179 tggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgc 278  Q
    ||| | |||| | | || |||||  |||| |||||||| ||   ||||||| |||||||||| ||  ||  ||||| ||||||  ||  ||||||| |      
T  29735702 tggtttttaatcactcaacactctttaccatacaacatcgt---tctgactactgtccgatagaattttcatttcaacttaagcagtgctttcttaccag 29735606  T
Q  279 acaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaag 378  Q
    | || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||         
T  29735605 ataacacacatga-actcatctccatttcaaccacccaacttgaataagatgatttacatatgcttctatttctccgtcattttgaactatggac----- 29735512  T
Q  379 atatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
       |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29735511 --gtttaaatcgtataacttggggtatgatatgatctcccactttcacctccatggtaga 29735454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 422
Target Start/End: Original strand, 30113423 - 30113827
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||  |||||||| ||||| |||| | ||||    
T  30113423 atgcccaaaccaattaaacctattttctaccatcttttctactatatgtgttaccccgactctctctctaataatgtcattcataatcttatcatatcta 30113522  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
     ||||| ||  |||| | | ||||||  ||||||||  ||  |||| |||| |||| |||||| ||||||||||  | || ||| || | |||||||| |    
T  30113523 ttcttaacaaacatctagcacaacattctcatctcctctacgcttattttattctcatgttggttcttaaccgcataacattccatatcatacaacatcg 30113622  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
    ||  | |||  | ||| ||||| ||  ||||||||| |||||  ||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  30113623 tcaatttgatagttgttcgatataatttttctttcaacttaatcggtattt-cttatcacataaaacacctgcgactcttctccatttcaaccatttagc 30113721  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttc-tatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctcc 416  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||  ||  |||||||||| |||  | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  30113722 ttgaatacaatgatttacatctgcttcttttttctccgtcattttatattacagattcaagatatttgaactatataatttggagtatgatatgatctcc 30113821  T
Q  417 aacttt 422  Q
    ||||||    
T  30113822 aacttt 30113827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25439391 - 25439249
Alignment:
Q  220 cggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 319  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  25439391 cggtctgactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccatcctgct 25439292  T
Q  320 tgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 362  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25439291 tgcatacgatgatttacatatgcttctatttctccgtcatttt 25439249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 435
Target Start/End: Original strand, 6510654 - 6511059
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||  ||||| |||||  ||||||    
T  6510654 atgcccaaaccatctaaatttgttttctaccaacttttctattataggtgctacgctctctctcttcaatggtgtcatttctaatcatatctcatctagt 6510753  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||  | |    ||||||| |||||||| |||  |||  ||         ||| |||    
T  6510754 cttaccacttatccaacacaacatcatcatc-ccgctacacttactcgattagtatgttggcacttaaccgtccaagactatgt---------catcgtc 6510843  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca-caaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 319  Q
    |||||||||  |||| | || ||| || |||||| ||||||  ||  ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6510844 ggtctgactaatgtctgttagaactttcctttcaacttaagcagtactttcttatcacatcaaaccacatgagactcttctccatttcaaccactcaact 6510943  T
Q  320 tgaatacgataattta-catctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaa 418  Q
    ||||| | || |||||  | ||||||| |||||||| ||| ||| || || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||  | || |||||| |||    
T  6510944 tgaatgcaatgatttatgacctgcttccatttctccttcactttatactacggatccaagatatttataccatgtaacttggg-gttatgtgatcttcaa 6511042  T
Q  419 ctttcacctccaaggta 435  Q
    | || ||||||||||||    
T  6511043 cctttacctccaaggta 6511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 434
Target Start/End: Original strand, 28300596 - 28300747
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    |||||| | ||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||  ||| |||||||||    
T  28300596 aaaacatccgagtctcttctccaatttaaccatccaacttgaatacgatgatgtacatctgcttttatatctcagtcattttgtaccatgaacccaagat 28300695  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 434  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28300696 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctccagctttcacctctaaggt 28300747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Original strand, 13171875 - 13172072
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||  |||||||  ||||||||||  |||||    
T  13171875 atgcccaaaccacctaagcatattttccaccatcttttctactataggtgcttccccaactctctctctaatcttgtcatttctaatcctatcccgtcta 13171974  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||  ||||||| | | | |||| |||| | |  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  13171975 gtcttactacacatccaatgcaacattctcatctctgatgtgcttaatttatttttatgttggttcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacat 13172072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 425
Target Start/End: Original strand, 19293776 - 19293913
Alignment:
Q  289 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19293776 tgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaagatatttaaac 19293875  T
Q  389 cgtgtaa-cttgggtatgatatgatctccaactttcac 425  Q
    ||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  19293876 cgtgtaatctggggtttgatacgttcttcaactttcac 19293913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 437
Target Start/End: Original strand, 41444809 - 41444949
Alignment:
Q  299 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatta-tggacccaagatatttaaaccgtgtaact 397  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  ||||||    
T  41444809 ctccatttcaaccaccttgcttgtattcaatgatttacacttgcttctatttctacatcattttgtatcattgaacccaagatatttaaaccaagtaact 41444908  T
Q  398 tg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  41444909 tgtggtatgatatgatctccacctttcacctctaagttaga 41444949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8932754 - 8932679
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattc 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932754 ccaaaccatctaaatctattttctaccaacttttctactgtatgtgctacccccactctctctaatggtgtcattc 8932679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 273 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35601799 - 35601686
Alignment:
Q  273 tatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga 372  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35601799 tatcacacaaaacacttgagagtcttctccatttctatcacccaa-ttgaattcgataatttacatctacgtctatttctctgtcattttgtattatgga 35601701  T
Q  373 cccaagatatttaaa 387  Q
     ||||||||||||||    
T  35601700 tccaagatatttaaa 35601686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 437
Target Start/End: Original strand, 33830721 - 33830875
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||    
T  33830721 aaaacacttgagactcttcaacattttaaccatccaacttgaacacgatgatttacatatgcttttatttcttcgtcattttgtacaatggacccaaaat 33830820  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  33830821 atttaaactgtgtaactt--atatgataagatatccaactttcatgtctaaggtaga 33830875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38667351 - 38667205
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||| | || |||| ||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  38667351 aaaacacattaggctctactctatttcaaccatccaactttaatacgatgatttacatcttcttttatttctctatcgttttgtactatgaacccaagat 38667252  T
Q  381 attt-aaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    |||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38667251 atttaaaactttgtaactt--gtatgatatgatctccaagtttcacctc 38667205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 11523949 - 11524040
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaa-gactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatccta 109  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11523949 atgcccaaaccatctaaagcctattaactaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatccta 11524040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 25985334 - 25985129
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||| |||||  ||| || | ||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| || |||| ||    
T  25985334 aaaacacttgaggcactcctccatttcaactacccattttggattcaatggtttacatctccttctatttctccatatttttgtactatagatccaatat 25985235  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatacccc 479  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||   |  |||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |     
T  25985234 atttaaaccgtgtaacttgtggtatgatatga--tccaactttcacctctaagctaga--aatgcttcgcctcttgctaaacttacattccatatactct 25985139  T
Q  480 gtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||    
T  25985138 gtcttgcttc 25985129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 476
Target Start/End: Original strand, 18849624 - 18849797
Alignment:
Q  290 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaacc 389  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||     ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||       ||||||||||||||    
T  18849624 gagactcttatccatttcaaccacccagcttg-----gatgatttacatttgcttctatttctccgtcactttatacta-------aagatatttaaacc 18849711  T
Q  390 gtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatac 476  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | | |   ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18849712 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaatttttacctctaaggcataac--tacttcaccttttgttgacgttatattccatatac 18849797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13589247 - 13589084
Alignment:
Q  268 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 367  Q
    |||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |    
T  13589247 tttcttatagcataaaacacatcaggctcttctccatttcaaccatccaccttgaatatggtgattttcatatgcttctatttcttcatcattttatact 13589148  T
Q  368 atggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctcca 430  Q
    |  ||||||| || |||  | | ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  13589147 aacgacccaatatttttgtatcatgtaacttgggatttgatatgatctctcactttcacctcca 13589084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Original strand, 42493536 - 42493663
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||   ||||| |||||| ||| |||||    
T  42493536 ccaaaccacctaagcctagtttccacaatcttttctactataggtgttaccccaactctctccaatgttgtcatttacaatccaatcttgactaatctta 42493635  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatct 152  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  42493636 ccacacaaccaacgcaacatcctcatct 42493663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 12491364 - 12491418
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacc 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491364 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacc 12491418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13986536 - 13986383
Alignment:
Q  35 taagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcat 132  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | || ||||  |||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  13986536 taagtctattttctaccatattttgtactataggtgctaccccaaatccctctttaatgatgtcattcctaattatatctcgtctagtattaccactcat 13986437  T
Q  133 ccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctctt 186  Q
    |||  | |||||| ||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  13986436 ccagtgtaacatcctcatctccgctatgcttacctgattctcgtgttggttctt 13986383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25985552 - 25985462
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatcc 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  25985552 tttctaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctctaatgttgtcgtttctaattctatcctgtcttgtcttaccacacatcc 25985462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Original strand, 12796926 - 12797011
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatc 106  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  12796926 atgcctaaatcatctaagcctattttctaccaacttttcttctataggtgttacctccactctttctaatggtgttattcctaatc 12797011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32043642 - 32043522
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||  |||| |||||  |||||||||    
T  32043642 ccaaaccaccaaagtctagtttctaccatcttttgtactataggtgataccccaactctctctctaatgttgtcatttctaattctatcccgtctagtct 32043543  T
Q  123 taccactcatccaacgcaaca 143  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  32043542 taccacacatccaacgcaaca 32043522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 141
Target Start/End: Original strand, 44681269 - 44681387
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccact--ctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  44681269 ccaaaccttctaagcttattttccaccatcttttctattataggtgctaccacaactgtctctctaatgttgtcatttctaatcttatctcgtctagtct 44681368  T
Q  123 taccactcatccaacgcaa 141  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  44681369 taccacacatccaatgcaa 44681387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 45512721 - 45512889
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc----cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||  | |||||  ||| |||| | | ||    
T  45512721 atgcccaaaccatctaagcttattttccatcatcttttctactataggtgctaccccaactccctctctttaatattttcatttctaacccta-cctatc 45512819  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctctt 186  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||| ||||    
T  45512820 tagtcttaccacacatccaacgaaacattctcatctccgctatgcttattttattttcgtgttggttctt 45512889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29520681 - 29520583
Alignment:
Q  56 tttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatct 152  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29520681 tttctactatagatgccaccccaactctctctctaatggtatcatttctaatcctatcccatctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatct 29520583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 216
Target Start/End: Original strand, 9905223 - 9905309
Alignment:
Q  130 catccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||    
T  9905223 catccaatgcaacatcctcatctccgttatactaactttattctcgtgttggttattaaccgtccaacactatgtaccatacaacat 9905309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 10080133 - 10080264
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||| | | ||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||  |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  10080133 atgcccaaaccatc-aggcctagtttccaccatcttttctact-tagatgctacctcaactctctctctaatgttgtcatttctaatcttatctcgtcta 10080230  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatct 152  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  10080231 gtcttaccaaacacccaacgcaacatcatcatct 10080264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Original strand, 45332039 - 45332117
Alignment:
Q  345 ctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaacttt 422  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45332039 ctatttctccaccgttttgtactatgaagccaggatatttaaaccgtgtaacttgtggtatgacatgatctccaacttt 45332117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30748513 - 30748384
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||   ||| |||| |||||||||||  ||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||| |    
T  30748513 atgcccaaaccacctaagccttgattccaccatcttttctactactggtgcgaccacaactctctgtaatgttgtcatttctaatcctatcatgtctaat 30748414  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
    || ||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  30748413 ctaaccacacatccaacgaaacatcctcat 30748384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36143421 - 36143243
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||| | |  |||||||||  | || ||  |||||||||||  ||||||    
T  36143421 atgcccaaaccacctaagtctattttccaccatctattctgctataggtgctacctcga--ctctctaatcttttcctttctaatcctatctcatctagt 36143324  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactc 201  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| | ||   | | |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  36143323 cttaccacacgaccaacacaacatcctcatctctgctacgttgattttattctcgtgttggttcttcaccgcccaacactc 36143243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21121180 - 21121105
Alignment:
Q  55 ttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccac 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21121180 ttttgtactataggtgctacccccactctctctctaatggtgccatttctaatcctatcccgtctagtcttaccac 21121105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 33666726 - 33666829
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  33666726 tgcccaaaccatttaagtagagtttctaccatcttttctacgataggtgctaccccaactctctct-cttatgtcattcttaatcctatctcatctagcc 33666824  T
Q  122 ttacc 126  Q
    |||||    
T  33666825 ttacc 33666829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 314
Target Start/End: Original strand, 10824546 - 10824609
Alignment:
Q  251 ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 314  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10824546 ttcaacttaactggtattttcgtatcacataaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 10824609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Original strand, 39760683 - 39760845
Alignment:
Q  54 cttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatc 151  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||| | |||||  || |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  39760683 cttttctacgataggtgctaacccaactctgtctctaatgttatcatttctactcctatcttgtctaatcctaccacacatccaacacaacatcctcatc 39760782  T
Q  152 tccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaac 214  Q
    || | || ||||  |||  |||||| |||| |||| |||| ||| ||| |||| || ||||||    
T  39760783 tctgctacacttcattttttctcgtattggttctttaccgtccaacaccccgtcccatacaac 39760845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6986603 - 6986525
Alignment:
Q  294 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga 372  Q
    ||||||| ||||||   ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6986603 ctcttcttcatttcggtcactcagattgaattcgataatttacatatgcttcgatttctctatcattttgtattatgga 6986525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7046390 - 7046285
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccc--ccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| | |  ||| |||| ||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  7046390 atgcccaaaccagctaagccgaggttccaccatcttttctacgattggtgctacccagcctctctctctaatgttgtcatttctaatcctatcatgtcta 7046291  T
Q  119 gtctta 124  Q
    ||||||    
T  7046290 gtctta 7046285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Original strand, 2518623 - 2518742
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccact--ctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| | |  |||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  2518623 caaaccacctaaacctattttccaccatcttttctacttgaggtgctaccccaattttctctctaatt-tgtcatttctaatcctatctcatctagtctt 2518721  T
Q  124 accactcatccaacgcaacat 144  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  2518722 accacacatccaatgcaacat 2518742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9695687 - 9695583
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| |||||||  |||| ||||| ||||||    
T  9695687 atgcccaaaccacctaagccgagtttccaccatcttttctactataggtgctaccccaaatatctctataatgttgtcatttctaattctatcctgtcta 9695588  T
Q  119 gtctt 123  Q
    |||||    
T  9695587 gtctt 9695583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16351411 - 16351312
Alignment:
Q  56 tttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||  |||  ||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  16351411 tttctactataggtgctaccctaattctctctctaatgttgtcatttctaactctattccgtctagtcttaccacatatccaacgcaacatcttcatctc 16351312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25439477 - 25439397
Alignment:
Q  63 tataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25439477 tatagttgctacccccactctct--aatggtatcgttcctattcctatctcatctagtcttaccactaatccagcgcaacatc 25439397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16252984 - 16252855
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttac 125  Q
    |||||||||  || ||| |||||| || ||||||| | ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||  ||||  |||||  |||| ||||||    
T  16252984 caaaccatcctagtctagtttctatcatcttttcttccataggagcaacctcaactctctctaatgttgtcatttctaattttatctcatctaatcttac 16252885  T
Q  126 cactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  16252884 cacacatccaacacaacatcctcatttccg 16252855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35601598 - 35601501
Alignment:
Q  290 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaa 387  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| | || || |||| | | || ||||||||||||||    
T  35601598 gagactattctccatttcaatcacccggattgaattcgataatttacatctacgtctctttcttcgtcgttgtgtactttagatccaagatatttaaa 35601501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 156
Target Start/End: Original strand, 37256011 - 37256080
Alignment:
Q  87 taatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgt 156  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||  | |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37256011 taatggtgtcatttctaattctatctcatttagtttaaccactcattcaacgcaacatcatcatctccgt 37256080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 427
Target Start/End: Original strand, 43732230 - 43732279
Alignment:
Q  379 atatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacct 427  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43732230 atatttaaaccgtgttacttgtgctatgatatgatctccaactttcacct 43732279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43732396 - 43732355
Alignment:
Q  283 aacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43732396 aacacttgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaat 43732355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16705788 - 16705700
Alignment:
Q  49 accaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaac 137  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||  |||| |||||   |||||||||||||| || |||||    
T  16705788 accatcttttttactatagatgctactccaactctctctaatgttgtcatttctaattctatcccatctagtcttaccacacaaccaac 16705700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 29700332 - 29700268
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct 85  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29700332 atgcccaaaccacctaagccaactttcctccatcttttctactataggtgctaccccaactctct 29700268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 2776455 - 2776522
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca-ctctctct 87  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2776455 atgcccaaaccacctaagccgagtttctaccatcatttctacgataggtgctacccccagctctctct 2776522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5908675 - 5908594
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctacccc--cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||    
T  5908675 tttcaaccatcttttctactataggttctaccccaactctctctctaatgttgtcatttctaatcttatcccgtctagtctt 5908594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 77
Target Start/End: Original strand, 25985839 - 25985881
Alignment:
Q  35 taagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc 77  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25985839 taagtctagtttctacaaacttttctactataggtgctacccc 25985881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 154
Target Start/End: Original strand, 30783331 - 30783401
Alignment:
Q  84 ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctcc 154  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  30783331 ctctaatgttgtcatttctaatcctatcctatctagtcttgccacagatccaacgcaagatcctcatctcc 30783401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36069639 - 36069573
Alignment:
Q  79 actctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36069639 actctctctaatgttgtcgtttctaatcttatcccgtctagtcttaccacacatccaacacaacatc 36069573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 13172147 - 13172200
Alignment:
Q  294 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttcta 347  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  13172147 ctcttctctatttcaaccaccctgcttgaatacaatgattcacatttgcttcta 13172200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16917240 - 16917080
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctc--taatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||  |||| |||||||||| | ||| ||||||| ||| | ||  ||||| ||||||| |||||||||||  | | |    
T  16917240 atgcccaaaccacctaagcctagtttgcaccatcttttctactttcggtactaccccaactttatcactaatgttgtcatttttaatcctatccagccga 16917141  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||  ||||||| | ||| |||| |||| | |||||||    
T  16917140 gtcttaccacaaagtcaacgcaacattctcatctctgctatgcttaatttattttcgtgtt 16917080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Original strand, 17491994 - 17492035
Alignment:
Q  161 cttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactcc 202  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17491994 cttactttattctcgtgttggttcttaaccgcccaacactcc 17492035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3285163 - 3285135
Alignment:
Q  400 ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285163 ggtatgatatgatctccaactttcacctc 3285135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 34196128 - 34196064
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct 85  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34196128 atgcccaaaccacataagtctagtttctactgttttttctactataggtgctaccccaactctct 34196064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 41444556 - 41444608
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc 77  Q
    |||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41444556 ccaaaccacctaaacctagtttccaccatcttttctactataggtgctacccc 41444608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 363
Target Start/End: Original strand, 44681543 - 44681644
Alignment:
Q  260 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 359  Q
    |||||| ||||| |||| || | ||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  44681543 agtggtattttcgtatcacatagaacacttgatgctcttctccatttcaaacactcaacttgaatacgctgatttaca--tacttctttttctccatcgt 44681640  T
Q  360 tttg 363  Q
    ||||    
T  44681641 tttg 44681644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1275320 - 1274852
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc-cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  1275320 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctaccatgtctag 1275221  T
Q  120 tcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| | |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |     
T  1275220 tcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctatgcttacttgattctcatgttgactcgtaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgc 1275121  T
Q  220 cggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1275120 cggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccttaggctcttcttcatttcaaccacccagct 1275021  T
Q  320 tgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaa 418  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1275020 tgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaa 1274921  T
Q  419 ctttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1274920 ctttcatctccaaggtagacc--tacttctcctttcgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 1274852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3301896 - 3301436
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3301896 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggggctaccctcactctctctctaatggtgacattcctaatcctatcatgtctagtct 3301797  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||| | |||||||||  |||||||| || |||||||||     |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |    
T  3301796 taccactcatcaagcgcaacatccccatctccgctacacttacttt-----cgtgttggctcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacattgtcag 3301702  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3301701 tctgactactgtccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcatctctatttcaaccacccagcttga 3301602  T
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3301601 atacgatgatttgcatctgcttctatttctccttcatttggtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 3301502  T
Q  422 tcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3301501 tcacctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 3301436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 12492610 - 12493082
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactatag---gtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  12492610 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactatagtaggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcttatcctgt 12492709  T
Q  116 ctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12492710 ctagtcttaccactcatccaacgtaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaaca 12492809  T
Q  216 ttgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccc 315  Q
      | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12492810 aagccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccc 12492909  T
Q  316 agcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatct 414  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12492910 agcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatct 12493009  T
Q  415 ccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| |   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12493010 ccaacttttacctccaaggtagagc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 12493082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 28977085 - 28977552
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  28977085 atgcacaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatttctagt 28977184  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtc 220  Q
     |||||||||||||||| ||||||  ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  28977185 tttaccactcatccaacacaacatactcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtc 28977284  T
Q  221 ggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 320  Q
    | || ||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28977285 gttcggactgatgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagctt 28977384  T
Q  321 gaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaac 419  Q
    |||||||||   |||||||| |||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28977385 gaatacgatggcttacatctacttctattactccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtgacttggggtatgatatgatctccaac 28977484  T
Q  420 tttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28977485 tttcacctctaaggtagacc--tacttctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 28977552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 2075700 - 2076169
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2075700 atgcccaaaccatctaagcctattgtctaccaacttttctactgtaggtgttacccccactctctctctaatgttgtcattcctaatcctatcttgtcta 2075799  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  2075800 gtcttacaactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacg 2075899  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  2075900 ccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttcttcatttcaaccacccaac 2075999  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2076000 ttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 2076099  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||||||  | |||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  2076100 actttcacctccaaggtagaac--tgcttctccttccgctgaagttacattccatgtactctgtcttgcttc 2076169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 10639360 - 10638884
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactatag-------gtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatc 111  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  10639360 atgcccaattcatctaagcctattttctaccaacttttctactatagtctataggtgctagccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatt 10639261  T
Q  112 ttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttac 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  10639260 ctgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttcaccgcccaacactccgtaccatac 10639161  T
Q  212 aacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacc 311  Q
    ||||  ||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10639160 aacaacgtcggtcggactgctgttcgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaacc 10639061  T
Q  312 acccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatg 410  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10639060 acccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatg 10638961  T
Q  411 atctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10638960 atttccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtctttcttc 10638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 24178566 - 24178111
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  24178566 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcatgtata 24178467  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||              ||||||  |    
T  24178466 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgccca--------------acaacaacg 24178381  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24178380 tcggtctgactgctgcccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccaac 24178281  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24178280 ttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatctttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctcca 24178181  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24178180 actttcacttccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 24178111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 1287805 - 1288284
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct------------ctctaatggtgtcattcttaatcct 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||| |||||||| |||||||    
T  1287805 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctctctctctctaatgatgtcattcctaatcct 1287904  T
Q  109 atcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacct 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  1287905 atcatgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtacca 1288004  T
Q  209 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 308  Q
    |||||||  | || || ||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1288005 tacaacaacgccgatcggactgctgttcgatagaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttca 1288104  T
Q  309 accacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgat 407  Q
    |||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1288105 accatccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggactcaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgat 1288204  T
Q  408 atgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1288205 atgatctccaactttcacctccaaggtaga--cttacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 1288284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 70 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20318989 - 20318578
Alignment:
Q  70 gctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactt 167  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  20318989 gctacccccactctttctctaatggtgtcattcctaatcctatcc-----agtcttaccactcatccaacgcaacatcctcatctctgctacacttactt 20318895  T
Q  168 tactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttt 267  Q
     | |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||||||      
T  20318894 gattctcatgttgactcttaaccgcgcaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctatccgatataactttcctttcaacttaagtggta- 20318796  T
Q  268 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 367  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  20318795 ---cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacg 20318699  T
Q  368 atggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttaca 466  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  | ||||||||||    
T  20318698 aaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaac--tacttctccttccgctgaagttaca 20318601  T
Q  467 ttccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  20318600 ttccatatactccgtcttgcttc 20318578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 195 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3394593 - 3394298
Alignment:
Q  195 agcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttct---ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctga 291  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3394593 agcactccgtactatacaacattgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctga 3394494  T
Q  292 gactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgt 391  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3394493 ggctcatctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgt 3394394  T
Q  392 gtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3394393 gtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaa-ttacattccatatactctgtcttgcttc 3394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 16347608 - 16347877
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  16347608 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccgctctctctctaatggtttcatttttaatcatatattgtctagtct 16347707  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  16347708 taccactcatccaacgcaacatcctcatctccgctacacttacttaactctcgtgttggctcttaaccgctcaacactccgtaccatacaatatcgtcgg 16347807  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgag 292  Q
    ||||| || ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16347808 tctgagtgttgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtaatttcttattgcacaaatcacatgag 16347877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34273083 - 34272768
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct------------aatggtgtcattcttaatcct 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||| |||||||    
T  34273083 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctattataggtgctacccccactctctctctctctctctctaatggtgtcattcctaatcct 34272984  T
Q  109 atcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacct 208  Q
         ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| | |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  34272983 -----gtctagtcttaccactcatccaatgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgactcttaaccgcccaacactccgtacca 34272889  T
Q  209 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 308  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  34272888 tacaacaacgtcggccggactgctgtccgattgaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttta 34272789  T
Q  309 accacccagcttgaatacgat 329  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  34272788 accacccaacttgaatacgat 34272768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 269 - 476
Target Start/End: Original strand, 16347879 - 16348084
Alignment:
Q  269 ttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatta 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  16347879 ttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccta-cttgaatacgatgatttacatacgcttttatttctccgtcattttgtacta 16347977  T
Q  369 tggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacat 467  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  16347978 tggacacaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttacat 16348075  T
Q  468 tccatatac 476  Q
    | |||||||    
T  16348076 ttcatatac 16348084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27944 - 27622
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  27944 caaaccacctaagcctattttccatcatcttttctactataggtgctaccctaactctttttcaaatggtgtcattcataatcatatcttgt-tagtttt 27846  T
Q  124 accactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggt 223  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  27845 accactcatctaatgcaacatcctcatctccgttatgcttacttaattctcatgttggttcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcgtctgt 27746  T
Q  224 ctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 323  Q
    | ||||  |||| |||| ||  || |||||| ||||||||||  ||||||||| |  |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27745 ccgactattgtcagatagaattttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacgtaaaacactcgagactcttctctatttccaccacccaacttgaa 27646  T
Q  324 tacgataatttacatctgcttcta 347  Q
    || ||| |||||||| || |||||    
T  27645 tatgatgatttacatttgattcta 27622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36200764 - 36200426
Alignment:
Q  93 tgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgc 192  Q
    |||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||| | ||||  ||||| ||||||||||    
T  36200764 tgtcattcctaatcttatcctatttagtcttaccgctcatccaacgcaacatcctcatctctgatacgcttacttgattctcacgttggttcttaaccgc 36200665  T
Q  193 ccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgag 292  Q
    | | ||||  ||| | |||||||||| | || |||||| |||||| || ||  || |||||| |||||   |  |||||||||| || ||||||| ||||    
T  36200664 ctaccactttgtatcatacaacattgccagtttgactgttgtccggtagaattttcctttcaacttaaacagcattttcttatcacataaaacacatgag 36200565  T
Q  293 actcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 392  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||    
T  36200564 tctcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgctactatttctatgtcattttgtactatgaacccaaaatatttaaacggtg 36200465  T
Q  393 taacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctcca 430  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36200464 taacttgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 36200426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4496440 - 4496312
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatc--ttgtc 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||   ||||    
T  4496440 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccagcttttctactataggtgctacccccactctctctctaaaggtgtcattcctaatcctatcctgtgtc 4496341  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496340 tagtcttaccactcatccaacgcaacatc 4496312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 485
Target Start/End: Original strand, 27302451 - 27302638
Alignment:
Q  294 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 393  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27302451 ctcttttccatttcaaccactcaacttgaatacgatgatttacatct---tctatttctccgccgttttgtattatggacacaagatatttaaaccgtgt 27302547  T
Q  394 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttg 485  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |   ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27302548 agtttgaggtatgatatgatctccaacactcaccttcaaggtagaac--tactttaccttttgttgaagttacattccatatactcagtcttg 27302638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 38685019 - 38684932
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctat 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38685019 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctat 38684932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 43558318 - 43558450
Alignment:
Q  297 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 396  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43558318 ttctccatttccactaccctgcttgaattcgatgatttacatctgcttctatttctctgtggttttgtacaatggacctaagatatttaaatcgtgtaac 43558417  T
Q  397 ttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43558418 ttgtggtatgctatgatctccaactttcacctc 43558450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32516606 - 32516475
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttacc 126  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||  |||  ||||| ||||||||||||||    
T  32516606 aaaccacctaagcctattttccaccatcttttctactataagtgttactccaactctctctaatgttgtcatttctaagtctatcctgtctagtcttacc 32516507  T
Q  127 actcatccaacgcaacatcatcatctccgtta 158  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32516506 acacatccaacacaacatcatcatctccgtta 32516475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15168844 - 15168721
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccc--actctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15168844 ccaaaccaccttagcctattttctaccatcttttctactataggtgctaccccccaactccctctaatggtgtcattcttaatcctatctcgtctaatct 15168745  T
Q  123 --taccactcatccaacgcaacat 144  Q
      | ||||||||| ||||||||||    
T  15168744 tgtgccactcatctaacgcaacat 15168721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Original strand, 26884918 - 26885040
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttc-tactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtc 121  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||     
T  26884918 ccaaaccgcctaagcctattttctaccaacttttcctgctataggtgctaccctcactctctttctaatggtgttattcctaatcctatcccgtctagtt 26885017  T
Q  122 ttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26885018 ttaccactcatccaacgcaacat 26885040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 31636146 - 31636253
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||| |||||  |||||||    
T  31636146 atgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgctaccccaactttctctaatgctgtcatttataattctatccagtctagt 31636245  T
Q  121 cttaccac 128  Q
    ||||||||    
T  31636246 cttaccac 31636253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 340 - 437
Target Start/End: Original strand, 17341748 - 17341846
Alignment:
Q  340 tgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17341748 tgcttctatttctctatcattttctactatggacccaatatatttaaaccatgtaatttcaggtatgatatgatctccaacttccacctccaaggtaga 17341846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14665766 - 14665658
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct------ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  14665766 ccaaaccatctaagcctattttctatcaacttctctactataggtgctacccccactctctctctctctaatggtgtcatttctaatcctatcatgtcta 14665667  T
Q  119 gtcttacca 127  Q
    | |||||||    
T  14665666 ggcttacca 14665658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3097216 - 3096828
Alignment:
Q  34 ctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatc 133  Q
    ||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||| |||||  |||||  |||||| |||  || ||||    
T  3097216 ctaagtctagtttctagcatcttttctaatataggtgttaccccaactctctataatgtcgtcatttttaattttatctcatctagttttataacacatc 3097117  T
Q  134 caacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctg 233  Q
    ||||| |||||| || |||| || | |||||||| |   ||||||||| | || |||| ||| || |  || || |||||||| |||||||| || | ||    
T  3097116 caacgtaacatcctcgtctctgtcacacttacttaatgttcgtgttggttatttaccgtccaacattttgtcccgtacaacatcgtcggtcttaccgttg 3097017  T
Q  234 tccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatt 333  Q
    | ||||||||  |||| |||| |||||| ||| |||||  ||| || ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||  ||    
T  3097016 ttcgataaaaa-tttccttcaacttaagcggtattttcacatcacataaaacacctaaggctctcatccatttcaaccacccaacttgaatttgatggtt 3096918  T
Q  334 tacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    || |||  ||| |||       |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  3096917 tatatccccttatat------gtcattttgtactataaacccaagatatttaaaccatgtaacttgtgctgagatatgatctctaactttcacctc 3096828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 11002649 - 11002781
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagt 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||| |||||   ||| ||    
T  11002649 atgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatgttttctactgtaggtgctacccgaactctctctaatgttgtcatttctaattctatcccatctcgt 11002748  T
Q  121 cttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  11002749 cttaccacacatccagcgcaacatcctcatctc 11002781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 376
Target Start/End: Original strand, 43423578 - 43423656
Alignment:
Q  298 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccca 376  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  43423578 tctccatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctgtttctccgtcattttgtactacggaccca 43423656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33667272 - 33667194
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcatt 99  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  33667272 atgcccaaaccacctaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgctaccccaactctcgttaatgttgtcatt 33667194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Original strand, 418211 - 418318
Alignment:
Q  21 atgcccaaacca--tctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||||||||||  |||||| | | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||     
T  418211 atgcccaaaccaggtctaagccaaatttctgccatcttttctaccataggtgctaccccaactctctctaatgttgtcatttctaattctatcatgtctc 418310  T
Q  119 gtcttacc 126  Q
    ||||||||    
T  418311 gtcttacc 418318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Original strand, 20077305 - 20077413
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat-tatggacccaaga 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |    
T  20077305 aaaacacctgaggctcttctccatttcaaccatccaacctgaaaatgatgatttgcatctgctttaatttctccgtcattttgtataaatgaacccaaaa 20077404  T
Q  380 tatttaaac 388  Q
    |||||||||    
T  20077405 tatttaaac 20077413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20456824 - 20456776
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctac 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20456824 caaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctac 20456776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 219702 - 219804
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaa 141  Q
    |||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  219702 tttccaccaccttttcaacgataggtgctaccccaactctctctccaatgttgtcattcgtaatcttatctcgtcttgtcttaacacgcatccaacgcaa 219801  T
Q  142 cat 144  Q
    |||    
T  219802 cat 219804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5305611 - 5305496
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||  | ||| |||| |||| |||||||||    
T  5305611 ctctctctaatgttgttatttctaattctatcttgtctagtcttaccacacatccaacgcaacatccccgtctttgctattcttattttattctcgtgtt 5305512  T
Q  180 ggctcttaaccgccca 195  Q
     | || ||||||||||    
T  5305511 cgttcataaccgccca 5305496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14667816 - 14667753
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14667816 cccaaaccacctaagtctattttccaccatcttttctactataggtgctaccccaactctctct 14667753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36215553 - 36215422
Alignment:
Q  22 tgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctag 119  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||| | |||||    
T  36215553 tgccgaaaccatctaagcatatttcctaccaacttttctactatagatgctacctccactctctccctaatg--gtcattcataatcatatcatatctag 36215456  T
Q  120 tcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    | ||||  |||||| | ||||||||  |||||||    
T  36215455 ttttactgctcatctagcgcaacatactcatctc 36215422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14749359 - 14749297
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14749359 ccaaaccatctaagtctagtttctaccaatttttctactataggtgctacaccaactctctct 14749297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7678471 - 7678340
Alignment:
Q  84 ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggct 183  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||  || ||||  | || ||||||||||| |    
T  7678471 ctctaatgttgtcatttctaatcctatcctatctagtcttgccacagatccaacgcaacatcctcatctccactacacttgttctattctcgtgttggtt 7678372  T
Q  184 cttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    ||| | |||||| |||||||| || ||||||||    
T  7678371 cttca-cgcccaacactccgttccatacaacat 7678340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27602 - 27518
Alignment:
Q  402 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgctt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |   ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  27602 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggcataac--tacttcgcctattgttgaagttacattccctatactctgtcttgctt 27518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 34194721 - 34194848
Alignment:
Q  18 tagatgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||  |||| |||| ||||| |  |||||||| || ||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||||| |||||    
T  34194721 tagatgcccaaaccacctaggcctggtttccaccatcttttatgttataggtgttatcccaactctctctaatgtttacatttctaatcctatcctgtct 34194820  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  34194821 agttttaccacacatccaacacaacatc 34194848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 421
Target Start/End: Original strand, 38578992 - 38579130
Alignment:
Q  281 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 380  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||   ||||| |||  || |||||||||| |||  || ||||||    
T  38578992 aaaacacatgaggcactcctccatttcaaccactcagcttggattcgatcgtttacat---cttctgttttcccgtcattttgtactatcaactcaagat 38579088  T
Q  381 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  38579089 atttaaactgtgtaacttgtgctataatatgatctccaactt 38579130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27998391 - 27998317
Alignment:
Q  107 ctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttgg 181  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| || ||| |||||||||    
T  27998391 ctattttgtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatctctgatatgcttaattcactttcgtgttgg 27998317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Original strand, 10082965 - 10083096
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccccca--ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    ||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||| | |||||  |||| |||||  |||||    
T  10082965 atgccgaaaccacttaagtctagtttctaccatcttttctactataggtgataccccaatgctctccctaatgttctcatttctaattctatcccgtcta 10083064  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatc 151  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  10083065 gtcttaccacacat-caaagcaacatcctcatc 10083096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 145
Target Start/End: Original strand, 17340724 - 17340789
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatc 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17340724 ctctctctaatggtgtcattcctaatcacatttcttctagttttaccactcatccaacgcaacatc 17340789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 18351134 - 18351190
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc 77  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18351134 atgcccaaaccacctaagcctagtttctaccatattttctactataggtgctacccc 18351190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21952346 - 21952274
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatct 152  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  21952346 ctctctttaatgctgtcatttctaatcttatctcgtctagtcttaccacacatgcaacgcaacatcctcatct 21952274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23979930 - 23979820
Alignment:
Q  374 ccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccata 473  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   ||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  23979930 ccaagatatctaaattgtgtaacttc--tatgatatgatctccaactttcacctctaaggttgaac--tactttgtcttttgttgaagttacattacata 23979835  T
Q  474 taccccgtcttgctt 488  Q
    ||||  |||||||||    
T  23979834 taccatgtcttgctt 23979820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Original strand, 28186956 - 28187028
Alignment:
Q  81 tctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctc 153  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  28186956 tctctctaatgttgtcatttctaatcctaccatgtctagtcttaccacacatccaatgcaacattctcatctc 28187028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 34040032 - 34039960
Alignment:
Q  80 ctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatct 152  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  34040032 ctctctctaatggtgtaatttttaatcctatcatatctagttttatcattcatccaacgcgacatcctcatct 34039960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 428
Target Start/End: Original strand, 6368478 - 6368561
Alignment:
Q  346 tatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6368478 tatttctccgtcgttttgtactatagatacaagatatttaaattgtgtaacttgtggtatgttatgatctccatctttcacctc 6368561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16454679 - 16454600
Alignment:
Q  107 ctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctctt 186  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16454679 ctatcatgtctagttttaccaaacatccaatgcatcatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttggttctt 16454600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21915619 - 21915532
Alignment:
Q  342 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21915619 cttctatttcttcgttattttgtactattgaaccaatatatttaaaccgtgtaacttgtattatgatataatctcgaactttcacctc 21915532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 28676651 - 28676596
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctaccc 76  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28676651 atgccgaaaccacctaagactattttccaccatcttttctactatagctgctaccc 28676596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37124278 - 37124207
Alignment:
Q  367 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 437  Q
    ||||||| |||| |||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37124278 tatggactcaagctatttaaacaatgtaacttgttgtatgatttgatctccaactttcacctctaaggtaga 37124207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9235062 - 9235000
Alignment:
Q  82 ctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacat 144  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9235062 ctctctaatgttgtcatttataatcctatcccgtctagtcttaccacacatccaatgcaacat 9235000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28676314 - 28676253
Alignment:
Q  289 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttc 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  28676314 tgagattcttctccatttcaaccacaca-cttgaatacgatgatttgcatatgcttctatttc 28676253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21093736 - 21093663
Alignment:
Q  115 tctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaa 188  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||  || ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  21093736 tctagtcttaccacacatacaacgcaacatcctcatatccactacacttattttattctcgtgttggttcttaa 21093663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25937780 - 25937719
Alignment:
Q  367 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggta-tgatatgatctccaactttcacct 427  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25937780 tatggacccaagatatttaatttgtgtaatttggggaatgatatgatctccaactttcacct 25937719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2713000 - 2712936
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct 85  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  2713000 atgcccaaaccacctaagtctagtctctaccatcttttagactataggtgctaccccaactctct 2712936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31906711 - 31906592
Alignment:
Q  27 aaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctct--ctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||  || | ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||   ||||||| |||    
T  31906711 aaactatctaagaatatttccgaccaacttttctattgtaggtgtcactctcactctctccctaatgatgtcattcctaatcctattccgtctagtttta 31906612  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacat 144  Q
    ||  ||||| ||||||||||    
T  31906611 ccgttcatcgaacgcaacat 31906592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33006711 - 33006587
Alignment:
Q  26 caaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttac 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || || ||||||| ||||| | || ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| |||||     
T  33006711 caaaccatctaagtctaatttatatcatcttttcttctatatgagcaacctcaactctctctaatgttgtcatttttaattttatctcgtctaatcttag 33006612  T
Q  126 cactcatccaacgcaacatcatcat 150  Q
     || ||| |||| ||||||| ||||    
T  33006611 aacacattcaacacaacatcctcat 33006587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6889045 - 6888931
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||  |||  |||||||  ||||| |||||  ||||||||    
T  6889045 ccaaaccacttaagcctattttccaccatcttttcctctatacgtgctaccccaactctttctgtaatattgtcatttctaatcatatctcatctagtct 6888946  T
Q  123 taccactcatccaac 137  Q
    |||||| ||||||||    
T  6888945 taccacacatccaac 6888931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 15489718 - 15489784
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||||||||||||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  15489718 atgcccaaaccatctaagctgagtttcaaccatcttttctacaataggtactaccccaactctctct 15489784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27553830 - 27553760
Alignment:
Q  85 tctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27553830 tctaatagtgtaatttttaattctatctcttctagtcttactattcatccaacacaacatcttcatctccg 27553760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 43475293 - 43475243
Alignment:
Q  24 cccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctac 74  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  43475293 cccaaaccacctaagcctagtttccaccatcttttctactataggtgctac 43475243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Original strand, 4026565 - 4026678
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctcta-atggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctt 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||| || ||| |||||| |||||||||  ||| | || || |||||| |||||  |||||||||    
T  4026565 ccaaaccacctaagactagtttccaccatcttttttactttacgtgttaccccaactctctcttcatgttctcgtttttaatcttatctcatctagtctt 4026664  T
Q  124 accactcatccaac 137  Q
    ||||| ||| ||||    
T  4026665 accacacatacaac 4026678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 179
Target Start/End: Original strand, 5848401 - 5848462
Alignment:
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgtt 179  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| ||||    
T  5848401 agtcttaccacacatccaatgcaacatcctcatctctgctacacttattttactctcatgtt 5848462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 151
Target Start/End: Original strand, 43558135 - 43558172
Alignment:
Q  114 gtctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatc 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43558135 gtctagtcttaccacacatccaacgcaacatcctcatc 43558172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 79547 - 79503
Alignment:
Q  43 ttttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct 87  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  79547 ttttccaccatcttttctactataggtactaccccaactctctct 79503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1174633 - 1174549
Alignment:
Q  44 tttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccac 128  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||   |||| |||||||||    
T  1174633 tttctaccatcttttctactatggctgttaccccaactctctctgatgctgtcatttataatcatatcccatctaatcttaccac 1174549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 31524 - 31055
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  31524 atgcccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcttatcctgtcta 31425  T
Q  119 gtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |    
T  31424 gtcttaccactcatccaacgcaacatcctaatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccgtacaacaccg 31325  T
Q  219 tcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagc 318  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31324 ccggtctgactgctgttcgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagc 31225  T
Q  319 ttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 417  Q
    |||||||||||    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31224 ttgaatacgatggcctacatctacttttatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatgtttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca 31125  T
Q  418 actttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31124 actttcacttccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactcagtcttgcttc 31055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 44094 - 44233
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatgg-----tgtcattcttaatcctatcttgt 115  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   || |     ||||||| ||||| ||||    |    
T  44094 atgcccaaaccacctaagcctattttccgccatcttttctactataggtgctaccccaactctctaatattgtcaattgtcatttttaatactataccat 44193  T
Q  116 ctagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccg 155  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  44194 ctagtcttaccgcacatccaacgcaacatcctcatctccg 44233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 82773 - 82356
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctct--aatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtct 122  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82773 ccaaatcatctaagcccattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcttaatcctatcatgtctagtct 82674  T
Q  123 taccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcgg 222  Q
    ||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  82673 tactactcatccagtgcaacatcctcatctccgctgcacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaagatcgtcgg 82574  T
Q  223 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 322  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  82573 tctgactgttgtccgatagaactttcctttcaacttaaggagtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctctttcccattgcaaccacccagcttga 82474  T
Q  323 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  82473 atacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttttactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatataatctccaactt 82374  T
Q  422 tcacctccaaggtagacc 439  Q
    || ||||||||| |||||    
T  82373 tcgcctccaaggcagacc 82356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 11822 - 12293
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccact----ctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtc 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||    
T  11822 atgcccaaatcatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactatctctctctgatggtgtcattcctaatcctattatgtc 11921  T
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | || || ||||| | |||| ||||| |||||| ||||||| || |  ||||| | |||||     
T  11922 tagtcttaccgctcatccagcgcaacatcctcatctctgctacacatacttgattctcatgttgactcttacccgcccaacattttgtaccatgcaacaa 12021  T
Q  217 tgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 316  Q
       || ||||| ||||| |||||||||| || |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||    
T  12022 ctccgttctgattgctgaccgataaaactttccttttaacttaagaggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggttcttctccatttcaacgaccca 12121  T
Q  317 gcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctc 415  Q
    |||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12122 gcttaaatacgatggcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctc 12221  T
Q  416 caactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 489  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  12222 caactttcaccgcgaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttacattctatataatccgtcttacttc 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 117 - 475
Target Start/End: Original strand, 2594 - 2951
Alignment:
Q  117 tagtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 216  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | || |||||||| | | || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||     
T  2594 tagtcttaccactcatccaatgaaacatcctcatctctgctacacttacttgattatcatgttgactcttaaccgcccaacactccataccatacaacaa 2693  T
Q  217 tgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 316  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2694 cgtcagtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccca 2793  T
Q  317 gcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctc 415  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2794 gcttgaatacgatgacttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctc 2893  T
Q  416 caactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatata 475  Q
    |||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2894 caactttcacctccaatgtaga--ctgacttctccttccgctgaagttacattccatata 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 1178 - 1271
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtcta 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1178 ccaaaccatctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctaccctcactctctctaatggtgtcattcataatcctatcctgtcta 1271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Original strand, 25683 - 25859
Alignment:
Q  33 tctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactct--ctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtcttaccactc 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25683 tctaagcctattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctctaatggtgtcattcctaatcctatcatgtctagtcttaccactc 25782  T
Q  131 atccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc 207  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25783 atccaacacaacatcctaatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtacc 25859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 4497 - 4687
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccc---cactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtct 117  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  4497 atgcccaaactatctaagcctattttttaccaacttttctactataggtgccaccccactctctctctctaatggtgtcatttataatcctatcatgtct 4596  T
Q  118 agtcttaccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacct 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| | |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  4597 agtcttaccattcatccaacgcaacatcctcatatctgttaaatttacttgattctcgtgttgactcataaccgtccaacactccgtacct 4687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 388
Target Start/End: Original strand, 86839 - 87204
Alignment:
Q  25 ccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtcattcttaatcctatcttgtctagtctta 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |    | | | ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||    
T  86839 ccaaactatctaagactattttctaccaacttttctactctctctctctctctctctctctctaatggtgtcatttctaatcttatcctttctggtctta 86938  T
Q  125 ccactcatccaacgcaacatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  86939 ccactcatccagcgcaacatcctcatctcctctacacttacttgagtctcatgtcggctcttaaccg-ccaacact--gtaccatacaaaatcgttggtc 87035  T
Q  225 tgactgctgtccgataaaaccttt-----ctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 319  Q
    |||||||||||| ||| | | |||      ||||| |||||||| |  |||||||| ||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| | | |     
T  87036 tgactgctgtccaatagagcttttttttcttttcaacttaagtgatactttcttattgcataaaacccccgaggcttttctccatttcaaccatcaaaca 87135  T
Q  320 tgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 388  Q
    |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  87136 tgaatatgatgagttacatctgattctatttctccgacattttatactatggacccaagatatttaaac 87204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 489
Target Start/End: Original strand, 88514 - 88618
Alignment:
Q  384 taaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtc 482  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  88514 taaaccatgtaacttgaagtatggtatgatttccatctttcatctccaaggtaaacctac--ttctccttttgctgaagttacattccatatactctgtc 88611  T
Q  483 ttgcttc 489  Q
    |||||||    
T  88612 ttgcttc 88618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5911 - 5834
Alignment:
Q  356 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaag 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5911 tcattttgtattgtggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaag 5834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7497 - 7422
Alignment:
Q  21 atgcccaaaccatctaagactattttctaccaacttttctactataggtgctacccccactctctctaatggtgtc 96  Q
    |||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7497 atgcccaaaccaactaagcgtgttttctacaaacttttgtactttacgtgctacccagactctctctaatggtgtc 7422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 362
Target Start/End: Original strand, 41 - 156
Alignment:
Q  249 ctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca--cccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 346  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  41 ctttcaacttaattggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttct 140  T
Q  347 atttctccatcatttt 362  Q
    ||||| || |||||||    
T  141 atttccccgtcatttt 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9434 - 9303
Alignment:
Q  298 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaact 397  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| | ||  ||||||||| |||| |||||| |||| |||| || |||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  9434 tctccctttcaactacccagtttgaatcctatgttttacatctccttccatttcttcatcgttttataatataaacctaagatatttaaatcgtgtaact 9335  T
Q  398 -tgggtatgatatgatctccaactttcacctc 428  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9334 aataatatgatatgatctccaacttttacctc 9303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University