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Alignment Overview

Query: NF1441R-Insertion-1 (Length: 872)

Name: NF1441R-Insertion-1
Description: NF1441R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1441R-Insertion-1
NF1441R-Insertion-1
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (8-335)||(29325081-29325406)
chr7 (8-185)||(28964658-28964835)
chr7 (337-534)||(19217627-19217825)
chr7 (195-335)||(28964566-28964704)
chr7 (337-534)||(29186664-29186862)
chr7 (337-534)||(43113674-43113872)
chr7 (337-534)||(29187950-29188148)
chr7 (338-530)||(18787149-18787342)
chr7 (337-534)||(7011633-7011832)
chr7 (337-534)||(7026991-7027190)
chr7 (337-523)||(13750567-13750754)
chr7 (337-534)||(9392735-9392933)
chr7 (337-534)||(18788480-18788678)
chr7 (337-534)||(27072574-27072772)
chr7 (337-534)||(27205541-27205739)
chr7 (337-534)||(43962489-43962687)
chr7 (337-534)||(44417457-44417655)
chr7 (340-534)||(3537429-3537624)
chr7 (337-531)||(48792443-48792638)
chr7 (337-531)||(48793439-48793634)
chr7 (337-534)||(44420443-44420640)
chr7 (337-531)||(9391519-9391714)
chr7 (337-535)||(44230427-44230626)
chr7 (340-534)||(44746729-44746924)
chr7 (337-534)||(32519669-32519867)
chr7 (340-534)||(45399930-45400125)
chr7 (337-534)||(13597144-13597341)
chr7 (354-534)||(32518438-32518610)
chr7 (337-534)||(37237148-37237343)
chr7 (337-534)||(3538493-3538681)
chr7 (341-447)||(12630507-12630614)
chr7 (417-534)||(44748483-44748600)
chr7 (633-748)||(40918040-40918151)
chr7 (337-413)||(42611435-42611511)
chr7 (337-413)||(45688867-45688943)
chr7 (337-534)||(43960945-43961131)
chr7 (360-534)||(12630586-12630762)
chr7 (337-418)||(44231879-44231960)
chr7 (337-464)||(37235813-37235941)
chr7 (331-402)||(27071014-27071085)
chr7 (331-402)||(27207228-27207299)
chr7 (338-402)||(7057382-7057446)
chr7 (619-789)||(19218649-19218816)
chr7 (417-530)||(26005432-26005545)
chr7 (337-403)||(26006795-26006861)
chr7 (337-410)||(19008931-19009004)
chr7 (415-523)||(43115018-43115126)
chr7 (337-426)||(19016725-19016815)
chr7 (618-702)||(22794094-22794175)
chr7 (338-387)||(26005412-26005461)
chr7 (618-702)||(29408995-29409076)
chr7 (618-702)||(29657272-29657353)
chr7 (337-385)||(43115097-43115144)
chr7 (419-466)||(13599246-13599293)
chr7 (485-534)||(13599177-13599226)
chr7 (622-670)||(29658397-29658446)
chr7 (622-718)||(43006676-43006769)
chr7 (618-666)||(4973838-4973887)
chr7 (356-385)||(13599268-13599297)
chr7 (340-405)||(45398545-45398610)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (8-335)||(35089413-35089740)
chr1 (618-872)||(40187893-40188149)
chr1 (618-848)||(50483877-50484107)
chr1 (337-547)||(40187603-40187813)
chr1 (337-534)||(51693147-51693345)
chr1 (337-534)||(5488787-5488985)
chr1 (337-531)||(51468339-51468534)
chr1 (337-534)||(52086627-52086823)
chr1 (338-530)||(5488502-5488695)
chr1 (360-534)||(7111395-7111570)
chr1 (343-534)||(50484916-50485108)
chr1 (337-534)||(7110226-7110424)
chr1 (337-537)||(18819262-18819463)
chr1 (360-534)||(17244198-17244373)
chr1 (345-524)||(45228283-45228463)
chr1 (330-534)||(51468821-51469026)
chr1 (360-534)||(52087694-52087869)
chr1 (337-534)||(1823216-1823410)
chr1 (340-534)||(45229523-45229718)
chr1 (337-534)||(52759363-52759561)
chr1 (337-534)||(50483511-50483708)
chr1 (416-534)||(52761516-52761634)
chr1 (671-776)||(40722141-40722246)
chr1 (354-469)||(38235134-38235250)
chr1 (341-467)||(47532961-47533088)
chr1 (338-431)||(25181502-25181596)
chr1 (337-468)||(17245651-17245782)
chr1 (339-534)||(47533774-47533970)
chr1 (337-405)||(18820806-18820874)
chr1 (360-534)||(1821931-1822107)
chr1 (672-768)||(40722712-40722808)
chr1 (618-702)||(49619578-49619659)
chr1 (619-789)||(51694169-51694336)
chr1 (733-789)||(50484052-50484108)
chr1 (481-534)||(21203156-21203209)
chr1 (618-718)||(16217727-16217823)
chr1 (337-389)||(52761602-52761654)
chr1 (622-666)||(40779431-40779476)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (618-872)||(54353314-54353569)
chr3 (337-547)||(54353023-54353234)
chr3 (331-534)||(31937029-31937233)
chr3 (337-534)||(28777607-28777805)
chr3 (337-534)||(31938227-31938425)
chr3 (337-534)||(23073294-23073492)
chr3 (337-534)||(2233225-2233423)
chr3 (330-534)||(43393973-43394179)
chr3 (337-534)||(46903544-46903742)
chr3 (340-531)||(46902334-46902526)
chr3 (337-534)||(21727910-21728108)
chr3 (340-534)||(52521930-52522124)
chr3 (337-534)||(54354311-54354509)
chr3 (338-534)||(35759151-35759348)
chr3 (338-534)||(37609322-37609519)
chr3 (360-534)||(17742212-17742388)
chr3 (360-534)||(19043532-19043708)
chr3 (355-534)||(47431107-47431287)
chr3 (340-534)||(5691015-5691209)
chr3 (337-534)||(2232602-2232800)
chr3 (337-526)||(11348399-11348589)
chr3 (337-534)||(17116202-17116399)
chr3 (337-534)||(28776448-28776646)
chr3 (337-534)||(10979095-10979293)
chr3 (337-467)||(23091191-23091322)
chr3 (338-534)||(11346813-11347010)
chr3 (338-534)||(53180724-53180920)
chr3 (338-471)||(53765949-53766083)
chr3 (339-471)||(52525342-52525475)
chr3 (340-534)||(55209785-55209979)
chr3 (340-471)||(53764432-53764563)
chr3 (338-534)||(47429628-47429820)
chr3 (340-448)||(23072063-23072171)
chr3 (360-531)||(47917536-47917707)
chr3 (337-471)||(50881092-50881227)
chr3 (354-534)||(21729108-21729289)
chr3 (337-530)||(5689725-5689913)
chr3 (362-534)||(17740862-17741028)
chr3 (362-534)||(19042182-19042348)
chr3 (419-534)||(37610683-37610798)
chr3 (337-469)||(53178701-53178834)
chr3 (340-467)||(15290476-15290604)
chr3 (341-448)||(43392630-43392738)
chr3 (331-468)||(17117387-17117523)
chr3 (330-468)||(46986077-46986215)
chr3 (337-403)||(34014508-34014574)
chr3 (337-402)||(24376481-24376546)
chr3 (424-534)||(10978093-10978203)
chr3 (417-534)||(35758085-35758202)
chr3 (360-435)||(50879517-50879593)
chr3 (337-412)||(53101816-53101891)
chr3 (337-413)||(27750473-27750549)
chr3 (337-397)||(34015826-34015886)
chr3 (431-534)||(50879782-50879885)
chr3 (398-466)||(33113306-33113376)
chr3 (618-702)||(36627192-36627272)
chr3 (482-530)||(53764896-53764944)
chr3 (338-405)||(27749107-27749174)
chr3 (416-530)||(55210832-55210946)
chr3 (339-412)||(53101545-53101617)
chr3 (337-389)||(35758064-35758116)
chr3 (340-384)||(37610797-37610841)
chr3 (354-396)||(21729380-21729422)
chr3 (360-390)||(23072142-23072172)
chr3 (484-534)||(33111765-33111815)
chr3 (230-286)||(34087426-34087481)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (635-859)||(48500797-48501022)
chr4 (337-531)||(22621867-22622062)
chr4 (337-534)||(7261463-7261661)
chr4 (337-534)||(38032340-38032538)
chr4 (337-533)||(17356361-17356558)
chr4 (337-534)||(34095579-34095777)
chr4 (337-534)||(38031168-38031366)
chr4 (337-531)||(8815280-8815475)
chr4 (337-531)||(10802889-10803084)
chr4 (360-534)||(48499387-48499562)
chr4 (337-534)||(8814135-8814332)
chr4 (368-534)||(22623063-22623230)
chr4 (337-534)||(10804115-10804313)
chr4 (341-534)||(48501244-48501437)
chr4 (337-471)||(56233724-56233859)
chr4 (340-523)||(17357794-17357978)
chr4 (336-526)||(35191816-35192007)
chr4 (338-534)||(23757890-23758088)
chr4 (358-534)||(5433327-5433504)
chr4 (337-534)||(18091580-18091778)
chr4 (355-506)||(35193144-35193296)
chr4 (337-534)||(56234941-56235138)
chr4 (340-447)||(48081597-48081705)
chr4 (337-442)||(48080270-48080376)
chr4 (337-413)||(34122844-34122920)
chr4 (337-413)||(48463026-48463102)
chr4 (330-413)||(34121292-34121375)
chr4 (355-432)||(48081552-48081630)
chr4 (364-534)||(36074714-36074885)
chr4 (230-329)||(29795659-29795763)
chr4 (620-702)||(5547177-5547256)
chr4 (11-116)||(29795853-29795957)
chr4 (691-782)||(23757622-23757712)
chr4 (618-702)||(37642292-37642373)
chr4 (437-534)||(35927036-35927133)
chr4 (328-376)||(22624389-22624437)
chr4 (618-718)||(55953101-55953198)
chr4 (712-783)||(5433072-5433143)
chr4 (711-789)||(17522251-17522329)
chr4 (618-698)||(54373766-54373843)
chr4 (339-390)||(48081392-48081443)
chr4 (672-718)||(1273151-1273197)
chr4 (739-789)||(5236573-5236623)
chr4 (340-413)||(48462145-48462219)
chr4 (485-534)||(35925840-35925889)
chr4 (618-662)||(48481198-48481243)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (618-794)||(39349851-39350027)
chr5 (337-534)||(39349480-39349678)
chr5 (337-534)||(39350565-39350763)
chr5 (337-530)||(19229997-19230191)
chr5 (339-534)||(19228840-19229036)
chr5 (331-534)||(18654290-18654495)
chr5 (337-547)||(9083203-9083414)
chr5 (337-534)||(12372314-12372512)
chr5 (337-529)||(18655577-18655770)
chr5 (340-534)||(13278151-13278346)
chr5 (337-534)||(9081979-9082177)
chr5 (337-467)||(12373708-12373839)
chr5 (337-513)||(13276819-13276996)
chr5 (337-534)||(39164061-39164252)
chr5 (337-468)||(6803610-6803742)
chr5 (336-444)||(8447076-8447185)
chr5 (340-435)||(6801977-6802073)
chr5 (418-534)||(4031903-4032019)
chr5 (618-702)||(30915759-30915840)
chr5 (337-412)||(35952479-35952554)
chr5 (793-872)||(39349966-39350047)
chr5 (419-533)||(4032946-4033060)
chr5 (338-405)||(25001643-25001710)
chr5 (618-696)||(33362346-33362420)
chr5 (691-755)||(1011185-1011249)
chr5 (618-702)||(30915873-30915954)
chr5 (630-719)||(25001908-25001996)
chr5 (337-389)||(4031881-4031933)
chr5 (729-788)||(25002194-25002252)
chr5 (481-534)||(12373637-12373690)
chr5 (622-670)||(14356722-14356771)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (337-534)||(35205-35403)
scaffold0141 (336-534)||(31032-31231)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (337-534)||(79409-79607)
scaffold0049 (336-534)||(83581-83780)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (340-534)||(30640801-30640995)
chr8 (716-859)||(41637340-41637484)
chr8 (337-534)||(9244065-9244263)
chr8 (337-534)||(41636831-41637029)
chr8 (338-534)||(522017-522214)
chr8 (337-534)||(9245351-9245550)
chr8 (337-534)||(26364741-26364939)
chr8 (337-530)||(26366118-26366312)
chr8 (618-732)||(41637209-41637323)
chr8 (337-534)||(41638073-41638270)
chr8 (340-534)||(30644625-30644819)
chr8 (337-534)||(20308923-20309121)
chr8 (337-534)||(21095556-21095754)
chr8 (339-534)||(34642667-34642862)
chr8 (337-467)||(43584408-43584539)
chr8 (337-534)||(20309971-20310170)
chr8 (337-534)||(21096604-21096803)
chr8 (671-789)||(20066411-20066529)
chr8 (340-468)||(43585930-43586059)
chr8 (338-534)||(34643885-34644076)
chr8 (672-768)||(20066926-20067022)
chr8 (618-743)||(12819811-12819933)
chr8 (337-413)||(3714562-3714638)
chr8 (360-435)||(31202989-31203065)
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chr8 (492-534)||(31203071-31203113)
chr8 (686-743)||(4808052-4808107)
chr8 (618-666)||(42307757-42307806)
chr8 (337-405)||(22012157-22012225)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (337-534)||(34995352-34995549)
chr6 (337-534)||(11801262-11801460)
chr6 (337-534)||(32713803-32714001)
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chr6 (339-534)||(34996681-34996877)
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chr6 (337-534)||(32347808-32348006)
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chr6 (337-405)||(29477759-29477827)
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chr6 (481-534)||(27719880-27719933)
chr6 (618-702)||(682537-682618)
chr6 (230-329)||(3088185-3088289)
chr6 (437-534)||(21094506-21094603)
chr6 (485-534)||(21095299-21095348)
chr6 (338-405)||(19788248-19788315)
chr6 (618-670)||(18499681-18499734)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (337-547)||(23832968-23833178)
chr2 (337-534)||(16602725-16602923)
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chr2 (337-411)||(5033478-5033552)
chr2 (398-467)||(38242944-38243014)
chr2 (337-413)||(5034858-5034934)
chr2 (355-400)||(43814599-43814644)
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chr2 (375-418)||(15496083-15496126)
chr2 (481-534)||(370907-370960)
[»] scaffold1425 (2 HSPs)
scaffold1425 (337-534)||(1521-1719)
scaffold1425 (337-534)||(134-332)
[»] scaffold0878 (3 HSPs)
scaffold0878 (337-534)||(2946-3145)
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[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (337-467)||(25332-25463)
scaffold0018 (485-534)||(25264-25313)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
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scaffold0026 (490-534)||(104405-104449)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (633-748)||(54944-55055)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (618-702)||(98321-98402)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (481-534)||(9302-9355)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
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[»] scaffold0081 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 8 - 335
Target Start/End: Original strand, 29325081 - 29325406
Alignment:
Q  8 aggattaaaccatcacatgaatgatttatgcaaagatcatcaacaaagatgattaccacccactgcatcagactttaagattgtgaagattttacgcatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29325081 aggattaaaccatcacatgaatgatttatgcaaagatcatcaacaaagatgattaccacccactgcatcagactctaagattgtgaagattttacgcatg 29325180  T
Q  108 tgagccacccgagatctgggctttagcccaaatcagcttgtacaactgaaaatttaacttagctatatatagatctcaagtacaactatcagcttgcaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29325181 tgagccacccgagatctgggctttagcccaaatcagcttgtacaactgaaaatttaacttagctatatatagatctcaagtacagctatcagcttgcaca 29325280  T
Q  208 gccgaaaatttaccttagctacatatagatatcaagttaacaaccaaagtatttaactcaaaaattaaatttactttttcaaaaagcttccacatgtcat 307  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325281 gccgaaaatttaccttcgctgcatatagatctcaagttaacaaccaaagtatttaactc--aaattaaatttactttttcaaaaagcttccacatgtcat 29325378  T
Q  308 attttatcacaaaaaattacataaaaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325379 attttatcacaaaaaattacataaaaaa 29325406  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28964835 - 28964658
Alignment:
Q  8 aggattaaaccatcacatgaatgatttatgcaaagatcatcaacaaagatgattaccacccactgcatcagactttaagattgtgaagattttacgcatg 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28964835 aggattaaaccattacatgaatgagttatgcaaagatcatcaacaaagatgattaccacccactgcatcatactctaagattgtgaagattttacgcatg 28964736  T
Q  108 tgagccacccgagatctgggctttagcccaaatcagcttgtacaactgaaaatttaacttagctatatatagatctca 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28964735 tgagccacccgagatctgggctttagcccaaatcagcttgcacagctgaaaatttaccttagctatatatagatctca 28964658  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 19217627 - 19217825
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19217627 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccattaacttatttctttta 19217726  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19217727 ttcaatttggtacaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcggattttatagtgtatcaccaacacctaa 19217825  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28964704 - 28964566
Alignment:
Q  195 atcagcttgcacagccgaaaatttaccttagctacatatagatatcaagttaacaaccaaagtatttaactcaaaaattaaatttactttttcaaaaagc 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28964704 atcagcttgcacagctgaaaatttaccttagctatatatagatctcaggttaacaaccaaagtatttaactcaaa--ttaaatttactttttcaaaaagc 28964607  T
Q  295 ttccacatgtcatattttatcacaaaaaattacataaaaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28964606 ttccacatgtcatattttatcacaaaaaattacataaaaaa 28964566  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 29186664 - 29186862
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  29186664 ggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttatttta 29186763  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29186764 ttcaatttggttcaattttgataattttaatcccttaaaaaatgagaccgtaggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 29186862  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 43113674 - 43113872
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43113674 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 43113773  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43113774 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccagcacctaa 43113872  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 29188148 - 29187950
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  29188148 ggcttaaatgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttatttta 29188049  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29188048 ttcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattgcagaggtctatcagattttatagtgcatcaccaacacctaa 29187950  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 338 - 530
Target Start/End: Original strand, 18787149 - 18787342
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttac 436  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  18787149 gcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttgtttaatttggtcccataaatcttaactttttcaaatatgtcccttaacttatttcttttat 18787248  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacac 530  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18787249 tcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaatagaccgttggattacggaggtttatcagattttatggtgtatcaccaacac 18787342  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 7011633 - 7011832
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7011633 ggcttaattgatctgtcagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacatgtcccttagcttatttctttta 7011732  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccct-nnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||  |          |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7011733 ttcaatttggtccaattttgataattttaatccattaaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 7011832  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 7026991 - 7027190
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7026991 ggcttaattgatctgtcagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacatgtcccttagcttatttctttta 7027090  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccct-nnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||  |          |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7027091 ttcaatttggtccaattttgataattttaatccattaaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 7027190  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 13750754 - 13750567
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13750754 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 13750655  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatca 523  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13750654 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctattagattttatagtgtatca 13750567  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9392933 - 9392735
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9392933 ggcttaattgatcttccgttcctttaacttatttcttttatttaatttattcctataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 9392834  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  9392833 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctagaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccggcacctaa 9392735  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18788678 - 18788480
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18788678 ggcttaattgatatgccggtcccttaatttatttcttttattcaatatggtcctataaatcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 18788579  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||         ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18788578 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaatagaccgttggattacgaaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaa 18788480  T

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Target: chr7; HSP #14
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
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T  27072772 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 27072673  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  27072672 ttcaatttggtcaaattttgataattttaatccactaaaaaaaaaaaccgttggattacagaggtctataagattttatagtttatcaccaacacctaa 27072574  T

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Target: chr7; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 337 - 534
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27205541 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 27205640  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  27205641 ttcaatttggtcaaattttgataattttaatccactaaaaaaaaaaaccgttggattacagaggtctataagattttatagtctatcaccaacacctaa 27205739  T

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Target: chr7; HSP #16
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43962687 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttagctttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 43962588  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||         ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||    
T  43962587 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcatctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtatatcactaacacctaa 43962489  T

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Target: chr7; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 44417457 - 44417655
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| ||||     
T  44417457 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaacattctcaaacacgtcccttaacttatttattttc 44417556  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  44417557 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagattgttggattacggaggtctatcagattttatagtctatcaccaacacctaa 44417655  T

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Target: chr7; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Original strand, 3537429 - 3537624
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Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  3537429 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 3537528  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  3537529 aatttagtctaattttaataattttaatcccctaaaaaaagaaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtatatcaccatcacctaa 3537624  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 337 - 531
Target Start/End: Original strand, 48792443 - 48792638
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48792443 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttttcaaacatgtcccttaacttatttctttta 48792542  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
     |||||||| || |||||| |||||||||||| |||         ||||||||||||||   ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  48792543 ttcaatttgatctaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaagggtgtataagattttatagtgtatcaccaacacc 48792638  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 337 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 48793634 - 48793439
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  48793634 ggcttaattgatttgccggtcccttaacttatttcttttattcattttggtcccataagtcttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttta 48793535  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  48793534 ttcaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtgtataagattttatagtgtatcaccaacacc 48793439  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 44420640 - 44420443
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44420640 ggcttaattgatatgccgatcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 44420541  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||          |||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  44420540 ttcaatttagtccaattttgataattttaatgccctaaaaaaagataccgttggattacgaaggtctatcaga-tttatagtgtatcaccaacatctaa 44420443  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 531
Target Start/End: Original strand, 9391519 - 9391714
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  9391519 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataaatcttaattttctcaaacacgtcccttcacttatttctttta 9391618  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |         ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  9391619 ttcaatttggtacaattttgataattttaatcctttaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacc 9391714  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 337 - 535
Target Start/End: Original strand, 44230427 - 44230626
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcctt-aacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  44230427 ggcttaattgatctgccgatcccttagattatttcttttattcaatttagttccataagttttaactttctcaatcacgtcctttaacttatttctttta 44230526  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaaa 535  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||         |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  44230527 ttcaatttggtccaattttaataatttcaatcccctacgaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttacagtgtatcatcaacacctaaa 44230626  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Original strand, 44746729 - 44746924
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  44746729 ttaattgatctgtcggtctcttaacttattttttttattcaatttgatcttataagtcttaattttctcaaacatgttcgttaacttatttcttttattc 44746828  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  44746829 aatttggtcaaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcatattttatagtgtattatcaacacctaa 44746924  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 32519867 - 32519669
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  32519867 ggctaaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacatcccttaaattatttctttta 32519768  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  32519767 ttcaatttggttcaattttaataattttaatcccttaaaaaaagagaccgttgaattacgaaggtctaccagattgtatagtgtgtcaccaacacctaa 32519669  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 45400125 - 45399930
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||  ||  |||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |     
T  45400125 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttgtttattttgatttggtctcataactcttaacttttgcaaacacgtcccttaacttatttcttttattt 45400026  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45400025 actttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaa 45399930  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 13597144 - 13597341
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  13597144 ggcttaattgaactgccgatcctttaacgtatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtccctgaacttatttctttta 13597243  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     | |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||          | |||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13597244 ttaaatttgat-caattttgataattttaatcctctaaaaaaagatatcgttggattagggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 13597341  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 354 - 534
Target Start/End: Original strand, 32518438 - 32518610
Alignment:
Q  354 ggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatt 452  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |        
T  32518438 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaaattatttcttttattcaatttggttc---- 32518533  T
Q  453 tttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
         ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32518534 -----aattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 32518610  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 37237343 - 37237148
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  37237343 ggcttaattgatctgcccgtcccttaatttatttcttttatttaatttggtctcataagtcttaactctctcaaacacatcccttaacttatt--tttta 37237246  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||         || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37237245 ttaaatttggtccaattttgataa-tttaatcctctaaaaaaagagatcgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatgaccaacacctaa 37237148  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3538681 - 3538493
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  3538681 ggcttaattgatccgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcttttcacttatttctttta 3538582  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
              | ||||||| ||||||||| ||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  3538581 ----------ttcaattttgataattttagtcccctaaaaaaagagaccgttggattacggagatctatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaa 3538493  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 341 - 447
Target Start/End: Original strand, 12630507 - 12630614
Alignment:
Q  341 taattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttcttttactca 439  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||    
T  12630507 taattgatatgtcggtcctttaacttatgtcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacatgttccttaacttatgtcttttcttca 12630606  T
Q  440 atttggtc 447  Q
    ||||||||    
T  12630607 atttggtc 12630614  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 417 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 44748600 - 44748483
Alignment:
Q  417 ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcg 516  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  44748600 ccttaatttatttcttttattcaatatggtccaattttgataattttaatcccctagaaaaggagactgttggattacgaaggtctatcagattttatag 44748501  T
Q  517 tgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44748500 tgtatcaccaacacctaa 44748483  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 633 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 40918151 - 40918040
Alignment:
Q  633 atttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcattt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40918151 atttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatctataattaacaacatcagtatcatttaactcataatcaaaactaacactcattt 40918056  T
Q  733 atcaaattcatcacct 748  Q
    |||||||| |||||||    
T  40918055 atcaaatttatcacct 40918040  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 413
Target Start/End: Original strand, 42611435 - 42611511
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  42611435 ggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggttccataagttttaactttctcaaaca 42611511  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 413
Target Start/End: Original strand, 45688867 - 45688943
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45688867 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaaca 45688943  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 43960945 - 43961131
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||             | || ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  43960945 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtc------------tcgttctcaaacacgtcccttaatttatttctttta 43961032  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||         ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43961033 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcctctacaaaaacagaccgttggattacaaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaa 43961131  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 360 - 534
Target Start/End: Original strand, 12630586 - 12630762
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaa-cttatttcttttactcaatttggtccaatttttat 457  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  12630586 ttaacttatgtcttttcttcaatttggtctcaaaagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacctttttttttttattcaatttggtctaattttgat 12630685  T
Q  458 aattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||         ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||  || ||||| |||||||||    
T  12630686 aattttaatcccctagaaaaagagactgttggattacagaggtatatcagattttattatggatcactaacacctaa 12630762  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 337 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44231960 - 44231879
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc 418  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  44231960 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaacttttgcaaacttgtcc 44231879  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 337 - 464
Target Start/End: Original strand, 37235813 - 37235941
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||  |||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |    
T  37235813 ggcttaattggcctgccggtcccttaacttatttcttttatttaatttggttccataaatcccaactttctcaaacgcgtcccttaacttatttctttga 37235912  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataatttta 464  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||    
T  37235913 ttcaatttggtccaattttgagaatttta 37235941  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Original strand, 27071014 - 27071085
Alignment:
Q  331 aaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaac 402  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27071014 aaaaaaggcttaattgatctgccggtcatttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaac 27071085  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27207299 - 27207228
Alignment:
Q  331 aaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaac 402  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27207299 aaaaaaggcttaattgatctgccggtcatttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaac 27207228  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7057446 - 7057382
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaac 402  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7057446 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaac 7057382  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 619 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 19218816 - 19218649
Alignment:
Q  619 tttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaa 717  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |    |||||||||| |||||| | |||||| ||||    ||||| ||||||    
T  19218816 tttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaac-acatgatcaaataaacccttaaatctagaattaagatcaccactatca----actcataatcaa 19218722  T
Q  718 aattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatc-caattcatcttcaacaacaaactcaatt 789  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||| | ||||||||||||    
T  19218721 aactaacatccatttatcaaattcatcacctttaaccataaatcagatttcatcttcatccacaaactcaatt 19218649  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 417 - 530
Target Start/End: Original strand, 26005432 - 26005545
Alignment:
Q  417 ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcg 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||         ||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |    
T  26005432 ccttaacttatttcttttattcaatttggttcaattttgataattttactccactaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtctataagattttatag 26005531  T
Q  517 tgtatcaccaacac 530  Q
    ||||||||||||||    
T  26005532 tgtatcaccaacac 26005545  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26006861 - 26006795
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaact 403  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26006861 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttgttcaatttggtcccataagttttaact 26006795  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 410
Target Start/End: Original strand, 19008931 - 19009004
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaa 410  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  19008931 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttctttttttcaatttggtcccataagtattaaatttgtcaa 19009004  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 415 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 43115126 - 43115018
Alignment:
Q  415 gtccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttat 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  43115126 gtccttaacttatttcttttattcaatttgatccaattttgataattttaatcccttaaaaaagaagaccgttggattactgaagtctatcagattttat 43115027  T
Q  515 cgtgtatca 523  Q
     ||| ||||    
T  43115026 agtgcatca 43115018  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19016815 - 19016725
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaactta 426  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || || ||||||||||    
T  19016815 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttctttttttcaatttggtcccataagtattaaatttgtcaaccacgtcccttaactta 19016725  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 22794175 - 22794094
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22794175 cttttaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatttataattaacaccaccacaatcat 22794094  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 387
Target Start/End: Original strand, 26005412 - 26005461
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggt 387  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005412 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 26005461  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 29409076 - 29408995
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29409076 ctttcaaaaattcatcattttaacttcaacaaaaaccataaaatcaaac----ccttaaatccataattaacaccaccaccatcat 29408995  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Original strand, 29657272 - 29657353
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||    | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29657272 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaatccaaaaaatcaaac----atttaaatttataattaacaccaccaccatcat 29657353  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 43115144 - 43115097
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttg 385  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43115144 ggcttaattgatgtgatggtcctt-aacttatttcttttattcaatttg 43115097  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13599293 - 13599246
Alignment:
Q  419 ttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaat 466  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13599293 ttaacttatttcttttattcaatttgctccaattttgataattttaat 13599246  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13599226 - 13599177
Alignment:
Q  485 gttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  13599226 gttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcagtaacacctaa 13599177  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 622 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 29658446 - 29658397
Alignment:
Q  622 caaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacactta 670  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29658446 caaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaactctta 29658397  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 622 - 718
Target Start/End: Original strand, 43006676 - 43006769
Alignment:
Q  622 caaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaa 718  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||| |||    | |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43006676 caaaaattcatcatttcaacttcataaaaaatcatataatcaaa----tccttaaatctggaataaacaccaccaccatcatgtaactcacaatcaaa 43006769  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 4973887 - 4973838
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaaca 666  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  4973887 ctttcaaaaattcatcatttcaacttgaacaaaaaccacaaaatcaaaca 4973838  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13599297 - 13599268
Alignment:
Q  356 tcctttaacttatttcttttattcaatttg 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13599297 tcctttaacttatttcttttattcaatttg 13599268  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 405
Target Start/End: Original strand, 45398545 - 45398610
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  45398545 ttaattgatctgtcggtcccttaacttacttctttatttcgatttggtcccatagctcttaacttt 45398610  T

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Target: chr1 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 335
Target Start/End: Original strand, 35089413 - 35089740
Alignment:
Q  8 aggattaaaccatcacatgaatgatttatgcaaagatcatcaacaaagatgattaccacccactgcatcagactttaagattgtgaagattttacgcatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35089413 aggattaaaccatcacatgaatgatttatacaaagatcatcaacaaagatgattaccacccactccatcagactctaagattgtgaagattttatgcatg 35089512  T
Q  108 tgagccacccgagatctgggctttagcccaaatcagcttgtacaactgaaaatttaacttagctatatatagatctcaagtacaactatcagcttgcaca 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35089513 tgagccacccgagatttgggctttagcgcaaatcaacttgtacaactgaaaatttaccttagctatatatagatctcaagtacagctatcagcttgcaca 35089612  T
Q  208 gccgaaaatttaccttagctacatatagatatcaagttaacaaccaaagtatttaactcaaaaattaaatttactttttcaaaaagcttccacatgtcat 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089613 gtcgaaaatttaccttagctacatatagatctcaagttaacaaccaaagtatttaactcaaaaattaaatttactttttcaaaaagcttccacatgtcat 35089712  T
Q  308 attttatcacaaaaaattacataaaaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089713 attttatcacaaaaaattacataaaaaa 35089740  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 618 - 872
Target Start/End: Original strand, 40187893 - 40188149
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaa 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40187893 ctttcaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctagaattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaa 40187992  T
Q  718 aattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatttaaatcaaattcatcaacttcaactaca 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40187993 aattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacgacaaactcaatttaaatcaaattcatcaccttcaaccaca 40188092  T
Q  818 aattccattcatcttcaactgcaaactcaa-tcaaatctgac-atattcatatcttc 872  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  40188093 aattcaattcatcttcaactacaaactcaattcaaatatgacaatattcatatcttc 40188149  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 618 - 848
Target Start/End: Original strand, 50483877 - 50484107
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaa 717  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50483877 cttttaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctagaattggcaccaccaccatcatataactcacaatcaa 50483976  T
Q  718 aattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatttaaatcaaattcatcaacttcaactaca 817  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||    
T  50483977 aattcacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaaatcatcttcaaccacaaactcaatttaaatcaatttcatcaccctcaaccaca 50484076  T
Q  818 aattccattcatcttcaactgcaaactcaat 848  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50484077 aattcaattcatcttcaactgcaaactcaat 50484107  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 337 - 547
Target Start/End: Original strand, 40187603 - 40187813
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttcttttac 436  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40187603 ggcttaattgatctgacggtcctttcacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttcttttac 40187702  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaaac 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40187703 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatcgtgtatcaccaacacctaaac 40187802  T
Q  537 ccaacaaattt 547  Q
    ||  |||||||    
T  40187803 cctgcaaattt 40187813  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 51693147 - 51693345
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51693147 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttctttta 51693246  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  51693247 ttcaatttggttcaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcggattttatagtgtatcaccaacacctaa 51693345  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5488985 - 5488787
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||    
T  5488985 ggcttaattgatccgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgttcattaacttatttctttta 5488886  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5488885 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 5488787  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 337 - 531
Target Start/End: Original strand, 51468339 - 51468534
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51468339 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 51468438  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51468439 ttcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaagattgatggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 51468534  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 52086627 - 52086823
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52086627 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 52086726  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  52086727 ttcaatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaa--accgttggattacgaaggtctataaaattttatagtgtatcaccatcacctaa 52086823  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 338 - 530
Target Start/End: Original strand, 5488502 - 5488695
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttac 436  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  5488502 gcttaattgatctgttggtcccttaatttatttcttttattcaatttgattccataagacttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttat 5488601  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacac 530  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5488602 tcaatttgatccaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 5488695  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 360 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 7111570 - 7111395
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttata 458  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7111570 ttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtccattaactgatttcttttattcaatttggtccaattttgata 7111471  T
Q  459 attttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7111470 attttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaa 7111395  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 343 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 50485108 - 50484916
Alignment:
Q  343 attgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaat 441  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  50485108 attgatctgccggtcccttaacttatttcatttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaat 50485009  T
Q  442 ttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||         |||| |||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  50485008 ttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccattggattacataggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 50484916  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 7110226 - 7110424
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  7110226 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 7110325  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  7110326 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagatcgttggattgcggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacgcctaa 7110424  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 337 - 537
Target Start/End: Original strand, 18819262 - 18819463
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  18819262 ggcttaattgatctgccggttccttaaattattttttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaatcacgtcccttaatttatttctttta 18819361  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaaa 535  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18819362 ttcaatttggcccaattttaataattttaatcccctatgaaaagaaaccgttggattacggaggtatatcagattttatagtgtatcaccaacacctaaa 18819461  T
Q  536 cc 537  Q
    ||    
T  18819462 cc 18819463  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 360 - 534
Target Start/End: Original strand, 17244198 - 17244373
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttata 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  17244198 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtctcaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttgattcaatttggtccaattttgata 17244297  T
Q  459 attttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||    
T  17244298 attttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcaccgatacctaa 17244373  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 345 - 524
Target Start/End: Original strand, 45228283 - 45228463
Alignment:
Q  345 tgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcctt-aacttatttcttttactcaattt 443  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  45228283 tgatctgccggttctttaacttatttcttttatttaattttgtcccataaattttaaccttatcaaacacgttctttaacttatttcttttattcaattt 45228382  T
Q  444 ggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcac 524  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45228383 ggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggagatctatcaaattttatagtgtatcac 45228463  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 51469026 - 51468821
Alignment:
Q  330 aaaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatt 428  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  51469026 aaaaaaaggcttaattgatctgtcagtcccttaacttattttttttattcaatttggtcccataaatcttaactttttcaaacacgtccctaaacttatt 51468927  T
Q  429 tcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaac 528  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||          | | ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  51468926 tcttctattcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaaaagcattggattacggagatctattagattttacagtgtatcaccaac 51468827  T
Q  529 acctaa 534  Q
    ||||||    
T  51468826 acctaa 51468821  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 360 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 52087869 - 52087694
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttata 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||    
T  52087869 ttaacttatttcttttattcaatttggtctcatatgtcttaactttctcaaacacgtcctttcacttatttcttttattcaatttgattcaattttgata 52087770  T
Q  459 attttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||| ||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  52087769 attttagtcccctaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaa 52087694  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1823410 - 1823216
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1823410 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcacataagtcttaa---tctcaaacatgtcgcttaacttattt-tttta 1823315  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||          |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1823314 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcttctaaaaagataaaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 1823216  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 45229718 - 45229523
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  45229718 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 45229619  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||  |         ||  |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  45229618 aatttgatccaattttgataattttaatcctataaaaaaaaagattgttggattacggaggtctatcagattttataatggatcaccaacacctaa 45229523  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 52759363 - 52759561
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||    
T  52759363 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaaaacgtccattaacttatctatttta 52759462  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |         |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52759463 ttcaatttagtccaattttgataattttaatctcttaaaaaatgagaccgttgaattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 52759561  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 50483511 - 50483708
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcctt-aacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| | ||| || || ||||||||||||    
T  50483511 ggcttaattgatctgtcggtc-tttaacttatttcttgtattcaatttggtctcataagtcttaattttcttaaaaacgtcatttaatttatttctttta 50483609  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccct-nnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||          ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  50483610 ttcaatttggtccaatttttataattttactcccctaaaaaaaagagactgttggattacggaagtcta-cagattttatcgtgtataaccaacacctaa 50483708  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 416 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 52761634 - 52761516
Alignment:
Q  416 tccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatc 515  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  52761634 tccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctgaaaaaagagaccgttggattgcggaggtctatcagattttata 52761535  T
Q  516 gtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||||||    
T  52761534 gtgtatcaccaacacctaa 52761516  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 671 - 776
Target Start/End: Original strand, 40722141 - 40722246
Alignment:
Q  671 cttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatc 770  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  40722141 cttaaatctagaattaacaccaccatcttcatctaactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaatccatcgccttcaaccgtaaatccaatttatc 40722240  T
Q  771 ttcaac 776  Q
    ||||||    
T  40722241 ttcaac 40722246  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 38235250 - 38235134
Alignment:
Q  354 ggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatt 452  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38235250 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattaaatttggtccaatt 38235151  T
Q  453 tttataattttaatccc 469  Q
    || |||| |||||||||    
T  38235150 ttaataagtttaatccc 38235134  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 341 - 467
Target Start/End: Original strand, 47532961 - 47533088
Alignment:
Q  341 taattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttcttttactca 439  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |||    
T  47532961 taattgatctgccggtcccttaagttattttttttattcaatttggtctcataaatcttaactttatcaaacacgttccttaaattatttcatttattca 47533060  T
Q  440 atttggtccaatttttataattttaatc 467  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  47533061 atttgattcaattttgataattttaatc 47533088  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 431
Target Start/End: Original strand, 25181502 - 25181596
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttct 431  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  25181502 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 25181596  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 337 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17245782 - 17245651
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||| |  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  17245782 ggcttaattgatccgccggttccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactctctcaaacaagtcccttaacttattt-tttta 17245684  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcc 468  Q
     | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17245683 ttaaatttggtccaattttgatcattttaatcc 17245651  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 339 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 47533970 - 47533774
Alignment:
Q  339 cttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttcttttact 437  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||| || | |    
T  47533970 cttaattgatctgctggtctcttaaattatttcttttatttaatttagtcccataagttttaactttttcaaatacgtctcttaaattatttcattcatt 47533871  T
Q  438 caatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| |||||| |          |||||||  ||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  47533870 caatttgattcaattttgataattataatcctccaaaaaaatagaccgttaaattagagagatctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 47533774  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18820874 - 18820806
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18820874 ggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaacttt 18820806  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 534
Target Start/End: Original strand, 1821931 - 1822107
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaactta-tttcttttactcaatttggtccaatttttat 457  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||| ||    
T  1821931 ttaatttattttttttattcaattttgtcctataaattttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttttttttatttaatttagtctaattttgat 1822030  T
Q  458 aattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||  |         ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1822031 aattttaatcctttaaaaaaagagaccgttgggttacgaaggtctatctgattttatagtgtatcattaacacctaa 1822107  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 672 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 40722808 - 40722712
Alignment:
Q  672 ttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattca 768  Q
    |||||| || ||||||||| | |||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||    
T  40722808 ttaaatataaaattaacacaaacaccgtcaaccaactcacaatcaaaattaacacccatttatcaaatccatcatcttcaaccagaaactcaattca 40722712  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 49619659 - 49619578
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  49619659 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacaaaatcaaac----atttaaatttagaattaacaccaccaccatcat 49619578  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 51694336 - 51694169
Alignment:
Q  619 tttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaa 717  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| |    |||||||||| |||||| | |||||| ||||    ||||| ||||||    
T  51694336 tttcaaaaattcatcatttcaacttcaaccaaaac-acatgatcaaataaacccttaaatctagaattaagatcaccactatca----actcataatcaa 51694242  T
Q  718 aattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatc-caattcatcttcaacaacaaactcaatt 789  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||| ||| | |||||  | |||||||||| | ||||||||||||    
T  51694241 aactaacatccatttatcaaattcatcacctttaacgataaatcagatttcatcttcatccacaaactcaatt 51694169  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 733 - 789
Target Start/End: Original strand, 50484052 - 50484108
Alignment:
Q  733 atcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatt 789  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  50484052 atcaatttcatcaccctcaaccacaaattcaattcatcttcaactgcaaactcaatt 50484108  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 534
Target Start/End: Original strand, 21203156 - 21203209
Alignment:
Q  481 gaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21203156 gaccgttggattacaaaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaa 21203209  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 718
Target Start/End: Original strand, 16217727 - 16217823
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatca 716  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||    | |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16217727 ctttcaaaaattcatcatttcaacatcatcaaaaac-agataatcaaa----tccttaaatctggaataaacaccaccaccatcatctaactcacaatca 16217821  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 52761654 - 52761602
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcc 389  Q
    |||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52761654 ggcttaattgatatgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 52761602  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 622 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 40779476 - 40779431
Alignment:
Q  622 caaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaaca 666  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40779476 caaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacaaaatcaaaca 40779431  T

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Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 618 - 872
Target Start/End: Original strand, 54353314 - 54353569
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaa 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  54353314 ctttcaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctagaattaacaccaccaccatcatataactca--atcaa 54353411  T
Q  718 aatt-aacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatttaaatcaaattcatcaacttcaactac 816  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54353412 aatttaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacgacaaactcaatttaaatcaaattcatcaccttcaactac 54353511  T
Q  817 aaattccattcatcttcaactgcaaactcaa-tcaaatctgac-atattcatatcttc 872  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  54353512 aaattcaattcatcttcaactacaaactcaattcaaatctgacaatattcatatcttc 54353569  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 337 - 547
Target Start/End: Original strand, 54353023 - 54353234
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54353023 ggcttaattgatctgacggtcctttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttatcaaacatgtcccttaacttatttctttta 54353122  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54353123 ctcaatttggtccaatttttataattttaatccccgaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatcgtgtatcactaacacctaaa 54353222  T
Q  536 cccaacaaattt 547  Q
    |||| |||||||    
T  54353223 cccagcaaattt 54353234  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 331 - 534
Target Start/End: Original strand, 31937029 - 31937233
Alignment:
Q  331 aaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttattt 429  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  31937029 aaaaaaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttcacttattt 31937128  T
Q  430 cttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaaca 529  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31937129 attttattcattttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaaca 31937228  T
Q  530 cctaa 534  Q
    |||||    
T  31937229 cctaa 31937233  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 28777805 - 28777607
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  28777805 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 28777706  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28777705 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaa 28777607  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 31938425 - 31938227
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31938425 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 31938326  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31938325 ttcaatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 31938227  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23073492 - 23073294
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23073492 ggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaagatgtcccttaacttatttctttta 23073393  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23073392 ttcaaactggttcaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtgtatcaaattttacggtgtatcaccaacacctaa 23073294  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2233423 - 2233225
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2233423 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaattcggtctcataagtcttaactttgtcaaacatgtcccttaacttatttctttta 2233324  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||         || |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  2233323 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaagagatcgttggattatggagatctataagattttatagcgtatcaccaacacctaa 2233225  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 330 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43394179 - 43393973
Alignment:
Q  330 aaaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaactta-t 427  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |    
T  43394179 aaaaaaagacttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaagacgtcccttaacttatt 43394080  T
Q  428 ttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaa 527  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  43394079 ttcttttattcaaattggtccaattttgataattttaaccccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaa 43393980  T
Q  528 cacctaa 534  Q
    |||||||    
T  43393979 cacctaa 43393973  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 46903742 - 46903544
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  46903742 ggcttaattgatctttcagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaagtttttcaaacacgtcctttaacttatttctttta 46903643  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||| ||||||| || |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46903642 ttcaatttggtacaattttgatgattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacacctaa 46903544  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 340 - 531
Target Start/End: Original strand, 46902334 - 46902526
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Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  46902334 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 46902433  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||         ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  46902434 aatttggtgcaattttgataattttaatcccctaaaagaagagattgttagattacggaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacc 46902526  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
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Target Start/End: Original strand, 21727910 - 21728108
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Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21727910 ggcttaattgatctgccggtcccataacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 21728009  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||         ||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  21728010 ttcaatttgattcaattttgataattttaatctcctaaaaaagtagactgttagattacgaaggtctatctcattttataatgtatcaccaacacctaa 21728108  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Original strand, 52521930 - 52522124
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Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactc 438  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||| ||    
T  52521930 ttaattgatctgctggtcccttaacttatttctttaattcaatttggtctcatagatcttaactttctcaaacacgtcctttcacttatttattttattc 52522029  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||         ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52522030 aatttggtccaattttgataactttaatcccct-aaaaaaaagacagttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 52522124  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 54354509 - 54354311
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  54354509 ggcttaattgatctgccggtcccttaacctatttcttttatttaatttggtcccttaagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttga 54354410  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||         |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  54354409 ttcaatttggtccaattttgataattttaattccctataaaaagagaccattggattatagaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 54354311  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 338 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 35759348 - 35759151
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttac 436  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||     
T  35759348 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttat 35759249  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||             ||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  35759248 tcaatttggtccaattttgataattttaatctaaaaaaaaaacagaccgttggattacgaatgtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 35759151  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 338 - 534
Target Start/End: Original strand, 37609322 - 37609519
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttac 436  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||     
T  37609322 gcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttatttaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttcttttat 37609421  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||| | |||| || |||| ||| ||||||||||    
T  37609422 tcaatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattagggaggtctataagatttaatagtgtctcatcaacacctaa 37609519  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17742388 - 17742212
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttata 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||    
T  17742388 ttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgata 17742289  T
Q  459 attttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattt-tatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  17742288 attttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatttatacagtgtatcaacaacacctaa 17742212  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19043708 - 19043532
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttata 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||    
T  19043708 ttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgata 19043609  T
Q  459 attttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattt-tatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  19043608 attttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatttatacagtgtatcaacaacacctaa 19043532  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 355 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 47431287 - 47431107
Alignment:
Q  355 gtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaattt 453  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47431287 gtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttttcaaacacgttccttaacttatttcttttgttcaatttggtccaattt 47431188  T
Q  454 ttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    | ||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47431187 tgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattatggaggtctattagattttatagtgtatcacccacacctaa 47431107  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5691209 - 5691015
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |     
T  5691209 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcacataagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatta 5691110  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    || || |||||||||| ||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5691109 aactt-gtccaattttgataatttaaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 5691015  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 2232602 - 2232800
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  2232602 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaatacgtcccttaatttatttctttta 2232701  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2232702 ttcaatttaatccaattttaataattttaatcccctagaaaaaaagaccattggattacggaggtctatgagattttacggtgtatcagcaacacctaa 2232800  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11348589 - 11348399
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11348589 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtattaactttatcatacatgttccttaactaatttctttta 11348490  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcacca 526  Q
     | |||||| ||||||||| ||||||||||| || |         |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  11348489 tttaatttgatccaattttgataattttaattccttagaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtatatcacca 11348399  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 17116202 - 17116399
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17116202 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtgttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 17116301  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||          |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  17116302 ttcaatttggttcaattttgataattttaat-ccctaaaaaatgacaccgttggattacggaggtccatcagagtttatagtgtatcaccaacacctaa 17116399  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 28776448 - 28776646
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  28776448 ggcttaattgatctatcagtcctttaatttattttttttattcaatttgatcctataaatcttaattttctcaaacaagtcccttaactgatttctttta 28776547  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  28776548 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaacagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcatcaacacctaa 28776646  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10979293 - 10979095
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  10979293 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaaatttctcaaacacgtcatttcacttatttctttta 10979194  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |         |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  10979193 ttcaatttgattcaattttgataattttagtccctttaaaaaagagaccattggattacggaggtttatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaa 10979095  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 337 - 467
Target Start/End: Original strand, 23091191 - 23091322
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  23091191 ggcttaattgatctgccggtcttttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtctcttaacttaattctttta 23091290  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatc 467  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23091291 ttcaatttggtccaactttgataattttaatc 23091322  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 338 - 534
Target Start/End: Original strand, 11346813 - 11347010
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttac 436  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||     
T  11346813 gcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcatataaatcttaactttatcaaacacgtgccttaatttatttcttttat 11346912  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||         |||| |||||||| | ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11346913 tcaatttgttccaattttgataattttaatcccctgaaaagagagaccattggattatgaaggtctaccatattgtatagtgtatcaccaacacctaa 11347010  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 338 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 53180920 - 53180724
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcctt-aacttatttcttttac 436  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||     
T  53180920 gcttaattgatttgccggtcccttaacttattt-ttttattcaatttgatctcataagtcgtaactttctcaaacacgttctttaacttattttttttat 53180822  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53180821 tcaatttagtccaattttaataattttaatcctctaaaaaaggagaccgttggattacggaggtctatcagattgtatagtgtatcaccaacacctaa 53180724  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 338 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 53766083 - 53765949
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttac 436  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||     
T  53766083 gcttaattgatctgcgggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccgtaagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 53765984  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccct 471  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  53765983 tcaatttgatccaattttaataattttaatcccct 53765949  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 339 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 52525475 - 52525342
Alignment:
Q  339 cttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttact 437  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |    
T  52525475 cttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcccttaacttatttcttttatt 52525376  T
Q  438 caatttggtccaatttttataattttaatcccct 471  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  52525375 caatttagtccaattttaataattttaatcccct 52525342  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Original strand, 55209785 - 55209979
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactc 438  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |     
T  55209785 ttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttattt 55209884  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |          |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||    
T  55209885 aatttggtccaattttgataattttaatccac-gaaaaaagagaccattggattacggaggtctatcagaatttatagtgtattaccaacacctaa 55209979  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 340 - 471
Target Start/End: Original strand, 53764432 - 53764563
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactc 438  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  53764432 ttaattgatctaccggtcctttaacttattt-ttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttattc 53764530  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccct 471  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  53764531 aatttagtcaaattttgataattttaatcccct 53764563  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 338 - 534
Target Start/End: Original strand, 47429628 - 47429820
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttcttttact 437  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||      | ||||||  |    
T  47429628 gcttaattgatctgcatgtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctt------tatcttttgtt 47429721  T
Q  438 caatttggtccaatttttataattttaatcccct--nnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47429722 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaaaagactgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacatctaa 47429820  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 340 - 448
Target Start/End: Original strand, 23072063 - 23072171
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttcttttactca 439  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  23072063 ttaattgatctgctggtcccttaattcatttcatttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaagacgtccttaacttatttcttttattca 23072162  T
Q  440 atttggtcc 448  Q
    |||||||||    
T  23072163 atttggtcc 23072171  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 47917707 - 47917536
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataa 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  47917707 ttaacttatttcttttatttaatttggtctcataaatcttagttttctcaaacacgtccctaacttatttcttttattcaatttgatctaattttaataa 47917608  T
Q  460 ttttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
    ||||||||||||         ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  47917607 ttttaatcccctaaaaataaagattgttggattacggaggtttatcagattttatagtgtattaccaacacc 47917536  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 50881227 - 50881092
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  50881227 ggcttaattgatgtgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttgaccacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttctttta 50881128  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccct 471  Q
     ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  50881127 ttcaatttagttcaattttgataattttaatcccct 50881092  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 354 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21729289 - 21729108
Alignment:
Q  354 ggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatt 452  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  21729289 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcccataagttctaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttgattcaatt 21729190  T
Q  453 tttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    || ||||||||||||| ||         |||| |||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21729189 ttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccattggattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaacacctaa 21729108  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 337 - 530
Target Start/End: Original strand, 5689725 - 5689913
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5689725 ggcttaattgatctgtcgctcccttagcttatttcttttattaaatttggtcccataaga------tttcccaaacacgtcccttaacttatttctttta 5689818  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacac 530  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5689819 ttaaatttggtccaattttgataattttaatcctttaaaacaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 5689913  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 362 - 534
Target Start/End: Original strand, 17740862 - 17741028
Alignment:
Q  362 aacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataat 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||    
T  17740862 aacttatttcttttatttaatttggtc-------tcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgataat 17740954  T
Q  461 tttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||  |         |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17740955 tttaatcctttaaaaatagagaccgtcggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 17741028  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 362 - 534
Target Start/End: Original strand, 19042182 - 19042348
Alignment:
Q  362 aacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataat 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||    
T  19042182 aacttatttcttttatttaatttggtc-------tcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgataat 19042274  T
Q  461 tttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||  |         |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19042275 tttaatcctttaaaaatagagaccgtcggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 19042348  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 419 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 37610798 - 37610683
Alignment:
Q  419 ttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtg 518  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37610798 ttaacttattttttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtg 37610699  T
Q  519 tatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||    
T  37610698 tatcaccaacacctaa 37610683  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 337 - 469
Target Start/End: Original strand, 53178701 - 53178834
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  53178701 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttattttttttattcaatttgatttcataagccttaactttctcaaacacgttccttaacttatttctttta 53178800  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatccc 469  Q
     |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  53178801 ttcaatttgatccaattttgatcattttaatccc 53178834  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 340 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15290604 - 15290476
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||    
T  15290604 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttatttaatttgatcacataagtcttaattttctcaaacatgtctattaaattatttcatttattc 15290505  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatc 467  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15290504 aatttgatccaattttaataattttaatc 15290476  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 341 - 448
Target Start/End: Original strand, 43392630 - 43392738
Alignment:
Q  341 taattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactca 439  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||||||| |||    
T  43392630 taattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaagcacgtccctgaacttatttcttttattca 43392729  T
Q  440 atttggtcc 448  Q
    |||||||||    
T  43392730 atttggtcc 43392738  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17117523 - 17117387
Alignment:
Q  331 aaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttc 430  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| | | || |||     
T  17117523 aaaaaaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaatt-tttt 17117425  T
Q  431 ttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcc 468  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  17117424 ttttattcaatttgggcaaattttgatgattttaatcc 17117387  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 330 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 46986215 - 46986077
Alignment:
Q  330 aaaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatt 428  Q
    |||||| |||||||||||| ||  || || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  46986215 aaaaaaaggcttaattgatttgccggccccttaatttatttcttttattcaatttggtccaataagtcttaactctctcaaacacgtcccttaacttatt 46986116  T
Q  429 tcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcc 468  Q
    | | ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  46986115 t-tcttattaaatttggtcaaattttgataattttaatcc 46986077  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 403
Target Start/End: Original strand, 34014508 - 34014574
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaact 403  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34014508 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaact 34014574  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24376546 - 24376481
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaac 402  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24376546 ggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaac 24376481  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 534
Target Start/End: Original strand, 10978093 - 10978203
Alignment:
Q  424 ttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatca 523  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10978093 ttatttcttttattcaacttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagaaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtgtatca 10978192  T
Q  524 ccaacacctaa 534  Q
    ||| |||||||    
T  10978193 ccatcacctaa 10978203  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 417 - 534
Target Start/End: Original strand, 35758085 - 35758202
Alignment:
Q  417 ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcg 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||             |||||||||||||| | |||||||| ||||||  |    
T  35758085 ccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatccaaaaaaaaaacaaaccgttggattacgaatgtctatcagattttacag 35758184  T
Q  517 tgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35758185 tgtatcaccaacacctaa 35758202  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 435
Target Start/End: Original strand, 50879517 - 50879593
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||| |||||| |||||    
T  50879517 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttcttaaacacgtcccttaaattatttttttta 50879593  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 53101891 - 53101816
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaac 412  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||    
T  53101891 ggcttaattgatctgccggtcccttaagttatttcttttattcaatttggtcctataattcttaattttagcaaac 53101816  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27750549 - 27750473
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  27750549 ggctcaattgatctgccagtcctttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaattttttcaaaca 27750473  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34015886 - 34015826
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtc 397  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34015886 ggcttaattgatttgtcggtcccttaagttatttcttttattcaatttggtcccataagtc 34015826  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 431 - 534
Target Start/End: Original strand, 50879782 - 50879885
Alignment:
Q  431 ttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacac 530  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |          | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50879782 ttttattcaattttgtccaattttgataattttaatcccatagaaaaaaaaatcgttagattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 50879881  T
Q  531 ctaa 534  Q
    ||||    
T  50879882 ctaa 50879885  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 33113376 - 33113306
Alignment:
Q  398 ttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttt-actcaatttggtccaatttttataattttaat 466  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33113376 ttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttttattcaatttggtccaattttgataattttaat 33113306  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Original strand, 36627192 - 36627272
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||      ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36627192 ctttcaaaaatttatcatttcaacttcaacaaaaatcacataatcaaac-----tttaaatctacaattaacaccacaaccatcat 36627272  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 530
Target Start/End: Original strand, 53764896 - 53764944
Alignment:
Q  482 accgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacac 530  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53764896 accgttgaattacggaggtctatcagattttatggtgtatcaccaacac 53764944  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Original strand, 27749107 - 27749174
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    |||||||||||||   ||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27749107 gcttaattgatctaccggttccttaacttatgtcttttattcaatttagtcacataagtcttaacttt 27749174  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 55210946 - 55210832
Alignment:
Q  416 tccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatc 515  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||          || |||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  55210946 tccttaacttatttcttttattaaatttggatcaattttgataattttaatccactaaaaaaagatactgttgaattacggagatctatcagattttata 55210847  T
Q  516 gtgtatcaccaacac 530  Q
     ||||||||||||||    
T  55210846 atgtatcaccaacac 55210832  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 412
Target Start/End: Original strand, 53101545 - 53101617
Alignment:
Q  339 cttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaac 412  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||    
T  53101545 cttaattgatctgccggtcctttaatttatt-cttttattcaatttgggcctataactcttaattttagcaaac 53101617  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 389
Target Start/End: Original strand, 35758064 - 35758116
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcc 389  Q
    ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35758064 ggcttaatcaatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 35758116  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37610841 - 37610797
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaattt 384  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37610841 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattt 37610797  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 354 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21729422 - 21729380
Alignment:
Q  354 ggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagt 396  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729422 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcccataagt 21729380  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 360 - 390
Target Start/End: Original strand, 23072142 - 23072172
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtccc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23072142 ttaacttatttcttttattcaatttggtccc 23072172  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 484 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 33111815 - 33111765
Alignment:
Q  484 cgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  33111815 cgttgtattacggaggtctataaaattttatagtgtatctcccacacctaa 33111765  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 286
Target Start/End: Original strand, 34087426 - 34087481
Alignment:
Q  230 atatagatatcaagttaacaaccaaagtattt-aactcaaaaattaaatttacttttt 286  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||    
T  34087426 atatagatctcaagttaacaaccaaagtatttaaactc--aagttaaatttacttttt 34087481  T

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Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 635 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 48501022 - 48500797
Alignment:
Q  635 ttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttat 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48501022 ttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctagaattaacaccaccaccatcatatagctcacaatcaaaattaacacccatttat 48500923  T
Q  735 caaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatttaaatcaaattcatcaacttcaactacaaattccattcatcttca 834  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||    
T  48500922 caaattcatcatcttcaaccacaaatccaattcatcttcaaccacaaactcaatttaaatcaaattcatcaccttcaatcataaattcaattcatcttca 48500823  T
Q  835 actgcaaactcaa-tcaaatctgaca 859  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48500822 actacaaactcaattcaaatctgaca 48500797  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 337 - 531
Target Start/End: Original strand, 22621867 - 22622062
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22621867 ggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctttacttatttctttta 22621966  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  22621967 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccgacacc 22622062  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 7261661 - 7261463
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7261661 ggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 7261562  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7261561 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaatagaccattggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 7261463  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 38032538 - 38032340
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  38032538 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 38032439  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38032438 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaa 38032340  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 337 - 533
Target Start/End: Original strand, 17356361 - 17356558
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17356361 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatgccagaaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 17356460  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacaccta 533  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17356461 ttcaatttgttccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccta 17356558  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34095777 - 34095579
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||     
T  34095777 ggcttaattgatctattagtcccttaacttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttg 34095678  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34095677 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaggagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtgtatcacccacacctaa 34095579  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 38031168 - 38031366
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  38031168 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 38031267  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38031268 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccataaaaaaaaagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaa 38031366  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8815475 - 8815280
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  8815475 ggcttaattgatttgccggtccgttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttcta 8815376  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8815375 ttcaaattggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaaaaaaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 8815280  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 531
Target Start/End: Original strand, 10802889 - 10803084
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10802889 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaattttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 10802988  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacc 531  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  10802989 ttcaatttggtccaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtttatcagattttatattgtatcaccaacacc 10803084  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 360 - 534
Target Start/End: Original strand, 48499387 - 48499562
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttata 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  48499387 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataattcttaactttttcaaacatgtcccttaacttatttattttattcaatttggtccaattttgata 48499486  T
Q  459 attttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||         || ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  48499487 attttaatcccctaaaaaaagagatcgttggattacagaggtctatcagattttacggtgtatcaccaacatctaa 48499562  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 8814135 - 8814332
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8814135 ggcttaattgatctatcggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataaatcttatctttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 8814234  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||         ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8814235 ttcaatttggtcgaattttgataattttaataccct-aaaaaatagactgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtaacaccaacacctaa 8814332  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 368 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22623230 - 22623063
Alignment:
Q  368 tttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaat 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22623230 tttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaagcacgtccctttacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaat 22623131  T
Q  467 cccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22623130 cccctacaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcaccaacatctaa 22623063  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10804313 - 10804115
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  10804313 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagttttaactttcttaaataagttccttaacttatttctttta 10804214  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||    
T  10804213 ttcaatttggttcaattttgataattttaatccactaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcatcaacgcctaa 10804115  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 341 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 48501437 - 48501244
Alignment:
Q  341 taattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttactca 439  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  48501437 taattgatctgtcggttctttaacttatttcttttattcaattaggtttcataattcttaactttctcaaacatgtcctttaacttatttcttttattca 48501338  T
Q  440 atttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||         ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  48501337 atttggtctaattttaat-attttaatcccctaaaaaaagagaccgttagattacggaggtctgtcagattttattgtgtatcatcaacacctaa 48501244  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 471
Target Start/End: Original strand, 56233724 - 56233859
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56233724 ggcttaatagatctatcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcgcataagtctcaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 56233823  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccct 471  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56233824 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccct 56233859  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 340 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17357978 - 17357794
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  17357978 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 17357879  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatca 523  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||| |||         |||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  17357878 aatatgatccaattttgataattttaatctcctgaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctaccagattttataatgtatca 17357794  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 336 - 526
Target Start/End: Original strand, 35191816 - 35192007
Alignment:
Q  336 gggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttctttt 434  Q
    |||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35191816 gggcttaattgattcgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtttcataagtcttaactttctcaaacacgttcattaacttatttctttt 35191915  T
Q  435 actcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcacca 526  Q
    | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||         || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35191916 attcaatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaacgttggattacggaagtctatcaaattttatagtgtaccacca 35192007  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 338 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23758088 - 23757890
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttac 436  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||     
T  23758088 gcttaattgatctgccggttctttaatttatttcttttattcaatttagtctcataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 23757989  T
Q  437 tcaa-tttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||||| |          |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23757988 taaattttgatccaattttgataattttaatcctccaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatggtgtatcaccaacacctaa 23757890  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 358 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5433504 - 5433327
Alignment:
Q  358 ctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaattttta 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |    
T  5433504 ctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagttttaactttctcaaacatgtgccttaacttatttattttattcaatttactccaattttga 5433405  T
Q  457 taattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||| ||||         ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||    
T  5433404 taattttaataccctaaaaattgagactgttgtattacggaggtctatcagattttataatgtatcacaaacacctaa 5433327  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 18091580 - 18091778
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||    
T  18091580 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaaaacgtccattaacttatctatttta 18091679  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |         |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18091680 ttcaatttagtccaattttgataattttaatctcttaaaaaatgagaccgttgaattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 18091778  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 355 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 35193296 - 35193144
Alignment:
Q  355 gtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcctt-aacttatttcttttactcaatttggtccaattt 453  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35193296 gtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataaaacttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttattcaatttggtccatttt 35193197  T
Q  454 ttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatca 506  Q
    | ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  35193196 tgataattttaatcccctagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatca 35193144  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 56235138 - 56234941
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca-tgtccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  56235138 ggcttaattgatctgtcagtcccttaatttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacacaccccttaacttatttctttta 56235039  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||         ||||  || |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  56235038 ttcaattcggtctaattttgatacttttaatcctct-aaaaaacagaccaatgaattacgaaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaa 56234941  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 340 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 48081705 - 48081597
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  48081705 ttaattgatgtgtcggtcccttaacttattccttttattcaatttggttccataagtcttaactttttcaaatatgtcccttaacttatttcttttattc 48081606  T
Q  439 aatttggtc 447  Q
    |||||||||    
T  48081605 aatttggtc 48081597  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 337 - 442
Target Start/End: Original strand, 48080270 - 48080376
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48080270 ggcttaattgatctgtcggtcacttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaacttgtcctttaacttatttctttta 48080369  T
Q  436 ctcaatt 442  Q
     ||||||    
T  48080370 ttcaatt 48080376  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34122920 - 34122844
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34122920 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaaca 34122844  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 48463102 - 48463026
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  48463102 ggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttctcaaaca 48463026  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 330 - 413
Target Start/End: Original strand, 34121292 - 34121375
Alignment:
Q  330 aaaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34121292 aaaaaaaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaaca 34121375  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48081630 - 48081552
Alignment:
Q  355 gtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctt 432  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||    
T  48081630 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaagttatttctt 48081552  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 36074885 - 36074714
Alignment:
Q  364 cttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaact-ttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaattttt-ataat 460  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  36074885 cttatttattttattcaatttagtcccataaattttaactcttctcaagcacgttccttaacttattttttttattcaatttggtctaattttttatatt 36074786  T
Q  461 tttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||| | |         || |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36074785 tttaatctcataaaaaaa--gatcgttggattacgaaggtctatcatattttatagtgtatcaccaacacctaa 36074714  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29795763 - 29795659
Alignment:
Q  230 atatagatatcaagttaacaaccaaagtattt-aactcaaaaattaaatttac---tttttcaaaaagcttccacatgtcatattttatcacaaaa-aat 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||    
T  29795763 atatagatctcaagttaacaaccaaagtatttaaactcaaaagttaaatttactgttttttcaaagagcttccgcatatcacattttatcataaaataat 29795664  T
Q  325 tacat 329  Q
    |||||    
T  29795663 tacat 29795659  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 620 - 702
Target Start/End: Original strand, 5547177 - 5547256
Alignment:
Q  620 ttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5547177 ttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatttataattaacaccaccaccatcat 5547256  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 29795957 - 29795853
Alignment:
Q  11 attaaaccatcacatgaatgatttatgcaaagatcatcaacaaagatgattaccacccactgcatcagactttaagattgtgaagattttacgcatgtga 110  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||| | |||||    
T  29795957 attaaaccatcgcat-aatgattcttgcaaaaataatcaaccaagatgaataccacccactgcagcaaaatctaagattgtgaagattttacacgtgtga 29795859  T
Q  111 gccacc 116  Q
    ||||||    
T  29795858 gccacc 29795853  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 23757712 - 23757622
Alignment:
Q  691 caccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaa 782  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  23757712 caccaccatcatcta-ctcataatcaaaactaacactcatttatcaaagtcatcactttaaaccataaatctagttcatcttcaaccacaaa 23757622  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 37642373 - 37642292
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37642373 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatttataatcaacaccaccaccatcat 37642292  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 35927133 - 35927036
Alignment:
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||         || |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35927133 tcaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaaaagatcgttggattacgaaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctaa 35927036  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22624437 - 22624389
Alignment:
Q  328 ataaaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttctttta 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  22624437 ataaaaaagggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttctttta 22624389  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 718
Target Start/End: Original strand, 55953101 - 55953198
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatca 716  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||    |  ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55953101 ctttcaaaaattcatcatttcaacttaatcaaaaaccatataatcaaa----tcattaaatctggaataaacaccaccaccatcatctaactcacaatca 55953196  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 712 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 5433143 - 5433072
Alignment:
Q  712 aatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaac 783  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| ||||||    
T  5433143 aatcaaaactaacactcatttatcaaagtcatcactttaaaccataaatttagttcatcttcaaccacaaac 5433072  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 711 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 17522329 - 17522251
Alignment:
Q  711 caatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatt 789  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  17522329 caatcaaaactaacatacatttatcaaatctttcacctttaaccataaatctagttcatcttcaaccacaaactcaatt 17522251  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 54373843 - 54373766
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccacca 698  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54373843 ctttaaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacaaaatcaaac----atttaaatttataactaacaccaccacca 54373766  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48081443 - 48081392
Alignment:
Q  339 cttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtccc 390  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48081443 cttaattgatttgccggtcccttaacttattccttttattcaatttggtccc 48081392  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 672 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 1273197 - 1273151
Alignment:
Q  672 ttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaa 718  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1273197 ttaaatctggaataaacaccaccaccatcatgtaactcacaatcaaa 1273151  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 739 - 789
Target Start/End: Original strand, 5236573 - 5236623
Alignment:
Q  739 ttcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatt 789  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  5236573 ttcatcaccttcaacaacaaatccaattcacatttaaccacaaactcaatt 5236623  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 413
Target Start/End: Original strand, 48462145 - 48462219
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattca-atttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  48462145 ttaattgatatgctggtcttttaatttatttcttttattaatatttggactcataagttttaactttttcaaaca 48462219  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 534
Target Start/End: Original strand, 35925840 - 35925889
Alignment:
Q  485 gttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  35925840 gttggattacggagatctatcagattttatagtgtatcgtcaacacctaa 35925889  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 662
Target Start/End: Original strand, 48481198 - 48481243
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataatta 662  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48481198 ctttcaaaaattcattatttcaacttcaacaaaaaccacgtaatta 48481243  T

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Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 618 - 794
Target Start/End: Original strand, 39349851 - 39350027
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaa 717  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39349851 ctttcaaaaattaccatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctagaattaacatcaccaccatcatataactcacaatcaa 39349950  T
Q  718 aattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatttaaat 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39349951 aattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaattcaattcatcttcaactacaaactcaattcaaat 39350027  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 39349480 - 39349678
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39349480 ggcttaattgatctgacggtcctttaacttatttcttttattcaatttggttccataactcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttctttta 39349579  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39349580 ctcaatttggttcaatttttataattttaatcccctaaaaaaagtgaccgtttgattacggaggtctattagattttatcgtggatcaccaacacctaa 39349678  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 39350763 - 39350565
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39350763 ggcttaattgatatgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 39350664  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  39350663 cttaatttggtccaatttttataattttaatcctctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 39350565  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 337 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 19230191 - 19229997
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  19230191 ggcttaattgatctgccgatcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 19230092  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacac 530  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19230091 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctcaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcatcaacac 19229997  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 339 - 534
Target Start/End: Original strand, 19228840 - 19229036
Alignment:
Q  339 cttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttcttttact 437  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  19228840 cttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgttccttaactgatttcttttatt 19228939  T
Q  438 caatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19228940 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaa 19229036  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 331 - 534
Target Start/End: Original strand, 18654290 - 18654495
Alignment:
Q  331 aaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttattt 429  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  18654290 aaaaaaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 18654389  T
Q  430 cttttact-caatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaac 528  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  18654390 cttttattaaaatttggtccaattttgatcattttaatcccattaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaac 18654489  T
Q  529 acctaa 534  Q
    ||||||    
T  18654490 acctaa 18654495  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 9083414 - 9083203
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  |||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  9083414 ggcttaattgatctgccggtttcttaattcatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttttttatttta 9083315  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaaa 535  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9083314 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaggagaccgttggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaaa 9083215  T
Q  536 cccaacaaattt 547  Q
    || | |||||||    
T  9083214 ccaagcaaattt 9083203  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 12372314 - 12372512
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  12372314 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttgttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtctcttaacttatttgtttta 12372413  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||          |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12372414 ttcaatttgatccaattttgataattttaataccctaaaaaaacataccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 12372512  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 337 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 18655770 - 18655577
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  18655770 ggcttaattgatctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttctttta 18655671  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaaca 529  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||         |||||||| |||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18655670 ttcaatttggtccaactttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttgaattacgaaagtctatcagattttacggtgtatcaccaaca 18655577  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13278346 - 13278151
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttac-t 437  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |    
T  13278346 ttaattgatctgtcggtcccttaatttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt-ttttactt 13278248  T
Q  438 caatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |         ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13278247 caatttgatccaattttgataattttaatcccatagaaaaagagaccgttggattagggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 13278151  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 9081979 - 9082177
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||   ||| | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9081979 ggcttaattgatctaccggttccttaactcatttcttttattcaatttgattccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 9082078  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||| | |||||||||    
T  9082079 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctagaaaatgagaccgttggatcacggatgtctatcagattttatagtatatcgctaacacctaa 9082177  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 12373839 - 12373708
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  12373839 ggcttaattgatccgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttatttta 12373740  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatc 467  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12373739 ttcaatttggtccaattttgataattttaatc 12373708  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 337 - 513
Target Start/End: Original strand, 13276819 - 13276996
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13276819 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataaatcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 13276918  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaatttta 513  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13276919 ttcaatttggtcaaattttgataattttaatcccttaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtgtatcacatttta 13276996  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 39164061 - 39164252
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39164061 ggcttaattgatctgctggtccattaactt-----ttttattcaatttagtctcataagtcttaactttatcaaacacgtcccttaacttatttctttta 39164155  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||| ||||         ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39164156 ttcaatttggtccaattttgat-attttaat-cccttaaaaaaaagactgttgaattacggaggcctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 39164252  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6803742 - 6803610
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6803742 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcacataagtcttaattttctcaaacatgtttcttaacttatttctttta 6803643  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcc 468  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6803642 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcc 6803610  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 336 - 444
Target Start/End: Original strand, 8447076 - 8447185
Alignment:
Q  336 gggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttt 434  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8447076 gggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 8447175  T
Q  435 actcaatttg 444  Q
    | ||||||||    
T  8447176 attcaatttg 8447185  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 340 - 435
Target Start/End: Original strand, 6801977 - 6802073
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6801977 ttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttttttaatttggtctcataagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 6802073  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 418 - 534
Target Start/End: Original strand, 4031903 - 4032019
Alignment:
Q  418 cttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgt 517  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||         |||||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||    
T  4031903 cttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatccactaaaaaaagagaccgttgaattacggaagtctaccagattttatagt 4032002  T
Q  518 gtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||||    
T  4032003 gtatcaccaacacctaa 4032019  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Original strand, 30915759 - 30915840
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30915759 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatttataattaacaccaccaccatcat 30915840  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35952554 - 35952479
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaac 412  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35952554 ggcttaactgatctgtcagtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaactttgtcaaac 35952479  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 793 - 872
Target Start/End: Original strand, 39349966 - 39350047
Alignment:
Q  793 atcaaattcatcaacttcaactacaaattccattcatcttcaactgcaaactcaa-tcaaatctgac-atattcatatcttc 872  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  39349966 atcaaattcatcaccttcaaccacaaattcaattcatcttcaactacaaactcaattcaaatatgacaatattcatatcttc 39350047  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4033060 - 4032946
Alignment:
Q  419 ttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtg 518  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  4033060 ttaacttattttttttatttaacttggtccaattttaataattttaatccactaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatg 4032961  T
Q  519 tatcaccaacaccta 533  Q
    |||||  ||||||||    
T  4032960 tatcattaacaccta 4032946  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Original strand, 25001643 - 25001710
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25001643 gcttaattgatatgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttgatttcataagtcttaacttt 25001710  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 618 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 33362420 - 33362346
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccac 696  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  33362420 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaat-tataattaacaccaccac 33362346  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 755
Target Start/End: Original strand, 1011185 - 1011249
Alignment:
Q  691 caccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaacca 755  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1011185 caccactatcatctaactcacaatcaaaactaacatcaatttatcaaattcatcacctttaacca 1011249  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 30915954 - 30915873
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30915954 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacaccatcaaac-ct---ttaaatttataattaacatcaccaccatcat 30915873  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 630 - 719
Target Start/End: Original strand, 25001908 - 25001996
Alignment:
Q  630 atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaa 719  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    |||| ||||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  25001908 atcatttcatcttcaacaaaaac-acataatcaaacaaacccttagatctagaattaacatcaccactatcatctaacacacaatcaaaa 25001996  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 389
Target Start/End: Original strand, 4031881 - 4031933
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcc 389  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4031881 ggcttaattgatctgccggtcacttaacttatttcttttattcaatttagtcc 4031933  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 729 - 788
Target Start/End: Original strand, 25002194 - 25002252
Alignment:
Q  729 atttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaat 788  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  25002194 atttatccaatccatcaccttcaacaacaaattca-ttcatcttcaaccacaaactcaat 25002252  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12373690 - 12373637
Alignment:
Q  481 gaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  12373690 gaccgttggattacgaatgtctatcagattttacactgtatcaccaacacctaa 12373637  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 622 - 670
Target Start/End: Original strand, 14356722 - 14356771
Alignment:
Q  622 caaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacactta 670  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14356722 caaaaattcatcattttaacttcaacaaaaaccacataatcaaactctta 14356771  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 35403 - 35205
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  35403 ggcttaattgatctggcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttta 35304  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  35303 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 35205  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 336 - 534
Target Start/End: Original strand, 31032 - 31231
Alignment:
Q  336 gggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttt 434  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  31032 gggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttt 31131  T
Q  435 actcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31132 actcaatttggtccagtttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 31231  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 79409 - 79607
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  79409 ggcttaattgatctggcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttta 79508  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  79509 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 79607  T

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Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 336 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 83780 - 83581
Alignment:
Q  336 gggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttt 434  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  83780 gggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttt 83681  T
Q  435 actcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  83680 actcaatttggtccagtttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 83581  T

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Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Original strand, 30640801 - 30640995
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttcttttactca 439  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  30640801 ttaattgatatgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaaccttatcaaacacgtcattaacttatttcttttattca 30640900  T
Q  440 atttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30640901 atttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 30640995  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 716 - 859
Target Start/End: Original strand, 41637340 - 41637484
Alignment:
Q  716 aaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaacaacaaactcaatttaaatcaaattcatcaacttcaacta 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  41637340 aaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatcttcaaccacaaactcaatttaaatcaaattcatcaccctcaacca 41637439  T
Q  816 caaattccattcatcttcaactgcaaactcaa-tcaaatctgaca 859  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41637440 caaattcaattcatcttcaactacaaactcaattcaaatctgaca 41637484  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 9244065 - 9244263
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  9244065 ggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttatttta 9244164  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9244165 ttcaatttggttcaattttgataattttaatcccttaaaaaatgagaccgtaggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 9244263  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 41636831 - 41637029
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  41636831 ggcttaattgatttgccggtccttttacttatttctttcattcaatttggtcccataagtcttaactttctaaaacacgtcccttaatttatttctttta 41636930  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41636931 ttcaatttggtccaacttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaagtctatcagattttatcgtgtatcaccaacacctaa 41637029  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 338 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 522214 - 522017
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttac 436  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  522214 gcttaattaatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttattttat 522115  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  522114 tcaatttgatctaattttgataattttaatcccctagaaaaagagactgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacccctaa 522017  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9245550 - 9245351
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtccttt-aacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttt 434  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  9245550 ggcttaaatgatctgccggtccttttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttatttt 9245451  T
Q  435 actcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9245450 attcaatttagtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattgctgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 9245351  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 26364741 - 26364939
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26364741 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcctttaacttatttctttta 26364840  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||         |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  26364841 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcctctaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaa 26364939  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 26366312 - 26366118
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatg-tccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26366312 ggcttaattgatctgccgatcctttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaaccttatcaaacatgttccataacttatttctttta 26366213  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacac 530  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  26366212 ttcaatttggtccatttttaataattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttagattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacac 26366118  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 618 - 732
Target Start/End: Original strand, 41637209 - 41637323
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaa 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41637209 ctttcaaaaattatcatttcaacttcaacaaaaaccatataattaaacacttacttaaatctagaattaacaccgccaccaacatataactcacaatcaa 41637308  T
Q  718 aattaacactcattt 732  Q
    |||||||||||||||    
T  41637309 aattaacactcattt 41637323  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 41638270 - 41638073
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41638270 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttattctcataagtcttaactttctcaaacatgtcctttaacttatttctttta 41638171  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||  ||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  41638170 ttcaatttggtccaattttaataattttaatcccct-aaaaaagagacaattggattacagaggtctatcatgttttatagtgtatcaccaacacctaa 41638073  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 30644819 - 30644625
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  30644819 ttaattgatctgtcggttccttaatttatttcttttatttaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtctcttaacttatttcttttattc 30644720  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  30644719 aatttgatccaattttgataattttaatcctct-aaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttataatggatcaccaacacctaa 30644625  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 20308923 - 20309121
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||  |||||    
T  20308923 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattgagtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttattgttttta 20309022  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||         ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20309023 ttcaatttggtccaattttgataattttgatcccctagaaaaagagaccgttggatcactgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaatacctaa 20309121  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 21095556 - 21095754
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||  |||||    
T  21095556 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattgagtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttattgttttta 21095655  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||         ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21095656 ttcaatttggtccaattttgataattttgatcccctagaaaaagagaccgttggatcactgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaatacctaa 21095754  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 339 - 534
Target Start/End: Original strand, 34642667 - 34642862
Alignment:
Q  339 cttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttact 437  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  34642667 cttaattgatctgccggtctcttaacttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 34642766  T
Q  438 caatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||          ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  34642767 caatttggtttaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaa-accgttggattgcggaggtctatcagattttatagtatatcaccaacatctaa 34642862  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 337 - 467
Target Start/End: Original strand, 43584408 - 43584539
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43584408 ggcttaattgatctgtcggtccattaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 43584507  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatc 467  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43584508 ttcaatttgatccaattttgataattttaatc 43584539  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20310170 - 20309971
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20310170 ggcttaattaatctgctcgtcccttaacttatttcttttattcattttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 20310071  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccct-nnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |          ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20310070 ttcgatttggttcaattttgataattttaatcccttagaaaaaaaagaccgttggattatgaaggtctgtcagattttatagtgtatcacctacacctaa 20309971  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21096803 - 21096604
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21096803 ggcttaattaatctgctcgtcccttaacttatttcttttattcattttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 21096704  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccct-nnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |          ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21096703 ttcgatttggttcaattttgataattttaatcccttagaaaaaaaagaccgttggattatgaaggtctgtcagattttatagtgtatcacctacacctaa 21096604  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 671 - 789
Target Start/End: Original strand, 20066411 - 20066529
Alignment:
Q  671 cttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattcatc 770  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||| |||    
T  20066411 cttaaatctagaattaacaccaccatcttcatctaactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaatcaatcgccttcaactataaatccaatttatc 20066510  T
Q  771 ttcaacaacaaactcaatt 789  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  20066511 ttcaaccataaactcaatt 20066529  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 340 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43586059 - 43585930
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||    
T  43586059 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttatttaatttgatctcataagtcttaattttctcaaacatgtctattaaattatttcatttattc 43585960  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcc 468  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43585959 aatttgatccaattttaataattttaatcc 43585930  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34644076 - 34643885
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttac 436  Q
    |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||  |||| ||||||||||||     
T  34644076 gcttaattgatccgtcggtcccttgacttatttcttttattcaatttg-tcccataaatcttaactttctcaaacacctctattaatttatttcttttat 34643978  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  34643977 ttaatttagttcaattttgataattttaatcccct--aaaaaaagaccgttggatt---gaggtctatcagattttatggcgtatcaccaacacctaa 34643885  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 672 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 20067022 - 20066926
Alignment:
Q  672 ttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatccaattca 768  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  20067022 ttaaatctaaaattaacacaaccaccatcaactaactcacaatcaaaattaacacctatttatcaaatccatcatcttcaaccacaaactcaattca 20066926  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 618 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 12819933 - 12819811
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatca 716  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||  | ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  12819933 ctttcaaaaattcatcttttcaacttcaacaaaaaccacattattaaaccctta----aattaagaattaacataaccaccatcatcttactcacaatca 12819838  T
Q  717 aaattaacactcatttatcaaattcat 743  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12819837 aaactaacacccatttatcaaattcat 12819811  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 337 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3714638 - 3714562
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3714638 ggcttaattgatctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaaca 3714562  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 360 - 435
Target Start/End: Original strand, 31202989 - 31203065
Alignment:
Q  360 ttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31202989 ttaacttatttcttttattcattttggtcccataaatcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 31203065  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 43134173 - 43134099
Alignment:
Q  331 aaaaagggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  43134173 aaaatgggcttaattgatatgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataacttttaacttt 43134099  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 11080866 - 11080785
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11080866 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatttataattaacaccaccactatcat 11080785  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22013357 - 22013289
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22013357 ggcttaattgaactgctggtcccttaacttatttctttatttcagtttggtcccataactcttaacttt 22013289  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 534
Target Start/End: Original strand, 31203071 - 31203113
Alignment:
Q  492 tacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31203071 tacggaggtctatcaaattttataatgtatcaccaacacctaa 31203113  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 743
Target Start/End: Original strand, 4808052 - 4808107
Alignment:
Q  686 aacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaattcat 743  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4808052 aacaccaccaccatcatcta-ctcacaatcaaaatcaa-actcatttatcaaattcat 4808107  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 666
Target Start/End: Original strand, 42307757 - 42307806
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaaca 666  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42307757 cttttaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaaca 42307806  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 405
Target Start/End: Original strand, 22012157 - 22012225
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22012157 ggcttaattgaactgtcggtcccttaacttatttctttatttcagtttggtctcataactcttaacttt 22012225  T

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Target: chr6 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 34995352 - 34995549
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttcttttac 436  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  34995352 ggcttaattgatctgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtctttaacttatttcttttat 34995451  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34995452 tcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaa 34995549  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 11801460 - 11801262
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11801460 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 11801361  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  11801360 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctcaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcattaacacctaa 11801262  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 32714001 - 32713803
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32714001 ggcttaattgatctgctggtcctgtaacttatttcttttattcagtttggttccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 32713902  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  32713901 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagtgaccgttggattacggaggtctataagattttacagtgtatcaccaacacctaa 32713803  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 32349155 - 32348957
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  32349155 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcttataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 32349056  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32349055 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaa 32348957  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 339 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34996877 - 34996681
Alignment:
Q  339 cttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttact 437  Q
    |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |    
T  34996877 cttaattgatttgtcggtccctgaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaatacgtcccttaacttatttcttttatt 34996778  T
Q  438 caatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||         ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34996777 caatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 34996681  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 340 - 534
Target Start/End: Original strand, 32712358 - 32712553
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttcttttactc 438  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||    
T  32712358 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcagtttggtcctataaatcttacatttctcaaatacgtctcttaacttatttcttttattc 32712457  T
Q  439 aatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32712458 aatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtaccaccaacacctaa 32712553  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3000911 - 3000713
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3000911 ggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacctcccttaacttatttctttta 3000812  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||         || |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3000811 ttcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaacacagatcgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaa 3000713  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 337 - 530
Target Start/End: Original strand, 18572885 - 18573078
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||||||||||    
T  18572885 ggcttaattgatctgccggtccgttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttcttaaaaacgtcccttaacttatttctttta 18572984  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacac 530  Q
     |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18572985 ttcaaattgggccaattttgataattttaatcccctaaaaaagac-actgttggattacggaggtctatcaaattttacagtgtatcaccaacac 18573078  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 32347808 - 32348006
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||    
T  32347808 ggcttaattgatctgctggttccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaagtgatttctttta 32347907  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32347908 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaacgttggattacgggggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaa 32348006  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 29479312 - 29479177
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||    
T  29479312 ggcttaattgatctgccgatcccttaaattatttcttttattcaatctggtcccataagttttaactttctcaatcacgtcctttaacttatttctttta 29479213  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccct 471  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29479212 ttcaatttggtccaattttaataatttcaatcccct 29479177  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 337 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18574411 - 18574299
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||||||    
T  18574411 ggcttaattgatctgccggtcccttgacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaagcacgtccctgaacttatttctttta 18574312  T
Q  436 ctcaatttggtcc 448  Q
     ||||||||||||    
T  18574311 ttcaatttggtcc 18574299  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 743
Target Start/End: Original strand, 1756537 - 1756659
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatca 716  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1756537 ctttcaaaaatttatcatttcaactttaacaaaaaccacataattaaac----ccttaaatttagaatcaacatcaccaccatcatctaactcacaatca 1756632  T
Q  717 aaattaacactcatttatcaaattcat 743  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  1756633 aaactaacacccatttattaaattcat 1756659  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 630 - 746
Target Start/End: Original strand, 21455430 - 21455542
Alignment:
Q  630 atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactca 729  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||    
T  21455430 atcattccaacttcaacaataactacataatcaaac----tcttaaatctagaattaacaccaccaccatcatctaactcaaaattaaaactaacaccca 21455525  T
Q  730 tttatcaaattcatcac 746  Q
    | |||||||||||||||    
T  21455526 tgtatcaaattcatcac 21455542  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 683 - 756
Target Start/End: Original strand, 23638769 - 23638842
Alignment:
Q  683 attaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcatttatcaaattcatcaccttcaaccac 756  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23638769 attaactccaccaccatcatctaattcataatcaaaactaacactcatttgtcaaattcatcaccttcaaccac 23638842  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 630 - 748
Target Start/End: Original strand, 18498268 - 18498382
Alignment:
Q  630 atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactca 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||| |||||| | || ||| |||||  |||||| |||||||| |||||| ||    
T  18498268 atcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatctagaattaataacatcactatcattaaactcataatcaaaactaacaccca 18498363  T
Q  730 tttatcaaattcatcacct 748  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18498364 tttatcaaatttatcacct 18498382  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 405
Target Start/End: Original strand, 29477759 - 29477827
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29477759 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaacttt 29477827  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 19383262 - 19383084
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttt--ac 436  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  |     
T  19383262 ttaattgatccgccggtcccttaacttatttcttttattcaatt-------ataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattttttttttat 19383170  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcac 524  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||         |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19383169 tcaatttgatctaattttgataattttaatgccct--aaaaagagaccgttggattacgatggtctatcagattttatagtgtatcac 19383084  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 534
Target Start/End: Original strand, 27719880 - 27719933
Alignment:
Q  481 gaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27719880 gaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 27719933  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Original strand, 682537 - 682618
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  682537 cttttaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatttataattaacaccaccaccatcat 682618  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3088289 - 3088185
Alignment:
Q  230 atatagatatcaagttaacaaccaaagtattt-aactcaaaaattaaatttac---tttttcaaaaagcttccacatgtcatattttatcacaaaa-aat 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||| |||    
T  3088289 atatagttatcaagttaacaaccaaagtatttaaactcaaaagttaaatttacttttttttcaaagagcttccacccatcacattttatcataaaataat 3088190  T
Q  325 tacat 329  Q
    |||||    
T  3088189 tacat 3088185  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 534
Target Start/End: Original strand, 21094506 - 21094603
Alignment:
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21094506 tcaatttgatccaattttgataactttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctactagattttatagtgtatcaccaacacctaa 21094603  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21095348 - 21095299
Alignment:
Q  485 gttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21095348 gttggattacggaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctaa 21095299  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Original strand, 19788248 - 19788315
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaacttt 405  Q
    |||||||| |||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19788248 gcttaattcatctgtcgatcccttaacttgtttcttttattcaatttgatctcataagttttaacttt 19788315  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 18499734 - 18499681
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacactta 670  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18499734 ctttcaaaaatccatcatttcaaattcaacaaaaaccacataatcaaaccctta 18499681  T

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Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 337 - 547
Target Start/End: Original strand, 23832968 - 23833178
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtccttaacttatttcttttac 436  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||     
T  23832968 ggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttattttattccatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccttaacttttttattttat 23833067  T
Q  437 tcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaaac 536  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23833068 tcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaagaagaccgttggattacggaggtctagaagattttatagtgtatcatcaacacctaaac 23833167  T
Q  537 ccaacaaattt 547  Q
    | | |||||||    
T  23833168 cgagcaaattt 23833178  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 16602725 - 16602923
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16602725 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 16602824  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     | || ||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  16602825 tttaaattggtccaattttgataattttaatccctaaaaaaaaaagaccgttggattacggatgtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 16602923  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27892454 - 27892256
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  27892454 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcagacacgtcccttaacttatttctttta 27892355  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||             ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27892354 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 27892256  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 38244073 - 38243942
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38244073 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcattttggtcccataagtcttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttta 38243974  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatc 467  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38243973 ttcaatttggtccaattttgataattttaatc 38243942  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 337 - 466
Target Start/End: Original strand, 27891106 - 27891236
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27891106 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataggtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 27891205  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaat 466  Q
     ||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  27891206 ttcattttggttcaattttgataattttaat 27891236  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 339 - 513
Target Start/End: Original strand, 26388220 - 26388395
Alignment:
Q  339 cttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttcttttact 437  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  26388220 cttaattgatctgtcggtctcttaacttattttttttattcaatttgatctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttatt 26388319  T
Q  438 caatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaatttta 513  Q
     |||||| | ||||||| |||||||||||||| |         ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26388320 taatttgattcaattttgataattttaatcccatataaaaaaagaccgtttgattacggaggtctatcagatttta 26388395  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 337 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16604307 - 16604195
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||    
T  16604307 ggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaagtttctcaagcacgtccctgaacttatttctttta 16604208  T
Q  436 ctcaatttggtcc 448  Q
     ||||||||||||    
T  16604207 ttcaatttggtcc 16604195  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 337 - 444
Target Start/End: Original strand, 43814521 - 43814629
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  43814521 ggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttcgtctcataagtcttaactttctcaaatacgtcctttaacttatttctttta 43814620  T
Q  436 ctcaatttg 444  Q
     ||||||||    
T  43814621 ttcaatttg 43814629  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 337 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23833988 - 23833898
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaactta 426  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  23833988 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta 23833898  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19577443 - 19577370
Alignment:
Q  338 gcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaa 411  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19577443 gcttaattgatctcccggtcccttaacttatttcttttagtcaatttggtcccataactcttaactttaacaaa 19577370  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 411
Target Start/End: Original strand, 5033478 - 5033552
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaa 411  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  5033478 ggcttaatagatctgtcagtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataacttttaactttctcaaa 5033552  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 467
Target Start/End: Original strand, 38242944 - 38243014
Alignment:
Q  398 ttaactttatcaaacatgtc-cttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatc 467  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38242944 ttaactttttcaaacatgtctcttaacttatttcttttatttaatttgatccaattttgataattttaatc 38243014  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5034934 - 5034858
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaaca 413  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| |||||||    
T  5034934 ggcttaattgatttgccggtcctttaacttatttcttttatttaatttggttctataacttttaactttctcaaaca 5034858  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 400
Target Start/End: Original strand, 43814599 - 43814644
Alignment:
Q  355 gtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtctta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43814599 gtcctttaacttatttcttttattcaatttgatcacataagtctta 43814644  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 12365869 - 12365788
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12365869 ctttcaaaaattgatcattaaaacttcaacaaaaaccatataatcaaac-ct---ttaaatttataattaacaccaccaccatcat 12365788  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43814696 - 43814636
Alignment:
Q  340 ttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtctta 400  Q
    ||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43814696 ttaattgatctgtcggtcccctaacatatttcttttattcaatttggtctcataagactta 43814636  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 418
Target Start/End: Original strand, 15496083 - 15496126
Alignment:
Q  375 tattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  15496083 tattcaatttggtcccataagtcttaactttcacaaacacgtcc 15496126  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 534
Target Start/End: Original strand, 370907 - 370960
Alignment:
Q  481 gaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  370907 gaccgttggataaatgaggtctatcaaatctaatggtgtatcaccaacacctaa 370960  T

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Target: scaffold1425 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold1425
Description:

Target: scaffold1425; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1719 - 1521
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||    
T  1719 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaatttatttccttta 1620  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  1619 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccttaaaaaaacagaccgttggattatagaggtctatcagattttacggtgtataaccaacacctaa 1521  T

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Target: scaffold1425; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Original strand, 134 - 332
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||    
T  134 ggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaatttatttccttta 233  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |         |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  234 ttcaatttggtcaaattttgataattttaattccttaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttacagcgtatcaccaacacctaa 332  T

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Target: scaffold0878 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3145 - 2946
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  3145 ggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcagacacgtcccttaacttatttctttta 3046  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcc-cctnnnnnnnnngaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||             ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3045 ttcaatttggtccaattttgataattttaatccaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 2946  T

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Target: scaffold0878; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 468
Target Start/End: Original strand, 1850 - 1900
Alignment:
Q  417 ccttaacttatttcttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcc 468  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1850 ccttaacttatttcttttattcaatttggtccaa-ttttataattttaatcc 1900  T

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Target: scaffold0878; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 389
Target Start/End: Original strand, 1847 - 1881
Alignment:
Q  355 gtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcc 389  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1847 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 1881  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25463 - 25332
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  25463 ggcttaattgatctgccgctcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttctttta 25364  T
Q  436 ctcaatttggtccaatttttataattttaatc 467  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25363 ttaaatttggtccaattttgataattttaatc 25332  T

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Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25313 - 25264
Alignment:
Q  485 gttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  25313 gttggattacggaggtttatcacattttatagtgtattatcaacacctaa 25264  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 442
Target Start/End: Original strand, 104301 - 104407
Alignment:
Q  337 ggcttaattgatctgatggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttctttta 435  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  104301 ggcttaattgatttgacggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaacattctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 104400  T
Q  436 ctcaatt 442  Q
     ||||||    
T  104401 ttcaatt 104407  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 490 - 534
Target Start/End: Original strand, 104405 - 104449
Alignment:
Q  490 attacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  104405 attacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaa 104449  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 633 - 748
Target Start/End: Original strand, 54944 - 55055
Alignment:
Q  633 atttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcatataactcacaatcaaaattaacactcattt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54944 atttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatctataattaacaacatcagtatcatttaactcataatcaaaactaacactcattt 55039  T
Q  733 atcaaattcatcacct 748  Q
    |||||||| |||||||    
T  55040 atcaaatttatcacct 55055  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Original strand, 98321 - 98402
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  98321 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacaaaattaaac----atttaaatttataattaacaccaccaccatcat 98402  T

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Target: scaffold0349 (Bit Score: 46; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 534
Target Start/End: Original strand, 9302 - 9355
Alignment:
Q  481 gaccgttggattacggaggtctatcaaattttatcgtgtatcaccaacacctaa 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9302 gaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 9355  T

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Target: scaffold0171 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 29088 - 29007
Alignment:
Q  618 ctttcaaaaatt-atcatttcaacttcaacaaaaaccacataattaaacacttacttaaatctataattaacaccaccaccatcat 702  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29088 ctttcaaaaattcatcatttcaacttcaacaaaaaccacataatcaaac-ct---ttaaatctacaattaacaccacaaccatcat 29007  T

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Target: scaffold0081 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 42829 - 42766
Alignment:
Q  727 tcatttatcaaattcatcaccttcaaccacaaatc-caattcatcttcaacaacaaactcaatt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  42829 tcatttatcaaattcatcacctttaaccataaatcaggtttcatcttcaaccacaaactcaatt 42766  T

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