View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14514_low_1 (Length: 613)

Name: NF14514_low_1
Description: NF14514
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14514_low_1
NF14514_low_1
[»] chr5 (116 HSPs)
chr5 (222-613)||(25921600-25921993)
chr5 (223-613)||(2174680-2175071)
chr5 (256-613)||(38881878-38882258)
chr5 (231-613)||(4236378-4236781)
chr5 (326-613)||(16776021-16776310)
chr5 (256-613)||(2818462-2818813)
chr5 (346-611)||(21947911-21948176)
chr5 (223-613)||(31466105-31466496)
chr5 (223-612)||(36402456-36402845)
chr5 (304-613)||(6756336-6756646)
chr5 (256-596)||(12556067-12556408)
chr5 (378-613)||(31542651-31542888)
chr5 (378-613)||(31544996-31545233)
chr5 (326-613)||(21684578-21684876)
chr5 (223-432)||(39797849-39798058)
chr5 (378-613)||(31179497-31179734)
chr5 (405-613)||(39854427-39854635)
chr5 (405-613)||(10529226-10529435)
chr5 (405-613)||(18468950-18469163)
chr5 (330-538)||(20507665-20507873)
chr5 (406-609)||(20042994-20043198)
chr5 (406-613)||(20044954-20045162)
chr5 (405-613)||(26097676-26097884)
chr5 (406-596)||(17072827-17073018)
chr5 (406-596)||(25904047-25904238)
chr5 (407-613)||(18466625-18466836)
chr5 (405-613)||(40221465-40221674)
chr5 (405-613)||(6747247-6747457)
chr5 (408-613)||(18509445-18509652)
chr5 (408-609)||(18511343-18511547)
chr5 (406-613)||(1189736-1189949)
chr5 (405-613)||(27910388-27910602)
chr5 (405-613)||(27912473-27912688)
chr5 (406-613)||(31472740-31472948)
chr5 (405-613)||(18596590-18596797)
chr5 (409-613)||(10474450-10474655)
chr5 (446-613)||(34477180-34477349)
chr5 (446-613)||(6745053-6745220)
chr5 (406-613)||(34530793-34531001)
chr5 (446-613)||(34479545-34479714)
chr5 (446-613)||(15552229-15552398)
chr5 (446-613)||(16092327-16092495)
chr5 (446-613)||(25804009-25804177)
chr5 (405-588)||(37705932-37706116)
chr5 (406-613)||(39398120-39398327)
chr5 (405-588)||(26098403-26098587)
chr5 (406-613)||(24126800-24127008)
chr5 (223-397)||(34479799-34479972)
chr5 (406-613)||(695833-696029)
chr5 (414-613)||(2954368-2954569)
chr5 (413-613)||(17818617-17818817)
chr5 (413-609)||(21288715-21288917)
chr5 (484-613)||(658480-658610)
chr5 (223-340)||(34477515-34477632)
chr5 (405-502)||(4410000-4410101)
chr5 (411-595)||(6661331-6661512)
chr5 (256-359)||(659746-659848)
chr5 (223-340)||(31544798-31544915)
chr5 (529-613)||(4410090-4410175)
chr5 (223-340)||(31542442-31542559)
chr5 (223-388)||(38960440-38960604)
chr5 (405-613)||(10586782-10586984)
chr5 (223-340)||(10749505-10749622)
chr5 (405-501)||(41585946-41586042)
chr5 (223-340)||(10756960-10757077)
chr5 (223-340)||(15354948-15355065)
chr5 (223-340)||(15357224-15357341)
chr5 (406-478)||(36208524-36208597)
chr5 (449-586)||(20053834-20053968)
chr5 (378-449)||(23665054-23665125)
chr5 (378-449)||(23793462-23793533)
chr5 (405-450)||(3373332-3373377)
chr5 (221-321)||(18186489-18186589)
chr5 (378-446)||(15354777-15354845)
chr5 (378-446)||(15357053-15357121)
chr5 (256-334)||(16775930-16776008)
chr5 (378-449)||(23667329-23667400)
chr5 (378-449)||(38960334-38960405)
chr5 (222-340)||(23664833-23664951)
chr5 (222-340)||(23793636-23793754)
chr5 (524-596)||(2723964-2724037)
chr5 (378-443)||(10757180-10757245)
chr5 (541-613)||(20505968-20506041)
chr5 (223-340)||(23667109-23667226)
chr5 (529-613)||(41585871-41585956)
chr5 (405-449)||(23742057-23742101)
chr5 (280-340)||(31179837-31179897)
chr5 (378-434)||(34477379-34477435)
chr5 (538-613)||(39798123-39798199)
chr5 (379-613)||(42770690-42770918)
chr5 (381-434)||(29748260-29748313)
chr5 (223-287)||(21684905-21684969)
chr5 (336-388)||(31542576-31542628)
chr5 (378-434)||(34479740-34479796)
chr5 (278-339)||(659869-659929)
chr5 (379-442)||(10749704-10749767)
chr5 (256-322)||(21947803-21947869)
chr5 (558-609)||(35385583-35385634)
chr5 (558-606)||(1170811-1170859)
chr5 (380-434)||(2144899-2144954)
chr5 (406-456)||(2723911-2723961)
chr5 (462-585)||(17413323-17413441)
chr5 (326-388)||(31179769-31179830)
chr5 (557-613)||(10749796-10749853)
chr5 (481-510)||(13295760-13295789)
chr5 (557-613)||(15354700-15354757)
chr5 (557-613)||(15356976-15357033)
chr5 (405-434)||(15552178-15552207)
chr5 (557-613)||(23665140-23665197)
chr5 (557-613)||(23793390-23793447)
chr5 (561-606)||(25452498-25452543)
chr5 (405-434)||(25803959-25803988)
chr5 (561-606)||(28786407-28786452)
chr5 (558-606)||(2298135-2298183)
chr5 (566-606)||(25445504-25445544)
chr5 (223-271)||(31179885-31179933)
[»] chr4 (125 HSPs)
chr4 (223-613)||(11434769-11435161)
chr4 (223-613)||(7941133-7941529)
chr4 (225-613)||(51015042-51015452)
chr4 (256-613)||(22800989-22801346)
chr4 (223-613)||(5637592-5638006)
chr4 (337-613)||(48486248-48486525)
chr4 (326-613)||(22802861-22803148)
chr4 (231-613)||(37089498-37089906)
chr4 (326-613)||(38409117-38409411)
chr4 (231-613)||(24888598-24889002)
chr4 (326-613)||(5198338-5198626)
chr4 (326-613)||(22044517-22044804)
chr4 (328-613)||(47274647-47274932)
chr4 (326-613)||(22046812-22047099)
chr4 (326-613)||(36919711-36920002)
chr4 (328-613)||(24880371-24880657)
chr4 (328-613)||(24878909-24879195)
chr4 (223-613)||(9174272-9174684)
chr4 (326-613)||(31849725-31850014)
chr4 (354-613)||(9148198-9148459)
chr4 (223-613)||(3824697-3825112)
chr4 (336-613)||(40091542-40091820)
chr4 (329-613)||(36921620-36921907)
chr4 (223-613)||(11006363-11006781)
chr4 (328-613)||(619574-619860)
chr4 (405-613)||(44599964-44600174)
chr4 (378-613)||(16934269-16934506)
chr4 (378-613)||(18847123-18847360)
chr4 (405-613)||(8631546-8631759)
chr4 (328-588)||(52942598-52942860)
chr4 (405-613)||(2484999-2485209)
chr4 (378-613)||(9176600-9176837)
chr4 (378-613)||(16931915-16932152)
chr4 (405-613)||(40637071-40637280)
chr4 (405-613)||(24348211-24348424)
chr4 (405-613)||(6764836-6765050)
chr4 (405-613)||(47868398-47868607)
chr4 (378-613)||(11008692-11008933)
chr4 (405-613)||(14633317-14633524)
chr4 (405-609)||(14787562-14787769)
chr4 (406-613)||(38928304-38928513)
chr4 (360-613)||(36378244-36378498)
chr4 (405-613)||(22132518-22132735)
chr4 (405-613)||(16453306-16453515)
chr4 (446-613)||(22782864-22783033)
chr4 (406-613)||(12395972-12396180)
chr4 (446-613)||(22780499-22780668)
chr4 (406-613)||(12400934-12401142)
chr4 (446-613)||(18709290-18709458)
chr4 (406-596)||(19095880-19096072)
chr4 (407-613)||(37313193-37313400)
chr4 (407-613)||(56030443-56030650)
chr4 (405-613)||(17662372-17662574)
chr4 (328-582)||(8756411-8756663)
chr4 (407-613)||(33415615-33415821)
chr4 (405-613)||(47210879-47211082)
chr4 (406-613)||(3937336-3937543)
chr4 (405-613)||(53405124-53405335)
chr4 (446-613)||(22134743-22134909)
chr4 (406-613)||(6132871-6133078)
chr4 (410-593)||(41997494-41997678)
chr4 (407-613)||(13543953-13544165)
chr4 (474-613)||(26086103-26086243)
chr4 (412-613)||(19322701-19322899)
chr4 (406-564)||(38270162-38270321)
chr4 (406-613)||(18409474-18409681)
chr4 (405-544)||(5100994-5101133)
chr4 (406-564)||(24446760-24446914)
chr4 (406-525)||(2891314-2891434)
chr4 (406-613)||(18537602-18537806)
chr4 (223-340)||(9176918-9177035)
chr4 (484-613)||(36380425-36380555)
chr4 (223-340)||(16932243-16932360)
chr4 (221-340)||(16934597-16934716)
chr4 (406-613)||(18534960-18535164)
chr4 (355-527)||(15032752-15032923)
chr4 (221-340)||(22783200-22783319)
chr4 (223-340)||(22780835-22780952)
chr4 (491-588)||(27499128-27499226)
chr4 (521-613)||(16455354-16455447)
chr4 (256-334)||(22044817-22044897)
chr4 (355-478)||(25357583-25357713)
chr4 (223-334)||(36920015-36920125)
chr4 (220-334)||(36921923-36922036)
chr4 (225-333)||(22803162-22803270)
chr4 (223-334)||(38408993-38409104)
chr4 (326-401)||(11008932-11009007)
chr4 (407-613)||(28453686-28453888)
chr4 (488-613)||(38890353-38890476)
chr4 (405-478)||(16186099-16186173)
chr4 (326-388)||(18847049-18847111)
chr4 (350-613)||(40999078-40999338)
chr4 (223-332)||(18846923-18847034)
chr4 (406-478)||(12102088-12102162)
chr4 (256-306)||(22048492-22048542)
chr4 (552-613)||(2891436-2891497)
chr4 (336-401)||(9176836-9176901)
chr4 (412-613)||(9863712-9863912)
chr4 (280-340)||(11009014-11009075)
chr4 (260-328)||(31850033-31850101)
chr4 (405-477)||(16455284-16455356)
chr4 (256-322)||(48486146-48486212)
chr4 (555-613)||(13547302-13547360)
chr4 (380-434)||(52043737-52043791)
chr4 (256-340)||(9148087-9148171)
chr4 (378-435)||(22780687-22780744)
chr4 (378-435)||(22783052-22783109)
chr4 (561-609)||(4556190-4556238)
chr4 (354-434)||(4569899-4569978)
chr4 (558-606)||(7050391-7050439)
chr4 (558-606)||(11853549-11853597)
chr4 (558-613)||(16185963-16186018)
chr4 (405-435)||(22134936-22134966)
chr4 (544-585)||(47151050-47151092)
chr4 (561-606)||(4558314-4558359)
chr4 (561-606)||(8529270-8529315)
chr4 (561-606)||(15316961-15317006)
chr4 (561-606)||(15831144-15831189)
chr4 (561-606)||(16689074-16689119)
chr4 (561-606)||(18586969-18587014)
chr4 (561-606)||(31300427-31300472)
chr4 (256-320)||(52942910-52942974)
chr4 (558-606)||(5336916-5336964)
chr4 (561-609)||(25699752-25699800)
chr4 (558-606)||(55822265-55822313)
[»] chr3 (145 HSPs)
chr3 (256-613)||(11170178-11170536)
chr3 (256-550)||(11162924-11163218)
chr3 (223-613)||(35777163-35777554)
chr3 (223-613)||(18097025-18097422)
chr3 (223-613)||(22114430-22114842)
chr3 (326-613)||(3859372-3859660)
chr3 (224-613)||(5191374-5191785)
chr3 (222-613)||(38889756-38890172)
chr3 (223-613)||(18099295-18099707)
chr3 (281-613)||(6065920-6066254)
chr3 (310-613)||(18162492-18162795)
chr3 (326-613)||(10084514-10084806)
chr3 (328-613)||(45882785-45883071)
chr3 (256-613)||(48361796-48362153)
chr3 (328-613)||(32264164-32264454)
chr3 (326-613)||(10956152-10956440)
chr3 (326-613)||(26720392-26720679)
chr3 (326-613)||(10191435-10191726)
chr3 (326-613)||(5522751-5523028)
chr3 (326-613)||(10958448-10958736)
chr3 (327-613)||(24979552-24979839)
chr3 (405-613)||(4308406-4308615)
chr3 (405-613)||(43228214-43228423)
chr3 (378-613)||(50493895-50494132)
chr3 (378-613)||(6063570-6063809)
chr3 (369-613)||(15780747-15781003)
chr3 (357-613)||(12268089-12268348)
chr3 (405-613)||(43226009-43226217)
chr3 (412-613)||(6561740-6561942)
chr3 (405-613)||(51727132-51727340)
chr3 (405-613)||(4104020-4104233)
chr3 (256-610)||(32218869-32219213)
chr3 (406-613)||(43423588-43423796)
chr3 (406-613)||(1626808-1627016)
chr3 (405-613)||(27101306-27101519)
chr3 (446-613)||(30005805-30005973)
chr3 (406-612)||(3314608-3314815)
chr3 (405-613)||(746674-746890)
chr3 (405-613)||(1313333-1313541)
chr3 (379-613)||(38210265-38210503)
chr3 (405-613)||(25533357-25533574)
chr3 (446-613)||(42990268-42990436)
chr3 (405-613)||(455826-456040)
chr3 (405-613)||(458203-458417)
chr3 (405-613)||(51943294-51943503)
chr3 (405-613)||(53917789-53917998)
chr3 (406-613)||(5926889-5927097)
chr3 (406-613)||(28100166-28100374)
chr3 (406-613)||(28102127-28102335)
chr3 (405-613)||(35918068-35918283)
chr3 (446-613)||(10621654-10621823)
chr3 (405-613)||(53915621-53915830)
chr3 (326-478)||(1321285-1321437)
chr3 (446-613)||(29956650-29956818)
chr3 (406-613)||(880576-880785)
chr3 (378-613)||(25388794-25389038)
chr3 (405-613)||(39715393-39715601)
chr3 (407-593)||(43421560-43421747)
chr3 (406-609)||(28180948-28181150)
chr3 (406-613)||(36011751-36011959)
chr3 (405-613)||(42992205-42992417)
chr3 (329-585)||(24177126-24177380)
chr3 (406-612)||(53468582-53468788)
chr3 (405-613)||(9604732-9604946)
chr3 (355-595)||(28761572-28761813)
chr3 (406-613)||(47149020-47149233)
chr3 (472-613)||(28413156-28413299)
chr3 (486-613)||(1321483-1321611)
chr3 (223-401)||(6719471-6719651)
chr3 (406-596)||(54691716-54691906)
chr3 (447-573)||(41849117-41849244)
chr3 (406-613)||(889898-890104)
chr3 (406-536)||(47701798-47701928)
chr3 (407-609)||(51674895-51675087)
chr3 (406-613)||(28137431-28137628)
chr3 (355-613)||(23633332-23633586)
chr3 (406-613)||(31151271-31151477)
chr3 (407-536)||(27635830-27635959)
chr3 (407-535)||(6231374-6231502)
chr3 (406-588)||(54884081-54884262)
chr3 (223-340)||(6063889-6064006)
chr3 (239-340)||(10192413-10192513)
chr3 (504-613)||(7606712-7606822)
chr3 (239-340)||(10085493-10085593)
chr3 (406-588)||(53591119-53591291)
chr3 (361-585)||(53597119-53597340)
chr3 (407-525)||(3306724-3306842)
chr3 (222-340)||(50493675-50493793)
chr3 (223-340)||(38210067-38210184)
chr3 (355-583)||(23636899-23637125)
chr3 (223-340)||(53896637-53896754)
chr3 (405-613)||(13420311-13420506)
chr3 (378-460)||(53896475-53896557)
chr3 (240-340)||(5899476-5899576)
chr3 (533-613)||(25688286-25688367)
chr3 (223-306)||(7606880-7606963)
chr3 (412-613)||(36871427-36871624)
chr3 (405-502)||(4560502-4560599)
chr3 (445-613)||(4666488-4666646)
chr3 (357-436)||(13893269-13893347)
chr3 (223-340)||(5885983-5886101)
chr3 (378-439)||(5886181-5886242)
chr3 (393-454)||(6719396-6719457)
chr3 (405-613)||(1673898-1674104)
chr3 (495-613)||(6484372-6484492)
chr3 (280-340)||(25388654-25388714)
chr3 (350-434)||(46966940-46967024)
chr3 (489-613)||(561902-562024)
chr3 (222-322)||(32264481-32264581)
chr3 (378-439)||(5899656-5899717)
chr3 (552-613)||(11168172-11168233)
chr3 (526-613)||(4560409-4560497)
chr3 (489-613)||(25635391-25635513)
chr3 (405-470)||(6484308-6484373)
chr3 (530-613)||(6231849-6231932)
chr3 (380-478)||(1618916-1619018)
chr3 (256-334)||(5523041-5523119)
chr3 (221-271)||(3859315-3859365)
chr3 (543-613)||(5886261-5886331)
chr3 (282-334)||(10956453-10956505)
chr3 (558-606)||(6303310-6303358)
chr3 (558-606)||(10094208-10094256)
chr3 (558-606)||(10100225-10100273)
chr3 (558-606)||(10201088-10201136)
chr3 (558-606)||(16462203-16462251)
chr3 (558-606)||(22626118-22626166)
chr3 (558-606)||(47883016-47883064)
chr3 (405-444)||(25690651-25690690)
chr3 (543-613)||(5899734-5899804)
chr3 (489-585)||(25633930-25634024)
chr3 (380-434)||(26762863-26762917)
chr3 (558-603)||(4535614-4535659)
chr3 (405-434)||(10621847-10621876)
chr3 (561-606)||(10897008-10897053)
chr3 (357-434)||(16996681-16996758)
chr3 (561-606)||(20031452-20031497)
chr3 (561-606)||(29914087-29914132)
chr3 (407-436)||(31021450-31021479)
chr3 (405-434)||(42990205-42990234)
chr3 (561-606)||(47878305-47878350)
chr3 (561-606)||(54193229-54193274)
chr3 (357-432)||(562069-562144)
chr3 (558-606)||(10208134-10208182)
chr3 (223-271)||(25388618-25388666)
chr3 (405-441)||(27101558-27101594)
[»] chr1 (112 HSPs)
chr1 (223-613)||(6822775-6823166)
chr1 (223-613)||(51749778-51750191)
chr1 (223-613)||(13761577-13761989)
chr1 (223-613)||(20302198-20302611)
chr1 (223-613)||(51752104-51752516)
chr1 (251-588)||(6823651-6824012)
chr1 (326-613)||(15823410-15823698)
chr1 (256-613)||(28840451-28840832)
chr1 (328-613)||(13214947-13215233)
chr1 (256-613)||(38925607-38925965)
chr1 (326-613)||(10399957-10400245)
chr1 (326-613)||(28842357-28842647)
chr1 (328-613)||(41646786-41647072)
chr1 (328-596)||(28207212-28207481)
chr1 (329-613)||(39462385-39462671)
chr1 (223-552)||(47451405-47451738)
chr1 (259-596)||(14098116-14098453)
chr1 (380-613)||(16226085-16226320)
chr1 (406-613)||(2617460-2617668)
chr1 (328-612)||(3579746-3580033)
chr1 (380-613)||(47179627-47179866)
chr1 (408-613)||(21948317-21948526)
chr1 (380-613)||(47177276-47177515)
chr1 (14-222)||(50767522-50767747)
chr1 (395-613)||(20291390-20291609)
chr1 (405-613)||(24325599-24325815)
chr1 (405-613)||(31735650-31735863)
chr1 (408-613)||(39932017-39932225)
chr1 (407-613)||(18307054-18307261)
chr1 (405-612)||(27337069-27337280)
chr1 (405-613)||(6995829-6996038)
chr1 (405-613)||(12302634-12302848)
chr1 (405-613)||(48665114-48665330)
chr1 (406-613)||(17186257-17186465)
chr1 (408-613)||(15294963-15295183)
chr1 (405-613)||(17324765-17324974)
chr1 (405-613)||(28998382-28998591)
chr1 (405-613)||(29004098-29004307)
chr1 (406-613)||(50307675-50307884)
chr1 (379-613)||(16428569-16428805)
chr1 (405-613)||(27339259-27339472)
chr1 (454-613)||(46431836-46431996)
chr1 (406-613)||(50076801-50077009)
chr1 (407-613)||(25251404-25251611)
chr1 (405-613)||(9463372-9463588)
chr1 (405-613)||(2510453-2510666)
chr1 (446-613)||(4131509-4131676)
chr1 (406-613)||(18839531-18839739)
chr1 (405-613)||(47906207-47906422)
chr1 (406-613)||(50078950-50079158)
chr1 (359-613)||(9241215-9241470)
chr1 (405-613)||(9459545-9459761)
chr1 (406-609)||(31489859-31490061)
chr1 (406-613)||(50248701-50248909)
chr1 (369-613)||(31423002-31423248)
chr1 (405-613)||(6756470-6756678)
chr1 (427-613)||(31425144-31425335)
chr1 (406-613)||(11457604-11457812)
chr1 (378-502)||(16231517-16231641)
chr1 (407-613)||(17318838-17319039)
chr1 (405-613)||(2949360-2949569)
chr1 (446-613)||(25127856-25128024)
chr1 (256-418)||(49687334-49687496)
chr1 (329-478)||(30790658-30790808)
chr1 (406-612)||(17324009-17324214)
chr1 (367-613)||(42922138-42922382)
chr1 (251-401)||(16231369-16231518)
chr1 (455-596)||(40133937-40134079)
chr1 (222-328)||(20291279-20291386)
chr1 (406-596)||(14183738-14183923)
chr1 (407-501)||(25248756-25248850)
chr1 (223-340)||(47179428-47179545)
chr1 (405-581)||(18800734-18800907)
chr1 (231-340)||(16225895-16226004)
chr1 (223-340)||(47177078-47177194)
chr1 (379-575)||(8349219-8349414)
chr1 (405-613)||(8347402-8347607)
chr1 (256-340)||(28842266-28842350)
chr1 (405-613)||(15669523-15669729)
chr1 (453-613)||(16432396-16432546)
chr1 (223-340)||(23783238-23783355)
chr1 (405-474)||(49495468-49495537)
chr1 (412-613)||(13125588-13125787)
chr1 (412-585)||(26520277-26520449)
chr1 (553-613)||(51757623-51757683)
chr1 (529-613)||(16231630-16231716)
chr1 (378-444)||(23783467-23783533)
chr1 (380-477)||(26613503-26613603)
chr1 (256-334)||(15823319-15823397)
chr1 (223-324)||(10400268-10400369)
chr1 (439-478)||(6115344-6115383)
chr1 (256-322)||(13214854-13214920)
chr1 (379-457)||(16431017-16431096)
chr1 (544-609)||(155788-155854)
chr1 (551-613)||(16429047-16429109)
chr1 (380-611)||(27916415-27916644)
chr1 (357-434)||(43104053-43104131)
chr1 (529-613)||(25248681-25248766)
chr1 (558-606)||(2232597-2232645)
chr1 (329-420)||(46782919-46783010)
chr1 (361-434)||(2401494-2401568)
chr1 (558-596)||(14997040-14997078)
chr1 (561-606)||(2401355-2401400)
chr1 (256-332)||(3580050-3580126)
chr1 (561-606)||(9526469-9526514)
chr1 (412-537)||(13127837-13127959)
chr1 (561-606)||(21353480-21353525)
chr1 (557-613)||(23785935-23785992)
chr1 (561-606)||(25134074-25134119)
chr1 (406-478)||(30738890-30738963)
chr1 (405-434)||(46432037-46432066)
chr1 (381-434)||(49958963-49959016)
[»] chr7 (116 HSPs)
chr7 (256-613)||(1049422-1049780)
chr7 (223-613)||(40836869-40837261)
chr7 (223-613)||(26804345-26804734)
chr7 (327-612)||(27306358-27306643)
chr7 (326-613)||(35503-35791)
chr7 (326-613)||(44438-44726)
chr7 (223-613)||(3878322-3878739)
chr7 (330-613)||(31435174-31435458)
chr7 (326-613)||(25542404-25542691)
chr7 (330-569)||(18567491-18567731)
chr7 (405-613)||(38393935-38394148)
chr7 (408-613)||(7472107-7472317)
chr7 (382-613)||(31156037-31156271)
chr7 (406-613)||(44724533-44724741)
chr7 (408-613)||(7470149-7470359)
chr7 (406-613)||(21679981-21680189)
chr7 (405-613)||(13099603-13099812)
chr7 (446-613)||(1047051-1047219)
chr7 (405-613)||(48457602-48457815)
chr7 (405-613)||(3035670-3035886)
chr7 (408-613)||(20625990-20626200)
chr7 (408-613)||(20629881-20630091)
chr7 (408-613)||(20642300-20642510)
chr7 (407-613)||(37412254-37412462)
chr7 (406-613)||(11355212-11355420)
chr7 (406-613)||(21678020-21678228)
chr7 (405-613)||(40946277-40946490)
chr7 (405-613)||(443548-443757)
chr7 (406-613)||(20137236-20137444)
chr7 (406-613)||(25276095-25276303)
chr7 (405-588)||(42331151-42331335)
chr7 (406-613)||(4296061-4296271)
chr7 (405-613)||(11757177-11757392)
chr7 (405-613)||(20299407-20299622)
chr7 (336-596)||(22392357-22392606)
chr7 (405-613)||(18345490-18345703)
chr7 (406-613)||(24748548-24748756)
chr7 (405-613)||(7349399-7349615)
chr7 (405-613)||(7351778-7351994)
chr7 (446-613)||(1849975-1850143)
chr7 (405-613)||(20297311-20297524)
chr7 (390-613)||(22251677-22251893)
chr7 (405-588)||(28485515-28485703)
chr7 (406-613)||(9680768-9680982)
chr7 (406-596)||(42223110-42223303)
chr7 (406-613)||(39146114-39146322)
chr7 (439-613)||(21592270-21592445)
chr7 (407-596)||(21990106-21990295)
chr7 (405-613)||(28487502-28487715)
chr7 (412-585)||(24258423-24258597)
chr7 (406-612)||(27832761-27832969)
chr7 (357-613)||(22828760-22829018)
chr7 (355-613)||(7188445-7188701)
chr7 (407-613)||(9679009-9679221)
chr7 (405-609)||(43253648-43253860)
chr7 (408-613)||(24817481-24817682)
chr7 (357-613)||(20091672-20091926)
chr7 (223-340)||(1047386-1047503)
chr7 (530-613)||(38396713-38396797)
chr7 (223-340)||(2935070-2935187)
chr7 (223-340)||(9027570-9027687)
chr7 (407-613)||(24465503-24465699)
chr7 (408-501)||(7094662-7094759)
chr7 (408-501)||(7092414-7092512)
chr7 (223-340)||(22136878-22136995)
chr7 (223-340)||(40551905-40552022)
chr7 (522-613)||(7092339-7092431)
chr7 (352-432)||(45366446-45366526)
chr7 (481-613)||(24813626-24813755)
chr7 (452-506)||(38396316-38396370)
chr7 (405-454)||(1606423-1606472)
chr7 (223-340)||(22107867-22107984)
chr7 (222-334)||(27306657-27306768)
chr7 (223-340)||(40549627-40549744)
chr7 (378-449)||(22108087-22108158)
chr7 (378-449)||(22137098-22137169)
chr7 (378-449)||(40549847-40549918)
chr7 (378-449)||(40552125-40552196)
chr7 (256-340)||(35412-35496)
chr7 (378-449)||(9027396-9027467)
chr7 (378-448)||(2935279-2935349)
chr7 (462-596)||(11081522-11081651)
chr7 (522-613)||(7094587-7094678)
chr7 (407-474)||(3677235-3677301)
chr7 (260-334)||(25542317-25542391)
chr7 (405-449)||(1849918-1849962)
chr7 (405-464)||(30906327-30906386)
chr7 (378-435)||(1047238-1047295)
chr7 (558-606)||(2120899-2120947)
chr7 (558-606)||(3320184-3320232)
chr7 (558-606)||(3324932-3324980)
chr7 (462-585)||(6048885-6049004)
chr7 (558-606)||(7069780-7069828)
chr7 (558-606)||(7074787-7074835)
chr7 (558-606)||(15541129-15541177)
chr7 (558-606)||(25351353-25351401)
chr7 (558-606)||(25357047-25357095)
chr7 (558-606)||(25405393-25405441)
chr7 (558-606)||(25410130-25410178)
chr7 (558-606)||(42006663-42006711)
chr7 (561-609)||(44143997-44144045)
chr7 (256-322)||(18567396-18567462)
chr7 (256-322)||(31435487-31435553)
chr7 (405-474)||(6332179-6332248)
chr7 (544-613)||(16297152-16297222)
chr7 (354-432)||(42006468-42006545)
chr7 (557-613)||(1606486-1606543)
chr7 (557-613)||(2935374-2935431)
chr7 (557-613)||(22137184-22137241)
chr7 (406-510)||(26210500-26210603)
chr7 (561-606)||(30246973-30247018)
chr7 (561-606)||(34546997-34547042)
chr7 (405-434)||(38396239-38396268)
chr7 (557-613)||(40552211-40552268)
chr7 (561-606)||(44512659-44512704)
chr7 (558-606)||(8378638-8378686)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (231-613)||(19502138-19502542)
chr2 (231-613)||(27104523-27104926)
chr2 (222-613)||(19504473-19504885)
chr2 (256-613)||(40032185-40032553)
chr2 (223-586)||(24162366-24162752)
chr2 (326-609)||(42064355-42064639)
chr2 (329-613)||(13910171-13910456)
chr2 (328-613)||(21520820-21521108)
chr2 (231-613)||(43623707-43624077)
chr2 (275-588)||(6264301-6264611)
chr2 (328-596)||(22287480-22287749)
chr2 (336-595)||(6258960-6259220)
chr2 (328-552)||(22407598-22407822)
chr2 (405-613)||(45280111-45280321)
chr2 (405-609)||(23452368-23452577)
chr2 (405-613)||(42452702-42452909)
chr2 (275-613)||(18800441-18800767)
chr2 (406-586)||(31732919-31733100)
chr2 (405-613)||(35215712-35215932)
chr2 (406-613)||(11739687-11739895)
chr2 (406-613)||(19007560-19007768)
chr2 (446-613)||(35218089-35218258)
chr2 (405-613)||(42923636-42923847)
chr2 (407-613)||(15539602-15539809)
chr2 (409-596)||(3022086-3022274)
chr2 (406-613)||(28196557-28196765)
chr2 (406-570)||(22163117-22163282)
chr2 (414-613)||(34979706-34979906)
chr2 (406-613)||(17848365-17848572)
chr2 (406-613)||(17849037-17849245)
chr2 (406-613)||(44289195-44289403)
chr2 (406-584)||(14837193-14837372)
chr2 (446-585)||(38020162-38020302)
chr2 (405-539)||(5377631-5377769)
chr2 (406-613)||(11578236-11578439)
chr2 (446-596)||(45239121-45239271)
chr2 (338-613)||(35107152-35107421)
chr2 (223-340)||(36559241-36559358)
chr2 (359-596)||(22874015-22874241)
chr2 (223-340)||(36561560-36561677)
chr2 (405-478)||(37963190-37963263)
chr2 (407-500)||(38020064-38020157)
chr2 (354-477)||(12342673-12342797)
chr2 (536-613)||(5375472-5375550)
chr2 (223-332)||(45332566-45332675)
chr2 (405-585)||(17897401-17897578)
chr2 (496-596)||(28459334-28459435)
chr2 (256-331)||(21521126-21521201)
chr2 (407-585)||(20146764-20146941)
chr2 (378-449)||(36559067-36559138)
chr2 (378-449)||(36561344-36561415)
chr2 (394-449)||(45332384-45332439)
chr2 (376-434)||(28462593-28462651)
chr2 (357-436)||(45156922-45157001)
chr2 (355-454)||(40699178-40699278)
chr2 (542-613)||(40699429-40699501)
chr2 (558-609)||(2736205-2736256)
chr2 (256-334)||(6259243-6259321)
chr2 (407-449)||(20147040-20147082)
chr2 (380-434)||(35028473-35028527)
chr2 (558-606)||(17462436-17462484)
chr2 (558-606)||(20054899-20054947)
chr2 (558-606)||(22712650-22712698)
chr2 (558-606)||(22717359-22717407)
chr2 (558-606)||(39686983-39687031)
chr2 (558-606)||(45567409-45567457)
chr2 (558-613)||(20589763-20589818)
chr2 (326-388)||(45332490-45332551)
chr2 (561-606)||(12781355-12781400)
chr2 (557-613)||(17921769-17921826)
chr2 (561-606)||(17932637-17932682)
chr2 (561-606)||(17943540-17943585)
chr2 (561-606)||(27517773-27517818)
chr2 (557-613)||(36558990-36559047)
chr2 (557-613)||(36561267-36561324)
chr2 (529-585)||(38414235-38414291)
chr2 (406-434)||(20589581-20589609)
chr2 (380-432)||(33603818-33603870)
chr2 (558-606)||(38190997-38191045)
[»] chr6 (84 HSPs)
chr6 (223-613)||(14507302-14507716)
chr6 (256-613)||(19227535-19227915)
chr6 (326-613)||(11983156-11983444)
chr6 (328-613)||(30728955-30729241)
chr6 (275-606)||(32279845-32280176)
chr6 (326-613)||(9019826-9020113)
chr6 (328-613)||(15541267-15541553)
chr6 (326-596)||(15530266-15530537)
chr6 (256-551)||(1072067-1072362)
chr6 (405-613)||(28241448-28241657)
chr6 (405-613)||(1230376-1230585)
chr6 (405-613)||(12195641-12195851)
chr6 (337-613)||(15532808-15533085)
chr6 (413-613)||(14458894-14459093)
chr6 (326-526)||(8995379-8995578)
chr6 (406-613)||(13057173-13057381)
chr6 (378-613)||(4816358-4816608)
chr6 (405-613)||(30967176-30967388)
chr6 (405-613)||(3390357-3390566)
chr6 (406-613)||(3629991-3630199)
chr6 (378-613)||(20915482-20915721)
chr6 (406-613)||(25477253-25477461)
chr6 (411-613)||(19704695-19704905)
chr6 (405-613)||(2629012-2629226)
chr6 (405-613)||(30034730-30034943)
chr6 (408-613)||(3632065-3632271)
chr6 (446-613)||(26065005-26065170)
chr6 (446-613)||(26084974-26085139)
chr6 (406-613)||(3233857-3234065)
chr6 (406-613)||(13039733-13039941)
chr6 (405-613)||(26932688-26932906)
chr6 (406-596)||(12161701-12161889)
chr6 (406-552)||(32447504-32447651)
chr6 (406-587)||(24338600-24338783)
chr6 (406-613)||(22490618-22490827)
chr6 (405-535)||(17852520-17852650)
chr6 (405-585)||(3028009-3028186)
chr6 (413-552)||(13870611-13870749)
chr6 (223-340)||(26068765-26068882)
chr6 (223-340)||(26066494-26066611)
chr6 (357-571)||(15346320-15346524)
chr6 (223-340)||(33308685-33308802)
chr6 (223-340)||(33310954-33311071)
chr6 (365-613)||(16455553-16455800)
chr6 (223-340)||(29755162-29755279)
chr6 (256-334)||(8995288-8995366)
chr6 (256-334)||(9019735-9019813)
chr6 (526-613)||(5273342-5273431)
chr6 (406-518)||(10584105-10584212)
chr6 (439-613)||(15719666-15719829)
chr6 (378-450)||(26068590-26068662)
chr6 (380-450)||(26066319-26066389)
chr6 (329-401)||(24192635-24192707)
chr6 (406-613)||(14466312-14466510)
chr6 (380-478)||(12186330-12186431)
chr6 (412-585)||(17012029-17012199)
chr6 (380-582)||(19696394-19696595)
chr6 (329-401)||(24191538-24191610)
chr6 (378-454)||(29754983-29755059)
chr6 (231-334)||(11983457-11983558)
chr6 (552-613)||(1069846-1069907)
chr6 (280-340)||(4816689-4816749)
chr6 (378-439)||(33308905-33308966)
chr6 (378-439)||(33311174-33311235)
chr6 (357-478)||(12911710-12911835)
chr6 (552-613)||(26945269-26945330)
chr6 (558-606)||(3577648-3577696)
chr6 (558-606)||(13878727-13878775)
chr6 (558-606)||(13883475-13883523)
chr6 (558-606)||(16785919-16785967)
chr6 (405-449)||(18318004-18318048)
chr6 (558-606)||(26887358-26887406)
chr6 (558-606)||(31248848-31248896)
chr6 (558-606)||(35201460-35201508)
chr6 (380-478)||(12937457-12937559)
chr6 (522-582)||(15367129-15367187)
chr6 (543-612)||(12186201-12186271)
chr6 (355-470)||(15366963-15367086)
chr6 (561-606)||(17036058-17036103)
chr6 (561-606)||(17694985-17695030)
chr6 (557-613)||(33308988-33309045)
chr6 (557-613)||(33311257-33311314)
chr6 (566-606)||(12166280-12166320)
chr6 (566-606)||(25941652-25941692)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (326-613)||(2753-3041)
scaffold0250 (264-334)||(2670-2740)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (256-596)||(4423868-4424209)
chr8 (326-613)||(14807672-14807959)
chr8 (326-613)||(27826906-27827194)
chr8 (326-613)||(27829217-27829505)
chr8 (328-613)||(15072632-15072919)
chr8 (326-612)||(28251695-28251981)
chr8 (328-613)||(15067903-15068189)
chr8 (378-613)||(18810680-18810916)
chr8 (251-506)||(3886153-3886412)
chr8 (378-613)||(44720815-44721052)
chr8 (406-613)||(33541515-33541723)
chr8 (405-613)||(32339304-32339517)
chr8 (378-613)||(18812865-18813090)
chr8 (355-613)||(14419318-14419578)
chr8 (406-613)||(27107024-27107232)
chr8 (383-613)||(13858611-13858842)
chr8 (256-517)||(12517248-12517532)
chr8 (405-613)||(1225165-1225374)
chr8 (405-613)||(27911014-27911222)
chr8 (405-613)||(27957433-27957641)
chr8 (405-613)||(3874005-3874218)
chr8 (406-613)||(14477276-14477484)
chr8 (405-613)||(22684783-22685002)
chr8 (415-613)||(608735-608942)
chr8 (405-613)||(15809214-15809426)
chr8 (405-613)||(28283346-28283561)
chr8 (405-613)||(24873307-24873523)
chr8 (454-613)||(43079650-43079811)
chr8 (446-613)||(43082013-43082182)
chr8 (406-613)||(30480630-30480838)
chr8 (405-582)||(26775200-26775378)
chr8 (405-596)||(41384744-41384935)
chr8 (328-478)||(2468361-2468511)
chr8 (407-582)||(36865538-36865715)
chr8 (406-596)||(5622882-5623073)
chr8 (405-613)||(43530123-43530323)
chr8 (406-608)||(5372310-5372512)
chr8 (406-588)||(25952521-25952703)
chr8 (405-552)||(41382672-41382819)
chr8 (357-596)||(15185852-15186095)
chr8 (406-564)||(35872559-35872713)
chr8 (223-332)||(43079347-43079456)
chr8 (223-340)||(43081722-43081839)
chr8 (359-613)||(31162165-31162417)
chr8 (223-340)||(18812668-18812785)
chr8 (406-613)||(21482322-21482518)
chr8 (405-501)||(181536-181632)
chr8 (223-340)||(18810483-18810600)
chr8 (439-562)||(37214369-37214512)
chr8 (359-575)||(31035021-31035236)
chr8 (256-334)||(27826815-27826893)
chr8 (256-334)||(27829126-27829204)
chr8 (496-613)||(15956051-15956165)
chr8 (439-595)||(21480547-21480692)
chr8 (256-340)||(28252009-28252093)
chr8 (439-613)||(3005759-3005929)
chr8 (379-434)||(17847501-17847556)
chr8 (326-401)||(44720742-44720816)
chr8 (231-334)||(14807556-14807659)
chr8 (223-340)||(44720617-44720735)
chr8 (544-613)||(31573854-31573924)
chr8 (231-328)||(15067785-15067882)
chr8 (223-331)||(15072506-15072614)
chr8 (544-613)||(31578406-31578476)
chr8 (405-449)||(6375988-6376032)
chr8 (558-606)||(9021241-9021289)
chr8 (558-606)||(16752656-16752704)
chr8 (558-606)||(16757401-16757449)
chr8 (561-609)||(23179692-23179740)
chr8 (558-606)||(28327908-28327956)
chr8 (558-606)||(28895502-28895550)
chr8 (378-434)||(43079558-43079614)
chr8 (378-434)||(43081930-43081986)
chr8 (561-606)||(590797-590842)
chr8 (561-606)||(29554919-29554964)
chr8 (541-613)||(31035252-31035325)
chr8 (383-431)||(31574054-31574100)
chr8 (561-606)||(33032657-33032702)
chr8 (558-606)||(4812621-4812669)
chr8 (558-606)||(17799558-17799606)
chr8 (558-606)||(28332631-28332679)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (231-552)||(73212-73536)
scaffold0025 (231-613)||(69418-69825)
scaffold0025 (518-564)||(73163-73210)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (328-613)||(3872-4157)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (336-613)||(14902-15180)
scaffold0131 (418-613)||(14509-14707)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (378-613)||(6124-6361)
scaffold0472 (223-340)||(5927-6044)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (405-613)||(41610-41819)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (326-613)||(29034-29332)
scaffold0068 (223-287)||(28941-29005)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (408-613)||(79140-79346)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (405-613)||(183768-183975)
scaffold0005 (405-609)||(51961-52168)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (405-613)||(1988-2202)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (405-613)||(11600-11809)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (406-613)||(35593-35800)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (446-613)||(34-203)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (406-613)||(79812-80021)
scaffold0004 (558-606)||(188376-188424)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (405-519)||(1053-1167)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (367-613)||(15949-16193)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (406-613)||(85184-85391)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (223-340)||(12937-13054)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (520-613)||(1579-1673)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (407-613)||(16778-16981)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (415-613)||(1770-1958)
[»] scaffold0140 (6 HSPs)
scaffold0140 (223-340)||(21915-22032)
scaffold0140 (223-340)||(24190-24307)
scaffold0140 (378-449)||(22135-22206)
scaffold0140 (378-449)||(24410-24481)
scaffold0140 (557-613)||(22221-22278)
scaffold0140 (557-613)||(24496-24553)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (412-585)||(4773-4943)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (558-606)||(224819-224867)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (561-606)||(16328-16373)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 116)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 222 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 25921993 - 25921600
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactg 320  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25921993 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactg 25921894  T
Q  321 gaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaata 420  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25921893 gaaaaatcgtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaata 25921794  T
Q  421 tagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttg 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25921793 tagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttg 25921694  T
Q  521 gaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25921693 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtag 25921600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 2174680 - 2175071
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2174680 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 2174779  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatata 422  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  2174780 aaaatcgtggcacgatggtgcactggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaataca 2174879  T
Q  423 gaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgga 522  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2174880 ggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgga 2174979  T
Q  523 acaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2174980 acaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 2175071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Original strand, 38881878 - 38882258
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatg---------------- 339  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||                    
T  38881878 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 38881977  T
Q  340 -----gtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38881978 cgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 38882077  T
Q  435 aagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactag 533  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  38882078 gagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactag 38882177  T
Q  534 ggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38882178 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 38882258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 231 - 613
Target Start/End: Original strand, 4236378 - 4236781
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 329  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4236378 ttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttta-aggcaaggcactggaaaaatcg 4236476  T
Q  330 tggcat---------------------gatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaactt 408  Q
    |||||                      |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4236477 tggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatactt 4236575  T
Q  409 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4236576 ttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 4236675  T
Q  509 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggacttt 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4236676 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 4236775  T
Q  608 gggtag 613  Q
    ||||||    
T  4236776 gggtag 4236781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 16776021 - 16776310
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa-tataga 424  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16776021 atcgtggcacgatggtgcgctggcatcgaaaaacagaaacatatttttgagtgaagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatataga 16776120  T
Q  425 ccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaac 524  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16776121 ccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaat 16776220  T
Q  525 aaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16776221 aaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 16776310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2818813 - 2818462
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||| |||||        | ||||    
T  2818813 aatcgtggcacgatggctaggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatgg--------cagcga 2818723  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2818722 ataacaaaaacgtattttcgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 2818623  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggg-ttgattca-c 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  2818622 ggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcacc 2818523  T
Q  553 ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2818522 ttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtag 2818462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 346 - 611
Target Start/End: Original strand, 21947911 - 21948176
Alignment:
Q  346 tggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt 445  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  21947911 tggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaatttt 21948010  T
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21948011 gagataga-ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 21948109  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggt 611  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21948110 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggt 21948176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31466496 - 31466105
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcat-aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 320  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||    
T  31466496 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatgagatgtttcagttat-gaggcaagtcactg 31466399  T
Q  321 gaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaata 420  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31466398 gaaaaatcttggcacgatggtgcactggcagggaataccataaatgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaata 31466299  T
Q  421 tagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttg 520  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31466298 tagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg 31466199  T
Q  521 gaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  31466198 gaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtag 31466105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 223 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 36402845 - 36402456
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| |||| || ||| |||| ||||  |||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36402845 tgtgagagttaacttaaaattaggtttctgcagaatctaggcacgatggctgggcaacatagcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactgg 36402747  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatat 421  Q
         |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36402746 ttttttcgtggcacgatggtgcgttggcaacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttc-aaattttaagcgatacttttactataaatat 36402648  T
Q  422 agaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg 521  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36402647 agaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 36402548  T
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggta 612  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||    
T  36402547 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggta 36402456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 304 - 613
Target Start/End: Original strand, 6756336 - 6756646
Alignment:
Q  304 tttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcga 403  Q
    ||||||||||| |||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  6756336 tttgaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttggtgcagatttattccaaattttaagtta 6756435  T
Q  404 aacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6756436 tacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgta 6756535  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  || |    
T  6756536 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgag 6756635  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  6756636 actttgggtag 6756646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 256 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 12556408 - 12556067
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  12556408 aatcgtggcataatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatgatgcgctggcagcga 12556310  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12556309 ataacagaaatgtatttttgtgtacagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 12556210  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  12556209 ggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcacct 12556110  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  12556109 tgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagag 12556067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 31542651 - 31542888
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542651 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31542750  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-ga 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  31542751 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 31542850  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  31542851 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 31542888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 31544996 - 31545233
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31544996 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 31545095  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-ga 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  31545096 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaga 31545195  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  31545196 gtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtag 31545233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 21684876 - 21684578
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21684876 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagac 21684777  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtct 515  Q
    |||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21684776 cttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 21684677  T
Q  516 ctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  21684676 cttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtag 21684578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 223 - 432
Target Start/End: Original strand, 39797849 - 39798058
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39797849 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcaccgga 39797948  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatata 422  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39797949 aaaatcatggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatata 39798048  T
Q  423 gaccttgtat 432  Q
    ||||||||||    
T  39798049 gaccttgtat 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31179734 - 31179497
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31179734 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 31179635  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-ga 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  31179634 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 31179535  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  31179534 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 31179497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854635
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaa 39854625  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  39854626 ctttgggtag 39854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529226
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||     
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 10529236  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  10529235 ctttgggtag 10529226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469163
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 18469149  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    |||||||| |||||    
T  18469150 gggactttaggtag 18469163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 330 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20507873 - 20507665
Alignment:
Q  330 tggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttg 429  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20507873 tggcacgaaggtgcgctagcagcgaataacagaaacatatttttgggagcagatttgttccaagatttaagcgatacttttactataaatatagatcttg 20507774  T
Q  430 tatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaaca 529  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20507773 tatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 20507674  T
Q  530 ctagggttt 538  Q
    | |||||||    
T  20507673 caagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 406 - 609
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043198
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  605 tttgg 609  Q
    |||||    
T  20043194 tttgg 20043198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045162
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||||  ||||||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  20045154 tttgggtag 20045162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26097884
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggac 26097875  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  26097876 tttgggtag 26097884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 406 - 596
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073018
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagag 17073018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 406 - 596
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904238
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 25904238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466836
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  503 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgg 601  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgg 18466824  T
Q  602 gactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||    
T  18466825 gactttgggtag 18466836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221674
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggga 40221664  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    |||| |||||    
T  40221665 cttttggtag 40221674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747457
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  503 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgg 601  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgg 6747445  T
Q  602 gactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||    
T  6747446 gactttgggtag 6747457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509445
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggact 18509453  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  18509452 ttgggtag 18509445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 408 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511343
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18511348  T
Q  605 tttgg 609  Q
    |||||    
T  18511347 tttgg 18511343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189736
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    | ||||||||||||    
T  1189749 gagactttgggtag 1189736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910602
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagg 27910586  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||||    
T  27910587 ctgtgactttgggtag 27910602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912688
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagg 27912672  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||||    
T  27912673 ctgagactttgggtag 27912688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472740
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    ||| |||||    
T  31472748 ttttggtag 31472740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596797
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtataaaga--caacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 18596787  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||| ||||    
T  18596788 ctttgagtag 18596797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 409 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474450
Alignment:
Q  409 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaa 508  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  509 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggacttt 607  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  608 gggtag 613  Q
    | ||||    
T  10474455 gagtag 10474450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477180
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 34477180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745220
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggtt 6745151  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtag 6745220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530793
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||  | ||||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||| ||||    
T  34530801 tttgagtag 34530793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479545
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtag 34479545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552398
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtag 15552398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092327
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 16092327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804177
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtag 25804177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 405 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705932
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 37705932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39398120
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |   | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  39398129 ctttgggtag 39398120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098403
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttac 26098403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127008
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| | ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  24127000 tttgggtag 24127008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 223 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34479972 - 34479799
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34479972 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34479873  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaatttt 397  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || || | |||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34479872 aaaatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacagatttt 34479799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696029
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 414 - 613
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954569
Alignment:
Q  414 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgt 513  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  514 ctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggt 611  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||  || ||||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  612 ag 613  Q
    ||    
T  2954568 ag 2954569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 413 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818617
Alignment:
Q  413 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttg 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  513 tctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggt 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||  || | ||||||||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  612 ag 613  Q
    ||    
T  17818618 ag 17818617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 413 - 609
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21288917
Alignment:
Q  413 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttg 512  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  513 tctctttggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||| | | ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  | ||||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttgaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactt 21288914  T
Q  607 tgg 609  Q
    |||    
T  21288915 tgg 21288917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 484 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658480
Alignment:
Q  484 caacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 582  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  583 ggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtag 658480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34477632 - 34477515
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34477632 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34477533  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  34477532 aaaatcgtggcacgatgg 34477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 405 - 502
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  501 gt 502  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 411 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661331
Alignment:
Q  411 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatt 510  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  511 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaaga 595  Q
    ||| |||| | |||||||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 6661331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 359
Target Start/End: Original strand, 659746 - 659848
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  659746 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttt--gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatggtgcgctggcagcga 659843  T
Q  355 ataac 359  Q
    |||||    
T  659844 ataac 659848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 31544798 - 31544915
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  31544798 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31544897  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  31544898 aaaatcgtggcacgatgg 31544915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410175
Alignment:
Q  529 actagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 4410175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 31542442 - 31542559
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  31542442 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtgacacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31542541  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  31542542 aaaatcgtggcacgatgg 31542559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38960604 - 38960440
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||   | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  38960604 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggctttgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38960505  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 388  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  || || | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  38960504 aaaatcgtggcacgatggtgcgttggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 38960440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10586984
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||             
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaac--------- 10586872  T
Q  502 tatagaatttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
      |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| | |||||  |    
T  10586873 --tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagatt 10586970  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    | ||||||||||||    
T  10586971 gagactttgggtag 10586984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 10749505 - 10749622
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10749505 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10749604  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  10749605 aaaatcgtggcacgatgg 10749622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 10756960 - 10757077
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10756960 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtagcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10757059  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  10757060 aaaatcgtggcacgatgg 10757077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15355065 - 15354948
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15355065 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15354966  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15354965 aaaatcgtggcacgatgg 15354948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15357341 - 15357224
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15357341 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15357242  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15357241 aaaatcgtggcacgatgg 15357224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 406 - 478
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208597
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 36208597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 449 - 586
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20053968
Alignment:
Q  449 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgat 20053929  T
Q  549 tcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggtt 586  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 20053968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 23665054 - 23665125
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665054 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23793533 - 23793462
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793533 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18186589 - 18186489
Alignment:
Q  221 aatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcact 319  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18186589 aatgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcact 18186491  T
Q  320 gg 321  Q
    ||    
T  18186490 gg 18186489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15354845 - 15354777
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 446  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354845 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15357121 - 15357053
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 446  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357121 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 16775930 - 16776008
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16775930 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtgacacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactgaaaaaatcgtggca 16776008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 23667329 - 23667400
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667329 gcagatttgttatagattttaagcatgactttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38960405 - 38960334
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38960405 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Original strand, 23664833 - 23664951
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||||    
T  23664833 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgg 23664932  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  23664933 aaaaatcgtggcacgatgg 23664951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23793754 - 23793636
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||||    
T  23793754 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgg 23793655  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  23793654 aaaaatcgtggcacgatgg 23793636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 596
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724037
Alignment:
Q  524 caaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagag 2724037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 443
Target Start/End: Original strand, 10757180 - 10757245
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 443  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757180 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505968
Alignment:
Q  541 gggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 20505968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 23667109 - 23667226
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||    
T  23667109 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgga 23667208  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  23667209 aaaatcgtggcacgatgg 23667226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585871
Alignment:
Q  529 actagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtag 41585871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23742101 - 23742057
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23742101 acttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31179897 - 31179837
Alignment:
Q  280 cgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31179897 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatgg 31179837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34477435 - 34477379
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477435 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 613
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798199
Alignment:
Q  538 tgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtag 39798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 613
Target Start/End: Original strand, 42770690 - 42770918
Alignment:
Q  379 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 476  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||| || |||||||  || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |     
T  42770690 cagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggttt-gg 42770787  T
Q  477 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 575  Q
    || ||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||| ||||| | ||||||  ||| |||||| |||    
T  42770788 aaggcaac-acaaaatta-ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttcattcaccatgggaa--actattaggactga 42770880  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||    
T  42770881 gtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 42770918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 434
Target Start/End: Original strand, 29748260 - 29748313
Alignment:
Q  381 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748260 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 29748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21684969 - 21684905
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21684969 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 21684905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 388
Target Start/End: Original strand, 31542576 - 31542628
Alignment:
Q  336 gatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 388  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31542576 gatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgtt 31542628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34479796 - 34479740
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479796 gcagatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 659929 - 659869
Alignment:
Q  278 aacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatg 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  659929 aacgtggcacgattggaggtttcagttt--gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatg 659869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 442
Target Start/End: Original strand, 10749704 - 10749767
Alignment:
Q  379 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 442  Q
    ||||||||||  | |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749704 cagatttgttatagattttaagcaggacttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 21947803 - 21947869
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  21947803 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtgacacgattggaggtttcag-ttttgaggtaagtcactgga 21947869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385583
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 35385583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170859
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 1170859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2144954 - 2144899
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaat-tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144954 agatttgttccaattatttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 2144899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 456  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413323
Alignment:
Q  462 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaa 560  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||| |||||||| ||  |||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaag-gcagcactaaaactatggtttgtagag--tttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  561 cactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggt 17413323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 31179830 - 31179769
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 388  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31179830 atcgtggcacgatggtgcgctggcgggtaaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 31179769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749853
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 10749853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 510
Target Start/End: Original strand, 13295760 - 13295789
Alignment:
Q  481 caacaacaaaactagggtttgtatagaatt 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295760 caacaacaaaactagggtttgtatagaatt 13295789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354700
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 15354700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356976
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 15356976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 15552178 - 15552207
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552178 acttttactataaatatagaccttgtatca 15552207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665197
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 23665197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793390
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 23793390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452543
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25452543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 25803959 - 25803988
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803959 acttttactataaatatagaccttgtatca 25803988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786452
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 28786452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298135
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 2298135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 606
Target Start/End: Original strand, 25445504 - 25445544
Alignment:
Q  566 ttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25445504 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25445544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31179933 - 31179885
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatgg 271  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31179933 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatgg 31179885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 125)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 11434769 - 11435161
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11434769 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactgg 11434868  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatat 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434869 aaaaatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatat 11434968  T
Q  422 agaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg 521  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11434969 agaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg 11435068  T
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11435069 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtag 11435161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 7941133 - 7941529
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7941133 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 7941232  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatat 421  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941233 aaaaatggtggcacgatggtgcgctggtgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatat 7941332  T
Q  422 agaccttgtatcaaagcaaac--tttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctcttt 519  Q
    |||| |||||||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7941333 agacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctta 7941432  T
Q  520 ggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7941433 cgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtag 7941529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 225 - 613
Target Start/End: Original strand, 51015042 - 51015452
Alignment:
Q  225 tgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaa 324  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51015042 tgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaa 51015141  T
Q  325 aat---------------------cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcga 403  Q
    |||                     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015142 aattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagcga 51015241  T
Q  404 aacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51015242 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 51015341  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51015342 tagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 51015441  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  51015442 actttgggtag 51015452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22801346 - 22800989
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |    
T  22801346 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggaactggaaaaatcgtggcacgatggtgcgccggcagcaa 22801248  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22801247 ataacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 22801149  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22801148 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 22801049  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22801048 tggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtag 22800989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 5638006 - 5637592
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5638006 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-gaggcaaggcactgga 5637908  T
Q  323 aaaatc---------------------gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    ||||||                     |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637907 aaaatcatgtcacgatgggatcgcatcgtggcatgatggtgagctggcagcgaaaaacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagc 5637809  T
Q  402 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 497  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5637808 gatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 5637709  T
Q  498 tttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5637708 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 5637609  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||    
T  5637608 gctgggactttgggtag 5637592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 337 - 613
Target Start/End: Original strand, 48486248 - 48486525
Alignment:
Q  337 atggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48486248 atggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaga 48486347  T
Q  437 gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggt 536  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48486348 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggt 48486447  T
Q  537 ttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  48486448 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 48486525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22803148 - 22802861
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22803148 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 22803050  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22803049 cttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 22802950  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22802949 aacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 22802861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 231 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 37089906 - 37089498
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 329  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  37089906 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgagatgttttagttttttaggtgaggcactggaaaaatcg 37089807  T
Q  330 tggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaactt 408  Q
    ||||| |||||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37089806 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaaaactt 37089707  T
Q  409 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37089706 ttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 37089607  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37089606 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggac 37089507  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  37089506 tttgggtag 37089498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 38409117 - 38409411
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38409117 atcgtggcacgatggtgcgttggcggcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 38409216  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctcttt 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  38409217 cttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttc 38409316  T
Q  520 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38409317 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 38409411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 231 - 613
Target Start/End: Original strand, 24888598 - 24889002
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 329  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24888598 ttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcg 24888696  T
Q  330 tggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaactt 408  Q
    ||||| |||||                     || |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24888697 tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcaatactt 24888796  T
Q  409 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  24888797 ttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagag 24888896  T
Q  509 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggacttt 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  24888897 tttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggacttt 24888996  T
Q  608 gggtag 613  Q
    ||||||    
T  24888997 gggtag 24889002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 5198338 - 5198626
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5198338 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 5198437  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5198438 cttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaaca 5198537  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||| ||||| ||||    
T  5198538 aacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtag 5198626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22044804 - 22044517
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22044804 atcgtggcacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag-tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggc 22044706  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22044705 cttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 22044606  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgatt-cacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22044605 aacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 22044517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 47274647 - 47274932
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  47274647 cgtggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagacct 47274746  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  47274747 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaa 47274845  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47274846 cactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtag 47274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22047099 - 22046812
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22047099 atcgtggcacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag-tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggc 22047001  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22047000 cttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaaca 22046901  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22046900 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 22046812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 36920002 - 36919711
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36920002 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaatagtagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 36919903  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttg--agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-a 522  Q
    ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |    
T  36919902 cttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggca 36919803  T
Q  523 acaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36919802 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtag 36919711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 24880371 - 24880657
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24880371 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 24880470  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24880471 tgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 24880570  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  24880571 cactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 24880657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 24878909 - 24879195
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24878909 cgtggcacgatggtacgctggcatcgaataacagaaacgtatttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 24879008  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24879009 tgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 24879108  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  24879109 caccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 24879195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 9174684 - 9174272
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  9174684 tgtgagagttaacttaaaatcaggttc-tgcagaatcgtggcacgacggctaggcaacgtagcacgatggaggttttagtttattaggcaaggcactgga 9174586  T
Q  323 aaaatc---------------------gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    ||||||                     |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  9174585 aaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagtttttaagc 9174486  T
Q  402 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174485 aagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 9174386  T
Q  502 tatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |    
T  9174385 tatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagatt 9174286  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    | ||||||||||||    
T  9174285 gagactttgggtag 9174272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31850014 - 31849725
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  31850014 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggt 31849915  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31849914 cttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 31849815  T
Q  526 aacact-agggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31849814 aacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtag 31849725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 354 - 613
Target Start/End: Original strand, 9148198 - 9148459
Alignment:
Q  354 aataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--ta 451  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  9148198 aataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagata 9148296  T
Q  452 gagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 551  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9148297 gagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 9148396  T
Q  552 -cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9148397 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtag 9148459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 3825112 - 3824697
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3825112 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaagcactgg 3825014  T
Q  322 aaaaatc---------------------gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    |||||||                     |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3825013 aaaaatcatggcacaatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 3824914  T
Q  401 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 495  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3824913 caatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactag 3824816  T
Q  496 ggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaag 594  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  3824815 ggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaag 3824716  T
Q  595 aggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3824715 aggctgggactttgggtag 3824697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 336 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 40091820 - 40091542
Alignment:
Q  336 gatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 435  Q
    |||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091820 gatggtgcactgacagcgaataacgtaaacgtatttttcagtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaa 40091721  T
Q  436 agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactaggg 535  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40091720 agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatgg 40091621  T
Q  536 tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40091620 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 40091542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 329 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 36921907 - 36921620
Alignment:
Q  329 gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 428  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36921907 gtggcacgatggtgcattggcagcgaataacagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagacctt 36921808  T
Q  429 gtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aaca 525  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  36921807 gtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaaca 36921709  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36921708 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 36921620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 11006781 - 11006363
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagattt-atgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11006781 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttatgcagaatcgtggcacgatcgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcaattttttaggcaaggcactgg 11006682  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    ||||||||||||| |||||                     ||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11006681 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaag 11006582  T
Q  401 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 495  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11006581 caagacttttactataaatatagaccttgtatcaga-ctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 11006483  T
Q  496 ggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaa 593  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||    
T  11006482 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 11006383  T
Q  594 gaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11006382 gaggctgggactttgggtag 11006363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 619860 - 619574
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  619860 cgtggcacaatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtagagattttttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagacct 619761  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  619760 tgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaa 619661  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  619660 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtag 619574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44599964
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||    
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 44599975  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  44599974 actttgggtag 44599964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16934506 - 16934269
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16934506 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16934407  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-ga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||    
T  16934406 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16934307  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  16934306 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 16934269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 18847123 - 18847360
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18847123 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa 18847222  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-ga 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||    
T  18847223 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattgga 18847322  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  18847323 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 18847360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631546
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 8631560  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  8631559 gggactttgggtag 8631546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 328 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 52942860 - 52942598
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  52942860 cgtggcacgatgatgcgctggcagcgaataacataaacatattttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacct 52942761  T
Q  428 tgtat--caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    |||||  || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  52942760 tgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaaca 52942662  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52942661 aacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 52942598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484999
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 2485010  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  2485009 actttgggtag 2484999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 9176837 - 9176600
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176837 gcagatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9176738  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-ga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  9176737 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 9176638  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  9176637 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 9176600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16932152 - 16931915
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16932152 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16932053  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-ga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||    
T  16932052 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16931953  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  16931952 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 16931915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637280
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||  || ||    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgaga 40637270  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  40637271 ctttgggtag 40637280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348424
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 24348410  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  24348411 gggactttgggtag 24348424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765050
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  505 agaatttgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    ||| ||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 6765035  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||    
T  6765036 tgggactttgggtag 6765050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868607
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 47868597  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  47868598 ctttgggtag 47868607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 11008933 - 11008692
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtt 472  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  11008933 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 11008835  T
Q  473 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagga 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11008834 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 11008735  T
Q  572 tt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11008734 ttggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 11008692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633524
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cggaagagattggga 14633514  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  14633515 ctttgggtag 14633524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 405 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787562
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  503 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgg 601  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||     
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 14787570  T
Q  602 gactttgg 609  Q
    ||||||||    
T  14787569 gactttgg 14787562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928304
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||     
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggg 38928314  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  38928313 ctttgggtag 38928304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 613
Target Start/End: Original strand, 36378244 - 36378498
Alignment:
Q  360 agaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg 458  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| | || |  ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  36378244 agaaacgtatttttgggc-cagatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacgggg 36378342  T
Q  459 ctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttggg 557  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||     
T  36378343 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgga 36378442  T
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  36378443 aaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtag 36378498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132518
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  496 ggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaag 594  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctc-ttcgaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 22132537  T
Q  595 aggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22132536 aggctgggactttgggtag 22132518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453515
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggga 16453505  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  16453506 ctttgggtag 16453515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782864
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 22782864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395972
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  12395980 tttgggtag 12395972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780499
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtag 22780499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400934
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  || |||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  12400942 tttgggtag 12400934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709290
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtag 18709290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 406 - 596
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096072
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 19096072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313193
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||| |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  37313200 ttgggtag 37313193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030650
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  |||  ||    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  56030643 ttgggtag 56030650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662372
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt-- 17662477  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
             ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  17662476 ---------ttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagact 17662386  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  17662385 gggactttgggtag 17662372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 328 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 8756663 - 8756411
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8756663 cgtgccatgttggtgcgctggaggcgaataacagaaacatatttctcggtgcagatttgttccaaattataaacgatacttttactataaatatagacct 8756564  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaa 526  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||| | |||||    
T  8756563 tgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaa 8756466  T
Q  527 acactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 582  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  8756465 acactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctt 8756411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415615
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||  || | ||    
T  33415721 agtttgtctc-ttggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  33415622 ttgggtag 33415615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210879
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg-----------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggc 47210894  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||    
T  47210893 tgggactttgggtag 47210879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937336
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||  || | |    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  3937344 tttgggtag 3937336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405335
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  502 tatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctg 600  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctg 53405322  T
Q  601 ggactttgggtag 613  Q
     |||||| |||||    
T  53405323 agactttaggtag 53405335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134743
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-ttcaaacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtag 22134743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133078
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  6133070 tttgggtag 6133078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 410 - 593
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997678
Alignment:
Q  410 tactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaat 509  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  510 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaa 593  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaa 41997678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544165
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  502 tatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  |    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  13544152 gggactttgggtag 13544165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 474 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26086103
Alignment:
Q  474 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 572  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  573 tgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  26086143 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag 26086103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 412 - 613
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19322899
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 511  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  512 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttggg 610  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  || |||||||||    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtt--tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 406 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270162
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 564  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 38270162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409474
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||  || |||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    ||| |||||    
T  18409482 ttttggtag 18409474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 405 - 544
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 544  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 406 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446760
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 24446820  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 564  Q
    || |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 24446760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 406 - 525
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgta-tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  505 agaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537602
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttag-aaacaaacaac-aaactagggtttgtat 18537709  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggtt--ggggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    |||| |||||    
T  18537611 cttttggtag 18537602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9177035 - 9176918
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9177035 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 9176936  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  9176935 aaaatcgtggcacgatgg 9176918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 484 - 613
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380555
Alignment:
Q  484 caacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 582  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  583 ggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtag 36380555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16932360 - 16932243
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16932360 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 16932261  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  16932260 aaaatcgtggcacgatgg 16932243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16934716 - 16934597
Alignment:
Q  221 aatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 320  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  16934716 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacatggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 16934617  T
Q  321 gaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  16934616 gaaaaatcgtggcacgatgg 16934597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534960
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgttta-aaaacaaacaac-aaactagggtttgtat 18535067  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||  || ||    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgaga 18534970  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  18534969 ctttgggtag 18534960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 355 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 15032923 - 15032752
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 453  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||| || || |||| |||||||| |    
T  15032923 ataacagaatcgaatttttgggctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaa 15032824  T
Q  454 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  15032823 gggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa 15032752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22783319 - 22783200
Alignment:
Q  221 aatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 320  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22783319 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 22783220  T
Q  321 gaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  22783219 gaaaaatcatggcacgatgg 22783200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22780952 - 22780835
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22780952 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22780853  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  22780852 aaaatcatggcacgatgg 22780835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 491 - 588
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499226
Alignment:
Q  491 actagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttac 27499226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 521 - 613
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455447
Alignment:
Q  521 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtag 16455447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22044897 - 22044817
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt--gaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044897 aatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 22044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 355 - 478
Target Start/End: Original strand, 25357583 - 25357713
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaatttta--agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag 452  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  25357583 ataacagaatcgtatttttgggctcagatttgttccaa-ttttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagag 25357681  T
Q  453 ag-----ggggctg-aaacaagggtttagaaa 478  Q
    ||     ||||||| |||||||||||||||||    
T  25357682 agtgagaggggctgaaaacaagggtttagaaa 25357713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36920125 - 36920015
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  36920125 tgtgagagttaacttaaaatcaggttc-tgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaatttt-gaggcaagtcactgg 36920028  T
Q  322 aaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||    
T  36920027 aaaaatcgtggca 36920015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36922036 - 36921923
Alignment:
Q  220 taatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcac 318  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36922036 taatgtgagagttaacttaaaatcaggttc-tgcaaaatcgtggtacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcac 36921939  T
Q  319 tggaaaaatcgtggca 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  36921938 tggaaaaatcgtggca 36921923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22803270 - 22803162
Alignment:
Q  225 tgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaa 323  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |  | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22803270 tgagagttaacttaaaatcaaatttctatagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggaaaggcactggaa 22803172  T
Q  324 aaatcgtggc 333  Q
    ||||||||||    
T  22803171 aaatcgtggc 22803162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Original strand, 38408993 - 38409104
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  38408993 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactgg 38409091  T
Q  322 aaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||    
T  38409092 aaaaatcgtggca 38409104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11009007 - 11008932
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11009007 atcgtggcacgatggtgcactggcagcaaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagc 11008932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28453888
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||   |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgcag 28453783  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||  |||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||    
T  28453784 ag--tttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    | ||||||||    
T  28453879 ccttgggtag 28453888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890353
Alignment:
Q  488 aaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggtt 586  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  587 accggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    || |||||||  || ||||||||||||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtag 38890353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16186099
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaa 478  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Original strand, 18847049 - 18847111
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 388  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18847049 atcgtggcacgatggtgcgctcgcggggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgtt 18847111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 40999338 - 40999078
Alignment:
Q  350 ggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |   ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||     
T  40999338 ggcgaaaaacagaaacgtatctttcaggatagatttgttccaaattttaagggttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgagg 40999239  T
Q  450 tagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 548  Q
    |||| | | ||| |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||   ||||||||||||| ||    | |||||    
T  40999238 taga-gagtctgaaaacaagggtttag-acgtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt--gagattgat 40999144  T
Q  549 tca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| || || ||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||   | ||||||||||||    
T  40999143 tcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtag 40999078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 332
Target Start/End: Original strand, 18846923 - 18847034
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttat--gcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcact 319  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |   || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18846923 tgtgagagttaacttaaaatcagatttttctgcagaatcgtggcacgattgttgggaatcgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtact 18847021  T
Q  320 ggaaaaatcgtgg 332  Q
    |||||||||||||    
T  18847022 ggaaaaatcgtgg 18847034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 478
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102162
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctg-aaacaagggtttagaaa 478  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaa 12102162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22048542 - 22048492
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 306  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22048542 aatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 22048492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 552 - 613
Target Start/End: Original strand, 2891436 - 2891497
Alignment:
Q  552 cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  2891436 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 2891497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9176901 - 9176836
Alignment:
Q  336 gatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9176901 gatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttataaatttaaagc 9176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 613
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9863912
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag-agggggctg--aaacaagggtttagaaaagcaacaac-aaaactagggtttgtataga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttag-aagccaaaaacaaaaactagggtttg--taga 9863808  T
Q  508 atttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
     ||||| |||| | ||||||||||| ||||   || |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || |||||||  || |||||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggtt--gggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactt 9863905  T
Q  607 tgggtag 613  Q
    |||||||    
T  9863906 tgggtag 9863912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11009075 - 11009014
Alignment:
Q  280 cgtggcacgatggaggtttcagtttttg-aggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11009075 cgtggcacaatggaggtttcaatttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 11009014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31850101 - 31850033
Alignment:
Q  260 gtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatc 328  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31850101 gtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgg-ggcaaggcactggaaaaatc 31850033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 477
Target Start/End: Original strand, 16455284 - 16455356
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455284 acttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 48486146 - 48486212
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48486146 aatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactgga 48486212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 613
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547360
Alignment:
Q  555 gggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 13547360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 52043791 - 52043737
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043791 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 52043737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 340
Target Start/End: Original strand, 9148087 - 9148171
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9148087 aatcgtggtacgattgctgggcaacgtggcgcgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgg 9148171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 378 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22780744 - 22780687
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22780744 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 22780687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 378 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22783109 - 22783052
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22783109 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 22783052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 561 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556190
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 4556190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 434
Target Start/End: Original strand, 4569899 - 4569978
Alignment:
Q  354 aataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  4569899 aataacagaaacgtattttcag-tgaagatttgttccatattttaagggttactttcactataaatataagccttgtatca 4569978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050391
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 7050391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853597
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 11853597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 558 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185963
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtag 16185963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22134966 - 22134936
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134966 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 22134936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 544 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47151050
Alignment:
Q  544 ttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt 47151050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558359
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 4558359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529315
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 8529315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317006
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 15317006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831189
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 15831189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16689074
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggactt 16689074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587014
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 18587014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300472
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 31300472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52942974 - 52942910
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 320  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  52942974 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ctttgaggcaagtcactg 52942910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336916
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactt 5336916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 561 - 609
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699800
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggactttgg 25699800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822313
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 55822313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 145)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Original strand, 11170178 - 11170536
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaa 355  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  11170178 aatcgtggcacggttgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcggtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggctcgattgtgcgctggcggcgaa 11170277  T
Q  356 taacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg 455  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11170278 taacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagg 11170377  T
Q  456 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ctt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  11170378 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcacctt 11170477  T
Q  555 gggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11170478 gggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtag 11170536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 256 - 550
Target Start/End: Original strand, 11162924 - 11163218
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaa 355  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11162924 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaattgtggcacgatggtgcgctggcggcgaa 11163023  T
Q  356 taacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11163024 taacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagg 11163123  T
Q  456 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163124 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 35777163 - 35777554
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  35777163 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgacagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 35777262  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatata 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35777263 aaaatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacataaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatata 35777361  T
Q  423 gaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgga 522  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35777362 gacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgga 35777461  T
Q  523 acaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  35777462 acaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 35777554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18097422 - 18097025
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  18097422 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcatagg 18097324  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatggtg-cgc----tggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactata 416  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18097323 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatagtggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactata 18097224  T
Q  417 aatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtct 515  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18097223 aatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 18097124  T
Q  516 ctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18097123 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 18097025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22114842 - 22114430
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114842 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 22114743  T
Q  323 aaaat---------------------cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    |||||                     ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114742 aaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgatggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 22114643  T
Q  402 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22114642 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttg 22114543  T
Q  502 tatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctg 600  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22114542 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 22114443  T
Q  601 ggactttgggtag 613  Q
    ||| |||||||||    
T  22114442 ggattttgggtag 22114430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 3859372 - 3859660
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859372 atcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 3859471  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3859472 cttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 3859571  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3859572 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 3859660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 224 - 613
Target Start/End: Original strand, 5191374 - 5191785
Alignment:
Q  224 gtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5191374 gtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactgga 5191472  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatg---------------------gtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    |||||||||||| ||||                     |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  5191473 aaaatcgtggcacgatgggatctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagg 5191572  T
Q  402 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5191573 gaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 5191672  T
Q  502 tatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctg 600  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5191673 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 5191772  T
Q  601 ggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||    
T  5191773 ggactttgggtag 5191785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 222 - 613
Target Start/End: Original strand, 38889756 - 38890172
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagattta-tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 320  Q
    |||||||| ||||||| |||| || |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  38889756 atgtgagagttaacttaaaattaggttttctgcagaatcgtggtacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcattg 38889855  T
Q  321 gaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt----------------------ccaaatttta 398  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||                      ||||||||||    
T  38889856 gaaaaatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagcagatttgttccaaatttta 38889955  T
Q  399 agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  38889956 agcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaatta 38890052  T
Q  495 gggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaa 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38890053 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 38890152  T
Q  594 gaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  38890153 gagattgggactttgggtag 38890172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18099707 - 18099295
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18099707 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagacactgg 18099609  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    ||||||||||||| |||||                     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099608 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaacaatagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 18099509  T
Q  401 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 499  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18099508 cgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 18099410  T
Q  500 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18099409 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 18099310  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||    
T  18099309 tgggactttgggtag 18099295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 281 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 6066254 - 6065920
Alignment:
Q  281 gtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgca 380  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || || | ||| ||||||||||| |||    
T  6066254 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaatgtatttttgggagca 6066156  T
Q  381 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaa 479  Q
    |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6066155 gatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaag 6066056  T
Q  480 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gact 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |    
T  6066055 gcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 6065956  T
Q  578 ctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6065955 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 6065920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 310 - 613
Target Start/End: Original strand, 18162492 - 18162795
Alignment:
Q  310 gcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttt 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18162492 gcaagtcactggaaaaatcgtgccacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttt 18162591  T
Q  410 tactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18162592 tactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagataga--gggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 18162689  T
Q  509 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggacttt 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  18162690 tttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 18162789  T
Q  608 gggtag 613  Q
    ||||||    
T  18162790 gggtag 18162795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10084806 - 10084514
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10084806 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagac 10084707  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg 521  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10084706 cttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 10084607  T
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10084606 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 10084514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 45882785 - 45883071
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45882785 cgtggcacgatggtgcgctgacaacgaataacagaaacctatttttgggtgcagatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 45882884  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45882885 tgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaa 45882984  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45882985 caataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtag 45883071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 48362153 - 48361796
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48362153 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaagtttcagtttt-gaggcaagtaactagatttttcgtggcatgatggtgcgctggcagcga 48362055  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  48362054 atagcagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacag 48361955  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-t 553  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  48361954 ggggctgaaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacat 48361856  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||| |||| |||||    
T  48361855 tgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtag 48361796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 32264454 - 32264164
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32264454 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 32264355  T
Q  428 tgtatcaaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaa 523  Q
    ||||||| || |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32264354 tgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaa 32264255  T
Q  524 caaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  32264254 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtag 32264164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10956440 - 10956152
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  10956440 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagac 10956341  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10956340 cttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 10956241  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10956240 aacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 10956152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 26720392 - 26720679
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26720392 atcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttagtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagac 26720491  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26720492 cttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaaca 26720591  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26720592 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 26720679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10191726 - 10191435
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10191726 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 10191627  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg 521  Q
    ||||||||  ||||||||||    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10191626 cttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttgg 10191527  T
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10191526 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtag 10191435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 5523028 - 5522751
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5523028 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 5522929  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||    
T  5522928 cttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt-----------ttgtctcttcggaaca 5522840  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5522839 aacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 5522751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10958736 - 10958448
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  10958736 atcgtggcacgatggtgcgctggcagccaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagac 10958637  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10958636 cttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 10958537  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  10958536 aacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtag 10958448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 327 - 613
Target Start/End: Original strand, 24979552 - 24979839
Alignment:
Q  327 tcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacc 426  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||    
T  24979552 tcgtggcacgatggtacgctggtagcgaataacataaacatattttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatatacc 24979651  T
Q  427 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaa 526  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24979652 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 24979751  T
Q  527 acactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  || ||||||||||||    
T  24979752 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtag 24979839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308406
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga 4308416  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  4308415 ctttgggtag 4308406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228423
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 43228413  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  43228414 ctttgggtag 43228423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 50493895 - 50494132
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493895 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 50493994  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-ga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  50493995 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 50494094  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  50494095 gtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtag 50494132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 6063809 - 6063570
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6063809 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttag 6063710  T
Q  476 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt- 573  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  6063709 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6063610  T
Q  574 gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6063609 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 6063570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 369 - 613
Target Start/End: Original strand, 15780747 - 15781003
Alignment:
Q  369 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15780747 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaag 15780846  T
Q  469 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag-----------aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgg 556  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15780847 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 15780946  T
Q  557 gaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  15780947 gaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtag 15781003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 357 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 12268348 - 12268089
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 456  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12268348 aacagagacgtatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagaggg 12268249  T
Q  457 ggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac-aaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
     ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12268248 agctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 12268149  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  12268148 tcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag 12268089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226217
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta-cgtttgtat 43226107  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 43226207  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  43226208 ctttgggtag 43226217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 412 - 613
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6561942
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  512 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttggg 610  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  611 tag 613  Q
    |||    
T  6561940 tag 6561942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51727132
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgaga 51727142  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  51727141 ctttgggtag 51727132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4104020
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 4104034  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  4104033 gggactttgggtag 4104020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 256 - 610
Target Start/End: Original strand, 32218869 - 32219213
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| | |||||     ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32218869 aatcgtggcacgatgattgggcaacgtggcacgattggaggtttcaacttt-gaggcaagtcgctggattttccgtggcacgatggtgcgctggcagcga 32218967  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  32218968 ataagagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagag 32219067  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||           |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  32219068 ggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcacct 32219156  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttggg 610  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  32219157 tgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttggg 32219213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423588
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  43423596 tttgggtag 43423588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626808
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  1626816 tttgggtag 1626808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101306
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaat 27101320  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  27101319 gggactttgggtag 27101306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30005973
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtag 30005973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 406 - 612
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314815
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |    
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  605 tttgggta 612  Q
    ||||||||    
T  3314808 tttgggta 3314815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 746674 - 746890
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 746873  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
      |||||||||||||||    
T  746874 attgggactttgggtag 746890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313541
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggga 1313531  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  1313532 ctttgggtag 1313541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 379 - 613
Target Start/End: Original strand, 38210265 - 38210503
Alignment:
Q  379 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttag 475  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210265 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcag-gctattttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 38210363  T
Q  476 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt- 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  38210364 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 38210463  T
Q  574 gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    || |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  38210464 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 38210503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 25533357 - 25533574
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25533357 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25533456  T
Q  497 gtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaaga 595  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  25533457 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaaga 25533556  T
Q  596 ggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  25533557 ggctgagactttgggtag 25533574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990436
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 42990436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456040
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||      
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 456025  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||    
T  456026 tgggactttgggtag 456040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458417
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||      
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 458402  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||    
T  458403 tgggactttgggtag 458417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943503
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||     
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggg 51943493  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    |||| |||||    
T  51943494 ctttaggtag 51943503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917789
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 53917799  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
     |||||||||    
T  53917798 ttttgggtag 53917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926889
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    ||| |||||    
T  5926897 ttttggtag 5926889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100166
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||| |    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  28100174 tttgggtag 28100166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28102127
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  28102135 tttgggtag 28102127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35918068
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaa------acactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    ||| ||||||||||||||||||      ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||     
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagaga 35918084  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| |||||||||    
T  35918083 ctgggaatttgggtag 35918068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621654
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 10621654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915621
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 53915631  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  53915630 ctttgggtag 53915621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 326 - 478
Target Start/End: Original strand, 1321285 - 1321437
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1321285 atcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 1321384  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 478  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321385 tttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956818
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtag 29956818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880576
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||  ||||     
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  880585 ctttgggtag 880576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 25388794 - 25389038
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---------gagatagagggggctgaaacaag 468  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||          |||| |||| | |||||||||||    
T  25388794 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctattttgagagagagagagagagagagagctgaaacaag 25388892  T
Q  469 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgtta 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  25388893 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaacactatta 25388992  T
Q  569 ggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25388993 ggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 25389038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715601
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 39715591  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  39715592 ctttgggtag 39715601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 407 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421560
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaa 593  Q
      |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaa 43421560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 406 - 609
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181150
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  605 tttgg 609  Q
    |||||    
T  28181146 tttgg 28181150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36011959
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  || |||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  36011951 tttgggtag 36011959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992417
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  |    
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt 42992404  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||||    
T  42992405 -ggactttgggtag 42992417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 329 - 585
Target Start/End: Original strand, 24177126 - 24177380
Alignment:
Q  329 gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 428  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  24177126 gtggcacgatggtgcgttggaggcgaaaaacataaacgtatttttaagtgcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagacctt 24177225  T
Q  429 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||    
T  24177226 gtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagatgt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaa 24177323  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||||| ||||   ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24177324 cactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468582
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaacca-ggtttgtata 53468690  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  605 tttgggta 612  Q
    ||||||||    
T  53468589 tttgggta 53468582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 9604946 - 9604732
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9604946 actttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9604848  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  9604847 ttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagg 9604748  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
     || ||||||||||||    
T  9604747 ttgagactttgggtag 9604732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 355 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 28761813 - 28761572
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagattt-gttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 453  Q
    |||||| |||| ||||||||||   |||||| ||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||    
T  28761813 ataacaaaaacatatttttgggctgagattttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagataga 28761714  T
Q  454 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-c 552  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  28761713 gggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcacc 28761615  T
Q  553 ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaaga 595  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28761614 ttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaaga 28761572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47149020
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 47149034  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||    
T  47149033 gggtctttgggtag 47149020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 472 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413156
Alignment:
Q  472 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagg 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  571 attg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 28413156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 486 - 613
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321611
Alignment:
Q  486 acaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttgg 584  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  585 ttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtag 1321611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 223 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6719651 - 6719471
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgg---aggtttcagtttttgaggcaaggcact 319  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |   |||||||||||||| |||||| |||||    
T  6719651 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcttaatcgtggcacgattgaagggcatcgtggcacgattggagaggtttcagttttt-aggcaatgcact 6719553  T
Q  320 ggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  6719552 ggaaaaatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgatacagattttaagc 6719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691716
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | |||||||  |||||||    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagag 54691716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 447 - 573
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  447 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  547 attca-cttgggaaacactgttaggatt 573  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889898
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaaca--aaacctagggtttgtata 890007  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||     
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-gttgggg 889908  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  889907 ctttgggtag 889898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 406 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggt 536  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 407 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674895
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||             
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaagg--------- 51674997  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| |    
T  51674996 --tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137431
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||    
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-----------ta 28137540  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||  |||| |    
T  28137539 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 355 - 613
Target Start/End: Original strand, 23633332 - 23633586
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 453  Q
    |||||||||||||||||| | |   ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  23633332 ataacagaaacgtattttcgagcctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga 23633431  T
Q  454 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcact 553  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||     
T  23633432 gagggctaaaacaaggatttag-aagccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgatttac- 23633526  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||    
T  23633527 cgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 23633586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151477
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| ||  ||||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  31151467 actttgggtag 31151477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 407 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635830
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggt 536  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 407 - 535
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactaggg 535  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 406 - 588
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884262
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||    
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--ta 54884178  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttac 54884262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6064006 - 6063889
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  6064006 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttatgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacaatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 6063907  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  6063906 aaaatcgtggcacgatgg 6063889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10192513 - 10192413
Alignment:
Q  239 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgat 338  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10192513 aaatcagatttatgcggaatcgtggcacgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 10192415  T
Q  339 gg 340  Q
    ||    
T  10192414 gg 10192413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 504 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606712
Alignment:
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  7606722 actttgggtag 7606712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10085593 - 10085493
Alignment:
Q  239 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgat 338  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10085593 aaatcagatttatgcggaatcgtggcatgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 10085495  T
Q  339 gg 340  Q
    ||    
T  10085494 gg 10085493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 406 - 588
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591291
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||            
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactaggg-------- 53591210  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  53591211 ---tttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttac 53591291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 585
Target Start/End: Original strand, 53597119 - 53597340
Alignment:
Q  361 gaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc 459  Q
    ||||||||||||||||   | || |||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||     
T  53597119 gaaacgtatttttgggctgaaatatgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-gggga 53597217  T
Q  460 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttggga 558  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||     ||||||||| |||||||    
T  53597218 tgaaacaagggttta-taagtcaacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--gaagttgattcaccttggga 53597313  T
Q  559 aacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||    
T  53597314 aacactattaggattgagtctcttggt 53597340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 525
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  507 aatttgtctctttggaaca 525  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Original strand, 50493675 - 50493793
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  50493675 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 50493774  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  50493775 aaaaatcgtggcacgatgg 50493793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 38210067 - 38210184
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  38210067 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38210166  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  38210167 aaaatcgtggcacgatgg 38210184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 355 - 583
Target Start/End: Original strand, 23636899 - 23637125
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 453  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| ||| ||| | || || | ||||| |||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||    
T  23636899 ataacagaaacatatttttcggcctagatttgtttcaattttatgagggataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagataga 23636998  T
Q  454 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-c 552  Q
    || |||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| | |    
T  23636999 ggaggctaaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtt--tgggttgatttacc 23637094  T
Q  553 ttgggaaacactgttaggattgactctcttg 583  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  23637095 ttgagaaacactattaggattgagtctcttg 23637125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 53896754 - 53896637
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  53896754 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggtactgga 53896655  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  53896654 aaaatcgtggcacgatgg 53896637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420311
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||| |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 13420321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 378 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 53896557 - 53896475
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 460  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896557 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 340
Target Start/End: Original strand, 5899476 - 5899576
Alignment:
Q  240 aatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatg 339  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899476 aatcaggtttctgcataatcatggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcatggcacgatg 5899575  T
Q  340 g 340  Q
    |    
T  5899576 g 5899576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 533 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688286
Alignment:
Q  533 gggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtag 25688286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7606963 - 7606880
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 306  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606963 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 7606880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871427
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| | | |  || ||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  512 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttggg 610  Q
    | ||||| | ||||||||| |||||| |  | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||  ||||||||||||    
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttggg 36871430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560502
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactagagtttgt 4560502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 613
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666646
Alignment:
Q  445 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 544  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||           |||||   |||| ||||||||||||| ||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggtttgt-----------ctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  545 tgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  4666577 tgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtag 4666646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 357 - 436
Target Start/End: Original strand, 13893269 - 13893347
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 436  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13893269 aacagaaacgtattttcag-tgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 5885983 - 5886101
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaa-cgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| |||| || ||| | || |||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  5885983 tgtgagagttaacttaaaattaggtttttacagaatcgtggcacgattgaagcgcaaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggtactgg 5886082  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  5886083 aaaaatcgtggcacgatgg 5886101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 439
Target Start/End: Original strand, 5886181 - 5886242
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 439  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5886181 gcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5886242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6719457 - 6719396
Alignment:
Q  393 attttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6719457 attttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674104
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||  ||||||||||||    ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaagtt-aacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  503 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcact-tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgg 601  Q
    ||| | |||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||  |||    
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgg 1674092  T
Q  602 gactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||    
T  1674093 gactttgggtag 1674104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 495 - 613
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484492
Alignment:
Q  495 gggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccgga 592  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  593 agaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||  ||||  |||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtag 6484492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Original strand, 25388654 - 25388714
Alignment:
Q  280 cgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25388654 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 25388714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 46967024 - 46966940
Alignment:
Q  350 ggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    |||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  46967024 ggcgaaaaacagaaacatatttttcaatgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaacattgtatca 46966940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561902
Alignment:
Q  489 aaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggtta 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  588 ccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |  ||||||  || ||||||||||||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtag 561902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32264581 - 32264481
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataa-tcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcact 319  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32264581 atgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcagaaatcgtggcacgatggctggg-aacgtggcacgattggaggtttcagtttttgaggcaagtcact 32264484  T
Q  320 gga 322  Q
    |||    
T  32264483 gga 32264481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 439
Target Start/End: Original strand, 5899656 - 5899717
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 439  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899656 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 613
Target Start/End: Original strand, 11168172 - 11168233
Alignment:
Q  552 cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11168172 cttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtag 11168233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 526 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560409
Alignment:
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||  |||  ||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtag 4560409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 489 - 613
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635513
Alignment:
Q  489 aaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggtta 587  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  588 ccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    | |||||||  || ||||||||||||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtag 25635513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 470  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 613
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6231932
Alignment:
Q  530 ctagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtag 6231932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 1619018 - 1618916
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttag 475  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1619018 agatttgttccaattttatgagggatactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttag 1618919  T
Q  476 aaa 478  Q
    |||    
T  1618918 aaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5523119 - 5523041
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5523119 aatcgtggcaagattgctgggcaacatggcacgattggtggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggca 5523041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 271
Target Start/End: Original strand, 3859315 - 3859365
Alignment:
Q  221 aatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatgg 271  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3859315 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacgatgg 3859365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 613
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886331
Alignment:
Q  543 gttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag 5886331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 282 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10956505 - 10956453
Alignment:
Q  282 tggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10956505 tggcacgattggaggtttcagttttgg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggca 10956453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303358
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094208
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 10094208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100225
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 10100225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201088
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 10201088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462251
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 16462251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626118
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 22626118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883016
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 47883016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25690690 - 25690651
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 444  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25690690 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt 25690651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 543 - 613
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899804
Alignment:
Q  543 gttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtag 5899804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 585
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  489 aaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |   || |||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 434
Target Start/End: Original strand, 26762863 - 26762917
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26762863 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatataaaccttgtatca 26762917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 603
Target Start/End: Original strand, 4535614 - 4535659
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  4535614 aaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga 4535659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10621876 - 10621847
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621876 acttttactataaatatagaccttgtatca 10621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897053
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggactt 10897053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 16996681 - 16996758
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| || ||   ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16996681 aacagaaacatatttttgggcctggatttgttccaaatttttagggatggttttaatataaatataaaccttgtatca 16996758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031452
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 20031452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29914087
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 29914087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 31021479 - 31021450
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021479 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 31021450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 42990205 - 42990234
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990205 acttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878305
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 47878305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193274
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 54193274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 357 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 562144 - 562069
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 432  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  562144 aacagaaacgtattttcgggc-cagatttgttccatttttataagggataattttactataaatatagactttgtat 562069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208134
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 10208134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 271
Target Start/End: Original strand, 25388618 - 25388666
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatgg 271  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  25388618 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatgg 25388666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27101594 - 27101558
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa 441  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27101594 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaa 27101558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 112)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 6822775 - 6823166
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6822775 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 6822874  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatat 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6822875 aaaaatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatagaaatgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatat 6822974  T
Q  422 agaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg 521  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  6822975 agaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagg 6823074  T
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  6823075 aacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtag 6823166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 51749778 - 51750191
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51749778 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggtacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51749877  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    ||||||||||||| |||||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749878 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatagtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 51749977  T
Q  401 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51749978 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 51750077  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51750078 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 51750177  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  51750178 gggactttgggtag 51750191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 13761577 - 13761989
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761577 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 13761676  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    |||||||||||| |||||                     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761677 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgcggcacgatggtgtgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 13761776  T
Q  402 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13761777 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttg 13761876  T
Q  502 tatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctg 600  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  13761877 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctg 13761976  T
Q  601 ggactttgggtag 613  Q
     ||||||||||||    
T  13761977 tgactttgggtag 13761989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 20302198 - 20302611
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20302198 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgcggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 20302297  T
Q  322 aaaaat---------------------cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    ||||||                     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20302298 aaaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcatatttgttccaaattttaag 20302397  T
Q  401 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20302398 tgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 20302497  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  20302498 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagact 20302597  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||||    
T  20302598 aggactttgggtag 20302611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 51752104 - 51752516
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51752104 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51752203  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatg---------------------gtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    ||||||||||||| ||||                     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752204 aaaaatcgtggcacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 51752303  T
Q  401 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| ||    
T  51752304 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggctt 51752403  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51752404 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggct 51752502  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    | ||||||||||||    
T  51752503 gagactttgggtag 51752516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 251 - 588
Target Start/End: Original strand, 6823651 - 6824012
Alignment:
Q  251 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatg---------- 339  Q
    |||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  6823651 tgcagaatcatggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggggtcgcatc 6823750  T
Q  340 -----------gtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 428  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6823751 gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagacctt 6823850  T
Q  429 gtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6823851 gtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 6823950  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  6823951 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttac 6824012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 15823410 - 15823698
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15823410 atcgtggcacgatggtgcgctagcagcaaataacagaaacatatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 15823509  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15823510 cttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 15823609  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15823610 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 15823698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Original strand, 28840451 - 28840832
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaat---------------------cgtggc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||                     ||||||    
T  28840451 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttt-aggcaaggtactggaaaaattgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 28840549  T
Q  334 atgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatc 433  Q
    | ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840550 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 28840649  T
Q  434 aaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacact 531  Q
    | ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28840650 agagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacact 28840749  T
Q  532 agggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28840750 agggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 28840832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 13214947 - 13215233
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| ||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13214947 cgtggcacgatggtgtgttggcagcaaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 13215046  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13215047 tgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 13215146  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  13215147 cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 13215233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 38925965 - 38925607
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||    | |||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  38925965 aatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gagacaagttactggattttttgtggcacgatggggcgttggcagcga 38925867  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38925866 acaacagaagtgtatttttgggtgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 38925767  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38925766 ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 38925667  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  38925666 tggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 38925607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 10400245 - 10399957
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10400245 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagac 10400146  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10400145 cttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 10400046  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  10400045 aacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtag 10399957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 28842357 - 28842647
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28842357 atcgtggcacgatggtgtcctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaac 28842456  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaa 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28842457 cttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa 28842556  T
Q  524 caaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28842557 caaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtag 28842647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 41646786 - 41647072
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41646786 cgtggcacgatggtgcactggcagcgaataacagaaacatatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 41646885  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41646886 tgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 41646985  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| || |||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  41646986 cacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtag 41647072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 328 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 28207481 - 28207212
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28207481 cgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtttttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 28207382  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  28207381 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaa 28207282  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  28207281 cactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagag 28207212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 329 - 613
Target Start/End: Original strand, 39462385 - 39462671
Alignment:
Q  329 gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  39462385 gtggcacgatggtgcgcttgcagtgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacct 39462484  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39462485 tgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 39462584  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  39462585 cactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 39462671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 223 - 552
Target Start/End: Original strand, 47451405 - 47451738
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataa-tcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggc-act 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    ||     
T  47451405 tgtgagagttaacttcaaatcagattt-tgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaatgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaatataca 47451502  T
Q  320 ggaaaa---atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactata 416  Q
     || |    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47451503 tgagatcgcatcgtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtattttttggtgcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactata 47451602  T
Q  417 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctc 516  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47451603 aatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 47451702  T
Q  517 tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 552  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47451703 ttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 47451738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 259 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 14098453 - 14098116
Alignment:
Q  259 cgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaata 357  Q
    |||||||||||||    ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||    |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  14098453 cgtggcacgatggttgagcaccgtggcacgattggaggtttcagcttt-gacgcaagtcactggatttttcgttgcacgatggtgcgctggcagcgaata 14098355  T
Q  358 acagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 457  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14098354 acataaacgtatttttgggtgcagatt-gttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagagggg 14098256  T
Q  458 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgg 556  Q
     ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14098255 actgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgg 14098156  T
Q  557 gaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14098155 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 14098116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 380 - 613
Target Start/End: Original strand, 16226085 - 16226320
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 479  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16226085 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaa 16226184  T
Q  480 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gact 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |    
T  16226185 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 16226284  T
Q  578 ctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  16226285 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 16226320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617668
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  2617660 tttgggtag 2617668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 328 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 3580033 - 3579746
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3580033 cgtggcacgatggtgcgctggcggcgaatatcataaacgtattttagagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagacct 3579934  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagag--ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    |||||||  | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  3579933 tgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 3579834  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggta 612  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | |||||  |||| |||||||||    
T  3579833 aacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggta 3579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 380 - 613
Target Start/End: Original strand, 47179627 - 47179866
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttag 475  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47179627 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47179726  T
Q  476 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt- 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  47179727 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 47179826  T
Q  574 gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  47179827 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 47179866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948317
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctggga 21948327  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  21948326 ctttgggtag 21948317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 380 - 613
Target Start/End: Original strand, 47177276 - 47177515
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttag 475  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47177276 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47177375  T
Q  476 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat-t 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      
T  47177376 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgg 47177475  T
Q  574 gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  47177476 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 47177515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 50767522 - 50767747
Alignment:
Q  14 agtggcctggtgtggataatgaaatatgaatgaatggaatgagatagatggtgcatttttaaattgtacagatgaaaacaaaagacaaatggaataagga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50767522 agtggcctggtgtggataatgaaatatgaatgaatggaatgagatagatggtgcatttttaaattgtacagatgaaaacaaaagacaaatggaataagga 50767621  T
Q  114 cgaaatattcatgaaaaata-----------------tcacaagggataccgtcataacatgttacattagtagnnnnnnngtaaattcacaaacatctt 196  Q
    ||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||    
T  50767622 cgaaatattcatgaaaaatatctctctcaggacgccttcacaagggataccgtcataacatgttacattactagtttttttgtaaattcacaaacatctt 50767721  T
Q  197 tctctaactatataaaagttaattaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  50767722 tctctaactatataaaagttaattaa 50767747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 395 - 613
Target Start/End: Original strand, 20291390 - 20291609
Alignment:
Q  395 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20291390 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 20291489  T
Q  495 gggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaa 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  20291490 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 20291589  T
Q  594 gaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  20291590 gagactaggactttgggtag 20291609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325815
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  497 gtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaaga 595  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 24325797  T
Q  596 ggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  24325798 ggctgtgactttgggtag 24325815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735650
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggct 31735664  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  31735663 gggactttgggtag 31735650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932225
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagac 39932216  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  39932217 tttgggtag 39932225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307261
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  18307254 ttgggtag 18307261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 405 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27337069
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  27337180 ttatag-atttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggct 27337082  T
Q  600 gggactttgggta 612  Q
    | |||||||||||    
T  27337081 gtgactttgggta 27337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995829
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||     
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 6995839  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  6995838 ctttgggtag 6995829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302634
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  500 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||      
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 12302649  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||| |||||    
T  12302648 tgggactttaggtag 12302634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665330
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttacc-ggaagag 596  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagag 48665313  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||    
T  48665314 gctgggactttgggtag 48665330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186257
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||  | | ||    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  17186265 tttgggtag 17186257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15294963
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 15295084  T
Q  494 agggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccgga 592  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  15295083 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 15294984  T
Q  593 agaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  15294983 agaggttgggactttgggtag 15294963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324765
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 17324775  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  17324774 ctttgggtag 17324765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998382
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||     
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 28998392  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  28998391 ctttgggtag 28998382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29004098
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||     
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 29004108  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  29004107 ctttgggtag 29004098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307675
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||     
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  50307684 ctttgggtag 50307675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 379 - 613
Target Start/End: Original strand, 16428569 - 16428805
Alignment:
Q  379 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||   || ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428569 cagatttgttcgaattttataagggatacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 16428668  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 576  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  16428669 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 16428768  T
Q  577 tctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  16428769 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 16428805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339259
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggct 27339273  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    | ||||||||||||    
T  27339272 gagactttgggtag 27339259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 454 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431836
Alignment:
Q  454 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-c 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  553 ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtag 46431836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076801
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||     
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  50076809 tttgggtag 50076801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251404
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
      |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  25251411 ttgggtag 25251404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463372
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9463389  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
      || ||||||||||||    
T  9463388 attgagactttgggtag 9463372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510453
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||  |    
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatt 2510467  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||||    
T  2510466 tggactttgggtag 2510453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131509
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtag 4131509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839739
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  || |||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  18839731 tttgggtag 18839739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906422
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 47906406  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
     |||| ||||||||||    
T  47906407 ttggggctttgggtag 47906422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078950
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  | ||||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  50078958 tttgggtag 50078950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 359 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 9241470 - 9241215
Alignment:
Q  359 cagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  | |  ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||    
T  9241470 cagaaacgtatttttgggt-cagatttgttccaattttatgggggttacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagagggg 9241372  T
Q  458 g-ctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttg 555  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9241371 ggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 9241273  T
Q  556 ggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||    
T  9241272 gaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtag 9241215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459545
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9459562  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
      || ||||||||||||    
T  9459561 attgagactttgggtag 9459545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 406 - 609
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490061
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  || |||    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  605 tttgg 609  Q
    |||||    
T  31490057 tttgg 31490061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248701
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||   | |||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  50248709 tttgggtag 50248701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 369 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31423248 - 31423002
Alignment:
Q  369 tttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaa 467  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |  | || ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31423248 tttttgggt-cagatttgttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa 31423150  T
Q  468 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactg 565  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||     
T  31423149 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacacta 31423050  T
Q  566 ttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  31423049 ttagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 31423002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756678
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  505 agaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||  ||||||  ||||    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga--gtcttgattacgagaagagattggg 6756667  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  6756668 actttgggtag 6756678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425144
Alignment:
Q  427 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aaca 525  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga---ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtag 31425144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457604
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||  |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||      
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  11457612 tttgggtag 11457604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 378 - 502
Target Start/End: Original strand, 16231517 - 16231641
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16231517 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaa 16231616  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  16231617 aagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319039
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||      |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggact 17319031  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  17319032 ttgggtag 17319039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949360
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||| ||  ||||     
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattgggg 2949370  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  2949369 ctttgggtag 2949360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128024
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||  || |||||| |||||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtag 25128024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 418
Target Start/End: Original strand, 49687334 - 49687496
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||| |||||||||||| | ||||    
T  49687334 aatcgtggcatgatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatggtgcgctgacagcga 49687432  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa 418  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49687433 ataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaa 49687496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 329 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 30790808 - 30790658
Alignment:
Q  329 gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 428  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30790808 gtggcacgatggtgcgctggaggggaaaaacataaacgtatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacatt 30790709  T
Q  429 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 478  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  30790708 gtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 30790658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 406 - 612
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324214
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||  |||||||  ||| ||    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  605 tttgggta 612  Q
    ||||||||    
T  17324207 tttgggta 17324214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 613
Target Start/End: Original strand, 42922138 - 42922382
Alignment:
Q  367 tatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac 465  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| |||||     
T  42922138 tatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaat 42922237  T
Q  466 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 564  Q
    |||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||    |||||||||| |||| |||| |||    
T  42922238 aagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt--gaggttgattcaccttgcgaaaaact 42922333  T
Q  565 gttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  42922334 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtag 42922382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 251 - 401
Target Start/End: Original strand, 16231369 - 16231518
Alignment:
Q  251 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcg 350  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231369 tgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatggtgcgctggcg 16231468  T
Q  351 gcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    |  || || | |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16231469 gataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagc 16231518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 455 - 596
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134079
Alignment:
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagag 40134079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 222 - 328
Target Start/End: Original strand, 20291279 - 20291386
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-tttttgaggcaaggcactg 320  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20291279 atgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacggtggaggtttcagttttttgaggcatggcactg 20291378  T
Q  321 gaaaaatc 328  Q
    ||||||||    
T  20291379 gaaaaatc 20291386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 406 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183738
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttag-aatgcaaca--caaactagggtttgtata 14183827  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagag 14183738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 407 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 47179428 - 47179545
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  47179428 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 47179527  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  47179528 aaaatcgtggcacgatgg 47179545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 405 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800734
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttag-aagtcaacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctct 581  Q
    ||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||   ||||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||    
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggtt--ggggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctct 18800734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Original strand, 16225895 - 16226004
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 330  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16225895 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 16225994  T
Q  331 ggcatgatgg 340  Q
    |||| |||||    
T  16225995 ggcacgatgg 16226004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 47177078 - 47177194
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  47177078 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacgactgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttg-ggcaagacactgga 47177176  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  47177177 aaaatcgtggcacgatgg 47177194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 379 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8349414 - 8349219
Alignment:
Q  379 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 476  Q
    |||||||||||||| ||| | || || | ||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8349414 cagatttgttccaattttatgagggataattttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttag- 8349316  T
Q  477 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 575  Q
    ||  |||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8349315 aagtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggtttattcaccttgggaaacactattaggattga 8349219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347402
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    ||||  ||| ||||| | ||||||||| | ||||   ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| | || |||||||  || |    
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgag 8347413  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||| ||||    
T  8347412 actttgagtag 8347402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 340
Target Start/End: Original strand, 28842266 - 28842350
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28842266 aatcgtggcacgatggcaaggctacgtggcacgattggaggtttcagttttt-aggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatgg 28842350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669523
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | |  ||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttgggag-gcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  503 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgg 601  Q
    ||| | |||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  ||     
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 15669535  T
Q  602 gactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||    
T  15669534 gactttgggtag 15669523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 453 - 613
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432546
Alignment:
Q  453 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca- 551  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  552 cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||  |||||||||||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtag 16432546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 23783238 - 23783355
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  23783238 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 23783337  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  23783338 aaaatcgtggcacgatgg 23783355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495468
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 474  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggttta 49495468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125588
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt-gtatagaatt 510  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| || ||  ||||||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaag-aagccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  511 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |  |||||||  |||||||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt--gaggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520277
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaat 509  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  510 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | ||    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--gaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggt 26520277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 613
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757683
Alignment:
Q  553 ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 51757683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231716
Alignment:
Q  529 actagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtag 16231716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 444
Target Start/End: Original strand, 23783467 - 23783533
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 444  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783467 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 26613603 - 26613503
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 476  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26613603 agatttgttccaatttttgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttaga 26613504  T
Q  477 a 477  Q
    |    
T  26613503 a 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 15823319 - 15823397
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15823319 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactagaaaaatcgtggca 15823397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10400369 - 10400268
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  10400369 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactgg 10400271  T
Q  322 aaa 324  Q
    |||    
T  10400270 aaa 10400268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  439 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 478  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 13214854 - 13214920
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13214854 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactgga 13214920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 457
Target Start/End: Original strand, 16431017 - 16431096
Alignment:
Q  379 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 457  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16431017 cagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 609
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155854
Alignment:
Q  544 ttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttgg 155854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 551 - 613
Target Start/End: Original strand, 16429047 - 16429109
Alignment:
Q  551 acttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  16429047 acttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtag 16429109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 611
Target Start/End: Original strand, 27916415 - 27916644
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggc--tgaaacaagggtttaga 476  Q
    ||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || | ||    ||||||||||||||     
T  27916415 agatttgttccaattttggagggatacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttag- 27916513  T
Q  477 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 575  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  27916514 aagccagcaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggaattgattcaccttggaaaacactattagaattga 27916608  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggt 611  Q
     ||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||    
T  27916609 gtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggt 27916644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 43104053 - 43104131
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaatttta-agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||  ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104053 aacagaaacatatttttgggcttagatttgttccagttttttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 43104131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248681
Alignment:
Q  529 actagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||  || |||||| |||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtag 25248681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232645
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 2232645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 420
Target Start/End: Original strand, 46782919 - 46783010
Alignment:
Q  329 gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaata 420  Q
    ||||||||||||  |||||  ||| || |||||||| | | ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  46782919 gtggcatgatggaacgctgaaggcaaaaaacagaaatgcacttttaagtgcatatttgttccaaattttaagggttacttttactataaata 46783010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2401568 - 2401494
Alignment:
Q  361 gaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttt-tactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  2401568 gaaacgtatttttcagtgaagatttgttccatattttaagggatactttccactataaatataagccttgtatca 2401494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 596
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997078
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 14997078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401355
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 2401355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3580126 - 3580050
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtgg 332  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  3580126 aatcgtggcacgattgcagggcaacgtgacacaattggatgtttcag-ttatgaggcaagtcattggaaaaatcgtgg 3580050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526514
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 9526514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127837
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||| |||||| |||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  512 gtctctttggaacaaacactagggtt 537  Q
      || || | ||||||||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt 13127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353480
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 21353480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23785992
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 23785992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134119
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25134119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 30738963 - 30738890
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 478  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30738963 cttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaa 30738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 46432066 - 46432037
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432066 acttttactataaatatagaccttgtatca 46432037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 434
Target Start/End: Original strand, 49958963 - 49959016
Alignment:
Q  381 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    |||||||||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49958963 gatttgttccaaattttgtgggatgcttttgctataaatatagaccttgtatca 49959016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 116)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1049780 - 1049422
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1049780 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaagcaaggtactggaaaaatcgtggcacgaaggtgcgctggcggcga 1049682  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1049681 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagag 1049582  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1049581 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcacct 1049482  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1049481 tgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 1049422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 40837261 - 40836869
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40837261 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggtcggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 40837162  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgg-gtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatat 421  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40837161 aaaatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaatagaaacatattttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatat 40837062  T
Q  422 agaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg 521  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  40837061 agaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg 40836962  T
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40836961 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 40836869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 26804345 - 26804734
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26804345 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggtacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcagtgg 26804443  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatat 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26804444 aaaaatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatat 26804542  T
Q  422 agaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg 521  Q
    |||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26804543 agaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 26804638  T
Q  522 aacaaacac---tagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26804639 aacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 26804734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 327 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27306643 - 27306358
Alignment:
Q  327 tcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacc 426  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27306643 tcgtggcacgatggtgcgctagcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacc 27306544  T
Q  427 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaa 526  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27306543 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaa 27306445  T
Q  527 acactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggta 612  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27306444 aaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggta 27306358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 35503 - 35791
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35503 atcgtggcccgatcgtgcgctggcagcaaatagcagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 35602  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35603 cttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaaca 35702  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35703 aacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 35791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 44438 - 44726
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44438 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 44537  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44538 cttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaaca 44637  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44638 aacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtag 44726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Original strand, 3878322 - 3878739
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  3878322 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactgg 3878420  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatggtg---------------------cgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |                     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3878421 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtacgctggcagcgaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaag 3878519  T
Q  401 cgaaacttttactataaat----atagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 494  Q
    ||| |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3878520 cgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 3878619  T
Q  495 gggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaa 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3878620 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 3878719  T
Q  594 gaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  3878720 gaggctgagactttgggtag 3878739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 330 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31435458 - 31435174
Alignment:
Q  330 tggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttg-ggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 428  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31435458 tggcacgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaatt-gttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatctt 31435360  T
Q  429 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaac 528  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31435359 gtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 31435260  T
Q  529 actagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31435259 gctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtag 31435174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 25542404 - 25542691
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgg-gtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatataga 424  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542404 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttgagtgtagatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatataga 25542503  T
Q  425 ccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaac 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  25542504 ccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaa 25542602  T
Q  525 aaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25542603 aaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtag 25542691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 330 - 569
Target Start/End: Original strand, 18567491 - 18567731
Alignment:
Q  330 tggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttg-ggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 428  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18567491 tggcacgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaatt-gttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatctt 18567589  T
Q  429 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaac 528  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18567590 gtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 18567689  T
Q  529 actagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttag 569  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18567690 gctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394148
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 38394134  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  38394135 gggactttgggtag 38394148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7472107
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 7472118  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  7472117 actttgggtag 7472107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 382 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31156271 - 31156037
Alignment:
Q  382 atttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaag 480  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31156271 atttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 31156172  T
Q  481 caacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactc 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  31156171 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 31156072  T
Q  579 tcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  31156071 tcttgggtacgggaagagattgggactttgggtag 31156037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724741
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  44724733 tttgggtag 44724741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470149
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 7470160  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  7470159 actttgggtag 7470149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680189
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  21680181 tttgggtag 21680189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099603
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||     
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 13099613  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  13099612 ctttgggtag 13099603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1047051
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 1047051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457815
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 48457801  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  48457802 gggactttgggtag 48457815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3035886
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccg---gaagag 596  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |   ||||||    
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagag 3035869  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||    
T  3035870 gctgggactttgggtag 3035886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Original strand, 20625990 - 20626200
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20625990 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20626089  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20626090 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20626189  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  20626190 actttgggtag 20626200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Original strand, 20629881 - 20630091
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20629881 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20629980  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20629981 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20630080  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  20630081 actttgggtag 20630091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Original strand, 20642300 - 20642510
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20642300 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20642399  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20642400 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20642499  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  20642500 actttgggtag 20642510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412254
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  507 aatttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  37412262 tttgggtag 37412254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355420
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagac 11355411  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  11355412 tttgggtag 11355420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678228
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||   ||||||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  21678220 tttgggtag 21678228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946490
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggct 40946476  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  40946477 gggactttgggtag 40946490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443757
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggga 443747  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  443748 ctttgggtag 443757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137236
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 20137245  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  20137244 tttgggtag 20137236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276303
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  25276295 tttgggtag 25276303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42331151
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 42331151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4296061
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagacctt-gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  505 agaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  4296071 actttgggtag 4296061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757392
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  500 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 11757376  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||    
T  11757377 ctgggactttgggtag 11757392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299622
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  500 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 20299606  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||    
T  20299607 ctgggactttgggtag 20299622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 336 - 596
Target Start/End: Original strand, 22392357 - 22392606
Alignment:
Q  336 gatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 435  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22392357 gatggtgcgctggaggcaaaaaacagaaatgtatttttcagtgcagatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcag 22392456  T
Q  436 agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactaggg 535  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||  |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||    
T  22392457 agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata--------aatcaaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactaggg 22392547  T
Q  536 tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    |   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  22392548 t---tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345703
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggct 18345689  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    | ||||||||||||    
T  18345690 gagactttgggtag 18345703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748756
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||||  ||||||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 24748747  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  24748748 tttgggtag 24748756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349399
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7349416  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
      || ||||||||||||    
T  7349415 attgagactttgggtag 7349399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 7351994 - 7351778
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7351994 acttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggct 7351895  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  7351894 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7351795  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
      |||||||||||||||    
T  7351794 attgggactttgggtag 7351778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850143
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtag 1850143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297524
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 20297510  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||    
T  20297511 ggggctttgggtag 20297524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 390 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22251893 - 22251677
Alignment:
Q  390 caaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaa 489  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22251893 caaattttaagcgacacttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaa 22251794  T
Q  490 aactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||        ||||||||| ||||||||||||    
T  22251793 aactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttac 22251702  T
Q  589 cggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||  || | ||||||||||    
T  22251701 gggaagagattgaggctttgggtag 22251677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 405 - 588
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485703
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttac 28485703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9680982
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||      
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    || ||||||||||||    
T  9680968 tgagactttgggtag 9680982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 406 - 596
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223303
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  505 agaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 42223303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39146114
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  39146122 tttgggtag 39146114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 439 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592270
Alignment:
Q  439 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggttt 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  539 gtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  21592345 gagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtag 21592270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 407 - 596
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990295
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagag 21990295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 28487502 - 28487715
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  28487502 acttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagttt 28487601  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  28487602 gtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatt 28487701  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||    
T  28487702 ggggctttgggtag 28487715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 412 - 585
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258597
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaattt 511  Q
    ||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  512 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24258597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 406 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832761
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 27832770  T
Q  604 ctttgggta 612  Q
    |||||||||    
T  27832769 ctttgggta 27832761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22829018 - 22828760
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg 455  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||||||  ||| | || || ||||||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||    
T  22829018 aacagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttatgagggatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagg 22828919  T
Q  456 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ctt 554  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  ||    
T  22828918 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagatt 22828819  T
Q  555 gggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     | ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  || ||||||||||||    
T  22828818 agaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtag 22828760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 355 - 613
Target Start/End: Original strand, 7188445 - 7188701
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 453  Q
    |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  7188445 ataacataaacgtatttttgggctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga 7188544  T
Q  454 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-c 552  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  7188545 gggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcacc 7188640  T
Q  553 ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| ||  || ||||||||||||    
T  7188641 ttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtag 7188701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679221
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  502 tatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  |    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  9679208 gggactttgggtag 9679221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 405 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253648
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |        ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  497 gtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaaga 595  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaaga 43253662  T
Q  596 ggctgggactttgg 609  Q
    ||||| ||||||||    
T  43253661 ggctgagactttgg 43253648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817481
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaagt-caacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaa-cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||| || | |||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  24817488 ttgggtag 24817481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 357 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 20091926 - 20091672
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg 455  Q
    ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20091926 aacagaaacgtattttcaggcctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagg 20091827  T
Q  456 gggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    |||||| |||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || | |||||| | |||||||   ||||||||||| ||    
T  20091826 gggctgaaaacaagggtttcg-gaggcaac-acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggtt--ggggttgattcacct 20091732  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||    
T  20091731 tgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 20091672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1047503 - 1047386
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1047503 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 1047404  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  1047403 aaaatcgtggcacgatgg 1047386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 530 - 613
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396797
Alignment:
Q  530 ctagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 38396797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 2935070 - 2935187
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2935070 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 2935169  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  2935170 aaaatcgtggcacgatgg 2935187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9027687 - 9027570
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  9027687 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 9027588  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  9027587 aaaatcgtggcacgatgg 9027570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465699
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtata 24465594  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    |  |||| ||||| | |||||||||||||||   ||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgaattgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 408 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 408 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaa-actagggtttg 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 22136878 - 22136995
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22136878 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22136977  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  22136978 aaaatcgtggcacgatgg 22136995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 40551905 - 40552022
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40551905 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40552004  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  40552005 aaaatcgtggcacgatgg 40552022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 522 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092339
Alignment:
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag 7092339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Original strand, 45366446 - 45366526
Alignment:
Q  352 cgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 432  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  45366446 cgaaaaacagaaacgtatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtat 45366526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 481 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813626
Alignment:
Q  481 caacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactct 579  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  580 cttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| || ||||| |  |||||||||||||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtag 24813626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 506
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396370
Alignment:
Q  452 gagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 38396370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 454
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 22107867 - 22107984
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22107867 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22107966  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  22107967 aaaatcgtggcacgatgg 22107984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27306768 - 27306657
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 320  Q
    |||||||| ||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  27306768 atgtgagagttaacttaaaataaggttt-tgcaaaatcgtggcacgatggctggacaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcattg 27306671  T
Q  321 gaaaaatcgtggca 334  Q
    ||||||||||||||    
T  27306670 gaaaaatcgtggca 27306657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 40549627 - 40549744
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40549627 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40549726  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  40549727 aaaatcgtggcacgatgg 40549744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 22108087 - 22108158
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108087 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 22137098 - 22137169
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137098 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 40549847 - 40549918
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549847 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 40552125 - 40552196
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552125 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 340
Target Start/End: Original strand, 35412 - 35496
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  35412 aatcgtggcacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgg 35496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9027467 - 9027396
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9027467 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 448
Target Start/End: Original strand, 2935279 - 2935349
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 448  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935279 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 462 - 596
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081651
Alignment:
Q  462 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaa 560  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacactagggtt--gagattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | || |||||||    
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagag 11081651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 522 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094587
Alignment:
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtag 7094587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 474
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 474  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 334
Target Start/End: Original strand, 25542317 - 25542391
Alignment:
Q  260 gtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25542317 gtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttta-aggcaaggcacttgaaaaatcgtggca 25542391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Original strand, 1849918 - 1849962
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1849918 acttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906327
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa 464  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaa 30906327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 378 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1047295 - 1047238
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1047295 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 1047238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2120947
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 2120947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320184
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 3320184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324932
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 3324932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 462 - 585
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049004
Alignment:
Q  462 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgg--gaa 559  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||| | |  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactagggtttgtaaagaat---tctcttggcaacaaacacta-ggtttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  560 acactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggt 6049004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069828
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 7069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074835
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 7074835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541129
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 15541129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351401
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25351401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357095
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25357095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405441
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25405441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410178
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25410178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006711
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 42006711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 561 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 18567396 - 18567462
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18567396 aatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactgga 18567462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31435553 - 31435487
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31435553 aatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactgga 31435487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 474
Target Start/End: Original strand, 6332179 - 6332248
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggttta 474  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6332179 acttttactataaatataaaacttgtatcagag-taaccttgagagagagggggctggaaacaagggttta 6332248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 544 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297152
Alignment:
Q  544 ttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 16297152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 432
Target Start/End: Original strand, 42006468 - 42006545
Alignment:
Q  354 aataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 432  Q
    ||||||| |||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42006468 aataacataaacgtattttcag-tgaagatttgttccatattttaagggttacttttactataaatataaaccgtgtat 42006545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606543
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 1606543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935431
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 2935431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137241
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 22137241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 510
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210603
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || |||||  ||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttag-aatccaacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  505 agaatt 510  Q
    ||||||    
T  26210598 agaatt 26210603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247018
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 30247018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546997
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 34546997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 38396239 - 38396268
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396239 acttttactataaatatagaccttgtatca 38396268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552268
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 40552268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512659
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 44512659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378638
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 8378638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 231 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 19502542 - 19502138
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 330  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19502542 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgt 19502443  T
Q  331 ggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttt 409  Q
    |||| |||||                     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  19502442 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacatatttttggttgcagatttgatccaaattttaagggaaaattt 19502343  T
Q  410 tactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  19502342 tactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagt 19502243  T
Q  510 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttg 608  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19502242 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttg 19502143  T
Q  609 ggtag 613  Q
    |||||    
T  19502142 ggtag 19502138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 231 - 613
Target Start/End: Original strand, 27104523 - 27104926
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 330  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104523 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 27104622  T
Q  331 ggcatgatg---------------------gtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttt 409  Q
    |||| ||||                     |||||||||| | ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104623 ggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacataaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttt 27104722  T
Q  410 tactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27104723 tactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 27104822  T
Q  510 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttg 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27104823 ttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 27104921  T
Q  609 ggtag 613  Q
    |||||    
T  27104922 ggtag 27104926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 222 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 19504885 - 19504473
Alignment:
Q  222 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 321  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19504885 atgtgaaagttaacttaaaatcaggtttcagcagaatcatggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttaattttttaggcaaggcactgg 19504786  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    ||||||||||||| |||||                     |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19504785 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacacatttttaggtgcagatttgttccaaattttaag 19504686  T
Q  401 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19504685 ggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19504586  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19504585 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cggaagaggct 19504487  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  19504486 gggactttgggtag 19504473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 40032553 - 40032185
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg----------tgcg 344  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||    |||||||| |||||          ||||    
T  40032553 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gagacaagtcactggatttttcgtggcacgatgggatacgatggtgcg 40032455  T
Q  345 ctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 444  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40032454 ctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactt 40032355  T
Q  445 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40032354 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 40032255  T
Q  545 tgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  40032254 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtag 40032185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 223 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24162752 - 24162366
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactgg 321  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24162752 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacaatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 24162653  T
Q  322 aaaaatcgtggcatgatgg---------------------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 400  Q
    ||||||||||||| |||||                     ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24162652 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgattgtgcgctggctgcgaatattagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaag 24162553  T
Q  401 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24162552 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 24162453  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggtt 586  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  24162452 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt 24162366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 326 - 609
Target Start/End: Original strand, 42064355 - 42064639
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42064355 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 42064454  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42064455 cttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 42064554  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42064555 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgg 42064639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 329 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 13910456 - 13910171
Alignment:
Q  329 gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 428  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13910456 gtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagacctt 13910357  T
Q  429 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaac 528  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13910356 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 13910257  T
Q  529 actagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  13910256 actagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtag 13910171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 21521108 - 21520820
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21521108 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaacct 21521009  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21521008 tgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaaca 21520909  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21520908 aacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtag 21520820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 231 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 43624077 - 43623707
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 329  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43624077 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcatggcacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcactgaaaaaatcg 43623979  T
Q  330 tggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttg 429  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  43623978 tggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagaccttg 43623880  T
Q  430 tatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaaca 529  Q
    ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||    
T  43623879 tatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct------------ca 43623792  T
Q  530 ctagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43623791 ctaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 43623707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 275 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 6264611 - 6264301
Alignment:
Q  275 ggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtattttt 373  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  6264611 ggcaacgtggcatgattggatgtttcagtttt-gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatggtgcattagcggcgaataacagaaacatattttt 6264513  T
Q  374 gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6264512 gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggttt 6264413  T
Q  474 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 572  Q
    ||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6264412 agaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 6264317  T
Q  573 tgactctcttggttac 588  Q
    | | ||||||||||||    
T  6264316 taagtctcttggttac 6264301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 328 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 22287749 - 22287480
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22287749 cgtggcaccatggtgcgctggcagcgaataacaaaaatgtatgtttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 22287650  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22287649 tgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaa 22287550  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22287549 cattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagag 22287480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 336 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 6259220 - 6258960
Alignment:
Q  336 gatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6259220 gatggtgcgctggcggtgaataacagaaacatatttttgggtgcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattag 6259121  T
Q  436 agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactaggg 535  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6259120 actaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactaggg 6259021  T
Q  536 tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaaga 595  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6259020 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 6258960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 328 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 22407822 - 22407598
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22407822 cgtggcacgatggtgcgttggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagacct 22407723  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407722 tgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 22407623  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattcac 552  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22407622 cactagggtttgagggttgattcac 22407598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45280111
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 45280122  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  45280121 actttgggtag 45280111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 405 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452368
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 23452378  T
Q  600 gggactttgg 609  Q
    ||||||||||    
T  23452377 gggactttgg 23452368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42452909
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    | | ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  42452802 aaagtttgtctc--tgtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 42452899  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  42452900 ctttgggtag 42452909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18800767 - 18800441
Alignment:
Q  275 ggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtattttt 373  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||    
T  18800767 ggcaacgtgacacgattggatgtttcagttat-gaagcaagtcactggaaaaattgtggcacgatggtgcgctagaggcgaa-aacagaaacatattttt 18800670  T
Q  374 gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttt 473  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18800669 aagtgcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggttt 18800570  T
Q  474 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 572  Q
    |||        ||  || ||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18800569 aga--------aatcaagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 18800482  T
Q  573 tgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||    
T  18800481 tgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtag 18800441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 406 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732919
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggtt 586  Q
    || |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt 31732919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 35215932 - 35215712
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215932 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 35215833  T
Q  495 gggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccgga 592  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||    
T  35215832 gggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 35215733  T
Q  593 agaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  35215732 agagtttgggactttgggtag 35215712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739687
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  11739695 tttgggtag 11739687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007768
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  |||||||  |||| |    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  19007760 tttgggtag 19007768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35218089
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 35218089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923636
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  503 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgg 601  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||    
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgg 42923648  T
Q  602 gactttgggtag 613  Q
    | ||||||||||    
T  42923647 ggctttgggtag 42923636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539602
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  15539609 ttgggtag 15539602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 409 - 596
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022274
Alignment:
Q  409 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaa 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  509 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagag 3022274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196765
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  || | |    
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggc 28196756  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  28196757 tttgggtag 28196765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 406 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163117
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttagg 570  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 22163117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 414 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979706
Alignment:
Q  414 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgt 513  Q
    |||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  514 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggta 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  613 g 613  Q
    |    
T  34979706 g 34979706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848572
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |     
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 17848562  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  17848563 ctttgggtag 17848572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849245
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||  || |||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  17849237 tttgggtag 17849245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289195
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    || ||||||    
T  44289203 ttagggtag 44289195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 406 - 584
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837372
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttgg 584  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 14837372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 446 - 585
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377631
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttg 539  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578236
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||   ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaa--actagggtt--ggggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  11578244 tttgggtag 11578236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 446 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239121
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggt 544  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactt--tctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 45239174  T
Q  545 tgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45239173 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 45239121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 338 - 613
Target Start/End: Original strand, 35107152 - 35107421
Alignment:
Q  338 tggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 437  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  35107152 tggtgcgctgaaggcgaataacataatcgtatttttcaatgcagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatag 35107251  T
Q  438 caaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggt 536  Q
     |||| ||||| |||| | | || ||| |||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||   |||||    
T  35107252 taaaccttgaggtaga-gagtctaaaaccaagagtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaac---agggt 35107345  T
Q  537 ttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |   || |||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||    
T  35107346 t--gggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtag 35107421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36559358 - 36559241
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  36559358 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36559259  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  36559258 aaaatcgtggcacgatgg 36559241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 359 - 596
Target Start/End: Original strand, 22874015 - 22874241
Alignment:
Q  359 cagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 457  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| | || |  |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22874015 cagaaacgtatttttgggc-cagatttgtttcaattttatgagggttacttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggg 22874113  T
Q  458 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgg 556  Q
    |||||||||||||||||||        ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||   |||||||||||| |||||    
T  22874114 gctgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggt---tgggttgattcaccttgg 22874201  T
Q  557 gaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
     ||||| | |||||||||| |||||| || || |||||||    
T  22874202 aaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagag 22874241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36561677 - 36561560
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  |  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  36561677 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcacggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36561578  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  36561577 aaaatcgtggcacgatgg 36561560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37963190
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 478  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 37963190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 407 - 500
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 354 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12342797 - 12342673
Alignment:
Q  354 aataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 453  Q
    ||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||| ||||    || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||    
T  12342797 aataacataatcatatttttggggtcagatttgttccaatttttttaggatacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagataga 12342698  T
Q  454 gggggctgaaac-aagggtttagaa 477  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  12342697 gggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 536 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375472
Alignment:
Q  536 tttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 5375472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45332675 - 45332566
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  45332675 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggaactgga 45332576  T
Q  323 aaaatcgtgg 332  Q
    ||||||||||    
T  45332575 aaaatcgtgg 45332566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897401
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaagt-caacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  503 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||||  |||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttg-agattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 17897401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 496 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459334
Alignment:
Q  496 ggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaag 594  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  595 ag 596  Q
    ||    
T  28459335 ag 28459334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21521201 - 21521126
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtg 331  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21521201 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaagcaagccactggaaaaatcgtg 21521126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146764
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| |     ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  20146842 agagtttg-cccttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggt 20146764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36559138 - 36559067
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559138 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36561415 - 36561344
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561415 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45332439 - 45332384
Alignment:
Q  394 ttttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332439 ttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28462651 - 28462593
Alignment:
Q  376 gtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28462651 gtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 436
Target Start/End: Original strand, 45156922 - 45157001
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 436  Q
    |||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45156922 aacataaacgtatttttaggcgtggatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttatatcaaa 45157001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 454
Target Start/End: Original strand, 40699178 - 40699278
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 453  Q
    ||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||    
T  40699178 ataacagaatcatatttttgggctgagatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagaga 40699277  T
Q  454 g 454  Q
    |    
T  40699278 g 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 613
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699501
Alignment:
Q  542 ggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtag 40699501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 609
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736256
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 2736256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6259321 - 6259243
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6259321 aatcgtggcacgatggctgtgcaacgtggcactattggatgtttcagtttt-gaggaaagtcactggaaaaatcgtggca 6259243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 434
Target Start/End: Original strand, 35028473 - 35028527
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35028473 agatttgttccaattttttagggatacttttactataaatatagacattgtatca 35028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462484
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 17462484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054899
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 20054899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712650
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 22712650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717359
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 22717359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687031
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 39687031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567457
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 45567457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 558 - 613
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589818
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 20589818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45332551 - 45332490
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 388  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45332551 atcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 45332490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781355
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 12781355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921826
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct-gggactttgggtag 613  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  17921769 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtag 17921826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932682
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 17932682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943585
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 17943585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517773
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 27517773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558990
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 36558990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561267
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 36561267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414235
Alignment:
Q  529 actagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 38414235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 434
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589609
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatca 20589609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 432
Target Start/End: Original strand, 33603818 - 33603870
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 432  Q
    ||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33603818 agatttgttccaatttgttagggatacttttactataaatataaaccttgtat 33603870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 84)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 223 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 14507716 - 14507302
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt--gaggcaaggcactg 320  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  14507716 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttttgatacaaggcactg 14507617  T
Q  321 gaaaaat---------------------cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaa 399  Q
    |||||||                     ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14507616 gaaaaatggtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctgccagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgtagatttgttccaaattttaa 14507517  T
Q  400 gcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 499  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14507516 gcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 14507417  T
Q  500 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14507416 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 14507317  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||    
T  14507316 tgggactttgggtag 14507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 256 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 19227915 - 19227535
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg--------------- 340  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                   
T  19227915 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcatgatggaggtttcaatttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 19227816  T
Q  341 ------tgcgctggcggcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatc 433  Q
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19227815 cgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatc 19227716  T
Q  434 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactag 533  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  19227715 agagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactag 19227616  T
Q  534 ggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19227615 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 19227535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 11983444 - 11983156
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11983444 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagac 11983345  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11983344 cttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 11983245  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11983244 aacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 11983156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 30729241 - 30728955
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  30729241 cgtggcacgatagtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatct 30729142  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30729141 tgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 30729042  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30729041 cactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtag 30728955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 275 - 606
Target Start/End: Original strand, 32279845 - 32280176
Alignment:
Q  275 ggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtattttt 373  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32279845 ggcaacgtggcacgattggatgtttcagttct-gaggcaagtcgctggaaaagtcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaatgtattttt 32279943  T
Q  374 gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttt 473  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32279944 gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttt 32280042  T
Q  474 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggat 572  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32280043 aaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 32280142  T
Q  573 tgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  32280143 tgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 32280176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 9019826 - 9020113
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9019826 atcgtggcacgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagat 9019924  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9019925 cttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 9020024  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  9020025 atcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtag 9020113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 15541553 - 15541267
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  15541553 cgtggcacgatggtacgctggcagcgaatagcagaaacatatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagacct 15541454  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15541453 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaa 15541354  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||    
T  15541353 cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtag 15541267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 326 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 15530537 - 15530266
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15530537 atcgtggcacgatggtgtgctggcagtgaattatagaaacatatttttgggtgcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 15530438  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15530437 cttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 15530338  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15530337 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 15530266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1072362 - 1072067
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||    |||||||| |||||| ||  ||| ||||    
T  1072362 aatcgtggtacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttaagtttt-gaggcaagtcattggatttttcgtggcacgatggtacgtaggcagcga 1072264  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  1072263 ataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaa 1072164  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 551  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072163 ggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241448
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 28241458  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    |||| |||||    
T  28241457 ctttcggtag 28241448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230376
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggga 1230386  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  1230385 ctttgggtag 1230376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195641
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||    
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 12195652  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||| ||||    
T  12195651 actttgagtag 12195641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 337 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 15533085 - 15532808
Alignment:
Q  337 atggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 436  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15533085 atggtgcgctggtagcaaataagagaaacatatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaga 15532986  T
Q  437 gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggt 536  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15532985 ctaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggt 15532886  T
Q  537 ttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||||||| |||||    
T  15532885 ttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtag 15532808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 413 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458894
Alignment:
Q  413 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttg 512  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  513 tctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggta 612  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc-cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggta 14458895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 326 - 526
Target Start/End: Original strand, 8995379 - 8995578
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8995379 atcgtggcacgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagat 8995477  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8995478 cttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 8995577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057381
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  13057373 tttgggtag 13057381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 4816608 - 4816358
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaa 463  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||              ||||||||||||||    
T  4816608 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaa 4816509  T
Q  464 acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaaca 562  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4816508 acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaaca 4816409  T
Q  563 ctgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4816408 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 4816358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967388
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagc-aaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat--aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  500 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 30967373  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    ||  |||||||||||    
T  30967374 tgaaactttgggtag 30967388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390566
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||     
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgggg 3390556  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  3390557 ctttgggtag 3390566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629991
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |    
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  3629999 tttgggtag 3629991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 20915721 - 20915482
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggttta 474  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915721 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 20915623  T
Q  475 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20915622 gaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 20915523  T
Q  574 -gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     || ||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||    
T  20915522 ggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtag 20915482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477461
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || | |||||  |||| |    
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  25477453 tttgggtag 25477461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 411 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704695
Alignment:
Q  411 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctggg 602  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||    
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 19704706  T
Q  603 actttgggtag 613  Q
    |||||||||||    
T  19704705 actttgggtag 19704695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2629012
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  500 tgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggc 598  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||      
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 2629027  T
Q  599 tgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||    
T  2629026 tgggactttgggtag 2629012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034730
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||  ||||||||||    
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggct 30034744  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  30034743 gggactttgggtag 30034730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3632065
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataga 507  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  508 atttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||  ||||||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  607 tgggtag 613  Q
    |||||||    
T  3632071 tgggtag 3632065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065170
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 26065170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085139
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 26085139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233857
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |     
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  3233866 ctttgggtag 3233857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13039941
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  || |||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||| ||||    
T  13039933 tttgcgtag 13039941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932688
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 496  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  497 gtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaag 594  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 26932707  T
Q  595 aggctgggactttgggtag 613  Q
    ||  || ||||||||||||    
T  26932706 agattgagactttgggtag 26932688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161701
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||| |||||||    
T  12161790 gagtttgtctc--tggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagag 12161701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447504
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcac 552  Q
    || |||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcac 32447504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 406 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338600
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacacta-gggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggtta 587  Q
     | ||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggtta 24338600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490827
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    || || |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 22490817  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  22490818 ctttgggtag 22490827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 405 - 535
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactaggg 535  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 405 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3028009
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggttt-ggaaggcaac-acaaaactagggtttgta 3028089  T
Q  504 tagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 3028009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 413 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870611
Alignment:
Q  413 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttg 512  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  513 tctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 552  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcac 13870611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26068882 - 26068765
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  26068882 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcatgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 26068783  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  26068782 aaaatcgtggcacgatgg 26068765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26066611 - 26066494
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  26066611 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttatttgggcaaggcactgga 26066512  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  26066511 aaaatcgtggcacgatgg 26066494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 357 - 571
Target Start/End: Original strand, 15346320 - 15346524
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagattt-gttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg 455  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||| ||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  15346320 aacagaaacgtatttttgagctgagattttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagg 15346419  T
Q  456 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ctt 554  Q
    |||||||| ||||||||||||        |   ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  15346420 gggctgaaccaagggtttaga--------attcaaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcacctt 15346507  T
Q  555 gggaaacactgttagga 571  Q
    |||||||||| ||||||    
T  15346508 gggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 33308685 - 33308802
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  33308685 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33308784  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  33308785 aaaatcgtggcacgatgg 33308802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 33310954 - 33311071
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  33310954 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33311053  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  33311054 aaaatcgtggcacgatgg 33311071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 365 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16455800 - 16455553
Alignment:
Q  365 cgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctga 462  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||  ||||| |  ||||    
T  16455800 cgtatttttgggctcagatttgttccaatttttcagggatacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctga 16455702  T
Q  463 aa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaa 560  Q
    || |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16455701 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | || | |||||  |||||||||||||||    
T  16455605 cactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtag 16455553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29755279 - 29755162
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  29755279 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 29755180  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  29755179 aaaatcgtggcacgatgg 29755162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 8995288 - 8995366
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8995288 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggca 8995366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 9019735 - 9019813
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9019735 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggca 9019813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 526 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273342
Alignment:
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 5273342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 406 - 518
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||     |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  506 gaatttgtctctt 518  Q
    || ||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 439 - 613
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719829
Alignment:
Q  439 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggttt 538  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||||||     
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt- 15719755  T
Q  539 gtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
      | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||    
T  15719756 --gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtag 15719829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 378 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 26068662 - 26068590
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 450  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068662 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 26066389 - 26066319
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 450  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066389 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24192707 - 24192635
Alignment:
Q  329 gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24192707 gtggcatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagc 24192635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466510
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||           ||    
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaac-----------ta 14466400  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  14466401 gagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 14466500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 380 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 12186431 - 12186330
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaa-acttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 476  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12186431 agatttgttccaattttttagcgattacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttaga 12186332  T
Q  477 aa 478  Q
    ||    
T  12186331 aa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 585
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012199
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatt 510  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  511 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||    |||||||||| |||  |||||| | |||||||||| |||||||||    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gaggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggt 17012199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 582
Target Start/End: Original strand, 19696394 - 19696595
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg--gggctg-aaacaagggtttaga 476  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||     
T  19696394 agatttgttccaatttttgaaggattcttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttag- 19696492  T
Q  477 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattga 575  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19696493 aaacaaacaac-aaattagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggtt--caaattgattcaccttgggaaacactgttaggattga 19696588  T
Q  576 ctctctt 582  Q
     ||||||    
T  19696589 gtctctt 19696595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24191610 - 24191538
Alignment:
Q  329 gtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24191610 gtggtatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagc 24191538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 29755059 - 29754983
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29755059 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11983558 - 11983457
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 330  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||   |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  11983558 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggttgggcaacatggtacgatggaggtttcag-ttgtgaggtaa-gcactggaaaaatcgt 11983461  T
Q  331 ggca 334  Q
    ||||    
T  11983460 ggca 11983457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 552 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1069907 - 1069846
Alignment:
Q  552 cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  1069907 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtag 1069846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4816749 - 4816689
Alignment:
Q  280 cgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4816749 cgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatgg 4816689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 439
Target Start/End: Original strand, 33308905 - 33308966
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 439  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308905 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 439
Target Start/End: Original strand, 33311174 - 33311235
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 439  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311174 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 12911835 - 12911710
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa--tatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagataga 453  Q
    ||||||| |||||||||| |   |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||   |||| |||||||| |    
T  12911835 aacagaatcgtatttttgtgcttagatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcaaatataaaccttgagataca 12911736  T
Q  454 g-ggggctgaaacaagggtttagaaa 478  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||    
T  12911735 gaggggctgaaaacagggtttagaaa 12911710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 552 - 613
Target Start/End: Original strand, 26945269 - 26945330
Alignment:
Q  552 cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  26945269 cttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtag 26945330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577648
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 3577648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878775
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 13878775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883523
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 13883523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785967
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 16785967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Original strand, 18318004 - 18318048
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18318004 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887358
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 26887358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248848
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 31248848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201460
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 35201460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 12937559 - 12937457
Alignment:
Q  380 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa--tatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttag 475  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | | |||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  12937559 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcagatgtaaaccttgagatacagaggggctgaaaacagggtttag 12937460  T
Q  476 aaa 478  Q
    |||    
T  12937459 aaa 12937457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 582
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367187
Alignment:
Q  522 aacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctctt 582  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctctt 15367187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 543 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186201
Alignment:
Q  543 gttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggta 612  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||  || |||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggta 12186201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 470
Target Start/End: Original strand, 15366963 - 15367086
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttggg-tgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-------gcaaactttg 446  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |       | |||| |||    
T  15366963 ataacataaacgtatttttgggctgatattttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagacatcggtgtaaaccttg 15367062  T
Q  447 agatagagggggctgaaacaaggg 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  15367063 agatagagggggctgaaccaaggg 15367086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036103
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 17036103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694985
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 17694985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309045
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 33309045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311314
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 33311314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 12166320 - 12166280
Alignment:
Q  566 ttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12166320 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 12166280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 606
Target Start/End: Original strand, 25941652 - 25941692
Alignment:
Q  566 ttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25941652 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25941692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 2753 - 3041
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2753 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaa 2852  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2853 cttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 2952  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  2953 aacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtag 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 334
Target Start/End: Original strand, 2670 - 2740
Alignment:
Q  264 cacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2670 cacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggca 2740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 256 - 596
Target Start/End: Original strand, 4423868 - 4424209
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggcggcga 354  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4423868 aatcgtggcacaattgctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttta-aggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggtgcgctggcagcga 4423966  T
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 454  Q
    | || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4423967 aaaatagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagag 4424066  T
Q  455 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4424067 ggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccg 4424166  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4424167 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 4424209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 14807672 - 14807959
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14807672 atcgtggcacggtggtgcgctggcagcgaaaaacataaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 14807770  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14807771 cttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 14807870  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14807871 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 14807959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 27826906 - 27827194
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27826906 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggc 27827005  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27827006 cttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 27827105  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27827106 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtag 27827194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 27829217 - 27829505
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27829217 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggc 27829316  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27829317 cttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 27829416  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27829417 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtag 27829505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 15072632 - 15072919
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15072632 cgtggcatgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 15072731  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15072732 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 15072831  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaaga-ggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  15072832 cactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtag 15072919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 326 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28251981 - 28251695
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28251981 atcgtggtacgatggtgcgttggcagcgaaaaacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 28251883  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28251882 cttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 28251783  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggta 612  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28251782 aacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggta 28251695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 15067903 - 15068189
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15067903 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaacct 15068002  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15068003 tgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 15068102  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  15068103 cactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtag 15068189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 18810680 - 18810916
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810680 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 18810779  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 576  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  18810780 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18810879  T
Q  577 tctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  18810880 tctcttggttacgggaataggctgggactttaggtag 18810916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 251 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 3886412 - 3886153
Alignment:
Q  251 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggtgcgctggc 349  Q
    |||| ||||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  3886412 tgcagaatcgtgacatgatggctggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactggaaaaatcgtggtacgatggtgtgctggc 3886313  T
Q  350 ggcgaataacagaaacgtattttt---gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 446  Q
     ||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3886312 agcgaataacagaaacatattttttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttg 3886213  T
Q  447 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3886212 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 44720815 - 44721052
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720815 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44720914  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttggg-aaacactgttaggattga 575  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  44720915 aggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattga 44721014  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721015 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 44721052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541515
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    ||| |||||    
T  33541523 ttttggtag 33541515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339517
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 32339503  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||    
T  32339504 ggggctttgggtag 32339517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 18812865 - 18813090
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18812865 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaa 18812964  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgac 576  Q
    | |||||||||||||           |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  18812965 aggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18813053  T
Q  577 tctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18813054 tctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtag 18813090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 355 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 14419578 - 14419318
Alignment:
Q  355 ataacagaaacgtatttttgggtgcagattt-gttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 453  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||    
T  14419578 ataacagaaacatatttttgggctgagattttgttccaatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga 14419479  T
Q  454 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-c 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  14419478 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcacc 14419379  T
Q  553 ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14419378 ttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 14419318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27107024
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  27107032 tttgggtag 27107024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 383 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 13858842 - 13858611
Alignment:
Q  383 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagca 482  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13858842 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggca 13858743  T
Q  483 acaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctct 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  13858742 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttct 13858643  T
Q  582 tggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  13858642 tggttacgggaagagattggggctttgggtag 13858611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12517532 - 12517248
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaa---------------------atcgtggc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||                     ||||||||    
T  12517532 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaatgtactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 12517434  T
Q  334 atgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatc 433  Q
    | ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12517433 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatc 12517334  T
Q  434 aaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctct 517  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12517333 agagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225374
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||     
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 1225364  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  1225365 ctttgggtag 1225374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911222
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 27911212  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  27911213 ctttgggtag 27911222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957641
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 27957631  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  27957632 ctttgggtag 27957641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874218
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggct 3874204  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  3874205 gggactttgggtag 3874218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477484
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
     | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  14477476 tttgggtag 14477484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684783
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  495 gggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaa 593  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 22684803  T
Q  594 gaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22684802 gaggctgggactttgggtag 22684783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 415 - 613
Target Start/End: Original strand, 608735 - 608942
Alignment:
Q  415 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 506  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  608735 taaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatag 608834  T
Q  507 aatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggact 605  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  608835 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 608934  T
Q  606 ttgggtag 613  Q
    ||||||||    
T  608935 ttgggtag 608942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809426
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||    
T  15809314 gtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaact 15809412  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||||    
T  15809413 aggactttgggtag 15809426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283346
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaga 28283362  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
     |||| ||||||||||    
T  28283361 ttggggctttgggtag 28283346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873307
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagag 24873324  T
Q  597 gctgggactttgggtag 613  Q
      |||||||||||||||    
T  24873323 attgggactttgggtag 24873307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 454 - 613
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079811
Alignment:
Q  454 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-c 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  553 ttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 43079811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082182
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 43082182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480630
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  || | |    
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  30480638 tttgggtag 30480630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 582
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775378
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 582  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 405 - 596
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41384935
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagag 41384935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 328 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 2468511 - 2468361
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2468511 cgtggcacgatggtgcgctggatgcgaataacagaaacgtattttttagtgcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagacct 2468412  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 478  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2468411 tgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaa 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 407 - 582
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865715
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctctt 582  Q
    || |||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 36865715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 5623073 - 5622882
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5623073 cttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5622974  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagag 596  Q
    || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  5622973 gagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530323
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  501 gtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggct 599  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggct 43530309  T
Q  600 gggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||    
T  43530310 gggactttgggtag 43530323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 406 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372310
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  605 tttg 608  Q
    ||||    
T  5372313 tttg 5372310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 588
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952703
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattaggg-ttgtata 25952619  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttac 588  Q
     | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttac 25952703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 405 - 552
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41382819
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 552  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcac 41382819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 357 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 15186095 - 15185852
Alignment:
Q  357 aacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg 455  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||| |||    
T  15186095 aacagaaacgtattttcgggcctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaagg 15185996  T
Q  456 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ctt 554  Q
     | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15185995 tgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 15185896  T
Q  555 gggaaacactgttaggattga--ctctcttggttaccggaagag 596  Q
    |  ||||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  15185895 gtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagag 15185852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 406 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872559
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 35872619  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 564  Q
    || |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 35872559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 332
Target Start/End: Original strand, 43079347 - 43079456
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43079347 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43079446  T
Q  323 aaaatcgtgg 332  Q
    ||||||||||    
T  43079447 aaaatcgtgg 43079456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 43081722 - 43081839
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43081722 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaaagtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43081821  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  43081822 aaaatcgtggcacgatgg 43081839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 359 - 613
Target Start/End: Original strand, 31162165 - 31162417
Alignment:
Q  359 cagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 457  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  31162165 cagaaacatatttttgagctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggg 31162264  T
Q  458 gct-gaaacaagggtttagaa--aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
    |||  |||||| |||||||||  |||||||    ||| ||| ||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||  |||   ||||||||||| ||    
T  31162265 gctaaaaacaaaggtttagaaacaagcaac----aaattagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcacct 31162357  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  31162358 tgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtag 31162417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 18812668 - 18812785
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18812668 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgaagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 18812767  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  18812768 aaaatcgtggcacgatgg 18812785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482518
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtata 21482413  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
     | |||| ||||| | |||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||||  |||| |    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 405 - 501
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 501  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 18810483 - 18810600
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18810483 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttatttttttaggcaaggcactgga 18810582  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||| | |||| |||||    
T  18810583 aaaattgcggcacgatgg 18810600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 439 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214369
Alignment:
Q  439 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagaatttgtctcttt 519  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                   |||||||||||||| |||||||||||    
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  520 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaaca 562  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 37214369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 359 - 575
Target Start/End: Original strand, 31035021 - 31035236
Alignment:
Q  359 cagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgaga--tagagg 455  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||| |    
T  31035021 cagaatcgtatttttgggctcagatttgttccaattttttag-gatatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtaga-g 31035118  T
Q  456 gggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ct 553  Q
     | ||| |||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||| ||    
T  31035119 agtctgaaaacaatggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcacct 31035214  T
Q  554 tgggaaacactgttaggattga 575  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  31035215 tgggaaacaccattaggattga 31035236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 27826815 - 27826893
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27826815 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaagcaaagcactggaaaaatcgtggca 27826893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 27829126 - 27829204
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggca 334  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27829126 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaggcaaaacactggaaaaatcgtggca 27829204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 496 - 613
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956165
Alignment:
Q  496 ggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaag 594  Q
    |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  595 aggctgggactttgggtag 613  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  15956147 agattgggactttgggtag 15956165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 439 - 595
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480692
Alignment:
Q  439 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggttt 538  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  539 gtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaaga 595  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21480637 --gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaga 21480692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28252093 - 28252009
Alignment:
Q  256 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28252093 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtggtacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgg 28252009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005759
Alignment:
Q  439 aaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtt 537  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| ||||||||||| |||| |||||   |||||||| |||||||    
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt 3005833  T
Q  538 tgtgggttgattcacttgggaaa-cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
       || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||| || | |||||  |||||||||||||||    
T  3005832 ---ggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtag 3005759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 434
Target Start/End: Original strand, 17847501 - 17847556
Alignment:
Q  379 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847501 cagatttgttccaaattttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Original strand, 44720742 - 44720816
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  44720742 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagc 44720816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Original strand, 14807556 - 14807659
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 329  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14807556 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcatgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcg 14807654  T
Q  330 tggca 334  Q
    |||||    
T  14807655 tggca 14807659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 44720617 - 44720735
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagattta-tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 320  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||  |||| |||||||||| ||| ||  ||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44720617 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaatcgtggcatgattgctgggcattgtggcacgtttggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactg 44720715  T
Q  321 gaaaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  44720716 gaaaaatcgtggcacgatgg 44720735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573854
Alignment:
Q  544 ttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||    
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 31573854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 328
Target Start/End: Original strand, 15067785 - 15067882
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcat-aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatc 328  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  15067785 ttaacttaaaatcagattt-tgcaggaatcgtggcaagatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaagcaagccactggaaaaatc 15067882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Original strand, 15072506 - 15072614
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcat-aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 320  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  15072506 tgtgagagttaacttaaaatcagattc-tgcaggaatcgtgacacgatggctgggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt-gaagcaagccacta 15072603  T
Q  321 gaaaaatcgtg 331  Q
    |||||||||||    
T  15072604 gaaaaatcgtg 15072614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578406
Alignment:
Q  544 ttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtag 31578406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376032
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021241
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 9021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752656
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 16752656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757401
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 16757401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 561 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179692
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgg 609  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327956
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 28327956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895550
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 28895550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 434
Target Start/End: Original strand, 43079558 - 43079614
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079558 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 434
Target Start/End: Original strand, 43081930 - 43081986
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 434  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081930 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43081986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590842
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 590842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554919
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 29554919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 613
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035325
Alignment:
Q  541 gggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||||||  || |||||| |||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtag 31035325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31574100 - 31574054
Alignment:
Q  383 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgta 431  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31574100 tttgttccaaattttgagaga--cttttactataaatatagaccttgta 31574054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032702
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 33032702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812621
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggactt 4812621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799558
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332679
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggactt 28332679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 231 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 73536 - 73212
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  73536 ttaacttaaaatcagatttatgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaattg 73438  T
Q  330 tggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttg 429  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  73437 tggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgtg 73339  T
Q  430 tatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaaca 525  Q
    |||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73338 tatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 73239  T
Q  526 aacactagggtttgtgggttgattcac 552  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  73238 aacactagggtttgagggttgattcac 73212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 231 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 69825 - 69418
Alignment:
Q  231 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 329  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  69825 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcg 69727  T
Q  330 tggcat---------------------gatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaactt 408  Q
    | |||                      ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  69726 tagcacaatgggatcgcatcgttgcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatactt 69628  T
Q  409 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  69627 ttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 69528  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  69527 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga 69428  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  69427 ctttgggtag 69418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73163
Alignment:
Q  518 ttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 564  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 73163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 328 - 613
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4157
Alignment:
Q  328 cgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 427  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3872 cgtggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagacct 3971  T
Q  428 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaa 527  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  3972 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaa 4070  T
Q  528 cactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4071 cactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtag 4157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 336 - 613
Target Start/End: Original strand, 14902 - 15180
Alignment:
Q  336 gatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 435  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14902 gatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcag 15001  T
Q  436 agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactaggg 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15002 agcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagag 15101  T
Q  536 tttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  |  ||||||||||||    
T  15102 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtag 15180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 418 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14509
Alignment:
Q  418 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtct 515  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  516 ctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 14509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 378 - 613
Target Start/End: Original strand, 6124 - 6361
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 477  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6124 gcagatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6223  T
Q  478 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattg-a 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  6224 aagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 6323  T
Q  576 ctctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6324 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 5927 - 6044
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5927 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 6026  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6027 aaaatcgtggcatgatgg 6044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41610
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 41620  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    |||| |||||    
T  41619 ctttcggtag 41610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 326 - 613
Target Start/End: Original strand, 29034 - 29332
Alignment:
Q  326 atcgtggcatgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29034 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagac 29133  T
Q  426 cttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtct 515  Q
    |||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29134 cttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 29233  T
Q  516 ctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc-acttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  29234 cttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtag 29332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 28941 - 29005
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcac 287  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28941 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 29005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 408 - 613
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79346
Alignment:
Q  408 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataga 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  508 atttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatt 79339  T
Q  607 tgggtag 613  Q
    |||||||    
T  79340 tgggtag 79346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183768
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cggaagagattggga 183778  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  183777 ctttgggtag 183768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 405 - 609
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52168
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  503 atagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgg 601  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||     
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 52160  T
Q  602 gactttgg 609  Q
    ||||||||    
T  52161 gactttgg 52168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2202
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  499 ttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagagg 597  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagg 2186  T
Q  598 ctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||    
T  2187 ctgggactttgggtag 2202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 405 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11600
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  505 agaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttga-ttcacttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 11610  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  11609 ctttgggtag 11600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35800
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  35792 tttgggtag 35800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Original strand, 34 - 203
Alignment:
Q  446 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  546 gattca-cttgggaaacactgttaggatt-gactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||  || ||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtag 203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80021
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  506 gaatttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctggga 603  Q
    || ||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||     
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggg 80011  T
Q  604 ctttgggtag 613  Q
    ||||||||||    
T  80012 ctttgggtag 80021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188376
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 188376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 405 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 1053
Alignment:
Q  405 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  505 agaatttgtctcttt 519  Q
    ||| |||||||||||    
T  1067 agagtttgtctcttt 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16193 - 15949
Alignment:
Q  367 tatttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac 465  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| |||||     
T  16193 tatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaat 16094  T
Q  466 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacact 564  Q
    |||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||    |||||||||| |||| |||| |||    
T  16093 aagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt--gaggttgattcaccttgcgaaaaact 15998  T
Q  565 gttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
     |||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  15997 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtag 15949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 406 - 613
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85391
Alignment:
Q  406 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||  ||||||  || |||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||| ||||    
T  85383 tttgagtag 85391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12937
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13054 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatgtcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 12955  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  12954 aaaatcgtggcacgatgg 12937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 520 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1579
Alignment:
Q  520 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac-ttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 1579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 407 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16778
Alignment:
Q  407 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 505  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaac-acaaaactagggtttgtata 16884  T
Q  506 gaatttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggac 604  Q
    || |||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||| || |||||||  || |||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagac 16787  T
Q  605 tttgggtag 613  Q
    |||||||||    
T  16786 tttgggtag 16778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1770
Alignment:
Q  415 taaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagaatttgt 513  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt-- 1862  T
Q  514 ctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactttgggta 612  Q
            |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  1861 -------caacaaacactaggg-ttgt-ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 6)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 21915 - 22032
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21915 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22014  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  22015 aaaatcgtggcacgatgg 22032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 24190 - 24307
Alignment:
Q  223 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 322  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  24190 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 24289  T
Q  323 aaaatcgtggcatgatgg 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  24290 aaaatcgtggcacgatgg 24307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 22135 - 22206
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22135 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 24410 - 24481
Alignment:
Q  378 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 449  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24410 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22278
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 22278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 613
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24553
Alignment:
Q  557 gaaacactgttaggattg-actctcttggttaccggaagaggctgggactttgggtag 613  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 24553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 412 - 585
Target Start/End: Original strand, 4773 - 4943
Alignment:
Q  412 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa--aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||  |||||||    |||||||||||| |||||      
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaagtaagcaac----aaactagggtttatatagcg 4868  T
Q  509 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-cttgggaaacactgttaggattgactctcttggt 585  Q
    ||| |||||  | |||||||||||| |||    | ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4869 ttt-tctctcagcaacaaacactagagtt--gagtttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 4943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224867
Alignment:
Q  558 aaacactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 224867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16373
Alignment:
Q  561 cactgttaggattgactctcttggttaccggaagaggctgggactt 606  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 16373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University