View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14349_low_56 (Length: 372)

Name: NF14349_low_56
Description: NF14349
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14349_low_56
NF14349_low_56
[»] chr5 (80 HSPs)
chr5 (160-350)||(6500443-6500632)
chr5 (160-342)||(40296292-40296473)
chr5 (162-351)||(6500814-6501002)
chr5 (160-350)||(27502013-27502202)
chr5 (188-350)||(18603124-18603286)
chr5 (184-350)||(32487386-32487551)
chr5 (184-349)||(41170627-41170792)
chr5 (185-345)||(36492218-36492378)
chr5 (160-339)||(25327938-25328117)
chr5 (184-342)||(15370099-15370257)
chr5 (188-351)||(624187-624350)
chr5 (171-342)||(3295002-3295172)
chr5 (184-339)||(3295345-3295498)
chr5 (173-342)||(13415750-13415918)
chr5 (160-340)||(42405574-42405752)
chr5 (184-352)||(9498655-9498822)
chr5 (162-342)||(41632782-41632961)
chr5 (159-342)||(26074121-26074304)
chr5 (162-340)||(26074614-26074792)
chr5 (160-340)||(1028493-1028673)
chr5 (172-340)||(6224198-6224366)
chr5 (184-335)||(11416977-11417128)
chr5 (160-342)||(36568545-36568725)
chr5 (184-341)||(299490-299647)
chr5 (188-332)||(34753029-34753173)
chr5 (184-342)||(12662652-12662810)
chr5 (191-340)||(26075168-26075318)
chr5 (183-342)||(35150007-35150165)
chr5 (184-350)||(623810-623976)
chr5 (154-316)||(15370428-15370589)
chr5 (188-330)||(33747783-33747925)
chr5 (207-345)||(29549278-29549416)
chr5 (204-350)||(5723811-5723957)
chr5 (172-340)||(24489194-24489360)
chr5 (210-340)||(26074807-26074938)
chr5 (192-337)||(38427553-38427697)
chr5 (192-342)||(26590918-26591068)
chr5 (186-340)||(300961-301107)
chr5 (184-340)||(35167838-35167994)
chr5 (173-339)||(2411010-2411176)
chr5 (184-339)||(35914852-35915007)
chr5 (267-350)||(7768842-7768925)
chr5 (210-341)||(36521922-36522053)
chr5 (174-256)||(26900007-26900089)
chr5 (247-340)||(42508614-42508707)
chr5 (224-339)||(36522277-36522392)
chr5 (262-340)||(26074320-26074398)
chr5 (224-342)||(31509623-31509742)
chr5 (205-339)||(41635212-41635346)
chr5 (185-340)||(13786002-13786157)
chr5 (217-328)||(31509745-31509857)
chr5 (224-275)||(13042606-13042657)
chr5 (184-255)||(38427306-38427377)
chr5 (261-340)||(39309686-39309764)
chr5 (183-284)||(13785631-13785732)
chr5 (206-258)||(795254-795306)
chr5 (204-271)||(9498343-9498410)
chr5 (206-285)||(36527117-36527196)
chr5 (247-340)||(42524719-42524811)
chr5 (224-284)||(32445943-32446003)
chr5 (228-275)||(13112604-13112651)
chr5 (282-339)||(6225047-6225104)
chr5 (302-350)||(5660290-5660338)
chr5 (217-305)||(19275566-19275653)
chr5 (224-262)||(13042784-13042822)
chr5 (224-262)||(13112782-13112820)
chr5 (300-342)||(35150747-35150789)
chr5 (300-342)||(35151038-35151080)
chr5 (186-284)||(42435486-42435583)
chr5 (188-240)||(24489583-24489635)
chr5 (224-275)||(36389016-36389067)
chr5 (230-260)||(5963765-5963795)
chr5 (210-288)||(9510546-9510624)
chr5 (293-350)||(22298956-22299014)
chr5 (208-244)||(795152-795189)
chr5 (188-252)||(5660340-5660405)
chr5 (230-271)||(34103625-34103666)
chr5 (184-237)||(35150810-35150863)
chr5 (307-339)||(13785732-13785764)
chr5 (230-274)||(41341523-41341567)
[»] chr1 (78 HSPs)
chr1 (160-351)||(44290800-44290992)
chr1 (184-351)||(44290458-44290625)
chr1 (184-350)||(41759475-41759641)
chr1 (173-350)||(3537589-3537765)
chr1 (184-342)||(41142372-41142531)
chr1 (173-342)||(41157375-41157545)
chr1 (162-351)||(48588465-48588655)
chr1 (184-340)||(26661522-26661678)
chr1 (160-342)||(41156991-41157175)
chr1 (188-350)||(3550712-3550871)
chr1 (187-340)||(17294579-17294733)
chr1 (160-342)||(31767138-31767319)
chr1 (193-340)||(37556113-37556260)
chr1 (160-351)||(45493951-45494146)
chr1 (184-342)||(29798199-29798357)
chr1 (160-342)||(34364507-34364688)
chr1 (184-340)||(34649440-34649596)
chr1 (183-342)||(34364925-34365084)
chr1 (184-342)||(5319965-5320123)
chr1 (184-334)||(14318875-14319025)
chr1 (184-350)||(50052024-50052189)
chr1 (192-341)||(40082408-40082556)
chr1 (172-338)||(9955911-9956079)
chr1 (184-340)||(11977282-11977438)
chr1 (160-350)||(32168674-32168853)
chr1 (216-348)||(32594748-32594880)
chr1 (160-342)||(45084382-45084557)
chr1 (173-342)||(22077484-22077653)
chr1 (186-342)||(3875333-3875489)
chr1 (171-342)||(37850588-37850758)
chr1 (199-345)||(38804370-38804516)
chr1 (207-340)||(26661921-26662054)
chr1 (193-339)||(37555733-37555878)
chr1 (191-342)||(24600321-24600472)
chr1 (188-342)||(66476-66630)
chr1 (184-342)||(39066201-39066358)
chr1 (160-336)||(5575110-5575284)
chr1 (263-351)||(3537226-3537314)
chr1 (160-342)||(24131965-24132143)
chr1 (160-342)||(41184383-41184583)
chr1 (222-353)||(44043810-44043946)
chr1 (175-317)||(22077101-22077243)
chr1 (190-341)||(22793279-22793431)
chr1 (195-342)||(66100-66247)
chr1 (173-342)||(22077818-22077986)
chr1 (192-332)||(5528762-5528902)
chr1 (162-342)||(19283434-19283613)
chr1 (194-342)||(30630648-30630796)
chr1 (194-340)||(45839629-45839779)
chr1 (184-271)||(11977015-11977102)
chr1 (160-342)||(21378036-21378199)
chr1 (194-342)||(44685456-44685605)
chr1 (171-342)||(1188574-1188746)
chr1 (184-272)||(50051689-50051776)
chr1 (171-342)||(1187349-1187522)
chr1 (160-271)||(47380143-47380254)
chr1 (185-327)||(44091909-44092051)
chr1 (224-300)||(10351202-10351278)
chr1 (195-315)||(4956218-4956340)
chr1 (310-350)||(50051777-50051817)
chr1 (295-342)||(35154150-35154197)
chr1 (283-342)||(50469180-50469239)
chr1 (276-342)||(4878803-4878869)
chr1 (248-293)||(41184152-41184197)
chr1 (184-243)||(4266798-4266855)
chr1 (182-342)||(5996870-5997029)
chr1 (227-287)||(35154046-35154106)
chr1 (277-350)||(4266875-4266948)
chr1 (185-301)||(9499020-9499136)
chr1 (224-260)||(12466365-12466401)
chr1 (310-342)||(22077248-22077280)
chr1 (274-333)||(30630912-30630972)
chr1 (290-342)||(47379891-47379943)
chr1 (223-269)||(9956212-9956258)
chr1 (172-249)||(30697310-30697387)
chr1 (160-202)||(45084576-45084617)
chr1 (224-260)||(31973375-31973411)
chr1 (206-342)||(50556451-50556587)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (184-351)||(29518911-29519078)
chr6 (184-350)||(29518495-29518661)
chr6 (184-350)||(32741171-32741337)
chr6 (184-351)||(2378117-2378284)
chr6 (160-350)||(35210196-35210384)
chr6 (194-350)||(3409251-3409407)
chr6 (12-159)||(485549-485696)
chr6 (160-350)||(3058218-3058409)
chr6 (184-351)||(3409651-3409818)
chr6 (173-352)||(3415448-3415629)
chr6 (184-350)||(14748342-14748504)
chr6 (184-340)||(2377756-2377912)
chr6 (171-342)||(2579860-2580030)
chr6 (184-349)||(1846741-1846906)
chr6 (184-340)||(2578443-2578598)
chr6 (173-342)||(10074352-10074521)
chr6 (171-336)||(16454913-16455078)
chr6 (194-350)||(26544041-26544197)
chr6 (172-350)||(1127352-1127530)
chr6 (182-342)||(10073989-10074149)
chr6 (184-340)||(16454577-16454733)
chr6 (193-340)||(16107680-16107827)
chr6 (184-336)||(2843560-2843713)
chr6 (171-341)||(2578822-2578991)
chr6 (162-340)||(5832007-5832182)
chr6 (170-337)||(2579478-2579645)
chr6 (159-342)||(10073592-10073772)
chr6 (187-339)||(6999799-6999951)
chr6 (171-342)||(593694-593867)
chr6 (160-340)||(2579087-2579261)
chr6 (199-339)||(1950200-1950340)
chr6 (234-337)||(32460630-32460733)
chr6 (188-342)||(10911565-10911720)
chr6 (185-340)||(16108065-16108208)
chr6 (217-336)||(9062383-9062501)
chr6 (171-342)||(12071678-12071849)
chr6 (171-342)||(12085021-12085191)
chr6 (190-357)||(5958613-5958776)
chr6 (172-342)||(12092470-12092640)
chr6 (210-342)||(6071132-6071264)
chr6 (161-342)||(31714671-31714849)
chr6 (223-342)||(8481927-8482045)
chr6 (157-338)||(17135044-17135223)
chr6 (226-327)||(2975567-2975668)
chr6 (269-322)||(35210498-35210551)
chr6 (172-335)||(30618606-30618766)
chr6 (230-274)||(22605301-22605345)
chr6 (191-238)||(3409405-3409452)
chr6 (223-274)||(11637760-11637811)
chr6 (259-305)||(14789279-14789325)
chr6 (230-274)||(21130103-21130147)
chr6 (192-250)||(10902438-10902496)
chr6 (224-266)||(11638053-11638095)
chr6 (160-217)||(2975296-2975352)
chr6 (160-208)||(35210554-35210601)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (184-351)||(36178605-36178772)
chr2 (160-350)||(41283451-41283641)
chr2 (186-351)||(37106179-37106344)
chr2 (184-350)||(14745667-14745833)
chr2 (184-351)||(5542625-5542792)
chr2 (184-346)||(37105920-37106082)
chr2 (188-351)||(5543002-5543165)
chr2 (184-340)||(6421387-6421543)
chr2 (187-342)||(962598-962753)
chr2 (190-340)||(15880265-15880415)
chr2 (184-342)||(42514649-42514807)
chr2 (184-335)||(15511495-15511646)
chr2 (184-342)||(35580724-35580881)
chr2 (184-324)||(36178171-36178311)
chr2 (184-326)||(6422126-6422268)
chr2 (184-340)||(6712978-6713135)
chr2 (191-351)||(14745300-14745461)
chr2 (191-340)||(36005887-36006035)
chr2 (185-342)||(38796619-38796778)
chr2 (160-337)||(33731653-33731831)
chr2 (187-342)||(40679632-40679787)
chr2 (160-342)||(37632575-37632755)
chr2 (184-340)||(40733519-40733675)
chr2 (194-350)||(1769884-1770040)
chr2 (174-351)||(7598600-7598769)
chr2 (203-338)||(28254258-28254391)
chr2 (186-342)||(28531316-28531472)
chr2 (235-350)||(36178320-36178435)
chr2 (174-331)||(40163362-40163520)
chr2 (160-329)||(23346250-23346417)
chr2 (184-340)||(40733885-40734040)
chr2 (183-342)||(7598228-7598387)
chr2 (198-340)||(5367457-5367599)
chr2 (185-342)||(29676903-29677065)
chr2 (161-280)||(6421793-6421911)
chr2 (235-342)||(16542449-16542556)
chr2 (184-334)||(29676543-29676687)
chr2 (234-342)||(31468800-31468904)
chr2 (160-288)||(3673122-3673249)
chr2 (194-342)||(12529038-12529186)
chr2 (160-342)||(16590888-16591065)
chr2 (254-339)||(31899496-31899581)
chr2 (184-342)||(30313178-30313335)
chr2 (161-270)||(3672773-3672882)
chr2 (184-340)||(29874023-29874179)
chr2 (230-334)||(37895107-37895211)
chr2 (226-339)||(31259658-31259774)
chr2 (224-342)||(33561491-33561609)
chr2 (264-342)||(38796298-38796376)
chr2 (188-280)||(6421688-6421780)
chr2 (225-342)||(30323464-30323581)
chr2 (197-289)||(36784273-36784365)
chr2 (172-342)||(29873525-29873695)
chr2 (224-342)||(37894732-37894850)
chr2 (285-342)||(36785664-36785721)
chr2 (184-339)||(9231252-9231407)
chr2 (211-341)||(31385738-31385868)
chr2 (237-326)||(28254165-28254254)
chr2 (234-342)||(33953821-33953929)
chr2 (186-339)||(3594180-3594333)
chr2 (171-252)||(31899090-31899170)
chr2 (188-278)||(35580443-35580534)
chr2 (235-339)||(12910231-12910335)
chr2 (235-342)||(41678419-41678527)
chr2 (294-340)||(6421306-6421352)
chr2 (201-342)||(33954279-33954419)
chr2 (224-300)||(30312831-30312907)
chr2 (229-288)||(25390313-25390372)
chr2 (224-275)||(28226404-28226455)
chr2 (280-327)||(42515031-42515078)
chr2 (243-300)||(2336666-2336723)
chr2 (306-342)||(3673085-3673121)
chr2 (224-272)||(8904498-8904546)
chr2 (224-271)||(28226726-28226772)
chr2 (160-238)||(2109988-2110066)
chr2 (226-275)||(13792536-13792585)
chr2 (306-342)||(3672719-3672755)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (160-342)||(1085593-1085774)
chr7 (159-342)||(7517580-7517763)
chr7 (160-348)||(29157559-29157747)
chr7 (184-351)||(37533011-37533177)
chr7 (184-342)||(23377-23535)
chr7 (184-350)||(37533364-37533530)
chr7 (155-335)||(11845198-11845377)
chr7 (184-340)||(30244272-30244428)
chr7 (184-340)||(6054562-6054718)
chr7 (172-340)||(45433243-45433411)
chr7 (184-342)||(40094774-40094932)
chr7 (162-342)||(22567017-22567196)
chr7 (192-342)||(36939741-36939891)
chr7 (213-342)||(7554025-7554154)
chr7 (187-351)||(14681501-14681663)
chr7 (195-340)||(45754718-45754862)
chr7 (194-334)||(19122740-19122879)
chr7 (184-340)||(30245079-30245231)
chr7 (184-342)||(24177435-24177593)
chr7 (186-336)||(34218036-34218186)
chr7 (184-340)||(45434638-45434794)
chr7 (160-342)||(118277-118459)
chr7 (171-340)||(47129097-47129265)
chr7 (160-342)||(8128417-8128599)
chr7 (161-342)||(36622960-36623140)
chr7 (223-342)||(22566702-22566820)
chr7 (184-337)||(30032572-30032725)
chr7 (186-339)||(9901648-9901799)
chr7 (222-342)||(16569196-16569316)
chr7 (222-342)||(16596346-16596466)
chr7 (188-342)||(40230295-40230449)
chr7 (207-339)||(24838724-24838857)
chr7 (216-342)||(1085280-1085407)
chr7 (187-339)||(20599317-20599471)
chr7 (193-342)||(36534795-36534942)
chr7 (184-342)||(41854635-41854792)
chr7 (186-321)||(37167808-37167937)
chr7 (184-300)||(30253534-30253646)
chr7 (160-296)||(28300229-28300366)
chr7 (190-339)||(41910592-41910749)
chr7 (155-261)||(47129450-47129554)
chr7 (221-342)||(43241495-43241616)
chr7 (254-342)||(28301613-28301701)
chr7 (269-342)||(30245494-30245567)
chr7 (269-342)||(30255339-30255412)
chr7 (185-259)||(28300569-28300644)
chr7 (272-342)||(30244701-30244771)
chr7 (274-342)||(36109007-36109075)
chr7 (186-254)||(37532753-37532821)
chr7 (160-241)||(30244453-30244533)
chr7 (160-241)||(30253671-30253751)
chr7 (237-337)||(44361517-44361616)
chr7 (224-275)||(21416181-21416232)
chr7 (160-241)||(30245256-30245336)
chr7 (160-232)||(7517767-7517839)
chr7 (160-232)||(7518033-7518105)
chr7 (225-273)||(23569043-23569091)
chr7 (224-342)||(4124128-4124246)
chr7 (305-348)||(14681281-14681324)
chr7 (195-274)||(40094424-40094503)
chr7 (292-342)||(40094502-40094552)
chr7 (197-259)||(45755010-45755072)
chr7 (230-275)||(21619091-21619136)
chr7 (184-287)||(37393114-37393216)
chr7 (290-340)||(36967335-36967385)
chr7 (224-342)||(37345916-37346036)
chr7 (184-300)||(15902342-15902457)
chr7 (230-274)||(27391815-27391859)
chr7 (159-206)||(7517982-7518029)
chr7 (193-247)||(4719305-4719359)
chr7 (235-275)||(27598052-27598092)
[»] chr4 (105 HSPs)
chr4 (162-351)||(50630731-50630920)
chr4 (160-342)||(25483336-25483517)
chr4 (161-340)||(36629239-36629418)
chr4 (184-350)||(41370349-41370515)
chr4 (175-350)||(55933113-55933288)
chr4 (160-342)||(10245920-10246101)
chr4 (187-342)||(54017596-54017751)
chr4 (160-342)||(3340807-3340988)
chr4 (185-342)||(1731646-1731803)
chr4 (171-340)||(39792845-39793014)
chr4 (184-345)||(50002423-50002584)
chr4 (159-342)||(36608635-36608817)
chr4 (185-340)||(39404400-39404555)
chr4 (160-342)||(22027936-22028117)
chr4 (194-342)||(52884695-52884844)
chr4 (160-340)||(39404020-39404200)
chr4 (171-342)||(44620660-44620830)
chr4 (194-327)||(54108928-54109060)
chr4 (185-340)||(34646648-34646803)
chr4 (160-342)||(22028342-22028527)
chr4 (204-350)||(49880152-49880297)
chr4 (185-339)||(50459724-50459878)
chr4 (184-332)||(54343006-54343147)
chr4 (184-333)||(44620362-44620511)
chr4 (184-340)||(36572021-36572177)
chr4 (194-342)||(52884887-52885038)
chr4 (175-342)||(22183253-22183420)
chr4 (201-342)||(4955332-4955473)
chr4 (184-333)||(44621011-44621160)
chr4 (184-351)||(18932747-18932925)
chr4 (183-342)||(49076828-49076986)
chr4 (184-323)||(54936215-54936353)
chr4 (160-336)||(20825842-20826018)
chr4 (174-341)||(16888804-16888971)
chr4 (191-342)||(32941128-32941279)
chr4 (183-339)||(49302907-49303065)
chr4 (184-343)||(54108537-54108694)
chr4 (171-342)||(2740700-2740869)
chr4 (185-341)||(16889535-16889691)
chr4 (189-336)||(20826223-20826370)
chr4 (213-327)||(45496820-45496934)
chr4 (183-342)||(3244448-3244607)
chr4 (187-342)||(4390102-4390257)
chr4 (233-342)||(2741071-2741180)
chr4 (184-288)||(23817679-23817783)
chr4 (171-340)||(43174508-43174677)
chr4 (224-340)||(41707503-41707618)
chr4 (219-350)||(6975489-6975620)
chr4 (187-342)||(34004586-34004739)
chr4 (184-342)||(49076449-49076604)
chr4 (160-342)||(54741154-54741334)
chr4 (184-342)||(3341128-3341286)
chr4 (196-340)||(19504707-19504842)
chr4 (185-340)||(45489331-45489485)
chr4 (187-342)||(51768061-51768216)
chr4 (187-342)||(3700365-3700512)
chr4 (186-296)||(18879852-18879962)
chr4 (184-302)||(43827480-43827597)
chr4 (190-291)||(31691203-31691306)
chr4 (234-329)||(54017750-54017845)
chr4 (205-340)||(40067045-40067181)
chr4 (184-342)||(28034229-28034387)
chr4 (184-321)||(48111696-48111833)
chr4 (184-320)||(3271806-3271947)
chr4 (173-337)||(760194-760356)
chr4 (201-300)||(15841383-15841482)
chr4 (253-342)||(10246347-10246436)
chr4 (290-350)||(50788087-50788147)
chr4 (276-334)||(44620304-44620362)
chr4 (210-342)||(23556890-23557022)
chr4 (184-336)||(45489712-45489864)
chr4 (184-250)||(43174233-43174299)
chr4 (276-342)||(44621426-44621492)
chr4 (224-275)||(11197293-11197344)
chr4 (224-339)||(34544107-34544225)
chr4 (186-317)||(39698944-39699077)
chr4 (276-340)||(44620946-44621011)
chr4 (160-279)||(11783528-11783646)
chr4 (188-262)||(41370738-41370812)
chr4 (160-229)||(23817431-23817498)
chr4 (254-342)||(11348396-11348484)
chr4 (224-336)||(15841023-15841134)
chr4 (224-275)||(10396198-10396249)
chr4 (224-275)||(10396483-10396534)
chr4 (223-275)||(922485-922537)
chr4 (235-274)||(1868119-1868158)
chr4 (193-232)||(19895406-19895445)
chr4 (148-214)||(1731556-1731621)
chr4 (226-284)||(11706584-11706641)
chr4 (230-276)||(51681604-51681650)
chr4 (171-228)||(11702284-11702341)
chr4 (228-288)||(2891864-2891924)
chr4 (294-342)||(45050601-45050649)
chr4 (188-264)||(50787996-50788072)
chr4 (224-275)||(11197003-11197054)
chr4 (319-350)||(18933103-18933134)
chr4 (244-287)||(45484774-45484817)
chr4 (224-298)||(31249896-31249970)
chr4 (305-351)||(41370692-41370738)
chr4 (224-266)||(41707279-41707321)
chr4 (160-214)||(45496678-45496732)
chr4 (301-342)||(11706636-11706677)
chr4 (194-231)||(19895533-19895570)
chr4 (246-279)||(29802604-29802637)
chr4 (224-260)||(34946151-34946187)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (184-351)||(3669678-3669845)
chr8 (172-350)||(3670052-3670229)
chr8 (172-351)||(30441072-30441255)
chr8 (186-340)||(3038292-3038446)
chr8 (174-340)||(34835211-34835377)
chr8 (192-340)||(34834878-34835026)
chr8 (160-350)||(20870550-20870741)
chr8 (194-342)||(45122067-45122215)
chr8 (192-350)||(1014253-1014411)
chr8 (172-342)||(45121898-45122068)
chr8 (160-340)||(30359273-30359454)
chr8 (181-340)||(25561812-25561972)
chr8 (192-351)||(1013879-1014038)
chr8 (184-342)||(6876862-6877021)
chr8 (183-342)||(9608745-9608904)
chr8 (185-340)||(33113368-33113523)
chr8 (174-340)||(34835476-34835643)
chr8 (174-340)||(34835742-34835909)
chr8 (184-340)||(40518071-40518229)
chr8 (186-340)||(40518584-40518738)
chr8 (184-340)||(37544490-37544646)
chr8 (184-328)||(45122638-45122782)
chr8 (184-339)||(147454-147609)
chr8 (188-335)||(9482608-9482755)
chr8 (184-342)||(9309355-9309512)
chr8 (171-317)||(9483174-9483320)
chr8 (184-340)||(1513915-1514071)
chr8 (187-335)||(70277-70425)
chr8 (184-342)||(8918764-8918922)
chr8 (190-348)||(40579512-40579670)
chr8 (184-342)||(5915872-5916025)
chr8 (186-342)||(5420651-5420807)
chr8 (188-340)||(30359611-30359763)
chr8 (187-342)||(41972158-41972316)
chr8 (184-342)||(45123006-45123164)
chr8 (182-351)||(6731895-6732055)
chr8 (160-332)||(18371970-18372142)
chr8 (184-342)||(9308977-9309139)
chr8 (194-339)||(32640542-32640682)
chr8 (191-340)||(45121663-45121811)
chr8 (185-338)||(18380020-18380171)
chr8 (184-351)||(6651496-6651652)
chr8 (188-335)||(18371665-18371807)
chr8 (184-348)||(32305478-32305635)
chr8 (194-342)||(4154678-4154824)
chr8 (194-342)||(147829-147968)
chr8 (191-342)||(9507777-9507933)
chr8 (205-319)||(9609108-9609222)
chr8 (264-350)||(41416251-41416335)
chr8 (229-339)||(43274824-43274934)
chr8 (171-264)||(41129066-41129159)
chr8 (224-340)||(8794113-8794229)
chr8 (172-342)||(9620666-9620834)
chr8 (184-267)||(40579269-40579352)
chr8 (238-338)||(18372988-18373085)
chr8 (193-342)||(12283873-12284021)
chr8 (270-339)||(18372785-18372854)
chr8 (184-260)||(8919144-8919220)
chr8 (234-340)||(18372656-18372758)
chr8 (173-342)||(4154270-4154438)
chr8 (270-339)||(18372342-18372411)
chr8 (252-339)||(3037776-3037865)
chr8 (193-338)||(43398077-43398225)
chr8 (269-332)||(25561729-25561792)
chr8 (237-337)||(20130454-20130553)
chr8 (210-342)||(5274775-5274907)
chr8 (172-265)||(20995404-20995497)
chr8 (175-339)||(40991756-40991920)
chr8 (184-248)||(43274635-43274699)
chr8 (204-261)||(16524446-16524503)
chr8 (298-339)||(18372485-18372526)
chr8 (160-231)||(3037944-3038016)
chr8 (250-306)||(18373236-18373292)
chr8 (201-288)||(40417733-40417820)
chr8 (188-242)||(18372288-18372342)
chr8 (234-271)||(12156708-12156745)
chr8 (285-342)||(20995502-20995559)
chr8 (265-342)||(33831978-33832055)
chr8 (243-284)||(11442911-11442952)
chr8 (310-342)||(18645713-18645745)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (165-351)||(22304560-22304747)
chr3 (160-340)||(37990615-37990795)
chr3 (174-340)||(37990967-37991133)
chr3 (186-340)||(43346793-43346947)
chr3 (184-340)||(35946524-35946680)
chr3 (160-342)||(15772854-15773035)
chr3 (172-342)||(29644890-29645060)
chr3 (160-342)||(42342364-42342546)
chr3 (192-353)||(39934963-39935126)
chr3 (172-342)||(12114550-12114720)
chr3 (184-342)||(32589704-32589861)
chr3 (184-342)||(33803252-33803410)
chr3 (160-342)||(54017793-54017974)
chr3 (184-342)||(54018198-54018356)
chr3 (184-342)||(29644581-29644739)
chr3 (193-350)||(39389062-39389219)
chr3 (184-342)||(41359765-41359919)
chr3 (184-342)||(25739425-25739583)
chr3 (187-340)||(32462903-32463057)
chr3 (184-340)||(52634678-52634833)
chr3 (184-342)||(21832345-21832501)
chr3 (186-342)||(42342092-42342248)
chr3 (184-350)||(50612447-50612618)
chr3 (192-340)||(22303963-22304104)
chr3 (190-342)||(15773192-15773346)
chr3 (201-351)||(4823646-4823796)
chr3 (183-342)||(31190017-31190168)
chr3 (184-342)||(53577364-53577522)
chr3 (184-340)||(25755396-25755552)
chr3 (160-342)||(1634291-1634473)
chr3 (187-342)||(45395656-45395811)
chr3 (210-335)||(3135099-3135224)
chr3 (184-340)||(3135454-3135617)
chr3 (183-340)||(45901715-45901873)
chr3 (184-341)||(53117975-53118131)
chr3 (182-342)||(39914252-39914412)
chr3 (183-342)||(8327904-8328067)
chr3 (184-340)||(32462558-32462715)
chr3 (184-350)||(37726496-37726654)
chr3 (192-340)||(49336694-49336843)
chr3 (183-350)||(51886553-51886714)
chr3 (185-339)||(11661954-11662108)
chr3 (160-284)||(22303634-22303759)
chr3 (159-340)||(33175634-33175820)
chr3 (191-342)||(9240149-9240300)
chr3 (184-342)||(44160547-44160702)
chr3 (159-332)||(42584799-42584970)
chr3 (160-268)||(41359467-41359575)
chr3 (210-342)||(47964544-47964676)
chr3 (218-316)||(33362327-33362425)
chr3 (235-351)||(3384317-3384433)
chr3 (287-351)||(22304237-22304301)
chr3 (172-342)||(39336219-39336387)
chr3 (184-272)||(54017548-54017636)
chr3 (184-342)||(47964915-47965073)
chr3 (250-339)||(7767380-7767469)
chr3 (224-340)||(11661537-11661638)
chr3 (160-233)||(22304302-22304376)
chr3 (234-339)||(46546375-46546480)
chr3 (286-342)||(43346650-43346706)
chr3 (214-300)||(39336000-39336086)
chr3 (195-300)||(12749211-12749316)
chr3 (232-292)||(52634990-52635050)
chr3 (185-238)||(8328374-8328427)
chr3 (210-339)||(25317161-25317290)
chr3 (224-340)||(25991405-25991521)
chr3 (224-275)||(53596027-53596078)
chr3 (224-275)||(53596342-53596393)
chr3 (230-287)||(17731950-17732007)
chr3 (230-287)||(19033181-19033238)
chr3 (184-262)||(43978865-43978947)
chr3 (224-275)||(53596542-53596593)
chr3 (184-260)||(7766783-7766857)
chr3 (228-275)||(48127859-48127906)
chr3 (171-215)||(9239940-9239984)
chr3 (310-342)||(12747878-12747910)
chr3 (230-274)||(16871005-16871049)
chr3 (230-274)||(17735037-17735081)
chr3 (230-274)||(19036306-19036350)
chr3 (230-275)||(16143505-16143550)
chr3 (230-271)||(16869843-16869884)
chr3 (276-337)||(36986040-36986101)
chr3 (276-337)||(37011479-37011540)
chr3 (243-279)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (184-340)||(514-670)
scaffold0702 (184-351)||(147-309)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (160-340)||(1083-1262)
scaffold0391 (224-295)||(1731-1802)
scaffold0391 (291-342)||(3092-3143)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (193-342)||(5396-5546)
scaffold0734 (193-342)||(5777-5931)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (184-342)||(47360-47518)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (222-342)||(5357-5477)
scaffold0078 (191-342)||(4982-5133)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (226-342)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (265-340)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (210-340)||(39459-39588)
scaffold0113 (217-340)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (264-348)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (264-304)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 80)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6500632 - 6500443
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500632 tgttgggtaagtgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 6500533  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500532 aatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 40296292 - 40296473
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40296292 tgttgggtca-tgagggaggcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggc 40296390  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296391 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 162 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6501002 - 6500814
Alignment:
Q  162 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 261  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6501002 ttgggtaagtgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaa 6500903  T
Q  262 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500902 tgagtttatgggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaacac 6500814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 27502013 - 27502202
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  27502013 tgttgggtca-tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggc 27502111  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502112 aataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 27502202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603286
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaaca 18603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32487551 - 32487386
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487551 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32487452  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487451 tat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 41170792 - 41170627
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170792 ggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41170693  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170692 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 345
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492378
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25328117 - 25327938
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328117 tgttgggtcactgaggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 25328018  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25328017 attaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15370257 - 15370099
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  15370257 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttact 15370158  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370157 tataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 188 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 624350 - 624187
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  624350 accgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttata 624251  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  624250 acgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 624187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 3295002 - 3295172
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3295002 tgaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttat 3295101  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3295102 gggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgca 3295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Original strand, 3295345 - 3295498
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3295345 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttact 3295443  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295444 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Original strand, 13415750 - 13415918
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13415750 aggggagccacggggaccg-ccatttcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgg 13415848  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415849 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 13415918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Original strand, 42405574 - 42405752
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42405574 tgttgggtcactggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagag--acaccacactcttacccaaaaccttaaggc 42405671  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    | | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405672 attaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 352
Target Start/End: Original strand, 9498655 - 9498822
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498655 ggggaccgtccacattgaggctagaccagc-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 9498753  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaca 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9498754 tataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcacatttgcaaaccaacaca 9498822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41632961 - 41632782
Alignment:
Q  162 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 261  Q
    |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  41632961 ttgggtcattaaggggagc-tgggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcat 41632863  T
Q  262 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632862 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 159 - 342
Target Start/End: Original strand, 26074121 - 26074304
Alignment:
Q  159 gtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074121 gtgttgggtcagagaggggagctttggggatcacccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 26074220  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26074221 caatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 26074304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26074792 - 26074614
Alignment:
Q  162 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 261  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074792 ttgggtcagagaggggagctttagggatcacccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 26074693  T
Q  262 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26074692 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttg 26074614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Original strand, 1028493 - 1028673
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  1028493 tgttgggtcactgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggt 1028592  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028593 tataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 172 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6224366 - 6224198
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  6224366 gaggggagcctgggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatg 6224267  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6224266 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 11416977 - 11417128
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11416977 ggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact 11417076  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11417077 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 36568545 - 36568725
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36568545 tgttgggtcattgaggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggc 36568642  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568643 aatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 299647 - 299490
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  299647 ggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttact 299548  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299547 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 332
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753173
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 332  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 12662652 - 12662810
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  12662652 ggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttact 12662751  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662752 tataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075318
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35150165 - 35150007
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  35150165 aggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttac 35150067  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150066 ttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 623976 - 623810
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||||    
T  623976 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttact 623877  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  623876 tgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15370589 - 15370428
Alignment:
Q  154 gatttgtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacct 253  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15370589 gattagtgttgggaca-tgaggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaacct 15370491  T
Q  254 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15370490 taaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 330  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 345
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  207 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  307 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 345  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 350
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723957
Alignment:
Q  204 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  304 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5723957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 340
Target Start/End: Original strand, 24489194 - 24489360
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24489194 gaggggagtctgagggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatg 24489293  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489294 ggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 210 - 340
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074938
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 308  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  309 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 26074938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 337  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 342
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591068
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggt 26591017  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||| ||  || |||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591018 gttcaacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 186 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 301107 - 300961
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||        ||||||||||    
T  301107 ggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt--------ctcttactta 301016  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  301015 taaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 35167838 - 35167994
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || ||||    
T  35167838 ggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctact 35167937  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  35167938 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2411176 - 2411010
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  2411176 aggggagcttgggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgg 2411077  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    || |||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2411076 gttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35915007 - 35914852
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||| || | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |  ||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  35915007 ggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttact 35914908  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35914907 tataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768842
Alignment:
Q  267 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaaca 7768842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 341
Target Start/End: Original strand, 36521922 - 36522053
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 309  Q
    |||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| ||     
T  36521922 caaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttc 36522021  T
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36522022 tatctgatgtgggacatataactcacacttgc 36522053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Original strand, 26900007 - 26900089
Alignment:
Q  174 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 256  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26900007 ggggagcttgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508614
Alignment:
Q  247 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 339
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522392
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |  | | || ||||| ||||| ||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  324 catataactcacactt 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522377 catataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074320
Alignment:
Q  262 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31509742 - 31509623
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 322  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||| |    
T  31509742 agagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgag 31509643  T
Q  323 acatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31509642 acatataactcacacttgca 31509623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 339
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635346
Alignment:
Q  205 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 304  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  305 tattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    | ||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  41635312 tcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Original strand, 13786002 - 13786157
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| || |  ||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||    
T  13786002 gggaccgtcgacaacgaggccagaacaatcataatagtgagagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttactt 13786101  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttg 340  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  13786102 ataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaacataattactcacacttg 13786157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31509857 - 31509745
Alignment:
Q  217 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 315  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||    
T  31509857 acaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccg 31509758  T
Q  316 atgtgggacatat 328  Q
    ||||| |||||||    
T  31509757 atgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38427377 - 38427306
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctta 255  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38427377 ggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309686
Alignment:
Q  261 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39309764 atgggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 284
Target Start/End: Original strand, 13785631 - 13785732
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||    
T  13785631 aggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttatagatcctattac 13785730  T
Q  283 tt 284  Q
    ||    
T  13785731 tt 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 258
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  206 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 271
Target Start/End: Original strand, 9498343 - 9498410
Alignment:
Q  204 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9498343 ctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 285
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527196
Alignment:
Q  206 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524719
Alignment:
Q  247 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32446003 - 32445943
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32446003 agagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  228 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  282 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660290
Alignment:
Q  302 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaaca 5660290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19275653 - 19275566
Alignment:
Q  217 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 305  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19275653 acaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataa-gtgttcaacctctact 19275566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13042822 - 13042784
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042822 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13112820 - 13112782
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112820 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  300 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  300 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42435583 - 42435486
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||    
T  42435583 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacacttatgagagagacatcacactctgattcaaaaccttaaggtaat-agattatggatcctcttactt 42435486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489583
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactc 240  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactc 24489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Original strand, 36389016 - 36389067
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  36389016 agagaaacaccacactctgacccaaaaccctaaggcactgagtttatgggtc 36389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5963795 - 5963765
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963795 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5963765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Original strand, 9510546 - 9510624
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  9510546 caaccacacaagtaagagagacactatatttttacctaaaattttaaggcattaggtttatggctcctctcacttataa 9510624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 350
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299014
Alignment:
Q  293 ttcaacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaaca 22299014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 244
Target Start/End: Original strand, 795152 - 795189
Alignment:
Q  208 aacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  795152 aacaaccacacaaagcaagagagacaccacactcttac 795189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5660405 - 5660340
Alignment:
Q  188 accgtccacatc-gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 252  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| ||||||||    
T  5660405 accgtccacatttgaggctagaacaaccacacaaacaagaaaaacaccatacttttatccaaaacc 5660340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34103666 - 34103625
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34103666 acaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 34103625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35150863 - 35150810
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  35150863 ggggaccatccacatcgaggctaaaacaatcacactagtgagagagacaccaca 35150810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 339
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785764
Alignment:
Q  307 ttttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcacactt 13785764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41341567 - 41341523
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  41341567 acaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatgggt 41341523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 78)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 44290800 - 44290992
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaagg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44290800 tgttgggtcagtggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaagg 44290899  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290900 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 44290992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Original strand, 44290458 - 44290625
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290458 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 44290557  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290558 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 44290625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759475
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaaca 41759475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 173 - 350
Target Start/End: Original strand, 3537589 - 3537765
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3537589 aggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatag 3537687  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3537688 gtcctcttactcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaaca 3537765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41142531 - 41142372
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41142531 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 41142432  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142431 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41157545 - 41157375
Alignment:
Q  173 aggggagcctag-gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41157545 aggggagccttgagggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatg 41157446  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157445 ggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 41157375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 162 - 351
Target Start/End: Original strand, 48588465 - 48588655
Alignment:
Q  162 ttgggtcagtgaggggagcctaggg-gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48588465 ttggttcagtgaggggaactttgggcgaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggca 48588564  T
Q  261 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48588565 atgaatttacgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaacac 48588655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 26661522 - 26661678
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26661522 ggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 26661621  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661622 tataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 26661678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41157175 - 41156991
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtga-ggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 257  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41157175 tgttgggtcactgaaggggagccttgggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaa 41157076  T
Q  258 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157075 gcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550712
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgccaaccaaca 3550712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17294733 - 17294579
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaacca-cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294733 gaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 17294634  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294633 taaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 31767138 - 31767319
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31767138 tgttgggtca-tgagggaagcttgggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggc 31767236  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767237 attaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556113
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  293 ttcaacctttacta-ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37556113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Original strand, 45493951 - 45494146
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45493951 tgttgggtcattggggggagc-tgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggc 45494049  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataa----ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45494050 aatgggtttatggatcatcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaacac 45494146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29798357 - 29798199
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29798357 ggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 29798258  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798257 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34364688 - 34364507
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34364688 tgttgggtcactg-ggggagctcagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggc 34364590  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364589 tatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34649596 - 34649440
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||    
T  34649596 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcact 34649497  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649496 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34365084 - 34364925
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34365084 agggaaccatccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttac 34364985  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364984 ttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 34364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 5319965 - 5320123
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  5319965 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact 5320064  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14319025 - 14318875
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  14319025 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttact 14318926  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14318925 tataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Original strand, 50052024 - 50052189
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  50052024 ggggactgtccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttact 50052122  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052123 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082408
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9956079 - 9955911
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt-at 270  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9956079 gaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaat 9955980  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacact 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9955979 gggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11977438 - 11977282
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  11977438 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttact 11977339  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977338 tataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 11977282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 32168674 - 32168853
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcct-aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32168674 tgttgggtcact-aggggagccttaggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaagg 32168772  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168773 caatgggtttatgggtcctct------taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32168853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594880
Alignment:
Q  216 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  316 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45084557 - 45084382
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  45084557 tgttgggtca-tgagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagac 45084459  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084458 g------ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Original strand, 22077484 - 22077653
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  22077484 aggggagcctgggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgg 22077583  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22077584 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 22077653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 3875333 - 3875489
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3875333 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 3875432  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875433 taaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 37850588 - 37850758
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  || | |||||||    
T  37850588 tgaggggagc-taggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttat 37850686  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850687 gggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 345
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804516
Alignment:
Q  199 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  299 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 345  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 207 - 340
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662054
Alignment:
Q  207 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  307 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  293 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 342
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600472
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||      
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 24600472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 342
Target Start/End: Original strand, 66476 - 66630
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  66476 accgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttata 66575  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66576 aggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 39066201 - 39066358
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |    
T  39066201 ggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagt 39066299  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066300 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5575284 - 5575110
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5575284 tgttgggtcactgaggagagtctgggggacattccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagc 5575187  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5575186 tatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 263 - 351
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537314
Alignment:
Q  263 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 3537314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 24131965 - 24132143
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  24131965 tgttgggtca-tgaggggggctcaggagatcgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggc 24132060  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132061 aatgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 41184383 - 41184583
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac---cacactcttacccaaaac---- 251  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||        
T  41184383 tgttggatcagtgaggggagctcggggggaccgtcgacatcgaggctggaacaaccgcacaagtaagagcgacaatatcacactcttacccaaaacctta 41184482  T
Q  252 ----------cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41184483 aggctgaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgc 41184582  T
Q  342 a 342  Q
    |    
T  41184583 a 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 222 - 353
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043946
Alignment:
Q  222 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct------ttactattttatccg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcg 44043909  T
Q  316 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacacaa 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44043910 atgtgggacatataact-acacttgcaaaccaacacaa 44043946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 22077101 - 22077243
Alignment:
Q  175 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22077101 gggagcctgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggt 22077200  T
Q  275 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22077201 cctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793279
Alignment:
Q  190 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa-tgggtttatgggtcctcttacttataa 288  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  289 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
     || |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22793331 agttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66247
Alignment:
Q  195 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 294  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  295 c-aacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttgca 342  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgca 66247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Original strand, 22077818 - 22077986
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  22077818 aggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgg 22077916  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22077917 gtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 332
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  5528762 tccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagat 5528861  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5528862 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Original strand, 19283434 - 19283613
Alignment:
Q  162 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19283434 ttgggtca-tgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcga 19283532  T
Q  262 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    || ||||||| ||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283533 tgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630796
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  | || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
      |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgca 30630796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839629
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  294 tc-----aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45839679 tcgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11977102 - 11977015
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11977102 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 21378036 - 21378199
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||                    
T  21378036 tgttgggtcactg-ggggagcgcaggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta---------------- 21378118  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378119 --tgggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44685605 - 44685456
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||  ||| ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  44685605 cacatcgaggttagaactacccccacaagagagaaagacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggtt 44685507  T
Q  293 ttcaa-cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44685506 ttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 1188574 - 1188746
Alignment:
Q  171 tgaggggagcc-taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||  ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1188574 tgaggggagcccttggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagttta 1188673  T
Q  270 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    || ||| ||| ||||||||  | ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1188674 tgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 272
Target Start/End: Original strand, 50051689 - 50051776
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50051689 ggggaccgtccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 1187349 - 1187522
Alignment:
Q  171 tgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| | | || |  ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||    
T  1187349 tgaggggagctctaggggaccgtccacatctaggtcagaacaactataaaaagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagttt 1187448  T
Q  269 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1187449 atgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacacttgca 1187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 271
Target Start/End: Original strand, 47380143 - 47380254
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  47380143 tgttgggtcaattaggggagtctaggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggc 47380242  T
Q  260 aatgggtttatg 271  Q
    |||| |||||||    
T  47380243 aatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44092051 - 44091909
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||   | | | ||||||||| |||| ||||    
T  44092051 gggaccgtctacatcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcactt 44091952  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 327  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  44091951 ataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  195 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    ||||||||| || | ||| | ||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  293 ttcaacctttactattttatccg 315  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 350
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051817
Alignment:
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50051817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 342
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  295 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 342
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469239
Alignment:
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgca 50469239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878803
Alignment:
Q  276 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  248 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Original strand, 4266798 - 4266855
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4266798 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaac--cacaagtaagagagacatcacactctta 4266855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 342
Target Start/End: Original strand, 5996870 - 5997029
Alignment:
Q  182 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 281  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | ||||| |||||| |    
T  5996870 taggggactgcccacatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggatcctctca 5996968  T
Q  282 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     ||||||  ||||||| |   ||| || || |  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5996969 tttataaaatgttcaagcaccacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttgca 5997029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 287
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  227 gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266948
Alignment:
Q  277 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaaca 4266948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9499136 - 9499020
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||||  ||||| |||| ||| || |    
T  9499136 gggaccgtccacatataggataaaacaaccacacaagtaaaagtgacaccacacttttatccaaaatttgaaggtaatgaatttataggtcatctaacat 9499037  T
Q  285 ataaggtgttcaacctt 301  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9499036 ataaaatgttcaacctt 9499020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12466401 - 12466365
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12466401 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 342
Target Start/End: Original strand, 22077248 - 22077280
Alignment:
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077248 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22077280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 333
Target Start/End: Original strand, 30630912 - 30630972
Alignment:
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaaccttt-actattttatccgatgtgggacatataactc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30630912 tcctcttacttataaggtgttcagcctttaatttttttatccgatgtaagacatataactc 30630972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379943
Alignment:
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgca 47379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Original strand, 9956212 - 9956258
Alignment:
Q  223 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9956212 aagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30697387 - 30697310
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttacccaaa 249  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | | ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30697387 gaggggagcct-ggggaccgcccacatctaggccatagcaaccacgcaaagtgagagagacaccacactcttacccaaa 30697310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45084617 - 45084576
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgag 202  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45084617 tgttgggtca-tgagggaagcctaggggaccgtccacatcgag 45084576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Original strand, 31973375 - 31973411
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973375 agagagacatcacactcttacccaaaatcttaaggca 31973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50556587 - 50556451
Alignment:
Q  206 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 305  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  ||| |||||| || | |||| ||||||||  ||||||||||   ||    
T  50556587 agaacaatcacacaagtgagagagataccaaacttttattcaaaaccttaagaaaataggtttacggattctctcacttataaattgttcaacctccgct 50556488  T
Q  306 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     || |||  |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  50556487 tttctatatgatgtgtgatatataacccacacttgca 50556451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29519078 - 29518911
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29519078 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518979  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518978 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 29518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 29518661 - 29518495
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29518661 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518562  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518561 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32741337 - 32741171
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32741337 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 32741238  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741237 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32741171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2378284 - 2378117
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2378284 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 2378185  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378184 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 2378117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35210384 - 35210196
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210384 tgttgggtcactg-ggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 35210287  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210286 aatggttttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 194 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409251
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 485696 - 485549
Alignment:
Q  12 gagagaagaaaggtgctagtgtttgtatatatatagaattttgtggtgagtgagagagtgtaatacttgtgagaatattgaatgagaaaataatgggatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485696 gagagaagaaaggtgctagtgtttgtgtatatatagaattttgtggtgagtgagagagtgtaatacttgtgagaatattgaatgagaaaataatgggatt 485597  T
Q  112 tcgtgtgctaaaaatgtgctatgaatgaatatgaggatatttgatttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485596 tcgtgtgctaaaaatgtgctatgaatgaatatgaggatatttgatttg 485549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3058409 - 3058218
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||| || ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058409 tgttggttcggtgaggggagctttgggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 3058310  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058309 caatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3409818 - 3409651
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409818 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 3409719  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409718 tataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaacac 3409651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 173 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3415629 - 3415448
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctaga--acaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3415629 aggggagcttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttat 3415530  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaca 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3415529 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaacaca 3415448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Original strand, 14748342 - 14748504
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  14748342 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatt 14748437  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748438 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2377912 - 2377756
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377912 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 2377813  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377812 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 2579860 - 2580030
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2579860 tgaggggagctt-ggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttat 2579958  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579959 gggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 184 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1846906 - 1846741
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1846906 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttact 1846807  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846806 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 2578443 - 2578598
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2578443 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttact 2578542  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2578543 tataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttg 2578598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Original strand, 10074352 - 10074521
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10074352 aggggagcctgggggactatccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 10074451  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10074452 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgca 10074521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16455078 - 16454913
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16455078 tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttat 16454979  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454978 gggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcaca 16454913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 194 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544041
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 172 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1127530 - 1127352
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1127530 gaggggagctttggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatg 1127431  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1127430 agtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaaca 1127352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 342
Target Start/End: Original strand, 10073989 - 10074149
Alignment:
Q  182 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 281  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073989 taggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 10074088  T
Q  282 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10074089 cttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgca 10074149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16454733 - 16454577
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454733 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 16454634  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454633 tataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107680
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  293 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2843713 - 2843560
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2843713 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttac 2843614  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2843613 ttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 171 - 341
Target Start/End: Original strand, 2578822 - 2578991
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2578822 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttat 2578921  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2578922 ggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgc 2578991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Original strand, 5832007 - 5832182
Alignment:
Q  162 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||       
T  5832007 ttgggtca-tgaggggagcct-ggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg- 5832103  T
Q  262 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832104 tggctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 337
Target Start/End: Original strand, 2579478 - 2579645
Alignment:
Q  170 gtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 269  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2579478 gtgaggggagcctgtggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagttta 2579577  T
Q  270 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 337  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2579578 tgggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 159 - 342
Target Start/End: Original strand, 10073592 - 10073772
Alignment:
Q  159 gtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    |||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10073592 gtgttgggtcac-gaggggagcctgaaggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagc 10073690  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10073691 caatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgca 10073772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 593694 - 593867
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca--ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 268  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  593694 tgaggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttt 593793  T
Q  269 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593794 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Original strand, 2579087 - 2579261
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |     
T  2579087 tgttgggtca-tgaggggagc-tcggggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagt 2579184  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
     |||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579185 tatgggtttatggttcct----cttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttg 2579261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 339
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  199 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 298  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  299 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 337
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  234 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  334 acac 337  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911565
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  288 aggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16108065
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttg 16108065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 336
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  217 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 316  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  317 tgtgggacatataactcaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 12071678 - 12071849
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  12071678 tgaggggagcttaggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttat 12071777  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | ||||| |   |||||| |||||||| ||  | | || |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071778 gagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 12085021 - 12085191
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12085021 tgaggggagcttaggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttat 12085120  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | ||||| |   |||||| |||||||| ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085121 gagtcctttctattataaagtgttcaaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 357
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958776
Alignment:
Q  190 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 289  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacacaattga 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcacaattgcacaccacaacaattga 5958776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 342
Target Start/End: Original strand, 12092470 - 12092640
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12092470 gaggggggccaaggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 12092569  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  12092570 gatcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071132
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 309  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttc 6071165  T
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6071164 tattcaatgtgggacatataactcacacttgca 6071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31714849 - 31714671
Alignment:
Q  161 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31714849 gttgggtcattgaggggagtctgggagaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcga-aaaaacgccacactcttactcaaaaccttaaggca 31714751  T
Q  261 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||| ||| ||||||||||| | |||||    |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31714750 atgagttaatgggtcctctca-ttatataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatat-agtcacacttgca 31714671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481927
Alignment:
Q  223 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  323 acatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgca 8481927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Original strand, 17135044 - 17135223
Alignment:
Q  157 ttgtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 256  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||| ||||||| ||      
T  17135044 ttgtgttgggtc--taaggggagtctgggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttct 17135141  T
Q  257 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 338  Q
      ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135142 aacaatgagtttatgaatcctcttgcttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975567
Alignment:
Q  226 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 325  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  326 ta 327  Q
    ||    
T  2975568 ta 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  269 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 30618606 - 30618766
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||  |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||  |||||||     
T  30618606 gaggggagccttggggaccacccacatt-aggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaagacaa-cggtttat- 30618702  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 335  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  30618703 ggtcatcttacttataaagtgttcatcctccactttttcaaccgatgtaggacttctaactcac 30618766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637811
Alignment:
Q  223 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 21130103 - 21130147
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21130103 acaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 21130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 10902438 - 10902496
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 250  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10902438 tccacatctaggtcagaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 266
Target Start/End: Original strand, 11638053 - 11638095
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11638053 agagagacaccatactcttacccaaaatcctaaggcaatgggt 11638095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2975352 - 2975296
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca 217  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2975352 tgttaggtcactgaggggagtc-agaggactgtccacatcgaggctagaacaaccaca 2975296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35210601 - 35210554
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctaga 208  Q
    |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35210601 tgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctaga 35210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Original strand, 36178605 - 36178772
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178605 ggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 36178704  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36178705 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaacac 36178772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 41283451 - 41283641
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283451 tgttgggtaagtgaggggagcatgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggc 41283550  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283551 aatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41283641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 186 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106179
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 37106179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Original strand, 14745667 - 14745833
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745667 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 14745766  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745767 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Original strand, 5542625 - 5542792
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5542625 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 5542724  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542725 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 5542792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37106082 - 37105920
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37106082 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttact 37105983  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37105982 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 37105920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 351
Target Start/End: Original strand, 5543002 - 5543165
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5543002 accgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttata 5543101  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543102 aggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 5543165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6421543 - 6421387
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6421543 ggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 6421444  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421443 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962598
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15880415 - 15880265
Alignment:
Q  190 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880415 cgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 15880265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42514807 - 42514649
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42514807 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttact 42514708  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514707 tataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 15511495 - 15511646
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15511495 ggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 15511594  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511595 tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 35580724 - 35580881
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35580724 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcact 35580822  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580823 tataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 324
Target Start/End: Original strand, 36178171 - 36178311
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36178171 ggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttact 36178270  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178271 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6422268 - 6422126
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6422268 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaat 6422169  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 326  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6422168 tataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6713135 - 6712978
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6713135 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttac 6713036  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6713035 ttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 351
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745461
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaacac 14745461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006035
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 342
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796778
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca--ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttac 38796718  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796719 ttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33731831 - 33731653
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctagg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    ||||||||||  ||||||||| | || |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33731831 tgttgggtcaccgaggggagctttggaggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaagg 33731732  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 337  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33731731 caataggtttatggatcctcttacttataaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679787
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgca 40679787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 37632575 - 37632755
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  37632575 tgttgggacactgaggggagcc-agggg-ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagt 37632672  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632673 tatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40733675 - 40733519
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  40733675 ggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttact 40733576  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40733575 tataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 40733519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 194 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769884
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1770040 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 1769941  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769940 tcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7598769 - 7598600
Alignment:
Q  174 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 273  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        |||||||    
T  7598769 ggggagcccagtgggccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatggg 7598678  T
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7598677 tcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaacac 7598600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254391
Alignment:
Q  203 gctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 302  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  303 actattttatccgatgtgggacatataactcacact 338  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531472
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 28531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 350
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178435
Alignment:
Q  235 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  335 cacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaaca 36178435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 331
Target Start/End: Original strand, 40163362 - 40163520
Alignment:
Q  174 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||  ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| ||||    
T  40163362 ggggagctcaggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgg 40163461  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40163462 gtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23346417 - 23346250
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23346417 tgttgggtca-tgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggc 23346319  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 329  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23346318 tatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40734040 - 40733885
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| | |||||||||    
T  40734040 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtagg-ttatgagccctcttact 40733942  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733941 tataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 40733885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7598387 - 7598228
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  7598387 aggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttat 7598288  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598287 ttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 198 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367457
Alignment:
Q  198 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 297  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  298 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 185 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676903
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-----tcctct 279  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  280 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 29676903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6421911 - 6421793
Alignment:
Q  161 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421911 gttgggtca-tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 6421813  T
Q  261 atgggtttatgggtcctctt 280  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6421812 ataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 235 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  235 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 334  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  335 cacttgca 342  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa------aaggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 334  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 342
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468904
Alignment:
Q  234 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  334 acacttgca 342  Q
    |||||||||    
T  31468896 acacttgca 31468904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3673249 - 3673122
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||    
T  3673249 tgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagc 3673151  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataa 288  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3673150 aatgagtttatggatcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529186
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16591065 - 16590888
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||   || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||  |||||||||||||    
T  16591065 tgttgggtcattgaggggagctcgggagactgtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggc 16590966  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590965 aatgtgtttatgggtcctcttactt------tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 339
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  254 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30313335 - 30313178
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| |||| | ||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  30313335 ggggatcgtcaaaatccaggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcact 30313236  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30313235 tataa-gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgca 30313178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3672882 - 3672773
Alignment:
Q  161 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    ||||||||| |  ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3672882 gttgggtcactagggggagccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggca 3672783  T
Q  261 atgggtttat 270  Q
    ||||||||||    
T  3672782 atgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 29874023 - 29874179
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||| ||||||| |||| | | ||||| ||||||   || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  29874023 ggggaccgcccacatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaat 29874122  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29874123 tataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 334
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  330 actca 334  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  226 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc---gatgtggg 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  323 acatataactcacactt 339  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 342
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561609
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||| |    
T  33561491 agagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaa 33561590  T
Q  324 catataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33561591 catataactcacacttgca 33561609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 342
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796376
Alignment:
Q  264 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 38796376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421688
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 280  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323464
Alignment:
Q  225 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | | || |||| ||| ||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  325 atataactcacacttgca 342  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgca 30323464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 289
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  197 atcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 289  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 342
Target Start/End: Original strand, 29873525 - 29873695
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||  | |||||| | ||||| || | ||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29873525 gaggggagccaggaggaccgcctacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 29873624  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     ||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29873625 agtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttgca 29873695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 342
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894850
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  324 catataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  37894832 catataactcacatttgca 37894850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 285 - 342
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785721
Alignment:
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36785721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| || |||  ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||| |    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385738
Alignment:
Q  211 aaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatttt 310  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | | || |    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttct 31385769  T
Q  311 atccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
    | |||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  31385768 aaccgatgtcagacttctaactcacacttgc 31385738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  237 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 326  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 342
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953929
Alignment:
Q  234 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 333  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  334 acacttgca 342  Q
    ||| |||||    
T  33953921 acatttgca 33953929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 252
Target Start/End: Original strand, 31899090 - 31899170
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 252  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31899090 tgaggggagctt-ggggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 278
Target Start/End: Original strand, 35580443 - 35580534
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| | | | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35580443 accgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  235 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| | | |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  335 cactt 339  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 342
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678527
Alignment:
Q  235 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataact 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   || || |||| |||||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  333 cacacttgca 342  Q
    ||||||||||    
T  41678518 cacacttgca 41678527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 342
Target Start/End: Original strand, 33954279 - 33954419
Alignment:
Q  201 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 300  Q
    |||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||| | | | |||||   |||| |||||    
T  33954279 aggccagaacaaccatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggca-tagatttatgagtcatttaagttatataatgtttaacct 33954377  T
Q  301 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33954378 caacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgca 33954419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30312907 - 30312831
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 300  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  30312907 agagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 288
Target Start/End: Original strand, 25390313 - 25390372
Alignment:
Q  229 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 288  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25390313 gacaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226404
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42515031
Alignment:
Q  280 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336666
Alignment:
Q  243 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 300  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3673121 - 3673085
Alignment:
Q  306 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3673121 attttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3673085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8904546 - 8904498
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8904546 agagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatgg 8904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28226772 - 28226726
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  28226772 agagagacaccacactcttaccaaaaacc-taagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2110066 - 2109988
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 238  Q
    |||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| ||| ||||||    
T  2110066 tgttgggttactgaggggagtcagggggaccgtccacatcgagactagagcaatcatacaagcgagagggacgccacac 2109988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 275
Target Start/End: Original strand, 13792536 - 13792585
Alignment:
Q  226 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  13792536 agagacatcacactcttacccaaaacctcaagtcaatgggtgtacgggtc 13792585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3672755 - 3672719
Alignment:
Q  306 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672755 attttattcgatgtgggacatataactcatacttgca 3672719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 1085593 - 1085774
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1085593 tgttgggtca-tgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggc 1085691  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085692 aatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 159 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7517763 - 7517580
Alignment:
Q  159 gtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517763 gtgttgggttactgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 7517664  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517663 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29157747 - 29157559
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157747 tgttgggtcagtgaggagagtctgggagaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 29157648  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 348  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157647 aatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Original strand, 37533011 - 37533177
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37533011 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 37533109  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533110 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 37533177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 23377 - 23535
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23377 ggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 23476  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23477 tataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Original strand, 37533364 - 37533530
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37533364 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttact 37533463  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37533464 tataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaaca 37533530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11845377 - 11845198
Alignment:
Q  155 atttgtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 254  Q
    |||| |||||||||| || |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11845377 atttctgttgggtcactg-ggggagcacgggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctt 11845279  T
Q  255 aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11845278 aaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30244428 - 30244272
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30244428 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 30244329  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244328 tataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 30244272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6054718 - 6054562
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6054718 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 6054619  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054618 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45433411 - 45433243
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45433411 gaggggagccagggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatg 45433312  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45433311 agttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 40094774 - 40094932
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40094774 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttact 40094873  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094874 tataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Original strand, 22567017 - 22567196
Alignment:
Q  162 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 261  Q
    |||||||  ||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22567017 ttgggtcgttgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 22567116  T
Q  262 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567117 tgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 342
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939891
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554025
Alignment:
Q  213 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  313 ccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttgca 7554025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681501
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaacac 14681501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754718
Alignment:
Q  195 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  295 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30245231 - 30245079
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30245231 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttact 30245136  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30245135 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 30245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24177593 - 24177435
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24177593 ggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttact 24177494  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177493 tataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 336
Target Start/End: Original strand, 34218036 - 34218186
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34218036 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 34218135  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218136 taaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45434794 - 45434638
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  45434794 ggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttact 45434695  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45434694 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 45434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 118277 - 118459
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaag 257  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  118277 tgttgggtcactg-ggggagcct-ggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacg 118374  T
Q  258 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  118375 gtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 171 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47129265 - 47129097
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47129265 tgaggggagc-tcggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttat 47129167  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47129166 gggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 8128417 - 8128599
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||| |||||||||||    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8128417 tgttgggttagtgaggggagtgcgggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggt 8128516  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128517 tatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36623140 - 36622960
Alignment:
Q  161 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36623140 gttgggtca-tgaggggagctcaagggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggca 36623042  T
Q  261 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36623041 atggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Original strand, 22566702 - 22566820
Alignment:
Q  223 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22566702 aagagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 22566800  T
Q  323 acatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22566801 acatattactcacacttgca 22566820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30032725 - 30032572
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  30032725 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttact 30032626  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 337  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30032625 tataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569196
Alignment:
Q  222 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  322 gacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 342
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596466
Alignment:
Q  222 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  322 gacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 188 - 342
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230449
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    || |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 339
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  207 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc-tcttacttataaggtgttcaacctttact 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  306 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085407
Alignment:
Q  216 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 315  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  316 atgtgggacat-ataactcacacttgca 342  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttgca 1085407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599317
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 342
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534942
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  293 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41854792 - 41854635
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||| ||    
T  41854792 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgct 41854693  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854692 tataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167808
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||      
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact-- 37167840  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 321  Q
         |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37167839 ----ctgttcaacatttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30253646 - 30253534
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30253646 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttact 30253551  T
Q  284 tataaggtgttcaacct 300  Q
    |||||||| ||||||||    
T  30253550 tataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 28300229 - 28300366
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| | ||||||| |  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28300229 tgttgggtcaataaggggagtcaggaggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggc 28300328  T
Q  260 aatgggtttat-gggtcctcttacttataaggtgttca 296  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28300329 aatgggtttatggggttctcttacttataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  190 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc--------ttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||| |        ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  282 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47129554 - 47129450
Alignment:
Q  155 atttgtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 254  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129554 atttctgttgggtca-tgaggggagc-tcggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 47129457  T
Q  255 aaggcaa 261  Q
    |||||||    
T  47129456 aaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  221 gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 320  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  321 ggacatataactcacacttgca 342  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 342
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  254 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245494
Alignment:
Q  269 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 30245494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255339
Alignment:
Q  269 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgca 30255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 259
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta-cccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244701
Alignment:
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 30244701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 254
Target Start/End: Original strand, 37532753 - 37532821
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532753 ggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30244533 - 30244453
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30244533 tgttgggtca-tgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30253751 - 30253671
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 241  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30253751 tgttgggtca-tgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 337
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  237 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30245336 - 30245256
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 241  Q
    |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30245336 tgttgggtca-taaggggagcatgggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7517839 - 7517767
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7517839 tgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7517767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7518105 - 7518033
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7518105 tgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7518033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  225 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 342
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124246
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||  | | || || ||||||| |||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtagga 4124227  T
Q  324 catataactcacacttgca 342  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4124228 catgtaattcacagttgca 4124246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681281
Alignment:
Q  305 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 14681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 274
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094503
Alignment:
Q  195 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 342
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094552
Alignment:
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgca 40094552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755010
Alignment:
Q  197 atcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaattttaaggc 45755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619136
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37393216 - 37393114
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||    
T  37393216 ggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttat-ggtcatcttact 37393118  T
Q  284 tata 287  Q
    ||||    
T  37393117 tata 37393114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 340
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37346036 - 37345916
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||| |  ||    
T  37346036 agagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatga 37345937  T
Q  324 c--atataactcacacttgca 342  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  37345936 catatataactcacacttgca 37345916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15902457 - 15902342
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | | ||||| ||  | | |||    
T  15902457 ggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaacgagcttatgtgtgatttcact 15902359  T
Q  284 tataaggtgttcaacct 300  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15902358 tataaagtgttcaacct 15902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 27391815 - 27391859
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27391815 acaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatgggt 27391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7518029 - 7517982
Alignment:
Q  159 gtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggcta 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  7518029 gtgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggcta 7517982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Original strand, 4719305 - 4719359
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccca 247  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4719305 ccacaacgaggctagagcaaccgcacaaacaagagaaataccacactcttaccca 4719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598052
Alignment:
Q  235 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtc 27598052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 105)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 162 - 351
Target Start/End: Original strand, 50630731 - 50630920
Alignment:
Q  162 ttgggtcagtgaggggagcctagg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630731 ttgggtcagtgaggggag-ctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 50630829  T
Q  261 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50630830 atgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaacac 50630920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25483517 - 25483336
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483517 tgttgggtcactg-ggggagccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 25483419  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483418 aatgggtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 161 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36629418 - 36629239
Alignment:
Q  161 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629418 gttgggtcattgaggggagcatgtgggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 36629319  T
Q  261 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629318 atgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41370515 - 41370349
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370515 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41370416  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370415 tataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41370349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Original strand, 55933113 - 55933288
Alignment:
Q  175 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55933113 gggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 55933212  T
Q  275 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933213 cctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 55933288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10246101 - 10245920
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10246101 tgttgggtcagcgaggggagcttgggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 10246002  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10246001 tttgggtttat-ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 54017596 - 54017751
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017596 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 54017695  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54017696 aagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3340988 - 3340807
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340988 tgttgggtcactg-ggggagctcaggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 3340890  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340889 agtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 342
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731803
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 340
Target Start/End: Original strand, 39792845 - 39793014
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  39792845 tgaggggagctcagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttac 39792944  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792945 ggttcctctttcttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50002584 - 50002423
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50002584 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 50002485  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 345  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002484 taaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 159 - 342
Target Start/End: Original strand, 36608635 - 36608817
Alignment:
Q  159 gtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36608635 gtgttgggtcac-gaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga 36608733  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608734 caatggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404400
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 39404400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 22027936 - 22028117
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22027936 tgttgggtca-tgaggggagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggc 22028034  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22028035 aatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgca 22028117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884695
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  293 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39404200 - 39404020
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  39404200 tgttggattagtgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgc 39404101  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  39404100 tatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44620830 - 44620660
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  44620830 tgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatgg-tttat 44620732  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620731 gggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44620660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 194 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646803
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 22028342 - 22028527
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22028342 tgttgggtcagtgaggggagctttgggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaaga 22028441  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta--ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028442 caatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 204 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49880297 - 49880152
Alignment:
Q  204 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 303  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880297 ctagaacaac-acataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 49880199  T
Q  304 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880198 ctattttattcaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 332
Target Start/End: Original strand, 54343006 - 54343147
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||    
T  54343006 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttact 54343098  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343099 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44620511 - 44620362
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  44620511 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatt 44620412  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620411 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572021
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884887
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagaga--caccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 342
Target Start/End: Original strand, 22183253 - 22183420
Alignment:
Q  175 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183253 gggagtctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22183352  T
Q  275 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183353 ccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 342
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955473
Alignment:
Q  201 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 300  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  301 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44621160 - 44621011
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  44621160 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttact 44621061  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621060 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Original strand, 18932747 - 18932925
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18932747 ggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatt 18932846  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccga-----------tgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18932847 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtaggaccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaacac 18932925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Original strand, 49076828 - 49076986
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  49076828 aggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac 49076927  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076928 -tataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 54936353 - 54936215
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936353 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 54936255  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54936254 tacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20826018 - 20825842
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||| ||| ||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826018 tgttggatcattgaagggagcatgggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 20825919  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
     |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20825918 taaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 16888804 - 16888971
Alignment:
Q  174 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 273  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||    
T  16888804 ggggagcttaggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttatagg 16888903  T
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888904 ttctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 342
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941279
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 183 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 49303065 - 49302907
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49303065 aggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 49302966  T
Q  283 --ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49302965 ttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 54108694 - 54108537
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-ggtttatgggtcctcttac 282  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  54108694 ggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttac 54108596  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108595 ttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2740869 - 2740700
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    ||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  2740869 tgaggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttat 2740772  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740771 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 341
Target Start/End: Original strand, 16889535 - 16889691
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  16889535 gggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttactt 16889634  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889635 ataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826223
Alignment:
Q  189 ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  289 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  213 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  313 ccgatgtgggacata 327  Q
    |||||||||||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Original strand, 3244448 - 3244607
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3244448 aggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 3244547  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3244548 ttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 3244607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390257
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | || |||||||||||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741071
Alignment:
Q  233 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  333 cacacttgca 342  Q
    ||||||||||    
T  2741080 cacacttgca 2741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 288
Target Start/End: Original strand, 23817679 - 23817783
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23817679 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttact 23817778  T
Q  284 tataa 288  Q
    |||||    
T  23817779 tataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43174677 - 43174508
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||    
T  43174677 tgaggggagc-tagggaaccgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttat 43174579  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact-attttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43174578 gtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttg 43174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 340
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707618
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  324 catataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975620
Alignment:
Q  219 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  319 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaaca 6975620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 34004586 - 34004739
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34004586 gaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttat 34004684  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004685 aagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 49076449 - 49076604
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||| ||||||| | ||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49076449 ggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttataggtcctcttact 49076545  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076546 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgca 49076604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 54741154 - 54741334
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||| || |||  |||||||||||||| ||||  |  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |    
T  54741154 tgttgggtcactgaggggagcccgagggaccatctacactgaggctagaacaacaacacgtg--agagagagactacactcttatccaaaaccttaagac 54741251  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54741252 aatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3341286 - 3341128
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  3341286 ggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttact 3341187  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341186 tataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3341128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504707
Alignment:
Q  196 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||         ||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  296 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489485
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| | || |||||||||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttg 45489485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768216
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768161 aaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700365
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------ccttttacttat 3700421  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700420 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879852
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  286 taaggtgttca 296  Q
    |||||||||||    
T  18879862 taaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43827597 - 43827480
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  43827597 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatt 43827499  T
Q  284 tataaggtgttcaaccttt 302  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  43827498 tataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691203
Alignment:
Q  190 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  288 aggt 291  Q
    ||||    
T  31691206 aggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 329
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  234 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 329  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  205 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac-cttta 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  304 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28034387 - 28034229
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||| || | ||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||    
T  28034387 ggggaccatccacatccagaccagagcaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcact 28034288  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28034287 tataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggacatataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 48111696 - 48111833
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||    
T  48111696 ggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttact 48111795  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 321  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48111796 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3271947 - 3271806
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacac-cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3271947 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctta 3271848  T
Q  282 ctt---ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 320  Q
    |||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||    
T  3271847 cttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 760356 - 760194
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||   ||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  760356 aggggagcccaggggaccacccacatccagta-agagcaaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgg 760259  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 337  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  760258 gtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 300
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  201 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 300  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246347
Alignment:
Q  253 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgca 10246347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788147
Alignment:
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 50788147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  276 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 342
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 309  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 336
Target Start/End: Original strand, 45489712 - 45489864
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| || || |||||||    
T  45489712 ggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaactttaaggtttaaggatcatcttact 45489811  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
    |||| | | ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  45489812 tatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43174299 - 43174233
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 250  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43174299 ggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621426
Alignment:
Q  276 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgca 44621426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34544225 - 34544107
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || ||| ||||||| |    
T  34544225 agagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgag 34544126  T
Q  323 --acatataactcacactt 339  Q
      | |||||||||||||||    
T  34544125 atatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 317
Target Start/End: Original strand, 39698944 - 39699077
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt--aaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||  || |  | || ||||||| ||||||||||    
T  39698944 ggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaacgacacggatttatggatcctcttact 39699043  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgat 317  Q
    || ||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  39699044 tagaatatgttcaacctttacttttatatccgat 39699077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620946
Alignment:
Q  276 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg-tgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttg 44620946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 279
Target Start/End: Original strand, 11783528 - 11783646
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||  ||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||    
T  11783528 tgttgggtca-tgaggggtgccagggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatggc 11783626  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctct 279  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  11783627 aataggtgtatgggtcctct 11783646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 23817431 - 23817498
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagag 229  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23817431 tgttgggtcactg-ggggagcct-gggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 342
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348484
Alignment:
Q  254 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Original strand, 15841023 - 15841134
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||| ||| |||||    
T  15841023 agagagacaatacactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatggga 15841121  T
Q  324 catataactcaca 336  Q
    ||||||| |||||    
T  15841122 catataattcaca 15841134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10396249 - 10396198
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396249 agagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10396534 - 10396483
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396534 agagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922485
Alignment:
Q  223 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgggtc 922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868119
Alignment:
Q  235 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 1868119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19895445 - 19895406
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19895445 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Original strand, 1731556 - 1731621
Alignment:
Q  148 atatttgatttgtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 214  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1731556 atatgtgatttgtattgggtcattg-ggggagcctgggggaccatccacatcgaggctagaataacc 1731621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706641
Alignment:
Q  226 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat-agtcctcttactt 11706641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 51681650 - 51681604
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  51681650 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatgagtcc 51681604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 228
Target Start/End: Original strand, 11702284 - 11702341
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga 228  Q
    ||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11702284 tgaggggagcgagggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 288
Target Start/End: Original strand, 2891864 - 2891924
Alignment:
Q  228 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 288  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2891864 agacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 264
Target Start/End: Original strand, 50787996 - 50788072
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 264  Q
    |||||| |||| || | |||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50787996 accgtctacattgaagttagagcaaccaaataagcgacagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgg 50788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11197054 - 11197003
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  11197054 agagagacacctcactcttacctaaaatcctaaggcaatgggtttaagggtc 11197003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 350
Target Start/End: Original strand, 18933103 - 18933134
Alignment:
Q  319 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933103 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 18933134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45484817 - 45484774
Alignment:
Q  244 cccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45484817 cccaaaaccttaaggcattgggtttatgggttctctcacttata 45484774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 31249896 - 31249970
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 298  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31249896 agagagagaccacactttaacccaaaacttgacgtcattaggtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaac 31249970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41370738 - 41370692
Alignment:
Q  305 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41370738 tattttatccgatatgggatatataactcactctttcaaaccaacac 41370692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 266
Target Start/End: Original strand, 41707279 - 41707321
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 266  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41707279 agagagataccacacttttacccaaaaccttaaggtaatgggt 41707321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45496732 - 45496678
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 214  Q
    |||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45496732 tgttgggtcagtaaggggagctcgagggaccgtctacatcgaggctagaacaacc 45496678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706677
Alignment:
Q  301 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgca 11706677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19895570 - 19895533
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19895570 cacatcgaagctagaacaaccacacaagcaagatagac 19895533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802604
Alignment:
Q  246 caaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctct 29802604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Original strand, 34946151 - 34946187
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34946151 agagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggca 34946187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3669845 - 3669678
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3669845 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 3669746  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669745 tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 3669678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 172 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3670229 - 3670052
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3670229 gaggggagc-tagggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatg 3670131  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670130 ggtcctcatacttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3670052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 172 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30441255 - 30441072
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441255 gaggggagccaaggtgactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 30441156  T
Q  272 ggtcctcttactta----taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441155 ggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 30441072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 186 - 340
Target Start/End: Original strand, 3038292 - 3038446
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3038292 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactta 3038391  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038392 taaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 174 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34835377 - 34835211
Alignment:
Q  174 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 273  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835377 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835278  T
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835277 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttg 34835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834878
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggt 34834927  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834926 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 20870550 - 20870741
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20870550 tgttgggtca-tgaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggc 20870648  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20870649 agtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaaca 20870741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122215
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 350
Target Start/End: Original strand, 1014253 - 1014411
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1014253 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggt 1014352  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014353 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 342
Target Start/End: Original strand, 45121898 - 45122068
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45121898 gaggggagcctgggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatg 45121997  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45121998 agtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30359454 - 30359273
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30359454 tgttgggtcattgaggggagctcgagggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 30359355  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359354 ctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 340
Target Start/End: Original strand, 25561812 - 25561972
Alignment:
Q  181 ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25561812 ctaggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctct 25561911  T
Q  280 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561912 tacttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 351
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014038
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaacac 1014038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 6876862 - 6877021
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6876862 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatt 6876961  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac-atataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876962 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9608904 - 9608745
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  9608904 agggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttac 9608805  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608804 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 340
Target Start/End: Original strand, 33113368 - 33113523
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33113368 gggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 33113467  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113468 ataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34835643 - 34835476
Alignment:
Q  174 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 273  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835643 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835544  T
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835543 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34835909 - 34835742
Alignment:
Q  174 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 273  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835909 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835810  T
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835809 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40518229 - 40518071
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  40518229 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttact 40518130  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttac--tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518129 tataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518584
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 37544490 - 37544646
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  37544490 ggggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttct 37544589  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544590 tataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 45122782 - 45122638
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45122782 ggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 45122683  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45122682 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgcgggccatat 45122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 147609 - 147454
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  147609 ggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatt 147510  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147509 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482755
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9309512 - 9309355
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9309512 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttact 9309414  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309413 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 9309355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Original strand, 9483174 - 9483320
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9483174 tgaggggagctatgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 9483273  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9483274 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 1513915 - 1514071
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  1513915 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttact 1514014  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514015 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70425
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 335  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 8918764 - 8918922
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8918764 ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact 8918863  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgca 8918922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 348
Target Start/End: Original strand, 40579512 - 40579670
Alignment:
Q  190 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40579512 cgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataag 40579611  T
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579612 gtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915872
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta-- 5915928  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
      ||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915927 --taaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420651
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359611
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 30359611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972158
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa---aaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45123164 - 45123006
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 281  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  45123164 ggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctta 45123065  T
Q  282 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45123064 ctta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 45123006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6732055 - 6731895
Alignment:
Q  182 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 281  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  6732055 taggggatcatccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta 6731956  T
Q  282 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6731955 ct---------ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaacac 6731895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 332
Target Start/End: Original strand, 18371970 - 18372142
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctagggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18371970 tgttgggtca-tgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaag 18372068  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 332  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372069 caatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9309139 - 9308977
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact---cttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9309139 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctctt 9309041  T
Q  281 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309040 acttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 194 - 339
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640682
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     |||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgt 32640636  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121811
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttg 45121811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 185 - 338
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6651652 - 6651496
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||      
T  6651652 ggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta-- 6651555  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
           | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6651554 -------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataact--cacttgcaaaacaacac 6651496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 18371665 - 18371807
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  18371665 accgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggca-tgggtttatgggtcttcttacttaa- 18371762  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 335  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371763 ---tgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32305635 - 32305478
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  32305635 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttact 32305536  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  32305535 tataaggtgttcaacctttactattttatcc-------gacatataactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Original strand, 4154678 - 4154824
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  4154678 cacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgt 4154775  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154776 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147829
Alignment:
Q  194 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 293  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  294 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 147829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507777
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  291 tgttcaacctttact---attttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 342  Q
    | |||||||||||||    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgca 9507777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  205 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  305 tattttatccgatgt 319  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416335
Alignment:
Q  264 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaaca 41416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 229 - 339
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  229 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 328  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  329 aactcacactt 339  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41129159 - 41129066
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41129159 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794113
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  324 catataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 342
Target Start/End: Original strand, 9620666 - 9620834
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||  ||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||| |||||||    
T  9620666 gaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatg 9620763  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620764 ggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 267
Target Start/End: Original strand, 40579269 - 40579352
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40579269 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 338
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373085
Alignment:
Q  238 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 337  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283873
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| ||| | |||||| |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  293 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 339
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  270 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Original strand, 8919144 - 8919220
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919144 ggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 234 - 340
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372758
Alignment:
Q  234 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 333  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  334 acacttg 340  Q
    |||||||    
T  18372752 acacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Original strand, 4154270 - 4154438
Alignment:
Q  173 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||| |||| ||| |||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  4154270 aggggagtctcggggaccacccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgg 4154369  T
Q  273 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4154370 gt-ctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactcacatttgca 4154438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 270 - 339
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  270 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 339
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  252 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacactt 339  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 338
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc---ttacttataag 289  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  290 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 338  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 332
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  269 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  237 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 336  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5274907 - 5274775
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 309  Q
    |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || |||    
T  5274907 caacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttt 5274808  T
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||| | |||| | |||||||||||| |||||||    
T  5274807 tattcaatgtagaacatataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 265
Target Start/End: Original strand, 20995404 - 20995497
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg 265  Q
    ||||||||||   ||||||  ||| ||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20995404 gaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40991920 - 40991756
Alignment:
Q  175 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 273  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | | ||||| |||||||||| |  ||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991920 gggagcctaggggatcatccacattgggcctagagcaaccacacaggtgagttggacaccaca-tcttaacccaaaaccttgaggcattgggtttatggg 40991822  T
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||  | ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991821 tcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 43274635 - 43274699
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43274635 ggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524446
Alignment:
Q  204 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 261  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 339
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  298 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 231
Target Start/End: Original strand, 3037944 - 3038016
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgagggg-agcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac 231  Q
    |||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3037944 tgttgggtcactgagggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  250 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 306  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Original strand, 40417733 - 40417820
Alignment:
Q  201 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 288  Q
    |||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  40417733 aggcaagagcaatcacacaagtgagagagacaccacacttttatccaaaatcttaacgcaatggatttacgagtcatcttacttataa 40417820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 18372288 - 18372342
Alignment:
Q  188 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt 242  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18372288 accgtccacatcgagactaaagcaaccgcacaagcgagagagacaccacactctt 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 271
Target Start/End: Original strand, 12156708 - 12156745
Alignment:
Q  234 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12156708 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 342
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995559
Alignment:
Q  285 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831978
Alignment:
Q  265 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || | | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgca 33831978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442911
Alignment:
Q  243 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcactt 11442911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 342
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645745
Alignment:
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgca 18645745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22304747 - 22304560
Alignment:
Q  165 ggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 263  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304747 ggtcagtgaggggaagctagggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 22304648  T
Q  264 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22304647 tgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaacac 22304560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Original strand, 37990615 - 37990795
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990615 tgttgggtcattgaggagagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 37990714  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37990715 aatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 37990795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 174 - 340
Target Start/End: Original strand, 37990967 - 37991133
Alignment:
Q  174 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 273  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  37990967 ggggagcctgagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttatagg 37991066  T
Q  274 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991067 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 186 - 340
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346947
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactta 43346892  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43346893 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35946680 - 35946524
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946680 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 35946581  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946580 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15773035 - 15772854
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15773035 tgttgggtca-tgaggggagtcaaaaggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagc 15772937  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772936 aatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 172 - 342
Target Start/End: Original strand, 29644890 - 29645060
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29644890 gaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 29644989  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29644990 ggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 42342364 - 42342546
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  42342364 tgttgggtcactaaggggagccagggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagac 42342463  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342464 aatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 353
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935126
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacacaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaacacaa 39935126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 172 - 342
Target Start/End: Original strand, 12114550 - 12114720
Alignment:
Q  172 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12114550 gaggggagtctgggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12114649  T
Q  272 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114650 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32589861 - 32589704
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589861 ggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32589762  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589761 tataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 33803252 - 33803410
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33803252 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttact 33803351  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803352 tatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 54017793 - 54017974
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017793 tgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 54017891  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
      | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54017892 gttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 54017974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 54018198 - 54018356
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  54018198 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttact 54018297  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018298 tataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 29644581 - 29644739
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29644581 ggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttact 29644680  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644681 tataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29644739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389062
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  293 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 39389062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 41359765 - 41359919
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359765 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41359864  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  41359865 tataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgca 41359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 25739425 - 25739583
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  25739425 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 25739524  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739525 tatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 340
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463057
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  287 aaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52634833 - 52634678
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52634833 ggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt-ctcttact 52634735  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634734 tataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 21832345 - 21832501
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  21832345 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttact 21832442  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21832443 tataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgca 21832501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342248
Alignment:
Q  186 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgca 42342248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Original strand, 50612447 - 50612618
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt-----tatgggtcctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||     |||| ||||||    
T  50612447 ggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctc 50612546  T
Q  279 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612547 ttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50612618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304104
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-- 22304060  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22304061 -----acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 22304104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15773346 - 15773192
Alignment:
Q  190 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  15773346 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttata 15773247  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    || |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773246 agatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15773192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 201 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823646
Alignment:
Q  201 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 300  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  301 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaacac 4823646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31190168 - 31190017
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||    
T  31190168 aggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaac 31190077  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190076 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 53577522 - 53577364
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| |    
T  53577522 ggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatt 53577423  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577422 tttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25755552 - 25755396
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||    
T  25755552 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttact 25755453  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25755452 tataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 1634291 - 1634473
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    ||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1634291 tgttgtgtcactgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagcc 1634389  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634390 aatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395811
Alignment:
Q  187 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 286  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 3135454 - 3135617
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat--gggtcctctta 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3135454 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctctta 3135553  T
Q  282 c-----ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |     | |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3135554 ctaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45901873 - 45901715
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  45901873 aggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttac 45901774  T
Q  283 ttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45901773 ttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 184 - 341
Target Start/End: Original strand, 53117975 - 53118131
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||    
T  53117975 ggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcact 53118073  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53118074 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 182 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39914412 - 39914252
Alignment:
Q  182 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 281  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39914412 tagggggctgtctacatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctctta 39914313  T
Q  282 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914312 tttataaggtgttcaacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8328067 - 8327904
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaac----cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  8328067 aggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctc 8327968  T
Q  279 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327967 ttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 32462558 - 32462715
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||    
T  32462558 gggggccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttact 32462657  T
Q  284 tataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32462658 tataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttg 32462715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37726654 - 37726496
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |        |||||||||    
T  37726654 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat--------cctcttact 37726563  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726562 tataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 37726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336843
Alignment:
Q  192 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51886714 - 51886553
Alignment:
Q  183 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 282  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||      |||||| ||||||||||||||||||    
T  51886714 agggtaccgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctcttac 51886621  T
Q  283 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 350  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886620 ttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 51886553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 185 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11662108 - 11661954
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  11662108 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcact 11662010  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11662009 tttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 284
Target Start/End: Original strand, 22303634 - 22303759
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggg-gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303634 tgttgagtcagtgaggagaagctagggagaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagg 22303733  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttactt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22303734 caatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 340
Target Start/End: Original strand, 33175634 - 33175820
Alignment:
Q  159 gtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac--tcttacccaaaaccttaa 256  Q
    |||||||| || ||||||||||   |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  33175634 gtgttgggccactgaggggagctcgggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaa 33175733  T
Q  257 ggcaatgggtttat---gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||| ||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33175734 ggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240149
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |   |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||| | ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 9240149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 44160547 - 44160702
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  44160547 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatt 44160643  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160644 tataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 332
Target Start/End: Original strand, 42584799 - 42584970
Alignment:
Q  159 gtgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 258  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |  |||  |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||     
T  42584799 gtgttgggtcattgaggagagtcgggggagccgtccacattgaaactagaacaaccgcataagtaagag--acaccacactctttctcaaaatcttaaga 42584896  T
Q  259 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42584897 caattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 268
Target Start/End: Original strand, 41359467 - 41359575
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  41359467 tgttgggtcagcgaggggagtctgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggt 41359566  T
Q  260 aatgggttt 268  Q
     ||||||||    
T  41359567 tatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 342
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964676
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 309  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttgca 47964676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 316
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  218 caagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 316  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 351
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384433
Alignment:
Q  235 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  335 cacttgcaaaccaacac 351  Q
    | |||||| ||||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaacac 3384433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304237
Alignment:
Q  287 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 22304237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 342
Target Start/End: Original strand, 39336219 - 39336387
Alignment:
Q  172 gaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 270  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  39336219 gaggggagccaagggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttat 39336315  T
Q  271 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336316 ggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 272
Target Start/End: Original strand, 54017548 - 54017636
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 272  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017548 ggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 47964915 - 47965073
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| || | |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  47964915 ggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcact 47965014  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||   |||| |||||  ||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47965015 tatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 339
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  250 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661537
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc---------------cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtggga 11661554  T
Q  324 catataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661553 catataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22304376 - 22304302
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac 233  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304376 tgttgggtcagtgaggggaagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 339
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  234 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||  ||  ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  334 acactt 339  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346650
Alignment:
Q  286 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  214 cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12749316 - 12749211
Alignment:
Q  195 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 294  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12749316 acatccagactagaacaaccacataagtaagagtgagtccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgtt 12749217  T
Q  295 caacct 300  Q
    ||||||    
T  12749216 caacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  232 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8328427 - 8328374
Alignment:
Q  185 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8328427 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317161
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 309  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| ||     
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttc 25317191  T
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacactt 339  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317190 catctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25991521 - 25991405
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||||||    
T  25991521 agagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtggga 25991422  T
Q  324 catataactcacacttg 340  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25991421 catattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596027
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596342
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 287
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17732007
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 17732007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 287
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033238
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 19033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 262
Target Start/End: Original strand, 43978865 - 43978947
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact----cttacccaaaaccttaaggcaat 262  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  43978865 ggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Original strand, 7766783 - 7766857
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 260  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7766783 ggggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaag--tgagagacgccacaatcttacctaaaaccttaaggca 7766857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 275
Target Start/End: Original strand, 48127859 - 48127906
Alignment:
Q  228 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48127859 agacaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatgggtc 48127906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9239984 - 9239940
Alignment:
Q  171 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacca 215  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9239984 tgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaaaaacca 9239940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 342
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  310 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871049
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 16871049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 17735037 - 17735081
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17735037 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 17735081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 19036306 - 19036350
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19036306 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 19036350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143505
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 275  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggtc 16143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Original strand, 16869843 - 16869884
Alignment:
Q  230 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 271  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16869843 acaccacactcttgctcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 16869884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  276 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 337  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  276 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 337  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Original strand, 50329391 - 50329427
Alignment:
Q  243 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 279  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50329391 acccaaaaccttaaggcattggatttatgggtcctct 50329427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Original strand, 514 - 670
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 613  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  614 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Original strand, 147 - 309
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| ||||||||||    
T  147 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatgg-tcctcttact 241  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  242 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1262
Alignment:
Q  160 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 259  Q
    |||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1083 tgttgggtcactg-ggggagcttggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggc 1181  T
Q  260 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1182 aatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 295
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1802
Alignment:
Q  224 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 342
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3143
Alignment:
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5396
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 291  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  292 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5777
Alignment:
Q  193 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-----cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 287  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  288 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgca 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47518 - 47360
Alignment:
Q  184 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47518 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttact 47419  T
Q  284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47418 tataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 222 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5357
Alignment:
Q  222 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 321  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  322 gacatataactcacacttgca 342  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgca 5357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4982
Alignment:
Q  191 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||     
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  291 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 342  Q
    | || |||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 342
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17614
Alignment:
Q  226 agagacaccacactcttacccaaaa--ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  324 catataactcacacttgca 342  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgca 17614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 340
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  265 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  210 caaccacacaagcaagagagacacc-acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaa-cttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  309 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 340  Q
     ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39963 - 39840
Alignment:
Q  217 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 316  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| |||  ||||||   || ||| |||||||| | || |||||   ||| || |||||||    
T  39963 acaagcgagagagacaccacatttttaaccaaaattttaaggtaataagtttatatctcatctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccga 39864  T
Q  317 tgtgggacatataactcacacttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39863 tgtgggacatataactcacacttg 39840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2869
Alignment:
Q  264 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 348  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||  | |||||  || ||||||||| |||||||| ||||    
T  2953 ggtttatggatcctcttatatataaagtgttcaacctttacatttttaaacaatgtgaaacttataactcatacttgcaatccaa 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 304
Target Start/End: Original strand, 10406 - 10446
Alignment:
Q  264 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 304  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10406 ggtttatggatcctcttacatataaagtgttcaacctttac 10446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University