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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14493_high_1 (Length: 929)

Name: NF14493_high_1
Description: NF14493
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14493_high_1
NF14493_high_1
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-918)||(54013965-54014882)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 874; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 874; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 918
Target Start/End: Original strand, 54013965 - 54014882
Alignment:
Q  1 ccatagcccttcattgaagccccaaagataggtattccaatcactgccatcaaaattagatgttccaaaaatgttgcatttccagctgcaccaatacaaa 100  Q
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T  54013965 ccatatcccatcattgaagccccaaagataggtattccaatcactgccatcaaaattagatgttccaaaaatgttgcatttccagctgcaccaatacaaa 54014064  T
Q  101 gtcatgcttaatcaccaatacaatatttacatgtagtttggaaggagtatagaataggttccaatataggataggtcctattctaatatagggtcggtca 200  Q
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T  54014065 gtcatgcttaatcaccaatacaatatttacatgtagtttggaaggagtatagaataggttccaatataggatcggtcctattctaatatagggtcggtca 54014164  T
Q  201 aaaaattacacgtgtattcaatcacatctaaccatataatcagatagatatttatgtacatattttaacaataaatttaagaaaacgatatcattgtgta 300  Q
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T  54014165 aaaaattacacgtgtattcaatcacatctaaccatataatcatatagatatttatgaacatattttaacaataaatttaagaaaacgatatcattgtgta 54014264  T
Q  301 atttaattagatgcgtgtgtaaaaatgtttactctgattaattgatcgtgtggataaagtaaatagtaaacacatggaggtatcatggttcatgaaccgg 400  Q
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T  54014265 atttaattagatgcgtgtgtaaaaatgtttactctgattaattgatcgtgtggataaagtaaatagtaaacacatggaggtatcatggttcatgaaccgg 54014364  T
Q  401 aataaatatgcaactggtcttcctctatggctgtataaatagacagtttccaaaaacataatccatgtgataaggcttaaaaagttaaattgaagatctg 500  Q
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T  54014365 aataaatatgtaactggtcttcctttatggctttataaatagacagtttccaaaaacataatccatgtgataaggcttaaaaagttaaattgaagatctg 54014464  T
Q  501 agaatctcaccggttaaaggcgttggtaccggagatgaatgatgaagagagtgatagtttttgaaaagataatctccatgaaatttcttatgtacccaat 600  Q
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T  54014465 agaatctcaccggttaaaggcgttggtaccggagatgaatgatgaagagagtgatagtttttgaaaagataatctccatgaaatttcttatgtacccaat 54014564  T
Q  601 aataaagtggctctgaaactcccacatgtagaatcatggcaacaataataccttttatattccatagaggaagatgctgaagaaatgggaaaatatagga 700  Q
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T  54014565 aataaagtggctctgaaactcccacatgtagaatcatagcaacaataataccttttacattccatagaggaagatgctgaagaaatgggaaaatatagga 54014664  T
Q  701 aactaaggtagcaacgagtgtttgaagaatcaagaaattgtccctgtttcaaaaaattatgatataaatcaataatcaacaaataattttcagcatatat 800  Q
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T  54014665 aactaaggtagcaacaagtgtttgaagaatcaagaaattgtccctgtttcaaaaaattatgatataaatcaataatcaacaaataattttcagcatatat 54014764  T
Q  801 aatatactttgttaaatgataaaatgttgaattaccagtcccattctttgtcaatctgcttgaaatcaacaccttgttgaagaatccttcgatttctagt 900  Q
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T  54014765 aatatactttgttaaatgataaaatgttgaattaccagtcccattctttgtcaatctgcttgaaatcaacaccttgttgaagaatccttcgatttctagt 54014864  T
Q  901 aagaaaaagcatgttact 918  Q
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T  54014865 aagaaaaagcatgttact 54014882  T

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