View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14439_high_33 (Length: 302)

Name: NF14439_high_33
Description: NF14439
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14439_high_33
NF14439_high_33
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (24-226)||(41544666-41544868)
chr1 (24-204)||(2115336-2115517)
chr1 (24-204)||(21457873-21458053)
chr1 (24-204)||(42033528-42033708)
chr1 (24-209)||(8539582-8539767)
chr1 (24-209)||(8604821-8605006)
chr1 (24-204)||(16154219-16154399)
chr1 (24-204)||(22406812-22406992)
chr1 (24-204)||(25018805-25018984)
chr1 (24-204)||(30550149-30550330)
chr1 (24-204)||(13964233-13964413)
chr1 (24-188)||(21885666-21885830)
chr1 (24-204)||(2370951-2371131)
chr1 (23-209)||(1186961-1187147)
chr1 (27-209)||(1968676-1968851)
chr1 (23-204)||(22960216-22960396)
chr1 (23-204)||(34822359-34822544)
chr1 (25-197)||(21782039-21782210)
chr1 (25-204)||(21822006-21822184)
chr1 (41-197)||(18097507-18097663)
chr1 (41-204)||(25867589-25867753)
chr1 (41-204)||(26194013-26194177)
chr1 (24-123)||(18382780-18382879)
chr1 (38-204)||(20308144-20308311)
chr1 (38-204)||(20311623-20311790)
chr1 (41-204)||(20328953-20329117)
chr1 (41-204)||(27065410-27065574)
chr1 (42-204)||(1975282-1975444)
chr1 (42-210)||(1990066-1990234)
chr1 (41-204)||(12418173-12418337)
chr1 (42-150)||(41207892-41208000)
chr1 (41-204)||(37011348-37011511)
chr1 (42-204)||(1982648-1982810)
chr1 (97-198)||(4950363-4950464)
chr1 (228-286)||(41544898-41544956)
chr1 (119-204)||(18381421-18381506)
chr1 (48-204)||(50940496-50940651)
chr1 (48-150)||(2653041-2653143)
chr1 (23-109)||(18062767-18062853)
chr1 (71-204)||(2371536-2371669)
chr1 (30-78)||(25824003-25824051)
chr1 (168-204)||(20585215-20585251)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (24-204)||(24931581-24931761)
chr6 (24-198)||(24922545-24922719)
chr6 (24-204)||(18159063-18159243)
chr6 (24-204)||(26425890-26426070)
chr6 (24-204)||(12454298-12454478)
chr6 (24-209)||(20911632-20911817)
chr6 (24-204)||(14790939-14791119)
chr6 (24-204)||(23777805-23777985)
chr6 (24-204)||(31356805-31356985)
chr6 (24-204)||(31366533-31366713)
chr6 (24-204)||(3285182-3285362)
chr6 (24-204)||(18200608-18200788)
chr6 (24-204)||(29539794-29539974)
chr6 (34-209)||(20926080-20926255)
chr6 (24-204)||(18168881-18169055)
chr6 (23-197)||(27788110-27788284)
chr6 (41-204)||(16897010-16897174)
chr6 (41-204)||(16907663-16907827)
chr6 (41-204)||(1595766-1595930)
chr6 (23-204)||(12991117-12991299)
chr6 (23-204)||(26021745-26021926)
chr6 (41-204)||(17823421-17823585)
chr6 (62-204)||(7756036-7756179)
chr6 (41-204)||(30658721-30658884)
chr6 (41-204)||(18712766-18712930)
chr6 (62-198)||(24370897-24371033)
chr6 (41-204)||(24505986-24506150)
chr6 (90-204)||(34764658-34764772)
chr6 (41-204)||(16320620-16320784)
chr6 (41-204)||(16922898-16923062)
chr6 (42-206)||(24692166-24692330)
chr6 (90-196)||(8563849-8563955)
chr6 (41-204)||(26161234-26161391)
chr6 (41-150)||(9762040-9762149)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (24-204)||(6421638-6421818)
chr3 (24-204)||(6432078-6432258)
chr3 (24-204)||(8982659-8982839)
chr3 (24-204)||(16335993-16336173)
chr3 (24-204)||(1685866-1686046)
chr3 (24-204)||(8972076-8972256)
chr3 (24-204)||(12804838-12805018)
chr3 (24-204)||(25432196-25432376)
chr3 (24-204)||(12538-12719)
chr3 (24-213)||(10012778-10012967)
chr3 (24-198)||(20491397-20491571)
chr3 (24-204)||(4024942-4025122)
chr3 (24-189)||(55478594-55478759)
chr3 (42-204)||(17732231-17732393)
chr3 (42-204)||(19033462-19033624)
chr3 (23-204)||(4783571-4783752)
chr3 (41-204)||(2490167-2490331)
chr3 (25-204)||(4370341-4370520)
chr3 (25-204)||(4380087-4380266)
chr3 (41-204)||(5656459-5656623)
chr3 (41-204)||(9536238-9536402)
chr3 (41-204)||(9546660-9546824)
chr3 (41-204)||(19828851-19829015)
chr3 (41-204)||(20292465-20292629)
chr3 (41-204)||(51979338-51979500)
chr3 (42-196)||(24792787-24792941)
chr3 (41-204)||(18560253-18560418)
chr3 (41-204)||(13120546-13120710)
chr3 (41-204)||(20745640-20745804)
chr3 (25-204)||(24762870-24763049)
chr3 (42-204)||(24873836-24873998)
chr3 (42-204)||(49387932-49388094)
chr3 (41-196)||(13113417-13113574)
chr3 (62-158)||(11459429-11459524)
chr3 (59-155)||(11044776-11044872)
chr3 (45-158)||(21542838-21542951)
chr3 (168-204)||(12375926-12375962)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (24-204)||(52302-52482)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (24-204)||(21988562-21988742)
chr8 (24-197)||(21998080-21998253)
chr8 (24-198)||(25034639-25034813)
chr8 (24-204)||(791072-791253)
chr8 (35-204)||(21446766-21446935)
chr8 (24-204)||(17268178-17268358)
chr8 (41-204)||(9325823-9325987)
chr8 (41-204)||(21203656-21203820)
chr8 (41-204)||(21214072-21214236)
chr8 (23-204)||(7757107-7757281)
chr8 (41-204)||(21333279-21333443)
chr8 (23-204)||(2690837-2691019)
chr8 (41-207)||(5758710-5758877)
chr8 (23-204)||(20098151-20098332)
chr8 (23-204)||(14882311-14882492)
chr8 (41-204)||(20531904-20532068)
chr8 (23-204)||(14894677-14894858)
chr8 (41-204)||(32008381-32008545)
chr8 (42-204)||(26362918-26363080)
chr8 (39-196)||(5867953-5868110)
chr8 (41-204)||(13673492-13673656)
chr8 (41-196)||(25506819-25506975)
chr8 (62-204)||(3967330-3967473)
chr8 (41-204)||(12842073-12842235)
chr8 (41-197)||(31992013-31992170)
chr8 (90-199)||(14436708-14436817)
chr8 (41-204)||(33774704-33774868)
chr8 (25-204)||(20707484-20707662)
chr8 (42-158)||(37295337-37295453)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (24-204)||(9535786-9535966)
chr7 (24-204)||(9546069-9546249)
chr7 (24-204)||(32108153-32108333)
chr7 (24-204)||(46496228-46496408)
chr7 (24-204)||(46506840-46507020)
chr7 (24-204)||(16132607-16132787)
chr7 (24-204)||(16143171-16143351)
chr7 (24-204)||(32097716-32097896)
chr7 (24-204)||(42620515-42620696)
chr7 (24-188)||(22964798-22964962)
chr7 (23-204)||(2992459-2992640)
chr7 (41-209)||(5926013-5926182)
chr7 (41-204)||(6543968-6544132)
chr7 (41-204)||(6533669-6533833)
chr7 (28-204)||(14943647-14943820)
chr7 (28-204)||(15371240-15371413)
chr7 (24-158)||(14114628-14114762)
chr7 (24-158)||(14424278-14424412)
chr7 (97-204)||(19799037-19799144)
chr7 (62-204)||(10414791-10414933)
chr7 (30-204)||(14249091-14249265)
chr7 (23-204)||(24541439-24541620)
chr7 (41-204)||(26348932-26349096)
chr7 (41-204)||(43982437-43982601)
chr7 (41-204)||(5382551-5382715)
chr7 (41-204)||(5392205-5392369)
chr7 (41-204)||(8500068-8500232)
chr7 (41-204)||(8510538-8510702)
chr7 (41-204)||(11627201-11627365)
chr7 (41-204)||(26363952-26364116)
chr7 (41-197)||(27987831-27987989)
chr7 (25-204)||(12769451-12769631)
chr7 (41-204)||(44896508-44896672)
chr7 (41-204)||(44906859-44907023)
chr7 (90-204)||(25441482-25441596)
chr7 (42-204)||(31824051-31824213)
chr7 (42-204)||(42594684-42594846)
chr7 (42-155)||(12827937-12828050)
chr7 (42-158)||(13286360-13286476)
chr7 (41-204)||(19585086-19585250)
chr7 (101-204)||(41026872-41026975)
chr7 (97-204)||(45552532-45552639)
chr7 (90-204)||(5616121-5616235)
chr7 (41-158)||(40701325-40701442)
chr7 (42-204)||(33090514-33090675)
chr7 (25-156)||(9006291-9006417)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (24-204)||(40921029-40921209)
chr4 (24-204)||(18106059-18106239)
chr4 (24-198)||(17985417-17985591)
chr4 (24-204)||(52498467-52498647)
chr4 (24-204)||(16252748-16252929)
chr4 (24-199)||(17160580-17160755)
chr4 (24-204)||(26330562-26330742)
chr4 (24-196)||(15668532-15668704)
chr4 (23-204)||(6406372-6406553)
chr4 (24-185)||(9836591-9836752)
chr4 (41-204)||(16248388-16248552)
chr4 (41-204)||(6691319-6691483)
chr4 (41-204)||(6701725-6701889)
chr4 (23-158)||(11476471-11476606)
chr4 (24-204)||(13403567-13403749)
chr4 (41-204)||(16471981-16472144)
chr4 (41-204)||(44888078-44888241)
chr4 (39-197)||(1292696-1292854)
chr4 (25-204)||(7847323-7847502)
chr4 (41-204)||(2828882-2829046)
chr4 (41-204)||(3488494-3488658)
chr4 (41-204)||(5294002-5294166)
chr4 (41-204)||(5303616-5303780)
chr4 (41-204)||(21845297-21845461)
chr4 (41-204)||(21854726-21854890)
chr4 (41-204)||(21901160-21901324)
chr4 (41-204)||(21910589-21910753)
chr4 (41-204)||(27681664-27681828)
chr4 (41-204)||(27691275-27691439)
chr4 (41-204)||(3497761-3497925)
chr4 (41-204)||(17829141-17829305)
chr4 (41-204)||(17838532-17838696)
chr4 (23-204)||(3606590-3606771)
chr4 (41-204)||(16628842-16629007)
chr4 (41-204)||(12865669-12865833)
chr4 (90-204)||(522843-522957)
chr4 (42-158)||(17421899-17422014)
chr4 (42-204)||(26457677-26457839)
chr4 (90-204)||(14601312-14601426)
chr4 (24-204)||(4417030-4417217)
chr4 (142-204)||(16241632-16241695)
chr4 (92-199)||(40883824-40883931)
chr4 (41-109)||(16211756-16211824)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (24-204)||(29131534-29131714)
chr2 (24-204)||(2999251-2999431)
chr2 (24-204)||(17488026-17488206)
chr2 (24-204)||(24697047-24697227)
chr2 (24-204)||(45014068-45014248)
chr2 (24-204)||(38958281-38958461)
chr2 (24-204)||(45024145-45024325)
chr2 (24-204)||(44639460-44639640)
chr2 (24-204)||(38930946-38931125)
chr2 (41-204)||(9503566-9503730)
chr2 (41-204)||(9514932-9515096)
chr2 (39-197)||(15940034-15940192)
chr2 (42-204)||(15479323-15479485)
chr2 (39-158)||(24239710-24239829)
chr2 (41-204)||(4456158-4456322)
chr2 (41-204)||(4457222-4457386)
chr2 (41-204)||(4466847-4467011)
chr2 (41-204)||(5337947-5338111)
chr2 (41-204)||(5347843-5348007)
chr2 (41-204)||(16934859-16935023)
chr2 (41-204)||(17005519-17005683)
chr2 (41-204)||(18660682-18660846)
chr2 (41-204)||(22688253-22688417)
chr2 (42-198)||(22901420-22901576)
chr2 (41-204)||(32937981-32938145)
chr2 (41-197)||(3606492-3606648)
chr2 (41-204)||(18662423-18662587)
chr2 (42-204)||(22909363-22909525)
chr2 (41-204)||(12569895-12570059)
chr2 (90-204)||(27160557-27160671)
chr2 (90-204)||(27170926-27171040)
chr2 (43-204)||(573570-573732)
chr2 (105-199)||(23721275-23721369)
chr2 (41-204)||(18650353-18650517)
chr2 (97-204)||(45190098-45190205)
chr2 (107-185)||(28460989-28461067)
chr2 (24-109)||(72658-72743)
chr2 (41-127)||(45190236-45190323)
chr2 (131-204)||(18495838-18495911)
chr2 (101-204)||(19341626-19341726)
chr2 (42-150)||(16135701-16135809)
chr2 (41-197)||(40409606-40409761)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (24-204)||(75269-75450)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (24-209)||(26203315-26203500)
chr5 (24-204)||(26192755-26192935)
chr5 (24-204)||(32069776-32069956)
chr5 (24-204)||(27411484-27411664)
chr5 (24-204)||(11411716-11411896)
chr5 (24-204)||(22240348-22240528)
chr5 (41-204)||(33938410-33938573)
chr5 (41-204)||(33948810-33948973)
chr5 (41-204)||(8766278-8766442)
chr5 (23-204)||(23379130-23379311)
chr5 (25-204)||(20905301-20905479)
chr5 (41-199)||(20763675-20763834)
chr5 (23-204)||(22174066-22174247)
chr5 (41-204)||(21680849-21681013)
chr5 (41-204)||(21752377-21752541)
chr5 (41-204)||(21761800-21761964)
chr5 (41-204)||(27274962-27275126)
chr5 (41-204)||(31916122-31916286)
chr5 (41-204)||(37816889-37817053)
chr5 (25-204)||(20896262-20896440)
chr5 (41-204)||(13572493-13572657)
chr5 (41-204)||(18210656-18210820)
chr5 (41-204)||(18360408-18360572)
chr5 (41-204)||(18389408-18389572)
chr5 (41-204)||(30944627-30944791)
chr5 (41-204)||(30954049-30954213)
chr5 (41-204)||(37549402-37549566)
chr5 (41-204)||(37652200-37652364)
chr5 (41-204)||(4038761-4038925)
chr5 (41-204)||(18220006-18220170)
chr5 (41-204)||(19889123-19889287)
chr5 (41-204)||(42091301-42091467)
chr5 (42-204)||(20947122-20947284)
chr5 (42-204)||(20957511-20957673)
chr5 (41-204)||(37299612-37299776)
chr5 (41-142)||(206260-206362)
chr5 (42-197)||(19549047-19549203)
chr5 (97-204)||(34131285-34131392)
chr5 (23-114)||(31104835-31104926)
chr5 (139-204)||(15240546-15240611)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (24-204)||(12711-12891)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (24-204)||(310571-310750)
scaffold0005 (90-204)||(215952-216066)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (24-204)||(87301-87483)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (24-204)||(19928-20107)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (24-204)||(15185-15365)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (24-204)||(4762-4943)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (24-204)||(7706-7887)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (24-204)||(93404-93585)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (41-204)||(8646-8810)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (76-204)||(132329-132457)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (23-197)||(29314-29488)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (62-204)||(22120-22263)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (42-197)||(267494-267649)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-204)||(13154-13335)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (25-204)||(10625-10803)
[»] scaffold0590 (1 HSPs)
scaffold0590 (23-204)||(9607-9788)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (41-204)||(58863-59027)
scaffold0058 (41-204)||(67106-67270)
scaffold0058 (41-204)||(57745-57909)
scaffold0058 (41-204)||(24372-24536)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (76-199)||(22915-23038)
scaffold0234 (24-75)||(21622-21673)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (41-204)||(112362-112526)
scaffold0031 (97-204)||(103163-103270)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (41-204)||(53957-54121)
scaffold0018 (41-204)||(57909-58073)
[»] scaffold0014 (5 HSPs)
scaffold0014 (41-204)||(234978-235142)
scaffold0014 (25-204)||(115079-115258)
scaffold0014 (23-204)||(167454-167635)
scaffold0014 (41-197)||(146043-146202)
scaffold0014 (41-204)||(154087-154251)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (41-204)||(1437-1602)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (41-204)||(18071-18235)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (41-204)||(33438-33602)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (47-158)||(65071-65182)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (23-204)||(199231-199413)
scaffold0015 (168-204)||(188943-188979)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (62-204)||(273-416)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (42-204)||(1377-1539)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (42-204)||(5070-5232)
scaffold0313 (42-204)||(19227-19389)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (98-204)||(41226-41332)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (41-204)||(12455-12619)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (41-147)||(30-137)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (101-204)||(13870-13973)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (64-209)||(22691-22838)
[»] scaffold1411 (1 HSPs)
scaffold1411 (41-196)||(207-364)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (106-204)||(396616-396714)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (30-79)||(1376-1425)
[»] scaffold0756 (1 HSPs)
scaffold0756 (168-204)||(4016-4052)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (168-204)||(13985-14021)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Original strand, 41544666 - 41544868
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41544666 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgatttttggtatgatttaaactttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 41544765  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagtatttagcctaaaatt 223  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  41544766 ccaagtaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttacctcaagagtatttggcctaaaatt 41544865  T
Q  224 tat 226  Q
    |||    
T  41544866 tat 41544868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2115517 - 2115336
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2115517 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 2115418  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatt-agggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2115417 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattaagggattttgcctcaa 2115336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21458053 - 21457873
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21458053 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatggttcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 21457954  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21457953 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21457873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42033708 - 42033528
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033708 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgatttttggtatgatttaaaccttgttcctatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 42033609  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42033608 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 42033528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8539767 - 8539582
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8539767 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcctgatatgatttaaaccttgctcctgtcttagtgaaacactcaagagcacaagttaaata 8539668  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8539667 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattcgtttattatccttaaaattaattagggattttgcctcaacagta 8539582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8605006 - 8604821
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8605006 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcctgatatgatttaaaccttgctcctgtcttagtgaaacactcaagagcacaagttaaata 8604907  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8604906 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattcgtttattatccttaaaattaattagggattttgcctcaacagta 8604821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16154399 - 16154219
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154399 gttagatcatgagttcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 16154300  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16154299 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16154219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 22406812 - 22406992
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22406812 gttagatcatgaaatcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacacttaagagcacaagttaaata 22406911  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22406912 ccaaggagttaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 22406992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25018984 - 25018805
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25018984 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaatattg-tcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 25018886  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25018885 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 25018805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 30550149 - 30550330
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30550149 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggaatgataaaaacattgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 30550248  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatt-agggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30550249 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattaagggattttgcctcaa 30550330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13964413 - 13964233
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  13964413 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcatggtatgatttaaaccttgttccagtcttagtaaaatactcacgagcagaagttaaata 13964314  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13964313 ccaatgaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagagattttgcctcaa 13964233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21885830 - 21885666
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21885830 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttgctatgatttaaactttgtttctgtctaagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 21885731  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||| |||||||||||    
T  21885730 ccaaagaattaatcaaagtccattaattttctaatcatattgatttattatctttaaaattaatt 21885666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 2370951 - 2371131
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2370951 gttagatcatgaatccaaatgtcttttgatttcttgaatcttggtatgatttaaaccttgttcatgtcttactaaaacactcaagagtacaagttaaata 2371050  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2371051 ccaaggaattaatcagagtccattaattctttaatcataaaggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 2371131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 1186961 - 1187147
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1186961 agttagttcatgaatccaaatgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgtttctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaat 1187060  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||| ||||    
T  1187061 accaagaaattaatcaaagtccatcaatttcttaatcattgaggtttattatctttaaaactaattagaaattttgcctcaacagta 1187147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1968851 - 1968676
Alignment:
Q  27 agatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatacca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1968851 agatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttg-------gtatgatttaaactttgtttctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatatca 1968759  T
Q  127 aaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    |  |||||||||||||||||| | |||||||| ||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1968758 aggaattaatcaaagtccatttaatctttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcttcaacagta 1968676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22960396 - 22960216
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960396 agttagttcatgaattcaa-tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 22960298  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    | |||  ||||||||||||| |||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22960297 atcaaggaattaatcaaagttcatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 22960216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34822544 - 34822359
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttg---at-tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagtt 118  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34822544 agttagttcataaagtcaaatgtcctttgatttcttgtatatatcttggtatgaattaaacattgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagtt 34822445  T
Q  119 aaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34822444 aaataccaataaattaatcaaagtccattaattctttaatcatcaaggtttattatctttaaaactaattaggaattttgcttcaa 34822359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21782210 - 21782039
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 124  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782210 ttagttcatgaattcaac-gtcctttgatttcttctatcttggtctgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 21782112  T
Q  125 caaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21782111 caaggaattaatcaaagtccatttagtccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggatttt 21782039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 21822006 - 21822184
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 124  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21822006 ttagttcatgaattcat-tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 21822104  T
Q  125 caaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |    |||||||||||  ||||| | || ||||| ||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21822105 cggggaattaatcaaaacccatttagtccttaatcattatagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21822184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Original strand, 18097507 - 18097663
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  18097507 aatgttctttgatttcttgtatcttggtattatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagaacacaagttaaatacaaaggaattaatcaaa 18097606  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    ||||||| | || ||||| ||    | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18097607 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatccttaaaattaattagggatttt 18097663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25867753 - 25867589
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  25867753 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaatttaaataccaaggaattaatcaa 25867654  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| ||| | |||||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25867653 agtcaatttaatctttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 25867589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 26194013 - 26194177
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26194013 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcatgtcttagtaaaaacagtcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 26194112  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26194113 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26194177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18382879 - 18382780
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18382879 gttagatcatgtattcaaatgtcctttgatttcttgaatcttggtatgatttaaacctgatttctgtcttagtaaaatactcaagagcacaatttaaata 18382780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20308311 - 20308144
Alignment:
Q  38 tcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaat 136  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  20308311 tcaaatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcatgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgatttaat 20308212  T
Q  137 caaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20308211 caaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20308144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20311790 - 20311623
Alignment:
Q  38 tcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaat 136  Q
    ||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  20311790 tcaaatgtcttttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggatttaat 20311691  T
Q  137 caaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20311690 caaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20311623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 20328953 - 20329117
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20328953 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaagccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatacgaaggaattaatcaa 20329052  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20329053 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20329117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27065574 - 27065410
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||| ||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  27065574 aatgtcttttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatgaatcaa 27065475  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27065474 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 27065410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 1975282 - 1975444
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1975282 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 1975381  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1975382 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 1975444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Original strand, 1990066 - 1990234
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1990066 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagaacacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 1990165  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagtat 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  1990166 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaacagtat 1990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12418337 - 12418173
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | || ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12418337 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcatacttttttcctgtcttagttaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 12418238  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12418237 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattaggaattttgcctcaa 12418173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41208000 - 41207892
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41208000 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgtttctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 41207901  T
Q  142 tccattaat 150  Q
    |||||||||    
T  41207900 tccattaat 41207892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37011511 - 37011348
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    ||||||||||| |||  ||  ||||||||| ||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37011511 aatgtcctttgttttaatgtatcttggtattattcaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 37011412  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  37011411 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaatcatggattttgcctcaa 37011348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 1982648 - 1982810
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1982648 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagaacacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 1982747  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1982748 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 1982810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4950464 - 4950363
Alignment:
Q  97 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4950464 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaagaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattt 4950365  T
Q  197 tg 198  Q
    ||    
T  4950364 tg 4950363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 286
Target Start/End: Original strand, 41544898 - 41544956
Alignment:
Q  228 tacaaagtacatcaattaatcatgatgttatcatttaaaaccaactttaatgtcatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41544898 tacaaagtacatcaattaatcatgatgtcatcatttaaaaccaactttaatgtcatgtc 41544956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18381506 - 18381421
Alignment:
Q  119 aaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18381506 aaataccaaggaattaatcaaagtccattaattatttaataataatggtttattatctttaaaattaattagggattttgcttcaa 18381421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50940651 - 50940496
Alignment:
Q  48 tttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccatt 147  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| |  ||| |  | ||||||| || |||||||||||||   ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  50940651 tttgattacttgcttcttggtttgatttatatattgttcttgtcttagttaatcactcaagagcacgtattaaa-accaagaaactaatcaaagtccatt 50940553  T
Q  148 aattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||    | || |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  50940552 aattctttaatcatcaaagtttgttatctttaaaattatttaaggattttgcctcaa 50940496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 150
Target Start/End: Original strand, 2653041 - 2653143
Alignment:
Q  48 tttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccatt 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||| | |||||||| | || ||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  2653041 tttgattacttgattcttggtctgatttgtactttgttcctctcttatttaatcactcaagcacacatattaaataccaagaaattaatcaaacttcatt 2653140  T
Q  148 aat 150  Q
    |||    
T  2653141 aat 2653143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Original strand, 18062767 - 18062853
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaaga 109  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||| || | |||| || || |||||||||    
T  18062767 agttagttcatgaattcaagtgtccttttatttcttgtatcttggtttgatttaaactttgtttgtttcttggttaatcactcaaga 18062853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2371669 - 2371536
Alignment:
Q  71 gatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgctta 170  Q
    ||||||||||||  || | ||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||   | |||    
T  2371669 gatttaaaccttcgttatgtcttagttaaacactctagagttcaaggtaaataccaaggaattaatcagagttccttaattccttaatcataaagggtta 2371570  T
Q  171 ttatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| | ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2371569 ttatttttaaaaataattaaggattttgcctcaa 2371536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 25824003 - 25824051
Alignment:
Q  30 tcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaa 78  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25824003 tcatgaattcaaacatcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaa 25824051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20585251 - 20585215
Alignment:
Q  168 ttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20585251 ttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20585215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 24931581 - 24931761
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931581 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 24931680  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24931681 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 24931761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 24922545 - 24922719
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24922545 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 24922644  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttg 198  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24922645 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttg 24922719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18159243 - 18159063
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18159243 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 18159144  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18159143 ccaagtaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18159063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26426070 - 26425890
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26426070 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 26425971  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26425970 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26425890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12454478 - 12454298
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12454478 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 12454379  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12454378 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 12454298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20911817 - 20911632
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911817 gttagatcataaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 20911718  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20911717 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaacagta 20911632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14791119 - 14790939
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14791119 gttagatcatgaaatcaaatgtcctttgatttcttgattcttggcatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 14791020  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14791019 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 14790939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23777985 - 23777805
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23777985 gttagatcattaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaacttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 23777886  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23777885 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 23777805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31356985 - 31356805
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31356985 gttagatcatgaattcaaatgccctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaata 31356886  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31356885 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 31356805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31366713 - 31366533
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31366713 gttagatcatgaattcaaatgccctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaata 31366614  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31366613 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 31366533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3285362 - 3285182
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285362 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattattggtatgatataaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 3285263  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
     |||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3285262 acaaggagttaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 3285182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18200788 - 18200608
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18200788 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgaattcatgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaataacacaagttaaata 18200689  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18200688 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18200608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29539974 - 29539794
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29539974 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaactttgttcctgtcttagtataacactcaagagcacaagttaaata 29539875  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29539874 ccaagtaattaatcaaagctcattaattctttaatcatattgatttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 29539794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20926255 - 20926080
Alignment:
Q  34 gaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  20926255 gaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgtatt 20926156  T
Q  134 aatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20926155 aatcaaattccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaacagta 20926080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18169055 - 18168881
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169055 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattca------gttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 18168962  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18168961 ccaagtaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18168881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 27788110 - 27788284
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27788110 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaacattgttcatgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaat 27788209  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27788210 accaagaaattaatcaaaatccattaattctttaatcataaaggtttattatctttaaaattatttagggatttt 27788284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16897174 - 16897010
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16897174 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 16897075  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16897074 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16897010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16907827 - 16907663
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16907827 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 16907728  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16907727 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16907663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1595930 - 1595766
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1595930 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 1595831  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1595830 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 1595766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 12991117 - 12991299
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12991117 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaa 12991215  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatat-ttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| || |   | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12991216 taccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcatttaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 12991299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 26021745 - 26021926
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26021745 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctatcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaa 26021843  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26021844 taccaaggaatgaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26021926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17823585 - 17823421
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17823585 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcgtagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 17823486  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17823485 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattaggggttttgcctcaa 17823421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 204
Target Start/End: Original strand, 7756036 - 7756179
Alignment:
Q  62 tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaatta 160  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||| |    
T  7756036 tcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatcttcaatca 7756135  T
Q  161 tatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7756136 ttaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 7756179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 30658721 - 30658884
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  30658721 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtattattcaaaccttgtttctgtcttagtaaaacactcaagagcacaaattaaataccaaggaattaatcaaa 30658820  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| || | || ||||| ||      ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30658821 gtccctttaatccttaatcattaaattttattatctttaaaattaattaggaattttgcctcaa 30658884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 18712766 - 18712930
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18712766 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgccttagtaaaaacattcaagagcacaacttaaataccaaggaattaatcaa 18712865  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18712866 agtccatttaatccttaataattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18712930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 198
Target Start/End: Original strand, 24370897 - 24371033
Alignment:
Q  62 tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattat 161  Q
    ||||||||||| || || |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24370897 tcttggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcat 24370996  T
Q  162 atttgcttattatctctaaaattaattagggattttg 198  Q
        | || |||| | |||||||||||||||||||||    
T  24370997 caaggtttgttatttttaaaattaattagggattttg 24371033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 24505986 - 24506150
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24505986 aatgtcctttgattttatgtatcttagtatgattcaaaccttgttcctgtcatagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaa 24506085  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24506086 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 24506150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34764772 - 34764658
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| |||||    
T  34764772 tcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaatta 34764673  T
Q  190 gggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| ||||    
T  34764672 gggattttgcctcaa 34764658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16320784 - 16320620
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||    
T  16320784 aatgtcctttgatttaatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacattcaagagcaccagctaaatacaaaggaattaatcaa 16320685  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16320684 agtccatttaatccttaatcattaaaggttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16320620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16923062 - 16922898
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||    
T  16923062 aatgtcatttgatttcatgtatcttggtatgatttaaaccttgtttctatcttagtaaaaaaacttaagagcacaagttaaatactaaggacttaatcaa 16922963  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||      ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16922962 agtccatttaatccttaatcattaaaatttattatctttaaaattaattagggatgttgcctcaa 16922898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24692330 - 24692166
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| |  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24692330 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcatgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaat 24692231  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaaga 206  Q
    | | ||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24692230 ttcgttaattccttaatcattaaggtttgttatctttaaaattaattaggaattttgcctcaaga 24692166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 196
Target Start/End: Original strand, 8563849 - 8563955
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    | || ||| || ||||||||||||    
T  8563849 tcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattacttccttaatcatcaaggtttgttaactttaaaattaatta 8563948  T
Q  190 gggattt 196  Q
    |||||||    
T  8563949 gggattt 8563955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26161391 - 26161234
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26161391 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttttttctgtcttagtaaaaacactc--gagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 26161294  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||| ||     || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26161293 agttca-----tccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26161234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Original strand, 9762040 - 9762149
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||  || |||| ||||||| || || |||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  9762040 aatgttctttgattgcttgcttcttggtttgatttatactatgtttctgtcttagttaatcaatcaagaacacatattaaataccaataaactaatcaaa 9762139  T
Q  141 gtccattaat 150  Q
    ||||||||||    
T  9762140 gtccattaat 9762149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6421818 - 6421638
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421818 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 6421719  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6421718 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 6421638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6432258 - 6432078
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6432258 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagctgaata 6432159  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6432158 ccaagaaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 6432078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8982839 - 8982659
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8982839 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 8982740  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8982739 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 8982659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 16335993 - 16336173
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16335993 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaata 16336092  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16336093 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16336173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 1685866 - 1686046
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685866 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 1685965  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1685966 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 1686046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8972256 - 8972076
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8972256 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 8972157  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8972156 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 8972076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 12804838 - 12805018
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12804838 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 12804937  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12804938 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 12805018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25432376 - 25432196
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25432376 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 25432277  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25432276 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctataatcatatttgtttattatctttaaaattaatttgggattttgcctcaa 25432196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 12538 - 12719
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12538 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgatttttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 12637  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatt-agggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12638 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattaagggattttgcctcaa 12719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 213
Target Start/End: Original strand, 10012778 - 10012967
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10012778 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttagtaaaacactcaagagtacaagttaaata 10012877  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagtattta 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  10012878 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaacagaattta 10012967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20491571 - 20491397
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491571 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttattgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 20491472  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttg 198  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20491471 ccaaggaattaatcaaagcccattaattctttaatcatattggttcattatctttaaaattaattacggattttg 20491397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 4024942 - 4025122
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4024942 gttagatcatgaattcaaatgtcctttaatttcttgattcttggtatgatttaaacattgttccagtcttagtaaaacactcaagagcagaagttaaata 4025041  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4025042 ccaatgaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggatattgcctcaa 4025122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Original strand, 55478594 - 55478759
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55478594 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgaatcttggtatgatttaaaccttgttcccgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaata 55478693  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  55478694 ccaagaaattaatcaaagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaaattaatta 55478759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17732393 - 17732231
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17732393 atgtcctttgatttcttatttcttggtatgaattaaaccttgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaaacaaag 17732294  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17732293 tccattaattccttaatcatcaatatttgttatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 17732231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19033624 - 19033462
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19033624 atgtcctttgatttcttatttcttggtatgaattaaaccttgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaaacaaag 19033525  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19033524 tccattaattccttaatcatcaatatttgttatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 19033462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 4783571 - 4783752
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4783571 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaa 4783669  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4783670 taccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4783752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 2490167 - 2490331
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2490167 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 2490266  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2490267 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 2490331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4370520 - 4370341
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4370520 ttagttcatggattcaaa-gtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaata 4370422  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4370421 ccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4370341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4380266 - 4380087
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4380266 ttagttcatggattcaaa-gtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaata 4380168  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4380167 ccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4380087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 5656459 - 5656623
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5656459 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5656558  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5656559 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 5656623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9536402 - 9536238
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9536402 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9536303  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9536302 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 9536238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9546824 - 9546660
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9546824 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9546725  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9546724 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 9546660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 19828851 - 19829015
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19828851 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacacttaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 19828950  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19828951 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 19829015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20292629 - 20292465
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20292629 aatgtcctttgatttcatgcatcttagtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 20292530  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| ||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20292529 agtctatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20292465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 51979338 - 51979500
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  51979338 aatgtcctttgatt-cttgtatcttggtattatttaaacattgttcctgtcttagtaaaacattcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaa 51979436  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51979437 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcatcaa 51979500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24792941 - 24792787
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24792941 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgtttctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaat 24792842  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    | ||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  24792841 ttcattaattccttaatcatcaatgtttgttatctttaaaattaattagggattt 24792787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18560418 - 18560253
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaa-aaaattaatca 138  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  18560418 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatttaatca 18560319  T
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18560318 aagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18560253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 13120546 - 13120710
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13120546 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 13120645  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    | |||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13120646 aatccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 13120710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 20745640 - 20745804
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  20745640 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagatcacaagttaaataccaaggaattaatgaa 20745739  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20745740 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20745804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24763049 - 24762870
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  24763049 ttagttcatgaattcaa-tgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaacattgtttctgtctgagtaaaaacattcaaaagcgcaagttaaata 24762951  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24762950 ccaaagaattaatcaaagttcatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 24762870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 24873836 - 24873998
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | || || |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24873836 atgtcctttgattctttgtatcttggtataaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 24873935  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||||  || | |||   | || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24873936 tccattaattccctattaataaaggtttgttatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 24873998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 49387932 - 49388094
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49387932 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 49388031  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49388032 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 49388094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Original strand, 13113417 - 13113574
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cac-tcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatca 138  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13113417 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtaaaaacacctcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 13113516  T
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    || |||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13113517 aaatccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattt 13113574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11459524 - 11459429
Alignment:
Q  62 tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaat 158  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11459524 tcttgatatgatttaaacattgttcctctcttacttaaacactcaa-agcacaagttaaatatcaagaaattaatcaaagtccattaattccttaat 11459429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 155
Target Start/End: Original strand, 11044776 - 11044872
Alignment:
Q  59 gattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattcttt 155  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| || | | ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  11044776 gattcttggtttgatttatactttgtttatgttttagttaaacactcaagaacacaaattagataccaagaaactaatcaaaattcattaattcttt 11044872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 158
Target Start/End: Original strand, 21542838 - 21542951
Alignment:
Q  45 tcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtcc 144  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| |||||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    ||| |||| ||||| |    
T  21542838 tcctttaattgcttgcttcttggaatgatttatactttgtttatgtcttagttaaacactcaagaatacaaattaaatacagtgaaactaattaaagttc 21542937  T
Q  145 attaattctttaat 158  Q
    |||||| |||||||    
T  21542938 attaatcctttaat 21542951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12375962 - 12375926
Alignment:
Q  168 ttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12375962 ttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 12375926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52482 - 52302
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52482 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 52383  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  52382 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 52302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 21988562 - 21988742
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21988562 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 21988661  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21988662 ccaagaaattaatcaaagtccattaattctttattcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21988742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Original strand, 21998080 - 21998253
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998080 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 21998179  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21998180 ccaagaaattaatcaaagtccattaattctttattcatatttgtttattatctttaaaattaattagggatttt 21998253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25034813 - 25034639
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25034813 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaacttgttcctgtcttactaaaacactcaagagcacaagttaaata 25034714  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttg 198  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25034713 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattaggaattttg 25034639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 791253 - 791072
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791253 gttagataatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttagtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 791154  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaa-ttagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  791153 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaaattaatttagggattttgcctcaa 791072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21446935 - 21446766
Alignment:
Q  35 aattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaatta 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21446935 aattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaactttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatta 21446836  T
Q  135 atcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21446835 atcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21446766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17268358 - 17268178
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17268358 gttagatcatgaattccaatgtcctttgatttcttgaatcttagtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagaacaagttaaata 17268259  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17268258 ccaatgaataaatcaaagtccattaattctttaatcataatggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 17268178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 9325823 - 9325987
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9325823 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9325922  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9325923 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 9325987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 21203656 - 21203820
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21203656 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21203755  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21203756 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21203820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 21214072 - 21214236
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21214072 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21214171  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21214172 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21214236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7757281 - 7757107
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757281 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 7757182  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||  ||||||||||||| ||| ||  |       ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7757181 accaaggaattaatcaaagttcataaaggc-------ataatggtttattatctttaaaattaattagggattttgcttcaa 7757107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21333443 - 21333279
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21333443 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaagcactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21333344  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21333343 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21333279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 2690837 - 2691019
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2690837 agttagttcataaaatcaaatgtcctttgatttcttgaatcttggtataatttaaactttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaa 2690936  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2690937 taccaagaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaagtttattgtctttaaaattaattaaggattttgcctcaa 2691019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5758877 - 5758710
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5758877 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaagaattaatcaa 5758778  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagag 207  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5758777 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaagag 5758710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20098332 - 20098151
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20098332 agttagttcatgaattcaaatgtccattgatttcttgaatcttggtatgatttaaaccttgttcttgttttagttaaacactcaagagcacaagttaaaa 20098233  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||    | ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20098232 actaagaaattaatcaaagtccattaattccttaaccatcaaggtttattatccttaaaattaattagagattttgcctcaa 20098151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 14882311 - 14882492
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14882311 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgtttctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaa 14882409  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14882410 taccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 14882492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 20531904 - 20532068
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20531904 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 20532003  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20532004 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20532068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 14894677 - 14894858
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14894677 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaa 14894775  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14894776 taccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 14894858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 32008381 - 32008545
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32008381 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 32008480  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32008481 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 32008545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 26362918 - 26363080
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | ||||| |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26362918 atgtcctttgattctttgtatcttggtataaattaaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 26363017  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26363018 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26363080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Original strand, 5867953 - 5868110
Alignment:
Q  39 caaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||| | |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5867953 caaatgtcctttgatttcttgtaaattggtatgatttaaactttgttccggtcttagttaaacacttaagagcacaagttaaataccaagaaattaatca 5868052  T
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    |||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||||||||| ||||||    
T  5868053 aagtccattaattccttaataatcaaggtttgttatctttaaaattaattaaggattt 5868110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13673656 - 13673492
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13673656 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 13673557  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13673556 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 13673492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25506975 - 25506819
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25506975 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 25506876  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25506875 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattt 25506819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3967473 - 3967330
Alignment:
Q  62 tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaatta 160  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| |    
T  3967473 tcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatca 3967374  T
Q  161 tatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3967373 ttaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 3967330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 12842073 - 12842235
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12842073 aatgtcctttgattt-ttgtatcttggtatgatttaaactttgttcctgtcttagttaaatactcaagagcacaaattaaataccaacaaattaatcaaa 12842171  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
     || |||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12842172 ttctattaattccttaatcatcaaagtttgttatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 12842235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Original strand, 31992013 - 31992170
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31992013 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttccagtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 31992112  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31992113 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggatttt 31992170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14436817 - 14436708
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || || |||||| |||||| |||||    
T  14436817 tcttagttaatcactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaatgtttgttatctttaaaataaatta 14436718  T
Q  190 gggattttgc 199  Q
    ||||||||||    
T  14436717 gggattttgc 14436708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 33774704 - 33774868
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| ||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33774704 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaactttgttcatgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 33774803  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||   || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33774804 agtccatttgatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 33774868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20707662 - 20707484
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  20707662 ttagttcatgaattcaa-tgtcctttgatttcttgtatcttggtgcgatttaaactttgtttctgtcttagtaaaaacactcatgag--caagttaaata 20707566  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatat-ttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||| || ||||| || |   | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20707565 ccaagaaaataatcaaagttaattaagtccttaatcatttaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20707484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 37295453 - 37295337
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||  ||| |  | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | |    
T  37295453 atgtcatttgattttttgtatcttggtatgatttaaaatttgttcatgtcttagttaaacactcaagagtacaaattaaataccaagaaattaatcgagg 37295354  T
Q  142 tccattaattctttaat 158  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37295353 tccattaattccttaat 37295337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 9535786 - 9535966
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535786 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 9535885  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9535886 ccaaagaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 9535966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 9546069 - 9546249
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546069 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 9546168  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9546169 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 9546249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32108333 - 32108153
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32108333 gttagatcatgaaatcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgtttctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 32108234  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32108233 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 32108153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46496408 - 46496228
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46496408 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 46496309  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  46496308 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 46496228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46507020 - 46506840
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46507020 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 46506921  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  46506920 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 46506840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 16132607 - 16132787
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16132607 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttaataaaacactcaagagcacaagttaaata 16132706  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16132707 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16132787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 16143171 - 16143351
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16143171 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttaataaaacactcaagagcacaagttaaata 16143270  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16143271 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16143351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32097896 - 32097716
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097896 gttagatcatgaaatcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 32097797  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32097796 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 32097716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42620696 - 42620515
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  42620696 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacacttaagagcacagattaaata 42620597  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatt-agggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42620596 ccaaagaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattaagggattttgcctcaa 42620515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 22964798 - 22964962
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22964798 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttgctatgatttaaactttgtttctgtctaagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 22964897  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatt 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||| |||||||||||    
T  22964898 ccaaagaattaatcaaagtccattaattttctaatcatattgatttattatctttaaaattaatt 22964962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 2992459 - 2992640
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | || |||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  2992459 agttagttcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgaatcttgatatgatttgaaacatgtttctgtcttagttaaaccctcaagagaacaagttaact 2992558  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2992559 accaagaaattaatcaaagtccattaattctttaatcataaaggtttattatctttaaaattaattatggattttgcctcaa 2992640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5926182 - 5926013
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5926182 aatgtcctttgattttatgcatctttgtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5926083  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5926082 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaacagta 5926013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6544132 - 6543968
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6544132 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaa 6544033  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6544032 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 6543968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6533833 - 6533669
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6533833 aatgtcctttgattttatgcatctttgtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaa 6533734  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6533733 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 6533669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14943820 - 14943647
Alignment:
Q  28 gatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaa 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14943820 gatcatgaattgaaatgtcctttaatttcttgattcttagtatgatttaaaccttcctg---tcttactataacactcaagagcacaagttaaatacaaa 14943724  T
Q  128 aaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14943723 ggaaataatcaaagtccattaattctttaatcatatcggtctattatctttaaaattaattagcgattttgcctcaa 14943647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15371413 - 15371240
Alignment:
Q  28 gatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaa 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15371413 gatcatgaattgaaatgtcctttaatttcttgattcttagtatgatttaaaccttcctg---tcttactataacactcaagagcacaagttaaatacaaa 15371317  T
Q  128 aaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15371316 ggaaataatcaaagtccattaattctttaatcatatcggtctattatctttaaaattaattagcgattttgcctcaa 15371240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 158
Target Start/End: Original strand, 14114628 - 14114762
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14114628 gttagttcataaagtcaaatgtcctttgaatttttgtatcttggtatgacttaaactttgctcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaata 14114727  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaat 158  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14114728 ccaagaaattaatcaaagtccattaattcgttaat 14114762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 158
Target Start/End: Original strand, 14424278 - 14424412
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14424278 gttagttcataaagtcaaatgtcctttgaatttttgtatcttggtatgacttaaactttgctcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaata 14424377  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaat 158  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14424378 ccaagaaattaatcaaagtccattaattcgttaat 14424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19799144 - 19799037
Alignment:
Q  97 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19799144 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttattctttaatcatttttgtttattatctttaaaattaattagggattt 19799045  T
Q  197 tgcttcaa 204  Q
    ||| ||||    
T  19799044 tgcctcaa 19799037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10414933 - 10414791
Alignment:
Q  62 tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattat 161  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||    
T  10414933 tcttggtattattcaaaccttgtttcgatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaaataatcaaagtccatttaatccttaatcat 10414834  T
Q  162 atttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
        | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10414833 taaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 10414791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 14249091 - 14249265
Alignment:
Q  30 tcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14249091 tcatgaattcaaatatcctttgatttcttgtatcttggaatgatttaatctttgttcctttcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccgaga 14249190  T
Q  130 aattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||  |||   | | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14249191 cattaatcatagttcattaattctttaagcataaaggttcattatcttcaaaattaattagggattttgcctcaa 14249265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 24541439 - 24541620
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  |||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24541439 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtaagattcaaaccttgtttctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaa 24541537  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24541538 taccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 24541620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 26348932 - 26349096
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26348932 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgtttctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 26349031  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26349032 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26349096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43982601 - 43982437
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43982601 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 43982502  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43982501 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 43982437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 5382551 - 5382715
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5382551 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5382650  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5382651 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 5382715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 5392205 - 5392369
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5392205 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5392304  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5392305 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 5392369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8500232 - 8500068
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8500232 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 8500133  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8500132 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 8500068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8510702 - 8510538
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8510702 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 8510603  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8510602 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 8510538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 11627201 - 11627365
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11627201 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 11627300  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11627301 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 11627365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 26363952 - 26364116
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26363952 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 26364051  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26364052 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26364116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27987989 - 27987831
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27987989 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctatcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 27987890  T
Q  140 agtccattaattctttaattatat-ttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||||||| | || ||||| || |   | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27987889 agtccatttaatccttaatcatttaaagtttattatctttaaaattaattagggatttt 27987831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12769631 - 12769451
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12769631 ttagttcatgaattcaatt-tcctttgatttcttgtatgttggtgtgatttaaaccttgtttctgtcttagtaaaaagactcaagagtacaagttaaata 12769533  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatat-ttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| |||  ||| |||||||||||| || ||||| || |   | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12769532 ccaagaaaacaattaaagtccattaaatccttaataatttaaagtttattatctctaaaattaattaggaattttgcctcaa 12769451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44896672 - 44896508
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44896672 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagaacacaagttaaataccaaggaattaatcaa 44896573  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44896572 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 44896508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44907023 - 44906859
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44907023 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagaacacaagttaaataccaaggaattaatcaa 44906924  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44906923 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 44906859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25441596 - 25441482
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| ||||||||||||    
T  25441596 tcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaatta 25441497  T
Q  190 gggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| ||||    
T  25441496 gggattttgcctcaa 25441482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31824213 - 31824051
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31824213 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 31824114  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    || |||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31824113 tctattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 31824051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42594846 - 42594684
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||| | || || |||| | || ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42594846 atgtcctttgattctttgtatcttggtataaattgaaacttgttcctttcttagttaaccactcaagaacacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 42594747  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||      || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42594746 tccattaattccttaatcatcaagttttgttatctttaaaattaattagggattttgcatcaa 42594684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 12827937 - 12828050
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12827937 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 12828036  T
Q  142 tccattaattcttt 155  Q
    | ||||||||||||    
T  12828037 tgcattaattcttt 12828050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 158
Target Start/End: Original strand, 13286360 - 13286476
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13286360 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaaag 13286459  T
Q  142 tccattaattctttaat 158  Q
    | ||||||||| |||||    
T  13286460 ttcattaattccttaat 13286476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19585250 - 19585086
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||| ||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19585250 aatgtcatttgattttatgcatcttagtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatactaaggaattaatcaa 19585151  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    | |||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19585150 aatccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 19585086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41026975 - 41026872
Alignment:
Q  101 cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||||||| |||||||||||     
T  41026975 cactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaatcagggattttgcc 41026876  T
Q  201 tcaa 204  Q
    ||||    
T  41026875 tcaa 41026872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45552639 - 45552532
Alignment:
Q  97 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45552639 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattt 45552540  T
Q  197 tgcttcaa 204  Q
    ||| ||||    
T  45552539 tgcctcaa 45552532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 5616121 - 5616235
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| |||||    
T  5616121 tcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaattccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaatta 5616220  T
Q  190 gggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| ||||    
T  5616221 gggattttgcctcaa 5616235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40701442 - 40701325
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    ||||||| || || || || | ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40701442 aatgtcctttgattgcttgcttcttaaattgatttatactttactcctgttttagttaaacactaaagaacacaatttaaataccaaaaaattaatcaaa 40701343  T
Q  141 gtccattaattctttaat 158  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  40701342 gtttattaattctttaat 40701325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33090675 - 33090514
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33090675 atgttctttgatttcttttatctttgtatgatttaaacgttgttcttgacttagtaaa-cattcaataacacaaattaaataccaataaattaatcaaag 33090577  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    | ||| ||||| ||||| ||    | |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33090576 ttcatcaattccttaatcatcgacgtttattatcttcaaaattaattaggaattttgcctcaa 33090514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9006417 - 9006291
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 124  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| || | |||| || || ||||||||| | |||   ||||||    
T  9006417 ttagttcattaattcaaatatcctttgatttcttgtatcttggtatgatttgaactttgtttttgtcttcgttaatcactcaagaacgcaa---aaatac 9006321  T
Q  125 caaaaaattaatcaaagtccattaattcttta 156  Q
    ||| ||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  9006320 caagaaat--atcaaagtgcattaatccttta 9006291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40921209 - 40921029
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40921209 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 40921110  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  40921109 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 40921029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 18106059 - 18106239
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106059 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 18106158  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18106159 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18106239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 17985417 - 17985591
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985417 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 17985516  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttg 198  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17985517 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttg 17985591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52498647 - 52498467
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52498647 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgttttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 52498548  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  52498547 ccaaggaattaatcaaagttcattaattctttaataatattggttcattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 52498467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16252929 - 16252748
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252929 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttattaaaacactcaagagcacaagttaaata 16252830  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaa-ttagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16252829 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaatttagggattttgcctcaa 16252748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17160755 - 17160580
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  17160755 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattgaaaccttgttcatgtcttagtgaaatactcaagagcgcaagttaaata 17160656  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgc 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17160655 ccaatgaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgc 17160580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26330742 - 26330562
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26330742 gttagatcatgaattcaaattttctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcatgtcttagtaaaacacgcaagatcacaagttaaata 26330643  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26330642 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26330562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15668704 - 15668532
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15668704 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcctggtatgatttgaactttgttcctgtcttggtaaaacactcaagagcacaagttacata 15668605  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15668604 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctataatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattt 15668532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 6406372 - 6406553
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6406372 agttagttcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaat 6406471  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || || ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6406472 accaagaaattaatcaaagcccattaattcctttatcatcaaggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 6406553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 185
Target Start/End: Original strand, 9836591 - 9836752
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9836591 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgaatcttggtatgattaaaaccttgttcttgttttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 9836690  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaatta 185  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||| ||||||||    
T  9836691 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcataaaggtttattatctttaaaatta 9836752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16248552 - 16248388
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16248552 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 16248453  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16248452 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16248388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6691483 - 6691319
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  6691483 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgatcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagggattaatcaa 6691384  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6691383 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 6691319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6701889 - 6701725
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  6701889 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgatcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagggattaatcaa 6701790  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6701789 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 6701725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11476606 - 11476471
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11476606 agttagttcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgtatcttggtataatttataccttgttcctatcttagtaaaacactcaagagtgcaagttaaat 11476507  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaat 158  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11476506 accaagaaattcatcaaagtccattaattctttaat 11476471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 13403567 - 13403749
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403567 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttgatatgatttatcttttatttctgtcttaataaaacactcaagagcacaagttaaata 13403666  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaatt-ctttaattatat-ttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |     ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13403667 ccaaggaattaatcaaagtcgattaattcctttaatcatttaaaatttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 13403749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16472144 - 16471981
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16472144 aatgtcctttgatttcttgtgtcttggtattatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaatacttaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 16472045  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16472044 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16471981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44888241 - 44888078
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44888241 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtattattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 44888142  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44888141 gtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 44888078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1292854 - 1292696
Alignment:
Q  39 caaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||    
T  1292854 caaatgtcatttgatttcttgaatcttggtataatttaaaccttgttcatgtcttaataaaacactcaatatcacaagttaaataccaaggaattaatca 1292755  T
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||||||||||||| ||||| ||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1292754 aagtccattaattccttaatcatcaaggtttattatctttaaaattaattagggatttt 1292696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 7847323 - 7847502
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagta-aaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7847323 ttagttcatgaattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtatgatttaatccttgttcctgtcttagtataaacactcaagagcacaagttaaata 7847421  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7847422 ccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 7847502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2829046 - 2828882
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2829046 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaa 2828947  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2828946 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagagattttgcctcaa 2828882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 3488494 - 3488658
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3488494 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 3488593  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3488594 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 3488658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 5294002 - 5294166
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5294002 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5294101  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5294102 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 5294166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 5303616 - 5303780
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5303616 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5303715  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5303716 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 5303780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21845461 - 21845297
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21845461 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21845362  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21845361 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21845297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21854890 - 21854726
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21854890 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21854791  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21854790 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21854726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21901324 - 21901160
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21901324 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21901225  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21901224 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21901160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21910753 - 21910589
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21910753 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21910654  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21910653 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21910589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 27681664 - 27681828
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27681664 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 27681763  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27681764 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 27681828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 27691275 - 27691439
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27691275 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 27691374  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27691375 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 27691439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 3497761 - 3497925
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3497761 aatgtcctttgattttatgcatcttgttatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 3497860  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3497861 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 3497925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 17829141 - 17829305
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17829141 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 17829240  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17829241 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 17829305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 17838532 - 17838696
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17838532 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 17838631  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17838632 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 17838696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 3606590 - 3606771
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3606590 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttttttctgtcttagttaaaacactcaagagcacaagttaaa 3606688  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3606689 taccaaggaattaattaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaatcagggattttgcctcaa 3606771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16629007 - 16628842
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttct-tgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatca 138  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16629007 aatgtcctttgatttttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 16628908  T
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16628907 aagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattacttagggattttgcctcaa 16628842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12865833 - 12865669
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||  ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12865833 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaattttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 12865734  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12865733 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 12865669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 522843 - 522957
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| |||||    
T  522843 tcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaatta 522942  T
Q  190 gggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| ||||    
T  522943 gggattttgcctcaa 522957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 158
Target Start/End: Original strand, 17421899 - 17422014
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17421899 atgtcctttgattctttgtatcttgatatgaattgaaacttg-ttctgtcttagttaatcactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 17421997  T
Q  142 tccattaattctttaat 158  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17421998 tccattaattccttaat 17422014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26457839 - 26457677
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||| ||||||| || || |||| | || ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26457839 atgtcctttgattctttgtatctgggtatgaattgaaacttgttcctgtcttagttaaccacccaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcgaag 26457740  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    || |||||||||||||| ||    | || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26457739 tctattaattctttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaattagggaatttgcctcaa 26457677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 14601312 - 14601426
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    |  |||||||| ||||||||||||    
T  14601312 tcttagtaaaatactcaagagcacaagttaaatacctaggaattaatcaaagttcattaattccttaatcattaaggtgtattatctttaaaattaatta 14601411  T
Q  190 gggattttgcttcaa 204  Q
    || ||||||| ||||    
T  14601412 ggaattttgcctcaa 14601426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4417217 - 4417030
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  4417217 gttagttcatgaatccaaatgtcctttgattttttgtatcttggtatgatgtaaactttgttattgtcttagttaaacactcaagagtacaatttaaata 4417118  T
Q  124 ccaaaa-------aattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    | ||||       ||  ||||||| || |||||||| ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4417117 caaaaaataaaataaaaaatcaaaatctattaattccttaatcatcaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4417030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16241695 - 16241632
Alignment:
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaa-ttagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16241695 tccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaatttagggattttgcctcaa 16241632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40883931 - 40883824
Alignment:
Q  92 ttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagg 191  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||  |      ||||||||| ||||||||||||||    
T  40883931 ttagttaaacactcaaaaacacaaattaaataccaaaaaattgataaaagtctattaatcctttaatcgtcgagatttattatctttaaaattaattagg 40883832  T
Q  192 gattttgc 199  Q
     |||||||    
T  40883831 aattttgc 40883824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Original strand, 16211756 - 16211824
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaaga 109  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || | |||| || || |||||||||    
T  16211756 aatgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaactttgtttgtgtcttggttaatcactcaaga 16211824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 29131534 - 29131714
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29131534 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagataaata 29131633  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29131634 ccaagaaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 29131714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 2999251 - 2999431
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2999251 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 2999350  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2999351 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 2999431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17488206 - 17488026
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488206 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 17488107  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17488106 ccaaggagttaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 17488026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 24697047 - 24697227
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24697047 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 24697146  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24697147 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 24697227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45014248 - 45014068
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014248 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 45014149  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45014148 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 45014068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 38958281 - 38958461
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958281 gttagatcatgaattcaaacgtcctttgatttattgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 38958380  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38958381 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 38958461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45024325 - 45024145
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45024325 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcttgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 45024226  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45024225 ccaatgaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcatcaa 45024145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 44639460 - 44639640
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44639460 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaatcttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaaattaaata 44639559  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  44639560 ccaaagaattaatcaaagtccattaattctttaatcataatggtttattatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 44639640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 38930946 - 38931125
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38930946 gttagatcat-aattcaaatgtcctttgatttattgattcttggtgtgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 38931044  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  38931045 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaactcattagggattttgcctcaa 38931125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 9503566 - 9503730
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9503566 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9503665  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9503666 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 9503730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 9514932 - 9515096
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9514932 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 9515031  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9515032 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 9515096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15940192 - 15940034
Alignment:
Q  39 caaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatca 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  15940192 caaatatcctttgatttcttgaatcttggtataaattaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaatttaaataccaagaaaataatca 15940093  T
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||||||||||||| ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15940092 aagtccattaattccttaatcatcaaagtttattatctttaaaattaattaggaatttt 15940034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 15479323 - 15479485
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15479323 atgtccttttatttcttgtttcttggtacgaattaaactttgttcctgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 15479422  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  15479423 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttcaaattaattagggattttgcctcaa 15479485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Original strand, 24239710 - 24239829
Alignment:
Q  39 caaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24239710 caaatgtcctttgatttcttgaatcttggtataatttaaaccttattcatgtcttagtaaaacacttaagagcacaagttaaataccaagaaaataatca 24239809  T
Q  139 aagtccattaattctttaat 158  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  24239810 aagtccattaattccttaat 24239829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4456322 - 4456158
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4456322 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctatcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4456223  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4456222 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4456158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4457386 - 4457222
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4457386 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4457287  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4457286 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4457222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4467011 - 4466847
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4467011 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4466912  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4466911 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4466847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 5337947 - 5338111
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5337947 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5338046  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5338047 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 5338111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 5347843 - 5348007
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5347843 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 5347942  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5347943 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 5348007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 16934859 - 16935023
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934859 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 16934958  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16934959 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 16935023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 17005519 - 17005683
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17005519 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 17005618  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17005619 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 17005683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18660846 - 18660682
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18660846 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgtttctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18660747  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18660746 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18660682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 22688253 - 22688417
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22688253 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 22688352  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22688353 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattaggtattttgcctcaa 22688417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22901576 - 22901420
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22901576 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgattctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaataaattaatcatag 22901477  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttg 198  Q
    ||||||||||||||||| ||    | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22901476 tccattaattctttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaattagggattttg 22901420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 32937981 - 32938145
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32937981 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 32938080  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32938081 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 32938145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Original strand, 3606492 - 3606648
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3606492 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtattattcaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataacaaagaattaatcaaa 3606591  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    || |||| | || ||||| ||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3606592 gttcatttaatcattaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggatttt 3606648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18662587 - 18662423
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18662587 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18662488  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18662487 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18662423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 22909363 - 22909525
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || || |||| | || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22909363 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaattgaaacttgttcctatctcagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcatag 22909462  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22909463 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 22909525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12570059 - 12569895
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  12570059 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaatactaaggaattaatcaa 12569960  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||| |||| | || | ||| ||    |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12569959 agttcatttaatcctcaatcattaaagtatattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 12569895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 27160557 - 27160671
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| |||||    
T  27160557 tcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaatta 27160656  T
Q  190 gggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| ||||    
T  27160657 gggattttgcctcaa 27160671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Original strand, 27170926 - 27171040
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| |||||    
T  27170926 tcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaatta 27171025  T
Q  190 gggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| ||||    
T  27171026 gggattttgcctcaa 27171040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 573732 - 573570
Alignment:
Q  43 tgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  573732 tgtcctttgattttatgcatcttgatatgattcaaaccttgttcttgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaag 573633  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  573632 tccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattatttagggattttgcctcaa 573570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23721369 - 23721275
Alignment:
Q  105 caagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23721369 caagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaattagggattttgc 23721275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18650517 - 18650353
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||||    
T  18650517 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagaacacaaattaaatacaaaggaataaatcaa 18650418  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18650417 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18650353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45190205 - 45190098
Alignment:
Q  97 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45190205 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattaaggattt 45190106  T
Q  197 tgcttcaa 204  Q
    ||| ||||    
T  45190105 tgcctcaa 45190098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 28460989 - 28461067
Alignment:
Q  107 agagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaatta 185  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  28460989 agagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagttcattaattctctaatcatattggtttattatctttaaaatta 28461067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 72658 - 72743
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaaga 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || | |||| || || |||||||||    
T  72658 gttagttcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaactttgtttgtgtcttggttaatcactcaaga 72743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 45190323 - 45190236
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaa 127  Q
    |||||| ||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45190323 aatgtcttttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaa 45190236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18495911 - 18495838
Alignment:
Q  131 attaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    | || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18495911 attaatcaaagtccattaattccttaattattaaggtttgttatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18495838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19341726 - 19341626
Alignment:
Q  101 cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||||||||||  |||||||     
T  19341726 cactcaagagcacaagttaa---ccaacaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaattagatattttgcc 19341630  T
Q  201 tcaa 204  Q
    ||||    
T  19341629 tcaa 19341626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 16135701 - 16135809
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| ||  |  | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| |    
T  16135701 atgtcctttaatttctggtatcttggtatgatttaaacttttttattgtcttagttaaacactcaagaacacaaattaaataccatgaaactaatcaatg 16135800  T
Q  142 tccattaat 150  Q
    | |||||||    
T  16135801 ttcattaat 16135809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Original strand, 40409606 - 40409761
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||  | ||| |  | ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||| || ||||     
T  40409606 aatgtcctttgattgcttgcttcttggattgatttattctttgttcttgtcttagttaaacactcaagaacaaaa-ttaaataccaagaaactattcaat 40409704  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||||||||| ||||||| ||    | || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  40409705 gtccattaatcctttaatcattaaggtttgttatatttaaaattaattagggatttt 40409761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 75269 - 75450
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75269 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 75368  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaa-ttagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  75369 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaatttagggattttgcctcaa 75450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 26203315 - 26203500
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203315 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 26203414  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26203415 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaacagta 26203500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 26192755 - 26192935
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192755 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 26192854  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26192855 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 26192935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32069956 - 32069776
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32069956 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 32069857  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32069856 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 32069776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27411664 - 27411484
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27411664 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatctaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaatagcacaagttaaata 27411565  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27411564 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 27411484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 11411716 - 11411896
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11411716 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgatttttggtatgattcaaacctcgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 11411815  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11411816 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagagattttgcctcaa 11411896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22240528 - 22240348
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22240528 gttagatcaagaattcaaatgtcctttgatttcttaattcttggtatgatttaaaccttgttcttatcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 22240429  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22240428 tcaaggaattaatcaaagtccattaattcgttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 22240348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33938573 - 33938410
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33938573 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 33938474  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33938473 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 33938410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33948973 - 33948810
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33948973 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaa 33948874  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33948873 gtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 33948810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 8766278 - 8766442
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8766278 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 8766377  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8766378 agtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 8766442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 23379130 - 23379311
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||  |  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23379130 agttagttcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgtatcttggaatgatttaaacatttttcatgtcttagtaaaacattcaagagcacaagttaaat 23379229  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||      ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23379230 accaagaaattaatcaaagtccattgattccttaatcatcaagttttattatctttaaaattaattaaggattttgcctcaa 23379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 20905301 - 20905479
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 124  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20905301 ttagttcatgaattcat-tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaacattgttcccgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatat 20905399  T
Q  125 caaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20905400 caaggaattaatcaaagtccatttagtccttaatcattatagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20905479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20763834 - 20763675
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20763834 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcatgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagaaattaatcaa 20763735  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgc 199  Q
    |||||||| |||| ||||| ||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20763734 agtccatttattccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgc 20763675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 22174066 - 22174247
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22174066 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgtatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaa 22174164  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22174165 taccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 22174247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21681013 - 21680849
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21681013 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21680914  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21680913 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21680849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21752541 - 21752377
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21752541 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21752442  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21752441 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21752377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21761964 - 21761800
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21761964 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 21761865  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21761864 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 21761800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 27274962 - 27275126
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27274962 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 27275061  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27275062 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 27275126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31916286 - 31916122
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31916286 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagaacacaagttaaataccaaggaattaatcaa 31916187  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31916186 agtccatttaatccttaatcattaatgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 31916122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37817053 - 37816889
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37817053 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 37816954  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37816953 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 37816889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20896440 - 20896262
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 124  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |  | | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20896440 ttagttcatgaattcaac-gtcctttgatttcttctatcttggtatgacttaaaccttgttcttatatttgtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 20896342  T
Q  125 caaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20896341 caaggaattaatcaaagtccatttagtccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20896262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 13572493 - 13572657
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  13572493 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaatcaatcaa 13572592  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13572593 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 13572657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 18210656 - 18210820
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18210656 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18210755  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18210756 agtccatttaatccttaatcattaaactttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18210820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18360572 - 18360408
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18360572 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18360473  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18360472 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18360408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18389572 - 18389408
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18389572 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18389473  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18389472 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18389408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 30944627 - 30944791
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30944627 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 30944726  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30944727 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 30944791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 30954049 - 30954213
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30954049 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 30954148  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30954149 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 30954213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 37549402 - 37549566
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37549402 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 37549501  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37549502 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 37549566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 37652200 - 37652364
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37652200 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 37652299  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37652300 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 37652364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 4038761 - 4038925
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    ||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4038761 aatgtcctttgattatatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaagcactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 4038860  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4038861 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4038925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 18220006 - 18220170
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18220006 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 18220105  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18220106 agtccatttaatccttaatcattaaactttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18220170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 19889123 - 19889287
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  19889123 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttattcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaattaa 19889222  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19889223 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 19889287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 42091301 - 42091467
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactc--aagagcacaagttaaataccaaaaaattaatc 137  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42091301 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgatttaaacattgttcctgtcttagtaaaaacactataaagagcacaagttaaataccaaggaattaatc 42091400  T
Q  138 aaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42091401 aaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 42091467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20947284 - 20947122
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20947284 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 20947185  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20947184 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 20947122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20957673 - 20957511
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20957673 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 20957574  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20957573 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 20957511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 37299612 - 37299776
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  37299612 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaactttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacatgttaaataccaaggaattaatcaa 37299711  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37299712 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattaggtattttgcctcaa 37299776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 142
Target Start/End: Original strand, 206260 - 206362
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  206260 aatgtcctttgatttcatgtatcttggtatgatttaaaccttattcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 206359  T
Q  140 agt 142  Q
    |||    
T  206360 agt 206362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 197
Target Start/End: Original strand, 19549047 - 19549203
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgat-tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaa 140  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||| || || |||| | || | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19549047 atgtcctttgattctttgttatcttggtatgaattgaaacttgttcctgttttagttaaccactcaagagcacaggttaaataccaacaaattaatcaaa 19549146  T
Q  141 gtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||||||||||  ||||| |     | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19549147 gtccattaatttcttaatcaacaaggtttgttatctttaaaattaattagggatttt 19549203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Original strand, 34131285 - 34131392
Alignment:
Q  97 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34131285 aaaacactcaagagcacaagttaaatatcaaggaattaatcaaagttcatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattt 34131384  T
Q  197 tgcttcaa 204  Q
    ||| ||||    
T  34131385 tgcctcaa 34131392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 31104926 - 31104835
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcaca 114  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| || | |||| || || ||||||||| ||||    
T  31104926 agttagttcatgaatttaaatgtcatttgatttcttgtatcatggtatgatttaaactttgtttgtgtcttggttaatcactcaagaacaca 31104835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 15240546 - 15240611
Alignment:
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||||| |||||| |||  | | |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15240546 aagtccattaatcctttaactatcatggtttatcatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 15240611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12891 - 12711
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12891 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaatttaaata 12792  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12791 ccaatgatttaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 12711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 310571 - 310750
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310571 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgt-ttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 310669  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  310670 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 216066 - 215952
Alignment:
Q  90 tcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaatta 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    |  |||||||| ||||||||||||    
T  216066 tcttagtaaaatactcaagagcacaagttaaatacctaggaattaatcaaagttcattaattccttaatcattaaggtgtattatctttaaaattaatta 215967  T
Q  190 gggattttgcttcaa 204  Q
    || ||||||| ||||    
T  215966 ggaattttgcctcaa 215952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 87483 - 87301
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtc--ctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87483 gttagatcatgaattcaaatgtctcctttgatttcttgattcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaa 87384  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  87383 taccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 87301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 19928 - 20107
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19928 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtataatt-aaaccttgttcctgtcttagtaaatcactcaagagcacaggttaaata 20026  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20027 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 20107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15365 - 15185
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15365 gttagatcatgaattcaattgtcctttgatttcttgattcttcgtatgatttaaacattgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 15266  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15265 ccaaggaattaatcaaagtctattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 15185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 4762 - 4943
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4762 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaactttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 4861  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaa-ttagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4862 ccaaggaattaatcaaaatccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaaattaatttagggattttgcctcaa 4943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7887 - 7706
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7887 gttagatcttgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaactttgttcctgtcttattaaaacactcaagagcacaagttaaata 7788  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaa-ttagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  7787 ccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaatttaatttagggattttgcctcaa 7706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 93404 - 93585
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93404 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgttcctgttttagtaaaacactcaagagcacaagttaaata 93503  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaa-ttagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  93504 ccaaggaattaatcgaagtccattaattctctaatcatattggtttattatctttaaaatgaatttagggattttgcctcaa 93585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 8646 - 8810
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  8646 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgatcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaagggattaatcaa 8745  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8746 agtccattaattctttaatcatattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 8810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 132457 - 132329
Alignment:
Q  76 aaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatc 175  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  132457 aaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatcatatttgtttattatc 132358  T
Q  176 tctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  132357 tttaaaattaattagggattttgcctcaa 132329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 29314 - 29488
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29314 agttagttcataaaatcaaatgtcctttgattacttgaatcttggtataatttaaaccttgttcatgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 29413  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29414 accaagaaattaatcaaagtctattaattccttaatcattaaggtttattatctttaaaactaattagggatttt 29488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22263 - 22120
Alignment:
Q  62 tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaatta 160  Q
    ||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22263 tcttggtatgattcagaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccattaattctttaatca 22164  T
Q  161 tatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22163 tattggtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 22120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 197
Target Start/End: Original strand, 267494 - 267649
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  267494 atgtcttttgatttcctgtttcttggtatgagttaaactttgtttctgtcttagttaaacactcaagaggacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 267593  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    ||||||||||| ||||| ||   || || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  267594 tccattaattccttaatcatcaatgtttgttatctttaaaattaattagggatttt 267649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13335 - 13154
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||  |  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13335 agttagttcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgtatcttggaatgatttaaacatttttcatgtcttagtaaaacattcaagagcacaagttaaat 13236  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||      ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13235 accaagaaattaatcaaagtccattgattccttaatcatcaagttttattatctttaaaattaattaaggattttgcctcaa 13154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10803 - 10625
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 124  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10803 ttagttcatgaattcat-tgtcctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaatac 10705  T
Q  125 caaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |    |||||||||||  ||||| | || ||||| ||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10704 cggggaattaatcaaaacccatttagtccttaatcattatagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0590 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0590
Description:

Target: scaffold0590; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9788 - 9607
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9788 agttagttcatggattcaa-tgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgtttctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaa 9690  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9689 taccaatgaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 58863 - 59027
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  58863 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgtttctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 58962  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  58963 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 59027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 67106 - 67270
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  67106 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcatgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 67205  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  67206 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcatcaa 67270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 57745 - 57909
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    ||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  57745 aatgtcctttgcttttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctatcttagtaaaaacacttaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 57844  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  57845 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 57909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24536
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    ||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24372 aatgtcctttgcttttatgcatcttggtatgattaaaaccttgttcttgtcttagtaaaaacactcaagaccacaagttaaataccaaggaattaatcaa 24471  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24472 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 24536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Original strand, 22915 - 23038
Alignment:
Q  76 aaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatc 175  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||   ||||||||    
T  22915 aaaccttgttcctgtcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaatgtccattaattctataatcatattgttttattatc 23014  T
Q  176 tctaaaattaattagggattttgc 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  23015 tttaaaattaattagggattttgc 23038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 75
Target Start/End: Original strand, 21622 - 21673
Alignment:
Q  24 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattt 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21622 gttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgattt 21673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 112362 - 112526
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  112362 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 112461  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  112462 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 112526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Original strand, 103163 - 103270
Alignment:
Q  97 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  103163 aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattt 103262  T
Q  197 tgcttcaa 204  Q
    ||| ||||    
T  103263 tgcctcaa 103270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54121 - 53957
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  54121 aatgtcctttgatttcttgtatcttggtgagatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaatagtacaagttaaataccaagaaaataatcaa 54022  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| || ||||| || |  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  54021 agtccattaagtccttaatcatttaagtttattatctttaaaattaattagtgattttgcctcaa 53957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 58073 - 57909
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  58073 aatgtcctttgatttcttgtatcttggtgagatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaatagtacaagttaaataccaagaaaataatcaa 57974  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||||| || ||||| || |  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  57973 agtccattaagtccttaatcatttaagtttattatctttaaaattaattagtgattttgcctcaa 57909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 234978 - 235142
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  234978 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 235077  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  235078 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 235142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 115079 - 115258
Alignment:
Q  25 ttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaata 123  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  115079 ttagttcatgaattcaa-tgtcctttgatttcatgcatcttggtatgatttaatccttgttcatgtcttagtaaaaacactcaagaacacgagttaaata 115177  T
Q  124 ccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  115178 ccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 115258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 167635 - 167454
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaat 122  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||   ||| | || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  167635 agttagttcataaatccaaatgtcctttgatttcttgtatctatgtatgatttaacatttgttcctgtcttagataaacacacaagagcacaagttaaat 167536  T
Q  123 accaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    |  |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  167535 accaagaaattaatccaagtccattaattccttaatcatcaaggtctattatctttaaaattaattaggaattttgcctcaa 167454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 146202 - 146043
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  146202 aatgtcctttgatttcatgcatcttggtatgattcaaacgttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 146103  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctc--taaaattaattagggatttt 197  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  146102 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctctttaaaattaattagggatttt 146043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 154087 - 154251
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||||  ||||||| ||    
T  154087 aatgtcctttgttttcatgcatcttggtatgatttaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactaaagcgaacatgttaaataccaaggaattaattaa 154186  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  154187 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 154251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 1437 - 1602
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttct-tgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatca 138  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1437 aatgtcctttgatttttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 1536  T
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1537 aagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18235 - 18071
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18235 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaacattgtttctgtcttagtaaaaacactaaagagcacaagttaaataccaatgaattaatcaa 18136  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18135 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 18071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 33438 - 33602
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33438 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 33537  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33538 agtccatttaatccttaatcattaaaaattattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 33602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 65182 - 65071
Alignment:
Q  47 ctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccat 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  65182 ctttgatttcttgtatcttggtatgatttaaaccttgttcttgtcttagttaaacactcaagagcacaagttaaatatcaagaaattaatcaaagtctat 65083  T
Q  147 taattctttaat 158  Q
    |||||| |||||    
T  65082 taattccttaat 65071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 199231 - 199413
Alignment:
Q  23 agttagatcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattctt-ggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaa 121  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  199231 agttagttcatgaatgcaaatgtcctttgatttcttgtatctttggtaatattttaaccttgttcctgtcttagttaaacactcaagagaacaagttaaa 199330  T
Q  122 taccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||  || || ||    | ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  199331 taccaagacattaatcaaagtccattaatttctttatcattaaggtttattatctttaaaataaatttgggactttgcttcaa 199413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 188943 - 188979
Alignment:
Q  168 ttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  188943 ttattatctttaaaattaattagggattttgcttcaa 188979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 204
Target Start/End: Original strand, 273 - 416
Alignment:
Q  62 tcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaatta 160  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| |    
T  273 tcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaaacactcaagagcacaaattaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatca 372  T
Q  161 tatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  373 ttaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 1377 - 1539
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1377 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 1476  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1477 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 1539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5232 - 5070
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5232 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 5133  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5132 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 5070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19389 - 19227
Alignment:
Q  42 atgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaag 141  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||| || |  |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19389 atgtcctttgattctttgtatcttggtatgaatttacacttgttcctgtcttagttaaccactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaag 19290  T
Q  142 tccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19289 tccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaataaattagggattttgcctcaa 19227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 204
Target Start/End: Original strand, 41226 - 41332
Alignment:
Q  98 aaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggatttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41226 aaacactcaaaagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaattagggatttt 41325  T
Q  198 gcttcaa 204  Q
    || ||||    
T  41326 gcctcaa 41332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 12455 - 12619
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagt-aaaacactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  |   ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12455 aatgtcctttgattttatccatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtcaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 12554  T
Q  140 agtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    |||||||| | || ||||| ||    | ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12555 agtccatttaatccttaatcattaaagtttattatattcaaaattaattagggattttgcctcaa 12619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 137 - 30
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  137 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtgaaagcactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaa 38  T
Q  140 agtccatt 147  Q
    ||||||||    
T  37 agtccatt 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13973 - 13870
Alignment:
Q  101 cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    | || |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13973 cactcaagagcacaagttaaataccaacaaattaatcaaaatccattaattccttaatcatcaaggtttgttatctttaaaattaattagggattttgcc 13874  T
Q  201 tcaa 204  Q
    ||||    
T  13873 tcaa 13870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22838 - 22691
Alignment:
Q  64 ttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cactcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattata 162  Q
    ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |  ||||| ||     
T  22838 ttggtatgattcaaaccttgttcctgtcttagtaaaaacactcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatgcttaatcatt 22739  T
Q  163 t-ttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaagagta 209  Q
    |   | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22738 taaagtttattatctttaaaattaattaggaattttgcctcaacagta 22691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1411 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1411
Description:

Target: scaffold1411; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Original strand, 207 - 364
Alignment:
Q  41 aatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaaccttgcttctctcttagtaaaa-cac-tcaagagcacaagttaaataccaaaaaattaatca 138  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  207 aatgtcctttgattttatgcatcttggtatgattcaaaccttgttcttgtcttagtaaaaacacctcaagagcacaagttaaataccaaggaattaatca 306  T
Q  139 aagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattt 196  Q
    || |||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  307 aaatccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattt 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 396616 - 396714
Alignment:
Q  106 aagagcacaagttaaataccaaaaaattaatcaaagtccattaattctttaattatatttgcttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  396616 aagagcacaagttaaataccaaggaattaatcaaagtccatttaatccttaatcattaaagtttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 396714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 1376 - 1425
Alignment:
Q  30 tcatgaattcaaatgtcctttgatttcttgattcttggtatgatttaaac 79  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1376 tcatgaattcaaatgtccattgatttcttgtatcttggtatgatttaaac 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0756 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0756
Description:

Target: scaffold0756; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 4016 - 4052
Alignment:
Q  168 ttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4016 ttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 4052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 13985 - 14021
Alignment:
Q  168 ttattatctctaaaattaattagggattttgcttcaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13985 ttattatctttaaaattaattagggattttgcctcaa 14021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University