View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14464_low_30 (Length: 290)

Name: NF14464_low_30
Description: NF14464
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14464_low_30
NF14464_low_30
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (1-290)||(28421110-28421406)
chr7 (1-278)||(3817462-3817744)
chr7 (1-278)||(3811320-3811602)
chr7 (1-279)||(351512-351794)
chr7 (16-290)||(5979340-5979623)
chr7 (23-279)||(339106-339366)
chr7 (71-278)||(35148237-35148442)
chr7 (63-278)||(5849256-5849469)
chr7 (63-278)||(22742149-22742363)
chr7 (1-190)||(20238762-20238959)
chr7 (1-218)||(15843730-15843955)
chr7 (1-218)||(15860839-15861064)
chr7 (63-270)||(43539711-43539919)
chr7 (102-278)||(26383395-26383569)
chr7 (63-167)||(35150761-35150865)
chr7 (163-278)||(35152849-35152962)
chr7 (143-278)||(42767505-42767636)
chr7 (63-211)||(26380876-26381023)
chr7 (153-268)||(7608163-7608276)
chr7 (63-280)||(18656873-18657087)
chr7 (187-267)||(8824535-8824614)
chr7 (168-270)||(24690652-24690749)
chr7 (75-138)||(3677889-3677952)
chr7 (64-138)||(7608306-7608381)
chr7 (63-108)||(12803893-12803938)
chr7 (14-51)||(42767459-42767496)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (1-290)||(12686330-12686626)
chr5 (1-290)||(12692432-12692728)
chr5 (1-278)||(28525537-28525819)
chr5 (21-290)||(32097193-32097470)
chr5 (1-278)||(28531633-28531915)
chr5 (21-290)||(32094392-32094669)
chr5 (1-278)||(41297005-41297291)
chr5 (16-278)||(7389713-7389981)
chr5 (63-278)||(19059991-19060206)
chr5 (63-278)||(30772006-30772221)
chr5 (63-243)||(19066332-19066512)
chr5 (75-278)||(20499864-20500066)
chr5 (63-265)||(14609909-14610108)
chr5 (64-278)||(30384607-30384817)
chr5 (84-267)||(33753476-33753659)
chr5 (75-259)||(26318492-26318677)
chr5 (84-267)||(33849110-33849290)
chr5 (71-280)||(26509573-26509779)
chr5 (63-96)||(8706639-8706672)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (1-290)||(6234-6531)
scaffold0208 (1-290)||(12107-12404)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (1-290)||(11839876-11840173)
chr3 (1-290)||(10244485-10244782)
chr3 (1-290)||(42191371-42191668)
chr3 (1-290)||(42197313-42197610)
chr3 (1-290)||(10238363-10238660)
chr3 (1-278)||(49151338-49151620)
chr3 (1-278)||(49157405-49157687)
chr3 (1-290)||(17055944-17056239)
chr3 (1-278)||(8331513-8331795)
chr3 (1-278)||(10760801-10761084)
chr3 (1-278)||(38455701-38455984)
chr3 (2-278)||(38449215-38449497)
chr3 (14-278)||(10769133-10769403)
chr3 (65-290)||(26429639-26429865)
chr3 (14-278)||(30051266-30051534)
chr3 (1-290)||(55003563-55003849)
chr3 (63-278)||(28964606-28964811)
chr3 (71-256)||(48128268-48128451)
chr3 (63-235)||(53069279-53069443)
chr3 (71-219)||(13444840-13444989)
chr3 (119-239)||(13367114-13367233)
chr3 (51-142)||(13837534-13837625)
chr3 (75-278)||(46656406-46656601)
chr3 (188-290)||(17601879-17601981)
chr3 (63-269)||(12108891-12109092)
chr3 (119-239)||(9760481-9760600)
chr3 (14-119)||(11846227-11846340)
chr3 (76-278)||(2982458-2982659)
chr3 (205-278)||(23138779-23138850)
chr3 (2-49)||(17593434-17593481)
chr3 (127-192)||(24643817-24643879)
chr3 (206-278)||(11846340-11846410)
chr3 (63-105)||(24643773-24643815)
chr3 (63-144)||(34300348-34300429)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (1-290)||(13455811-13456108)
chr2 (1-290)||(13461752-13462049)
chr2 (14-290)||(36750126-36750410)
chr2 (57-290)||(35084893-35085127)
chr2 (16-278)||(44716971-44717239)
chr2 (1-279)||(28683096-28683379)
chr2 (57-290)||(35090866-35091100)
chr2 (14-278)||(31002102-31002372)
chr2 (14-278)||(30965053-30965323)
chr2 (14-278)||(31008080-31008350)
chr2 (14-278)||(13149848-13150123)
chr2 (77-278)||(11048785-11048988)
chr2 (71-267)||(23343290-23343485)
chr2 (65-279)||(19879319-19879536)
chr2 (143-278)||(35439671-35439804)
chr2 (63-152)||(35438925-35439014)
chr2 (187-278)||(31651357-31651446)
chr2 (197-278)||(35442187-35442266)
chr2 (75-259)||(28765325-28765508)
chr2 (77-278)||(29832931-29833127)
chr2 (175-267)||(23284680-23284772)
chr2 (72-126)||(29034697-29034751)
chr2 (187-278)||(1388363-1388454)
chr2 (177-278)||(7771521-7771620)
chr2 (194-284)||(16361750-16361841)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-290)||(32890600-32890897)
chr8 (1-290)||(32896724-32897021)
chr8 (14-290)||(36818684-36818967)
chr8 (1-279)||(5542311-5542595)
chr8 (14-290)||(42993167-42993447)
chr8 (14-278)||(10699755-10700025)
chr8 (14-290)||(9934995-9935274)
chr8 (55-278)||(22219939-22220161)
chr8 (14-278)||(10705564-10705833)
chr8 (63-278)||(42033523-42033740)
chr8 (1-180)||(14417763-14417949)
chr8 (63-278)||(39735768-39735972)
chr8 (63-172)||(1883039-1883148)
chr8 (63-171)||(39727528-39727637)
chr8 (194-278)||(17954232-17954316)
chr8 (185-272)||(1883185-1883272)
chr8 (201-278)||(39727643-39727718)
chr8 (113-147)||(1171215-1171249)
chr8 (201-270)||(14417695-14417762)
chr8 (63-99)||(1171249-1171285)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (14-290)||(4580485-4580769)
chr6 (14-287)||(25343340-25343620)
chr6 (14-287)||(25353926-25354207)
chr6 (1-278)||(8650954-8651237)
chr6 (1-279)||(21191017-21191304)
chr6 (71-278)||(21770795-21770998)
chr6 (58-278)||(31756435-31756652)
chr6 (63-279)||(21197250-21197475)
chr6 (71-278)||(21783546-21783759)
chr6 (71-278)||(21789769-21789982)
chr6 (102-278)||(30905841-30906014)
chr6 (73-256)||(17581384-17581562)
chr6 (81-239)||(28728047-28728203)
chr6 (193-276)||(12801890-12801973)
chr6 (2-51)||(32035438-32035487)
chr6 (109-278)||(1106039-1106206)
chr6 (77-165)||(20745394-20745482)
chr6 (101-171)||(17900402-17900472)
chr6 (1-38)||(21782904-21782941)
chr6 (193-228)||(12801646-12801681)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (14-290)||(25381699-25381983)
chr1 (1-290)||(50305909-50306198)
chr1 (51-290)||(1077956-1078196)
chr1 (14-290)||(25387668-25387950)
chr1 (2-279)||(34739711-34739993)
chr1 (14-278)||(31051270-31051540)
chr1 (14-278)||(31057770-31058040)
chr1 (15-278)||(8093011-8093279)
chr1 (63-278)||(44409726-44409940)
chr1 (73-278)||(24926991-24927193)
chr1 (63-278)||(38152184-38152391)
chr1 (74-276)||(24963940-24964139)
chr1 (63-278)||(27954887-27955099)
chr1 (217-290)||(25275421-25275494)
chr1 (193-278)||(12183962-12184047)
chr1 (82-275)||(33458149-33458340)
chr1 (187-284)||(23253855-23253956)
chr1 (74-121)||(12183820-12183867)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (14-290)||(24287699-24287982)
chr4 (2-278)||(10733504-10733783)
chr4 (2-278)||(10947273-10947552)
chr4 (2-278)||(10739491-10739770)
chr4 (2-278)||(10953260-10953539)
chr4 (14-278)||(48166904-48167174)
chr4 (14-278)||(48160685-48160955)
chr4 (14-278)||(6257369-6257638)
chr4 (63-278)||(26957023-26957237)
chr4 (14-238)||(33458431-33458662)
chr4 (14-238)||(33461556-33461787)
chr4 (51-278)||(44831827-44832048)
chr4 (112-278)||(26971824-26971988)
chr4 (64-278)||(50168321-50168532)
chr4 (64-278)||(50155687-50155897)
chr4 (63-276)||(49976326-49976524)
chr4 (73-270)||(19686551-19686743)
chr4 (58-275)||(35177523-35177741)
chr4 (2-104)||(10733398-10733507)
chr4 (2-104)||(10947167-10947276)
chr4 (74-191)||(4632192-4632310)
chr4 (65-278)||(17627002-17627208)
chr4 (194-280)||(28704253-28704340)
chr4 (74-178)||(32284504-32284608)
chr4 (120-280)||(9237105-9237262)
chr4 (62-162)||(33045085-33045185)
chr4 (71-138)||(3769434-3769501)
chr4 (62-121)||(50427238-50427297)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-278)||(173041-173323)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (1-278)||(1345-1621)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (1-180)||(770-956)
scaffold0363 (201-270)||(957-1024)
[»] scaffold1114 (2 HSPs)
scaffold1114 (116-276)||(791-949)
scaffold1114 (71-136)||(950-1015)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (154-278)||(13999-14121)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (146-278)||(5693-5824)
scaffold0185 (58-121)||(5826-5889)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (82-279)||(38151-38347)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-51)||(5493-5543)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 28421110 - 28421406
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28421110 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 28421209  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28421210 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggcc 28421309  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28421310 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 28421406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 3817462 - 3817744
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3817462 gctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 3817561  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  3817562 ccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgacc 3817661  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3817662 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 3817744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 3811320 - 3811602
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3811320 gctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataacaaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 3811419  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  3811420 ccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgacc 3811519  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3811520 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 3811602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 351794 - 351512
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  351794 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaa-agaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaa 351696  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  351695 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggcc 351596  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat 279  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  351595 attagggtttcccattattccagtaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattat 351512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 290
Target Start/End: Original strand, 5979340 - 5979623
Alignment:
Q  16 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5979340 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgc 5979439  T
Q  109 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactctttta-tattggatggtcattagggtttccc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  ||||||  ||||||    
T  5979440 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccataacctcttttattattggatgaccattagactttccc 5979539  T
Q  207 attattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||| |||||| |  |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5979540 attattctgttaattggccatccgaacatccatccatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 5979623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 339366 - 339106
Alignment:
Q  23 caacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  339366 caacaatgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagt 339267  T
Q  116 tctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  339266 tctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacctcttttatattggatggccatta-ggtttcccattattcca 339168  T
Q  216 ttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat 279  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  339167 gtaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattat 339106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 35148237 - 35148442
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccat 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35148237 cggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggatcat 35148336  T
Q  171 agactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata 270  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35148337 agcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattctgttaatgagccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaata 35148434  T
Q  271 attaatta 278  Q
     |||||||    
T  35148435 tttaatta 35148442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5849469 - 5849256
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5849469 gttagcggcgtctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttatcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgtacggtatattg 5849370  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5849369 aggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggtttctcattattccgttaatggaccatccgaacatccactca--ttgagtccatatcaacta 5849272  T
Q  263 attaaataattaatta 278  Q
    |||||||| |||||||    
T  5849271 attaaatatttaatta 5849256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Original strand, 22742149 - 22742363
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccatgtacggtgtatt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22742149 gttagcggcggctgatttggtttttcatcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagttttgccatgtacggtatatt 22742248  T
Q  162 ggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact 261  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22742249 ggagaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaact 22742346  T
Q  262 aattaaataattaatta 278  Q
    | ||| ||| |||||||    
T  22742347 acttatatatttaatta 22742363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20238959 - 20238762
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20238959 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 20238860  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatg 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20238859 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 20238762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15843955 - 15843730
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15843955 gctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 15843856  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgta-cggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||      
T  15843855 ctggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtttgccgtgtaccggtgtattggagaccataacctcttttatattggatgac 15843756  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgtta 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  15843755 cattagagtttcccattattccgtta 15843730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15861064 - 15860839
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15861064 gctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 15860965  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgta-cggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||      
T  15860964 ctggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtttgccgtgtaccggtgtattggagaccataacctcttttatattggatgac 15860865  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgtta 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  15860864 cattagagtttcccattattccgtta 15860839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43539919 - 43539711
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg---gagaagagagagtttgccatgtacggtgta 159  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  43539919 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggagaagagagagtttgccgtgcacggtata 43539820  T
Q  160 ttggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaa 259  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43539819 ttggggaccataacctcttttatattgggtgaccattagggttttccgttattccgttaatgggtcatccagacatccactca--ttgagtccatatcaa 43539722  T
Q  260 ctaattaaata 270  Q
     ||||||||||    
T  43539721 ttaattaaata 43539711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26383569 - 26383395
Alignment:
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  26383569 tttatgcctcaagttctcttcaaatagggagaagagagagtttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggt 26383470  T
Q  202 ttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  26383469 ttcccattattccattaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatattcattaattaaatatttaatta 26383395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Original strand, 35150761 - 35150865
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150761 gttagcggcggctgatttggttattcttcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 35150860  T
Q  163 gggac 167  Q
    |||||    
T  35150861 gggac 35150865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 278
Target Start/End: Original strand, 35152849 - 35152962
Alignment:
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35152849 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaacta 35152946  T
Q  263 attaaataattaatta 278  Q
    |||||||| |||||||    
T  35152947 attaaatatttaatta 35152962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 42767505 - 42767636
Alignment:
Q  143 ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactca 242  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42767505 ttgccgtgtacggtatattcgggaccatagcctcttttatat---atggccattagggtttcctattattccgttaatggatcatccagacatccactca 42767601  T
Q  243 tgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42767602 t-tgaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 42767636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26381023 - 26380876
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||  | |||| ||    
T  26381023 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttcttcagatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtactg 26380924  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattat 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  26380923 gggaccatag-ctcttttatattggatgaccattaagatttcccattat 26380876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7608276 - 7608163
Alignment:
Q  153 cggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtcc 252  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||  | |  ||    
T  7608276 cggtgtattggggaccataacatcttttatattggatggtcattagggtttttcattatttcattaatgggtcatccggacatccactcat--taacccc 7608179  T
Q  253 atatcaactaattaaa 268  Q
    ||||||||||||||||    
T  7608178 atatcaactaattaaa 7608163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 280
Target Start/End: Original strand, 18656873 - 18657087
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||| | |||| |||| ||||    
T  18656873 gttagcgaaagctgatttggttcttcctcaactgttacttttatgtctttagttctcttcagacggagagaagagaaagtttgtcgtgtatggtgcattg 18656972  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattg-gatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact 261  Q
    | ||| |||| |||  ||| | || ||| | ||||||| ||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |    
T  18656973 gagacaatagcctc--ttacagtgtgat-gccattaggatttaccattattgtattaatgggtcatccagacatccactca--tagagtccatattaatt 18657067  T
Q  262 aa-ttaaataattaattatc 280  Q
    || |||||||||||||||||    
T  18657068 aatttaaataattaattatc 18657087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8824614 - 8824535
Alignment:
Q  187 gatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 267  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  8824614 gatggtcattaaggtttctcattattccgtta-tgagtcatccagacatccactcatattgagtccatattaattaattaa 8824535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24690749 - 24690652
Alignment:
Q  168 catagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 267  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| |||||||| |||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24690749 cataaactcttttatattagatgatcgttagg-tttctcattattctgttaatgggtca----gacatccactcatattgagtccatattaactaattaa 24690655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3677952 - 3677889
Alignment:
Q  75 tgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3677952 tgatttgtttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaatttctcttcagatggagagaagaga 3677889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7608381 - 7608306
Alignment:
Q  64 ttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat-ggggagaagaga 138  Q
    |||||| || |||||||||| ||| || || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7608381 ttagcggcgactgatttggtacttcctaaatcggtacctttatgactcaagttctcttccgatgggggagaagaga 7608306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12803938 - 12803893
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgc 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12803938 gttagcgacgactgattaggttcttcctcaaccggtacctttatgc 12803893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 51
Target Start/End: Original strand, 42767459 - 42767496
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga 51  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42767459 ccctctcatcaacaacgataatcaaagagagaagatga 42767496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 12686330 - 12686626
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12686330 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 12686429  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  12686430 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggcc 12686529  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12686530 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 12686626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 12692432 - 12692728
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12692432 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 12692531  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  12692532 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggcc 12692631  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12692632 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 12692728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 28525537 - 28525819
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  28525537 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaa 28525636  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28525637 ccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggcc 28525736  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28525737 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 28525819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 32097193 - 32097470
Alignment:
Q  21 atcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32097193 atcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 32097292  T
Q  114 gttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32097293 gttctcttcagatggggagaatagagagtatttccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattatt 32097392  T
Q  213 ccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32097393 ccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 32097470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 28531633 - 28531915
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  28531633 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaa 28531732  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28531733 ccagtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggagaccatagcctcttttatattggatggcc 28531832  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28531833 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 28531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 32094392 - 32094669
Alignment:
Q  21 atcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32094392 atcaacaacaataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 32094491  T
Q  114 gttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32094492 gttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtatttgggaccatagcctcttttatattagatggccattagggtttcccattatt 32094591  T
Q  213 ccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32094592 ccgttaatgggccatccggacatacactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 32094669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41297291 - 41297005
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41297291 gctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaggagaggaggtgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 41297192  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagt---tctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41297191 ccggtacctttatgcctcaagtagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggat 41297092  T
Q  190 ggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41297091 gaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaattaattaaatatttaatta 41297005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 278
Target Start/End: Original strand, 7389713 - 7389981
Alignment:
Q  16 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7389713 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgc 7389812  T
Q  109 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7389813 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacagtatattgggaaccatagcctcttttatattggatggccattagagtttccca 7389912  T
Q  208 ttattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7389913 ttattccgttaatgggtcatccgaacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 7389981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Original strand, 19059991 - 19060206
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||  | |||||||    
T  19059991 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacttttatgcctcaagttctcttcatatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtattg 19060090  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  19060091 gggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggacatccagacatccactcatattgagtccatatccatta 19060190  T
Q  263 attaaataattaatta 278  Q
    ||||| ||||||||||    
T  19060191 attaattaattaatta 19060206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30772221 - 30772006
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | | |||||    
T  30772221 gttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtctgatatattg 30772122  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30772121 tggaccatagtctcttctatattggatgatcatcagggtttttcattattctgttaatgggtcatccagacatccactcatattgagtccatatcaacta 30772022  T
Q  263 attaaataattaatta 278  Q
    ||||| || |||||||    
T  30772021 attaattatttaatta 30772006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 243
Target Start/End: Original strand, 19066332 - 19066512
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  19066332 gttagcggcagctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtccggtgtattg 19066431  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcat 243  Q
    ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19066432 gggaccacaacctattttatattggatggtcattagggttttccattatttcgttaatgggtcatccagacatccactcat 19066512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20500066 - 20499864
Alignment:
Q  75 tgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccatgtacggtgtattggggaccataga 173  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20500066 tgatttggttcttccttaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcaaatggagagaacagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccatagc 20499967  T
Q  174 ctcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataatt 273  Q
    ||||| | |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20499966 ctcttatttattggatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggccatccagacatccactca--ttgagtccatatcaattaattaaatattt 20499869  T
Q  274 aatta 278  Q
    |||||    
T  20499868 aatta 20499864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14610108 - 14609909
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14610108 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctcttcagatggggagaaaagaaagtttgccgtgttcggtgtattg 14610009  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  14610008 gggaccataacctcttttacattagatgaccattagggttt-ccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaatta 14609912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Original strand, 30384607 - 30384817
Alignment:
Q  64 ttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattgg 163  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |    
T  30384607 ttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatacctcgagttctcttcagatggggagaagagaatgtttgccgtgtacggtgtatt-g 30384705  T
Q  164 ggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |||| | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||| | |||    
T  30384706 ggaccatagtctcttttatattggatgactatta-gattttccattattccgttaatgagtcatccagacatccactca--ttgaatccatatctattaa 30384802  T
Q  264 ttaaataattaatta 278  Q
    | ||||| |||||||    
T  30384803 tgaaatatttaatta 30384817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Original strand, 33753476 - 33753659
Alignment:
Q  84 tcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttata 183  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |    
T  33753476 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacggtgtactgaggaacataggctctttta-a 33753574  T
Q  184 ttggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgag-tccatatcaactaattaa 267  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  33753575 tatgatggtcattagggtttcccattattccgttaatgtatcatccataaatccactcatattgagtttcatatcaattaattaa 33753659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 26318492 - 26318677
Alignment:
Q  75 tgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagac 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | | || | ||||||||| ||||| |    
T  26318492 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagat-gggagaagagagagtttgtcgtttccgatatattggggatcatagcc 26318590  T
Q  175 tcttttatattg-gatggtcattaggg-tttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaa 259  Q
    |||| |||| || ||||  |||||||| |||  ||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  26318591 tcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagacattcactcaaattgagtccatatcaa 26318677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Original strand, 33849110 - 33849290
Alignment:
Q  84 tcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttata 183  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||| || ||| ||||| |||||||| |    
T  33849110 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacagtgtactgaggaacataggctctttta-a 33849208  T
Q  184 ttggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgag-tccatatcaactaattaa 267  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  33849209 tatgatagtcattagggtttcccattattccgt---tgtatcatccataaatccactcatattgagtttcatatcaattaattaa 33849290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26509779 - 26509573
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccat 170  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||||||| || |||||||| ||| | |||||||    
T  26509779 cggctgatttgatacttcctcaatcggtacctttatgcctctagttctcatcagat--ggaaaagggagagtttaccgtgtacggtatatcgtggaccat 26509682  T
Q  171 agactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta-attaaat 269  Q
    |  ||||| ||   ||  | | |||||  ||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  | |||| |||||||| ||  ||||||    
T  26509681 aacctcttatagtgtgatttgccattaaagtttctcaatattccgttgatggaccatccaaacatccactca--tagagttcatatcaattattttaaat 26509584  T
Q  270 aattaattatc 280  Q
    |||||||||||    
T  26509583 aattaattatc 26509573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 96
Target Start/End: Original strand, 8706639 - 8706672
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8706639 gttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccg 8706672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6531 - 6234
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6531 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 6432  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6431 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 6332  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6331 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 6234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12404 - 12107
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12404 gctttcaaggcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 12305  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  12304 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 12205  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12204 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 12107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 11839876 - 11840173
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11839876 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 11839975  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  11839976 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 11840075  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11840076 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 11840173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 10244485 - 10244782
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10244485 gctttcaagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 10244584  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  10244585 ccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 10244684  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10244685 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 10244782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 42191371 - 42191668
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  42191371 gctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaa 42191470  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  42191471 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 42191570  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42191571 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 42191668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 42197313 - 42197610
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  42197313 gctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaa 42197412  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  42197413 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 42197512  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42197513 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 42197610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 10238363 - 10238660
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10238363 gctttcaagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggatatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 10238462  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  10238463 ccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 10238562  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10238563 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 10238660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49151620 - 49151338
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  49151620 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaa 49151521  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  49151520 ccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggcc 49151421  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49151420 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 49151338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49157687 - 49157405
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  49157687 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaa 49157588  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  49157587 ccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggcc 49157488  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49157487 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 49157405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 17055944 - 17056239
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17055944 gctttcatagcagccctctaatcaacaacggtaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 17056043  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  17056044 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatgtcc 17056143  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17056144 attagggtttcccattattccgttaatag-gcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 17056239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8331795 - 8331513
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8331795 gctttcaaggcagccctctcgtcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 8331696  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  8331695 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgacc 8331596  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8331595 attagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactgattaaatatttaatta 8331513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 10760801 - 10761084
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10760801 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaa 10760900  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10760901 ccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggt 10761000  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10761001 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 10761084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 38455701 - 38455984
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38455701 gctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 38455800  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  38455801 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgac 38455900  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38455901 cattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 38455984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 38449215 - 38449497
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaac 94  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38449215 ctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaac 38449314  T
Q  95 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  38449315 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgacc 38449414  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38449415 attagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 38449497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Original strand, 10769133 - 10769403
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgac-------acacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10769133 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 10769232  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10769233 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 10769332  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10769333 cattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 10769403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 26429639 - 26429865
Alignment:
Q  65 tagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattgg 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26429639 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattgg 26429738  T
Q  164 ggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 263  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26429739 ggaccatagcctcttttatactggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagcccatatcaactaa 26429838  T
Q  264 ttaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26429839 ttaaataattaattatccaaaatagaa 26429865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Original strand, 30051266 - 30051534
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30051266 ccctctaatcgacaacaataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 30051365  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30051366 gcctcaagttctcttcagatgggcagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggttt-cc 30051464  T
Q  207 attattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30051465 attattccgttaatgggccatccggacatccactc--gttaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 30051534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 55003563 - 55003849
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgac-------acacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||    
T  55003563 gctttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaaaagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttc---ctcaa 55003659  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||       
T  55003660 tcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattggatg--- 55003756  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
          ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55003757 ----acgtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 55003849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28964811 - 28964606
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28964811 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccg--------atgcctcgagttctcttcagatggggagaagagagagttttccgtgtacggtatattg 28964720  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28964719 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattccgttaatggaccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaacta 28964622  T
Q  263 attaaataattaatta 278  Q
    |||||||| |||||||    
T  28964621 attaaatatttaatta 28964606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 256
Target Start/End: Original strand, 48128268 - 48128451
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccat 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48128268 cggctgatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctttagttctcttcagacagggagaagagaatgtttgccgtgtacggtatattggggaccat 48128367  T
Q  171 agactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatat 256  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  48128368 agcctcttttatattggatgaccattaaggttttccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatat 48128451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 235
Target Start/End: Original strand, 53069279 - 53069443
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069279 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct----------agttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 53069368  T
Q  163 gggaccatagactc--ttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacat 235  Q
     ||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  53069369 aggaccatagcctcttttttatattggacgatcattagggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacat 53069443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13444989 - 13444840
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggacca 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||||||||||||||    
T  13444989 cggctgatttggttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagaatatcgttgtgtacggtgtattggggacca 13444890  T
Q  170 tagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaa 219  Q
    ||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13444889 taacctattttatattggatggccattagggtttcccattatttcgttaa 13444840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 239
Target Start/End: Original strand, 13367114 - 13367233
Alignment:
Q  119 cttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgtta 218  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13367114 cttcagatggggagaagagcggttttgctatgtacggtatattggggaccatagcctcttt-atattggatggtcattagggtttcccattattccgtta 13367212  T
Q  219 atggatcatccagacatccac 239  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13367213 atggaccatccagacatccac 13367233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13837625 - 13837534
Alignment:
Q  51 acacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837625 acacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 13837534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 46656601 - 46656406
Alignment:
Q  75 tgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagac 174  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||      |||||||||||||| ||||||  |    
T  46656601 tgatttggctcttccttaaccggcacctttatgtctctaattctattcagatggggagaagagaatgttt------tacggtgtattgggaaccataacc 46656508  T
Q  175 tcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataatta 274  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  46656507 tcttttatattggataaccaatagggtttcccattattccgttaataggtcatccggacatccactca--tcgagtacatatcaactaattaaatattta 46656410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 290
Target Start/End: Original strand, 17601879 - 17601981
Alignment:
Q  188 atggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaata 287  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17601879 atggccattagggtttgtcattattccgttaatgggtcattcggacatccaatcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaata 17601978  T
Q  288 gaa 290  Q
    |||    
T  17601979 gaa 17601981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 269
Target Start/End: Original strand, 12108891 - 12109092
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||     ||||||| || |||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12108891 gttagcggcgactgatttggttcttctttaaccggtacctttatgcctcaag-----ttcagatcggaagaaaagatagtttgccgtgtacgatgtattg 12108985  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
     ||||| ||  ||||||||||||| |||  ||||    |||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  12108986 aggaccgtactctcttttatattgaatgaccattgttatttctcattattccgttaacgagtcatctagacatcaactcatattgagtccatatcaatta 12109085  T
Q  263 attaaat 269  Q
    || ||||    
T  12109086 atcaaat 12109092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9760600 - 9760481
Alignment:
Q  119 cttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgtta 218  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||    
T  9760600 cttcagatggggagaagagcggttttactatgtacggtatattggggaccatatcctcttt-atattggatgaccattagggtttcctattattccttta 9760502  T
Q  219 atggatcatccagacatccac 239  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  9760501 atggaccatccagacatccac 9760481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Original strand, 11846227 - 11846340
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgattt-ggttcttgctcaaccggtaccttta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  11846227 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgattttggttcttcctcaaccggaaccttta 11846326  T
Q  106 tgcctcaagttctc 119  Q
    |||| |||||||||    
T  11846327 tgccgcaagttctc 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 278
Target Start/End: Original strand, 2982458 - 2982659
Alignment:
Q  76 gatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagact 175  Q
    ||||||||||||  ||||   ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | || ||| |||| ||||||||   ||    
T  2982458 gatttggttcttcttcaataagtatctttatgtcttaagttctcttcagatagggagaaaagagagttcgccgtatatggtatatttgggaccatgacct 2982557  T
Q  176 cttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaa 275  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||| | ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  2982558 cttttatatttgttggtcattaggattt-tcattattcttttaatgggtcatcctgacatatactcgtattgagtttatatcaactaattaaatatttaa 2982656  T
Q  276 tta 278  Q
    |||    
T  2982657 tta 2982659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 278
Target Start/End: Original strand, 23138779 - 23138850
Alignment:
Q  205 ccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23138779 ccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 23138850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Original strand, 17593434 - 17593481
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat 49  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593434 ctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat 17593481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 192
Target Start/End: Original strand, 24643817 - 24643879
Alignment:
Q  127 ggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24643817 ggggagaagagagagtttgtc--gtacggtgtattgggg-ccatagcctcttttatattggatggt 24643879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 278
Target Start/End: Original strand, 11846340 - 11846410
Alignment:
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  11846340 cattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgactcaatatcaactaattaaatatttaatta 11846410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 24643773 - 24643815
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtaccttta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24643773 gttagcggcggctgatttggttctttctcaaccggtaccttta 24643815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34300429 - 34300348
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt 144  Q
    ||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  34300429 gttagcggcgacttatttggttattcttcaaccggtactttcatgcctcaagttctcttcatacgaggagatgagagagttt 34300348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13456108 - 13455811
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  13456108 gctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaa 13456009  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  13456008 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 13455909  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13455908 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 13455811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13462049 - 13461752
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  13462049 gctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaa 13461950  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  13461949 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 13461850  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13461849 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 13461752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36750410 - 36750126
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36750410 ccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttat 36750311  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36750310 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 36750211  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36750210 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaaatatccaaaatagaa 36750126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 57 - 290
Target Start/End: Original strand, 35084893 - 35085127
Alignment:
Q  57 aatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacgg 155  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35084893 aatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacgg 35084992  T
Q  156 tgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccata 255  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35084993 tatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccata 35085092  T
Q  256 tcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35085093 tcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 35085127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 278
Target Start/End: Original strand, 44716971 - 44717239
Alignment:
Q  16 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44716971 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgc 44717070  T
Q  109 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44717071 ctcaagttctcttcagatggggagaagagatagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggttttcca 44717170  T
Q  208 ttattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44717171 ttattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattatatatttaatta 44717239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 28683096 - 28683379
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||       ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  28683096 gctttcaagacaaccctctcatcaacaacgataaccaaggagagtggatgatctgaaacacacaatagagttaacagcggctgatttggttcttcctcaa 28683195  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28683196 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggcc 28683295  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28683296 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatgtttaattat 28683379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 290
Target Start/End: Original strand, 35090866 - 35091100
Alignment:
Q  57 aatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacgg 155  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35090866 aatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacgg 35090965  T
Q  156 tgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccata 255  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35090966 tatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtctata 35091065  T
Q  256 tcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35091066 tcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 35091100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31002372 - 31002102
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31002372 ccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttat 31002273  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31002272 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcc 31002173  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31002172 cattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 31002102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30965323 - 30965053
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30965323 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttat 30965224  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  30965223 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggccattaggatttcc 30965124  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30965123 cattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgaatccatatcaactaattaaatatttaatta 30965053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31008350 - 31008080
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31008350 ccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttat 31008251  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31008250 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcc 31008151  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31008150 cattattccgttaatgggtcattcggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 31008080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Original strand, 13149848 - 13150123
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13149848 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 13149947  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggg-----gagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |     ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13149948 gcctcaagttctcttcagatgagatgaggagaagagagaatattgccgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattagatgaccattaggg 13150047  T
Q  201 tttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13150048 tttcccattattccgttaatgggtcatccgtacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 13150123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Original strand, 11048785 - 11048988
Alignment:
Q  77 atttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtt----tgccatgtacggtgtattggggaccatag 172  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11048785 atttggttcttcctcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttggtttgccgtgtacgatgtattggggaccatag 11048884  T
Q  173 actcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataat 272  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11048885 cctcttttatattggatcgccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccagacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatt 11048982  T
Q  273 taatta 278  Q
    ||||||    
T  11048983 taatta 11048988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23343485 - 23343290
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccat 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23343485 cggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttcccgtgtacggtgtattggggaccat 23343386  T
Q  171 agactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 267  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| | |||||||    
T  23343385 agcctcttttatattggatggtcattagggttt-ccattattctgttaatgggtcatccggacatccacctatattgagtccatatccattaattaa 23343290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19879536 - 19879319
Alignment:
Q  65 tagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccatgtacggtgtattgg 163  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  19879536 tagcggcggctgatttgattcttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacgatgtattgg 19879437  T
Q  164 ggaccatagactctt-----ttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatca 258  Q
     |||||||  |||||     ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  19879436 cgaccataacctcttttatgttatattggatggccatta-agtttcccattattccgttaatgggtcatctggacattcactca--ttgagtcaatatca 19879340  T
Q  259 actaattaaataattaattat 279  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  19879339 attaattaaatatttaattat 19879319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 35439671 - 35439804
Alignment:
Q  143 ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactca 242  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35439671 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 35439770  T
Q  243 tgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
      || ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35439771 --ttaagttcatatcaactaattaaatatttaatta 35439804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 152
Target Start/End: Original strand, 35438925 - 35439014
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgta 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35438925 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta 35439014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31651446 - 31651357
Alignment:
Q  187 gatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31651446 gatggtcattaaggtttcccattattcttttaatggatcatctagacatcgactca--ttgagtccatatcaattaattaaatatttaatta 31651357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 278
Target Start/End: Original strand, 35442187 - 35442266
Alignment:
Q  197 agggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35442187 agggttttccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 35442266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28765508 - 28765325
Alignment:
Q  75 tgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagac 174  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||| ||  | ||||| | |  ||||| | |||| |||||| | |||||||| | |    
T  28765508 tgatttggttcttcctcaataggtaccttgatgcctcaaattctcttcggaatgagagaatataatgtttgtcgtgtatggtgtaat-gggaccattgcc 28765410  T
Q  175 tcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaa 259  Q
    |||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  28765409 tcttttatattgaatcgccattagagttttccattattccgttgatgagtcatccatacattcactcatatcgagttcatatcaa 28765325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29833127 - 29832931
Alignment:
Q  77 atttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactc 176  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||  | ||||| | |||||||    |||   ||||||||||||||||||   |    
T  29833127 atttggttcttcctcaaccgatacatttatccttcaagttctcttcagacagagagaatatagagttt----tgt--cgtgtattggggaccatag---c 29833037  T
Q  177 ttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcat----gttgagtccatatcaactaattaaataat 272  Q
     ||||||| | |||  |||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| | ||||| |||||||     ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  29833036 atttatatcgaatgaccattagggtttctcattattctgttgatgggtcattctgacattcactcattcccattgagtccatatcaattaattaaatatt 29832937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23284772 - 23284680
Alignment:
Q  175 tcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 267  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  23284772 tcttttatatttgatggccattagagtttcacattattccgttaatgggtcatcagaacatccacccatattgagtcaatatccattaattaa 23284680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29034751 - 29034697
Alignment:
Q  72 ggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 126  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29034751 ggctgatttgattcttcctcaactggtacctttatgtctcaagttctcttcagat 29034697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 278
Target Start/End: Original strand, 1388363 - 1388454
Alignment:
Q  187 gatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  1388363 gatgatcattggagtttctcattattccgttaacgtgtcatctagacatcaaatcatattgagttcatatcaattaattaaaaaattaatta 1388454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 278
Target Start/End: Original strand, 7771521 - 7771620
Alignment:
Q  177 ttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtcca-tatcaactaattaaataattaa 275  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  7771521 ttttatattggatgacgattagg-tttcccattattctgttaatgggtcatccggacgtccactcatc--gagtcccgtatcaactaattaaatatttaa 7771617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16361841 - 16361750
Alignment:
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactca-tgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaa 284  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||  | ||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16361841 attagggtttcacattgttccgttaatgagtcatccagatattgattcaatattgagttcatatcaattaattatataattaattatctaaa 16361750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32890897 - 32890600
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32890897 gctttcaaggcaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 32890798  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  32890797 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggc 32890698  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32890697 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 32890600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32897021 - 32896724
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32897021 gctttcaagacaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 32896922  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  32896921 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggc 32896822  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32896821 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 32896724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36818967 - 36818684
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36818967 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 36818868  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  36818867 gcctcaagttctcatcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatagccattagggtttccc 36818768  T
Q  207 attattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36818767 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 36818684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 5542311 - 5542595
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5542311 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagaggggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 5542410  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5542411 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggc 5542510  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5542511 cattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattat 5542595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 42993167 - 42993447
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42993167 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 42993266  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42993267 gcctcaagttctcttcagatggggagaa---agagtattgccgtgttcggtatattggggaccataacctcttttatattggatggcgattagggtttcc 42993363  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42993364 cattattccgttaatgggccat-cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 42993447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10700025 - 10699755
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10700025 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 10699926  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  10699925 gcctcaagttttcgtcagatggagagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatatttgatgaccattagggtttcc 10699826  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10699825 cattactccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 10699755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9935274 - 9934995
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||       ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9935274 ccctctaatcaacaacgttaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagatttagcggcggctgatttggttcttcctcaatcggtacctttat 9935175  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  9935174 gcctcaagttctcttcagatggggagaag--agagtttgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttat-ttggatggccatta-ggtttccc 9935079  T
Q  207 attattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9935078 attattccgttaatgggtcatccggatatccactcatgttgagtccatatcaataaattaaataattaattatccaaaatagaa 9934995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 278
Target Start/End: Original strand, 22219939 - 22220161
Alignment:
Q  55 acaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtac 153  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22219939 acaataaagttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtac 22220038  T
Q  154 ggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtcca 253  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  22220039 ggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccattca--ttgagtcca 22220136  T
Q  254 tatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  22220137 tatcaactaattaaatatttaatta 22220161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10705833 - 10705564
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10705833 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 10705734  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||| |    
T  10705733 ggcttaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttatatttgatgactattagggttt-c 10705635  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10705634 cattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 10705564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42033740 - 42033523
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  42033740 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaagagagagtttgccgtgtacaatgtattg 42033641  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaat----ggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatca 258  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    ||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42033640 gggaccatagcctcctttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatca 42033543  T
Q  259 actaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  42033542 actaattaaatatttaatta 42033523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14417949 - 14417763
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14417949 gctttcatagcagccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 14417850  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactctttt 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14417849 ccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 14417763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Original strand, 39735768 - 39735972
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccatgtacggtgtatt 161  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||         
T  39735768 gttagcggcggctgatttgattcttccttaactggtacatttatgcctcaagtactcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacggt----- 39735862  T
Q  162 ggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact 261  Q
        |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39735863 ----accagagcctcttttatattagatggccattagggtttccc-ttattccgttaatgggtcatccggacatccactgat--tgagtccatatcaact 39735955  T
Q  262 aattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||| |||||||    
T  39735956 aattaaatatttaatta 39735972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Original strand, 1883039 - 1883148
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  1883039 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagtttgccgtgtattgtgtattg 1883138  T
Q  163 gggaccatag 172  Q
    ||||||||||    
T  1883139 gggaccatag 1883148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Original strand, 39727528 - 39727637
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccatgtacggtgtatt 161  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  39727528 gttagcggctgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtactcttgagatggggagaagagagagttttgttgtgtacggtatatt 39727627  T
Q  162 ggggaccata 171  Q
    ||||||||||    
T  39727628 ggggaccata 39727637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17954316 - 17954232
Alignment:
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17954316 attagggttttccattattccgttagtgggtcatctgaacatccactcattttgagtccatatcaactaattaattaattaatta 17954232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Original strand, 1883185 - 1883272
Alignment:
Q  185 tggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataat 272  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  1883185 tggatggccattaaggtttcccattatttcgttaatgggtcatccggacatccactcatattgagtccatatccattaattaattaat 1883272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 278
Target Start/End: Original strand, 39727643 - 39727718
Alignment:
Q  201 tttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39727643 tttcccattgttccgttaatgggctatccggacatccactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaatta 39727718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1171249 - 1171215
Alignment:
Q  113 agttctcttcagatggggagaagagagagtttgcc 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171249 agttctcttcagatggggagaagagagagtttgcc 1171215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14417762 - 14417695
Alignment:
Q  201 tttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata 270  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14417762 tttcccattatttcgttaatgggacatccgaacatccactca--ttgagcccatatcaactaattaaata 14417695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1171285 - 1171249
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggta 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1171285 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 1171249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 4580485 - 4580769
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4580485 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacgcaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 4580584  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4580585 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 4580684  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4580685 cattattccattaatgggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 4580769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25343620 - 25343340
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25343620 ccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 25343521  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25343520 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggac-atagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 25343422  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaata 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25343421 cattattccgttaatggaccatccgaacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaata 25343340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25354207 - 25353926
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25354207 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 25354108  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  25354107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattagatgaccattagagtttcc 25354008  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaata 287  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25354007 cattattccgttaatgggccatccggatatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaata 25353926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 8650954 - 8651237
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8650954 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 8651053  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  8651054 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgac 8651153  T
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8651154 cattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 8651237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 21191017 - 21191304
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21191017 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 21191116  T
Q  94 ccggtacctttatgcctca---agttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggat 189  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21191117 ccggtacctttatgcctcatcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtaaggtatattggggaccatagcctcttttatattggat 21191216  T
Q  190 ggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat 279  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21191217 ggccattatggtttcacattattccgttaatgggccatccgaacatccactca--ttgaatccatatcaactaattaaatatttaattat 21191304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 21770795 - 21770998
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccatgtacggtgtattggggacca 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  21770795 cggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg--agaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccg 21770892  T
Q  170 tagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaat 269  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  21770893 tagcctcttttatattggttggccattagggtttcccattattccgttaatgg-tcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaat 21770989  T
Q  270 aattaatta 278  Q
    | |||||||    
T  21770990 atttaatta 21770998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 31756435 - 31756652
Alignment:
Q  58 atagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtg 157  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | |     
T  31756435 atagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaacaggtacctttatacctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtttgata 31756534  T
Q  158 tattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatc 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31756535 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattcc-ttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatc 31756631  T
Q  258 aactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  31756632 aactaattaattatttaatta 31756652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 279
Target Start/End: Original strand, 21197250 - 21197475
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-----------ttgccatgt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |||    
T  21197250 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgagtattgccgtgt 21197349  T
Q  152 acggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtc 251  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  21197350 acggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggttttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtc 21197447  T
Q  252 catatcaactaattaaataattaattat 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21197448 catatcaactaattaaatatttaattat 21197475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 21783546 - 21783759
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccgg------tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccatgtacggtgtattgg 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21783546 cggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattgg 21783645  T
Q  164 gg--accatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact 261  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21783646 ggacaccatagcctcttttatattggat-gccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaact 21783742  T
Q  262 aattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21783743 aattaaatatttaatta 21783759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 21789769 - 21789982
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccgg------tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccatgtacggtgtattgg 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21789769 cggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattgg 21789868  T
Q  164 gg--accatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact 261  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21789869 ggacaccatagcctcttttatattggat-gccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaact 21789965  T
Q  262 aattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21789966 aattaaatatttaatta 21789982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 278
Target Start/End: Original strand, 30905841 - 30906014
Alignment:
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||    
T  30905841 tttatgcctcaagttctcttcagatgggg-gaagagagagtttgtcgagtacggtgtattgggaaccatagcctcttttatattggatgaccattatggt 30905939  T
Q  202 ttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30905940 ttcccattattctgttaaaggatcatccagacatctactca--tagagtccatatcaactaattaaatatttaatta 30906014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17581562 - 17581384
Alignment:
Q  73 gctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccatgtacggtgtattggggaccata 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||   ||||||||||||    
T  17581562 gctgatttggttcttcctcaacttgtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacagt---ttggggaccata 17581466  T
Q  172 gactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatat 256  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17581465 gcctcttttatattggacggttattagg-tttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatat 17581384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28728203 - 28728047
Alignment:
Q  81 ggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactctttt 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||  || | | ||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||     
T  28728203 ggttcttcctcaaccggtacctcgatgccctaa-tgcgcttcagatggggagaagagcggttttgctgtgtacggtatattggggaccatagcctcatt- 28728106  T
Q  181 atattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccac 239  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28728105 atataggatggccattagggtttcccattattccgttaatggaccatccggacatccac 28728047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 12801890 - 12801973
Alignment:
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||    
T  12801890 cattagggtttcccattattccattaatgggtcatccagacatccactcatattgagtccaaatccattaaataattaattaat 12801973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 32035438 - 32035487
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga 51  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035438 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga 32035487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1106206 - 1106039
Alignment:
Q  109 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccca 207  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | | ||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||| |  ||| |||||| ||||| |||    
T  1106206 ctcaagttctcttcacatagggagaagagaaagttttgacgtgtacagt--attggggaccatatcctcatttatactcaatgatcattacggttttcca 1106109  T
Q  208 ttattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaa-ttaaataattaatta 278  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  1106108 ttatttcgttaatgagtcatccggacatccactca--ttgaatccatattaattaatttaaatatttaatta 1106039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20745482 - 20745394
Alignment:
Q  77 atttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattgggg 165  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20745482 atttggtttttcctcaatcggtacttttaagccccaagttctcttcagatggaaataagtgagaatatgccatgtacggtgtattgggg 20745394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Original strand, 17900402 - 17900472
Alignment:
Q  101 ctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccata 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  17900402 ctttatgcctcaagttctcttcatatccgaagaagagagaacatgtcatgtacgatgtattggggaccata 17900472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 21782904 - 21782941
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaa 38  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21782904 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaa 21782941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 228
Target Start/End: Original strand, 12801646 - 12801681
Alignment:
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12801646 cattagggtttcccattattccgttaatgggtcatc 12801681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 25381699 - 25381983
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25381699 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 25381798  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25381799 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 25381898  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25381899 cattattccattaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 25381983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50306198 - 50305909
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50306198 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 50306099  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  50306098 ccggta-------gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagaatttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgacc 50306006  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50306005 attagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 50305909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 51 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1078196 - 1077956
Alignment:
Q  51 acacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccat 149  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  1078196 acacacaatagagttagcggccgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggtgagaagagagagtattgccgt 1078097  T
Q  150 gtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgag 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1078096 gtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcatgttgag 1077997  T
Q  250 tccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1077996 tccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 1077956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 25387668 - 25387950
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25387668 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 25387767  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25387768 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 25387867  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25387868 cattattccattaatgggccatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 25387950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34739993 - 34739711
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaac 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34739993 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaac 34739894  T
Q  95 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  34739893 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttatattggatggcca 34739794  T
Q  195 ttagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34739793 ttagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattat 34739711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31051540 - 31051270
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31051540 ccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttccttaaccggtacctttat 31051441  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31051440 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 31051341  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31051340 cattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 31051270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31058040 - 31057770
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31058040 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttccttaaccggtacctttat 31057941  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31057940 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttatattgtatggccattagggtttcc 31057841  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31057840 cattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 31057770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Original strand, 8093011 - 8093279
Alignment:
Q  15 cctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaa-tagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       || |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8093011 cctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacaaacaactag-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 8093109  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  8093110 gcctcaagttctcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatgatcgttagggtttccc 8093209  T
Q  207 attattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8093210 attattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaacatttaatta 8093279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44409940 - 44409726
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccatgtacggtgtatt 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||    
T  44409940 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtatagtgtatt 44409841  T
Q  162 ggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact 261  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  44409840 ggggaccataacctcttttatattggatggccattagggtttctcattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatattaact 44409743  T
Q  262 aattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||| |||||||    
T  44409742 aattaaatatttaatta 44409726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 278
Target Start/End: Original strand, 24926991 - 24927193
Alignment:
Q  73 gctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatag 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||    
T  24926991 gctgatttggttcttcctcaaccggtacctatatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttccacgtatggagtattgggaaccatag 24927090  T
Q  173 actcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataat 272  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  24927091 cctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccagacatccac-ca--ttgagtccatatccattaattaattaat 24927187  T
Q  273 taatta 278  Q
    ||||||    
T  24927188 taatta 24927193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Original strand, 38152184 - 38152391
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  38152184 gttagcggcagctaatttggttcttcttcaaccggtacctttatgcttcaagttttctttagatggggagaagaacgagtttgtcgtgtacggtgtattg 38152283  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||        |||||| |||||||||||    
T  38152284 ggaaccatagcctcttttatattggatggtcatta-ggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatc-------attgagttcatatcaacta 38152375  T
Q  263 attaaataattaatta 278  Q
    |||||||| |||||||    
T  38152376 attaaatatttaatta 38152391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 276
Target Start/End: Original strand, 24963940 - 24964139
Alignment:
Q  74 ctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccataga 173  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||     
T  24963940 ctgatttggttcttcctcaaccagtacatttatgcctcaagtcctcttcagatggggagaagagagagtttgccacatacggtgtcttggtgatcatagc 24964039  T
Q  174 ctcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataatt 273  Q
     ||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  24964040 atcttttatattagatgacaattagggttt-ccatttttccgttaatgggtcattcagacatccaccca--ttgagttcatatccattaattaattaatt 24964136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27955099 - 27954887
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtatt 161  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  || ||| | |||   |||||||    
T  27955099 gttaacgacgactgatttagttattcctcaaccggtacctttatgtcttaagttctct-cagatggggagaagagaatgtattgtcgtgt---gtgtatt 27955004  T
Q  162 ggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact 261  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||  |||||   |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27955003 ggggatcataacatcttttatattggatgaccattatgatttcccattattccactaatgagccatccatacatccactcatattgagtccatatcaact 27954904  T
Q  262 aattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||| |||||||    
T  27954903 aattaaatatttaatta 27954887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Original strand, 25275421 - 25275494
Alignment:
Q  217 taatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25275421 taatgggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaa 25275494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 278
Target Start/End: Original strand, 12183962 - 12184047
Alignment:
Q  193 cattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12183962 cattagggtttctcattattccgttaattggccatccggacatctactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 12184047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 275
Target Start/End: Original strand, 33458149 - 33458340
Alignment:
Q  82 gttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactctttta 181  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| ||  |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||   | ||||| ||||| ||    
T  33458149 gttctttctcaactggtagctttatgtctatagttctattcgtatgggaagaagagagagtttgccgtgtctagtgtattgaaaatcatagcctcttata 33458248  T
Q  182 -tattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaa 275  Q
     ||||  ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  33458249 gtatt--atggtcattagggtttctcgttatttcattaatggatcatccggacatccactcacatt-agtccatatcagttaattaaatatttaa 33458340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23253956 - 23253855
Alignment:
Q  187 gatggtcattagggtttcccattattccgttaat----ggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    || ||||  | ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23253956 gatggtcattagggtttaccattattccattaattaatgggtcatttatacatctactcatatcgagtccatatcaattaattaattaattaattatcta 23253857  T
Q  283 aa 284  Q
    ||    
T  23253856 aa 23253855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 121
Target Start/End: Original strand, 12183820 - 12183867
Alignment:
Q  74 ctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 121  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12183820 ctgatttggttatttctcaaccgctacctttatgcctcaagttctctt 12183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24287982 - 24287699
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24287982 ccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 24287883  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24287882 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggac-atagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 24287784  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatctaaaatagaa 290  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  24287783 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaatatttaaatatccaaaatagaa 24287699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 10733504 - 10733783
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaac 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10733504 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10733603  T
Q  95 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtca 194  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  10733604 cgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggcca 10733701  T
Q  195 ttagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10733702 ttagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaatcaaatacttaatta 10733783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 10947273 - 10947552
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaac 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10947273 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10947372  T
Q  95 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtca 194  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  10947373 cgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggcca 10947470  T
Q  195 ttagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10947471 ttagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaatcaaatacttaatta 10947552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 10739491 - 10739770
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaac 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10739491 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaac 10739590  T
Q  95 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtca 194  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  10739591 cgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggcca 10739688  T
Q  195 ttagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10739689 ttagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaatcaaatacttaatta 10739770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 10953260 - 10953539
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaac 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10953260 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaac 10953359  T
Q  95 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtca 194  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  10953360 cgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggcca 10953457  T
Q  195 ttagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10953458 ttagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaatcaaatacttaatta 10953539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48167174 - 48166904
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48167174 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttat 48167075  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48167074 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 48166975  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48166974 cattattccgttaatgggccatccgaacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 48166904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48160955 - 48160685
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48160955 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttat 48160856  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48160855 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcc 48160756  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48160755 cattattccgttaatgggccatccgaacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 48160685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Original strand, 6257369 - 6257638
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6257369 ccctctcatcaacaacgataaccaaagtgaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 6257468  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  6257469 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggttt-c 6257567  T
Q  206 cattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6257568 cattattccgttaatgggccatccggatatccactca--ttgagcccatatcaattaattaaatatttaatta 6257638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 278
Target Start/End: Original strand, 26957023 - 26957237
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtatt 161  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26957023 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatatt 26957122  T
Q  162 ggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26957123 ggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgagccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaact 26957220  T
Q  262 aattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||| |||||||    
T  26957221 aattaaatatttaatta 26957237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 33458431 - 33458662
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33458431 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttctttctcaaccgatacctttat 33458530  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |    
T  33458531 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccgttagggtttcgc 33458630  T
Q  207 attattccgttaatggatcatccagacatcca 238  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  33458631 attatttcgttaatgggccatccagacatcca 33458662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 33461556 - 33461787
Alignment:
Q  14 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33461556 ccctctcatcaacaacgataatcaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 33461655  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttccc 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33461656 gcctcaagttcttttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgatcatcagggtttccc 33461755  T
Q  207 attattccgttaatggatcatccagacatcca 238  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  33461756 attatcccgttaatgagtcatccggacatcca 33461787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 278
Target Start/End: Original strand, 44831827 - 44832048
Alignment:
Q  51 acacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatg 150  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     ||    
T  44831827 acacaaaatagggttagcgacggctgatgtggttcttcctcaaccggtatttttatgcctcaagttctcttcggatgcggagaagagagagttg----tg 44831922  T
Q  151 tacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagt 250  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  44831923 ttcggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccaattattccgttaatggaccatccggacatgcactca--ttgagt 44832020  T
Q  251 ccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44832021 ccatatcaactaattaaatatttaatta 44832048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 278
Target Start/End: Original strand, 26971824 - 26971988
Alignment:
Q  112 aagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccatta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26971824 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatattggatggccattagggttt-ccatta 26971922  T
Q  211 ttccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26971923 ttccgttaatggaccatccagacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 26971988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50168532 - 50168321
Alignment:
Q  64 ttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattgg 163  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  50168532 ttagcggcggttgatttagttcttcctcaac-ggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaaaagagagttttgcgtgtacggtgtattgg 50168434  T
Q  164 ggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50168433 ggaccatagcctcttttatattgaatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggtcattcggtcatccactca--ttgagtccatatcaactaa 50168336  T
Q  264 ttaaataattaatta 278  Q
    ||||||| |||||||    
T  50168335 ttaaatatttaatta 50168321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50155897 - 50155687
Alignment:
Q  64 ttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaa-gagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  50155897 ttagcggcggctgatttgattctttctcgactggtacctttatgccttaagttcttttcagatgaggagaaagagagagttttgcgtgtacggtgtattg 50155798  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
    |||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||    
T  50155797 gggaccataacttcttttatattggatgatcattatggtttctcattagttcgttaatggatcatccggacatccactc-----gagtccatatcaacta 50155703  T
Q  263 attaaataattaatta 278  Q
    |||||||| |||||||    
T  50155702 attaaatatttaatta 50155687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49976524 - 49976326
Alignment:
Q  63 gttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |       
T  49976524 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaac-ggtac-tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgga--- 49976430  T
Q  163 gggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaacta 262  Q
      |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||        |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||    
T  49976429 --gaccataacctcttttatattggatggccattagggttttccattattacg--------tcatccagacatccacccatattgaatccatatccatta 49976340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Original strand, 19686551 - 19686743
Alignment:
Q  73 gctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatag 172  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||| | || ||||    
T  19686551 gctgatttggttcgttctcaaccggtaccattatgcctcaatttctcttgggatgaggagaagagagagtttgccttgt--gatgtattgag-actatag 19686647  T
Q  173 actcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata 270  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19686648 tctcttttatattggatggtcagtagggtttctcattatttcgttaatgggtcatccagacatccact--gcttgagttcatatcaattaattaaata 19686743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35177741 - 35177523
Alignment:
Q  58 atagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga-gagagtttgccatgtacggt 156  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||    |||   ||||||||    
T  35177741 atagagttagcggcgcctgatttgattatttctcaaccgatacatttatgcctcaagttctcttcagatgaggagaccatgatttattgttgtgtacggt 35177642  T
Q  157 gtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatat 256  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  35177641 gtattgaggactataacctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattcctttaataggtcatccagacatacactcgtattgagtccatgt 35177542  T
Q  257 caactaattaaataattaa 275  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  35177541 caacaaattaaatatttaa 35177523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 10733398 - 10733507
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatg-------acacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaac 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10733398 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10733497  T
Q  95 cggtaccttt 104  Q
    || |||||||    
T  10733498 cgataccttt 10733507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 10947167 - 10947276
Alignment:
Q  2 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatg-------acacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaac 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10947167 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10947266  T
Q  95 cggtaccttt 104  Q
    || |||||||    
T  10947267 cgataccttt 10947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4632310 - 4632192
Alignment:
Q  74 ctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatag 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||     
T  4632310 ctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatgagaagaagagaaagtattgtcatgtactgtatattggggaccataa 4632211  T
Q  173 actcttttatattggatgg 191  Q
     ||||||||||||||||||    
T  4632210 cctcttttatattggatgg 4632192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 278
Target Start/End: Original strand, 17627002 - 17627208
Alignment:
Q  65 tagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggg 164  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||      ||||| ||||||||||    
T  17627002 tagcgacggctagttttgttcttcctcaaccggtacttttatgcttctagttctcttcagatggggagaagagaatgt-----gtgtactgtgtattggg 17627096  T
Q  165 gaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaat 264  Q
    || ||| | ||||||||||||  |    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||| || ||||    
T  17627097 gatcatggcctcttttatatttaacaaccattagggttttcaattattccgttaatgggtcatcctgacatcccctca--ttgagtccatattaattaat 17627194  T
Q  265 taaataattaatta 278  Q
     ||||| |||||||    
T  17627195 caaatatttaatta 17627208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28704340 - 28704253
Alignment:
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataattaattatc 280  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  28704340 attagggtttctcattattcagttaatgagtcatccagacatccactcatattgagttcatatcagttaattaaaataattaattatc 28704253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32284608 - 32284504
Alignment:
Q  74 ctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccataga 173  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | |  |||||| | |||||| |||||||||||    
T  32284608 ctgatttggttcttcctcgatcggtacctttaggcctcaagttttcttcagatgaggagaatagagaatatatcatgtatgatgtattagggaccataga 32284509  T
Q  174 ctctt 178  Q
     ||||    
T  32284508 atctt 32284504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9237262 - 9237105
Alignment:
Q  120 ttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattg-gatggtcattagggtttcccattattccgtta 218  Q
    |||| ||||| |||| | |||||||| | |||||  ||||||||| | ||||| |||||  ||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  9237262 ttcaaatgggaagaacaaagagtttgtcgtgtacaatgtattgggaatcatagcctctt--atagtgtgatggtcattaaggtttcc-attatcccgtta 9237166  T
Q  219 atggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaact-aattaaataattaattatc 280  Q
    || | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  9237165 attggtcatccagacatccactca--tagagtccatatcacttcaattaaataattaattatc 9237105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33045185 - 33045085
Alignment:
Q  62 agttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtatt 161  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||   | |||||||||||| || | | || ||||||||||    
T  33045185 agttaacggcggctgatttagttctttctcaaccggtacttttatatctcaagttctcttcaatcgcggagaagagagaattcgtcgtgaacggtgtatt 33045086  T
Q  162 g 162  Q
    |    
T  33045085 g 33045085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3769501 - 3769434
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  3769501 cggctgatttggttcttcctcaacccgtatatttatgcctatagttcttttcagatagggagaagaga 3769434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 50427297 - 50427238
Alignment:
Q  62 agttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 121  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50427297 agttagcgacgattggtttggttcttactcaaccggtacatttatgcctcaacttctctt 50427238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 173041 - 173323
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  173041 gctttcaagatagccctcttatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 173140  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  173141 ccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgacc 173240  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  173241 attagggtttcccattattccgttaatagaacatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 173323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 1345 - 1621
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  1345 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggtttttcctcaa 1444  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtc 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1445 ccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggcc 1544  T
Q  194 attagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    |||||| ||| ||||||||||      || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1545 attaggattttccattattcc------gggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 1621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 770 - 956
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga-------cacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaa 93  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  770 gctttcatagcagccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 869  T
Q  94 ccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactctttt 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  870 ccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 270
Target Start/End: Original strand, 957 - 1024
Alignment:
Q  201 tttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata 270  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  957 tttcccattatttcgttaatgggacatccgaacatccactca--ttgagcccatatcaactaattaaata 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 949 - 791
Alignment:
Q  116 tctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  949 tctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctg 850  T
Q  216 ttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaat 276  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  849 ttaatgggtcatctagacattcactca--ttgagtacatatcagttaattaaatatttaat 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1015 - 950
Alignment:
Q  71 cggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1015 cggctgatttggttcttcctcaaccgttatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14121 - 13999
Alignment:
Q  154 ggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtcca 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||    
T  14121 ggtgtattggggaccataacctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgaatcca 14024  T
Q  254 tatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  14023 tatcaactaattaaatatttaatta 13999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5824 - 5693
Alignment:
Q  146 ccatgtacggtgtattggggaccatagactcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgt 245  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  5824 ccatgtacgatgtattgggaaccatagcctcttttatattgaatggccgttagg-tttcccattattctgttaatgggtcatccgaacatccactcatat 5726  T
Q  246 tgagtccatatcaactaattaaataattaatta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5725 tgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5889 - 5826
Alignment:
Q  58 atagagttagcgacggctgatttggttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 121  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5889 atagggttagcgacgactaatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatctt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38347 - 38151
Alignment:
Q  82 gttcttgctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggaccatagactctttt 180  Q
    |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||  |||  ||    
T  38347 gttcttcctcaactgatacctttatgtctcaagttctcttcagatgggaagaatagagtgtattatcatgtacggtgtattggagaccataacctc--tt 38250  T
Q  181 atattg-gatggtcattagggtttcccattattccgttaatggatcatccagacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat 279  Q
    ||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38249 atagtgtgatgatcattagggttttctattattccgttaatcggtcatctagacatccac-catattaagtccatatcaattaattaaataattaattat 38151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5493
Alignment:
Q  1 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543 gctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatga 5493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University