View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14437_low_14 (Length: 273)

Name: NF14437_low_14
Description: NF14437
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14437_low_14
NF14437_low_14
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-273)||(1365969-1366241)
chr7 (20-273)||(26282391-26282646)
chr7 (1-208)||(25610091-25610298)
chr7 (1-266)||(26633330-26633595)
chr7 (1-266)||(36438183-36438448)
chr7 (5-268)||(40001547-40001795)
chr7 (92-266)||(32956742-32956916)
chr7 (5-266)||(773719-773981)
chr7 (1-225)||(41852133-41852356)
chr7 (124-261)||(33910036-33910174)
chr7 (1-262)||(40737833-40738084)
chr7 (93-231)||(44893952-44894091)
chr7 (92-231)||(7636247-7636388)
chr7 (5-226)||(42312016-42312238)
chr7 (1-225)||(30739131-30739357)
chr7 (92-225)||(12251210-12251344)
chr7 (133-262)||(18895361-18895490)
chr7 (130-266)||(7366654-7366790)
chr7 (158-266)||(9479094-9479202)
chr7 (94-231)||(18015504-18015644)
chr7 (92-231)||(36796293-36796434)
chr7 (16-231)||(46221550-46221765)
chr7 (1-183)||(40841074-40841259)
chr7 (4-264)||(41908147-41908407)
chr7 (124-247)||(11672572-11672696)
chr7 (99-231)||(4099970-4100104)
chr7 (1-183)||(28589977-28590157)
chr7 (99-231)||(6380013-6380146)
chr7 (92-231)||(33419039-33419180)
chr7 (92-231)||(42161044-42161182)
chr7 (98-216)||(44876087-44876202)
chr7 (1-198)||(3799595-3799789)
chr7 (166-225)||(8358291-8358350)
chr7 (1-58)||(28105789-28105846)
chr7 (1-51)||(44002765-44002815)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-273)||(55134168-55134441)
chr4 (25-267)||(45172502-45172742)
chr4 (5-268)||(34982189-34982452)
chr4 (5-266)||(35653816-35654077)
chr4 (92-266)||(5545296-5545470)
chr4 (111-226)||(21791490-21791604)
chr4 (92-231)||(19661381-19661521)
chr4 (92-247)||(41038236-41038392)
chr4 (98-231)||(32130718-32130852)
chr4 (127-226)||(10575481-10575580)
chr4 (92-231)||(44478041-44478182)
chr4 (135-264)||(43154754-43154883)
chr4 (124-231)||(23426120-23426228)
chr4 (92-231)||(28463510-28463650)
chr4 (92-231)||(53011714-53011854)
chr4 (96-231)||(23256596-23256731)
chr4 (92-225)||(11681664-11681798)
chr4 (92-225)||(11689943-11690077)
chr4 (92-261)||(27632370-27632540)
chr4 (92-231)||(29579882-29580022)
chr4 (139-266)||(22423651-22423780)
chr4 (4-109)||(24449222-24449328)
chr4 (94-261)||(29221545-29221713)
chr4 (159-266)||(24449091-24449200)
chr4 (92-194)||(51066347-51066449)
chr4 (92-261)||(16072566-16072740)
chr4 (98-264)||(26328961-26329127)
chr4 (1-35)||(9925295-9925329)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-273)||(1092873-1093144)
chr6 (5-268)||(29308303-29308566)
chr6 (5-266)||(30915197-30915463)
chr6 (1-264)||(3748400-3748663)
chr6 (5-268)||(31860968-31861214)
chr6 (1-208)||(6294279-6294488)
chr6 (94-231)||(2618357-2618495)
chr6 (94-231)||(6754208-6754346)
chr6 (92-231)||(628018-628157)
chr6 (158-273)||(1690622-1690737)
chr6 (92-231)||(6360762-6360901)
chr6 (124-231)||(12614670-12614778)
chr6 (20-231)||(21946109-21946317)
chr6 (97-231)||(29401142-29401277)
chr6 (92-225)||(22503751-22503885)
chr6 (92-231)||(57690-57830)
chr6 (124-215)||(11088564-11088655)
chr6 (93-231)||(29149405-29149544)
chr6 (124-231)||(3514804-3514912)
chr6 (123-264)||(350383-350524)
chr6 (92-231)||(7525089-7525228)
chr6 (104-266)||(19231580-19231741)
chr6 (164-231)||(14893412-14893479)
chr6 (1-59)||(1690549-1690607)
chr6 (1-58)||(11088746-11088803)
chr6 (188-233)||(31234911-31234956)
chr6 (16-51)||(3514698-3514733)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (1-273)||(3349561-3349832)
chr5 (1-273)||(43511578-43511850)
chr5 (1-273)||(20975945-20976217)
chr5 (9-273)||(42291719-42291985)
chr5 (1-268)||(29156155-29156422)
chr5 (5-273)||(17513772-17514040)
chr5 (16-273)||(4734428-4734686)
chr5 (5-273)||(10591109-10591377)
chr5 (1-273)||(5829345-5829613)
chr5 (1-226)||(7390233-7390457)
chr5 (92-233)||(40956313-40956454)
chr5 (131-263)||(138114-138246)
chr5 (13-266)||(17325811-17326065)
chr5 (1-266)||(27351316-27351581)
chr5 (13-226)||(33281681-33281894)
chr5 (92-231)||(13474632-13474772)
chr5 (92-231)||(13656212-13656352)
chr5 (92-231)||(19099236-19099376)
chr5 (124-259)||(931354-931484)
chr5 (13-231)||(18873459-18873680)
chr5 (92-231)||(12661311-12661451)
chr5 (125-231)||(13423866-13423973)
chr5 (14-266)||(10033513-10033770)
chr5 (92-231)||(26377695-26377836)
chr5 (8-180)||(8379282-8379453)
chr5 (125-233)||(40779192-40779298)
chr5 (5-58)||(4177375-4177428)
chr5 (1-58)||(13288618-13288675)
chr5 (157-262)||(16515495-16515600)
chr5 (16-51)||(13424046-13424081)
chr5 (1-56)||(16515682-16515737)
chr5 (139-231)||(36718535-36718629)
chr5 (188-233)||(37029051-37029096)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (1-273)||(34523786-34524055)
chr8 (7-273)||(39697776-39698042)
chr8 (1-261)||(12531531-12531791)
chr8 (8-273)||(23567117-23567378)
chr8 (4-264)||(32098012-32098273)
chr8 (20-266)||(3628598-3628844)
chr8 (98-218)||(5869253-5869371)
chr8 (93-231)||(43926246-43926385)
chr8 (92-247)||(7858071-7858227)
chr8 (92-231)||(18420531-18420671)
chr8 (124-261)||(3471572-3471710)
chr8 (92-246)||(18112103-18112259)
chr8 (99-247)||(43967999-43968148)
chr8 (124-231)||(13585301-13585409)
chr8 (95-226)||(30915214-30915345)
chr8 (4-109)||(35875022-35875128)
chr8 (124-231)||(44665000-44665108)
chr8 (124-231)||(1004060-1004170)
chr8 (159-266)||(35874891-35875000)
chr8 (5-232)||(42076109-42076337)
chr8 (127-232)||(29372358-29372463)
chr8 (13-215)||(36514999-36515202)
chr8 (132-247)||(42951727-42951847)
chr8 (124-261)||(27074546-27074684)
chr8 (123-246)||(33452778-33452901)
chr8 (68-215)||(42777763-42777911)
chr8 (146-204)||(3575117-3575175)
chr8 (151-218)||(5971742-5971805)
chr8 (1-58)||(33452934-33452991)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (1-273)||(17117477-17117741)
chr2 (1-273)||(18172774-18173044)
chr2 (5-273)||(38985545-38985813)
chr2 (5-267)||(18915889-18916152)
chr2 (1-270)||(15457463-15457733)
chr2 (5-268)||(21747067-21747329)
chr2 (1-262)||(36059737-36059998)
chr2 (5-266)||(39081365-39081624)
chr2 (92-264)||(38599371-38599541)
chr2 (13-256)||(1418886-1419129)
chr2 (92-231)||(18676232-18676373)
chr2 (1-266)||(13997281-13997545)
chr2 (92-231)||(19367341-19367481)
chr2 (92-231)||(26151669-26151809)
chr2 (92-247)||(41096459-41096616)
chr2 (92-231)||(2063807-2063947)
chr2 (16-266)||(29480484-29480734)
chr2 (92-231)||(13020425-13020565)
chr2 (92-231)||(45618979-45619118)
chr2 (93-247)||(25222309-25222464)
chr2 (92-231)||(7993634-7993775)
chr2 (132-266)||(27302491-27302625)
chr2 (92-266)||(31273089-31273262)
chr2 (99-231)||(4855995-4856128)
chr2 (92-215)||(42759678-42759802)
chr2 (139-249)||(6530643-6530754)
chr2 (127-261)||(34061813-34061948)
chr2 (16-231)||(42411406-42411620)
chr2 (16-225)||(1226114-1226323)
chr2 (99-261)||(45042361-45042525)
chr2 (96-199)||(36481428-36481532)
chr2 (98-215)||(13001655-13001772)
chr2 (92-231)||(12269427-12269566)
chr2 (92-155)||(38599593-38599655)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-273)||(12971366-12971638)
chr1 (1-266)||(50371101-50371366)
chr1 (5-261)||(27703370-27703621)
chr1 (1-266)||(44836558-44836818)
chr1 (13-224)||(13120710-13120921)
chr1 (92-231)||(18127859-18127999)
chr1 (130-262)||(37873723-37873855)
chr1 (92-259)||(17674278-17674444)
chr1 (92-231)||(25930606-25930745)
chr1 (95-266)||(5560450-5560622)
chr1 (130-266)||(42740077-42740213)
chr1 (92-231)||(48722292-48722432)
chr1 (92-261)||(10109692-10109862)
chr1 (92-234)||(30004830-30004972)
chr1 (92-247)||(30899642-30899800)
chr1 (132-231)||(12884100-12884199)
chr1 (139-261)||(24556778-24556900)
chr1 (92-225)||(51110023-51110157)
chr1 (99-231)||(33124559-33124692)
chr1 (92-231)||(9-149)
chr1 (92-231)||(28885593-28885733)
chr1 (92-225)||(6150729-6150864)
chr1 (1-215)||(26486207-26486419)
chr1 (13-266)||(22386680-22386934)
chr1 (94-231)||(29208022-29208160)
chr1 (5-232)||(15441291-15441516)
chr1 (92-231)||(50552497-50552637)
chr1 (1-225)||(9777421-9777647)
chr1 (124-225)||(17487237-17487339)
chr1 (92-226)||(14084622-14084758)
chr1 (92-218)||(6333441-6333565)
chr1 (132-225)||(52055560-52055654)
chr1 (94-210)||(1269574-1269689)
chr1 (94-231)||(20905210-20905349)
chr1 (123-183)||(31369358-31369418)
chr1 (5-55)||(37873592-37873642)
chr1 (159-246)||(3907459-3907545)
chr1 (173-264)||(38263833-38263924)
chr1 (1-51)||(39080453-39080503)
chr1 (1-46)||(24556989-24557034)
chr1 (10-58)||(1269727-1269775)
chr1 (188-224)||(32810370-32810406)
chr1 (16-52)||(33124489-33124525)
chr1 (92-183)||(52240458-52240550)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (9-273)||(48626869-48627133)
chr3 (5-273)||(43905689-43905947)
chr3 (1-266)||(7767030-7767298)
chr3 (1-266)||(46904709-46904974)
chr3 (5-264)||(27303156-27303413)
chr3 (130-266)||(42009223-42009359)
chr3 (130-264)||(36538147-36538281)
chr3 (98-231)||(51939483-51939618)
chr3 (92-225)||(25599009-25599142)
chr3 (130-266)||(50677275-50677411)
chr3 (92-247)||(52655045-52655201)
chr3 (95-231)||(13401461-13401599)
chr3 (95-226)||(15987207-15987338)
chr3 (92-231)||(28132658-28132797)
chr3 (94-231)||(18408193-18408331)
chr3 (101-264)||(19965812-19965975)
chr3 (130-266)||(21596302-21596438)
chr3 (92-231)||(24252622-24252762)
chr3 (92-231)||(21784705-21784846)
chr3 (136-273)||(1649798-1649935)
chr3 (132-231)||(29387716-29387816)
chr3 (92-231)||(46791619-46791759)
chr3 (104-231)||(54430554-54430682)
chr3 (123-233)||(40152084-40152194)
chr3 (157-224)||(41707043-41707110)
chr3 (92-231)||(8364174-8364315)
chr3 (124-231)||(1255007-1255112)
chr3 (94-261)||(23164496-23164664)
chr3 (92-231)||(27729691-27729831)
chr3 (132-215)||(6715457-6715540)
chr3 (92-231)||(23067646-23067787)
chr3 (5-264)||(51146907-51147165)
chr3 (157-233)||(4207346-4207418)
chr3 (92-155)||(27110794-27110857)
chr3 (125-226)||(20762056-20762158)
chr3 (1-51)||(21596516-21596566)
chr3 (5-58)||(40151966-40152019)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (94-247)||(17056-17210)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (92-231)||(16712-16852)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (92-208)||(1086-1203)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (108-231)||(8332-8457)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (94-224)||(46099-46228)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (92-208)||(22727-22844)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (13-57)||(99092-99136)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1366241 - 1365969
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  1366241 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttgtaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttacaaacggtg 1366142  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1366141 tcatttgaatatgtcaattatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaataactttt 1366042  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1366041 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggaga 1365969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 273
Target Start/End: Original strand, 26282391 - 26282646
Alignment:
Q  20 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttgaatttgtcactt 119  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  26282391 aatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaatgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttgtatttttcactt 26282490  T
Q  120 attcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaag 217  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26282491 atatgttgtgggaaaggagaaaatgaatgatttatatgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaag 26282590  T
Q  218 tcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    | ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  26282591 tgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtgcagataggaga 26282646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25610298 - 25610091
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||       |||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  25610298 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttccaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagagatagaatttactaacggtg 25610199  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||    
T  25610198 tcgtttggatttgtcacctatccattgtgggaaaggggaaaactattggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatgactttt 25610099  T
Q  201 caaattga 208  Q
    ||||||||    
T  25610098 caaattga 25610091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26633595 - 26633330
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||  | |||||| ||||||    
T  26633595 tagctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacgtctaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggt 26633496  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||| |||| | | |||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26633495 gtcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttt 26633397  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  26633396 tcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggttttatagcatcaaatttatgtccaga 26633330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 36438183 - 36438448
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||| ||||  | ||||| |||||||    
T  36438183 tagctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggt 36438282  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    |||||||| | | ||||||  | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  36438283 gtcatttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaagggaaaacgaatggtttatgtgaaaaataaattattgttgtgattctttcaatgaaatggtttt 36438381  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  36438382 tcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatagtggtttgatagcatcaaatttatgtccaga 36438448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 40001547 - 40001795
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  40001547 taagctttattagaaaaatagaattagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtggaatttactaacggcgtcgt 40001646  T
Q  105 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||               ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40001647 ttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtt---------------tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaa 40001731  T
Q  205 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagata 268  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40001732 ttgactgattaagtgattatacaaattggaggtggtttgatagtaccagatttatgttcagata 40001795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32956916 - 32956742
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  32956916 ctaacagtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatcattgttgtgattctttcaatgaa 32956817  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||  ||||||  ||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  32956816 ataactttataaattgactgattaaatgattataaaaattgggggtggtttgatagcatcagatttatgtccaga 32956742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 773719 - 773981
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 103  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||| |||     
T  773719 taagcttcattaaaaaatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaata-aaaaaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggcgtcg 773817  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgta--aaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 201  Q
    ||||||||||| |||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  773818 tttgaatttgtgactcctccgttgttggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcacaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagcttttc 773916  T
Q  202 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | || |||||| ||||||    
T  773917 aaattgactgataaagtaattatacaaattaggggtgatttgatagcatcagatttatttccaga 773981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 41852133 - 41852356
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggt 99  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||        |||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||    
T  41852133 tagctaagtttcattaagaaatcagaatcagaagaacttttaaacgtcaaacgaaata--aaaaaattaagtgaaagagatgtgaaatttatctaacggt 41852230  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| || |    
T  41852231 gtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtggaaaaggggaaaatgaattatttatgcaaaaaagaaatgagtgttgcgattctttcaatgaaataactct 41852330  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  41852331 ttaaattgactgagtaagtgattata 41852356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33910174 - 33910036
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33910174 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagcgatt 33910075  T
Q  223 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    |||| |||| |  |||||||||||| | || ||||||||    
T  33910074 atacaaattaggggtgatttgataggatcagatttatgt 33910036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 40737833 - 40738084
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||        | |||||| ||||||||  | ||||| |||||||    
T  40737833 tagctaagcttcattaaaaagtcagaatcaaaagaacttttaaa-atgaaacaaaataaaataaaataaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggt 40737931  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    |||||||||| | ||||||  | ||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||         ||||||||||| | || ||||||||||    
T  40737932 gtcatttgaaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacgaatagtttatgcgaaaaag---------ttgtgattctttcaataaaatagcttt 40738021  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtc 262  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  40738022 ttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtc 40738084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Original strand, 44893952 - 44894091
Alignment:
Q  93 taacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  || | ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | || ||    
T  44893952 taacggtgtcgtttgaatttgtaactcctttgctgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaa 44894051  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  44894052 atagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaatt 44894091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 7636247 - 7636388
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||  ||| |||||||||||| ||||||| | |||    
T  7636247 ctaacggtatcgtttgaatttgtcactcttctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggcttatgggaagaaaaaaaatgattgttgcgattctttcaatg 7636346  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7636347 aaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 7636388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42312238 - 42312016
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnn-ttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtc 102  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||    
T  42312238 taagcttcattaaaaaattagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggtgtc 42312139  T
Q  103 atttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttca 202  Q
     |||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||  |||| |  ||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  42312138 gtttagatttgtcgctcatccgttgtgg-aaaggggaaaacgaattatttaagcgaaaaataaatgactgttgtgattcttttaatgaaatagcttttca 42312040  T
Q  203 aattgactgattaagtcattatac 226  Q
    |||||||| || |||| |||||||    
T  42312039 aattgactaatcaagtgattatac 42312016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30739357 - 30739131
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaa-gtgacagagaggtagagtttactaa-cgg 98  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||        | || |||| ||||||||  | ||||| || |||    
T  30739357 tagctaaacttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttctatacatgaaatgaaataaaataaaataaaagtgaaagagaggtgaaatttaccaaacgg 30739258  T
Q  99 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||    |||||||  |||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||   |||||||| |||    
T  30739257 tgtcatttggatttgtcactccgccgttgtgaaaaaggggaaaactaattgtttatgcgaaaaggaaatgatcgttgtgattcttttaatgaaataactt 30739158  T
Q  199 ttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30739157 ttcaaattgactgattaagtgattata 30739131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Original strand, 12251210 - 12251344
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  12251210 ctaacggtgacgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 12251309  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12251310 aatagctttccaaattgactgattaaatgattata 12251344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 262
Target Start/End: Original strand, 18895361 - 18895490
Alignment:
Q  133 aaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||     
T  18895361 aaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaggaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaattgattatacaaatta 18895460  T
Q  233 gtagtgatttgatagtaccaaatttatgtc 262  Q
     ||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  18895461 atagtggtttgataacatcaaatttatgtc 18895490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7366790 - 7366654
Alignment:
Q  130 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||    
T  7366790 ggaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaatagtttttcaaattgacaaattaagtaattattcaaa 7366691  T
Q  230 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||| | ||| ||| |||  | ||||||||||||||||    
T  7366690 ttgatggtggtttaatatcatcaaatttatgtccaga 7366654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9479202 - 9479094
Alignment:
Q  158 aaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaattt 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||||    
T  9479202 aaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagttttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaattt 9479103  T
Q  258 atgtccaga 266  Q
    |||||||||    
T  9479102 atgtccaga 9479094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Original strand, 18015504 - 18015644
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg---taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||||||||| |||     ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  18015504 aacggtgtcgtttgaatttgtcacttttctgttgtgtaaaagggtaaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatga 18015603  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  18015604 aatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaatt 18015644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 36796293 - 36796434
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  36796293 ctaacggtgtcgttttgatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 36796392  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36796393 aaataattttccaaattgactgattaagttattatacaaatt 36796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Original strand, 46221550 - 46221765
Alignment:
Q  16 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtcatttgaatttgt 114  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||        |||||||| ||||  ||| | |||| |||||| | ||||||| ||||||    
T  46221550 aaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaagaaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtaaaatttatctaacgatatcatttggatttgt 46221647  T
Q  115 cacttattc-gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactga 212  Q
    || || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  46221648 ca-ttcttctgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaataaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactga 46221746  T
Q  213 ttaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||| ||| ||| ||||    
T  46221747 ttaagtgattctacaaatt 46221765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 40841074 - 40841259
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggt-agagtttactaacg 97  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||         ||| ||| ||| |||| | | ||| |||| |    
T  40841074 tagctaagctttattaaaaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaataattgaaagataggtgaaattttcctaatg 40841173  T
Q  98 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattctt 183  Q
    || || |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  40841174 gtctcgtttggatttgtcacttctccgttgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgagtgttgtaattctt 40841259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41908407 - 41908147
Alignment:
Q  4 ctaagctttattaaaaaa-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgt 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||        |||||||| | ||||||  | |||| |||||| | |    
T  41908407 ctaagcttcattaaaaaaatcagaatcagaaaaacttctaaacatgaaacaaaata-aaaaaaattaagtgaaaaagaggtgaaatttatctaacgatat 41908309  T
Q  102 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 201  Q
    | |||| || |||||||  | ||| |||  ||||| ||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  41908308 cgtttggatctgtcactcctccgtagtgaaaaaggagaatacgagtg-tttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttc 41908210  T
Q  202 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||||| || | || |||||||||||    
T  41908209 taattgactgattaagtgattgtacaaattggaggtggtttgaaagcatcagatttatgtcca 41908147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11672696 - 11672572
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  11672696 gttgtggaaaagagtaaaacgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaataactttccaaattgactgattaagtgatt 11672597  T
Q  223 ataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    |||| |||| | |||| ||||||||    
T  11672596 atacaaattaggagtggtttgatag 11672572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4100104 - 4099970
Alignment:
Q  99 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaa-cgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagc 196  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||  || ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  4100104 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaaacgaatggtttttgcgaagaaaaaaatgattgttgtaattctttcaatgaaatagc 4100005  T
Q  197 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4100004 ttttcaaattgattgattaagtgattatacaaatt 4099970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 28589977 - 28590157
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||        |||||||  ||||||||  | ||||| ||||  |    
T  28589977 tagctaaacttcattaaaaaatcagaatcagaagaatttctaaacatgaaatgaaata--gaaaaattaagtggaagagaggtgaattttacctaacaat 28590074  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattctt 183  Q
    ||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  28590075 gtcgtttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaggggaaaacgaatgg-ttacgcgaaaaagaaataattgttgtgattctt 28590157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 6380013 - 6380146
Alignment:
Q  99 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaa-atgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||| | |||||||||      
T  6380013 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaatagac 6380112  T
Q  198 tttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  6380113 ttccaaattgattgattaagtgattatacaaatt 6380146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 33419039 - 33419180
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||| | ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  33419039 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattattgtgattctttcaatga 33419138  T
Q  191 aatagcttttcaaattgac-tgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  33419139 aataacttttcaaattgacttaattaagtgattatacaaatt 33419180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 42161044 - 42161182
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || || || || ||| |||||||||| | |||||    
T  42161044 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaattg-ttgctgtgattctttcaatgaa 42161142  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||    
T  42161143 atagctttccaaattaactgatcaagtgattatacaaatt 42161182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Original strand, 44876087 - 44876202
Alignment:
Q  98 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  44876087 gtgtcgtttggatttgtcactccttcattgtggaaa--gggaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagct 44876183  T
Q  198 tttcaaattgactgattaa 216  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  44876184 ttctaaattgactgattaa 44876202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3799595 - 3799789
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggt 99  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||||||  | |||| ||||||||    
T  3799595 tagctaaacttcatttaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaata--aaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggt 3799692  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctt 198  Q
    ||| |||| ||||| | ||  | | |||||||||     |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3799693 gtcgtttggatttg-cgctcctccattgtgggaatttctaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctt 3799789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Original strand, 8358291 - 8358350
Alignment:
Q  166 atgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8358291 atgattgttgtgattctttcaatgagataactttttaaattgactgattaagtgattata 8358350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28105846 - 28105789
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 58  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  28105846 tagctaagcttcattaagaaattagaatcagaaaaacttttaaacatgaaacgaaata 28105789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 44002765 - 44002815
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 51  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  44002765 tagctaagcttcattaaaaaattataatcagaagaacttctaaacatgaaa 44002815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55134441 - 55134168
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  55134441 tagctaagctttattaaaaaatcaggatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacagtg 55134342  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaa-gaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55134341 tcatttggatttattacttatccgttgcgggaaaagggaaaacgaatgatttatgtaaaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttt 55134242  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55134241 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 55134168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 45172502 - 45172742
Alignment:
Q  25 gaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcg 124  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||       | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  45172502 gaatcagcagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaat-aagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccg 45172600  T
Q  125 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45172601 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtctatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattat 45172700  T
Q  225 accaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagat 267  Q
    || |||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45172701 acaaattag-ggtggtttgatagtaccagatttatgtccagat 45172742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34982452 - 34982189
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||       |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  34982452 taagctttattaaaaa-tcagaatcagaagaaattctaaacataaaacgaaatacaaaaaaattaagtaaaagagaggtagaatttactaacggggtcgt 34982354  T
Q  105 ttga-atttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 203  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||| |    
T  34982353 ttgagatttgtcatttatctgttgtgggaaaggggaaaacaaatgatttatatgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagtttttcca 34982254  T
Q  204 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagata 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||   || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34982253 attgactgattaagtgattatacaaattggggatggtttgttagtaccagatttatgtccagata 34982189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 35653816 - 35654077
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtca 103  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  35653816 taagcttcattaaaaagtccgaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacggtgtca 35653915  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 203  Q
    |||||| | ||||||  | ||| || |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35653916 tttgaaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaa 35654014  T
Q  204 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  35654015 attgattgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcatatttatgtccaga 35654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5545470 - 5545296
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||   |||||    
T  5545470 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtgagaagggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgaa 5545371  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  5545370 atagctttccaaattgaccgattaagtgattatacaaattggtggtggtttgatggcatcaaatttatgtccaga 5545296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Original strand, 21791490 - 21791604
Alignment:
Q  111 ttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgact 210  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  21791490 ttgtcactcattcgtcgtgggaaaggggaaa-caaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgact 21791588  T
Q  211 gattaagtcattatac 226  Q
    |||||||| |||||||    
T  21791589 gattaagtgattatac 21791604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19661521 - 19661381
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  19661521 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaggattgttgtgtttctttcaatga 19661422  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19661421 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 19661381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41038392 - 41038236
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  41038392 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 41038293  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  41038292 aatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgatag 41038236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Original strand, 32130718 - 32130852
Alignment:
Q  98 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagc 196  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  32130718 gtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagt 32130817  T
Q  197 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32130818 ttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 32130852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 226
Target Start/End: Original strand, 10575481 - 10575580
Alignment:
Q  127 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  10575481 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattatttcaatgaaataactttctaaattgactgattaagtgattatac 10575580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44478182 - 44478041
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  44478182 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 44478083  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  44478082 aaatagctttccaaattgactgatttagtgattatacaaatt 44478041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 264
Target Start/End: Original strand, 43154754 - 43154883
Alignment:
Q  135 ggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggt 234  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  43154754 ggggaaaacgaatgatttatgcgaaaaataaataattgttgtgattcttttaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgat 43154853  T
Q  235 agtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  43154854 ggtggtttgatagcatcaaatttatgtcca 43154883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 23426120 - 23426228
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  23426120 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatt 23426219  T
Q  223 ataccaatt 231  Q
    |||| ||||    
T  23426220 atacaaatt 23426228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 28463510 - 28463650
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| || | ||||    
T  28463510 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctattgtggaaaagggcaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatga 28463609  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  28463610 aatagcttttcaacttgattgattaagtgattatacaaatt 28463650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53011854 - 53011714
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  53011854 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttttaatga 53011755  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  53011754 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 53011714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23256731 - 23256596
Alignment:
Q  96 cggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatag 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23256731 cggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgggaagaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaatag 23256632  T
Q  196 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  23256631 ctttctaaattgactgattaagtggttatacaaatt 23256596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Original strand, 11681664 - 11681798
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  11681664 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 11681763  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11681764 aataactttccaaattgactgattaagtgattata 11681798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Original strand, 11689943 - 11690077
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  11689943 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 11690042  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11690043 aataactttccaaattgactgattaagtgattata 11690077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27632540 - 27632370
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||  || ||| ||||||||| |||||||||| | ||||    
T  27632540 ctaacggtgttgtttggatttgtcactactctgttgtggaaaagggtaaagcgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgatgtgattctttcaatga 27632441  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |||||||||||    
T  27632440 agtagcttttcaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcaaatttatgt 27632370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29580022 - 29579882
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || ||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  |||    
T  29580022 ctaacggtatcatttggatttgtcactactctgttgtggaaaatggtaaaacgaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattga 29579923  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29579922 aatagcttttcaatttgactgattaattaattatacaaatt 29579882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22423780 - 22423651
Alignment:
Q  139 aaaacgaatggtttatgt--aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtag 236  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| | |    
T  22423780 aaaacgaatgatttatgtggaaaaaataaataattgttttgattctttcaataaaatagtttttcaaattgattgattaagtgatcatacaaattgatgg 22423681  T
Q  237 tgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  22423680 tggtttgatagcatcaaatttatgtccaga 22423651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 24449328 - 24449222
Alignment:
Q  4 ctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtc 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  24449328 ctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaacgagaggtggagtttacctaacgatgtc 24449229  T
Q  103 atttgaa 109  Q
    |||||||    
T  24449228 atttgaa 24449222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 261
Target Start/End: Original strand, 29221545 - 29221713
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| | | ||||||    
T  29221545 aacggtgtcgtttaaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattccttcaatgaaa 29221644  T
Q  193 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    |||  || ||||||||| | |||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| | || ||||||||    
T  29221645 tagacttccaaattgaccgtttaagtgattatacaaattaagagtggtttgataggatcagatttatgt 29221713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24449200 - 24449091
Alignment:
Q  159 aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg--gtagtgatttgatagtaccaaatt 256  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||| |||||||| | ||||||    
T  24449200 aaaagaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatt 24449101  T
Q  257 tatgtccaga 266  Q
    ||| ||||||    
T  24449100 tatatccaga 24449091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 194
Target Start/End: Original strand, 51066347 - 51066449
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt--aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  51066347 ctaacagtgtcatttggatttgtcactccttcgttttgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 51066444  T
Q  190 aaata 194  Q
    |||||    
T  51066445 aaata 51066449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16072740 - 16072566
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctat-- 188  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||  |  ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||| || |      
T  16072740 ctaacgatgtcatttgggtttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttctttca 16072641  T
Q  189 --gaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |   || |||||||| | |||||||||||    
T  16072640 ttgaaatagtttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattagggatggtttgataggatcaaatttatgt 16072566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 26328961 - 26329127
Alignment:
Q  98 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagc 196  Q
    ||||| ||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||  |||    
T  26328961 gtgtcgtttgaatttatcattcctccgttgtgggaaaggggaaa-caaatggtttatccaaaaaataaatgatcgttgtgattctttttattgaagcagc 26329059  T
Q  197 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    |||  ||||||||||||| | | ||||||  ||||||  ||| |||| ||| | || |||||||||||    
T  26329060 tttctaaattgactgattgaatgattatataaattggaggtggtttggtagcatcagatttatgtcca 26329127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 9925329 - 9925295
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaaga 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9925329 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaaga 9925295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1092873 - 1093144
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1092873 tagctaagctttattaaaaaattagaatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaatttactaacggtg 1092972  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1092973 tcatttggatttgtcacttatccgttttgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttc-atgaaatagctttt 1093071  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1093072 taaattgactgatttagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggaga 1093144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 29308303 - 29308566
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29308303 taagctttattaaaaaatcagaatcataagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcat 29308402  T
Q  105 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    ||  |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  29308403 ttagatttatcacttatccattgtgggaaaggggaaaacgaatgatttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattacttcaatgaaatagtttttcaaa 29308502  T
Q  205 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagata 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308503 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagata 29308566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 30915197 - 30915463
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||     
T  30915197 taagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttataaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagagataaaatttacataacggtgtcg 30915296  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaa-----gaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctt 198  Q
    |||||| | ||||||| | ||| ||  ||||||||| || ||||||||||||  |||||     ||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  30915297 tttgaaat-gtcacttctacgtcgtaagaaaggggataatgaatggtttatgcgaaaaattaaagaaatgattgttgtgattctttcaattaaatagctt 30915395  T
Q  199 ttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  30915396 ttcaaattgactgattaagtaattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatgtccaga 30915463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 3748400 - 3748663
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |        |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||    
T  3748400 tagctaagcttcattaaaaagtcaaaatcagaagaacttttaaatatgaaataaaacaaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggt 3748499  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    |||||||| | | ||||||  | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3748500 gtcatttggaat-gtcactcctacgtcgcatgaaaggggaaaacgaatagtttatgtgacaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttt 3748598  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | | | |||||||| | ||||||||||||||    
T  3748599 tcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatggcggtttgatagcatcaaatttatgtcca 3748663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31861214 - 31860968
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatc-agaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtca 103  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||       |||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||      
T  31861214 taagctttattaaaaaaaatagaattagaagagcttctaaacataaaacgaaatacaaaaaa-ttaagtgaaagagagatagaatttactaacgacgttg 31861116  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||               |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31861115 tttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggttt---------------gattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaa 31861031  T
Q  204 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagata 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31861030 attgactgattaagtaattatacaaattgg-ggtggtttgata-taccagatttatgtccagata 31860968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6294488 - 6294279
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||        ||| |||| ||||||||  | ||||| |||||    
T  6294488 tagctaagcttcattaaaaaaaatcagaatcaaaagaacttctaaacatgaaacaaaataaaataaaattatgtgaaagagaggtgaaatttacctaacg 6294389  T
Q  98 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    ||||| |||| | | ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  6294388 gtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaattgct 6294290  T
Q  198 tttcaaattga 208  Q
    |||||||||||    
T  6294289 tttcaaattga 6294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2618495 - 2618357
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  2618495 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaa 2618396  T
Q  193 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2618395 tagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 2618357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6754346 - 6754208
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6754346 aacggtgtcatttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaa 6754247  T
Q  193 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  6754246 tagctttccaaattgactgattaagtgactatacaaatt 6754208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 628018 - 628157
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  628018 ctaacgatgtcgtttggatttatcacttctctgttgtggaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 628116  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  628117 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 628157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 273
Target Start/End: Original strand, 1690622 - 1690737
Alignment:
Q  158 aaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaattt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  1690622 aaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataaattttcaaattgattgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattt 1690721  T
Q  258 atgtccagataagaga 273  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  1690722 atgtccaaataggaga 1690737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6360901 - 6360762
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttat-gtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | |||     
T  6360901 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg- 6360803  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6360802 aataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 6360762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 12614670 - 12614778
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12614670 gttgtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatt 12614769  T
Q  223 ataccaatt 231  Q
    |||| ||||    
T  12614770 atacaaatt 12614778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21946317 - 21946109
Alignment:
Q  20 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatttgtcact 118  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |        |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  21946317 aatcagaatcagaataacttttaaatatgaaacaaaaca-aaataaattaagtgaaagagaggtggaatttacctaacggtgtcgtttgaat--gtcact 21946221  T
Q  119 tattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 218  Q
      | ||| || |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21946220 cttacgt-gtaggaaagaggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttatggttctttcaatgaaatagcttttcaaatagactgattaagt 21946122  T
Q  219 cattataccaatt 231  Q
     ||||||| ||||    
T  21946121 gattatacaaatt 21946109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29401277 - 29401142
Alignment:
Q  97 ggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatag 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |  || |||| |||||| || ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  29401277 ggtgtcatttggatttgtcactcctctgtcgtggaaaagggtaagacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataa 29401178  T
Q  196 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29401177 cttttcaaattgactgattaagtgattatactaatt 29401142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22503885 - 22503751
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttat-gtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||| |||||||||||   || ||| ||||||||||| | |||||| | | ||    
T  22503885 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttttaattctttcaacga 22503786  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22503785 aatagtttttcaaattgactgattaagtgattata 22503751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 57830 - 57690
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  57830 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttgaatga 57731  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  57730 aatagctttctaaattgactgattaagtgattatacaaatt 57690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11088655 - 11088564
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttcaaattgactgatta 215  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11088655 gttgtggtaaaggggaaa-caaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagcttttcaaattgactgatta 11088564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29149544 - 29149405
Alignment:
Q  93 taacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  29149544 taacggtatcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 29149445  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
     || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29149444 ctaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 29149405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 3514804 - 3514912
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||| || |||    
T  3514804 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgatatagctttccaaattgaatgattacgtgatt 3514903  T
Q  223 ataccaatt 231  Q
    |||| ||||    
T  3514904 atacaaatt 3514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 350524 - 350383
Alignment:
Q  123 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctat-gaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 221  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  350524 cgttatgggaaaagggaaa-caaattgtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagctttcgaaattgactgattgagtgat 350426  T
Q  222 tataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    ||||  ||||| | ||| |||||||| | || |||||||||||    
T  350425 tatataaattgatggtggtttgatagcatcatatttatgtcca 350383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 7525089 - 7525228
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||  ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | || |    
T  7525089 ctaacggtgtc-tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaataaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataa 7525187  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7525188 aataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 7525228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19231741 - 19231580
Alignment:
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 203  Q
    |||| |||| |||||| | | ||||||||||   ||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||    
T  19231741 tttggatttatcacttctccattgtgggaaaattgaaaaagaatagtttatacgaaaaagaaatgattgttgtgattttttcaatgtcatagcttttcaa 19231642  T
Q  204 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||||   ||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  19231641 attgattgattaagtga-tatacaaattgaaggtagtttgatagcaccagatttatgtccaga 19231580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Original strand, 14893412 - 14893479
Alignment:
Q  164 aaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14893412 aaatgattgttgtgattcttttaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 14893479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 1690549 - 1690607
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatac 59  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1690549 tagctaaactttataaaaaaatcagaatcagaaaagcttctaaacatgaaacgaaatac 1690607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 11088803 - 11088746
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 58  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11088803 tagctaaacttcattaaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaata 11088746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31234956 - 31234911
Alignment:
Q  188 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  31234956 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgg 31234911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Original strand, 3514698 - 3514733
Alignment:
Q  16 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 51  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3514698 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaa 3514733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 3349561 - 3349832
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||       || ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  3349561 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaactaaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtg 3349660  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3349661 tgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaacggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagctttt 3349760  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3349761 caaattgactgattaagtcattattccaattggtagtggtttgat-gtaccaaatttatgtccagataggaga 3349832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43511850 - 43511578
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43511850 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagcagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtg 43511751  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43511750 tcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagctttt 43511651  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43511650 caaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggaga 43511578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20976217 - 20975945
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20976217 tagctatgctttattaaaaaatcataatcagaagagcttttaaacattgaaccaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtg 20976118  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20976117 tcatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagacgaaaacgaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttt 20976018  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20976017 caaattgactgattaaatgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccaaatttatgtcaagataagaga 20975945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 42291719 - 42291985
Alignment:
Q  9 ctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnn--ttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcattt 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         |||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  42291719 ctttataaaaaaatcagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttaccaacgatgacattt 42291818  T
Q  107 gaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaatt 206  Q
    | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  42291819 ggatttgtcacttatccgcggtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaatt 42291918  T
Q  207 gactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42291919 gactgattaagtgattatacaaattggtggtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataggaga 42291985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29156422 - 29156155
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  29156422 tagctaaactttattaaaaaatcaaaatcagtagagcttctaaacatgaaacaaaatacaaaaaaattaattgaaagagaggtagaatttactaacggta 29156323  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29156322 tcgtttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttt 29156223  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagata 268  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29156222 taaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatagtaccagatttatgttcagata 29156155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 17513772 - 17514040
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||| ||||   || |    
T  17513772 taagctttattaaaaaaatagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttaccaacgacctcgt 17513871  T
Q  105 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  17513872 ttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcagtgaaataacttttcaaa 17513971  T
Q  205 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  17513972 ttgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgttagtaccagatttatatccagataggaga 17514040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 4734428 - 4734686
Alignment:
Q  16 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnn-ttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttgaatttgt 114  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||        |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4734428 aaaaaattaaaatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaatttactaacggtgtcatttggatttgt 4734527  T
Q  115 cacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 214  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  4734528 cacttatccgctgtgggaaatgggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgagtgatc 4734627  T
Q  215 aagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4734628 aagggattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggaga 4734686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 10591109 - 10591377
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  10591109 taagctttattaaaaaatcagaatcagaatagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgccgt 10591208  T
Q  105 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    ||| |||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10591209 ttggattgattacttatccgttgtgggaaaggggataacgaatgatttttgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaa 10591308  T
Q  205 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  10591309 ttaactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccatatttatgttcagataggaga 10591377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5829613 - 5829345
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5829613 tagctaaactttattaaaaaatcagaatcagaagagcttctaaacat--aatgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagagtttactaacagtg 5829516  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||     
T  5829515 tcgtttggatttgtcacctatccgttgtaggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttt- 5829417  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||    || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5829416 -aaattgactgattaagtgattatacaaattgaggttggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggaga 5829345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 7390233 - 7390457
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |        |||||||| ||||||||  | |||| ||||||||    
T  7390233 tagctaagcttcattaaaaaatcggaatcagaagaacttttaaacataaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacggt 7390332  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||| |||||||  ||||||| |  || |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  7390333 gtcgtttgaat--gtcacttctatgtcgcaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtcgtgattctttcgatgaaataacttt 7390430  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattatac 226  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||    
T  7390431 ttaaattgactgattaagtgattatac 7390457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40956454 - 40956313
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  40956454 ctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttccattgtgggaaaggggaaaacgaatggtgtatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattcttttaatgaa 40956355  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 233  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  40956354 atagtttttcaaattaaatgattaagtgattatacaaattgg 40956313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 138246 - 138114
Alignment:
Q  131 gaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  138246 gaaaggggaaaacgaatggtttatgcggaaaaaaaataattgttgtgattatttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaat 138147  T
Q  231 tggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcc 263  Q
    || | ||| |||||||| | |||||||||||||    
T  138146 tgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtcc 138114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17326065 - 17325811
Alignment:
Q  13 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |        | |||||| ||| ||||  | ||||| |||||||||| |||| | |    
T  17326065 attaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacgaaacaaaacaaaataaaataaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat 17325966  T
Q  112 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatag-cttttcaaattgact 210  Q
     ||||||  | ||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  17325965 -gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaagcgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttcaaattgact 17325867  T
Q  211 gattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |||||||| ||||| | ||| | | ||  ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  17325866 gattaagtgattattcaaatcgatggtagtttaatagcatcaaatttatgtccaga 17325811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27351581 - 27351316
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||        |||||||| ||||||||  | ||||| |||  ||    
T  27351581 tagctaaacttcattaaaaaattcgaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaaata-aaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatagt 27351483  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| | |||||||| ||||    
T  27351482 gtcgtttagatttgtcactcctccgttgtgggaaagaagaaaatgactggtttatgcaaaaaagaaatgatttaggttattctttcaatgaaataacttt 27351383  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
     ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27351382 ccaaattgactgattaagtggttatacaaattggaggtggtttgatagcaccaaatttatgttcaga 27351316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33281894 - 33281681
Alignment:
Q  13 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtcatttgaatt 111  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||        | |||||| ||||||||  | |||||| |||| |||| ||||||||    
T  33281894 attaaaagatcataatcaaaagaacttctaaacatgaaacaaaatataaaaaaat-aagtgaaagagaggtgaaatttacttaacgatgtcgtttgaatt 33281796  T
Q  112 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactg 211  Q
    ||||||| || |||||||||||| || ||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||     
T  33281795 tgtcactcatccgttgtgggaaaaggaaaagcaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgggattctttcaatgaaataactttttaaattgacta 33281696  T
Q  212 attaagtcattatac 226  Q
    ||||||| |||||||    
T  33281695 attaagtgattatac 33281681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13474772 - 13474632
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  13474772 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 13474673  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13474672 aacaacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 13474632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13656352 - 13656212
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  13656352 ctaacggtgtcgtttgaatttgacactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 13656253  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13656252 aataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 13656212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 19099236 - 19099376
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||| ||  |  |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  19099236 ctaacggtgtcgtttggatttgtcacttctcggttgtggaaagtgataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 19099335  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19099336 aatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaatt 19099376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 931484 - 931354
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |     |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  931484 gttgtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgtgattctttc-----aatagctttctaaattgactgattaagtgatta 931390  T
Q  224 taccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttat 259  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||| | |||||||||    
T  931389 tacaaattgggtgtgatttaatagcatcaaatttat 931354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18873680 - 18873459
Alignment:
Q  13 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatt 111  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||| ||||  | ||||| ||||||| || |||| | |    
T  18873680 attaaaaaattagaatcagaaaaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaagttaagtgaaagaaaggtgaaatttacctaacggtttcgtttggaat 18873581  T
Q  112 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaat---ggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattga 208  Q
     ||||||  | ||| || ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  18873580 -gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacgaataatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgg 18873482  T
Q  209 ctgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||  |||||| ||||    
T  18873481 ctgattaagtggttatacaaatt 18873459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12661451 - 12661311
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||  ||||||||||||||| | ||||    
T  12661451 ctaacagtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatattgttgtgattctttcaatga 12661352  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  12661351 aatagctttccaaattgactggttaagtgattatacaaatt 12661311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13423973 - 13423866
Alignment:
Q  125 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 223  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  13423973 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgattgattaagtgatta 13423874  T
Q  224 taccaatt 231  Q
    ||| ||||    
T  13423873 tacaaatt 13423866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10033770 - 10033513
Alignment:
Q  14 ttaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaa-----tacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||        |||||||| ||||||||  | ||||| ||||||| || ||||    
T  10033770 ttaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtttcgtttg 10033671  T
Q  108 aatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattg 207  Q
     | | ||||||  | ||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  10033670 gaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattattgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattg 10033573  T
Q  208 ac-tgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    || | | | ||| ||||||| ||||| | | | |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  10033572 actttaatcagtgattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatgtacaga 10033513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 26377695 - 26377836
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||  ||| || |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  26377695 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctcagttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 26377794  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  26377795 aaatagcttctcacattgactgaataagtgattatacaaatt 26377836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 8379282 - 8379453
Alignment:
Q  8 gctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtcattt 106  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |        |||||||| ||||||||  | |||||  ||||||||| |||    
T  8379282 gcttcattaaaaaataagtatcagaagatcttctaaacatgaaacgaaaaa-aaaaatattaagtgaaagagaggtgaaatttacgcaacggtgtcgttt 8379380  T
Q  107 gaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgatt 180  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  8379381 ggatttgtcactcatccgttgtgggaa-ggggaaaacgaatggattatgcgaaaaagaaattattgttgtgatt 8379453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40779298 - 40779192
Alignment:
Q  125 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt-aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 223  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||| |||||   ||||    
T  40779298 ttgtgggaaagg--aaaacgaatggtttatacgaaaaaagaaatgattgttgtgattcct-caatggaatagtttttcaaattgacttattaaacgatta 40779202  T
Q  224 taccaattgg 233  Q
    ||| ||||||    
T  40779201 tacaaattgg 40779192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 4177428 - 4177375
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 58  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4177428 taagcttcattaaaaaatcataatcagaagaacttctaaacatgaaacaaaata 4177375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 13288675 - 13288618
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 58  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13288675 tagctaagtttcattaaaaaatcataatcagaagaacatttaaacatgaaacaaaata 13288618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16515600 - 16515495
Alignment:
Q  157 aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatt 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||   ||||| | ||| ||| |||| | ||||||    
T  16515600 aaaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaataatttttcaaattgattgattaagtgattattaaaattgatggtgttttaatagcatcaaatt 16515501  T
Q  257 tatgtc 262  Q
    ||||||    
T  16515500 tatgtc 16515495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 13424081 - 13424046
Alignment:
Q  16 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 51  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13424081 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaa 13424046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 16515737 - 16515682
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaa 56  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  16515737 tagctaagcttcatgaaaaagtcagaatgagaagaactttaaaacatgaaacaaaa 16515682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 36718535 - 36718629
Alignment:
Q  139 aaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||| |||| || |||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  36718535 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaattatggttgtgattctttcaataaaataactttacaaattgactgattaaatgattatacaaatt 36718629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 37029051 - 37029096
Alignment:
Q  188 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 233  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  37029051 tgaaatagctttttaaattgattgattaagtgattatacaaattgg 37029096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 34523786 - 34524055
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||  | ||||||||| |||| ||||||||    
T  34523786 tagctaagctttattaaaa-atcagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtg--aaagaggtagaatttaataacggtg 34523882  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  34523883 tcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttt 34523982  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34523983 caaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggaga 34524055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Original strand, 39697776 - 39698042
Alignment:
Q  7 agctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcattt 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||        ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39697776 agctatattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaataagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcattt 39697875  T
Q  107 gaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaatt 206  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39697876 ggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggcgaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaatt 39697975  T
Q  207 gactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||| ||||| | || |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  39697976 gactaattaaatgatcatacaaattggtggtggtttgatagtaccaaatttatgccaagataggaga 39698042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12531791 - 12531531
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  12531791 tagctaagctttattaaaaaatcagaataagaagagcttctaaacatgaaacgaaatataaaaaaattaagtgaaagagaggtataatttactaacggcg 12531692  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12531691 tcgtttgaatttgtcatttatccgttgtgggaaaggggaaaacaaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagatttt 12531592  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||  ||||||||||| | ||||||||    
T  12531591 taaattgactgattaagtgattatacaaattggaggtagtttgatagtacaagatttatgt 12531531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 23567117 - 23567378
Alignment:
Q  8 gctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttg 107  Q
    ||||||||||||||  |||||   |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23567117 gctttattaaaaaaatagaat---aagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaa-ttaagtgaaagagtggtagaatttactaacggcgtcgtttg 23567212  T
Q  108 aatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattg 207  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||    
T  23567213 gatttgtcatttatccgttgtgggaaaaggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatcattgttgtgatactttcaatgaaatagtatttcaaattg 23567312  T
Q  208 actgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23567313 actgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtagcagatttatgttcagataagaga 23567378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 264
Target Start/End: Original strand, 32098012 - 32098273
Alignment:
Q  4 ctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtc 102  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||    
T  32098012 ctaagcatcattaaaaaatcgaaatcagatgaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacgtaacggtgtc 32098111  T
Q  103 atttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttca 202  Q
     |||| ||| ||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||    
T  32098112 gtttggattcgtcactcctctgttgtgggaatggggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttcca 32098211  T
Q  203 aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||   |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  32098212 aattgactgattaagtgatcatacaaattaagagtggtttgatagcatcaaatttatgtcca 32098273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 3628598 - 3628844
Alignment:
Q  20 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatttgtcact 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||||| |||| | | ||||||    
T  3628598 aatcagaatcaaaagaacttttaaacatgaaagaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaactgtgtcgtttggaat-gtcact 3628696  T
Q  119 tattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 218  Q
      | ||| || ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  3628697 cctacgtcgtaggaaacggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattatgt 3628796  T
Q  219 cattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
     ||||||| ||||  | ||| |||||||| | |||||||||| |||||    
T  3628797 gattatacaaattaatggtggtttgatagcatcaaatttatgaccaga 3628844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 218
Target Start/End: Original strand, 5869253 - 5869371
Alignment:
Q  98 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5869253 gtgtcgtttgaatttgtcactccttcattgtgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 5869350  T
Q  198 tttcaaattgactgattaagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5869351 tttcaaattgactgattaagt 5869371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Original strand, 43926246 - 43926385
Alignment:
Q  93 taacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||| |||||| ||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  43926246 taacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaagcgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 43926345  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43926346 atagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 43926385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7858227 - 7858071
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  7858227 ctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttaaatga 7858128  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    | || |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  7858127 attaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgatag 7858071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 18420531 - 18420671
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||  ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  18420531 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 18420630  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18420631 aacagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 18420671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3471710 - 3471572
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3471710 gttgtggaaaagggtaaaatgaatggttcatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatt 3471611  T
Q  223 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | || ||||||||    
T  3471610 atacaaattaggggtggtttgatagaatcacatttatgt 3471572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18112259 - 18112103
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||     
T  18112259 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaata 18112160  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgata 246  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||    
T  18112159 aaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggagtggtttgata 18112103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 43967999 - 43968148
Alignment:
Q  99 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  43967999 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagagtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataact 43968098  T
Q  198 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  43968099 tttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggagtggtttgatag 43968148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13585409 - 13585301
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  13585409 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaattgatt 13585310  T
Q  223 ataccaatt 231  Q
    |||| ||||    
T  13585309 atacaaatt 13585301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Original strand, 30915214 - 30915345
Alignment:
Q  95 acggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaat 193  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| || |  |||||||||| ||||||| | |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  30915214 acggtgttatttggatttatcatttctctgttgtgggaatggggaaa-caaattatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttaatgaaat 30915312  T
Q  194 agcttttcaaattgactgattaagtcattatac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30915313 agcttttcaaattgactgattaagtgattatac 30915345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 35875128 - 35875022
Alignment:
Q  4 ctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtc 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  35875128 ctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaacgagaggtggagtttacctaacgatgtc 35875029  T
Q  103 atttgaa 109  Q
    |||||||    
T  35875028 atttgaa 35875022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 44665000 - 44665108
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||     
T  44665000 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaatagactgattaagtgatg 44665099  T
Q  223 ataccaatt 231  Q
    |||| ||||    
T  44665100 atacaaatt 44665108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1004170 - 1004060
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaa--aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt-caaattgactgattaagtca 220  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |    
T  1004170 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgatgaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttttcaaattgactgattaagtga 1004071  T
Q  221 ttataccaatt 231  Q
    |||||| ||||    
T  1004070 ttatacaaatt 1004060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35875000 - 35874891
Alignment:
Q  159 aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg--gtagtgatttgatagtaccaaatt 256  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||| |||||||| | ||||||    
T  35875000 aaaagaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatt 35874901  T
Q  257 tatgtccaga 266  Q
    ||| ||||||    
T  35874900 tatatccaga 35874891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42076337 - 42076109
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtca 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||    
T  42076337 taagcttcattaaaaaatcagaatcaaaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtca 42076238  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttat--gtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 201  Q
    |||| |  |||||||  | | | || | |||||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||| ||| || |||||||| | |||  ||||||||||    
T  42076237 tttgga-atgtcactcctac-tcgtagaaaaggggaaaacgaatagtttatgcggaaaaaaataattattattatgattctttcaatgttatagcttttc 42076140  T
Q  202 aaattgactgattaagtcattataccaattg 232  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  42076139 aaattgattgattaagttattatacaaattg 42076109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29372463 - 29372358
Alignment:
Q  127 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| | ||  |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  29372463 gtggcaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtcattctttcaattgaataactttccaaattgactgattaaatgattatac 29372364  T
Q  227 caattg 232  Q
     |||||    
T  29372363 aaattg 29372358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 36514999 - 36515202
Alignment:
Q  13 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtcatttgaatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |        |||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| |||| |      
T  36514999 attaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagagctgaaatttatctaacggtgtcgtttgga-a 36515097  T
Q  112 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgact 210  Q
    |||||||  | ||| || ||||| |||||||| |||| ||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||    
T  36515098 tgtcactcctacgtcgtaggaaatgggaaaacaaatgatttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattaact 36515197  T
Q  211 gatta 215  Q
    |||||    
T  36515198 gatta 36515202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 247
Target Start/End: Original strand, 42951727 - 42951847
Alignment:
Q  132 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtg----attcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||    |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42951727 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgtgtgattctttcaataaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatac 42951826  T
Q  227 caattggtagtgatttgatag 247  Q
     |||| | |||| ||||||||    
T  42951827 aaattaggagtggtttgatag 42951847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27074684 - 27074546
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  27074684 gttgtggaaaaaggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagacttttaaattgactgattaagtgatt 27074585  T
Q  223 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | || ||||||||    
T  27074584 atacaaattaggggtggtttgataggatcagatttatgt 27074546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33452901 - 33452778
Alignment:
Q  123 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  33452901 cgttgtgggaaaggggaaa-caaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattaaaataacttttcaaattgattaattgagtgat 33452803  T
Q  222 tataccaattggtagtgatttgata 246  Q
    ||||  ||||||  ||| |||||||    
T  33452802 tatataaattggaggtggtttgata 33452778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42777911 - 42777763
Alignment:
Q  68 taagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa 166  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||  ||||  |||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||   |||| |||    
T  42777911 taagtgaaagagaggtgaaatttactgaacggtgtggtttggttttgtcactcctccgttgtgggaaatgagaaaacgaatggtatatgcggaaaaaaaa 42777812  T
Q  167 tgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 215  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  42777811 tgattgttgtgattcttttaattaaatagctttctaaattgactaatta 42777763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Original strand, 3575117 - 3575175
Alignment:
Q  146 atggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3575117 atggtttatgcaaaaatgaaatgatttaggtgattctttcaatgaaatagcttttcaaa 3575175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Original strand, 5971742 - 5971805
Alignment:
Q  151 ttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 218  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5971742 ttatgcaaaagagaactgattgttgtgattctt----taaaatagctttttaaattgactgattaagt 5971805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33452991 - 33452934
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 58  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  33452991 tagctaaacttcattaaaaaatcataattagaagaacttctaaacatgaaacgaaata 33452934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17117477 - 17117741
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17117477 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtg 17117576  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17117577 tcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttt 17117676  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||        ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17117677 caaattgactg--------attatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggaga 17117741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 18172774 - 18173044
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||       ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  18172774 tagccaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaatt--gtgaaagagaggtagaatttaccaacggcg 18172871  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18172872 tcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagctttt 18172971  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  18172972 caaattgagtgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatagtaccagatttatgtccatataggaga 18173044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 38985545 - 38985813
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||       |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |    
T  38985545 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaaaatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaattcactaacggcgtctt 38985644  T
Q  105 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38985645 ttggatttgtcacttatccgttgtggaaaaggggaaaacaaatgttttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaa 38985744  T
Q  205 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38985745 ttgattgattaaatgattatacaaattggaggtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggaga 38985813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 267
Target Start/End: Original strand, 18915889 - 18916152
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  18915889 taagctttattaaaaaaatagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggcgtcgt 18915988  T
Q  105 tt-gaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 203  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  18915989 ttcgattttatcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacaaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgctgtgattctttcagtgaaatagcttttcaa 18916088  T
Q  204 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagat 267  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18916089 attgattgattaagtgattatacaaattggggatggtttgatagtaccagatttatgtccagat 18916152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15457733 - 15457463
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||       |||||||| |||||| |||| ||||||||| | |    
T  15457733 tagctaagctttattaaaaaatcaaaataagaagagcttctgaacatgaaacgaaaaacaaaaaaattaagtgaaagagagatagaatttactaacagcg 15457634  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt-aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  15457633 tcgtttggatttgtcacttgtccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttgtgtgaaaaaaaaaattattgttgtgattctttcaataaaatagcttt 15457534  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataag 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15457533 tcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtagtttgatagtaccagatttatgtccggataag 15457463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 21747067 - 21747329
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  21747067 taagctttattaaaaaaatagaatcaaaagagcttttaaacatgaaacgaaatacaaaaaa-ttcagtgaaagagaggtagaatttactaacggcgtcgt 21747165  T
Q  105 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||  ||| |||    
T  21747166 ttgaatttctcacttatctgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgacatagtattttaaa 21747265  T
Q  205 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagata 268  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21747266 ttgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgttcagata 21747329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 36059737 - 36059998
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||     
T  36059737 tagctaaacttcattaaaaaatcagattcacaagaacttctaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtaaaatttacgtaacggc 36059836  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||| |||| | | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  36059837 gtcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtgggaaaagggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtggttctttcaatgaaatagcttt 36059935  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtc 262  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||| ||||    
T  36059936 ttaaattaactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttttgtc 36059998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39081624 - 39081365
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |        |||||||| ||||||||  | |||||  |  |||||||    
T  39081624 taagcttcattataaaatcagaatcataagaacttttaaatatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatgtgtcat 39081525  T
Q  105 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    ||| | | ||||||  | ||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  39081524 ttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaactaatggtttatatgaaaa-gaaataattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaa 39081427  T
Q  205 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  39081426 ttgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccaga 39081365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38599541 - 38599371
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| | |||||    
T  38599541 ctaacggtgtcgtttgaaat-gccactcatacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-aaaaaataaataattgttttgattctttcaatgaa 38599444  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  38599443 atagtttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgataatgatttgatagcatcaaatttatatcca 38599371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1419129 - 1418886
Alignment:
Q  13 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatt 111  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||| | |    
T  1419129 attaaaaagtcaaaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacctaacggtgtcatttggaat 1419030  T
Q  112 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactg 211  Q
     |||||| || |||  | |||||||  |||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  1419029 -gtcactcatacgtcataggaaaggaaaaaatgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttacaaattgactg 1418931  T
Q  212 attaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatt 256  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||    
T  1418930 attaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatt 1418886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 18676232 - 18676373
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  18676232 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctcttttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 18676331  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18676332 aaatagctttccaaattgactgattaagttattatacaaatt 18676373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13997545 - 13997281
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| |||  ||    
T  13997545 tagctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacaaaacaaaataaaacaagattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaaatgt 13997446  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||  |||| | | |||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  13997445 gttgtttggaat-gtcactcatacgtcgtaggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttt 13997348  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||   ||| ||  |||| | ||||||||||||||||    
T  13997347 tcaaattgactcattaagtgattattcaaattgacggtggttcaatagcatcaaatttatgtccaga 13997281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 19367341 - 19367481
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||     ||||||| |||||| ||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  19367341 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactccactgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 19367440  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19367441 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 19367481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 26151669 - 26151809
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  26151669 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 26151768  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26151769 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 26151809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 247
Target Start/End: Original strand, 41096459 - 41096616
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  41096459 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 41096558  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  41096559 aaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgatag 41096616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2063947 - 2063807
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaa-aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||| ||    |||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  2063947 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttttgcgggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 2063848  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2063847 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 2063807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Original strand, 29480484 - 29480734
Alignment:
Q  16 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||| |||| | | ||    
T  29480484 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaatacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaactttacctaacggtgtcgtttggaat-gt 29480582  T
Q  115 cacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 214  Q
    ||||  |  || ||  |||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  29480583 cactcctatgtcgtaagaaaggggaagacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataatttttcaaattgactgaat 29480682  T
Q  215 aagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||  |||| | ||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  29480683 aagtgtttattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttatgtccaga 29480734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13020565 - 13020425
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||  ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||   ||||    
T  13020565 ctaacggtgtcatttgaatttttcactcctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttaaatga 13020466  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13020465 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 13020425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45619118 - 45618979
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  45619118 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 45619019  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45619018 aatagc-ttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 45618979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25222464 - 25222309
Alignment:
Q  93 taacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  25222464 taacggtgttgtttgaatttgtcactcctctgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 25222365  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    ||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||    
T  25222364 ataactttctaaattgactaattaagtgattatacaaattaggaatgatttgatag 25222309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7993775 - 7993634
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||||||| | |||    
T  7993775 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaagattgttgtgattctttcaatg 7993676  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  7993675 aaatagctttccaaattggctgattaagtgattatacaaatt 7993634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 266
Target Start/End: Original strand, 27302491 - 27302625
Alignment:
Q  132 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  27302491 aaaggtgaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgatatagcttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaatt 27302590  T
Q  232 ggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |   |||||||| ||| | | ||||| ||||||||    
T  27302591 gagggtgatttggtagcatcgaatttttgtccaga 27302625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 31273089 - 31273262
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||   |||||    
T  31273089 ctaactgtgtcgtttggatttgtcacttttctgttgtgggaaagagaaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgaatgttatgattcttttaatgaa 31273188  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||  || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||| |||||||  | |||||||| |||||||    
T  31273189 atagtattccaaattgactgattaaatgattatacaaattgg-ggtggtttgataacatcaaatttaagtccaga 31273262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4856128 - 4855995
Alignment:
Q  99 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||  |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4856128 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggttaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 4856029  T
Q  198 tttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  4856028 ttccaaattcactgattaagtgattatacaaatt 4855995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 215
Target Start/End: Original strand, 42759678 - 42759802
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  42759678 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcacccctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 42759777  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgatta 215  Q
    |||| |||| |||||||||||||||    
T  42759778 aataactttccaaattgactgatta 42759802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6530754 - 6530643
Alignment:
Q  139 aaaacgaatggtttatgtaaaaaaga-aatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagt 237  Q
    |||||||||||||||||  || || | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||    
T  6530754 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcaatgaaataccttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 6530655  T
Q  238 gatttgatagta 249  Q
    | ||||||||||    
T  6530654 ggtttgatagta 6530643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 261
Target Start/End: Original strand, 34061813 - 34061948
Alignment:
Q  127 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  34061813 gtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtaatcata 34061912  T
Q  226 ccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    | ||||    ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  34061913 caaattatgggtggtttgataggaccagatttatgt 34061948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Original strand, 42411406 - 42411620
Alignment:
Q  16 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttgaatttgtc 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||        |||||||| |||| | || | ||  ||||||||||| |||| |||| ||    
T  42411406 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaagaaatta-aaaataattaagtgaaagag-gttaaatttatctaacggtgtcgtttggatttttc 42411503  T
Q  116 acttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaa-aagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 214  Q
    |||  |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42411504 actcctctgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagtaaaaaatgattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactaatt 42411603  T
Q  215 aagtcattataccaatt 231  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  42411604 aagtgattatacaaatt 42411620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 1226114 - 1226323
Alignment:
Q  16 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatttgt 114  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||        |||||||| |||||| |  | ||||| ||||| |||| |||| |||| |    
T  1226114 aaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaagagagatgaaatttacctaacgatgtcgtttggatttat 1226213  T
Q  115 cacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttcaaattgactgat 213  Q
     | |  |||||||||||  |||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  1226214 gattccttcgttgtggggtagg--aaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaataacttttcaaattgtctgat 1226311  T
Q  214 taagtcattata 225  Q
    | ||| ||||||    
T  1226312 tgagtgattata 1226323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45042525 - 45042361
Alignment:
Q  99 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    |||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||  |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||      
T  45042525 tgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaa--cgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagac 45042428  T
Q  198 tttca---aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    |||||   |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |||||||||||    
T  45042427 tttcaccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcaaatttatgt 45042361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36481532 - 36481428
Alignment:
Q  96 cggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaata 194  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36481532 cggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaata 36481433  T
Q  195 gcttt 199  Q
    |||||    
T  36481432 gcttt 36481428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13001772 - 13001655
Alignment:
Q  98 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| || |||    |||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  13001772 gtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtgggaaaggagaaaacgaattgtatatactgaaaaaaaatgattattgtgattcttttaatgaaatagct 13001673  T
Q  198 tttcaaattgactgatta 215  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  13001672 ttataaattgactaatta 13001655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12269566 - 12269427
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  |  | ||||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||   ||||    
T  12269566 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcattcctctgctgtggaaaaagataaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgtggtgatttttttaatga 12269467  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  12269466 aatagctttccaaa-tcactgattaagtgattatacaaatt 12269427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38599655 - 38599593
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 155  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38599655 ctaacggtgtcgtttgaaat-gccactcatacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 38599593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12971638 - 12971366
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||        ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  12971638 tagctaaactttattaaaaaatcagaatcagtttagcttcttaacatgaaacgaaatacaaaaaaaataagtgaaagataggtagaatttactaacggag 12971539  T
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 200  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12971538 tcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagctttt 12971439  T
Q  201 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  12971438 caaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgataatatcagatttatgtccagataggaga 12971366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50371366 - 50371101
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| |    
T  50371366 tagctaagcttcattaaaaaatcagaatcataagaacttctaaacatgaaacgaaata-aaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacgat 50371268  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||  |||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||    
T  50371267 gttgtttggatttgtcactcctccgttgtgggtaagggaaaaactaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagtttt 50371168  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  50371167 tcaaattgactgattaagtgattatacaaattgagggtgatttgatagcatcaactttatatccaga 50371101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 27703370 - 27703621
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||        ||||||||  |||||||  | ||||| |||| |||||     
T  27703370 taagctttgttaaaaaatcagaatcataataacttctaaacatgaaacgaaata-----aaattaagtgaaggagaggtgaaatttacctaacagtgtcg 27703464  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 203  Q
    |||| ||| ||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  27703465 tttggatt-gtcactcttccgtggtggaaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagctttccaa 27703563  T
Q  204 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||    
T  27703564 attgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagcatcaaatttatgt 27703621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 44836558 - 44836818
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||    
T  44836558 tagctaag-tttattaaaaaattagaatcataagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctagcggt 44836656  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    |||||||| | | ||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||| |  |||||||| |||    
T  44836657 gtcatttggaat-gtcactcctacgtcgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgat----gtgattctttcagtgaaatagtttt 44836751  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  44836752 tcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgttcaga 44836818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 13120710 - 13120921
Alignment:
Q  13 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||| |||| | |    
T  13120710 attaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgatagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat 13120809  T
Q  112 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactg 211  Q
     ||||||  | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  13120810 -gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtggtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactg 13120908  T
Q  212 attaagtcattat 224  Q
    ||||||| |||||    
T  13120909 attaagtgattat 13120921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 18127859 - 18127999
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  18127859 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattcttgcaatga 18127958  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18127959 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 18127999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 262
Target Start/End: Original strand, 37873723 - 37873855
Alignment:
Q  130 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  37873723 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgcagaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattaactgattaagtgactatacaaa 37873822  T
Q  230 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtc 262  Q
    ||| | ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  37873823 ttgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtc 37873855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 259
Target Start/End: Original strand, 17674278 - 17674444
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||  | ||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  17674278 ctaacggtgtcatttggaat-gtcactcttacgtcgtaggaaaggggaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaa 17674376  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttat 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||| ||| |||| | |||||||||    
T  17674377 atagtttttcaaattgactgattaagtgattattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttat 17674444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25930745 - 25930606
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| | |||||    
T  25930745 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatccaaagaaaaaatgattgttgtgatcctttcaatgaa 25930646  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25930645 atagcttttcaagttgactgattaagtgattatacaaatt 25930606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5560622 - 5560450
Alignment:
Q  95 acggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaa-atgattgttgtgattcttcctatgaaat 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||| | ||||| |||| |||||||   |||| || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5560622 acggtgttatttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaagagaaaatgaatagtttatgcggaaaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaat 5560523  T
Q  194 agcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| ||| |||| |||||||||||||    
T  5560522 aactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttggtagcaccagatttatgtccaga 5560450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42740213 - 42740077
Alignment:
Q  130 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  42740213 ggaaaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgcgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactaattaagttattatacaaa 42740114  T
Q  230 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||| | ||  |||||||| | |||| |||||||||||    
T  42740113 ttgatggttgtttgatagcatcaaacttatgtccaga 42740077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 48722292 - 48722432
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| || | ||||    
T  48722292 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattatttcaatga 48722391  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  48722392 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 48722432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10109862 - 10109692
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  10109862 ctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 10109763  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||| | | |||||||||    
T  10109762 aattgctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggtggtttgataggatccaatttatgt 10109692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 234
Target Start/End: Original strand, 30004830 - 30004972
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||| | |||||    
T  30004830 ctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgggaagaacaaatgattgttgcgattctttcaatgaa 30004929  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggt 234  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  30004930 atagcttttcaaattaattgattaagtgattatacaaattggt 30004972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30899800 - 30899642
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg---taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctat 188  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  30899800 ctaacggtgtcgtttggatttgtcattcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaat 30899701  T
Q  189 gaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  30899700 gaaatagctttccaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtgatttgatag 30899642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 231
Target Start/End: Original strand, 12884100 - 12884199
Alignment:
Q  132 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12884100 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaatt 12884199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24556900 - 24556778
Alignment:
Q  139 aaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtg 238  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| | |||    
T  24556900 aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttaaatgaaatagtttttcaaattgacttattaagtgattattcaaattgatggtg 24556801  T
Q  239 atttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
     ||| |||| |||||||||||||    
T  24556800 gtttaatagcaccaaatttatgt 24556778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Original strand, 51110023 - 51110157
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa-tgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||  ||||| |||||||||||  || || ||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  51110023 ctaacggtgtcatttgaatttgtcactcctttgttgtggaaaaggataaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaacttattgttgtgattctttcaatga 51110122  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  51110123 aatagctttctaaattgactgattaagtgattata 51110157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 33124559 - 33124692
Alignment:
Q  99 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 197  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33124559 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaatggtataacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 33124658  T
Q  198 tttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  33124659 tttcaaattgacttattaagtgattatacaaatt 33124692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 9
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  149 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 50  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  49 aatcactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 28885593 - 28885733
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||| ||| |  |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  28885593 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaaagataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttacaatga 28885692  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  28885693 aatagctttcaaaattgattgattaagtgattatacaaatt 28885733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6150864 - 6150729
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaagggg-aaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaat-gattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||  || |||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||| | |||    
T  6150864 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaattgattgttgtgattctttcaatg 6150765  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6150764 aaatagcttttcaaattgactgattaaatgattata 6150729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26486207 - 26486419
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggt 99  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||| ||  | ||||||  | |||| | ||||||    
T  26486207 tagctaagcttcatttaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaattg--aaagaggtgaaatttaccaaacggt 26486304  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    |||||||| |  |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  26486305 gtcatttgga-atgtcacttctacgtcgtaggaaagaggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttatgattttttcaatgaaatagcttt 26486403  T
Q  200 tcaaattgactgatta 215  Q
    ||| ||| | ||||||    
T  26486404 tcagattaagtgatta 26486419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 22386680 - 22386934
Alignment:
Q  13 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtcatttgaatt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||        |||||||| ||||| ||  | |||| | |||| |||| |||| | |    
T  22386680 attaaaaaatcagaatcataagattttttaaacacgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttatttaacgatgtcgtttggaat 22386779  T
Q  112 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatga-ttgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgact 210  Q
     ||||||  | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22386780 -gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacaaatggtttatgcaaaaaaaatattaattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgact 22386878  T
Q  211 gattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |||||||| ||| | | ||||| | ||| ||  |||| | ||||||||||||||||    
T  22386879 gattaagtgattgttcaaattgatggtggttaaatagcatcaaatttatgtccaga 22386934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Original strand, 29208022 - 29208160
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29208022 aacggtgtcatttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaa 29208121  T
Q  193 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||  || || ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29208122 tagacttccagattgactgattaaatgattatacaaatt 29208160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15441516 - 15441291
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 103  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||         ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||     
T  15441516 taagcttcattaaaaaatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaacggaataaaaaaaa--taagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggcgtcg 15441419  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttca 202  Q
    |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||  || ||||||||||||  |    
T  15441418 tttggatttgtcactcttctgttgtggaaaaggg-aaaatgaatgatttatgcaaaaaagaatt-attgttgtgattctttttaatgaaatagctttata 15441321  T
Q  203 aattgactgattaagtcattataccaattg 232  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15441320 aattgagtgattaagtgattatacaaattg 15441291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50552637 - 50552497
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || |||| |||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  50552637 ctaatggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaaaggtaaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 50552538  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  50552537 aataacttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaatt 50552497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9777647 - 9777421
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnn-ttaagtgacagagaggtagagtttac-taacgg 98  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||         |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||    
T  9777647 tagctaaacttcattaaaaaatcagaattagaataacttctaaacatgaaactaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacctaacgg 9777548  T
Q  99 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagct 197  Q
    |||| |||| |||| ||| | || | || |||||||||||||| | |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  9777547 tgtcgtttggatttatcattcatccattatgggaaaggggaaa-caaatggtttatgagaaaaggtaatgattgttgtgattctttttattgaaatagtt 9777449  T
Q  198 tttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9777448 attcaaattgactgattgagtgattata 9777421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 17487237 - 17487339
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 222  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||    
T  17487237 gttgtggaaaaggataaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgatttattaagtgatt 17487336  T
Q  223 ata 225  Q
    |||    
T  17487337 ata 17487339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 226
Target Start/End: Original strand, 14084622 - 14084758
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa--tgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||  |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||  || || |||  ||||| ||||||||||| | |||    
T  14084622 ctaatggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggagaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattgattattgtgattctttcaatg 14084721  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 226  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  14084722 aaatagctttctaaattgactgattaagtgattatac 14084758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Original strand, 6333441 - 6333565
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||| ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||   || ||    
T  6333441 ctaacagtgtcgtttggattcttcactcattcgttgtgggaa--gggaaagcgaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaataaa 6333538  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagt 218  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  6333539 ataactttccaatttgactgattaagt 6333565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52055654 - 52055560
Alignment:
Q  132 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa-tgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||  | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  52055654 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaactgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattata 52055560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1269689 - 1269574
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcg-ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| | ||||   |||| ||||||||||||||||||||   ||||||    
T  1269689 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctccgcttgtgggaaaggagaaaacgaatg-tatatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaa 1269592  T
Q  193 tagcttttcaaattgact 210  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1269591 tagcttttcaaattgact 1269574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Original strand, 20905210 - 20905349
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaagggg-aaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||||||||||| | |||||    
T  20905210 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaa 20905309  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  20905310 atagacttccaaattgactgaataagtgattatacaaatt 20905349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Original strand, 31369358 - 31369418
Alignment:
Q  123 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattctt 183  Q
    |||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31369358 cgttgtgggataaggaaaaatgaatggtttatgcaaaaaagaaatgatttttgtgattctt 31369418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 37873592 - 37873642
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaa 55  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37873592 taagcttcattaaaaaattagaatcataagaacttttaaacatgaaacaaa 37873642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3907545 - 3907459
Alignment:
Q  159 aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgata 246  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  3907545 aaaagaaattatttttatgattctttcaatgaaataatttttcaaattgattgattaaatgattatacaaattgg-agtggtttgata 3907459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38263924 - 38263833
Alignment:
Q  173 ttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || | ||| | ||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  38263924 ttgtgattctatcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtaataattcaaatcgatagtggtttaatagcatcaaatttatgtcca 38263833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 39080453 - 39080503
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 51  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  39080453 tagctaagcttcattgaaaaatcagaatcataagaacttctaaacatgaaa 39080503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 24557034 - 24556989
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaaca 46  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24557034 tagctaagcttcattgaaaaattagaatcagaagaacttttaaaca 24556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 1269775 - 1269727
Alignment:
Q  10 tttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 58  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  1269775 tttattaaaaaatcagaatcaatagaacttctaaacatgaaacgaaata 1269727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 224
Target Start/End: Original strand, 32810370 - 32810406
Alignment:
Q  188 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32810370 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattat 32810406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 33124489 - 33124525
Alignment:
Q  16 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac 52  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33124489 aaaaattcagaatcagaagaacttttaaacatgaaac 33124525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 183
Target Start/End: Original strand, 52240458 - 52240550
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattctt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||  |  ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  52240458 ctaacagtgtcgtttgaatttgtcgctcctctgttgtggaaaagggcaaaatgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctt 52240550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 48626869 - 48627133
Alignment:
Q  9 ctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnt-taagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttg 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48626869 ctttataaaaaaattagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaaataagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttg 48626968  T
Q  108 aatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattg 207  Q
     ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  48626969 gatttgtcacttatccgctgtgggaatggg-aaaacgaatggtttatgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattg 48627067  T
Q  208 actgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  48627068 actgatcaagtgattatacaaattggcggtggtctgatagtatcagatttatgtccagatatgaga 48627133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 43905689 - 43905947
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 104  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43905689 taagctttactaaaaaaatagaatcataagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcat 43905788  T
Q  105 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 204  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||          ||||||| |||||||||    
T  43905789 ttggatttgtcacttatccgctgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtg----------tgaaataacttttcaaa 43905878  T
Q  205 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||   ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43905879 ttgactgattgagtgattatacaaattgagggtagtttgatagtaccagatttatgtccagataggaga 43905947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7767298 - 7767030
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| |||| ||    
T  7767298 tagctaagcttcattaaaaagtcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaactgt 7767199  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa---aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagc 196  Q
    |||||||| | | ||||||  | |||  | ||||| |||||||||||| |||||||| ||   ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7767198 gtcatttggaat-gtcactcctacgtcttaggaaatgggaaaacgaatagtttatgtgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagc 7767100  T
Q  197 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  7767099 ttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggttgtttgatagcatcaaatttatgtccaga 7767030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 46904974 - 46904709
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||    
T  46904974 tagcgaagcttcattaaaaaatcagaataagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggt 46904875  T
Q  100 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    ||| |||| | | ||||||  | ||| || |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  46904874 gtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaataaaaggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttt 46904776  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  46904775 ttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatctatgtccaga 46904709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27303413 - 27303156
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||     
T  27303413 taagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatggtgtcg 27303314  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 203  Q
    |||||||  ||||||  | ||| || |||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27303313 tttgaat--gtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aaaacaaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaa 27303217  T
Q  204 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| || | | ||||||||||||||    
T  27303216 attgattgattaagtgattatacaaattgatggtggtttcatggcatcaaatttatgtcca 27303156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 266
Target Start/End: Original strand, 42009223 - 42009359
Alignment:
Q  130 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42009223 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaa 42009322  T
Q  230 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||| | ||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  42009323 ttgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccaga 42009359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Original strand, 36538147 - 36538281
Alignment:
Q  130 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36538147 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaa 36538246  T
Q  230 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    ||| | ||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  36538247 ttgatggtggtttgatagcatcaagtttatgtcca 36538281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Original strand, 51939483 - 51939618
Alignment:
Q  98 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatag 195  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51939483 gtgtcgtttggatttgtcacttctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatag 51939582  T
Q  196 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  51939583 cttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 51939618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Original strand, 25599009 - 25599142
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || || | |||||||||||||||||| | |||||    
T  25599009 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaacatgattgttgtgattctttcaatgaa 25599108  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattata 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25599109 atagtttttcaaattgactgattaagtgattata 25599142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 266
Target Start/End: Original strand, 50677275 - 50677411
Alignment:
Q  130 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50677275 ggaaaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattgtttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaa 50677374  T
Q  230 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    ||| | ||| |||||||  | ||||||| ||||||||    
T  50677375 ttgatggtggtttgataacaacaaatttttgtccaga 50677411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 247
Target Start/End: Original strand, 52655045 - 52655201
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  52655045 ctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 52655144  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  52655145 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggtggtttgatag 52655201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13401599 - 13401461
Alignment:
Q  95 acggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgta--aaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13401599 acggtgtcgtttgaatttggcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgggaaaaaaaaatgattgttgtgattcttccaatgaaa 13401500  T
Q  193 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13401499 tagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 13401461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15987338 - 15987207
Alignment:
Q  95 acggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||    
T  15987338 acggtgtcatttgaatttgtcactcctccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgatagttgtaattcttttaatgaaata 15987239  T
Q  195 gcttttcaaattgactgattaagtcattatac 226  Q
     ||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  15987238 actttcgaaattgaatgattaagtgattatac 15987207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 28132658 - 28132797
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 191  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| | |||||    
T  28132658 ctaacggcgtcgtttgaacttgtcactcctctgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 28132757  T
Q  192 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28132758 atagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 28132797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18408331 - 18408193
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt-aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |     
T  18408331 aacggtgtcgtttggatttgtcactgctctgttgtggaaaagggtaaaacgaattgtttatgcgaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatggat 18408232  T
Q  193 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18408231 tagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 18408193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Original strand, 19965812 - 19965975
Alignment:
Q  101 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgtt-gtgattcttcctatgaaatagcttt 199  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  19965812 tcatttgaatttctcattcatccgttgtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgggaaa-aaatgattgtttgtgattcttttaatgaaatagcttt 19965910  T
Q  200 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    |||| || ||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| | || |||||||||||    
T  19965911 tcaatttaactaattaagtgattatacaaattggcagtggtttgatagcatcagatttatgtcca 19965975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21596438 - 21596302
Alignment:
Q  130 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 229  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21596438 ggaaagggaaaaacaaatggtttgagcaaaaaataaatgattgttgtgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgactgattaagtgattatacaaa 21596339  T
Q  230 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 266  Q
    |||| |||| |||||||| | |  |||||||||||||    
T  21596338 ttgggagtggtttgatagcatctgatttatgtccaga 21596302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24252762 - 24252622
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  |||    
T  24252762 ctaacggggtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcactga 24252663  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24252662 aataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 24252622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 21784705 - 21784846
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  21784705 ctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 21784804  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  21784805 aaatagctttccaaattaactgattaagtgattatacaaatt 21784846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 273
Target Start/End: Original strand, 1649798 - 1649935
Alignment:
Q  136 gggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggta 235  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||      
T  1649798 gggaaaacaaatggcttatgcaaaaaagaattgattgttgcgaagctttcagtgaaatagattttcaaattgaatgattaagtgattatacaaattgggg 1649897  T
Q  236 gtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagaga 273  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  1649898 gtgatttgatagcaccagatttatgtctagaaaagaga 1649935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 231
Target Start/End: Original strand, 29387716 - 29387816
Alignment:
Q  132 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaat 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  29387716 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaat 29387815  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  29387816 t 29387816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 46791619 - 46791759
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||||||  ||  ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  46791619 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtcaagtgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcaatga 46791718  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  46791719 aatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 46791759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54430682 - 54430554
Alignment:
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttca 202  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||||||   |||||||| |||||||    
T  54430682 tttggatttgtcactcgtttgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgcaattcttttaatgaaataacttttca 54430583  T
Q  203 aattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54430582 aattgactgattaagtgattatacaaatt 54430554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Original strand, 40152084 - 40152194
Alignment:
Q  123 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  40152084 cgttgtgggaaaggggaaa-caaatggtttatgcgcaaaagaaatgattgttgtgattcgttttaatgaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgat 40152182  T
Q  222 tataccaattgg 233  Q
    ||||| ||||||    
T  40152183 tatacaaattgg 40152194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Original strand, 41707043 - 41707110
Alignment:
Q  157 aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41707043 aaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattat 41707110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8364315 - 8364174
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||  |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  8364315 ctaacggtgtcgtttggatttgtctctcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttgtgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 8364216  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8364215 aaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 8364174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 1255007 - 1255112
Alignment:
Q  124 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||  |||||||| | |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1255007 gttgcgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaattattgt--tgattctttcaatgaaataactttctaaattgaccgattaagtcatta 1255104  T
Q  224 taccaatt 231  Q
    ||| ||||    
T  1255105 tacaaatt 1255112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 261
Target Start/End: Original strand, 23164496 - 23164664
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  23164496 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaaa 23164595  T
Q  193 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 261  Q
    |||  || |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | || ||||||||    
T  23164596 tagacttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcagatttatgt 23164664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 27729691 - 27729831
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaaga-aatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||  || || | ||||||||||||||||||| | || |    
T  27729691 ctaacagtgtcgtttggatttgtcacttctatgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcgatca 27729790  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  27729791 aattgctttccaaattgattgattatgtgattatacaaatt 27729831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6715540 - 6715457
Alignment:
Q  132 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  6715540 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaataactttcaaaattgactgatta 6715457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 23067646 - 23067787
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-taaaaaagaaatgattgt-tgtgattcttcctatg 189  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||  || |||||||||| ||||||||||   |||    
T  23067646 ctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaattaaaaaatgattgtgtgtgattctttaaatg 23067745  T
Q  190 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||    
T  23067746 aaataacttttcaaattgactggtgaagtgattatacaaatt 23067787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 51147165 - 51146907
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 103  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |        | |||||| |||||| || | ||||| ||||||||||     
T  51147165 taagcttcattaaaaaatcataatcagaagaactcttaaacacgaaacaaaacaaaataaaatgaagtgaaagagagataaaatttacctaacggtgtcg 51147066  T
Q  104 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaa-aagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttca 202  Q
    |||| | | ||||||| |  || || | |||||| |||||||||||||||||  | | || |||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| |    
T  51147065 tttggaat-gtcacttctatgtcgtagaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgagagaaaaaataattgttgtgattctttcaataaaatagtttttta 51146968  T
Q  203 aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 264  Q
    |||||||||||||||| | ||| | ||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  51146967 aattgactgattaagtga-tattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttatgtcca 51146907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 4207346 - 4207418
Alignment:
Q  157 aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  4207346 aaaaaagaaaggattgttgtgattctt----tgaaatatctttccaaattgaatgattaagtgattatacaaattgg 4207418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 155
Target Start/End: Original strand, 27110794 - 27110857
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27110794 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatg 27110857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20762158 - 20762056
Alignment:
Q  125 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 223  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||  || |||||| |||||| |||| ||||    
T  20762158 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgacgaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaatagacttccaaattaactgatcaagtgatta 20762059  T
Q  224 tac 226  Q
    |||    
T  20762058 tac 20762056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 21596566 - 21596516
Alignment:
Q  1 tagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 51  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  21596566 tagctaagcttcattaaaaaatcagaatcaaaagaacttctaaacatgaaa 21596516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 40151966 - 40152019
Alignment:
Q  5 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 58  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||    
T  40151966 taagcttcattaaaaaatcagaatcataaaaacttttaaatatgaaacgaaata 40152019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 247
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17210
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa-tgattgttgtgattcttcctatgaaa 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| | | ||||    
T  17056 aacggtgtcgtttgaatttgtcacttctttgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaagaaaatgattgttgtgattctttcaacgaaa 17155  T
Q  193 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  17156 tagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgatag 17210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16852 - 16712
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaa-atgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || || || ||||| |||||||||||| | ||||    
T  16852 ctaacggtgtcgtttggatttgttactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgatcgttgtgattctttcaatga 16753  T
Q  191 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16752 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 16712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1203 - 1086
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  1203 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 1104  T
Q  191 aatagcttttcaaattga 208  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  1103 aatagctttccaaattga 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 231
Target Start/End: Original strand, 8332 - 8457
Alignment:
Q  108 aatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt--aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaat 205  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||  ||||    
T  8332 aatttgtcactcctccgttgcgggaagggggaaaacgaatggtttgtgtggaaaaaaaaaataatttttgtgattctttcaatgaaatagttttcgaaat 8431  T
Q  206 tgactgattaagtcattataccaatt 231  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  8432 tgactgattaattgattatacaaatt 8457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 224
Target Start/End: Original strand, 46099 - 46228
Alignment:
Q  94 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaat 193  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  | | |||||  |||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  46099 aacggtgtcgtttggatttgtcactcct-ctttgtgaaaaagagtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaatgattgttgtgattatttcaatgaaat 46197  T
Q  194 agcttttcaaattgactgattaagtcattat 224  Q
    ||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  46198 agacttccaaattgactgattaagtgattat 46228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Original strand, 22727 - 22844
Alignment:
Q  92 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  22727 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattattgtgattctttcaatga 22826  T
Q  191 aatagcttttcaaattga 208  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  22827 aatagtttttcatattga 22844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 99136 - 99092
Alignment:
Q  13 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  99136 attaaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaat 99092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University