View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14529_high_3 (Length: 326)

Name: NF14529_high_3
Description: NF14529
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14529_high_3
NF14529_high_3
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (16-192)||(3467428-3467604)
chr8 (41-192)||(41981052-41981203)
chr8 (21-186)||(28425515-28425680)
chr8 (16-143)||(43550835-43550962)
chr8 (22-190)||(34342897-34343063)
chr8 (19-142)||(6399149-6399272)
chr8 (22-108)||(3097250-3097336)
chr8 (19-108)||(25698001-25698089)
chr8 (19-143)||(40742068-40742192)
chr8 (22-164)||(40742339-40742479)
chr8 (21-147)||(44926781-44926906)
chr8 (75-192)||(26242986-26243103)
chr8 (20-113)||(41289100-41289193)
chr8 (21-114)||(42148978-42149071)
chr8 (19-143)||(8124915-8125038)
chr8 (23-114)||(33627079-33627170)
chr8 (34-140)||(27649693-27649799)
chr8 (19-143)||(38152215-38152339)
chr8 (21-136)||(4941824-4941939)
chr8 (22-127)||(29023199-29023304)
chr8 (16-143)||(22936831-22936958)
chr8 (21-100)||(42143407-42143486)
chr8 (25-143)||(26125516-26125634)
chr8 (21-143)||(30081693-30081815)
chr8 (24-114)||(3619114-3619204)
chr8 (34-108)||(36114096-36114170)
chr8 (19-136)||(440230-440347)
chr8 (34-101)||(24897643-24897710)
chr8 (25-104)||(11126499-11126578)
chr8 (52-138)||(16915010-16915096)
chr8 (16-113)||(31246353-31246450)
chr8 (24-114)||(37458344-37458439)
chr8 (16-113)||(15206670-15206767)
chr8 (74-114)||(24297687-24297727)
chr8 (22-82)||(26243129-26243189)
chr8 (52-108)||(45147324-45147380)
chr8 (276-310)||(41980934-41980968)
chr8 (55-143)||(38114389-38114477)
chr8 (34-164)||(30085682-30085815)
chr8 (74-108)||(41891915-41891949)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (16-171)||(10825999-10826154)
chr6 (16-139)||(16442388-16442511)
chr6 (16-143)||(16548075-16548202)
chr6 (21-147)||(13739138-13739263)
chr6 (22-164)||(33899049-33899191)
chr6 (21-134)||(13744651-13744763)
chr6 (16-140)||(6208101-6208224)
chr6 (19-114)||(29409292-29409387)
chr6 (36-142)||(31132401-31132507)
chr6 (34-143)||(21455818-21455926)
chr6 (34-140)||(7215514-7215619)
chr6 (16-121)||(17830036-17830141)
chr6 (23-108)||(699529-699613)
chr6 (24-108)||(21254924-21255008)
chr6 (16-113)||(1312477-1312574)
chr6 (24-101)||(5584094-5584171)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (19-190)||(3622488-3622659)
chr7 (22-192)||(43737970-43738140)
chr7 (16-190)||(48459620-48459794)
chr7 (16-190)||(42740302-42740476)
chr7 (19-139)||(37562531-37562651)
chr7 (19-192)||(3750598-3750767)
chr7 (21-185)||(39391167-39391331)
chr7 (16-143)||(37639387-37639514)
chr7 (20-164)||(3375426-3375570)
chr7 (16-143)||(38230025-38230152)
chr7 (22-138)||(3342752-3342868)
chr7 (34-158)||(9456047-9456171)
chr7 (16-137)||(386506-386627)
chr7 (19-156)||(12632111-12632248)
chr7 (16-140)||(44967424-44967548)
chr7 (20-166)||(34366011-34366156)
chr7 (19-170)||(32205855-32206006)
chr7 (16-157)||(47021862-47022003)
chr7 (34-121)||(48134559-48134646)
chr7 (56-166)||(47301622-47301732)
chr7 (16-135)||(10371983-10372102)
chr7 (34-108)||(34010332-34010406)
chr7 (19-140)||(47217569-47217690)
chr7 (34-137)||(43631738-43631841)
chr7 (16-136)||(46541564-46541684)
chr7 (52-143)||(34011022-34011114)
chr7 (34-108)||(19095929-19096002)
chr7 (19-108)||(32186932-32187021)
chr7 (19-108)||(41715649-41715738)
chr7 (53-138)||(12964401-12964483)
chr7 (19-113)||(42904540-42904634)
chr7 (75-112)||(37886854-37886891)
chr7 (53-126)||(43581609-43581682)
chr7 (22-114)||(39977538-39977630)
chr7 (24-108)||(40903200-40903284)
chr7 (64-138)||(12961735-12961807)
chr7 (25-88)||(37008384-37008447)
chr7 (52-106)||(36920239-36920293)
chr7 (52-108)||(1766417-1766473)
chr7 (16-113)||(39634190-39634287)
chr7 (74-114)||(4035920-4035960)
chr7 (74-114)||(25191336-25191376)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (22-171)||(20813054-20813203)
chr3 (16-190)||(31084097-31084270)
chr3 (19-189)||(16246135-16246305)
chr3 (16-158)||(10334059-10334201)
chr3 (19-138)||(38172348-38172467)
chr3 (19-170)||(52966850-52967001)
chr3 (24-135)||(10853313-10853424)
chr3 (19-186)||(23207109-23207274)
chr3 (22-142)||(44224699-44224819)
chr3 (21-163)||(53074819-53074960)
chr3 (19-136)||(38340749-38340865)
chr3 (21-191)||(42318216-42318387)
chr3 (19-140)||(53179788-53179908)
chr3 (19-143)||(3348179-3348303)
chr3 (21-136)||(31618930-31619045)
chr3 (20-166)||(15511418-15511563)
chr3 (16-114)||(26519629-26519727)
chr3 (22-164)||(35930653-35930795)
chr3 (16-143)||(23496260-23496380)
chr3 (21-191)||(38125485-38125656)
chr3 (16-140)||(30811570-30811693)
chr3 (16-136)||(35425277-35425396)
chr3 (16-139)||(50664699-50664821)
chr3 (22-166)||(25847946-25848089)
chr3 (19-143)||(32357447-32357571)
chr3 (52-143)||(22736917-22737008)
chr3 (55-158)||(48189518-48189620)
chr3 (16-134)||(8424768-8424885)
chr3 (16-140)||(44939454-44939576)
chr3 (59-164)||(14959634-14959739)
chr3 (24-108)||(45423814-45423898)
chr3 (19-106)||(21224963-21225050)
chr3 (19-114)||(42475674-42475769)
chr3 (18-111)||(30809985-30810078)
chr3 (69-106)||(55087593-55087630)
chr3 (74-114)||(37698485-37698525)
chr3 (52-115)||(41459037-41459099)
chr3 (24-115)||(49526715-49526806)
chr3 (74-108)||(53078329-53078363)
chr3 (19-68)||(4984592-4984641)
chr3 (24-101)||(14651147-14651224)
chr3 (51-92)||(19874675-19874716)
chr3 (16-113)||(34561074-34561171)
chr3 (77-114)||(40244079-40244116)
chr3 (73-114)||(44610311-44610351)
chr3 (74-114)||(30811289-30811329)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (16-190)||(42944936-42945110)
chr4 (19-138)||(48550468-48550587)
chr4 (19-190)||(39636657-39636830)
chr4 (19-171)||(43772164-43772316)
chr4 (16-136)||(51922868-51922988)
chr4 (16-143)||(16566226-16566353)
chr4 (19-170)||(4954092-4954243)
chr4 (19-190)||(49519604-49519775)
chr4 (19-139)||(6138661-6138780)
chr4 (21-157)||(19592274-19592410)
chr4 (16-135)||(26651886-26652005)
chr4 (19-142)||(49136444-49136567)
chr4 (21-147)||(43781562-43781687)
chr4 (21-158)||(13183093-13183230)
chr4 (19-143)||(46830110-46830234)
chr4 (52-192)||(55638861-55639001)
chr4 (19-170)||(15603254-15603405)
chr4 (16-114)||(29149345-29149443)
chr4 (54-192)||(9893582-9893721)
chr4 (34-140)||(14072427-14072533)
chr4 (22-164)||(56241879-56242021)
chr4 (21-191)||(30842003-30842174)
chr4 (21-191)||(48407741-48407912)
chr4 (24-138)||(30887199-30887313)
chr4 (20-126)||(31520413-31520518)
chr4 (54-192)||(9889410-9889549)
chr4 (55-143)||(28986942-28987030)
chr4 (16-140)||(54152969-54153092)
chr4 (19-141)||(6505124-6505246)
chr4 (22-108)||(14564190-14564276)
chr4 (19-140)||(2175188-2175309)
chr4 (16-113)||(13167476-13167573)
chr4 (55-140)||(32238135-32238220)
chr4 (52-140)||(54735724-54735812)
chr4 (19-114)||(25312665-25312760)
chr4 (19-108)||(14054807-14054896)
chr4 (19-143)||(15619538-15619659)
chr4 (19-114)||(54150476-54150571)
chr4 (16-94)||(39187704-39187782)
chr4 (19-140)||(14075939-14076060)
chr4 (34-106)||(26426170-26426242)
chr4 (52-108)||(48908231-48908287)
chr4 (19-108)||(48550173-48550262)
chr4 (52-191)||(38693921-38694060)
chr4 (74-108)||(5025485-5025519)
chr4 (16-113)||(38305962-38306059)
chr4 (19-112)||(46926000-46926093)
chr4 (52-113)||(48257054-48257115)
chr4 (16-113)||(54488556-54488653)
chr4 (79-165)||(45780923-45781009)
chr4 (74-114)||(20191781-20191821)
chr4 (86-114)||(43628685-43628713)
chr4 (74-114)||(45106358-45106398)
chr4 (52-108)||(54655206-54655262)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (19-190)||(5410553-5410723)
chr1 (16-190)||(48510821-48510995)
chr1 (19-143)||(4369844-4369968)
chr1 (19-138)||(31223339-31223458)
chr1 (21-186)||(40229514-40229679)
chr1 (19-143)||(7826396-7826520)
chr1 (19-143)||(42850261-42850385)
chr1 (19-143)||(43728920-43729043)
chr1 (16-143)||(35569241-35569368)
chr1 (16-143)||(20800316-20800443)
chr1 (16-147)||(25229963-25230093)
chr1 (34-143)||(6166070-6166179)
chr1 (19-140)||(12468176-12468296)
chr1 (16-143)||(1199787-1199914)
chr1 (22-192)||(36205102-36205272)
chr1 (19-140)||(45710012-45710132)
chr1 (18-140)||(6464571-6464692)
chr1 (20-166)||(13055935-13056080)
chr1 (19-166)||(11051353-11051499)
chr1 (52-143)||(35536032-35536123)
chr1 (20-166)||(50977383-50977528)
chr1 (34-143)||(12247380-12247489)
chr1 (58-143)||(31933687-31933772)
chr1 (19-123)||(13931603-13931706)
chr1 (55-114)||(10470579-10470638)
chr1 (52-143)||(11023404-11023495)
chr1 (19-114)||(47123375-47123470)
chr1 (19-114)||(50406119-50406214)
chr1 (34-103)||(9447533-9447602)
chr1 (55-140)||(40821788-40821873)
chr1 (24-111)||(25061218-25061305)
chr1 (19-108)||(26058236-26058325)
chr1 (16-99)||(11561826-11561909)
chr1 (19-113)||(15884216-15884311)
chr1 (24-102)||(23628752-23628830)
chr1 (19-88)||(27801694-27801763)
chr1 (52-91)||(41856950-41856989)
chr1 (24-102)||(34718452-34718530)
chr1 (22-78)||(291762-291818)
chr1 (74-114)||(46033210-46033250)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (19-147)||(7472713-7472840)
chr2 (19-136)||(9988540-9988657)
chr2 (16-143)||(5916278-5916404)
chr2 (19-190)||(26207968-26208139)
chr2 (16-143)||(36312222-36312348)
chr2 (16-127)||(28127323-28127434)
chr2 (16-114)||(2213480-2213578)
chr2 (18-140)||(14821111-14821232)
chr2 (19-143)||(28641587-28641711)
chr2 (16-107)||(1945075-1945166)
chr2 (34-108)||(39141523-39141597)
chr2 (19-136)||(28261246-28261363)
chr2 (23-127)||(44619104-44619208)
chr2 (57-158)||(8170244-8170344)
chr2 (34-127)||(23358219-23358312)
chr2 (51-114)||(2234901-2234963)
chr2 (16-126)||(3853862-3853972)
chr2 (19-141)||(7296102-7296224)
chr2 (19-141)||(25940280-25940402)
chr2 (16-114)||(42089564-42089666)
chr2 (19-140)||(42516015-42516135)
chr2 (19-114)||(27911380-27911475)
chr2 (52-115)||(31562756-31562819)
chr2 (52-143)||(32501931-32502022)
chr2 (24-141)||(7295392-7295507)
chr2 (19-108)||(16467066-16467155)
chr2 (19-78)||(31224690-31224749)
chr2 (19-158)||(36548130-36548268)
chr2 (19-77)||(2213658-2213716)
chr2 (24-108)||(3602503-3602587)
chr2 (24-108)||(25747925-25748009)
chr2 (18-113)||(18511077-18511172)
chr2 (95-164)||(2212745-2212814)
chr2 (19-108)||(43436320-43436409)
chr2 (21-127)||(2215215-2215319)
chr2 (76-143)||(39106764-39106831)
chr2 (55-115)||(3552921-3552981)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (19-140)||(8388-8509)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (19-171)||(32030638-32030788)
chr5 (21-157)||(41834828-41834964)
chr5 (16-143)||(22482139-22482266)
chr5 (21-147)||(32454483-32454608)
chr5 (19-140)||(40885163-40885285)
chr5 (16-114)||(3667833-3667931)
chr5 (19-158)||(28869541-28869679)
chr5 (16-114)||(35760168-35760266)
chr5 (22-135)||(3060265-3060376)
chr5 (22-143)||(10058024-10058145)
chr5 (19-140)||(40495396-40495516)
chr5 (19-143)||(9275522-9275646)
chr5 (16-108)||(13253118-13253209)
chr5 (21-111)||(7385972-7386062)
chr5 (21-111)||(39988007-39988097)
chr5 (19-140)||(16158503-16158624)
chr5 (22-127)||(41740634-41740739)
chr5 (34-134)||(2430349-2430449)
chr5 (24-111)||(8049094-8049181)
chr5 (34-140)||(33953954-33954060)
chr5 (16-121)||(4292121-4292226)
chr5 (58-192)||(7714840-7714975)
chr5 (18-136)||(27021085-27021203)
chr5 (20-107)||(5710425-5710511)
chr5 (19-165)||(24045759-24045904)
chr5 (24-108)||(7178763-7178847)
chr5 (34-106)||(40791122-40791194)
chr5 (34-106)||(42146295-42146367)
chr5 (52-108)||(2694831-2694887)
chr5 (58-115)||(16843516-16843573)
chr5 (74-114)||(3747683-3747723)
chr5 (52-108)||(41959446-41959502)
chr5 (19-102)||(34106985-34107068)
chr5 (73-115)||(19784791-19784833)
chr5 (74-114)||(40979997-40980037)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (16-134)||(29161-29278)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (54-192)||(8997-9136)
[»] scaffold0983 (1 HSPs)
scaffold0983 (21-140)||(2311-2430)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (22-108)||(253099-253185)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (22-141)||(2071-2190)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (55-135)||(5903-5988)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (24-108)||(46734-46818)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (74-114)||(9254-9294)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3467604 - 3467428
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3467604 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatatttatttaaaagtgattcttatgaattgatgttggttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatatg 3467505  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3467504 gaatgaccaaactatccttttaattataattagaaataaatatttcattctcattagataattatttcaacttatca 3467428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41981203 - 41981052
Alignment:
Q  41 atatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41981203 atatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatactttgaatcaaaattgattttaaatatggaatgaccaaactatctttttaatt 41981104  T
Q  141 gtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981103 gtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 41981052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 28425515 - 28425680
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  28425515 gtgaattgatttatgtttggatacactttcttacaagtgattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatg 28425614  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaac 186  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  28425615 accaaactatccttttaattgtatttaaaagtaaatatcttattctcattagataattatttcaac 28425680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43550962 - 43550835
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43550962 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaatgtg 43550863  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     || ||  ||||||||||||||||||||    
T  43550862 taaagactaaactatccttttaattgta 43550835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Original strand, 34342897 - 34343063
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  34342897 tgaattgatttttgtttggataaatttatttaaaagtgattcttat-agtggatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaa-gtgtaatga 34342994  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
     |||| ||  |||||||||||| ||  ||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34342995 ccaaattaatcttttaattgtattttaaaataaacacctcattctcattagataattatttcaacttat 34343063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 6399149 - 6399272
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  6399149 atgtgaattgatttatgtttcgatacactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataattttaatcaaaattgattttgaatgtgcaa 6399248  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgt 142  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||    
T  6399249 tgaccaaattatctttttaattgt 6399272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Original strand, 3097250 - 3097336
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097250 tgaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 3097336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Original strand, 25698001 - 25698089
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25698001 atgtgaattgatta-tgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 25698089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40742192 - 40742068
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||| ||    
T  40742192 atgtgaattgatttatgtttggatacactttaataaaattgattcttatgagttgatattgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgtaa 40742093  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  40742092 tgatcaaattatccttttaattgta 40742068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Original strand, 40742339 - 40742479
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40742339 tgaattgatttatgtttggatacactaatgtaa--gtgattcttatgagttgatgatgtttggatattttaaatcaaaattgattttaaatgtgtagtga 40742436  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 164  Q
     |||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  40742437 ccaaattacccttttaattgtgtttaaaattaaatatttcatt 40742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44926906 - 44926781
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  44926906 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttatttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatg 44926808  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaatta 147  Q
    | |||| |||| || ||||||||||||    
T  44926807 accaaattatctttgtaattgtaatta 44926781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26243103 - 26242986
Alignment:
Q  75 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  | |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||    
T  26243103 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgcgtaaaaaccaaactattcttttaattgtatttaaaagtaaatatctcattctcattagat 26243004  T
Q  175 acttatttcaacttatca 192  Q
    | ||||||||||||||||    
T  26243003 aattatttcaacttatca 26242986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 113
Target Start/End: Original strand, 41289100 - 41289193
Alignment:
Q  20 tgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41289100 tgtgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgattcttataggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatg 41289193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 42149071 - 42148978
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42149071 gtgaattgatttatgtttggatagacttatttaaaagtgattcgtatgagttgatgttgtttagataatttgaatcaaaattgattttgaatgt 42148978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8125038 - 8124915
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  8125038 atgtgaattgatta-tgtttggatacactcatttaaaagtgattcttaggagttgaagttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatggataa 8124940  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||  || |||||||||||||    
T  8124939 tgaccaacttacccttttaattgta 8124915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 114
Target Start/End: Original strand, 33627079 - 33627170
Alignment:
Q  23 gaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33627079 gaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaatcgattttgaatgt 33627170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27649799 - 27649693
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||| || |||    
T  27649799 tgtttagatacactcatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacattgaatgaccaaattaccct 27649700  T
Q  134 tttaatt 140  Q
    |||||||    
T  27649699 tttaatt 27649693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 38152215 - 38152339
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||    
T  38152215 atgtaaattgatttatgtttggaaatatttacttaaaaatgattcttatgagttgatgtggtttggatactttaaatcaaaattgattttgaacgtgtaa 38152314  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  38152315 tgaccaaagtatccctttaattgta 38152339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 4941824 - 4941939
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||    
T  4941824 gtgaattgatttatgtttggataaaattatttaaaagcgattcttatgagttgatgttgtttgaataatttgaattaaaattgattttgaatgtaaaatg 4941923  T
Q  121 atcaaactatcctttt 136  Q
    | |||| ||| |||||    
T  4941924 accaaattattctttt 4941939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 29023304 - 29023199
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  29023304 tgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaattgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 29023205  T
Q  122 tcaaac 127  Q
     |||||    
T  29023204 ccaaac 29023199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 22936831 - 22936958
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |     
T  22936831 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaatttggttttgaatata 22936930  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  |||||||||||||| |||||    
T  22936931 taatgactaaactatccttttagttgta 22936958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Original strand, 42143407 - 42143486
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  42143407 gtgaattgatttatgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgacgttgtttggataatttgaaacaaaa 42143486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26125634 - 26125516
Alignment:
Q  25 attgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatca 124  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  26125634 attgatttatgtttggatacactaatgtaaaaatgattcttatgagttgataatgtttggacggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgacga 26125535  T
Q  125 aactatccttttaattgta 143  Q
    || |||| |||||||||||    
T  26125534 aaatatctttttaattgta 26125516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 30081693 - 30081815
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |   |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30081693 gtgaattgatttatgtttggataagctgacacaaaagcaattcttatgggctgatgttgtttggatagtttgtttcaaaattgattttagatgtgtaatg 30081792  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgta 143  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  30081793 accaaattatccttttaattgta 30081815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 114
Target Start/End: Original strand, 3619114 - 3619204
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||| |||||||||| | | || | |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3619114 aattgatttgtgtttggatacattaatatgaaagtgattcttatcaatgtatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 3619204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 36114096 - 36114170
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36114096 tgtttggatacactcgtttaaaagtgattcttatgagttgatattgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 36114170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Original strand, 440230 - 440347
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  440230 atgtgaattgatttatgtttggatacattcagttaaaaatgattcttatgagttaacgttgtttggatagattgaatcaaaactgattttgaatgtataa 440329  T
Q  119 tgatcaaactatcctttt 136  Q
    ||| |||  |||||||||    
T  440330 tgaccaacttatcctttt 440347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 101
Target Start/End: Original strand, 24897643 - 24897710
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaat 101  Q
    |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24897643 tgtttggatacatttatttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaat 24897710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11126578 - 11126499
Alignment:
Q  25 attgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattga 104  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11126578 attgatttatgtttggatacacttataaataagtgattttcatgagtttgtgttgtttggatagtttgaatcaaaattga 11126499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16915096 - 16915010
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||||||    
T  16915096 taaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggttggtttgtatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattaaccttttaa 16915010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Original strand, 31246353 - 31246450
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   | |   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31246353 tgaatgtgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttaaatg 31246450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 114
Target Start/End: Original strand, 37458344 - 37458439
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagtt---gatgt--tgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37458344 aattgatttatgtttggatatattgacataaaagtgattcttatcaattcatgatgtgatgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 37458439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15206767 - 15206670
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | | |  || ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  15206767 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacattgacttagaagtgattcttaaaaattcatgttgtttggatagtttggcccaaaattgattttgaatg 15206670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 24297687 - 24297727
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24297687 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttacatgt 24297727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26243189 - 26243129
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgttt 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26243189 tgaattgatttatgtttggatataattgtttaaaagtgattcttatgagttggtgatgttt 26243129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Original strand, 45147324 - 45147380
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  45147324 taaaagtgattcttataagttgatattgtttgaataacttgaatcaaaattgatttt 45147380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41980968 - 41980934
Alignment:
Q  276 aatacaatataagcttaaaaagatgtcactaaaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41980968 aatacaatataagcttaaaaagatgtcactaaaaa 41980934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38114477 - 38114389
Alignment:
Q  55 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||||||||| ||  |  ||||| |||| || |||||||||||||    
T  38114477 aagtgattcttatgagttgaggttgtttgaatatttcgaacaaaaattgattttgaacattcaatgaccaaattacccttttaattgta 38114389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 30085682 - 30085815
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaa------attgattttaaatgtggaatgatcaaac 127  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||   ||||||| | |||||||||| ||| |||||||      ||||||||||||| || | ||| ||||     
T  30085682 tgtttggatacactaatgtaaaagtgattct---gagttgacgatgtttggatattttaaatcaaaattgatattgattttaaatatgtagtgaccaaat 30085778  T
Q  128 tatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 164  Q
    || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  30085779 tacccttttaattgtgtttaaaattaaatatttcatt 30085815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 108
Target Start/End: Original strand, 41891915 - 41891949
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41891915 atgttgtttggacagtttgaatcaaaattgatttt 41891949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10826154 - 10825999
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10826154 tgaatttgaattgatttttgtttggatatacttatttaaaagtgattcttatgagttgattttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatatg 10826055  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatta 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10826054 gaatgaccaaactatccttttaattataattagaaataaatatttcattctcatta 10825999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 16442388 - 16442511
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16442388 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatattgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtg 16442487  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaat 139  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  16442488 taatgaccaaactatccttttaat 16442511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16548202 - 16548075
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16548202 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 16548103  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16548102 taatgactaaactatccttttaattgta 16548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13739263 - 13739138
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  13739263 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatg 13739165  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaatta 147  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  13739164 accaaattatccttgtaattgtaatta 13739138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Original strand, 33899049 - 33899191
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33899049 tgaattgatttatgtttggatacactaatgtaaaagtgattcttatgagttaataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatga 33899148  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 164  Q
     |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  33899149 ccaaaatatccttttaattgtatttaaaattaaatatctcatt 33899191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13744763 - 13744651
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  13744763 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatg 13744665  T
Q  121 atcaaactatcctt 134  Q
    | |||| |||||||    
T  13744664 accaaattatcctt 13744651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 6208101 - 6208224
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  6208101 tgaatgtgaattgatta-tgtttggatacactttactaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtc 6208199  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
     |||||  ||| ||||||| |||||    
T  6208200 taatgactaaattatccttataatt 6208224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 29409292 - 29409387
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29409292 atgtgaattgatttatgtttggatacagttttttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgt 29409387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31132507 - 31132401
Alignment:
Q  36 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttt 135  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||| |||| || |||||    
T  31132507 tttggatacacttatttaaaagtgattcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaactttaaatgaccaaattacccttt 31132408  T
Q  136 taattgt 142  Q
    |||||||    
T  31132407 taattgt 31132401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21455926 - 21455818
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |    
T  21455926 tgtttgtatacacttat-taaaagtgattctcatgagttaatgttgtttgcatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgattaaattatctt 21455828  T
Q  134 tttaattgta 143  Q
    ||||||||||    
T  21455827 tttaattgta 21455818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7215619 - 7215514
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  7215619 tgtttgtatacacttat-taaaagtgattctcatgagttaatgttgtttgcataaattgaatcaaaattaattttaaatatgtaatgattaaattatcct 7215521  T
Q  134 tttaatt 140  Q
    || ||||    
T  7215520 ttaaatt 7215514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Original strand, 17830036 - 17830141
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || | ||   || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17830036 tgaatgtgaattgatttatgtttagttacagtttattagaagtcgttcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 17830135  T
Q  116 gaatga 121  Q
     |||||    
T  17830136 taatga 17830141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 699613 - 699529
Alignment:
Q  23 gaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  699613 gaattgatttatgtttggatgcactttactaaaagtaattcttataagttaatgttgtt-ggatagtttgaatcaaaatcgatttt 699529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 21254924 - 21255008
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||||| |||||||||| | | | |||||| |||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  21254924 aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttcggtagtttgaatcaaaattgctttt 21255008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Original strand, 1312477 - 1312574
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| | | |  || || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  1312477 tgaatgcgaattgatttatgttcggatacattgacttagaattgattcttaaaaattaatgttgtttggatagtttgacccaaaattgattttgaatg 1312574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 5584094 - 5584171
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaat 101  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||  | || | |||||||||||| ||| |||||||||    
T  5584094 aattgatttatgtttggatatatttatatagaagtgatttttaccaattcaagttgtttggataatttaaatcaaaat 5584171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 3622488 - 3622659
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  3622488 atgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtataaatcaaaattgattttaaatgtgtaa 3622587  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  3622588 cgatcaaagtatccttttaattgtatttagaagtaaatatctcattcacattagataattatttcagcttat 3622659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 43737970 - 43738140
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43737970 tgaattgatttttgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgaaatga 43738069  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 192  Q
     |||| || ||||||||||||| ||  || |||| |  || || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43738070 ccaaattaaccttttaattgtattttaaagtaaacacctctttttcattagataattatttcaacttatca 43738140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 48459794 - 48459620
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  48459794 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgaatggatgttgtttggatagtatgtattaaaattgattttaagtgtg 48459695  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  48459694 taatgaccaaactatccttttaattatatttaaaattaaatatcccattctcattagataattatttcatcttat 48459620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42740476 - 42740302
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  42740476 tgaatgttaattgatttatgtttagatatacttacttaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtg 42740377  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
     ||||| |||| |||| |||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  42740376 taatgaccaaagtatcattttaattatatttaaaagtaaatatctcattctcattagataattatttcagcttat 42740302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37562651 - 37562531
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||    
T  37562651 atgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgtatgtgtaa 37562552  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaat 139  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  37562551 tgaccaaactatccttttaat 37562531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3750767 - 3750598
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  3750767 atgtgaattgatttatgtttggatacactttaatataattgaatcttatgaattgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattaatttt-aatgtgtaa 3750669  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3750668 tgaccaaactatccttttaattgt-attaaaaataa--atttcattctcattagataattatttcaacttatca 3750598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 39391167 - 39391331
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  39391167 gtgaattgatttatgtttggatacactttcttacaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatg 39391266  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaa 185  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||    
T  39391267 acctaactatccttttaattgtatttaaaagtaaatatcttattctcattagataattaattcaa 39391331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37639514 - 37639387
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37639514 tgaatgtgaattgatttatgtttggagaaactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtg 37639415  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37639414 taatgactaaactatccttttaattgta 37639387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3375570 - 3375426
Alignment:
Q  20 tgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  3375570 tgtgaattgatttgtgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagtcgatgttgtttggatgatttggatcaaaattgattttgaatgtgcaat 3375471  T
Q  120 gatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 164  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  3375470 gaccaaattatccttttaattgtatttaaaattaaatatctcatt 3375426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38230152 - 38230025
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38230152 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacattttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 38230053  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  38230052 taatgactaaactatccatttaattgta 38230025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3342868 - 3342752
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  3342868 tgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgtaatga 3342769  T
Q  122 tcaaactatccttttaa 138  Q
     ||||||||||||||||    
T  3342768 ccaaactatccttttaa 3342752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9456171 - 9456047
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||| |    
T  9456171 tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatcttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaattatctt 9456072  T
Q  134 tttaattgtaattagaaataaatat 158  Q
    |||||||||| ||| || |||||||    
T  9456071 tttaattgtatttaaaactaaatat 9456047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 386506 - 386627
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattga-ttttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  386506 tgaatgtgaattgatttatgtttggatatactaaccgaaaagtgattcttatga-ttgatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttttaaatgt 386604  T
Q  115 ggaatgatcaaactatcctttta 137  Q
      ||||| |||| ||||||||||    
T  386605 ataatgaccaaattatcctttta 386627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 12632111 - 12632248
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12632111 atgtgaattgatttatgtttgagtgtactcgcttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaattgtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaa 12632210  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaat 156  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  12632211 tgaccaaaatatccttttaattgtatttaaaactaaat 12632248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 44967424 - 44967548
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    
T  44967424 tgaatgtgaattgatttatgtttgaatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgagtttg 44967523  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
     ||||| |||| |||||||||||||    
T  44967524 taatgaccaaattatccttttaatt 44967548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 34366011 - 34366156
Alignment:
Q  20 tgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    
T  34366011 tgtgaattgatttatgtttggatacgcttat-taaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaaggcgtaat 34366109  T
Q  120 gatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 166  Q
    || |||| || |||||||| |||  ||| || ||||||| |||||||    
T  34366110 gaccaaattacccttttaactgtgtttaaaattaaatatctcattct 34366156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32206006 - 32205855
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg-ga 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  32206006 atgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgagtt-atgttgttt-gatagtatgaatcaaaattgattttaaatgtgcaa 32205909  T
Q  118 atgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttc-attctcatt 170  Q
    |||| |||| || ||||| |||| || ||| || |||||||||| |||||||||    
T  32205908 atgaccaaattaacctttaaattttatttaaaactaaatatttcaattctcatt 32205855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 47022003 - 47021862
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47022003 tgaaagtgaattgatttatgtttggatacactttactagatgtgattcttacgaattgatgttgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtg 47021904  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaata 157  Q
     ||||| |||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||    
T  47021903 caatgaccaaattatcattttaattgtatttaaaagtaaata 47021862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48134646 - 48134559
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48134646 tgtttggataaacttgtttaaaagtgatttttataagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatga 48134559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 166
Target Start/End: Original strand, 47301622 - 47301732
Alignment:
Q  56 agtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaa 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||||||||||||| || ||| || ||||    
T  47301622 agtgattcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgactaaattatccttttaattatatttaaaactaaa 47301721  T
Q  156 tatttcattct 166  Q
     || |||||||    
T  47301722 catctcattct 47301732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 10371983 - 10372102
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || | ||   || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10371983 tgaatgtgaattgatttatgtttggttacagtttattagaagtgattcttgtgggttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgcg 10372082  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttt 135  Q
     |||||  |||| |||||||    
T  10372083 taatgactaaaccatccttt 10372102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 34010406 - 34010332
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34010406 tgtttgaatacactcatttaaaagtggttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaatttt 34010332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 47217569 - 47217690
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||    
T  47217569 atgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaacgtacaa 47217668  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    |||  ||| |||||||||||||    
T  47217669 tgactaaattatccttttaatt 47217690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Original strand, 43631738 - 43631841
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||  ||| |||| | ||||||    
T  43631738 tgtttggatatgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatatattgaatcaaaattgattgtgaatgtataattatcatattatcct 43631837  T
Q  134 ttta 137  Q
    ||||    
T  43631838 ttta 43631841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46541684 - 46541564
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattga-ttttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||| | | | ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46541684 tgaatgtgaattggtttatgtttgagtatattcaccgaaaagtgattcttatga-ttgatattgttttgatagattgaatcaaaattgatttttaaatgt 46541586  T
Q  115 ggaatgatcaaactatcctttt 136  Q
      ||||| |||| |||||||||    
T  46541585 ataatgaccaaattatcctttt 46541564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Original strand, 34011022 - 34011114
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgttt-ggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| || ||| ||||| || | ||||| ||||||||||    
T  34011022 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggggtactttaaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccacaatatccctttaattgta 34011114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19096002 - 19095929
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19096002 tgtttggatacactcgtttaaaaatgattcttatgagtt-atgttgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 19095929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32187021 - 32186932
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  32187021 atgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 32186932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 41715738 - 41715649
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  41715738 atgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 41715649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12964483 - 12964401
Alignment:
Q  53 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaa 138  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12964483 aaaagtaattattatgagttaatgttgtttggatagtttgagtcaaca---attttgaatgtgtaatgatcaaactatcattttaa 12964401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 42904634 - 42904540
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||  | |||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  42904634 atgtgaattgatttatgttttgatacactcgtttaaaagtgattcttatgaattaattttgtttgtatattttaaatcaaaattacttttaaatg 42904540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 112
Target Start/End: Original strand, 37886854 - 37886891
Alignment:
Q  75 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37886854 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaat 37886891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 43581682 - 43581609
Alignment:
Q  53 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaa 126  Q
    |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  43581682 aaaagtgattataattaattgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgcttttagatgtgtaattatcaaa 43581609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 39977630 - 39977538
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  39977630 tgaattgatttatttttggataaactcatataaaagttattatttcaagttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgattttagatgt 39977538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 40903200 - 40903284
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||| ||| |||||||||||| | |  ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40903200 aattggtttatgtttggatatattaaagtaaaagtgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgatttt 40903284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12961807 - 12961735
Alignment:
Q  64 ttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaa 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |   ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12961807 ttatgagttaatgttgtttggatagtttgaagcaaca--aattttgaatgtgtaatgatcaaactatcattttaa 12961735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Original strand, 37008384 - 37008447
Alignment:
Q  25 attgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag 88  Q
    |||||||| |||||||| | ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37008384 attgatttatgtttggagacactttcttataagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag 37008447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 106
Target Start/End: Original strand, 36920239 - 36920293
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 106  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36920239 taaaggtgattcttttgagttgatgttgtttgggtacattgaatcaaaattgatt 36920293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1766473 - 1766417
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  1766473 taaaagtgattcttatcaattgatgatgtttgaataatttgaattaaaattgatttt 1766417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Original strand, 39634190 - 39634287
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatct-aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  39634190 tgaatatgaattgatttatgtttggata-acttaaaacaaaagtgattcttataaattcttgttgtttggataacttggatcaaaattgattttgaatg 39634287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 4035960 - 4035920
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  4035960 atgttgtttggatagttttaatcaaaattgcttttgaatgt 4035920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 25191336 - 25191376
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  25191336 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgcttttaaatgt 25191376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20813203 - 20813054
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20813203 tgaattgatttttgtttggatatacttattcaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatga 20813104  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatta 171  Q
      |||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||    
T  20813103 ctaaactatccttttaattgtatttaaaagtaaatttctcattctcatta 20813054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31084270 - 31084097
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  31084270 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttct-taaaagtgattcttatgacttgatattatttggatagtttgaatcataattgattttgaatatg 31084172  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31084171 taatgaccaaactatcattttaattgtatttaaaagtaaatatctcattctcattatataattatttcaacttat 31084097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 16246135 - 16246305
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | ||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16246135 atgtaaattgatttatgtttggaaacactttaatagaagtgattcttaggagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaa 16246234  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaactta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16246235 tgatcaaactatccttttaattgtatgtaaaagtaaataccacattctcattagataattatttcaactta 16246305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10334201 - 10334059
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  10334201 tgaatatgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaattta 10334102  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 158  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  10334101 taatgaccaaactatccttttaattgtatttaaaagtaaatat 10334059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 138
Target Start/End: Original strand, 38172348 - 38172467
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  38172348 atgtgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgtaa 38172447  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaa 138  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  38172448 tgaccaaactatccttttaa 38172467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 52966850 - 52967001
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52966850 atgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaa 52966949  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatt 170  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||| ||||    
T  52966950 tgaccaaattatccttttaattgtatttaaaattatatatctcattcccatt 52967001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Original strand, 10853313 - 10853424
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatc 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |    
T  10853313 aattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtattgacc 10853412  T
Q  124 aaactatccttt 135  Q
    ||| ||||||||    
T  10853413 aaattatccttt 10853424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Original strand, 23207109 - 23207274
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  || ||    
T  23207109 atgtgaattgatttatgtttggatacacttttttacaagtgatt-ttatgagttgatgttgtttg-atagtttgaatcaaaattaattttgaacttgtaa 23207206  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaac 186  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  23207207 tgaccaaaccatccttttaattgtatttaaaagtaaatatcttattctcattagataattatttcaac 23207274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44224819 - 44224699
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||    
T  44224819 tgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataattttagtcaaaattgattttgaatgtgcaatga 44224720  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgt 142  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  44224719 ccaaattatccttttaattgt 44224699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53074960 - 53074819
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  53074960 gtgaattgatta-tgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgcgtaaag 53074862  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcat 163  Q
    | |||  || ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  53074861 accaacttacccttttaattgtatttataactaaatatctcat 53074819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38340865 - 38340749
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  38340865 atgtgaattgatttatgtttggatatgcttat-taaaagtaatttttataagttgacgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttaaatgtgtag 38340767  T
Q  119 tgatcaaactatcctttt 136  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  38340766 tgaccaaattatcctttt 38340749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42318387 - 42318216
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  42318387 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatg 42318289  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 191  Q
    |  ||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  42318288 acaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagatacttatttgaacttatc 42318216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 53179908 - 53179788
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  53179908 atgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtacaa 53179810  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  53179809 tgaccaaattatccttttaatt 53179788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3348303 - 3348179
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |     
T  3348303 atgtaaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttatatcaaaattgattttgaatgtgtat 3348204  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  3348203 tgaccaaattatccttttaattgta 3348179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 31618930 - 31619045
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  31618930 gtgaattgatttatgtttggatactctcacttagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtataatg 31619029  T
Q  121 atcaaactatcctttt 136  Q
    |||||  |||||||||    
T  31619030 atcaacttatcctttt 31619045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 15511418 - 15511563
Alignment:
Q  20 tgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||    
T  15511418 tgtgaattgatttatgtttggatacgcttat-taaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgcgtaat 15511516  T
Q  120 gatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 166  Q
    ||  ||| ||  |||||||||||  ||| || ||||||| |||||||    
T  15511517 gacgaaattactcttttaattgtgtttaaaattaaatatctcattct 15511563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 26519727 - 26519629
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26519727 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaaacaaaattgattttaaatgt 26519629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35930795 - 35930653
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35930795 tgaattgatttatgcttggatacactaatgtataagtcattcttatgagttgataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatga 35930696  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 164  Q
     |||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  35930695 ccaaaatatcattttaattgtatttaaaattaaatatctcatt 35930653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23496380 - 23496260
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  23496380 tgaatgtgaattgatttatgtttggata-------ctaaaagtgattcttgcgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgta 23496288  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  |||||||| |||||||||||    
T  23496287 taatgactaaactatcattttaattgta 23496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 38125485 - 38125656
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  38125485 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatg 38125583  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 191  Q
    |  ||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  38125584 acaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagatacttatttgaacttatc 38125656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 30811570 - 30811693
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30811570 tgaatgtgaattgatta-tgtttggatacactttaacagaagtgattcttatgacttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 30811668  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
     |||||| ||| ||| |||||||||    
T  30811669 taatgattaaattattcttttaatt 30811693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35425396 - 35425277
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35425396 tgaatgtgaattgatta-tgtttggatacactttaacagaagtgattcttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 35425298  T
Q  116 gaatgatcaaactatcctttt 136  Q
     |||||  ||| |||||||||    
T  35425297 taatgactaaattatcctttt 35425277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 50664821 - 50664699
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |  || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  50664821 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacacacacttagaagtgattcttaagagtt-atgttgtttagatagtttaaattaaaattgattttgaatgtg 50664723  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaat 139  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  50664722 taatgatcaaattatccttttaat 50664699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25848089 - 25847946
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25848089 tgaattgatttatgtttggataccttcacttaaaaatgattcttatgagtttgtgttgtttggatagtt-gaataaaaattgattttaaatgtgtaatga 25847991  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 166  Q
     |||| ||| |||| ||||||| | | || |||||||||||||||    
T  25847990 ccaaattatactttaaattgtattaaaaactaaatatttcattct 25847946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32357571 - 32357447
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||| | | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||  |    
T  32357571 atgtaaattgatttatgtttgaaaacactcatttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttgggtactttgaattaaaattgattttgaacgtgtga 32357472  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  32357471 tgatcaaaatatccctttaattgta 32357447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22737008 - 22736917
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22737008 taaaagtgattattatgagttaatgttgttgggatggtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaacaaattatacttttaattgta 22736917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Original strand, 48189518 - 48189620
Alignment:
Q  55 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||  ||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  48189518 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatccttctaa-tgttattaaaaataa 48189616  T
Q  155 atat 158  Q
    ||||    
T  48189617 atat 48189620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 8424768 - 8424885
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8424768 tgaacgtgaattgatta-tgtttggatacacttcaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtg 8424866  T
Q  116 gaatgatcaaactatcctt 134  Q
     |||||  ||| |||||||    
T  8424867 taatgactaaattatcctt 8424885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Original strand, 44939454 - 44939576
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||     
T  44939454 tgaatatgaattgatta-tgtttggatacattta-ctataagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagttttaatcaaaattaattttgaatgtc 44939551  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
     |||||  ||| ||||||| |||||    
T  44939552 taatgactaaattatccttataatt 44939576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14959739 - 14959634
Alignment:
Q  59 gattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||     
T  14959739 gatttttatgagttgatgttgtttagatgatttgaatcaaacttgattttgaatgtgtaacgattaaattatctttttaattgtatttaaaattaaatag 14959640  T
Q  159 ttcatt 164  Q
    ||||||    
T  14959639 ttcatt 14959634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 45423814 - 45423898
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||| ||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45423814 aattggtttatgtttggatatattaaagtaaaagtgattcttatcaattcatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgatttt 45423898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21225050 - 21224963
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 106  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21225050 atgtaaattgatatatgtttggatacactttcttaaaagcgattcttacgagttgatgtcgttttgatagtttgaatcaaaattgatt 21224963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 42475769 - 42475674
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||   |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42475769 atgtgaattgatttttgtttgaatacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgcttttagatgt 42475674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 30809985 - 30810078
Alignment:
Q  18 aatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 111  Q
    ||||||||||||||| || |||  ||  ||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30809985 aatgtgaattgatttatgattgattacgcttacttaaaagtgattcttataaattgatgatgtttggatagtttgaatcaaaattacttttaaa 30810078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 106
Target Start/End: Original strand, 55087593 - 55087630
Alignment:
Q  69 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55087593 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 55087630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 37698485 - 37698525
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37698485 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttacatgt 37698525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41459099 - 41459037
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41459099 taaaagtgattcttatcaattcatggtgtttggataatttgaat-aaaattgattttgaatgtg 41459037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Original strand, 49526715 - 49526806
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| | | || ||||| |||||||||| | || |||||||||  ||||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  49526715 aattgatttatgtttggatacattcatgtaaaattgattcttatcaatttatgttgtttaaatagtctaaatcaaaattgcttttgaatgtg 49526806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 53078363 - 53078329
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53078363 atgttgtttggacagtttgaatcaaaattgatttt 53078329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 4984641 - 4984592
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatg 68  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  4984641 atgtgaattgatttatgtttggatacactcgtttaaaagtgattcttatg 4984592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 14651147 - 14651224
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaat 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||| |||  | || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14651147 aattgatttgtgttttgatatacttacatagaagtgatttttaccaattcaagttgtttggataatttgaatcaaaat 14651224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19874716 - 19874675
Alignment:
Q  51 ctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttg 92  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19874716 ctaaaagttattcttatgagttgacgttgtttgcatagtttg 19874675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34561171 - 34561074
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| | | |  || || |||||||||  | || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  34561171 tgaatgcgaattgatttatgtttggatacattgacttagaattgattcttaaaaattaatgttggttggatagtttgacccaaaattgattttgaatg 34561074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40244116 - 40244079
Alignment:
Q  77 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40244116 ttgtttggatagttttaatcaaaattgtttttaaatgt 40244079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 114
Target Start/End: Original strand, 44610311 - 44610351
Alignment:
Q  73 gatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44610311 gatgttgtttggatagtttg-atcaaaattgattttgaatgt 44610351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 30811329 - 30811289
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  30811329 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttgaatgt 30811289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 42944936 - 42945110
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  42944936 tgaatgtgaattgatttatgtttagatatacttacttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaaatgta 42945035  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  42945036 taatgaccaaactatccttttaattatatttaaaagtaaatatcccattctcattagataattatttcagcttat 42945110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 138
Target Start/End: Original strand, 48550468 - 48550587
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48550468 atgtgaattgatttatgtttggataaactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaa 48550567  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaa 138  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  48550568 tgatcaaactatcattttaa 48550587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39636830 - 39636657
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39636830 atgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtatgaatcaaaattgattttaaatgtgtaa 39636731  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaata--tttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
     || |||| ||||||||||||| || ||| || ||||||  | |||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  39636730 cgaccaaaatatccttttaattatatttacaagtaaatatctctcattcacattagataattatttcagcttat 39636657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Original strand, 43772164 - 43772316
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43772164 atgtgaatcgatttatgtttggatacacttttttagaagtgattcttacgagttgatgttgtttggataatatgaatcaaaattgattttaagtgtgtaa 43772263  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatta 171  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  43772264 tgaccaaactatccttttaattatatttaaaagtaaatatctcattctcatta 43772316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 51922988 - 51922868
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  51922988 tgaatctgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgta 51922889  T
Q  116 gaatgatcaaactatcctttt 136  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  51922888 taatgaccaaactatcctttt 51922868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16566353 - 16566226
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16566353 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 16566254  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16566253 taatgactaaactatccttttaattgta 16566226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 4954092 - 4954243
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4954092 atgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataggttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaa 4954191  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatt 170  Q
    ||| | || |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||| ||||    
T  4954192 tgacctaattatccttttaattgtatttaaaattatatatctcattcccatt 4954243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 49519775 - 49519604
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||   ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||    
T  49519775 atgtgaatttatttatgtttggatacacttgcttaaaaatgattcttatgaattgatattgtttggatagtatgtattaaaattgattttaagtgtgtaa 49519676  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
    ||| ||||||||| |||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  49519675 tgaccaaactatcattttaattatatttaaaagtaaatatctcattctcattagataattatttcagcttat 49519604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 6138661 - 6138780
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||    
T  6138661 atgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaaatgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattga-tttgaatgtgtaa 6138759  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaat 139  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  6138760 tgaccaaactatcattttaat 6138780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Original strand, 19592274 - 19592410
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||    
T  19592274 gtgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgattcttacgaattgacgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtacaatg 19592373  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaata 157  Q
    | |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  19592374 accaaattattcttttaattgtatttagaagtaaata 19592410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 26651886 - 26652005
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26651886 tgaatgtgaattgatttatgtttagatacactttactaaaagtaattcttatgagtcgatgttatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgta 26651985  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttt 135  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26651986 taatgaccaaactatccttt 26652005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 49136567 - 49136444
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  49136567 atgtgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaataattttaatcaaaattgattttgaatgtacaa 49136468  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgt 142  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  49136467 tgaccaaattatccttttaattgt 49136444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 43781562 - 43781687
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  43781562 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatg 43781660  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaatta 147  Q
    | |||| |||||||  |||||||||||    
T  43781661 accaaattatccttgcaattgtaatta 43781687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Original strand, 13183093 - 13183230
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||||    
T  13183093 gtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaaatgatttttataagttgatgttttttggataatttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatg 13183192  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 158  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  13183193 accaaactatcctttaaattgtatttaaaagtaaatat 13183230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 46830110 - 46830234
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |     
T  46830110 atgtgaattgatttatgtttggatacactttcttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatattctacatcaaaattgattttaaatgtgtat 46830209  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  46830210 tgaccaaattatccttttaattgta 46830234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 192
Target Start/End: Original strand, 55638861 - 55639001
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaa 151  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  55638861 taaaagggattcttatgagttgatattgtttggataatatgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcattttaattgtatttaaaag 55638960  T
Q  152 taaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 192  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| | |||||||    
T  55638961 taaatatatcattctcgttagataattattttagcttatca 55639001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15603405 - 15603254
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||   ||    
T  15603405 atgtgaattgatttgtgtttagatatacttgcttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaagtcaaaattgattttgaatgcacaa 15603306  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatt 170  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||| ||||| |||||    
T  15603305 tgatcaaattatccttttgattgtttttaaaactaaatatctcattatcatt 15603254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 29149345 - 29149443
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149345 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 29149443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9893721 - 9893582
Alignment:
Q  54 aaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaata 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  9893721 aaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttaaattaaaattgattttgaatgtataatgattaaattatccttttaa-tgttattaaaaata 9893623  T
Q  154 aatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatca 192  Q
    ||||| ||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||    
T  9893622 aatatctcattttcattttagataattatttgaacttatca 9893582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14072533 - 14072427
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||    
T  14072533 tgtttggatacactttaatagaagtgattctaatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatcct 14072434  T
Q  134 tttaatt 140  Q
    |||||||    
T  14072433 tttaatt 14072427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Original strand, 56241879 - 56242021
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||| |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  56241879 tgaattgatttatgtttggatacattaatgtaaaagtgattcttatgagttgataatgtttagatgatttaaatcaaaattgattttgaatgtataatga 56241978  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 164  Q
     |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  56241979 ccaaaatatccttttaattgtatttaaaattaaatatctcatt 56242021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30842174 - 30842003
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  30842174 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatg 30842076  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 191  Q
    |  ||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  30842075 acaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagatacttatttgaacttatc 30842003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 48407741 - 48407912
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  48407741 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatg 48407839  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 191  Q
    |  ||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  48407840 acaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagatacttatttgaacttatc 48407912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 30887199 - 30887313
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatc 123  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  30887199 aattgatttatgtttggatacaccaatataaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggatggtttgtatcaaaattgattttgaatgtgtaatgacc 30887298  T
Q  124 aaactatccttttaa 138  Q
    ||| || ||||||||    
T  30887299 aaattaaccttttaa 30887313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Original strand, 31520413 - 31520518
Alignment:
Q  20 tgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaat 119  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31520413 tgtgaatggatttatgtttagatatgcttat-taaaagtgatttttatgagttgatgttttttgggtagtttgaataaaaattgattttaaatgtgtaat 31520511  T
Q  120 gatcaaa 126  Q
    || ||||    
T  31520512 gaccaaa 31520518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Original strand, 9889410 - 9889549
Alignment:
Q  54 aaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaata 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||  ||| ||||||||||| ||| |||| | |||    
T  9889410 aaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatccttttaa-tgttattaaatata 9889508  T
Q  154 aatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatca 192  Q
    ||||| ||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||    
T  9889509 aatatctcattttcattttagataattatttgaacttatca 9889549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28987030 - 28986942
Alignment:
Q  55 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  || | |||||||||||    
T  28987030 aagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttaccattttaattgta 28986942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54153092 - 54152969
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  54153092 tgaatgtgaattgatta-tgtttgaatacactttactagaagtgattctcatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtc 54152994  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
     |||||  ||| ||||||| |||||    
T  54152993 taatgactaaattatccttataatt 54152969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6505246 - 6505124
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |  ||    
T  6505246 atgtgaattgatttatgtttagatacactcatataaaagtgattatcatgacttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataa 6505147  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattg 141  Q
    |||   || ||||||||||||||    
T  6505146 tgactgaattatccttttaattg 6505124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Original strand, 14564190 - 14564276
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14564190 tgaattgatttatgtttggataccttcagttaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 14564276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 2175188 - 2175309
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||    
T  2175188 atgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaacgtacaa 2175287  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    |||  ||| |||||||||||||    
T  2175288 tgactaaattatccttttaatt 2175309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13167573 - 13167476
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||  || |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13167573 tgaatgtgaattgatttatatttggatacacccatttaaaagtgattcttatgtattaatgatgtttggatagattgaatcaaaattgcttttaaatg 13167476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 140
Target Start/End: Original strand, 32238135 - 32238220
Alignment:
Q  55 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  ||| ||||||| |||||    
T  32238135 aagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaactgattttgaatgtctaatgactaaattatccttataatt 32238220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Original strand, 54735724 - 54735812
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  54735724 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgagtattttaaatcaaaattgatcttgaatgtgtaatgaccaaagtatccctttaatt 54735812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25312760 - 25312665
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25312760 atgtgaattgatttttgtttggatacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgcttttagatgt 25312665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14054896 - 14054807
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14054896 atgtgaattgatttatgtttggataaacttatataaaagtgattatttcaagttgatgttgtttgaatactttaaattaaaattgatttt 14054807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15619659 - 15619538
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | ||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||    
T  15619659 atgtgaattgatgtatgtttggataca-tta-ctataagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaa-tgatcttgaatgtgtaa 15619563  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    |||  ||| |||| |||||||||||    
T  15619562 tgactaaattatcattttaattgta 15619538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 54150571 - 54150476
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||    
T  54150571 atgtgaattgatttttgtttggatacacttcgttaaaaatgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgcttttagatgt 54150476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 39187782 - 39187704
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaa 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39187782 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttactagaagtgattcttgttagttgatgttgtttgaataatttgaa 39187704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14076060 - 14075939
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||| || || |||||| ||    
T  14076060 atgtaaattgatttatgtttggaaacatatacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttgagtactttaaatcaaaattaatcttgaatgtgtaa 14075961  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||| |||| ||||| |||||||    
T  14075960 tgaccaaagtatccctttaatt 14075939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 26426170 - 26426242
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 106  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26426170 tgtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 26426242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 48908287 - 48908231
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48908287 taaaagtaattcatataagttgatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgatttt 48908231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 48550262 - 48550173
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  48550262 atgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatattgtttggatagattggattaaaattgatttt 48550173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38694060 - 38693921
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaa 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||  ||||| |||| ||| ||||||||| ||  || ||     
T  38694060 taaaagtgattcttatgggttgatcttgcttgaataatttaaatcaaaattaattttgaatgt--aatgaccaaattatacttttaattatatataaaac 38693963  T
Q  152 taaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 191  Q
    |||| || ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  38693962 taaacatctcaatctcattttaaatgattatttcaacttatc 38693921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5025519 - 5025485
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5025519 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 5025485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38306059 - 38305962
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||   | |   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  38306059 tgaatgcgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttgaatg 38305962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 46926093 - 46926000
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||| || || || |||  ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  46926093 atgtgaattgatttatgtttggatacactcgtttaaaagtgatttttatgaattaattttatttatatattttgaatcaaaattacttttaaat 46926000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 48257115 - 48257054
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  48257115 taaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataaattggatcaaaattgattttgaatg 48257054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 54488653 - 54488556
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||   | |   ||||||||||||||| | || || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  54488653 tgaatgtgaattgatttatgtttgaataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcattttgtttggataacttggatcaaaattgattttaaatg 54488556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 165
Target Start/End: Original strand, 45780923 - 45781009
Alignment:
Q  79 gtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattc 165  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| |||| || | | || ||||||| ||||||    
T  45780923 gtttggatgatttgaatcaaaattgattttagatgtgcaatgaccaaattattctttaaattatactaaaaactaaatatctcattc 45781009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 20191781 - 20191821
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  20191781 atgttgtttggataacttgaatcaaaattaattttaaatgt 20191821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43628713 - 43628685
Alignment:
Q  86 tagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43628713 tagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 43628685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 45106398 - 45106358
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  45106398 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgattttgaatgt 45106358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 54655262 - 54655206
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  54655262 taaaagtgattatttcaagttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgatttt 54655206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5410723 - 5410553
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||    
T  5410723 atgtaaattgatttatgtttgaatacactact-taaaagtgattcttatgacttgatgttgtttggatagtttgaatcataattgattttgaatatgtaa 5410625  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5410624 tgaccaaactatccttttaattgtatttaaaagtaaatatctcattctcattatataattatttcaacttat 5410553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 48510995 - 48510821
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  48510995 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttgcttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtg 48510896  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
     |||||||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  48510895 taatgatcaaactatccttttgattatatttaaaagtaaatatctcattctgattagataattatttcagcttat 48510821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 4369844 - 4369968
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4369844 atgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaa 4369943  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  4369944 tgaccaaattatccttttaattgta 4369968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31223458 - 31223339
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  31223458 atgtgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgtaa 31223359  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaa 138  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  31223358 tgaccaaactatccttttaa 31223339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 40229514 - 40229679
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||   || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  40229514 gtgaattgatttatgtttggatacactttcttacaggtgattcttctgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatg 40229613  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaac 186  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  40229614 accaaactatccttttaatagtatttgaaagtaaatatcttattctcattagataattatttcaac 40229679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 7826396 - 7826520
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7826396 atgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaa 7826495  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||    
T  7826496 tgaccaagttatccttttaattgta 7826520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 42850261 - 42850385
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |     
T  42850261 atgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtat 42850360  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  42850361 tgaccaaattatccttttaattgta 42850385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 43728920 - 43729043
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  43728920 atgtgaattgatta-tgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatattaaa 43729018  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||| || ||||||| |||||    
T  43729019 tgaccaaattacccttttatttgta 43729043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 35569241 - 35569368
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  35569241 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgta 35569340  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  |||||||| |||||||||||    
T  35569341 taatgactaaactatcattttaattgta 35569368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 20800316 - 20800443
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  20800316 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaatattgattttgaatgta 20800415  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20800416 taatgactaaattatccttttaattgta 20800443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25230093 - 25229963
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  25230093 tgaatgtgaattgatta-tgtttggatacactttaatagaagtgattcttattagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgagtgtg 25229995  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgtaatta 147  Q
     ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  25229994 taatgaccaaattatccttttaattttaatta 25229963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6166179 - 6166070
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  || |||    
T  6166179 tgtttggatacactcatttaaaagtgattcttaggagttgatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttaccct 6166080  T
Q  134 tttaattgta 143  Q
    ||||||||||    
T  6166079 tttaattgta 6166070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12468296 - 12468176
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  12468296 atgtaaattgatttatatttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtacaa 12468198  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  12468197 tgaccaaattatccttttaatt 12468176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1199914 - 1199787
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1199914 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtg 1199815  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  |||||||| ||||| |||||    
T  1199814 taatgactaaactatctttttagttgta 1199787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36205272 - 36205102
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  36205272 tgaattggtttttgattggataaacttatttaaaagtgattcttacgagtgaatgttgcttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtttaatga 36205173  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 192  Q
     |||| || ||||||||||||| ||  || |||| |  ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  36205172 ccaaattaaccttttaattgtattttaaagtaaacacctcattttcattagataagtattttaacttatca 36205102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45710132 - 45710012
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  45710132 atgtgaattgatta-tgtttgaatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtctaa 45710034  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    |||  ||| ||||||| |||||    
T  45710033 tgactaaattatccttataatt 45710012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6464692 - 6464571
Alignment:
Q  18 aatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgga 117  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  6464692 aatgtgaattgatta-tgtttttatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtcta 6464594  T
Q  118 atgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||||  ||| ||||||| |||||    
T  6464593 atgactaaattatccttataatt 6464571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13056080 - 13055935
Alignment:
Q  20 tgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaat 119  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||    
T  13056080 tgtgaattgatttatgtttgaatacgcttat-taaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgcgtaat 13055982  T
Q  120 gatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 166  Q
    ||  ||| || |||||||| |||  ||| || ||||||| |||||||    
T  13055981 gacgaaattacccttttaactgtgtttaaaattaaatatctcattct 13055935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Original strand, 11051353 - 11051499
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||  |  ||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  11051353 atgtgaattgatttatgtttgaatacacacacttaaaaatggttcttaagagtt-atgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgtgtaa 11051451  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 166  Q
    ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||  |||||| |||||||    
T  11051452 tgaccaaattatccttttaattatatttaaaacaaaatatctcattct 11051499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35536123 - 35536032
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |  ||||| |||| || |||||||||||||    
T  35536123 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattacccttttaattgta 35536032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 50977383 - 50977528
Alignment:
Q  20 tgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaat 119  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  50977383 tgtgaattgttttatgtttggatacgcttat-tacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgtgtaat 50977481  T
Q  120 gatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 166  Q
    ||  ||| || |||||||| |||  ||| || ||||||| |||||||    
T  50977482 gactaaattacccttttaactgtgtttaaaattaaatatctcattct 50977528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12247489 - 12247380
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |  ||||| |||| || |||    
T  12247489 tgtttggatacacttgtttaaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggagaatttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattaccct 12247390  T
Q  134 tttaattgta 143  Q
    ||||||||||    
T  12247389 tttaattgta 12247380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31933772 - 31933687
Alignment:
Q  58 tgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31933772 tgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 31933687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13931706 - 13931603
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  13931706 atgtgaattgatta-tgtttggatatactcacttaaacatgattcttacaagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgtaa 13931608  T
Q  119 tgatc 123  Q
    |||||    
T  13931607 tgatc 13931603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10470638 - 10470579
Alignment:
Q  55 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10470638 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgt 10470579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Original strand, 11023404 - 11023495
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  || |||||||||||||    
T  11023404 taaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttacccttttaattgta 11023495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 47123470 - 47123375
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||    
T  47123470 atgtgaattgatttttgtttggatacacttcgttaaaagtgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgcttttagatgt 47123375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 50406214 - 50406119
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||   ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  50406214 atgtgaattgatttttgtttggatgcacttcgttaaaaatgattcttataagttgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgtttttaaatgt 50406119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9447602 - 9447533
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattg 103  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9447602 tgtttagatatactcatttaaaagtgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattg 9447533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40821873 - 40821788
Alignment:
Q  55 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  40821873 aagtgattcttatttgttgatgttatttggataatttgaatcaaaattgagtttgaatgtgcaatgactaaattatccttttaatt 40821788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25061305 - 25061218
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatc-taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25061305 aattgatttatgtttggatac-cttaacataaaagtgattcttatcaattgatgatgtttggataatttgaatcaaaattgattttaaa 25061218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26058325 - 26058236
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  26058325 atgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 26058236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11561909 - 11561826
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||    
T  11561909 tgaatgtgaattgatttatatttgaatatactattttaaaagtgattcttatgagttcatttaatttggatagtttgactcaaa 11561826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15884311 - 15884216
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatct-aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | | |  | |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15884311 atgtgaattgatttatgtttggatacaataaagtaaaaagtgatttttataaattcatgttgtttggatagtttggatcaaaattgattttgaatg 15884216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Original strand, 23628752 - 23628830
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 102  Q
    ||||||||| |||||||||| | | | |||||| |||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23628752 aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttgggtggtttgaatcaaaatt 23628830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 27801694 - 27801763
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag 88  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27801694 atgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatag 27801763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41856989 - 41856950
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41856989 taaaagtgattcttattagttgattttgtttggatagttt 41856950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34718530 - 34718452
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 102  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34718530 aattgatttatgtttgaatacacttgtacaaaagtgattcttatgaattatagttgtttggatactttgaattaaaatt 34718452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 78
Target Start/End: Original strand, 291762 - 291818
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgtt 78  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  291762 tgaattggtttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattgttatgagttgttgtt 291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 46033210 - 46033250
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  46033210 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgattttgaatgt 46033250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 7472713 - 7472840
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  7472713 atgtgaattgatta-tgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaa 7472811  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaatta 147  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  7472812 tgaccaaattatccttgtaattgtaatta 7472840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Original strand, 9988540 - 9988657
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  9988540 atgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtgtaa 9988639  T
Q  119 tgatcaaactatcctttt 136  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  9988640 tgaccaaactatcatttt 9988657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 5916278 - 5916404
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5916278 tgaatgtgaattgatta-tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 5916376  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5916377 taatgactaaactatccttttaattgta 5916404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 26207968 - 26208139
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26207968 atgtgaattgatttatgttttgatacacttaattaaaattgattcttacaagttgatgttgtttggattatatgaatcaaaattgattttaaatgtacaa 26208067  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 190  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  26208068 tgaccaaactatccttttgattgtatttaaaagcaaatatctcattcacattagataattatttcagcttat 26208139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36312348 - 36312222
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36312348 tgaatgtgaattgatta-tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 36312250  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||    
T  36312249 taatgactaaactatccttttaattgta 36312222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 28127323 - 28127434
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28127323 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgta 28127422  T
Q  116 gaatgatcaaac 127  Q
     ||||| |||||    
T  28127423 aaatgaccaaac 28127434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2213578 - 2213480
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2213578 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 2213480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14821232 - 14821111
Alignment:
Q  18 aatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgga 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |    
T  14821232 aatgtgaattgatta-tgtttggatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttgaatcaaaattgattttgaatgtcta 14821134  T
Q  118 atgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||||  ||| ||||||| |||||    
T  14821133 atgactaaattatccttataatt 14821111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28641711 - 28641587
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatactt-atctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgga 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28641711 atgtgaattgatttatatttgggta-acttcatttaaaagtgattattataagttgatgttgtttggatatgttgaattaaaattgattttaaatgtgta 28641613  T
Q  118 atgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  28641612 atgaccaaattatccttttaattgta 28641587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 1945075 - 1945166
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1945075 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 1945166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 39141523 - 39141597
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39141523 tgtttggatacactcatttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 39141597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28261363 - 28261246
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  28261363 atgtgaattgatttatatttggatactctcacatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtataa 28261264  T
Q  119 tgatcaaactatcctttt 136  Q
    ||| |||  |||||||||    
T  28261263 tgaccaacttatcctttt 28261246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Original strand, 44619104 - 44619208
Alignment:
Q  23 gaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgat 122  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||     
T  44619104 gaattgatttatgtttggatacacttgtttaaaaatgattattatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaatcgattttgaatgtaaaatgac 44619203  T
Q  123 caaac 127  Q
    |||||    
T  44619204 caaac 44619208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8170344 - 8170244
Alignment:
Q  57 gtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||  ||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  8170344 gtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatccttctaa-tgttattaaaaataaat 8170246  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  8170245 at 8170244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23358312 - 23358219
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaac 127  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  23358312 tgtttggatacacttgtttaaaagtgattgtgatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaac 23358219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2234963 - 2234901
Alignment:
Q  51 ctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2234963 ctaaaagtgattcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgt 2234901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3853972 - 3853862
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| | | || ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3853972 tgaatgtaaattgatttatgtttggatacattcatgtaaaattgattcttatcaatctatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgcttttgaatgtg 3853873  T
Q  116 gaatgatcaaa 126  Q
     ||| ||||||    
T  3853872 taattatcaaa 3853862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7296224 - 7296102
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||| |  ||    
T  7296224 atgtgaattgatttatgtttggatacactcatataaaagtgattatcatgacttgatgttatttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataa 7296125  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattg 141  Q
    ||| | || ||||||||| ||||    
T  7296124 tgaccgaattatccttttgattg 7296102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 25940280 - 25940402
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| | |||| ||| |||  | || |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  25940280 atgtgaattgatttatatttgaatacactcgtatagaagtgattattatgagatgatgttgtttggacagtttgaatcaaaattgattttgaatatataa 25940379  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattg 141  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||    
T  25940380 tgaccaaattatccttctaattg 25940402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 42089564 - 42089666
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatata----cttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || ||||| |    
T  42089564 tgaatgtgaattgatttatgtttggatagatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataaatcgaatcaaaactgcttttaga 42089663  T
Q  112 tgt 114  Q
    |||    
T  42089664 tgt 42089666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 42516015 - 42516135
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  42516015 atgtgaattgatta-tgtttgaatatactcattaaaaaatgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataa 42516113  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    | | |||| |||| ||||||||    
T  42516114 taaccaaattatctttttaatt 42516135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27911475 - 27911380
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  27911475 atgtgaattgatttatgtttggatatactcatttaaaagtgattatttcaagttgatgttatttggatactttaaattaaaattgattttagatgt 27911380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Original strand, 31562756 - 31562819
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31562756 taaaagtgattcttatgagtttatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaatgtg 31562819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32502022 - 32501931
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  || |||||||||||||    
T  32502022 taaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttacccttttaattgta 32501931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 141
Target Start/End: Original strand, 7295392 - 7295507
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatc 123  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |  ||||| |    
T  7295392 aattgatttatgtttggatacacatat--aaaagtgattatcatgagttgatgttgtttggatagtttaagtcaaacttgattttgaatatataatgacc 7295489  T
Q  124 aaactatccttttaattg 141  Q
     || ||||||||||||||    
T  7295490 gaattatccttttaattg 7295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16467155 - 16467066
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  16467155 atgtaaattgatttatgtttggatatgataatgtaaaagtgattcttatgggttgatgtagtttggatagtttagatcaaaattaatttt 16467066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 31224749 - 31224690
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgtt 78  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31224749 atgtgaattgatttatgtttggatatattttactaaaagtgattcttatgagttgatgtt 31224690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 36548268 - 36548130
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||  ||    
T  36548268 atgtgaattgatttatgtttggatactctcacttaaaa-tgatttttatgggttgatgttgtttggataatttaaattaaaattgattttgaacgtacaa 36548170  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 158  Q
    |||  ||| ||||||||||||| || ||| || |||||||    
T  36548169 tgactaaattatccttttaattatatttaaaactaaatat 36548130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2213716 - 2213658
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgt 77  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2213716 atgtgaattgatttgtctttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgt 2213658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 3602503 - 3602587
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3602503 aattgaattatgtttggatatattaaaataaaagtgatttttattaattcatgttgtttggatagtttgaattaaaattgatttt 3602587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 25747925 - 25748009
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||||| |||||||||| | | | |||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25747925 aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgctttt 25748009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18511172 - 18511077
Alignment:
Q  18 aatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 113  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |   || ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  18511172 aatgttaattgatttatgtttggatacatcaatgtaaaaatgattcttataaagtgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgattttgaatg 18511077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2212814 - 2212745
Alignment:
Q  95 tcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||    
T  2212814 tcaaaattgattttaaatgtgcaatgaccaaattatccttttaattttatttaaaattaaatatctcatt 2212745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Original strand, 43436320 - 43436409
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||  ||| || ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  43436320 atgtaaattgatttatgttttgatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 43436409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 2215319 - 2215215
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||  ||||    
T  2215319 gtgaattgatttatgtttggatacacttgtttaaaaataattttt--gagttgatgttgtttggataatttaaattagaattgattttgaatgtaaaatg 2215222  T
Q  121 atcaaac 127  Q
    | |||||    
T  2215221 accaaac 2215215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Original strand, 39106764 - 39106831
Alignment:
Q  76 gttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  39106764 gttgtttagataatttgaatcaaaattgattttaaatatacaatgaccaaattatcctttaaattgta 39106831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 3552921 - 3552981
Alignment:
Q  55 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    |||| |||||||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3552921 aagtaattcttatcatttcatattgtttggataatttgaatcaaaattgatcttaaatgtg 3552981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8509 - 8388
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  8509 atgtgaattgatttatgtttggatacacttttttaaaaatgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtacaa 8410  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  8409 tgaccaaattatccttttaatt 8388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32030788 - 32030638
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  32030788 atgtgaattgatttttgttttgatatacttattcaaaagtgattcttatg--ttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaaggtgtaa 32030691  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatta 171  Q
    |||  |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| | ||||||||||||    
T  32030690 tgactaaactatccttttagttgtatttaaaagtaaatgtctcattctcatta 32030638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41834964 - 41834828
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  41834964 gtgaattgatttatgtttggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtgcaatg 41834865  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaattagaaataaata 157  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  41834864 accaaattatccttttaattgtatttaaaagtaaata 41834828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22482266 - 22482139
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22482266 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgta 22482167  T
Q  116 gaatgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22482166 taatgactaaactatccttttaattgta 22482139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32454608 - 32454483
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  32454608 gtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatg 32454510  T
Q  121 atcaaactatccttttaattgtaatta 147  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  32454509 accaaattatccttgtaattgtaatta 32454483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40885285 - 40885163
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga-ttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgga 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  40885285 atgtgaattgatttatgtttggacacacttgtttaaaagtgagtttttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgta 40885186  T
Q  118 atgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  40885185 atgatcaaattatccttttaatt 40885163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3667931 - 3667833
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3667931 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 3667833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Original strand, 28869541 - 28869679
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  | |||| ||    
T  28869541 atgtggattgatttatgtttgaatacacttacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgagt-aaaatagatttcgagtgtgtaa 28869639  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 158  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  28869640 tgaccaaattatccttttaattgtatttaaaactaaatat 28869679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35760266 - 35760168
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35760266 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaactgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 35760168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 3060265 - 3060376
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  3060265 tgaattaatttatgtttggatatactca-cttaaagtgattcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtattga 3060362  T
Q  122 tcaaactatccttt 135  Q
     |||| ||||||||    
T  3060363 ccaaattatccttt 3060376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10058145 - 10058024
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || ||    
T  10058145 tgaattgatttatgtttggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaacgtgcaacga 10058046  T
Q  122 tcaaactatccttttaattgta 143  Q
     |||| |||| |||||||||||    
T  10058045 ccaaattatcattttaattgta 10058024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 40495396 - 40495516
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||  ||    
T  40495396 atgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttgaatagtttaaatcaaaattgatttggaatgtacaa 40495494  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  40495495 tgatcaaattatccttttaatt 40495516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 9275522 - 9275646
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||| ||    
T  9275522 atgttaattgatttatgtttggatacactttaataaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgtaa 9275621  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgta 143  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||    
T  9275622 tgaccaaattatctttttaattgta 9275646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 13253118 - 13253209
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13253118 tgaatatgaattgatta-tgtttggatacactcatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgatttt 13253209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Original strand, 7385972 - 7386062
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  7385972 gtgaattgatttatgtttaaatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgcttttaaa 7386062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Original strand, 39988007 - 39988097
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||    
T  39988007 gtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttaaatcaaaatttcttttaaa 39988097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 16158503 - 16158624
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    ||||||||| |||| | |||||||  |||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16158503 atgtgaattaatttatatttggatgcacttttttaaaagtgattcttaggaattgatgttctttggatgatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaa 16158602  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaatt 140  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  16158603 tgatcaaaatattcttttaatt 16158624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 41740634 - 41740739
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  41740634 tgaattggtttatgtttgaatacacttgtttaaaagtgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 41740733  T
Q  122 tcaaac 127  Q
     |||||    
T  41740734 ccaaac 41740739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 134
Target Start/End: Original strand, 2430349 - 2430449
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||| ||||||    
T  2430349 tgtttggatacacttcaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtaatgactaaattatcct 2430448  T
Q  134 t 134  Q
    |    
T  2430449 t 2430449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Original strand, 8049094 - 8049181
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  8049094 aattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgttgttgtttggatgatttaaatcaaaattgcttttaaa 8049181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 140
Target Start/End: Original strand, 33953954 - 33954060
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatcct 133  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||||||    
T  33953954 tgtttggatacactttaatagaagtgattctgatgagttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtgtaatgactaaattatcct 33954053  T
Q  134 tttaatt 140  Q
    |||||||    
T  33954054 tttaatt 33954060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4292226 - 4292121
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4292226 tgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttaattagaagtgattcttgttggttgatattgtttggataatttgaatcaaaattaattttgaatgtg 4292127  T
Q  116 gaatga 121  Q
     |||||    
T  4292126 taatga 4292121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7714975 - 7714840
Alignment:
Q  58 tgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaata 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  7714975 tgattcttataagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaaagtataatgactaaattatccttttaa-tgttattaaaaataaata 7714877  T
Q  158 tttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatca 192  Q
    | ||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||    
T  7714876 tctcattttcattttagataattatttgaacttatca 7714840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27021203 - 27021085
Alignment:
Q  18 aatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggat-agtttgaatcaaaattgattttaaatgtgg 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||      
T  27021203 aatgtgaattgatttatgtttgg-tatactcacttaaaagtgattcttagaagttgatgttgtttggataagattgaatcaaaattgattttgaatgtat 27021105  T
Q  117 aatgatcaaactatcctttt 136  Q
    |||||  ||| |||||||||    
T  27021104 aatgacgaaattatcctttt 27021085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 5710425 - 5710511
Alignment:
Q  20 tgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 107  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5710425 tgtgaattgctttatgtttggatacgcttat-tacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattt 5710511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24045904 - 24045759
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||   || |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||  ||    
T  24045904 atgtgaattgatttatgtttggatgctctcacttaaaa-tgatttttatgggttgatgttgtttggataatttgaattaaaattgattttgaacgtacaa 24045806  T
Q  119 tgatcaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattc 165  Q
    |||  ||| |||||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||    
T  24045805 tgactaaattatccttttaattagatttaaaactaaatatctcattc 24045759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 7178847 - 7178763
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||||| |||||||||| | | | |||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7178847 aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgctttt 7178763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 40791122 - 40791194
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 106  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40791122 tgtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 40791194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 42146367 - 42146295
Alignment:
Q  34 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 106  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42146367 tgtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 42146295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Original strand, 2694831 - 2694887
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2694831 taaaagtgattcttatcaattgatgatgtttgtataatttgaatcaaaattgatttt 2694887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16843573 - 16843516
Alignment:
Q  58 tgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  16843573 tgatttttacgagttgatgttgtttggatagtttaaatgataattgattttgaatgtg 16843516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 3747683 - 3747723
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3747683 atgttgtttggatagttttaatcaaaattgattttacatgt 3747723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 41959502 - 41959446
Alignment:
Q  52 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  | ||||||||||    
T  41959502 taaaagtgattcttatgagttaatgttgttttcatagtttgaaatagaattgatttt 41959446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 102
Target Start/End: Original strand, 34106985 - 34107068
Alignment:
Q  19 atgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaatt 102  Q
    |||||||||||||  |||||  ||| | | || ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34106985 atgtgaattgattaatgtttaaatacattcatttaaaagtaattcttatgaattaatgttgtttgaataggttgaatcaaaatt 34107068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19784833 - 19784791
Alignment:
Q  73 gatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19784833 gatgttgtttggatagttttgatcaaaattgcttttaaatgtg 19784791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40980037 - 40979997
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  40980037 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttgaatgt 40979997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 29161 - 29278
Alignment:
Q  16 tgaatgtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||   || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29161 tgaatgtgaattgatta-tgtttggatacactttaatagaagttattcttatgaattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtg 29259  T
Q  116 gaatgatcaaactatcctt 134  Q
     |||||  ||| |||||||    
T  29260 taatgactaaattatcctt 29278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9136 - 8997
Alignment:
Q  54 aaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttttaattgtaattagaaata 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||  ||| ||||||||||| ||| |||| | |||    
T  9136 aaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatccttttaa-tgttattaaatata 9038  T
Q  154 aatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatca 192  Q
    ||||| ||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||    
T  9037 aatatctcattttcattttagataattatttgaacttatca 8997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0983 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 2311 - 2430
Alignment:
Q  21 gtgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatg 120  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| || |||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||||    
T  2311 gtgaattgatttatgtttggacacacttgtttaaaagtggtttttacaagttgacgttgtttagatagtttgaatcaaaattgattttggatatgtaatg 2410  T
Q  121 atcaaactatccttttaatt 140  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  2411 accaaattatccttttaatt 2430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 253185 - 253099
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  253185 tgaattgatttatgtttggataccttcagttaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 253099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Original strand, 2071 - 2190
Alignment:
Q  22 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |  || ||    
T  2071 tgaattgatttatgtttggatgcactcatataaaagtgattatcatggcttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataaaga 2170  T
Q  122 tcaaactatccttttaattg 141  Q
     | || ||||||||||||||    
T  2171 ccgaattatccttttaattg 2190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 135
Target Start/End: Original strand, 5903 - 5988
Alignment:
Q  55 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt-----gaatcaaaattgattttaaatgtggaatgatcaaactatccttt 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  5903 aagtgattcttgtgggttgatgttgtttggatagtttaatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatccttt 5988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 46818 - 46734
Alignment:
Q  24 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 108  Q
    ||||| ||| |||||||||||| | |  ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46818 aattggtttatgtttggatatattaaagtaaaagtgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgatttt 46734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 114
Target Start/End: Original strand, 9254 - 9294
Alignment:
Q  74 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9254 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttaaatgt 9294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University