View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14363_high_9 (Length: 471)

Name: NF14363_high_9
Description: NF14363
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14363_high_9
NF14363_high_9
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (15-311)||(42419482-42419775)
chr4 (15-311)||(25478066-25478358)
chr4 (101-311)||(6784830-6785040)
chr4 (101-311)||(19549451-19549661)
chr4 (101-296)||(36854913-36855108)
chr4 (101-311)||(12835032-12835241)
chr4 (101-300)||(18032757-18032956)
chr4 (101-300)||(50696782-50696981)
chr4 (127-296)||(19550108-19550277)
chr4 (120-311)||(25236377-25236568)
chr4 (129-311)||(42418974-42419156)
chr4 (127-311)||(12834408-12834592)
chr4 (127-311)||(25478680-25478864)
chr4 (127-311)||(36855548-36855731)
chr4 (130-301)||(50696183-50696354)
chr4 (134-269)||(29101713-29101848)
chr4 (54-121)||(12834954-12835021)
chr4 (54-121)||(50696704-50696771)
chr4 (15-121)||(18032967-18033072)
chr4 (15-121)||(36855119-36855224)
chr4 (15-121)||(19549672-19549777)
chr4 (101-259)||(32383746-32383907)
chr4 (139-205)||(46823337-46823403)
chr4 (197-293)||(13767497-13767593)
chr4 (209-311)||(13767686-13767787)
chr4 (127-224)||(32383275-32383374)
chr4 (227-292)||(29004321-29004386)
chr4 (242-311)||(550316-550386)
chr4 (250-311)||(45919500-45919561)
chr4 (271-311)||(21825174-21825214)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (54-290)||(5114213-5114449)
chr6 (101-311)||(18969706-18969915)
chr6 (101-301)||(34713214-34713414)
chr6 (101-280)||(24063039-24063218)
chr6 (127-297)||(24063660-24063830)
chr6 (127-311)||(18969100-18969284)
chr6 (15-121)||(34713097-34713203)
chr6 (15-121)||(24063229-24063335)
chr6 (209-311)||(1370149-1370250)
chr6 (215-311)||(1371023-1371119)
chr6 (227-292)||(10788965-10789030)
chr6 (241-296)||(32907431-32907486)
chr6 (219-293)||(4620870-4620944)
chr6 (127-169)||(5121369-5121411)
chr6 (241-310)||(18649895-18649964)
chr6 (271-311)||(8992896-8992936)
chr6 (271-311)||(9017343-9017383)
chr6 (56-88)||(18969649-18969681)
chr6 (207-307)||(35073373-35073473)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (101-311)||(16303245-16303455)
chr3 (101-311)||(46889122-46889332)
chr3 (101-310)||(46914962-46915170)
chr3 (101-310)||(50802445-50802653)
chr3 (101-310)||(50873224-50873432)
chr3 (101-293)||(37986421-37986613)
chr3 (127-296)||(37987054-37987223)
chr3 (127-311)||(16302623-16302806)
chr3 (127-311)||(46915608-46915791)
chr3 (127-296)||(46888480-46888649)
chr3 (127-311)||(50801822-50802006)
chr3 (127-311)||(50873874-50874058)
chr3 (127-296)||(13644003-13644172)
chr3 (104-213)||(18346890-18346999)
chr3 (163-263)||(18346985-18347085)
chr3 (15-121)||(16303129-16303234)
chr3 (16-121)||(37986624-37986728)
chr3 (15-121)||(50802329-50802434)
chr3 (15-121)||(50873443-50873548)
chr3 (15-121)||(46888974-46889080)
chr3 (196-296)||(16854594-16854694)
chr3 (54-121)||(46915181-46915248)
chr3 (207-293)||(7253229-7253315)
chr3 (242-311)||(54584877-54584945)
chr3 (241-309)||(53948651-53948719)
chr3 (241-311)||(20200605-20200675)
chr3 (241-311)||(20202789-20202859)
chr3 (241-311)||(53950074-53950144)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (84-311)||(15883155-15883382)
chr5 (101-300)||(25836466-25836665)
chr5 (15-311)||(3259568-3259873)
chr5 (101-300)||(9918339-9918538)
chr5 (101-311)||(4737659-4737870)
chr5 (101-311)||(14480738-14480948)
chr5 (101-311)||(490903-491114)
chr5 (101-296)||(10394720-10394915)
chr5 (127-311)||(492018-492201)
chr5 (127-311)||(14481342-14481525)
chr5 (101-300)||(12281107-12281306)
chr5 (101-300)||(15915084-15915283)
chr5 (113-311)||(36038453-36038651)
chr5 (127-311)||(3259062-3259245)
chr5 (127-296)||(9917733-9917902)
chr5 (127-296)||(15915697-15915866)
chr5 (127-293)||(25835861-25836027)
chr5 (127-311)||(4737034-4737218)
chr5 (127-293)||(10394112-10394278)
chr5 (127-282)||(12281745-12281900)
chr5 (15-121)||(12281317-12281422)
chr5 (15-121)||(4737543-4737648)
chr5 (54-121)||(15915294-15915361)
chr5 (55-121)||(10394643-10394709)
chr5 (19-121)||(25836354-25836455)
chr5 (15-121)||(9918225-9918328)
chr5 (15-121)||(491125-491232)
chr5 (65-121)||(14480959-14481017)
chr5 (241-311)||(23206191-23206261)
chr5 (271-311)||(11768830-11768870)
chr5 (241-309)||(21145927-21145995)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (101-311)||(24022878-24023087)
chr8 (101-299)||(41272966-41273164)
chr8 (101-310)||(34654192-34654401)
chr8 (127-311)||(20054258-20054442)
chr8 (127-311)||(34654805-34654984)
chr8 (127-296)||(14763210-14763379)
chr8 (163-297)||(41273703-41273837)
chr8 (165-311)||(20054903-20055048)
chr8 (196-311)||(3583593-3583708)
chr8 (196-311)||(3583242-3583357)
chr8 (54-121)||(41273175-41273242)
chr8 (209-311)||(29267934-29268035)
chr8 (15-121)||(20054768-20054873)
chr8 (15-121)||(41273333-41273438)
chr8 (101-166)||(41273449-41273514)
chr8 (215-311)||(29268785-29268881)
chr8 (215-296)||(16846817-16846898)
chr8 (196-311)||(16847624-16847738)
chr8 (15-121)||(34654412-34654519)
chr8 (215-311)||(3582422-3582518)
chr8 (216-311)||(14754163-14754256)
chr8 (242-311)||(10092908-10092977)
chr8 (101-134)||(14762764-14762797)
chr8 (54-98)||(14762813-14762857)
chr8 (271-311)||(5881132-5881172)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (101-311)||(2054937-2055147)
chr2 (101-298)||(36150338-36150535)
chr2 (101-311)||(34452239-34452449)
chr2 (101-311)||(863196-863405)
chr2 (101-300)||(37875391-37875590)
chr2 (127-311)||(863844-864028)
chr2 (127-311)||(36150979-36151163)
chr2 (101-269)||(27006239-27006407)
chr2 (127-311)||(2054345-2054528)
chr2 (101-261)||(8043081-8043241)
chr2 (127-311)||(34452888-34453071)
chr2 (133-311)||(8043688-8043866)
chr2 (127-311)||(37876030-37876215)
chr2 (113-280)||(7498176-7498344)
chr2 (178-311)||(39830738-39830866)
chr2 (127-300)||(7486774-7486949)
chr2 (15-121)||(34452460-34452565)
chr2 (15-121)||(36150546-36150651)
chr2 (15-121)||(37875601-37875706)
chr2 (54-121)||(27006161-27006228)
chr2 (209-311)||(24433332-24433434)
chr2 (227-311)||(19911108-19911193)
chr2 (15-121)||(8043252-8043357)
chr2 (215-311)||(38985979-38986075)
chr2 (196-292)||(38986802-38986898)
chr2 (55-121)||(863416-863482)
chr2 (209-311)||(27059166-27059267)
chr2 (209-311)||(27059977-27060079)
chr2 (215-311)||(24429608-24429703)
chr2 (257-311)||(2868668-2868721)
chr2 (241-311)||(8911833-8911903)
chr2 (65-98)||(2054888-2054921)
chr2 (241-311)||(42849495-42849565)
chr2 (271-311)||(20203327-20203367)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (101-296)||(24306963-24307158)
chr7 (101-311)||(42489828-42490038)
chr7 (101-311)||(30002414-30002624)
chr7 (101-311)||(36783749-36783958)
chr7 (101-311)||(37706178-37706387)
chr7 (127-311)||(30469320-30469503)
chr7 (127-311)||(32022544-32022728)
chr7 (101-298)||(30468695-30468889)
chr7 (127-311)||(32021212-32021395)
chr7 (127-311)||(36784396-36784580)
chr7 (127-296)||(24306353-24306522)
chr7 (127-311)||(30001793-30001976)
chr7 (127-292)||(42489222-42489387)
chr7 (314-450)||(229478-229614)
chr7 (15-121)||(30468900-30469005)
chr7 (15-121)||(24306847-24306952)
chr7 (15-121)||(30002298-30002403)
chr7 (15-121)||(42489712-42489817)
chr7 (209-311)||(30470970-30471071)
chr7 (59-121)||(37706105-37706167)
chr7 (15-121)||(32022114-32022219)
chr7 (15-121)||(36783969-36784074)
chr7 (139-213)||(26928582-26928656)
chr7 (209-286)||(30470127-30470204)
chr7 (239-311)||(21415389-21415461)
chr7 (213-311)||(3219294-3219391)
chr7 (241-311)||(30659844-30659914)
chr7 (241-311)||(31179915-31179985)
chr7 (241-311)||(43334119-43334189)
chr7 (241-312)||(38059835-38059906)
chr7 (241-311)||(3162858-3162928)
chr7 (241-311)||(3163494-3163563)
chr7 (101-131)||(32022073-32022103)
chr7 (271-309)||(46428145-46428183)
chr7 (250-311)||(8513469-8513530)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (101-296)||(24081458-24081653)
chr1 (101-311)||(48644687-48644897)
chr1 (101-299)||(51661213-51661411)
chr1 (102-311)||(39870052-39870261)
chr1 (101-300)||(23173897-23174095)
chr1 (101-296)||(31151290-31151485)
chr1 (113-297)||(23601739-23601923)
chr1 (127-311)||(31150667-31150851)
chr1 (127-296)||(23173288-23173457)
chr1 (127-293)||(39870693-39870859)
chr1 (127-311)||(48577438-48577621)
chr1 (127-311)||(51660592-51660774)
chr1 (144-301)||(24082096-24082253)
chr1 (101-220)||(18249168-18249287)
chr1 (15-154)||(23602233-23602371)
chr1 (174-311)||(23602367-23602505)
chr1 (15-121)||(23173780-23173886)
chr1 (15-121)||(18249021-18249126)
chr1 (15-121)||(24081664-24081769)
chr1 (15-121)||(51661097-51661202)
chr1 (54-121)||(39870273-39870340)
chr1 (209-311)||(4595540-4595642)
chr1 (209-296)||(40959736-40959823)
chr1 (15-121)||(31151174-31151279)
chr1 (209-296)||(4594710-4594797)
chr1 (209-296)||(40958891-40958978)
chr1 (213-293)||(50505366-50505446)
chr1 (241-312)||(21791478-21791548)
chr1 (241-311)||(5216550-5216620)
chr1 (271-311)||(14886141-14886181)
chr1 (207-311)||(16317541-16317645)
chr1 (241-311)||(21790739-21790809)
chr1 (228-306)||(44672106-44672184)
chr1 (271-311)||(5496534-5496574)
chr1 (271-311)||(17606252-17606292)
chr1 (93-121)||(48644648-48644676)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (127-311)||(8401-8584)
[»] scaffold1339 (1 HSPs)
scaffold1339 (207-311)||(1906-2009)
[»] scaffold0093 (2 HSPs)
scaffold0093 (209-311)||(21944-22046)
scaffold0093 (209-296)||(22732-22819)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (241-311)||(105500-105569)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 42419482 - 42419775
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42419482 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaat-tgggaaaatttataaatttggggaa 42419579  T
Q  115 ataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42419580 ataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagt 42419679  T
Q  215 tttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42419680 tttaagcctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 42419775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25478358 - 25478066
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25478358 catatgtatatgagttctaccattcattttataaaaaaactttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatatgggaaaatttataaatttggggaa 25478259  T
Q  115 ataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25478258 ataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttctcaatta---gatatagagtatttggtgtatgataattaatttagtgatagt 25478162  T
Q  215 tttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25478161 tttaagcctttggattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaa-cccatatatatat 25478066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6785040 - 6784830
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6785040 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttggtgtatattaatt 6784941  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6784940 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccc 6784841  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  6784840 tatatatatat 6784830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19549661 - 19549451
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19549661 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgacagagagtatttggtgtatattaatt 19549562  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19549561 aatttggtgatagttttaagcctttagattaaataaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 19549462  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  19549461 tatatatatat 19549451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36855108 - 36854913
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36855108 ataaatttgaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaagtgatagagagtatttggtgtatattaatt 36855009  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36855008 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaagggatgagatttgatgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 36854913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 12835032 - 12835241
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12835032 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 12835131  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12835132 aatttggtgacagttttaagcatttgaattaaataaaatgaagggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaa-cc 12835230  T
Q  301 catatatatat 311  Q
    |||||||||||    
T  12835231 catatatatat 12835241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18032956 - 18032757
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18032956 ataaattttaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaagtgatagagagtatttggtgtatattaatt 18032857  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18032856 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaagggatgagatttcgtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 18032757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Original strand, 50696782 - 50696981
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50696782 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatcatagatatttttcttaaataggtgatagaaagtatttggtgtatattaatt 50696881  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50696882 aatttgatgatagttttaagtctttggattaaataaaatgaagggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 50696981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Original strand, 19550108 - 19550277
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19550108 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 19550207  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19550208 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 19550277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 120 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25236568 - 25236377
Alignment:
Q  120 aatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25236568 aatggaatgtttgattataaaataacgatgataaatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatgttaattaatttggtgatagttttaa 25236469  T
Q  220 acctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25236468 gcctttggattaaataaaatgaatggataatatttagtgtcaaactaattttgacaccatgatgtcatttgatcctaaccctatatatatat 25236377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42419156 - 42418974
Alignment:
Q  129 tttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcga 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42419156 tttgattatgaattaatgatgatatatatgtttcttaattaagtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttgga 42419057  T
Q  229 ttaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  42419056 ttaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatgtatat 42418974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12834592 - 12834408
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12834592 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagggagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 12834493  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12834492 gattaaatgaaatgaatggatataatttggtgtcaaactaattttgacaccatagtgtcatttgatcctatccctatatatatat 12834408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 25478680 - 25478864
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25478680 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaagtgatagagagtatttggtgtatgataattaatttggtgatagttttaagcctttg 25478779  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25478780 gattaaatgaaatgaatagataagatttggtgtcaaactaattttgacaacatgatatcatttgatcctaaccctatatatatat 25478864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 36855548 - 36855731
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  36855548 tgtttgattatgaattaatgataatagatatgtttcttaattaggtgatagggagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 36855647  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36855648 gattaaatgaaatgaattgataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 36855731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 50696354 - 50696183
Alignment:
Q  130 ttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgat 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  50696354 ttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaagttgatgatagttttaagcctttggat 50696255  T
Q  230 taaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaacccc 301  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50696254 taaatgaaatgaattgataaaatttagtgtcaaactaattttgacaccaaggtgtcatttgatcctatcccc 50696183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 269
Target Start/End: Original strand, 29101713 - 29101848
Alignment:
Q  134 ttataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaa 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29101713 ttataaattaacgatgataaatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtaagttaattaatttggtgatagttttaagcctttggattaaa 29101812  T
Q  234 tgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29101813 tgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaatt 29101848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Original strand, 12834954 - 12835021
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12834954 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 12835021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Original strand, 50696704 - 50696771
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50696704 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 50696771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18033072 - 18032967
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18033072 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgaaaaaatttataaatttggggaa 18032974  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  18032973 ataaaaa 18032967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36855224 - 36855119
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36855224 cataggtatacgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgaaaaaatttataaatttggggaa 36855126  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  36855125 ataaaaa 36855119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19549777 - 19549672
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19549777 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttaaaaaagaagtttgaatatgattatagaaatctgagaaaatttataaatttgaggaa 19549679  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  19549678 ataaaaa 19549672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 259
Target Start/End: Original strand, 32383746 - 32383907
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaa-taaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttctt-aattaggtgatag-agagtatttggtgtatatta 197  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| | |||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  32383746 ataaattaggggaaaataaaaagggaatgattgattttgaattgatgatggtaaatatgtttttttaattaggtgataggaaaatatttggtgtatatta 32383845  T
Q  198 attaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgt 259  Q
    ||||| ||  ||||||||||||  | || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  32383846 attaacttaatgatagttttaagtcattagattaaatgaaacaaatggatgagatttgatgt 32383907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 46823403 - 46823337
Alignment:
Q  139 aattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaattt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  46823403 aattaatgatgatagatatgtttctcaattaggtgatagacagtatttagtgtatgttaattaattt 46823337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13767593 - 13767497
Alignment:
Q  197 aattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatc 293  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||| || || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13767593 aattattttggtgatagctttaaacctttggattaaatgtatcgaatgaattagttttggtgtcaaattaattttgacaccatggtgtcttttgatc 13767497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 13767686 - 13767787
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||    
T  13767686 gatagtttttaacctttgaattaaatgtaatgaatgaatgaggtttggtgtcaaactaattttgacactatattgtcatttgatcct-atcccatatata 13767784  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  13767785 tat 13767787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32383374 - 32383275
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtg--atagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  32383374 tgtttgattatgaattaatgatggtaaatgtgttttttaattaggtggtagagagagtatttggtgcatgtgaaataatttagtgatagttttaagcctt 32383275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 292
Target Start/End: Original strand, 29004321 - 29004386
Alignment:
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgat 292  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29004321 gattaaatgaaatgaatggatgaaatttagtatcaaactaattttgacatcatggtgtcatttgat 29004386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 311
Target Start/End: Original strand, 550316 - 550386
Alignment:
Q  242 atggataagatttgatgtcaaacta-attatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  550316 atggttaagatttgatgtcaaaatttagtttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 550386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45919561 - 45919500
Alignment:
Q  250 gatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45919561 gatttgatgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 45919500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Original strand, 21825174 - 21825214
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  21825174 tgacaccatggtgtcatttgatcctatccatatatatatat 21825214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5114449 - 5114213
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatag 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5114449 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatatggaaaaatttataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatat 5114350  T
Q  154 atatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5114349 atatgtttattaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggataagatt 5114250  T
Q  254 tgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttg 290  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5114249 tggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttg 5114213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 18969706 - 18969915
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18969706 ataaatttggagaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgattcttaattaggtgatagagagtatgtggtgtatattaatt 18969805  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18969806 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatgaatgagatttagtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcc 18969904  T
Q  301 catatatatat 311  Q
    |||||||||||    
T  18969905 catatatatat 18969915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 301
Target Start/End: Original strand, 34713214 - 34713414
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34713214 ataaatttggagaaataaaaatgaaatgtttgattataaattaacgatgataaatatgtttcttaattaggtgatagagagtattttgtgtatattaatt 34713313  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34713314 aatttgatgatagttttaaacctttcaattaaatgaaatgaatgaataagatttgatgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgattctaaccc 34713413  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  34713414 c 34713414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 101 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24063218 - 24063039
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24063218 ataaatttggggaaataaaaatgaaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttggtgtatattaatt 24063119  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  24063118 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgtcaccatg 24063039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 297
Target Start/End: Original strand, 24063660 - 24063830
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24063660 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 24063759  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaa 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24063760 gattaaatcaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaa 24063830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18969284 - 18969100
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||     
T  18969284 tgtttgattatgaattaataatgatagatatgtttcttaatgaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggttatagttttaagtctttg 18969185  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18969184 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 18969100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 34713097 - 34713203
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34713097 cataggtatatgaattctaccattcattttataaaaaaagtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 34713196  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  34713197 ataaaaa 34713203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24063335 - 24063229
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||       |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24063335 cataggtatatgagttctaccattcattttataaaaaaagttttgaaaataagtttgagtatgattatagaaatatgggaaaatttataaatttggggaa 24063236  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  24063235 ataaaaa 24063229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1370250 - 1370149
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1370250 gatagttttaaacctttgaattaaatgtgatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatata 1370152  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  1370151 tat 1370149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Original strand, 1371023 - 1371119
Alignment:
Q  215 tttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  1371023 tttaaacctttggattaaatataatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccatatatatatat 1371119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 292
Target Start/End: Original strand, 10788965 - 10789030
Alignment:
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgat 292  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  10788965 gattaaatgaaacgaatgtatgagatttgatgtcaaactaattttgacaccatattgtcatttgat 10789030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32907486 - 32907431
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32907486 aatggttaagatttggtgtcaaattaaatttgacaccatggtgtcatttgatccta 32907431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4620944 - 4620870
Alignment:
Q  219 aacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatc 293  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| ||| || ||||||||||    
T  4620944 aacctttggattaaatataatgaatggatgagatttgatgtcaaacaaattttaacatcatagtatcatttgatc 4620870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 5121369 - 5121411
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaatta 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5121369 tgtttgattatgaattaatgatgatatatatgtttcttaatta 5121411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 18649895 - 18649964
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatata 310  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18649895 aatggttatgatttggtgtcaaatttaatttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatata 18649964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8992936 - 8992896
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8992936 tgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 8992896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9017383 - 9017343
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9017383 tgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 9017343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Original strand, 18969649 - 18969681
Alignment:
Q  56 ttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaat 88  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18969649 ttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaat 18969681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 307
Target Start/End: Original strand, 35073373 - 35073473
Alignment:
Q  207 gtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatata 306  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||||| || | ||||||||||||||| ||||| | | | | ||||||| || |||||||||||| || ||| |||||    
T  35073373 gtgattgttttaagcctttgggttaaataaattaaatggataagatttggtgtcacatttaatttgacaccttgatgtcatttgatcttatccctatata 35073472  T
Q  307 t 307  Q
    |    
T  35073473 t 35073473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 16303245 - 16303455
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16303245 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 16303344  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16303345 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatgatgtcatttgatcctaaccc 16303444  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  16303445 tatatatatat 16303455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 46889122 - 46889332
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46889122 ataaatttgggaaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 46889221  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46889222 aatttgatgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 46889321  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  46889322 tatatatatat 46889332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46915170 - 46914962
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46915170 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagatatatttcttaattatgtgatagagagtatttggtgtatattaatt 46915071  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  46915070 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcc 46914972  T
Q  301 catatatata 310  Q
    ||||||||||    
T  46914971 catatatata 46914962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Original strand, 50802445 - 50802653
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50802445 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttggtgtatattaatt 50802544  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  50802545 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcaattgatcct-atcc 50802643  T
Q  301 catatatata 310  Q
    ||||||||||    
T  50802644 catatatata 50802653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50873432 - 50873224
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50873432 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtatgattataaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttggtgtatattaatt 50873333  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  50873332 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcaattgatcct-atcc 50873234  T
Q  301 catatatata 310  Q
    ||||||||||    
T  50873233 catatatata 50873224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 101 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37986613 - 37986421
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37986613 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataatttaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgttgtatattaatt 37986514  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37986513 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatc 37986421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Original strand, 37987054 - 37987223
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  37987054 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttggtgtatattaactaatttggtgatagttttaagccttta 37987153  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37987154 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 37987223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16302806 - 16302623
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16302806 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 16302707  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16302706 gattaaatgaaatgaatggataaaatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 16302623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 46915608 - 46915791
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  46915608 tgtttgattatgaattaatgatgataaatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 46915707  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  46915708 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 46915791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 46888649 - 46888480
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  46888649 tgtttgattatgaattaatgatgatgaatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 46888550  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46888549 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 46888480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50802006 - 50801822
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50802006 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatatttcttaattaggtgatatagagtatttgatgtatcataattaatttggtgatagttttaaacctttg 50801907  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  50801906 aattaaatgaaatgaatggataagattcggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcatatccctatatatatat 50801822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 50873874 - 50874058
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50873874 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatatttcttaattaggtgatatagagtatttgatgtatcataattaatttggtgatagttttaaacctttg 50873973  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  50873974 aattaaatgaaatgaatggataagattcggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcatatccctatatatatat 50874058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Original strand, 13644003 - 13644172
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13644003 tgtttgattatgaattaatgatgataaatatatttcttaattaggtgatagagagtatttgatgcatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 13644102  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13644103 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtatcatttgatccta 13644172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Original strand, 18346890 - 18346999
Alignment:
Q  104 aatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaat 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18346890 aattaggggaaataaaaatagaatgtttgattatgaattaatgatgataaatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaat 18346989  T
Q  204 ttggtgatag 213  Q
    ||||||||||    
T  18346990 ttggtgatag 18346999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Original strand, 18346985 - 18347085
Alignment:
Q  163 ttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaa 262  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18346985 ttaatttggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttggattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaa 18347084  T
Q  263 a 263  Q
    |    
T  18347085 a 18347085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 16303129 - 16303234
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16303129 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 16303227  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  16303228 ataaaaa 16303234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 37986728 - 37986624
Alignment:
Q  16 ataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaa 115  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37986728 ataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaa 37986630  T
Q  116 taaaaa 121  Q
    ||||||    
T  37986629 taaaaa 37986624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 50802329 - 50802434
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50802329 cataggtatatgagttcaaccatttattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatataaatatgggaaaatttataaatttggggaa 50802427  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  50802428 ataaaaa 50802434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 50873548 - 50873443
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50873548 cataggtatatgagttcaaccatttattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatataaatatgggaaaatttataaatttggggaa 50873450  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  50873449 ataaaaa 50873443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 46888974 - 46889080
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaa-gtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttgggga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46888974 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttgggga 46889072  T
Q  114 aataaaaa 121  Q
    ||||||||    
T  46889073 aataaaaa 46889080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Original strand, 16854594 - 16854694
Alignment:
Q  196 taattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcct 295  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16854594 taattattttgtagatagttttaaacctttggattaaatgtgatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatgatgtcatttgatcct 16854693  T
Q  296 a 296  Q
    |    
T  16854694 a 16854694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 46915248 - 46915181
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46915248 gtttagaaaaaaagtttgaatatgattatagaaatctgggaaaattaataaatttggggaaataaaaa 46915181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 293
Target Start/End: Original strand, 7253229 - 7253315
Alignment:
Q  207 gtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatc 293  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||||||| ||||| | | | | |||||||||||||||||||||||    
T  7253229 gtgattgttttaagcctttggattaaacaaattaaatggataagatttggtgtcacatttaatttgacaccatggtgtcatttgatc 7253315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 311
Target Start/End: Original strand, 54584877 - 54584945
Alignment:
Q  242 atggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  54584877 atggttaagatttgatgttaaatttagtttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 54584945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 53948719 - 53948651
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatat 309  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53948719 aatggttatgatttggtgtcaaatttaatttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatat 53948651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 20200605 - 20200675
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20200605 aatggctaggatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 20200675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 20202789 - 20202859
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20202789 aatggctaggatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 20202859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 53950074 - 53950144
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  53950074 aatggctaggatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 53950144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15883382 - 15883155
Alignment:
Q  84 gaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagta 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15883382 gaaatatgggaaaatttataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttctcaattagatgatagagagta 15883283  T
Q  184 tttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtg 283  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15883282 tttggtgtatgataattaatttcgtgatagttttaagcctttggattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattttgacaccatgatg 15883183  T
Q  284 tcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15883182 tcatttgatcctaaccctatatatatat 15883155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Original strand, 25836466 - 25836665
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25836466 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 25836565  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25836566 aatttggtgatagttttaaacctttagattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaaataattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 25836665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 3259568 - 3259873
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaattta-----------ta 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |           ||    
T  3259568 cataggtatatgagttcaaacattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgaatatgattatagaaatttggggaaataaaagaggaacaaata 3259666  T
Q  104 aatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259667 aatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaat 3259766  T
Q  204 ttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3259767 ttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaa-cccat 3259865  T
Q  304 atatatat 311  Q
    ||||||||    
T  3259866 atatatat 3259873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Original strand, 9918339 - 9918538
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9918339 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 9918438  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9918439 aatttggtgatagtttcaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatatggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 9918538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 4737659 - 4737870
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4737659 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtatatattaatt 4737758  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaac-c 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4737759 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacatcatggtgtcatttgatcctaacac 4737858  T
Q  300 ccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||    
T  4737859 ccatatatatat 4737870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14480948 - 14480738
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14480948 ataaatttgaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaagtgatagagagtatttggtgtatattaatt 14480849  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14480848 aatttggtgatagttctaagcctttgaattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcatatccc 14480749  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  14480748 tatatatatat 14480738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 491114 - 490903
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  491114 ataaatttgaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 491015  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatg--acaccatggtgtcatttgatcctaac 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | |     
T  491014 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacacaccatggtgtcatttgatcat-at 490916  T
Q  299 cccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||    
T  490915 cccatatatatat 490903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 296
Target Start/End: Original strand, 10394720 - 10394915
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394720 ataaatttggggaaataaaaatagaatgtttgattataaattaataatgatagatatgttttttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 10394819  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10394820 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatagatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcattttatccta 10394915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 492018 - 492201
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  492018 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 492117  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  492118 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 492201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 14481342 - 14481525
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14481342 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 14481441  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14481442 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 14481525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12281306 - 12281107
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12281306 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttggttataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtggtagagagtatttgatgtatattaatt 12281207  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12281206 aatttggttatagttttaagcctttggattaaataaaatgaaaggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcataaccc 12281107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15915283 - 15915084
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15915283 ataaatttgaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatattttttttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 15915184  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15915183 aatttggtgatagttttaagcttttggattaaataaaatgaaaggatgagatttggtgtcaaattaattttgacaccatgatgtcatttgatcctaaccc 15915084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 113 - 311
Target Start/End: Original strand, 36038453 - 36038651
Alignment:
Q  113 aaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgata 212  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36038453 aaataagaagggattgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatgttaattaatttggtgata 36038552  T
Q  213 gttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36038553 gttttaagcttttggattaaattaaatgaatggataatatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccatatatatatat 36038651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3259245 - 3259062
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3259245 tgtttgattatgaattaatgatgatatatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 3259146  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3259145 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 3259062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9917902 - 9917733
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9917902 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattatgtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 9917803  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9917802 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 9917733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Original strand, 15915697 - 15915866
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15915697 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagggagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 15915796  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15915797 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 15915866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25836027 - 25835861
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  25836027 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttgatgatagttttaagcctttg 25835928  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25835927 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatc 25835861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4737218 - 4737034
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4737218 tgtttgattatgaattaatgatgatagataagtttcataattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 4737119  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  4737118 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaacttattttgacaccatggtgtcatttgatcttatccatatatatatat 4737034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10394278 - 10394112
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10394278 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtaatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 10394179  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10394178 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaattaattttgacaccatggtgtcatttgatc 10394112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 12281745 - 12281900
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  12281745 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtatcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttctaagcctttg 12281844  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12281845 gattaaatgaaatgaatgaataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggt 12281900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12281422 - 12281317
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12281422 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 12281324  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  12281323 ataaaaa 12281317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 4737543 - 4737648
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4737543 catatgtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttggaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 4737641  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  4737642 ataaaaa 4737648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15915361 - 15915294
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15915361 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttgggaaaataaaaa 15915294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 121
Target Start/End: Original strand, 10394643 - 10394709
Alignment:
Q  55 tttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394643 tttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 10394709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 25836354 - 25836455
Alignment:
Q  19 ggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataa 118  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25836354 ggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctaggaaaatttataaatttggggaaataa 25836452  T
Q  119 aaa 121  Q
    |||    
T  25836453 aaa 25836455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 9918225 - 9918328
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9918225 catagatatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagt--gagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 9918321  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  9918322 ataaaaa 9918328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 491232 - 491125
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgatt--atagaaatctgggaaaatttataaatttgggg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  491232 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaataagtttgagtatgattttatagaaatctgggaaaatatataaatatgggg 491134  T
Q  113 aaataaaaa 121  Q
    |||||||||    
T  491133 aaataaaaa 491125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 14481017 - 14480959
Alignment:
Q  65 aagtttgagtatgatt--atagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14481017 aagtttgagtatgattttatagaaatctgggaaaatatataaatttggggaaataaaaa 14480959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 23206191 - 23206261
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23206191 aatggctaggatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 23206261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11768870 - 11768830
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11768870 tgacaccatgatgtcatttgatcctatccctatatatatat 11768830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21145995 - 21145927
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatat 309  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21145995 aatggctaggatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatat 21145927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 24022878 - 24023087
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24022878 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgcttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 24022977  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24022978 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttgttgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaa-cc 24023076  T
Q  301 catatatatat 311  Q
    |||||||||||    
T  24023077 catatatatat 24023087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41273164 - 41272966
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41273164 ataaatttgaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 41273065  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaacc 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41273064 aatttggtgatagttttaagcctttgaattaaataaaatgaagggatgagatttgatgtcaaactaattttaacaccatggtgtcatttgatcctaacc 41272966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34654401 - 34654192
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34654401 ataaatttgaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatattttttttaattaggtgatagagagtattttgtgtatattaatt 34654302  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34654301 aatttggtgataattttaagtctttggattaaatgaaatgaatggataagatttgctgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatcct 34654202  T
Q  301 catatatata 310  Q
     |||||||||    
T  34654201 tatatatata 34654192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20054442 - 20054258
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20054442 tgtttgattatgaattaatgatgataaatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 20054343  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20054342 gattaaatgaaataaatggataaaagttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 20054258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 34654805 - 34654984
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  34654805 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgataaagagtatttggtgtatgttaattaatttggtgatagttttaagactttg 34654904  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34654905 gattaaatgaaatgaatgaataagatttggtgtcaa---aatt-tgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 34654984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Original strand, 14763210 - 14763379
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  14763210 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagctttaagccttta 14763309  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  14763310 gattaaataaaatgaatggataagatttggtgtcaaacttattttgacatcataatgtcatttgatccta 14763379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 163 - 297
Target Start/End: Original strand, 41273703 - 41273837
Alignment:
Q  163 ttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  41273703 ttaattaggtgatagagagtatttgatgtatattaattaatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaagggatgagatttaatgtcaa 41273802  T
Q  263 actaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaa 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41273803 actaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaa 41273837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Original strand, 20054903 - 20055048
Alignment:
Q  165 aattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaac 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  20054903 aattaggtgatagatagtatttggtgtatgttaattaatttggtgatagttttaaacttttggattaaatgaaatgaatggatgagattcgctgtaaaac 20055002  T
Q  265 taattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  20055003 taattttgacaccatggtgtcatttgatcat-atcccatatatatat 20055048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 311
Target Start/End: Original strand, 3583593 - 3583708
Alignment:
Q  196 taattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcct 295  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3583593 taattattttgtggatagttttaaacctttggattaaatgtgatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct 3583692  T
Q  296 aaccccatatatatat 311  Q
    | ||| ||||||||||    
T  3583693 atccctatatatatat 3583708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 311
Target Start/End: Original strand, 3583242 - 3583357
Alignment:
Q  196 taattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcct 295  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3583242 taattattttgtagatagttttaaacctttggattaaatgtgatgaatggatgagatttggtgtcaaattaattttgacaccatggtgtcatttgatcct 3583341  T
Q  296 aaccccatatatatat 311  Q
    | ||| ||||||||||    
T  3583342 atccctatatatatat 3583357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41273242 - 41273175
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41273242 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 41273175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29268035 - 29267934
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29268035 gatagttttaaacctttggattaaatgtgatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatata 29267937  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  29267936 tat 29267934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 20054768 - 20054873
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20054768 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttgggaaa 20054866  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  20054867 ataaaaa 20054873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 41273333 - 41273438
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41273333 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgactgtgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 41273431  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  41273432 ataaaaa 41273438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 166
Target Start/End: Original strand, 41273449 - 41273514
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaa 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41273449 ataaatttgggaaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaa 41273514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Original strand, 29268785 - 29268881
Alignment:
Q  215 tttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  29268785 tttaaacctttggattaaatataatgaatggatgagatttgatgtcaaattaattttgacaccatggtgtcatttgatcatatctctatatatatat 29268881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16846898 - 16846817
Alignment:
Q  215 tttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    |||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16846898 tttaaacctttgaattgaatataatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 16846817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 311
Target Start/End: Original strand, 16847624 - 16847738
Alignment:
Q  196 taattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcct 295  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||| ||| |||||||||   ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16847624 taattattttgtggataattttaaacatttggattaaatgtgttgaatagatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct 16847723  T
Q  296 aaccccatatatatat 311  Q
     | |||||||||||||    
T  16847724 -atcccatatatatat 16847738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34654519 - 34654412
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgatt--atagaaatctgggaaaatttataaatttgggg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34654519 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaataagtttgagtgtgattttatagaaatctgggaaaatatataaatttgggg 34654421  T
Q  113 aaataaaaa 121  Q
    |||||||||    
T  34654420 aaataaaaa 34654412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3582518 - 3582422
Alignment:
Q  215 tttaaacctttcgattaaatga-aatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  3582518 tttaaacctttggattaattaataatgaatgaataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatgatgtcatttgatcat-atcccatatatatat 3582422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14754256 - 14754163
Alignment:
Q  216 ttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  14754256 ttaaatctttggattaaatataatgaatagattagatttggtgtcaaactaattttgacacca--gtgtcatttgatcatatccctatatatatat 14754163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10092977 - 10092908
Alignment:
Q  242 atggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  10092977 atggttaagatttgatgtcaaatttagtttgacaccatggcgtcatttgatcatatccctatatatatat 10092908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14762797 - 14762764
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14762797 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgat 14762764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14762857 - 14762813
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14762857 gtttagaaaagaagtttgagtatgattgtagaaatttggggaaat 14762813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5881172 - 5881132
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5881172 tgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 5881132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 2054937 - 2055147
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2054937 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 2055036  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2055037 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagattttgtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccc 2055136  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  2055137 tatatatatat 2055147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 101 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36150535 - 36150338
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36150535 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttggtgtatattaatt 36150436  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaac 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36150435 aatttggttatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaac 36150338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34452449 - 34452239
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34452449 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 34452350  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34452349 aatttggtgatagttttaagcatttggattaaataaaatgaagggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 34452250  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  34452249 tatatatatat 34452239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 863405 - 863196
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  863405 ataaaattgaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 863306  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  863305 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcc 863207  T
Q  301 catatatatat 311  Q
    |||||||||||    
T  863206 catatatatat 863196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37875590 - 37875391
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37875590 ataaattttaggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaagtgatagagagtatttggtgtatattaatt 37875491  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37875490 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaagggatgagatttcgtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 37875391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 863844 - 864028
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  863844 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 863943  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  863944 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 864028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 36150979 - 36151163
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  36150979 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatgttaattaatttggtgatagttttaagtctttg 36151078  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36151079 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaactctatatatatat 36151163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 101 - 269
Target Start/End: Original strand, 27006239 - 27006407
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27006239 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttcattataaattaatgatgataaatatgtttcttaattaggtgatagagagtattttgtgtatattaatt 27006338  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaatt 269  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  27006339 aatttggtgatagttttaaatctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttggtatcaaacaaatt 27006407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2054528 - 2054345
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2054528 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgcatgttacttaatttggtgatagttttaaacctttg 2054429  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2054428 gattaaatgaaatgaatggataagatttagtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 2054345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8043241 - 8043081
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8043241 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagatatatttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 8043142  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtca 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8043141 aatttgatgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgaaatttgatgtca 8043081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 34452888 - 34453071
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  34452888 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagggagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 34452987  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34452988 aattaaatgaaatgaatggataaaatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 34453071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 133 - 311
Target Start/End: Original strand, 8043688 - 8043866
Alignment:
Q  133 attataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaa 232  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  8043688 attatgaattaatgattatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtaatagttttaagcctttggattaa 8043787  T
Q  233 atgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8043788 atgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 8043866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 37876030 - 37876215
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  37876030 tgtttgattatgaattaatgataatagatatgtttcttaattaggtgatagggagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 37876129  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataag-atttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37876130 gattaaataaaatgaagggatgagaatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccctatatatatat 37876215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 280
Target Start/End: Original strand, 7498176 - 7498344
Alignment:
Q  113 aaataaaaatggaatgtttgattata-aattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgat 211  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  7498176 aaataaaaaggggttgtttaattatataattaatgatgattaatatgttttttaattaggtgataaagagtatttgatatatgttaattaatttggtcat 7498275  T
Q  212 agttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatg 280  Q
    | |||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7498276 aattttaaacatttgaattaaaagaaatgaatggatgagatttgatgtcaaagtaattttgacaccatg 7498344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 311
Target Start/End: Original strand, 39830738 - 39830866
Alignment:
Q  178 agagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacacc 277  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  39830738 agagtattttgtgtatgttaattaattttgtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaattaattttgacac- 39830836  T
Q  278 atggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
       |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39830837 ---gtgtcatttgattctaa-cccatatatatat 39830866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 300
Target Start/End: Original strand, 7486774 - 7486949
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttctt-aattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaaccttt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  7486774 tgtttaattataaattaatgatgattaatatgtttttttaattaggtgataaagagtatttgatatatgttaattaatttggtcatagttttaagtcttt 7486873  T
Q  226 cgattaaatgaaatgaatggataaga-tttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
      || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  7486874 gaatcaaaagaaatgaatggatgagattttgatgtcaaagtgattttgacatcatggtgtcttttgatccttaccc 7486949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34452565 - 34452460
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34452565 cataggtatatgagttcaaccattcatttcataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 34452467  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  34452466 ataaaaa 34452460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36150651 - 36150546
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36150651 cataggtatatgagttctaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatatgggaaaatttataaatttggggaa 36150553  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
     ||||||    
T  36150552 gtaaaaa 36150546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 37875706 - 37875601
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37875706 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgaaaaaatttataaatttggggaa 37875608  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  37875607 ataaaaa 37875601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Original strand, 27006161 - 27006228
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27006161 gtttagaaaagaagtttgagtatgattataaaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 27006228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 24433332 - 24433434
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24433332 gatagttttaaacttttggattaaatgtgatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacatcatggtgtcatttgatcctatccctatatata 24433431  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  24433432 tat 24433434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Original strand, 19911108 - 19911193
Alignment:
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttga-tgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19911108 gattaaatgaaatgaatggataaaatttgggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccctatatatatat 19911193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 8043357 - 8043252
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8043357 cataggtatatgagttcaatcattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatatgggaaaatttataaatttggggaa 8043259  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  8043258 ataaaaa 8043252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38986075 - 38985979
Alignment:
Q  215 tttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38986075 tttaaacctttggattgaatataatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatagtgtcatttgatcctatccctatatatatat 38985979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Original strand, 38986802 - 38986898
Alignment:
Q  196 taattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgat 292  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  38986802 taattattttgtggatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgataccatgatgtcatttgat 38986898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 863482 - 863416
Alignment:
Q  55 tttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  863482 tttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatatgagaaaatttataaatttggggaaataaaaa 863416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27059267 - 27059166
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27059267 gataattttaaacctttggattaaatgtgatgaatggatgagatttggtgtgaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatata 27059169  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  27059168 tat 27059166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 27059977 - 27060079
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27059977 gatagctttaaacctttggattaaatataatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacactatggtatcatttgatcctatccctatatata 27060076  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  27060077 tat 27060079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24429703 - 24429608
Alignment:
Q  215 tttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24429703 tttaaacctttggattaaatataatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacacgatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 24429608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 311
Target Start/End: Original strand, 2868668 - 2868721
Alignment:
Q  257 tgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2868668 tgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 2868721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 8911833 - 8911903
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8911833 aatggttatgatttggtgtcaaatttaatttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 8911903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 2054888 - 2054921
Alignment:
Q  65 aagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2054888 aagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaat 2054921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 42849495 - 42849565
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42849495 aatggctaggatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 42849565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Original strand, 20203327 - 20203367
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  20203327 tgacaccatggtgtcatttgatcctatcccattatatatat 20203367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 101 - 296
Target Start/End: Original strand, 24306963 - 24307158
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24306963 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatattaatt 24307062  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24307063 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttgatgtcaaactaattttgacatcatggtgtcatttgatccta 24307158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 42489828 - 42490038
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42489828 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagatatgtttcttaatttggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 42489927  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42489928 aatttggtgataattttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatccc 42490027  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     | ||||||||    
T  42490028 tagatatatat 42490038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 30002414 - 30002624
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30002414 ataaatttggggaaataaaaatgaaatgtttgattataaattaatgatgatagatattttttttaattaggcgattgagagtatttggtgtatattaatt 30002513  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  30002514 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaatggatgagatttgatgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaacta 30002613  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  30002614 tatatatatat 30002624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36783958 - 36783749
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36783958 ataaatttggagaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 36783859  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  36783858 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaaaggatgaaatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtatcatttgatcctaa-cc 36783760  T
Q  301 catatatatat 311  Q
    |||||||||||    
T  36783759 catatatatat 36783749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 37706178 - 37706387
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37706178 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaataatgatagttatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtttatattaatt 37706277  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37706278 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaattaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatagtgtcatttgatcctaa-cc 37706376  T
Q  301 catatatatat 311  Q
    |||||||||||    
T  37706377 catatatatat 37706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 30469320 - 30469503
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  30469320 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttctaagcctttg 30469419  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30469420 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 30469503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 32022544 - 32022728
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  32022544 tgtttgattatgaatcaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagattatttgatgtatattaattaatttggtgatagttttaagcctttg 32022643  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  32022644 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcatatccctatatatatat 32022728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 101 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30468889 - 30468695
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30468889 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgat---aaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagaaaatatttggtgtatattaatt 30468793  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaac 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30468792 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaaatgatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaac 30468695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32021395 - 32021212
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  32021395 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttgattagatgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 32021296  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32021295 gattaaatgaaatgaatgggtaagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 32021212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 36784396 - 36784580
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  36784396 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttctaagcctttg 36784495  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36784496 gattaaatgaaatggatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtatcatttgatcctatccctatatatatat 36784580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24306522 - 24306353
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  24306522 tgtttaattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcttttg 24306423  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24306422 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 24306353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30001976 - 30001793
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  30001976 tgtttaattatgaattaatgatgataaatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 30001877  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30001876 gatgaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatagtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 30001793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42489387 - 42489222
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  42489387 tgtttgattatgaattaatgatgatatatatgtttcttaatcaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 42489288  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgat 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42489287 gattaaatgaaatgaatgaataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgat 42489222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 314 - 450
Target Start/End: Original strand, 229478 - 229614
Alignment:
Q  314 ctcagagataggagacatattgctcatcatgtttcttcctcaatttcgagcagtgtcaaaagtgaatataccacaattcttgagaattccacatttttgt 413  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  229478 ctcagatataggagacatattgttcatcatgtttcttcctcaatttggagcaatgtcaaaagtgaatataccacatttcatgagaattccacatgtttgt 229577  T
Q  414 taggaaatggggaaaatatcaagttctagactgatag 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  229578 taggaaatggggaaaatatcaagttctggactgatag 229614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30469005 - 30468900
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30469005 catagctatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 30468907  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  30468906 ataaaaa 30468900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 24306847 - 24306952
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24306847 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggagaa 24306945  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  24306946 ataaaaa 24306952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 30002298 - 30002403
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30002298 cataggtatatgagttaaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgagaaaatttataaatttggggaa 30002396  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  30002397 ataaaaa 30002403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 42489712 - 42489817
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42489712 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctaggaaaatttataaatttggggaa 42489810  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  42489811 ataaaaa 42489817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 30470970 - 30471071
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30470970 gatagttttaaacctttgaattaaatgtgatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatata 30471068  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  30471069 tat 30471071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 37706105 - 37706167
Alignment:
Q  59 gaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706105 gaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 37706167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32022219 - 32022114
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32022219 cataggtgtatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttcgggaa 32022121  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  32022120 ataaaaa 32022114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36784074 - 36783969
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36784074 cataagtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagaatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttgggaaa 36783976  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  36783975 ataaaaa 36783969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26928656 - 26928582
Alignment:
Q  139 aattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatag 213  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26928656 aattaatgatgatatatatgttttttaattaagtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatag 26928582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30470204 - 30470127
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtca 286  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30470204 gatagctttaaacctttggattaaatataatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtca 30470127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Original strand, 21415389 - 21415461
Alignment:
Q  239 tgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21415389 tgaatggatgagatttggtgtcatatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctaaccctatatatatat 21415461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3219391 - 3219294
Alignment:
Q  213 gttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||| ||||||  ||||| | | | | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3219391 gttttaagcctttagattaaacaaattgaatggatgagatttagtgtcatatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctaa-cccatatatatat 3219294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30659914 - 30659844
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30659914 aatggttatgatttggtgtcaaatttaatttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 30659844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 31179915 - 31179985
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31179915 aatggttaagatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 31179985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43334189 - 43334119
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  43334189 aatggttatgatttgatgtcaaacttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccatatatatatat 43334119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38059906 - 38059835
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatatt 312  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38059906 aatggctaggatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatatt 38059835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3162928 - 3162858
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3162928 aatggttaggatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 3162858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 3163494 - 3163563
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3163494 aatggttatgatttggtgtcaaatttaatttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 3163563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32022103 - 32022073
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgttt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32022103 ataaatttggggaaataaaaatggaatgttt 32022073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 309
Target Start/End: Original strand, 46428145 - 46428183
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatat 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  46428145 tgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatat 46428183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 311
Target Start/End: Original strand, 8513469 - 8513530
Alignment:
Q  250 gatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8513469 gatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 8513530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24081653 - 24081458
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24081653 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtgtgattataaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 24081554  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24081553 aatttggtgatagttttaaacctttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaattaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 24081458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 48644687 - 48644897
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48644687 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaaataggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 48644786  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48644787 aatttggtgatagttttaagtctttggattaaataaaatgaagggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 48644886  T
Q  301 catatatatat 311  Q
     ||||||||||    
T  48644887 tatatatatat 48644897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 299
Target Start/End: Original strand, 51661213 - 51661411
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51661213 ataaacttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 51661312  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaacc 299  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51661313 aatttagtgatatttttaagcctttggattaaataaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaacc 51661411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39870261 - 39870052
Alignment:
Q  102 taaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39870261 taaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttagtatatattaatta 39870162  T
Q  202 atttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaacccc 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  39870161 atttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatgaaatgatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggcgtcatttgatcctaaccct 39870062  T
Q  302 atatatatat 311  Q
    ||||||||||    
T  39870061 atatatatat 39870052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 101 - 300
Target Start/End: Original strand, 23173897 - 23174095
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23173897 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaacgatgatagatatttttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 23173996  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23173997 aatttggtgatagttttaagcctttggattaaataaaatg-agggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaaccc 23174095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 101 - 296
Target Start/End: Original strand, 31151290 - 31151485
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31151290 ataaatttgggaaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgataaagatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtatatattaatt 31151389  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31151390 aatttggtgatagttttaaacttttggattaaatgaaatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgataccatggtgtcatttgatccta 31151485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23601923 - 23601739
Alignment:
Q  113 aaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgata 212  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23601923 aaataagaagggattgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatgttaattaatttggtgata 23601824  T
Q  213 gttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaa 297  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23601823 gttttaagccttttgattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctaa 23601739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31150851 - 31150667
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31150851 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgttttttaatcaggtgattgagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 31150752  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31150751 gattaaataaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccattgtgtcatttgatcctatccctatatatatat 31150667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23173457 - 23173288
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  23173457 tgtttgattatgaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagggagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 23173358  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23173357 gattaaatgaaatgaatggataagatttagtgtcaaactaattttgacaccatgatgtcatttgatccta 23173288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 39870693 - 39870859
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  39870693 tgtttgattatgaattaatgatgatatatatgtttcttaattaggtgatagtgagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 39870792  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatc 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39870793 gattaaatgaaatgaattgataagatttggtgtcaaactaaatttgacaccatggtgtcatttgatc 39870859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 48577438 - 48577621
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  48577438 tgtttgattatgaattaataatgatagatatgtttcttaataagatgaaaaagagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 48577537  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48577538 gattaaatggaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 48577621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 51660774 - 51660592
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||     
T  51660774 tgtttgattatgaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatgttaattaatttgg---tagttttaagcctttg 51660678  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatg-gtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  51660677 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgacaaactaattttgacaccatgtgtgtcatttgatcctatccatatatatatat 51660592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 144 - 301
Target Start/End: Original strand, 24082096 - 24082253
Alignment:
Q  144 atgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24082096 atgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagaatatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttggattaaatgaaatgaat 24082195  T
Q  244 ggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaacccc 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24082196 ggataagatttggtgtcaaactaattttgataccatgatgtcatttgatcctatcccc 24082253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 101 - 220
Target Start/End: Original strand, 18249168 - 18249287
Alignment:
Q  101 ataaatttggggaaataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18249168 ataaatttggggaaataaaaatagaatgtttgattataaattaataatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttgatgtatattaatt 18249267  T
Q  201 aatttggtgatagttttaaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18249268 aatttggtgatagttttaaa 18249287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 23602233 - 23602371
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23602233 cataggtatatgagttctaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatatgggaaaatttataaatttggggaa 23602331  T
Q  115 ataaaaatggaatgtttgattataaattaatgatgataga 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23602332 ataaaaatggaatgtttgattataaattaatgataataga 23602371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Original strand, 23602367 - 23602505
Alignment:
Q  174 atagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaatta--- 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||       
T  23602367 atagagaatatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttgaattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaa--aattagtt 23602464  T
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23602465 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccctatatatatat 23602505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 23173780 - 23173886
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23173780 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaaagtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 23173879  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  23173880 ataaaaa 23173886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 18249021 - 18249126
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249021 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 18249119  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  18249120 ataaaaa 18249126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24081769 - 24081664
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24081769 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttgagtatgattatataaatctgggaaaatttataaatttggggaa 24081671  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  24081670 ataaaaa 24081664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 51661097 - 51661202
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51661097 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttaaaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttgggaaa 51661195  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  51661196 ataaaaa 51661202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 39870340 - 39870273
Alignment:
Q  54 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39870340 gtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctggaaaaatttataaatttggggaaataaaaa 39870273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 4595540 - 4595642
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  4595540 gatagctttaaacctttggattaaatataatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcctatcccattatata 4595639  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  4595640 tat 4595642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Original strand, 40959736 - 40959823
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40959736 gatagctttaaacctttggattaaatataatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 40959823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 31151174 - 31151279
Alignment:
Q  15 cataggtatatgagttctaccatttattttatnnnnnnngtttagaaaagaagtttgagtatgattatagaaatctgggaaaatttataaatttggggaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  31151174 cataggtatatgagttcaaccattcattttataaaaaa-gtttagaaaaaaagtttaagtatgattatagaaatctgagaaaatttataaatttgggaaa 31151272  T
Q  115 ataaaaa 121  Q
    |||||||    
T  31151273 ataaaaa 31151279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4594797 - 4594710
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4594797 gatagttttaaacctttgaattaaatgtgatgaatggatgaaatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 4594710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40958978 - 40958891
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  40958978 gatagttttaaacctttgaattaaatgtgatgaatggatgggatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtatcatttgatccta 40958891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Original strand, 50505366 - 50505446
Alignment:
Q  213 gttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatc 293  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  50505366 gttttaagcctttggattaaaggaaataaatggatgagatttgatgtcaaaataattttgacaccacggtattatttgatc 50505446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Original strand, 21791478 - 21791548
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatatt 312  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21791478 aatggttaagatttggtgtcaaatttaatttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatatt 21791548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5216620 - 5216550
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5216620 aatggttaagatttggtatcaaatttaatttgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 5216550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14886181 - 14886141
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14886181 tgacaccatggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 14886141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16317645 - 16317541
Alignment:
Q  207 gtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatata 306  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||||||| | ||| | | | | |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  16317645 gtgattgttttaagcctttggattaaacaaattaaatggataagatttggtctcacatttaatttgacaccatgatgtcatttgatcttatccctatata 16317546  T
Q  307 tatat 311  Q
    |||||    
T  16317545 tatat 16317541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21790809 - 21790739
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21790809 aatggttatgatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 21790739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 306
Target Start/End: Original strand, 44672106 - 44672184
Alignment:
Q  228 attaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatata 306  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  44672106 attaaatgtaatgaatagatgatatttggtgtcaaactaattttaccaccatgatgtcatttgatcttatccctatata 44672184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5496574 - 5496534
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5496574 tgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 5496534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17606292 - 17606252
Alignment:
Q  271 tgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17606292 tgacaccttggtgtcatttgatcctatccctatatatatat 17606252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 121
Target Start/End: Original strand, 48644648 - 48644676
Alignment:
Q  93 gaaaatttataaatttggggaaataaaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48644648 gaaaatttataaatttggggaaataaaaa 48644676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8584 - 8401
Alignment:
Q  127 tgtttgattataaattaatgatgatagatatgtttcttaattaggtgatagagagtatttggtgtatattaattaatttggtgatagttttaaacctttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8584 tgtttgattatgaattaatgataatagatatgtttcttaattaggtgatagggagtatttgatgtatgttaattaatttggtgatagttttaagcctttg 8485  T
Q  227 gattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8484 gattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 8401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1339 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1339
Description:

Target: scaffold1339; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2009 - 1906
Alignment:
Q  207 gtgatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatata 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  2009 gtgatagttttaagcctttggattaaatgaaatgaatggataagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgttatttgatcct-atcccatata 1911  T
Q  307 tatat 311  Q
    |||||    
T  1910 tatat 1906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22046 - 21944
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatata 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  22046 gatagctttaaacctttggattaaatataatgaatggatgagatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtatcatttgatcctatccctatatata 21947  T
Q  309 tat 311  Q
    |||    
T  21946 tat 21944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Original strand, 22732 - 22819
Alignment:
Q  209 gatagttttaaacctttcgattaaatgaaatgaatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatccta 296  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22732 gatagttttaaacctttgaattaaatgtgatgaatggatgaaatttggtgtcaaactaattttgacaccatggtgtcatttgatccta 22819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 105569 - 105500
Alignment:
Q  241 aatggataagatttgatgtcaaactaattatgacaccatggtgtcatttgatcctaaccccatatatatat 311  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | | | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  105569 aatggttaagatttggtgtcaaatttaatttgacaccttggtgtcatttgatcct-atcccatatatatat 105500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University