View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14357_low_7 (Length: 387)

Name: NF14357_low_7
Description: NF14357
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14357_low_7
NF14357_low_7
[»] chr6 (95 HSPs)
chr6 (50-372)||(34963520-34963842)
chr6 (59-372)||(30676412-30676725)
chr6 (59-368)||(24422698-24423006)
chr6 (59-368)||(33861945-33862253)
chr6 (59-368)||(33864429-33864737)
chr6 (59-368)||(12742468-12742777)
chr6 (59-368)||(18334295-18334603)
chr6 (59-368)||(26924343-26924651)
chr6 (59-368)||(8055180-8055489)
chr6 (59-368)||(1540614-1540922)
chr6 (59-368)||(2290883-2291191)
chr6 (59-372)||(25688649-25688962)
chr6 (59-368)||(19858625-19858930)
chr6 (62-356)||(28289042-28289334)
chr6 (59-368)||(22782378-22782686)
chr6 (59-320)||(19847674-19847931)
chr6 (59-310)||(1598266-1598516)
chr6 (50-285)||(25535641-25535876)
chr6 (62-357)||(12942363-12942646)
chr6 (59-309)||(19005361-19005611)
chr6 (85-323)||(17377576-17377814)
chr6 (59-309)||(18914142-18914392)
chr6 (50-320)||(23992622-23992891)
chr6 (59-309)||(31630243-31630493)
chr6 (50-226)||(19005637-19005813)
chr6 (63-226)||(1871-2034)
chr6 (63-226)||(8830-8993)
chr6 (59-226)||(1598542-1598709)
chr6 (50-226)||(19847472-19847648)
chr6 (50-226)||(30676210-30676386)
chr6 (59-226)||(25688988-25689155)
chr6 (59-225)||(27557016-27557182)
chr6 (59-222)||(26924150-26924313)
chr6 (59-225)||(23415258-23415424)
chr6 (50-226)||(1598735-1598911)
chr6 (50-222)||(18914615-18914787)
chr6 (50-226)||(31630041-31630217)
chr6 (60-222)||(18914422-18914584)
chr6 (59-179)||(15892111-15892231)
chr6 (63-226)||(79-242)
chr6 (234-368)||(19005197-19005330)
chr6 (234-336)||(31630524-31630626)
chr6 (251-372)||(25656776-25656897)
chr6 (107-226)||(25737128-25737247)
chr6 (62-164)||(17883203-17883305)
chr6 (234-352)||(18913994-18914111)
chr6 (97-226)||(25689181-25689310)
chr6 (183-309)||(15875621-15875737)
chr6 (234-356)||(15875469-15875590)
chr6 (131-226)||(22981321-22981416)
chr6 (131-226)||(23806992-23807087)
chr6 (59-133)||(25737028-25737102)
chr6 (305-368)||(1595700-1595763)
chr6 (59-125)||(9019-9085)
chr6 (287-352)||(18937252-18937317)
chr6 (108-226)||(18334151-18334269)
chr6 (108-206)||(19984130-19984228)
chr6 (108-226)||(24423032-24423150)
chr6 (97-206)||(16240296-16240405)
chr6 (97-206)||(16556945-16557054)
chr6 (97-206)||(16633501-16633610)
chr6 (97-206)||(16650175-16650284)
chr6 (105-206)||(22593590-22593691)
chr6 (59-103)||(22981442-22981486)
chr6 (59-103)||(23806922-23806966)
chr6 (97-206)||(25904474-25904584)
chr6 (108-226)||(33864763-33864881)
chr6 (136-206)||(35016043-35016113)
chr6 (97-206)||(27654597-27654706)
chr6 (235-299)||(35056717-35056781)
chr6 (136-206)||(22226608-22226679)
chr6 (108-206)||(21776107-21776205)
chr6 (235-293)||(32259078-32259136)
chr6 (137-206)||(1555527-1555596)
chr6 (137-206)||(10487971-10488040)
chr6 (137-178)||(16133087-16133128)
chr6 (137-206)||(16377288-16377357)
chr6 (137-206)||(16384612-16384681)
chr6 (137-206)||(16826408-16826477)
chr6 (327-372)||(25754956-25755001)
chr6 (137-226)||(26924035-26924124)
chr6 (137-206)||(33315116-33315185)
chr6 (108-152)||(10905416-10905460)
chr6 (195-226)||(2290826-2290857)
chr6 (97-204)||(19609582-19609689)
chr6 (191-226)||(22782712-22782747)
chr6 (271-301)||(17883303-17883333)
chr6 (97-183)||(25175135-25175221)
chr6 (235-312)||(15875565-15875642)
chr6 (97-178)||(18455449-18455530)
chr6 (235-312)||(18914086-18914163)
chr6 (137-178)||(19443697-19443738)
chr6 (327-368)||(20556864-20556905)
chr6 (340-368)||(18456870-18456898)
chr6 (340-368)||(19847932-19847960)
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (59-372)||(16413018-16413331)
chr8 (59-368)||(24485746-24486055)
chr8 (59-368)||(1484553-1484861)
chr8 (59-368)||(14409147-14409455)
chr8 (59-368)||(5852995-5853303)
chr8 (59-336)||(27472119-27472395)
chr8 (66-368)||(4483431-4483733)
chr8 (59-368)||(15070710-15071020)
chr8 (59-368)||(4542076-4542384)
chr8 (59-368)||(22001904-22002212)
chr8 (59-368)||(14823924-14824234)
chr8 (59-331)||(32121916-32122188)
chr8 (59-368)||(20045898-20046206)
chr8 (59-331)||(18677767-18678039)
chr8 (59-299)||(38549707-38549947)
chr8 (59-289)||(24048841-24049070)
chr8 (59-298)||(16198115-16198354)
chr8 (50-309)||(1326625-1326884)
chr8 (59-307)||(16401627-16401875)
chr8 (59-312)||(15202881-15203134)
chr8 (59-312)||(20403486-20403739)
chr8 (97-298)||(25657893-25658094)
chr8 (59-309)||(19936610-19936850)
chr8 (59-316)||(19896524-19896781)
chr8 (50-226)||(20403765-20403941)
chr8 (50-226)||(27471917-27472093)
chr8 (59-225)||(14397443-14397609)
chr8 (100-312)||(45290385-45290597)
chr8 (59-226)||(19896807-19896974)
chr8 (50-226)||(32122214-32122390)
chr8 (59-227)||(15202688-15202856)
chr8 (59-226)||(38549514-38549681)
chr8 (50-226)||(38549313-38549488)
chr8 (61-198)||(45290252-45290389)
chr8 (50-226)||(15071046-15071222)
chr8 (50-226)||(15202486-15202662)
chr8 (62-226)||(16401437-16401601)
chr8 (59-226)||(16401242-16401408)
chr8 (50-226)||(16412816-16412992)
chr8 (50-226)||(19897000-19897176)
chr8 (50-218)||(24049104-24049272)
chr8 (234-368)||(20403378-20403511)
chr8 (234-368)||(32810082-32810215)
chr8 (234-368)||(15203109-15203242)
chr8 (234-368)||(45290572-45290705)
chr8 (53-226)||(19936411-19936584)
chr8 (234-368)||(19896419-19896553)
chr8 (50-204)||(11361024-11361178)
chr8 (235-366)||(19936882-19937014)
chr8 (234-336)||(38549988-38550090)
chr8 (234-336)||(20982604-20982710)
chr8 (234-309)||(13425336-13425411)
chr8 (234-309)||(20982498-20982573)
chr8 (234-356)||(1326915-1327042)
chr8 (50-152)||(32810263-32810365)
chr8 (234-323)||(16401908-16401996)
chr8 (245-309)||(13425241-13425305)
chr8 (97-206)||(15319989-15320098)
chr8 (97-206)||(15500358-15500467)
chr8 (137-206)||(29759429-29759498)
chr8 (108-226)||(1484887-1485005)
chr8 (137-206)||(13663129-13663198)
chr8 (137-226)||(20045783-20045872)
chr8 (137-206)||(22007126-22007195)
chr8 (238-301)||(21513644-21513707)
chr8 (108-226)||(5852851-5852969)
chr8 (108-226)||(14409003-14409121)
chr8 (136-206)||(17150655-17150725)
chr8 (235-301)||(18815609-18815675)
chr8 (235-299)||(38988740-38988804)
chr8 (235-299)||(39019837-39019901)
chr8 (136-206)||(22089412-22089482)
chr8 (235-301)||(36733302-36733368)
chr8 (97-206)||(223305-223414)
chr8 (137-206)||(272204-272273)
chr8 (137-206)||(643576-643645)
chr8 (97-206)||(688076-688185)
chr8 (97-206)||(736928-737037)
chr8 (137-206)||(829382-829451)
chr8 (97-206)||(860823-860932)
chr8 (242-299)||(5083001-5083058)
chr8 (235-312)||(19936829-19936906)
chr8 (235-299)||(38549936-38550000)
chr8 (191-226)||(4483765-4483800)
chr8 (191-226)||(14824260-14824295)
chr8 (234-312)||(1326862-1326940)
chr8 (196-226)||(16401186-16401216)
chr8 (310-356)||(35026849-35026895)
chr8 (108-178)||(39364118-39364188)
chr8 (108-178)||(44522814-44522884)
chr8 (235-312)||(13425284-13425361)
chr8 (137-206)||(18618830-18618899)
chr8 (235-312)||(20982552-20982629)
chr8 (137-206)||(22146977-22147046)
chr8 (247-312)||(32810190-32810255)
chr8 (97-178)||(44477018-44477099)
chr8 (97-178)||(44480280-44480361)
chr8 (235-299)||(13425390-13425454)
chr8 (340-368)||(26224070-26224098)
chr8 (340-368)||(41598339-41598367)
[»] chr4 (97 HSPs)
chr4 (59-372)||(3515154-3515467)
chr4 (59-372)||(14970409-14970722)
chr4 (59-368)||(15118055-15118363)
chr4 (62-357)||(15534343-15534638)
chr4 (59-368)||(44615439-44615748)
chr4 (59-368)||(50222042-50222350)
chr4 (59-372)||(19242846-19243160)
chr4 (62-356)||(36038033-36038327)
chr4 (59-309)||(52872775-52873025)
chr4 (62-356)||(49547479-49547773)
chr4 (59-368)||(44772786-44773098)
chr4 (62-309)||(362390-362637)
chr4 (62-356)||(14048740-14049034)
chr4 (59-368)||(7640889-7641203)
chr4 (62-309)||(19617772-19618019)
chr4 (59-303)||(29267569-29267813)
chr4 (63-309)||(15495880-15496126)
chr4 (59-367)||(1837222-1837519)
chr4 (59-309)||(14746214-14746464)
chr4 (59-309)||(19857798-19858038)
chr4 (51-312)||(11949-12210)
chr4 (59-312)||(52312769-52313021)
chr4 (50-226)||(14970207-14970383)
chr4 (50-226)||(19858064-19858240)
chr4 (50-226)||(52872573-52872749)
chr4 (59-224)||(362668-362833)
chr4 (50-226)||(19617567-19617743)
chr4 (59-226)||(14746021-14746188)
chr4 (50-226)||(362859-363035)
chr4 (50-226)||(18214704-18214880)
chr4 (50-226)||(52313240-52313416)
chr4 (59-226)||(52313047-52313214)
chr4 (191-368)||(18239254-18239430)
chr4 (62-226)||(3515493-3515657)
chr4 (180-309)||(18214992-18215121)
chr4 (92-226)||(15495716-15495850)
chr4 (234-372)||(19618050-19618187)
chr4 (234-368)||(18215152-18215285)
chr4 (59-245)||(30147189-30147375)
chr4 (234-368)||(12185-12318)
chr4 (234-368)||(15355202-15355335)
chr4 (234-368)||(52312661-52312794)
chr4 (206-309)||(15355068-15355171)
chr4 (234-356)||(15496949-15497070)
chr4 (234-355)||(52873056-52873176)
chr4 (120-226)||(14185621-14185727)
chr4 (234-356)||(14746495-14746618)
chr4 (50-134)||(12778376-12778460)
chr4 (234-301)||(19857700-19857767)
chr4 (108-226)||(22725284-22725401)
chr4 (60-177)||(14185477-14185594)
chr4 (59-119)||(18214906-18214966)
chr4 (268-336)||(362268-362336)
chr4 (109-206)||(14951270-14951367)
chr4 (50-118)||(15489649-15489717)
chr4 (156-222)||(14745925-14745991)
chr4 (137-206)||(14995644-14995713)
chr4 (136-204)||(55377225-55377293)
chr4 (108-226)||(15117911-15118029)
chr4 (108-206)||(25120046-25120144)
chr4 (105-206)||(43281694-43281795)
chr4 (50-101)||(15355018-15355069)
chr4 (63-126)||(22725431-22725494)
chr4 (104-218)||(9198544-9198658)
chr4 (97-206)||(18247739-18247848)
chr4 (303-356)||(19857607-19857660)
chr4 (97-206)||(47357183-47357292)
chr4 (97-204)||(15287859-15287966)
chr4 (97-204)||(15294969-15295076)
chr4 (191-226)||(44772725-44772760)
chr4 (108-206)||(5683367-5683465)
chr4 (108-226)||(7640745-7640863)
chr4 (108-206)||(22355071-22355169)
chr4 (97-206)||(10643746-10643855)
chr4 (327-372)||(12611090-12611135)
chr4 (97-194)||(16731688-16731785)
chr4 (137-206)||(17146320-17146389)
chr4 (137-206)||(18168293-18168362)
chr4 (235-312)||(19617998-19618075)
chr4 (327-372)||(51463838-51463883)
chr4 (50-105)||(14745876-14745931)
chr4 (110-152)||(11940064-11940106)
chr4 (97-178)||(630280-630361)
chr4 (165-218)||(9221267-9221320)
chr4 (234-299)||(14629428-14629493)
chr4 (235-312)||(14746443-14746520)
chr4 (235-312)||(15355150-15355227)
chr4 (137-206)||(19020009-19020078)
chr4 (235-312)||(19857742-19857819)
chr4 (327-372)||(23803235-23803280)
chr4 (235-299)||(362347-362411)
chr4 (108-152)||(11557892-11557936)
chr4 (340-368)||(15367845-15367873)
chr4 (340-368)||(15370172-15370200)
chr4 (340-368)||(15371357-15371385)
chr4 (340-368)||(15373638-15373666)
chr4 (340-368)||(15402858-15402886)
[»] chr7 (105 HSPs)
chr7 (59-372)||(16213831-16214144)
chr7 (59-368)||(27217011-27217320)
chr7 (59-368)||(41523068-41523377)
chr7 (59-368)||(41525530-41525839)
chr7 (59-368)||(456472-456781)
chr7 (59-368)||(15376416-15376724)
chr7 (59-368)||(20384826-20385134)
chr7 (59-368)||(16232671-16232980)
chr7 (59-368)||(14948825-14949133)
chr7 (59-368)||(32125642-32125950)
chr7 (62-357)||(11303409-11303704)
chr7 (66-368)||(13869498-13869801)
chr7 (59-368)||(16410210-16410518)
chr7 (63-368)||(21189302-21189606)
chr7 (62-356)||(16108394-16108688)
chr7 (59-368)||(18640423-18640731)
chr7 (59-368)||(24702389-24702688)
chr7 (59-368)||(24704836-24705135)
chr7 (59-368)||(18627717-18628025)
chr7 (59-368)||(18430863-18431171)
chr7 (62-356)||(23664658-23664952)
chr7 (59-309)||(14269659-14269909)
chr7 (59-309)||(15081544-15081794)
chr7 (59-309)||(8940489-8940743)
chr7 (59-368)||(26355684-26355994)
chr7 (59-368)||(26358136-26358446)
chr7 (59-368)||(11393002-11393298)
chr7 (62-356)||(29796771-29797067)
chr7 (62-356)||(29800590-29800886)
chr7 (59-307)||(45847357-45847605)
chr7 (50-309)||(8468945-8469204)
chr7 (50-312)||(11972755-11973017)
chr7 (59-226)||(8940769-8940935)
chr7 (50-226)||(14269264-14269440)
chr7 (59-226)||(10501096-10501263)
chr7 (50-226)||(38897728-38897904)
chr7 (59-225)||(25926832-25926998)
chr7 (127-299)||(13841274-13841446)
chr7 (50-226)||(16214170-16214346)
chr7 (59-226)||(14156781-14156944)
chr7 (50-226)||(8940962-8941138)
chr7 (59-225)||(1856932-1857097)
chr7 (50-226)||(21189096-21189272)
chr7 (63-226)||(14156592-14156755)
chr7 (59-226)||(14269466-14269633)
chr7 (50-220)||(15081342-15081512)
chr7 (59-225)||(13918105-13918272)
chr7 (234-368)||(11972647-11972780)
chr7 (234-356)||(14269940-14270061)
chr7 (63-189)||(10500934-10501060)
chr7 (64-226)||(17985092-17985254)
chr7 (234-368)||(15081825-15081960)
chr7 (260-368)||(13841163-13841270)
chr7 (234-336)||(45847638-45847739)
chr7 (234-356)||(38898106-38898229)
chr7 (234-356)||(8940335-8940458)
chr7 (229-309)||(38897995-38898075)
chr7 (108-226)||(45847213-45847331)
chr7 (268-356)||(8468803-8468891)
chr7 (139-227)||(11310239-11310327)
chr7 (60-141)||(11310133-11310213)
chr7 (60-129)||(23461795-23461864)
chr7 (136-206)||(11286976-11287046)
chr7 (108-226)||(15376272-15376390)
chr7 (108-226)||(20384682-20384800)
chr7 (137-206)||(125965-126034)
chr7 (108-194)||(16202766-16202852)
chr7 (108-226)||(16410544-16410662)
chr7 (234-299)||(15119918-15119983)
chr7 (235-299)||(13745569-13745633)
chr7 (235-299)||(38294567-38294631)
chr7 (191-226)||(18628051-18628086)
chr7 (191-226)||(18640757-18640792)
chr7 (191-226)||(26355623-26355658)
chr7 (191-226)||(26358075-26358110)
chr7 (140-206)||(15951637-15951703)
chr7 (108-226)||(27217346-27217464)
chr7 (137-206)||(7822013-7822082)
chr7 (137-206)||(7829324-7829393)
chr7 (235-312)||(14269888-14269965)
chr7 (137-206)||(15760779-15760848)
chr7 (137-206)||(27102552-27102621)
chr7 (137-206)||(27109900-27109969)
chr7 (137-206)||(27175705-27175774)
chr7 (137-206)||(38784644-38784713)
chr7 (108-188)||(10000996-10001076)
chr7 (108-152)||(13475728-13475772)
chr7 (191-226)||(13869833-13869868)
chr7 (50-89)||(45846945-45846984)
chr7 (235-285)||(9743795-9743845)
chr7 (97-178)||(10896371-10896452)
chr7 (327-368)||(13647480-13647521)
chr7 (235-312)||(15081773-15081850)
chr7 (97-178)||(23664500-23664581)
chr7 (137-178)||(29004416-29004457)
chr7 (235-312)||(38898054-38898131)
chr7 (235-312)||(45847586-45847663)
chr7 (235-299)||(8468902-8468966)
chr7 (235-299)||(8940446-8940510)
chr7 (340-368)||(12756654-12756682)
chr7 (340-368)||(17061898-17061926)
chr7 (97-129)||(20110747-20110779)
chr7 (235-283)||(25941523-25941571)
chr7 (235-299)||(43747672-43747736)
chr7 (340-368)||(44116660-44116688)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (60-372)||(4841-5153)
scaffold0716 (50-226)||(5180-5356)
[»] scaffold0230 (6 HSPs)
scaffold0230 (59-368)||(14098-14407)
scaffold0230 (63-310)||(23237-23484)
scaffold0230 (50-226)||(22871-23047)
scaffold0230 (140-226)||(23121-23207)
scaffold0230 (50-110)||(20704-20764)
scaffold0230 (59-104)||(23073-23118)
[»] chr2 (111 HSPs)
chr2 (59-368)||(39682464-39682773)
chr2 (59-372)||(32214633-32214936)
chr2 (59-368)||(571548-571857)
chr2 (59-368)||(18809094-18809402)
chr2 (59-368)||(23711716-23712024)
chr2 (59-368)||(28577250-28577558)
chr2 (62-357)||(20261381-20261676)
chr2 (66-368)||(23131013-23131315)
chr2 (66-368)||(23133480-23133782)
chr2 (66-368)||(34402231-34402533)
chr2 (59-368)||(23709235-23709543)
chr2 (59-368)||(24897898-24898206)
chr2 (59-368)||(24905335-24905643)
chr2 (59-368)||(24900381-24900689)
chr2 (59-368)||(24902858-24903166)
chr2 (59-368)||(24907810-24908118)
chr2 (59-368)||(26505530-26505838)
chr2 (59-368)||(26508008-26508316)
chr2 (59-309)||(23706919-23707169)
chr2 (59-309)||(24642451-24642701)
chr2 (59-368)||(32039201-32039509)
chr2 (62-356)||(10684468-10684764)
chr2 (59-368)||(23135741-23136039)
chr2 (59-309)||(24671235-24671485)
chr2 (59-309)||(24918350-24918600)
chr2 (62-309)||(24681654-24681901)
chr2 (63-320)||(24529253-24529510)
chr2 (59-312)||(22105672-22105925)
chr2 (61-309)||(38967689-38967937)
chr2 (59-293)||(45027607-45027840)
chr2 (59-312)||(24368033-24368286)
chr2 (59-312)||(6726254-6726507)
chr2 (59-312)||(21154710-21154963)
chr2 (59-312)||(41523775-41524028)
chr2 (120-331)||(25616369-25616580)
chr2 (50-226)||(22105951-22106127)
chr2 (50-222)||(41523380-41523552)
chr2 (61-226)||(41523584-41523749)
chr2 (50-226)||(24529047-24529223)
chr2 (59-204)||(23931775-23931920)
chr2 (50-226)||(24368312-24368488)
chr2 (50-226)||(24918626-24918802)
chr2 (50-226)||(6726533-6726709)
chr2 (50-226)||(24681930-24682106)
chr2 (59-226)||(21154517-21154684)
chr2 (50-224)||(32214430-32214604)
chr2 (50-223)||(23931949-23932122)
chr2 (50-226)||(21154315-21154491)
chr2 (50-224)||(45027405-45027579)
chr2 (50-226)||(23706526-23706702)
chr2 (50-226)||(24671511-24671687)
chr2 (59-226)||(23709042-23709209)
chr2 (234-368)||(6726146-6726279)
chr2 (238-368)||(21154942-21155071)
chr2 (234-368)||(22105564-22105697)
chr2 (59-221)||(23706727-23706889)
chr2 (234-368)||(24367925-24368058)
chr2 (234-368)||(38967526-38967658)
chr2 (234-368)||(24642732-24642867)
chr2 (234-356)||(23707200-23707323)
chr2 (234-356)||(24918196-24918319)
chr2 (237-356)||(24671081-24671201)
chr2 (234-356)||(24681500-24681623)
chr2 (59-128)||(31345570-31345639)
chr2 (287-366)||(45029784-45029863)
chr2 (161-225)||(31345490-31345554)
chr2 (137-218)||(16900803-16900884)
chr2 (137-218)||(16994194-16994275)
chr2 (135-206)||(67339-67410)
chr2 (108-226)||(18809428-18809546)
chr2 (97-206)||(24686598-24686707)
chr2 (137-206)||(34823750-34823819)
chr2 (235-299)||(21368375-21368439)
chr2 (174-226)||(24642373-24642425)
chr2 (108-226)||(23711572-23711690)
chr2 (108-226)||(26505864-26505982)
chr2 (108-226)||(26508342-26508460)
chr2 (136-206)||(27261332-27261402)
chr2 (108-226)||(27920323-27920441)
chr2 (108-226)||(28577584-28577702)
chr2 (108-226)||(32039057-32039175)
chr2 (97-178)||(6483113-6483194)
chr2 (137-206)||(12727711-12727780)
chr2 (97-206)||(19887275-19887384)
chr2 (235-299)||(23799467-23799531)
chr2 (108-152)||(44584588-44584632)
chr2 (191-226)||(23131347-23131382)
chr2 (191-226)||(34402164-34402199)
chr2 (234-277)||(41524003-41524045)
chr2 (120-178)||(34135071-34135129)
chr2 (137-226)||(571883-571972)
chr2 (97-178)||(6486580-6486661)
chr2 (137-206)||(11232253-11232322)
chr2 (137-206)||(22514100-22514169)
chr2 (137-206)||(28776702-28776771)
chr2 (138-206)||(22274022-22274090)
chr2 (240-316)||(22686145-22686221)
chr2 (340-372)||(29601486-29601518)
chr2 (191-226)||(23133814-23133849)
chr2 (191-226)||(23708981-23709016)
chr2 (195-226)||(39682799-39682830)
chr2 (97-178)||(21081348-21081429)
chr2 (327-368)||(22173799-22173840)
chr2 (235-312)||(23707148-23707225)
chr2 (235-312)||(24642680-24642757)
chr2 (235-312)||(24918294-24918371)
chr2 (138-206)||(22283255-22283323)
chr2 (235-283)||(22686062-22686110)
chr2 (110-206)||(23281235-23281331)
chr2 (340-368)||(24529511-24529539)
chr2 (108-152)||(24788042-24788086)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (59-372)||(21840914-21841226)
chr1 (59-368)||(13989017-13989325)
chr1 (59-368)||(21922994-21923302)
chr1 (59-372)||(16362064-16362378)
chr1 (59-368)||(21474789-21475098)
chr1 (59-373)||(15859711-15860024)
chr1 (59-372)||(23593436-23593750)
chr1 (59-309)||(16274958-16275209)
chr1 (62-299)||(27161292-27161529)
chr1 (59-312)||(29776947-29777200)
chr1 (59-312)||(31612572-31612825)
chr1 (61-299)||(29298461-29298699)
chr1 (59-312)||(22122717-22122970)
chr1 (50-312)||(22050530-22050792)
chr1 (59-253)||(29535317-29535511)
chr1 (59-253)||(13227129-13227323)
chr1 (50-226)||(29298727-29298903)
chr1 (62-226)||(31612851-31613015)
chr1 (60-226)||(15859506-15859672)
chr1 (50-226)||(22122514-22122691)
chr1 (50-226)||(31613044-31613220)
chr1 (50-226)||(29777226-29777402)
chr1 (50-226)||(16274756-16274932)
chr1 (50-226)||(16401407-16401583)
chr1 (50-219)||(9044698-9044867)
chr1 (234-368)||(29776839-29776972)
chr1 (50-216)||(40129387-40129553)
chr1 (234-367)||(16275240-16275373)
chr1 (62-226)||(27161099-27161263)
chr1 (234-368)||(29298287-29298420)
chr1 (234-368)||(22122945-22123078)
chr1 (234-368)||(31612464-31612597)
chr1 (50-151)||(43543269-43543370)
chr1 (234-331)||(22050767-22050863)
chr1 (235-323)||(27161518-27161605)
chr1 (156-226)||(10812612-10812682)
chr1 (58-178)||(10812707-10812827)
chr1 (108-226)||(13989351-13989469)
chr1 (50-112)||(43630282-43630344)
chr1 (234-299)||(29298408-29298473)
chr1 (304-356)||(43543214-43543266)
chr1 (136-206)||(21858592-21858662)
chr1 (108-206)||(44035830-44035928)
chr1 (60-175)||(16401265-16401380)
chr1 (137-206)||(17003909-17003978)
chr1 (137-206)||(21650910-21650979)
chr1 (137-206)||(22366527-22366596)
chr1 (235-294)||(12710152-12710211)
chr1 (99-178)||(18060577-18060656)
chr1 (195-226)||(21474732-21474763)
chr1 (137-183)||(16655956-16656002)
chr1 (235-312)||(16275188-16275265)
chr1 (137-178)||(24815269-24815310)
chr1 (340-368)||(13212844-13212872)
chr1 (340-368)||(21347113-21347141)
chr1 (235-283)||(22824136-22824184)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (62-372)||(11435-11746)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (59-372)||(9389-9701)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (59-368)||(37972-38281)
scaffold0134 (108-226)||(38307-38425)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (59-372)||(17142-17455)
scaffold0023 (59-368)||(94562-94870)
scaffold0023 (50-226)||(16940-17116)
scaffold0023 (108-226)||(94896-95014)
scaffold0023 (137-206)||(154892-154961)
[»] chr3 (110 HSPs)
chr3 (59-372)||(12567707-12568019)
chr3 (59-368)||(7781049-7781358)
chr3 (59-372)||(13544172-13544483)
chr3 (59-368)||(17463329-17463637)
chr3 (59-368)||(45606609-45606918)
chr3 (60-368)||(53301207-53301516)
chr3 (59-368)||(27165402-27165712)
chr3 (59-368)||(34159477-34159785)
chr3 (59-368)||(8499670-8499980)
chr3 (62-356)||(54520985-54521279)
chr3 (59-368)||(6468837-6469145)
chr3 (59-368)||(16453983-16454292)
chr3 (59-368)||(10247426-10247734)
chr3 (59-368)||(55476642-55476950)
chr3 (59-331)||(46822449-46822721)
chr3 (66-368)||(15412581-15412884)
chr3 (59-368)||(13153958-13154266)
chr3 (59-356)||(15977696-15977992)
chr3 (59-336)||(10557091-10557368)
chr3 (50-301)||(12119347-12119598)
chr3 (59-368)||(13151493-13151801)
chr3 (62-354)||(29544547-29544839)
chr3 (59-298)||(13436520-13436759)
chr3 (59-368)||(28848324-28848622)
chr3 (50-285)||(24513910-24514145)
chr3 (59-312)||(38961540-38961794)
chr3 (59-312)||(17444466-17444719)
chr3 (59-312)||(41124146-41124399)
chr3 (59-299)||(20629894-20630138)
chr3 (59-312)||(16282460-16282714)
chr3 (59-299)||(25237063-25237303)
chr3 (148-349)||(12305315-12305516)
chr3 (59-299)||(25229476-25229716)
chr3 (50-233)||(10379613-10379796)
chr3 (51-226)||(41124425-41124600)
chr3 (63-226)||(55319010-55319173)
chr3 (50-226)||(10557394-10557570)
chr3 (50-226)||(46822747-46822923)
chr3 (59-225)||(15465448-15465614)
chr3 (50-226)||(20629692-20629868)
chr3 (50-226)||(27165738-27165914)
chr3 (50-226)||(38961338-38961514)
chr3 (50-226)||(53301004-53301180)
chr3 (59-225)||(26054967-26055133)
chr3 (59-225)||(5223677-5223843)
chr3 (50-223)||(8500009-8500182)
chr3 (50-226)||(55318804-55318980)
chr3 (234-368)||(9707484-9707618)
chr3 (62-226)||(13937485-13937649)
chr3 (234-368)||(8899245-8899378)
chr3 (234-368)||(16282689-16282822)
chr3 (50-226)||(17444264-17444440)
chr3 (234-368)||(41124038-41124171)
chr3 (50-226)||(16282258-16282434)
chr3 (234-368)||(38961769-38961902)
chr3 (97-226)||(14567432-14567561)
chr3 (105-227)||(36528447-36528569)
chr3 (60-226)||(17393201-17393367)
chr3 (234-356)||(11913928-11914051)
chr3 (120-227)||(3264324-3264431)
chr3 (120-226)||(16358238-16358344)
chr3 (59-150)||(15007868-15007962)
chr3 (59-147)||(16358370-16358458)
chr3 (234-314)||(17444694-17444773)
chr3 (60-141)||(36528340-36528421)
chr3 (50-126)||(8899418-8899494)
chr3 (234-301)||(25237009-25237075)
chr3 (162-226)||(15007988-15008052)
chr3 (62-116)||(12305525-12305579)
chr3 (137-218)||(25058286-25058367)
chr3 (81-127)||(10555766-10555812)
chr3 (108-226)||(34159811-34159929)
chr3 (136-206)||(51158683-51158753)
chr3 (137-206)||(16934851-16934920)
chr3 (137-206)||(49231768-49231837)
chr3 (316-368)||(17446614-17446666)
chr3 (62-141)||(3264459-3264538)
chr3 (108-226)||(17463663-17463781)
chr3 (108-226)||(55476976-55477094)
chr3 (97-206)||(14528625-14528734)
chr3 (60-117)||(14567588-14567645)
chr3 (235-299)||(25201333-25201397)
chr3 (138-206)||(30152450-30152518)
chr3 (137-204)||(54039167-54039234)
chr3 (108-206)||(14263640-14263738)
chr3 (235-293)||(15025934-15025992)
chr3 (120-210)||(21026092-21026182)
chr3 (137-206)||(1468654-1468723)
chr3 (97-206)||(8276474-8276583)
chr3 (234-299)||(17044330-17044395)
chr3 (137-206)||(17956869-17956938)
chr3 (327-372)||(50242969-50243014)
chr3 (191-226)||(6468776-6468811)
chr3 (191-226)||(15412916-15412951)
chr3 (104-206)||(2281000-2281102)
chr3 (59-93)||(13937675-13937709)
chr3 (97-206)||(8269363-8269472)
chr3 (235-312)||(11913876-11913953)
chr3 (97-178)||(16979504-16979585)
chr3 (235-280)||(18700200-18700245)
chr3 (97-178)||(18889958-18890039)
chr3 (327-368)||(43550448-43550489)
chr3 (236-289)||(50351664-50351717)
chr3 (108-176)||(6158993-6159061)
chr3 (136-216)||(8023778-8023858)
chr3 (235-299)||(12119585-12119649)
chr3 (340-368)||(12119707-12119735)
chr3 (138-182)||(16643595-16643639)
chr3 (340-368)||(17248224-17248252)
chr3 (340-372)||(17672773-17672805)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (59-368)||(20898-21208)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (59-368)||(6098-6406)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (59-368)||(264471-264779)
chr5 (59-368)||(20909163-20909471)
chr5 (59-368)||(39245287-39245595)
chr5 (66-368)||(39363535-39363837)
chr5 (62-331)||(17516869-17517138)
chr5 (59-368)||(10732643-10732951)
chr5 (59-368)||(29346131-29346439)
chr5 (66-368)||(38619586-38619889)
chr5 (59-368)||(29348604-29348912)
chr5 (59-368)||(29351077-29351385)
chr5 (59-320)||(2154334-2154595)
chr5 (59-368)||(42245068-42245376)
chr5 (59-368)||(23064663-23064973)
chr5 (59-309)||(20901623-20901873)
chr5 (63-356)||(37804609-37804902)
chr5 (59-312)||(32027652-32027905)
chr5 (59-299)||(20917549-20917789)
chr5 (97-356)||(9776521-9776780)
chr5 (59-312)||(29330190-29330442)
chr5 (50-226)||(20901421-20901597)
chr5 (50-226)||(17516471-17516647)
chr5 (59-226)||(295977-296144)
chr5 (50-226)||(29330468-29330644)
chr5 (50-226)||(32028511-32028687)
chr5 (50-226)||(2154132-2154308)
chr5 (59-226)||(32028124-32028292)
chr5 (59-226)||(17516673-17516840)
chr5 (50-226)||(20917347-20917523)
chr5 (234-372)||(20917830-20917967)
chr5 (234-368)||(32027544-32027677)
chr5 (50-226)||(295775-295951)
chr5 (59-226)||(32027931-32028098)
chr5 (59-226)||(32028318-32028485)
chr5 (234-368)||(29330085-29330215)
chr5 (234-320)||(20901904-20901990)
chr5 (136-206)||(27183208-27183278)
chr5 (97-206)||(22883904-22884013)
chr5 (137-206)||(1220384-1220453)
chr5 (137-206)||(10778832-10778901)
chr5 (97-206)||(43444009-43444118)
chr5 (238-301)||(18743973-18744036)
chr5 (108-226)||(264327-264445)
chr5 (108-226)||(20909497-20909615)
chr5 (234-312)||(20917777-20917855)
chr5 (97-206)||(11903-12012)
chr5 (97-206)||(25426177-25426286)
chr5 (97-204)||(7424879-7424986)
chr5 (191-226)||(39245621-39245656)
chr5 (191-226)||(39363869-39363904)
chr5 (235-301)||(1628169-1628235)
chr5 (237-299)||(21399896-21399958)
chr5 (108-226)||(23064999-23065117)
chr5 (137-206)||(1168832-1168901)
chr5 (137-206)||(11212734-11212803)
chr5 (109-206)||(11342190-11342287)
chr5 (137-206)||(21074249-21074318)
chr5 (137-206)||(21933283-21933352)
chr5 (137-206)||(21939453-21939522)
chr5 (97-206)||(22367095-22367204)
chr5 (137-206)||(35581340-35581409)
chr5 (137-206)||(36990679-36990748)
chr5 (108-146)||(23280293-23280331)
chr5 (137-183)||(28901509-28901555)
chr5 (137-183)||(28937904-28937950)
chr5 (136-206)||(32950213-32950283)
chr5 (97-178)||(19511781-19511862)
chr5 (235-312)||(20901852-20901929)
chr5 (235-276)||(24067282-24067323)
chr5 (97-178)||(37804450-37804531)
chr5 (340-368)||(2154596-2154624)
chr5 (235-299)||(20198507-20198571)
chr5 (340-368)||(20901991-20902019)
chr5 (108-164)||(22755214-22755270)
chr5 (340-368)||(31061220-31061248)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (59-368)||(13543-13852)
scaffold0444 (186-226)||(13878-13918)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (59-368)||(134362-134670)
scaffold0028 (59-368)||(136831-137139)
scaffold0028 (59-368)||(139300-139608)
scaffold0028 (59-368)||(141769-142077)
scaffold0028 (59-368)||(144238-144546)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (62-356)||(3186-3480)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (59-368)||(40551-40859)
scaffold0044 (97-218)||(37848-37968)
scaffold0044 (186-226)||(40885-40925)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (59-356)||(4005-4304)
scaffold0741 (59-226)||(3812-3979)
scaffold0741 (59-222)||(3619-3782)
scaffold0741 (174-226)||(3541-3593)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (50-309)||(217-476)
scaffold0494 (234-309)||(507-582)
scaffold0494 (304-372)||(12196-12264)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (50-368)||(38349-38668)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (59-323)||(6638-6902)
scaffold0317 (50-226)||(6436-6612)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (59-309)||(30229-30479)
scaffold0149 (50-226)||(30505-30681)
scaffold0149 (236-320)||(30112-30196)
scaffold0149 (340-368)||(30083-30111)
[»] scaffold1792 (4 HSPs)
scaffold1792 (63-310)||(416-663)
scaffold1792 (50-226)||(853-1029)
scaffold1792 (140-226)||(693-779)
scaffold1792 (59-104)||(782-827)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (59-301)||(807-1049)
scaffold0747 (77-226)||(1075-1224)
scaffold0747 (50-196)||(1225-1370)
scaffold0747 (234-356)||(645-768)
[»] scaffold0043 (5 HSPs)
scaffold0043 (62-309)||(10001-10248)
scaffold0043 (62-226)||(10277-10441)
scaffold0043 (63-226)||(10470-10633)
scaffold0043 (234-268)||(9936-9970)
scaffold0043 (235-312)||(9945-10022)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (89-356)||(15083-15352)
scaffold0306 (59-268)||(11042-11251)
scaffold0306 (62-226)||(10852-11016)
scaffold0306 (50-226)||(15398-15573)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (97-356)||(53612-53873)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (61-372)||(501231-501522)
scaffold0001 (50-226)||(501550-501726)
scaffold0001 (340-368)||(85562-85590)
scaffold0001 (108-164)||(139589-139645)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (120-356)||(1591-1827)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (59-298)||(6682-6911)
scaffold0574 (50-226)||(6937-7113)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (149-372)||(10920-11142)
scaffold0454 (59-94)||(1-36)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (62-262)||(7996-8196)
scaffold0278 (59-226)||(8225-8392)
scaffold0278 (50-223)||(8421-8594)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (59-253)||(68227-68421)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (59-256)||(43002-43199)
scaffold0040 (109-301)||(13379-13571)
scaffold0040 (50-226)||(43225-43401)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (50-226)||(18423-18599)
scaffold0322 (59-104)||(18352-18397)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (50-226)||(1740-1916)
scaffold1296 (59-139)||(1634-1714)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (62-225)||(17947-18110)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (62-225)||(33465-33628)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (135-292)||(57708-57865)
[»] scaffold0711 (4 HSPs)
scaffold0711 (61-225)||(7395-7558)
scaffold0711 (59-226)||(7200-7367)
scaffold0711 (131-224)||(7079-7172)
scaffold0711 (59-95)||(7585-7621)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (59-225)||(31497-31663)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (59-225)||(39626-39792)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (59-226)||(8311-8478)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (59-225)||(19791-19957)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (63-226)||(36905-37068)
scaffold0151 (100-226)||(36749-36875)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (174-312)||(28048-28186)
scaffold0114 (234-350)||(27958-28073)
[»] scaffold0513 (3 HSPs)
scaffold0513 (222-309)||(10647-10734)
scaffold0513 (234-356)||(10765-10886)
scaffold0513 (235-312)||(10713-10790)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (60-218)||(113317-113475)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (234-356)||(15150-15273)
scaffold0106 (210-309)||(15030-15119)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (59-141)||(75607-75689)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (234-318)||(9932-10016)
scaffold0145 (236-298)||(10005-10067)
scaffold0145 (340-368)||(9901-9929)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (246-356)||(35955-36065)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (234-356)||(1204-1327)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (50-140)||(398-488)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (97-206)||(6196-6305)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (105-206)||(12489-12590)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (97-206)||(8566-8675)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (97-206)||(30470-30579)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (137-204)||(912-979)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (104-218)||(1219-1333)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (137-206)||(6970-7039)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (97-206)||(725-834)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (236-299)||(16263-16326)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (108-206)||(1267-1365)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (138-204)||(15780-15846)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (108-206)||(32118-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (108-206)||(40628-40726)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (136-206)||(39965-40035)
scaffold0034 (136-206)||(45448-45518)
scaffold0034 (136-206)||(79003-79073)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (137-206)||(1375-1444)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (97-206)||(110065-110174)
scaffold0035 (97-206)||(118566-118675)
scaffold0035 (108-151)||(15910-15953)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (235-299)||(15297-15361)
scaffold0174 (241-299)||(15350-15408)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (136-206)||(868-938)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (136-206)||(53946-54016)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (136-206)||(19939-20009)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (327-372)||(253-298)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (137-206)||(18205-18274)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (137-206)||(38375-38444)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (327-372)||(82219-82264)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (234-299)||(313-378)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (327-368)||(12209-12250)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (165-218)||(31918-31971)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (327-368)||(1250-1291)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (137-206)||(167129-167198)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (234-299)||(187890-187955)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (340-372)||(4444-4476)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (170-226)||(217-273)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (340-368)||(2111-2139)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (340-368)||(164573-164601)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (235-291)||(66762-66818)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (340-368)||(158433-158461)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 95)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 50 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34963842 - 34963520
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963842 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 34963743  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963742 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 34963643  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgtt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34963642 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 34963543  T
Q  350 gttatattgtgatataattatat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34963542 gttatattgtgatataattatat 34963520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Original strand, 30676412 - 30676725
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30676412 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 30676511  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676512 gtttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 30676611  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30676612 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 30676711  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  30676712 tgatataattatat 30676725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24423006 - 24422698
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24423006 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 24422907  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422906 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 24422807  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24422806 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 24422708  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  24422707 tgatataatt 24422698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33862253 - 33861945
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  33862253 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 33862154  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33862153 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 33862054  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  33862053 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 33861955  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  33861954 tgatataatt 33861945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33864737 - 33864429
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  33864737 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 33864638  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864637 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 33864538  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  33864537 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 33864439  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  33864438 tgatataatt 33864429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12742777 - 12742468
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12742777 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 12742678  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742677 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 12742578  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  12742577 tgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 12742478  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  12742477 tgatataatt 12742468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 18334295 - 18334603
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18334295 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 18334394  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334395 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 18334494  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  18334495 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 18334593  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  18334594 tgatataatt 18334603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 26924343 - 26924651
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26924343 tccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 26924442  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924443 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 26924542  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  26924543 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 26924641  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  26924642 tgatataatt 26924651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8055489 - 8055180
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  8055489 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttg 8055390  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8055389 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 8055290  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  8055289 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 8055190  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  8055189 tgatataatt 8055180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 1540614 - 1540922
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1540614 tccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 1540713  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1540714 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 1540813  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1540814 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 1540912  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    |||| |||||    
T  1540913 tgatgtaatt 1540922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 2290883 - 2291191
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2290883 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttg 2290982  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2290983 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 2291082  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  2291083 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 2291181  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  2291182 tgatataatt 2291191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25688962 - 25688649
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25688962 tccgaatttgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttg 25688863  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688862 gtttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 25688763  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25688762 tgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattg 25688663  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    |||||| |||||||    
T  25688662 tgatatgattatat 25688649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 19858625 - 19858930
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||    
T  19858625 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttg 19858721  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19858722 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 19858821  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  19858822 tgtatatg-ctgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattg 19858920  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  19858921 tgatataatt 19858930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 28289042 - 28289334
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289042 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 28289141  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28289142 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 28289241  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  28289242 atatatttgtga--gcgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22782686 - 22782378
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22782686 tccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 22782587  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782586 gtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 22782487  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  22782486 tgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattg 22782388  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  22782387 tgatataatt 22782378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 59 - 320
Target Start/End: Original strand, 19847674 - 19847931
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||| ||||||||| |||||    
T  19847674 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttg 19847769  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847770 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 19847869  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19847870 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 19847931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 59 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1598516 - 1598266
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1598516 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 1598417  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598416 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 1598317  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1598316 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 50 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25535876 - 25535641
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535876 catctttgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 25535777  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535776 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatta 25535677  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535676 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 62 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12942646 - 12942363
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||            |||||||||||||||||||||    
T  12942646 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtt 12942559  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12942558 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 12942459  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatatt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12942458 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19005611 - 19005361
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005611 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 19005512  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19005511 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggta 19005412  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  19005411 tgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcataattgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 85 - 323
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377814
Alignment:
Q  85 tgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaa 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  185 cttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattg 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 17377775  T
Q  285 ttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttt 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17377776 ttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18914392 - 18914142
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  18914392 tccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttg 18914293  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914292 gtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 18914193  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18914192 tgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 50 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23992891 - 23992622
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23992891 catctctgccccgaatttgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttcta 23992792  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992791 atgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaatta 23992692  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatg 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23992691 gtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 23992622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 31630243 - 31630493
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||     
T  31630243 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgtta 31630342  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31630343 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgta 31630442  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31630443 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19005813 - 19005637
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005813 catctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 19005714  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005713 atgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2034
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 1970  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 8830 - 8993
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8830 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 8929  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8930 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1598709 - 1598542
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1598709 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 1598610  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598609 gtatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 19847472 - 19847648
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847472 catctctgccccaaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 19847571  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| | || || |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847572 atgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 30676210 - 30676386
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676210 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 30676309  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676310 attccgttgctctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25689155 - 25688988
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25689155 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 25689056  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  ||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25689055 gtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27557182 - 27557016
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27557182 tccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattg 27557083  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27557082 gtctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 26924150 - 26924313
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26924150 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttg 26924249  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 222  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924250 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23415424 - 23415258
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  23415424 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattg 23415325  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415324 gtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1598911 - 1598735
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598911 catctctaccccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 1598812  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598811 attccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18914787 - 18914615
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  18914787 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttcta 18914688  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914687 atgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 31630041 - 31630217
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31630041 catctctgccccgaatttaaaatgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttcta 31630140  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31630141 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaat 31630217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18914584 - 18914422
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 159  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  18914584 ccgaattttaaattaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttgg 18914485  T
Q  160 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 222  Q
    | |||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18914484 tctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 179
Target Start/End: Original strand, 15892111 - 15892231
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15892111 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttg 15892210  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgattta 179  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  15892211 gtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 79 - 242
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  79 aatttaaaatgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtct 178  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  179 gacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005197
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 19005232  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005231 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 19005197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 336
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630626
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 31630623  T
Q  334 att 336  Q
    |||    
T  31630624 att 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 251 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656776
Alignment:
Q  251 tatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgttt 25656798  T
Q  351 ttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25656797 ttatattgtgatataattatat 25656776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  107 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  207 gcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Original strand, 17883203 - 17883305
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17883203 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtt 17883302  T
Q  162 tga 164  Q
    |||    
T  17883303 tga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18913994
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtta-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 18914013  T
Q  334 attaccatttgatgttgtt 352  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  18914012 attattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25689181
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  197 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875621
Alignment:
Q  183 aacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatat 15875648  T
Q  283 tgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15875647 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875469
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15875492  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatat 356  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  15875491 attattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981416
Alignment:
Q  131 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806992
Alignment:
Q  131 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25737102 - 25737028
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25737102 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595700
Alignment:
Q  305 atatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataatt 1595700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Original strand, 9019 - 9085
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagtt 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9019 tccgaattttaaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 287 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18937317 - 18937252
Alignment:
Q  287 catgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgtt 352  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18937317 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984228
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16240405 - 16240296
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||||     
T  16240405 aattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatga 16240306  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  16240305 tcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 16556945 - 16557054
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  16556945 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16557044  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  16557045 tcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 16633501 - 16633610
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  16633501 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16633600  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  16633601 tcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 16650175 - 16650284
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| || |||||||||| |||||     
T  16650175 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatga 16650274  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  16650275 tcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 22593590 - 22593691
Alignment:
Q  105 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  22593590 ttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaatta 22593689  T
Q  205 ct 206  Q
    ||    
T  22593690 ct 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 103
Target Start/End: Original strand, 22981442 - 22981486
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22981442 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23806966 - 23806922
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23806966 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25904584 - 25904474
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatga-tttatagaacttgaattatg 195  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  25904584 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatg 25904485  T
Q  196 gtcaaattact 206  Q
     ||||||||||    
T  25904484 atcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33864881 - 33864763
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  33864881 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 33864782  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33864781 cacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 35016043 - 35016113
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35016043 atgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 27654597 - 27654706
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  27654597 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 27654696  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  27654697 ttaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056717
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaa 35056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 22226608 - 22226679
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatga-tttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22226608 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776205
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 293  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555527
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10488040 - 10487971
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  10488040 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 16133087 - 16133128
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16133087 tgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgattt 16133128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 16377288 - 16377357
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16377288 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 16384612 - 16384681
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16384612 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 16826408 - 16826477
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  16826408 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754956
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatat 25754956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Original strand, 26924035 - 26924124
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924035 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315185
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 152
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 152  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Original strand, 2290826 - 2290857
Alignment:
Q  195 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290826 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19609689 - 19609582
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||| ||||||||||  ||||     
T  19609689 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatga 19609590  T
Q  197 tcaaatta 204  Q
    ||||||||    
T  19609589 tcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22782747 - 22782712
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782747 ttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 22782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 301
Target Start/End: Original strand, 17883303 - 17883333
Alignment:
Q  271 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883303 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 17883333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25175221 - 25175135
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttataga 183  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  25175221 aattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttaga 25175135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15875642 - 15875565
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  15875642 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgtat 15875565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Original strand, 18455449 - 18455530
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||    
T  18455449 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 18455530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18914163 - 18914086
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  18914163 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 18914086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 19443697 - 19443738
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19443697 tgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 19443738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20556905
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 20556905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456870
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataatt 18456870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19847960
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataatt 19847960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Original strand, 16413018 - 16413331
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16413018 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttg 16413117  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413118 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 16413217  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16413218 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 16413317  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  16413318 tgatataattatat 16413331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 24485746 - 24486055
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24485746 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 24485845  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485846 gtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 24485945  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24485946 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 24486045  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  24486046 tgatataatt 24486055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1484861 - 1484553
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1484861 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 1484762  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484761 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 1484662  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1484661 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 1484563  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  1484562 tgatataatt 1484553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 14409147 - 14409455
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14409147 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 14409246  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409247 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 14409346  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  14409347 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 14409445  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  14409446 tgatataatt 14409455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 5852995 - 5853303
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  5852995 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 5853094  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853095 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 5853194  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  5853195 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 5853293  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  5853294 tgatataatt 5853303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Original strand, 27472119 - 27472395
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472119 tccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttg 27472218  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472219 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 27472318  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgatt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27472319 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4483733 - 4483431
Alignment:
Q  66 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4483733 ttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 4483634  T
Q  166 ttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4483633 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 4483534  T
Q  266 gtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatata 365  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  4483533 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatata 4483434  T
Q  366 att 368  Q
    |||    
T  4483433 att 4483431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15071020 - 15070710
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15071020 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttg 15070921  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15070920 gtttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 15070821  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatatt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15070820 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatatt 15070721  T
Q  358 gtgatataatt 368  Q
      |||||||||    
T  15070720 cagatataatt 15070710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 4542076 - 4542384
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||     
T  4542076 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttc 4542175  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  4542176 gcttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaa 4542275  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  4542276 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 4542374  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  4542375 tgatataatt 4542384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22002212 - 22001904
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22002212 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttg 22002113  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22002112 gtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 22002013  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  22002012 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 22001914  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  22001913 tgatataatt 22001904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14824234 - 14823924
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14824234 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 14824135  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14824134 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaa 14824035  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg--tatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  14824034 tgtatatg-ttgtaaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatat 14823936  T
Q  357 tgtgatataatt 368  Q
    ||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataatt 14823924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 59 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32122188 - 32121916
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32122188 tccgaatttgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtta 32122089  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122088 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 32121989  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgt 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32121988 tgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgt 32121916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 20045898 - 20046206
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  20045898 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttg 20045997  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20045998 gtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaa 20046097  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  20046098 tgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 20046196  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  20046197 tgatataatt 20046206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 59 - 331
Target Start/End: Original strand, 18677767 - 18678039
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18677767 tccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttg 18677866  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18677867 gtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtata 18677966  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18677967 tgtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgt 18678039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 38549707 - 38549947
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38549707 tccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttg 38549806  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549807 gtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 38549906  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549907 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 38549947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24049070 - 24048841
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049070 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 24048971  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048970 gtttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 24048872  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24048871 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16198354 - 16198115
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16198354 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttg 16198255  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198254 gtttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 16198155  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198154 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 50 - 309
Target Start/End: Original strand, 1326625 - 1326884
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1326625 catctttgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttcta 1326724  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326725 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 1326824  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1326825 gtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 59 - 307
Target Start/End: Original strand, 16401627 - 16401875
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16401627 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttg 16401726  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401727 gtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 16401826  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatata 307  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16401827 tgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Original strand, 15202881 - 15203134
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15202881 tccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 15202980  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15202981 gtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaa 15203080  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| || || |||||||||||| |  |||||||||    
T  15203081 tgtatatgtttatgagtatgatgttatttatgattgatgaattagtatatgtat 15203134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20403739 - 20403486
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20403739 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttg 20403640  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403639 gtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaa 20403540  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20403539 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20403486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 97 - 298
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658094
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  197 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgat 25658092  T
Q  297 ga 298  Q
    ||    
T  25658093 ga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 19936610 - 19936850
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  19936610 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattg 19936709  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||             
T  19936710 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta--------- 19936800  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19936801 -gtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19896781 - 19896524
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||  | |||||    
T  19896781 tccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttg 19896682  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  19896681 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaa 19896582  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatat 316  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  19896581 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatatat 19896524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20403941 - 20403765
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20403941 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 20403842  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403841 atgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 27471917 - 27472093
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471917 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 27472016  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472017 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 14397443 - 14397609
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14397443 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttg 14397542  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397543 gtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 312
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290597
Alignment:
Q  100 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtca 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  200 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T
Q  300 gtgatatatgtat 312  Q
     |  |||||||||    
T  45290585 ttagtatatgtat 45290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19896974 - 19896807
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19896974 tccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 19896875  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19896874 gtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32122390 - 32122214
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122390 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 32122291  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122290 atgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 227
Target Start/End: Original strand, 15202688 - 15202856
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15202688 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattg 15202787  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 227  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202788 gtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 38549514 - 38549681
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  38549514 tccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttg 38549613  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549614 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 38549313 - 38549488
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38549313 catctctcccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttcta 38549412  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38549413 atgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 45290252 - 45290389
Alignment:
Q  61 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45290252 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 45290351  T
Q  161 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtc 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45290352 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15071222 - 15071046
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071222 catctctgccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 15071123  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15071122 atgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 15202486 - 15202662
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202486 catctctaccccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 15202585  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15202586 ataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 16401437 - 16401601
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16401437 gaatttgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtt 16401536  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  16401537 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 16401242 - 16401408
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16401242 tccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 16401340  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16401341 gtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 16412816 - 16412992
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412816 catctctgccgcgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 16412915  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412916 attccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19897176 - 19897000
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19897176 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttcta 19897077  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19897076 atgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24049272 - 24049104
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24049272 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttcta 24049173  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 218  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049172 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403378
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 20403413  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403412 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 20403378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810082
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttg 32810117  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810116 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 32810082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203242
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15203207  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203208 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 15203242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290705
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 45290670  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45290671 attattatttgacgttgttatactgtgatataatt 45290705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Original strand, 19936411 - 19936584
Alignment:
Q  53 ctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  19936411 ctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaatt 19936510  T
Q  153 tcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
     ||||||| || | | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19936511 ccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896419
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgat-gttttaagatgtc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgtt 19896455  T
Q  333 gattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896454 gattattatttgatgttgttatattgtgatataatt 19896419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11361178 - 11361024
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11361178 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttcta 11361079  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    ||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  11361078 atactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 366
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19937014
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgtc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||     
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 19936980  T
Q  333 gattaccatttgatgttgttatattgtgatataa 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936981 gattatcatttgatgttgttatattgtgatataa 19937014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 336
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550090
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38550087  T
Q  334 att 336  Q
    |||    
T  38550088 att 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 336
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982710
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtg----atatatgtatatatgatgttttaagat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagat 20982703  T
Q  330 gtcgatt 336  Q
    || ||||    
T  20982704 gttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 309
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425411
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 309
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1327042
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtg------atatatgtatatatgatgttttaag 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||| ||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgag 1327013  T
Q  328 atgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  1327014 atgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 32810365 - 32810263
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32810365 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctaatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgta 32810266  T
Q  150 atg 152  Q
    |||    
T  32810265 atg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401996
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttt 16401996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 309
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  245 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 15319989 - 15320098
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  15319989 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15320088  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  15320089 tcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 15500358 - 15500467
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  15500358 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15500457  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  15500458 tcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045872
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513644
Alignment:
Q  238 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 21513644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 5852851 - 5852969
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  5852851 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 5852950  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5852951 cacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 14409003 - 14409121
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  14409003 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 14409102  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14409103 cacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 17150655 - 17150725
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  17150655 atgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 301
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815675
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 18815675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988740
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 38988740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019837
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 39019837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 22089412 - 22089482
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22089412 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatgatcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 301
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733368
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagt 36733368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 223305 - 223414
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  223305 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 223404  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  223405 ttaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 272204 - 272273
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  272204 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 643645 - 643576
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  643645 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 688076 - 688185
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  688076 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 688175  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  688176 ttaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 736928 - 737037
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  736928 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 737027  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  737028 ttaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 829451 - 829382
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  829451 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 860823 - 860932
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  860823 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 860922  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  860923 ttaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 299
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083058
Alignment:
Q  242 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 5083058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 19936829 - 19936906
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  19936829 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaattagtatatgtat 19936906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 38549936 - 38550000
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  38549936 atgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4483800 - 4483765
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4483800 ttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 4483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14824295 - 14824260
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14824295 ttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 312
Target Start/End: Original strand, 1326862 - 1326940
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || | | ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  1326862 tatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgcttttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 1326940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 226
Target Start/End: Original strand, 16401186 - 16401216
Alignment:
Q  196 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401186 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026895
Alignment:
Q  310 tatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39364188 - 39364118
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39364188 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 39364118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Original strand, 44522814 - 44522884
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44522814 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 44522884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 13425284 - 13425361
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  13425284 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 13425361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18618899 - 18618830
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  18618899 tgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 20982552 - 20982629
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20982552 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20982629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22147046 - 22146977
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22147046 tgttagctttcttttggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22146977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32810255 - 32810190
Alignment:
Q  247 ttagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  32810255 ttagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 32810190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44477099 - 44477018
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  44477099 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44477018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44480361 - 44480280
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  44480361 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44480280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 13425390 - 13425454
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  13425390 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13425454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26224070
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataatt 26224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598339
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataatt 41598339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 97)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3515467 - 3515154
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3515467 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 3515368  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3515367 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgta 3515268  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3515267 tgtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 3515168  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  3515167 tgatataattatat 3515154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Original strand, 14970409 - 14970722
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14970409 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 14970508  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970509 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgta 14970608  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14970609 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 14970708  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  14970709 tgatataattatat 14970722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 15118055 - 15118363
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  15118055 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 15118154  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118155 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 15118254  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  15118255 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 15118353  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  15118354 tgatataatt 15118363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 62 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15534638 - 15534343
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15534638 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 15534539  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15534538 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 15534439  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatatt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15534438 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44615748 - 44615439
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  44615748 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 44615649  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44615648 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 44615549  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  44615548 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 44615449  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  44615448 tgatataatt 44615439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 50222042 - 50222350
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50222042 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 50222141  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222142 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 50222241  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||    
T  50222242 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactg 50222340  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  50222341 tgatataatt 50222350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19243160 - 19242846
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19243160 tccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttg 19243061  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19243060 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 19242961  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatatt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  19242960 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatatt 19242861  T
Q  358 gtgatataattatat 372  Q
    |||||||||||||||    
T  19242860 gtgatataattatat 19242846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36038327 - 36038033
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36038327 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtt 36038228  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36038227 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgt 36038128  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36038127 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 52872775 - 52873025
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52872775 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttg 52872874  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872875 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 52872974  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  52872975 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 49547479 - 49547773
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49547479 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 49547578  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49547579 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgt 49547678  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49547679 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 44772786 - 44773098
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44772786 tccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttg 44772885  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  44772886 gtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaa 44772985  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg----tatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttat 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  44772986 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttat 44773084  T
Q  355 attgtgatataatt 368  Q
    ||||||||||||||    
T  44773085 attgtgatataatt 44773098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 62 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 362637 - 362390
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  362637 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtt 362538  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362537 tgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 362438  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  362437 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14049034 - 14048740
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14049034 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtt 14048935  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14048934 tgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgt 14048835  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14048834 atatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 7640889 - 7641203
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||    
T  7640889 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattg 7640988  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7640989 gtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaa 7641088  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtg------atatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgtt 352  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  7641089 tgtatatg-ttgtgaatacgatatttttcatgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgtt 7641187  T
Q  353 atattgtgatataatt 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  7641188 atattgtgatataatt 7641203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 62 - 309
Target Start/End: Original strand, 19617772 - 19618019
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  19617772 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtg 19617871  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617872 tgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 19617971  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19617972 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 59 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29267813 - 29267569
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  29267813 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttg 29267714  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267713 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 29267614  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtga 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29267613 tgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtga 29267569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 63 - 309
Target Start/End: Original strand, 15495880 - 15496126
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15495880 aatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 15495979  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 262  Q
     | ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15495980 aaattcgaaaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 15496079  T
Q  263 tatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15496080 tatgtttctgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 59 - 367
Target Start/End: Original strand, 1837222 - 1837519
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1837222 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 1837321  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1837322 gtttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-- 1837419  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
             ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  1837420 ---------ttgtgaaaacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatg 1837510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 14746214 - 14746464
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  14746214 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttg 14746313  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14746314 gtttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatata 14746413  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14746414 tgtatatgtttgtgaatactattatgttcatgattgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19858038 - 19857798
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19858038 tccgaatgagaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttg 19857939  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19857938 gtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----- 19857844  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19857843 -----atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 51 - 312
Target Start/End: Original strand, 11949 - 12210
Alignment:
Q  51 atctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11949 atctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaa 12048  T
Q  151 tgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12049 tgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 12148  T
Q  251 tatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||  || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  12149 tatatgaatgtatatgtttatgtgtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 12210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 52313021 - 52312769
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  52313021 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 52312922  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312921 gttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 52312823  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  52312822 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 52312769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 14970207 - 14970383
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970207 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 14970306  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970307 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19858240 - 19858064
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858240 catctctaccccgaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 19858141  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858140 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 52872573 - 52872749
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872573 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 52872672  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872673 attctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 362833 - 362668
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362833 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 362734  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 224  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362733 gtctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 19617567 - 19617743
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617567 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 19617666  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617667 atgccgttggtctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 14746021 - 14746188
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14746021 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttg 14746120  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14746121 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 363035 - 362859
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  363035 catctctgccccgaatttgaaatgaaatgtggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 362936  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362935 atgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 18214704 - 18214880
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214704 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 18214803  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18214804 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52313416 - 52313240
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52313416 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttcta 52313317  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313316 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52313214 - 52313047
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  52313214 tccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttg 52313115  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313114 gtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 368
Target Start/End: Original strand, 18239254 - 18239430
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18239254 ttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatg 18239352  T
Q  291 attgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18239353 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaatt 18239430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3515657 - 3515493
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3515657 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 3515558  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    | || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515557 tcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  180 tagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  280 tattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 226
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  92 tacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaat 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  192 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 372
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618187
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 19618148  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618149 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 19618187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215285
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 18215250  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215251 attatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 18215285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30147375 - 30147189
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||   |||| | |||    
T  30147375 tccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattg 30147276  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 245  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147275 gtatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12318
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 12283  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12284 attattattggatgttgttatattgtgatataatt 12318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355335
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15355300  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355301 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 15355335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312661
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 52312696  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312695 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 52312661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 206 - 309
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355171
Alignment:
Q  206 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgata 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 15355167  T
Q  306 tatg 309  Q
    ||||    
T  15355168 tatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497070
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15497047  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatat 356  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  15497048 attattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 355
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873176
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 52873154  T
Q  334 attaccatttgatgttgttata 355  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  52873155 attattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14185727 - 14185621
Alignment:
Q  120 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  14185727 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtaggtcac 14185628  T
Q  220 agtgaat 226  Q
    |||||||    
T  14185627 agtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746618
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 14746593  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  14746594 tgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Original strand, 12778376 - 12778460
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12778376 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857700
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19857700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaatc-cgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14185594 - 14185477
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| || |  ||||||||||| | || | ||||    
T  14185594 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttgg 14185495  T
Q  160 tttgacttcaaaatgatt 177  Q
    | |||||| |||||||||    
T  14185494 tgtgacttgaaaatgatt 14185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 119
Target Start/End: Original strand, 18214906 - 18214966
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacaca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18214906 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaca 18214966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362268
Alignment:
Q  268 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgatt 336  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14951367 - 14951270
Alignment:
Q  109 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14951367 gtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Original strand, 15489649 - 15489717
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15489649 catctctgccccgaatttgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  156 ttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 222  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14995713 - 14995644
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14995713 tgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 204
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  105 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  205 ct 206  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 15355018 - 15355069
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattg 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15355018 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtatcgattgctacataattg 15355069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Original strand, 22725431 - 22725494
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22725431 aatttgaaatgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198544
Alignment:
Q  104 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatt 203  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T
Q  204 actgcacgtaggtca 218  Q
    | | |||||| ||||    
T  9198558 aatacacgtatgtca 9198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18247848 - 18247739
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  18247848 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 18247749  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  18247748 ttaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19857660 - 19857607
Alignment:
Q  303 atatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  19857660 atatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47357292 - 47357183
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  47357292 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatga 47357193  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  47357192 ttaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Original strand, 15287859 - 15287966
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  15287859 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15287958  T
Q  197 tcaaatta 204  Q
    ||||||||    
T  15287959 tcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Original strand, 15294969 - 15295076
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  15294969 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15295068  T
Q  197 tcaaatta 204  Q
    ||||||||    
T  15295069 tcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Original strand, 44772725 - 44772760
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772725 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683465
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 7640745 - 7640863
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||   |    ||| ||||||| |||||||||    
T  7640745 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggttaaattactg 7640844  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7640845 cacgtaggtcacagtgaat 7640863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355169
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10643855 - 10643746
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  10643855 aattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatga 10643756  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  10643755 ttaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12611090
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatat 12611090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16731785 - 16731688
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattat 194  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  16731785 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 17146320 - 17146389
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  17146320 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168293
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 19617998 - 19618075
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  19617998 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 19618075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51463883
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatat 51463883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 105
Target Start/End: Original strand, 14745876 - 14745931
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtct 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||    
T  14745876 catctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtct 14745931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11940106 - 11940064
Alignment:
Q  110 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11940106 tgtaaacataaaagttgtaggtatggatgtaagctttccaatg 11940064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Original strand, 630280 - 630361
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  630280 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattt 630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9221320 - 9221267
Alignment:
Q  165 cttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 218  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9221320 cttcaaaatgttttctagaatttgatttatggtcaaattactacacataggtca 9221267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14629493 - 14629428
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  14629493 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 14629428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 14746443 - 14746520
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  14746443 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 14746520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 15355150 - 15355227
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  15355150 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 15355227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19020078 - 19020009
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  19020078 tgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19857819 - 19857742
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  19857819 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 19857742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803280
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatat 23803280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 362411 - 362347
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  362411 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 362347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11557936 - 11557892
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 152  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11557936 ggtgtaaacattcaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 11557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367845
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataatt 15367845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370172
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataatt 15370172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371357
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataatt 15371357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373638
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataatt 15373638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402858
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataatt 15402858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 105)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16214144 - 16213831
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16214144 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 16214045  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16214044 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgta 16213945  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16213944 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttg 16213845  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  16213844 tgatataattatat 16213831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27217320 - 27217011
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  27217320 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 27217221  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27217220 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 27217121  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  27217120 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 27217021  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  27217020 tgatataatt 27217011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41523377 - 41523068
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41523377 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 41523278  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41523277 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 41523178  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  41523177 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 41523078  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  41523077 tgatataatt 41523068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41525839 - 41525530
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41525839 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 41525740  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41525739 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 41525640  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  41525639 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 41525540  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  41525539 tgatataatt 41525530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 456781 - 456472
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  456781 tccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 456682  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  456681 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 456582  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  456581 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 456482  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  456481 tgatataatt 456472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 15376416 - 15376724
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  15376416 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 15376515  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376516 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 15376615  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  15376616 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 15376714  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  15376715 tgatataatt 15376724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 20384826 - 20385134
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20384826 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 20384925  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20384926 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 20385025  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  20385026 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 20385124  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  20385125 tgatataatt 20385134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16232980 - 16232671
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  16232980 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 16232881  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16232880 gtttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 16232781  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  16232780 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 16232681  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  16232680 tgatataatt 16232671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 14948825 - 14949133
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14948825 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 14948924  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14948925 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 14949024  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  14949025 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 14949123  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  14949124 tgatataatt 14949133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32125950 - 32125642
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  32125950 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttg 32125851  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125850 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 32125751  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  32125750 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 32125652  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  32125651 tgatataatt 32125642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 62 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11303704 - 11303409
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11303704 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 11303605  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11303604 tgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 11303505  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatatt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11303504 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13869801 - 13869498
Alignment:
Q  66 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13869801 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 13869702  T
Q  166 ttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869701 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 13869602  T
Q  266 gtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatat 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  13869601 gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatat 13869502  T
Q  365 aatt 368  Q
    ||||    
T  13869501 aatt 13869498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16410518 - 16410210
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  16410518 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 16410419  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16410418 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaa 16410319  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |     
T  16410318 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacta 16410220  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  16410219 tgatataatt 16410210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 63 - 368
Target Start/End: Original strand, 21189302 - 21189606
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21189302 aatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggttt 21189401  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21189402 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 21189501  T
Q  263 tatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgat 362  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21189502 ta-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgat 21189600  T
Q  363 ataatt 368  Q
    ||||||    
T  21189601 ataatt 21189606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 16108394 - 16108688
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  16108394 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtt 16108493  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16108494 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 16108593  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16108594 atatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18640731 - 18640423
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  18640731 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttg 18640632  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18640631 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaa 18640532  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  18640531 tgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattg 18640433  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  18640432 tgatataatt 18640423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24702688 - 24702389
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24702688 tccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 24702589  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         
T  24702588 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtat----- 24702494  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24702493 -----atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 24702399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24705135 - 24704836
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24705135 tccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 24705036  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         
T  24705035 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtat----- 24704941  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24704940 -----atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 24704846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18628025 - 18627717
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18628025 tccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 18627926  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18627925 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaa 18627826  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  18627825 tgtatatg-ttgtgaatacgatattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattg 18627727  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  18627726 tgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18431171 - 18430863
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  18431171 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttg 18431072  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18431071 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaa 18430972  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  18430971 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 18430873  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  18430872 tgatataatt 18430863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 23664658 - 23664952
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23664658 gaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 23664757  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23664758 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgt 23664857  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23664858 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 14269659 - 14269909
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14269659 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttg 14269758  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269759 gttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 14269858  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14269859 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 15081544 - 15081794
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15081544 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 15081643  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081644 gtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 15081743  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15081744 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8940743 - 8940489
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacaca----aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtc 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8940743 tccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcc 8940644  T
Q  155 gttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940643 gttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 8940544  T
Q  255 tgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8940543 tgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 26355684 - 26355994
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26355684 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttg 26355783  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26355784 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaa 26355883  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg--tatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  26355884 tgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatat 26355982  T
Q  357 tgtgatataatt 368  Q
    ||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataatt 26355994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 26358136 - 26358446
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26358136 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttg 26358235  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26358236 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaa 26358335  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg--tatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  26358336 tgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatat 26358434  T
Q  357 tgtgatataatt 368  Q
    ||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataatt 26358446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 11393002 - 11393298
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11393002 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaga-------------gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 11393088  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11393089 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 11393188  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  11393189 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 11393288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29797067 - 29796771
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29797067 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29796968  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29796967 tgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 29796868  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat--atatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29796867 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29800886 - 29800590
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29800886 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29800787  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29800786 tgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 29800687  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat--atatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29800686 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 59 - 307
Target Start/End: Original strand, 45847357 - 45847605
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||     
T  45847357 tccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgtta 45847456  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45847457 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgta 45847556  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatata 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45847557 tgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 50 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8469204 - 8468945
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8469204 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttcta 8469105  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469104 atgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaatta 8469005  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8469004 gtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgatgaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11973017 - 11972755
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11973017 catctctgccccgaacttaaaatgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcta 11972918  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972917 atgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 11972818  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  11972817 gtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 11972755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8940935 - 8940769
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8940935 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaaca-aaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 8940837  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940836 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 14269264 - 14269440
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269264 catctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 14269363  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269364 attccgttggtttgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 10501096 - 10501263
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10501096 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttg 10501195  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10501196 gtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 38897728 - 38897904
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897728 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 38897827  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897828 atgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 25926832 - 25926998
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  25926832 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattg 25926931  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926932 gtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  127 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  227 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16214346 - 16214170
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16214346 catctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttcta 16214247  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16214246 atgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 14156781 - 14156944
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14156781 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttg 14156876  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156877 gtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8941138 - 8940962
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8941138 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 8941039  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8941038 atgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 1856932 - 1857097
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1856932 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattg 1857030  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857031 gtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 21189096 - 21189272
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21189096 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagcttttta 21189195  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189196 atgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 14156592 - 14156755
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14156592 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 14156691  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14156692 gacttcaaaaggatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 14269466 - 14269633
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14269466 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttg 14269565  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14269566 gtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Original strand, 15081342 - 15081512
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081342 catctatgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 15081441  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 220  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15081442 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 13918105 - 13918272
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctt-aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgtt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||  | ||    
T  13918105 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccatt 13918204  T
Q  158 ggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13918205 ggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972647
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattg 11972682  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972681 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 11972647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270061
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 14270038  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatat 356  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  14270039 attattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Original strand, 10500934 - 10501060
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10500934 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 10501033  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttga 189  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10501034 gacttcaaaaggatttatagaacttga 10501060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 17985092 - 17985254
Alignment:
Q  64 atttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttg 163  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  17985092 atttcaaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttg 17985191  T
Q  164 acttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    | | ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17985192 attccaaaatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081960
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 15081923  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081924 tgattatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 15081960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 260 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841163
Alignment:
Q  260 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgt 13841172  T
Q  360 gatataatt 368  Q
    |||||||||    
T  13841171 gatataatt 13841163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 336
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847739
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttg 45847736  T
Q  334 att 336  Q
    |||    
T  45847737 att 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898229
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 38898204  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  38898205 tgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940335
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 8940360  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  8940359 tgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 229 - 309
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  229 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468803
Alignment:
Q  268 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  139 ttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11310213 - 11310133
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 141  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  11310213 ccgaatttgaaatgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Original strand, 23461795 - 23461864
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 129  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23461795 ccgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11287046 - 11286976
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11287046 atgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202852
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattat 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||| ||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16410662 - 16410544
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| || ||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  16410662 ggtgtaaacataaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggcttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 16410563  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16410562 cacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119983
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 15119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745633
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaa 13745633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18628086 - 18628051
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628086 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18640792 - 18640757
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640792 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Original strand, 26355623 - 26355658
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355623 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Original strand, 26358075 - 26358110
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358075 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 206
Target Start/End: Original strand, 15951637 - 15951703
Alignment:
Q  140 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  15951637 tagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27217464 - 27217346
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| ||||||||||||||||     
T  27217464 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattacta 27217365  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27217364 cacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7822082 - 7822013
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  7822082 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7829393 - 7829324
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  7829393 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 14269888 - 14269965
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  14269888 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatatgtat 14269965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760848
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 27102552 - 27102621
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27102552 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 27109900 - 27109969
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27109900 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27175774 - 27175705
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27175774 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 38784644 - 38784713
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  38784644 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001076
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 152
Target Start/End: Original strand, 13475728 - 13475772
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 152  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13475728 ggtgtaaacacaaaggttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 13475772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13869868 - 13869833
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869868 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 13869833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 89
Target Start/End: Original strand, 45846945 - 45846984
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgatt 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45846945 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgatt 45846984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 9743795 - 9743845
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 285  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  9743795 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgt 9743845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Original strand, 10896371 - 10896452
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  10896371 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 10896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647480
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 13647480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 15081773 - 15081850
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  15081773 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 15081850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Original strand, 23664500 - 23664581
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||    
T  23664500 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgactcgaaaatgattt 23664581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29004457 - 29004416
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29004457 tgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 29004416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 38898054 - 38898131
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  38898054 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 38898131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 45847586 - 45847663
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  45847586 atgattgatgaagtgttatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatatgtat 45847663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8468966 - 8468902
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  8468966 atgattgatgaaatgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8940510 - 8940446
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  8940510 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8940446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756682
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataatt 12756682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17061926
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataatt 17061926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25941571 - 25941523
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  25941571 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 25941523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43747736 - 43747672
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  43747736 atgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 43747672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116660
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataatt 44116660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 60 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5153 - 4841
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  5153 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatgg 5054  T
Q  160 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5053 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 4954  T
Q  260 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4953 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgt 4854  T
Q  360 gatataattatat 372  Q
    |||||||||||||    
T  4853 gatataattatat 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 5180
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5356 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttctt 5257  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5256 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 6)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14407 - 14098
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14407 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 14308  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14307 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 14208  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  14207 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 14108  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  14107 tgatataatt 14098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 63 - 310
Target Start/End: Original strand, 23237 - 23484
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23237 aatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggttt 23336  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23337 gacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 23436  T
Q  263 tatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23437 tatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 22871 - 23047
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22871 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttcta 22970  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22971 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  140 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Original strand, 20704 - 20764
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggt 110  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20704 catctctgccccgaattggaaatgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Original strand, 23073 - 23118
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23073 tccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 23118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 111)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39682773 - 39682464
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  39682773 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 39682674  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682673 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 39682574  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  39682573 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 39682474  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  39682473 tgatataatt 39682464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Original strand, 32214633 - 32214936
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32214633 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattg 32214732  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  32214733 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta--------- 32214823  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32214824 -gtatatgtttgtgtatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 32214922  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  32214923 tgatataattatat 32214936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 571857 - 571548
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  571857 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttg 571758  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  571757 gtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 571658  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  571657 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 571558  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  571557 tgatataatt 571548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18809402 - 18809094
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18809402 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 18809303  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18809302 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 18809203  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  18809202 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 18809104  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  18809103 tgatataatt 18809094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 23711716 - 23712024
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  23711716 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 23711815  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23711816 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 23711915  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23711916 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 23712014  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  23712015 tgatataatt 23712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28577558 - 28577250
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28577558 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 28577459  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28577458 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 28577359  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  28577358 tgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 28577260  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  28577259 tgatataatt 28577250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 62 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20261676 - 20261381
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20261676 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 20261577  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20261576 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 20261477  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatatt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20261476 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23131315 - 23131013
Alignment:
Q  66 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23131315 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 23131216  T
Q  166 ttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23131215 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 23131116  T
Q  266 gtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatata 365  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  23131115 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatata 23131016  T
Q  366 att 368  Q
    |||    
T  23131015 att 23131013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23133782 - 23133480
Alignment:
Q  66 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23133782 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 23133683  T
Q  166 ttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23133682 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 23133583  T
Q  266 gtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatata 365  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  23133582 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatata 23133483  T
Q  366 att 368  Q
    |||    
T  23133482 att 23133480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Original strand, 34402231 - 34402533
Alignment:
Q  66 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34402231 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 34402330  T
Q  166 ttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34402331 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 34402430  T
Q  266 gtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatata 365  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  34402431 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatata 34402530  T
Q  366 att 368  Q
    |||    
T  34402531 att 34402533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 23709235 - 23709543
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  23709235 tccgaatttgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttg 23709334  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709335 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 23709434  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23709435 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 23709533  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  23709534 tgatataatt 23709543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 24897898 - 24898206
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  24897898 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgtta 24897997  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24897998 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaa 24898097  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  24898098 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 24898196  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  24898197 tgatataatt 24898206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 24905335 - 24905643
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  24905335 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgtta 24905434  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24905435 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaa 24905534  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  24905535 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 24905633  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  24905634 tgatataatt 24905643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 24900381 - 24900689
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  24900381 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgtta 24900480  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24900481 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaa 24900580  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  24900581 tttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 24900679  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  24900680 tgatataatt 24900689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 24902858 - 24903166
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  24902858 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgtta 24902957  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24902958 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaa 24903057  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  24903058 tttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 24903156  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  24903157 tgatataatt 24903166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 24907810 - 24908118
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  24907810 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgtta 24907909  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24907910 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaa 24908009  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  24908010 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 24908108  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  24908109 tgatataatt 24908118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26505838 - 26505530
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26505838 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 26505739  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26505738 gtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 26505639  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  26505638 tgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 26505540  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  26505539 tgatataatt 26505530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26508316 - 26508008
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||     
T  26508316 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgtta 26508217  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26508216 gtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 26508117  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  26508116 tgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 26508018  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  26508017 tgatataatt 26508008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 23706919 - 23707169
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23706919 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttg 23707018  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707019 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 23707118  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23707119 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 24642451 - 24642701
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642451 tccgaatttgaaaagaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 24642550  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642551 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 24642650  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24642651 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 32039201 - 32039509
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||    
T  32039201 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttg 32039300  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32039301 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 32039400  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  32039401 tgtatatg-ttgtgaatctgatattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattg 32039499  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  32039500 tgatataatt 32039509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Original strand, 10684468 - 10684764
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10684468 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 10684567  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10684568 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 10684667  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg--tatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10684668 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23136039 - 23135741
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  23136039 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttg 23135940  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23135939 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-- 23135842  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23135841 ---------ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactg 23135751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24671485 - 24671235
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24671485 tccgaatttgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttg 24671386  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671385 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 24671286  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24671285 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24918600 - 24918350
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24918600 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttg 24918501  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918500 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 24918401  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24918400 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 62 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24681901 - 24681654
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681901 gaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 24681802  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
     | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681801 gggcttccaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 24681702  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24681701 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 63 - 320
Target Start/End: Original strand, 24529253 - 24529510
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24529253 aatttaaaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggttt 24529352  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 262  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529353 gacttcaaaaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 24529452  T
Q  263 tatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24529453 tatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg 24529510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22105925 - 22105672
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105925 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 22105826  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105825 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 22105726  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22105725 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 22105672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 61 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38967937 - 38967689
Alignment:
Q  61 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38967937 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggt 38967838  T
Q  161 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatg 260  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967837 ttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatg 38967738  T
Q  261 tatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38967737 tatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Original strand, 45027607 - 45027840
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  45027607 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattg 45027706  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45027707 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 45027806  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45027807 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24368286 - 24368033
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24368286 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 24368187  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24368186 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 24368087  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  24368086 tgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24368033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6726507 - 6726254
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6726507 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttg 6726408  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6726407 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaa 6726308  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  6726307 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 6726254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Original strand, 21154710 - 21154963
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21154710 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 21154809  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21154810 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 21154909  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| || ||||||||| |  |||||||||    
T  21154910 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttataattgatgaattagtatatgtat 21154963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Original strand, 41523775 - 41524028
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41523775 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttg 41523874  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41523875 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaa 41523974  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  41523975 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 41524028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 120 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25616580 - 25616369
Alignment:
Q  120 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25616580 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtcac 25616481  T
Q  220 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgat 319  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25616480 aatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgat 25616381  T
Q  320 gttttaagatgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  25616380 gttttaagatgt 25616369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22106127 - 22105951
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22106127 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 22106028  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22106027 atgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Original strand, 41523380 - 41523552
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523380 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 41523479  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523480 atgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Original strand, 41523584 - 41523749
Alignment:
Q  61 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggt 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||    
T  41523584 cgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggt 41523683  T
Q  161 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523684 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 24529047 - 24529223
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529047 catctttgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 24529146  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529147 atgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23931920 - 23931775
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23931920 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttg 23931821  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23931820 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24368488 - 24368312
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368488 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 24368389  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368388 atgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24918802 - 24918626
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24918802 catctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttcta 24918703  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918702 ataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6726709 - 6726533
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726709 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 6726610  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6726609 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24682106 - 24681930
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24682106 catctctcccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattcta 24682007  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||| || |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24682006 atgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 21154517 - 21154684
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21154517 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 21154616  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21154617 gtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 32214430 - 32214604
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214430 catctctgccccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 32214529  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 224  Q
    ||| ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32214530 atgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23932122 - 23931949
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932122 catctctgccctgaatttgaaatgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 23932023  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 223  Q
    || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  23932022 atttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 21154315 - 21154491
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154315 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 21154414  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21154415 atgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 45027405 - 45027579
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  45027405 catctctgccccaaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcga 45027504  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 224  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027505 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 23706526 - 23706702
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706526 catctctggcccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 23706625  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||  |||||||  |  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23706626 atggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24671687 - 24671511
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24671687 catctctgccccgaatttggaatgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttcta 24671588  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| | ||  |||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24671587 atgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 23709042 - 23709209
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23709042 tccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttg 23709141  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23709142 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726146
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 6726181  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726180 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 6726146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 238 - 368
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155071
Alignment:
Q  238 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgatta 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 21155040  T
Q  338 ccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155041 ttatttgatgttgttatattgtgatataatt 21155071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105564
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 22105599  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105598 attataatttgatgttgttatattgtgatataatt 22105564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 221
Target Start/End: Original strand, 23706727 - 23706889
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  23706727 tccgaatttgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtag 23706826  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacag 221  Q
    || |||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23706827 gtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367925
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttg 24367960  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367959 gttattatttgatgttgttatattgtgatataatt 24367925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967526
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttg 38967560  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38967559 attattatttgatgttg-tatattgtgatataatt 38967526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642867
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24642830  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642831 tgattatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 24642867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707323
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 23707298  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  23707299 tgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918196
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24918221  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  24918220 tgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671081
Alignment:
Q  237 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgtcga 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |   ||||| ||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttga 24671103  T
Q  335 ttaccatttgatgttgttatat 356  Q
    ||| |||||||| |||||||||    
T  24671102 ttatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681500
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |   |||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24681525  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||| | ||||||||||||||||||    
T  24681524 tgatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31345639 - 31345570
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31345639 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45029863
Alignment:
Q  287 catgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataa 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataa 45029863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  161 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 67410 - 67339
Alignment:
Q  135 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  67410 gatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 24686598 - 24686707
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||     
T  24686598 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatga 24686697  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  24686698 tcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368375
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 21368375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  174 gatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 23711572 - 23711690
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  23711572 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 23711671  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23711672 cacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26505982 - 26505864
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  26505982 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 26505883  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26505882 cacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26508460 - 26508342
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  26508460 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 26508361  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26508360 cacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27261402 - 27261332
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  27261402 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 27920323 - 27920441
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  27920323 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 27920422  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27920423 cacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28577702 - 28577584
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  28577702 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 28577603  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  28577602 cacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 32039057 - 32039175
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  32039057 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 32039156  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32039157 cacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6483194 - 6483113
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6483194 aattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12727780 - 12727711
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12727780 tgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 19887275 - 19887384
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  19887275 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 19887374  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  19887375 ttaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799467
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaa 23799467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 152
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23131382 - 23131347
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131382 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Original strand, 34402164 - 34402199
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402164 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 277
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 34135071 - 34135129
Alignment:
Q  120 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||||    
T  34135071 aaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttccatatgattt 34135129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 571972 - 571883
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||| || | |    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571972 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6486661 - 6486580
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  6486661 aattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 6486580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 11232253 - 11232322
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  11232253 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 22514100 - 22514169
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22514100 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 28776702 - 28776771
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28776702 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  138 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686145
Alignment:
Q  240 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatat 316  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatat 22686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601486
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatat 29601486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23133849 - 23133814
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133849 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 23133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Original strand, 23708981 - 23709016
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23708981 ttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39682830 - 39682799
Alignment:
Q  195 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682830 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Original strand, 21081348 - 21081429
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  21081348 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgattt 21081429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173840
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 22173840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 23707148 - 23707225
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  23707148 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 23707225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 24642680 - 24642757
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  24642680 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24642757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24918371 - 24918294
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  24918371 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24918294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22283323 - 22283255
Alignment:
Q  138 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  22283323 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattact 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22686110 - 22686062
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  22686110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22686062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23281331 - 23281235
Alignment:
Q  110 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || | ||||||| ||||||  || |||| || || |||| ||||||||||||||||    
T  23281331 tgtaaacataaaggttgcagatatggattttacctttctagtggctttggtttcacttcattattatttttaaaatttgatttatggtcaaattact 23281235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529539
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataatt 24529539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 152  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21841226 - 21840914
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21841226 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 21841127  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841126 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 21841027  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21841026 tgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 21840928  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  21840927 tgatataattatat 21840914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13989325 - 13989017
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  13989325 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 13989226  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13989225 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 13989126  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13989125 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 13989027  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  13989026 tgatataatt 13989017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 21922994 - 21923302
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21922994 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 21923093  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923094 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 21923193  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  21923194 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 21923292  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  21923293 tgatataatt 21923302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16362378 - 16362064
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  16362378 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttg 16362279  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16362278 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgta 16362179  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatatt 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16362178 tgtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatatt 16362079  T
Q  358 gtgatataattatat 372  Q
    |||||||||||||||    
T  16362078 gtgatataattatat 16362064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 21474789 - 21475098
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21474789 tccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 21474888  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21474889 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 21474988  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  21474989 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 21475088  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  21475089 tgatataatt 21475098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 373
Target Start/End: Original strand, 15859711 - 15860024
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15859711 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttg 15859810  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859811 gtttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 15859910  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15859911 tgtatat-cttgcgaatacgatattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattg 15860009  T
Q  359 tgatataattatatg 373  Q
    |||||||||| ||||    
T  15860010 tgatataattgtatg 15860024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Original strand, 23593436 - 23593750
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23593436 tccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttg 23593535  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23593536 gtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 23593635  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatatt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23593636 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatatt 23593735  T
Q  358 gtgatataattatat 372  Q
    |||||||||||||||    
T  23593736 gtgatataattatat 23593750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 16274958 - 16275209
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa-tgtcgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16274958 tccgaattggaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcatt 16275057  T
Q  158 ggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 257  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16275058 ggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgt 16275157  T
Q  258 atgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16275158 atgtatatgtttgtgaattcgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 62 - 299
Target Start/End: Original strand, 27161292 - 27161529
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161292 gaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 27161391  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161392 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 27161491  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  27161492 atatgtttatgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29777200 - 29776947
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777200 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 29777101  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29777100 ggttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 29777001  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  29777000 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 29776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31612825 - 31612572
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31612825 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttg 31612726  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31612725 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 31612626  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  31612625 tgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgatgaattagtatatgtat 31612572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 61 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29298699 - 29298461
Alignment:
Q  61 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  29298699 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggt 29298600  T
Q  161 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatg 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29298599 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatg 29298500  T
Q  261 tatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  29298499 tatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Original strand, 22122717 - 22122970
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22122717 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttg 22122816  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22122817 gtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 22122916  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  22122917 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 312
Target Start/End: Original strand, 22050530 - 22050792
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050530 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 22050629  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    |||||  |||| | |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050630 atgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 22050729  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22050730 gtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 22050792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 59 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29535511 - 29535317
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29535511 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttg 29535412  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 253  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535411 gtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13227323 - 13227129
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  13227323 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttg 13227224  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227223 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29298903 - 29298727
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298903 catctctgcaccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 29298804  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298803 atgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31613015 - 31612851
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  31613015 gaatttgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtt 31612916  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612915 tgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Original strand, 15859506 - 15859672
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15859506 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 15859605  T
Q  160 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859606 tctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 22122514 - 22122691
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac-aaaagttgtaggtatggatgttagctttct 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122514 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttct 22122613  T
Q  149 aatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22122614 aatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31613220 - 31613044
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31613220 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttcta 31613121  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31613120 ataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29777402 - 29777226
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29777402 catctctgccctgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttcta 29777303  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29777302 atgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 16274756 - 16274932
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274756 catctctgccccgaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 16274855  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || || ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16274856 atatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16401583 - 16401407
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401583 catctctgctccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 16401484  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
     |  | ||||| | || |  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401483 tttccattggtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Original strand, 9044698 - 9044867
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9044698 catctctgccccaaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttcta 9044797  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcac 219  Q
    ||| ||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9044798 atgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776839
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 29776874  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776873 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 29776839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40129553 - 40129387
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40129553 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttcta 40129454  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggt 216  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  40129453 atgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 234 - 367
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275373
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattg 16275339  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataat 367  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275340 attattatttgatgttgttatattgtgatataat 16275373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 27161099 - 27161263
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  27161099 gaatttgaaatggaatatagtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtc 27161198  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27161199 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298287
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 29298322  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29298321 attattatttgatgttattatattgtgatataatt 29298287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123078
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattg 22123043  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123044 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 22123078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612464
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattg 31612499  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612498 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 31612464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43543370 - 43543269
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543370 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 43543271  T
Q  150 at 151  Q
    ||    
T  43543270 at 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 234 - 331
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050863
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgt 22050863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 323
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161605
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttt 323  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  156 ttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 178
Target Start/End: Original strand, 10812707 - 10812827
Alignment:
Q  58 ctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||    ||||||||||| | || | ||    
T  10812707 ctccgaatttgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgccttt 10812806  T
Q  158 ggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  10812807 ggtttgacttagaaatgattt 10812827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 112
Target Start/End: Original strand, 43630282 - 43630344
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgt 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43630282 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298408
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43543266 - 43543214
Alignment:
Q  304 tatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  43543266 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21858662 - 21858592
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21858662 atgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035928
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16401380 - 16401265
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||  |||||||||  |||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | ||||    
T  16401380 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggtcggtacaaaattggcatttagtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttgg 16401281  T
Q  160 tttgacttcaaaatga 175  Q
    |||||||  |||||||    
T  16401280 tttgactcaaaaatga 16401265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17003978 - 17003909
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  17003978 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 21650910 - 21650979
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
T  21650910 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366527
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12710211 - 12710152
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 294  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||    
T  12710211 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcacgattg 12710152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 178
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060656
Alignment:
Q  99 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattt 18060656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Original strand, 21474732 - 21474763
Alignment:
Q  195 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474732 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21474763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655956
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttataga 183  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttataga 16655956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 16275188 - 16275265
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  16275188 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 16275265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 24815269 - 24815310
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24815269 tgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgattt 24815310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13212872
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataatt 13212872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21347113
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataatt 21347113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 283
Target Start/End: Original strand, 22824136 - 22824184
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  22824136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22824184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 62 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11746 - 11435
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  11746 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggt 11647  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11646 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 11547  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatata-tgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11546 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtg 11447  T
Q  361 atataattatat 372  Q
    ||||||||||||    
T  11446 atataattatat 11435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9701 - 9389
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  9701 tccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttg 9602  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9601 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 9502  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9501 tgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 9403  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  9402 tgatataattatat 9389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38281 - 37972
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  38281 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 38182  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38181 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 38082  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  38081 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 37982  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  37981 tgatataatt 37972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Original strand, 17142 - 17455
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  17142 tccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttg 17241  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17242 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgta 17341  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17342 tgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactg 17441  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  17442 tgatataattatat 17455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 94870 - 94562
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  94870 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 94771  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94770 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 94671  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  94670 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 94572  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  94571 tgatataatt 94562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 16940 - 17116
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940 catctctgccccaaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 17039  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17040 atgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  || |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 110)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12568019 - 12567707
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12568019 tccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 12567920  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567919 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 12567820  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12567819 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattg 12567721  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  12567720 tgatataattatat 12567707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 7781049 - 7781358
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  7781049 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttg 7781148  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7781149 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgta 7781248  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  7781249 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 7781348  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  7781349 tgatataatt 7781358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13544483 - 13544172
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13544483 tccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 13544384  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544383 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 13544285  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13544284 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattg 13544186  T
Q  359 tgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||    
T  13544185 tgatataattatat 13544172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17463637 - 17463329
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  17463637 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 17463538  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463537 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 17463438  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  17463437 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 17463339  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  17463338 tgatataatt 17463329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 45606609 - 45606918
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  45606609 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 45606708  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45606709 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 45606808  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  45606809 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 45606908  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  45606909 tgatataatt 45606918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 60 - 368
Target Start/End: Original strand, 53301207 - 53301516
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53301207 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttgg 53301306  T
Q  160 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53301307 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 53301406  T
Q  260 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatattg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  53301407 gtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattg 53301506  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  53301507 tgatataatt 53301516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27165712 - 27165402
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  27165712 tccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgtta 27165613  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27165612 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 27165513  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatatt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27165512 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatatt 27165413  T
Q  358 gtgatataatt 368  Q
    |||||||||||    
T  27165412 gtgatataatt 27165402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34159785 - 34159477
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  34159785 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 34159686  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159685 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 34159586  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  34159585 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 34159487  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  34159486 tgatataatt 34159477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8499980 - 8499670
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8499980 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttg 8499881  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8499880 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 8499781  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatatt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  8499780 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatatt 8499681  T
Q  358 gtgatataatt 368  Q
    |||||||||||    
T  8499680 gtgatataatt 8499670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 54521279 - 54520985
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54521279 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 54521180  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  54521179 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 54521080  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54521079 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 6468837 - 6469145
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  6468837 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 6468936  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6468937 gtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 6469036  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  6469037 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 6469135  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  6469136 tgatataatt 6469145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 16453983 - 16454292
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  16453983 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 16454082  T
Q  159 gtttgacttcaaaat-gatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16454083 gtttgacttcaaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatga 16454182  T
Q  258 atgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatatt 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |    
T  16454183 atgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatact 16454281  T
Q  358 gtgatataatt 368  Q
    |||||||||||    
T  16454282 gtgatataatt 16454292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 10247426 - 10247734
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  10247426 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 10247525  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |    
T  10247526 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaa 10247625  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  10247626 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 10247724  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  10247725 tgatataatt 10247734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 55476950 - 55476642
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  55476950 tccgaatttgaaattaaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 55476851  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476850 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 55476751  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  55476750 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 55476652  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  55476651 tgatataatt 55476642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 59 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 46822721 - 46822449
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46822721 tccgattttgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 46822622  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822621 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 46822522  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46822521 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgt 46822449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15412884 - 15412581
Alignment:
Q  66 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15412884 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 15412785  T
Q  166 ttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15412784 ttcaaaaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatat 15412685  T
Q  266 gtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatat 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15412684 gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatat 15412585  T
Q  365 aatt 368  Q
    ||||    
T  15412584 aatt 15412581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 13153958 - 13154266
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  13153958 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgtta 13154057  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13154058 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaa 13154157  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  13154158 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 13154256  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  13154257 tgatataatt 13154266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 59 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15977992 - 15977696
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  15977992 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 15977893  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15977892 gtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 15977793  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  15977792 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10557368 - 10557091
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10557368 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtta 10557269  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10557268 gttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgta 10557169  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgatt 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10557168 tgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 50 - 301
Target Start/End: Original strand, 12119347 - 12119598
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119347 catctctgccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 12119446  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119447 gtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 12119546  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119547 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 12119598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 13151493 - 13151801
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  13151493 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgtta 13151592  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13151593 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaa 13151692  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  13151693 ggtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 13151791  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  13151792 tgatataatt 13151801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 62 - 354
Target Start/End: Original strand, 29544547 - 29544839
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29544547 gaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29544646  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29544647 tgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatct 29544746  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttat 354  Q
    |||| ||||| || | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29544747 atatatttgttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13436759 - 13436520
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13436759 tccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 13436660  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436659 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 13436560  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436559 tatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 28848324 - 28848622
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  28848324 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 28848423  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28848424 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-- 28848521  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
             |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  28848522 ---------ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 28848612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24514145 - 24513910
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514145 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 24514046  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514045 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 24513946  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24513945 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Original strand, 38961540 - 38961794
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtc-gtt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  38961540 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgtt 38961639  T
Q  158 ggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38961640 ggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatga 38961739  T
Q  258 atgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  38961740 atgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 38961794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Original strand, 17444466 - 17444719
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17444466 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttg 17444565  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17444566 gtttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 17444665  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  17444666 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 17444719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41124399 - 41124146
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41124399 tccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 41124300  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41124299 atttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaa 41124200  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  41124199 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 41124146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 20629894 - 20630138
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20629894 tccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 20629993  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgat----tgatgaattagtata 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |  |||     
T  20629994 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattgatgaagtgttatc 20630093  T
Q  255 tgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    || |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  20630094 tgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20630138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Original strand, 16282460 - 16282714
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||    
T  16282460 tccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattg 16282559  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16282560 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 16282659  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattg-ttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||| || |||||||||||| |  |||||||||    
T  16282660 tgtatatgtttatgagtatgatgttgttttatgattgatgaattagtatatgtat 16282714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25237303 - 25237063
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||      
T  25237303 tccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgt 25237204  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25237203 gtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 25237104  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  25237103 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 148 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305315
Alignment:
Q  148 taatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaat 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  248 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatg 347  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 12305317  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  12305316 tt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25229716 - 25229476
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||      
T  25229716 tccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgt 25229617  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25229616 gtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 25229517  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  25229516 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10379796 - 10379613
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379796 catctctgccccgaatatgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 10379697  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 233  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379696 atgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41124600 - 41124425
Alignment:
Q  51 atctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 150  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41124600 atctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaa 41124501  T
Q  151 tgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124500 tgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 55319010 - 55319173
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  55319010 aatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 55319109  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55319110 gacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10557570 - 10557394
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557570 catctctgccccgaatttgaaacgaaatatggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 10557471  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557470 atgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46822923 - 46822747
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822923 catctgtgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttcta 46822824  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46822823 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15465614 - 15465448
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  15465614 tccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattg 15465515  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465514 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 20629692 - 20629868
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20629692 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttcta 20629791  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629792 atgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27165914 - 27165738
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27165914 catctctgccccgaatttgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttcta 27165815  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165814 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 38961338 - 38961514
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961338 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 38961437  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961438 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 53301004 - 53301180
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53301004 catctttgccccgaatttgaaataaaaacaagtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttcta 53301103  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53301104 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 26054967 - 26055133
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26054967 tccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttg 26055066  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26055067 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5223843 - 5223677
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5223843 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattg 5223744  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5223743 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8500182 - 8500009
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8500182 catctcttccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttcta 8500083  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 223  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8500082 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 55318804 - 55318980
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55318804 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttcta 55318903  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55318904 atgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707618
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 9707583  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707584 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 9707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 13937485 - 13937649
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13937485 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtc 13937584  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13937585 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899245
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 8899280  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899279 attatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 8899245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282822
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 16282787  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282788 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 16282822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 17444264 - 17444440
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17444264 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttcta 17444363  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| | || ||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17444364 atgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124038
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 41124073  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124072 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 41124038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 16282258 - 16282434
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  16282258 catctctgccccgaatttaaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatcttttta 16282357  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282358 atgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961902
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38961867  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961868 gttattatttgatgttgttatattgtgatataatt 38961902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567561
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  197 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  105 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  205 ctgcacgtaggtcacagtgaata 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17393367 - 17393201
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 159  Q
    |||||||| |||||||  ||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  17393367 ccgaatttcaaatgaactcttctattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttgg 17393268  T
Q  160 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17393267 tttgactccaaaatgatttttagaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11914051
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 11914026  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  11914027 tgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Original strand, 3264324 - 3264431
Alignment:
Q  120 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3264324 aaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcac 3264423  T
Q  220 agtgaata 227  Q
    ||||||||    
T  3264424 agtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 226
Target Start/End: Original strand, 16358238 - 16358344
Alignment:
Q  120 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16358238 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcataggtcac 16358337  T
Q  220 agtgaat 226  Q
    | |||||    
T  16358338 attgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15007962 - 15007868
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaa---ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 150  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007962 tccgaatttgaaatgaaaagtactggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 147
Target Start/End: Original strand, 16358370 - 16358458
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttc 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358370 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 234 - 314
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444773
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36528421 - 36528340
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36528421 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 8899494 - 8899418
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8899494 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12305579 - 12305525
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaac 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12305579 gaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25058367 - 25058286
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  25058367 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  81 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 16934851 - 16934920
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16934851 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 368
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446666
Alignment:
Q  316 tgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataatt 17446666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 141
Target Start/End: Original strand, 3264459 - 3264538
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3264459 gaatttgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtatggatgtta 3264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17463781 - 17463663
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  17463781 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 17463682  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17463681 cacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 55477094 - 55476976
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||   |    ||| |||||||||||||||||    
T  55477094 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactg 55476995  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  55476994 cacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 14528625 - 14528734
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||     
T  14528625 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatga 14528724  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  14528725 ttaaattact 14528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 117
Target Start/End: Original strand, 14567588 - 14567645
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  14567588 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaaca 14567645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201333
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaa 25201333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  138 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14263738 - 14263640
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||   |   ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14263738 ggtgtaaacattaaatttgtatctatggatgttagctttctttggggtttggtttgactccattatgatttctagaacttgagttatggtcaaattact 14263640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 293  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21026182 - 21026092
Alignment:
Q  120 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||| |||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21026182 aaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcac 21026092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 1468654 - 1468723
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  1468654 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 8276474 - 8276583
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  8276474 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatga 8276573  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  8276574 ttaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956938
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242969
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatat 50242969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Original strand, 6468776 - 6468811
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6468776 ttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaat 6468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15412951 - 15412916
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15412951 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2281102 - 2281000
Alignment:
Q  104 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatt 203  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||| | | ||||||||||||||  || |||| || ||||||| ||||| | |||||    
T  2281102 cttagttgtaaacatgaaagttttaggtatgtatgttacctttgtaaaggctttggtttgacttcattattatttctataacttgagttatgattaaatt 2281003  T
Q  204 act 206  Q
    |||    
T  2281002 act 2281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 93
Target Start/End: Original strand, 13937675 - 13937709
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 93  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13937675 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 13937709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 8269363 - 8269472
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  8269363 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 8269462  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  8269463 ttaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 11913876 - 11913953
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  11913876 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 11913953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16979585 - 16979504
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  16979585 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 16979504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Original strand, 18700200 - 18700245
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgat 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18700200 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 18700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18890039 - 18889958
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  18890039 aattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattt 18889958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550489
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 43550489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 289
Target Start/End: Original strand, 50351664 - 50351717
Alignment:
Q  236 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 289  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  50351664 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcat 50351717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6159061 - 6158993
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgat 176  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  6159061 ggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgat 6158993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8023858 - 8023778
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggt 216  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||| | ||| |||| || ||||||    
T  8023858 atgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggt 8023778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 12119585 - 12119649
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  12119585 atgattgatgaagtattatatgaatgtatatatttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 12119649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119735
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataatt 12119735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16643639 - 16643595
Alignment:
Q  138 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatag 182  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16643639 gttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatag 16643595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248252
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataatt 17248252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672773
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatat 17672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21208 - 20898
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaat-gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgtt 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  21208 tccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgtt 21109  T
Q  158 ggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21108 ggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgt 21009  T
Q  258 atgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatatt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21008 atgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatt 20909  T
Q  358 gtgatataatt 368  Q
    |||||||||||    
T  20908 gtgatataatt 20898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6406 - 6098
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6406 tccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 6307  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6306 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 6207  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  6206 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 6108  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    |||| |||||    
T  6107 tgatttaatt 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 264471 - 264779
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  264471 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttg 264570  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  264571 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaa 264670  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  264671 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 264769  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  264770 tgatataatt 264779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20909471 - 20909163
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20909471 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 20909372  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909371 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 20909272  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  20909271 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 20909173  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  20909172 tgatataatt 20909163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39245595 - 39245287
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  39245595 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 39245496  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39245495 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 39245396  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  39245395 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 39245297  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    |||| |||||    
T  39245296 tgatgtaatt 39245287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39363837 - 39363535
Alignment:
Q  66 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  39363837 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgac 39363738  T
Q  166 ttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39363737 ttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 39363638  T
Q  266 gtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatata 365  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  39363637 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatata 39363538  T
Q  366 att 368  Q
    |||    
T  39363537 att 39363535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 62 - 331
Target Start/End: Original strand, 17516869 - 17517138
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17516869 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 17516968  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516969 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 17517068  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17517069 atatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgt 17517138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 10732643 - 10732951
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  10732643 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 10732742  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10732743 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 10732842  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |    
T  10732843 tgtatatg-ttgtgaatacgattttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacgg 10732941  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  10732942 tgatataatt 10732951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29346439 - 29346131
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  29346439 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 29346340  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |    
T  29346339 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaa 29346240  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  29346239 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 29346141  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  29346140 tgatataatt 29346131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38619889 - 38619586
Alignment:
Q  66 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  38619889 ttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgac 38619790  T
Q  166 ttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619789 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 38619690  T
Q  266 gtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatat 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||    
T  38619689 gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatat 38619590  T
Q  365 aatt 368  Q
    ||||    
T  38619589 aatt 38619586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29348912 - 29348604
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||    
T  29348912 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttg 29348813  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |    
T  29348812 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaa 29348713  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  29348712 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 29348614  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  29348613 tgatataatt 29348604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29351385 - 29351077
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||    
T  29351385 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttg 29351286  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |    
T  29351285 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaa 29351186  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  29351185 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 29351087  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  29351086 tgatataatt 29351077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 59 - 320
Target Start/End: Original strand, 2154334 - 2154595
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  2154334 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttg 2154433  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154434 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 2154533  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154534 tgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 2154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Original strand, 42245068 - 42245376
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  42245068 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttg 42245167  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42245168 gtttgacttcaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 42245267  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  42245268 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 42245366  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  42245367 tgatataatt 42245376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23064973 - 23064663
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||     
T  23064973 tccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttc 23064874  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23064873 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgta 23064774  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttg-ttatatt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  23064773 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatatt 23064674  T
Q  358 gtgatataatt 368  Q
    | |||||||||    
T  23064673 gggatataatt 23064663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Original strand, 20901623 - 20901873
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20901623 tccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttg 20901722  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901723 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 20901822  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20901823 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 63 - 356
Target Start/End: Original strand, 37804609 - 37804902
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37804609 aatttgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttt 37804708  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 262  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37804709 gacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgta 37804808  T
Q  263 tatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  37804809 tatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32027905 - 32027652
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  32027905 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttg 32027806  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32027805 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 32027706  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  32027705 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 32027652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 20917549 - 20917789
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20917549 tccgaattcgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 20917648  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20917649 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 20917748  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  20917749 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 97 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776521
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  197 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggt 9776581  T
Q  297 gaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9776580 gaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 59 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29330442 - 29330190
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  29330442 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttg 29330343  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29330342 gtttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 29330244  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||  || || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  29330243 tgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 29330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 20901421 - 20901597
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20901421 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttcta 20901520  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901521 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 17516471 - 17516647
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516471 catctctgccccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 17516570  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17516571 atgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 295977 - 296144
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  295977 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttg 296076  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  296077 gtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29330644 - 29330468
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330644 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 29330545  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    | | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29330544 aggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32028687 - 32028511
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028687 catctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 32028588  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028587 atatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 2154132 - 2154308
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2154132 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttttta 2154231  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2154232 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32028292 - 32028124
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32028292 tccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 32028193  T
Q  159 g-tttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    | |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028192 gttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 17516673 - 17516840
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516673 tccgatttttaaatgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 17516772  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17516773 gtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 20917347 - 20917523
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20917347 catctctgccccgaatttgaaatgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 20917446  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| || |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20917447 atgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 372
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917967
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 20917928  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917929 attattatttgatgttgttatattgtgatataattatat 20917967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027544
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 32027579  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027578 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 32027544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 295775 - 295951
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  || |  ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  295775 catctctgtcccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 295874  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295875 atgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32028098 - 32027931
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | |||    
T  32028098 tccgaatttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattg 32027999  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||  ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32027998 gtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32028485 - 32028318
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||    
T  32028485 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttg 32028386  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32028385 gtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330085
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagat---g 29330120  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330119 attattatttgatgttgttatattgtgatataatt 29330085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 320
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901990
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 20901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183278
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 22883904 - 22884013
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||     
T  22883904 aattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatga 22884003  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  22884004 tcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 43444009 - 43444118
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  43444009 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 43444108  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  43444109 ttaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743973
Alignment:
Q  238 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 18743973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 264327 - 264445
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  264327 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 264426  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  264427 cacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20909615 - 20909497
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||||||| | |    ||| |||||||||||||||||    
T  20909615 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20909516  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20909515 cacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 312
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917855
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20917855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11903
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  12012 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 11913  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  11912 ttaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25426286 - 25426177
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  25426286 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 25426187  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  25426186 ttaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7424986 - 7424879
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  7424986 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 7424887  T
Q  197 tcaaatta 204  Q
    ||||||||    
T  7424886 tcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39245656 - 39245621
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245656 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39363904 - 39363869
Alignment:
Q  191 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363904 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 301
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628235
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagt 1628235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399958
Alignment:
Q  237 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaa 21399958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23065117 - 23064999
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactg 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||   |    ||| |||||||| ||||||||    
T  23065117 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtccaattactg 23065018  T
Q  208 cacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23065017 cacgtaggtcacagtgaat 23064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168901
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattact 1168901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11342287 - 11342190
Alignment:
Q  109 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||  |||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  11342287 gtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074318
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 21933283 - 21933352
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21933283 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 21939453 - 21939522
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21939453 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 22367095 - 22367204
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| || |||||||  ||||     
T  22367095 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatga 22367194  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    | ||||||||    
T  22367195 ttaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35581409 - 35581340
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  35581409 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 36990679 - 36990748
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  36990679 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 146
Target Start/End: Original strand, 23280293 - 23280331
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagcttt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23280293 ggtgtaaacacaaaagttgtagatattgatgttagcttt 23280331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901509
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttataga 183  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttataga 28901509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937904
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttataga 183  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttataga 28937904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32950283 - 32950213
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||| |||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  32950283 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattact 32950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19511862 - 19511781
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  19511862 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 19511781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 20901852 - 20901929
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20901852 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20901929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067282
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 276  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Original strand, 37804450 - 37804531
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgattt 178  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||  | ||||||||||| |||| | || ||||||||  ||||||||||    
T  37804450 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgattt 37804531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154624
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataatt 2154624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 20198507 - 20198571
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20198507 atgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttaatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 20198571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902019
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataatt 20902019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22755270 - 22755214
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 164  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  22755270 ggtgtaaacatgaaagttgtagatatggatgttagctttcatatgtatttggtttga 22755214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061220
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataatt 31061220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13852 - 13543
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  13852 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttg 13753  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13752 gtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 13653  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  13652 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 13553  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    |||| |||||    
T  13552 tgatgtaatt 13543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13878
Alignment:
Q  186 ttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 134670 - 134362
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  134670 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 134571  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  134570 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 134471  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  134470 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 134372  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  134371 tgatataatt 134362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 137139 - 136831
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  137139 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 137040  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  137039 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 136940  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  136939 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 136841  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  136840 tgatataatt 136831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 139608 - 139300
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  139608 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 139509  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  139508 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 139409  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  139408 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 139310  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  139309 tgatataatt 139300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 142077 - 141769
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  142077 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 141978  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  141977 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 141878  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  141877 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 141779  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  141778 tgatataatt 141769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 144546 - 144238
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  144546 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 144447  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  144446 gtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 144347  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  144346 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 144248  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  144247 tgatataatt 144238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 62 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3480 - 3186
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3480 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 3381  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3380 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 3281  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3280 atatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 40859 - 40551
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  40859 tccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttg 40760  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40759 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 40660  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  40659 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactg 40561  T
Q  359 tgatataatt 368  Q
    ||||||||||    
T  40560 tgatataatt 40551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37848
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||     
T  37968 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatga 37870  T
Q  197 tcaaattactgcacgtaggtca 218  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  37869 tcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40885
Alignment:
Q  186 ttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 59 - 356
Target Start/End: Original strand, 4005 - 4304
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4005 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 4104  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4105 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 4204  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4205 tgtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 3812 - 3979
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  3812 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttg 3911  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||  |||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3912 gtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 3619 - 3782
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3619 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 3718  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 222  Q
    || |||  |||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3719 gtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  174 gatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 50 - 309
Target Start/End: Original strand, 217 - 476
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  217 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttcta 316  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  317 atgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaatta 416  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  417 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 309
Target Start/End: Original strand, 507 - 582
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 304 - 372
Target Start/End: Original strand, 12196 - 12264
Alignment:
Q  304 tatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 12264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 50 - 368
Target Start/End: Original strand, 38349 - 38668
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||| | ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38349 catctctgccccgaatttgaaataaaaattagtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 38448  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38449 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaatta 38548  T
Q  250 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgtt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38549 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 38648  T
Q  350 g-ttatattgtgatataatt 368  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  38649 gtttatattgtgatataatt 38668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 323
Target Start/End: Original strand, 6638 - 6902
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  6638 tccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttg 6737  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6738 gtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 6837  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttt 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6838 tgtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 6902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6612
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6436 catctccgccccgaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttcta 6535  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536 atgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 59 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30479 - 30229
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  30479 tccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttg 30380  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379 gtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 30280  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30279 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30681 - 30505
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30681 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcca 30582  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| | ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30581 atgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30112
Alignment:
Q  236 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 30112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 30083
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataatt 30083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 63 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 663 - 416
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  663 aatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggttt 564  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  563 gacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagta 464  T
Q  263 tatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  463 tatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 853
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1029 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttcta 930  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  929 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  140 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 782
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  827 tccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 59 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1049 - 807
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1049 tccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 950  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  949 gtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgta 850  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  849 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1075
Alignment:
Q  77 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  177 ttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1225
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1370 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct- 1272  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1271 atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 645
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 670  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  669 tgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 5)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 62 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10001
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10248 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtt 10149  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10148 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgt 10049  T
Q  262 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10048 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10441 - 10277
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  10441 gaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtc 10342  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10341 tgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10633 - 10470
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  10633 aatttgaactgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtct 10534  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10533 gacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10022 - 9945
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  10022 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 89 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15352 - 15083
Alignment:
Q  89 tggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttg 188  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  15352 tggtacagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttg 15253  T
Q  189 aattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttca 288  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15252 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtcca 15153  T
Q  289 tgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15152 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 268
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11251
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  11042 tccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttg 11141  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    ||  ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 gtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 11241  T
Q  259 tgtatatgtt 268  Q
    ||||||||||    
T  11242 tgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 10852 - 11016
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  10852 gaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtc 10951  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10952 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15573 - 15398
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15573 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttcta 15475  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15474 atgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 356
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53873
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  197 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  297 gaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53812 gaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 501522 - 501231
Alignment:
Q  61 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggt 160  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  501522 cgaatttgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggt 501424  T
Q  161 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||    
T  501423 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa-------------------tatgtatg 501343  T
Q  261 tatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  501342 tatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtg 501243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 501726 - 501550
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501726 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 501627  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501626 atgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85590
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataatt 85590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139645
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 164  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 120 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1827 - 1591
Alignment:
Q  120 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1827 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 1728  T
Q  220 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgat 319  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1727 agtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgat 1628  T
Q  320 gttttaagatgtcgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1627 tttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6911 - 6682
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6911 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 6812  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgta 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  6811 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----- 6717  T
Q  259 tgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 298  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716 -----atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7113 - 6937
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113 catctctgtcccgaatatgaaatgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 7014  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7013 atgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 149 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10920
Alignment:
Q  149 aatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  249 agtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttgatgt 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 10944  T
Q  349 tgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10943 tgttatattgtgatataattatat 10920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36 - 1
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 62 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8196 - 7996
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8196 gaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtt 8097  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8096 tgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgt 7997  T
Q  262 a 262  Q
    |    
T  7996 a 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8392 - 8225
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||    
T  8392 tccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttg 8293  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8292 gtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8421
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8594 catctctgccccgaatttgaaatggaaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttcta 8495  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 223  Q
    ||  | ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8494 attccattggtatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 59 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 68421 - 68227
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||    
T  68421 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattg 68322  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68321 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43199 - 43002
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43199 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttg 43100  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 256  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43099 gtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 109 - 301
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13571
Alignment:
Q  109 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgc 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  209 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43401 - 43225
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43401 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 43302  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43301 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18599 - 18423
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 18500  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18499 atgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18397 - 18352
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  18397 tccgaatttgaaatgaaaactggcattgattggtacagaaatggtc 18352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1916 - 1740
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1916 catctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 1817  T
Q  150 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1816 atgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1714 - 1634
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1714 tccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18110 - 17947
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||     
T  18110 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtc 18011  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18010 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33628 - 33465
Alignment:
Q  62 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  33628 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtc 33529  T
Q  162 tgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33528 tgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 135 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57708
Alignment:
Q  135 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 292  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 7395 - 7558
Alignment:
Q  61 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggt 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7395 cgaatttgaaatgaaa-ctggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggt 7493  T
Q  161 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7494 ctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 7200 - 7367
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  7200 tccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttg 7299  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    || |||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7300 gtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 224
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7172
Alignment:
Q  131 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 95
Target Start/End: Original strand, 7585 - 7621
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7585 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 7621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31663 - 31497
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||    
T  31663 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattg 31564  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31563 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39792 - 39626
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  39792 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattg 39693  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39692 gtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8478 - 8311
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  8478 tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattg 8379  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8378 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 19791 - 19957
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19791 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattg 19890  T
Q  159 gtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 225  Q
    || |||| |||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19891 gtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 36905 - 37068
Alignment:
Q  63 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 162  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36905 aatttgaaatgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 37004  T
Q  163 gacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37005 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 226
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  100 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtca 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  200 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28186 - 28048
Alignment:
Q  174 gatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 273  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28186 gatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatga 28087  T
Q  274 atacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
     || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  28086 gtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 28048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 27958
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 27975  T
Q  334 attaccatttgatgttg 350  Q
    ||||  |||||||||||    
T  27974 attattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 309
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  222 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10886
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttg 10863  T
Q  334 attaccatttgatgttgttatat 356  Q
    | ||  |||||||||||||||||    
T  10864 agtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 10713 - 10790
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtat 312  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  10713 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 10790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 113475 - 113317
Alignment:
Q  60 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| | ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  113475 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttgg 113376  T
Q  160 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 218  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  113375 tttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15273
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 15248  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  15249 tgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 309
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15119
Alignment:
Q  210 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatg 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||          |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaatta----------gtatatgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 75607 - 75689
Alignment:
Q  59 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  75607 tccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9932
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatga 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  236 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9901
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataatt 9901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 356
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36065
Alignment:
Q  246 attagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa-gtgatatatgtatatatgatgttttaagatgtcgattaccatttg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttg 36053  T
Q  345 atgttgttatat 356  Q
    ||||| ||||||    
T  36054 atgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1327
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgatatatgtatatatgatgtttta--agatgt 331  Q
    ||||||| || |||||||||||| || || ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  1204 tatgattaataaattagtatatgaatataaatgtt-gagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 1302  T
Q  332 cgattaccatttgatgttgttatat 356  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  1303 tgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 398
Alignment:
Q  50 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtt 140  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  488 catctatgccccgaatttgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6305
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||     
T  6196 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatga 6295  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  6296 tcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 12489 - 12590
Alignment:
Q  105 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12489 ttaggtgttaacctaaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 12588  T
Q  205 ct 206  Q
    ||    
T  12589 ct 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8675 - 8566
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||     
T  8675 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatga 8576  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  8575 tcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30470
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  30579 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 30480  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  30479 tcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 912
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1219
Alignment:
Q  104 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatt 203  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1333 cttagatgtaaacataaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaatt 1234  T
Q  204 actgcacgtaggtca 218  Q
    ||| ||| |||||||    
T  1233 actacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 725
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  834 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 735  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  734 tcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  236 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 1267 - 1365
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1267 ggtgtaaacataaaagttttagataattgtgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  138 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaatta 204  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32216
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40628
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1375
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1444 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 110065 - 110174
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  110065 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 110164  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  110165 tcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 118566 - 118675
Alignment:
Q  97 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatgg 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||     
T  118566 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 118665  T
Q  197 tcaaattact 206  Q
    ||||||||||    
T  118666 tcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 151
Target Start/End: Original strand, 15910 - 15953
Alignment:
Q  108 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 151  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15910 ggtgtacacataaaagttgtaggtatggaagttagctttctaat 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15297
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaa 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15408 - 15350
Alignment:
Q  241 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  15408 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttattcatgattgatgaa 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 868
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattact 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 54016 - 53946
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  54016 atgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 19939 - 20009
Alignment:
Q  136 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19939 atgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 253
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatat 253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18274 - 18205
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18274 tgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38444 - 38375
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  38444 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82219
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatat 82219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 313
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  378 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12209
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 12209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31971 - 31918
Alignment:
Q  165 cttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 218  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31971 cttcaaaatgttttctagaatttgatttatggtcaaattactacacataggtca 31918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1291
Alignment:
Q  327 gatgtcgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataatt 1291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 167129 - 167198
Alignment:
Q  137 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  167129 tgttagctttataatgtcgttggtttgaggaccaaattttttttagaacttgagttatgatcaaattact 167198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Original strand, 187890 - 187955
Alignment:
Q  234 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  187890 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 187955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4444
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataattatat 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatat 4444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 217 - 273
Alignment:
Q  170 aaatgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 226  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  217 aaatgatttttagattttgatttatggtcaaactactacacgtaggtcacaatgaat 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2139
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataatt 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164601
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataatt 164601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 291
Target Start/End: Original strand, 66762 - 66818
Alignment:
Q  235 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 291  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  66762 atgaatgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatga 66818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158461
Alignment:
Q  340 atttgatgttgttatattgtgatataatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataatt 158461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University