View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14536_high_3 (Length: 544)

Name: NF14536_high_3
Description: NF14536
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14536_high_3
NF14536_high_3
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (27-380)||(37392543-37392897)
chr8 (27-377)||(38363804-38364155)
chr8 (27-380)||(35818421-35818775)
chr8 (27-380)||(25837631-25837985)
chr8 (29-378)||(32660932-32661283)
chr8 (27-380)||(16313504-16313858)
chr8 (27-382)||(12710363-12710719)
chr8 (27-380)||(38132734-38133089)
chr8 (37-376)||(18297836-18298176)
chr8 (30-376)||(18726619-18726967)
chr8 (37-378)||(3049731-3050073)
chr8 (29-385)||(26061859-26062216)
chr8 (29-366)||(1554353-1554692)
chr8 (37-378)||(7930961-7931303)
chr8 (37-378)||(26601945-26602286)
chr8 (31-375)||(42755592-42755937)
chr8 (30-373)||(10896217-10896560)
chr8 (28-306)||(41228712-41228990)
chr8 (27-375)||(5020487-5020837)
chr8 (29-321)||(7317156-7317445)
chr8 (27-335)||(35394156-35394464)
chr8 (32-375)||(21137134-21137476)
chr8 (31-376)||(33444627-33444969)
chr8 (37-377)||(29421496-29421839)
chr8 (95-378)||(15226688-15226970)
chr8 (36-375)||(41432464-41432805)
chr8 (200-381)||(40197223-40197405)
chr8 (69-376)||(19160780-19161088)
chr8 (37-380)||(43871973-43872316)
chr8 (94-377)||(31117594-31117874)
chr8 (105-339)||(6805698-6805936)
chr8 (69-378)||(16218982-16219290)
chr8 (37-186)||(40197083-40197232)
chr8 (227-378)||(25899381-25899531)
chr8 (37-186)||(38437369-38437518)
chr8 (98-376)||(37981857-37982134)
chr8 (69-201)||(14763970-14764101)
chr8 (227-381)||(33533589-33533744)
chr8 (26-186)||(25899548-25899707)
chr8 (29-146)||(34672289-34672406)
chr8 (319-380)||(35394078-35394139)
chr8 (262-378)||(34672083-34672201)
chr8 (99-376)||(12649859-12650137)
chr8 (227-375)||(38437203-38437351)
chr8 (300-376)||(37124073-37124149)
chr8 (344-382)||(41228984-41229022)
chr8 (95-167)||(32901787-32901858)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (27-375)||(2430223-2430571)
chr1 (29-378)||(46666431-46666781)
chr1 (30-377)||(20260086-20260434)
chr1 (28-377)||(9115561-9115911)
chr1 (30-380)||(14788444-14788795)
chr1 (31-383)||(25789481-25789834)
chr1 (27-376)||(1597339-1597689)
chr1 (27-380)||(52630494-52630848)
chr1 (29-380)||(12190176-12190528)
chr1 (27-381)||(8331734-8332089)
chr1 (37-378)||(36361506-36361847)
chr1 (32-378)||(32824644-32824992)
chr1 (32-375)||(9831872-9832216)
chr1 (30-377)||(39930181-39930529)
chr1 (29-378)||(6911208-6911566)
chr1 (29-383)||(4683373-4683727)
chr1 (29-378)||(2632576-2632925)
chr1 (37-374)||(51445087-51445424)
chr1 (37-377)||(38964686-38965027)
chr1 (27-376)||(39329347-39329683)
chr1 (32-378)||(50190767-50191113)
chr1 (29-305)||(3572564-3572841)
chr1 (29-378)||(5518503-5518852)
chr1 (29-378)||(5806290-5806625)
chr1 (29-375)||(35187181-35187529)
chr1 (29-375)||(48916021-48916368)
chr1 (27-321)||(6978550-6978845)
chr1 (29-376)||(32202330-32202660)
chr1 (37-371)||(13653581-13653916)
chr1 (47-376)||(37436638-37436966)
chr1 (29-378)||(29091395-29091739)
chr1 (27-363)||(52699463-52699799)
chr1 (29-336)||(49822916-49823203)
chr1 (29-235)||(47037324-47037530)
chr1 (207-383)||(47031577-47031754)
chr1 (83-380)||(46960349-46960646)
chr1 (41-375)||(1227889-1228225)
chr1 (28-377)||(47677368-47677716)
chr1 (37-332)||(30240782-30241074)
chr1 (31-378)||(24116338-24116683)
chr1 (32-374)||(38519064-38519405)
chr1 (30-186)||(1007663-1007819)
chr1 (61-379)||(17475352-17475659)
chr1 (250-384)||(25473972-25474107)
chr1 (156-375)||(48462258-48462475)
chr1 (37-375)||(31806763-31807093)
chr1 (31-215)||(11014442-11014626)
chr1 (31-375)||(13931885-13932218)
chr1 (37-378)||(9011168-9011511)
chr1 (74-372)||(13521053-13521349)
chr1 (69-189)||(19083144-19083264)
chr1 (69-189)||(19131032-19131152)
chr1 (37-252)||(20504996-20505213)
chr1 (69-215)||(13440281-13440428)
chr1 (88-375)||(29769230-29769526)
chr1 (37-156)||(52186053-52186172)
chr1 (301-382)||(49627293-49627374)
chr1 (297-381)||(52186265-52186349)
chr1 (69-186)||(37261764-37261880)
chr1 (207-306)||(1007566-1007665)
chr1 (222-380)||(37261540-37261699)
chr1 (283-378)||(45771815-45771910)
chr1 (114-377)||(3939225-3939486)
chr1 (29-195)||(19094020-19094186)
chr1 (222-376)||(19923655-19923810)
chr1 (283-362)||(45813648-45813727)
chr1 (324-378)||(37726805-37726859)
chr1 (68-195)||(33702380-33702508)
chr1 (90-145)||(52276877-52276930)
chr1 (69-127)||(3939515-3939573)
chr1 (328-373)||(49824022-49824067)
chr1 (349-381)||(6978517-6978549)
chr1 (106-194)||(11077963-11078051)
chr1 (100-156)||(37336514-37336570)
chr1 (171-262)||(52186170-52186260)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (27-380)||(40907986-40908339)
chr3 (27-382)||(11239117-11239473)
chr3 (29-378)||(8476307-8476657)
chr3 (29-378)||(26848744-26849094)
chr3 (30-374)||(47114857-47115202)
chr3 (49-374)||(31611004-31611330)
chr3 (37-378)||(33217920-33218262)
chr3 (32-376)||(1098923-1099267)
chr3 (28-384)||(44952024-44952381)
chr3 (27-380)||(48339754-48340108)
chr3 (27-382)||(20297511-20297867)
chr3 (30-378)||(6231501-6231850)
chr3 (30-384)||(9320448-9320804)
chr3 (30-372)||(28124436-28124779)
chr3 (29-376)||(20414464-20414812)
chr3 (29-378)||(24574289-24574647)
chr3 (51-379)||(46359673-46360002)
chr3 (38-378)||(53165733-53166073)
chr3 (27-375)||(43132154-43132502)
chr3 (45-380)||(10822733-10823068)
chr3 (94-375)||(43718994-43719271)
chr3 (27-376)||(31435920-31436269)
chr3 (154-376)||(29512324-29512546)
chr3 (30-376)||(12228256-12228601)
chr3 (69-376)||(26849194-26849492)
chr3 (29-377)||(28770209-28770557)
chr3 (115-306)||(19532939-19533130)
chr3 (40-343)||(1246912-1247213)
chr3 (69-377)||(27822994-27823306)
chr3 (222-382)||(6832114-6832275)
chr3 (32-375)||(40584336-40584669)
chr3 (27-384)||(24783925-24784279)
chr3 (69-205)||(12930980-12931115)
chr3 (87-371)||(38140425-38140710)
chr3 (222-373)||(49216027-49216179)
chr3 (29-215)||(2565459-2565644)
chr3 (29-159)||(27093957-27094088)
chr3 (87-201)||(18460839-18460953)
chr3 (37-291)||(32071256-32071504)
chr3 (28-213)||(33647701-33647886)
chr3 (283-374)||(6927817-6927908)
chr3 (88-162)||(29512631-29512705)
chr3 (29-191)||(45826687-45826848)
chr3 (27-92)||(43715305-43715370)
chr3 (26-154)||(6831953-6832079)
chr3 (290-376)||(32070994-32071080)
chr3 (228-371)||(18460582-18460725)
chr3 (295-372)||(33650280-33650357)
chr3 (69-156)||(28139759-28139846)
chr3 (69-136)||(39932562-39932631)
chr3 (28-126)||(55435390-55435488)
chr3 (299-373)||(55435652-55435726)
chr3 (295-366)||(27093763-27093834)
chr3 (295-382)||(28693697-28693784)
chr3 (68-159)||(33497799-33497890)
chr3 (344-381)||(19532908-19532945)
chr3 (283-372)||(21925775-21925864)
chr3 (283-376)||(31267601-31267694)
chr3 (301-373)||(45826064-45826136)
chr3 (300-375)||(26085442-26085517)
chr3 (314-380)||(44533943-44534009)
chr3 (321-374)||(2566471-2566524)
chr3 (55-96)||(9320405-9320446)
chr3 (116-172)||(12108242-12108298)
chr3 (88-195)||(13642976-13643083)
chr3 (27-163)||(28693423-28693559)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (29-378)||(346344-346694)
chr2 (29-378)||(6171513-6171863)
chr2 (27-380)||(42674658-42675012)
chr2 (29-378)||(11071327-11071677)
chr2 (27-381)||(4559278-4559633)
chr2 (29-378)||(37533675-37534024)
chr2 (29-378)||(14777497-14777847)
chr2 (27-376)||(17965707-17966057)
chr2 (32-380)||(2050586-2050935)
chr2 (28-378)||(41729128-41729479)
chr2 (27-380)||(21737397-21737759)
chr2 (30-373)||(9733846-9734190)
chr2 (32-382)||(37192240-37192591)
chr2 (37-377)||(5770117-5770458)
chr2 (29-341)||(2521434-2521747)
chr2 (37-375)||(28311704-28312042)
chr2 (37-376)||(638318-638657)
chr2 (37-375)||(37233155-37233493)
chr2 (26-378)||(40950855-40951208)
chr2 (31-353)||(41750276-41750599)
chr2 (37-374)||(26309993-26310333)
chr2 (28-377)||(20426481-20426830)
chr2 (27-354)||(34356697-34357023)
chr2 (29-325)||(39995130-39995435)
chr2 (29-370)||(45408981-45409322)
chr2 (29-370)||(27357962-27358303)
chr2 (99-378)||(23943885-23944165)
chr2 (130-375)||(13760692-13760938)
chr2 (37-378)||(18713664-18714005)
chr2 (37-375)||(3902182-3902520)
chr2 (27-381)||(45693908-45694262)
chr2 (37-375)||(14832536-14832874)
chr2 (30-339)||(1988073-1988382)
chr2 (29-378)||(40569740-40570092)
chr2 (37-376)||(39819414-39819760)
chr2 (29-186)||(6571602-6571759)
chr2 (27-378)||(7007307-7007647)
chr2 (28-370)||(4875506-4875848)
chr2 (27-382)||(5002834-5003188)
chr2 (224-366)||(11763594-11763737)
chr2 (45-237)||(11763386-11763577)
chr2 (45-211)||(14253412-14253578)
chr2 (222-374)||(3254284-3254437)
chr2 (95-370)||(41297983-41298255)
chr2 (94-370)||(13539399-13539675)
chr2 (169-372)||(13790018-13790222)
chr2 (29-186)||(25454939-25455096)
chr2 (37-278)||(1623206-1623446)
chr2 (72-201)||(25724925-25725055)
chr2 (29-146)||(14403232-14403349)
chr2 (32-143)||(24499400-24499509)
chr2 (66-337)||(4684945-4685214)
chr2 (263-374)||(1623078-1623188)
chr2 (69-203)||(8868702-8868834)
chr2 (317-370)||(2521381-2521434)
chr2 (109-211)||(3254142-3254245)
chr2 (301-372)||(14253254-14253325)
chr2 (68-214)||(37851744-37851891)
chr2 (69-195)||(25625290-25625418)
chr2 (37-105)||(13760941-13761009)
chr2 (101-211)||(516463-516572)
chr2 (318-380)||(36590862-36590924)
chr2 (301-378)||(25444922-25444999)
chr2 (297-370)||(45212662-45212735)
chr2 (297-367)||(10390559-10390627)
chr2 (242-314)||(14253340-14253413)
chr2 (151-251)||(14137054-14137153)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (28-374)||(45045352-45045699)
chr7 (28-377)||(35488187-35488537)
chr7 (27-380)||(11329713-11330067)
chr7 (27-380)||(27248013-27248367)
chr7 (31-380)||(45265049-45265399)
chr7 (27-381)||(33378553-33378916)
chr7 (30-378)||(44565767-44566116)
chr7 (31-382)||(43948963-43949315)
chr7 (29-377)||(27213854-27214203)
chr7 (37-378)||(48341086-48341426)
chr7 (27-382)||(9946987-9947344)
chr7 (30-373)||(38543920-38544265)
chr7 (45-376)||(34930481-34930814)
chr7 (29-376)||(27419223-27419571)
chr7 (27-380)||(48313842-48314196)
chr7 (29-372)||(39553910-39554255)
chr7 (37-377)||(45448665-45449006)
chr7 (27-380)||(28904183-28904537)
chr7 (29-340)||(8419588-8419900)
chr7 (37-380)||(25924644-25924988)
chr7 (30-332)||(40212657-40212960)
chr7 (29-372)||(25097796-25098141)
chr7 (45-378)||(38396381-38396714)
chr7 (31-380)||(41632365-41632710)
chr7 (27-347)||(9814215-9814532)
chr7 (32-373)||(44819981-44820323)
chr7 (28-377)||(48160589-48160921)
chr7 (32-374)||(37534105-37534447)
chr7 (31-374)||(30685993-30686336)
chr7 (27-262)||(16825351-16825586)
chr7 (29-372)||(18823890-18824218)
chr7 (37-377)||(6656480-6656819)
chr7 (80-380)||(45722879-45723170)
chr7 (27-252)||(25045615-25045838)
chr7 (114-382)||(31921811-31922079)
chr7 (27-252)||(11000552-11000777)
chr7 (30-375)||(45440637-45440979)
chr7 (28-286)||(41684020-41684278)
chr7 (32-262)||(6656226-6656454)
chr7 (95-381)||(40385692-40385979)
chr7 (95-378)||(5543196-5543479)
chr7 (99-371)||(22156248-22156520)
chr7 (99-371)||(22212163-22212435)
chr7 (34-377)||(43445887-43446229)
chr7 (225-381)||(17276353-17276511)
chr7 (227-374)||(31598449-31598597)
chr7 (87-338)||(38528764-38529012)
chr7 (118-281)||(43569773-43569936)
chr7 (68-159)||(10902688-10902779)
chr7 (326-381)||(16916182-16916237)
chr7 (37-332)||(47246071-47246366)
chr7 (31-97)||(45723211-45723277)
chr7 (37-156)||(31598623-31598741)
chr7 (69-159)||(30871130-30871220)
chr7 (178-328)||(10902820-10902971)
chr7 (29-96)||(31921747-31921813)
chr7 (349-378)||(40212626-40212655)
chr7 (69-125)||(20601297-20601353)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (27-380)||(201646-201999)
scaffold0006 (37-371)||(143342-143677)
scaffold0006 (69-372)||(119051-119352)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (27-381)||(22935909-22936264)
chr5 (29-378)||(4765559-4765909)
chr5 (28-374)||(19065503-19065850)
chr5 (26-384)||(28602272-28602630)
chr5 (29-378)||(29543014-29543364)
chr5 (29-378)||(18411931-18412281)
chr5 (51-374)||(8646412-8646735)
chr5 (37-375)||(11855662-11856001)
chr5 (29-378)||(12970529-12970879)
chr5 (29-376)||(555705-556053)
chr5 (29-378)||(14206820-14207170)
chr5 (29-375)||(27481082-27481429)
chr5 (37-380)||(6091435-6091779)
chr5 (37-378)||(8406616-8406958)
chr5 (32-379)||(32535658-32536006)
chr5 (30-320)||(36703654-36703945)
chr5 (69-376)||(27480735-27481041)
chr5 (27-375)||(42012176-42012530)
chr5 (77-375)||(1664456-1664754)
chr5 (25-380)||(6930362-6930720)
chr5 (32-318)||(20962373-20962659)
chr5 (30-378)||(43346895-43347243)
chr5 (226-376)||(36703506-36703657)
chr5 (69-381)||(17251533-17251844)
chr5 (227-378)||(26637217-26637370)
chr5 (66-374)||(31583099-31583404)
chr5 (48-362)||(35348545-35348858)
chr5 (27-205)||(40275751-40275930)
chr5 (297-378)||(28429450-28429531)
chr5 (37-202)||(19089724-19089889)
chr5 (73-186)||(30899470-30899583)
chr5 (300-372)||(16720957-16721029)
chr5 (222-380)||(35602968-35603124)
chr5 (95-214)||(41783685-41783805)
chr5 (32-127)||(26637045-26637140)
chr5 (67-138)||(28429664-28429735)
chr5 (304-374)||(20962286-20962356)
chr5 (68-191)||(15200584-15200704)
chr5 (312-376)||(40276524-40276587)
chr5 (94-189)||(28023745-28023840)
chr5 (73-175)||(16720255-16720356)
chr5 (239-374)||(30899327-30899463)
chr5 (301-374)||(36978405-36978478)
chr5 (68-128)||(36978209-36978269)
chr5 (299-362)||(27901697-27901760)
chr5 (83-142)||(35602876-35602935)
chr5 (69-159)||(3913239-3913327)
chr5 (274-374)||(19089915-19090016)
chr5 (69-125)||(830059-830115)
chr5 (289-377)||(27079220-27079308)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (30-378)||(13229989-13230338)
chr4 (28-382)||(55967998-55968353)
chr4 (30-376)||(27762899-27763246)
chr4 (29-378)||(35999412-35999762)
chr4 (27-380)||(45595992-45596346)
chr4 (30-371)||(48518891-48519233)
chr4 (29-378)||(48879051-48879401)
chr4 (27-378)||(39730290-39730642)
chr4 (27-382)||(42773670-42774026)
chr4 (28-378)||(45747794-45748144)
chr4 (27-380)||(43722988-43723342)
chr4 (29-376)||(40435628-40435976)
chr4 (29-378)||(6279920-6280270)
chr4 (27-380)||(25932165-25932519)
chr4 (27-380)||(41859044-41859397)
chr4 (27-381)||(935849-936204)
chr4 (29-378)||(23686513-23686863)
chr4 (31-382)||(47670084-47670436)
chr4 (27-380)||(18405231-18405584)
chr4 (30-336)||(34049597-34049904)
chr4 (29-370)||(50672907-50673245)
chr4 (29-378)||(39835306-39835656)
chr4 (27-380)||(27555151-27555488)
chr4 (32-376)||(41744222-41744568)
chr4 (23-375)||(18931482-18931835)
chr4 (45-378)||(8321971-8322305)
chr4 (30-378)||(32953249-32953598)
chr4 (37-376)||(27942465-27942811)
chr4 (27-339)||(39498590-39498903)
chr4 (27-339)||(39501929-39502242)
chr4 (83-370)||(34238007-34238295)
chr4 (29-291)||(25916034-25916295)
chr4 (148-378)||(48873747-48873978)
chr4 (31-377)||(31937870-31938217)
chr4 (69-377)||(7258691-7258998)
chr4 (29-378)||(51968505-51968853)
chr4 (68-374)||(52469427-52469735)
chr4 (29-262)||(30415746-30415978)
chr4 (31-280)||(38414032-38414278)
chr4 (69-377)||(47426279-47426567)
chr4 (160-377)||(36858135-36858351)
chr4 (69-377)||(38394634-38394942)
chr4 (37-186)||(10400812-10400961)
chr4 (27-287)||(36858375-36858634)
chr4 (96-370)||(37014451-37014724)
chr4 (94-262)||(18405597-18405764)
chr4 (129-377)||(30790275-30790518)
chr4 (265-378)||(38413902-38414015)
chr4 (72-194)||(12275953-12276075)
chr4 (283-381)||(18405126-18405223)
chr4 (222-375)||(10400973-10401126)
chr4 (300-377)||(36860027-36860104)
chr4 (69-189)||(22654516-22654638)
chr4 (95-355)||(48059804-48060065)
chr4 (37-195)||(44309670-44309828)
chr4 (270-372)||(52413959-52414061)
chr4 (95-335)||(24805150-24805397)
chr4 (27-126)||(9327242-9327342)
chr4 (27-126)||(9374001-9374101)
chr4 (319-378)||(25916302-25916362)
chr4 (68-214)||(18094139-18094286)
chr4 (37-90)||(34237427-34237480)
chr4 (27-143)||(26165326-26165442)
chr4 (293-340)||(37296473-37296520)
chr4 (297-379)||(12276178-12276260)
chr4 (129-286)||(32384492-32384650)
chr4 (45-126)||(9382297-9382379)
chr4 (31-117)||(36860106-36860191)
chr4 (59-121)||(37296662-37296724)
chr4 (229-372)||(14796295-14796439)
chr4 (95-155)||(54478495-54478555)
chr4 (270-341)||(54478366-54478437)
chr4 (96-124)||(9297144-9297172)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (29-378)||(2657422-2657772)
chr6 (29-378)||(7053569-7053927)
chr6 (30-378)||(1316741-1317089)
chr6 (37-380)||(18897641-18897985)
chr6 (27-375)||(14170740-14171087)
chr6 (33-376)||(16968649-16968993)
chr6 (107-378)||(8029025-8029297)
chr6 (29-262)||(7344082-7344315)
chr6 (173-378)||(10246259-10246465)
chr6 (27-381)||(6705762-6706104)
chr6 (37-327)||(345837-346130)
chr6 (78-375)||(14781668-14781955)
chr6 (31-205)||(10849784-10849959)
chr6 (29-118)||(8029316-8029405)
chr6 (262-362)||(7344727-7344827)
chr6 (45-215)||(21008039-21008208)
chr6 (262-372)||(21008212-21008322)
chr6 (288-381)||(9762299-9762392)
chr6 (316-376)||(11570071-11570131)
chr6 (123-382)||(8314612-8314873)
chr6 (69-157)||(9760409-9760497)
chr6 (95-140)||(8314874-8314919)
chr6 (29-216)||(3869391-3869577)
chr6 (300-380)||(12328063-12328142)
chr6 (30-66)||(10246222-10246258)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (37-375)||(28959-29298)
[»] scaffold0662 (1 HSPs)
scaffold0662 (26-380)||(4186-4543)
[»] scaffold0702 (1 HSPs)
scaffold0702 (26-380)||(3561-3916)
[»] scaffold0238 (2 HSPs)
scaffold0238 (37-252)||(23303-23517)
scaffold0238 (300-372)||(23604-23675)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (29-201)||(21789-21961)
[»] scaffold1480 (1 HSPs)
scaffold1480 (29-201)||(384-556)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (229-372)||(43292-43436)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 37392543 - 37392897
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37392543 ttagggtgtatttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattc 37392642  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37392643 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 37392742  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37392743 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 37392842  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37392843 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 37392897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38364155 - 38363804
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38364155 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 38364056  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  38364055 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 38363956  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38363955 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 38363856  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38363855 aaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 38363804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 35818421 - 35818775
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35818421 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 35818520  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  35818521 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 35818620  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35818621 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc 35818720  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35818721 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 35818775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25837985 - 25837631
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25837985 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtacatgcctatgtttgttacaagtttacaaaattttattc 25837886  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  25837885 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaaaaaaagggtggcaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 25837786  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25837785 tattataatccctatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 25837686  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25837685 aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 25837631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 32660932 - 32661283
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32660932 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 32661031  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa-gaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32661032 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 32661131  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32661132 attataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 32661231  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32661232 aggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 32661283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 16313504 - 16313858
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16313504 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 16313603  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |     
T  16313604 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataattttcc 16313703  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16313704 tattataatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc 16313803  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16313804 aaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta 16313858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12710719 - 12710363
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12710719 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 12710620  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  12710619 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 12710520  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710519 tattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaacgaaacatatttttcctacatttcttggaataaaattcccatctttatattcc 12710420  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710419 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 12710363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 38132734 - 38133089
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38132734 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 38132833  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 225  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38132834 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgtgaataaattcataaatagtttac 38132933  T
Q  226 ttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38132934 ctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattc 38133033  T
Q  325 caaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38133034 caaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 38133089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 37 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18298176 - 18297836
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298176 tttgtttcaagttataatttttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 18298077  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18298076 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagtttacctattataatc 18297977  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297976 cctatttttatggttcctagaaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 18297877  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18297876 attcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 18297836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 376
Target Start/End: Original strand, 18726619 - 18726967
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18726619 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccca 18726718  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  18726719 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatggaaataaattcataaatagtttaccta 18726818  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18726819 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattttcatctttatattccaa 18726918  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
      |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18726919 ttaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 18726967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3050073 - 3049731
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3050073 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 3049974  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3049973 aatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatc 3049874  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3049873 cctatttttatgattcctaggaatattataaagataaccaaacatattttttctaaattccttcgaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgtt 3049774  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3049773 attcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 3049731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26062216 - 26061859
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26062216 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatgtatattcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 26062117  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  26062116 tggtataaaatgtccctgggaatagaaaaaaattcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttaccta 26062017  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26062016 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattacaa 26061917  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtatc 385  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26061916 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaacacacccttaatatc 26061859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 29 - 366
Target Start/End: Original strand, 1554353 - 1554692
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554353 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 1554452  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  1554453 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcatacataatttaccta 1554552  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatc-tttatattcca 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1554553 ttataatccctaattttatggttcctaggaatattataaaactaaccaaccatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttttatattcca 1554652  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaa 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1554653 aggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaa 1554692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7931303 - 7930961
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  7931303 tttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgatagaaatgtatatgtatatgtttgttataagtttactaaaatttattccttggtataa 7931204  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7931203 aatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatc 7931104  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7931103 cctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaatgtt 7931004  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7931003 attcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 7930961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Original strand, 26601945 - 26602286
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26601945 tttgtttcaaattataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgg-tataa 26602043  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26602044 aatgttcttgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttagctattataatc 26602143  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26602144 cctatttttatggttccaaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatgtttcaaggaatgtt 26602243  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602244 atttctagcaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 26602286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42755937 - 42755592
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       
T  42755937 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgttagttacaagtttactaaaatttattccttt 42755838  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42755837 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgagaataaattcataaatagtttacctatt 42755738  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42755737 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaatatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatcttcatattccaagg 42755638  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42755637 aatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 42755592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 30 - 373
Target Start/End: Original strand, 10896217 - 10896560
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||      
T  10896217 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttactaaaatttattcctt 10896316  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10896317 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaaaatc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 10896415  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10896416 tataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaag 10896515  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacac 373  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10896516 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 10896560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Original strand, 41228712 - 41228990
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41228712 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttaattcccgggaataaaatggtaggaatgtatatgcctacgtttgttacaagtttactaaattttattcc 41228811  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |    
T  41228812 cgggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccgaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagat-agaataaattcataaatagtttacct 41228910  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41228911 attataatccctatttttatggtttctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaa 41228990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Original strand, 5020487 - 5020837
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagga---atgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta 123  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||   || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5020487 ttagagtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcatgggaataaaatgataggaggaatatatatgcatatgtttcttacaagtttactaaagttta 5020586  T
Q  124 ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttt 223  Q
     || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  5020587 ctctcgggtataaaatgtttctgtgaatagaaaaattttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataagtag-tt 5020685  T
Q  224 acttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 322  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  5020686 acctattataatccatatttttatgattccca-gaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttagaataaaattatcatctttatat 5020784  T
Q  323 tccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5020785 tccaaagaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 5020837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7317445 - 7317156
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7317445 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattttcaaaaataaaatgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt-cc 7317347  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    || |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  7317346 ggatataaagtgttcctagg-atagaaaaattttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcgtaaatag-ttaccta 7317249  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 321  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7317248 ttataatccctattttcatggtt-ctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttagaataaaattcacatctttata 7317156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35394464 - 35394156
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| ||  |||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35394464 ttagggtttgtttgtttcaagttatatttattgattcacgagaataaaatgaaagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 35394365  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||     
T  35394364 ccgggtataaaatgttctacgtaatagaaaaaaatttccaagaaaaatggtgggaataaagttcctaaggagatgggaacaaactcatatatag-ttacc 35394266  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  35394265 tattataatccttatttttatggttcataggaatattataaagttaaccaaacatatttttcttaaataccttggaataaaattctcatctttatatttc 35394166  T
Q  326 aaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||    
T  35394165 aaggaatgtt 35394156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 21137134 - 21137476
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21137134 gtgtgtttgtttgaagttatatttgttgattcctgagaataaaataatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 21137233  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| | ||| ||||  |||| ||||| |||||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||| |||| |||||    
T  21137234 tataaaatgtttgtgggaatataaatatttttccaaagaaaatggtggaaataaagttctcgtggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctatta 21137332  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  21137333 taatccgtatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttttaaataccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaa 21137432  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||| |||  ||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  21137433 atgttatt-ctagtaataaatttgataaactaaaaacaaacacac 21137476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 376
Target Start/End: Original strand, 33444627 - 33444969
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33444627 ggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgagaataaaatgataaaaatatatatgtctatgtttgttacaagtt-actaaattttattcccgg 33444725  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||  ||| |||| ||||    
T  33444726 -tataaaatgttcttgggaatagaaaaaattgcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgag-ataatttcatatgtag-ttacctatt 33444822  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    | |||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |     
T  33444823 agaatcactatttgtatgattgctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaataccttgaaataaaattttcatctttatattccatga 33444922  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33444923 aatgttattcttatgaataaattcagtaaacttgaaacaaacacacc 33444969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 377
Target Start/End: Original strand, 29421496 - 29421839
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29421496 tttgtttcaaattatatttgttgattcatgagaataaaatgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttattaaattttattctcgggtataa 29421595  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||| |||| ||||||||||    
T  29421596 aatatttctgggaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatttatatgtag-ttacctattataatc 29421694  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa---aattcccatctttata-ttccaaggaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||| ||||||   ||||  |||||||||| ||||||  ||    
T  29421695 cctatttttatggttcctaggaatattataaagttaatcaaatatattttttctaaataccttagaataaaacaattttcatctttatatttccaaataa 29421794  T
Q  332 tgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  29421795 tgttattcataggaataaatttcgtaaa-ttaaaacaaacacaccc 29421839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15226970 - 15226688
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15226970 tatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgggtataaaatattcctgcgaatagaaaagattcccaaagaaaa-gggtgggaataaagttcccat 15226872  T
Q  195 ggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaat 293  Q
    | ||||| ||| ||| | ||    | || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  15226871 gaagatgagaataaaattatgtggaatt-acctattataatccctatttttaaggttccttggatttttataaagttaaccaaacatattttttctaaat 15226773  T
Q  294 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15226772 accttgaaataaaattctcatctttatattccaaggaaagttattcctaataataaatttggtaaaattgaaacaaacgcaccct 15226688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41432805 - 41432464
Alignment:
Q  36 atttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 135  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41432805 atttgttttaagttatattcgtggattcctgggaataaaatgataggaatacacatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattccc-ggtata 41432707  T
Q  136 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggaga-tgggaaaaaattcataaatagtttacttattataa 234  Q
    ||| |||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | || ||| | ||||||||    
T  41432706 aaacgtttatgggaatagaaaatttttccctagaaaaagggtggaaataaagttcccatggagattgagaataaattcatgagtaattt-cctattataa 41432608  T
Q  235 tccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaac--ataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 331  Q
    | ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||    
T  41432607 ttcctatttttatggctcccaagaatattataatgttaagcaaacatatattttttttaaatgccttggaataaaatttccatctttatgtttcaagaaa 41432508  T
Q  332 tgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41432507 tgttattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaaacacac 41432464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 200 - 381
Target Start/End: Original strand, 40197223 - 40197405
Alignment:
Q  200 tgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattcctt 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40197223 tgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattcctt 40197322  T
Q  299 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40197323 agaataaaattcccatctttatattccaaagaatattattcctaggaataaatttggtaaacttgaagcaaacaaacccttag 40197405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 376
Target Start/End: Original strand, 19160780 - 19161088
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||     
T  19160780 aataaaataatataaatatatatgcagatgtttgttacaagtttactaaatttcattcccgtgtataaaatattcttgggaatataaaaaaaattccaaa 19160879  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaa 267  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  19160880 gaaaagggtgggaataaagttgtcatggagatgagaatgaattcatatgta-attacctattataatccctatttttatggttcctaagaatattataat 19160978  T
Q  268 gctaaccaaacata-attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaa 366  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| || || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  19160979 gctaaccaaacatatttttttctaaataccctgaaataaatttctcatctttatattccaaagaatgttattcttgagaataaatttgataaacttgaaa 19161078  T
Q  367 caaacacacc 376  Q
    ||||||||||    
T  19161079 caaacacacc 19161088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 380
Target Start/End: Original strand, 43871973 - 43872316
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||  ||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43871973 tttgtttcaagttataattatagattcttggaaataaaatcataaaaacatacatgcctatgtttgttacaagtttgttaaattttattcccgggtataa 43872072  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||  |||  |||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||   |||  |||| ||||||||||    
T  43872073 aatgttcctgggaatataaatattttttcaaagaaattggtaggaataaagttcatatggagatgggaataaaatcacgtata-attacctattataatc 43872171  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    |||||||||  ||||||| | || | ||||| | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  43872172 cctatttttgaggttccttgaaacattataatgttaaccaaacatcttttttctaaataccttggaataaaatttacatctatatatttcaaggaatgtt 43872271  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43872272 attcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacaccctta 43872316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 377
Target Start/End: Original strand, 31117594 - 31117874
Alignment:
Q  94 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 193  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117594 ctatgtttgttacgattttattaaattttatttccgaatataaaatgttcttcagaatagaaaaaaatttccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 31117693  T
Q  194 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataa---ttttcct 289  Q
    ||| |||      |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    |||| ||    
T  31117694 tggggat------aaattcataaatagtt-acctattataatatctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaagcatatatttttttct 31117786  T
Q  290 aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31117787 aaatactttgaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaatataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 31117874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 339
Target Start/End: Original strand, 6805698 - 6805936
Alignment:
Q  105 acaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatggga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  6805698 acaagtttactaaattttattcccgagtataatatgttcttgggaatagaaaatttttcctaaagaaaagggtgagaataaagttctcatggagatgaga 6805797  T
Q  205 aaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaatt----ccttg 299  Q
    | |||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||     |||||    
T  6805798 ataaattcataaatagat-acctattaaaatctctattttcatggttcctgggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatatataccttg 6805896  T
Q  300 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6805897 gaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgttattc 6805936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 378
Target Start/End: Original strand, 16218982 - 16219290
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||   ||||||| |||| || |||||     
T  16218982 aataaaacgatagaaatatgtatgcctatgtttgttacaagtttactagattttattccggggtttaaaacgttctcaggaatagtaaaatttccccaaa 16219081  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaa 267  Q
     |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||    || || || |||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||     
T  16219082 gaaaagg-tgggaataatcttcccatgaagatgggaataaatccacgtgtaatt-acctattataatccccattttcatggttcccaagaatattataat 16219179  T
Q  268 gctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaac 367  Q
    | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||    
T  16219180 gttaaccaaacatcttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttaagttccaaggaacgttattcctaggaataaattggataaacttaaaac 16219279  T
Q  368 aaacacaccct 378  Q
    |||||||||||    
T  16219280 aaacacaccct 16219290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 40197083 - 40197232
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||   | |||||    
T  40197083 tttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttataagtttactaaaatttattctttgatataa 40197182  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |  |||| |||| ||||||||||||    
T  40197183 aatgtttctgggaatagaaaaaaaatttcaaggaaaaaggtgggaataaa 40197232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25899531 - 25899381
Alignment:
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25899531 tattatattccatatttttaaggttccttggaat-tataatgtcaaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcctatctttatattcca 25899433  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25899432 aggaatgttattcctaaaaataaatttgttacacttgaaacaaacacaccct 25899381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38437518 - 38437369
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  38437518 tttgttttaagttatatttgtatattcctgaaaataaaacgataggaatacatatatctatgtttgttacaagtttacaaaattttattttcgggtataa 38437419  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    || ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  38437418 aacgttcctgagaatagaaaatttttcccaaagaaaagggtggaaataaa 38437369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 376
Target Start/End: Original strand, 37981857 - 37982134
Alignment:
Q  98 gtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgga 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||  || ||||||| |||| |||||||  ||||||  ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  37981857 gtttgtttcaagtttacaaaattt-attcttggatataaaacgttcttgggaattaaaaaaaaatc--aaggaaaagggtggaaataaagttcctatgaa 37981953  T
Q  198 gatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcct--aaatt 294  Q
     ||| ||| ||||| |||  || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | ||| |||||||  ||||  |  ||||     
T  37981954 aatgagaataaatttatatgtaatt-acttgttataatccctatttttatggttcccataaatattataatgttaagcaaacatcttttttttttaaata 37982052  T
Q  295 ccttggaataaaa-ttcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37982053 ccttggaataaaaattctcatctttatgttc-aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 37982134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 201
Target Start/End: Original strand, 14763970 - 14764101
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  | | | |    
T  14763970 aataaaatgatagaaatatacatgcatatgtttgtttcaagtttactaaattttattcacgggtataaaatgttcatgagaatagaaaaaaaattcaatg 14764069  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatg 201  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  14764070 aaaaa-ggtgggaataaagttcacatgaagatg 14764101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 381
Target Start/End: Original strand, 33533589 - 33533744
Alignment:
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||| |||| | ||| |||||||  || | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  33533589 tattataattcctatttttaaggttcttgagaatatcataatgttaatcaaacatctttattctaaatacattggaataaaattcacatctttatattca 33533688  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33533689 aaggaataatattcctaggaataaatttgacaaacttgaaacaaacacacccttag 33533744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25899707 - 25899548
Alignment:
Q  26 attagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| || |||||||| |||  |||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25899707 attacggtgtgtttgtttcaaattatatttgtagattcctgggaataaaatcataaaaatgcatgtgtctatgtttgttgcaagtttattaaattttatt 25899608  T
Q  126 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||  |||| |||| |||||||    
T  25899607 tccgggtat-aaatgttcctcggaatagaaaagtttttccaaagaaaatggtgagaataaa 25899548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34672406 - 34672289
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  34672406 agggtgtgtttgtttgaagttgtatttgttgattcctgaaaataaaatgataaaaatatatatgcttacatttattacaagtttaataaattttattctc 34672307  T
Q  129 gggtataaaatgttcctg 146  Q
     | |||||||||||||||    
T  34672306 agatataaaatgttcctg 34672289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35394139 - 35394078
Alignment:
Q  319 atattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35394139 atattccaaagaatgttattactaagaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta 35394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34672201 - 34672083
Alignment:
Q  262 tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt--atattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaa 359  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||    
T  34672201 tataaagttaaccaaaaatattttttctaaaaaccttagtataaaatttccatctttttatatttcaaggactgttatttctaaaaataaatttgataaa 34672102  T
Q  360 cttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  34672101 cttaaaacaaacacaccct 34672083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12650137 - 12649859
Alignment:
Q  99 tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggag 198  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| ||| ||| |||||||||  || | |||  ||||  |||||||||||||||||||| |     
T  12650137 tttgttacaagattattaaattttatttctgtgtataaaatattcatggaaatagaaaat-ttacgcaaagaaaatagtgggaataaagttcccatgaaa 12650039  T
Q  199 atgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcct--aaattc 295  Q
    |||  || ||||||| |  ||  | || |||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||| | ||| |||||||  ||||  |  ||||      
T  12650038 atgaaaataaattcacatgtaact-acctattataatctctattttttaagttcctaagaatattataatgttaatcaaacatcttttttttttaaataa 12649940  T
Q  296 cttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
     ||| |||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649939 tttgaaataaaattcacatcattgtattacaaggattgttattcgtagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 12649859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38437351 - 38437203
Alignment:
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||  | ||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||      
T  38437351 tattataattcctatttttatggttcccagaaatactgtagtgttaaacaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaattctcatccttatattaa 38437252  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||  ||| |||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  38437251 aaa-aatattatttttaagaatgaatttaataaacttgaaacaaacacac 38437203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37124149 - 37124073
Alignment:
Q  300 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||  ||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  37124149 gaataaaattctcatctttatattccaaatattgttatttttaacaataaatttgataaacttaaaataaacacacc 37124073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Original strand, 41228984 - 41229022
Alignment:
Q  344 gaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41228984 gaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccatagt 41229022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 167
Target Start/End: Original strand, 32901787 - 32901858
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa 167  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  32901787 tatgtttgtcacaagtttaaaaaaatttattcatgg-tataaaatgtttctgggaataggaaaattttcccaa 32901858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2430571 - 2430223
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2430571 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 2430472  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2430471 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttact 2430372  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2430371 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 2430272  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2430271 aggaacgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 2430223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46666781 - 46666431
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46666781 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 46666682  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  46666681 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 46666582  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46666581 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaa 46666482  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46666481 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 46666431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 30 - 377
Target Start/End: Original strand, 20260086 - 20260434
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260086 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 20260185  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20260186 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 20260285  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260286 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaagcaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaag 20260385  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260386 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 20260434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9115911 - 9115561
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9115911 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcc 9115812  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9115811 ttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 9115712  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9115711 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcca 9115612  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9115611 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 9115561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 30 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 14788795 - 14788444
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14788795 gggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaataataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattatattcccg 14788696  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14788695 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 14788596  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788595 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttgcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatattccaag 14788496  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14788495 gaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccctta 14788444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25789834 - 25789481
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  25789834 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttg 25789735  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25789734 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt 25789635  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25789634 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaagg 25789535  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagta 383  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25789534 aatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacccatagta 25789481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 1597339 - 1597689
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597339 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 1597438  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1597439 ccggatataaaatgttcctgggaatagaaaaatttttccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacc 1597538  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1597539 tattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttc 1597638  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597639 aaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 1597689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 52630848 - 52630494
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52630848 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 52630749  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  52630748 tcgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 52630649  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52630648 tattataattcctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc 52630549  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52630548 aaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 52630494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 29 - 380
Target Start/End: Original strand, 12190176 - 12190528
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12190176 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattttcgggaataaaatgataggaatgtacatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 12190275  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  12190276 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagttttccta 12190375  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12190376 ttataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 12190475  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12190476 ggaatgttattcttaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta 12190528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8332089 - 8331734
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8332089 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttgcaagtttactaaattttattc 8331990  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  8331989 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaaatttcaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 8331890  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331889 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattcc 8331790  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8331789 aaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacacccttag 8331734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36361847 - 36361506
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36361847 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaggtataa 36361748  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36361747 aatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaggg-gggaataaagttcccatggagatgagagtaaattcataaatagtttacctattataatc 36361649  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36361648 cctatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatttttatattccaaggaatgtt 36361549  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36361548 attcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 36361506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 32 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32824992 - 32824644
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32824992 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccggaaataaaataataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccggg 32824893  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32824892 tataaattgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctatt 32824793  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32824792 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 32824693  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32824692 aatgttattcctaggaataaatttcgtaaatttgaaacaaacacaccct 32824644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 9831872 - 9832216
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  9831872 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttgg 9831971  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9831972 tataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta 9832071  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9832072 taatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccgagga 9832171  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9832172 atgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 9832216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39930529 - 39930181
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  39930529 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctt 39930430  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39930429 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 39930330  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39930329 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaa 39930230  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39930229 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 39930181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6911566 - 6911208
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6911566 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgataagaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 6911467  T
Q  129 gggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 220  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6911466 gggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatag 6911367  T
Q  221 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6911366 tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattaaaaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatcttta 6911267  T
Q  320 tattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6911266 tattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 6911208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 383
Target Start/End: Original strand, 4683373 - 4683727
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4683373 agggtgtctttgtttcaatttataattgttgattcccagaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttactaaattttattccc 4683472  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4683473 ggatataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaaggg-gggaataaagttcccatggagatgtgaataaattcataaatagtttaccta 4683571  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4683572 ttataatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 4683671  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagta 383  Q
      |||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4683672 aaaatgttattcttagaaataaatttgataaacttgaaacaatcacatcctaagta 4683727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2632925 - 2632576
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2632925 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaataataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 2632826  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2632825 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggt-ggaataaagttcccatggagatgtgaataaattcataaatagtttaccta 2632727  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2632726 ttataatccctatttttatggttcctagaaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattcgctggaataaaattcccatatttatattctaa 2632627  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2632626 ggaatgttattcctagaaataaatttagtaaacttgaaacaaatacaccct 2632576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 51445087 - 51445424
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||    
T  51445087 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatataaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcttag-tataa 51445185  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51445186 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatc 51445285  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  51445286 cctatttttatggttcctaggaatattataaaggtaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctatatattccaaggaatgtt 51445385  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51445386 attcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 51445424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 37 - 377
Target Start/End: Original strand, 38964686 - 38965027
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  38964686 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcttatgtttgttacaagtttacaaaaatttattccttggtataa 38964785  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  38964786 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagagaaagggtgggaataaagttcccatggagattggaataaattcataaataatttacctattataatc 38964885  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964886 cctatttttatggttattaggaatattataaagctatccaaagatatatttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 38964985  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38964986 attcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccc 38965027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39329683 - 39329347
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39329683 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 39329584  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39329583 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 39329484  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||              || ||||||    
T  39329483 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaa--------------ttttattcc 39329398  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39329397 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 39329347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 32 - 378
Target Start/End: Original strand, 50190767 - 50191113
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50190767 gtgtgtttgtttcaagatataattgttaatttccggaaataaaatgctaggaatgtatatgcctacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 50190866  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  50190867 tataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaaggtgggaataaagttcccatgaagat-ggaataaattcataaatagtttacctatta 50190965  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50190966 taatccctatttttatgattcctaggaatattataaagctaatcaaacatatttttcctaaattcctcgaaataaaattctcatctttatattctaagga 50191065  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50191066 atgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 50191113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 3572564 - 3572841
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3572564 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 3572663  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  3572664 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 3572763  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3572764 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataa 3572841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 5518503 - 5518852
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5518503 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccaggaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 5518602  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||| ||    
T  5518603 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcccaaggaaaaaggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaatttatatatag-ttaccta 5518701  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaat-atataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5518702 ttataatccctatttttatggttcctaggaatgttataaagttaaccgaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaa 5518801  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5518802 ggaatgttattccaatgaataaatttggtaaacttcaaacaaacagaccct 5518852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 5806290 - 5806625
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  5806290 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcct----ttgttacaagtttactaaaatttattcct 5806385  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  5806386 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattttccaag-----------gaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatagtttaccta 5806474  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5806475 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 5806574  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5806575 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 5806625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35187529 - 35187181
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35187529 agggtgtgtttttttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 35187430  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||    
T  35187429 tggtataaaatgttcgtgggaatagaaaaaatttcccaaggagaagggtgggaataaagttcccatggagataagaataagttcataaatagtttaccta 35187330  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35187329 ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaaactaaccaaacatatatttcctaaattctttagaataaaatttccatctttatatttcaa 35187230  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaac-ttgaaacaaacacac 375  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  35187229 gaaatattattcctaagaataaatttggtaaactttgaaacaaacacac 35187181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 48916021 - 48916368
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  48916021 agggtgtgtttatttcaagttatatttgttgattccagagaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattttc 48916120  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || | ||    
T  48916121 gggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaagataaggatgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcatatgtag-ttgccta 48916219  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata-attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  48916220 ttataatccctatttttatggtttctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatattcta 48916319  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48916320 aggaatgttattcctaagaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 48916368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6978845 - 6978550
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6978845 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 6978746  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |   |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  6978745 cttcgtataaaatgtttcagggaatagaaaaaatttctcaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 6978646  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6978645 tattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttata 6978550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Original strand, 32202330 - 32202660
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||                  ||||||| |||| |||     
T  32202330 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgatagaaatgtatatgc------------------tactaaaatttaatcct 32202411  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32202412 tggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 32202511  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32202512 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttatattccaa 32202611  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32202612 ggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 32202660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13653916 - 13653581
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13653916 tttgtttcaagttaaatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataa 13653817  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  13653816 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataatc 13653718  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaat-aaaattcccatctttatattccaaggaatgt 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13653717 cctaattttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatgt 13653618  T
Q  335 tattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaac 371  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13653617 tattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 13653581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 376
Target Start/End: Original strand, 37436638 - 37436966
Alignment:
Q  47 gttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctg 146  Q
    |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||    
T  37436638 gttatatttgttgattcacgagaataaaatgataggaatgtatatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattttcggatataaaatgttactg 37436737  T
Q  147 ggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctattttta 246  Q
     ||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  37436738 agaatagaaaat-tttcccaaagaaaagggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagttatct-attataatccttattttta 37436835  T
Q  247 tggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaaga 345  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37436836 tggttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaacaccttgaaataaaatttccatatttatattccaaggaatgttattcttaaga 37436935  T
Q  346 attaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37436936 ataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 37436966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29091739 - 29091395
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29091739 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgataataaaatgataaaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 29091640  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     | ||||| | | |||||| || ||    
T  29091639 gagtaaaaaatgttcatcggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaaaggtgggaataaagttcccatggaga-----ataaatttacacatagtt-accta 29091546  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29091545 ttataaaccctatttttatggttcctagtaatattataaagttaaccaaacatattttttataaataccttggaataaaattcccatctttatattttaa 29091446  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29091445 ggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 29091395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Original strand, 52699463 - 52699799
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52699463 ttagggtgcgtttgtttcaagttatattcgtagattcctgggaataaaatgataggaatacacatgcctatgtttgttacaagtttactgaattttattc 52699562  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |     
T  52699563 ccgggtataaaacgttcctgggaatagaacatttttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcatgagtaattt-cc 52699661  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52699662 tattataattcctattttcatggttcccaggaatattataatgttaagcaaacttattttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatattcc 52699761  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttg 363  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52699762 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttg 52699799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Original strand, 49822916 - 49823203
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  49822916 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt------ 49823009  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
                   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| ||    
T  49823010 ---------------ctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgataataaattcataaataatttaccta 49823094  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49823095 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaacctaaccaaacatattttttctaaattccatggaataaaattcccatctttatattccaa 49823194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47037530 - 47037324
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  47037530 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 47037431  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  47037430 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 47037331  T
Q  229 ttataat 235  Q
    |||||||    
T  47037330 ttataat 47037324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 207 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 47031754 - 47031577
Alignment:
Q  207 aaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47031754 aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataa 47031655  T
Q  306 aattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagta 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47031654 aattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaagta 47031577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 46960646 - 46960349
Alignment:
Q  83 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaa 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  46960646 aatgcatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttcccaatgaaaagggtgggaa 46960547  T
Q  183 taaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacat- 280  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||  |   ||  |||| |||||||| | ||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||     
T  46960546 taaagttcccatgaagatgaaataaaatt-gtgtgta-attacctattataaactctatttttaaggttcattggaatattataatgttaaccaaacatc 46960449  T
Q  281 aattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
      |||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46960448 tttttttctaaatatcttggaataaatttctcatctttatattccaaagaatgttattcctaggaataaatttgataaatttgaaacaaacacaccctta 46960349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 375
Target Start/End: Original strand, 1227889 - 1228225
Alignment:
Q  41 ttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatg 140  Q
    |||||||||||| | || |||||  | ||||||||| |||  |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  1227889 ttttaagttatattcgtagattcttgaaaataaaatcataaaaatacatatgcctatgcttgttacaagtttattaaattttattttcaggtataaaatg 1227988  T
Q  141 ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatcccta 240  Q
    || || ||||||||||| |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| ||| | ||  | | || || ||||||||||||||    
T  1227989 tttcttggaatagaaaagatttccgaaagaaaaggtcgggaataaagttcccatgaagattagaataaaattatgtagaatt-acctattataatcccta 1228087  T
Q  241 tttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttc--ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat 337  Q
    |||||| ||||||| | ||||| |||||| | |||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1228088 tttttaaggttccttgaaatattataaagttcaccaaacatattttttttctaaattctttggaataaaattctcatctttatattccaaggaaggttat 1228187  T
Q  338 tcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    || ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1228188 tcatagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacac 1228225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47677716 - 47677368
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||  |||  |||||  | ||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  47677716 tagggtgtgtttgtttcccgttatatttgtggattccgggaa-taaaatcataaaaatacatatgtttgtgtttgttataaatttactaaattttatttc 47677618  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||   || || || |    
T  47677617 cgggtataaaatgttccattgaatagaaaagttttcccaaaggaaaggatgggaataaagttcccatgaagatgggaataaaattatgtgtaatt-acat 47677519  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47677518 attataatccctatttttaaggttccttagaatattacaaagttaaccaaacatattttttttaaatatcttggaataaaattctcatctttatattcca 47677419  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  47677418 agaaattttattcctaagaataaatttcataaactttaaataaacacaccc 47677368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30241074 - 30240782
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  30241074 tttgtttcaagttatatttgttgatttttggtaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc-ggaataa 30240976  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    || |||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||    
T  30240975 aaagttattgggaatagaaaaaaattcccaaagaaaagagtgagaataaagttctcatgaagatgagaataaatttatatgta-attacctattataatc 30240877  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 332  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  | || |  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  30240876 cctacttttatggttcttaggaatattataaagttaaccaaacatattttt--ttaaatatttggaataaaatttccatttttatatttcaaggaat 30240782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 378
Target Start/End: Original strand, 24116338 - 24116683
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| | |||||| |||| |||||| |  ||||||| ||||| |||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24116338 ggtgtgtttgtttcaggttatatttgtagattcctgagaataaaacgatagaaat--atatgtttatgtttgtcacaagtttactaaattttattcccgg 24116435  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||| | |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||   ||  |||| ||||    
T  24116436 gtataaaacgttcctgtaaataaaaaagaattcccaaagaaaagggagggaataaagctcccatgaagatgagaatatatttatgtgta-attacctatt 24116534  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |  |||| | ||| | ||| |||||||  |||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24116535 ataattcctatttttatggtttccaaaaatattttaatgttaagcaaacatcttttttctatataccttgaaataaaattctcatctttatattctaagg 24116634  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24116635 aatgttattcttaagaataaatttgttaaacttaaaacaaacacaccct 24116683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 374
Target Start/End: Original strand, 38519064 - 38519405
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||| ||||   |||||||||   |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38519064 gtgtgtttgtttcaagttatatttgtagatttttggaaataaatcaatagaaatacagatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccagg 38519163  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||  |||  |||| ||||    
T  38519164 tataaaatgtttttggga--agaaaaattttcccaaagaaaaggtttgggaataaagttcccat-gaaattaggaaaaattcatgtataaattacctatt 38519260  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| | ||| |||||||  |||| |||||| | |||||||||||||  ||| ||||| ||||||      
T  38519261 ataatccctatttttatggtttccaagaatattataatgttaaacaaacatcttttttctaaatacattggaataaaattttcatttttatgttccaaaa 38519360  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38519361 aatgttattcctacgaataaatttggtaaatttgaaacaaacaca 38519405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1007819 - 1007663
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1007819 gggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgagaataaaatgatatgaatatatatgtctaggtttgttacaagtttactaaattttattcccg 1007720  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1007719 gatataaaatgttcctgggaatagaaaaattttaccaagaaaaagggtgagaataaa 1007663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 379
Target Start/End: Original strand, 17475352 - 17475659
Alignment:
Q  61 ttcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaat 160  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  17475352 ttcccgaaaataaaacgatagaaatatatatgtttatgtttgttataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaataaataaaat 17475451  T
Q  161 ttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaat 260  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||  |||||     || || ||        ||| ||||||||||| |||||  |||||    
T  17475452 ttcccaaagaaaagagtgggaataaagttccaatagagatgggagtaaatt-----attgtgta--------aatacctatttttatagttcccgggaat 17475538  T
Q  261 at-ataaagctaaccaaacat-aattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaa 358  Q
    || |||| | ||| |||||||   |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||| || |||| |||||| |||    
T  17475539 atcataatgttaagcaaacatctttttttctaaataccttggaataaaatttccatttttattttccatagaatgttattcttaggaataaatttgataa 17475638  T
Q  359 acttgaaacaaacacaccctt 379  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  17475639 acttgaaacgaacacaccctt 17475659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25474107 - 25473972
Alignment:
Q  250 ttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaatt 348  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  25474107 ttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctaggaata 25474008  T
Q  349 aatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtat 384  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25474007 aatttgataaacttgaaacaaacacaccctttgtat 25473972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48462475 - 48462258
Alignment:
Q  156 aaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttccta 255  Q
    ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48462475 aaaatttccgaagaaaa-ggatgggtataaagttcccatggaattgggaataaattcataaatagtt-acctattataatccttatttttatggttccta 48462378  T
Q  256 ggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttg 354  Q
      ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  48462377 caaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatat-ttggaatataattctcatctttatactccaaagaatgttattcataaaaataaatttg 48462279  T
Q  355 gtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
     ||||||| ||||||| ||||    
T  48462278 ataaacttaaaacaaatacac 48462258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 375
Target Start/End: Original strand, 31806763 - 31807093
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||||    
T  31806763 tttgtttcaagttatatttgtagattcctgagaataaaatgatagaaatatacatgcttatgtttgttac--gtttactaaattttattctcgaacataa 31806860  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||  |||  |||||||       
T  31806861 aacgttcctgggaatagaaaaaaattcccaaataaaagggtggaaataaagttcccatgaagatgagaacaaattcatgtgta-attatctattata--- 31806956  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
       ||||||||||||||    |||| ||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||    
T  31806957 ---atttttatggttcccgcaaatattataatgttaagcaaacatattttttctaaataccttagaataaaattttcatctttatgttccaagaaatatt 31807053  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||| ||  ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  31807054 attcttagaaataaatttgatcaacttgaaataaacacac 31807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 11014442 - 11014626
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  11014442 ggtgcatttgtttcaagttatatatgtagattcctgggaataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttaataaattatattcacgg 11014541  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata 215  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  11014542 atataaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttcaaaagaaaagggtggaaataaagttctcatgaagatgagaataaattcata 11014626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 375
Target Start/End: Original strand, 13931885 - 13932218
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||  | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13931885 ggtgtgtttgtttgaagttatatttgtagattcctaggaataaaatcataaaaatacatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttccgg 13931984  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||     |||||| ||   ||  |||| ||||    
T  13931985 gtataaaatgttcct-ggaatagaaatgttttcctaaagaaaagggtgggaataaatttcccatgaaaat-----aaaatt-atgtgta-attacctatt 13932076  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata--attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||| |||||||||| ||||||     ||| ||||||  ||||||||||||   |||| || ||| ||||| |||||| || ||||||||||||| |||    
T  13932077 ataat-cctatttttaaggttcc-----atactataaaattaaccaaacatattttttttctgaataccttgaaataaagtttccatctttatatttcaa 13932170  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
     |||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13932171 tgaatgttattccttgaaataaatttgataaacttgaaacaaacacac 13932218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Original strand, 9011168 - 9011511
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||  | |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  9011168 tttgtttcaagttatattcgtagattcttgaaaataaaatgataggaatatacatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattttc-ggtataa 9011266  T
Q  137 aatg-ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 235  Q
    || | ||| || |||| |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||||| | || ||| | |||||||||    
T  9011267 aaggtttcgtgagaatcgaaaatttttcccaaagaaaagggtcggaataaagttcccatagtggtgggaataaattcatgagtaattt-cctattataat 9011365  T
Q  236 ccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca---taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 331  Q
     | || |||||||||  | ||||||| ||||| | ||| ||||||   |  |||| |||||| | || ||| ||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  9011366 tctta-ttttatggtctccaggaatattataatgttaagcaaacatttttttttttctaaatactttagaagaaaattttcatctttatgttccgaggaa 9011464  T
Q  332 tgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    | |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9011465 tattattcctaaaaataaatttgataaacttaaaacaaacacaccct 9011511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13521349 - 13521053
Alignment:
Q  74 aatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaa 173  Q
    |||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13521349 aatgatagaaatatacatgtctgtgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaa 13521250  T
Q  174 gggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaa 272  Q
    |||||| ||||||||| |||   ||||| ||| ||| |||    ||   || ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||  | | |    
T  13521249 gggtggaaataaagtttccagaaagatgagaataaa-tcaggtgta-actatttattataatccctattcttaaggttccggggaatattatagtgttca 13521152  T
Q  273 ccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    | |||||   |||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  13521151 cgaaacaccttttttctaaa-tacttgaaataaaattcacatctttatattctagtgaatgttatttttaagaataaatttggtaaacttaaatcaaaca 13521053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Original strand, 19083144 - 19083264
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    |||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19083144 aatacaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaa 19083243  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagtt 189  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  19083244 gaaaagggtggaaataaagtt 19083264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Original strand, 19131032 - 19131152
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    |||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19131032 aatacaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttataagtttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaa 19131131  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagtt 189  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  19131132 gaaaagggtggaaataaagtt 19131152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 252
Target Start/End: Original strand, 20504996 - 20505213
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| | |  ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20504996 tttgttttaaattatatttgtagatttctgagaataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataa 20505095  T
Q  137 aatgttcctgggaat----agaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 232  Q
    ||| |||||||||||    | |||||||| || |||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||||  || ||||||||   ||   ||| ||||||    
T  20505096 aatattcctgggaataagaaaaaaaaattaccaaagaaaaa-ggtgaaaataaagcttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-actacatattat 20505193  T
Q  233 aatccctatttttatggttc 252  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20505194 aatccctatttttatggttc 20505213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13440428 - 13440281
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa--aaaatttccca 166  Q
    |||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |    
T  13440428 aatacaatgatagaaatataaatgactatgtttgttagaattttactaaattttattcacgagtataaaatgttcctgagaatagaaaaaaaaattccaa 13440329  T
Q  167 agaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata 215  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13440328 ag-aaaagggtggaaataaagtttccatgaagatgagaataaattcata 13440281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29769526 - 29769230
Alignment:
Q  88 atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa-gaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  29769526 atatgtctatgtttgttacaaaattactaaattttattctttgacataaaatgttcctggcaatagaacaattttcctaaagaaaaagggtgggaataaa 29769427  T
Q  187 gttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattt 285  Q
    ||| ||||| |||||  || ||||||||   ||  |||| ||||||||||  | ||| || ||||||| | |||| ||||| | |||| ||||||  |||    
T  29769426 gtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-attacctattataatctatgtttctaaggttccttgaaatattataatgttaactaaacatttttt 29769328  T
Q  286 ---tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt-----cctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
       | ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||       ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29769327 ttcttctaaatatcttgaaataaaattcacatctttatattccaaagaatgttattattcatataagaataaatttagtaaacttaaaacaaacacac 29769230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 52186053 - 52186172
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |    ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  52186053 tttgtttcaagttatatttgttgatttcttataataaaatgatagaaatatatatgtctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgacgataa 52186152  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  52186153 aatgtttctgggaatagaaa 52186172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 49627374 - 49627293
Alignment:
Q  301 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49627374 aataaaattcccatctttatattccaagaaatgttattcttaaaaataaatttggtaaatttgaaacaaacacatccttagt 49627293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 297 - 381
Target Start/End: Original strand, 52186265 - 52186349
Alignment:
Q  297 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  52186265 ttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattccttaaaataaatttggtaaacttaaaacaaatacaccattag 52186349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37261880 - 37261764
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    |||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||     
T  37261880 aataaaattatagaaatatacatgcatatgtttgttacaagtttattaaattttattccc-gacataaaatctttttgggaatagaaaaaatttcccaaa 37261782  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaa 186  Q
    ||||||| || |||||||    
T  37261781 aaaaaggttgagaataaa 37261764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1007665 - 1007566
Alignment:
Q  207 aaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa 305  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  1007665 aaattcataaatagtt-acctattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagttaatcaaacatatttttcctaaatactttggaataa 1007567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 37261699 - 37261540
Alignment:
Q  222 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||   |||||||||||  |||| ||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||    
T  37261699 ttacctattataatccatatttttaacgttctttggaatattataatattaaccaaacatcttttttctaaatatctaagaataaaattcacatatttat 37261600  T
Q  321 attccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  37261599 attccaatgaatgttaatcataaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacatcctta 37261540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45771910 - 45771815
Alignment:
Q  283 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45771910 tttttctaaataccttggaataaaattctcacctttatgttccaagaaaggttattcatgggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 45771815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3939486 - 3939225
Alignment:
Q  114 ctaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattca 213  Q
    |||||||||||||| ||  || |||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  3939486 ctaaattttattcctggaaatgaaatattattgggaatagaaaaaaattccaaagaaaa-gtgtaggaatcaagtttccattaagatgagaataaattca 3939388  T
Q  214 taaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattccc 312  Q
    || || ||| || ||||||||||  |||||||| | |||||   ||||| |||| | ||| |||||||  ||||  |||||  |||  |||||||||| |    
T  3939387 tacatggtt-acctattataatctatatttttaag-ttccttaaaatattataatgttaatcaaacatgttttttttaaatatcttaaaataaaattcac 3939290  T
Q  313 atctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3939289 ttttttatattccaaagaatgttattcctaaaaatatatttgataaacttaaaacaaacacaccc 3939225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19094186 - 19094020
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | ||| |  || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |     
T  19094186 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgtaaattcctggaaatagaatgatggaaatatgcattcctatgtttgttgcaagtttattaaattttatttct 19094087  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatg 195  Q
     | |||||||||||||||  |||  || ||  |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  19094086 agatataaaatgttcctgataatgaaataacattcccaaagaaaactgtgggaataaagttcccatg 19094020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 376
Target Start/End: Original strand, 19923655 - 19923810
Alignment:
Q  222 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 320  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||  |  || || |||| | ||| |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19923655 ttacctattataatccctacttttttggttctcaaaaacattataatgttaaacaaacatattttttctaaatatcttagaataaaattctcatctttat 19923754  T
Q  321 attccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
     ||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19923755 gttctaagaaatgttatttctaaaaataaatttgatgaacttaaaacaaacacacc 19923810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 362
Target Start/End: Original strand, 45813648 - 45813727
Alignment:
Q  283 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaactt 362  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45813648 tttttctaaataccttaaaataaaattcacatctttatatttcaatgaatgttattcctaagaataaatttgataaactt 45813727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37726859 - 37726805
Alignment:
Q  324 ccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37726859 ccaaggaatgttattcctaggaataaatttagtgaacttgaaacaaacacaccct 37726805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Original strand, 33702380 - 33702508
Alignment:
Q  68 aaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttta-ttcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccca 166  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||| |||| ||||||||| ||   ||| || |||| || | ||||||||||||||||||||     
T  33702380 aaataaaatgatagaaatatatattcttaagtttgttacaaatttattaaattttatttttggggaattaaatttttcagggaatagaaaaaatttcccg 33702479  T
Q  167 agaaaaagggtgggaataaagttcccatg 195  Q
    |  |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  33702480 aataaaaaggtgagaataaaattcccatg 33702508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 52276930 - 52276877
Alignment:
Q  90 atgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcct 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  52276930 atgcctatatttgttacaagtttactaaattttatt--cggatataaaatgttcct 52276877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3939573 - 3939515
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3939573 aatagaatgatagaaatatacatgcttatgtttgttacaagtttgctaaattttattcc 3939515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 49824022 - 49824067
Alignment:
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacac 373  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49824022 ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacac 49824067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 6978549 - 6978517
Alignment:
Q  349 aatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6978549 aatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 6978517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11078051 - 11077963
Alignment:
Q  106 caagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccat 194  Q
    |||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  11078051 caagtttattaaattttatttctggatataacatgtttttgggaatagaaaaattttccaaaaaaaaaaggtgaacataaagttcccat 11077963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 156
Target Start/End: Original strand, 37336514 - 37336570
Alignment:
Q  100 ttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||  ||||||||||||    
T  37336514 ttgttacaagtttactaaattttattctcagatataaaatattattgggaatagaaa 37336570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 262
Target Start/End: Original strand, 52186170 - 52186260
Alignment:
Q  171 aaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat 262  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||  || |||| |||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  52186170 aaagggtgggaattaagttcacattgagatgtgaataaatttctacatag-ttacctattataatttctatttttatggtttctaagaatat 52186260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40908339 - 40907986
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40908339 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 40908240  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  40908239 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataatttacc 40908140  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40908139 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttca 40908040  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40908039 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 40907986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 27 - 382
Target Start/End: Original strand, 11239117 - 11239473
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11239117 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 11239216  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11239217 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 11239316  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11239317 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc 11239416  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239417 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 11239473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 8476307 - 8476657
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8476307 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctgtgtttgttacaagtttactaaattttattccc 8476406  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8476407 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 8476506  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8476507 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaa 8476606  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8476607 ggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 8476657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26849094 - 26848744
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26849094 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 26848995  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26848994 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttaccta 26848895  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26848894 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 26848795  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26848794 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 26848744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 30 - 374
Target Start/End: Original strand, 47114857 - 47115202
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47114857 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 47114956  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  47114957 agtataaaatgttcctggaaataaaaaaaaattcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 47115056  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115057 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 47115156  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47115157 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 47115202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 49 - 374
Target Start/End: Original strand, 31611004 - 31611330
Alignment:
Q  49 tataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctggg 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31611004 tataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctggg 31611103  T
Q  149 aatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatg 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31611104 aatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatg 31611203  T
Q  249 gttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaat 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31611204 gttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcataagaat 31611303  T
Q  348 taatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  31611304 aaatttggtaaacttgaaacaaacaca 31611330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Original strand, 33217920 - 33218262
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33217920 tttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaaatttattaaattttattcccgagtataa 33218019  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33218020 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatc 33218119  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33218120 cctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgtt 33218219  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33218220 attcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 33218262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 32 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1099267 - 1098923
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  1099267 gtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatccctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttgg 1099168  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  1099167 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaata-tttacctatta 1099069  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099068 taatccctatttttatggttcctagaaatattataaagctagccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 1098969  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098968 atgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 1098923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 28 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44952381 - 44952024
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44952381 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcc 44952282  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  44952281 ttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacct 44952182  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcct-aggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44952181 attataatccctatttttat-gttcctaaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 44952083  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtat 384  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44952082 aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctaagtat 44952024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 48339754 - 48340108
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48339754 ttaggatgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgatataaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 48339853  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  48339854 cttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 48339953  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  48339954 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattct 48340053  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48340054 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 48340108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20297867 - 20297511
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20297867 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaaatttattc 20297768  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  20297767 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacc 20297668  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20297667 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagtcaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatattcc 20297568  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20297567 aaagaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttaaaacaaacacacccttagt 20297511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Original strand, 6231501 - 6231850
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231501 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 6231600  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  6231601 ggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaatgaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctat 6231700  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6231701 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatctttatatttcaag 6231800  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6231801 gaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 6231850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 384
Target Start/End: Original strand, 9320448 - 9320804
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320448 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatacttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 9320547  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9320548 ggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaaaggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatagtttacttat 9320647  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattcctt-ggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9320648 tatgatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttaggaataaaattctcatctttatattccaa 9320747  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtat 384  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9320748 ggaatgttattcctatgaataaatttcataaacttgaaacaaacacacccgtagtat 9320804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 372
Target Start/End: Original strand, 28124436 - 28124779
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28124436 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttattcccg 28124535  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28124536 ggtataaaatgttcctcggaatataaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacatat 28124635  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28124636 tataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatatttatattccaag 28124735  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28124736 gaatgttaatcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 28124779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Original strand, 20414464 - 20414812
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20414464 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttataaatttactaaattttattccc 20414563  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20414564 gggtataaaatgttcttggaaataaaaaaaaattcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 20414663  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20414664 ttataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaatcaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaa 20414763  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20414764 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 20414812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24574647 - 24574289
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24574647 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 24574548  T
Q  129 gggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 220  Q
    ||||||||||||        || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24574547 gggtataaaatgataaaatgtttctggaaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag 24574448  T
Q  221 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24574447 tttacctattataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattctcatcttta 24574348  T
Q  320 tattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24574347 tatttcaaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 24574289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 51 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46360002 - 46359673
Alignment:
Q  51 taattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaa 150  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  46360002 taattgttgatttcttggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcttgtgaa 46359903  T
Q  151 tagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggt 250  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  46359902 tagaaaatatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttttatgat 46359803  T
Q  251 tcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaatta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  46359802 tcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataa 46359703  T
Q  350 atttggtaaacttgaaacaaacacaccctt 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46359702 atttgataaacttgaaacaaacacaccctt 46359673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 38 - 378
Target Start/End: Original strand, 53165733 - 53166073
Alignment:
Q  38 ttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaa 137  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53165733 ttgtttcaagttatatttgttgattcccataaataaaatgataggaatatatatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataaa 53165832  T
Q  138 atgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatcc 237  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||      
T  53165833 atgtttctgggaatagaaaattttttccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatat 53165931  T
Q  238 ctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtta 336  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  53165932 ctatttttatgattcctaggaatattataaggttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaatacccatctttatatttcaaggaatgtta 53166031  T
Q  337 ttcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||| ||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  53166032 ttcttagaaataaattggataaacttgaaacaaacacaccct 53166073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Original strand, 43132154 - 43132502
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  43132154 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattctcgagaataaaataataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattt 43132253  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
     |  ||||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||     
T  43132254 tcatgtataaaatgtacctgagaatataaattttttcccaaggaaaagggtgggaatagagttcccacggagatgagattaaattcataaatag-ttacc 43132352  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43132353 tattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattctcatctttatattcc 43132452  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43132453 aaggaatgttattcctaagaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 43132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 45 - 380
Target Start/End: Original strand, 10822733 - 10823068
Alignment:
Q  45 aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 144  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  10822733 aagttatatttgttgatttccgggaataaaatgatagaagtgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaaaaaattcccgggtataaaatgttcc 10822832  T
Q  145 tgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||  || || |||||||||||||     
T  10822833 tgggaatagaaaaaatttccctaggaaaagggtgggaataaagttttcatggagatgggaataaaatcataaatagttatct-ataataatccctatttg 10822931  T
Q  245 tatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaa 343  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  10822932 tatggttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattctcatctttatattgtaaggaatgttattcctag 10823031  T
Q  344 gaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10823032 aaataaatttgctaaacttgaaacaaacacaccctta 10823068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 94 - 375
Target Start/End: Original strand, 43718994 - 43719271
Alignment:
Q  94 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43718994 ctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggcataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagatccca 43719093  T
Q  194 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaa 292  Q
    |||||||||     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43719094 tggagatgg-----aattcataaataatttacttattataatccatatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaa 43719188  T
Q  293 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43719189 ttccttggaataaaattctcaactttatattccaaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 43719271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 31435920 - 31436269
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435920 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 31436019  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||| ||||     
T  31436020 ctgggtataaaatgttcctgaaaatagaaaaattttcccaaagaaattggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattctaatgtag-ttacc 31436118  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31436119 tattataatccttatttttatgattccaagaaatattataaaactaaccaaacatgttttttctatataccttggaataaaattcctatctttatattct 31436218  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    || |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31436219 aaagaatgttatttccaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 31436269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29512546 - 29512324
Alignment:
Q  154 aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcc 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29512546 aaaaaatttcccaaggaaaagggtggaaataaagttcccatagagatgg-aataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcc 29512448  T
Q  254 taggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatt 352  Q
    || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29512447 tatgaatattataaagctaaccaaacgtatttttcctaaatttcttgaaataaaattcccatctttatattctaaggaatgttattcctaggaataaatt 29512348  T
Q  353 tggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  29512347 tggtaaatttgaaacaaacacacc 29512324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 376
Target Start/End: Original strand, 12228256 - 12228601
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12228256 gggtgtgtttgttttaaaatatagttgttaattcctgcgaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttattacaagtttactaaattttattctcg 12228355  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||  ||    
T  12228356 ggtacaaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaa--ggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaaatcatatgtag-ttatcta 12228452  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12228453 ttataatacttatttttatgattcctaagaatatcataaaactaaccaaacatattttttttaaataccttagaataaaattctcatctttatatttcaa 12228552  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
      ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12228553 ataatgttattcccaagaataaatttgataaacttgtaacaaacacacc 12228601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 376
Target Start/End: Original strand, 26849194 - 26849492
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt-tcccaa 167  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | | ||    
T  26849194 aataaaatgatagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttact----------cccgggtataaaaagtttctgggaatagaaaaaaaaattcaaa 26849283  T
Q  168 gaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataa 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26849284 gaaaaatggtgggaataaagttcctacagagatgagaataaattcataaatagtt-acctattataatctctatttttatggttcctatgaatattataa 26849382  T
Q  267 agctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaa 366  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  26849383 agttaaccaaacatattttttctaaataccttgaaataaaatttccatctttatattccaagaaatattattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaa 26849482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 377
Target Start/End: Original strand, 28770209 - 28770557
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| | || |||||| || ||||||| ||||| ||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  28770209 agggtgtgtttctttcaagttatattcgtagattcctgggaataaaaagatagaaatatgcatgtctatgtttggtacaagtttactaaatttgattcct 28770308  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||  |||| ||    
T  28770309 gggtataaaacgttcctagcaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtgggaataaagttctcatgaagatgggaatgatttcatatgta-attaccta 28770407  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||| ||||| | ||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  28770408 ttataatccctatttttatggttcccgataatattataacgttaaacaaacatcatttttctatataccttggaataaaattctcatcattatgttccaa 28770507  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28770508 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacacaccc 28770557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19533130 - 19532939
Alignment:
Q  115 taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  19533130 taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaatttttttccaaggaaaagggtgggaataaagtttccttggagatgggaataaattcat 19533031  T
Q  215 aaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaa 306  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19533030 aaatag-ttacctattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaa 19532939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 343
Target Start/End: Original strand, 1246912 - 1247213
Alignment:
Q  40 gttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaat 139  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  1246912 gtttgaagctatatttgttgattctcgggaataaaatgatagaaatacatatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcccaagaataaaat 1247011  T
Q  140 gttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccct 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||| || |||| |||  ||||||||||| |    
T  1247012 gttcctggtaatagaaaaaatttccgaaggaaaaaggtgggaat--agttcacatggagatcggaataaattcttatatag-ttatctattataatccat 1247108  T
Q  240 atttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt 338  Q
    |||||||| || || |||| || |||| || |||||||||||| |||||   ||| | || ||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||    
T  1247109 atttttatagtaccaaggagtattatagagttaaccaaacatatttttctcgaatactttagaataaaattctcatctatttattctaaaaaatgttatt 1247208  T
Q  339 cctaa 343  Q
    |||||    
T  1247209 cctaa 1247213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27823306 - 27822994
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||| |||| ||||||||     
T  27823306 aataaaatgatagaaatataaatgtctatgtttgctataagtttactaaattttattcccgagtataaaacgttcatcgaaataggaaaattttcccaaa 27823207  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaa 267  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||   ||  |||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||     
T  27823206 gaaaagggtgggaataaaattctcatgaagatgagaacaaattcatgtgta-attacctgttataatccatatttttatgatttctaggaatattataat 27823108  T
Q  268 gctaaccaaaca----taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttg 363  Q
    | ||| |||| |    |  |||| |||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27823107 gttaagcaaatattttttttttttctaaataccttaaaataaaattctcatatttatgttcgaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttg 27823008  T
Q  364 aaacaaacacaccc 377  Q
    ||||||||||||||    
T  27823007 aaacaaacacaccc 27822994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 222 - 382
Target Start/End: Original strand, 6832114 - 6832275
Alignment:
Q  222 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 320  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6832114 ttacctattataatccttatttttaaggttctttggaatactatgaagttaaccaaacatattttttctaaataccttggaataaaattctcatctttat 6832213  T
Q  321 attccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6832214 attccaagtaatgttattcttaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacacacccttagt 6832275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40584669 - 40584336
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||| |||  |||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||     
T  40584669 gtgtatttgttttaagttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatgcatatgtctatgttttctacaagtttattaaattttattttcgga 40584570  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    ||||||||          ||||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   || |  || |||||    
T  40584569 tataaaat----------atagaaaagtttttccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaaattatgtgtaatc-acctatta 40584481  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  40584480 tatttcctatttttaaggttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatatttgaagga 40584381  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  40584380 atgttattcttaggaataaatttgttacacttgaaacaaacacac 40584336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24784279 - 24783925
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    | |||||||| |||  |||  ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24784279 ttagggtgtgtttgttttaagttataattgtagattttttggaataaaattataaaaatacatatgtca--gtttgttacaagtttactaaattttattc 24784182  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |    |||||||| ||| |  ||||| |||   ||| | ||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||   || || ||     
T  24784181 ctaa-tataaaatattcataagaatataaagttttttcaaagaaaa-gtgtatgaataaagttcccatgaagatgggaataaaattatgtgtaatt-acc 24784085  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatata-taaagct-aaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 324  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24784084 tattataatctttatttttaaggttccttggaatattctaaagtttaaccaaacatattttttttaaataccttagaataaaattctcatctttatattc 24783985  T
Q  325 caaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtat 384  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24783984 caaggaatgttattcttatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacactgttagtat 24783925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 205
Target Start/End: Original strand, 12930980 - 12931115
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    |||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||     
T  12930980 aataaaatcataaaaatgcatatggctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc-ggtataaaatgtttatgggaatagaaaagttttctcaaa 12931078  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaa 205  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12931079 gaaaatggtgggaataaagttcccatagagatgggaa 12931115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 371
Target Start/End: Original strand, 38140425 - 38140710
Alignment:
Q  87 tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaat--gttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaata 184  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| | ||||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||   ||| ||||  ||||||||| |||||    
T  38140425 tatatgtcaatgtttgttataagtttactataatttattgacgagtataaaatatgttcctaggaatagaaatttttttccaaagaaaagggtgagaata 38140524  T
Q  185 aagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataat 283  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || |||||   || ||| || |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||| | ||| |||||||  |    
T  38140525 aagttcc-atgaagatgagaataagttcatgtgtaatttcct-attataatccttattttttaggttcccaggaatattataatgttaatcaaacatctt 38140622  T
Q  284 tttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaac 371  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||| |||||||||||    
T  38140623 ttttctatataccttggaataaaattcacacctttatattccaaggaatgttattcctagaaataaattttataaaattgaaacaaac 38140710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49216179 - 49216027
Alignment:
Q  222 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 320  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||| | ||||| | |||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49216179 ttacctattataatctatatttttaaggttctttggaattttataaggttaaccaaacatattttttctaaataccttggaataaaattcccatctttat 49216080  T
Q  321 attccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacac 373  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||    
T  49216079 attccaaggaacattattcctaagaataattttggaaaacttaaaacaaacac 49216027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 2565459 - 2565644
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  2565459 agggtgtgttcgttttaagttatatttgttgattcttaggaataaaataatagaaatatatatacctgtgtttgttacaagtttgttaaattt-atttcc 2565557  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata 215  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  2565558 gggtataaaatgtttcttggaatagaaaattttttccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgagagtaaattcata 2565644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27094088 - 27093957
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaa-tgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||     
T  27094088 agggtgtatttgttttaagttatatgtgtaggttcccggaaaaaaaaatgattgaaatatatatgcctatgtttgttataagtttactatatcttattct 27093989  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 159  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27093988 cgggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaa 27093957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18460953 - 18460839
Alignment:
Q  87 tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  18460953 tatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaattttcccaaagaaaatggtggaaataaa 18460854  T
Q  187 gttcccatggagatg 201  Q
    |||| | ||||||||    
T  18460853 gttctcttggagatg 18460839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32071504 - 32071256
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| || |||||| |   |||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    
T  32071504 tttgtttgaagttatatttattgatttctaaaaataaaatgatagaaatatatat----atgtttgttacaagtttactaaattttatt-ttgggtatga 32071410  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||||  ||  ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| |||||  ||  ||| |||| ||||||||||    
T  32071409 aatgttcatggaaatagaaagattttcttaaagaaaagggcgagaataaagtt-acatggagatgagaataaatttgtatgtag-ttacctattataatc 32071312  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaa 291  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  32071311 tttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaa 32071256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 33647701 - 33647886
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| | || ||||| ||| ||||||| | ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33647701 tagggtgtgtttgtttcaagtaatattcgtagattctcgggaataaaacgttagaaatatacatctctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 33647800  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattca 213  Q
     |||||||||| ||| ||| ||||| |||||| || ||||  ||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||| |||||||    
T  33647801 tgggtataaaacgtttctgagaatataaaaaaatttccaaagaaaagagtggaaataaagtttccttgaagatgagaataaattca 33647886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 283 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6927908 - 6927817
Alignment:
Q  283 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  6927908 tttttctaaataccttagaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctagtaataaatttgataaacttaaaacaaacaca 6927817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29512705 - 29512631
Alignment:
Q  88 atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt 162  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29512705 atatgcctacgtttgtttcaagtttactaaattttattcctgagtataaaatgttcatcggaatagaaaaaattt 29512631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45826848 - 45826687
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||| || ||||||||||||| ||| |  || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  45826848 agggtgtgtttgtttcaagttatcgttgtagattccagggaataaaatgatagaaatctgcattcatatgttt-ttacaagtttattaaattttatttca 45826750  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcc 191  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||  |||||| |||||| ||||||||    
T  45826749 tgatataaaatgttcctgggaatagaagaacattcacaaagaaaaggatgggaaaaaagttcc 45826687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 43715305 - 43715370
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatg 92  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43715305 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgatagaaatgtatatg 43715370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 6831953 - 6832079
Alignment:
Q  26 attagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| | |  ||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6831953 attagggtgtgtttgtttcaacttatatttgtagattcctggaaataaaatcacaaaaaac-acatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 6832051  T
Q  126 cccgggtataaaatgttcctgggaataga 154  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||    
T  6832052 -ccaggtataaaatattcctgggaataga 6832079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32071080 - 32070994
Alignment:
Q  290 aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||| || |||||||| ||||    
T  32071080 aaataccttggaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcataggaataaatttgataaatttaaaacaaacccacc 32070994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18460725 - 18460582
Alignment:
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||| || |  ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| |     
T  18460725 attataatccctgtttttatggttc-tatgaatattataaagttaaccaaatatatttcttttaaataccttgtaatcaaattctcatctttatatttcg 18460627  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaac 371  Q
    |  |||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18460626 aaaaatgttattcgtagaaataaatttgataaacttgaaacaaac 18460582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 372
Target Start/End: Original strand, 33650280 - 33650357
Alignment:
Q  295 ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33650280 ccttagaataaaattctcatctttagatttcaaataatgttattcataaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 33650357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 28139759 - 28139846
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaa 156  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28139759 aataaaaagatagaaatatacatgcttatgtttgttacaagattagtaaattttattttcggatataaaacgttcttgggaatagaaa 28139846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 39932562 - 39932631
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatat--gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39932562 aataaaatgatagaaatgtatatatgtttatgtttgttataagtttactaaattttattcccggatataa 39932631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 126
Target Start/End: Original strand, 55435390 - 55435488
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| || || ||||||||||||||||| |  || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  55435390 tagggtgtatttgtttcaagttatttttgtagatacctgggaataaaatgataggaatatgcattctcatgtttgttacaagtttgttaaattttattc 55435488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Original strand, 55435652 - 55435726
Alignment:
Q  299 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacac 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  55435652 ggaataaaactcccatctttatattcccgggaaagttattcacaagaataaatctagtaaacttgaaacaaacac 55435726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27093834 - 27093763
Alignment:
Q  295 ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaa 366  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  27093834 ccttgaaataaaattcacatctttatattctaaggaatattatttttaagaataaatttgataaacatgaaa 27093763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 382
Target Start/End: Original strand, 28693697 - 28693784
Alignment:
Q  295 ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28693697 ccttgaaataaaattctcatcttaaagtttcaaggaaaattatttctaggaataaatttagtaaatttgaaacaaacacacccttagt 28693784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33497890 - 33497799
Alignment:
Q  68 aaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 159  Q
    |||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||  || || ||||||||| || ||||| ||||||    
T  33497890 aaataaaatgatagaaatatacatgcttatatttgttacaaatttattaaattttattctaggatacaaaatgttcatgagaataaaaaaaa 33497799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19532945 - 19532908
Alignment:
Q  344 gaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19532945 gaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 19532908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 372
Target Start/End: Original strand, 21925775 - 21925864
Alignment:
Q  283 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21925775 tttttctaaataccttataataaaatttcgatctttatgttctgaggaatcttacttctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 21925864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 376
Target Start/End: Original strand, 31267601 - 31267694
Alignment:
Q  283 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||| |||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||  | ||||||| |||||||||||||    
T  31267601 tttttctaaataccttaaaatgaaattcacatctttatattttaagaaatgttattcctaaaaataaatccgataaacttaaaacaaacacacc 31267694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45826136 - 45826064
Alignment:
Q  301 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacac 373  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  45826136 aataaaactcccattcttatattcccaggaaagttattcctaggaataaatctagtaaactggaaacaaacac 45826064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26085517 - 26085442
Alignment:
Q  300 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| || |||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26085517 gaataaaattcatatctttatgttcgaaagaatcttatttctaaaaataaatttagtaaacttgaaacgaacacac 26085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44534009 - 44533943
Alignment:
Q  314 tctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||| | ||||   |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44534009 tctttatattcccaagaataacattcataagaataaatttagtaaactttaaacaaacacaccctta 44533943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 2566471 - 2566524
Alignment:
Q  321 attccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||||||||||| ||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2566471 attccaaggaatattatttcaagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 2566524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Original strand, 9320405 - 9320446
Alignment:
Q  55 tgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgccta 96  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9320405 tgttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatataccta 9320446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12108298 - 12108242
Alignment:
Q  116 aaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaa 172  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12108298 aaattttattctcggatataaaatatttttaggaatagaaaaaatttcccaaaaaaa 12108242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13643083 - 13642976
Alignment:
Q  88 atatgcctatgtttgttacaagtttac-taaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |  |||||||||||| | |||||||||||  ||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  13643083 atatgtctatgtttgttacaagttaacctaatttttgttcttgattataaaatgttcttaggaatagaaaagtttttccaaaaaaaatggt-ggaataaa 13642985  T
Q  187 gttcccatg 195  Q
    ||| |||||    
T  13642984 gtttccatg 13642976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Original strand, 28693423 - 28693559
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| |  | ||||||||  |||||||  |||  ||| | ||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  28693423 ttagagtgtgtttgtttcaagttatattcatagattcccgagaataaaaaaataaaaatatgtatgcttatgtttgttataagtcaattaaattttattc 28693522  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttc 163  Q
      | |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  28693523 atgagtataaaacgatcctgagaatagaaaaattttc 28693559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 346344 - 346694
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  346344 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 346443  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  346444 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 346543  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346544 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 346643  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346644 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6171863 - 6171513
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6171863 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 6171764  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6171763 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 6171664  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6171663 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 6171564  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6171563 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 6171513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 42674658 - 42675012
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42674658 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 42674757  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  42674758 ccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttacc 42674857  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42674858 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattcc 42674957  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42674958 aagaaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 42675012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11071677 - 11071327
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11071677 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 11071578  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11071577 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttaccta 11071478  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11071477 ttataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaa 11071378  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11071377 ggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 11071327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4559633 - 4559278
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4559633 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccaagaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattc 4559534  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4559533 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 4559434  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4559433 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 4559334  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4559333 aaggaatgttattcttagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 4559278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37534024 - 37533675
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37534024 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 37533925  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  37533924 gggtataaaatgttccttggaatagaaaaaatttcccaaaaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttaccta 37533825  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37533824 ttataatccctatttttatggttcccaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttttattccaag 37533725  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37533724 gaatgttattcctagaaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccct 37533675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 14777497 - 14777847
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14777497 agggtgtgtttgtttcaatttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 14777596  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14777597 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 14777696  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14777697 ttataatccctatttttatagttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 14777796  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14777797 ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 14777847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17966057 - 17965707
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17966057 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgataataaaatgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttaccaaattttattc 17965958  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17965957 ccgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttacc 17965858  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17965857 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 17965758  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17965757 aaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 17965707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 32 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2050935 - 2050586
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050935 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 2050836  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  2050835 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttcctatta 2050736  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050735 taattcctatttttatgattcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 2050636  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2050635 atgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta 2050586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 28 - 378
Target Start/End: Original strand, 41729128 - 41729479
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41729128 tagggtgtgtttgtttcaagttataattttttattcccgggaataaaatgataggaatggatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattgc 41729227  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  41729228 cagatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatagtttacct 41729327  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41729328 attataatccctatttttatggttactaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 41729427  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41729428 aggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 41729479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 21737397 - 21737759
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21737397 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 21737496  T
Q  127 ccgggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaat 218  Q
    | ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21737497 ctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaat 21737596  T
Q  219 agtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctt 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21737597 agtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatatt 21737696  T
Q  318 tatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21737697 tatattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacatcctta 21737759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 30 - 373
Target Start/End: Original strand, 9733846 - 9734190
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  9733846 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctt 9733945  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9733946 ggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 9734045  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734046 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 9734145  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacac 373  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9734146 gaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacac 9734190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 32 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37192591 - 37192240
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  37192591 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttgg 37192492  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  37192491 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagattggaataaattcataaatagtttacctatta 37192392  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37192391 taatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaagga 37192292  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37192291 atgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 37192240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 37 - 377
Target Start/End: Original strand, 5770117 - 5770458
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5770117 tttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 5770216  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  5770217 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaataattttcctattataatc 5770316  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5770317 cctatttttatggttgctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgtt 5770416  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5770417 attcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 5770458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2521747 - 2521434
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2521747 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 2521648  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2521647 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaaattcctatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 2521548  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2521547 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaa 2521448  T
Q  328 ggaatgttattcct 341  Q
    ||||||||||||||    
T  2521447 ggaatgttattcct 2521434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 37 - 375
Target Start/End: Original strand, 28311704 - 28312042
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28311704 tttgtttcaagttatatttgttgattcccgggaataaaatgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactgaattttattcccgggtataa 28311803  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28311804 aatgttcctgggaatagaaaatctttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccgtggagatgggaataaattcataaatag-ttacctattataatc 28311902  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311903 cctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 28312002  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28312003 attcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 28312042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 37 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 638657 - 638318
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  638657 tttgtttcaagttataattgttgatttccggaaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaggtttactaaattttatttccgggtataa 638558  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  638557 aatgttcctaggaatataaaaaatttcccaaggaaaaggg-gggaataaagttctcatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatc 638459  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  638458 cctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 638359  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  638358 attcctaggaataaatttggtaaacttaaatcaaacacacc 638318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 37 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37233493 - 37233155
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37233493 tttgtttcaagttatatttgttgattcccgggaataaaatgataggaacatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 37233394  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37233393 aatgttcctgggaatagaaaatcgttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatag-ttacctattataatc 37233295  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37233294 cttattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 37233195  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37233194 attcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 37233155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 378
Target Start/End: Original strand, 40950855 - 40951208
Alignment:
Q  26 attagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40950855 attagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatatatatgcttatgtttgttacaagtttactaaaatttatt 40950954  T
Q  126 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 225  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40950955 ccttggtataaaatgttcctgggaatacaaaaaaatttccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttac 40951054  T
Q  226 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  40951055 ctattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattttcatctttatattc 40951154  T
Q  325 caaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40951155 caaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaatttgaaacaaacataccct 40951208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41750599 - 41750276
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  41750599 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttg 41750500  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41750499 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatt 41750400  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41750399 ataatccctatttttatggttcttaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattcccatctttatatttcaagg 41750300  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaattt 353  Q
    ||||||||||||| |||| |||||    
T  41750299 aatgttattcctaggaataaattt 41750276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26310333 - 26309993
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctat--gtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtat 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  26310333 tttgtttaaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatatgtttgttagaagtttattaaaatttattccttggtat 26310234  T
Q  135 aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataa 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26310233 aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataa 26310134  T
Q  235 tccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26310133 tccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaccatatttttcctaaatttcttgtaataaaattcccatctttatattccaaggaatg 26310034  T
Q  334 ttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26310033 ctattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 26309993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 20426481 - 20426830
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20426481 tagggtgtgtttgtttcaaattatatttgttgattcccgggaataaaatgataggaatttatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatccc 20426580  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |    
T  20426581 cggatataaaatgttcctgggaatagaaaatttttcccaaggaaaagggtgagaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatag-ttacct 20426679  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20426680 attataatctctatttttatggttggtaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatacattgaaataaaattcccatctttatattcca 20426779  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20426780 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaactttaaacaaacacaccc 20426830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 27 - 354
Target Start/End: Original strand, 34356697 - 34357023
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34356697 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattc 34356796  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  34356797 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccacgga-atgggaataaattcataaataattttcc 34356895  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34356896 tattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaatttcttggaataaaattcctatc-ttatattcc 34356994  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttg 354  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34356995 aaggaatgctattcctaagaataaatttg 34357023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Original strand, 39995130 - 39995435
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39995130 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 39995229  T
Q  129 gggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 220  Q
    || |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39995230 ggatataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatag 39995329  T
Q  221 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39995330 tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaatttccatcttta 39995429  T
Q  320 tattcc 325  Q
    ||||||    
T  39995430 tattcc 39995435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45409322 - 45408981
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  45409322 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccaagtataaaatgataggaatgtatatgcctatgttttttacaagtttactaaattttattacc 45409223  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||    
T  45409222 gggtataaaatattcatgggaatagaaaaatttacccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattcataaatag-ttaccta 45409124  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45409123 ttataatccttatttttatggttcctagaaatattataaatttaatcaaacatatttttgctaaataccttggaataaaattctcatctttatattccaa 45409024  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
      ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  45409023 taaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaa 45408981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 370
Target Start/End: Original strand, 27357962 - 27358303
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357962 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccaggtataaaatgatagggatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 27358061  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||    
T  27358062 aggtataaaatattcatgggaatagaaaaatttacccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattcataaatag-ttaccta 27358160  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27358161 ttataatccttatttttatggttcctaggaatattataaatttaatcaaacatatttttgctaaataccttgaaataaaattctcatctttatattccaa 27358260  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
      ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  27358261 taaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaa 27358303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 99 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23944165 - 23943885
Alignment:
Q  99 tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23944165 tttgttacaagtttactaaattttattctcggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaacgaaaagggtgggaataaagttcccatggag 23944066  T
Q  199 atgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattcct 297  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  23944065 atgagaataaattcataaataatttacctattataatctttatttttatggttcctaggaatattataaaggtaaccaaacatattttttctaaattctt 23943966  T
Q  298 tggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23943965 tacaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 23943885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 130 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13760938 - 13760692
Alignment:
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13760938 ggtataaaatgtttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 13760839  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13760838 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 13760739  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13760738 gaatgttattcctagaaataaatttggcaaacttgaaacaaacacac 13760692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Original strand, 18713664 - 18714005
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713664 tttgtttcaagttatatttgttgattcatggtaataaaatgatataaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 18713763  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||| | || |||||||| |    
T  18713764 aatgttcttggtaataaaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaatttatacgtag-taacctattataaac 18713862  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18713863 cctatttttatggttcataggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatatcttggaataatattctcatctttatattccaaggaatgtt 18713962  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18713963 attcctataaataaatttggtaagcttgaatcaaacacaccct 18714005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3902520 - 3902182
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||| |  ||||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  3902520 tttgtttcaagttatatttgttctttcctgagaataaaatgatagaaatatatagacatatgtttgttacaagtttactaaattttattctcaggtttaa 3902421  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  3902420 aatgttcctgggaatagaaaaaaattcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccttggagatgagaataaattcatatatag-ttacctattataatc 3902322  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3902321 cctatttttatggttcctgtgaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatatcttggaataaaattcccatctttatatttcaaggaatgtt 3902222  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3902221 attcctaaaaataaatatggtaaacttgaaacaaacacac 3902182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 45694262 - 45693908
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| | || |||| | || |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45694262 ttagggtgcgtttgtttcaagttatattcgtagatttctgggaataaaatgataggaatacacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 45694163  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | || ||| |     
T  45694162 ccgggtataaaacgttcatgggaatagaaaatttttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaattcatgagtaatttgc- 45694064  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||  ||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45694063 aattataattcctatttttatggttcccaggaatattataatgttaagcaaacatttttttttaaaatgccttggaataaaattctcatctttatgttcc 45693964  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45693963 aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacatccttag 45693908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14832874 - 14832536
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14832874 tttgtttcaagttatatttgttgattcctaggaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttaaaagtttactaaattttattcccaggtataa 14832775  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||  || ||| | ||||||||||    
T  14832774 aatgttcttgggaatagaaaaattttcccaaagaaaagggtgggaataaagttctcattgagatgagaataaatttatacgtaattt-cctattataatc 14832676  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  14832675 cttatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaatatctaggaataaaattatcatctttatattttaaggaatgtt 14832576  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14832575 attcttggaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 14832536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1988382 - 1988073
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1988382 gggtgtgtttgtttgaagttatatttgttgatttctgggaataaaatgatagaaatatacatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccg 1988283  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||| |||| |||    
T  1988282 gatataaaatgttcttgggaatagaaaaattttctcaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgagaataaattcttatatag-ttacctat 1988184  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  1988183 tataatccctatttttttggttccaaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcccaaaaatcttggaataaaattctcatatttatattctaag 1988084  T
Q  329 gaatgttattc 339  Q
    |||||||||||    
T  1988083 gaatgttattc 1988073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40570092 - 40569740
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||  ||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40570092 agggtgtgtttgtttcaagttataattgtagattcctgggaataaaatcataaaaacatacatgcctatgtttgttacaagtttgttaaattttattccc 40569993  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaata---aagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||  ||||    
T  40569992 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaatttttcccaaagaaaatggtgggaataaagaagttcccatggaaatgggaataaaatcatgtata-attac 40569894  T
Q  226 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 324  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||| | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  40569893 ctattataatccctatttttgaggttccttggaacattataatgttaaccaaacatcttttttctaaataccttggaataaaatttacatatatatattc 40569794  T
Q  325 caaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40569793 caaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 40569740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39819760 - 39819414
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  39819760 tttgtttcaagttatatttgtagattcctgaaaataaaatcatgaaaatacatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttcattcccgggtatat 39819661  T
Q  137 aat---gttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaata---gtttacttatt 230  Q
    |||   |||||||||||| ||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||| | ||| ||    |||||| || |    
T  39819660 aataatgttcctgggaattgaaaaaaatttccaaagaaaatggtgggaataaagttctcatgaagatgagagtaaaattatatatgtttgtttacctaat 39819561  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  39819560 ataatccttatttttaaggttccttggaatattataaagtcaaccaaacatattttttctaaatacctgggaataaaatttccatctttatattccaaag 39819461  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39819460 aatgttattcctatgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacacc 39819414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6571759 - 6571602
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6571759 agggtgtatttgtttaaagttatatttgttgatttccggaaataaaatgataggaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 6571660  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6571659 aggtataaaatgttccggggaatataaaaaatttcccaagaaaaagggtaggaataaa 6571602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7007647 - 7007307
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||  |||||||||| | ||| ||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||       
T  7007647 ttagggtgtgtttatttcaagttatatttgttgattcttggggataaaatgatggaaatatatttgtcaatgtttcatacaagtttactaaatttta--- 7007551  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
           |||||||||  ||  |||  |||||| |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||     
T  7007550 ------ctaaaatgttattgataat--aaaaaaattcccaaagaaaatggtgggaataaaattaccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacc 7007460  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  7007459 tattatactccctattttaatggttcttaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaatactttagaataaaattctcatctttatatttc 7007360  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7007359 aagaaatgttattcctaataataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccct 7007307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4875848 - 4875506
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| | ||   |||||||||||||||| |||  || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  4875848 tagggtgcgtttgttttaagttatatttgtagctttttggaaataaaatgatagaaataaatttgtttatgtttgttacaagtttgctaaattttatttt 4875749  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    |   ||||||| ||||  | ||||| ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  || || || |    
T  4875748 caa-tataaaacgttctcgagaataaaaaaaaaatcccaaagaaacgggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaattcatatgtaatt-acat 4875651  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttc-ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||  ||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4875650 attataatccctatttttatggttcctcggcatattataatgttaagaaaacatatttttttctaaatacattggaataaaattcacatctttatattcc 4875551  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  4875550 aaagaatattattcctaagaataaatttgacaaacttgaaacaaa 4875506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 382
Target Start/End: Original strand, 5002834 - 5003188
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |    ||||||||||||| | | || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5002834 ttagggtgcgtttgtttcaagttatatttgtagatttctaagaataaaatgatagaagtatacatgcatatatttgttacaagtttgctaaattttattc 5002933  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  | ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||  || | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||  |||||||   ||  | ||     
T  5002934 caag-tataaaatgtttctgggaatagaaaaaaaattccaaagaatatggtgggaataaagtttccatgaagatatgaatcaattcatgtgtaact-acc 5003031  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaa-gctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||  ||| | |||||||||||  |||  | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5003032 tattataatccatatttttatggttcctgaaaatattaaaatgttaaccaaacatcttttatccaaataccttggaataaaattcgcatctttatattcc 5003131  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  5003132 aaggaatgttattcctataaataaatttggtaaattttaaacaaacacacctttagt 5003188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 224 - 366
Target Start/End: Original strand, 11763594 - 11763737
Alignment:
Q  224 acttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11763594 acttattataatccctatttttatggttcttaggaatattataaaattaatcaaacatattttttctagataccttggaataaaattctcatctttatat 11763693  T
Q  323 tccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaa 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11763694 tccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaa 11763737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 11763386 - 11763577
Alignment:
Q  45 aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 144  Q
    |||||||| |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||||||| || |    
T  11763386 aagttatatttgttgtttttcgggaatgaaatgataggaatatatatgtctatgtttgttataaatttactaaattttattctcggacataaaatatttc 11763485  T
Q  145 tgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatcc 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11763486 tgggaatagaaaaaatttccaaaggaaaaaggtgggaataaagtttccatgaagatgagaataaattcataaatag-ttacctattataatcc 11763577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14253578 - 14253412
Alignment:
Q  45 aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 144  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  14253578 aagttatatttgttgattctcgggaataaaatgatagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttta 14253479  T
Q  145 tgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||    
T  14253478 tgggaatagaaaaaatttctcaaagaaaagggtgtgaataaaattttcatgaagatgagaataaatt 14253412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 222 - 374
Target Start/End: Original strand, 3254284 - 3254437
Alignment:
Q  222 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 320  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  3254284 ttacttattataacccttatttttatggtttctaggaatattatgaagttaaccaaacatattttttctaaataccttagaataaaattctcatttttat 3254383  T
Q  321 attccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3254384 attccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca 3254437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 370
Target Start/End: Original strand, 41297983 - 41298255
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccat 194  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | | |||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||    
T  41297983 tatgtatgttacaagtttattaaattttattcccggatataaaatgtttttagaaataaaaaaaatttcccaaagcaaagggtgtgaataaagttctcat 41298082  T
Q  195 ggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaat 293  Q
    | ||||| ||| | ||||||  |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||  ||||  |||||    
T  41298083 gaagatgagaatatattcatttata-attacctattataatctctattcttatggttccttggaatattataatgttaaacaaacatcttttttttaaat 41298181  T
Q  294 tccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
     |     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||||    
T  41298182 ac---aaaataaaattctcatctttatattccaatgaatgttattcctaaaaataaatttgatatacttaaaacaaa 41298255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13539675 - 13539399
Alignment:
Q  94 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 193  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||   ||||||||||||||||||    
T  13539675 ctatgtttgttacaaatttattaaattttattcgcaggtataaaatgtttatgggaatggaaaaaatttctcacagaaactagtgggaataaagttccca 13539576  T
Q  194 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaa 292  Q
    || | ||||||| | ||||||   || ||  || |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||| | ||| |||||||  |||| |||||    
T  13539575 tgaacatgggaatagattcatgtgtaattatct-attataatccttatttttatggtttctgagaatactataatgttaagcaaacatcttttttctaaa 13539477  T
Q  293 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
    |   || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13539476 tattttagaataaaattctcatctttatgttccaagaaatgttatcaccaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaa 13539399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13790222 - 13790018
Alignment:
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata-aatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataa 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  13790222 aaaaacggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaaatcatgtaata--ttacctattataatccctatttttaaggttccttggaatattataa 13790125  T
Q  267 agctaaccaaacataattttcct-aaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaa 365  Q
     | ||| |||||||  ||||  | |||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  13790124 tgttaatcaaacatctttttttttaaataccttagaataaaatttacatctatatatttcaaggaatgttattcctacaaataaatttgataaacttgaa 13790025  T
Q  366 acaaaca 372  Q
    |||||||    
T  13790024 acaaaca 13790018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25455096 - 25454939
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |  |||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  25455096 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatacatatgtctatgtttgttacaagtttactaaatttcattctc 25454997  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| || |||||||||    
T  25454996 gagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaaaaaaatggagggaataaa 25454939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1623446 - 1623206
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    | |||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1623446 tttgttttaaattatatttgttgattcctaagagtaaaataatagaaatatatatgtctatgtt-gttacgagtttattaaatttgattcccggttataa 1623348  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||| | | ||| ||| ||| ||||  || | || |||||||||||| | ||| | ||| ||| |||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  1623347 aatgttcctgagtacagagaaatttttccaaagaacatggcgggaataaagtttcaatgaatatgagaataaattcatatgtag-ttaccaattataatc 1623249  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaat-atataaagctaaccaaac 278  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  1623248 tctatttttatggttcctacgaataatataaagttaatcaaac 1623206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25725055 - 25724925
Alignment:
Q  72 aaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa-ttttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaa 170  Q
    |||||||||| |||   ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  25725055 aaaatgatagaaatacgtattcctatgtttgttgcaggtttattaaaattttattgctgggtataaaatgtttctgggaatagaaaaagtttcccaaaga 25724956  T
Q  171 aaagggtgggaataaagttcccatggagatg 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25724955 aaagggtgggaataaagttctcatgaagatg 25724925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 14403232 - 14403349
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  14403232 agggtgtgtttgtttgaagttgtatttgttgattcctggaaataaaatgataaaaatatacatgcctacatttattacaagtttaataaattttattctc 14403331  T
Q  129 gggtataaaatgttcctg 146  Q
     |||||||||||||||||    
T  14403332 aggtataaaatgttcctg 14403349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24499509 - 24499400
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  24499509 gtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcatagaaataaaatgatagaaatatatat--ctatgtttgttataagtttactaaattttattccatgg 24499412  T
Q  132 tataaaatgttc 143  Q
    ||||||||||||    
T  24499411 tataaaatgttc 24499400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4685214 - 4684945
Alignment:
Q  66 ggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatg-ttcctgggaatag-aaaaaatttc 163  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| || |||| ||||||||||| | | |||||||| | ||||||| ||||| ||||||        
T  4685214 ggaaataaaatgatagaaatatacatgtttatgtttgttataaatttattaaattttatttcagagtataaaacgtttcctggcaatagaaaaaaaaaaa 4685115  T
Q  164 ccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatata 263  Q
     |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||    || ||||||||| | ||||||||||| ||| | ||   ||    
T  4685114 tcaaagaaaagggtgtgaataaagttcccatgaagatgggaacaaattcatgtgta----acctattataattcatatttttatggatccgaagatatta 4685019  T
Q  264 taaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat 337  Q
    ||| | ||| |||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  4685018 taatgttaagcaaatatatttttactaaatacctaggaataaaattctcatctttatgttctaaagaatgttat 4684945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1623188 - 1623078
Alignment:
Q  263 ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaactt 362  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||    
T  1623188 ataaagttaaccaaacatatattttctaaatac-ttgaaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattactaggaataaatttagtaaaatt 1623090  T
Q  363 gaaacaaacaca 374  Q
    ||||||||||||    
T  1623089 gaaacaaacaca 1623078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 203
Target Start/End: Original strand, 8868702 - 8868834
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    |||||| |||||| |||  |||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||     
T  8868702 aataaattgatagaaatacatattcttatgtttgttacaggattagtaaattttattcctaggtagaaaatgttcctggg-atag-gaatatttcccaaa 8868799  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatggg 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8868800 gaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatggg 8868834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2521434 - 2521381
Alignment:
Q  317 ttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2521434 ttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaa 2521381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 211
Target Start/End: Original strand, 3254142 - 3254245
Alignment:
Q  109 gtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  3254142 gtttactaaattttattctcgcgtacaaaatgtttctgggaatagaaaattttttcccaaaggaaatggtgggaataaagttcccatgaagatgagaata 3254241  T
Q  208 aatt 211  Q
    ||||    
T  3254242 aatt 3254245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14253325 - 14253254
Alignment:
Q  301 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  14253325 aataaaattctcatccttatattccaaagaatgttattcctaaaaataaatttggtaaatttaaaacaaaca 14253254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37851891 - 37851744
Alignment:
Q  68 aaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa---aaaatttcc 164  Q
    |||||||||||||| ||| ||  | | |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||   |||| ||||    
T  37851891 aaataaaatgatagaaatataccttcttatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttcgggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattcc 37851793  T
Q  165 caagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcat 214  Q
     ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  37851792 aaag-aaaatggtgagaataaagttcccatgaagatgagaataaattcat 37851744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25625418 - 25625290
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa--tttccca 166  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  |||   |    
T  25625418 aataaaatgatagaaatatgaatgtctaggtttgttgcaaatttactagattttattctgaggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaatttgaaa 25625319  T
Q  167 agaaaaagggtgggaataaagttcccatg 195  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25625318 aaaaaaaaggtgggaataaagttctcatg 25625290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13761009 - 13760941
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgtta 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  13761009 tttgtttcaagttataattattgattttcgggaataaaatgataggaatatatgtacctatgtttgtta 13760941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 211
Target Start/End: Original strand, 516463 - 516572
Alignment:
Q  101 tgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagat 200  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  516463 tgttataattttagtaaattttatttctgggtataaaatgtttttgggaatataaaaaaattccaaag-aaaatggtgagaataaaattcccgtgaagat 516561  T
Q  201 gggaaaaaatt 211  Q
    | ||| |||||    
T  516562 gagaataaatt 516572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 380
Target Start/End: Original strand, 36590862 - 36590924
Alignment:
Q  318 tatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  36590862 tatattccaacgaatgttattcctaaaaataaatttagtaaacttaaaacaaactcactctta 36590924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25444999 - 25444922
Alignment:
Q  301 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  25444999 aataaaattatcatctttatattccaaaaaatgttattccttaaaataaatttgacaaacttaaaacatacacaccct 25444922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45212735 - 45212662
Alignment:
Q  297 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||| || |||||||    
T  45212735 ttggaataaaattctcatctttacatttcaaagaatgtaattcctaaaaataaatttgataaatttaaaacaaa 45212662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10390627 - 10390559
Alignment:
Q  297 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaac 367  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10390627 ttggaataaagttctcat-tttatgttccaaggaatataattc-taagaataaatttggtaaacttgaaac 10390559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14253413 - 14253340
Alignment:
Q  242 ttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccat 314  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  14253413 ttttatgtttcctaaaaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaatattttggaataaaatttccat 14253340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14137153 - 14137054
Alignment:
Q  151 tagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggt 250  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| |  ||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||  || || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  14137153 tagaaaaattttctcaaaaaaaaggttaagaataaagttctcatgaagacgagaataaattcatatgtaatt-acttattaaaatctctatttttatggt 14137055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 28 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45045699 - 45045352
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45045699 tagggtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttatttc 45045600  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45045599 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 45045500  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045499 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 45045400  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45045399 aggaatattattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 45045352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 35488187 - 35488537
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35488187 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 35488286  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35488287 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 35488386  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35488387 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 35488486  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35488487 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 35488537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 11330067 - 11329713
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11330067 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 11329968  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11329967 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 11329868  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11329867 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc 11329768  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329767 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 11329713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27248367 - 27248013
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248367 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 27248268  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27248267 ccaggtataaaatgttactgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 27248168  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27248167 tattataatccctatttttatagttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattct 27248068  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27248067 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacatcctta 27248013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 380
Target Start/End: Original strand, 45265049 - 45265399
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45265049 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttataagtttactaaattttatttccgg 45265148  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45265149 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctatt 45265248  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45265249 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 45265348  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45265349 aatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta 45265399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33378916 - 33378553
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378916 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 33378817  T
Q  127 ccgggtataaaatg--------ttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaat 218  Q
    | ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33378816 ctgggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaat 33378717  T
Q  219 agtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctt 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378716 agtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctt 33378617  T
Q  318 tatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378616 tatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 33378553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44566116 - 44565767
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44566116 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccggaaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccg 44566017  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  44566016 ggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 44565917  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44565916 tataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaatttccatctttatattccaag 44565817  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44565816 gaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 44565767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43949315 - 43948963
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  43949315 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctta 43949216  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43949215 gtataaaatgttcctggaaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctatt 43949116  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949115 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 43949016  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43949015 aatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaatacacccttagt 43948963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 377
Target Start/End: Original strand, 27213854 - 27214203
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27213854 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 27213953  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27213954 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttaccta 27214053  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27214054 ttataatccctgtttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 27214153  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27214154 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 27214203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48341426 - 48341086
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48341426 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattcccgg-tataa 48341328  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48341327 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatc 48341228  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48341227 cctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattccc-tctttatattccaaggaatgtt 48341129  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48341128 attcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 48341086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 382
Target Start/End: Original strand, 9946987 - 9947344
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9946987 ttagggtgtgtttgtttaaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 9947086  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  9947087 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagattaaattcataaatagtttacc 9947186  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata-attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9947187 tattacaatccctatttttatggttcctatgaatattataaagctaaccaaacatatttttttctacattccttggaataaaattcccatctttatatta 9947286  T
Q  325 caaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9947287 caaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 9947344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 30 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38544265 - 38543920
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38544265 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttattacaggtttactaaattttattcccg 38544166  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38544165 ggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttctcaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 38544066  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38544065 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattctcatctttatattccaag 38543966  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaac-ttgaaacaaacac 373  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  38543965 gaatgttattcctaagaataaatttagtaaactttgaaacaaacac 38543920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 34930481 - 34930814
Alignment:
Q  45 aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgttt-gttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttc 143  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  34930481 aagttataattgttgattcctgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgttttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttc 34930580  T
Q  144 ctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctattt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34930581 ctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttatctattataatccctattt 34930680  T
Q  244 ttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattccta 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34930681 ttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattccta 34930780  T
Q  343 agaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34930781 ggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 34930814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Original strand, 27419223 - 27419571
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27419223 agggtgtgtttgtttcaagttataattgctgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 27419322  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27419323 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 27419422  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27419423 ttataatctctatttttatggtccctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattctttggaataaaattcccatctttatattccaa 27419522  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27419523 gaaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 27419571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 48314196 - 48313842
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48314196 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttagaagtttactaaattttattc 48314097  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  48314096 ccggatataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaatttataaatagttttcc 48313997  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48313996 tattataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattcc 48313897  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48313896 aagaaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta 48313842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39554255 - 39553910
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39554255 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 39554156  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39554155 tggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 39554056  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata-attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39554055 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaaaatattttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 39553956  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  39553955 aggaatgttattactaagaataaatttgataaacttcaaacaaaca 39553910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 37 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45449006 - 45448665
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45449006 tttgtttcaagttataatttttgattctcgggaataaaatgataggaatgtagatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 45448907  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45448906 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatagagaggggaataaattcataaatagtttatctattataatc 45448807  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45448806 cttatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttagaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 45448707  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45448706 attcataggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 45448665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 28904183 - 28904537
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28904183 ttagggtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccgagaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 28904282  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  28904283 cttggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaaatttataagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 28904382  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28904383 tattataatccatatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattcc 28904482  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28904483 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 28904537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Original strand, 8419588 - 8419900
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8419588 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattccc 8419687  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8419688 aggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 8419787  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419788 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataaaattcccatctttatattccaa 8419887  T
Q  328 ggaatgttattcc 340  Q
    |||||||||||||    
T  8419888 ggaatgttattcc 8419900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 37 - 380
Target Start/End: Original strand, 25924644 - 25924988
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  25924644 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctttgtataa 25924743  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25924744 aatgttcctgggaatagaaaaaatttccccaggaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatc 25924843  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25924844 catatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgtt 25924943  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25924944 attcttaggaataaatttggtaaacatgaaacaaacacaccctta 25924988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40212960 - 40212657
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40212960 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcgcgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccgg 40212861  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  40212860 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttatctat 40212761  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40212760 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcctag 40212661  T
Q  329 gaat 332  Q
    ||||    
T  40212660 gaat 40212657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25098141 - 25097796
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25098141 agggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattttcgggaataaaatgataggaatgtatatgcccatgtttgttacaagtttactaaattttatttcc 25098042  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25098041 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 25097942  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc-a 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25097941 ttataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 25097842  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    |  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25097841 aaaaatattattcctaggaataaatttggtaaacttaaaacaaaca 25097796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Original strand, 38396381 - 38396714
Alignment:
Q  45 aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396381 aagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 38396480  T
Q  145 tgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  38396481 tgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccacggagatgggaataaattcataaataattttcctattataatccctatttt 38396580  T
Q  245 tatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  38396581 tatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaattcctatc-ttatattccaatgaatgctattcctag 38396679  T
Q  344 gaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38396680 gaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 38396714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 380
Target Start/End: Original strand, 41632365 - 41632710
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |    
T  41632365 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgagaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttattacaagtttactaaaatttattccttg 41632464  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41632465 gtataaaatgttcttaggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctatt 41632564  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41632565 ataatccatatttttatggttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcaaagg 41632664  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41632665 aatgttatt-----gaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 41632710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 27 - 347
Target Start/End: Original strand, 9814215 - 9814532
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9814215 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatg----tgtttgttacaagtttactaaattttattc 9814310  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  9814311 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttatc 9814410  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  9814411 tattataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaatcaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattgtcatctttatattcc 9814510  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaat 347  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  9814511 aagaaatgttattcctaggaat 9814532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44820323 - 44819981
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||    
T  44820323 gtgtgtttgtttcaagttataattgttgattttcaggaataaaatgatagaaatgtatttgtatgtgtttgttacatgtttattaaaatttattccttgg 44820224  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44820223 tataaaatgttcctcggaacagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta 44820124  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  44820123 tagtccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaatatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattttaagga 44820024  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacac 373  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44820023 atgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacac 44819981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 48160589 - 48160921
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160589 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 48160688  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
                     |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  48160689 -----------------tgggaagagaaaaaatttcc-aaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacct 48160770  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160771 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 48160870  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48160871 aggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccc 48160921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 374
Target Start/End: Original strand, 37534105 - 37534447
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||  || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37534105 gtgtgtttgtttcatgttataattgtagattcctggaaataaaatcataaaaacatacatgcatatgtttgttacaagtttactaacttttatttccggg 37534204  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37534205 tataaaatatttatgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgtgaataaattcataaatag-ttacttatta 37534303  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37534304 taatccctattattatagttcctaagaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttgaaataaaattctcatctttatattccaagga 37534403  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||||||| |||  ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37534404 atgttatttctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacaca 37534447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 374
Target Start/End: Original strand, 30685993 - 30686336
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||   | |||||||| |||  ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30685993 ggtgtgtttgtttcaagttataattgtagattcgttggaataaaatcataaaaacatacatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 30686092  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30686093 gtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaaaggtgggaataaagttcctagggagatgggaataaattcataaatag-ttacttatt 30686191  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30686192 ataatcgctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttgcaataaaattttcatctttatattccaagg 30686291  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  30686292 aatgttattcctagaaataaatttgataaacttaaaacaaacaca 30686336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 16825351 - 16825586
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16825351 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttaattcctaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 16825450  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16825451 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 16825550  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825551 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat 16825586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18824218 - 18823890
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaa-tgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||||   || ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18824218 agggtgtgtttgtttcaagttgtatttgttgatttttgggaataaaatgatagaaaatatatatgcctatgtttgttacaagttcactaaattttattcc 18824119  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |    
T  18824118 cgggtataaaatgtttttgggaatagaaaaattttcccaaggaaaaaggtgggaataaagtt-ccatggagatgggaataaattcataaata-attacct 18824021  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||               ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18824020 attataatccctat---------------gaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttagaataaaattctcatctttatattcca 18823936  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18823935 aagaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaaca 18823890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 377
Target Start/End: Original strand, 6656480 - 6656819
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||    
T  6656480 tttgtttcaagttatatttgttgatttttggaaataaa-tgatatgaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattt-attttcgagtataa 6656577  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  6656578 aatgtttctgggaatagaaaagttttcccaatgaaaaatatgggaataaagttcccatggagatgggaataaagtcataaatag-ttacctattataatc 6656676  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatg-t 334  Q
      ||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |    
T  6656677 tatatttttttggttcttagaaatattataaagttaacaaaacatattttttccaaataccttggaataaaattctcatatttctattccaaggaatgtt 6656776  T
Q  335 tattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6656777 tattcctaagaataaatttagtaaacttgaaagaaacacaccc 6656819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 80 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45723170 - 45722879
Alignment:
Q  80 aggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgg 179  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45723170 aggaatatatatgcctatgtttgtcacaagtttactaaattttattcccgagtataaaatgttcttgggaatagaaaaattttcccaagaaaaatggtgg 45723071  T
Q  180 gaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaac 278  Q
    |||||||||||||||| | || | || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  45723070 gaataaagttcccatgaaaatagaaataaattcataaatag-ttacctattataatccatatttttatgatttctaggaatattataaagttaattaaac 45722972  T
Q  279 ataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||| |||| |         |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45722971 atattttttc---------tggaataaaatttccatctttatatttcaaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaataaagacaccct 45722881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 25045615 - 25045838
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  || | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25045615 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattctgggga-taaaaagataggaatatatatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattc 25045713  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||     
T  25045714 ccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaaattttcgtaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaata-attaca 25045812  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttc 252  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||    
T  25045813 tattataatccatattttcatggttc 25045838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 382
Target Start/End: Original strand, 31921811 - 31922079
Alignment:
Q  114 ctaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattca 213  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  31921811 ctaaattttattcctgagtataaaatgtttgtgggaatagaaaaaaatttccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgagaataaattca 31921910  T
Q  214 taaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaat--tc 310  Q
    || |||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||    
T  31921911 tatatagt---cctattataatgtctatttttatggttcctagaaatattataaagttaaccatacatattttttctaaataccttggaataaaattctc 31922007  T
Q  311 ccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31922008 ccatatttatattccaaagaatgttattcatggtaataaatttgataaacttgaaacaaacacacccttagt 31922079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11000777 - 11000552
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatat-gcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000777 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatatgttgattcctggaaataaaatgatataaatatatatagcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 11000678  T
Q  126 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 225  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||   || |  |    
T  11000677 cccgggtataaaatattcttgggaatagaaaaattttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgcatatgagaataaattcatatgaag-tcgc 11000579  T
Q  226 ttattataatccctatttttatggttc 252  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  11000578 ctattataatccctatttttatggttc 11000552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45440979 - 45440637
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatg-tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||| |||  ||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45440979 gggtgtgtttgtttcaagttataattgtagattcttgggaataaaatcataaaaaacatacatgcatatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 45440880  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||  |||| ||    
T  45440879 gagtataaaatgttcctcggaatataaaaattttcccaaagaaagtagtgggaataaagttctcatggagatgggaaaaaaatcatgtata-attaccta 45440781  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||| | ||| |||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||    
T  45440780 ttataatccctagttttaaggttacttggaatattataatgttaatcaaacat-ctttttttaaatatcttggaataaaatttacatc--tatattctaa 45440684  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    | ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45440683 gaaatgttattactatgaataaatttggtaaac-tgaaacaaacacac 45440637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Original strand, 41684020 - 41684278
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41684020 tagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcctgagaataatatgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttatttc 41684119  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||  || |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||  ||| |||| |    
T  41684120 cggatataagatgttcttgggaatagaaaattttgcccaaagaaaagagtgggaataaagttctcatggagatgaaaataaatttatatgtag-ttacct 41684218  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataatttt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  41684219 attataatctctatttttatggttcctataaatattataaaattaaccaaacatattttt 41684278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 6656226 - 6656454
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |    
T  6656226 gtgtgtttgtttcaagttatatttgttgatttttggaaataaaatgatatgaatatatatacctatgtttgttataagtttactaaattt-attttcgag 6656324  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    |||||||| || |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||    
T  6656325 tataaaatatttctggaaatagaaaagttttcccaataaaaagggtggaaataaagtttccatggagatgggaataaaatcataaatag-ttacctatta 6656423  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaatat 262  Q
    |||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  6656424 taatctgtatttttttggttcctaagaatat 6656454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 381
Target Start/End: Original strand, 40385692 - 40385979
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaa-aaagggtgggaataaagttccca 193  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  40385692 tatgtttgttagaagtttactgaattttattcctgtctataaaatgtttctgggaatagaaaaaatatcccaaaaagaaatggtgggaataaagttccca 40385791  T
Q  194 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaa 292  Q
    |  |||||| || ||| ||||   ||  | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||  ||||  ||||    
T  40385792 ttaagatggaaataaactcatgtgtaact-acctattataatccatatttttatggttcttaggaatattataatgttaaccaaatatcttttttttaaa 40385890  T
Q  293 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| | ||||||| ||||    
T  40385891 taccttaaaataaaattctcatctttatattccaaaaaatgttattactaagaataaatttgatacacttgaaagagacacacctttag 40385979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Original strand, 5543196 - 5543479
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttccca 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| ||||||||||||   |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5543196 tatgtttgttacaagtttactaaattttattctctcgtataaaactttcttgggaatagaaattttttcccaaagaaaaatagtgggaataaagttccca 5543295  T
Q  194 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaa 292  Q
    || ||||||||| ||||||||   ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| | ||| |||||||  |||| |||||    
T  5543296 tgaagatgggaacaaattcatgtgta-attacctattataatccatatttttatggttcccgggaacattataatgttaagcaaacatcttttttctaaa 5543394  T
Q  293 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||  |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5543395 tacctt-gaataaaattctcatctttatgtttcaaataatgatattcttagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacaccct 5543479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 371
Target Start/End: Original strand, 22156248 - 22156520
Alignment:
Q  99 tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgga 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  22156248 tttgttacaagtttaataaattttaatcccgcgtataaaacgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtaggaataaagttctcataga 22156347  T
Q  198 gatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattcc 296  Q
    |||| ||| || ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||  | ||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  22156348 gatgagaataagttcatatgta-attacatattataatccatatttttatggttctcgtgaatattatactgttaaacaaacat-ttttttctatatacc 22156445  T
Q  297 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaac 371  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22156446 ttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac 22156520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 371
Target Start/End: Original strand, 22212163 - 22212435
Alignment:
Q  99 tttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgga 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  22212163 tttgttacaagtttaataaattttaatcccgcgtataaaacgttcctgggaatagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtaggaataaagttctcataga 22212262  T
Q  198 gatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattcc 296  Q
    |||| ||| || ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||  | ||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  22212263 gatgagaataagttcatatgta-attacatattataatccatatttttatggttctcgtgaatattatactgttaaacaaacat-ttttttctatatacc 22212360  T
Q  297 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaac 371  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22212361 ttagaataaaattcttatctttatattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttgataaatttgaaacaaac 22212435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Original strand, 43445887 - 43446229
Alignment:
Q  34 gtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggta 133  Q
    |||||||||| |||||||| || | |||||  |  |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  43445887 gtatttgtttcaagttatatttatagattcttgcgaataaaattataaaaatgtatatgcctatatttgttataagtttactaaattttattctcgaata 43445986  T
Q  134 taaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattata 233  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||   ||  |||| |||||||    
T  43445987 taaaatgttcatgagaataaaaaagttttcccaaagaaaatggtgggaataaagttctcatggagatgagaataaaattatgtgta-attacctattata 43446085  T
Q  234 atccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 332  Q
     | ||||| ||||  |||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  43446086 tttcctatctttaatgttctttagaatattataatgttaaccaaacat-atttttctaaataccttaaaataaaattcctatctttatattccgataaat 43446184  T
Q  333 gttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    ||||||| ||  ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  43446185 gttattcatagaaatcaatttggtacactttaaacaaacaaaccc 43446229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 381
Target Start/End: Original strand, 17276353 - 17276511
Alignment:
Q  225 cttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaa-ccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 322  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |||| | ||| ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  17276353 cttattgtaatccttatttttaaggtttcttggaatattataatgttaaaccaaacatcttttttctaaatatcttggaataaaatttacatctatatat 17276452  T
Q  323 tccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17276453 tccaaggaatgttattcctagaaataaattttgtaaaattgaaacaaacacacccttag 17276511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31598597 - 31598449
Alignment:
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||| |||| | ||| |||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31598597 tattataaatcctatttttatgattcccaggtatattataatgttaaacaaacatcttttttttaaataccttgaaataaaattcctatctttatattcc 31598498  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    ||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31598497 aagaaatgttattcccaaaaataaatttggtaaacttaaaacaaacaca 31598449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Original strand, 38528764 - 38529012
Alignment:
Q  87 tatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||| |||| |||||||    
T  38528764 tatatgcttatgtttgttacaagtttactagattttattcttgggtataaaatgttattgggaatagaataaatat-caaagaaaaa-ggtgagaataaa 38528861  T
Q  187 gttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattt 285  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||| ||   ||  || | ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||| | |||||||||||  |||    
T  38528862 gttctcatgaagatgagaataaatttatgtgta-attgcatattataatccctatttttaaagtttctcagaatattataatgttaaccaaacat-tttt 38528959  T
Q  286 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttatt 338  Q
    |  |||||   ||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38528960 ttttaaataagttgaaataaaatttacatttttatattccaagaaatgttatt 38529012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 281
Target Start/End: Original strand, 43569773 - 43569936
Alignment:
Q  118 attttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||  || |||||||||||    
T  43569773 attttattcccgggtataaaatattcttcgaaatataaaaatttacctaagaaaaagggtgggaataaaattcacatgaggatgtaaataaattcataaa 43569872  T
Q  218 tagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata 281  Q
    ||  |||  |||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  43569873 ta-attatctattataatccctatttttatgatttctaaaaatattataaagttaatcaaacata 43569936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 159
Target Start/End: Original strand, 10902688 - 10902779
Alignment:
Q  68 aaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 159  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  10902688 aaataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatttttggatataaaatgtttttgggaatagaaaaaa 10902779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 381
Target Start/End: Original strand, 16916182 - 16916237
Alignment:
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16916182 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 16916237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Original strand, 47246071 - 47246366
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgata--ggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtat 134  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||   ||||||||||||||  | ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  47246071 tttgtttcaaattatatttgtagattcttagaaataaaatgatatagaaatatatatttctatgtttgttacaagtttactgaattttattctcaggtat 47246170  T
Q  135 aaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataa 234  Q
    ||||||||| | ||||| |||    |||   ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||   ||   ||  ||||||||    
T  47246171 aaaatgttcttaggaattgaattttttttaaaag-aaaagggtgagaataaagttcccatgaatatgagaataaattcatgtgtaaactatctattataa 47246269  T
Q  235 tccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacat-aattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaat 332  Q
    |||||||||||| |||  |||||| || ||||| | | |||||||||   |||| |||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  47246270 tccctatttttaaggt--ctaggagtattataatgttgaccaaacatctttttttctaaatacttttgaataaaattcacat-tttatattccaaagaat 47246366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45723277 - 45723211
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctat 97  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45723277 ggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgagaataaaatgataggaatatatatgcctat 45723211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31598741 - 31598623
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |  | |||||| | |||||||| ||||| |||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  31598741 tttgtttcaagttatattcatagattcctgaaaataaaacgatagaaatacaaatgcttatatttgttacaagtttactaaattttattacaaggtataa 31598642  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaa 156  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  31598641 aacgttcct-ggaatagaaa 31598623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30871220 - 30871130
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 159  Q
    ||||||||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  30871220 aataaaatgatagaaatatacatttttatgtttgttacaagtttattaagttttattttcggatatcaaatgtttgtgggaatagaaaaaa 30871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Original strand, 10902820 - 10902971
Alignment:
Q  178 gggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaa 276  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||   ||   | | |||||| || | |||||||| |||||| | |||||| |||| | |||||||    
T  10902820 gggaataaagttcacatgaagatgagaataaattcatgtgtaaactgcctattatgattcatatttttaaggttccaatgaatattataatgttaaccaa 10902919  T
Q  277 acataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  10902920 acatctttttcataaataccttgggctaaaattcacatctttatatcccaag 10902971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Original strand, 31921747 - 31921813
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgccta 96  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31921747 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttcatttc-ggaaataaaatgatagaaatatatatgccta 31921813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40212655 - 40212626
Alignment:
Q  349 aatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40212655 aatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 40212626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20601353 - 20601297
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| || |||| |||||||||||    
T  20601353 aataaaatgataggaatgtacattctaatgtttgttataaatttattaaattttatt 20601297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 201999 - 201646
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  201999 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattt 201900  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||     
T  201899 ccgggtataaaatattcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacc 201800  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  201799 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattcccatctttatattcca 201700  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201699 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 201646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 143677 - 143342
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  143677 tttgtttcaagttaaatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatatatatgtatacgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataa 143578  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  143577 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcatatgtag-ttacctattataatc 143479  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaat-aaaattcccatctttatattccaaggaatgt 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  143478 cctaattttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttccaaataccttgaaataaaaattctcatctttatattccaaggaatgt 143379  T
Q  335 tattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaac 371  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  143378 tattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 143342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 119352 - 119051
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    |||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||     
T  119352 aatacaatgatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcatgagtataaaatgttcctgggaatagaaaattttttccaaa 119253  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaa 267  Q
     |||||||||| |||||||||  || | ||||| ||| ||| ||||   ||   ||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||      
T  119252 gaaaagggtggaaataaagttttcaggcagatgagaataaa-tcatgtgta-actacctattataatccctattcttaaggttccggggaatattatagt 119155  T
Q  268 gctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaac 367  Q
    | | ||||||||   |||| ||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |    
T  119154 gttcaccaaacaccttttttctaaatatc-tgaaataaaattcacatctttatattccaatgaatgttatttttaagaataaatttggtaaacttaaagc 119056  T
Q  368 aaaca 372  Q
    |||||    
T  119055 aaaca 119051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 27 - 381
Target Start/End: Original strand, 22935909 - 22936264
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22935909 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattc 22936008  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  22936009 ccaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 22936108  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22936109 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 22936208  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22936209 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 22936264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 4765559 - 4765909
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4765559 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaattttattccc 4765658  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4765659 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 4765758  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4765759 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattccaa 4765858  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4765859 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 4765909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 28 - 374
Target Start/End: Original strand, 19065503 - 19065850
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19065503 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatttc 19065602  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19065603 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 19065702  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19065703 attataatccctatatttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatattttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 19065802  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19065803 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacaca 19065850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28602630 - 28602272
Alignment:
Q  26 attagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28602630 attagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 28602531  T
Q  126 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 225  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28602530 cccgg-tataaaatgtttctgagaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttac 28602432  T
Q  226 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 324  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28602431 ctattataatccctatttgtatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattc 28602332  T
Q  325 caaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtat 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28602331 caaggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagtat 28602272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 29543014 - 29543364
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29543014 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctgggaataaaatgattggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 29543113  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29543114 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttaccta 29543213  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29543214 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 29543313  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29543314 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 29543364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18412281 - 18411931
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18412281 agggtgtgtttgtttcaagttataattattgattcctgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 18412182  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18412181 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaaaggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttaccta 18412082  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18412081 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 18411982  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18411981 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 18411931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 51 - 374
Target Start/End: Original strand, 8646412 - 8646735
Alignment:
Q  51 taattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaa 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8646412 taattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggttataaaatgttcctgggaa 8646511  T
Q  151 tagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggt 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8646512 tagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctatttttatggt 8646611  T
Q  251 tcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  8646612 tcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaa 8646711  T
Q  351 tttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  8646712 tttagtaaacttgaaacaaacaca 8646735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 37 - 375
Target Start/End: Original strand, 11855662 - 11856001
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11855662 tttgtttcaagttataattgttgattcctgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggatataa 11855761  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11855762 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatc 11855861  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11855862 cctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgtt 11855961  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11855962 attcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 11856001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 12970529 - 12970879
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12970529 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 12970628  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12970629 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcttaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 12970728  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12970729 ttacaatccctatttttatggttcctatgaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 12970828  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12970829 ggaatgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 12970879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Original strand, 555705 - 556053
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  555705 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 555804  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  555805 tggtataaaatgttccagggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagtttccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 555904  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  555905 ttataatccctaatttgatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 556004  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  556005 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 556053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 14206820 - 14207170
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14206820 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 14206919  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14206920 tggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 14207019  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14207020 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttatattccaa 14207119  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14207120 tgaatgttattcctaggaataaattttgtaaacttgaaacaaacacaccct 14207170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27481429 - 27481082
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27481429 agggtgtgtttgtttcaagttataatttttgatttttggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 27481330  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27481329 gggtataaaatattcctgagaataaaaaatatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaattcataaatagtttacata 27481230  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27481229 ttataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaa 27481130  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27481129 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 27481082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 37 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6091779 - 6091435
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  6091779 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatataaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataa 6091680  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  6091679 aatgttcttgggaatagaaaaattttcccaaggaaaagagtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatt 6091580  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6091579 cctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgtt 6091480  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6091479 attcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 6091435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8406958 - 8406616
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8406958 tttgtttcaagttataattgttgattttcgagaataaaatgataggaatgtacatgcctatatttgttacaagtttgctaaattttattcccgggtataa 8406859  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8406858 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttttcctattataatc 8406759  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8406758 cctatttttttggttccttggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 8406659  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8406658 attcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 8406616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 32 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32536006 - 32535658
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||    
T  32536006 gtgtgtttgttttaagttataattgttgattcccaggaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttatttcttgg 32535907  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32535906 tataaaatgttattgggaatagaaaaaatttcctaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctatta 32535807  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagga 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32535806 taacccctatttttatggttcctgagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggattaaaattcccatctttatattccaagga 32535707  T
Q  331 atgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctt 379  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32535706 atgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctt 32535658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36703945 - 36703654
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  36703945 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattatcgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcctt 36703846  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  36703845 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctat 36703746  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36703745 tataatccctattttgatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattctcatctttat 36703654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27481041 - 27480735
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  27481041 aataaaatgataggaatatgtatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcctgtgtataaaatgttcatgggaatagaaaattttttccaag 27480942  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaa 267  Q
     |||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  27480941 gaaaa-ggtgagaataaagtttccatggagatgagaataaattcataaatag-ctacctattataatttctatttttatggttcatagaaatattataaa 27480844  T
Q  268 gctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaac 367  Q
    | ||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  27480843 gttaaccaagcatattttttctaaataccttgaaataaaattctcatctttatatttcaagaaatattattcctaaaaataaatttggtaaacttaaaat 27480744  T
Q  368 aaacacacc 376  Q
    |||||||||    
T  27480743 aaacacacc 27480735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Original strand, 42012176 - 42012530
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42012176 ttagggtgtgtttgtttgaagctatatttgttgattctcgggaataaaatgatagaaatacatatgtctatgtttgttacaaatttactaaattttattc 42012275  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| || |||| ||||     
T  42012276 tcgagtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttccgaaggaaaagggtgggaataaagttcacatggagatcagaataaattcttatatag-ttacc 42012374  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaacca----aa--cataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| || || | |    ||  |||| |||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||     
T  42012375 tattataatccatatttttatggttccaaggagtattatatagttacctattataatccatattttttccaaataccttagaacaaaattcccatctttt 42012474  T
Q  320 tattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42012475 tattccaaaaaatgttattcctaaaaataaatttagtaaacttgaaacaaacacac 42012530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 77 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1664754 - 1664456
Alignment:
Q  77 gataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaaggg 176  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  ||| |||    
T  1664754 gatagaaatctatatgcttatgtttgttacaaattgactaaattttattaccagctataaaatgttcctgagaatagaaattttttcccaaagaaacggg 1664655  T
Q  177 tgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaacca 275  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  1664654 tgggaattaaattcccatggagatgagaataaatttatatgtagtt-acctattataatccctatttttatggttcataagaatattataaagttaacca 1664556  T
Q  276 aacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1664555 aacatattttttctaaataccttgaaataaaattctcatctttatatttcaagaaatattattctcaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 1664456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6930720 - 6930362
Alignment:
Q  25 cattagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatat----gcctatgtttgttacaagtttactaaatt 120  Q
    ||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||    |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6930720 cattaaggtgtgtttatttcaagttatatttgttgattcctgagaataaaatgatagaaatatatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaatt 6930621  T
Q  121 ttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 220  Q
    |||||  ||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||  |||    
T  6930620 ttattttcggatataaaatattattgggaatagaaaaa-tttcccaaagaaaattgtgggaataaagttcccatgaagatggaaataaatttatatctag 6930522  T
Q  221 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 319  Q
    ||  || ||||||||| |||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| |||||| |    
T  6930521 ttatct-attataatctctatctgtaaggtttctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttttaaataccttaaaataaaattctcatcttga 6930423  T
Q  320 tattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6930422 tatttcaaggaatgttattcatatgaataaatttgataaacttaaaacaaacacaccctta 6930362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20962659 - 20962373
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccggg 131  Q
    |||| ||||||| |||||||| | || |||||  || |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20962659 gtgtgtttgtttcaagttatattcgtagattcttgggaataaaatgataggaatacacgtgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgga 20962560  T
Q  132 tataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatta 231  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| || | || ||| | |||||    
T  20962559 tataaaacgtttctgggaatagaaaatttttcccaaggaaaagggtgggagtaaagttctcatggagatgagaataaattaatgagtaattt-cctatta 20962461  T
Q  232 taatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttt 318  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| | ||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20962460 taattcctatttttatggttcccagaaatattataatgttaagcaaacatattttttttaaatgccttggaataaaattcccatcttt 20962373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Original strand, 43346895 - 43347243
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||  |||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43346895 gggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagattcctgaaaataaaatcataaaaatacatatgtatgtgtttgttacaagtttactaaattttattccca 43346994  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||   ||  |||| |||    
T  43346995 ggtataaattgtttctggcaatagaaaagtttttccaatgaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaaattatgcgta-attacctat 43347093  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| || |  | ||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  43347094 tttaatccctatttttaaggttccttcgaatattacattgttaaccaaactttttttttctaaataccttagaataaacttctcatctttatattccaat 43347193  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
     |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43347194 aaatgttattcctaagaataaatttcgaaaacttgaaacaaacacaccct 43347243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 226 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36703657 - 36703506
Alignment:
Q  226 ttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  36703657 ttattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttaaattc 36703558  T
Q  325 caaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36703557 caaggaatgttattcctatgaataaatttggtaaatttgaaacaaacacacc 36703506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17251844 - 17251533
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    ||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  17251844 aataaaatgatagaaatatacatgtttatgtttgttataattttactaaattttattctcgagtataaaatgttcatgataatagaaaaaatttcccaaa 17251745  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaa- 267  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||   ||  | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||     
T  17251744 gaaaatgatgggaataaagtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgtaact-atatattataatccctatttttatggttc-taggaatattaaaat 17251647  T
Q  268 gctaaccaaacataattttc-ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaa 366  Q
    | |||||||||||  ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||    
T  17251646 gttaaccaaacatctttttatctaaataccttggaaaaaaattcctatccttatattccaagaaatgttatt-gtaggaataaatttggtaaatttgaaa 17251548  T
Q  367 caaacacacccttag 381  Q
    |||||||||||||||    
T  17251547 caaacacacccttag 17251533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 227 - 378
Target Start/End: Original strand, 26637217 - 26637370
Alignment:
Q  227 tattataatccctattttt-atggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattc 324  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26637217 tattataatccatattttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacacattttttctaaataccttggaataaaattcccatctttatattc 26637316  T
Q  325 caaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26637317 caaggaatgttattcctaaaaataaatttgataaacttgaaataaacacaccct 26637370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 374
Target Start/End: Original strand, 31583099 - 31583404
Alignment:
Q  66 ggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc 165  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  31583099 ggaaataaaacgatagaaatatat-tgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgagtataaaacgttcccaggaatagaaaaaattttcc 31583197  T
Q  166 aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tat 264  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||    
T  31583198 aaagaaaaaggtgggaataaagttcccacaaagat-ggaaataattcatatgta-agtacctattataatccctatttttacggttcctgagaatattat 31583295  T
Q  265 aaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttga 364  Q
    || | ||| | || ||  |||| ||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |    
T  31583296 aatgttaaaccaatat-ttttttctaaatatcttgaaataatatttccatctttatgtttcaaagaatgttattcgtagaaataaatttagtaaacttaa 31583394  T
Q  365 aacaaacaca 374  Q
    ||||||||||    
T  31583395 aacaaacaca 31583404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 362
Target Start/End: Original strand, 35348545 - 35348858
Alignment:
Q  48 ttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgg 147  Q
    ||||||| || ||||  ||| ||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||    
T  35348545 ttataatcgtagattttcgggaataaaaagatag-aatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattgtatttt-gggtataaaatgtttttgg 35348642  T
Q  148 gaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttat 247  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||  |||| ||||||||| | |||||||||    
T  35348643 gaatagaaaat-tttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataaattcacatgta-attacctattataattcatatttttat 35348740  T
Q  248 ggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca--taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaag 344  Q
    ||||||  |||||| ||||| | |||  |||||  |  |||| ||  || ||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  35348741 ggttcccgggaatattataatgttaaaaaaacattttttttttctgtataccttaaaataaaattctcatctttatgttccaatgaatgttattcttaag 35348840  T
Q  345 aattaatttggtaaactt 362  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  35348841 aataaatttgataaactt 35348858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 40275751 - 40275930
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgtttt-aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||   || |||||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40275751 ttagggtgtgttttttttcaagttatatttgtagatttttgggaataaaattataaaaatacatatgtctatgtttgttacaagtttgctaaattttatt 40275850  T
Q  126 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaa 205  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40275851 cccagatatgaaatattcctgggaatagaaaagttttcccaaagaaaatgatgggaataaagttcccatgaagatgggaa 40275930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28429531 - 28429450
Alignment:
Q  297 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28429531 ttggaataaaattcacatctttatatttcaaggaatgttatttctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 28429450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 19089724 - 19089889
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||| || |||||||  |||| ||| |  |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||    
T  19089724 tttgttttaagttatattcgtaaattcctgggaataaaaaaatagaaatatgcatgtttatgtttgttataagtttattaaattttattcttgagtataa 19089823  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgg 202  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  19089824 aacgtttttgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatgatgggtataaagttctcatgaagatgg 19089889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30899583 - 30899470
Alignment:
Q  73 aaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaa 172  Q
    ||||||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  30899583 aaatgatattaatatacatgcttatgtatgttacaagttttctaaattttattcctggatataaaatattcttgggaatagaaacaattttccaaagaaa 30899484  T
Q  173 agggtgggaataaa 186  Q
    |||||| |||||||    
T  30899483 agggtgagaataaa 30899470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Original strand, 16720957 - 16721029
Alignment:
Q  300 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16720957 gaataaaattcacatttttatattccaatgaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaaca 16721029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 380
Target Start/End: Original strand, 35602968 - 35603124
Alignment:
Q  222 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaa-gctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 320  Q
    |||| |||||||  || |||||||| ||||||| |||||||  ||| | |||||||||||  ||||  ||||| | || |||||||||| | ||||||||    
T  35602968 ttacctattatataccatatttttaaggttccttggaatattaaaatgttaaccaaacattttttt--taaatactttagaataaaatttctatctttat 35603065  T
Q  321 attccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35603066 attccaaaaaatgttattcctaa-aaataatttggtacacttgaaccaaacacaccctta 35603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 214
Target Start/End: Original strand, 41783685 - 41783805
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa-tttcccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||   | | |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41783685 tatgtttgttataagtttactaaattttattctcggatataaaatgtttctgaaaatagaaaaaagaattcaaagaaaaaggttgggaataaagtttcca 41783784  T
Q  194 tggagatgggaaaaaattcat 214  Q
    |  ||||| ||| ||||||||    
T  41783785 taaagatgtgaacaaattcat 41783805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 127
Target Start/End: Original strand, 26637045 - 26637140
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26637045 gtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattaatgggaataaaatgatagaattatatatgtctatatttgttacaagtttactaaattttattcc 26637140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28429735 - 28429664
Alignment:
Q  67 gaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaa 138  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28429735 gaaataaaatgatagaaatatacatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattcccgaatataaaa 28429664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20962356 - 20962286
Alignment:
Q  304 aaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  20962356 aaaatttccatctttatgttccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttaaaacaaacaca 20962286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Original strand, 15200584 - 15200704
Alignment:
Q  68 aaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa 167  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||    
T  15200584 aaataaaatgatataaatatatatgtctatgtttgttataaatttattaaattttattctcaggcataaaatgtttctggg-atagaaaaaattcccaaa 15200682  T
Q  168 gaaaaagggtgggaataaagttcc 191  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||    
T  15200683 gaaca--ggtgggaataaaattcc 15200704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 376
Target Start/End: Original strand, 40276524 - 40276587
Alignment:
Q  312 catctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40276524 catctttatattc-aaggaatgttattaccaagaataaatttagtaaacttgaaacaaacacacc 40276587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28023840 - 28023745
Alignment:
Q  94 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagtt 189  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  28023840 ctatatttgttacaagttcattaaattttattctcacatataaaatgtgtttgggaatagaaaaaatttctcaaacaaaagggtgagaataaagtt 28023745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 16720255 - 16720356
Alignment:
Q  73 aaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaa 172  Q
    ||||||||| ||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||| ||||    
T  16720255 aaatgatagaaatatacatacatatgtttgttgcaagtttactaaattttattatcgggtataaaatatt-tttggaatagaacaattttcccaaaaaaa 16720353  T
Q  173 agg 175  Q
    |||    
T  16720354 agg 16720356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30899463 - 30899327
Alignment:
Q  239 tatttttatggttcctaggaatata-taaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttat 337  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  30899463 tatttttaaggttcgtgagaatataataaagttaaccaaacatcttttttctaaatacattg-aataaatttctcatctttatatttcaaaaaatgttat 30899365  T
Q  338 tcct-aagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    | || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30899364 ttcttaacaataaattttgtaaacttgaaacaaacaca 30899327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Original strand, 36978405 - 36978478
Alignment:
Q  301 aataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacaca 374  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  36978405 aataaaattctcatatttatattctaaagaatgttattcctataaataaatttaataaacttgaaacaaacaca 36978478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 128
Target Start/End: Original strand, 36978209 - 36978269
Alignment:
Q  68 aaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  36978209 aaataaaatgatagaaatatatatgtctatgtttgttacaaacttacaaaattttattccc 36978269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27901760 - 27901697
Alignment:
Q  299 ggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaactt 362  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  27901760 ggaataaaattcatatctttatattctaaagaatgttgttcttaagaataaattttgtaaactt 27901697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 142
Target Start/End: Original strand, 35602876 - 35602935
Alignment:
Q  83 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgtt 142  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  35602876 aatgcatatgcatatatttgttacaagtttattaaattttatttccgaggataaaatgtt 35602935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Original strand, 3913239 - 3913327
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaa 159  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  3913239 aataaaacgatagaaatatacatgtgtatgtttattacaaatttactaaattttatt-ccaggtataaaatgtt-ttaggaatagaaaaaa 3913327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 374
Target Start/End: Original strand, 19089915 - 19090016
Alignment:
Q  274 caaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa-tgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  19089915 caaatatattttttctatataccttggaatagaattctcatctttatgttctaagaaaatattattcttaaaaataaatttggtaaatttgaatcaaaca 19090014  T
Q  373 ca 374  Q
    ||    
T  19090015 ca 19090016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 125
Target Start/End: Original strand, 830059 - 830115
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  830059 aataaaaagatatcaatatatatgaatatgtttgttacaagtttattaaattttatt 830115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 377
Target Start/End: Original strand, 27079220 - 27079308
Alignment:
Q  289 taaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||   | | ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  27079220 taaataccttagaataaaatttccatctttatgttcaaatgaatgctattccttcaactaaatttggtaaaccggaaagaaacacaccc 27079308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Original strand, 13229989 - 13230338
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13229989 gggtgtgtttgtttcaagttataattttttattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 13230088  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13230089 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 13230188  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230189 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 13230288  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230289 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 13230338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 55967998 - 55968353
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55967998 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgtctctgtttgttacaagtttactaaattttattcc 55968097  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  55968098 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccatgaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacct 55968197  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55968198 attataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 55968297  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55968298 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 55968353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 30 - 376
Target Start/End: Original strand, 27762899 - 27763246
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27762899 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 27762998  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27762999 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaatatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 27763098  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27763099 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaag 27763198  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27763199 gaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 27763246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35999762 - 35999412
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35999762 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 35999663  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  35999662 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 35999563  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35999562 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 35999463  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35999462 ggaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacaaaccct 35999412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45596346 - 45595992
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45596346 ttagggtgcgtttgtttcaagttataattgttgattttcgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 45596247  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  45596246 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgggaataaattcataaatagtttacc 45596147  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45596146 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 45596047  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45596046 aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 45595992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 371
Target Start/End: Original strand, 48518891 - 48519233
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48518891 gggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccca 48518990  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  48518991 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctat 48519090  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48519091 tataatacctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcacatctttatattccaag 48519190  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaac 371  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48519191 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 48519233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48879401 - 48879051
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  48879401 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 48879302  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  48879301 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 48879202  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48879201 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctacattccttggaataatattcccatctttatattccaa 48879102  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48879101 ggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 48879051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 27 - 378
Target Start/End: Original strand, 39730290 - 39730642
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39730290 ttagggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 39730389  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39730390 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcacatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 39730489  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39730490 tattataatccctattttcatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattcc 39730589  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39730590 aaggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 39730642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 27 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42774026 - 42773670
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42774026 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttctgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 42773927  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  42773926 ccgggtataaaatgttcctggggataaaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 42773827  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42773826 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatactcc 42773727  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42773726 aaggaatgttatttctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacgcccttagt 42773670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 28 - 378
Target Start/End: Original strand, 45747794 - 45748144
Alignment:
Q  28 tagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45747794 tagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcc 45747893  T
Q  128 cgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  45747894 cgggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggggggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttac-c 45747992  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45747993 attataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 45748092  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45748093 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 45748144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43723342 - 43722988
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43723342 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgaaaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 43723243  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  43723242 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 43723143  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723142 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcccatctttatattcc 43723043  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723042 aaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 43722988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40435976 - 40435628
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40435976 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 40435877  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  40435876 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatagagatgggaataaattcataaatagtttaccta 40435777  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435776 ttataatctctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 40435677  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435676 ggaatgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 40435628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 6279920 - 6280270
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6279920 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatatgaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 6280019  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6280020 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 6280119  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6280120 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaatatatttttcataaattccttggaataaaattcctatttttatattccaa 6280219  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6280220 ggaatgttattcctatgaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 6280270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25932519 - 25932165
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25932519 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctaggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 25932420  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  25932419 cttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 25932320  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25932319 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttc 25932220  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25932219 aaggaatgttattcctaggaataaatttgggaaacttgaaacaaacacaccctta 25932165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 41859044 - 41859397
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41859044 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattc 41859143  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  41859144 ccaggtataaaatgttcctgggaatag-aaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacc 41859242  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41859243 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgaaataaaattctcatctttatattcc 41859342  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41859343 aaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 41859397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 936204 - 935849
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936204 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaatgattggaatatatatccctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 936105  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  936104 ccgggcataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcacaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagtttacc 936005  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  936004 tattataatccctatttttatagttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattctttggaataaaattcctatctttatattcc 935905  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  935904 aagaaatgttattcttaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 935849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23686863 - 23686513
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23686863 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 23686764  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23686763 tggtataaaatatttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 23686664  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23686663 ttataattcatatttttatggttcctaggaatattataaaactaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatttcaa 23686564  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23686563 ggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 23686513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 31 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47670436 - 47670084
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  47670436 ggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcctggaaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttg 47670337  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  47670336 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtggaaataaagtttccatgaagatgagaataaattcataaatagtttacctatt 47670237  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47670236 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagataaccaaatatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 47670137  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47670136 aatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 47670084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Original strand, 18405231 - 18405584
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18405231 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgagaataaaattatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 18405330  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  18405331 cttggtataaaatgttcctgggaataaaaaaaatttcc-aaggaaaagggtgagaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacc 18405429  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  18405430 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattcctgagaataaaatttccatctttatattcc 18405529  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18405530 aaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 18405584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Original strand, 34049597 - 34049904
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34049597 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattccag 34049696  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  34049697 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagttttcctat 34049796  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34049797 tataatccctatttttatggttccttggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 34049896  T
Q  329 gaatgtta 336  Q
    ||||||||    
T  34049897 gaatgtta 34049904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 370
Target Start/End: Original strand, 50672907 - 50673245
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50672907 agggtgtgtttgttttaagtta--attgttgattccgggaa-taaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctc 50673003  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  50673004 gggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 50673103  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  50673104 ttataatcccta-ttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatatttcaa 50673202  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  50673203 ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaa 50673245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 39835306 - 39835656
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39835306 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatataaatgtatatgcatatgtttgttacaagtttactaaaatttattcct 39835405  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39835406 tggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagattagaataaattcataaatagtttaccta 39835505  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39835506 ttataatccttatttttatgatttctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 39835605  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39835606 ggaatgttattcatagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 39835656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27555488 - 27555151
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27555488 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattctcgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 27555389  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
     |||||||||||                |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  27555388 gcgggtataaaa----------------aaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataatttacc 27555305  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27555304 tattataatccctatttttatggttcctaggaatatataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 27555205  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27555204 aggaatgttattcctaggaataaatttagtaaacttgaaacaaacacaccctta 27555151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 376
Target Start/End: Original strand, 41744222 - 41744568
Alignment:
Q  32 gtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg-g 130  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |    
T  41744222 gtgtgtttatttcaagttataattgttgatttccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttatttctttg 41744321  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41744322 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataattagtttacctatt 41744421  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  41744422 ataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaatg 41744521  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744522 aatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 41744568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18931835 - 18931482
Alignment:
Q  23 aacattagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaatttt 122  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18931835 aacattagagtgtgtttgtttcaagttataattgttgatttctgggaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttggtataagtttactaaatttt 18931736  T
Q  123 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  18931735 attcccgtgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaaatttccaagaaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaatttataaataatt 18931636  T
Q  223 tacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttata 321  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18931635 ttcctattataatccctatttttatagttcataggaatattataaagctaaccaaacatatttttcttaaattccttggaataaaatttctatctttata 18931536  T
Q  322 ttccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18931535 ttccaaggaatgttattcctaagaataaatttgataaacttaaaacaaacacac 18931482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 45 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8322305 - 8321971
Alignment:
Q  45 aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 144  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||     
T  8322305 aagttataattgttgattcctgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatattct 8322206  T
Q  145 tgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttt 244  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8322205 tgggaatagaaaaaaatttccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaataatttacctattataatccctatttt 8322106  T
Q  245 tatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaa 343  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8322105 tatggttcctatgaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttgtaataaaattctcatctttatattccaaagaatgttattcctaa 8322006  T
Q  344 gaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322005 aaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 8321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32953598 - 32953249
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32953598 gggtgtgtttgtctcaagttataattgttgattcccaggaacaaaatgataggaatgtatatgcctatctttgttacaagtttactaaattttattctcg 32953499  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  32953498 ggtataaaatgttcctaggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttctcatggagatgggaataaattcataaatagttttcctat 32953399  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32953398 tataatccctatttttatggttccttgaaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaat 32953299  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||| ||||| |||  ||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  32953298 gaatattatttctagaaataaattagataaacttgaaacaaacataccct 32953249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 37 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27942811 - 27942465
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgt------tacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |      || ||||||||||||||||||||||||    
T  27942811 tttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgtctatgtttatgtttattataagtttactaaattttattcccgg 27942712  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  27942711 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccattgaaatgagaataaattcataaataatttacctatt 27942612  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaagg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |      
T  27942611 ataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttgaaataaaattctcatatttatattcctaaa 27942512  T
Q  330 aatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942511 aatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 27942465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39498903 - 39498590
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39498903 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 39498804  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39498803 cttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaagggtggaaataaagttctcatagagatgggaataaattcataaatagtttacc 39498704  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39498703 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaatatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattcc 39498604  T
Q  326 aaggaatgttattc 339  Q
    ||||||||||||||    
T  39498603 aaggaatgttattc 39498590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39502242 - 39501929
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39502242 ttagggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaaatgatagaaatgtatatgtttatgtttgttacaagtttactaaaatttattc 39502143  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39502142 cttggtataaaatgttcatgggaatagaaaaaaaattccaaggaaaagggtggaaataaagttctcatagagatgggaataaattcataaatagtttacc 39502043  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39502042 tattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaatatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatctttatattcc 39501943  T
Q  326 aaggaatgttattc 339  Q
    ||||||||||||||    
T  39501942 aaggaatgttattc 39501929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 34238007 - 34238295
Alignment:
Q  83 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34238007 aatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcttgggaatagaaacaatttcccaaggaaaagggtgggaa 34238106  T
Q  183 taaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34238107 taaagttcccatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattataatccctattttttttgttcctaggaatattataaagctaaccaaacata 34238206  T
Q  282 attttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  34238207 tttttcttaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaggaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaa 34238295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 291
Target Start/End: Original strand, 25916034 - 25916295
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25916034 agggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatgtat--gcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 25916131  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25916132 gggtataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttaccta 25916231  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  25916232 ttataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaatcaaacatattttttctaa 25916295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 148 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48873978 - 48873747
Alignment:
Q  148 gaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttat 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48873978 gaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctatttttat 48873879  T
Q  248 ggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaa 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48873878 ggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctacattccttggaataatattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaa 48873779  T
Q  347 ttaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48873778 taaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 48873747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 377
Target Start/End: Original strand, 31937870 - 31938217
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   | ||||||||| |||  ||  || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||      
T  31937870 ggtgtgtttgtttcaagttataattgtagatttttgaaaataaaatcataaaaacatacatgcatatgtttgttagaagtttattaaattttattcccaa 31937969  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag-aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || |||    
T  31937970 atataaaatgttcttgggaataaaaaaaattttccaaggaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataaattcataaacagtt-acctat 31938068  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  31938069 tataatccttatttttatggttcctaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaataccttggaataaaattttcatctttaaattccaag 31938168  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31938169 gaatgttattcctatgaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccc 31938217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7258998 - 7258691
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaag 168  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7258998 aataaaatgatag-aatatacatgtctttgtttgttacaagtttactaaattttatttccgcgtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccaaaa 7258900  T
Q  169 aaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaa 267  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||   ||   ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| || ||     
T  7258899 gaaaagagtgggaataaagttcccatgaatatgggaataaattcatttgta-actacttattatagtcctaatttttatggttccttggaatattaaaat 7258801  T
Q  268 gctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaac 367  Q
    | |||||||||||  |||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  7258800 gttaaccaaacatcttttattcaaataccttggaataaaattcccatatttatattccaaggaatgttattcctgagaataaatttgataaacttgaaac 7258701  T
Q  368 aaacacaccc 377  Q
    ||||||||||    
T  7258700 aaacacaccc 7258691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51968853 - 51968505
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | ||  ||| | || ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  51968853 agggtgtgtttgtttcaagttatattcgtaaatttctgggaataaaaagatagaaatatgcatgcctatgtttgttacaagtttgctaaattttattctt 51968754  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||  ||  ||||      
T  51968753 gagtataaaacgttcctgggaatagaaaatgtttcccaaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatggaaataatttcatatgta-attac-- 51968657  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcca 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | ||| |||||||  |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||  | | |    
T  51968656 attataatccttatttttatggttctcagaaatattataatgttaaacaaacatcttttttctatataccttggaataaaattctcatctttacgtacga 51968557  T
Q  327 aggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51968556 aggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 51968505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52469735 - 52469427
Alignment:
Q  68 aaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa 167  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||   ||| ||||    
T  52469735 aaataaaatgatagaattgcatatgtctatgtttgttacaagtttattaaattttatttccggcaataaaatgtttctaggaatagaaatttttttccaa 52469636  T
Q  168 gaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataa 266  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  52469635 ggaaattggtgggaataaagttcccatggagatggaaataaattccaatatag-ttacctattataatctctatatttatggttcataggaatattataa 52469537  T
Q  267 agctaaccaaacat-aattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc-aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttga 364  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||   |||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |    
T  52469536 agctaaccaaacatgtttttttctaaatattttggtataaaatttcaatctttatattccaaaggaatgttattcctaagaataaatttgattaacttaa 52469437  T
Q  365 aacaaacaca 374  Q
    ||||||||||    
T  52469436 aacaaacaca 52469427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30415978 - 30415746
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30415978 agggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcccgataataaaatgataggaatatatatgtctgtgtttgttacaagtttactaaattttattccc 30415879  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
       |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||  |||||  || || ||||||||||  |||| ||    
T  30415878 aaatataaaatgttctttggaatagaaaaaatttcccaaagaaaatggtgggaataaaatttccataaagatgaaaataatttcataaata-attaccta 30415780  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30415779 ttataatccctatttttatggttcctaagaatat 30415746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38414278 - 38414032
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |    
T  38414278 ggtgtgtttgtctaaagttatatttgttgattc--gggaataaaatgatagaaatatacatgtctatgtttgtaataagtttactaaattttattccatg 38414181  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttatt 230  Q
     ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| |||| ||||    
T  38414180 -tataaaatgtttccgggaatataaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttctcatggagatggtaataaattcatatgtag-ttacctatt 38414083  T
Q  231 ataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  38414082 ataattcctatttttatggtttctaagaatattataaagttacccaaacat 38414032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 377
Target Start/End: Original strand, 47426279 - 47426567
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgt-atatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa 167  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||    
T  47426279 aataaaatgatatgaatattatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttatttcttgatataaaatgttcctggaaatagaaaaatattatcaa 47426378  T
Q  168 gaaaaa-gggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ata 265  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||||||       ||||||||||||||| |||    
T  47426379 gaaaaaagggtggcaataaagttcccatgaagatgaaaataaattcataaatagtt-acctattataatcccta-------ggttcctaggaatattata 47426470  T
Q  266 aagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaa 365  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||               ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  47426471 aagttaaccaaatatattttttctaaatacctttgaataaaattcccatc---------------atgttattcctaaaaataaatttggtaaacttgaa 47426555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36858351 - 36858135
Alignment:
Q  160 tttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaa 259  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36858351 tttcccaaagaaaagggtgggaataaaattctcatggagatgggaataaattcatatatag-ttacctgttataatccttatttttatggttcctaggaa 36858253  T
Q  260 ta-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaa 358  Q
    || || |||| || ||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||    
T  36858252 tattacaaagttatccaaacatatttttcttaaatacctt-gaatgaaattcccatctgtgtattacaaggaatgttattcttaagaataaattttataa 36858154  T
Q  359 acttgaaacaaacacaccc 377  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  36858153 acttgtaacaagcacaccc 36858135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38394942 - 38394634
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaa- 167  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||| |||||| |||||||     
T  38394942 aataaaacgatgggaatatacatgcttatgtttgttacaagtttactaaattttattcctag-tataaaatatttctggaaatataaaaaaattcccaaa 38394844  T
Q  168 gaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataa 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||| || |||||||| | || ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  38394843 gaaaaggggtgggaataaagttctgatagagatggaaataaattcatgagtaatttcct-attataattcctatttttatggttcccaaaaatattataa 38394745  T
Q  267 agctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaa 366  Q
       ||| |||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||| ||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  38394744 tattaagcaaacatcttttttctaaataccttgaaataaaattctcatatttatgttctaagaaatattagtcttagaaataaatttggtaaacttgaaa 38394645  T
Q  367 caaacacaccc 377  Q
    |||||||||||    
T  38394644 caaacacaccc 38394634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 10400812 - 10400961
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10400812 tttgtttcaagttatatttgttgatttttgggaataaaatgatagaaatgtatatgtctatgtttattacaagtttactaaattttattcttgggtataa 10400911  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaa 186  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  10400912 aatattcctggaaatagaaaaaatttcccaaagaaattggtgggaataaa 10400961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 287
Target Start/End: Original strand, 36858375 - 36858634
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||   ||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36858375 ttagggtgtgtttgtttcaagttatattcttagattcccaagaataaaaagatagaaatgcat--gcttatgtttgttacaagtttactaaattttatgc 36858472  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatag---aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagttt 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||  ||  ||    
T  36858473 ccgggtataaaatgttcctgagaatagaaaaaaaaaatt--caaataaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgagaataatttcatatgta-att 36858569  T
Q  224 acttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttc 287  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  36858570 acatattataatccctatttttatggtttccgggaatattataatgttaaacaaacatatttttc 36858634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 370
Target Start/End: Original strand, 37014451 - 37014724
Alignment:
Q  96 atgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatg 195  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||  || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  37014451 atgtttgttatgagtttattaaattttatatccaggtataacatgttcataggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagagtggaaataaagttctcatg 37014550  T
Q  196 gagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaatt 294  Q
     ||||| ||| ||||||||   || ||| |||| |||||| | |||||||| | || || | |||| ||||| | |||||||||||  |||| ||||||     
T  37014551 aagatgagaataaattcatgtgtaattt-cttactataattcttatttttaagatttct-gaaatattataatgttaaccaaacatcttttttctaaata 37014648  T
Q  295 ccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa 370  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37014649 tcttcgaataaaattcgcatctttatattccaaaaaatattattcttaggaataaattttgtaaacttgaaacaaa 37014724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18405764 - 18405597
Alignment:
Q  94 ctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttccca 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  18405764 ctatgtttgttacaagtttacaaaattttatttctaggtataaaatgttcctaggaatagaaaatttttcctaaagaaaagggtgggaataaagttctca 18405665  T
Q  194 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat 262  Q
    |  ||||||||| |||| |||   ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18405664 ttaagatgggaataaatccatgtgta-attacctattataatctctatttttatggttcctagaaatat 18405597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30790518 - 30790275
Alignment:
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||| | ||     || || |||    
T  30790518 gggtataaaatgtttctgagaatagaaaagtttttccaatgaaaaggatgggaataaagtttccatgaagatggaaataaaattat-----gtgtaatta 30790424  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||  ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30790423 ttataaattctatttttaaggttccttggaatattataatgttaaccaaacatcttttttttaaatactttggaataaatttctcatctttatattccaa 30790324  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    | ||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30790323 g-aatgttactcctagaaataaatttgctaaacttgaaacaaacacaccc 30790275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38414015 - 38413902
Alignment:
Q  265 aaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttga 364  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  38414015 aaagttaaccaaacatattttttctaaataccttggaattaaattctcatctttatattccaaggaatgttatttctaaaattaaatttggtaaacttga 38413916  T
Q  365 aacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||| ||||    
T  38413915 aacaaacacgccct 38413902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 194
Target Start/End: Original strand, 12275953 - 12276075
Alignment:
Q  72 aaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaa 171  Q
    |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||||| | |||||||| | |    
T  12275953 aaaatgatagaaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattcctggatataaaatgttcttggaaaaagaaatattttcccaaaaga 12276052  T
Q  172 aagggtgggaataaagttcccat 194  Q
    || |||||||||||| |||||||    
T  12276053 aaaggtgggaataaaattcccat 12276075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 283 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18405223 - 18405126
Alignment:
Q  283 ttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18405223 tttttctaaataccttggaataca-ttcccatctttatatttcaaggaatgttattcctaagaataaatttggcaaacttaaaacaaacacacccttag 18405126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 375
Target Start/End: Original strand, 10400973 - 10401126
Alignment:
Q  222 ttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttat 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||| ||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  10400973 ttacctattataatccttatttttatggttccgaggaatattataaa-ctaaccaaacatgttttttctatatatcttggaataaaattctcatttttat 10401071  T
Q  321 attccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    | | ||| |||||||||| | |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10401072 acttcaaagaatgttatttccagaaataaatttggtaaacttaaaacaaacacac 10401126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 300 - 377
Target Start/End: Original strand, 36860027 - 36860104
Alignment:
Q  300 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 377  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36860027 gaataaaatttccatttttatgttccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccc 36860104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Original strand, 22654516 - 22654638
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatt--tccca 166  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||| ||  ||| |    
T  22654516 aataaaatgatagaaatatacatgcctatgtttattacaagttaactaatttttattctcgggtaaaaaatgttattgcgaatagaaaaactttctccaa 22654615  T
Q  167 agaaaaagggtgggaataaagtt 189  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  22654616 aaaaaaagggtgggaataaagtt 22654638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 48060065 - 48059804
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccat 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||    
T  48060065 tatgtttgttacgagtttattaaattttatttttggatataaaatatttatgggaatagaaaaaatttcccaaataaaatggtgggaataaagttctcat 48059966  T
Q  195 ggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacata-attttcctaaa 292  Q
      | ||   || ||||||||| |||  |||| ||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| ||||||  |||  |||||||  |||| |||||    
T  48059965 aaaaatataaataaattcatatata-attacctattataattcttatttttataattcctagaaatattataaaattaattaaacatatttttttctaaa 48059867  T
Q  293 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttgg 355  Q
    | | | | |||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  48059866 tacatcgaaataaaattctcatcattatattctaaaaaatattattcgtaagaataaatttgg 48059804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44309828 - 44309670
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||| | || |||| | | |||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||    
T  44309828 tttgtttcaagttatattcgtagatttctgaaaataaaacgatagaaatatgcatgtctatgtttgttacaaggttactaaattttatt-cctagtataa 44309730  T
Q  137 aatgttcctgggaatag-aaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatg 195  Q
    || ||||  | |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44309729 aacgttctagagaatagaaaaaaatttcctaaagaaaagggtgggaataaagttcccatg 44309670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52414061 - 52413959
Alignment:
Q  270 taaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaa 369  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  52414061 taaccaaacatattttttctaattcgcttgaaataaaattcacatctttatattccaagggttgttatttctaagaataaatttggtaaatttgaagcaa 52413962  T
Q  370 aca 372  Q
    |||    
T  52413961 aca 52413959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 335
Target Start/End: Original strand, 24805150 - 24805397
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgg-gaataaagttccca 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||  |||||||||||||    
T  24805150 tatgtttgttacaaatttactaaattttattttcgggaataaaacatt-ttgggaatagaaaaaatttcacaaagaaaatggtggaaaataaagttccca 24805248  T
Q  194 tggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatt-------tttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattt 285  Q
    || | ||||||| |||| |||   ||  |||| ||||||| ||||||||       ||||||||||| || |||| ||||| | ||| |||||||  |||    
T  24805249 tgaatatgggaataaatccatgtgta-attacctattatattccctatttttatggtttatggttcccagtaatattataatgttaagcaaacatctttt 24805347  T
Q  286 tcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    | |||||| ||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24805348 ttctaaataccttaaagtaaaattcacatctttatgttccaaggaatgtt 24805397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Original strand, 9327242 - 9327342
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||   |||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9327242 ttagggtgtttttatttcaagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataagtttactaaattttatt 9327341  T
Q  126 c 126  Q
    |    
T  9327342 c 9327342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Original strand, 9374001 - 9374101
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||   |||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9374001 ttagggtgtttttatttcaagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataagtttactaaattttatt 9374100  T
Q  126 c 126  Q
    |    
T  9374101 c 9374101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 378
Target Start/End: Original strand, 25916302 - 25916362
Alignment:
Q  319 atattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaactt-gaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25916302 atattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttagaaacaaacacaccct 25916362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18094286 - 18094139
Alignment:
Q  68 aaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa---aaaatttcc 164  Q
    |||||||||||||| ||| ||  | | |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||   |||| ||||    
T  18094286 aaataaaatgatagaaatataccttcttatgtttgctagaagtttactaa-ttttattttcgggtataaaatgtttctaggaatagaaaaaaaaaattcc 18094188  T
Q  165 caagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcat 214  Q
     ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  18094187 aaag-aaaatggtgagaataaagttcccatgaagatgagaataaattcat 18094139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 90
Target Start/End: Original strand, 34237427 - 34237480
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtata 90  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34237427 tttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtata 34237480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26165442 - 26165326
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||| |  |||||||| |||  |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26165442 ttagggtgtgtttgtttcatgttatatttgtagattcctgagaataaaatcataaaaatgcacatgtttatgtttgttacaagtttactaaattttattc 26165343  T
Q  127 ccgggtataaaatgttc 143  Q
      |  ||||||||||||    
T  26165342 atgaatataaaatgttc 26165326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37296520 - 37296473
Alignment:
Q  293 ttccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcc 340  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37296520 ttccttggaataaaattcacatatttatattccaaggaatgttattcc 37296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Original strand, 12276178 - 12276260
Alignment:
Q  297 ttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaa-cacaccctt 379  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12276178 ttgaaataaaattcacatctttatattcaaaa-aatgttattcctataaataaatttagtaaacttgaaacaaatcacaccctt 12276260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 286
Target Start/End: Original strand, 32384492 - 32384650
Alignment:
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaa-aatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactt 227  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||| ||    |  |||| |    
T  32384492 gggtataaaacgttcatggaaacagaaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaaattcccataaagattggaacaaatttatgtgca-attacct 32384590  T
Q  228 attataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataatttt 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||    
T  32384591 attataatccctaattttatggtttccaggaatattataatgttaagcaaacatactttt 32384650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 126
Target Start/End: Original strand, 9382297 - 9382379
Alignment:
Q  45 aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttg-ttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    |||||||| |||||||||||   |||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  9382297 aagttatatttgttgattcctaaaaataaaatgttagaaatatatatgtctatgtttgtttataaatttactaaattttattc 9382379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 36860191 - 36860106
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaa 117  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |   |||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36860191 ggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgatttctt-aaataaaatgatataaatatatatgtttatgtttgttacaagtttactaa 36860106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 37296724 - 37296662
Alignment:
Q  59 gattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37296724 gattcctggaaataaaatgatagaaatatacatgcttatgtttgttactagtttgctaaattt 37296662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14796439 - 14796295
Alignment:
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||| |||||||  |||| |||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14796439 ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa 14796340  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
      ||| |||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| |||||    
T  14796339 aaaatattattcctaaaaataaatttgacaaacttaaaataaaca 14796295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 54478555 - 54478495
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaa 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  54478555 tatgtttgttataagtttactaaatttcattcatgggtataaaatgttattggaaatagaa 54478495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54478437 - 54478366
Alignment:
Q  270 taaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcct 341  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  54478437 taaccaaacatcttttttctaaataccttagaataaaattcacatatttatatttcaagaaatgctattcct 54478366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 124
Target Start/End: Original strand, 9297144 - 9297172
Alignment:
Q  96 atgtttgttacaagtttactaaattttat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9297144 atgtttgttacaagtttactaaattttat 9297172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2657772 - 2657422
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657772 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatacctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 2657673  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  2657672 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaataattttccta 2657573  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657572 ttataatccatatttttatgattactaggaatattataaagttaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 2657473  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2657472 ggaatgttattcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccct 2657422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 378
Target Start/End: Original strand, 7053569 - 7053927
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7053569 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcct 7053668  T
Q  129 gggtataa--------aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatag 220  Q
    ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7053669 gggtataaaatgataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatag 7053768  T
Q  221 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7053769 tttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcataaattccttggaataaaattcccatattta 7053868  T
Q  320 tattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7053869 tattccaaggaatgttattcctaagaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 7053927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1317089 - 1316741
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccg 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  1317089 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgattggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactttattttattccca 1316990  T
Q  130 ggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1316989 ggtataaaatgttcctgggaataga-aaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaataaattcataaatagtttacctat 1316891  T
Q  230 tataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1316890 tataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaa 1316791  T
Q  329 gaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1316790 gaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 1316741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 37 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18897985 - 18897641
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  18897985 tttgtttcaagttataattgttgattcccggaaataaagtgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttattaaaatttattccttggtataa 18897886  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18897885 aatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtggaaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatt 18897786  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897785 cctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 18897686  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18897685 attcctaggaataaatttgataaacttgaaacaaacacaccctta 18897641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14171087 - 14170740
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14171087 ttagggtgtgtttgtttcaagttataatttttgattcccgggaataaaatgataggaatctatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 14170988  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  14170987 ctggatataaaatgttcctgggaatagaaaaaattt-ccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagat-ggaataaattcataaatagtttacc 14170890  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14170889 tattacaatccctatttttatggttcctaggaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 14170790  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14170789 aaggaatgttattcctagaaataaatttggtaaacttgaaacaaacacac 14170740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 33 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16968993 - 16968649
Alignment:
Q  33 tgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggt 132  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16968993 tgtatttgtttcaagttataattgttgattcctgagaataaaatgataggaatctatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcgggt 16968894  T
Q  133 ataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattat 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16968893 ataaaatgtttctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcctatggagatgagaataaattcataaatagtttacctattat 16968794  T
Q  233 aatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16968793 aatccctatttttatggttcctaagaatattataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattctcatctttatattccaaagaa 16968694  T
Q  332 tgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16968693 tgttattcctagaaataaatttgataaacttgaaacaaacacacc 16968649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 107 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8029297 - 8029025
Alignment:
Q  107 aagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8029297 aagtttactaaaatttattccttggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaat 8029198  T
Q  207 aaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataa 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8029197 aaattcataaatagtttacctattataatccctatttttatggttcctaggaatattataaagccaaccaaacatatttttcctaaatttcttggaataa 8029098  T
Q  306 aattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8029097 aatttccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaacacaccct 8029025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 262
Target Start/End: Original strand, 7344082 - 7344315
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344082 agggtgtgttcgtttcaaattataattgtaaatttccgagaataaaatgataggaatgtatatgcctatatttgttacaagtttactaaattttattccc 7344181  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttactta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7344182 aggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttaccta 7344281  T
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344282 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat 7344315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 173 - 378
Target Start/End: Original strand, 10246259 - 10246465
Alignment:
Q  173 agggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagcta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10246259 agggtgggaataaagttcccatggagatgggaataaattcataaatagtttacctattataatccctaattttatggttcctaggaatattataaagcta 10246358  T
Q  272 accaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaac 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10246359 accaaacatatttttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaac 10246458  T
Q  372 acaccct 378  Q
    |||||||    
T  10246459 acaccct 10246465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 381
Target Start/End: Original strand, 6705762 - 6706104
Alignment:
Q  27 ttagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6705762 ttagggtgtgtttgtttcaagttatatttgttgattcattggaataaaatggtagaaatatatatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattc 6705861  T
Q  127 ccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttact 226  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||      
T  6705862 ctaggtataaaatgttcctgggaatagaaaaatgttcccaaagaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgagaataatttcatatgta-ttta-- 6705958  T
Q  227 tattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattcc 325  Q
              ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  6705959 ----------cctgtttttatagttcttaggaatattataaagttaaccaaatatattttttctaaataccttagaataaaattctcatctttatatttc 6706048  T
Q  326 aaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6706049 aaggaatgttattcctagaaataaaattggtaaacttgaaacaaacatacccttag 6706104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 327
Target Start/End: Original strand, 345837 - 346130
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattccc-ggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtata 135  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  345837 tttgttttaagttatattcgtagattcctaggaaataaaatgataggaatacacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattctcggatata 345936  T
Q  136 aaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataat 235  Q
    ||| |||  | |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || ||| | ||||| |||    
T  345937 aaacgtttttaggaatagaaaatttttcccaaagaaaagggtgggaataaagttccaatggagatgagaataaattcatgagtaattt-cctattaaaat 346035  T
Q  236 ccctatttttatgg-ttcct-aggaat-atataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| | ||| |||||||  |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  346036 tcctatttttatggtttcctcaggaatgttataatgttaagcaaacatcttttttctaaatgtcttagaataaaattctcatctttatattccaa 346130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 375
Target Start/End: Original strand, 14781668 - 14781955
Alignment:
Q  78 ataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggt 177  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||  ||||||||    
T  14781668 ataggaatatacatacatatgtttgttacaagtttactaaattttattcctaggtataaaatgctcatgggaatagaaattttttccaaaagaaaagggt 14781767  T
Q  178 gggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaa 276  Q
    ||     |||||     ||||||||||| |||||||| | || || || ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||| |||    
T  14781768 gg-----aagtta----ggagatgggaataaattcatgagtaatt-acctattataaatcctacttttatggttcccaggaatattataatgttaagcaa 14781857  T
Q  277 acataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    ||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  14781858 acatcttttttctaaataccttggaataaaattctcatctttatgttccaatgaatgttattcccaggaataaatttggtaaa-atgaaacaaacacac 14781955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Original strand, 10849784 - 10849959
Alignment:
Q  31 ggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgg 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||  || | |||||| || ||||||||||||| | | ||| | ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  10849784 ggtgtgtttgtttcaagttatttttatagattcctgggaataaaatgatagaattatatcttcctatattagttacaagtttagtaacttttcttcctgg 10849883  T
Q  131 gtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttccc-aagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10849884 gtgtaaaatgttcctgggaatagaaaaatgttcccaaagaaaaagggtgggaataaagttcccatgaagatgggaa 10849959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8029405 - 8029316
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa 118  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8029405 agggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccgggaataaaatgatagaaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaa 8029316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 7344727 - 7344827
Alignment:
Q  262 tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaact 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  7344727 tataaagctaaccaaacatatttttcctaaattccttagaataaaattctcatatttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttgataaact 7344826  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  7344827 t 7344827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 21008039 - 21008208
Alignment:
Q  45 aagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcc 144  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  21008039 aagttatatttgttgatttctgggaataaaatgataaaaatatatatgcctctatttgttacaggtttactaaattttattcccgaacatgaaatgttct 21008138  T
Q  145 tgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcata 215  Q
    |||||||||||||||  | | || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  21008139 tgggaatagaaaaaaaattcaaacaaaaa-ggtgggaataaagttctcatagagatgggaataaattcata 21008208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 372
Target Start/End: Original strand, 21008212 - 21008322
Alignment:
Q  262 tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaact 361  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||  ||||||    
T  21008212 tataaagttaaccaaacatattttttctaaatgccttggaataaaattctcatctttatattccaagaaatgttattcataaaaataaatttaataaact 21008311  T
Q  362 tgaaacaaaca 372  Q
    |||||||||||    
T  21008312 tgaaacaaaca 21008322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 288 - 381
Target Start/End: Original strand, 9762299 - 9762392
Alignment:
Q  288 ctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttag 381  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9762299 ctaaatacctttgaataaaattcacatatttataatccaaggaatgttattcctaataataaacttggtaaacttgaaacaaacacaccgttag 9762392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 376
Target Start/End: Original strand, 11570071 - 11570131
Alignment:
Q  316 tttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11570071 tttatattccaaggaatgttattcctaggaataaatttggtaaacttgaaacaaagacacc 11570131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8314873 - 8314612
Alignment:
Q  123 attcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaaggg-tgggaataaagttcccatggagatgg-gaaaaaattcataaatag 220  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || |||||  | || |||||||||| ||||| |||| | ||| ||||||| |  ||     
T  8314873 attcccgtatataaaatgtttctggcaatagaaaatttttccaaaaaaaaaatgatgagaataaagtttccatgaagattgagaataaattcaaatgtaa 8314774  T
Q  221 tttacttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatcttta 319  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||| | |||| ||||||  |||| ||||||  ||| ||||||||||  ||| | ||    
T  8314773 tt-acctattataatccctatttttaaggttccttgaattattataatgttaactaaacattttttttctaaatatcttagaataaaatttacatgtgta 8314675  T
Q  320 tattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacacccttagt 382  Q
    |||| |||| ||||||| | ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  8314674 tattgcaagtaatgttaattctaggaataaatttgataaacttaaaacaaacgtacccttagt 8314612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 157
Target Start/End: Original strand, 9760409 - 9760497
Alignment:
Q  69 aataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaa 157  Q
    ||||||||||| | | | || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| || ||||||||||    
T  9760409 aataaaatgatcgaattatacatgcctatttttgttataagtttactaaattttatttcaggatataaaatgttcatgagaatagaaaa 9760497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8314919 - 8314874
Alignment:
Q  95 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataaaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8314919 tatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgtatataaaatg 8314874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3869577 - 3869391
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||| |||| | || ||||||||||||| ||| | |||  ||| |||||||| | ||| | |||||||||||       
T  3869577 agggtgtgtttgtttcaagttatttttgtagatttctgggaataaaatgatagaaatatgtattactacgtttgttaaatgttcattaaattttatt--- 3869481  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgg---gaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataa 216  Q
     || |||||||||||   |||||||||||  ||||||||  |||| |||||   |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  3869480 -ggcataaaatgttcaatggaatagaaaagttttcccaaagaaaatggtggtgagaataaagttcccacgaagatgagaataaattcataa 3869391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12328142 - 12328063
Alignment:
Q  300 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  12328142 gaatgaaattcacatctttatattcaaag-aatgttattactagaaataaatttggtaaatttgaaacagacagaccctta 12328063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 10246222 - 10246258
Alignment:
Q  30 gggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccg 66  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10246222 gggtgtgtttgtttcaagttataattgttgattcccg 10246258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 37 - 375
Target Start/End: Original strand, 28959 - 29298
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28959 tttgtttcaagttataattgttgattttcgggaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 29058  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29059 aatgttcctgggaatagaaaaaatttctcaaggaaaagggtgggaataaagttcccatggaaatgagaataaattcataaatagttttcctattataatc 29158  T
Q  237 cctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaaggaatgtt 335  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  29159 cctatttttataattcctaggaatattataaagctaaccaaacatattttttctaaattccttggaataaaattcctatctttatattccaaaaaatgtt 29258  T
Q  336 attcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacac 375  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  29259 attcataggaataaatttgataaacttaaaataaacacac 29298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0662 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4543 - 4186
Alignment:
Q  26 attagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |  | |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4543 attagggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagatttctaggaataaaattataaaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 4444  T
Q  126 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaa-aaaattcataaatagttta 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||      |||    
T  4443 cccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaaattaatagtgtaatta 4344  T
Q  225 cttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca-taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatat 322  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4343 cctattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacattttttttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatat 4244  T
Q  323 tccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4243 tccaaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccctta 4186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 380
Target Start/End: Original strand, 3561 - 3916
Alignment:
Q  26 attagggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 125  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |  | |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3561 attagggtgtgtttgtttcaagttatatttgtagatttctaggaataaaattataaaaatatatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttatt 3660  T
Q  126 cccgggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttac 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||   ||  ||||    
T  3661 cccgagtataaaatgttcctgggaatagaaaagttttctcaaagaaaatggtgggaataaagttcccatggagatgaaaataaaattatgtgta-attac 3759  T
Q  226 ttattataatccctatttttatggttcctaggaata-tataaagctaaccaaaca-taattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatatt 323  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3760 ctattatattccctatttttaaggttccttggaatattataatgttaacgaaacattttttttcctaaataccttggaataaaattcctatctttatatt 3859  T
Q  324 ccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaacacaccctta 380  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3860 ccaaggaatgttattcataggaataaatttggtgcacttgaaacaaacacaccctta 3916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 252
Target Start/End: Original strand, 23303 - 23517
Alignment:
Q  37 tttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattcccgggtataa 136  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| | |  |||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23303 tttgttttaaattatatttgtagatttctgagaataaaattatagaaatatacatgtctatgtttgttacaagtttactaaattttattcacgagtataa 23402  T
Q  137 aatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatgggaaaaaattcataaatagtttacttattataatc 236  Q
    ||| |||||||||||| |||   ||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||   ||   ||| ||||||||||    
T  23403 aatattcctgggaatataaatttttttccaaagaaaacggtgggaataaagtttccatgaagatgaaaataaattcatgtgta-actacctattataatc 23501  T
Q  237 cctatttttatggttc 252  Q
    |||||||||| |||||    
T  23502 cctatttttaaggttc 23517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Original strand, 23604 - 23675
Alignment:
Q  300 gaataaaattcccatctttatattccaaggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  23604 gaataaaattcc-atttttatattccaagaaatattattcttaaaaataaatttggtaaacttaaaataaaca 23675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 201
Target Start/End: Original strand, 21789 - 21961
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||  |||||| |||||| | ||| |  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  21789 agggtgtatttgtttcaagttatctttgtaaattcctcgaaatagaatgatggaaatatgcattcctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcct 21888  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatg 201  Q
     | ||||||||||||||||| ||  || ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  21889 agatataaaatgttcctgggtatgaaataacattcccaaaaaaaattgtgggaataaagttcccatgaagatg 21961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1480 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:

Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 201
Target Start/End: Original strand, 384 - 556
Alignment:
Q  29 agggtgtatttgttttaagttataattgttgattcccggaaataaaatgataggaatgtatatgcctatgtttgttacaagtttactaaattttattccc 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||| ||||||| |||||| | ||| |  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  384 agggtgtgtttgtttcaagttatctttgtaaattcctggaaatagaatgatggaaatatgcattcctatgtttgttgcaagtttattaaattttattcct 483  T
Q  129 gggtataaaatgttcctgggaatagaaaaaatttcccaagaaaaagggtgggaataaagttcccatggagatg 201  Q
       ||||||||||||||||||||  || ||  |||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  484 aaatataaaatgttcctgggaatgaaataacattcccaaagaaaattgtgggaataaagttcccatgaagatg 556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 372
Target Start/End: Original strand, 43292 - 43436
Alignment:
Q  229 ttataatccctatttttatggttcctaggaatat-ataaagctaaccaaacataattttcctaaattccttggaataaaattcccatctttatattccaa 327  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||| |||||||  |||| |||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43292 ttataatctttatttttaaggttcctaaaaatatcataatgttaaacaaacatcttttttctaaatactttaaaataaaattcacatctttatattctaa 43391  T
Q  328 ggaatgttattcctaagaattaatttggtaaacttgaaacaaaca 372  Q
      ||| |||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| |||||    
T  43392 aaaatattattcctaaaaataaatttgacaaacttaaaataaaca 43436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University