View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14352_low_21 (Length: 316)

Name: NF14352_low_21
Description: NF14352
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14352_low_21
NF14352_low_21
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (144-316)||(2324887-2325059)
chr2 (145-313)||(14660460-14660628)
chr2 (146-316)||(746477-746647)
chr2 (142-316)||(17600847-17601021)
chr2 (146-316)||(23901790-23901960)
chr2 (143-316)||(4034603-4034776)
chr2 (143-316)||(34518378-34518551)
chr2 (144-316)||(6594456-6594628)
chr2 (145-316)||(40635229-40635400)
chr2 (146-316)||(38997112-38997282)
chr2 (146-316)||(45371001-45371171)
chr2 (139-316)||(27651027-27651204)
chr2 (146-316)||(10244582-10244752)
chr2 (146-316)||(11184983-11185153)
chr2 (146-316)||(13815218-13815388)
chr2 (146-316)||(26710356-26710526)
chr2 (143-316)||(6430484-6430657)
chr2 (149-316)||(10424606-10424773)
chr2 (146-316)||(37620867-37621040)
chr2 (146-316)||(27400414-27400584)
chr2 (144-316)||(1091949-1092121)
chr2 (143-313)||(32856433-32856603)
chr2 (139-316)||(27024426-27024603)
chr2 (146-316)||(4609637-4609807)
chr2 (146-316)||(5726140-5726310)
chr2 (146-316)||(32327372-32327542)
chr2 (143-316)||(7892685-7892858)
chr2 (135-316)||(40735475-40735656)
chr2 (144-316)||(33427645-33427817)
chr2 (146-316)||(2914138-2914308)
chr2 (146-316)||(14697537-14697707)
chr2 (145-316)||(37255336-37255502)
chr2 (146-316)||(32948457-32948626)
chr2 (144-316)||(40037154-40037325)
chr2 (146-316)||(11159633-11159802)
chr2 (172-316)||(32608391-32608535)
chr2 (145-316)||(9444694-9444875)
chr2 (144-276)||(25294886-25295018)
chr2 (173-316)||(12842114-12842257)
chr2 (172-312)||(8432942-8433082)
chr2 (152-316)||(15925091-15925255)
chr2 (142-316)||(21734896-21735059)
chr2 (148-316)||(145293-145450)
chr2 (135-279)||(1229675-1229820)
chr2 (203-316)||(42899926-42900039)
chr2 (146-316)||(35158050-35158209)
chr2 (180-316)||(41172469-41172605)
chr2 (146-253)||(447633-447740)
chr2 (147-316)||(39103058-39103216)
chr2 (146-312)||(4258505-4258659)
chr2 (146-316)||(12333497-12333654)
chr2 (146-316)||(28641292-28641451)
chr2 (146-312)||(29687056-29687211)
chr2 (144-316)||(13543622-13543783)
chr2 (146-313)||(19428426-19428582)
chr2 (144-316)||(27331309-27331474)
chr2 (140-316)||(39301191-39301356)
chr2 (146-316)||(43898971-43899129)
chr2 (144-316)||(44481839-44482000)
chr2 (142-316)||(12730072-12730235)
chr2 (146-316)||(27764863-27765021)
chr2 (142-312)||(34249280-34249439)
chr2 (143-316)||(2688726-2688888)
chr2 (151-316)||(35126791-35126945)
chr2 (184-258)||(28014856-28014930)
chr2 (142-296)||(3711664-3711807)
chr2 (166-253)||(12827137-12827223)
chr2 (151-316)||(28566703-28566857)
chr2 (146-316)||(43356110-43356266)
chr2 (236-316)||(3266307-3266387)
chr2 (248-316)||(12814625-12814693)
chr2 (236-316)||(40544155-40544235)
chr2 (146-316)||(2000339-2000496)
chr2 (164-316)||(8056637-8056778)
chr2 (231-311)||(30545837-30545917)
chr2 (221-306)||(38985342-38985426)
chr2 (144-201)||(42900781-42900837)
chr2 (148-204)||(3266399-3266455)
chr2 (284-316)||(28019959-28019991)
chr2 (261-316)||(10176570-10176625)
chr2 (196-245)||(17799296-17799345)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (143-316)||(31308013-31308186)
chr1 (146-316)||(3611148-3611318)
chr1 (146-316)||(45538165-45538335)
chr1 (144-316)||(44661982-44662154)
chr1 (138-316)||(17994943-17995121)
chr1 (137-310)||(26085389-26085562)
chr1 (135-316)||(26277189-26277370)
chr1 (145-316)||(38790196-38790367)
chr1 (146-316)||(21139412-21139582)
chr1 (146-316)||(25678259-25678429)
chr1 (152-316)||(4068689-4068853)
chr1 (144-316)||(5981182-5981354)
chr1 (148-316)||(43251723-43251891)
chr1 (146-316)||(25058700-25058870)
chr1 (146-316)||(37620192-37620362)
chr1 (144-316)||(6327546-6327717)
chr1 (144-316)||(23932507-23932679)
chr1 (144-316)||(23984767-23984939)
chr1 (144-316)||(31040721-31040893)
chr1 (136-316)||(50774229-50774409)
chr1 (146-316)||(24245025-24245195)
chr1 (146-316)||(33112818-33112987)
chr1 (146-316)||(47383732-47383902)
chr1 (140-313)||(39646583-39646756)
chr1 (144-316)||(24885513-24885685)
chr1 (144-316)||(38331857-38332029)
chr1 (150-316)||(26794316-26794482)
chr1 (135-316)||(41999827-42000009)
chr1 (146-316)||(46967041-46967211)
chr1 (146-316)||(47671598-47671768)
chr1 (149-312)||(28888597-28888760)
chr1 (145-316)||(33884100-33884271)
chr1 (145-316)||(33959981-33960152)
chr1 (142-316)||(26524885-26525059)
chr1 (146-316)||(36566342-36566512)
chr1 (146-316)||(47317327-47317497)
chr1 (142-316)||(49253971-49254145)
chr1 (159-315)||(42863878-42864034)
chr1 (150-316)||(23220939-23221099)
chr1 (146-316)||(5980080-5980250)
chr1 (146-312)||(35273612-35273778)
chr1 (143-316)||(35692660-35692834)
chr1 (146-316)||(51057083-51057253)
chr1 (144-316)||(36003142-36003317)
chr1 (145-316)||(46616561-46616732)
chr1 (147-316)||(3285414-3285582)
chr1 (174-316)||(31844388-31844530)
chr1 (146-316)||(46784435-46784605)
chr1 (144-316)||(47187117-47187289)
chr1 (144-312)||(42313359-42313531)
chr1 (146-316)||(49398988-49399158)
chr1 (190-316)||(25518826-25518952)
chr1 (144-316)||(48373516-48373679)
chr1 (146-293)||(2450529-2450676)
chr1 (144-316)||(10928079-10928240)
chr1 (146-316)||(27983603-27983757)
chr1 (146-316)||(2657315-2657474)
chr1 (146-316)||(41467632-41467791)
chr1 (164-316)||(51403035-51403177)
chr1 (143-316)||(33073223-33073385)
chr1 (146-287)||(51045596-51045737)
chr1 (143-274)||(4808699-4808830)
chr1 (135-316)||(29770682-29770852)
chr1 (169-291)||(45475866-45475987)
chr1 (147-316)||(6626025-6626183)
chr1 (142-316)||(42234852-42235014)
chr1 (209-316)||(31979998-31980105)
chr1 (152-316)||(26472185-26472338)
chr1 (146-316)||(30289910-30290069)
chr1 (144-316)||(4953064-4953225)
chr1 (143-316)||(26685868-26686030)
chr1 (144-316)||(2954867-2955028)
chr1 (146-316)||(4243490-4243649)
chr1 (209-316)||(2556909-2557016)
chr1 (152-316)||(34752320-34752473)
chr1 (145-277)||(4156438-4156577)
chr1 (146-239)||(13312531-13312624)
chr1 (146-316)||(41895164-41895323)
chr1 (146-316)||(48683330-48683489)
chr1 (146-316)||(1388485-1388644)
chr1 (236-316)||(32448660-32448740)
chr1 (146-304)||(38716247-38716394)
chr1 (142-316)||(51155586-51155748)
chr1 (232-315)||(13313249-13313332)
chr1 (172-316)||(13281588-13281721)
chr1 (144-278)||(47772170-47772304)
chr1 (236-316)||(44544125-44544205)
chr1 (146-315)||(39475783-39475940)
chr1 (146-316)||(7561528-7561701)
chr1 (146-312)||(33187356-33187505)
chr1 (145-316)||(5961266-5961426)
chr1 (137-316)||(44293446-44293614)
chr1 (146-312)||(10920216-10920371)
chr1 (221-316)||(27924722-27924817)
chr1 (146-316)||(52323950-52324110)
chr1 (164-316)||(35991617-35991758)
chr1 (144-316)||(52367895-52368056)
chr1 (236-316)||(46428332-46428412)
chr1 (237-316)||(24649802-24649881)
chr1 (229-316)||(39637912-39637996)
chr1 (269-316)||(4156188-4156235)
chr1 (146-293)||(38718167-38718309)
chr1 (169-285)||(24215806-24215911)
chr1 (146-265)||(31286504-31286612)
chr1 (143-183)||(31844818-31844858)
chr1 (149-202)||(32448754-32448807)
chr1 (276-312)||(10919313-10919349)
chr1 (165-207)||(39359502-39359544)
chr1 (172-236)||(9779919-9779982)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (144-316)||(32984075-32984247)
chr8 (146-316)||(24079901-24080071)
chr8 (146-316)||(40435153-40435323)
chr8 (144-316)||(9303572-9303744)
chr8 (145-316)||(6365998-6366169)
chr8 (145-316)||(43328719-43328890)
chr8 (146-316)||(10646135-10646305)
chr8 (144-312)||(33730639-33730807)
chr8 (144-312)||(33981661-33981829)
chr8 (144-316)||(37956433-37956605)
chr8 (145-316)||(5946059-5946230)
chr8 (150-316)||(31830959-31831125)
chr8 (146-316)||(41862232-41862402)
chr8 (144-316)||(17718720-17718892)
chr8 (146-316)||(2714561-2714730)
chr8 (146-316)||(9734267-9734435)
chr8 (146-312)||(35628793-35628959)
chr8 (146-316)||(41653907-41654077)
chr8 (143-316)||(9013696-9013868)
chr8 (147-316)||(37301326-37301495)
chr8 (144-316)||(13356118-13356290)
chr8 (148-316)||(32114261-32114429)
chr8 (145-316)||(25185911-25186082)
chr8 (145-316)||(45236564-45236735)
chr8 (146-316)||(37419952-37420122)
chr8 (144-312)||(41231962-41232130)
chr8 (144-316)||(13760644-13760818)
chr8 (169-312)||(29048426-29048569)
chr8 (143-316)||(2275925-2276097)
chr8 (144-316)||(45066590-45066762)
chr8 (147-316)||(22878403-22878572)
chr8 (147-316)||(41639926-41640095)
chr8 (164-316)||(44088461-44088613)
chr8 (6-145)||(38873302-38873441)
chr8 (145-316)||(45258522-45258692)
chr8 (139-272)||(12032986-12033119)
chr8 (146-316)||(25248051-25248215)
chr8 (158-316)||(42701301-42701460)
chr8 (146-279)||(3904126-3904258)
chr8 (146-262)||(41981534-41981650)
chr8 (145-316)||(4447294-4447454)
chr8 (146-316)||(31940327-31940485)
chr8 (142-256)||(31336166-31336280)
chr8 (146-316)||(117329-117488)
chr8 (146-316)||(10378321-10378480)
chr8 (146-316)||(40458772-40458931)
chr8 (143-316)||(3211218-3211379)
chr8 (146-316)||(41843265-41843424)
chr8 (151-316)||(4975412-4975566)
chr8 (221-312)||(39915887-39915978)
chr8 (146-316)||(9713701-9713857)
chr8 (146-316)||(2379152-2379311)
chr8 (226-307)||(41981454-41981535)
chr8 (164-316)||(32373745-32373885)
chr8 (137-316)||(26196308-26196475)
chr8 (137-316)||(33896834-33897001)
chr8 (236-316)||(27243218-27243298)
chr8 (236-316)||(27254793-27254873)
chr8 (146-316)||(33622467-33622624)
chr8 (144-316)||(3490397-3490558)
chr8 (152-316)||(40649837-40649990)
chr8 (145-316)||(9509399-9509559)
chr8 (168-316)||(38631664-38631801)
chr8 (219-316)||(31148953-31149049)
chr8 (259-316)||(164734-164791)
chr8 (146-221)||(41425429-41425503)
chr8 (146-211)||(39901674-39901739)
chr8 (145-205)||(31148890-31148950)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (144-316)||(5882518-5882690)
chr6 (142-312)||(26377200-26377370)
chr6 (150-313)||(14891383-14891546)
chr6 (137-316)||(22551052-22551231)
chr6 (145-316)||(24168103-24168274)
chr6 (145-315)||(11988973-11989143)
chr6 (138-316)||(34527854-34528032)
chr6 (148-316)||(2892200-2892368)
chr6 (146-316)||(8615252-8615422)
chr6 (146-316)||(18101495-18101665)
chr6 (141-315)||(22341783-22341959)
chr6 (144-312)||(2593850-2594018)
chr6 (142-316)||(19415529-19415703)
chr6 (148-316)||(7345114-7345282)
chr6 (144-316)||(7393584-7393756)
chr6 (146-316)||(599904-600074)
chr6 (146-316)||(959904-960074)
chr6 (146-316)||(28947099-28947269)
chr6 (146-316)||(24224070-24224240)
chr6 (145-316)||(1970723-1970894)
chr6 (145-312)||(10507907-10508074)
chr6 (142-316)||(30743444-30743618)
chr6 (155-316)||(16703378-16703539)
chr6 (144-316)||(5294799-5294971)
chr6 (144-316)||(5299351-5299523)
chr6 (146-312)||(33452572-33452738)
chr6 (147-316)||(19281056-19281225)
chr6 (199-316)||(30467656-30467773)
chr6 (144-296)||(23261927-23262079)
chr6 (146-316)||(28948845-28949004)
chr6 (146-316)||(7167594-7167753)
chr6 (153-316)||(13329393-13329545)
chr6 (145-312)||(15965449-15965605)
chr6 (146-309)||(4487546-4487698)
chr6 (144-316)||(3291020-3291181)
chr6 (146-312)||(1398569-1398724)
chr6 (146-316)||(3786761-3786920)
chr6 (246-316)||(929671-929741)
chr6 (232-312)||(1939579-1939659)
chr6 (146-221)||(18661830-18661905)
chr6 (144-221)||(24913094-24913171)
chr6 (142-205)||(34262342-34262405)
chr6 (230-316)||(375797-375883)
chr6 (221-316)||(13844848-13844943)
chr6 (148-205)||(375729-375786)
chr6 (272-316)||(11743070-11743114)
[»] chr4 (127 HSPs)
chr4 (144-316)||(34276559-34276731)
chr4 (146-316)||(44984773-44984943)
chr4 (146-316)||(9798477-9798647)
chr4 (146-316)||(21366609-21366779)
chr4 (146-316)||(23437604-23437774)
chr4 (142-316)||(53461812-53461986)
chr4 (146-316)||(53854430-53854599)
chr4 (147-316)||(6019940-6020109)
chr4 (144-316)||(237489-237661)
chr4 (145-313)||(2826681-2826848)
chr4 (145-316)||(42085219-42085390)
chr4 (146-316)||(51363019-51363188)
chr4 (147-312)||(32366661-32366826)
chr4 (144-316)||(146427-146599)
chr4 (136-308)||(26091248-26091420)
chr4 (144-312)||(45797495-45797663)
chr4 (144-312)||(55776061-55776228)
chr4 (144-312)||(55840239-55840406)
chr4 (141-316)||(31532130-31532305)
chr4 (145-316)||(39077557-39077728)
chr4 (146-316)||(18462013-18462183)
chr4 (142-316)||(22618510-22618682)
chr4 (146-308)||(54574940-54575102)
chr4 (148-316)||(397414-397582)
chr4 (148-316)||(41702461-41702629)
chr4 (144-316)||(42765840-42766011)
chr4 (149-316)||(6285319-6285486)
chr4 (145-316)||(43471694-43471865)
chr4 (145-316)||(55056258-55056429)
chr4 (146-316)||(27373088-27373257)
chr4 (146-316)||(29478372-29478542)
chr4 (146-316)||(41560340-41560510)
chr4 (146-316)||(47344668-47344838)
chr4 (143-316)||(19387685-19387858)
chr4 (146-316)||(41949394-41949566)
chr4 (146-316)||(49881059-49881233)
chr4 (136-316)||(47662092-47662272)
chr4 (145-316)||(31914210-31914380)
chr4 (142-316)||(29777253-29777427)
chr4 (146-316)||(31972336-31972506)
chr4 (146-316)||(42033187-42033357)
chr4 (146-316)||(56022998-56023168)
chr4 (145-316)||(3170638-3170809)
chr4 (141-316)||(3692205-3692380)
chr4 (146-316)||(407766-407934)
chr4 (146-316)||(42222303-42222473)
chr4 (150-316)||(50534643-50534809)
chr4 (146-316)||(54607974-54608144)
chr4 (143-316)||(2243470-2243643)
chr4 (143-316)||(31070071-31070243)
chr4 (142-316)||(38591680-38591850)
chr4 (143-316)||(50234012-50234185)
chr4 (143-316)||(50457807-50457980)
chr4 (144-316)||(1932775-1932947)
chr4 (146-312)||(23609103-23609269)
chr4 (146-312)||(54086425-54086590)
chr4 (146-316)||(55519839-55520009)
chr4 (144-316)||(48657836-48658002)
chr4 (146-309)||(54425001-54425163)
chr4 (150-316)||(35446518-35446683)
chr4 (144-316)||(14017374-14017544)
chr4 (155-316)||(33897504-33897665)
chr4 (136-316)||(50536614-50536794)
chr4 (146-316)||(48313569-48313737)
chr4 (163-316)||(22468787-22468940)
chr4 (147-316)||(53834055-53834224)
chr4 (146-316)||(41632007-41632176)
chr4 (164-316)||(39587797-39587949)
chr4 (146-288)||(52728307-52728448)
chr4 (143-316)||(48259509-48259680)
chr4 (146-316)||(54805614-54805788)
chr4 (144-316)||(48654826-48655004)
chr4 (144-272)||(36532828-36532956)
chr4 (146-316)||(45633779-45633938)
chr4 (148-316)||(51951694-51951861)
chr4 (146-316)||(9997931-9998090)
chr4 (146-316)||(15060289-15060448)
chr4 (143-316)||(20351839-20352001)
chr4 (146-273)||(42509351-42509478)
chr4 (144-316)||(37239088-37239249)
chr4 (144-316)||(43890940-43891101)
chr4 (144-316)||(54715047-54715208)
chr4 (169-316)||(5117461-5117597)
chr4 (146-243)||(35595772-35595869)
chr4 (142-316)||(31881310-31881473)
chr4 (146-316)||(34552331-34552490)
chr4 (146-316)||(54216736-54216895)
chr4 (145-316)||(38547600-38547760)
chr4 (145-316)||(46708740-46708900)
chr4 (146-312)||(22620609-22620764)
chr4 (142-316)||(34835189-34835352)
chr4 (143-316)||(47811918-47812080)
chr4 (144-312)||(4486579-4486736)
chr4 (146-314)||(49014112-49014269)
chr4 (148-316)||(54216325-54216482)
chr4 (146-316)||(52688361-52688520)
chr4 (144-316)||(27873548-27873707)
chr4 (145-305)||(52461386-52461535)
chr4 (146-316)||(33289715-33289873)
chr4 (143-312)||(46720041-46720202)
chr4 (190-280)||(52396774-52396865)
chr4 (147-248)||(35344868-35344968)
chr4 (146-316)||(573815-573974)
chr4 (150-316)||(27398607-27398762)
chr4 (221-316)||(14335165-14335260)
chr4 (221-316)||(27580131-27580226)
chr4 (236-316)||(3293102-3293182)
chr4 (236-316)||(11972208-11972288)
chr4 (146-300)||(27872607-27872750)
chr4 (147-219)||(33048990-33049062)
chr4 (221-316)||(1662323-1662418)
chr4 (144-316)||(6371247-6371408)
chr4 (148-312)||(33557944-33558097)
chr4 (244-316)||(42557594-42557666)
chr4 (143-223)||(48259701-48259780)
chr4 (229-312)||(43231518-43231601)
chr4 (138-291)||(51981471-51981613)
chr4 (142-251)||(42558270-42558371)
chr4 (222-316)||(49057933-49058027)
chr4 (137-214)||(3291796-3291873)
chr4 (222-316)||(18206583-18206681)
chr4 (277-316)||(17555617-17555656)
chr4 (144-198)||(1662259-1662313)
chr4 (240-299)||(43478089-43478147)
chr4 (145-187)||(14335100-14335142)
chr4 (174-315)||(49304518-49304657)
chr4 (146-198)||(18206512-18206564)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (146-316)||(25893917-25894087)
chr7 (146-316)||(33411273-33411443)
chr7 (144-316)||(49171360-49171532)
chr7 (147-316)||(33423276-33423445)
chr7 (144-316)||(33839713-33839885)
chr7 (146-316)||(45690097-45690267)
chr7 (143-316)||(17855441-17855614)
chr7 (144-308)||(36389377-36389541)
chr7 (144-316)||(47066975-47067147)
chr7 (145-316)||(35328068-35328239)
chr7 (145-312)||(35355905-35356072)
chr7 (144-316)||(46913122-46913296)
chr7 (138-312)||(5183817-5183991)
chr7 (146-316)||(22979647-22979817)
chr7 (146-316)||(23393051-23393221)
chr7 (146-316)||(33695821-33695991)
chr7 (144-316)||(2341659-2341832)
chr7 (144-316)||(31586861-31587033)
chr7 (144-316)||(45482671-45482843)
chr7 (145-316)||(37846015-37846186)
chr7 (146-316)||(20165814-20165984)
chr7 (146-316)||(27018129-27018299)
chr7 (146-316)||(47740331-47740501)
chr7 (155-316)||(15877563-15877724)
chr7 (143-316)||(40670576-40670749)
chr7 (140-316)||(5712181-5712357)
chr7 (137-316)||(33332802-33332980)
chr7 (146-316)||(48609677-48609847)
chr7 (146-316)||(10028501-10028673)
chr7 (144-316)||(26579715-26579887)
chr7 (158-316)||(41990870-41991028)
chr7 (135-312)||(35757009-35757186)
chr7 (145-316)||(31625717-31625887)
chr7 (146-316)||(19563460-19563630)
chr7 (146-304)||(29446863-29447020)
chr7 (146-316)||(43499498-43499668)
chr7 (146-316)||(45063357-45063525)
chr7 (147-314)||(33870260-33870424)
chr7 (144-316)||(35767494-35767659)
chr7 (145-316)||(10618311-10618475)
chr7 (146-312)||(31429475-31429641)
chr7 (180-316)||(33720070-33720206)
chr7 (144-316)||(35752032-35752193)
chr7 (146-283)||(28233936-28234073)
chr7 (145-277)||(30076526-30076658)
chr7 (170-311)||(44564356-44564497)
chr7 (145-316)||(46817420-46817580)
chr7 (145-316)||(37127950-37128110)
chr7 (142-262)||(41904272-41904392)
chr7 (146-316)||(43489231-43489390)
chr7 (143-316)||(24923021-24923183)
chr7 (140-316)||(7876322-7876487)
chr7 (146-316)||(36816845-36817004)
chr7 (144-316)||(46898014-46898175)
chr7 (145-316)||(48085871-48086031)
chr7 (155-316)||(26941541-26941691)
chr7 (139-253)||(44405424-44405538)
chr7 (145-316)||(24228554-24228714)
chr7 (146-316)||(498188-498347)
chr7 (145-316)||(44003369-44003529)
chr7 (147-316)||(33393341-33393499)
chr7 (146-312)||(2332036-2332191)
chr7 (146-316)||(21718130-21718288)
chr7 (146-312)||(26371066-26371221)
chr7 (146-316)||(29610648-29610807)
chr7 (147-312)||(45502817-45502971)
chr7 (180-316)||(32556640-32556765)
chr7 (144-316)||(39323629-39323781)
chr7 (142-316)||(47906754-47906918)
chr7 (142-316)||(45237529-45237692)
chr7 (237-316)||(29098764-29098843)
chr7 (144-316)||(25037506-25037667)
chr7 (164-316)||(41855072-41855213)
chr7 (148-316)||(39453484-39453634)
chr7 (146-316)||(7257394-7257553)
chr7 (236-316)||(39866678-39866758)
chr7 (221-316)||(16482847-16482942)
chr7 (143-316)||(44659857-44660018)
chr7 (147-316)||(46103134-46103291)
chr7 (146-304)||(47460772-47460919)
chr7 (148-304)||(15643948-15644093)
chr7 (228-312)||(29863032-29863116)
chr7 (236-316)||(33455109-33455189)
chr7 (148-312)||(35484653-35484807)
chr7 (144-316)||(38448446-38448607)
chr7 (143-289)||(37443599-37443734)
chr7 (261-315)||(35557744-35557798)
chr7 (228-316)||(7720574-7720662)
chr7 (264-316)||(30077043-30077095)
chr7 (266-316)||(35823303-35823353)
chr7 (220-281)||(26456157-26456218)
chr7 (146-211)||(42272180-42272244)
chr7 (221-316)||(21649442-21649538)
chr7 (150-218)||(29098847-29098915)
chr7 (164-204)||(39866762-39866802)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (146-316)||(24253394-24253564)
chr5 (145-316)||(35626050-35626221)
chr5 (146-316)||(43326379-43326549)
chr5 (147-316)||(15398483-15398652)
chr5 (145-316)||(739703-739874)
chr5 (145-316)||(39932591-39932762)
chr5 (137-316)||(43262174-43262353)
chr5 (148-312)||(6901815-6901979)
chr5 (145-313)||(7722064-7722232)
chr5 (145-316)||(3466680-3466851)
chr5 (141-316)||(18479663-18479838)
chr5 (146-316)||(5184984-5185154)
chr5 (146-316)||(15683803-15683973)
chr5 (146-311)||(27938914-27939080)
chr5 (146-316)||(40278858-40279028)
chr5 (146-316)||(40886028-40886197)
chr5 (146-312)||(12648813-12648979)
chr5 (146-316)||(27501055-27501225)
chr5 (146-316)||(31938909-31939079)
chr5 (143-291)||(29789292-29789440)
chr5 (145-316)||(25831533-25831703)
chr5 (146-312)||(2484292-2484458)
chr5 (147-316)||(27278474-27278647)
chr5 (145-316)||(5137727-5137898)
chr5 (142-316)||(38756483-38756658)
chr5 (146-308)||(13504742-13504904)
chr5 (144-316)||(28424793-28424963)
chr5 (146-286)||(34451292-34451432)
chr5 (148-316)||(40110246-40110413)
chr5 (145-316)||(890918-891088)
chr5 (144-316)||(33617597-33617758)
chr5 (142-311)||(763740-763909)
chr5 (160-316)||(4149706-4149852)
chr5 (137-316)||(38015505-38015673)
chr5 (147-316)||(9424593-9424751)
chr5 (144-312)||(5497289-5497446)
chr5 (146-316)||(19295742-19295901)
chr5 (146-316)||(27503391-27503550)
chr5 (144-316)||(23195246-23195407)
chr5 (143-316)||(13957682-13957844)
chr5 (155-316)||(42658671-42658821)
chr5 (144-316)||(6973075-6973236)
chr5 (146-312)||(14971994-14972149)
chr5 (146-316)||(31293989-31294159)
chr5 (146-316)||(9374502-9374661)
chr5 (184-316)||(40632511-40632634)
chr5 (164-316)||(36365463-36365604)
chr5 (145-316)||(27390609-27390769)
chr5 (146-301)||(3656568-3656712)
chr5 (149-316)||(6206896-6207052)
chr5 (148-302)||(36948492-36948633)
chr5 (217-316)||(12558090-12558188)
chr5 (146-316)||(2585474-2585633)
chr5 (220-316)||(5120037-5120132)
chr5 (240-316)||(42247865-42247941)
chr5 (144-316)||(38637908-38638069)
chr5 (145-316)||(36472284-36472443)
chr5 (142-316)||(1402501-1402664)
chr5 (146-316)||(24167784-24167943)
chr5 (147-316)||(33623940-33624098)
chr5 (141-294)||(38492647-38492788)
chr5 (146-312)||(18327173-18327328)
chr5 (142-302)||(612753-612900)
chr5 (243-316)||(9171111-9171184)
chr5 (144-316)||(40686911-40687071)
chr5 (261-316)||(9527124-9527179)
chr5 (237-304)||(3940411-3940478)
chr5 (261-316)||(15300977-15301032)
chr5 (146-209)||(3940336-3940399)
chr5 (229-295)||(20207088-20207154)
chr5 (268-314)||(28756092-28756138)
chr5 (143-220)||(9171032-9171108)
chr5 (268-313)||(27584400-27584447)
chr5 (140-180)||(40633525-40633565)
[»] chr3 (111 HSPs)
chr3 (138-316)||(47257805-47257983)
chr3 (144-316)||(7855112-7855284)
chr3 (144-316)||(40130957-40131129)
chr3 (142-316)||(38416720-38416894)
chr3 (144-316)||(47809594-47809767)
chr3 (143-316)||(49330049-49330222)
chr3 (141-316)||(28048387-28048562)
chr3 (143-316)||(20754390-20754563)
chr3 (147-316)||(51170034-51170203)
chr3 (145-316)||(27066977-27067148)
chr3 (146-316)||(22399109-22399278)
chr3 (146-316)||(24100295-24100464)
chr3 (146-316)||(41464364-41464534)
chr3 (146-316)||(52628966-52629135)
chr3 (143-316)||(43612044-43612217)
chr3 (144-316)||(32234396-32234567)
chr3 (144-316)||(42291854-42292026)
chr3 (145-316)||(29625826-29625997)
chr3 (145-312)||(35748310-35748477)
chr3 (145-316)||(40419847-40420018)
chr3 (146-316)||(37324553-37324723)
chr3 (142-316)||(39634568-39634741)
chr3 (146-312)||(40643816-40643982)
chr3 (142-316)||(55453240-55453414)
chr3 (148-316)||(48609735-48609903)
chr3 (145-316)||(2666012-2666183)
chr3 (145-316)||(48739232-48739403)
chr3 (143-305)||(46126010-46126171)
chr3 (144-312)||(35594137-35594305)
chr3 (144-316)||(51452749-51452920)
chr3 (145-316)||(40804509-40804680)
chr3 (146-316)||(37313411-37313581)
chr3 (146-316)||(44222841-44223011)
chr3 (146-316)||(51102378-51102548)
chr3 (143-316)||(44806696-44806869)
chr3 (144-316)||(7755305-7755476)
chr3 (144-316)||(53943586-53943757)
chr3 (145-312)||(18946919-18947086)
chr3 (146-316)||(41732540-41732710)
chr3 (147-316)||(43021726-43021896)
chr3 (146-316)||(46134368-46134538)
chr3 (143-316)||(43125843-43126015)
chr3 (144-316)||(39053406-39053578)
chr3 (144-316)||(41293317-41293488)
chr3 (148-316)||(43183924-43184092)
chr3 (146-316)||(5560025-5560202)
chr3 (168-316)||(52215088-52215236)
chr3 (144-316)||(52638854-52639026)
chr3 (148-316)||(53832486-53832654)
chr3 (171-316)||(24376585-24376730)
chr3 (144-316)||(41216467-41216639)
chr3 (146-316)||(36368951-36369120)
chr3 (179-316)||(53637853-53637990)
chr3 (148-316)||(47894822-47894990)
chr3 (146-312)||(51146215-51146381)
chr3 (164-312)||(46949391-46949537)
chr3 (143-316)||(42589842-42590004)
chr3 (144-316)||(25641658-25641819)
chr3 (142-316)||(31286789-31286952)
chr3 (142-316)||(51415981-51416144)
chr3 (148-316)||(54159000-54159158)
chr3 (144-316)||(54401199-54401360)
chr3 (144-261)||(33550465-33550582)
chr3 (145-316)||(54707219-54707379)
chr3 (146-316)||(34279721-34279880)
chr3 (146-316)||(38156632-38156791)
chr3 (142-316)||(49130590-49130753)
chr3 (144-316)||(55000176-55000337)
chr3 (143-312)||(48546837-48546995)
chr3 (144-316)||(39141123-39141285)
chr3 (144-268)||(52864550-52864673)
chr3 (143-316)||(41635797-41635959)
chr3 (182-311)||(37758946-37759075)
chr3 (146-316)||(47510940-47511099)
chr3 (146-316)||(55379997-55380156)
chr3 (144-316)||(53115459-53115620)
chr3 (145-316)||(25353566-25353726)
chr3 (146-316)||(37028735-37028894)
chr3 (148-316)||(45058895-45059052)
chr3 (144-315)||(30251499-30251659)
chr3 (171-316)||(17665549-17665683)
chr3 (147-316)||(42998790-42998947)
chr3 (141-316)||(40022086-40022250)
chr3 (146-316)||(24688126-24688285)
chr3 (147-316)||(51143829-51143987)
chr3 (197-279)||(47182049-47182131)
chr3 (146-316)||(51224038-51224196)
chr3 (142-312)||(44945931-44946084)
chr3 (229-316)||(41882063-41882150)
chr3 (146-316)||(43176738-43176897)
chr3 (146-316)||(50731914-50732073)
chr3 (146-316)||(50780783-50780942)
chr3 (217-316)||(2227995-2228094)
chr3 (229-316)||(21597220-21597307)
chr3 (229-316)||(28576184-28576271)
chr3 (217-316)||(47402810-47402908)
chr3 (229-316)||(48726070-48726157)
chr3 (146-300)||(52756067-52756214)
chr3 (145-233)||(30429226-30429314)
chr3 (143-272)||(48534004-48534122)
chr3 (146-297)||(40165682-40165822)
chr3 (217-297)||(41609098-41609178)
chr3 (135-316)||(177173-177343)
chr3 (217-316)||(8847718-8847817)
chr3 (252-316)||(48752097-48752161)
chr3 (252-316)||(52434151-52434216)
chr3 (276-316)||(37741447-37741487)
chr3 (145-187)||(41882010-41882052)
chr3 (147-205)||(48752226-48752284)
chr3 (147-188)||(37760345-37760386)
chr3 (284-316)||(51942543-51942575)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (142-316)||(13758-13932)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (144-316)||(39554-39726)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (146-316)||(1881-2051)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (146-316)||(11133-11302)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (144-316)||(278018-278192)
scaffold0007 (145-316)||(176666-176837)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (144-316)||(75242-75414)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (146-316)||(2432-2602)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (143-312)||(18851-19020)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (174-316)||(32573-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (146-286)||(4596-4736)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (145-316)||(3100-3262)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (146-316)||(7102-7262)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (146-316)||(14756-14915)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (146-316)||(20477-20636)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (146-316)||(114-272)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (146-316)||(4554-4714)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (146-316)||(3404-3564)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (180-316)||(17918-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (222-316)||(19229-19327)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 2324887 - 2325059
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2324887 aaggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 2324986  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2324987 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 2325059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14660628 - 14660460
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660628 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 14660529  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660528 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 14660460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 746647 - 746477
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  746647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 746548  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 746477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17601021 - 17600847
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17601021 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 17600922  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17600921 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 17600847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23901960 - 23901790
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901960 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23901861  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901860 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 23901790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4034776 - 4034603
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034776 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 4034677  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034676 tatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 4034603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34518551 - 34518378
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518551 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 34518452  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518451 tatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 34518378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 6594456 - 6594628
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594456 aaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 6594555  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594556 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 6594628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40635400 - 40635229
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40635400 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 40635301  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40635300 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaa 40635229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38997282 - 38997112
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997282 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 38997183  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997182 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 38997112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45371171 - 45371001
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371171 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45371072  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45371071 cttgaccccgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 45371001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 139 - 316
Target Start/End: Original strand, 27651027 - 27651204
Alignment:
Q  139 aaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651027 aaatttaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 27651126  T
Q  239 gaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651127 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgggcggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 27651204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 10244582 - 10244752
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244582 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10244681  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244682 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 10244752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11185153 - 11184983
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185153 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11185054  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11185053 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaa 11184983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 13815218 - 13815388
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815218 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13815317  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815318 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 13815388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26710526 - 26710356
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710526 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26710427  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710426 cttgaccccaccaacaaaatgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 26710356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6430657 - 6430484
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430657 taaggtaataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 6430558  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6430557 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaa 6430484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10424773 - 10424606
Alignment:
Q  149 gacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424773 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 10424674  T
Q  249 gaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424673 gaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 10424606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 37620867 - 37621040
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620867 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatccaaaccaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37620966  T
Q  246 cttg---accccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620967 cttgagtaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 37621040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27400584 - 27400414
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400584 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 27400485  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400484 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 27400414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 1091949 - 1092121
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1091949 aaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 1092048  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1092049 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 1092121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Original strand, 32856433 - 32856603
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32856433 taaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatgaac 32856532  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32856533 tatcttgatcccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagg 32856603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27024603 - 27024426
Alignment:
Q  139 aaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27024603 aaattaaggtgacaactagggtacccatggaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataatcatatttttaagtggtatccat 27024504  T
Q  239 gaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024503 gaactatcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggtttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 27024426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4609807 - 4609637
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609807 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttggataatttaccccaaccaatacacattaggcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4609708  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609707 cttgaccccaccaacaaattacttattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 4609637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5726310 - 5726140
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5726310 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtaaccatgaactat 5726211  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5726210 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 5726140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32327542 - 32327372
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32327542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 32327443  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32327442 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggctggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 32327372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 7892685 - 7892858
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7892685 taaggtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaac 7892784  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892785 tatattgaccccgccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 7892858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40735656 - 40735475
Alignment:
Q  135 aattaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 234  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40735656 aattatattatggtgacaattagggtactcatggaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagtacatttttaagtggtat 40735557  T
Q  235 ccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735556 ccataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 40735475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 33427645 - 33427817
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33427645 aaggtgataactagggtacccatgaaagaatggtgtgtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 33427744  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33427745 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattattcaaaggtaa 33427817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 2914138 - 2914308
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914138 ggtgacaactaggatatccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccgatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2914237  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2914238 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 2914308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 14697537 - 14697707
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697537 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14697636  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14697637 cttgatcacaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 14697707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 37255336 - 37255502
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255336 aggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 37255435  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  37255436 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt-----ccattcttcaaaggtaa 37255502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32948626 - 32948457
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32948626 ggtgacaactagagtacccatagaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact-t 32948528  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32948527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 32948457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40037325 - 40037154
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40037325 aaggtgacaactagggtacccatgaaa-aatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 40037227  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40037226 atcttgaccccaccaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaa 40037154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11159802 - 11159633
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11159802 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccatccaatacacaatagccacataaacacatttttaagtggcatccatgaactat 11159703  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11159702 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaatta-ccaccatttttcaaaggtaa 11159633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32608535 - 32608391
Alignment:
Q  172 aatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcat 271  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32608535 aatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactatcttgacaccaccaacaaattgctcat 32608436  T
Q  272 tttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608435 tttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 32608391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9444875 - 9444694
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaat---ggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9444875 aggtgacaactagggtatccatggaagaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 9444776  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgg-------gtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9444775 ctatcttgaccccaccagcaaattgctcattttcattggttggtgggtaattggtaaattacccaccattcttcaaatgtaa 9444694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 144 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25295018 - 25294886
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25295018 aaggggacaactagggtactcatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 25294919  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttca 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25294918 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttca 25294886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12842257 - 12842114
Alignment:
Q  173 atggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcatt 272  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  12842257 atggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaattggtatccaagaactatcttgactccaccaacaaattactcatt 12842158  T
Q  273 ttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12842157 ttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 12842114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 8432942 - 8433082
Alignment:
Q  172 aatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcat 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8432942 aatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtatattttaaagtggtatccatgaactatcttgaccacaccaacaaattgctcat 8433041  T
Q  272 tttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8433042 tttcattggttggcaggtaaattatccaccattcttcaaag 8433082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15925255 - 15925091
Alignment:
Q  152 aactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 251  Q
    ||||||||||   ||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15925255 aactagggtatctatgaaagaatgatggataatttacctcaaccaatacacattagctacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 15925156  T
Q  252 cccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15925155 cccaccaataaattactcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttgaaaggtaa 15925091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 21734896 - 21735059
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||           ||| ||||||    
T  21734896 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaa 21734984  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21734985 ctatcttgacccccccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 21735059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145293
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||    
T  145450 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaactatct 145362  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  145361 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 145293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1229820 - 1229675
Alignment:
Q  135 aattaaattaaggtgacaactagggta-ctcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggta 233  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1229820 aattaaatagaggtgacaacttgggtaacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatatattagccagataagcacatttttaagtggta 1229721  T
Q  234 tccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1229720 tccatgaactatcttgaccccatcaacaaattgttcattttcattg 1229675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42900039 - 42899926
Alignment:
Q  203 attagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacca 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42900039 attagccacataagcgcatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaacca 42899940  T
Q  303 ttcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||||||    
T  42899939 ttcttcgaaggtaa 42899926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 35158050 - 35158209
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  35158050 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 35158138  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35158139 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 35158209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41172605 - 41172469
Alignment:
Q  180 gtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattg 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  41172605 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtacctttgaactatcttgacctcaccaataaattactcattttcattg 41172506  T
Q  280 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41172505 gttggtgggtaaattacccatcattcttcaaatgtaa 41172469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 253
Target Start/End: Original strand, 447633 - 447740
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  447633 ggtgacaactagggtacccatggatgaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 447732  T
Q  246 cttgaccc 253  Q
    ||||||||    
T  447733 cttgaccc 447740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39103216 - 39103058
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||     
T  39103216 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatt 39103128  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39103127 ttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 39103058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4258659 - 4258505
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  4258659 ggtgacaactaggctacccatgaacgaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 4258571  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4258570 cttgaccc-acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 4258505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 12333497 - 12333654
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||    
T  12333497 ggtgacaactaggctac-catgaaagaatgatgggtaattta-cccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 12333583  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12333584 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 12333654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 28641292 - 28641451
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||           ||||||||||    
T  28641292 ggtgacaactaggctacccatgaaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatatatt-----------catgaactat 28641380  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28641381 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 28641451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29687211 - 29687056
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  29687211 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29687123  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29687122 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 29687056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 13543622 - 13543783
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  13543622 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 13543710  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13543711 atcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 13543783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 313
Target Start/End: Original strand, 19428426 - 19428582
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  19428426 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 19428514  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 313  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19428515 cttgaccccacaagtaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 19428582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27331474 - 27331309
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||       | ||||||||    
T  27331474 aaggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacatattagccacataagcacatatata-------ttcatgaact 27331382  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331381 atcttgaccctacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 27331309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 316
Target Start/End: Original strand, 39301191 - 39301356
Alignment:
Q  140 aattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 239  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||| ||           ||||    
T  39301191 aattagggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagtcatataagcacatatt-----------catg 39301279  T
Q  240 aactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39301280 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 39301356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 43898971 - 43899129
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  43898971 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaattta-cccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43899058  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43899059 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaa 43899129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44482000 - 44481839
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||           ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  44482000 aaggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacttt-----------cacctttttaggtggtatccataaact 44481912  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44481911 atcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 44481839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12730235 - 12730072
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||           ||||    
T  12730235 ttaaggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagtcacataagcacatattta-----------tgaa 12730147  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12730146 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 12730072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 27764863 - 27765021
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  27764863 ggtggcaactaggctacccatgaaaga-tgatggttaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27764950  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27764951 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaa 27765021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34249439 - 34249280
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||| ||    
T  34249439 ttaaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagtcacataagcacatatt-----------cataaa 34249351  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34249350 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattactcaccattcttcaaag 34249280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 2688726 - 2688888
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||    
T  2688726 taaggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 2688814  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2688815 tatcttgaccctacaaataaattgctaattttcattaatcggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 2688888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35126945 - 35126791
Alignment:
Q  151 caactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttga 250  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35126945 caactagggtatctatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatcttga 35126857  T
Q  251 ccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35126856 ccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccgtttttcaaaggtaa 35126791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 258
Target Start/End: Original strand, 28014856 - 28014930
Alignment:
Q  184 tttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccacta 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014856 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccacta 28014930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3711807 - 3711664
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||| ||||||    
T  3711807 ttaaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcaca-----------tattcatgaa 3711719  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 296  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3711718 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtaggtaaattac 3711664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12827223 - 12827137
Alignment:
Q  166 tggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccc 253  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12827223 tggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactatcttaaccc 12827137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 316
Target Start/End: Original strand, 28566703 - 28566857
Alignment:
Q  151 caactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttga 250  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  28566703 caactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 28566791  T
Q  251 ccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28566792 ccccagaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaagtaa 28566857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43356266 - 43356110
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||  |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  43356266 ggtgacaactaggctaaccatgaaagaatcatgggtaatttactcaaaccaatacaaattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43356178  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  43356177 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggt---ttacccaccattcttcaaaggtaa 43356110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3266387 - 3266307
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3266387 catgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaa 3266307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12814693 - 12814625
Alignment:
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814693 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 12814625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 40544155 - 40544235
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40544155 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaactatccaccattcttcaaaggtaa 40544235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 2000339 - 2000496
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||           ||||||||    
T  2000339 ggtgacaactaggctac-catgaaagaatgatgagtaatttaccccaac-aatacatatgagccacgtaagcacatattta-----------tgaactat 2000425  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2000426 tttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 2000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8056778 - 8056637
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||           ||||||||||||| || |||| || |||    
T  8056778 catgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagctacataagcgcatatt-----------catgaactatcttcactccacaaataaa 8056690  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8056689 tagttcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 8056637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30545917 - 30545837
Alignment:
Q  231 gtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30545917 gtatccacgaactatcttgaccccaccaataagttgctcatttttattgtttggtaggtaaattatccaccattcttcaaa 30545837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Original strand, 38985342 - 38985426
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattct 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  38985342 tttttaggtggtatccatgaactatcttgacatatc-aataaattgctcattttcattggttggtgagtaaattactcaccgttct 38985426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42900837 - 42900781
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaataca 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42900837 aaggtgacaactagg-tacacatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaataca 42900781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3266455 - 3266399
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacat 204  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3266455 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacat 3266399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 28019959 - 28019991
Alignment:
Q  284 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28019959 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 28019991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10176625 - 10176570
Alignment:
Q  261 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10176625 aaattgctcattttcattaattggtgaataagttacccaccattctttaaaggtaa 10176570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 245
Target Start/End: Original strand, 17799296 - 17799345
Alignment:
Q  196 aatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17799296 aataaacattagccacatattcatatttttaagtggtattcatgaactat 17799345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31308186 - 31308013
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308186 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 31308087  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308086 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 31308013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3611318 - 3611148
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611318 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 3611219  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611218 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 3611148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45538335 - 45538165
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538335 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45538236  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 45538165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44662154 - 44661982
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44662154 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 44662055  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662054 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 44661982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 138 - 316
Target Start/End: Original strand, 17994943 - 17995121
Alignment:
Q  138 taaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 237  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994943 taaataaaggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 17995042  T
Q  238 tgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17995043 tgaattatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 17995121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 137 - 310
Target Start/End: Original strand, 26085389 - 26085562
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26085389 ttaaatcatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattc 26085488  T
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085489 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaa 26085562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 135 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26277370 - 26277189
Alignment:
Q  135 aattaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 234  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26277370 aattaaataatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacaaatttttaagtggtat 26277271  T
Q  235 ccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277270 ccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 26277189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 38790196 - 38790367
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38790196 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccataaacta 38790295  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38790296 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaaccattcttcaaaggtaa 38790367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 21139412 - 21139582
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139412 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21139511  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21139512 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatacttcaaaggtaa 21139582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 25678259 - 25678429
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678259 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25678358  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25678359 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 25678429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Original strand, 4068689 - 4068853
Alignment:
Q  152 aactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 251  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068689 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 4068788  T
Q  252 cccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4068789 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 4068853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5981354 - 5981182
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981354 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 5981255  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981254 atcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 5981182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43251891 - 43251723
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251891 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43251792  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43251791 tgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 43251723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25058870 - 25058700
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058870 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25058771  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058770 tttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 25058700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 37620192 - 37620362
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620192 ggtgacaactagggtacacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaggacatttttaagtggtatccatgaactat 37620291  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620292 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 37620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 6327546 - 6327717
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327546 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtca-ataagcacatttttaagtggtatccatgaact 6327644  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327645 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 6327717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 23932507 - 23932679
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23932507 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctgatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtgtccatgaact 23932606  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932607 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 23932679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23984939 - 23984767
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984939 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 23984840  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984839 atcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 23984767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31040893 - 31040721
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31040893 aaggtgacaactagggtacccatggaataatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 31040794  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31040793 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 31040721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 136 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50774409 - 50774229
Alignment:
Q  136 attaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc 235  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50774409 attaattttaggtgacaactagggtacccatggaagaaaggtgggtaatttatcccaaccaatacacattggtcacataagcatatttttaagtggtatc 50774310  T
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50774309 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaa 50774229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 24245025 - 24245195
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245025 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24245124  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245125 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 24245195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 33112818 - 33112987
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112818 ggtgacaactagggtac-catgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33112916  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33112917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaa 33112987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 47383732 - 47383902
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47383732 ggtgacaactagggtaccaatgaaagaatggtgggtaatttatcccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47383831  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47383832 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 47383902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 140 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39646756 - 39646583
Alignment:
Q  140 aattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 239  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39646756 aatttaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagttacataagcacatttttaagtggtatccatg 39646657  T
Q  240 aactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 313  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39646656 acctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 39646583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24885685 - 24885513
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24885685 aaggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattatccacataaacatatttttaagtggtatccatgaact 24885586  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885585 atcttgaccccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 24885513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 38331857 - 38332029
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  38331857 aaggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaact 38331956  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38331957 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 38332029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26794482 - 26794316
Alignment:
Q  150 acaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26794482 acaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttg 26794383  T
Q  250 accccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26794382 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 26794316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 135 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42000009 - 41999827
Alignment:
Q  135 aattaaatta-aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggta 233  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42000009 aattaaattataggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggta 41999910  T
Q  234 tccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41999909 tccatgaacaatcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 41999827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 46967041 - 46967211
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967041 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaacaaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46967140  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967141 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 46967211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47671768 - 47671598
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671768 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47671669  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47671668 cttgacccctccaacaaatagctcattttcattggttggtcggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 47671598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 149 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28888760 - 28888597
Alignment:
Q  149 gacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888760 gacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatctcaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 28888661  T
Q  249 gaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888660 gatcccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 28888597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33884271 - 33884100
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33884271 aggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaacta 33884172  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33884171 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 33884100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 33959981 - 33960152
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33959981 aggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaacta 33960080  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33960081 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 33960152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 26524885 - 26525059
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  26524885 ttaaggtgacaactagggtatccatggaagaatagtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatctataaa 26524984  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26524985 ctatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 26525059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36566512 - 36566342
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566512 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36566413  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||    
T  36566412 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgaatatattacccactattcttcaaaggtaa 36566342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47317497 - 47317327
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47317497 ggtgacaactagggtacccatagaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 47317398  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47317397 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgaataaattacccaccattcttcaaaggtaa 47317327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 49253971 - 49254145
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49253971 ttaaggtgataattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagcacatttttaagtggtatccataaa 49254070  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49254071 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 49254145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42864034 - 42863878
Alignment:
Q  159 gtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccacta 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42864034 gtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactatcttgaccccacca 42863935  T
Q  259 acaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42863934 acaaatagctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggta 42863878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 316
Target Start/End: Original strand, 23220939 - 23221099
Alignment:
Q  150 acaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23220939 acaactagggtacccatggaagaatggtggata------cccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 23221032  T
Q  250 accccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221033 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 23221099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5980250 - 5980080
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5980250 ggtgacagctagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagctaatttttaagtggtatccattaactat 5980151  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5980150 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 5980080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35273778 - 35273612
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273778 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtgtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35273679  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35273678 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattatccaccattcttcaaag 35273612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 35692660 - 35692834
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35692660 taaggtgacaactagagtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagcggtatccatgaac 35692759  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtggg-taaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692760 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 35692834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51057253 - 51057083
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51057253 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacctcaactaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgatctat 51057154  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51057153 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 51057083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36003317 - 36003142
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatg---gaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36003317 aaggtgacaactagggtacctatgaaagaagaatggtgggtaatttatccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 36003218  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36003217 actatcttgaccccaccagtaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 36003142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46616732 - 46616561
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  46616732 aggtgacacctagagtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaacta 46616633  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46616632 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 46616561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3285582 - 3285414
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3285582 gtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatc 3285484  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3285483 ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaa 3285414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31844530 - 31844388
Alignment:
Q  174 tggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31844530 tggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacctcaccaacaaattgctcattt 31844431  T
Q  274 tcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31844430 tcattggttggtgggtaaattatccaccattcctcaaaggtaa 31844388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46784605 - 46784435
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46784605 ggtgacaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46784506  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46784505 ctttacttctccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcctcaaaggtaa 46784435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47187289 - 47187117
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47187289 aaggtgacaactacggtacccatgaaagaatggtggataatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaact 47187190  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  47187189 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattactcatcaatcttcaaaggtaa 47187117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Original strand, 42313359 - 42313531
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  42313359 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtattaatgaact 42313458  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac----ccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  42313459 atcttgactccaccaataaatttctcattttcattggttggtgggtaaattatatatccaccattcttcaaag 42313531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 49398988 - 49399158
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49398988 ggtgacaactaggatacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaactat 49399087  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49399088 cttaactccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaa 49399158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25518952 - 25518826
Alignment:
Q  190 ccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518952 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 25518853  T
Q  290 aaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25518852 aaattacccaccatttttcaaaggtaa 25518826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48373679 - 48373516
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373679 aaggtgacaactaaggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaact 48373589  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373588 atcttgaccccaccaataaactgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 48373516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2450676 - 2450529
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450676 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgataggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 2450577  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaat 293  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2450576 cttgattccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaat 2450529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10928240 - 10928079
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||    
T  10928240 aaggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaact 10928152  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10928151 atcttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 10928079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 27983603 - 27983757
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||               
T  27983603 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtat----------- 27983691  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27983692 -----ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 27983757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2657474 - 2657315
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  2657474 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 2657386  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657385 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 2657315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 41467632 - 41467791
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  41467632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 41467720  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41467721 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 41467791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Original strand, 51403035 - 51403177
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51403035 catggaagaatggtgagtaatttatcccaaccaatacatat---------aagcacatttt-aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaa 51403124  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51403125 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 51403177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33073385 - 33073223
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||| |||||||    
T  33073385 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 33073297  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33073296 tatcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 33073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 287
Target Start/End: Original strand, 51045596 - 51045737
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  51045596 ggtgacaactaggatacccgtagaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcataaactat 51045695  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgg 287  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51045696 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgg 51045737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4808830 - 4808699
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4808830 taaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 4808731  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcatttt 274  Q
    ||||||||||| |  || |||||| |||||||    
T  4808730 tatcttgaccctatcaataaattgttcatttt 4808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 135 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29770852 - 29770682
Alignment:
Q  135 aattaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              
T  29770852 aattaaattaaggtggcaactaggctacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt---------- 29770763  T
Q  235 ccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29770762 -catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 29770682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Original strand, 45475866 - 45475987
Alignment:
Q  169 aagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45475866 aagaatggtgggtaattta-cccaaccaatacacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatcaactatcttgaccccaccaataaattgct 45475964  T
Q  269 cattttcattggttggtgggtaa 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  45475965 cattttcattgattggtgggtaa 45475987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 6626025 - 6626183
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||    
T  6626025 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatc 6626113  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6626114 ttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 6626183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42235014 - 42234852
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||    
T  42235014 ttaaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataattta-cccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaa 42234927  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234926 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 42234852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 316
Target Start/End: Original strand, 31979998 - 31980105
Alignment:
Q  209 cacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979998 cacataaggacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaacaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 31980097  T
Q  309 aaaggtaa 316  Q
    ||||||||    
T  31980098 aaaggtaa 31980105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Original strand, 26472185 - 26472338
Alignment:
Q  152 aactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 251  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||    
T  26472185 aactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaagacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 26472273  T
Q  252 cccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26472274 cccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 26472338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 30289910 - 30290069
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  30289910 ggtgacaactaaggtactcatggaagaatggtggataatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 30289998  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30289999 cttgactccaccaataaattgctcatattcactggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 30290069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4953225 - 4953064
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||||    
T  4953225 aaggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaact 4953137  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4953136 atcttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 4953064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26686030 - 26685868
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| |||    
T  26686030 taaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaac 26685942  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26685941 tatcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 26685868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2955028 - 2954867
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |           ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2955028 aaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacaat-----------cacctttttaagtggtatccattaact 2954940  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2954939 atcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattacccaccatttgtcaaaggtaa 2954867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 4243490 - 4243649
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||           ||| ||||||    
T  4243490 ggtgacaactagactacccatgaaagaattatgggtaatttaccccatccaatacacattagccacataagcacatatt-----------cataaactat 4243578  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4243579 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaa 4243649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 316
Target Start/End: Original strand, 2556909 - 2557016
Alignment:
Q  209 cacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  2556909 cacataaacacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaacagattgctcattttcattagttagtggataaattatccaccattcttc 2557008  T
Q  309 aaaggtaa 316  Q
    ||||||||    
T  2557009 aaaggtaa 2557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Original strand, 34752320 - 34752473
Alignment:
Q  152 aactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 251  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||| |     
T  34752320 aactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttaag 34752408  T
Q  252 cccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34752409 cccacaaataaattgctcattttatttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 34752473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4156577 - 4156438
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4156577 aggtgacaactagagtacccatggaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtggtatccataaacta 4156478  T
Q  245 -------tcttgaccccactaacaaattgctcattttcat 277  Q
           |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4156477 tattgagtcttgaccccaccaacaaattggtcattttcat 4156438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 239
Target Start/End: Original strand, 13312531 - 13312624
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13312531 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatttaagtggtatccatg 13312624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 41895164 - 41895323
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||    
T  41895164 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 41895252  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41895253 cttgacctcacaaataaattgctaattgttattggttggtgggtaaattacccacaattctttaaaggtaa 41895323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 48683330 - 48683489
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  48683330 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 48683418  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48683419 cttgactccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaaggtaa 48683489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1388644 - 1388485
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  1388644 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 1388556  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1388555 cttgaccctaccaataaattgctcatcatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaatgtaa 1388485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32448740 - 32448660
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32448740 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 32448660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 304
Target Start/End: Original strand, 38716247 - 38716394
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| || |||    
T  38716247 ggtgacaacaagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaattat 38716335  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 304  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38716336 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt 38716394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 51155586 - 51155748
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||    
T  51155586 ttaaggtgacagctaaggtac-catggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagtcacataaacacatatt-----------catgaa 51155673  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51155674 ctatcttgactccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtaa 51155748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 315
Target Start/End: Original strand, 13313249 - 13313332
Alignment:
Q  232 tatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13313249 tatccatgaactatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccacaattcttcaaaggta 13313332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Original strand, 13281588 - 13281721
Alignment:
Q  172 aatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcat 271  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||    
T  13281588 aatgatggataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactattttgaccccacaaataaattgttcat 13281676  T
Q  272 tttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13281677 tgtcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 13281721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Original strand, 47772170 - 47772304
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||    
T  47772170 aaggtgacaattaaggtacccatggaagaatggtgtgtaatttactccaaccaatatacattagtcacataaacacatttttaaatggtatatataaact 47772269  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcatt 278  Q
    || ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  47772270 attttgaccctaccaacaaattgcttattttcatt 47772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 44544125 - 44544205
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44544125 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 44544205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 315
Target Start/End: Original strand, 39475783 - 39475940
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||           |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39475783 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggttatttatcccaaccaataaacgtt-----------cacatttttaggtggtatccataaactat 39475871  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 315  Q
    |||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39475872 cttgaccc-accaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggta 39475940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 7561528 - 7561701
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattag--ccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || | |   |||  || |       
T  7561528 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccccacgtaagcacatattcatgaactataaattatgg 7561627  T
Q  244 at-cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7561628 gtaattgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaa 7561701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33187505 - 33187356
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||                 ||||||||||||| || ||||||    
T  33187505 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatatt-----------------tttaagtggtatctataaactat 33187423  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  33187422 cttgatccaaccaataaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattctttaaag 33187356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 5961266 - 5961426
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  5961266 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaacta 5961354  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  5961355 tcttgatcccaccaataaattgctcattatgatttgttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaagtaa 5961426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Original strand, 44293446 - 44293614
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||  |||| ||||||| || |||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||           |    
T  44293446 ttaaaataaggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaactaatatatattagccacataagtacatatt-----------c 44293534  T
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44293535 atgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttgatgggtaaattacctactattcttcaaaggtaa 44293614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10920371 - 10920216
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  10920371 ggtgacaactaaggtatccatggaaaaatggtcggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 10920283  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10920282 cttgaccccaccaataaattgtgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 10920216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Original strand, 27924722 - 27924817
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27924722 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaa 27924817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52324110 - 52323950
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||  |||||           ||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  52324110 ggtgacaactagggtacccatggaagattggtgggtaatttactccaatcaatgaacattt----------cacctttttaggtggtattcataaattat 52324021  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52324020 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 52323950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Original strand, 35991617 - 35991758
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||           ||||||||||||||||||||| || |||    
T  35991617 catgaaagaatgatagctaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaa 35991705  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  35991706 ttgctcattttcaattgttggtggataaattacccacaattcttcaaaggtaa 35991758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52368056 - 52367895
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||  || ||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  52368056 aaggtgacaactagggtacctatggaaaaatgatgggtaatttatctaaatcaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaact 52367968  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  52367967 atcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccacaattttttaaaggtaa 52367895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 46428332 - 46428412
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46428332 catgaactatcttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttgctgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 46428412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 316
Target Start/End: Original strand, 24649802 - 24649881
Alignment:
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24649802 atgaactatcttgaccccaccaataaataactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaa 24649881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39637996 - 39637912
Alignment:
Q  229 tggtatccat-gaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39637996 tggtatccattgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttta----ttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaa 39637912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 316
Target Start/End: Original strand, 4156188 - 4156235
Alignment:
Q  269 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156188 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 4156235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 293
Target Start/End: Original strand, 38718167 - 38718309
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaattta-tcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |     |||  ||||||||    
T  38718167 ggtgacaactaggctac-catgaaagaatgatgggtaatttactcccaaccgatatacattagccacataagcacatattca-----tatttatgaacta 38718260  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaat 293  Q
    ||||||  |||| || |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  38718261 tcttgatgccacaaataaattgttcatttttattggtcggtggataaat 38718309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24215911 - 24215806
Alignment:
Q  169 aagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |           ||| ||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  24215911 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacata-----------tattcatgaactatcttgatcctacaaataaattgct 24215823  T
Q  269 cattttcattggttggt 285  Q
    |||||||||||||||||    
T  24215822 cattttcattggttggt 24215806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 265
Target Start/End: Original strand, 31286504 - 31286612
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  31286504 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 31286592  T
Q  246 cttgaccccactaacaaatt 265  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  31286593 cttgaccccaccaataaatt 31286612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31844858 - 31844818
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaa 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31844858 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaa 31844818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32448807 - 32448754
Alignment:
Q  149 gacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacac 202  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32448807 gacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacac 32448754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Original strand, 10919313 - 10919349
Alignment:
Q  276 attggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10919313 attggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 10919349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39359544 - 39359502
Alignment:
Q  165 atggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattag 207  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39359544 atggaataattgtgggtaatttaccccaaccaatacacattag 39359502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 9779919 - 9779982
Alignment:
Q  172 aatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9779919 aatggtggctaattaa-cccaacaaatatatattagccacgtaaacacatttttaagtggtatcc 9779982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 32984075 - 32984247
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984075 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 32984174  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984175 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 32984247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 24079901 - 24080071
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24079901 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24080000  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24080001 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 24080071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 40435153 - 40435323
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435153 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40435252  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40435253 cttgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaa 40435323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 9303572 - 9303744
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9303572 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 9303671  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303672 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 9303744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6366169 - 6365998
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366169 aggtgacaactagggtatccatgaaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 6366070  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366069 tattgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 6365998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43328890 - 43328719
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328890 aggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 43328791  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328790 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 43328719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10646305 - 10646135
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646305 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagaacatttttaagtggtatccatgaactat 10646206  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10646205 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaa 10646135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Original strand, 33730639 - 33730807
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730639 aaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 33730738  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730739 atcttgaccccaccaacaaattgctcatattaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 33730807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Original strand, 33981661 - 33981829
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33981661 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcacatttttaagtggtatccatgaact 33981760  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33981761 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaag 33981829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37956605 - 37956433
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956605 aaggtgacaactagggtatccatgaaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 37956506  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956505 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 37956433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5946230 - 5946059
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946230 aggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 5946131  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946130 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 5946059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 316
Target Start/End: Original strand, 31830959 - 31831125
Alignment:
Q  150 acaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31830959 acaactagggtacccatggaagaatggtaggtaatttacccaaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 31831058  T
Q  250 accccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831059 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 31831125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41862402 - 41862232
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41862402 ggtgacaattaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 41862303  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41862302 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 41862232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 17718720 - 17718892
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718720 aaggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 17718819  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718820 atcttgaccccatcaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 17718892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2714730 - 2714561
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714730 ggtgacaactaaagtac-catggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2714632  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714631 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 2714561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9734435 - 9734267
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9734435 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 9734338  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9734337 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 9734267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35628959 - 35628793
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35628959 ggtgacaactagggtactcatagaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtattcttgaactat 35628860  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35628859 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 35628793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41654077 - 41653907
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41654077 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 41653978  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41653977 tttgaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 41653907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9013868 - 9013696
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9013868 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaattta-cctaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaac 9013770  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9013769 tatcttgactccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaa 9013696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 37301326 - 37301495
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37301326 gtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatt 37301425  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37301426 ttggccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 37301495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 13356118 - 13356290
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13356118 aaggtgacaactagagtacccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 13356217  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13356218 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacctttcttcaaatgtaa 13356290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32114429 - 32114261
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32114429 tgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 32114330  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32114329 tgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 32114261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25186082 - 25185911
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25186082 aggtgacgattagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaatta 25185983  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25185982 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 25185911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 45236564 - 45236735
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236564 aggtgacaactaggatacccataaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45236663  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236664 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 45236735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37420122 - 37419952
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37420122 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccttaatcaatacacattagtcacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 37420023  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37420022 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 37419952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41232130 - 41231962
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232130 aaggtgacaactagggtatccatggaggaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattggtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 41232031  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232030 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 41231962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 13760644 - 13760818
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactc--atggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13760644 aaggtgacaactagggtacacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaaatggtatccatgaa 13760743  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13760744 ctatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 13760818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 312
Target Start/End: Original strand, 29048426 - 29048569
Alignment:
Q  169 aagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048426 aagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 29048525  T
Q  269 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29048526 cattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaag 29048569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2276097 - 2275925
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2276097 taaggtgacaactagtctacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaac 2275999  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2275998 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 2275925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 45066590 - 45066762
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45066590 aaggtgagaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttattataatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 45066689  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45066690 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccattattcttcaaaggtaa 45066762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22878572 - 22878403
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878572 gtgacaactagggtacccatagaagaattgtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 22878473  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||  || |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878472 ttgaccccaacaaaaaattgatcattttcattggaaggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 22878403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41640095 - 41639926
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41640095 gtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataaacatatttttaagcggtatctatgaactatc 41639996  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41639995 ttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattactcatcattcttcaaaggtaa 41639926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Original strand, 44088461 - 44088613
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44088461 catggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaa 44088560  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  44088561 ttgctcatttttattggttggtgagtaaattattcatcattcttcaaaggtaa 44088613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 145
Target Start/End: Original strand, 38873302 - 38873441
Alignment:
Q  6 actcgtccatatcattattcatcattactccaaagaaatctctcatcaactcaacaccttcatctttaggcatttacgagatatggtctcaaaagtacat 105  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38873302 actcgtccatatcattatccagcactactccaaagaaatcactcatcaactcaacaccttcatctttaggcatttacgagatatggtctcaaaagtacat 38873401  T
Q  106 atagcacaaaaataactttcatattcctaaattaaattaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38873402 atagcacaaaaataactttcatattcctaaacaaaattaa 38873441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45258692 - 45258522
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45258692 aggtgataactagagtac-catggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagttacataaacacatttttaaatggtatccatgaacta 45258594  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45258593 tcttgacccctccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattaccgaccattcttcaaaagtaa 45258522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12033119 - 12032986
Alignment:
Q  139 aaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12033119 aaatgaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 12033020  T
Q  239 gaactatcttgaccccactaacaaattgctcatt 272  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12033019 gaactatcttgaccgcaccaacaaattgctcatt 12032986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25248215 - 25248051
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25248215 ggtgacaattagggtatccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagcaacataagcacattttaaagtggtatccatgaactat 25248116  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25248115 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt------ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 25248051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 158 - 316
Target Start/End: Original strand, 42701301 - 42701460
Alignment:
Q  158 ggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttt---taagtggtatccatgaactatcttgacccc 254  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42701301 ggtacccatggaaggatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcaca--agcacattttttttaagtggtattcatgaactatcttgacccc 42701398  T
Q  255 actaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42701399 actaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaa 42701460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3904258 - 3904126
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3904258 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacaatagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactat 3904160  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattg 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3904159 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 3904126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41981650 - 41981534
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981650 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41981551  T
Q  246 cttgaccccactaacaa 262  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41981550 cttgaccccaccaacaa 41981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 4447294 - 4447454
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||| |||||||||    
T  4447294 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaacta 4447382  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4447383 tcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 4447454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31940485 - 31940327
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  31940485 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaattta-cccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31940398  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31940397 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 31940327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31336280 - 31336166
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31336280 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgccccaaccaatacacattagccatataaacatatttttaagtggtatccatgaa 31336181  T
Q  242 ctatcttgaccccac 256  Q
    |||||||||||||||    
T  31336180 ctatcttgaccccac 31336166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 117329 - 117488
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  117329 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 117417  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117418 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 117488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10378480 - 10378321
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  10378480 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 10378392  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10378391 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 10378321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 40458772 - 40458931
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||           ||||||||||    
T  40458772 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacaaaaacacatatt-----------catgaactat 40458860  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40458861 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 40458931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3211379 - 3211218
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||    
T  3211379 taaggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaacgaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 3211291  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3211290 tatcttaaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaa 3211218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41843424 - 41843265
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| ||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  41843424 ggtgataactaagctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 41843336  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41843335 ctggaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 41843265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 316
Target Start/End: Original strand, 4975412 - 4975566
Alignment:
Q  151 caactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttga 250  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  4975412 caactaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccatataagcacatatt-----------catgaactatcttga 4975500  T
Q  251 ccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4975501 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 4975566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 312
Target Start/End: Original strand, 39915887 - 39915978
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39915887 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 39915978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9713857 - 9713701
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  9713857 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 9713769  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9713768 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggt---tgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 9713701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2379311 - 2379152
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  2379311 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 2379223  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379222 tttgatcccacaaataaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 2379152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41981535 - 41981454
Alignment:
Q  226 aagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41981535 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattctt 41981454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Original strand, 32373745 - 32373885
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |||    
T  32373745 catggaagaatggtgg-taatttaccccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccaccaataaa 32373832  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32373833 ttgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaaggtaa 32373885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Original strand, 26196308 - 26196475
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| |||||||||    
T  26196308 ttaaataaaggtgacaactaggatattcatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatcc 26196396  T
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || |||||| |||||||||| || |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26196397 ataaactattttgaccccaccaataaattgtt-attatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 26196475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Original strand, 33896834 - 33897001
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||           ||  |||||| ||||||||     
T  33896834 ttaaaataaggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatct 33896922  T
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33896923 ataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaa 33897001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 27243218 - 27243298
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27243218 catgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 27243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 27254793 - 27254873
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27254793 catgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 27254873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 33622467 - 33622624
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  33622467 ggtgacaactaggctac-catgaaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagtcacataaccacatatt-----------catgaactat 33622554  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     ||||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33622555 tttgaccc-ataaatatattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 33622624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 3490397 - 3490558
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| |||||| |||| || |    
T  3490397 aaggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtagtttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtaaccataaatt 3490485  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3490486 atcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 3490558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Original strand, 40649837 - 40649990
Alignment:
Q  152 aactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 251  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||| ||| ||||     
T  40649837 aactaggctacccatgaaagaatgatgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaattattttgat 40649925  T
Q  252 cccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40649926 cccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattctttaaaggtaa 40649990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 9509399 - 9509559
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||           |||||||||    
T  9509399 aggtgaaaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaataaaaatttgccacataaacacatatt-----------catgaacta 9509487  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9509488 tcttaaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattctttaaaggtaa 9509559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38631801 - 38631664
Alignment:
Q  168 gaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgc 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||           ||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  38631801 gaagaatggtggataatttatcccaaccaatacatattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccacaccaataaattgc 38631713  T
Q  268 tcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38631712 tcatattcattggttgatgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaa 38631664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Original strand, 31148953 - 31149049
Alignment:
Q  219 catttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31148953 catttttaagtggtatc-atgaactatcttaaccccatcaataaatagctcattttcattggttagtgaataaattacccaccatttttcaaaggtaa 31149049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 164791 - 164734
Alignment:
Q  259 acaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  164791 acaaattgctcatttttattggttggtggataaattacccatcattccttaaaggtaa 164734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 221
Target Start/End: Original strand, 41425429 - 41425503
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacat 221  Q
    |||| |||||||| ||| |||  ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41425429 ggtggcaactaggctacccataaaagaattatggataattta-cccaaccaatacacattagccacataagcacat 41425503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39901739 - 39901674
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccac 211  Q
    ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  39901739 ggtgacaactaaggtatccattgaagaatggtggataatttacctcaaccaataaacattagccac 39901674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Original strand, 31148890 - 31148950
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacatt 205  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  31148890 aggtgacaactagggtatctatggaaggatggtggataatttatctcaatcaataaacatt 31148950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5882690 - 5882518
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882690 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 5882591  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882590 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 5882518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 142 - 312
Target Start/End: Original strand, 26377200 - 26377370
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377200 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 26377299  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377300 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 26377370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Original strand, 14891383 - 14891546
Alignment:
Q  150 acaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891383 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 14891482  T
Q  250 accccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891483 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 14891546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Original strand, 22551052 - 22551231
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22551052 ttaatttatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaggtggtatcc 22551151  T
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551152 atgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 22551231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24168274 - 24168103
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168274 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 24168175  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24168174 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 24168103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 145 - 315
Target Start/End: Original strand, 11988973 - 11989143
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11988973 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 11989072  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989073 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 11989143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 138 - 316
Target Start/End: Original strand, 34527854 - 34528032
Alignment:
Q  138 taaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34527854 taaataaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatcca 34527953  T
Q  238 tgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34527954 tgaattatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 34528032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2892368 - 2892200
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892368 tgacaactagggtacccatagaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 2892269  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892268 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 2892200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8615422 - 8615252
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615422 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 8615323  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615322 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 8615252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 18101495 - 18101665
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101495 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18101594  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101595 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 18101665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 141 - 315
Target Start/End: Original strand, 22341783 - 22341959
Alignment:
Q  141 attaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341783 attaaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 22341882  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggt--tggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341883 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgtgttgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 22341959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Original strand, 2593850 - 2594018
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2593850 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtggataatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 2593949  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2593950 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaag 2594018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 19415529 - 19415703
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19415529 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgag 19415628  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415629 ctatcttgaccccaccaacaaattggtcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 19415703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 7345114 - 7345282
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7345114 tgacaactaaggtagacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 7345213  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7345214 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaa 7345282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 7393584 - 7393756
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7393584 aaggtgacaattatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 7393683  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7393684 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaa 7393756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 600074 - 599904
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  600074 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatttatcccaaccaatacaaattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 599975  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599974 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 599904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 959904 - 960074
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  959904 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatctatgaattat 960003  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  960004 cttgaccccaccaacaaattgctcatttccattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 960074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28947269 - 28947099
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28947269 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaattat 28947170  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947169 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 28947099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 24224070 - 24224240
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24224070 ggtgacaactaggatactcatgaaagaatagtaggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24224169  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24224170 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 24224240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1970894 - 1970723
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1970894 aggtgacaactaaagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtgatattcatgaacta 1970795  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1970794 tcttgaccccaccaacaaattgtttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 1970723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 145 - 312
Target Start/End: Original strand, 10507907 - 10508074
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10507907 aggtgacaactagggtagccatcgaagaatggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaacta 10508006  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10508007 tcttgaccccaccaacaaattgctcattatcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaag 10508074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 30743444 - 30743618
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||| || |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30743444 ttaaggtgataattagggtatccatgaaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaa 30743543  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30743544 ctatcttgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 30743618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 155 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16703539 - 16703378
Alignment:
Q  155 tagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 254  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16703539 taggatacccatggaagaatgatgcgtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgacccc 16703440  T
Q  255 actaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703439 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 16703378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 5294799 - 5294971
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294799 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 5294898  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  5294899 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaa 5294971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 5299351 - 5299523
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299351 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 5299450  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  5299451 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaa 5299523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Original strand, 33452572 - 33452738
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452572 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 33452671  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33452672 cttgaccccaacaacaaattattcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaag 33452738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 19281056 - 19281225
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19281056 gtgacaactaggctacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactatc 19281155  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19281156 ttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggcaaattacccaccattcttcaaaggtaa 19281225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 316
Target Start/End: Original strand, 30467656 - 30467773
Alignment:
Q  199 acacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30467656 acacattagccacataagcacatgtttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgtttggtgggtaaattaccc 30467755  T
Q  299 accattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30467756 accattcttcaaaggtaa 30467773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 296
Target Start/End: Original strand, 23261927 - 23262079
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23261927 aaggtgacaactagggtacctatgaaagaacggtggataatttaccccaaccaatacatattaacctcataagcacatttttaagtgatatccatgaact 23262026  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 296  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23262027 atcttaaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23262079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 28948845 - 28949004
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||| |||    
T  28948845 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaattat 28948933  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28948934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 28949004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7167753 - 7167594
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  7167753 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 7167665  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7167664 cttgaccccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 7167594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13329545 - 13329393
Alignment:
Q  153 actagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacc 252  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||| |||    
T  13329545 actaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattta-----------tgaactatcttaacc 13329457  T
Q  253 ccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13329456 ccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 13329393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15965605 - 15965449
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||| ||    
T  15965605 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatatt-----------catgaagta 15965517  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15965516 tcttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 15965449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4487698 - 4487546
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||           ||||||||||    
T  4487698 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatgagtacatatt-----------catgaactat 4487610  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttca 309  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4487609 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttca 4487546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3291181 - 3291020
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||           ||||||    
T  3291181 aaggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacatattagccacataagcacatattta-----------tgaact 3291093  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3291092 atcttaaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 3291020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1398724 - 1398569
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||| ||||||    
T  1398724 ggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catcaactat 1398636  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1398635 cttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaag 1398569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3786920 - 3786761
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  3786920 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 3786832  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3786831 attgaccccacaaataaattcttcattttcattgattggtaggtaaattatccaccattcttcaaaagtaa 3786761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 929741 - 929671
Alignment:
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  929741 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 929671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Original strand, 1939579 - 1939659
Alignment:
Q  232 tatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1939579 tatccatgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggtttataggtaaattatccaccattcttcaaag 1939659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18661905 - 18661830
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacat 221  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18661905 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacat 18661830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 221
Target Start/End: Original strand, 24913094 - 24913171
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacat 221  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24913094 aaggtgacaactaagctactcatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacat 24913171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34262405 - 34262342
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34262405 ttaaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcacaaccaataaacatt 34262342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 316
Target Start/End: Original strand, 375797 - 375883
Alignment:
Q  230 ggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  375797 ggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattagttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaagtaa 375883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13844943 - 13844848
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  13844943 tttttaggtggtatttatgaactattttgactccatcaataaattgttcattttcatttgttagtggttaagttaaccaccatttttcaaaggtaa 13844848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 375729 - 375786
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacatt 205  Q
    |||||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  375729 tgacaattaaggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt 375786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 316
Target Start/End: Original strand, 11743070 - 11743114
Alignment:
Q  272 tttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11743070 tttcattgattgatggataaattacccaccattcttcaagggtaa 11743114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 127)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34276731 - 34276559
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276731 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 34276632  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276631 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 34276559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44984943 - 44984773
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984943 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44984844  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44984843 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 44984773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9798647 - 9798477
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 9798548  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 9798477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 21366609 - 21366779
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366609 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21366708  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366709 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 21366779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23437774 - 23437604
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437774 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23437675  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 23437604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 53461812 - 53461986
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53461812 ttaaggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 53461911  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53461912 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaa 53461986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 53854430 - 53854599
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854430 ggtgacaactagggtac-catggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53854528  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854529 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 53854599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6020109 - 6019940
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6020109 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatt 6020010  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020009 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 6019940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 237661 - 237489
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  237661 aaggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaact 237562  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  237561 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 237489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 2826681 - 2826848
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2826681 aggtgacaactagggtac-catggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 2826779  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2826780 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 2826848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42085390 - 42085219
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085390 aggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 42085291  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42085290 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 42085219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51363188 - 51363019
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363188 ggtgacaactagggtac-catggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 51363090  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363089 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 51363019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 312
Target Start/End: Original strand, 32366661 - 32366826
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366661 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 32366760  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32366761 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaag 32366826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 146427 - 146599
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146427 aaggtgacaactagagtacgcatagaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 146526  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146527 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 146599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 136 - 308
Target Start/End: Original strand, 26091248 - 26091420
Alignment:
Q  136 attaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc 235  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26091248 attaaatgatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatc 26091347  T
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091348 catgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 26091420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45797663 - 45797495
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45797663 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaact 45797564  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45797563 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 45797495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 55776228 - 55776061
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55776228 aaggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 55776129  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55776128 atcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 55776061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 55840406 - 55840239
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55840406 aaggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 55840307  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55840306 atcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 55840239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 141 - 316
Target Start/End: Original strand, 31532130 - 31532305
Alignment:
Q  141 attaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532130 attatggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 31532229  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31532230 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 31532305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39077728 - 39077557
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077728 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgttgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 39077629  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077628 tcttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 39077557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 18462013 - 18462183
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18462013 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtgatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 18462112  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462113 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 18462183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 22618510 - 22618682
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618510 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaattta-cctaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 22618608  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618609 ctatcttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 22618682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 308
Target Start/End: Original strand, 54574940 - 54575102
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54574940 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 54575039  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 308  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54575040 cttgaccccaccaccaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 54575102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 397582 - 397414
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  397582 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatct 397483  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  397482 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 397414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 41702461 - 41702629
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702461 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 41702560  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41702561 taaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaa 41702629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 42765840 - 42766011
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42765840 aaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacattagcacatttttaagtggtat-catgaact 42765938  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42765939 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 42766011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 149 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6285486 - 6285319
Alignment:
Q  149 gacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6285486 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatttt 6285387  T
Q  249 gaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6285386 gaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 6285319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 43471694 - 43471865
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43471694 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataatcacatttttaagtggtatccatgaacta 43471793  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43471794 tcttgaccacaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 43471865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 55056258 - 55056429
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55056258 aggtgacaacaagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaacta 55056357  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55056358 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 55056429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27373257 - 27373088
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27373257 ggtgacaattagagtac-catggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 27373159  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27373158 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 27373088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29478542 - 29478372
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 29478443  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478442 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 29478372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41560510 - 41560340
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560510 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41560411  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41560410 cttgatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 41560340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47344838 - 47344668
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47344838 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 47344739  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344738 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 47344668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 19387685 - 19387858
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19387685 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 19387784  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19387785 aatcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaacgtaa 19387858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41949566 - 41949394
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacata--agcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949566 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatataagcacatttttaagtggtatccatgaact 41949467  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949466 atcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 41949394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 49881059 - 49881233
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatccc----aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49881059 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccgcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaa 49881158  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49881159 ctatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 49881233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 136 - 316
Target Start/End: Original strand, 47662092 - 47662272
Alignment:
Q  136 attaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47662092 attatattaaggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatc 47662191  T
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47662192 cattaactatattgacaccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattattcaaaggtaa 47662272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31914380 - 31914210
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31914380 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc-cataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 31914282  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31914281 tcttgaccccaccaacaaattgctcagtttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaaggtaa 31914210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 29777253 - 29777427
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29777253 ttaaggtgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtaaa 29777352  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777353 ctatctcgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 29777427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 31972336 - 31972506
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31972336 ggtgacaattagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 31972435  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31972436 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 31972506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42033357 - 42033187
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033357 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaatatacattagctacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42033258  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033257 cttgactccaccaacaaattgctcattttaattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 42033187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 56022998 - 56023168
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56022998 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 56023097  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56023098 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaa 56023168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3170809 - 3170638
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3170809 aggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaacta 3170710  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3170709 tcttgaccccaccaacaaattgttcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattcttcaaaggtaa 3170638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 141 - 316
Target Start/End: Original strand, 3692205 - 3692380
Alignment:
Q  141 attaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  3692205 attaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcaataa 3692304  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3692305 actatcttaatcccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaa 3692380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 407934 - 407766
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  407934 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 407837  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  407836 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 407766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42222473 - 42222303
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42222473 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgtgtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcaatgaactat 42222374  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42222373 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 42222303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50534809 - 50534643
Alignment:
Q  150 acaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 249  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50534809 acaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 50534710  T
Q  250 accccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50534709 accccaccaataaattgctcatttttattgattggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaa 50534643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54608144 - 54607974
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54608144 ggtgactactagggtatccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatacatgaactat 54608045  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54608044 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 54607974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2243643 - 2243470
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2243643 taaggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttactccaactaatacacataagccacataaatacatttttaagtggtatccatgaac 2243544  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243543 tatcttgacccgaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 2243470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 31070071 - 31070243
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31070071 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacatgagcacatttttaagtggtat-catgaac 31070169  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070170 tatcttgactccaccagcaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 31070243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38591850 - 38591680
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||    
T  38591850 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatt----aatggtatccatgaa 38591755  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38591754 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaatgtaa 38591680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50234185 - 50234012
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50234185 taaggtgacaactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccattaac 50234086  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50234085 tatcttgatcccaccaacaaatttctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaa 50234012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 50457807 - 50457980
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457807 taagatgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttacctcaaccaatacacattagcaacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 50457906  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457907 tatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 50457980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1932947 - 1932775
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1932947 aaggtgataactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 1932848  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1932847 atcttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacctactattcttcaaaggtaa 1932775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23609269 - 23609103
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609269 ggtgacaaatagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtgaactat 23609170  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23609169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttgattggtgggtaaattacccactattcttcaaag 23609103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 54086590 - 54086425
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54086590 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgcacattagccacataagcacatttttaagcggtatccatgaactat 54086491  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  54086490 cttga-cccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaag 54086425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 55520009 - 55519839
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55520009 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55519910  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55519909 cttgatcccaccaaaaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaa 55519839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48658002 - 48657836
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48658002 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 48657903  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  48657902 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtggg------acccaccattcttcaaaggtaa 48657836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 54425163 - 54425001
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54425163 ggtgacaactagtgtac-catggaagaatcgtgggtaatttaccccaaccaatagacattagtcacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 54425065  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttca 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54425064 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttca 54425001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 150 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35446683 - 35446518
Alignment:
Q  150 acaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35446683 acaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccaaataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35446584  T
Q  250 accccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35446583 accccatcaacaaattgctcattttcattggtcggt-ggtaaattacccaccattcttaaaaggtaa 35446518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 14017374 - 14017544
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  14017374 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggcaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacactt--aagtggtatccatgaact 14017471  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017472 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 14017544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 316
Target Start/End: Original strand, 33897504 - 33897665
Alignment:
Q  155 tagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 254  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33897504 tagggtacctatagaagaatggtgggtaatttattccaattaatacacattagccatataatcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 33897603  T
Q  255 actaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33897604 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 33897665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 136 - 316
Target Start/End: Original strand, 50536614 - 50536794
Alignment:
Q  136 attaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc 235  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  50536614 attaaataagggtaacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagtcacataaacatatttttaagtggtatc 50536713  T
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50536714 cattaactatcttgaccccaccaacaaatttctcattttcatcggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaa 50536794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48313737 - 48313569
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48313737 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaaccaatatatattagctacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 48313639  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313638 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 48313569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 163 - 316
Target Start/End: Original strand, 22468787 - 22468940
Alignment:
Q  163 tcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22468787 tcatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatctatgaactatcttgatcccaccaacaa 22468886  T
Q  263 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468887 attgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 22468940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 53834055 - 53834224
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53834055 gtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacttcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 53834154  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53834155 ttgaccgcaccaacaaattgctcattttcattgattgttgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 53834224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 41632007 - 41632176
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41632007 ggtgacaactaggatacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagtacatttttaagcgatatccatgaactat 41632106  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41632107 cttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 41632176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Original strand, 39587797 - 39587949
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39587797 catggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagttatataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaa 39587896  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39587897 ttgctcatattcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 39587949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 288
Target Start/End: Original strand, 52728307 - 52728448
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52728307 ggtgacaactagggtac-catggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacgcattagtcacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 52728405  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtggg 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52728406 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 52728448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 48259509 - 48259680
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48259509 taaggtgataagtagggtac-catggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacatattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaac 48259606  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48259607 tatcttgactccaccaactaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaagggtaa 48259680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 54805614 - 54805788
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataag----cacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||    
T  54805614 ggtgacatctagggtacccatggaacaatgatgagtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaataaacacatttttaagtggtatctatgaa 54805713  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54805714 ctatcttaatcccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 54805788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48655004 - 48654826
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacat------tagccacataagcacatttttaagtggtatcca 237  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48655004 aaggtgacaattagggtagccatggaagaatggtaggtaatttaccccaaccaatacacatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatcta 48654905  T
Q  238 tgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48654904 tcaactatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaa 48654826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Original strand, 36532828 - 36532956
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36532828 aaggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 36532927  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcatt 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36532928 atcttgaccccaccaacaaattgctcatt 36532956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 45633779 - 45633938
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  45633779 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 45633867  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45633868 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 45633938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51951861 - 51951694
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51951861 tgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaattta-cacaaccaatatacattagccacataagcacatttttaactgatatccatgaactatct 51951763  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  51951762 tgactccattaacaaattgttcattttcattgattggtggataaattactcatcattcttcaaaagtaa 51951694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 9997931 - 9998090
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||    
T  9997931 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 9998019  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9998020 cttgatcccaccaataaattactcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 9998090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 15060289 - 15060448
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  15060289 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 15060377  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060378 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 15060448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 20351839 - 20352001
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||    
T  20351839 taaggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaac 20351927  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351928 tatcttgatcccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 20352001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42509478 - 42509351
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42509478 ggtgataactagggtactcatggaagaatggtggataatttatcctaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42509379  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattt 273  Q
     |||||||||| || |||||| ||||||    
T  42509378 tttgaccccaccaataaattggtcattt 42509351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 37239088 - 37239249
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  37239088 aaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 37239176  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37239177 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 37239249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43891101 - 43890940
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||    
T  43891101 aaggtgacaactatggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaact 43891013  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43891012 atattgactccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 43890940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54715208 - 54715047
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  54715208 aaggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaactaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 54715120  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54715119 atgttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 54715047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 169 - 316
Target Start/End: Original strand, 5117461 - 5117597
Alignment:
Q  169 aagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5117461 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgct 5117549  T
Q  269 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5117550 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 5117597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35595869 - 35595772
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595869 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35595772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 31881310 - 31881473
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||    
T  31881310 ttaaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaa 31881398  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31881399 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaa 31881473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34552490 - 34552331
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||           ||||||||||    
T  34552490 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccgcataagcacatatt-----------catgaactat 34552402  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34552401 cttgacaccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 34552331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 54216736 - 54216895
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  54216736 ggtgataactagggtatccatggaagaatggagggtaatttatcccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactat 54216824  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54216825 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 54216895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 38547600 - 38547760
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  38547600 aggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaacta 38547688  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38547689 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 38547760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 46708740 - 46708900
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           |||||||||    
T  46708740 aggtgacaactaggctatcaatgaaagaatgatgggtgatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaacta 46708828  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46708829 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 46708900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22620764 - 22620609
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  22620764 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 22620676  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22620675 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaag 22620609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34835352 - 34835189
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| ||||||  |||||| ||| ||    
T  34835352 ttaaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttagatggtattcataaa 34835264  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34835263 ctatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 34835189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47812080 - 47811918
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||    
T  47812080 taaggtgacaattagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 47811992  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| | |  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47811991 tatcttgactcaatcaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 47811918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Original strand, 4486579 - 4486736
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||  ||   ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||| |    
T  4486579 aaggtgacaactagactatctatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaatt 4486667  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4486668 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccgttcttcaaag 4486736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49014269 - 49014112
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||           ||||||||||    
T  49014269 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagtacatatt-----------catgaactat 49014181  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggt 314  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49014180 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggt 49014112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54216482 - 54216325
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  54216482 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatcgataatttaccccaaccaatacacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 54216394  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54216393 tgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 54216325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52688520 - 52688361
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||||    
T  52688520 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactat 52688432  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52688431 tttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaa 52688361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 27873548 - 27873707
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  27873548 aaggtgacaactaggctacccaa--aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 27873634  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27873635 atcttaaccccacaaataaattactcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 27873707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 52461535 - 52461386
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  52461535 aggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 52461447  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattc 305  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52461446 tcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattc 52461386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33289873 - 33289715
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  33289873 ggtgacaa-taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaactat 33289786  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33289785 cttgatcctacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaa 33289715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46720202 - 46720041
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||       |||  ||| |||||| ||||||||||| |||    
T  46720202 taaggtaacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacat-------atat-cacctttttaggtggtatccataaac 46720111  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46720110 tatcttgaccccatcaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 46720041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52396865 - 52396774
Alignment:
Q  190 ccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc-ttgaccccactaacaaattgctcattttcattgg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52396865 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatctttaaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 52396774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35344968 - 35344868
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35344968 gtgacaactaggatacctatggaagaatggtggataattta-ccaaaccaatacacattagccacataagcacattttcaagtggtatccatgaactatc 35344870  T
Q  247 tt 248  Q
    ||    
T  35344869 tt 35344868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 573974 - 573815
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  573974 ggtgacaactagtgtactcatggaaaaatagtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaactat 573886  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  573885 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtaggtaaattacccaccattttttaaaggtaa 573815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 316
Target Start/End: Original strand, 27398607 - 27398762
Alignment:
Q  150 acaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 249  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||            ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27398607 acaactagggtaccaatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattt-----------acatttttaagtggtatccataaactatcttg 27398695  T
Q  250 accccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27398696 accccaccaataaattgcgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaa 27398762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Original strand, 14335165 - 14335260
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14335165 tttttaggtggtatctatgaactatcttgaccctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaa 14335260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27580226 - 27580131
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27580226 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 27580131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 3293102 - 3293182
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3293102 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 3293182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 11972208 - 11972288
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972208 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 11972288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27872750 - 27872607
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  27872750 ggtgacaactacggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 27872662  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  27872661 cttgatcccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattatccac 27872607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33049062 - 33048990
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33049062 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac 33048990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Original strand, 1662323 - 1662418
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1662323 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 1662418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 6371247 - 6371408
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| |||||| || | || |    
T  6371247 aaggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtaaccctaaatt 6371335  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6371336 atcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaa 6371408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Original strand, 33557944 - 33558097
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||           ||||||||||||    
T  33557944 tgacaattaggctattcatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaatacatatt-----------catgaactatct 33558032  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33558033 tgaccctacaaataaattcctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaag 33558097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42557666 - 42557594
Alignment:
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42557666 atcttgaccccaccaacaaattactcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 42557594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 48259701 - 48259780
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacattt 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48259701 taaggtgacaactagggtac-catggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacatattagccacataagcacattt 48259780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43231601 - 43231518
Alignment:
Q  229 tggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43231601 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttgatggataaattacccaccattcttcaaag 43231518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Original strand, 51981471 - 51981613
Alignment:
Q  138 taaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 237  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||  ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||    
T  51981471 taaattatggtgataactagtctaccaatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattca 51981559  T
Q  238 tgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 291  Q
    ||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51981560 tgaactatcttaatcccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaa 51981613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42558371 - 42558270
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||    
T  42558371 ttaaggtgacaactaagatacccatggaagaatggtggataatttaccctaatcaatacacattagcc--------acatttttaagtggtatctatgaa 42558280  T
Q  242 ctatcttgac 251  Q
    ||||||||||    
T  42558279 ctatcttgac 42558270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 316
Target Start/End: Original strand, 49057933 - 49058027
Alignment:
Q  222 ttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49057933 ttttaaatggtatctatgaactattttaacctcatcaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaa 49058027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 3291796 - 3291873
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacata 214  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||  |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3291796 ttaatttaaggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 3291873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 316
Target Start/End: Original strand, 18206583 - 18206681
Alignment:
Q  222 ttttaagtggtatccatgaactat----cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18206583 ttttaggtggtatccatgaactatatatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaaagtaa 18206681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 316
Target Start/End: Original strand, 17555617 - 17555656
Alignment:
Q  277 ttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555617 ttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 17555656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Original strand, 1662259 - 1662313
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaat 198  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  1662259 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaat 1662313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43478147 - 43478089
Alignment:
Q  240 aactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccca 299  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  43478147 aactatcttgaccacactaataaattgctca-tttcattggttgatcgataaattaccca 43478089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 187
Target Start/End: Original strand, 14335100 - 14335142
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaattta 187  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14335100 aggtgacaactagagtacccatgaaagaatggtgggtaattta 14335142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 49304657 - 49304518
Alignment:
Q  174 tggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc-ttgaccccactaacaaattgctcatt 272  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||  | |||  ||||| | | ||| |||| || ||| ||||||||    
T  49304657 tggtgggtaatttattc-aaccaataaacatcagccacataaatacatttttaagtgagaaccacaaactaacatggactccacaaagaaa-tgctcatt 49304560  T
Q  273 ttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 315  Q
    | |||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  49304559 tgcattggatggtgggtaagttactca-cattctttaaaggta 49304518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 198
Target Start/End: Original strand, 18206512 - 18206564
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaat 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  18206512 ggtgacaactaaggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatttcaaccaat 18206564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 25893917 - 25894087
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893917 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25894016  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894017 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 25894087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33411443 - 33411273
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411443 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33411344  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411343 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 33411273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 49171360 - 49171532
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49171360 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 49171459  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49171460 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 49171532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 33423276 - 33423445
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423276 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 33423375  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33423376 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 33423445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 33839713 - 33839885
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839713 aaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 33839812  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839813 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 33839885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 45690097 - 45690267
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690097 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45690196  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45690197 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 45690267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17855614 - 17855441
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17855614 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaac 17855515  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17855514 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 17855441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36389541 - 36389377
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36389541 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 36389442  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389441 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 36389377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 47066975 - 47067147
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47066975 aaggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 47067074  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47067075 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 47067147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 35328068 - 35328239
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35328068 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 35328167  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35328168 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaa 35328239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35356072 - 35355905
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35356072 aggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 35355973  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35355972 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 35355905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46913296 - 46913122
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcaca--tttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  46913296 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacacatttttaagtggtatccatgaa 46913197  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913196 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 46913122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 138 - 312
Target Start/End: Original strand, 5183817 - 5183991
Alignment:
Q  138 taaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 237  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5183817 taaatgaaggtgataactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatcca 5183916  T
Q  238 tgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5183917 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaag 5183991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 22979647 - 22979817
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22979647 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 22979746  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22979747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 22979817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 23393051 - 23393221
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23393150  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23393151 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaa 23393221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 33695821 - 33695991
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695821 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33695920  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33695921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 33695991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 2341659 - 2341832
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactc-atggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2341659 aaggtgacaactagggtaccccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaac 2341758  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2341759 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 2341832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31587033 - 31586861
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31587033 aaggtgagaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 31586934  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31586933 atcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 31586861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45482843 - 45482671
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45482843 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatcagtcacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 45482744  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45482743 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 45482671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 37846015 - 37846186
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37846015 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaatta 37846114  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37846115 tcttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 37846186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 20165814 - 20165984
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165814 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaacctatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 20165913  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165914 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 20165984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27018299 - 27018129
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018299 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27018200  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27018199 cttgaccacaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 27018129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 47740331 - 47740501
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47740331 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 47740430  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47740431 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 47740501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 155 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15877724 - 15877563
Alignment:
Q  155 tagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877724 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 15877625  T
Q  255 actaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877624 accaacaaattgctcattttcatttgttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 15877563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40670749 - 40670576
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40670749 taaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaac 40670650  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40670649 tatcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 40670576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5712357 - 5712181
Alignment:
Q  140 aattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5712357 aattatggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccata 5712258  T
Q  240 aactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5712257 aactatcttgaccccactaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaa 5712181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33332980 - 33332802
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  33332980 ttaaataaaggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagcatatttttaagtggtatc- 33332882  T
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332881 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 33332802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 48609677 - 48609847
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  48609677 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaattat 48609776  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609777 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 48609847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10028673 - 10028501
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggta--ctcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10028673 ggtgacaactagggtatacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaact 10028574  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10028573 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 10028501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 26579715 - 26579887
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26579715 aaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaact 26579814  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26579815 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgatttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 26579887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 158 - 316
Target Start/End: Original strand, 41990870 - 41991028
Alignment:
Q  158 ggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccact 257  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  41990870 ggtacccatggaagaatggtgagtaatttatccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgaccccacc 41990969  T
Q  258 aacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41990970 aacaaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 41991028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 312
Target Start/End: Original strand, 35757009 - 35757186
Alignment:
Q  135 aattaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggta 233  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35757009 aattaattaaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggta 35757108  T
Q  234 tccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35757109 tc-atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttggtggataaattatccaccattcttcaaag 35757186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31625887 - 31625717
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31625887 aggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgg-taatttactccaaccaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 31625789  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31625788 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaa 31625717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19563630 - 19563460
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19563630 ggtgacaattagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccttaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 19563531  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19563530 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaa 19563460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29447020 - 29446863
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29447020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaattactcc-aaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29446922  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 304  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29446921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 29446863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43499668 - 43499498
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43499668 ggtgagaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatatacattggccacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 43499569  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43499568 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaa 43499498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 45063357 - 45063525
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063357 ggtgacaactagagtaccaatgaaagaatggtggataatttacctcaac--atacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45063454  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063455 cttgactccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 45063525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33870424 - 33870260
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    ||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33870424 gtgacaactagagtacccat---agaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtattcatgaactatc 33870328  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33870327 ttgaccccaccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggt 33870260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35767659 - 35767494
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35767659 aaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtatccatgaact 35767560  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |       |||||||||||||||||||||||    
T  35767559 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgggg-------tacccaccattcttcaaaggtaa 35767494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10618475 - 10618311
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  10618475 aggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtattcatgaacta 10618376  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |       |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10618375 t-------ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaatgtaa 10618311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Original strand, 31429475 - 31429641
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31429475 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgagtaatttacttcaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgtactat 31429574  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31429575 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaatcacccaccattcttcaaag 31429641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Original strand, 33720070 - 33720206
Alignment:
Q  180 gtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattg 279  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  33720070 gtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccatcaacaaattgctcatttttattg 33720169  T
Q  280 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33720170 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 33720206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 35752032 - 35752193
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  35752032 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 35752120  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35752121 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 35752193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 283
Target Start/End: Original strand, 28233936 - 28234073
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28233936 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28234035  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttg 283  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28234036 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttg 28234073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 277
Target Start/End: Original strand, 30076526 - 30076658
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30076526 aggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttacgccaactaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 30076625  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcat 277  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30076626 tcttgaccccaccaacaaattgatcattttcat 30076658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44564497 - 44564356
Alignment:
Q  170 agaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctc 269  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  44564497 agaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatctatgaactatcttgacaccactaataaattgctt 44564398  T
Q  270 attttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 311  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44564397 atttttattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 44564356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 46817420 - 46817580
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  46817420 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 46817508  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46817509 tcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 46817580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37128110 - 37127950
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           |||||||    
T  37128110 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatattta-----------tgaacta 37128022  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37128021 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 37127950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41904392 - 41904272
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41904392 ttaaggtgacaactaggatacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 41904293  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaa 262  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  41904292 ctatcttgacctcaccaacaa 41904272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43489390 - 43489231
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  43489390 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43489302  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43489301 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaa 43489231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 24923021 - 24923183
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||     
T  24923021 taaggtgacaactaggctacccatgaaagaaggatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaat 24923109  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24923110 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 24923183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 316
Target Start/End: Original strand, 7876322 - 7876487
Alignment:
Q  140 aattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||           ||||    
T  7876322 aattaaggtgacaactaggctaccaatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatatt-----------catg 7876410  T
Q  240 aactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7876411 aactatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 7876487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 36816845 - 36817004
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  36816845 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 36816933  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 36817004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 46898014 - 46898175
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||    
T  46898014 aaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaact 46898102  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || |||||||||  || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  46898103 attttgaccccatcaataaattgctcatatttattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaa 46898175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48086031 - 48085871
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||| || |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  48086031 aggtgataattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 48085943  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48085942 tcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 48085871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 316
Target Start/End: Original strand, 26941541 - 26941691
Alignment:
Q  155 tagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 254  Q
    |||| ||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||    
T  26941541 taggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgacccc 26941629  T
Q  255 actaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941630 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 26941691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44405538 - 44405424
Alignment:
Q  139 aaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 238  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44405538 aaataaaggtgacaactagaatacccatggaagaatggtaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccat 44405439  T
Q  239 gaactatcttgaccc 253  Q
    |||||||||||||||    
T  44405438 gaactatcttgaccc 44405424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24228714 - 24228554
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||||    
T  24228714 aggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaacta 24228626  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24228625 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 24228554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 498188 - 498347
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  498188 ggtggcaactaggctagccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 498276  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  498277 cttgaccccacaaataaattactcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 498347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 44003369 - 44003529
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  44003369 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaacta 44003457  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44003458 tcttgactccaccaataaattgctcattatgattagttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 44003529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33393499 - 33393341
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||           |||||| ||||||||||| |||||||    
T  33393499 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacattaacc-----------tttttaggtggtatccataaactatc 33393411  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  33393410 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccactattttttaaaggtaa 33393341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2332191 - 2332036
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  2332191 ggtgacaacttgggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaatacacagtaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 2332103  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2332102 cttgatcccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaag 2332036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21718288 - 21718130
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  21718288 ggtgacaactaggctacccatgaaa-aataatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 21718201  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21718200 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccgttattcaaaggtaa 21718130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26371221 - 26371066
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  26371221 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 26371133  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26371132 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattcttcaaag 26371066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29610807 - 29610648
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||| | ||| |||| ||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  29610807 ggtggcaactatgctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29610719  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29610718 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 29610648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 312
Target Start/End: Original strand, 45502817 - 45502971
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||               
T  45502817 gtgacaactaaggtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagctacataagcatatttttaaatggtatc----------- 45502905  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45502906 ttgacccaactaacaaattgctcattttcattgattggtaggtaaattactcaccattcttcaaag 45502971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Original strand, 32556640 - 32556765
Alignment:
Q  180 gtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattg 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||    
T  32556640 gtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgtccccacaaataaattgttcattttcattg 32556728  T
Q  280 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32556729 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 32556765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39323781 - 39323629
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                   | ||||||||    
T  39323781 aaggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgggtaattta-cccaaccaatacacattagccacata-------------------ttcatgaact 39323702  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39323701 atcttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 39323629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 47906754 - 47906918
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||| || |||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||    
T  47906754 ttaaggtggcaactaggctatccatgaaaaaatgatgggtaattttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catga 47906842  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906843 actatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 47906918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 45237529 - 45237692
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||    
T  45237529 ttaaggtgacaactaagctacccataaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaa 45237617  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45237618 ttatcttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacctatcattcttcaaaggtaa 45237692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 237 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29098843 - 29098764
Alignment:
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29098843 atgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaa 29098764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 25037506 - 25037667
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  25037506 aaggtggcacctaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaatcaatacacatcagccacataagcacatatt-----------catgaact 25037594  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25037595 atcttgaccccaccaataaattgatcattttaattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 25037667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41855213 - 41855072
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||           |||||||||||||| |||| || |||    
T  41855213 catggaagaatgatgggtaatttatccaaactaatacacattagccacataagcatatattta-----------tgaactatcttgactccaccaataaa 41855125  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41855124 ttgctcacattcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaa 41855072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 39453484 - 39453634
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||                  ||||||||    
T  39453484 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccattacacattagtcacataaacacat------------------aactatct 39453565  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39453566 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 39453634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7257553 - 7257394
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||           ||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  7257553 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataatcatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 7257465  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  7257464 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcgaaggtaa 7257394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39866758 - 39866678
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39866758 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 39866678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Original strand, 16482847 - 16482942
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16482847 tttttaggtggtatccataaaccatcttgaccccaccaataaattgctcattatcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 16482942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44660018 - 44659857
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || ||           |||||||    
T  44660018 taaggtggcaactaggctacccataaaagaatgatggataatttactccaaccgatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaac 44659930  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44659929 tatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtggataaatta-ccaccattcttcaaaggtaa 44659857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46103291 - 46103134
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||     
T  46103291 gtgacaactagactacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaactaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatt 46103203  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46103202 ttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggt-ggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 46103134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 304
Target Start/End: Original strand, 47460772 - 47460919
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||           ||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  47460772 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 47460860  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 304  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47460861 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattatccaccatt 47460919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 304
Target Start/End: Original strand, 15643948 - 15644093
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    |||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| |||||| |    
T  15643948 tgacaactagtgtacccatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaatcaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactattt 15644036  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 304  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15644037 tgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt 15644093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29863116 - 29863032
Alignment:
Q  228 gtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29863116 gtggtatccatgaactattttgattccaccaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 29863032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33455189 - 33455109
Alignment:
Q  236 catgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33455189 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcataggtaa 33455109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35484807 - 35484653
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||||| || |||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  35484807 tgacaattaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaataatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatct 35484719  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaa-ttacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35484718 tgaccccataaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatttacccaccattcttcaaag 35484653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 38448446 - 38448607
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||           |||||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  38448446 aaggtgacaattagggtacttatggaaaaatggtggataatttaccccaatcaataaatatt-----------cacatttttaggtgatattcataaact 38448534  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  38448535 atcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattatccacaatttttcaaaggtaa 38448607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 289
Target Start/End: Original strand, 37443599 - 37443734
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| |||||||| || |||    
T  37443599 taaggtgacaactagggtacccataaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatctataaac 37443687  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 289  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37443688 tatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggt 37443734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35557798 - 35557744
Alignment:
Q  261 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35557798 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggta 35557744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 316
Target Start/End: Original strand, 7720574 - 7720662
Alignment:
Q  228 gtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |   | |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7720574 gtggtatccatgaactatcttaacccaatctataaattgcttatttttattggttagtggataaattacccaccatttttcaaaggtaa 7720662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 30077043 - 30077095
Alignment:
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30077043 ttgcccattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 30077095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35823353 - 35823303
Alignment:
Q  266 gctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35823353 gctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttctaaggtaa 35823303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26456218 - 26456157
Alignment:
Q  220 atttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggt 281  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26456218 atttttaagaagtattcatgaactatcttgatcccaccaataaattgctcattttcattggt 26456157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42272244 - 42272180
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccac 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  42272244 ggtgacaactagggta-tcatggaagaattatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccac 42272180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Original strand, 21649442 - 21649538
Alignment:
Q  221 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacca-ttcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| || || |||||||||||    
T  21649442 tttttaggtggtatccataaactatcttaaatctactaataaattgctcattttcattggttaataagtaaattacccatcattttttcaaaggtaa 21649538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29098915 - 29098847
Alignment:
Q  150 acaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagca 218  Q
    ||||||||| ||  |||| || |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29098915 acaactaggctatccatgaaaaaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca 29098847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39866802 - 39866762
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacat 204  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39866802 catgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacat 39866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24253564 - 24253394
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253564 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24253465  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253464 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 24253394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35626221 - 35626050
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626221 aggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 35626122  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626121 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 35626050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 43326379 - 43326549
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326379 ggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataggcacatttttaagtggtatccatgaactat 43326478  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326479 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 43326549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 15398483 - 15398652
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398483 gtgacaactagagtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 15398582  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398583 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 15398652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 739703 - 739874
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739703 aggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 739802  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  739803 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 739874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39932762 - 39932591
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932762 aggtgacaactagagtacccatggaagaatggttggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 39932663  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932662 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 39932591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Original strand, 43262174 - 43262353
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262174 ttaaatttaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 43262273  T
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43262274 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtaggttaattacccaccattcttcaaaggtaa 43262353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6901979 - 6901815
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6901979 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatct 6901880  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901879 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 6901815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7722232 - 7722064
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722232 aggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 7722133  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7722132 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaagg 7722064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 3466680 - 3466851
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3466680 aggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 3466779  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3466780 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 3466851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 141 - 316
Target Start/End: Original strand, 18479663 - 18479838
Alignment:
Q  141 attaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||| |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18479663 attatggtgactactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 18479762  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18479763 actattttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 18479838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5185154 - 5184984
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5185154 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 5185055  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5185054 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 5184984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15683973 - 15683803
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683973 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 15683874  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15683873 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacacatcattcttcaaaggtaa 15683803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27939080 - 27938914
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggta-ctcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27939080 ggtgacaactagggtaacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 27938981  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27938980 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 27938914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 40278858 - 40279028
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40278858 ggtgacaactagggtattcatggaagaatgatgggtaatttatctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 40278957  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40278958 gttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 40279028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 40886028 - 40886197
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40886028 ggtgaaaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 40886126  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40886127 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 40886197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12648979 - 12648813
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648979 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 12648880  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12648879 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 12648813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 27501055 - 27501225
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501055 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaacaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27501154  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27501155 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaa 27501225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31939079 - 31938909
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31939079 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 31938980  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31938979 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 31938909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 143 - 291
Target Start/End: Original strand, 29789292 - 29789440
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29789292 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 29789391  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789392 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 29789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25831703 - 25831533
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25831703 aggtgacaaataaggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaattggtatccatgaacta 25831604  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831603 t-ttgaccccaccaacaaattgcttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 25831533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Original strand, 2484292 - 2484458
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2484292 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtagtatccatgaactat 2484391  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2484392 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 2484458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 27278474 - 27278647
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa----c 242  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  27278474 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaattatc 27278573  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27278574 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaa 27278647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5137898 - 5137727
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  | || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137898 aggtgacaactagggtattaatggaagaatggtggataatttactcaaatcaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 5137799  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137798 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 5137727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 38756483 - 38756658
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatgg-aagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38756483 ttaaggtgacaactagggtacctatgggaagaattgtgggtaatttatctcaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatga 38756582  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756583 actatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcatttattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 38756658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 308
Target Start/End: Original strand, 13504742 - 13504904
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504742 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttatcccaactaatacatattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13504841  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 308  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13504842 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttc 13504904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 28424793 - 28424963
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28424793 aaggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaact 28424892  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  28424893 atcttgaccccaccaacaaattg--cattttcattggttgatggataaattacccactatccttcaaaggtaa 28424963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34451432 - 34451292
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34451432 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34451333  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtg 286  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34451332 attgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtg 34451292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40110413 - 40110246
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40110413 tgacaattaggatactcatggaagaatggtagataatttaccctaactaatatacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 40110314  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40110313 tga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaa 40110246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 891088 - 890918
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  891088 aggtgacaattaggatacccatggaagaatggtaggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaacta 890990  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  890989 tcttgactcgaccaacaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaa 890918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33617758 - 33617597
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||    
T  33617758 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaact 33617670  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33617669 atcttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 33617597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 763909 - 763740
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||||||||||||| |||  |||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  763909 ttaaggtgacaactagagtatccatcaaagaatgatgggtaatttaccccaactaatacatattagccacataagtacatttttaagtgatatccatgaa 763810  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 311  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  763809 ctatcttaactccaccaacaaattactcatttttattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaa 763740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4149852 - 4149706
Alignment:
Q  160 tactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaa 259  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||| ||    
T  4149852 tacttatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca----------taaccccaccaa 4149763  T
Q  260 caaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4149762 caaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 4149706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Original strand, 38015505 - 38015673
Alignment:
Q  137 ttaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 236  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |    
T  38015505 ttaaaataaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------c 38015593  T
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38015594 atgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 38015673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 9424593 - 9424751
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||||||    
T  9424593 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatc 9424681  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9424682 ttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 9424751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5497446 - 5497289
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||    
T  5497446 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaact 5497358  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5497357 attttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 5497289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19295901 - 19295742
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||    
T  19295901 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 19295813  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19295812 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 19295742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27503550 - 27503391
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  27503550 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27503462  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27503461 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 27503391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 23195246 - 23195407
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  23195246 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 23195334  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23195335 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 23195407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13957844 - 13957682
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||           |||||||    
T  13957844 taaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcgcatatt-----------catgaac 13957756  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13957755 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 13957682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 155 - 316
Target Start/End: Original strand, 42658671 - 42658821
Alignment:
Q  155 tagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 254  Q
    |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||||||||||||||    
T  42658671 taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgacccc 42658759  T
Q  255 actaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42658760 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 42658821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6973236 - 6973075
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||           ||||||||    
T  6973236 aaggtgtcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagtcacataagcacatatt-----------catgaact 6973148  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6973147 atcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 6973075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14972149 - 14971994
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||| ||||||    
T  14972149 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaatcaatacacattagtcacataagcacatatt-----------cataaactat 14972061  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972060 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 14971994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 31293989 - 31294159
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |  ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||     
T  31293989 ggtgacaactagggtacccatgtaagaatggtgggtaatttactccaaccaataaccatcaatcacgtaagcatatttttaagtggtattcatggactac 31294088  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |  ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31294089 ccggaccctaccaataatttgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtaa 31294159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 9374502 - 9374661
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||           ||||||||||    
T  9374502 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacctaaacacatatt-----------catgaactat 9374590  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9374591 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 9374661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40632634 - 40632511
Alignment:
Q  184 tttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttg 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40632634 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacc---------ggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttg 40632544  T
Q  284 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40632543 gtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 40632511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Original strand, 36365463 - 36365604
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |||    
T  36365463 catgaaagaatgatggctaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaa 36365551  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36365552 ttgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 36365604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27390769 - 27390609
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||           ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  27390769 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaacta 27390681  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27390680 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaactatccaccatttttcaaaggtaa 27390609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Original strand, 3656568 - 3656712
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  3656568 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 3656656  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacc 301  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3656657 cttgaccccaaaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacc 3656712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6207052 - 6206896
Alignment:
Q  149 gacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 248  Q
    |||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||| ||    
T  6207052 gacaactagcctacttatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatttt 6206964  T
Q  249 gaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6206963 gaccccccaaataaattgctcattttaattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaagtaa 6206896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 302
Target Start/End: Original strand, 36948492 - 36948633
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||    
T  36948492 tgacagctagggtactcatgcaagaatggtgggtaattta-ccctaccaatacacattagccacataagcaca-----------tatccatgaactatct 36948579  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacca 302  Q
    | |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36948580 t-accctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacca 36948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Original strand, 12558090 - 12558188
Alignment:
Q  217 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12558090 cacatttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccacatcaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 12558188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2585633 - 2585474
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  2585633 ggtgacaattagggtatccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------caactttttagatggtatccataaactat 2585545  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2585544 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 2585474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5120132 - 5120037
Alignment:
Q  220 atttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5120132 atttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcatcaaaggtaa 5120037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 240 - 316
Target Start/End: Original strand, 42247865 - 42247941
Alignment:
Q  240 aactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247865 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 42247941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 38637908 - 38638069
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||           ||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  38637908 aaggtgacaactagggtacccatggaaaaattgtgggtaatttaccccaactaataaacatt-----------cacctttttagttggtatccataaact 38637996  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38637997 atcttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaa 38638069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 36472284 - 36472443
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| | |||           ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  36472284 aggtgacaactagggtac-catgaaaaaatggtgggtaatttattctaaccaataaatatt-----------cactttttaaagtggtatccataaacta 36472371  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36472372 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaa 36472443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 1402501 - 1402664
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||           ||| |||||  ||||||||||| ||    
T  1402501 ttaaggtgataactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaactaataaacatt-----------cacctttttgggtggtatccataaa 1402589  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1402590 ctatcttgatcccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaa 1402664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 24167784 - 24167943
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  24167784 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgttgagtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 24167872  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24167873 cttgaccccaccaataaattgtttattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaa 24167943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 33623940 - 33624098
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||           | ||||||| |||     
T  33623940 gtgacaattagggtatccattgaaaaatggtggataatttaccccaaccgatacacattagccacataagcacat-----------acccatgaattatt 33624028  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  33624029 ttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatctaccattattcaaaggtaa 33624098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38492788 - 38492647
Alignment:
Q  141 attaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           |||||    
T  38492788 attatggtggcaactaggctac-catgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catga 38492701  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatt 294  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38492700 actatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 38492647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Original strand, 18327173 - 18327328
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  18327173 ggtgataactaaggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 18327261  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||| |||| || ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18327262 cttgactccaccaataaattgcgcattataattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaag 18327328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 302
Target Start/End: Original strand, 612753 - 612900
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaattta-tcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||             |||| || |    
T  612753 ttaaggtgacaactaggatacccatggaagaatactgagtaatttactcccaaccaatacacattagccacataagca-------------tatcaataa 612839  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacca 302  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  612840 actatcttgaccccaccaataaattgttcattttca-tggttggtggttaaattacccacca 612900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 316
Target Start/End: Original strand, 9171111 - 9171184
Alignment:
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171111 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcatttgttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 9171184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40687071 - 40686911
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  40687071 aaggtgacaattagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cac-tttttagatggtattcataaact 40686984  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40686983 atcttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttctcaaaggtaa 40686911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 9527124 - 9527179
Alignment:
Q  261 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9527124 aaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 9527179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Original strand, 3940411 - 3940478
Alignment:
Q  237 atgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 304  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3940411 atgaattatcttgaccgcaccaataaattgctcattttcatttgttggtgggtaaattacccaccatt 3940478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 15300977 - 15301032
Alignment:
Q  261 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15300977 aaattgctcattttcattggttgatgtgtaaattaccaatcattcttcaaaggtaa 15301032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 3940336 - 3940399
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagcc 209  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3940336 ggtgacaactaaggtatctatggaagaatgatgagtaatttattcgaaccaatacacattagcc 3940399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Original strand, 20207088 - 20207154
Alignment:
Q  229 tggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 295  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||  || |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20207088 tggtatccatgaactatcttaatcacatcaataaattgttcattttcattggttgatggataaatta 20207154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28756138 - 28756092
Alignment:
Q  268 tcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggt 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28756138 tcattttcattgcttggtgggtaaattatccacctttctttaaaggt 28756092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 220
Target Start/End: Original strand, 9171032 - 9171108
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcaca 220  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| |||||||    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9171032 taaggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacaagtaattta-cccaatcaatacacattaaccacataagcaca 9171108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27584447 - 27584400
Alignment:
Q  268 tcattttcattggttggtgggtaaa--ttacccaccattcttcaaagg 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27584447 tcattttcactggttggtgggtaaactatacccaccattcttcaaagg 27584400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40633565 - 40633525
Alignment:
Q  140 aattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggg 180  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40633565 aatttaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggg 40633525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 111)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 138 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47257983 - 47257805
Alignment:
Q  138 taaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47257983 taaataaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattca 47257884  T
Q  238 tgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257883 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 47257805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 7855112 - 7855284
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7855112 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccttgaact 7855211  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7855212 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 7855284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 40130957 - 40131129
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40130957 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 40131056  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131057 atcttgaccccacagacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 40131129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 38416720 - 38416894
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416720 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaa 38416819  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38416820 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaa 38416894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 47809594 - 47809767
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47809594 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaac 47809693  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47809694 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 47809767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49330222 - 49330049
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330222 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 49330123  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330122 tatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 49330049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 141 - 316
Target Start/End: Original strand, 28048387 - 28048562
Alignment:
Q  141 attaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048387 attatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 28048486  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048487 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 28048562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 20754390 - 20754563
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  20754390 taaggtgacaactagggtactcatggaataatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtgatatccatgaac 20754489  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20754490 tatcttgactctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 20754563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 51170034 - 51170203
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51170034 gtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 51170133  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51170134 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 51170203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 27066977 - 27067148
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27066977 aggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaacta 27067076  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27067077 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 27067148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22399278 - 22399109
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22399278 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttt-aagtggtttccatgaactat 22399180  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22399179 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 22399109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24100464 - 24100295
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24100464 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatc-atgaactat 24100366  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100365 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 24100295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41464534 - 41464364
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464534 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgctgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41464435  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464434 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 41464364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52629135 - 52628966
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52629135 ggtgacaactagggtac-catggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 52629037  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52629036 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 52628966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 43612044 - 43612217
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43612044 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 43612143  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43612144 tatcttgaccacgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaa 43612217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 32234396 - 32234567
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32234396 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaact 32234494  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234495 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 32234567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42292026 - 42291854
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  42292026 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatctatgaact 42291927  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42291926 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 42291854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 29625826 - 29625997
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29625826 aggtgataattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 29625925  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29625926 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 29625997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 312
Target Start/End: Original strand, 35748310 - 35748477
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35748310 aggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 35748409  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35748410 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaag 35748477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40420018 - 40419847
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40420018 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 40419919  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40419918 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 40419847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37324723 - 37324553
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37324723 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaatatatttttaagtggtatacatgaactat 37324624  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37324623 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaa 37324553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 39634568 - 39634741
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634568 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaattgtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 39634667  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39634668 ctat-ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaaatacccaccattcttcaaaagtaa 39634741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40643982 - 40643816
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  40643982 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatgatatccataaactat 40643883  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40643882 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 40643816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 55453240 - 55453414
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55453240 ttaaagtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 55453339  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55453340 ctatcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttgatgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 55453414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48609903 - 48609735
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609903 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 48609804  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48609803 taaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcgaaggtaa 48609735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2666183 - 2666012
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2666183 aggtgacaactagagtacccatgaaagaatagtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacagttttaagtggtatccatgaacta 2666084  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2666083 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 2666012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 48739232 - 48739403
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48739232 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaa 48739331  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48739332 tcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaa 48739403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46126171 - 46126010
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46126171 taaggtgacaactagggtac-catggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatccatgaac 46126073  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattc 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  46126072 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattc 46126010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35594305 - 35594137
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35594305 aaggtaacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 35594206  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594205 atcttgaccccatcaacaaattgctcatttttattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 35594137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 51452749 - 51452920
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51452749 aaggtgacaattagggtac-catggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaact 51452847  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452848 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 51452920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 40804509 - 40804680
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40804509 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 40804608  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40804609 tcttgatcctaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 40804680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37313581 - 37313411
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37313581 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 37313482  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313481 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 37313411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44223011 - 44222841
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44223011 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacaat 44222912  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44222911 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccactatttttcaaaggtaa 44222841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 51102378 - 51102548
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51102378 ggtgacaactagggtaccaacggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtgatatccatgaactat 51102477  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51102478 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 51102548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44806869 - 44806696
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806869 taaggtgacaactagggtacccatgaaagaattgtggataatttacttcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 44806770  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806769 tatcttgattccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 44806696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 7755305 - 7755476
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  7755305 aaggtgacaagtagggtacccatggaagaatgatgggttatttaccccaagcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccataatct 7755403  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7755404 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 7755476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 53943586 - 53943757
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53943586 aaggtgacaactagagtac-catggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtatatttttaagtggtatccatgaact 53943684  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53943685 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaa 53943757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 145 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18947086 - 18946919
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18947086 aggtgacaagtagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgtctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaactggtatccatgaacta 18946987  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18946986 tcttgaccccacaaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacgcaccattcttcaaag 18946919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41732710 - 41732540
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41732710 ggtgacaactggggtatccatggaaggatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41732611  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41732610 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattgattgatggataaattatccaccatttttcaaaggtaa 41732540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43021896 - 43021726
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43021896 gtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagctacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatc 43021797  T
Q  247 ttga-ccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021796 ttgacccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 43021726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46134538 - 46134368
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134538 ggtgacaattagggtatccatgaaagaatggtgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46134439  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46134438 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 46134368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43126015 - 43125843
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43126015 taaggtgacaactagg-tacctataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 43125917  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43125916 tatcttgaccccaccaataaattgctcattttcattgattagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 43125843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39053578 - 39053406
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||| |||  |||  || |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053578 aaggtgacaactagagtatccataaaaaaatgatgggtaatttaccccaacgaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 39053479  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053478 atcttgaccccatcaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 39053406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 41293317 - 41293488
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  41293317 aaggtgacaattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaatt 41293415  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41293416 atcttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 41293488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43184092 - 43183924
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43184092 tgacaactagggtacctatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43183993  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43183992 tgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattactcaccattcttcaaaggtaa 43183924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 5560025 - 5560202
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacatta--gccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5560025 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatagacattatagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 5560124  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctc-----attttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5560125 atcttgaccccacaaacaaattgctcatttaattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 5560202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 168 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52215236 - 52215088
Alignment:
Q  168 gaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgc 267  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52215236 gaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccaccaacaaattgc 52215137  T
Q  268 tcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52215136 tcatgttcattagttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 52215088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52639026 - 52638854
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52639026 aaggtgacaactagggtacccatagaataatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaagtggtatccatgaatt 52638927  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52638926 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttcgttggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 52638854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 53832486 - 53832654
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  53832486 tgacaactagggaacacatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcccctttttaattggtatccataaactatct 53832585  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53832586 tgacaccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 53832654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24376730 - 24376585
Alignment:
Q  171 gaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctca 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24376730 gaatggtgggtaatttaccccaacaaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctca 24376631  T
Q  271 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24376630 ttttcattggttggtgcgtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 24376585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41216639 - 41216467
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41216639 aaggtgacaactagagtacctatggaagaatagtgggtaatttatcccaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 41216540  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41216539 atattaaccccaccaacaaattgcttattttcattggttgatggataaattacccaccatcctttaaaggtaa 41216467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36369120 - 36368951
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36369120 ggtgataactagagcacccatggaaga-tggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36369022  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36369021 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattagttggtgggtaaattatcgaccattcttcaaaggtaa 36368951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 53637990 - 53637853
Alignment:
Q  179 ggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcatt 278  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53637990 ggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcctgaccccactaacaaattgctcattttcatt 53637891  T
Q  279 ggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53637890 ggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 53637853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 47894822 - 47894990
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47894822 tgacaactagggtacccatggaagaatggtggatgatttacctcaactaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 47894921  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47894922 tgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtaggtaaattatccaccattctttaaaggtaa 47894990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Original strand, 51146215 - 51146381
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51146215 ggtggcaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcaaatttttaagtggtatccatgaactat 51146314  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  51146315 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgatgtgtaaattacctaccattcttcaaag 51146381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46949537 - 46949391
Alignment:
Q  164 catggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  46949537 catggaagaatggtgggtaatttatcc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccgccaacaaa 46949439  T
Q  264 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  46949438 ttgttcattttcattggtcggtgggtaaattacacacca-tcttcaaag 46949391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42590004 - 42589842
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||    
T  42590004 taaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaac 42589916  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42589915 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 42589842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25641819 - 25641658
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||    
T  25641819 aaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattta-----------tgaact 25641731  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25641730 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 25641658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 31286789 - 31286952
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||    
T  31286789 ttaaggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaa 31286877  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31286878 ctatcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 31286952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51416144 - 51415981
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||    
T  51416144 ttaaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaa 51416056  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51416055 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaa 51415981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 54159000 - 54159158
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54159000 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatt-accccaaccaatacaca---------taagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 54159089  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54159090 tgactccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 54159158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54401360 - 54401199
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||| ||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  54401360 aaggtggcaattaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 54401272  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54401271 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 54401199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 261
Target Start/End: Original strand, 33550465 - 33550582
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33550465 aaggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaatt 33550564  T
Q  244 atcttgaccccactaaca 261  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  33550565 atcttaaccccaccaaca 33550582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Original strand, 54707219 - 54707379
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  54707219 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 54707307  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54707308 tcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 54707379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 34279721 - 34279880
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  34279721 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 34279809  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279810 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 34279880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 38156632 - 38156791
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  38156632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 38156720  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38156721 cttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 38156791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49130753 - 49130590
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||    
T  49130753 ttaaggagacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaa 49130665  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49130664 ctatcttgacctcatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 49130590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 55000176 - 55000337
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  55000176 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 55000264  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55000265 atcttgaccctacaaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaa 55000337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 312
Target Start/End: Original strand, 48546837 - 48546995
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48546837 taagatgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttaccccaatcaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaac 48546927  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48546928 tat-ttgaccc-accaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 48546995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 39141123 - 39141285
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |         || ||||||||    
T  39141123 aaggtgataactaggttac-catgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatat---------attcatgaact 39141212  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39141213 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaa 39141285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 52864673 - 52864550
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52864673 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaattta-ctcaaccaatatacattagctacataaacacatttttaaatggtatccatgaact 52864575  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgct 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  52864574 atcttgaccccaccaacaaattgct 52864550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 316
Target Start/End: Original strand, 41635797 - 41635959
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||    
T  41635797 taaggtgacaactagattacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaac 41635885  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41635886 tatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 41635959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37759075 - 37758946
Alignment:
Q  182 aatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggt 281  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37759075 aatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatgaactatcttgacttcatcaacaaattgctcattttcattggt 37758976  T
Q  282 tggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 311  Q
    || ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  37758975 tgatggataaattattcaccattcttcaaa 37758946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 47510940 - 47511099
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  47510940 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 47511028  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47511029 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 47511099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 55380156 - 55379997
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  55380156 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 55380068  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55380067 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 55379997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 53115620 - 53115459
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  53115620 aaggtgacaactagggtacctatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaagtggtatccataaact 53115532  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53115531 atcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 53115459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25353726 - 25353566
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||           ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  25353726 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaacta 25353638  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25353637 tcttgaccccaccaataaattgcttattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 25353566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37028894 - 37028735
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  37028894 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatatt-----------catgaactat 37028806  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37028805 cttgactccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattctttaaaggtaa 37028735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45059052 - 45058895
Alignment:
Q  148 tgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 247  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  45059052 tgacaactaggctgcccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatatacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 45058964  T
Q  248 tgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45058963 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 45058895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 315
Target Start/End: Original strand, 30251499 - 30251659
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  30251499 aaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttagcccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaact 30251587  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 315  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30251588 atcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgagtaaattacccaccatttttcaaaggta 30251659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 316
Target Start/End: Original strand, 17665549 - 17665683
Alignment:
Q  171 gaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctca 270  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||           ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17665549 gaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgctca 17665637  T
Q  271 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17665638 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaa 17665683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 42998790 - 42998947
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||           ||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  42998790 gtgacaactaaggtactcatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataagcatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatc 42998878  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42998879 ttgaccccaccaataaattgatcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaa 42998947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40022250 - 40022086
Alignment:
Q  141 attaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 240  Q
    ||||||| | |||||| | ||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||    
T  40022250 attaaggaggcaactacgctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catga 40022162  T
Q  241 actatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40022161 actatcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccatcattcttcaaaggtaa 40022086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24688285 - 24688126
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  24688285 ggtgacaactaggttacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccagtagacattagccacataaacacatatt-----------catgaactat 24688197  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24688196 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacaatttttcaaaggtaa 24688126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51143987 - 51143829
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 246  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||     
T  51143987 gtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactata 51143899  T
Q  247 ttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51143898 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 51143829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47182131 - 47182049
Alignment:
Q  197 atacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattg 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47182131 atacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 47182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 51224038 - 51224196
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||| |||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  51224038 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatatattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 51224126  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51224127 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattg-ttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 51224196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 312
Target Start/End: Original strand, 44945931 - 44946084
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||                     
T  44945931 ttaaggtgacaactaggctacgcatgaaagaatgatgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt----------------- 44946013  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44946014 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaag 44946084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 41882063 - 41882150
Alignment:
Q  229 tggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41882063 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 41882150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 43176738 - 43176897
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||            ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  43176738 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaataaacatc-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 43176826  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||  ||| || |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43176827 cttgacatcaccaataaattgttcattatgattggttggtggataaattatccaccatttttcaaaggtaa 43176897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 50731914 - 50732073
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||           |||  |||||  |||||||||| |||||     
T  50731914 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50732002  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50732003 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 50732073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50780942 - 50780783
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||           |||  |||||  |||||||||| |||||     
T  50780942 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50780854  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50780853 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 50780783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Original strand, 2227995 - 2228094
Alignment:
Q  217 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2227995 cacattttgaagtgatatctatgaactatcttgacctcaccaataaattgcttattttcattggttgatcggtaaatttcccaccatttttcaaaggtaa 2228094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 21597220 - 21597307
Alignment:
Q  229 tggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21597220 tggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaaggtaa 21597307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 28576184 - 28576271
Alignment:
Q  229 tggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28576184 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattttcatcggttgatgggtaaattacccatcatacttcaaaggtaa 28576271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Original strand, 47402810 - 47402908
Alignment:
Q  217 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47402810 cacatttttaaatggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattgttcattttcattgattgatggataaattacccaccattctttaaaggtaa 47402908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 48726070 - 48726157
Alignment:
Q  229 tggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48726070 tggtatccatgaactgtcttgactctaccaataaattgcttattttcattgattggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 48726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Original strand, 52756067 - 52756214
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacatta----gccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||           ||||||    
T  52756067 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccaaaccaatacacattaattagccacataagcacatatt-----------catgaa 52756155  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52756156 ctatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttagtgggtaaataacccac 52756214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Original strand, 30429226 - 30429314
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggta 233  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30429226 aggtgacaactagggtacctacggaagaatggtggataatttatcccaattaatacatattagtcacataaacacatttttaagtggta 30429314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 272
Target Start/End: Original strand, 48534004 - 48534122
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||    
T  48534004 taaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccgatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 48534092  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcatt 272  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  48534093 tatcttgaccccacaaataaattgctcatt 48534122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40165822 - 40165682
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  40165822 ggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 40165734  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacc 297  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  40165733 cttgactccaccaataaattactcattatgattgcttggtgggtaaattacc 40165682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41609178 - 41609098
Alignment:
Q  217 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacc 297  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  41609178 cacatttttaggtagtatccatgaactattttaactccactaataaattgctcattttcattagttggtaggtaaattacc 41609098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 177343 - 177173
Alignment:
Q  135 aattaaattaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 234  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||           ||| |||||| || ||||    
T  177343 aattatatttaggtgacaactaggatattcatggaaaaatggtgggtaatttgctccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggttgtat 177255  T
Q  235 ccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| || | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  177254 ccataaagtatcttgatcccaccaataaattactcgttatgattggttggtgactaaattacccaccatttttcaaaggtaa 177173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 316
Target Start/End: Original strand, 8847718 - 8847817
Alignment:
Q  217 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  8847718 cacatttttaagtggtattcgtgaactattttgatcccaccaataaattgttcatttttattagttggtatgtaaattatacactattcttcaaaggtaa 8847817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48752161 - 48752097
Alignment:
Q  252 cccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48752161 cccaccaataaattgcacattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 48752097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52434216 - 52434151
Alignment:
Q  252 cccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggt-aaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  52434216 cccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaaattacccaccatttttcaaaggtaa 52434151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37741487 - 37741447
Alignment:
Q  276 attggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37741487 attggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaa 37741447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 187
Target Start/End: Original strand, 41882010 - 41882052
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaattta 187  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  41882010 aggtgacaactagggtacccgtggaagaatggtggataattta 41882052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48752284 - 48752226
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacatt 205  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48752284 gtgacaactaggatatctatggaaaaattgtgggtaatttatcccaaccaataaacatt 48752226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37760386 - 37760345
Alignment:
Q  147 gtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttat 188  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37760386 gtgataactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttat 37760345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 51942543 - 51942575
Alignment:
Q  284 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51942543 gtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaa 51942575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 13758 - 13932
Alignment:
Q  142 ttaaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758 ttaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 13857  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13858 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 13932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 39554 - 39726
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39554 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 39653  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39654 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 39726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2051 - 1881
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 1952  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1951 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 11133 - 11302
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11133 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11232  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11233 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctt-aaaggtaa 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 278192 - 278018
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagt--ggtatccatgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  278192 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggggtatccatgaa 278093  T
Q  242 ctatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  278092 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaatttacccaccattcttcaaaggtaa 278018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 176837 - 176666
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  176837 aggtgacaactaggatacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatccatgaacta 176738  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176737 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtcggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 176666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 75242 - 75414
Alignment:
Q  144 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 243  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  75242 aaggtgacaactaggttaccaatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatgcatgaact 75341  T
Q  244 atcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75342 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 75414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 2432 - 2602
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2432 ggtgataactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2531  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2532 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataatttacccaccattcttcaaaggtaa 2602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 143 - 312
Target Start/End: Original strand, 18851 - 19020
Alignment:
Q  143 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18851 taaggtgacaactagggtacccatggaagaattgtggataatttattccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaat 18950  T
Q  243 tatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18951 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 19020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 174 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32715 - 32573
Alignment:
Q  174 tggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32715 tggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataaacacatttttaaatggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattt 32616  T
Q  274 tcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32615 tcattggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaa 32573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 286
Target Start/End: Original strand, 4596 - 4736
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 4695  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtg 286  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  4696 ctttaccccaccaacaaattgttcatttttattagttggtg 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3100
Alignment:
Q  145 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 244  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3262 aggtgacaactaaggtatccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 3163  T
Q  245 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||         |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3162 tcttgatcccaccaacaaattgctcatttt---------gtgaataaattacccaccattcttcaaaggtaa 3100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 7102
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  7262 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 7174  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcatttt-cattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7173 cttgaccccacaaataaattgctcatttttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 7102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14915 - 14756
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  14915 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtaggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 14827  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14826 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 14756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 20477 - 20636
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||||||||||| || |||    
T  20477 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaattat 20565  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20566 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 20636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 114
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||  |||||           ||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  272 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtggg-aatttacctcaaccaattaacatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 185  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  184 cttgactccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4714
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||  |||||           ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4554 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacatt-----------cacctttttaaatggtatccatgaactat 4642  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctca-ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  4643 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaa 4714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3564 - 3404
Alignment:
Q  146 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 245  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||  |||||           ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3564 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacatt-----------cacctttttaaatggtatccatgaactat 3476  T
Q  246 cttgaccccactaacaaattgctcatttt-cattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  3475 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaa 3404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18043 - 17918
Alignment:
Q  180 gtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctcattttcattg 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||| || ||| ||||| |||  || |||||| |||| |||||||    
T  18043 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcataaaatattttgactccatcaataaattgatcatattcattg 17955  T
Q  280 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17954 gttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaa 17918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19327 - 19229
Alignment:
Q  222 ttttaagtggtatccatgaactat----cttgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19327 ttttaggtggtatccatgaactatatatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaaagtaa 19229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University