View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14472_low_2 (Length: 511)

Name: NF14472_low_2
Description: NF14472
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14472_low_2
NF14472_low_2
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (243-493)||(44536400-44536648)
chr4 (13-144)||(6643636-6643767)
chr4 (13-144)||(32884815-32884946)
chr4 (13-140)||(34360673-34360800)
chr4 (13-144)||(44536172-44536303)
chr4 (13-144)||(47464341-47464472)
chr4 (13-144)||(53346773-53346904)
chr4 (18-144)||(38405083-38405209)
chr4 (23-144)||(35311209-35311330)
chr4 (18-144)||(49428323-49428449)
chr4 (18-140)||(52247409-52247531)
chr4 (24-144)||(17237283-17237403)
chr4 (13-144)||(43237257-43237388)
chr4 (13-139)||(40122830-40122956)
chr4 (35-144)||(11907597-11907706)
chr4 (13-140)||(7061640-7061767)
chr4 (13-144)||(33790707-33790838)
chr4 (23-117)||(28500877-28500971)
chr4 (23-120)||(46396869-46396966)
chr4 (35-140)||(52859797-52859902)
chr4 (16-140)||(16821310-16821434)
chr4 (13-140)||(2942621-2942747)
chr4 (18-144)||(5841408-5841535)
chr4 (13-144)||(47772995-47773126)
chr4 (18-105)||(51625136-51625223)
chr4 (13-144)||(22130057-22130192)
chr4 (25-131)||(42517626-42517732)
chr4 (13-143)||(49175910-49176040)
chr4 (23-144)||(6609775-6609896)
chr4 (13-142)||(17114456-17114585)
chr4 (18-138)||(42616884-42617004)
chr4 (41-144)||(21240708-21240811)
chr4 (13-120)||(29575146-29575253)
chr4 (38-144)||(36985800-36985906)
chr4 (13-144)||(2066803-2066934)
chr4 (13-120)||(4972598-4972705)
chr4 (37-144)||(35380333-35380440)
chr4 (42-144)||(54506802-54506904)
chr4 (23-143)||(11288616-11288735)
chr4 (62-140)||(50264105-50264183)
chr4 (15-120)||(52869110-52869215)
chr4 (13-144)||(2653434-2653563)
chr4 (32-144)||(49746975-49747086)
chr4 (22-125)||(30192238-30192341)
chr4 (18-136)||(30682177-30682295)
chr4 (23-140)||(19265826-19265943)
chr4 (23-120)||(39397382-39397479)
chr4 (13-144)||(3689576-3689707)
chr4 (89-144)||(44526393-44526448)
chr4 (42-144)||(25233195-25233297)
chr4 (23-144)||(49579164-49579285)
chr4 (31-140)||(461976-462085)
chr4 (57-144)||(26147635-26147722)
chr4 (31-113)||(35251934-35252016)
chr4 (18-72)||(50263913-50263967)
chr4 (38-144)||(53412122-53412228)
chr4 (18-87)||(41711437-41711506)
chr4 (23-118)||(5618582-5618677)
chr4 (70-144)||(38663480-38663554)
chr4 (42-143)||(38502487-38502588)
chr4 (242-271)||(40123058-40123087)
chr4 (23-140)||(47358935-47359052)
chr4 (82-138)||(2400798-2400854)
chr4 (51-119)||(3098757-3098825)
chr4 (191-223)||(44536349-44536381)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (13-144)||(9307641-9307772)
chr1 (18-144)||(39864125-39864251)
chr1 (13-144)||(12039096-12039227)
chr1 (13-144)||(24991626-24991757)
chr1 (31-144)||(28749005-28749118)
chr1 (13-138)||(23168966-23169091)
chr1 (35-144)||(37276475-37276584)
chr1 (13-140)||(31042815-31042942)
chr1 (18-140)||(917042-917164)
chr1 (13-144)||(6023622-6023753)
chr1 (18-125)||(33733241-33733347)
chr1 (22-133)||(34031509-34031620)
chr1 (13-144)||(44707733-44707864)
chr1 (42-144)||(40144849-40144951)
chr1 (35-140)||(7759233-7759338)
chr1 (51-144)||(15699136-15699229)
chr1 (31-144)||(26093408-26093521)
chr1 (35-144)||(49223981-49224090)
chr1 (32-140)||(6160451-6160559)
chr1 (13-144)||(42410008-42410139)
chr1 (18-140)||(31978630-31978752)
chr1 (45-144)||(36701935-36702034)
chr1 (45-144)||(36718039-36718138)
chr1 (18-140)||(2572487-2572608)
chr1 (40-144)||(14757591-14757698)
chr1 (38-143)||(32970565-32970670)
chr1 (35-140)||(37506142-37506250)
chr1 (23-140)||(44761514-44761631)
chr1 (23-140)||(52429362-52429479)
chr1 (13-120)||(11449923-11450028)
chr1 (24-144)||(13579605-13579725)
chr1 (13-144)||(20209813-20209944)
chr1 (13-144)||(38787355-38787486)
chr1 (18-144)||(16395025-16395150)
chr1 (18-144)||(30754919-30755045)
chr1 (13-134)||(41121795-41121919)
chr1 (35-120)||(22181374-22181459)
chr1 (30-135)||(24880899-24881004)
chr1 (36-144)||(45331352-45331463)
chr1 (13-141)||(12151193-12151321)
chr1 (13-144)||(32825965-32826098)
chr1 (45-144)||(8896337-8896436)
chr1 (70-144)||(22856267-22856341)
chr1 (91-144)||(35367816-35367869)
chr1 (62-142)||(7351652-7351732)
chr1 (16-128)||(4441579-4441691)
chr1 (21-144)||(10495853-10495975)
chr1 (13-83)||(6267829-6267899)
chr1 (23-144)||(21909989-21910109)
chr1 (51-144)||(29074898-29074991)
chr1 (30-86)||(35682795-35682851)
chr1 (45-120)||(35538681-35538756)
chr1 (35-144)||(9379245-9379355)
chr1 (30-144)||(27896969-27897083)
chr1 (18-72)||(43500762-43500816)
chr1 (194-224)||(45775455-45775485)
chr1 (13-86)||(7439888-7439961)
chr1 (92-144)||(25089137-25089190)
chr1 (191-224)||(43500889-43500922)
chr1 (50-138)||(34688857-34688945)
chr1 (50-138)||(34693385-34693473)
chr1 (30-86)||(35367635-35367691)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (18-144)||(19823025-19823151)
chr3 (31-144)||(37695654-37695767)
chr3 (23-144)||(43253843-43253964)
chr3 (13-144)||(1778657-1778787)
chr3 (13-136)||(37311972-37312095)
chr3 (18-144)||(30190635-30190761)
chr3 (23-144)||(11905836-11905957)
chr3 (21-144)||(28690760-28690883)
chr3 (13-144)||(36460386-36460517)
chr3 (13-143)||(12736542-12736672)
chr3 (35-140)||(24569092-24569197)
chr3 (23-140)||(37772944-37773061)
chr3 (24-140)||(51837940-51838056)
chr3 (13-144)||(11632095-11632225)
chr3 (13-140)||(23004353-23004479)
chr3 (18-144)||(8679029-8679155)
chr3 (20-144)||(36476598-36476722)
chr3 (13-144)||(38795358-38795489)
chr3 (13-144)||(3313268-3313395)
chr3 (23-116)||(10366622-10366715)
chr3 (31-140)||(27471353-27471462)
chr3 (35-144)||(37497506-37497615)
chr3 (23-144)||(44301576-44301697)
chr3 (24-144)||(34750510-34750630)
chr3 (45-144)||(3901151-3901250)
chr3 (18-116)||(5322914-5323010)
chr3 (21-144)||(19611923-19612045)
chr3 (13-144)||(45710864-45710995)
chr3 (18-144)||(29023941-29024066)
chr3 (23-144)||(14194570-14194690)
chr3 (35-144)||(54726499-54726608)
chr3 (13-85)||(33491053-33491125)
chr3 (18-125)||(49830162-49830270)
chr3 (13-120)||(30711111-30711218)
chr3 (25-144)||(43719281-43719399)
chr3 (13-140)||(48540970-48541097)
chr3 (13-140)||(53560235-53560362)
chr3 (13-105)||(31158492-31158583)
chr3 (15-136)||(49447766-49447884)
chr3 (13-144)||(17652766-17652893)
chr3 (45-142)||(30682068-30682165)
chr3 (42-140)||(52290911-52291009)
chr3 (13-86)||(51064788-51064861)
chr3 (47-131)||(42278692-42278776)
chr3 (62-140)||(39043773-39043854)
chr3 (50-140)||(54477466-54477556)
chr3 (30-86)||(7757599-7757655)
chr3 (92-140)||(33491408-33491456)
chr3 (191-224)||(53560152-53560185)
chr3 (241-269)||(27549479-27549507)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (14-135)||(1875564-1875685)
chr8 (23-144)||(21216082-21216203)
chr8 (13-144)||(31082633-31082764)
chr8 (13-140)||(39405780-39405907)
chr8 (13-138)||(39482635-39482760)
chr8 (48-144)||(44761500-44761596)
chr8 (21-140)||(9300092-9300211)
chr8 (13-144)||(11976907-11977038)
chr8 (13-140)||(45425637-45425764)
chr8 (18-116)||(7703132-7703230)
chr8 (18-143)||(31271036-31271161)
chr8 (23-144)||(32476301-32476422)
chr8 (35-143)||(31231745-31231853)
chr8 (24-128)||(42972490-42972594)
chr8 (13-144)||(10097962-10098093)
chr8 (13-139)||(51132-51257)
chr8 (18-140)||(7172932-7173054)
chr8 (18-140)||(10179923-10180045)
chr8 (23-144)||(40996346-40996467)
chr8 (31-144)||(34948676-34948789)
chr8 (13-106)||(36967413-36967506)
chr8 (45-144)||(5053156-5053255)
chr8 (13-119)||(39300912-39301018)
chr8 (23-144)||(13335230-13335351)
chr8 (13-143)||(34393925-34394059)
chr8 (24-135)||(14854916-14855027)
chr8 (13-144)||(17719229-17719360)
chr8 (13-144)||(27294030-27294161)
chr8 (30-120)||(41092032-41092122)
chr8 (13-86)||(1739712-1739785)
chr8 (91-144)||(32678417-32678470)
chr8 (13-128)||(2767262-2767377)
chr8 (45-144)||(4428354-4428453)
chr8 (18-133)||(26626088-26626203)
chr8 (45-144)||(31331422-31331521)
chr8 (18-144)||(5356614-5356739)
chr8 (18-144)||(17823935-17824060)
chr8 (23-144)||(22771816-22771937)
chr8 (54-143)||(42887015-42887104)
chr8 (39-98)||(10953405-10953464)
chr8 (39-98)||(10961410-10961469)
chr8 (13-72)||(32678804-32678863)
chr8 (42-120)||(396611-396689)
chr8 (18-96)||(6796021-6796099)
chr8 (92-144)||(29226578-29226630)
chr8 (24-120)||(33765698-33765794)
chr8 (31-86)||(39329091-39329146)
chr8 (91-139)||(10953787-10953832)
chr8 (91-139)||(10961792-10961837)
chr8 (31-85)||(39329370-39329423)
chr8 (35-84)||(9549999-9550048)
chr8 (91-136)||(29806330-29806375)
chr8 (50-102)||(12559649-12559701)
chr8 (91-135)||(27870888-27870932)
chr8 (91-135)||(27976678-27976722)
chr8 (91-135)||(28033947-28033991)
chr8 (32-116)||(39890663-39890747)
chr8 (51-119)||(40028555-40028623)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (13-144)||(11373405-11373536)
chr7 (13-144)||(7463234-7463365)
chr7 (13-144)||(28103754-28103885)
chr7 (13-144)||(34947521-34947652)
chr7 (25-144)||(41506054-41506173)
chr7 (13-144)||(2459492-2459621)
chr7 (13-144)||(5524401-5524532)
chr7 (18-140)||(26974051-26974176)
chr7 (18-144)||(3178186-3178312)
chr7 (17-144)||(24516270-24516397)
chr7 (13-143)||(9786010-9786140)
chr7 (13-144)||(21350605-21350733)
chr7 (23-144)||(21390316-21390437)
chr7 (23-144)||(30865988-30866109)
chr7 (13-144)||(22738722-22738853)
chr7 (13-139)||(7457398-7457524)
chr7 (24-144)||(13961980-13962100)
chr7 (13-144)||(8592417-8592548)
chr7 (13-144)||(23670507-23670637)
chr7 (13-144)||(28202286-28202417)
chr7 (18-144)||(21759966-21760092)
chr7 (42-144)||(43873944-43874046)
chr7 (35-144)||(16560569-16560678)
chr7 (35-144)||(16604984-16605093)
chr7 (23-144)||(38391769-38391890)
chr7 (24-144)||(759079-759199)
chr7 (13-144)||(83406-83537)
chr7 (17-144)||(19271714-19271841)
chr7 (13-144)||(34100524-34100655)
chr7 (13-128)||(42935698-42935813)
chr7 (13-144)||(46478270-46478401)
chr7 (18-140)||(32346034-32346156)
chr7 (30-126)||(2850875-2850971)
chr7 (13-144)||(27921009-27921140)
chr7 (18-144)||(17828334-17828459)
chr7 (13-119)||(40076361-40076467)
chr7 (18-144)||(31930479-31930607)
chr7 (13-117)||(29835391-29835495)
chr7 (21-140)||(33819239-33819358)
chr7 (24-125)||(12631345-12631446)
chr7 (91-144)||(25571440-25571493)
chr7 (24-140)||(49101688-49101807)
chr7 (13-120)||(46211473-46211583)
chr7 (13-143)||(16904401-16904531)
chr7 (23-144)||(37245711-37245834)
chr7 (13-102)||(44180268-44180357)
chr7 (24-143)||(32018700-32018819)
chr7 (79-134)||(42796039-42796094)
chr7 (92-144)||(6494990-6495042)
chr7 (91-135)||(7930083-7930127)
chr7 (69-136)||(21937820-21937887)
chr7 (38-144)||(32018917-32019024)
chr7 (64-119)||(39452390-39452445)
chr7 (49-120)||(47045467-47045537)
chr7 (24-58)||(34635958-34635992)
chr7 (13-144)||(44424165-44424287)
chr7 (191-224)||(40076261-40076294)
chr7 (94-138)||(30546413-30546457)
chr7 (96-144)||(36790761-36790809)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (13-144)||(8947020-8947151)
chr2 (13-144)||(45235595-45235726)
chr2 (13-144)||(5789616-5789747)
chr2 (23-140)||(39691508-39691625)
chr2 (24-140)||(43410444-43410560)
chr2 (13-144)||(15359055-15359186)
chr2 (18-144)||(31448666-31448792)
chr2 (18-140)||(43115775-43115897)
chr2 (13-144)||(16463703-16463834)
chr2 (18-144)||(37322442-37322569)
chr2 (18-144)||(14523345-14523471)
chr2 (18-143)||(16805896-16806021)
chr2 (18-143)||(16845177-16845302)
chr2 (13-144)||(35313901-35314033)
chr2 (13-136)||(16377624-16377747)
chr2 (23-144)||(17695344-17695465)
chr2 (18-102)||(19937733-19937817)
chr2 (13-144)||(25637495-25637625)
chr2 (13-144)||(39329629-39329762)
chr2 (13-144)||(39785599-39785733)
chr2 (22-140)||(34225608-34225726)
chr2 (42-144)||(36794298-36794400)
chr2 (50-143)||(19426470-19426564)
chr2 (23-144)||(34120417-34120536)
chr2 (24-144)||(36354422-36354542)
chr2 (13-96)||(3323254-3323337)
chr2 (23-85)||(26607946-26608008)
chr2 (13-60)||(7438874-7438921)
chr2 (35-118)||(32783404-32783487)
chr2 (13-81)||(18853168-18853236)
chr2 (13-144)||(11742497-11742627)
chr2 (65-136)||(32831195-32831266)
chr2 (98-144)||(9458319-9458365)
chr2 (26-120)||(27866530-27866623)
chr2 (51-120)||(1206709-1206778)
chr2 (13-86)||(27501506-27501579)
chr2 (35-144)||(35242287-35242396)
chr2 (80-140)||(26608178-26608238)
chr2 (41-143)||(43699595-43699694)
chr2 (91-126)||(3601416-3601451)
chr2 (22-57)||(3601465-3601500)
chr2 (28-142)||(17346346-17346459)
chr2 (108-144)||(3323335-3323371)
chr2 (92-144)||(26863405-26863457)
chr2 (51-138)||(43730635-43730720)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (24-144)||(13909438-13909558)
chr6 (13-140)||(3720210-3720337)
chr6 (13-137)||(23142688-23142812)
chr6 (13-144)||(15058131-15058262)
chr6 (23-144)||(11655925-11656046)
chr6 (13-144)||(29363320-29363451)
chr6 (13-144)||(31894179-31894310)
chr6 (42-144)||(6801945-6802047)
chr6 (38-144)||(13087544-13087650)
chr6 (13-144)||(21010187-21010322)
chr6 (39-141)||(24983444-24983546)
chr6 (23-128)||(1781832-1781937)
chr6 (13-144)||(32440614-32440745)
chr6 (13-143)||(3291737-3291867)
chr6 (35-144)||(5302365-5302474)
chr6 (13-132)||(6834338-6834457)
chr6 (13-139)||(1063572-1063698)
chr6 (23-119)||(27448135-27448231)
chr6 (13-144)||(181570-181700)
chr6 (31-126)||(7920271-7920365)
chr6 (42-143)||(30716915-30717016)
chr6 (26-142)||(21804511-21804626)
chr6 (45-144)||(17828954-17829053)
chr6 (31-110)||(27367423-27367502)
chr6 (31-110)||(27457770-27457849)
chr6 (75-144)||(11143618-11143687)
chr6 (32-143)||(1225062-1225173)
chr6 (13-86)||(34639421-34639494)
chr6 (92-144)||(34657610-34657662)
chr6 (69-144)||(34300009-34300084)
chr6 (44-126)||(1955979-1956061)
chr6 (74-136)||(10923408-10923470)
chr6 (191-224)||(5302287-5302320)
chr6 (74-135)||(8115068-8115129)
chr6 (191-224)||(21010107-21010140)
chr6 (51-144)||(22398427-22398519)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (23-143)||(27542810-27542930)
chr5 (13-144)||(8698323-8698454)
chr5 (13-144)||(40530192-40530323)
chr5 (18-144)||(6315750-6315876)
chr5 (22-136)||(8724986-8725100)
chr5 (13-128)||(4818581-4818696)
chr5 (13-144)||(29570406-29570537)
chr5 (13-128)||(31655083-31655198)
chr5 (18-144)||(6753632-6753757)
chr5 (23-144)||(7827904-7828025)
chr5 (24-140)||(27580618-27580735)
chr5 (26-144)||(30512666-30512785)
chr5 (26-144)||(30553006-30553125)
chr5 (18-140)||(1248577-1248699)
chr5 (13-119)||(32440180-32440286)
chr5 (13-122)||(9515782-9515891)
chr5 (24-144)||(40899932-40900052)
chr5 (15-144)||(15818450-15818581)
chr5 (13-136)||(29374364-29374487)
chr5 (13-143)||(21060645-21060775)
chr5 (31-144)||(6615866-6615979)
chr5 (35-144)||(19929960-19930069)
chr5 (13-144)||(22848352-22848483)
chr5 (13-144)||(41496094-41496225)
chr5 (30-144)||(6754043-6754156)
chr5 (31-140)||(29856065-29856172)
chr5 (18-144)||(2232046-2232168)
chr5 (23-144)||(42803598-42803719)
chr5 (21-86)||(843509-843574)
chr5 (31-119)||(15439305-15439393)
chr5 (13-131)||(38508155-38508273)
chr5 (46-144)||(41062161-41062259)
chr5 (18-136)||(11904227-11904346)
chr5 (51-144)||(4441035-4441128)
chr5 (13-144)||(41492316-41492447)
chr5 (13-144)||(11796135-11796266)
chr5 (73-144)||(38161440-38161511)
chr5 (31-120)||(37184065-37184154)
chr5 (41-131)||(5731803-5731893)
chr5 (51-141)||(18841496-18841586)
chr5 (13-102)||(5282398-5282487)
chr5 (30-86)||(3076662-3076717)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (13-144)||(33989-34120)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (35-128)||(2055-2148)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (13-120)||(16136-16243)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (13-140)||(50222-50349)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (23-144)||(5404-5525)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (35-140)||(105702-105807)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (13-144)||(136007-136138)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (13-116)||(17077-17180)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (35-144)||(7973-8082)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (23-119)||(39127-39223)
[»] scaffold1391 (1 HSPs)
scaffold1391 (13-116)||(1787-1890)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (19-102)||(6793-6876)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (37-143)||(1719-1825)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (56-128)||(697-769)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (18-86)||(6260-6328)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (32-144)||(20342-20454)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (13-54)||(84383-84424)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 243 - 493
Target Start/End: Original strand, 44536400 - 44536648
Alignment:
Q  243 aaagagacaataattatgagacggatgaaagtataataataccataaataagttttagtctatattctacttttacaattttaatctagtcaaataaatt 342  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44536400 aaagagaaaataattgtgagactgatgaaa-tataataatatcataaataagttttagtctatattctacttttacaattttaatctagtcaaataaatt 44536498  T
Q  343 agtaaaaatttgatggcaataattgagtttttcatgcagtttactaaaaagtttgatgatttgtcaatcaattaggtaatagtttgtttg-caagagagg 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44536499 agtaaaaatttgatggc-ataattgagtttttcatgcagtttactaaaatg-ttgatgatttgtcaatcaattaggtattagtttgtttgacaagagagg 44536596  T
Q  442 acaagacattaaagttaaatcttatattgacatgacaagagagggtatactt 493  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  44536597 acaatactttaaagttaaatcttacattgacatgacaagagaggatatactt 44536648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 6643636 - 6643767
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| | |||||    
T  6643636 aatattagtagtttaatgtttgagcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatctttatt 6643735  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6643736 aattgtagttagtggtatagttaagttggatg 6643767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32884946 - 32884815
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||  | |||||| |||||||| ||||||    
T  32884946 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtagaattagtagcatttagtaaaacactcttatt 32884847  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32884846 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 32884815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34360800 - 34360673
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  34360800 aatattaatcgtttaaagtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttatt 34360701  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34360700 aattgtagttagtggagtagttaagttg 34360673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 44536172 - 44536303
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  44536172 aatattaattgtttaaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattagcaggatttattaaaacacccttatt 44536271  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||    
T  44536272 aattgtagttagtggagtagctaagttagatg 44536303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 47464341 - 47464472
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| || ||||||    
T  47464341 aatattagtcgtttaaggtttgagcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaactcttatt 47464440  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  47464441 aattgtagttggtggagtagttaagttggatg 47464472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 53346904 - 53346773
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53346904 aatattagtcgtttaaaatttgtgcacgattattaagaaaataattgattgtgttagtttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacccttatt 53346805  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  53346804 aattttagttagtggagtagttaagtttgatg 53346773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 38405083 - 38405209
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38405083 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattctgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 38405182  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  38405183 tagttagtggtgtagttaagttggatg 38405209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 35311209 - 35311330
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  35311209 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattatgttaatttcaatggtaaaattaattgcatttactagaacactcttattaattgtagtt 35311308  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  35311309 agtggagtaattaagttggatg 35311330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 49428323 - 49428449
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49428323 tagtcgtttaaggtttttgcacgattattaaggaaatgattatttgtgttgatttcaatggtaaaattaatataatttactaaaatacccttattaattg 49428422  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  49428423 tagttagtggagtaattaagttggatg 49428449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 52247409 - 52247531
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  52247409 tagtcgtttaaggattgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattaatacaatttactaaaatatccttattaattg 52247508  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  52247509 tagttagtggagtagttaagttg 52247531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Original strand, 17237283 - 17237403
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17237283 tttaaggtttgtgcatgattattaagaaaataattaattgtgttgattgcaatggtaaaattagtaacatttactaaaacaaccttattaattgtagtta 17237382  T
Q  124 gtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  17237383 gtggagtagttaagttggatg 17237403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43237388 - 43237257
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  || ||||||||||| | | |||||    
T  43237388 aatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtaatatttactaaaaaatcattatt 43237289  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  43237288 aattatagttagtgaagtagttaagttggatg 43237257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Original strand, 40122830 - 40122956
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  40122830 aatattagtcgtttaagctttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgcgttgattttaatgttaaaattagtagcatttactaaaacacccttatt 40122929  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagtt 139  Q
     ||||||| |||||||  |||||||||    
T  40122930 gattgtagttagtggagcagttaagtt 40122956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 11907597 - 11907706
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  11907597 tgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttattggagtagtt 11907696  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  11907697 aagttggatg 11907706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 7061640 - 7061767
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||| || | | |||||    
T  7061640 aatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactataatatctttatt 7061739  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  7061740 aattgtagttagtggattaattaagttg 7061767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 33790707 - 33790838
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    ||||| ||||||||||||||||    
T  33790707 aataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtttcatttgctaaaacacccttatt 33790806  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33790807 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 33790838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 28500877 - 28500971
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28500877 gtttaatgtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 28500971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Original strand, 46396869 - 46396966
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46396869 gtttaaggtttgtgcacgatcattaagtaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacactcttattaattgtag 46396966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 140
Target Start/End: Original strand, 52859797 - 52859902
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52859797 tgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagtt 52859896  T
Q  135 aagttg 140  Q
    ||||||    
T  52859897 aagttg 52859902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 16821310 - 16821434
Alignment:
Q  16 attagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaat 115  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| || | ||||||||||    
T  16821310 attagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaatgcaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatccttattaat 16821409  T
Q  116 tgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    | ||| ||||||| || ||||||||    
T  16821410 tatagttagtggagtatttaagttg 16821434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 2942621 - 2942747
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  2942621 aatattagtcgtttaaggtttgtataagattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcgatgataaaattagtagcatttactaaaaca-ccttatt 2942719  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  2942720 aattgtagttagtggagtggttaagttg 2942747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 5841408 - 5841535
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | || ||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5841408 tagtcgtttaaggtttgtgcacaactattaaggaaatgattgattgcgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 5841507  T
Q  118 taggtagtggaatag-ttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  5841508 tagttagtggagtagtttaagttggatg 5841535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 47772995 - 47773126
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  47772995 aataatagtcgtttaaggttgatgcacagttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttatt 47773094  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47773095 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 47773126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 51625223 - 51625136
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacac 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  51625223 tagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaaaacac 51625136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22130192 - 22130057
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaa----ctgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacaccct 108  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| || |||||  | ||||||| |||||| |||    
T  22130192 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacggttattaaggaaatgattaattgtatgtgttgatttcaatggtataattagtatcatttacaaaaacatcct 22130093  T
Q  109 tattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  22130092 tattaattgtagttagtggagtaattaagttggatg 22130057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 42517626 - 42517732
Alignment:
Q  25 ttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtag 124  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  42517626 ttaatgtttgtacacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaagatcatttactaaaatacccttattaattatagttag 42517725  T
Q  125 tggaata 131  Q
    || ||||    
T  42517726 tgaaata 42517732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 49175910 - 49176040
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||    
T  49175910 aataatagtcgtttaaggtttgtgcatgatttttaagaaaatgattaattgtggagatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaataaccttatt 49176009  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  49176010 aattgtagttagcggagtagttaagttggat 49176040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6609896 - 6609775
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||||| |||||| | ||||||||||||  |    
T  6609896 gtttaaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacaaaaacatctttattaattgtaatt 6609797  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    | |||| |||||||||||||||    
T  6609796 attggagtagttaagttggatg 6609775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17114585 - 17114456
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17114585 aataatagtcgtttaaggttgatgcacagttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttatt 17114486  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttgga 142  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  17114485 aattgtagttagtggagtagttaatttgga 17114456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 42616884 - 42617004
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |   ||||||||||    
T  42616884 tagtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattg 42616983  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagt 138  Q
    |||  |||||| |||||||||    
T  42616984 tagtaagtggagtagttaagt 42617004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 144
Target Start/End: Original strand, 21240708 - 21240811
Alignment:
Q  41 attattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  21240708 attattaaggaaatgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaacacatccttattaattgtagttagttgagtagttaagttg 21240807  T
Q  141 gatg 144  Q
    ||||    
T  21240808 gatg 21240811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 29575253 - 29575146
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||    
T  29575253 aatattagtcgtttaaaatttgtacacgattactaagaaaatgattaattatgttaatttaaatgataaaattaataacatttattaaaatactcttgtt 29575154  T
Q  113 aattgtag 120  Q
    ||||||||    
T  29575153 aattgtag 29575146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36985906 - 36985800
Alignment:
Q  38 acgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaag 137  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  36985906 acgatttttcaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccgtattaattgtagttagtagaataattaag 36985807  T
Q  138 ttggatg 144  Q
    |||||||    
T  36985806 ttggatg 36985800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2066934 - 2066803
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||| |||  |  ||||| |||||||||||||||    
T  2066934 aataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaagttagtattatttattaaaacacccttatt 2066835  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  2066834 aattttagttagtggggtagttaagttagatg 2066803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4972705 - 4972598
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  4972705 aatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaatgaaatgattaattgtgttgatttcaattgaaaaattggtgacatttactaaaacactcttatt 4972606  T
Q  113 aattgtag 120  Q
    ||||||||    
T  4972605 aattgtag 4972598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 144
Target Start/End: Original strand, 35380333 - 35380440
Alignment:
Q  37 cacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  35380333 cacgattattaagaaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatcattattaattgtagttagtggagtggttaa 35380432  T
Q  137 gttggatg 144  Q
    ||||||||    
T  35380433 gttggatg 35380440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54506904 - 54506802
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| | | |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  54506904 ttattaagaaaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatcattatcaattgtagttagtggagtagttaagtttg 54506805  T
Q  142 atg 144  Q
    |||    
T  54506804 atg 54506802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 11288616 - 11288735
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||  |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| |    
T  11288616 gtttaaggtttatgtacgattattaagaaaatgattaattgtattgatttcaatggcaaaattaatatcatttactaaaata-tcttattaattgtagtt 11288714  T
Q  123 agtggaatagttaagttggat 143  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  11288715 ggtggagtagttaagttggat 11288735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 140
Target Start/End: Original strand, 50264105 - 50264183
Alignment:
Q  62 tgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  50264105 tgtgttgatttcaatgttaaaattaacatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtgaaatatttaagttg 50264183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 52869215 - 52869110
Alignment:
Q  15 tattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaa 114  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||| ||||| | | |||| ||||| ||| |||||||    
T  52869215 tattagtcgtttaaggtttgtgcacaattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaatagtaagattaatatcgtttattaaaatacctttattaa 52869116  T
Q  115 ttgtag 120  Q
    ||||||    
T  52869115 ttgtag 52869110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2653563 - 2653434
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||  | |||||| ||||| || ||||||    
T  2653563 aataatagttgtttaagatttgtgcatgattattaa--aaatgattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtatcatttattaaaatactcttatt 2653466  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| |||||||    
T  2653465 aattgtagttaaaggagtagttaaattggatg 2653434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 49747086 - 49746975
Alignment:
Q  32 ttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaata 131  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||| || ||    
T  49747086 ttgtgcacgattattaaa-aaataattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaataccttcattaattatagttagttgagta 49746988  T
Q  132 gttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||    
T  49746987 gttaagttggatg 49746975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30192341 - 30192238
Alignment:
Q  22 tgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtagg 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||   ||||| |||||| |  ||||||||||||||     
T  30192341 tgtttaatgtttgtacacgatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaattataaaattaatgtcatttgctaaaatattcttattaattgtagt 30192242  T
Q  122 tagt 125  Q
    ||||    
T  30192241 tagt 30192238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Original strand, 30682177 - 30682295
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||| || | |||||||| |||    
T  30682177 tagtcgtttaaggtttttgcacgactattaaaaaaatgattaattgtgttaattttattggtaaaattaatatcatttactataatatccttattagttg 30682276  T
Q  118 taggtagtggaatagttaa 136  Q
    ||| |||| || |||||||    
T  30682277 tagttagtagagtagttaa 30682295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19265943 - 19265826
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| | | || |||||||| ||||||||||    ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |    
T  19265943 gtttaaactttctgcacggttattaagaaaatgattaattatatttatttcaataataaaattaatgttatttattaaaataaccttattaattatagtt 19265844  T
Q  123 agtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| |||||||||||    
T  19265843 agtggagtagttaagttg 19265826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 39397479 - 39397382
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| |||||| || |||| ||||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  39397479 gtttaaagtttgtgcacgatgtttaaggaaatgattaattatgttgatttcattggtaaatttaatgtcatttactaaaatccccatattaattgtag 39397382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3689707 - 3689576
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||| || ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  3689707 aataatagtcgtttaaggtttatgtacggttattaaagaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttatt 3689608  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| |||| || | |||||||| ||||    
T  3689607 aattatagttagttgagttgttaagttagatg 3689576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44526448 - 44526393
Alignment:
Q  89 aacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44526448 aacatttattaaaacatccttattaattgtagttagtggaatagtgaagttggatg 44526393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25233297 - 25233195
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||   |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  25233297 ttattaaagaaataattaattgtgttaattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactagtattaattatagttagtgaagtagttaagttgg 25233198  T
Q  142 atg 144  Q
    |||    
T  25233197 atg 25233195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 49579164 - 49579285
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgtt-aatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtagg 121  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||  |  | ||||||||||||  |||||||||||||     
T  49579164 gtttaaagtttgtgcatgatttttaaataaatgattaattgtgttgatttttaatgataaaattattatta-ttactaaaacacttttattaattgtagt 49579262  T
Q  122 tagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    || || ||| |||||||||||||    
T  49579263 tattgaaattgttaagttggatg 49579285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 462085 - 461976
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaat 130  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||| |    
T  462085 tttgtgcataatttttaagaaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaagtaatattatttactaaaatatccttattaattgtaattagcggagt 461986  T
Q  131 agttaagttg 140  Q
    ||||||||||    
T  461985 agttaagttg 461976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 144
Target Start/End: Original strand, 26147635 - 26147722
Alignment:
Q  57 ttaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  26147635 ttaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatg 26147722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35252016 - 35251934
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatta 113  Q
    |||||||| |||| | ||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  35252016 tttgtgcatgattttcaagaaaataattaattgtggttatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaataccattatta 35251934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Original strand, 50263913 - 50263967
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaattt 72  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  50263913 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattcactgtgttgattt 50263967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 53412228 - 53412122
Alignment:
Q  38 acgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaag 137  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| | | || ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |   ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  53412228 acgatttttaagaaaacgattaattttattgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatttttattaattatagtttgtggaatagttaag 53412129  T
Q  138 ttggatg 144  Q
    |||||||    
T  53412128 ttggatg 53412122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Original strand, 41711437 - 41711506
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaa 87  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||    
T  41711437 tagttgtttaaggtttgtgcacaatttttatggaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattaa 41711506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5618677 - 5618582
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgt 118  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||| |  ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  5618677 gtttaatgtttgtgctcgattattaaaaaaatgatgagttgtgttgattttaatggtaaaattaaaattatttattaaaatatccttattaattgt 5618582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 144
Target Start/End: Original strand, 38663480 - 38663554
Alignment:
Q  70 tttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||  | |||||||||||||||    
T  38663480 tttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacttttattaatcgtagttagtaaagtagttaagttggatg 38663554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 38502487 - 38502588
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||| ||||| ||  ||||||||| ||| || || | ||||||||||||    
T  38502487 ttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaatacttttattaattatagttaatgtagtagttaagttgg 38502586  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  38502587 at 38502588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 271
Target Start/End: Original strand, 40123058 - 40123087
Alignment:
Q  242 taaagagacaataattatgagacggatgaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40123058 taaagagacaataattatgagacggatgaa 40123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 47358935 - 47359052
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||| |||   |||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||  |  |||| |||||| ||  |||||||||||||      
T  47358935 gtttaatgtttgtgcatgatgtctaagaaaattattgattgtgttgatttcaatgataaaattagaataattttctaaaatacttttattaattgtagtc 47359034  T
Q  123 agtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| || ||||||||    
T  47359035 agtggagtaattaagttg 47359052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2400854 - 2400798
Alignment:
Q  82 aattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagt 138  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  2400854 aattaacattatttactaaaacaccctcattgattgtagtttgtggagtagttaagt 2400798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3098825 - 3098757
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgta 119  Q
    |||||||||| | | || ||||||||||||||||| | | |||||||||||| | | ||||||||||||    
T  3098825 aaatgattaattatattgatttcaatgataaaattgatatcatttactaaaatatctttattaattgta 3098757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 223
Target Start/End: Original strand, 44536349 - 44536381
Alignment:
Q  191 gctgcattagtattataaagtgacaattatttt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44536349 gctgcattagtattgtaaagtgacaattatttt 44536381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9307772 - 9307641
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  9307772 aatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaactgtgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacacccttgtt 9307673  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9307672 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 9307641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39864251 - 39864125
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||    
T  39864251 tagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaatactcttattaattg 39864152  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39864151 tagttagtggagtagttaagttggatg 39864125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12039227 - 12039096
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  12039227 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaatacactcttatt 12039128  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  12039127 aattgtagttaatggagtatttaagttggatg 12039096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 24991626 - 24991757
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |  |||||||| |||||| |||||    
T  24991626 aatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatagtatttactacaacacctttatt 24991725  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24991726 aattgtagttagtggaatagttaagttggatg 24991757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28749118 - 28749005
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  28749118 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtaattagtagaat 28749019  T
Q  131 agttaagttggatg 144  Q
     |||||||||||||    
T  28749018 tgttaagttggatg 28749005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 23168966 - 23169091
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  23168966 aatattagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatccttatt 23169065  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagt 138  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||    
T  23169066 aattatagttagttaaatagttaagt 23169091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37276584 - 37276475
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37276584 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcgtttactaaaacacccttattaattgtagttagtggaatagtt 37276485  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    || |||||||    
T  37276484 aaattggatg 37276475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31042942 - 31042815
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||  || |||||||||    
T  31042942 aatattagtcatttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactgtaatacccttatt 31042843  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||    
T  31042842 aattgtaggtagtgaagtaattaagttg 31042815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 917164 - 917042
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  917164 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaataaatgattaattatgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 917065  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||| |||| || |||||||||||    
T  917064 tagttagtagattagttaagttg 917042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 6023622 - 6023753
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  6023622 aatattagtcgtttaatgtttgtgcgcgattattacggaaatgtttaattgtgttgatttcaatggtaaatttagtagcttttactaaaatacctttatt 6023721  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  6023722 aattgtagttattggagtagttaagttggatg 6023753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Original strand, 33733241 - 33733347
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  33733241 tagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgatt-attgtgttgatttcaatggtaaaattattaacatttactaaaatacttttattaattg 33733339  T
Q  118 taggtagt 125  Q
    ||| ||||    
T  33733340 tagttagt 33733347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Original strand, 34031509 - 34031620
Alignment:
Q  22 tgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtagg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  34031509 tgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattacttgtgttgattccaatggtaaaattaatatcatttactaaaataccgttattaattgtagt 34031608  T
Q  122 tagtggaatagt 133  Q
    ||||| ||||||    
T  34031609 tagtgtaatagt 34031620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 44707733 - 44707864
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||  |||||    
T  44707733 aatattagtcgtttaaagtttttgcacgattattatagaaatgattaattatattgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaacacatttatt 44707832  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  44707833 aattgtagttagtgaagcagttaagttggatg 44707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Original strand, 40144849 - 40144951
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  40144849 ttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagttaagttgg 40144948  T
Q  142 atg 144  Q
    |||    
T  40144949 atg 40144951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7759338 - 7759233
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7759338 tgcacgattattaaaaaaataattaattgtgttgatttcaatggtgaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggaatagtt 7759239  T
Q  135 aagttg 140  Q
    ||||||    
T  7759238 aagttg 7759233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15699229 - 15699136
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15699229 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 15699136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26093521 - 26093408
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaat 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| | |    
T  26093521 tttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatccttattaattgtagttagtgaagt 26093422  T
Q  131 agttaagttggatg 144  Q
    | ||||||| ||||    
T  26093421 aattaagttagatg 26093408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 49223981 - 49224090
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  49223981 tgcacggttactaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtt 49224080  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  49224081 aagttggatg 49224090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Original strand, 6160451 - 6160559
Alignment:
Q  32 ttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaata 131  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  6160451 ttgtgtacgatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactcttattaattgtagttaatggaata 6160550  T
Q  132 gttaagttg 140  Q
    |||||||||    
T  6160551 gttaagttg 6160559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 42410139 - 42410008
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  42410139 aataatagttgtttaaggttgatgcacggttattaaaaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaagcacccttatt 42410040  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  42410039 aattgtagttagttggatagttaagtaggatg 42410008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 31978630 - 31978752
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||||  |  ||||||||||     
T  31978630 tagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaaagattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcacttactaaactattcttattaatta 31978729  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||| || |||| |||||||||||    
T  31978730 tagttaatggagtagttaagttg 31978752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36702034 - 36701935
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  36702034 ttaaggaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatg 36701935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36718138 - 36718039
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  36718138 ttaaggaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatg 36718039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2572608 - 2572487
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  2572608 tagtcgtttaaagtttgtgtacgattattaaaataatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaatatcatttact-aaatacaattattaattg 2572510  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  2572509 tagttagtggagtagttaagttg 2572487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 144
Target Start/End: Original strand, 14757591 - 14757698
Alignment:
Q  40 gattattaaggaaatga---ttaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  14757591 gattattaaggaaaagagaattaattgtgttgatttcaacgataaaattagtaacatttactaaaacactcttattaattgtagttagtgaagtagttaa 14757690  T
Q  137 gttggatg 144  Q
    ||| ||||    
T  14757691 gttcgatg 14757698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 32970565 - 32970670
Alignment:
Q  38 acgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaag 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||||  |||| |||||    
T  32970565 acgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaatactcgtattaattgttgttagtaaaataattaag 32970664  T
Q  138 ttggat 143  Q
    ||||||    
T  32970665 ttggat 32970670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37506250 - 37506142
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta--acaa-catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaata 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||  || | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  37506250 tgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgataaaattagtactatcatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagta 37506151  T
Q  132 gttaagttg 140  Q
    |||||||||    
T  37506150 gttaagttg 37506142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 44761514 - 44761631
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  44761514 gtttagagtttgtgtatgattaataaaaaaatgattaattatgttaattttaatgataaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattatagtt 44761613  T
Q  123 agtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| |||||||||    
T  44761614 agtggaatggttaagttg 44761631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 52429479 - 52429362
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||| | ||| |||| ||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  52429479 gtttaaggtttgtgcacgattatgaaggaaatgattaatttggttgattacgatggtaaatttaatgtcatttattaaaatacccttattaattgtagtt 52429380  T
Q  123 agtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| |||||||||||    
T  52429379 agtggagtagttaagttg 52429362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11450028 - 11449923
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |||||  |||||    
T  11450028 aataatagttgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatggttaattatgttgatttcaatggtaaaattaata--attttctataacacatttatt 11449931  T
Q  113 aattgtag 120  Q
    ||||||||    
T  11449930 aattgtag 11449923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Original strand, 13579605 - 13579725
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  13579605 tttaaggtttatgcatgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttgatgacaatattaatatcatttacaaaaacacccatattaattgtagtta 13579704  T
Q  124 gtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| || ||||||| ||||    
T  13579705 gtggagtatttaagtttgatg 13579725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 20209813 - 20209944
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||||| |  |||||  |||||||| |||||||||| | |||| ||||  ||  ||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20209813 aataatagtcgtttaaaggtgatgcaccgttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatagtaaaattagtatcatttactaaaacatccttatt 20209912  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20209913 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 20209944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38787486 - 38787355
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| ||||| ||  | ||||| | |||||| |||||||    
T  38787486 aataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttgccaaaacatccttatt 38787387  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  38787386 aattatagttagtggagtagttaaattggatg 38787355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 16395025 - 16395150
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||  | |||||||||||| | |||| |||||||    
T  16395025 tagtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatagtaaaattagtatcatttactaaaata-cctttttaattg 16395123  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  16395124 tagttagtggagtagttaagttagatg 16395150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 30754919 - 30755045
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||| | |  ||||||||||| | | |||||||||     
T  30754919 tagtcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaagggtaaaatttatattatttactaaaatatcattattaatta 30755018  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30755019 tagttagtgaaatagttaagttagatg 30755045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 41121795 - 41121919
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaa---ggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacaccctt 109  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||   |||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  41121795 aataatagttgtttaaggtttatgcacatttattaattaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagcataatttactaaaataccctt 41121894  T
Q  110 attaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41121895 attaattgtagttagtggagtagtt 41121919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22181459 - 22181374
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22181459 tgcacggttattaaggaaatgattagttgagttcatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttagttattgtag 22181374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24881004 - 24880899
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaa 129  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||     
T  24881004 gtttgtgcataattattacggaaatgattgattatgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacttttattaattgtagttagtggag 24880905  T
Q  130 tagtta 135  Q
    ||||||    
T  24880904 tagtta 24880899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45331463 - 45331352
Alignment:
Q  36 gcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta---gtggaatag 132  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| | |||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||    
T  45331463 gcacggttattaagaaaataattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttaatggaggaatag 45331364  T
Q  133 ttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||    
T  45331363 ttaagttggatg 45331352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12151321 - 12151193
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| |   | |||    
T  12151321 aatatttgtcgtttaaggtttgtgtatgattattaaggagattattaattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatattgtaatt 12151222  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  12151221 aattgtagttagtggagcagttaagttgg 12151193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 32825965 - 32826098
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||| |||||    
T  32825965 aataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaa-tgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacctttatt 32826063  T
Q  113 aattgtaggtagt---ggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||    
T  32826064 aattgtaattagtggaggagtagttaagttggatg 32826098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 8896337 - 8896436
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8896337 ttaagaaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatatttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatg 8896436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 144
Target Start/End: Original strand, 22856267 - 22856341
Alignment:
Q  70 tttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  22856267 tttcaatcataaaattaataccatttactaaaataccctaattaattgtagttagtggagtagttaagctggatg 22856341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35367869 - 35367816
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  35367869 catttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatg 35367816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7351732 - 7351652
Alignment:
Q  62 tgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgga 142  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7351732 tgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaataaccttattaattctagttagtggaataattaagttgga 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 4441579 - 4441691
Alignment:
Q  16 attagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaat 115  Q
    |||||||||||||  ||||||||   |||||||| |||| ||||| |||| | |||| |||| |||||||||     ||||||||||||||||| |||||    
T  4441579 attagttgtttaagatttgtgcatctttattaagaaaataattaattgtggtgattttaatggtaaaattaatcgtctttactaaaacacccttgttaat 4441678  T
Q  116 tgtaggtagtgga 128  Q
    ||||| |||||||    
T  4441679 tgtagttagtgga 4441691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10495975 - 10495853
Alignment:
Q  21 ttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||  |||| ||||| | |||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||     
T  10495975 ttgtttaaggtttatgtaagattattaaaaaaattattaattttgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacact-ttattaattgtaa 10495877  T
Q  121 gtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  10495876 ttagtggagtagttaagttggatg 10495853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 6267829 - 6267899
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaa 83  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  6267829 aataatagtcgtttaaggtttgtgcactatttttaaagaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaa 6267899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 21909989 - 21910109
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | | ||| |||||||| ||||||||| | ||| |    
T  21909989 gtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcgtttgctaaaaca-ccttattaactatagtt 21910087  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
     | ||| |||||||||| ||||    
T  21910088 tgaggagtagttaagtttgatg 21910109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29074991 - 29074898
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||||| | ||  | |||||||||||||||||    
T  29074991 aaatgattagttgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttattaaaacatccatattaattgttgttaacgtaatagttaagttggatg 29074898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 35682795 - 35682851
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  35682795 gtttgtgcacgatttttaacgaaaagattaattgtgttgatttcaatgataacatta 35682851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35538756 - 35538681
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  | |  ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35538756 ttaagaaaattattaattgtgttgatttcaatgataaaatggatattatttactaaaatatccttattaattgtag 35538681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9379355 - 9379245
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagt-ggaatagt 133  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||  | |||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  9379355 tgcacaatttttaaagaaatgattaattgtaatgattttaatgataaaattaatatcatttattaaaatatatttattaattgtagttagtgggagtagt 9379256  T
Q  134 taagttggatg 144  Q
    |||||| ||||    
T  9379255 taagtttgatg 9379245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27897083 - 27896969
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaa 129  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||  |  |||||  |||| |  |||||||||| ||| |||||||     
T  27897083 gtttgtgcatgatttttaaggaaataattaaacgtgttgattttaatgataaaattagtataatttatcaaaatattcttattaattatagttagtggag 27896984  T
Q  130 tagttaagttggatg 144  Q
    || || |||||||||    
T  27896983 taatttagttggatg 27896969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Original strand, 43500762 - 43500816
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaattt 72  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43500762 tagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaattattaattgtgttgattt 43500816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 224
Target Start/End: Original strand, 45775455 - 45775485
Alignment:
Q  194 gcattagtattataaagtgacaattattttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45775455 gcattagtattataaagtgacaattattttg 45775485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 7439888 - 7439961
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  7439888 aataatagtcgtttaaggtttttgcacgatttttagaaaaatgattaaccgtgtcaatttcaatggtaaaatta 7439961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Original strand, 25089137 - 25089190
Alignment:
Q  92 atttactaaaacaccctt-attaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  25089137 atttactaaaacatcctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatg 25089190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 224
Target Start/End: Original strand, 43500889 - 43500922
Alignment:
Q  191 gctgcattagtattataaagtgacaattattttg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43500889 gctgcattagtattctaaagtgacaattattttg 43500922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Original strand, 34688857 - 34688945
Alignment:
Q  50 gaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagt 138  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||  | | ||||||||| ||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  34688857 gaaatgattaatttggttgatttaaatgataaaattagtatcgtttactaaaccaggcttattaattttagttagttgaatagttaagt 34688945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Original strand, 34693385 - 34693473
Alignment:
Q  50 gaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagt 138  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||  | | ||||||||| ||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  34693385 gaaatgattaatttggttgatttaaatgataaaattagtatcgtttactaaaccaggcttattaattttagttagttgaatagttaagt 34693473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 35367635 - 35367691
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  35367635 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaatta 35367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19823151 - 19823025
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19823151 tagttgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtagaattagtatcatttactaaaacacccttattaattg 19823052  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19823051 tagttagtggaatagttaagttggatg 19823025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 37695654 - 37695767
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37695654 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagt 37695753  T
Q  131 agttaagttggatg 144  Q
    ||||||||| ||||    
T  37695754 agttaagttagatg 37695767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 43253843 - 43253964
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43253843 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagtt 43253942  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  43253943 agtggagtagttaagtgggatg 43253964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1778787 - 1778657
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  1778787 aatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatgacatttactaaaacatccttatt 1778688  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
     ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  1778687 -attgtagttagtggagtagataagttggatg 1778657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37312095 - 37311972
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||    
T  37312095 aatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaacccttatt 37311996  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
T  37311995 aattgtagttagtggagtagttaa 37311972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 30190635 - 30190761
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30190635 tagtcgtttaaggtttgtgcacggttatgaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaattg 30190734  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30190735 tagttagtggagtagttaagttggatg 30190761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11905957 - 11905836
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  11905957 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 11905858  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    | |||| | |||||||||||||    
T  11905857 aatggagttgttaagttggatg 11905836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 28690760 - 28690883
Alignment:
Q  21 ttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  28690760 ttgtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattgtag 28690859  T
Q  121 gtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
     |||||  ||||||||||||||||    
T  28690860 ttagtgagatagttaagttggatg 28690883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 36460386 - 36460517
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||||    
T  36460386 aatattagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaattattaattgtgttaatttcaatagtaaaattagtaacatttattaaaatattcttatt 36460485  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  36460486 aattgtagttaatggagtaattaagttggatg 36460517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 12736542 - 12736672
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||    
T  12736542 aataatagttgtttaaagtttgtgcacgatttttaaggaaatgattaattgtgttgattctaatgataaaattagtatcatttactacaatacccttatt 12736641  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    |||||||  ||||| | ||||||| ||||||    
T  12736642 aattgtacttagtgtagtagttaatttggat 12736672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 140
Target Start/End: Original strand, 24569092 - 24569197
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24569092 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatattatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagtt 24569191  T
Q  135 aagttg 140  Q
    ||||||    
T  24569192 aagttg 24569197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 37772944 - 37773061
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||      
T  37772944 gtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtattgattacaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattatagtc 37773043  T
Q  123 agtggaatagttaagttg 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37773044 agtggaatagttaagttg 37773061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Original strand, 51837940 - 51838056
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  51837940 tttaaggtttgtgcatgagtattaagtaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattagttgtagcta 51838039  T
Q  124 gtggaatagttaagttg 140  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  51838040 gtggagtagttacgttg 51838056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11632225 - 11632095
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||||| |||||    
T  11632225 aatattagtcatttaagatttgtgcacgattattaaa-aaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattagtagtatttactaaaacacctttatt 11632127  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11632126 aattgtagttagtggaaaagttaagttggatg 11632095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 23004353 - 23004479
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  |  || ||||||||||||||||||    
T  23004353 aatattagtcgtttaaggtttgtt-actattattaaggaaatgattaattgtgtcgatttcaatggtaaaattagtagtatatactaaaacacccttatt 23004451  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23004452 aattgtagttagtggagtagttaagttg 23004479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 8679029 - 8679155
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||     
T  8679029 tagtcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaagatccttattaatta 8679128  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||| | || ||||||||||||    
T  8679129 tagttagtgaattaattaagttggatg 8679155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36476722 - 36476598
Alignment:
Q  20 gttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgta 119  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| ||| | |||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36476722 gttgtttaaggtttgttcacggttattaagaaaataattgattgtgttgattgcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 36476623  T
Q  120 ggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    | |||| || |||||||||| ||||    
T  36476622 gttagtagagtagttaagtttgatg 36476598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38795489 - 38795358
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||  |||  ||||||||    
T  38795489 aataatagtcgtttaatgtttgtgcacgatatttaaggaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtatcatttacccaaatgcccttatt 38795390  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  38795389 aattgtagttggtggagttgttaagttggatg 38795358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3313395 - 3313268
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    |||  ||||||||| ||||||||  |  ||| |||||||||||||||||    
T  3313395 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgatta----tgtcgatttcaatggtaaaattagtagaattaactaaaacacccttatt 3313300  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  3313299 aattgtagttaatggagtatttaagttggatg 3313268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Original strand, 10366622 - 10366715
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaatt 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  10366622 gtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaacactcttattaatt 10366715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27471462 - 27471353
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaat 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  27471462 tttgtgcacgattattaagaaaatgattaattatgttgatttcaatggtgaaattagttgcatttactaaaacactcttattaattataagtagtggagt 27471363  T
Q  131 agttaagttg 140  Q
    ||||||||||    
T  27471362 agttaagttg 27471353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37497615 - 37497506
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||    
T  37497615 tgcacgattattaaggaaatgatttattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacaccgttgttaactgtagttagtggagtagtt 37497516  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  37497515 aagttggatg 37497506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44301697 - 44301576
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||  |    
T  44301697 gtttaaggtttgtgcccgacttttaaggaaatatttaattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatacccttatcaattgtaatt 44301598  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  44301597 agtggagtagttaagttggatg 44301576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34750630 - 34750510
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  34750630 tttaaggtttgtgcacgatttttgatgaaatgattgattgtgttgattttaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttg 34750531  T
Q  124 gtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  34750530 gtggagtagttaacttggatg 34750510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 3901151 - 3901250
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  3901151 ttaagaaaatgattaattgtattaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacattcttattagttgtagttagtggggtacttaagttggatg 3901250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 5322914 - 5323010
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaatt 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  5322914 tagttgtttaaggtttgtgcacgattattaa--aaatgattaattatgttgatttcagtgataaaattaatatcatttactaaaatacacttattaatt 5323010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19612045 - 19611923
Alignment:
Q  21 ttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |  ||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  19612045 ttgtttaaagtttgtgtacgatttttaagaaagtgattaattgtgttgatttcaatgttaaaatt-atataatttactaaaatatccttattaattgttg 19611947  T
Q  121 gtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
     ||||||| |||||||||| ||||    
T  19611946 ttagtggagtagttaagtttgatg 19611923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45710995 - 45710864
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||||| || ||||| |||||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||  |||||    
T  45710995 aataatagtcgtttaaggttgatgcacggttgttaagaaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacttttatt 45710896  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45710895 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 45710864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 29023941 - 29024066
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  29023941 tagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaaaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaaca-tcttattaattg 29024039  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  29024040 tagttagtggagtaattaagttggatg 29024066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14194690 - 14194570
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||  |||| |||||| | |    
T  14194690 gtttaaggtttgtgcacgatttttaaagaaatgatcaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaccatttactaaaatacttttatgaattgt-gtt 14194592  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  14194591 agtggagtaattaagttggatg 14194570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54726608 - 54726499
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||||    
T  54726608 tgcacggttattaagaaaatgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacatctttattaattgtagttaatggagtagtt 54726509  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||| ||||    
T  54726508 aagttagatg 54726499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 33491053 - 33491125
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatt 85  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  33491053 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaatt 33491125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 49830270 - 49830162
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaa-tgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaatt 116  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||    
T  49830270 tagtcgtttaacgtttgtgcacgattattaaaaaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatatcatttactaaaataccattattaatt 49830171  T
Q  117 gtaggtagt 125  Q
    |||| ||||    
T  49830170 gtagttagt 49830162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30711218 - 30711111
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||   ||||||| ||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  30711218 aatattagtattttaaggtttgtgcattgttattaaagaaataattaattatgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaaaacaccattatt 30711119  T
Q  113 aattgtag 120  Q
    ||||||||    
T  30711118 aattgtag 30711111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43719399 - 43719281
Alignment:
Q  25 ttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtag 124  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  43719399 ttaaagtttgtacacgatcattaataaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattat-atcattcactgaaacatccttattaattgtagttag 43719301  T
Q  125 tggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  43719300 tggagtagttaaattggatg 43719281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 48540970 - 48541097
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | ||| |||||| || |||||||||| | |||||| ||||| |  ||||||    
T  48540970 aataatagttgtttaaagtttgtgcacaatgtttaaggaaatgactaattatgtcaatttctataataaaattaatatcatttattaaaatattcttatt 48541069  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||    
T  48541070 aattgtaattagttgagtagttaagttg 48541097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 53560362 - 53560235
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  ||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  53560362 aataatagttgtttaaggttgatgcacgatgattaaggaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaatttgtatcatttactaaaacacccttatt 53560263  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    || | ||| |||| || |||||||||||    
T  53560262 aaatatagttagtagagtagttaagttg 53560235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 31158492 - 31158583
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacac 105  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31158492 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaa-aaaatgattaattgtgctgatttcgatagtaaaattaataacatttactaaaacac 31158583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 49447766 - 49447884
Alignment:
Q  15 tattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaa 114  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |   ||| ||| |  |||||| |||| |||||||||||    
T  49447766 tattagtcgtttaatgtttgtgtacgataattaacgaaatgattaattgtgttgatttcaacg---aaaataatattatttaccaaaatacccttattaa 49447862  T
Q  115 ttgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  49447863 ttgtagttagtagaatagttaa 49447884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17652893 - 17652766
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||  |    ||||||||||| |||||||    
T  17652893 aataatagtcgtttgaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagta----ttactaaaacatccttatt 17652798  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  17652797 aattgtagttagtgaggtagttaagttggatg 17652766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Original strand, 30682068 - 30682165
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgga 142  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |  | |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  30682068 ttaaggaaatgattaattgttttaattttaatgttaaaatgagtatcatttactaaaataatcttattaattgtagttaatggaataattaagttgga 30682165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 52291009 - 52290911
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || ||||  ||| ||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  52291009 ttattaagaaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattagtaccatttattaaaacagccttattaattatagttagtggagtagttaagttg 52290911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 51064788 - 51064861
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  51064788 aatattagtcgtttaaagtttatgcacgaatattaaaaaaatgattaattgtgttgctttcaatggtaaaatta 51064861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42278776 - 42278692
Alignment:
Q  47 aaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaata 131  Q
    |||||||||||||  ||  || ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  42278776 aaggaaatgattagttgaattgatttcaatcgtaaaattaacatcatttactaaaacactcatattaattatagttagtggaata 42278692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 140
Target Start/End: Original strand, 39043773 - 39043854
Alignment:
Q  62 tgtgttaatttcaatgataaaattaacaa---catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39043773 tgtgttgatttcaatggtaaaattaatagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggagtagttaagttg 39043854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 140
Target Start/End: Original strand, 54477466 - 54477556
Alignment:
Q  50 gaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| |   ||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  54477466 gaaatggttaattgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtagttaatggagtagttaagttg 54477556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7757655 - 7757599
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7757655 gtttatgcacgtttgttaaggaaaagattaattgtgttgatttcaatgataaaatta 7757599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 140
Target Start/End: Original strand, 33491408 - 33491456
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  33491408 atttactaaaacactcttattaattatagttagtggagtagttaagttg 33491456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 53560185 - 53560152
Alignment:
Q  191 gctgcattagtattataaagtgacaattattttg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53560185 gctgcattagtattctaaagtgacaattattttg 53560152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 269
Target Start/End: Original strand, 27549479 - 27549507
Alignment:
Q  241 ttaaagagacaataattatgagacggatg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27549479 ttaaagagacaataattatgagacggatg 27549507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 1875564 - 1875685
Alignment:
Q  14 atattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatta 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  1875564 atattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttatta 1875663  T
Q  114 attgtaggtagtggaatagtta 135  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    
T  1875664 attgtagttagtgaaatagtta 1875685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 21216082 - 21216203
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21216082 gtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttactaaaacatccttattaattgtagtt 21216181  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21216182 agtggagtagttaagttggatg 21216203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31082764 - 31082633
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  31082764 aatattagttgtttatggtttgtgcacgataattaaggaaatgattaattgtcttgattttaatgataaaattagtggtatttactaaaacacccttatt 31082665  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31082664 aattatagttagtggagtagttaagttggatg 31082633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39405907 - 39405780
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || | | |||||    
T  39405907 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatctttatt 39405808  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||||  || ||||||| || ||||||||    
T  39405807 aattacagttagtggagtaattaagttg 39405780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 39482760 - 39482635
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  39482760 aatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaagggtaaaattagtagaatttactaaaacacccttatt 39482661  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagt 138  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  39482660 aattatagttagtggactagttaagt 39482635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 144
Target Start/End: Original strand, 44761500 - 44761596
Alignment:
Q  48 aggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44761500 aggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 44761596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 9300092 - 9300211
Alignment:
Q  21 ttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9300092 ttgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattgtttgtgttgattttaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacccttattaattttag 9300191  T
Q  121 gtagtggaatagttaagttg 140  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  9300192 ttagtggagtagttaagttg 9300211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 11976907 - 11977038
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||| |  | |||||||||||| |||||||||    
T  11976907 aatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattatggaaatcattaattgtgttgatttcaatggtataatcagtagcatttactaaaatacccttatt 11977006  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  11977007 aattgtagttagtagagtagttaagttagatg 11977038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 45425637 - 45425764
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  45425637 aatattagtcgtttaagttttatgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattaataacatttattaaaacattcttatt 45425736  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  45425737 aattgtagttagtggagtaattaagttg 45425764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 7703132 - 7703230
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaatt 116  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  7703132 tagtcgtttaaagtttgtgtaagattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaatt 7703230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31271161 - 31271036
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||     
T  31271161 tagtcgtttaaggtttgtgtacgattattaagaaaatgattgattgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatatactaaaatactcttattaatta 31271062  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31271061 tagttagtggagtagttaagttggat 31271036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32476422 - 32476301
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  32476422 gtttaaggtttgtgcacggttattaagaaaatgattgattctgttgatttcaatgataaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgtagtt 32476323  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    | || | |||||||||| ||||    
T  32476322 aatgaagtagttaagtttgatg 32476301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31231853 - 31231745
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||  ||||  ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31231853 tgcacggttattaaggaaatgatgaattgtgtcgattttgatggtaaaattaatatcatttactgaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtt 31231754  T
Q  135 aagttggat 143  Q
    |||||||||    
T  31231753 aagttggat 31231745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Original strand, 42972490 - 42972594
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  42972490 tttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgttttgatttcaatggtaaaattaatatcgtttactaaaatacccttattaattatagtta 42972589  T
Q  124 gtgga 128  Q
    |||||    
T  42972590 gtgga 42972594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 10097962 - 10098093
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||| | |||||||| |||||||||| ||| || ||||  ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  10097962 aataatagtcgtttaaggttgatgcatggttattaagaaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattaatatcatttactataacacccttatt 10098061  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10098062 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 10098093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 51257 - 51132
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |  | ||||||| |||||||  |||||    
T  51257 aataatagttgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttaatg-taaaataagtatcatttacaaaaacacatttatt 51159  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagtt 139  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||    
T  51158 aattgtagttagtggattaattaagtt 51132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7173054 - 7172932
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||||||    
T  7173054 tagttgtttaaggtttgtgtatcattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttactaaaacatatttattaattg 7172955  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||| || || | |||||||||||    
T  7172954 tagttaatgaagtagttaagttg 7172932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 10179923 - 10180045
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| || ||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| || |||||||||||    
T  10179923 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgagtagttgtattgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaatacacttattaattg 10180022  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  10180023 tagttagtggagtagttaagttg 10180045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 40996346 - 40996467
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttc-aatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtagg 121  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40996346 gtttaaggtttatgcacaattgttaaggaaatgattaattgtgttgattttgaatg-taaaattagtttcatttactaaaacacccttattaattgtagt 40996444  T
Q  122 tagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  40996445 tagtgaaatggttaagttggatg 40996467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 34948676 - 34948789
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaat 130  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||  | |||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||| |    
T  34948676 tttgtacacaattattaaggaaatgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattagtatcatttacagaaacacatttattaattgtagttagtggagt 34948775  T
Q  131 agttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||||    
T  34948776 agttaagttggatg 34948789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 36967506 - 36967413
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacc 106  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36967506 aataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacc 36967413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 5053156 - 5053255
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  5053156 ttaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacagtcttattaattgtagttagcggagtagttaaattggatg 5053255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 39300912 - 39301018
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  39300912 aatagtagtcgtttaagatttgtgtacgattattaaagaaatgattaattatgttgatttcgatggtaaaattaatatcatttactaaaaaaccctaatt 39301011  T
Q  113 aattgta 119  Q
    |||||||    
T  39301012 aattgta 39301018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13335351 - 13335230
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||| ||||||||  |||||||||| || |    
T  13335351 gtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatggttaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttagtaaaacacatttattaattgcagtt 13335252  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| || |||||||||| ||||    
T  13335251 agtagagtagttaagtttgatg 13335230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 34393925 - 34394059
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  |  ||||||||||||||| |||||    
T  34393925 aataatagtcgtttaaagttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtataatttactaaaacacctttatt 34394024  T
Q  113 aattgtag----gtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    |||| |||     ||||||| ||||||||||||||    
T  34394025 aattatagttaactagtggagtagttaagttggat 34394059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Original strand, 14854916 - 14855027
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| | | |||||| |||| |||| |||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14854916 tttaaggtttgtacacgattatcaagaaaatgaatcattgtgttgattttaatggtaaaattaattgcatttgctaaaacacctttattaattgtagtta 14855015  T
Q  124 gtggaatagtta 135  Q
    ||||| ||||||    
T  14855016 gtggagtagtta 14855027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 17719229 - 17719360
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  | |||| |||| |||| |||  |  ||||||||||| | |||||||    
T  17719229 aataatagtcgtttaagatttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattgtaatgattttaatggtaaagttagtattatttactaaaatatccttatt 17719328  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17719329 aattatagttagtggagtagttaagttggatg 17719360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 27294030 - 27294161
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||| |||| |||||||||||||  | | |||||||||| |   |||||    
T  27294030 aataatagttggttaaggtttgtgcacgatttttaaagaagttattaattgtgttcatttgaatgataaaattagtatcttttactaaaatatatttatt 27294129  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  27294130 aattgcagttagtggagtaattaagttggatg 27294161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41092122 - 41092032
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41092122 gtttgtgaacgatttttaaagaaacgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatactcttattaattgtag 41092032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1739785 - 1739712
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  1739785 aatattagtcgtctaaggtttgtgtacgattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaatta 1739712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32678470 - 32678417
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32678470 catttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 32678417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 2767262 - 2767377
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||| ||||||| |||||||    
T  2767262 aatagtagttgtttgaggttgatgcacggttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaacatccttatt 2767361  T
Q  113 aattgtaggtagtgga 128  Q
    | |||||| |||||||    
T  2767362 atttgtagttagtgga 2767377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 4428354 - 4428453
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  4428354 ttaagaaaatgattatttgtgttgattttaatgataaaattattatcatttactaaaatacaattattaattgtagttagtgaattagttaagttagatg 4428453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 26626088 - 26626203
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||| |||||||   |  ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26626088 tagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgaatttgatggtaaaatttgtataatttattaaaatatccttattaattg 26626187  T
Q  118 taggtagtggaatagt 133  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  26626188 tagttagtggagtagt 26626203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31331521 - 31331422
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||  |  ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  31331521 ttaaggaaatgattaattgtattgatttcaattataaaattattattatttactaaaatatcattattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatg 31331422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5356739 - 5356614
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||| ||| ||||||| || | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||   | | ||||||||||    
T  5356739 tagtcgttttaaggttgtgcatgactttttaggaaatgattagttgtgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaatgta-ctttattaattg 5356641  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  5356640 tagttaatggaataattaagttggatg 5356614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17824060 - 17823935
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| ||||||| |  ||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||| || ||| ||||||||||    
T  17824060 tagtcgtttaaggtttgtgtattatttttaaggaaaag-ttaatcgtgttgatttcaatgataaaattagtatcttttactagaatacctttattaattg 17823962  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  17823961 tagttagtgaagtagttaagttggatg 17823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 22771816 - 22771937
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||| || ||| ||||  ||| ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22771816 gtttaaggtttatgcacagttattaaggaattgattaattgggttgattttgatggtaaaattagtgtcatttattaaaacacccttattaattgtagtt 22771915  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| | || ||| ||||||||    
T  22771916 agtgaagtaattatgttggatg 22771937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42887104 - 42887015
Alignment:
Q  54 tgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   |||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  42887104 tgattaattgtgttgatttcaatagcaaaattagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggcgtagttaagttggat 42887015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 98
Target Start/End: Original strand, 10953405 - 10953464
Alignment:
Q  39 cgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttact 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  10953405 cgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgatataattaatagcatttact 10953464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 98
Target Start/End: Original strand, 10961410 - 10961469
Alignment:
Q  39 cgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttact 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  10961410 cgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgatataattaatagcatttact 10961469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32678863 - 32678804
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaattt 72  Q
    |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32678863 aataatagtcgtttaaagtttatacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattt 32678804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Original strand, 396611 - 396689
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||  | ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  396611 ttattaaggaaatgattaattatgttgatttcaacggtaaaattagtatcatttactacaatatccttattaattgtag 396689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Original strand, 6796021 - 6796099
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacattta 96  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||| | ||||||    
T  6796021 tagtcgtttaatgtttgtgcacgattattaataaaatgattaacagcgttgattttaatggtaaaattaatatcattta 6796099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Original strand, 29226578 - 29226630
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  29226578 atttattaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatg 29226630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 33765794 - 33765698
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||  ||||||||  | |||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  33765794 tttaaggtttgtgcacaatttttaaggaaatgattaattatgttgattttaatactaaaattactatcatttactaatatacttttattaattgtag 33765698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39329146 - 39329091
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39329146 tttgtgtacaatttttaagaaaatgattaattgtgttaattttaatgataaaatta 39329091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 139
Target Start/End: Original strand, 10953787 - 10953832
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagtt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  10953787 catttactaaaacacccttattaattgt---tagtggagtagttaagtt 10953832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 139
Target Start/End: Original strand, 10961792 - 10961837
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagtt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  10961792 catttactaaaacacccttattaattgt---tagtggagtagttaagtt 10961837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39329423 - 39329370
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatt 85  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39329423 tttgtgcacaatttttaag-aaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaatt 39329370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 9550048 - 9549999
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaat 84  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  9550048 tgcacgataattaatgaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaat 9549999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 136
Target Start/End: Original strand, 29806330 - 29806375
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29806330 catttactaaaacacttttattaactgtagttagtggaatagttaa 29806375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 12559701 - 12559649
Alignment:
Q  50 gaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaa 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  12559701 gaaatgattaattgtgttgattttaataataaaattaataccatttactaaaa 12559649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27870932 - 27870888
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtta 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27870932 catttagtaaaacaaccttattaattgtagttagtagaatagtta 27870888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27976722 - 27976678
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtta 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27976722 catttagtaaaacagccttattaattgtagttagtagaatagtta 27976678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28033991 - 28033947
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtta 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28033991 catttagtaaaacagccttattaattgtagttagtagaatagtta 28033947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39890747 - 39890663
Alignment:
Q  32 ttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaatt 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39890747 ttgtgcgcgatttttaaagaaatgattagttgagttgacttcaataataaaattagtagcatttactaaaacattcttattaatt 39890663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 40028623 - 40028555
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgta 119  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| | | ||||||||||||    
T  40028623 aaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttattaaaatatcattattaattgta 40028555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 11373405 - 11373536
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  11373405 aatattagtcgtttaaggattgtgcacgattattaaggaaatgtttaattgtgttgatttcgatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttatt 11373504  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11373505 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 11373536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7463365 - 7463234
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| |||    
T  7463365 aatattagtcgtttaaggattgtgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttacttaaataccctcatt 7463266  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7463265 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 7463234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28103885 - 28103754
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  28103885 aatatttgtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagcagcatttaccaaaacacccttatt 28103786  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  28103785 aattgtagttagtgaagtggttaagttggatg 28103754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34947652 - 34947521
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  34947652 aataatagtcgtttaaggtttgtgcatgtttattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattattatcatttactaaaacacccttatt 34947553  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34947552 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 34947521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Original strand, 41506054 - 41506173
Alignment:
Q  25 ttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtag 124  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41506054 ttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgtagttag 41506153  T
Q  125 tggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  41506154 tggagtagttaagttggatg 41506173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2459621 - 2459492
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  2459621 aatattagtcgtttaatgtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaatta--gtcatttactacaacacccttatt 2459524  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  2459523 aattgtagttagtggagtagttaagtaggatg 2459492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5524532 - 5524401
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  |||||    
T  5524532 aatatttgtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttaataaaacacttttatt 5524433  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| |||| || |||||||||||||||    
T  5524432 aattatagttagttgagtagttaagttggatg 5524401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26974176 - 26974051
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaa---caacatttactaaaacacccttattaa 114  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||   || |||||||||||| || ||||||||    
T  26974176 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatcatttactaaaatactcttattaa 26974077  T
Q  115 ttgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||    
T  26974076 ttgtagttagtggagtagttaagttg 26974051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 3178186 - 3178312
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3178186 tagttgtttaaggtttgtgcatgattattaagtaaatgattgattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattg 3178285  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3178286 tagttagtggagtagttaagttggatg 3178312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 24516270 - 24516397
Alignment:
Q  17 ttagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaatt 116  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  24516270 ttagtcgtttaaggtttatacacgattattaataaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaaaaaaaccttattaatt 24516369  T
Q  117 gtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24516370 gtagttagtggagtagttaagttggatg 24516397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9786140 - 9786010
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  9786140 aataatagtcgtttaaggtctgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatttcatttactaaaacacgcttatt 9786041  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  9786040 aattgtagttagtgaagtagttaagttggat 9786010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 21350605 - 21350733
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||| ||||| ||     |||||||||||||||||||||    
T  21350605 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaat---taattgtgttgatttcaatggtaaaaatagttgtatttactaaaacacccttatt 21350701  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21350702 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 21350733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21390437 - 21390316
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  21390437 gtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaattttgatggtaaaactaatatcatttactaaaacatccttattgattgtagtt 21390338  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  21390337 agtggagtagttaagttagatg 21390316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30866109 - 30865988
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| || |||||||||| ||  |    
T  30866109 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttaatttcaatggtataattaatatcatttactaaaatactcttattaattataatt 30866010  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  30866009 agtggagtagttaagttagatg 30865988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22738853 - 22738722
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||| |||    
T  22738853 aatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaagaaatgattaattgtgtagatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatcctcatt 22738754  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  22738753 aattgtagttagtagattagttaagttggatg 22738722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Original strand, 7457398 - 7457524
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  7457398 aatattagttatttaatgtttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagttacatttactaaaagacccttatt 7457497  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagtt 139  Q
    || ||||| ||| |||||| |||||||    
T  7457498 aaatgtagttagcggaataattaagtt 7457524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13962100 - 13961980
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | || ||| ||||| | ||||||||| ||||| ||    
T  13962100 tttaaggtttatgcacgtttattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatatcacttaataaaatatccttattaagtgtagtta 13962001  T
Q  124 gtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13962000 gtggagtagttaagttggatg 13961980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 8592417 - 8592548
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||  |  ||||| |||||||||||||||    
T  8592417 aatattagccgtttaaggtttgtgcatgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggttaaattagtagtatttaataaaacacccttatt 8592516  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  8592517 aattgtagttagtggagtagtaaagttagatg 8592548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23670637 - 23670507
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  23670637 aatattaatcgtttaaggtttgtgcacaattattaagggaat-attaattgtgttgatttccatggtaaaattaatagcatttactaaaacactcttatt 23670539  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  23670538 aatggtagttagtggagtagttaagtttgatg 23670507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 28202286 - 28202417
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||  ||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  28202286 aataatagttgtttaaggtttatgcacggttattaagaaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatgtcatttactaaaacatccttatt 28202385  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  28202386 aattgtagttagtggagtagtaaagttggatg 28202417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 21759966 - 21760092
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21759966 tagtcgtttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttaataaaacacccttactaattg 21760065  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||    
T  21760066 tagttaatggagtagttaagttggatg 21760092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43874046 - 43873944
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43874046 ttattaaagaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaaatgtagttagtggagtagttaagttgg 43873947  T
Q  142 atg 144  Q
    |||    
T  43873946 atg 43873944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 16560569 - 16560678
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  16560569 tgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggggtagtt 16560668  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  16560669 aagttggatg 16560678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16605093 - 16604984
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  16605093 tgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggggtagtt 16604994  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  16604993 aagttggatg 16604984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38391890 - 38391769
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  38391890 gtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttgttaattgtagtt 38391791  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  38391790 agtggaataattaagttggatg 38391769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Original strand, 759079 - 759199
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  759079 tttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagtta 759178  T
Q  124 gtggaatagttaagttggatg 144  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  759179 gcggagtagttaagttggatg 759199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 83537 - 83406
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||  ||||||    
T  83537 aataatagtcgtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttatt 83438  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  83437 aattgtagttagcggagtagttaagtttgatg 83406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 19271714 - 19271841
Alignment:
Q  17 ttagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaatt 116  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    |||| ||||||| ||  |||||||||    
T  19271714 ttagtcgtttaatgcttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattgtgttgatttcaatgatcaaattagtggcattgactaaaatacttttattaatt 19271813  T
Q  117 gtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19271814 gtagttagtggagtagttaagttggatg 19271841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 34100524 - 34100655
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||  | |||||||||||| | | |||||    
T  34100524 aatattagttgtttaagatttgtcaacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattagtagcatttactaaaatatctttatt 34100623  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||    
T  34100624 aattgtagttactgaagtagttaagttggatg 34100655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42935813 - 42935698
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42935813 aataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttatt 42935714  T
Q  113 aattgtaggtagtgga 128  Q
    |||||||| |||||||    
T  42935713 aattgtagttagtgga 42935698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 46478270 - 46478401
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||  |||| |||  | |||||||||||| |||||||||    
T  46478270 aatattagtcgtttaaagttcatacacgattattaattaaatgattaattgtgttaattttaatagtaaagttagtagcatttactaaaatacccttatt 46478369  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||    
T  46478370 aattgtagttaattgagtagttaagttggatg 46478401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 32346034 - 32346156
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||     
T  32346034 tagttgtttaaggtttgtgtacggttattaaggaaataattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatctactaaaatactcttattaatta 32346133  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||  ||||||| |||||||||||    
T  32346134 taattagtggagtagttaagttg 32346156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 2850875 - 2850971
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtg 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  2850875 gtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaataccctcattaattatagttagtg 2850971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27921140 - 27921009
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||  |||||||| |||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||  | |||||| |||||||| ||||||    
T  27921140 aataatagttgtttaaggttgatgcacagttattaagaaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtatcatttattaaaacactcttatt 27921041  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  27921040 aattgtagttagtgcattagttaagttggatg 27921009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 17828334 - 17828459
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||  || ||||| |||||    
T  17828334 tagtcgtttaaagtttgtgcacgat-attaaggaaacgattatttttgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttacaaaattactcttatcaattg 17828432  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  17828433 tagttagtggagtaattaagttggatg 17828459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 40076467 - 40076361
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||||    
T  40076467 aataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttaattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactattatt 40076368  T
Q  113 aattgta 119  Q
    |||||||    
T  40076367 aattgta 40076361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 31930479 - 31930607
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| |||    ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31930479 tagtcgtttaaagtttatgcacgattattaaagaaatgattgactgtgttgattttaatggtaaaactaatctaattttttaaaatacccttattaattg 31930578  T
Q  118 taggtagtgga--atagttaagttggatg 144  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  31930579 tagttagtggagtatagttaagtttgatg 31930607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Original strand, 29835391 - 29835495
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  29835391 aatattaatcgtttaaggtttgtgcgcgcttattaaggaaatgattaattatgttgatttaaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttatt 29835490  T
Q  113 aattg 117  Q
    |||||    
T  29835491 aattg 29835495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33819358 - 33819239
Alignment:
Q  21 ttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| ||| |||||||||||| |    
T  33819358 ttgtttaaggttaatgtacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttacaaaatcactcttattaattgttg 33819259  T
Q  121 gtagtggaatagttaagttg 140  Q
     | ||||| |||| ||||||    
T  33819258 tttgtggagtagtgaagttg 33819239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12631446 - 12631345
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||  ||||||||  |  |||||  |||||| ||||||||||||||| ||    
T  12631446 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaataattaattgtattgatttcaatagtaaaattagtagtatttatcaaaacatccttattaattgtagtta 12631347  T
Q  124 gt 125  Q
    ||    
T  12631346 gt 12631345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25571493 - 25571440
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25571493 catttactaaaatacccttattagttgtagttagtggaatagttaagttggatg 25571440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 49101807 - 49101688
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttac---taaaacacccttattaattgtag 120  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| | |||||||   ||||| || | ||||||||||||    
T  49101807 tttaaggtttgtttacgatttttaagaaaatgattaattgtgtttattttaaggataaaattaatatcatttactattaaaatactcatattaattgtag 49101708  T
Q  121 gtagtggaatagttaagttg 140  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  49101707 ttagtggagtagttaagttg 49101688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 46211583 - 46211473
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta--ac-aacatttactaaaacaccctt 109  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||  || | |||||||||||||| ||||    
T  46211583 aataatagtcgtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtactatcatttactaaaacatcctt 46211484  T
Q  110 attaattgtag 120  Q
    |||||||||||    
T  46211483 attaattgtag 46211473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16904531 - 16904401
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||  | || || |||||| || | ||||    
T  16904531 aataatagtcgtttaaggtttgtgcaaaatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattattatcactttctaaaatactcgtatt 16904432  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16904431 aattatagttagtgaaataattaagttggat 16904401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37245834 - 37245711
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattatt---aaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgta 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||| ||| |||||| | |||| ||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37245834 gtttaaggtttgtgcacgattatttataagaaaaagattaattctgttgatttcaatggtaaa-ttagtagcatttactaaaacactcttattaattgta 37245736  T
Q  120 ggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
       |||||| | |||||||||||||    
T  37245735 ataagtggagtggttaagttggatg 37245711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 44180357 - 44180268
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaa 102  Q
    |||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |  |||||||||||    
T  44180357 aataatagtcgtttaaggtttatacacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaa 44180268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 32018700 - 32018819
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    |||||| ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||   | |||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  32018700 tttaaaatttttgtacgatttttaatgaaatgaataattgtgttgatttcaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttattaattgtcgtta 32018799  T
Q  124 gtggaatagttaagttggat 143  Q
    || || || |||||||||||    
T  32018800 gtagagtaattaagttggat 32018819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42796094 - 42796039
Alignment:
Q  79 taaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42796094 taaaattagtaacatttattaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtt 42796039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Original strand, 6494990 - 6495042
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  6494990 atttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatg 6495042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 7930127 - 7930083
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtta 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  7930127 catttactaaaacacccttattaattatagttagtgaaatagtta 7930083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 21937820 - 21937887
Alignment:
Q  69 atttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||| |||||||||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21937820 attttaatgataaaattagtgtcatttactaaagcactcttattaattgtagttagtggagtagttaa 21937887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Original strand, 32018917 - 32019024
Alignment:
Q  38 acgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttc-aatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||  |||||||   | |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| || ||||    
T  32018917 acgatttttaatgaaatgattaattgtgttgattttgaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttattaattgttgttagtggagtaattaa 32019016  T
Q  137 gttggatg 144  Q
    ||||||||    
T  32019017 gttggatg 32019024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39452445 - 39452390
Alignment:
Q  64 tgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgta 119  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39452445 tgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 39452390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 120
Target Start/End: Original strand, 47045467 - 47045537
Alignment:
Q  49 ggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47045467 ggaaatgattaattgagttgatttcaatg-taaaattagtatcatttcctaaaatacccttattaattgtag 47045537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 34635992 - 34635958
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgatt 58  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34635992 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgatt 34635958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44424287 - 44424165
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||   | |||||      |||||||||||    
T  44424287 aataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaatt---atcattt------acacccttatt 44424197  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    || ||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  44424196 aaatgtagttagtggagtaattaagttggatg 44424165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40076294 - 40076261
Alignment:
Q  191 gctgcattagtattataaagtgacaattattttg 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40076294 gctgcattggtattataaagtgacaattattttg 40076261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 138
Target Start/End: Original strand, 30546413 - 30546457
Alignment:
Q  94 ttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagt 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  30546413 ttactaaaacacctttattaattgtagttattggagtagttaagt 30546457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36790809 - 36790761
Alignment:
Q  96 actaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||    
T  36790809 actaaaacacccttattaattgtagttagttgagtagttatgtcggatg 36790761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 8947020 - 8947151
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||    
T  8947020 aatattaatcgtttaaagtttgtgcataattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaatatttactaaaacatccttatt 8947119  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8947120 aattatagttagtggagtagttaagttggatg 8947151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45235726 - 45235595
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45235726 aataatagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttatt 45235627  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  45235626 aattgtagttaatgaaatagttaagtttgatg 45235595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 5789616 - 5789747
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  5789616 aatattagtcatttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgaattcaatagtaaaattagtggcatttactaaaacacccttatt 5789715  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5789716 aattgtagttagtgaaatagttaagttggatg 5789747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39691625 - 39691508
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  39691625 gtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgcagtt 39691526  T
Q  123 agtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  39691525 agtggagtagtaaagttg 39691508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43410560 - 43410444
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  43410560 tttaatgtttgtgcacgattattaaggaaattattaattgtgttgatatcaatgataaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattgtagtta 43410461  T
Q  124 gtggaatagttaagttg 140  Q
     |||| |||||||||||    
T  43410460 atggagtagttaagttg 43410444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 15359055 - 15359186
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15359055 aataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaagaagatgattaattgtgttgattttgatgataaaattaatatcatttactaaaacacccttatt 15359154  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15359155 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 15359186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 31448666 - 31448792
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31448666 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagagtcatttactaaaacacccttactaattg 31448765  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
     || ||||| |||||||||||||||||    
T  31448766 cagttagtgaaatagttaagttggatg 31448792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 43115775 - 43115897
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||| || |||||| ||||    
T  43115775 tagtcgtttaaagtttgtgcgcgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaagttagtagcatttactaaaatactcttatttattg 43115874  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  43115875 tagttagtggagtagttaagttg 43115897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16463834 - 16463703
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16463834 aataatagtcgtttaaggtttatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttatt 16463735  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  16463734 aattgtagttagtggagtagtaaagtttgatg 16463703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37322569 - 37322442
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaa-tgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaatt 116  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37322569 tagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatacccttattaatt 37322470  T
Q  117 gtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  37322469 gtagttagtggagtagttaagttagatg 37322442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 14523345 - 14523471
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  14523345 tagtcgtttaaagtttatgcaaggttattaaggaaatgattttttgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattg 14523444  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  14523445 tagttagtggagtagttaagttagatg 14523471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16806021 - 16805896
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  16806021 tagtagtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattg 16805922  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  16805921 tagttagtggagttgttaagttggat 16805896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16845302 - 16845177
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  16845302 tagtagtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattg 16845203  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  16845202 tagttagtggagttgttaagttggat 16845177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35314033 - 35313901
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttg-tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttat 111  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |  ||||| |||| || ||||||    
T  35314033 aatattagtcgtttaaatattgatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagtatttattaaagcaaccttat 35313934  T
Q  112 taattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  35313933 taattgtagttagtggagtagttaagtttgatg 35313901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 16377624 - 16377747
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||| | |||||||    
T  16377624 aatattaatcgtttaagatttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattacaatggtaaaattaatatcatttaccaaaataaccttatt 16377723  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
T  16377724 aattgtagttagtggagtagttaa 16377747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17695465 - 17695344
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |  |||||||||| ||| |    
T  17695465 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattgatatcatttacaaaaatattcttattaattatagtt 17695366  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  17695365 agtagagtagttaagttggatg 17695344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19937817 - 19937733
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  19937817 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaa 19937733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25637625 - 25637495
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    |||||||||||||||| |||||    
T  25637625 aataatagttgtttaaggtttatgcacgattat-aaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacctttatt 25637527  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  25637526 aattgtagttataggagtagttaagttggatg 25637495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 39329629 - 39329762
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagttt-gtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgt--taatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacaccctt 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  39329629 aatattagtcgtttaacgttttgtgcacgatttctaagaaaatgatcaattgtgtattgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacactctt 39329728  T
Q  110 attaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||    
T  39329729 attaattgtagtta-tggagtagttaaattggatg 39329762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39785733 - 39785599
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta--acaa-catttactaaaacaccctt 109  Q
    |||| |||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  || | ||||||||||||||| |||    
T  39785733 aataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtactatcatttactaaaacactctt 39785634  T
Q  110 attaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  39785633 attaattgtagttaatggagtagttaagttggatg 39785599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34225726 - 34225608
Alignment:
Q  22 tgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||| |||| |||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34225726 tgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgaataattatattgattttaatggtaaacttagtattatttactaaaacacccttattaattgtagt 34225627  T
Q  122 tagtggaatagttaagttg 140  Q
    || |||| || ||||||||    
T  34225626 taatggagtatttaagttg 34225608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36794400 - 36794298
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  | | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36794400 ttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcttttactaaaacgcccttattaactgtagttagtggagtagttaagttgg 36794301  T
Q  142 atg 144  Q
    |||    
T  36794300 atg 36794298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19426564 - 19426470
Alignment:
Q  50 gaaatgattaactgtgttaattt-caatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  19426564 gaaatgattaattgtgttgattttcaatgataaaattagcaacatttactaaaatatcattattaattgtagtaagtcgagtagttaagttggat 19426470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 34120417 - 34120536
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||  |  ||||||||||| |   ||||||||||||| |    
T  34120417 gtttaaagtttatgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtattatttactaaaatat--ttattaattgtagtt 34120514  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34120515 agtggaatagttaagttggatg 34120536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Original strand, 36354422 - 36354542
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||  ||| ||||||||  |  ||||| | |||||| |||||||||||||| ||    
T  36354422 tttaaggtttatgtacgattattaaggaaatgactagttgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttattgaaacactcttattaattgtagtta 36354521  T
Q  124 gtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  36354522 gtggagtagttaagttggatg 36354542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Original strand, 3323254 - 3323337
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacattta 96  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3323254 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattataaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacattta 3323337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Original strand, 26607946 - 26608008
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatt 85  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  26607946 gtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatt 26608008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 7438874 - 7438921
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaa 60  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7438874 aatattagttgtttaaggtttgagcacgattattaaggaaatgattaa 7438921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32783487 - 32783404
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgt 118  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32783487 tgcacggttattaagaaaatgattaattgtgtttattttgatagtaaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattgt 32783404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 18853168 - 18853236
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataa 81  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  18853168 aataatagtcgtttaaaatttgtgcacgatctttaaggaaataattaattgtgttgatttcaatgataa 18853236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 11742497 - 11742627
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |  |||| ||| || ||||  ||| |||| | || |  ||||| |||||||||||||||    
T  11742497 aatattagtcgtttaacgtttatgcacgattattaagaaattttttaattgtattgattttgatggtaaa-tcaatattatttattaaaacacccttatt 11742595  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || |||| |||||||||| ||||    
T  11742596 aattgtagttaatggagtagttaagtttgatg 11742627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Original strand, 32831195 - 32831266
Alignment:
Q  65 gttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||    
T  32831195 gttaattacaatggtaaaattaatatcatttactaaaacatctttattaattgtagttattggagtagttaa 32831266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Original strand, 9458319 - 9458365
Alignment:
Q  98 taaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  9458319 taaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatg 9458365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27866623 - 27866530
Alignment:
Q  26 taaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| | | |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  27866623 taaaggttctgcacgatttttaaggaaatgattaataatgttgattttaatgataaaattaatatc-tttagtaaaatatccttattaattgtag 27866530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 120
Target Start/End: Original strand, 1206709 - 1206778
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||||||| | |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1206709 aaatgattaattatgttgatttcagtggtaaaattagtaacatttactaaaatatccttattaattgtag 1206778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 27501506 - 27501579
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||    
T  27501506 aatattcgtcgtttaaggtttgtgtatgattattaaggaaatgataaattatgttgatttcaatggtaaaatta 27501579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 35242287 - 35242396
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| || |   ||||||||||||| |||| || |||||    
T  35242287 tgcacaatttttaaggagatgtttaattgtgttgattttaatgttaaaattagaatcatttactagaatatatttattaattgtagttagttgagtagtt 35242386  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  35242387 aagttggatg 35242396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 140
Target Start/End: Original strand, 26608178 - 26608238
Alignment:
Q  80 aaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| | |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  26608178 aaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattatagttagtggattagttaagttg 26608238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 43699595 - 43699694
Alignment:
Q  41 attattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  | |||||| ||||| || | |||||||| |   ||||||| || ||||||||    
T  43699595 attattaagaaaatgattaactgtgttgatttcaatagtaaaattagtatcatttattaaaatacacctattaatttt---tagtggagtaattaagttg 43699691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3601451 - 3601416
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacccttattaattgtaggtagtg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3601451 catttactaaaacacccttattaattgtagttagtg 3601416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3601500 - 3601465
Alignment:
Q  22 tgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3601500 tgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgat 3601465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Original strand, 17346346 - 17346459
Alignment:
Q  28 aagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtgg 127  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| | | || |||||||   ||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||||| ||||||    
T  17346346 aagtttgcgtacgattattaaagaaat-attaattattttgatttcaaaagtaaaattaatatcatttattaaaatatttttattaattgtagttagtgg 17346444  T
Q  128 aatagttaagttgga 142  Q
    | |||||||||||||    
T  17346445 agtagttaagttgga 17346459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 3323335 - 3323371
Alignment:
Q  108 ttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3323335 ttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 3323371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Original strand, 26863405 - 26863457
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  26863405 atttattaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagtcggatg 26863457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43730720 - 43730635
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagt 138  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||| || | || |||||||||    
T  43730720 aaatgattaggtgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaa--aaccttattaattgtagttactagagtagttaagt 43730635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13909558 - 13909438
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13909558 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaaatgtgttgatttcaatggtaaaattagtgacatttactaaaatacccttattaattgtagtta 13909459  T
Q  124 gtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| || ||||||| ||||    
T  13909458 gtggagtaattaagttagatg 13909438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 3720210 - 3720337
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||   |  |||||| ||||||| ||||||    
T  3720210 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaatgaaatgattaattgtgttgatttcaattataaaatttgtagtatttacaaaaacactcttatt 3720309  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3720310 aattgtagttagtggaatagttaagttg 3720337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23142812 - 23142688
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  23142812 aatattagttatttaaggtttatccacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaaatagtggcatttactaaaacacccttatt 23142713  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaag 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  23142712 aattgtaggtagtggagtagttaag 23142688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15058262 - 15058131
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||||    
T  15058262 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattaagttaatttcaatggtaaaattagtggcatttactaaaatacccttatt 15058163  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  15058162 aattgtagttagtgaagtatttaagttggatg 15058131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 11655925 - 11656046
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11655925 gtttaaggtttatgcacggttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtagtt 11656024  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  11656025 agtggagtagtaaagttggatg 11656046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29363451 - 29363320
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||  | |||||||||||||| |||||||    
T  29363451 aataatagtcgtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttatt 29363352  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  29363351 aattgtagttagcggattagttaagttggatg 29363320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 31894179 - 31894310
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||| | ||||||  |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  | |||||    
T  31894179 aatattaatcgtttaagatttgtgtatgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacgtcattatt 31894278  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  31894279 aattgtagttagtgaagtagttaagttggatg 31894310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6802047 - 6801945
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6802047 ttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacgcccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgg 6801948  T
Q  142 atg 144  Q
    |||    
T  6801947 atg 6801945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13087650 - 13087544
Alignment:
Q  38 acgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaag 137  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | || |||||    
T  13087650 acgattattaagaaagtgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattatagttagtgaagtaattaag 13087551  T
Q  138 ttggatg 144  Q
    |||||||    
T  13087550 ttggatg 13087544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21010322 - 21010187
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||  |||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  21010322 aataatagttgtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatggaaaaattagtatcatttactaaaacacccttata 21010223  T
Q  113 aattgtag----gtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||     ||||||| |||||||||||||||    
T  21010222 aattgtagttaattagtggagtagttaagttggatg 21010187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 141
Target Start/End: Original strand, 24983444 - 24983546
Alignment:
Q  39 cgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24983444 cgattcttaaggaaatgattagttgagttgatttcaatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagt 24983543  T
Q  139 tgg 141  Q
    |||    
T  24983544 tgg 24983546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1781937 - 1781832
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |||| || |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1781937 gtttaaggtttatgcacgattgttaagaaaatgattaattatgttgatctcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagtt 1781838  T
Q  123 agtgga 128  Q
    ||||||    
T  1781837 agtgga 1781832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 32440614 - 32440745
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| ||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  32440614 aataatagtcgtttaagatttatgcacggttatttaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttactaaaacacccttatt 32440713  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  32440714 aattgtaattagtagagtagttaagttggatg 32440745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 3291737 - 3291867
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||| ||| ||||  |  ||||||||||| ||| |||||    
T  3291737 aataatagtcgtttaaggtttttgcacgattattaaggaaatgattaattgtatcgattttaatggtaatattagtattatttactaaaatacctttatt 3291836  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  3291837 aattgtagttagtgaagtagttaagttggat 3291867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5302474 - 5302365
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  5302474 tgcacggttattaagaaaatgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatataatttaccaaaacatccttattaattgtagttaatggagtagtt 5302375  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  5302374 aagttggatg 5302365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 6834338 - 6834457
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||  ||  | ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  6834338 aataatagttctttaaagtttatgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgattttgatagtcaaattaatatcatttactaaaacacctttatt 6834437  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatag 132  Q
    |||| ||| |||| ||||||    
T  6834438 aattatagttagtagaatag 6834457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Original strand, 1063572 - 1063698
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| || |  ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || || | |    
T  1063572 aatagtagtcgtttaaagtttatgtataatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactctgagt 1063671  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagtt 139  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1063672 aattgtagttagtggagtagttaagtt 1063698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Original strand, 27448135 - 27448231
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgta 119  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27448135 gtttaaggtttttgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgatgaaattagtatcatttactaaaacatcattattaattgta 27448231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 181700 - 181570
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||| | |||||    
T  181700 aatattagtcgtctaaggtttgagcacgattattaaaaaaat-attaattgtattgatttcaatagtaaaattagtagtatttactaaaacatcattatt 181602  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  181601 aattatagttagtggagtagttaagttggatg 181570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7920365 - 7920271
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtg 126  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  7920365 tttgtgcacgatttttaaagaaatgattaattttgttgatttcaatggtaaaattaaaaccatttactaaaata-tcttattaattgtagttagtg 7920271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30717016 - 30716915
Alignment:
Q  42 ttattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    ||||||||||||||||||| | | || | ||  ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  30717016 ttattaaggaaatgattaattttattgactttgatggtaaaattagtatcatttacttaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttgg 30716917  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  30716916 at 30716915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 142
Target Start/End: Original strand, 21804511 - 21804626
Alignment:
Q  26 taaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagt 125  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||    
T  21804511 taaagtttgtgcataatttttaaagaaatgattaattgtattaatttcaattgtaaaattagtatcatttacttaaata-tcttattaattgtagttagt 21804609  T
Q  126 ggaatagttaagttgga 142  Q
    |||| | ||||||||||    
T  21804610 ggaaaaattaagttgga 21804626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17829053 - 17828954
Alignment:
Q  45 ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  17829053 ttaaggaaattattaatagtgttaatttcaacagtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatg 17828954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 110
Target Start/End: Original strand, 27367423 - 27367502
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacaccctta 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27367423 tttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttagttgtaaaattaattgcatttactaaaacaccctta 27367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 110
Target Start/End: Original strand, 27457770 - 27457849
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacaccctta 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27457770 tttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttagttgtaaaattaattgcatttactaaaacaccctta 27457849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Original strand, 11143618 - 11143687
Alignment:
Q  75 atgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  11143618 atgataaaattagtatcatttactaaatcacccttattaattatagttagtgaagtagttaagttggatg 11143687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1225173 - 1225062
Alignment:
Q  32 ttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaata 131  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| |  |    
T  1225173 ttgtgcacgagttttaaagaaatgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattaatattatttactaaaatattcttattaattttagttagtgaagaa 1225074  T
Q  132 gttaagttggat 143  Q
    ||||||||||||    
T  1225073 gttaagttggat 1225062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 34639421 - 34639494
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    ||||||| | |||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  34639421 aatattaatcgtttgaggtttgtacacgattaataaggaaataattaattgtgttaatttcaatggtgaaatta 34639494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Original strand, 34657610 - 34657662
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34657610 atttattaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 34657662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34300084 - 34300009
Alignment:
Q  69 atttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| |||||||||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  34300084 atttgaatgataaaattagtattatttactaaaatatccttattaattgtggttagtgaagtagttaagttggatg 34300009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 1955979 - 1956061
Alignment:
Q  44 attaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtg 126  Q
    |||||| ||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||  | |||||||||| | || |||||||||||||| |||||    
T  1955979 attaagaaaaagattaattgtattgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaatatactcttattaattgtagttagtg 1956061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 10923408 - 10923470
Alignment:
Q  74 aatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  10923408 aatgataaaattaatattatttactaaaataccgttgttaattgtagctagtggaataattaa 10923470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5302320 - 5302287
Alignment:
Q  191 gctgcattagtattataaagtgacaattattttg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5302320 gctgcattagtattctaaagtgacaattattttg 5302287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 135
Target Start/End: Original strand, 8115068 - 8115129
Alignment:
Q  74 aatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtta 135  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  8115068 aatgataaaattagtatcatttactaaaatactcttattaattttagttagtggattagtta 8115129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21010140 - 21010107
Alignment:
Q  191 gctgcattagtattataaagtgacaattattttg 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21010140 gctgcattggtattataaagtgacaattattttg 21010107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22398519 - 22398427
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | |||  ||| |||||||||||||| || || | |||||||||| ||||    
T  22398519 aaatgattaattgtgtagattttaatgataaaattaac-acattcattaagtcactcttattaattgtagttattgaagtagttaagttagatg 22398427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27542930 - 27542810
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  27542930 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaataccatttactaaaatactcttattaattgtagtt 27542831  T
Q  123 agtggaatagttaagttggat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  27542830 agtggagtagttaagttggat 27542810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8698454 - 8698323
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||||||||    
T  8698454 aatatttgttgtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttaccaaaacacccttatt 8698355  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8698354 aattgtagttagtggagtggttaagttggatg 8698323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 40530192 - 40530323
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  40530192 aatatttgtcgtttaaggtctgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttatt 40530291  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  40530292 aattgtagttagtggagtggttaagttggatg 40530323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 6315750 - 6315876
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6315750 tagtcgtttaagggttgtactcgattattaaggaaatgattgattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 6315849  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  6315850 tagttagtgaagtagttaagttggatg 6315876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 8724986 - 8725100
Alignment:
Q  22 tgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8724986 tgtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacacttattaattgtagt 8725085  T
Q  122 tagtggaatagttaa 136  Q
    ||||||| |||||||    
T  8725086 tagtggagtagttaa 8725100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4818696 - 4818581
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  4818696 aatatttgtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtagcatttactaaaacacccttatt 4818597  T
Q  113 aattgtaggtagtgga 128  Q
    |||||||| |||||||    
T  4818596 aattgtagttagtgga 4818581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29570537 - 29570406
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||  |  |||| |||||||||| |||||    
T  29570537 aatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatgttaaaattattagtatttgctaaaacacctttatt 29570438  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29570437 aattgtagttaatggaatagttaagttggatg 29570406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31655198 - 31655083
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| || | |||||||    
T  31655198 aatattagtcgtttaaagtttgtgtacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactataatatccttatt 31655099  T
Q  113 aattgtaggtagtgga 128  Q
    |||||||| |||||||    
T  31655098 aattgtagttagtgga 31655083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 6753632 - 6753757
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6753632 tagtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaatt-tattaatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaattg 6753730  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6753731 tagttagtggagtagttaagttggatg 6753757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 7827904 - 7828025
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  7827904 gtttaaggtttgtacacgattattaagaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaatacccttattaattgtagtt 7828003  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  7828004 agtggagtagttaagttggatg 7828025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27580735 - 27580618
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgatta-ttaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27580735 tttaaggtttctgcacgattaatttaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagtt 27580636  T
Q  123 agtggaatagttaagttg 140  Q
    |||||| |||||||||||    
T  27580635 agtggagtagttaagttg 27580618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Original strand, 30512666 - 30512785
Alignment:
Q  26 taaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaa-ttgtaggtag 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || ||||||||  ||||| |||    
T  30512666 taaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaacatcatttactaagatactcttattaacatgtagttag 30512765  T
Q  125 tggaatagttaagttggatg 144  Q
    || |||||||||||||||||    
T  30512766 tgaaatagttaagttggatg 30512785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Original strand, 30553006 - 30553125
Alignment:
Q  26 taaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaa-ttgtaggtag 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || ||||||||  ||||| |||    
T  30553006 taaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaacatcatttactaagatactcttattaacatgtagttag 30553105  T
Q  125 tggaatagttaagttggatg 144  Q
    || |||||||||||||||||    
T  30553106 tgaaatagttaagttggatg 30553125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 1248577 - 1248699
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1248577 tagtcgtttaagatttgtgcacggttattaaggaaattattaattatgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 1248676  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||| ||||| | |||||||||||    
T  1248677 tagttagtgaagtagttaagttg 1248699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32440286 - 32440180
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  32440286 aataatagtcgttaaaggtttgtgcatgatttttaaagaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttatt 32440187  T
Q  113 aattgta 119  Q
    |||||||    
T  32440186 aattgta 32440180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9515891 - 9515782
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  9515891 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagataatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttatt 9515792  T
Q  113 aattgtaggt 122  Q
    ||| ||||||    
T  9515791 aatagtaggt 9515782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40900052 - 40899932
Alignment:
Q  24 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggta 123  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40900052 tttaaggtttatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggcaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagtta 40899953  T
Q  124 gtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  40899952 gtggagtagttaagttagatg 40899932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 15818450 - 15818581
Alignment:
Q  15 tattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta--acaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||  |  | ||||||||||||||| |||||    
T  15818450 tattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgtttaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatatttactaaaacacctttatt 15818549  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  15818550 aattgtaatcagtggagtagttaaattggatg 15818581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29374487 - 29374364
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| |||| |  | | |||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||    
T  29374487 aatattagtcgtttaaggtttatttaaggttattaagaaaatgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaagacctttatt 29374388  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
T  29374387 aattgtagttagtggagtagttaa 29374364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21060775 - 21060645
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||  |  ||||||||||| || ||||||    
T  21060775 aataatagtcgtttaaggtttatgcacggttattagggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaattagtattatttactaaaatactcttatt 21060676  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggat 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21060675 aattgtagttagtggagtagttaagttggat 21060645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 6615866 - 6615979
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaat 130  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  6615866 tttgtgcacgattattaaataaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttaccaaaacatccttattaattttagttagtggagt 6615965  T
Q  131 agttaagttggatg 144  Q
     |||||||||||||    
T  6615966 ggttaagttggatg 6615979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19930069 - 19929960
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19930069 tgcacgattattaagaaaatgattaattttgttgattttgatggtaaaactagcgtcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtgaaatagtt 19929970  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  19929969 aagttggatg 19929960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 22848352 - 22848483
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| | |||| || |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  22848352 aatattagtcgtttaaggcttgtacaagattattaaggaagcgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatagtatttattaaaacacccttatt 22848451  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| || |||| ||||||  |||||||    
T  22848452 aattgtagttaatggagtagttagattggatg 22848483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41496225 - 41496094
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    |||||| ||||||| | |||||    
T  41496225 aatattagtcgattaaggtttgtacacgattattaaaaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttagtaaaacatcattatt 41496126  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  41496125 aattgtagttagtggagtagttaaattggatg 41496094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6754156 - 6754043
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaa 129  Q
    |||| ||||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  6754156 gtttatgcactattaataagaaaatgattaatt-tgttgatttcaatagtaaaattaatgtcatttactaaaacactcttattaattgtagttagtggag 6754058  T
Q  130 tagttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||||    
T  6754057 tagttaagttggatg 6754043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29856172 - 29856065
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || || ||| ||||||||||||||||||| | || || |||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  29856172 tttgtgcacgattattaaggaaataa--aattgcgttgatttcaatgataaaattaatatcacttgctaaaatactcttattaattgtagttagtggagt 29856075  T
Q  131 agttaagttg 140  Q
    ||||||||||    
T  29856074 agttaagttg 29856065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 2232046 - 2232168
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattg 117  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||| ||||| || ||||||||||     
T  2232046 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgaataattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttattaaaaaactcttattaatt- 2232144  T
Q  118 taggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
        ||||||| |||||||||||||||    
T  2232145 ---ttagtggagtagttaagttggatg 2232168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 42803598 - 42803719
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  42803598 gtttaaggtttatgcacgattatcaaagaaataattaattgtgttcatttcaattgtaaaattagtagtatttactaaaacaccattattaattgtagtt 42803697  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    | |||| | |||||||||||||    
T  42803698 aatggagtggttaagttggatg 42803719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 843574 - 843509
Alignment:
Q  21 ttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  843574 ttgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattttgttgatttcaatgataaaatta 843509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 15439305 - 15439393
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgta 119  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  15439305 tttgtgcacgatatttaaggaaatgattaattgtattaatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacttttattaattgta 15439393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Original strand, 38508155 - 38508273
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | || | | ||||| || ||||||    
T  38508155 aataatagtcgtttaagatttgtgctcgatttttaagaaaatgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattagtatcactcattaaaatactcttatt 38508254  T
Q  113 aattgtaggtagtggaata 131  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  38508255 aattgtagttagcggaata 38508273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 144
Target Start/End: Original strand, 41062161 - 41062259
Alignment:
Q  46 taaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| |||| ||||| | |||| ||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  41062161 taagaaaataattaattatgttgattttgatgataaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtagaataattaagctggatg 41062259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11904346 - 11904227
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacaccctta-ttaatt 116  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||| ||| || | |||||| |||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||    
T  11904346 tagtcgtttaatgtttgtgcacgatctttaagaaagtgattaattgtattgagttcaataataaaattaatatcatttactaaaatactcttatttaatt 11904247  T
Q  117 gtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||| | ||||| |||||||    
T  11904246 gtagttggtggagtagttaa 11904227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4441128 - 4441035
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  4441128 aaataattaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatatttttattaattgtagttagtggagtagttaaattggatg 4441035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41492447 - 41492316
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaaca-cccttat 111  Q
    |||| |||| || ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||| |    
T  41492447 aataatagtcgtctaaggtttgtgcgcgatttttaagaaaatgattaattgtgcttatttcaatggtaaaattagtgacatttactaaaatatcccttgt 41492348  T
Q  112 taattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  41492347 taaatgtagttaatgg-atagttaagttagatg 41492316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 11796135 - 11796266
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| |||| |||||| ||||| |||| ||  | ||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |   |||||    
T  11796135 aataatagtggtttaaggtttgcgcacaatgttaaagaaaatggttaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatattattatt 11796234  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  11796235 aattgtagttagtgtagtagttaagttagatg 11796266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Original strand, 38161440 - 38161511
Alignment:
Q  73 caatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    ||||| ||||||| | | |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38161440 caatggtaaaattcatatcatttactaaaatatccttattaatcgtagttagtggagtagttaagttggatg 38161511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 37184065 - 37184154
Alignment:
Q  31 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtag 120  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | | ||||| |||||||    
T  37184065 tttgtgcaagatttttaaaaaaatgattaattgagttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattcattgtag 37184154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5731893 - 5731803
Alignment:
Q  41 attattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaata 131  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||    | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  5731893 attattaagaaaatgattaattgtgttcattttaataacaaaatgtgtatcatttactaaaacatccttattaatcgtagttagtgaaata 5731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18841586 - 18841496
Alignment:
Q  51 aaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaagttgg 141  Q
    |||||||||| | | || |||| |||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  18841586 aaatgattaattatattgatttaaatggtaaaattaatatcatttaataaaataccgttattaattgtagttagtgaaataattaaattgg 18841496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 5282487 - 5282398
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaa 102  Q
    |||| ||||||||||| |||| || ||  || ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |  |||||||||||    
T  5282487 aataatagttgtttaaggtttctgtacagtttttaagaaaatgattaattgtgctaattttaatgataaaataaatataatttactaaaa 5282398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3076717 - 3076662
Alignment:
Q  30 gtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3076717 gtttgtgcacaatt-ttaacaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaatta 3076662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 33989 - 34120
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  33989 aatattagtcatttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgaattcaatagtaaaattagtggcatttactaaaacacccttatt 34088  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34089 aattgtagttagtgaaatagttaagttggatg 34120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2148 - 2055
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtgga 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2148 tgcacgattattaaggaagtgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtgga 2055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16243 - 16136
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16243 aatattagtagtttaagatttgttcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatagcatttactaaaacacacttatt 16144  T
Q  113 aattgtag 120  Q
    ||||||||    
T  16143 aattgtag 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 50349 - 50222
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || | | |||||    
T  50349 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatctttatt 50250  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttg 140  Q
    ||||  || ||||||| || ||||||||    
T  50249 aattacagttagtggagtaattaagttg 50222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5525 - 5404
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggt 122  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  5525 gtttaaggtttgtacatgattattaagaaaatgattaactgtgttgaattcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattttagtt 5426  T
Q  123 agtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  5425 agtggagtagttaagttggatg 5404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 105807 - 105702
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  105807 tgcatgattattaagtaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattaatagcgtttactaaaacacccttattaattgtagttagtgaagtagtt 105708  T
Q  135 aagttg 140  Q
    ||||||    
T  105707 aagttg 105702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 136007 - 136138
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  136007 aatattagtcgtttaagatttatgcacgattattaaataaatgattaataatgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacccttatt 136106  T
Q  113 aattgtaggtagtggaatagttaagttggatg 144  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  136107 aattatagttagtgaagtagttaagtttgatg 136138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17180 - 17077
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||| || ||||||||||||    
T  17180 aatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttattagaacacccttatt 17081  T
Q  113 aatt 116  Q
    ||||    
T  17080 aatt 17077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 7973 - 8082
Alignment:
Q  35 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagtt 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  7973 tgcacggttattaaggaaatgattaattttgttgatttggatggtaaaattaatattatttaccaaaacacccttattaattgtagttagtggagtaatt 8072  T
Q  135 aagttggatg 144  Q
    ||||||||||    
T  8073 aagttggatg 8082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39223 - 39127
Alignment:
Q  23 gtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgta 119  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39223 gtttaaggtttttgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgatgaaattagtatcatttactaaaacatcattattaattgta 39127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1391 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1391
Description:

Target: scaffold1391; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 1787 - 1890
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttatt 112  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||  ||  | ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  1787 aataatagttctttaaagtttatgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgattttgatagtcaaattaatatcatttactaaaacacctttatt 1886  T
Q  113 aatt 116  Q
    ||||    
T  1887 aatt 1890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 6876 - 6793
Alignment:
Q  19 agttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  6876 agttgtttaaggtttgtgcgtgatttttaaggaaatgattaattgttttaatttcaatgataaaattagtattatttactaaaa 6793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1825 - 1719
Alignment:
Q  37 cacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaatagttaa 136  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||    
T  1825 cacggttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacttaaacacccgtattaattgtagtcagtggagtagttaa 1726  T
Q  137 gttggat 143  Q
    |||||||    
T  1725 gttggat 1719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 697 - 769
Alignment:
Q  56 attaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtgga 128  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  697 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacctttattgattgtagttagtgga 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 6260 - 6328
Alignment:
Q  18 tagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaatta 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  6260 tagtcgtttaaagtttgtgcacgatttttaacgaaatgattaattgtgttgattctaatgataaaatta 6328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Original strand, 20342 - 20454
Alignment:
Q  32 ttgtgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttaatttcaatgataaaattaacaacatttactaaaacacccttattaattgtaggtagtggaata 131  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  20342 ttgtgcaagattattaattaaatgattaattgtgttgattttgattgtaaaattagtatcatttagtaaaatacccttattaattgcagttagtgaagta 20441  T
Q  132 gttaagttggatg 144  Q
    |||||||||||||    
T  20442 gttaagttggatg 20454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Original strand, 84383 - 84424
Alignment:
Q  13 aatattagttgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaat 54  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  84383 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagcaaat 84424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University